
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2379] =>      2379 nucs 'mol-32-2105-070950_2379'

Score:        2355
Aligned:      2377        nucs
Identic:      2375 (100%) nucs =>       910 (100%)      1465 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115079219,115080128] EXCISED REGION [115080129,115081595]
 second seq =>  [        1,      910] EXCISED REGION [      913,     2379]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [911,912]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [911,913] to [913,915]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115080128,115080128] to [115080129,115080129]
 second seq =>         1 nucs [910,910] to [913,913]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

115079219 TCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAA 115079278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAA 60

115079279 AGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGACATAATGTTTGACATAATATTACA 115079338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGACATAATGTTTGACATAATATTACA 120

115079339 TACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATTATTATTAAGCCTTTAAAAGGAA 115079398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATTATTATTAAGCCTTTAAAAGGAA 180

115079399 TATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGCAACAACATATGAACTTGAAAGA 115079458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGCAACAACATATGAACTTGAAAGA 240

115079459 TATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAAAATACTGCATGATCTCACTTTA 115079518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAAAATACTGCATGATCTCACTTTA 300

115079519 GAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAATTCATAAAAGCAGAGTAGAATG 115079578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAATTCATAAAAGCAGAGTAGAATG 360

115079579 GTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAATGGTTTTTGTTTATTTATTTGCT 115079638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAATGGTTTTTGTTTATTTATTTGCT 420

115079639 TGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTACAGTGGCACGATCTTGACTCACT 115079698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTACAGTGGCACGATCTTGACTCACT 480

115079699 GCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGATTA 115079758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGATTA 540

115079759 CAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTT 115079818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTT 600

115079819 AATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGGCTGCTTTCAAACTCCTGACCTC 115079878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGGCTGCTTTCAAACTCCTGACCTC 660

115079879 AAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGTGC 115079938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGTGC 720

115079939 CCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTTTAGTTATGTAGCATGAATAAAT 115079998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTTTAGTTATGTAGCATGAATAAAT 780

115079999 TTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAATAATACTGTATTGCAAACCACTT 115080058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAATAATACTGTATTGCAAACCACTT 840

115080059 GAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCACACACACCAAAATAAGGCAAAAA 115080118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCACACACACCAAAATAAGGCAAAAA 900

115080119 AAAAAAAAAA 115080128
          ||||||||||
      901 AAAAAAAAAA 910

EXCISED REGION

115080129 AGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAAAATCCAATGAACCC 115080188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 AGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAAAATCCAATGAACCC 972

115080189 ATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTCAATCATCAGAATGA 115080248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 ATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTCAATCATCAGAATGA 1032

115080249 CCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGAGCAAAGGAAATGCT 115080308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 CCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGAGCAAAGGAAATGCT 1092

115080309 CAGAAACTACCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAACAGTTTGGTGATA 115080368
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 CAGAAACTGCCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAACAGTTTGGTGATA 1152

115080369 TTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACATAATTTGCCCAAG 115080428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 TTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACATAATTTGCCCAAG 1212

115080429 GTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGACCTTAAATTTTCT 115080488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 GTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGACCTTAAATTTTCT 1272

115080489 TATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATA 115080548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 TATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATA 1332

115080549 GTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGA 115080608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 GTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGA 1392

115080609 GATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGT 115080668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 GATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGT 1452

115080669 TAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAAT 115080728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 TAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAAT 1512

115080729 TCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACA 115080788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 TCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACA 1572

115080789 CAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTAT 115080848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 CAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTAT 1632

115080849 TAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAA 115080908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 TAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAA 1692

115080909 TTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTC 115080968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 TTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTC 1752

115080969 CTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATA 115081028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 CTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATA 1812

115081029 CCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTT 115081088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTT 1872

115081089 CATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTT 115081148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 CATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTT 1932

115081149 TTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATA 115081208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 TTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATA 1992

115081209 AAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAA 115081268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 AAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAA 2052

115081269 ATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCT 115081328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 ATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCT 2112

115081329 GTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATT 115081388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 GTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATT 2172

115081389 TTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAG 115081448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 TTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAG 2232

115081449 CTCTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTA 115081508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 CTCTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTA 2292

115081509 TTTTATTTTATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGG 115081568
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 TTTTATTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGG 2352

115081569 CGGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCT 115081595
          |||||||||||||||||||||||||||
     2353 CGGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCT 2379

Alignment time is 1.92395 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4171] =>      4171 nucs 'mol-32-2383-100773_4171'

Score:        3913
Aligned:      4176        nucs
Identic:      4121 ( 99%) nucs =>      1696 ( 98%)      2425 ( 99%)
Gaps:           44 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115077610,115079315] EXCISED REGION [115080677,115083118]
 second seq =>  [        1,     1717] EXCISED REGION [     1721,     4163]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1361 nucs [115079316,115080676]
 second seq =>         3 nucs [1718,1720]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080677,115080677]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080676,115080676]
 second seq =>         0 nucs

115077610 GCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACACATTGTAGAAACTC 115077669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACACATTGTAGAAACTC 60

115077670 TGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTTGAGAGAAAATATT 115077729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTTGAGAGAAAATATT 120

115077730 ATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCAACAGTTTTCATTT 115077789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
      121 ATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCAA--GTTTTCATTT 178

115077790 ATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATTAGTATGCATACTC 115077849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 ATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATTAGTATGCATACTC 238

115077850 CAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGAGCATATTACATTC 115077909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 CAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGAGCATATTACATTC 298

115077910 TAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGCAAATAACTGTGAA 115077969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 TAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGCAAATAACTGTGAA 358

115077970 TCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAAAATATTTTCAGGC 115078029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 TCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAAAATATTTTCAGGC 418

115078030 ATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTGAAACCACACTACA 115078089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 ATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTGAAACCACACTACA 478

115078090 AAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAAAAGACAAAGGAGA 115078149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAAAAGACAAAGGAGA 538

115078150 AACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATCCTTTTTATTATTT 115078209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 AACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATCCTTTTTATTATTT 598

115078210 TTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGAGAAGCTAACTAGG 115078269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGAGAAGCTAACTAGG 658

115078270 ACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCCCTAGACTGGAGAG 115078329
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ACACACTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCCCTAGACTGGAGAG 718

115078330 ATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGCAGAGGTTAGAACT 115078389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 ATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGCAGAGGTTAGAACT 778

115078390 TCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTGCTGCTAGAGGCAT 115078449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTGCTGCTAGAGGCAT 838

115078450 CTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTTTTTACCTCTGTTT 115078509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTTTTTACCTCTGTTT 898

115078510 CCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCCCCACTTTCAAAGA 115078569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCCCCACTTTCAAAGA 958

115078570 GAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACATAAGGT--------- 115078620
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
      959 GAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA------ATGTCCAAG 1012

115078621 ----------AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAA 115078670
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 AGAAAATCAAAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAA 1072

115078671 AGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGAT 115078730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGAT 1132

115078731 AAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCA 115078790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 AAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCA 1192

115078791 AACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATG 115078850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 AACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATG 1252

115078851 ACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAAT 115078910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 ACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAAT 1312

115078911 TAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTT 115078970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTT 1372

115078971 CTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATG 115079030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 CTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATG 1432

115079031 TTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATG 115079090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATG 1492

115079091 GATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTA 115079150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTA 1552

115079151 ATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAAGG 115079210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1553 ATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAATG 1612

115079211 GTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTA 115079270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTA 1672

115079271 TTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 1717

EXCISED REGION

115080677 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 115080736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 1780

115080737 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 115080796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 1840

115080797 ATGCTACA-ATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 115080855
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 ATGCTACACATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 1900

115080856 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 115080915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 1960

115080916 GACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 115080975
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 GGCTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 2020

115080976 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTG 115081035
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2021 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTA 2080

115081036 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 115081095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 2140

115081096 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 115081155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 2200

115081156 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 115081215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 2260

115081216 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 115081275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 2320

115081276 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 115081335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2321 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTCACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 2380

115081336 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 115081395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2381 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTACAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 2440

115081396 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 115081455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 2500

115081456 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 115081515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 2560

115081516 TTATTTATTTTTTT-TTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 115081574
          ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TTATTTATTT----ATTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 2616

115081575 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 115081634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 2676

115081635 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 115081694
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACGGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 2736

115081695 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 115081754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 2796

115081755 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 115081814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 2856

115081815 CACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 115081874
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 CACTTACATGTATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 2916

115081875 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 115081934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 2976

115081935 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 115081994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 3036

115081995 TATGCA-------TGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 115082047
          |||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TAT---TCATGCGTGCTGTTGATAAAAGG-AAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 3092

115082048 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 115082107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 3152

115082108 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 115082167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 3212

115082168 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 115082227
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTAAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 3272

115082228 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 115082287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 3332

115082288 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 115082347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 3392

115082348 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 115082407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 3452

115082408 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 115082467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 3512

115082468 ATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 115082527
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 ATCATTTGACATTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 3572

115082528 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 115082587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 3632

115082588 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 115082647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 3692

115082648 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 115082707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 3752

115082708 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTT 115082767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3753 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCTGTT 3812

115082768 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 115082827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 3872

115082828 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTC 115082887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTC 3932

115082888 TATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATTGACACATTGTGG 115082947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 TATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATTGACACATTGTGG 3992

115082948 TTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGATGAATCTTATCTA 115083007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 TTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGATGAATCTTATCTA 4052

115083008 ATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTATTTTTTTAATATTAAGAGATTTAAAATAA 115083067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 ATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTATTTTTTTAATATTAAGAGATTTAAAATAA 4112

115083068 AACATGTACAAAAATTTGTAGTGAATCTTTAACCTCTAGCTGACATTTAAA 115083118
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 AACATGTACAAAAATTTGTAGTGAATCTTTAACCTCTAGCTGACATTTAAA 4163

Alignment time is 3.33015 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4799] =>      4799 nucs 'mol-32-285e-000965_4799'

Score:        4766
Aligned:      4799        nucs
Identic:      4796 (100%) nucs =>      1875 (100%)      2921 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115078238,115080113] EXCISED REGION [115080116,115083038]
 second seq =>  [        1,     1876] EXCISED REGION [     1877,     4799]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [115080114,115080115]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [115080114,115080127] to [115080116,115080129]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115080114,115080114] to [115080115,115080115]
 second seq =>         0 nucs

115078238 ACATAATAGAAGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGG 115078297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATAATAGAAGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGG 60

115078298 CAGAAAGACATGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGA 115078357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAAAGACATGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGA 120

115078358 GAGATTAGCACTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCAC 115078417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGATTAGCACTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCAC 180

115078418 TATGAAAGAGATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATT 115078477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGAAAGAGATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATT 240

115078478 GCTTTCTCCCTTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTA 115078537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTTCTCCCTTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTA 300

115078538 GGATTCACAGGAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGT 115078597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      301 GGATTCACAGGAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGAGAGAAGT 360

115078598 ATATATAACAGAAAACATAAGGTAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAG 115078657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATATAACAGAAAACATAAGGTAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAG 420

115078658 TCTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTC 115078717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTC 480

115078718 AAAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAA 115078777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAA 540

115078778 ATACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTT 115078837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTT 600

115078838 ACTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCA 115078897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCA 660

115078898 TCTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAAT 115078957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAAT 720

115078958 ACAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTT 115079017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTT 780

115079018 CTGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAA 115079077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAA 840

115079078 GTGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCA 115079137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCA 900

115079138 TTTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCAT 115079197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCAT 960

115079198 GTTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAA 115079257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAA 1020

115079258 ACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGACAT 115079317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGACAT 1080

115079318 AATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATTA 115079377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATTA 1140

115079378 TTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGCA 115079437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGCA 1200

115079438 ACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAAA 115079497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAAA 1260

115079498 ATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAAT 115079557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAAT 1320

115079558 TCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAATG 115079617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAATG 1380

115079618 GTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTACA 115079677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTACA 1440

115079678 GTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAGC 115079737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAGC 1500

115079738 CTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTGT 115079797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTGT 1560

115079798 TTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGGC 115079857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGGC 1620

115079858 TGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 115079917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 1680

115079918 TACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTTT 115079977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTTT 1740

115079978 AGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAATA 115080037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAATA 1800

115080038 ATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCACA 115080097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCACA 1860

115080098 CACACCAAAATAAGGC 115080113
          ||||||||||||||||
     1861 CACACCAAAATAAGGC 1876

EXCISED REGION

115080116 AAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAAA 115080175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 AAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAAA 1936

115080176 ATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTCA 115080235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 ATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTCA 1996

115080236 ATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGAG 115080295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 ATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGAG 2056

115080296 CAAAGGAAATGCTCAGAAACTACCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAA 115080355
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 CAAAGGAAATGCTCAGAAACTGCCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAA 2116

115080356 CAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACA 115080415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACA 2176

115080416 TAATTTGCCCAAGGTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGA 115080475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TAATTTGCCCAAGGTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGA 2236

115080476 CCTTAAATTTTCTTATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCA 115080535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 CCTTAAATTTTCTTATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCA 2296

115080536 ATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTT 115080595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 ATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTT 2356

115080596 TAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCA 115080655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 TAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCA 2416

115080656 GGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTT 115080715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 GGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTT 2476

115080716 TTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTA 115080775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 TTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTA 2536

115080776 ATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGAT 115080835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 ATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGAT 2596

115080836 TCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTT 115080895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTT 2656

115080896 AGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCC 115080955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 AGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCC 2716

115080956 TTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTC 115081015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTC 2776

115081016 TCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAA 115081075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 TCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAA 2836

115081076 AGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTT 115081135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 AGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTT 2896

115081136 ATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAA 115081195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 ATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAA 2956

115081196 TGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTAC 115081255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 TGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTAC 3016

115081256 TTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACAT 115081315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 TTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACAT 3076

115081316 TGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTT 115081375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 TGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTT 3136

115081376 GTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAG 115081435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 GTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAG 3196

115081436 CTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTT 115081495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 CTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTT 3256

115081496 GTTCCTAACTTTATTTTATTTTATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGC 115081555
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3257 GTTCCTAACTTTATTTTATTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGC 3316

115081556 TCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCC 115081615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 TCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCC 3376

115081616 GGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCA 115081675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 GGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCA 3436

115081676 CCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTAT 115081735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 CCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTAT 3496

115081736 GCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCT 115081795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 GCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCT 3556

115081796 ACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTT 115081855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 ACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTT 3616

115081856 TATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTA 115081915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 TATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTA 3676

115081916 ATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACG 115081975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 ATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACG 3736

115081976 AAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAA 115082035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 AAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAA 3796

115082036 TTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGA 115082095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 TTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGA 3856

115082096 GCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGT 115082155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 GCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGT 3916

115082156 TTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGT 115082215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 TTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGT 3976

115082216 TGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCAT 115082275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 TGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCAT 4036

115082276 ACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCA 115082335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 ACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCA 4096

115082336 TTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTT 115082395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 TTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTT 4156

115082396 TTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGA 115082455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 TTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGA 4216

115082456 AACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGAT 115082515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 AACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGAT 4276

115082516 ATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGA 115082575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 ATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGA 4336

115082576 TTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTAT 115082635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 TTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTAT 4396

115082636 TTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTT 115082695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 TTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTT 4456

115082696 CAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTG 115082755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 CAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTG 4516

115082756 ATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATG 115082815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 ATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATG 4576

115082816 AAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTG 115082875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 AAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTG 4636

115082876 TCATTTGACTTCTATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATT 115082935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 TCATTTGACTTCTATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATT 4696

115082936 GACACATTGTGGTTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGAT 115082995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 GACACATTGTGGTTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGAT 4756

115082996 GAATCTTATCTAATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTA 115083038
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 GAATCTTATCTAATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTA 4799

Alignment time is 3.74831 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2194] =>      2194 nucs 'mol-32-299d-091777_2194'

Score:        2021
Aligned:      2190        nucs
Identic:      2164 ( 99%) nucs =>        47 (100%)      2117 ( 99%)
Gaps:           17 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115079269,115079315] EXCISED REGION [115080677,115082810]
 second seq =>  [        1,       47] EXCISED REGION [       51,     2185]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1361 nucs [115079316,115080676]
 second seq =>         3 nucs [48,50]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080677,115080677]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080676,115080676]
 second seq =>         0 nucs

115079269 TATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 47

EXCISED REGION

115080677 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 115080736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       51 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 110

115080737 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 115080796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      111 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 170

115080797 ATGCTACA-ATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 115080855
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      171 ATGCTACACATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 230

115080856 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 115080915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 290

115080916 GACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 115080975
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 GGCTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 350

115080976 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTG 115081035
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      351 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTA 410

115081036 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 115081095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 470

115081096 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 115081155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 530

115081156 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 115081215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 590

115081216 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 115081275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 650

115081276 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 115081335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      651 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTCACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 710

115081336 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 115081395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      711 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTACAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 770

115081396 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 115081455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 830

115081456 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 115081515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 890

115081516 TTATTTATTTTTTT-TTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 115081574
          ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 TTATTTATTT----ATTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 946

115081575 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 115081634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 1006

115081635 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 115081694
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACGGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 1066

115081695 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 115081754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 1126

115081755 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 115081814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 1186

115081815 CACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 115081874
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 CACTTACATGTATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 1246

115081875 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 115081934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 1306

115081935 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 115081994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 1366

115081995 TATGCA-------TGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 115082047
          |||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 TAT---TCATGCGTGCTGTTGATAAAAGG-AAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 1422

115082048 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 115082107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 1482

115082108 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 115082167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 1542

115082168 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 115082227
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTAAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 1602

115082228 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 115082287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 1662

115082288 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 115082347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 1722

115082348 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 115082407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 1782

115082408 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 115082467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 1842

115082468 ATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 115082527
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 ATCATTTGACATTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 1902

115082528 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 115082587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 1962

115082588 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 115082647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 2022

115082648 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 115082707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 2082

115082708 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTT 115082767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2083 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCTGTT 2142

115082768 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAA 115082810
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAA 2185

Alignment time is 1.71273 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3796] =>      3796 nucs 'mol-32-29be-074283_3796'

Score:        3546
Aligned:      3809        nucs
Identic:      3754 ( 99%) nucs =>      1585 ( 98%)      2169 ( 99%)
Gaps:           44 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115077721,115079315] EXCISED REGION [115080677,115082862]
 second seq =>  [        1,     1606] EXCISED REGION [     1610,     3796]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1361 nucs [115079316,115080676]
 second seq =>         3 nucs [1607,1609]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080677,115080677]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080676,115080676]
 second seq =>         0 nucs

115077721 GAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCAACAG 115077780
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
        1 GAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCAA--G 58

115077781 TTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATTAGTA 115077840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       59 TTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATTAGTA 118

115077841 TGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGAGCAT 115077900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 TGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGAGCAT 178

115077901 ATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGCAAAT 115077960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 ATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGCAAAT 238

115077961 AACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAAAATA 115078020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 AACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAAAATA 298

115078021 TTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTGAAAC 115078080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 TTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTGAAAC 358

115078081 CACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAAAAGA 115078140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 CACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAAAAGA 418

115078141 CAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATCCTTT 115078200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 CAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATCCTTT 478

115078201 TTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGAGAAG 115078260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGAGAAG 538

115078261 CTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCCCTAG 115078320
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CTAACTAGGACACACTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCCCTAG 598

115078321 ACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGCAGAG 115078380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 ACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGCAGAG 658

115078381 GTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTGCTGC 115078440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTGCTGC 718

115078441 TAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTTTTTA 115078500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTTTTTA 778

115078501 CCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCCCCAC 115078560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCCCCAC 838

115078561 TTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACATAAGGT 115078620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
      839 TTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA------ 892

115078621 -------------------AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTA 115078661
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 ATGTCCAAGAGAAAATCAAAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTA 952

115078662 CATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAA 115078721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 CATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAA 1012

115078722 ATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATAC 115078781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 ATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATAC 1072

115078782 AAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTT 115078841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTT 1132

115078842 ATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTA 115078901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 ATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTA 1192

115078902 ATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAA 115078961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 ATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAA 1252

115078962 ATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGC 115079021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 ATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGC 1312

115079022 ACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGT 115079081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 ACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGT 1372

115079082 CCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTA 115079141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 CCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTA 1432

115079142 TTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTG 115079201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTG 1492

115079202 TAGCAAAGGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCT 115079261
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TAGCAAATGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCT 1552

115079262 TAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 1606

EXCISED REGION

115080677 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 115080736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 1669

115080737 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 115080796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 1729

115080797 ATGCTACA-ATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 115080855
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 ATGCTACACATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 1789

115080856 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 115080915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 1849

115080916 GACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 115080975
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 GGCTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 1909

115080976 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTG 115081035
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1910 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTA 1969

115081036 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 115081095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 2029

115081096 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 115081155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 2089

115081156 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 115081215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 2149

115081216 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 115081275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 2209

115081276 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 115081335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2210 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTCACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 2269

115081336 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 115081395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2270 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTACAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 2329

115081396 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 115081455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 2389

115081456 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 115081515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 2449

115081516 TTATTTATTTTTTT-TTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 115081574
          ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 TTATTTATTT----ATTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 2505

115081575 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 115081634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 2565

115081635 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 115081694
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACGGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 2625

115081695 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 115081754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 2685

115081755 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 115081814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 2745

115081815 CACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 115081874
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 CACTTACATGTATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 2805

115081875 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 115081934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 2865

115081935 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 115081994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 2925

115081995 TATGCA-------TGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 115082047
          |||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TAT---TCATGCGTGCTGTTGATAAAAGG-AAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 2981

115082048 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 115082107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 3041

115082108 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 115082167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 3101

115082168 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 115082227
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTAAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 3161

115082228 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 115082287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 3221

115082288 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 115082347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 3281

115082348 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 115082407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 3341

115082408 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 115082467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 3401

115082468 ATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 115082527
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 ATCATTTGACATTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 3461

115082528 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 115082587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 3521

115082588 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 115082647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 3581

115082648 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 115082707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 3641

115082708 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTT 115082767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3642 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCTGTT 3701

115082768 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 115082827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 3761

115082828 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATA 115082862
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATA 3796

Alignment time is 2.99985 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2336] =>      2336 nucs 'mol-32-2efc-077271_2336'

Score:        2188
Aligned:      2343        nucs
Identic:      2306 ( 98%) nucs =>      1393 ( 98%)       913 ( 99%)
Gaps:           31 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115077915,115079315] EXCISED REGION [115080677,115081597]
 second seq =>  [        1,     1414] EXCISED REGION [     1418,     2336]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1361 nucs [115079316,115080676]
 second seq =>         3 nucs [1415,1417]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080677,115080677]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080676,115080676]
 second seq =>         0 nucs

115077915 TGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGCAAATAACTGTGAATCCAG 115077974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGCAAATAACTGTGAATCCAG 60

115077975 TAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAAAATATTTTCAGGCATATG 115078034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAAAATATTTTCAGGCATATG 120

115078035 AAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTGAAACCACACTACAAAACT 115078094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTGAAACCACACTACAAAACT 180

115078095 GATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAAAAGACAAAGGAGAAACAT 115078154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAAAAGACAAAGGAGAAACAT 240

115078155 TTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATCCTTTTTATTATTTTTTAA 115078214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATCCTTTTTATTATTTTTTAA 300

115078215 AGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACA 115078274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACA 360

115078275 CTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAA 115078334
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAA 420

115078335 TGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGC 115078394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGC 480

115078395 ATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCC 115078454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCC 540

115078455 AAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAAC 115078514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAAC 600

115078515 CAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAAT 115078574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAAT 660

115078575 TATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACATAAGGT-------------- 115078620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
      661 TATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA------ATGTCCAAGAGAAA 714

115078621 -----AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACC 115078675
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 ATCAAAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACC 774

115078676 TAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAAC 115078735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 TAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAAC 834

115078736 AGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTA 115078795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 AGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTA 894

115078796 AGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATGACAAA 115078855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 AGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATGACAAA 954

115078856 ATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATT 115078915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 ATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATT 1014

115078916 ACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGT 115078975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 ACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGT 1074

115078976 TATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCAT 115079035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 TATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCAT 1134

115079036 TGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTA 115079095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 TGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTA 1194

115079096 ATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTAATAAC 115079155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 ATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTAATAAC 1254

115079156 CAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAAGGGTAGG 115079215
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1255 CAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAATGGTAGG 1314

115079216 CTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTT 115079275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 CTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTT 1374

115079276 TAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 1414

EXCISED REGION

115080677 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 115080736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 1477

115080737 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 115080796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 1537

115080797 ATGCTACA-ATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 115080855
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 ATGCTACACATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 1597

115080856 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 115080915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 1657

115080916 GACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 115080975
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 GGCTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 1717

115080976 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTG 115081035
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1718 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTA 1777

115081036 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 115081095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 1837

115081096 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 115081155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 1897

115081156 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 115081215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 1957

115081216 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 115081275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 2017

115081276 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 115081335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2018 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTCACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 2077

115081336 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 115081395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2078 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTACAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 2137

115081396 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 115081455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 2197

115081456 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 115081515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 2257

115081516 TTATTTATTTTTTT-TTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 115081574
          ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TTATTTATTT----ATTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 2313

115081575 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCA 115081597
          |||||||||||||||||||||||
     2314 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCA 2336

Alignment time is 1.86579 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2365] =>      2365 nucs 'mol-32-2f28-094857_2365'

Score:        2322
Aligned:      2366        nucs
Identic:      2362 (100%) nucs =>      2281 (100%)        81 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115079241,115081525] EXCISED REGION [115081528,115081608]
 second seq =>  [        1,     2283] EXCISED REGION [     2285,     2365]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [115081526,115081527]
 second seq =>         1 nucs [2284,2284]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [115081523,115081537] to [115081525,115081539]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [115081523,115081525] to [115081528,115081530]
 second seq =>         3 nucs [2281,2283] to [2285,2287]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115081526,115081526] to [115081527,115081527]
 second seq =>         0 nucs

115079241 ATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTA 115079300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTA 60

115079301 CACGTAATATTAGACATAATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACAC 115079360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACGTAATATTAGACATAATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACAC 120

115079361 TTAAAGGGTTACTATTATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGG 115079420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAAAGGGTTACTATTATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGG 180

115079421 AAAACCTACCCTTTGCAACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAAC 115079480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAACCTACCCTTTGCAACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAAC 240

115079481 CAGTCACAGATAGAAAAATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCA 115079540
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
      241 CAGTCACAGATAGAAAAATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAA-TACTGCA 299

115079541 TGATTCTCACTTAGAATTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTT 115079600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TGATTCTCACTTAGAATTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTT 359

115079601 GGCAAAATGGGTAAATGGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTC 115079660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GGCAAAATGGGTAAATGGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTC 419

115079661 ACTCAGACTGGAGTACAGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTC 115079720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 ACTCAGACTGGAGTACAGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTC 479

115079721 AAGTCTCATGCCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTG 115079780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AAGTCTCATGCCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTG 539

115079781 GCTAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTT 115079840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GCTAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTT 599

115079841 CACCATATTAGCCAGGCTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCC 115079900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CACCATATTAGCCAGGCTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCC 659

115079901 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCA 115079960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCA 719

115079961 AAAAGATGCGAAGTTTTAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCAC 115080020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AAAAGATGCGAAGTTTTAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCAC 779

115080021 GGTGACTATAGTTAATAATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCT 115080080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GGTGACTATAGTTAATAATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCT 839

115080081 ATTGCGTTCTCACCACACACACCAAAATAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAA 115080140
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
      840 ATTGCGTTCTCACCACACACACCAAAATAAGGCAAAAAAAAAAAAAAA-GAAAATGTAAA 898

115080141 TAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAAAATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAA 115080200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAAAATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAA 958

115080201 AACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTCAATCATCAGAATGACCTAACTTATAA 115080260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTCAATCATCAGAATGACCTAACTTATAA 1018

115080261 AACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGAGCAAAGGAAATGCTCAGAAACTACCG 115080320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1019 AACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGAGCAAAGGAAATGCTCAGAAACTGCCG 1078

115080321 GTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAACAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTG 115080380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAACAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTG 1138

115080381 AAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACATAATTTGCCCAAGGTTCATGATTAT 115080440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACATAATTTGCCCAAGGTTCATGATTAT 1198

115080441 CAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGACCTTAAATTTTCTTATCCATACCCT 115080500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGACCTTAAATTTTCTTATCCATACCCT 1258

115080501 CAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAA 115080560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAA 1318

115080561 ATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGT 115080620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 ATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGT 1378

115080621 GCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAAT 115080680
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGCATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAAT 1438

115080681 ATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAATAC 115080740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 ATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAATAC 1498

115080741 AGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTACATGC 115080800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTACATGC 1558

115080801 TACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATT 115080860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATT 1618

115080861 ATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTATGACTG 115080920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTATGACTG 1678

115080921 GCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGC 115080980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGC 1738

115080981 CGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAG 115081040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAG 1798

115081041 CTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTT 115081100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTT 1858

115081101 CCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTA 115081160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTA 1918

115081161 TTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTA 115081220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTA 1978

115081221 AAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTC 115081280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTC 2038

115081281 TGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCT 115081340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCT 2098

115081341 GGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTA 115081400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTA 2158

115081401 AGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTA 115081460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTA 2218

115081461 TCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATTTTATT 115081520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATTTTATT 2278

115081521 TATTT 115081525
          |||||
     2279 TATTT 2283

EXCISED REGION

115081528 TTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTGA 115081587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTGA 2344

115081588 TCTCAGCTCACTGCAAGCTCC 115081608
          |||||||||||||||||||||
     2345 TCTCAGCTCACTGCAAGCTCC 2365

Alignment time is 1.88248 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2089] =>      2089 nucs 'mol-32-2fcd-118472_2089'

Score:        2078
Aligned:      2089        nucs
Identic:      2088 (100%) nucs =>       768 (100%)      1320 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115079346,115080113] EXCISED REGION [115080115,115081435]
 second seq =>  [        1,      768] EXCISED REGION [      769,     2089]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [115080114,115080114]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [115080317,115080317]
 second seq =>         1 nucs [971,971]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [115080114,115080128] to [115080115,115080129]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

115079346 TTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATTATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATT 115079405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATTATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATT 60

115079406 AAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGCAACAACATATGAACTTGAAAGATATAATG 115079465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGCAACAACATATGAACTTGAAAGATATAATG 120

115079466 CTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAAAATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTA 115079525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAAAATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTA 180

115079526 GAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAATTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTA 115079585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAATTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTA 240

115079586 CCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAATGGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACA 115079645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAATGGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACA 300

115079646 GAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTACAGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCT 115079705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTACAGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCT 360

115079706 TCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACAT 115079765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACAT 420

115079766 GCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTT 115079825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTT 480

115079826 AGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGGCTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAAT 115079885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGGCTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAAT 540

115079886 CTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCA 115079945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCA 600

115079946 GGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTTTAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAG 115080005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTTTAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAG 660

115080006 ATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAATAATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTT 115080065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAATAATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTT 720

115080066 GTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCACACACACCAAAATAAGGC 115080113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCACACACACCAAAATAAGGC 768

EXCISED REGION

115080115 AAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAA 115080174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 AAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAA 828

115080175 AATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTC 115080234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 AATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTC 888

115080235 AATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGA 115080294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 AATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGA 948

115080295 GCAAAGGAAATGCTCAGAAACTACCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGA 115080354
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 GCAAAGGAAATGCTCAGAAACTGCCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGA 1008

115080355 ACAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTAC 115080414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 ACAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTAC 1068

115080415 ATAATTTGCCCAAGGTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTG 115080474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 ATAATTTGCCCAAGGTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTG 1128

115080475 ACCTTAAATTTTCTTATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATC 115080534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 ACCTTAAATTTTCTTATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATC 1188

115080535 AATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGT 115080594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 AATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGT 1248

115080595 TTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTC 115080654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTC 1308

115080655 AGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCT 115080714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 AGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCT 1368

115080715 TTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCT 115080774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 TTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCT 1428

115080775 AATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGA 115080834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 AATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGA 1488

115080835 TTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCT 115080894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCT 1548

115080895 TAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCC 115080954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCC 1608

115080955 CTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTT 115081014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 CTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTT 1668

115081015 CTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAA 115081074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 CTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAA 1728

115081075 AAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTT 115081134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 AAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTT 1788

115081135 TATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGA 115081194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGA 1848

115081195 ATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTA 115081254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 ATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTA 1908

115081255 CTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACA 115081314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 CTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACA 1968

115081315 TTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATT 115081374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATT 2028

115081375 TGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGA 115081434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGA 2088

115081435 G 115081435
          |
     2089 G 2089

Alignment time is 1.65099 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2913] =>      2913 nucs 'mol-32-2ff9-255889_2913'

Score:        2901
Aligned:      2912        nucs
Identic:      2911 (100%) nucs =>      1466 (100%)      1445 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115077831,115079296] EXCISED REGION [115079298,115080743]
 second seq =>  [        1,     1466] EXCISED REGION [     1468,     2913]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [115079297,115079297]
 second seq =>         1 nucs [1467,1467]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [115079297,115079298] to [115079298,115079299]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [115079294,115079296] to [115079298,115079300]
 second seq =>         3 nucs [1464,1466] to [1468,1470]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

115077831 GACATTAGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTT 115077890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACATTAGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTT 60

115077891 TGTGGAGCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGC 115077950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGGAGCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGC 120

115077951 TGTGGCAAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAAT 115078010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGGCAAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAAT 180

115078011 ATAAAAAATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAAT 115078070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAAAAATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAAT 240

115078071 AAAGTGAAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAG 115078130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTGAAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAG 300

115078131 TATTAAAAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAAT 115078190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTAAAAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAAT 360

115078191 GCCATCCTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGA 115078250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCATCCTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGA 420

115078251 GGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGA 115078310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGA 480

115078311 TTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTG 115078370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTG 540

115078371 CTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATG 115078430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATG 600

115078431 CTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTA 115078490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTA 660

115078491 CAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAA 115078550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAA 720

115078551 TCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAA 115078610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAA 780

115078611 AACATAAGGTAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAA 115078670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACATAAGGTAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAA 840

115078671 AGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGAT 115078730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGAT 900

115078731 AAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCA 115078790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCA 960

115078791 AACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATG 115078850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATG 1020

115078851 ACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAAT 115078910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAAT 1080

115078911 TAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTT 115078970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTT 1140

115078971 CTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATG 115079030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATG 1200

115079031 TTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATG 115079090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATG 1260

115079091 GATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTA 115079150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTA 1320

115079151 ATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAAGG 115079210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAAGG 1380

115079211 GTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTA 115079270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTA 1440

115079271 TTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTA 115079296
          ||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTA 1466

EXCISED REGION

115079298 TTACACGTAATATTAGACATAATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTA 115079357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TTACACGTAATATTAGACATAATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTA 1527

115079358 CACTTAAAGGGTTACTATTATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAAT 115079417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 CACTTAAAGGGTTACTATTATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAAT 1587

115079418 AGGAAAACCTACCCTTTGCAACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTA 115079477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 AGGAAAACCTACCCTTTGCAACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTA 1647

115079478 AACCAGTCACAGATAGAAAAATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACT 115079537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 AACCAGTCACAGATAGAAAAATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACT 1707

115079538 GCATGATTCTCACTTAGAATTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAG 115079597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 GCATGATTCTCACTTAGAATTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAG 1767

115079598 GTTGGCAAAATGGGTAAATGGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCT 115079657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 GTTGGCAAAATGGGTAAATGGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCT 1827

115079658 GTCACTCAGACTGGAGTACAGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCG 115079717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GTCACTCAGACTGGAGTACAGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCG 1887

115079718 TTCAAGTCTCATGCCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGC 115079777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 TTCAAGTCTCATGCCTCAGCCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGC 1947

115079778 CTGGCTAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGG 115079837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 CTGGCTAGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGG 2007

115079838 TTTCACCATATTAGCCAGGCTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCG 115079897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TTTCACCATATTAGCCAGGCTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCG 2067

115079898 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAA 115079957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAA 2127

115079958 TCAAAAAGATGCGAAGTTTTAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAG 115080017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 TCAAAAAGATGCGAAGTTTTAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAG 2187

115080018 CACGGTGACTATAGTTAATAATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTG 115080077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 CACGGTGACTATAGTTAATAATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTG 2247

115080078 GCTATTGCGTTCTCACCACACACACCAAAATAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGT 115080137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 GCTATTGCGTTCTCACCACACACACCAAAATAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGT 2307

115080138 AAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAAAATCCAATGAACCCATGAAGTGT 115080197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 AAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAAAATCCAATGAACCCATGAAGTGT 2367

115080198 AAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTCAATCATCAGAATGACCTAACTTA 115080257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 AAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTCAATCATCAGAATGACCTAACTTA 2427

115080258 TAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGAGCAAAGGAAATGCTCAGAAACTA 115080317
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2428 TAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGAGCAAAGGAAATGCTCAGAAACTG 2487

115080318 CCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAACAGTTTGGTGATATTTAGTAAA 115080377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 CCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAACAGTTTGGTGATATTTAGTAAA 2547

115080378 GTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACATAATTTGCCCAAGGTTCATGAT 115080437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 GTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACATAATTTGCCCAAGGTTCATGAT 2607

115080438 TATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGACCTTAAATTTTCTTATCCATAC 115080497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGACCTTAAATTTTCTTATCCATAC 2667

115080498 CCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATAGTAAATCCC 115080557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 CCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATAGTAAATCCC 2727

115080558 CAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTA 115080617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 CAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTA 2787

115080618 AGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAA 115080677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 AGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAA 2847

115080678 AATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAA 115080737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 AATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAA 2907

115080738 TACAGT 115080743
          ||||||
     2908 TACAGT 2913

Alignment time is 2.27921 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2253] =>      2253 nucs 'mol-32-3046-016082_2253'

Score:        2241
Aligned:      2252        nucs
Identic:      2251 (100%) nucs =>      1000 (100%)      1251 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115079317,115080316] EXCISED REGION [115080318,115081569]
 second seq =>  [        1,     1000] EXCISED REGION [     1002,     2253]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [115080317,115080317]
 second seq =>         1 nucs [1001,1001]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

115079317 TAATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATT 115079376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATT 60

115079377 ATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGC 115079436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGC 120

115079437 AACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAA 115079496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAA 180

115079497 AATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAA 115079556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAA 240

115079557 TTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAAT 115079616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAAT 300

115079617 GGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTAC 115079676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTAC 360

115079677 AGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAG 115079736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAG 420

115079737 CCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTG 115079796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTG 480

115079797 TTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGG 115079856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGG 540

115079857 CTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 115079916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 600

115079917 TTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTT 115079976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTT 660

115079977 TAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAAT 115080036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAAT 720

115080037 AATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCAC 115080096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCAC 780

115080097 ACACACCAAAATAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAA 115080156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACACACCAAAATAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAA 840

115080157 TAGACTAAAATATTTTAAAATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTAT 115080216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGACTAAAATATTTTAAAATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTAT 900

115080217 AATACTGAATCATTCCTCAATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAA 115080276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATACTGAATCATTCCTCAATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAA 960

115080277 TGTTGGTGCAAATTCAGAGCAAAGGAAATGCTCAGAAACT 115080316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTGGTGCAAATTCAGAGCAAAGGAAATGCTCAGAAACT 1000

EXCISED REGION

115080318 CCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAACAGTTTGGTGATATTTAGTAAA 115080377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 CCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGAACAGTTTGGTGATATTTAGTAAA 1061

115080378 GTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACATAATTTGCCCAAGGTTCATGAT 115080437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 GTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTACATAATTTGCCCAAGGTTCATGAT 1121

115080438 TATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGACCTTAAATTTTCTTATCCATAC 115080497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 TATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTGACCTTAAATTTTCTTATCCATAC 1181

115080498 CCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATAGTAAATCCC 115080557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 CCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATAGTAAATCCC 1241

115080558 CAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTA 115080617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 CAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTA 1301

115080618 AGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAA 115080677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 AGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAA 1361

115080678 AATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAA 115080737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 AATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAA 1421

115080738 TACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTACA 115080797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTACA 1481

115080798 TGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTTCA 115080857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTTCA 1541

115080858 ATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTATGA 115080917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 ATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTATGA 1601

115080918 CTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCTCT 115080977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 CTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCTCT 1661

115080978 AGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTGCC 115081037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 AGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTGCC 1721

115081038 TAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTCAG 115081097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 TAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTCAG 1781

115081098 TTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTGCA 115081157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 TTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTGCA 1841

115081158 TTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTAAG 115081217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTAAG 1901

115081218 CTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGATA 115081277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 CTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGATA 1961

115081278 GTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTG 115081337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTG 2021

115081338 GCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTCAG 115081397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 GCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTCAG 2081

115081398 GTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGAT 115081457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 GTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGAT 2141

115081458 CTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATTTT 115081517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATTTT 2201

115081518 ATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGC 115081569
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 ATTTATTTATTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGC 2253

Alignment time is 1.73657 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2116] =>      2116 nucs 'mol-32-30eb-094889_2116'

Score:        2105
Aligned:      2116        nucs
Identic:      2115 (100%) nucs =>       797 (100%)      1318 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115079317,115080113] EXCISED REGION [115080115,115081433]
 second seq =>  [        1,      797] EXCISED REGION [      798,     2116]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [115080114,115080114]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [115080317,115080317]
 second seq =>         1 nucs [1000,1000]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [115080114,115080128] to [115080115,115080129]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

115079317 TAATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATT 115079376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATT 60

115079377 ATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGC 115079436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGC 120

115079437 AACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAA 115079496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAA 180

115079497 AATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAA 115079556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAA 240

115079557 TTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAAT 115079616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAAT 300

115079617 GGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTAC 115079676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTAC 360

115079677 AGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAG 115079736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAG 420

115079737 CCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTG 115079796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTG 480

115079797 TTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGG 115079856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGG 540

115079857 CTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 115079916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 600

115079917 TTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTT 115079976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTT 660

115079977 TAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAAT 115080036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAAT 720

115080037 AATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCAC 115080096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCAC 780

115080097 ACACACCAAAATAAGGC 115080113
          |||||||||||||||||
      781 ACACACCAAAATAAGGC 797

EXCISED REGION

115080115 AAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAA 115080174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 AAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAA 857

115080175 AATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTC 115080234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 AATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTC 917

115080235 AATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGA 115080294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 AATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGA 977

115080295 GCAAAGGAAATGCTCAGAAACTACCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGA 115080354
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 GCAAAGGAAATGCTCAGAAACTGCCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGA 1037

115080355 ACAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTAC 115080414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 ACAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTAC 1097

115080415 ATAATTTGCCCAAGGTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTG 115080474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 ATAATTTGCCCAAGGTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTG 1157

115080475 ACCTTAAATTTTCTTATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATC 115080534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 ACCTTAAATTTTCTTATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATC 1217

115080535 AATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGT 115080594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 AATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGT 1277

115080595 TTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTC 115080654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 TTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTC 1337

115080655 AGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCT 115080714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 AGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCT 1397

115080715 TTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCT 115080774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCT 1457

115080775 AATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGA 115080834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 AATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGA 1517

115080835 TTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCT 115080894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 TTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCT 1577

115080895 TAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCC 115080954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 TAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCC 1637

115080955 CTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTT 115081014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 CTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTT 1697

115081015 CTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAA 115081074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 CTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAA 1757

115081075 AAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTT 115081134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 AAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTT 1817

115081135 TATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGA 115081194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 TATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGA 1877

115081195 ATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTA 115081254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 ATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTA 1937

115081255 CTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACA 115081314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 CTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACA 1997

115081315 TTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATT 115081374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATT 2057

115081375 TGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAG 115081433
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 TGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAG 2116

Alignment time is 1.61395 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2305] =>      2305 nucs 'mol-32-30eb-103087_2305'

Score:        2304
Aligned:      2304        nucs
Identic:      2304 (100%) nucs =>       947 (100%)      1357 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115080579,115081525] EXCISED REGION [115081528,115082884]
 second seq =>  [        1,      947] EXCISED REGION [      949,     2305]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [115081526,115081527]
 second seq =>         1 nucs [948,948]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [115081523,115081537] to [115081525,115081539]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [115081523,115081525] to [115081528,115081530]
 second seq =>         3 nucs [945,947] to [949,951]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115081526,115081526] to [115081527,115081527]
 second seq =>         0 nucs

115080579 GTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTT 115080638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTT 60

115080639 AACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGA 115080698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGA 120

115080699 CTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTA 115080758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTA 180

115080759 CCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGT 115080818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGT 240

115080819 TGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTT 115080878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTT 300

115080879 GGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTC 115080938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTC 360

115080939 TAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCC 115080998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCC 420

115080999 TTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCC 115081058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCC 480

115081059 TCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGG 115081118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGG 540

115081119 TTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACA 115081178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACA 600

115081179 TCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAA 115081238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAA 660

115081239 AACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCC 115081298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCC 720

115081299 CTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAA 115081358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAA 780

115081359 GAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCA 115081418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCA 840

115081419 AATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTC 115081478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTC 900

115081479 AACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATTTTATTTATTT 115081525
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATTTTATTTATTT 947

EXCISED REGION

115081528 TTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTGA 115081587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 TTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTGA 1008

115081588 TCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 115081647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 TCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 1068

115081648 GAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 115081707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 GAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 1128

115081708 GAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCTG 115081767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 GAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCTG 1188

115081768 CAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCAT 115081827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 CAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCAT 1248

115081828 GGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAAG 115081887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 GGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAAG 1308

115081888 ATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAACA 115081947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 ATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAACA 1368

115081948 TTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGTT 115082007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 TTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGTT 1428

115082008 GATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATTC 115082067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 GATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATTC 1488

115082068 AGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTAG 115082127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 AGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTAG 1548

115082128 CTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAAC 115082187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 CTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAAC 1608

115082188 CCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAGA 115082247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 CCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAGA 1668

115082248 ATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAGG 115082307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 ATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAGG 1728

115082308 GAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTGG 115082367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 GAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTGG 1788

115082368 TGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCAT 115082427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCAT 1848

115082428 GGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAGA 115082487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 GGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAGA 1908

115082488 AAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGAA 115082547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 AAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGAA 1968

115082548 AAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATAA 115082607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 AAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATAA 2028

115082608 AGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGAT 115082667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 AGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGAT 2088

115082668 TTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATGA 115082727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 TTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATGA 2148

115082728 TATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGGT 115082787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 TATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGGT 2208

115082788 ACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCAA 115082847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 ACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCAA 2268

115082848 ACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGAC 115082884
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 ACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGAC 2305

Alignment time is 1.76047 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     7175] =>      7175 nucs 'mol-32-310c-015495_7175'

Score:        6815
Aligned:      7188        nucs
Identic:      7123 ( 99%) nucs =>      3145 ( 99%)      3978 ( 99%)
Gaps:           44 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115076157,115079315] EXCISED REGION [115080677,115084677]
 second seq =>  [        1,     3170] EXCISED REGION [     3174,     7175]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1361 nucs [115079316,115080676]
 second seq =>         3 nucs [3171,3173]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080677,115080677]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080676,115080676]
 second seq =>         0 nucs

115076157 GTGTGTGGCTCTAAATCTTGCTTCTGAAACTTAAAATTGTGTGACCTTGAGAAAGTTCTC 115076216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGTGGCTCTAAATCTTGCTTCTGAAACTTAAAATTGTGTGACCTTGAGAAAGTTCTC 60

115076217 TAAAATCATTGAAACTTTGAGTTTGCCATTAAGAAAGGGGATGGTAATAATATATACTTC 115076276
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAATCATTGAAACTTTGAGTTTGCTATTAAGAAAGGGGATGGTAATAATATATACTTC 120

115076277 ATAAGATTGTTTTCAGTATTGAGTTATTATCTTTGCAATGATTAGAACATTGCCAGGTAT 115076336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAGATTGTTTTCAGTATTGAGTTATTATCTTTGCAATGATTAGAACATTGCCAGGTAT 180

115076337 ATAATAAATGTTCATAAAAATGTGGTTATTGTGAGGAATATTCAGTGAGTCTTTAACTTA 115076396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAATAAATGTTCATAAAAATGTGGTTATTGTGAGGAATATTCAGTGAGTCTTTAACTTA 240

115076397 AAAATTTCAGGTATTATAAACTAAGCCATAACATTTTGTGCTTAAGGTAGATCTGTCACT 115076456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      241 AAAATTTCAGGTATTATAAACTAAGCCATAACATTTTGTGCTTAAGTTAGATCTGTCACT 300

115076457 TCCTGCTTTAACACATGATCTTCTCAAAACTAAAAACAATGTCAAATAAAATAAAAAAGA 115076516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTGCTTTAACACATGATCTTCTCAAAACTAAAAACAATGTCAAATAAAATAAAAAAGA 360

115076517 GAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGAGTCAAAAGT 115076576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGAGTCAAAAGT 420

115076577 AAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCATGGCCAGAGA 115076636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCATGGCCAGAGA 480

115076637 CTTGCAATAAAGGCCAAGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATGGCATACTGA 115076696
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGCAATAAAGGCCAGGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATGGCATACTGA 540

115076697 AGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGATAGTGAATGA 115076756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGATAGTGAATGA 600

115076757 TAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGCGGATTATATATCCAAA 115076816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      601 TAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGTGGATTATATATCCAAA 660

115076817 TATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAACACAACATT 115076876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAACACAACATT 720

115076877 GAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAACTTCAAACAT 115076936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAACTTCAAACAT 780

115076937 ATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAAGGGCTATCT 115076996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAAGGGCTATCT 840

115076997 GGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAAACAAAATGG 115077056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAAACAAAATGG 900

115077057 CTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAATAACATGCT 115077116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAATAACATGCT 960

115077117 AAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAACTTAATTTT 115077176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAACTTAATTTT 1020

115077177 AAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAAAGTGATAGT 115077236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAAAGTGATAGT 1080

115077237 AAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAAGAAGAACAG 115077296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAAGAAGAACAG 1140

115077297 ATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTTATTCTAGTT 115077356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTTATTCTAGTT 1200

115077357 AACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAATGCATTACA 115077416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAATGCATTACA 1260

115077417 GATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGAGAGATTGGT 115077476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGAGAGATTGGT 1320

115077477 CTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAGAGTTACAAT 115077536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAGAGTTACAAT 1380

115077537 GTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAGAAACTAATT 115077596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAGAAACTAATT 1440

115077597 TCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACAC 115077656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACAC 1500

115077657 ATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTT 115077716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTT 1560

115077717 GAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCA 115077776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCA 1620

115077777 ACAGTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATT 115077836
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 A--GTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATT 1678

115077837 AGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGA 115077896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGA 1738

115077897 GCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGC 115077956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGC 1798

115077957 AAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAA 115078016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAA 1858

115078017 AATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTG 115078076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTG 1918

115078077 AAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAA 115078136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAA 1978

115078137 AAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATC 115078196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATC 2038

115078197 CTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGA 115078256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGA 2098

115078257 GAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCC 115078316
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCC 2158

115078317 CTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGC 115078376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGC 2218

115078377 AGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTG 115078436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTG 2278

115078437 CTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTT 115078496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTT 2338

115078497 TTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCC 115078556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCC 2398

115078557 CCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACATA 115078616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     2399 CCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA-- 2456

115078617 AGGT-------------------AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAG 115078657
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 ----ATGTCCAAGAGAAAATCAAAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAG 2512

115078658 TCTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTC 115078717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 TCTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTC 2572

115078718 AAAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAA 115078777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 AAAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAA 2632

115078778 ATACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTT 115078837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 ATACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTT 2692

115078838 ACTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCA 115078897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 ACTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCA 2752

115078898 TCTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAAT 115078957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TCTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAAT 2812

115078958 ACAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTT 115079017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 ACAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTT 2872

115079018 CTGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAA 115079077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 CTGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAA 2932

115079078 GTGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCA 115079137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 GTGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCA 2992

115079138 TTTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCAT 115079197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 TTTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCAT 3052

115079198 GTTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAA 115079257
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GTTGTAGCAAATGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAA 3112

115079258 ACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 ACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 3170

EXCISED REGION

115080677 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 115080736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 3233

115080737 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 115080796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 3293

115080797 ATGCTACA-ATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 115080855
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 ATGCTACACATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 3353

115080856 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 115080915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 3413

115080916 GACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 115080975
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 GGCTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 3473

115080976 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTG 115081035
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3474 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTA 3533

115081036 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 115081095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 3593

115081096 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 115081155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 3653

115081156 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 115081215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 3713

115081216 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 115081275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 3773

115081276 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 115081335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3774 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTCACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 3833

115081336 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 115081395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3834 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTACAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 3893

115081396 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 115081455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 3953

115081456 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 115081515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 4013

115081516 TTATTTATTTTTTT-TTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 115081574
          ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TTATTTATTT----ATTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 4069

115081575 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 115081634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 4129

115081635 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 115081694
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACGGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 4189

115081695 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 115081754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 4249

115081755 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 115081814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 4309

115081815 CACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 115081874
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 CACTTACATGTATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 4369

115081875 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 115081934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 4429

115081935 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 115081994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 4489

115081995 TATGCA-------TGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 115082047
          |||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 TAT---TCATGCGTGCTGTTGATAAAAGG-AAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 4545

115082048 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 115082107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 4605

115082108 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 115082167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 4665

115082168 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 115082227
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTAAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 4725

115082228 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 115082287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 4785

115082288 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 115082347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 4845

115082348 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 115082407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 4905

115082408 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 115082467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 4965

115082468 ATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 115082527
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 ATCATTTGACATTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 5025

115082528 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 115082587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 5085

115082588 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 115082647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 5145

115082648 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 115082707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 5205

115082708 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTT 115082767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5206 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCTGTT 5265

115082768 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 115082827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 5325

115082828 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTC 115082887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTC 5385

115082888 TATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATTGACACATTGTGG 115082947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 TATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATTGACACATTGTGG 5445

115082948 TTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGATGAATCTTATCTA 115083007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5446 TTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGATGAATCTTATCTA 5505

115083008 ATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTATTTTTTTAATATTAAGAGATTTAAAATAA 115083067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 ATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTATTTTTTTAATATTAAGAGATTTAAAATAA 5565

115083068 AACATGTACAAAAATTTGTAGTGAATCTTTAACCTCTAGCTGACATTTAAATTTTATTTT 115083127
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5566 AACATGTACAAAAATTTGTAGTGAATCTTTAACCTCTAGCTGACATTTAAACTTTATTTT 5625

115083128 AAATACAGATGAATCCACACATAATTTCATTCCTGTATATGATAATTGTATATCATATAC 115083187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 AAATACAGATGAATCCACACATAATTTCATTCCTGTATATGATAATTGTATATCATATAC 5685

115083188 ATATACATATATTAACAGAGTTACTGATAATAAACAGGTTAATTTACTTGATAAAAAAGG 115083247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5686 ATATACATATATTAACAGAGTTACTGATAATAAACAGGTTAATTTACTTGATAAAAAAGG 5745

115083248 AAGGCAGCATATAAAACTCAAAATATATTTGTAGATCTCCAGATTCATGAAGAAATATTT 115083307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5746 AAGGCAGCATATAAAACTCAAAATATATTTGTAGATCTCCAGATTCATGAAGAAATATTT 5805

115083308 TGATCATTAGACCATATGGCCTTAATAGATCTTTTAATGCATTCATTTGTTATACTAAAT 115083367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5806 TGATCATTAGACCATATGGCCTTAATAGATCTTTTAATGCATTCATTTGTTATACTAAAT 5865

115083368 AATTATTTAATTTCATTTTTTGTCATGTGTTCTTGCTAGCAAATGACTTTTTTAAAGGTT 115083427
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5866 AATTATTTAATTTCATTTTTTGTCGTGTGTTCTTGCTAGCAAATGACTTTTTTAAAGGTT 5925

115083428 TTATTTACAGCTTATTTTTTAAAAAAATATATTCAATCTTGAACTTGTAGGTGTGCTTTG 115083487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 TTATTTACAGCTTATTTTTTAAAAAAATATATTCAATCTTGAACTTGTAGGTGTGCTTTG 5985

115083488 TTTCCTAAATTAATTTAGTAGACTATTTTCCCATAAAAATAATGTTATAAATATATTGTA 115083547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5986 TTTCCTAAATTAATTTAGTAGACTATTTTCCCATAAAAATAATGTTATAAATATATTGTA 6045

115083548 TTTTCCAGTGTTCATTCTCGAAAACTGAAATAGTCAATGATATTGCTAAATTATAGTAAT 115083607
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6046 TTTTCCAGTGTTAATTCTCGAAAACTGAAATAGTCAATGATATTGCTAAATTATAGTAAT 6105

115083608 AACAATATTGATCTCAGTTCTGGTTCCTTAAATCTCCCAAGAGTATTTTCCTTTGAAAAG 115083667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6106 AACAATATTGATCTCAGTTCTGGTTCCTTAAATCTCCCAAGAGTATTTTCCTTTGAAAAG 6165

115083668 ACAACTCTTATCTATTCAACTGATTTGCTAAGTATTAATATTTCAGAGAGTATAATATAA 115083727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6166 ACAACTCTTATCTATTCAACTGATTTGCTAAGTATTAATATTTCAGAGAGTATAATATAA 6225

115083728 ATGATGTGAATATGTCCAAGGGGCCTTGTGGAAGTAATTTATTGGCATCAAGAACATCAG 115083787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6226 ATGATGTGAATATGTCCAAGGGGCCTTGTGGAAGTAATTTATTGGCATCAAGAACATCAG 6285

115083788 AAGGCAGCCCAGTACCTTTGAATTCTGTACCTAGGGGGGCTTCCCTAAGGTCTTCCTGGT 115083847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6286 AAGGCAGCCCAGTACCTTTGAATTCTGTACCTAGGGGGGCTTCCCTAAGGTCTTCCTGGT 6345

115083848 TTTCATGGATTTTTATACTGTGCTTGGCAGAAGAAGAAAAAGAAGTTGATTATTCAGGAG 115083907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6346 TTTCATGGATTTTTATACTGTGCTTGGCAGAAGAAGAAAAAGAAGTTGATTATTCAGGAG 6405

115083908 CATAAGGATTCTTTGGGAAGTAAACAGATATTTAGGACAGTCAGTCAGAGAAAATGATGG 115083967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6406 CATAAGGATTCTTTGGGAAGTAAACAGATATTTAGGACAGTCAGTCAGAGAAAATGATGG 6465

115083968 CAAGGCCCAAGAGCAGAAGATTGTGGAAGAACAAGCGGCAGATGGCATTAATTTCCATCC 115084027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6466 CAAGGCCCAAGAGCAGAAGATTGTGGAAGAACAAGCGGCAGATGGCATTAATTTCCATCC 6525

115084028 TGACTGGTGGTTTGAGGAAGTACTATTTACATATAAAATAGGAGTTTTTTCAGGGAATTA 115084087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6526 TGACTGGTGGTTTGAGGAAGTACTATTTACATATAAAATAGGAGTTTTTTCAGGGAATTA 6585

115084088 AGGTTCTTTCACAGTCAGTTATTAGATGGTTATTTTACTCATTCATTCAATAGCTCATTC 115084147
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6586 AGGTTCTTTCACAGTCAGTTATTAGATGGTTATTTTACTCATTCATTCAGTAGCTCATTC 6645

115084148 AACAATTGTCAGGCTCCTCCTGTGTGTGGTGCACTGATGTATGGAGGTAATGGAGACAGA 115084207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6646 AACAATTGTCAGGCTCCTCCTGTGTGTGGTGCACTGATGTATGGAGGTAATGGAGACAGA 6705

115084208 CACAACCTGACTTTCACAGTCCATGCAGTTTAACGGAGGAGACAGGAACCTAAACAAGTT 115084267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6706 CACAACCTGACTTTCACAGTCCATGCAGTTTAACGGAGGAGACAGGAACCTAAACAAGTT 6765

115084268 TTTAGAAATGAGCATTTTCTCGAATAGTTTCATATTTACAGGAAAAAAGGAAAGCACCAG 115084327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6766 TTTAGAAATGAGCATTTTCTCGAATAGTTTCATATTTACAGGAAAAAAGGAAAGCACCAG 6825

115084328 TACAAAGAGTACTCATATACTCCATAGCCAGTTTCCCCTAGTATTAACACCTTTATTAGT 115084387
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6826 TACAAAAAGTACTCATATACTCCATAGCCAGTTTCCCCTAGTATTAACACCTTTATTAGT 6885

115084388 CTGATGCATTTGTCACAAGTGCACCAATGAACCAATATTAATATATTATTATTAATTAAT 115084447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6886 CTGATGCATTTGTCACAAGTGCACCAATGAACCAATATTAATATATTATTATTAATTAAT 6945

115084448 GCCCACCCTTGATTCATATTTCTTAGCTTTTATCTAATGTCCTATTTCTAGCCCAGGATC 115084507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6946 GCCCACCCTTGATTCATATTTCTTAGCTTTTATCTAATGTCCTATTTCTAGCCCAGGATC 7005

115084508 ACATCGATGATACCACTTTACATTCATAATACTTGTCGTTTTCTTGCCTATGTGTAAATA 115084567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7006 ACATCGATGATACCACTTTACATTCATAATACTTGTCGTTTTCTTGCCTATGTGTAAATA 7065

115084568 ATAAGCTCTTGGCTGTGAGAGTTTCTCAGAATTAATTTGTTTTTGATGACCTTGAGAGTT 115084627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7066 ATAAGCTCTTGGCTGTGAGAGTTTCTCAGAATTAATTTGTTTTTGATGACCTTGAGAGTT 7125

115084628 TTAAAGGTACTTCATCAGGTATTTTCTAGGATCGCCTCTACTGGGATTTG 115084677
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7126 TTAAAGGTACTTCATCAGGTATTTTTTAGGATCGCCTCTACTGGGATTTG 7175

Alignment time is 5.3901 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3170] =>      3170 nucs 'mol-32-310c-015495_3170'

Score:        3074
Aligned:      3153        nucs
Identic:      3145 (100%) nucs =>      2451 (100%)       694 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115076157,115078614] EXCISED REGION [115078621,115079315]
 second seq =>  [        1,     2456] EXCISED REGION [     2476,     3170]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [115078615,115078620]
 second seq =>        19 nucs [2457,2475]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2456,2457] to [2475,2476]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115078614,115078614] to [115078621,115078621]
 second seq =>         1 nucs [2456,2456] to [2476,2476]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115078615,115078615] to [115078620,115078620]
 second seq =>         1 nucs [2457,2457] to [2475,2475]

115076157 GTGTGTGGCTCTAAATCTTGCTTCTGAAACTTAAAATTGTGTGACCTTGAGAAAGTTCTC 115076216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGTGGCTCTAAATCTTGCTTCTGAAACTTAAAATTGTGTGACCTTGAGAAAGTTCTC 60

115076217 TAAAATCATTGAAACTTTGAGTTTGCCATTAAGAAAGGGGATGGTAATAATATATACTTC 115076276
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAATCATTGAAACTTTGAGTTTGCTATTAAGAAAGGGGATGGTAATAATATATACTTC 120

115076277 ATAAGATTGTTTTCAGTATTGAGTTATTATCTTTGCAATGATTAGAACATTGCCAGGTAT 115076336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAGATTGTTTTCAGTATTGAGTTATTATCTTTGCAATGATTAGAACATTGCCAGGTAT 180

115076337 ATAATAAATGTTCATAAAAATGTGGTTATTGTGAGGAATATTCAGTGAGTCTTTAACTTA 115076396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAATAAATGTTCATAAAAATGTGGTTATTGTGAGGAATATTCAGTGAGTCTTTAACTTA 240

115076397 AAAATTTCAGGTATTATAAACTAAGCCATAACATTTTGTGCTTAAGGTAGATCTGTCACT 115076456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      241 AAAATTTCAGGTATTATAAACTAAGCCATAACATTTTGTGCTTAAGTTAGATCTGTCACT 300

115076457 TCCTGCTTTAACACATGATCTTCTCAAAACTAAAAACAATGTCAAATAAAATAAAAAAGA 115076516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTGCTTTAACACATGATCTTCTCAAAACTAAAAACAATGTCAAATAAAATAAAAAAGA 360

115076517 GAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGAGTCAAAAGT 115076576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGAGTCAAAAGT 420

115076577 AAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCATGGCCAGAGA 115076636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCATGGCCAGAGA 480

115076637 CTTGCAATAAAGGCCAAGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATGGCATACTGA 115076696
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGCAATAAAGGCCAGGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATGGCATACTGA 540

115076697 AGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGATAGTGAATGA 115076756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGATAGTGAATGA 600

115076757 TAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGCGGATTATATATCCAAA 115076816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      601 TAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGTGGATTATATATCCAAA 660

115076817 TATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAACACAACATT 115076876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAACACAACATT 720

115076877 GAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAACTTCAAACAT 115076936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAACTTCAAACAT 780

115076937 ATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAAGGGCTATCT 115076996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAAGGGCTATCT 840

115076997 GGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAAACAAAATGG 115077056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAAACAAAATGG 900

115077057 CTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAATAACATGCT 115077116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAATAACATGCT 960

115077117 AAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAACTTAATTTT 115077176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAACTTAATTTT 1020

115077177 AAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAAAGTGATAGT 115077236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAAAGTGATAGT 1080

115077237 AAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAAGAAGAACAG 115077296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAAGAAGAACAG 1140

115077297 ATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTTATTCTAGTT 115077356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTTATTCTAGTT 1200

115077357 AACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAATGCATTACA 115077416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAATGCATTACA 1260

115077417 GATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGAGAGATTGGT 115077476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGAGAGATTGGT 1320

115077477 CTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAGAGTTACAAT 115077536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAGAGTTACAAT 1380

115077537 GTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAGAAACTAATT 115077596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAGAAACTAATT 1440

115077597 TCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACAC 115077656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACAC 1500

115077657 ATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTT 115077716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTT 1560

115077717 GAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCA 115077776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCA 1620

115077777 ACAGTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATT 115077836
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 A--GTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATT 1678

115077837 AGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGA 115077896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGA 1738

115077897 GCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGC 115077956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGC 1798

115077957 AAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAA 115078016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAA 1858

115078017 AATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTG 115078076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTG 1918

115078077 AAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAA 115078136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAA 1978

115078137 AAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATC 115078196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATC 2038

115078197 CTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGA 115078256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGA 2098

115078257 GAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCC 115078316
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCC 2158

115078317 CTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGC 115078376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGC 2218

115078377 AGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTG 115078436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTG 2278

115078437 CTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTT 115078496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTT 2338

115078497 TTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCC 115078556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCC 2398

115078557 CCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA 115078614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA 2456

EXCISED REGION

115078621 AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACCTAAAT 115078680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACCTAAAT 2535

115078681 GTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAACAGTAT 115078740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAACAGTAT 2595

115078741 CTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTAAGAAC 115078800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 CTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTAAGAAC 2655

115078801 AAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATGACAAAATTTT 115078860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 AAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATGACAAAATTTT 2715

115078861 TAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATTACTCT 115078920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 TAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATTACTCT 2775

115078921 CTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGTTATAT 115078980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 CTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGTTATAT 2835

115078981 ATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCATTGTAG 115079040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 ATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCATTGTAG 2895

115079041 ACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTAATACA 115079100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 ACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTAATACA 2955

115079101 TAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTAATAACCAATC 115079160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTAATAACCAATC 3015

115079161 ATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTC 115079220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3016 ATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAATGGTAGGCTTTC 3075

115079221 CTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAG 115079280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 CTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAG 3135

115079281 GTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 GTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 3170

Alignment time is 2.4166 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     9731] =>      9731 nucs 'mol-32-3240-102475_9731'

Score:        9162
Aligned:      9750        nucs
Identic:      9654 ( 99%) nucs =>      4160 ( 99%)      5494 ( 99%)
Gaps:           60 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115075137,115079315] EXCISED REGION [115080677,115086209]
 second seq =>  [        1,     4190] EXCISED REGION [     4194,     9731]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1361 nucs [115079316,115080676]
 second seq =>         3 nucs [4191,4193]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080677,115080677]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080676,115080676]
 second seq =>         0 nucs

115075137 ACTTTTCCTAAAGCATATAAAAGCTTAGAATTGTTTAGAGACTATATGGAAAAAACTCAG 115075196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTTTCCTAAAGCATATAAAAGCTTAGAATTGTTTAGAGACTATATGGAAAAAACTCAG 60

115075197 TAAGCATTCAAAATACGAAAGAATATAGCATTGCATATTGTATATTTGGATCTTGGTTTG 115075256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGCATTCAAAATACGAAAGAATATAGCATTGCATATTGTATATTTGGATCTTGGTTTG 120

115075257 ACAACTTGGGTTGACATAATGAATTCTAAAATAGTATAATTAGCAAATAAAAACCAAACA 115075316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAACTTGGGTTGACATAATGAATTCTAAAATAGTATAATTAGCAAATAAAAACCAAACA 180

115075317 TTTCAAATAAAAATGGACCTCAAATATGTTCAGTAACATGCCTCGAGTCAAATAGTTAAA 115075376
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      181 TTTCAAATAAAAATGGACCTCAAATATGTTCAGTAACATGCCTTGAGTCAAATAGTTAAA 240

115075377 TATTAGGCAAAGTTAAGTTTGGAATATATTCTCCATTCCTTTCTTTCTTTAGATACAACT 115075436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTAGGCAAAGTTAAGTTTGGAATATATTCTCCATTCCTTTCTTTCTTTAGATACAACT 300

115075437 GTGGAGTCTTTTTAGATATTATGGTGAAGTCTTAGTACCATAAGTAGTACATTAATTGTT 115075496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGGAGTCTTTTTAGATATTATGGTGAAGTCTTAGTACCATAAGTAGTACATTAATTGTT 360

115075497 CTATTTCTTAAATTAATTGATCCCCAGGATTTAGCATGCTTATATATGATATATGGGCTT 115075556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATTTCTTAAATTAATTGATCCCCAGGATTTAGCATGCTTATATATGATATATGGGCTT 420

115075557 AGAAACCTACCTGAAAATTCAGTCATAATAAACTTTATGAAAGTCTGATACACAATGTGT 115075616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAACCTACCTGAAAATTCAGTCATAATAAACTTTATGAAAGTCTGATACACAATGTGT 480

115075617 TTATAGCTGTCATTCACCCAGCAAATAGTTACTGGGAGTGGAGGTTGAATCTCCAAGTAT 115075676
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATAGCTGTCATTCACCCAGCAAATAGTTACTAGGAGTGGAGGTTGAATCTCCAAGTAT 540

115075677 AATACATGAACTCCCAGGCTGTCGAACCCATGCATGTCAGAAATGCAGTCATACAAAATT 115075736
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      541 AATACATGAACTCCCAGGCTGTCGAGCCCATGCATGTCAGAAATGCAGTCATACGAAATT 600

115075737 TTTGTGCTTTCAGAATATACTGCATAACTCACCTTCACCTTCAGGCATCCTTTCGATGGA 115075796
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTATGCTTTCAGAATATACTGCATAACTCACCTTCACCTTCAGGCATCCTTTCGATGGA 660

115075797 TTCACAAAGCTGGAAGAGAAATTTGTTCATTCTGATAGTCAGCCATCCCGCAAGTAATGT 115075856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCACAAAGCTGGAAGAGAAATTTGTTCATTCTGATAGTCAGCCATCCCGCAAGTAATGT 720

115075857 GCATTGGGAGATGAAGTTAAGTAGAAAGAGCTTATTCTCCTCTAGGCATATAACATAATT 115075916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCATTGGGAGATGAAGTTAAGTAGAAAGAGCTTATTCTCCTCTAGGCATATAACATAATT 780

115075917 GCTTTTTTCCTTCTTTCAACCACTGTTAAAGGAGCATAGAGTTTTTGGCATAAACTATGT 115075976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTTTTTTCCTTCTTTCAACCACTGTTAAAGGAGCATAGAGTTTTTGGCATAAACTATGT 840

115075977 TGCAAACAGTTCATAAAGAATATAATAAGCATGCCACTTTGTCACGGTATGAAGACCAAA 115076036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAAACAGTTCATAAAGAATATAATAAGCATGCCACTTTGTCACGGTATGAAGACCAAA 900

115076037 TAAATGTTTTCAAAATAAAGCAATCGGTGTTTATTTCTTGCCTAATGCAACATAGATTTT 115076096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAATGTTTTCAAAATAAAGCAATCGGTGTTTATTTCTTGCCTAATGCAACATAGATTTT 960

115076097 AGAGTCTTCCAAGGCATGTGATGTTTGTTTTAGCAAAATGGATAAGTACATGGAATCACA 115076156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGTCTTCCAAGGCATGTGATGTTTGTTTTAGCAAAATGGATAAGTACATGGAATCACA 1020

115076157 GTGTGTGGCTCTAAATCTTGCTTCTGAAACTTAAAATTGTGTGACCTTGAGAAAGTTCTC 115076216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGTGTGGCTCTAAATCTTGCTTCTGAAACTTAAAATTGTGTGACCTTGAGAAAGTTCTC 1080

115076217 TAAAATCATTGAAACTTTGAGTTTGCCATTAAGAAAGGGGATGGTAATAATATATACTTC 115076276
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAAATCATTGAAACTTTGAGTTTGCTATTAAGAAAGGGGATGGTAATAATATATACTTC 1140

115076277 ATAAGATTGTTTTCAGTATTGAGTTATTATCTTTGCAATGATTAGAACATTGCCAGGTAT 115076336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAAGATTGTTTTCAGTATTGAGTTATTATCTTTGCAATGATTAGAACATTGCCAGGTAT 1200

115076337 ATAATAAATGTTCATAAAAATGTGGTTATTGTGAGGAATATTCAGTGAGTCTTTAACTTA 115076396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAATAAATGTTCATAAAAATGTGGTTATTGTGAGGAATATTCAGTGAGTCTTTAACTTA 1260

115076397 AAAATTTCAGGTATTATAAACTAAGCCATAACATTTTGTGCTTAAGGTAGATCTGTCACT 115076456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1261 AAAATTTCAGGTATTATAAACTAAGCCATAACATTTTGTGCTTAAGTTAGATCTGTCACT 1320

115076457 TCCTGCTTTAACACATGATCTTCTCAAAACTAAAAACAATGTCAAATAAAATAAAAAAGA 115076516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTGCTTTAACACATGATCTTCTCAAAACTAAAAACAATGTCAAATAAAATAAAAAAGA 1380

115076517 GAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGAGTCAAAAGT 115076576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGAGTCAAAAGT 1440

115076577 AAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCATGGCCAGAGA 115076636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCATGGCCAGAGA 1500

115076637 CTTGCAATAAAGGCCAAGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATGGCATACTGA 115076696
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTGCAATAAAGGCCAGGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATGGCATACTGA 1560

115076697 AGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGATAGTGAATGA 115076756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGATAGTGAATGA 1620

115076757 TAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGCGGATTATATATCCAAA 115076816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1621 TAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGTGGATTATATATCCAAA 1680

115076817 TATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAACACAACATT 115076876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAACACAACATT 1740

115076877 GAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAACTTCAAACAT 115076936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAACTTCAAACAT 1800

115076937 ATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAAGGGCTATCT 115076996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAAGGGCTATCT 1860

115076997 GGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAAACAAAATGG 115077056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAAACAAAATGG 1920

115077057 CTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAATAACATGCT 115077116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAATAACATGCT 1980

115077117 AAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAACTTAATTTT 115077176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAACTTAATTTT 2040

115077177 AAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAAAGTGATAGT 115077236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAAAGTGATAGT 2100

115077237 AAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAAGAAGAACAG 115077296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAAGAAGAACAG 2160

115077297 ATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTTATTCTAGTT 115077356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTTATTCTAGTT 2220

115077357 AACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAATGCATTACA 115077416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAATGCATTACA 2280

115077417 GATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGAGAGATTGGT 115077476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGAGAGATTGGT 2340

115077477 CTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAGAGTTACAAT 115077536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAGAGTTACAAT 2400

115077537 GTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAGAAACTAATT 115077596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAGAAACTAATT 2460

115077597 TCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACAC 115077656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACAC 2520

115077657 ATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTT 115077716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTT 2580

115077717 GAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCA 115077776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCA 2640

115077777 ACAGTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATT 115077836
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 A--GTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATT 2698

115077837 AGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGA 115077896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGA 2758

115077897 GCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGC 115077956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGC 2818

115077957 AAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAA 115078016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAA 2878

115078017 AATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTG 115078076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTG 2938

115078077 AAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAA 115078136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAA 2998

115078137 AAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATC 115078196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATC 3058

115078197 CTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGA 115078256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGA 3118

115078257 GAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCC 115078316
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCC 3178

115078317 CTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGC 115078376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGC 3238

115078377 AGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTG 115078436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTG 3298

115078437 CTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTT 115078496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 CTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTT 3358

115078497 TTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCC 115078556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCC 3418

115078557 CCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACATA 115078616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     3419 CCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA-- 3476

115078617 AGGT-------------------AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAG 115078657
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ----ATGTCCAAGAGAAAATCAAAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAG 3532

115078658 TCTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTC 115078717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 TCTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTC 3592

115078718 AAAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAA 115078777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 AAAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAA 3652

115078778 ATACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTT 115078837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 ATACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTT 3712

115078838 ACTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCA 115078897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 ACTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCA 3772

115078898 TCTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAAT 115078957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TCTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAAT 3832

115078958 ACAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTT 115079017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 ACAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTT 3892

115079018 CTGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAA 115079077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 CTGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAA 3952

115079078 GTGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCA 115079137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GTGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCA 4012

115079138 TTTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCAT 115079197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TTTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCAT 4072

115079198 GTTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAA 115079257
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 GTTGTAGCAAATGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAA 4132

115079258 ACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 ACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 4190

EXCISED REGION

115080677 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 115080736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 4253

115080737 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 115080796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 4313

115080797 ATGCTACA-ATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 115080855
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 ATGCTACACATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 4373

115080856 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 115080915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 4433

115080916 GACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 115080975
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 GGCTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 4493

115080976 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTG 115081035
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4494 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTA 4553

115081036 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 115081095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 4613

115081096 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 115081155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 4673

115081156 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 115081215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 4733

115081216 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 115081275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 4793

115081276 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 115081335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4794 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTCACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 4853

115081336 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 115081395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4854 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTACAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 4913

115081396 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 115081455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 4973

115081456 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 115081515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 5033

115081516 TTATTTATTTTTTT-TTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 115081574
          ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 TTATTTATTT----ATTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 5089

115081575 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 115081634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 5149

115081635 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 115081694
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5150 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACGGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 5209

115081695 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 115081754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 5269

115081755 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 115081814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 5329

115081815 CACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 115081874
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 CACTTACATGTATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 5389

115081875 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 115081934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5390 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 5449

115081935 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 115081994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5450 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 5509

115081995 TATGCA-------TGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 115082047
          |||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 TAT---TCATGCGTGCTGTTGATAAAAGG-AAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 5565

115082048 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 115082107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 5625

115082108 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 115082167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 5685

115082168 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 115082227
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5686 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTAAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 5745

115082228 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 115082287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5746 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 5805

115082288 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 115082347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5806 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 5865

115082348 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 115082407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5866 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 5925

115082408 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 115082467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 5985

115082468 ATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 115082527
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5986 ATCATTTGACATTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 6045

115082528 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 115082587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6046 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 6105

115082588 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 115082647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6106 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 6165

115082648 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 115082707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6166 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 6225

115082708 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTT 115082767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6226 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCTGTT 6285

115082768 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 115082827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6286 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 6345

115082828 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTC 115082887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6346 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTC 6405

115082888 TATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATTGACACATTGTGG 115082947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6406 TATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATTGACACATTGTGG 6465

115082948 TTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGATGAATCTTATCTA 115083007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6466 TTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGATGAATCTTATCTA 6525

115083008 ATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTATTTTTTTAATATTAAGAGATTTAAAATAA 115083067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6526 ATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTATTTTTTTAATATTAAGAGATTTAAAATAA 6585

115083068 AACATGTACAAAAATTTGTAGTGAATCTTTAACCTCTAGCTGACATTTAAATTTTATTTT 115083127
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6586 AACATGTACAAAAATTTGTAGTGAATCTTTAACCTCTAGCTGACATTTAAACTTTATTTT 6645

115083128 AAATACAGATGAATCCACACATAATTTCATTCCTGTATATGATAATTGTATATCATATAC 115083187
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6646 AAATACAGATTAATCCACACATAATTTCATTCCTGTATATGATAATTGTATATCATATAC 6705

115083188 ATATACATATATTAACAGAGTTACTGATAATAAACAGGTTAATTTACTTGATAAAAAAGG 115083247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6706 ATATACATATATTAACAGAGTTACTGATAATAAACAGGTTAATTTACTTGATAAAAAAGG 6765

115083248 AAGGCAGCATATAAAACTCAAAATATATTTGTAGATCTCCAGATTCATGAAGAAATATTT 115083307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6766 AAGGCAGCATATAAAACTCAAAATATATTTGTAGATCTCCAGATTCATGAAGAAATATTT 6825

115083308 TGATCATTAGACCATATGGCCTTAATAGATCTTTTAATGCATTCATTTGTTATACTAAAT 115083367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6826 TGATCATTAGACCATATGGCCTTAATAGATCTTTTAATGCATTCATTTGTTATACTAAAT 6885

115083368 AATTATTTAATTTCATTTTTTGTCATGTGTTCTTGCTAGCAAATGACTTTTTTAAAGGTT 115083427
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6886 AATTATTTAATTTCATTTTTTGTCGTGTGTTCTTGCTAGCAAATGACTTTTTTAAAGGTT 6945

115083428 TTATTTACAGCTTATTTTTTAAAAAAATATATTCAATCTTGAACTTGTAGGTGTGCTTTG 115083487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6946 TTATTTACAGCTTATTTTTTAAAAAAATATATTCAATCTTGAACTTGTAGGTGTGCTTTG 7005

115083488 TTTCCTAAATTAATTTAGTAGACTATTTTCCCATAAAAATAATGTTATAAATATATTGTA 115083547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7006 TTTCCTAAATTAATTTAGTAGACTATTTTCCCATAAAAATAATGTTATAAATATATTGTA 7065

115083548 TTTTCCAGTGTTCATTCTCGAAAACTGAAATAGTCAATGATATTGCTAAATTATAGTAAT 115083607
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7066 TTTTCCAGTGTTAATTCTCGAAAACTGAAATAGTCAATGATATTGCTAAATTATAGTAAT 7125

115083608 AACAATATTGATCTCAGTTCTGGTTCCTTAAATCTCCCAAGAGTATTTTCCTTTGAAAAG 115083667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7126 AACAATATTGATCTCAGTTCTGGTTCCTTAAATCTCCCAAGAGTATTTTCCTTTGAAAAG 7185

115083668 ACAACTCTTATCTATTCAACTGATTTGCTAAGTATTAATATTTCAGAGAGTATAATATAA 115083727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7186 ACAACTCTTATCTATTCAACTGATTTGCTAAGTATTAATATTTCAGAGAGTATAATATAA 7245

115083728 ATGATGTGAATATGTCCAAGGGGCCTTGTGGAAGTAATTTATTGGCATCAAGAACATCAG 115083787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7246 ATGATGTGAATATGTCCAAGGGGCCTTGTGGAAGTAATTTATTGGCATCAAGAACATCAG 7305

115083788 AAGGCAGCCCAGTACCTTTGAATTCTGTACCTAGGGGGGCTTCCCTAAGGTCTTCCTGGT 115083847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7306 AAGGCAGCCCAGTACCTTTGAATTCTGTACCTAGGGGGGCTTCCCTAAGGTCTTCCTGGT 7365

115083848 TTTCATGGATTTTTATACTGTGCTTGGCAGAAGAAGAAAAAGAAGTTGATTATTCAGGAG 115083907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7366 TTTCATGGATTTTTATACTGTGCTTGGCAGAAGAAGAAAAAGAAGTTGATTATTCAGGAG 7425

115083908 CATAAGGATTCTTTGGGAAGTAAACAGATATTTAGGACAGTCAGTCAGAGAAAATGATGG 115083967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7426 CATAAGGATTCTTTGGGAAGTAAACAGATATTTAGGACAGTCAGTCAGAGAAAATGATGG 7485

115083968 CAAGGCCCAAGAGCAGAAGATTGTGGAAGAACAAGCGGCAGATGGCATTAATTTCCATCC 115084027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7486 CAAGGCCCAAGAGCAGAAGATTGTGGAAGAACAAGCGGCAGATGGCATTAATTTCCATCC 7545

115084028 TGACTGGTGGTTTGAGGAAGTACTATTTACATATAAAATAGGAGTTTTTTCAGGGAATTA 115084087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7546 TGACTGGTGGTTTGAGGAAGTACTATTTACATATAAAATAGGAGTTTTTTCAGGGAATTA 7605

115084088 AGGTTCTTTCACAGTCAGTTATTAGATGGTTATTTTACTCATTCATTCAATAGCTCATTC 115084147
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     7606 AGGTTCTTTCACAGTCAGTTATTAGATGGTTATTTTACTCATTCATTCAGTAGCTCATTC 7665

115084148 AACAATTGTCAGGCTCCTCCTGTGTGTGGTGCACTGATGTATGGAGGTAATGGAGACAGA 115084207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7666 AACAATTGTCAGGCTCCTCCTGTGTGTGGTGCACTGATGTATGGAGGTAATGGAGACAGA 7725

115084208 CACAACCTGACTTTCACAGTCCATGCAGTTTAACGGAGGAGACAGGAACCTAAACAAGTT 115084267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7726 CACAACCTGACTTTCACAGTCCATGCAGTTTAACGGAGGAGACAGGAACCTAAACAAGTT 7785

115084268 TTTAGAAATGAGCATTTTCTCGAATAGTTTCATATTTACAGGAAAAAAGGAAAGCACCAG 115084327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7786 TTTAGAAATGAGCATTTTCTCGAATAGTTTCATATTTACAGGAAAAAAGGAAAGCACCAG 7845

115084328 TACAAAGAGTACTCATATACTCCATAGCCAGTTTCCCCTAGTATTAACACCTTTATTAGT 115084387
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7846 TACAAAAAGTACTCATATACTCCATAGCCAGTTTCCCCTAGTATTAACACCTTTATTAGT 7905

115084388 CTGATGCATTTGTCACAAGTGCACCAATGAACCAATATTAATATATTATTATTAATTAAT 115084447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7906 CTGATGCATTTGTCACAAGTGCACCAATGAACCAATATTAATATATTATTATTAATTAAT 7965

115084448 GCCCACCCTTGATTCATATTTCTTAGCTTTTATCTAATGTCCTATTTCTAGCCCAGGATC 115084507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7966 GCCCACCCTTGATTCATATTTCTTAGCTTTTATCTAATGTCCTATTTCTAGCCCAGGATC 8025

115084508 ACATCGATGATACCACTTTACATTCATAATACTTGTCGTTTTCTTGCCTATGTGTAAATA 115084567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8026 ACATCGATGATACCACTTTACATTCATAATACTTGTCGTTTTCTTGCCTATGTGTAAATA 8085

115084568 ATAAGCTCTTGGCTGTGAGAGTTTCTCAGAATTAATTTGTTTTTGATGACCTTGAGAGTT 115084627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8086 ATAAGCTCTTGGCTGTGAGAGTTTCTCAGAATTAATTTGTTTTTGATGACCTTGAGAGTT 8145

115084628 TTAAAGGTACTTCATCAGGTATTTTCTAGGATCGCCTCTACTGGGATTTGTCTTTCTTCT 115084687
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8146 TTAAAGGTACTTCATCAGGTATTTTTTAGGATCGCCTCTACTGGGATTTGTCTTTCTTCT 8205

115084688 TCAAATAATTATTCAAGGGTTATGAGTTTTTGGAAACAGGACTGCAGAGGTAAAGTGTCA 115084747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8206 TCAAATAATTATTCAAGGGTTATGAGTTTTTGGAAACAGGACTGCAGAGGTAAAGTGTCA 8265

115084748 TTTTTATTACATCCTATGAAGGGAATGCACTACCAATATGCCTTCTTATTGTTGATATTA 115084807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     8266 TTTTTATTACATCCTATGAAGGGAATGCACTATCAATATGCCTTCTTATTGTTGATATTA 8325

115084808 AACTTGATCATTTGGCTGAAGTAGTGTCTGTCACCTTTTTCCATTATAAGTGACCTTTTT 115084867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8326 AACTTGATCATTTGGCTGAAGTAGTGTCTGTCACCTTTTTCCATTATAAGTGACCTTTTT 8385

115084868 TACCTTTTCTATACTGTACTATTTAGAGGGAAATGACTATAAATAGGCTTTTAATCATAA 115084927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8386 TACCTTTTCTATACTGTACTATTTAGAGGGAAATGACTATAAATAGGCTTTTAATCATAA 8445

115084928 CATGGGAAGAGGAATGAGGTAAGAAGCAGTGCTTAGATAGGGAATTTGTACAGGGAGTTG 115084987
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8446 CGTGGGAAGAGGAATGAGGTAAGAAGCAGTGCTTAGATAGGGAATTTGTACAGGGAGTTG 8505

115084988 TGAAAATGTATAGGAGGATGAAATAGCATGGCCACTGACAACAGGAAATGCCCCTCTTAA 115085047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8506 TGAAAATGTATAGGAGGATGAAATAGCATGGCCACTGACAACAGGAAATGCCCCTCTTAA 8565

115085048 GATGTCATACTTTACTGACTCTGAAGAATCAAAATTCATTAGTCAAATAACAGTGTGAAA 115085107
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     8566 GATGTCATACTTTACTGACTCTGAAGAATCAAACTTCATTAGTCAAATAACAGTGTGAAA 8625

115085108 TGGAGGGAGCAGAATTAGTGTGCAAAGACATTGGATGGTTTTAGTGTTTTCAGCACCTCT 115085167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8626 TGGAGGGAGCAGAATTAGTGTGCAAAGACATTGGATGGTTTTAGTGTTTTCAGCACCTCT 8685

115085168 TGTTTATCTAATGATCTCTACAAATTATAAAAAGTTAACCTTCAGCCCAAATTATAAAAA 115085227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8686 TGTTTATCTAATGATCTCTACAAATTATAAAAAGTTAACCTTCAGCCCAAATTATAAAAA 8745

115085228 GCTAACCTTCAGCCCAAATTTTAACTTGACGTTTTATATTCCAAATAATTGCCATAATTG 115085287
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     8746 GCTAACCTTCAGCCCAAATTTTAACTTGACATTTTATATTCCAAATAATTGCCATAATTG 8805

115085288 TTTTTCTATCAAAATAATATGTTGTACCACATGTGTGTATATTTGCCTCATACATTATAT 115085347
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     8806 TTTTTCTATCAAAATAATATGTTGTACCACATGTGTGTATATTTGTCTCATACATTATAT 8865

115085348 TTTATTTCATAGAAAAATGTTGCTGTGAAAATCAAGCAAATAATTGCCATTTGCAAGTGT 115085407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8866 TTTATTTCATAGAAAAATGTTGCTGTGAAAATCAAGCAAATAATTGCCATTTGCAAGTGT 8925

115085408 TTCTACACAATTCTGTCTATTCTTCATAATTTTTAGAGGCAGGTGTTATTCCTGGTATTT 115085467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8926 TTCTACACAATTCTGTCTATTCTTCATAATTTTTAGAGGCAGGTGTTATTCCTGGTGTTT 8985

115085468 TGAAAGAATAGCTGATAACCAGTAGGAAAGGAAAGTGATTGATGCTGTACAAATGGTGGG 115085527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8986 TGAAAGAATAGCTGATAACCAGTAGGAAAGGAAAGTGATTGATGCTGTACAAATGGTGGG 9045

115085528 TGTGGAAGTGGAGGTGACCTAAATATATTGTTCTAATTCATTCTTATTTGACCCCTGTGT 115085587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9046 TGTGGAAGTGGAGGTGACCTAAATATATTGTTCTAATTCATTCTTATTTGACCCCTGTGT 9105

115085588 CTTAGTCCATTTGAGATGCTATATCA-----AAATGCTATAAACTGGGTAGCTTACAAAC 115085642
          ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||
     9106 CTTAGTCCATTTGAGATGCTATATCAAAATGAAATGCTATAAACTGGGTAGCTTACAAAC 9165

115085643 AACTAACATTTATTTATCACAGTTTTGGGGCCTGGGATGAAAAAAATCAAGGCAACACCA 115085702
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     9166 AACTAACATTTATTTATCACAGTTTTGGAGCCTGGGATGAAAAAAATCAAGGCAACACCA 9225

115085703 GATTCAATGCCTGGTAAGGGCCTGCTTCCTCAAAGGCAGAGC-----CTTCCTCCTGTAG 115085757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||
     9226 GATTCAATGCCTGGTAAGGGCCTGCTTCCTCAAAGG------GCCTGCTTCCTCCTGTAG 9279

115085758 CCTAACATTGTGAAAGGAGCAGGCAGCCCTCTGGGACCTCTTTAAAAAGAGAGCTAATCT 115085817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9280 CCTAACATTGTGAAAGGAGCAGGCAGCCCTCTGGGACCTCTTTAAAAAGAGAGCTAATCT 9339

115085818 CATTCACGAGGCCTCCACCCTGATGAACTAATCACCTCCCAAATGCCCGACCTTCTAATA 115085877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     9340 CATTCACGAGGCCTCCACCCTGATGAACTAATCACCTCCCAAATGCCCAACCTTCTAATA 9399

115085878 CATTGCTTTGGTAATTAGGTTTCAACATAAGAATTTTTGGAGGACATAAACATTCAGACC 115085937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9400 CATTGCTTTGGTAATTAGGTTTCAACATAAGAATTTTTGGAGGACATAAACATTCAGACC 9459

115085938 ACAGAACTCTATAAACCAGACAGAGACGAATACCATGGAAAAATAAAATGAGGGGAAATT 115085997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9460 ACAGAACTCTATAAACCAGACAGAGACGAATACCATGGAAAAATAAAATGAGGGGAAATT 9519

115085998 AGTAATTGTCAAAATTTATAATTGTTCAGCCATTCAGGAAGTGTTGAATATATTGAGAAG 115086057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9520 AGTAATTGTCAAAATTTATAATTGTTCAGCCATTCAGGAAGTGTTGAATATATTGAGAAG 9579

115086058 CTACTATGAGGTAGGCATAGTCTTATTTGTTGGAGTTAATATGACAGGCATAATCAGACA 115086117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     9580 CTACTATGAGGTAGGCATAGTCTTATTTGTTGGAGTTAGTATGACAGGCATAATCAGACA 9639

115086118 CAGCCTGAGGGACTTTAATATTCTAAATACAAATATACCTAACGGACTTGGTTTTAGCAT 115086177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9640 CAGCCTGAGGGACTTTAATATTCTAAATACAAATATACCTAACGGACTTGGTTTTAGCAT 9699

115086178 TCTACTACTTAGCTACCTATGTAGACTTAAGT 115086209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     9700 TCTACTACTTAGCTACCTATGTAGACTTAAGT 9731

Alignment time is 7.31242 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4190] =>      4190 nucs 'mol-32-3240-102475_4190'

Score:        4039
Aligned:      4173        nucs
Identic:      4160 (100%) nucs =>      3466 (100%)       694 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115075137,115078614] EXCISED REGION [115078621,115079315]
 second seq =>  [        1,     3476] EXCISED REGION [     3496,     4190]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [115078615,115078620]
 second seq =>        19 nucs [3477,3495]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3476,3477] to [3495,3496]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115078614,115078614] to [115078621,115078621]
 second seq =>         1 nucs [3476,3476] to [3496,3496]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115078615,115078615] to [115078620,115078620]
 second seq =>         1 nucs [3477,3477] to [3495,3495]

115075137 ACTTTTCCTAAAGCATATAAAAGCTTAGAATTGTTTAGAGACTATATGGAAAAAACTCAG 115075196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTTTCCTAAAGCATATAAAAGCTTAGAATTGTTTAGAGACTATATGGAAAAAACTCAG 60

115075197 TAAGCATTCAAAATACGAAAGAATATAGCATTGCATATTGTATATTTGGATCTTGGTTTG 115075256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGCATTCAAAATACGAAAGAATATAGCATTGCATATTGTATATTTGGATCTTGGTTTG 120

115075257 ACAACTTGGGTTGACATAATGAATTCTAAAATAGTATAATTAGCAAATAAAAACCAAACA 115075316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAACTTGGGTTGACATAATGAATTCTAAAATAGTATAATTAGCAAATAAAAACCAAACA 180

115075317 TTTCAAATAAAAATGGACCTCAAATATGTTCAGTAACATGCCTCGAGTCAAATAGTTAAA 115075376
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      181 TTTCAAATAAAAATGGACCTCAAATATGTTCAGTAACATGCCTTGAGTCAAATAGTTAAA 240

115075377 TATTAGGCAAAGTTAAGTTTGGAATATATTCTCCATTCCTTTCTTTCTTTAGATACAACT 115075436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTAGGCAAAGTTAAGTTTGGAATATATTCTCCATTCCTTTCTTTCTTTAGATACAACT 300

115075437 GTGGAGTCTTTTTAGATATTATGGTGAAGTCTTAGTACCATAAGTAGTACATTAATTGTT 115075496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGGAGTCTTTTTAGATATTATGGTGAAGTCTTAGTACCATAAGTAGTACATTAATTGTT 360

115075497 CTATTTCTTAAATTAATTGATCCCCAGGATTTAGCATGCTTATATATGATATATGGGCTT 115075556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATTTCTTAAATTAATTGATCCCCAGGATTTAGCATGCTTATATATGATATATGGGCTT 420

115075557 AGAAACCTACCTGAAAATTCAGTCATAATAAACTTTATGAAAGTCTGATACACAATGTGT 115075616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAACCTACCTGAAAATTCAGTCATAATAAACTTTATGAAAGTCTGATACACAATGTGT 480

115075617 TTATAGCTGTCATTCACCCAGCAAATAGTTACTGGGAGTGGAGGTTGAATCTCCAAGTAT 115075676
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATAGCTGTCATTCACCCAGCAAATAGTTACTAGGAGTGGAGGTTGAATCTCCAAGTAT 540

115075677 AATACATGAACTCCCAGGCTGTCGAACCCATGCATGTCAGAAATGCAGTCATACAAAATT 115075736
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      541 AATACATGAACTCCCAGGCTGTCGAGCCCATGCATGTCAGAAATGCAGTCATACGAAATT 600

115075737 TTTGTGCTTTCAGAATATACTGCATAACTCACCTTCACCTTCAGGCATCCTTTCGATGGA 115075796
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTATGCTTTCAGAATATACTGCATAACTCACCTTCACCTTCAGGCATCCTTTCGATGGA 660

115075797 TTCACAAAGCTGGAAGAGAAATTTGTTCATTCTGATAGTCAGCCATCCCGCAAGTAATGT 115075856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCACAAAGCTGGAAGAGAAATTTGTTCATTCTGATAGTCAGCCATCCCGCAAGTAATGT 720

115075857 GCATTGGGAGATGAAGTTAAGTAGAAAGAGCTTATTCTCCTCTAGGCATATAACATAATT 115075916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCATTGGGAGATGAAGTTAAGTAGAAAGAGCTTATTCTCCTCTAGGCATATAACATAATT 780

115075917 GCTTTTTTCCTTCTTTCAACCACTGTTAAAGGAGCATAGAGTTTTTGGCATAAACTATGT 115075976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTTTTTTCCTTCTTTCAACCACTGTTAAAGGAGCATAGAGTTTTTGGCATAAACTATGT 840

115075977 TGCAAACAGTTCATAAAGAATATAATAAGCATGCCACTTTGTCACGGTATGAAGACCAAA 115076036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAAACAGTTCATAAAGAATATAATAAGCATGCCACTTTGTCACGGTATGAAGACCAAA 900

115076037 TAAATGTTTTCAAAATAAAGCAATCGGTGTTTATTTCTTGCCTAATGCAACATAGATTTT 115076096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAATGTTTTCAAAATAAAGCAATCGGTGTTTATTTCTTGCCTAATGCAACATAGATTTT 960

115076097 AGAGTCTTCCAAGGCATGTGATGTTTGTTTTAGCAAAATGGATAAGTACATGGAATCACA 115076156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGTCTTCCAAGGCATGTGATGTTTGTTTTAGCAAAATGGATAAGTACATGGAATCACA 1020

115076157 GTGTGTGGCTCTAAATCTTGCTTCTGAAACTTAAAATTGTGTGACCTTGAGAAAGTTCTC 115076216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGTGTGGCTCTAAATCTTGCTTCTGAAACTTAAAATTGTGTGACCTTGAGAAAGTTCTC 1080

115076217 TAAAATCATTGAAACTTTGAGTTTGCCATTAAGAAAGGGGATGGTAATAATATATACTTC 115076276
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAAATCATTGAAACTTTGAGTTTGCTATTAAGAAAGGGGATGGTAATAATATATACTTC 1140

115076277 ATAAGATTGTTTTCAGTATTGAGTTATTATCTTTGCAATGATTAGAACATTGCCAGGTAT 115076336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAAGATTGTTTTCAGTATTGAGTTATTATCTTTGCAATGATTAGAACATTGCCAGGTAT 1200

115076337 ATAATAAATGTTCATAAAAATGTGGTTATTGTGAGGAATATTCAGTGAGTCTTTAACTTA 115076396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAATAAATGTTCATAAAAATGTGGTTATTGTGAGGAATATTCAGTGAGTCTTTAACTTA 1260

115076397 AAAATTTCAGGTATTATAAACTAAGCCATAACATTTTGTGCTTAAGGTAGATCTGTCACT 115076456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1261 AAAATTTCAGGTATTATAAACTAAGCCATAACATTTTGTGCTTAAGTTAGATCTGTCACT 1320

115076457 TCCTGCTTTAACACATGATCTTCTCAAAACTAAAAACAATGTCAAATAAAATAAAAAAGA 115076516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTGCTTTAACACATGATCTTCTCAAAACTAAAAACAATGTCAAATAAAATAAAAAAGA 1380

115076517 GAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGAGTCAAAAGT 115076576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGAGTCAAAAGT 1440

115076577 AAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCATGGCCAGAGA 115076636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCATGGCCAGAGA 1500

115076637 CTTGCAATAAAGGCCAAGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATGGCATACTGA 115076696
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTGCAATAAAGGCCAGGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATGGCATACTGA 1560

115076697 AGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGATAGTGAATGA 115076756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGATAGTGAATGA 1620

115076757 TAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGCGGATTATATATCCAAA 115076816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1621 TAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGTGGATTATATATCCAAA 1680

115076817 TATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAACACAACATT 115076876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAACACAACATT 1740

115076877 GAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAACTTCAAACAT 115076936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAACTTCAAACAT 1800

115076937 ATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAAGGGCTATCT 115076996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAAGGGCTATCT 1860

115076997 GGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAAACAAAATGG 115077056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAAACAAAATGG 1920

115077057 CTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAATAACATGCT 115077116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAATAACATGCT 1980

115077117 AAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAACTTAATTTT 115077176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAACTTAATTTT 2040

115077177 AAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAAAGTGATAGT 115077236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAAAGTGATAGT 2100

115077237 AAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAAGAAGAACAG 115077296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAAGAAGAACAG 2160

115077297 ATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTTATTCTAGTT 115077356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTTATTCTAGTT 2220

115077357 AACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAATGCATTACA 115077416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAATGCATTACA 2280

115077417 GATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGAGAGATTGGT 115077476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGAGAGATTGGT 2340

115077477 CTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAGAGTTACAAT 115077536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAGAGTTACAAT 2400

115077537 GTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAGAAACTAATT 115077596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAGAAACTAATT 2460

115077597 TCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACAC 115077656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATACCTGCACAC 2520

115077657 ATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTT 115077716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAAACACTGCTT 2580

115077717 GAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCA 115077776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTCTGAAAAGCA 2640

115077777 ACAGTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATT 115077836
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 A--GTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTCCCTGACATT 2698

115077837 AGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGA 115077896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTCCTTTGTGGA 2758

115077897 GCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGC 115077956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAATTGCTGTGGC 2818

115077957 AAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAA 115078016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAATAATATAAAA 2878

115078017 AATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTG 115078076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCAAATAAAGTG 2938

115078077 AAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAA 115078136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAGCAGTATTAA 2998

115078137 AAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATC 115078196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTAAATGCCATC 3058

115078197 CTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGA 115078256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGAAGAGGCTGA 3118

115078257 GAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCC 115078316
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACATGATTGCCC 3178

115078317 CTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGC 115078376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCACTGCTTTGC 3238

115078377 AGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTG 115078436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAGATGCTGCTG 3298

115078437 CTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTT 115078496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 CTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCCTTACAATTT 3358

115078497 TTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCC 115078556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAGGAATCAGCC 3418

115078557 CCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA 115078614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 CCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACAGAAAACA 3476

EXCISED REGION

115078621 AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACCTAAAT 115078680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACCTAAAT 3555

115078681 GTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAACAGTAT 115078740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 GTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAACAGTAT 3615

115078741 CTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTAAGAAC 115078800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 CTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTAAGAAC 3675

115078801 AAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATGACAAAATTTT 115078860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 AAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATGACAAAATTTT 3735

115078861 TAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATTACTCT 115078920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 TAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATTACTCT 3795

115078921 CTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGTTATAT 115078980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 CTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGTTATAT 3855

115078981 ATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCATTGTAG 115079040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 ATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCATTGTAG 3915

115079041 ACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTAATACA 115079100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 ACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTAATACA 3975

115079101 TAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTAATAACCAATC 115079160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 TAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTAATAACCAATC 4035

115079161 ATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTC 115079220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4036 ATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAATGGTAGGCTTTC 4095

115079221 CTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAG 115079280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 CTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAG 4155

115079281 GTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 GTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 4190

Alignment time is 3.17814 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2420] =>      2420 nucs 'mol-32-331c-107058_2420'

Score:        2419
Aligned:      2419        nucs
Identic:      2419 (100%) nucs =>      1015 (100%)      1404 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115080511,115081525] EXCISED REGION [115081527,115082930]
 second seq =>  [        1,     1015] EXCISED REGION [     1017,     2420]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [115081526,115081526]
 second seq =>         1 nucs [1016,1016]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [115081523,115081538] to [115081524,115081539]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [115081523,115081525] to [115081527,115081529]
 second seq =>         3 nucs [1013,1015] to [1017,1019]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

115080511 GATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATG 115080570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATAATAAATAACTTAAGAATATCAATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATG 60

115080571 TTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAA 115080630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGTTTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAA 120

115080631 TTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCT 115080690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCT 180

115080691 ACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAG 115080750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAG 240

115080751 AAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTA 115080810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTA 300

115080811 CAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTT 115080870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTT 360

115080871 TTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTA 115080930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTA 420

115080931 TTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATG 115080990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATG 480

115080991 TTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCC 115081050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCC 540

115081051 TGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACA 115081110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACA 600

115081111 GCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTT 115081170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTT 660

115081171 CTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAA 115081230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAA 720

115081231 CACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAG 115081290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAG 780

115081291 CACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTA 115081350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTA 840

115081351 AGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAA 115081410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAA 900

115081411 CTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTATCATTCTATA 115081470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTATCATTCTATA 960

115081471 TTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATTTTATTTATTT 115081525
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATTTTATTTATTT 1015

EXCISED REGION

115081527 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTG 115081586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTG 1076

115081587 ATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 115081646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 ATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 1136

115081647 CGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGT 115081706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGT 1196

115081707 AGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCT 115081766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 AGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCT 1256

115081767 GCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCA 115081826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCA 1316

115081827 TGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAA 115081886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAA 1376

115081887 GATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAAC 115081946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAAC 1436

115081947 ATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGT 115082006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGT 1496

115082007 TGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATT 115082066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATT 1556

115082067 CAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTA 115082126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 CAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTA 1616

115082127 GCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAA 115082186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 GCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAA 1676

115082187 CCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAG 115082246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAG 1736

115082247 AATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAG 115082306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 AATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAG 1796

115082307 GGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTG 115082366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTG 1856

115082367 GTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCA 115082426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 GTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCA 1916

115082427 TGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAG 115082486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAG 1976

115082487 AAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGA 115082546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 AAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGA 2036

115082547 AAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATA 115082606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATA 2096

115082607 AAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGA 115082666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 AAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGA 2156

115082667 TTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATG 115082726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATG 2216

115082727 ATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGG 115082786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 ATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGG 2276

115082787 TACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCA 115082846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCA 2336

115082847 AACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTCTATAAGCTAAATATTCGTC 115082906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTCTATAAGCTAAATATTCGTC 2396

115082907 ATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTA 115082930
          ||||||||||||||||||||||||
     2397 ATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTA 2420

Alignment time is 1.84729 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2246] =>      2246 nucs 'mol-32-3395-091026_2246'

Score:        2245
Aligned:      2245        nucs
Identic:      2245 (100%) nucs =>       915 (100%)      1330 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115080611,115081525] EXCISED REGION [115081527,115082856]
 second seq =>  [        1,      915] EXCISED REGION [      917,     2246]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [115081526,115081526]
 second seq =>         1 nucs [916,916]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [115081523,115081538] to [115081524,115081539]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [115081523,115081525] to [115081527,115081529]
 second seq =>         3 nucs [913,915] to [917,919]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

115080611 TTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTA 115080670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTCAGGCAACTCTTAGTTA 60

115080671 ACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTC 115080730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTC 120

115080731 TCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACA 115080790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACA 180

115080791 GTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTA 115080850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTA 240

115080851 AGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATT 115080910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATT 300

115080911 CTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCT 115080970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCT 360

115080971 TATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACC 115081030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACC 420

115081031 TCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCA 115081090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCA 480

115081091 TGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTT 115081150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTT 540

115081151 CAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAA 115081210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAA 600

115081211 AATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAAT 115081270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAAT 660

115081271 TAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGT 115081330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGT 720

115081331 AACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTT 115081390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTT 780

115081391 ATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCT 115081450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCT 840

115081451 CTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATT 115081510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATT 900

115081511 TTATTTTATTTATTT 115081525
          |||||||||||||||
      901 TTATTTTATTTATTT 915

EXCISED REGION

115081527 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTG 115081586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTG 976

115081587 ATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 115081646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 ATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 1036

115081647 CGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGT 115081706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 CGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGT 1096

115081707 AGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCT 115081766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 AGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCT 1156

115081767 GCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCA 115081826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 GCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCA 1216

115081827 TGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAA 115081886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 TGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAA 1276

115081887 GATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAAC 115081946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 GATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAAC 1336

115081947 ATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGT 115082006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 ATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGT 1396

115082007 TGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATT 115082066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 TGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATT 1456

115082067 CAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTA 115082126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 CAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTA 1516

115082127 GCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAA 115082186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 GCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAA 1576

115082187 CCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAG 115082246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 CCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAG 1636

115082247 AATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAG 115082306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 AATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAG 1696

115082307 GGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTG 115082366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 GGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTG 1756

115082367 GTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCA 115082426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 GTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCA 1816

115082427 TGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAG 115082486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAG 1876

115082487 AAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGA 115082546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 AAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGA 1936

115082547 AAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATA 115082606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 AAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATA 1996

115082607 AAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGA 115082666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 AAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGA 2056

115082667 TTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATG 115082726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 TTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATG 2116

115082727 ATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGG 115082786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 ATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGG 2176

115082787 TACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCA 115082846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCA 2236

115082847 AACTGCATTA 115082856
          ||||||||||
     2237 AACTGCATTA 2246

Alignment time is 1.71552 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     5150] =>      5150 nucs 'mol-32-33a0-177680_5150'

Score:        5128
Aligned:      5150        nucs
Identic:      5148 (100%) nucs =>      2295 (100%)      2853 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115077819,115080113] EXCISED REGION [115080115,115082969]
 second seq =>  [        1,     2295] EXCISED REGION [     2296,     5150]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [115080114,115080114]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [115080317,115080317]
 second seq =>         1 nucs [2498,2498]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [115080114,115080128] to [115080115,115080129]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

115077819 TACTCTTTCCCTGACATTAGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATA 115077878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTCTTTCCCTGACATTAGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATA 60

115077879 AATTCCTTCCTTTGTGGAGCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATA 115077938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTCCTTCCTTTGTGGAGCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATA 120

115077939 TGTTAAAATTGCTGTGGCAAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCA 115077998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTAAAATTGCTGTGGCAAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCA 180

115077999 TTATAAAATAATATAAAAAATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAA 115078058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATAAAATAATATAAAAAATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAA 240

115078059 TTGTTGCCAAATAAAGTGAAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACT 115078118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTTGCCAAATAAAGTGAAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACT 300

115078119 GATGAAAAGCAGTATTAAAAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAA 115078178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATGAAAAGCAGTATTAAAAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAA 360

115078179 AAAGAATTAAATGCCATCCTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACA 115078238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGAATTAAATGCCATCCTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACA 420

115078239 CATAATAGAAGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGC 115078298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATAATAGAAGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGC 480

115078299 AGAAAGACATGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAG 115078358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAAGACATGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAG 540

115078359 AGATTAGCACTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACT 115078418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATTAGCACTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACT 600

115078419 ATGAAAGAGATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTG 115078478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGAAAGAGATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTG 660

115078479 CTTTCTCCCTTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAG 115078538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCTCCCTTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAG 720

115078539 GATTCACAGGAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTA 115078598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTCACAGGAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTA 780

115078599 TATATAACAGAAAACATAAGGTAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGT 115078658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATATAACAGAAAACATAAGGTAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGT 840

115078659 CTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCA 115078718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCA 900

115078719 AAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAA 115078778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAA 960

115078779 TACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTA 115078838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTA 1020

115078839 CTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCAT 115078898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCAT 1080

115078899 CTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATA 115078958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATA 1140

115078959 CAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTC 115079018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTC 1200

115079019 TGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAG 115079078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAG 1260

115079079 TGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCAT 115079138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCAT 1320

115079139 TTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATG 115079198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATG 1380

115079199 TTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAA 115079258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAA 1440

115079259 CCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGACATA 115079318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGACATA 1500

115079319 ATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATTAT 115079378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGTTTGACATAATATTACATACAATATTACACATACTACACTTAAAGGGTTACTATTAT 1560

115079379 TATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGCAA 115079438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTAAGCCTTTAAAAGGAATATTATTAAGTCTTAAAATAGGAAAACCTACCCTTTGCAA 1620

115079439 CAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAAAA 115079498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAACATATGAACTTGAAAGATATAATGCTAAGTGAAGTAAACCAGTCACAGATAGAAAAA 1680

115079499 TACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAATT 115079558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACTGCATGATCTCACTTTAGAATTTAGAAAAAAATACTGCATGATTCTCACTTAGAATT 1740

115079559 CATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAATGG 115079618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATAAAAGCAGAGTAGAATGGTGGTTACCAAGGATAAAGGTTGGCAAAATGGGTAAATGG 1800

115079619 TTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTACAG 115079678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTGTTTATTTATTTGCTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACTCAGACTGGAGTACAG 1860

115079679 TGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAGCC 115079738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGCACGATCTTGACTCACTGCAATCTTCACCTCCAGCGTTCAAGTCTCATGCCTCAGCC 1920

115079739 TCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTGTT 115079798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCCCCAAGTAGCTGGGATTACAGACATGCCCCACAATGCCTGGCTAGTTTTTTGTTTGTT 1980

115079799 TGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGGCT 115079858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCACCATATTAGCCAGGCT 2040

115079859 GCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 115079918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTTTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 2100

115079919 ACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTTTA 115079978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAGGCGTGAGTCACCGTGCCCTGTCAGGTAAATGTTAATCAAAAAGATGCGAAGTTTTA 2160

115079979 GTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAATAA 115080038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTATGTAGCATGAATAAATTTTAGAGATCTAGGTACAGCACGGTGACTATAGTTAATAA 2220

115080039 TACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCACAC 115080098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TACTGTATTGCAAACCACTTGAACTTTGTTAAGAGATTGGCTATTGCGTTCTCACCACAC 2280

115080099 ACACCAAAATAAGGC 115080113
          |||||||||||||||
     2281 ACACCAAAATAAGGC 2295

EXCISED REGION

115080115 AAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAA 115080174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 AAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGTAAATAACCTAATGTATAAATAGACTAAAATATTTTAA 2355

115080175 AATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTC 115080234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 AATCCAATGAACCCATGAAGTGTAAAAACATAATTGTACTATAATACTGAATCATTCCTC 2415

115080235 AATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGA 115080294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 AATCATCAGAATGACCTAACTTATAAAACCTGAAAACATAAATGTTGGTGCAAATTCAGA 2475

115080295 GCAAAGGAAATGCTCAGAAACTACCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGA 115080354
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 GCAAAGGAAATGCTCAGAAACTGCCGGTAGGAATGGCAGTTAGAATAACTATCATGAAGA 2535

115080355 ACAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTAC 115080414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 ACAGTTTGGTGATATTTAGTAAAGTGAAAAATACAATAAATTGAGACTTAGCAAGATTAC 2595

115080415 ATAATTTGCCCAAGGTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTG 115080474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 ATAATTTGCCCAAGGTTCATGATTATCAAATTGGGAACCTAAATTTGGGTTCAGCTTGTG 2655

115080475 ACCTTAAATTTTCTTATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATC 115080534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 ACCTTAAATTTTCTTATCCATACCCTCAATAACTATGATAATAAATAACTTAAGAATATC 2715

115080535 AATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGT 115080594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 AATTCTAAAGCATAGTAAATCCCCAAATTATCAATGTTTGAATTGTTGAGTAAATTTTGT 2775

115080595 TTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTC 115080654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 TTAGCGAGGTAAGAGATTTTGTAAGTGCAAGTAGAATTATTTTTAACAAGGTTTGAATTC 2835

115080655 AGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCT 115080714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 AGGCAACTCTTAGTTAACCAGAAAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCT 2895

115080715 TTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCT 115080774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 TTTCTTATTATAATTCTCTTTAATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCT 2955

115080775 AATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGA 115080834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 AATTTCTGGGTACACAGTTTACATGCTACAATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGA 3015

115080835 TTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCT 115080894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 TTCTATCCTTTTATTAAGCTTCAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCT 3075

115080895 TAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCC 115080954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 TAGAAATTATACAATTCTTATGACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCC 3135

115080955 CTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTT 115081014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 CTTATCTTGTCTTCCTTATCTCTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTT 3195

115081015 CTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAA 115081074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 CTCTGGTAGAAATACCTCTTGCCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAA 3255

115081075 AAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTT 115081134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 AAGATGTGACCTTTCATGCTCAGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTT 3315

115081135 TATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGA 115081194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 TATGGGATTATTTTTTCAGTGCATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGA 3375

115081195 ATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTA 115081254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 ATGCTCTTAAAATAAAAATTAAGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTA 3435

115081255 CTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACA 115081314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 CTTTCTATCAGGAAATTAAGATAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACA 3495

115081315 TTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATT 115081374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 TTGAGCAAAGTCCTGTAACCTTGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATT 3555

115081375 TGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGA 115081434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 TGTATAAAACAATTTTATCTCAGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGA 3615

115081435 GCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGT 115081494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 GCTTTTTTTTTTAGCTCTGAGATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGT 3675

115081495 TGTTCCTAACTTTATTTTATTTTATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCG 115081554
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3676 TGTTCCTAACTTTATTTTATTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCG 3735

115081555 CTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCC 115081614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 CTCTTTCGCCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCC 3795

115081615 CGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCC 115081674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 CGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCC 3855

115081675 ACCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTA 115081734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 ACCGCTCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTA 3915

115081735 TGCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGC 115081794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 TGCATTGGCTTTAGAAATACTTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGC 3975

115081795 TACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATT 115081854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 TACAACACAAGTTTTCAGGTCACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATT 4035

115081855 TTATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTT 115081914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 TTATAGAGTAAAATATTAGCTATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTT 4095

115081915 AATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAAC 115081974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 AATTTGTTAAATATCTGCATGGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAAC 4155

115081975 GAAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATA 115082034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 GAAATACGTCTATTTGTAAATATGCATGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATA 4215

115082035 ATTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATG 115082094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 ATTGTGATCTATTGATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATG 4275

115082095 AGCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATG 115082154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 AGCTAGAAGACAAAACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATG 4335

115082155 TTTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGG 115082214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 TTTAAAGGAAATATTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGG 4395

115082215 TTGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCA 115082274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 TTGCCACATTATGCTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCA 4455

115082275 TACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACC 115082334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 TACTATCCTATCTGCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACC 4515

115082335 ATTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGT 115082394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 ATTTTGGTGCCAGCAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGT 4575

115082395 TTTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAG 115082454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 TTTCTGTGTATTCTTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAG 4635

115082455 AAACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGA 115082514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 AAACACACTTTATATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGA 4695

115082515 TATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATG 115082574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 TATCGAATATACTTACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATG 4755

115082575 ATTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTA 115082634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 ATTAATAATTCAGTTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTA 4815

115082635 TTTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTT 115082694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 TTTGATCACTTTCTTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTT 4875

115082695 TCAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGT 115082754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 TCAATACACATTGAAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGT 4935

115082755 GATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGAT 115082814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4936 GATCTGCTCAGTTTCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGAT 4995

115082815 GAAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTT 115082874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4996 GAAACAGGATAAAAGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTT 5055

115082875 GTCATTTGACTTCTATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATAT 115082934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5056 GTCATTTGACTTCTATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATAT 5115

115082935 TGACACATTGTGGTTTTGTGAGATTTAAATGAAAG 115082969
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5116 TGACACATTGTGGTTTTGTGAGATTTAAATGAAAG 5150

Alignment time is 3.87585 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     9291] =>      9291 nucs 'mol-32-34b3-186703_9291'

Score:        8733
Aligned:      9310        nucs
Identic:      9215 ( 99%) nucs =>      2795 ( 99%)      6420 ( 99%)
Gaps:           60 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115076508,115079315] EXCISED REGION [115080677,115087140]
 second seq =>  [        1,     2819] EXCISED REGION [     2823,     9291]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1361 nucs [115079316,115080676]
 second seq =>         3 nucs [2820,2822]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080677,115080677]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115079316,115079316] to [115080676,115080676]
 second seq =>         0 nucs

115076508 TAAAAAAGAGAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGA 115076567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAAAAGAGAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGA 60

115076568 GTCAAAAGTAAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCAT 115076627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCAAAAGTAAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCAT 120

115076628 GGCCAGAGACTTGCAATAAAGGCCAAGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATG 115076687
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCCAGAGACTTGCAATAAAGGCCAGGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATG 180

115076688 GCATACTGAAGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGAT 115076747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATACTGAAGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGAT 240

115076748 AGTGAATGATAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGCGGATTAT 115076807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      241 AGTGAATGATAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGTGGATTAT 300

115076808 ATATCCAAATATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAA 115076867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATCCAAATATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAA 360

115076868 CACAACATTGAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAAC 115076927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAACATTGAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAAC 420

115076928 TTCAAACATATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAA 115076987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCAAACATATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAA 480

115076988 GGGCTATCTGGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAA 115077047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGCTATCTGGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAA 540

115077048 ACAAAATGGCTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAA 115077107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAAATGGCTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAA 600

115077108 TAACATGCTAAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAA 115077167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAACATGCTAAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAA 660

115077168 CTTAATTTTAAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAA 115077227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTAATTTTAAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAA 720

115077228 AGTGATAGTAAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAA 115077287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTGATAGTAAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAA 780

115077288 GAAGAACAGATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTT 115077347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGAACAGATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTT 840

115077348 ATTCTAGTTAACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAA 115077407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTCTAGTTAACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAA 900

115077408 TGCATTACAGATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGA 115077467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCATTACAGATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGA 960

115077468 GAGATTGGTCTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAG 115077527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGATTGGTCTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAG 1020

115077528 AGTTACAATGTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAG 115077587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTACAATGTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAG 1080

115077588 AAACTAATTTCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATA 115077647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACTAATTTCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATA 1140

115077648 CCTGCACACATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAA 115077707
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGCACACATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAA 1200

115077708 ACACTGCTTGAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTC 115077767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACTGCTTGAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTC 1260

115077768 TGAAAAGCAACAGTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTC 115077827
          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAAAAGCAA--GTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTC 1318

115077828 CCTGACATTAGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTC 115077887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CCTGACATTAGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTC 1378

115077888 CTTTGTGGAGCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAAT 115077947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CTTTGTGGAGCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAAT 1438

115077948 TGCTGTGGCAAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAAT 115078007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TGCTGTGGCAAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAAT 1498

115078008 AATATAAAAAATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCA 115078067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AATATAAAAAATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCA 1558

115078068 AATAAAGTGAAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAG 115078127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AATAAAGTGAAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAG 1618

115078128 CAGTATTAAAAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTA 115078187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CAGTATTAAAAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTA 1678

115078188 AATGCCATCCTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGA 115078247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AATGCCATCCTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGA 1738

115078248 AGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACA 115078307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1739 AGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACA 1798

115078308 TGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCA 115078367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCA 1858

115078368 CTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAG 115078427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAG 1918

115078428 ATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCC 115078487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCC 1978

115078488 TTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAG 115078547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAG 2038

115078548 GAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACA 115078607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACA 2098

115078608 GAAAACATAAGGT-------------------AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACA 115078648
          |||||||                         ||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GAAAACA------ATGTCCAAGAGAAAATCAAAAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACA 2152

115078649 AAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAG 115078708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACCTAAATGTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAG 2212

115078709 TAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTC 115078768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAACAGTATCTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTC 2272

115078769 CTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAA 115078828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 CTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTAAGAACAAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAA 2332

115078829 TTAAAATTTACTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTT 115078888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTAAAATTTACTTATCAACATGACAAAATTTTTAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTT 2392

115078889 TTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAA 115078948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 TTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATTACTCTCTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAA 2452

115078949 TAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCA 115079008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 TAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGTTATATATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCA 2512

115079009 AATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAA 115079068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 AATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCATTGTAGACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAA 2572

115079069 AAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAAT 115079128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 AAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTAATACATAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAAT 2632

115079129 GACTGGCCATTTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAG 115079188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 GACTGGCCATTTATTTCACTTAATAACCAATCATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAG 2692

115079189 TCCATCCATGTTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAA 115079248
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TCCATCCATGTTGTAGCAAATGGTAGGCTTTCCTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAA 2752

115079249 TATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAAT 115079308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAGGTAAATACATGAATTATTTACACGTAAT 2812

115079309 ATTAGAC 115079315
          |||||||
     2813 ATTAGAC 2819

EXCISED REGION

115080677 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 115080736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 AAATATGATCTTCTACCTGTGACTGACCAGGATTTTCTTTTCTTATTATAATTCTCTTTA 2882

115080737 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 115080796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 ATACAGTCCCTTAGAAGTCTTACCATTACTGCTAATCTAATTTCTGGGTACACAGTTTAC 2942

115080797 ATGCTACA-ATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 115080855
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 ATGCTACACATTCTACAATCAGTTGCTATGGCTCCCTGATTCTATCCTTTTATTAAGCTT 3002

115080856 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 115080915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 CAATTATTTACCTTTTTCCATTTGGGGAATTAGTTTGCTTAGAAATTATACAATTCTTAT 3062

115080916 GACTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 115080975
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 GGCTGGCAGCTTTTATTTCTTTCTAAAATTTAAGTCTCCCTTATCTTGTCTTCCTTATCT 3122

115080976 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTG 115081035
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3123 CTAGCCGCATACATGTTTCCTCCTTCACAAAGCCCTTTTCTCTGGTAGAAATACCTCTTA 3182

115081036 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 115081095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 CCTAGCTAAAGATCCTGACATCCTCTAACAGACTAAGAAAAGATGTGACCTTTCATGCTC 3242

115081096 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 115081155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 AGTTTCCTAGAAACAGCTAACGGTTCATGGTTTATGGTTTATGGGATTATTTTTTCAGTG 3302

115081156 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 115081215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 CATTATTTCTGCCTTCTACAACATCCTCATTCCAGTGGAATGCTCTTAAAATAAAAATTA 3362

115081216 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 115081275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 AGCTAAAATAATGAACACAGAAAAACTCTAACAGGCCTACTTTCTATCAGGAAATTAAGA 3422

115081276 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTGACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 115081335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3423 TAGTCTGTCACAAAGCACTTCCCCTATCATTAACTCACATTGAGCAAAGTCCTGTAACCT 3482

115081336 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTATAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 115081395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3483 TGGCTGGGTCTCCTAAGTCTTAAGAGTTGCTACAAAATTTGTATAAAACAATTTTATCTC 3542

115081396 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 115081455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 AGGTAAGGACAATAACTGAATCAAATATATTTGCTGAGAGCTTTTTTTTTTAGCTCTGAG 3602

115081456 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 115081515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 ATCTATCATTCTATATTTTATTCAACTATATCCATTTGTTGTTCCTAACTTTATTTTATT 3662

115081516 TTATTTATTTTTTT-TTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 115081574
          ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 TTATTTATTT----ATTTTTTTTTTGAGACGGGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCGGGAG 3718

115081575 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 115081634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT 3778

115081635 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 115081694
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACGGGCGCCCGCCACCGCTCCCGGCTAATTTTT 3838

115081695 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 115081754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTGTTCCTAATTTTATTATGCATTGGCTTTAGAAATAC 3898

115081755 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 115081814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TTTGAAGACTCTGCAAGTAGATCATACTCATTAATTGTGCTACAACACAAGTTTTCAGGT 3958

115081815 CACTTACATGCATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 115081874
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 CACTTACATGTATGGCATTAATCCACTGGTCCAAGATATTTTATAGAGTAAAATATTAGC 4018

115081875 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 115081934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TATAATTTGAAAGATCTTAAAATTAGTAATATTTAATGTTAATTTGTTAAATATCTGCAT 4078

115081935 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 115081994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GGATTATTTAACATTTGTTTCAGAAAAAAACTGTAAAAACGAAATACGTCTATTTGTAAA 4138

115081995 TATGCA-------TGCTGTTGATAAAAGGAAAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 115082047
          |||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TAT---TCATGCGTGCTGTTGATAAAAGG-AAAAAATATACAAAATAATTGTGATCTATT 4194

115082048 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 115082107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 GATTTGCAACTAAGTAATTCAGAACTGTGTAATTCTACTTTGGAATGAGCTAGAAGACAA 4254

115082108 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 115082167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 AACAAAAAAGTACAAATTAGCTTACTTTACTGAAACATTTTTCCATGTTTAAAGGAAATA 4314

115082168 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTGAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 115082227
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 TTCCTTTAATATTAAATAACCCATCTAAAGATAATTTGCTTTCATGGTTGCCACATTATG 4374

115082228 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 115082287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 CTTATTTAACGTAAGTTAGAATATTCCAGTAAGGGTTGAAATTATCATACTATCCTATCT 4434

115082288 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 115082347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 GCATTTTATGGATCCGAAGGGAAACTGACCTCCTTTAATATGAGACCATTTTGGTGCCAG 4494

115082348 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 115082407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 CAGGGATGAGTTTCCTGTGGTGAGCATTTGGCTTATGACAGACTTGTTTTCTGTGTATTC 4554

115082408 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 115082467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 TTAGCAGGGTGGGAAGCCATGGGAACAGAACCATCCGAGCTGACAAGAAACACACTTTAT 4614

115082468 ATCATTTGACGTTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 115082527
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 ATCATTTGACATTTAGTAGAAAGACAAACTTTAGTTATTTTTTCTGATATCGAATATACT 4674

115082528 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 115082587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 TACATCACATAATTAAGGAAAAGTCTACCTTAGTTAACTCATTGATGATTAATAATTCAG 4734

115082588 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 115082647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TTTTTGGAGTAGGTAAATAAAGGAAGAATAAATGAATGATTGGTCTATTTGATCACTTTC 4794

115082648 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 115082707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 TTTAAAGAAAAAATTTTGATTTAAACACACACCTCCATTATCAAGTTTCAATACACATTG 4854

115082708 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCAGTT 115082767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4855 AAAATGAATAAATTGTATGATATTCATTTTACTGTAAAGCTACAGGTGATCTGCTCTGTT 4914

115082768 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 115082827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 TCATTTATACTAACCATGGTACTTTAAAAGTAGTAATCATTAATGATGAAACAGGATAAA 4974

115082828 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTC 115082887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 AGCTTAAGCTTCAGAATCAAACTGCATTAAGTATAAATATTAGCTTTGTCATTTGACTTC 5034

115082888 TATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATTGACACATTGTGG 115082947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 TATAAGCTAAATATTCGTCATCTGAAAAACGAAAGCCTCATTAATATTGACACATTGTGG 5094

115082948 TTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGATGAATCTTATCTA 115083007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 TTTTGTGAGATTTAAATGAAAGGATGGAGATCCATCACTTAATATGATGAATCTTATCTA 5154

115083008 ATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTATTTTTTTAATATTAAGAGATTTAAAATAA 115083067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 ATAAACACAAGTTATTAATGGTGTTATTGTATTTTTTTAATATTAAGAGATTTAAAATAA 5214

115083068 AACATGTACAAAAATTTGTAGTGAATCTTTAACCTCTAGCTGACATTTAAATTTTATTTT 115083127
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5215 AACATGTACAAAAATTTGTAGTGAATCTTTAACCTCTAGCTGACATTTAAACTTTATTTT 5274

115083128 AAATACAGATGAATCCACACATAATTTCATTCCTGTATATGATAATTGTATATCATATAC 115083187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 AAATACAGATGAATCCACACATAATTTCATTCCTGTATATGATAATTGTATATCATATAC 5334

115083188 ATATACATATATTAACAGAGTTACTGATAATAAACAGGTTAATTTACTTGATAAAAAAGG 115083247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 ATATACATATATTAACAGAGTTACTGATAATAAACAGGTTAATTTACTTGATAAAAAAGG 5394

115083248 AAGGCAGCATATAAAACTCAAAATATATTTGTAGATCTCCAGATTCATGAAGAAATATTT 115083307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 AAGGCAGCATATAAAACTCAAAATATATTTGTAGATCTCCAGATTCATGAAGAAATATTT 5454

115083308 TGATCATTAGACCATATGGCCTTAATAGATCTTTTAATGCATTCATTTGTTATACTAAAT 115083367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 TGATCATTAGACCATATGGCCTTAATAGATCTTTTAATGCATTCATTTGTTATACTAAAT 5514

115083368 AATTATTTAATTTCATTTTTTGTCATGTGTTCTTGCTAGCAAATGACTTTTTTAAAGGTT 115083427
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 AATTATTTAATTTCATTTTTTGTCGTGTGTTCTTGCTAGCAAATGACTTTTTTAAAGGTT 5574

115083428 TTATTTACAGCTTATTTTTTAAAAAAATATATTCAATCTTGAACTTGTAGGTGTGCTTTG 115083487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 TTATTTACAGCTTATTTTTTAAAAAAATATATTCAATCTTGAACTTGTAGGTGTGCTTTG 5634

115083488 TTTCCTAAATTAATTTAGTAGACTATTTTCCCATAAAAATAATGTTATAAATATATTGTA 115083547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 TTTCCTAAATTAATTTAGTAGACTATTTTCCCATAAAAATAATGTTATAAATATATTGTA 5694

115083548 TTTTCCAGTGTTCATTCTCGAAAACTGAAATAGTCAATGATATTGCTAAATTATAGTAAT 115083607
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 TTTTCCAGTGTTAATTCTCGAAAACTGAAATAGTCAATGATATTGCTAAATTATAGTAAT 5754

115083608 AACAATATTGATCTCAGTTCTGGTTCCTTAAATCTCCCAAGAGTATTTTCCTTTGAAAAG 115083667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 AACAATATTGATCTCAGTTCTGGTTCCTTAAATCTCCCAAGAGTATTTTCCTTTGAAAAG 5814

115083668 ACAACTCTTATCTATTCAACTGATTTGCTAAGTATTAATATTTCAGAGAGTATAATATAA 115083727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 ACAACTCTTATCTATTCAACTGATTTGCTAAGTATTAATATTTCAGAGAGTATAATATAA 5874

115083728 ATGATGTGAATATGTCCAAGGGGCCTTGTGGAAGTAATTTATTGGCATCAAGAACATCAG 115083787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 ATGATGTGAATATGTCCAAGGGGCCTTGTGGAAGTAATTTATTGGCATCAAGAACATCAG 5934

115083788 AAGGCAGCCCAGTACCTTTGAATTCTGTACCTAGGGGGGCTTCCCTAAGGTCTTCCTGGT 115083847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 AAGGCAGCCCAGTACCTTTGAATTCTGTACCTAGGGGGGCTTCCCTAAGGTCTTCCTGGT 5994

115083848 TTTCATGGATTTTTATACTGTGCTTGGCAGAAGAAGAAAAAGAAGTTGATTATTCAGGAG 115083907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 TTTCATGGATTTTTATACTGTGCTTGGCAGAAGAAGAAAAAGAAGTTGATTATTCAGGAG 6054

115083908 CATAAGGATTCTTTGGGAAGTAAACAGATATTTAGGACAGTCAGTCAGAGAAAATGATGG 115083967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 CATAAGGATTCTTTGGGAAGTAAACAGATATTTAGGACAGTCAGTCAGAGAAAATGATGG 6114

115083968 CAAGGCCCAAGAGCAGAAGATTGTGGAAGAACAAGCGGCAGATGGCATTAATTTCCATCC 115084027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 CAAGGCCCAAGAGCAGAAGATTGTGGAAGAACAAGCGGCAGATGGCATTAATTTCCATCC 6174

115084028 TGACTGGTGGTTTGAGGAAGTACTATTTACATATAAAATAGGAGTTTTTTCAGGGAATTA 115084087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 TGACTGGTGGTTTGAGGAAGTACTATTTACATATAAAATAGGAGTTTTTTCAGGGAATTA 6234

115084088 AGGTTCTTTCACAGTCAGTTATTAGATGGTTATTTTACTCATTCATTCAATAGCTCATTC 115084147
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6235 AGGTTCTTTCACAGTCAGTTATTAGATGGTTATTTTACTCATTCATTCAGTAGCTCATTC 6294

115084148 AACAATTGTCAGGCTCCTCCTGTGTGTGGTGCACTGATGTATGGAGGTAATGGAGACAGA 115084207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 AACAATTGTCAGGCTCCTCCTGTGTGTGGTGCACTGATGTATGGAGGTAATGGAGACAGA 6354

115084208 CACAACCTGACTTTCACAGTCCATGCAGTTTAACGGAGGAGACAGGAACCTAAACAAGTT 115084267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 CACAACCTGACTTTCACAGTCCATGCAGTTTAACGGAGGAGACAGGAACCTAAACAAGTT 6414

115084268 TTTAGAAATGAGCATTTTCTCGAATAGTTTCATATTTACAGGAAAAAAGGAAAGCACCAG 115084327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 TTTAGAAATGAGCATTTTCTCGAATAGTTTCATATTTACAGGAAAAAAGGAAAGCACCAG 6474

115084328 TACAAAGAGTACTCATATACTCCATAGCCAGTTTCCCCTAGTATTAACACCTTTATTAGT 115084387
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 TACAAAAAGTACTCATATACTCCATAGCCAGTTTCCCCTAGTATTAACACCTTTATTAGT 6534

115084388 CTGATGCATTTGTCACAAGTGCACCAATGAACCAATATTAATATATTATTATTAATTAAT 115084447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 CTGATGCATTTGTCACAAGTGCACCAATGAACCAATATTAATATATTATTATTAATTAAT 6594

115084448 GCCCACCCTTGATTCATATTTCTTAGCTTTTATCTAATGTCCTATTTCTAGCCCAGGATC 115084507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 GCCCACCCTTGATTCATATTTCTTAGCTTTTATCTAATGTCCTATTTCTAGCCCAGGATC 6654

115084508 ACATCGATGATACCACTTTACATTCATAATACTTGTCGTTTTCTTGCCTATGTGTAAATA 115084567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 ACATCGATGATACCACTTTACATTCATAATACTTGTCGTTTTCTTGCCTATGTGTAAATA 6714

115084568 ATAAGCTCTTGGCTGTGAGAGTTTCTCAGAATTAATTTGTTTTTGATGACCTTGAGAGTT 115084627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 ATAAGCTCTTGGCTGTGAGAGTTTCTCAGAATTAATTTGTTTTTGATGACCTTGAGAGTT 6774

115084628 TTAAAGGTACTTCATCAGGTATTTTCTAGGATCGCCTCTACTGGGATTTGTCTTTCTTCT 115084687
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 TTAAAGGTACTTCATCAGGTATTTTTTAGGATCGCCTCTACTGGGATTTGTCTTTCTTCT 6834

115084688 TCAAATAATTATTCAAGGGTTATGAGTTTTTGGAAACAGGACTGCAGAGGTAAAGTGTCA 115084747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 TCAAATAATTATTCAAGGGTTATGAGTTTTTGGAAACAGGACTGCAGAGGTAAAGTGTCA 6894

115084748 TTTTTATTACATCCTATGAAGGGAATGCACTACCAATATGCCTTCTTATTGTTGATATTA 115084807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6895 TTTTTATTACATCCTATGAAGGGAATGCACTATCAATATGCCTTCTTATTGTTGATATTA 6954

115084808 AACTTGATCATTTGGCTGAAGTAGTGTCTGTCACCTTTTTCCATTATAAGTGACCTTTTT 115084867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 AACTTGATCATTTGGCTGAAGTAGTGTCTGTCACCTTTTTCCATTATAAGTGACCTTTTT 7014

115084868 TACCTTTTCTATACTGTACTATTTAGAGGGAAATGACTATAAATAGGCTTTTAATCATAA 115084927
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     7015 TACCTTTTCTATACTGTACTATTTAGAGGGAAATGACTATAAATAGGCTTTTAGTCATAA 7074

115084928 CATGGGAAGAGGAATGAGGTAAGAAGCAGTGCTTAGATAGGGAATTTGTACAGGGAGTTG 115084987
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7075 CGTGGGAAGAGGAATGAGGTAAGAAGCAGTGCTTAGATAGGGAATTTGTACAGGGAGTTG 7134

115084988 TGAAAATGTATAGGAGGATGAAATAGCATGGCCACTGACAACAGGAAATGCCCCTCTTAA 115085047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7135 TGAAAATGTATAGGAGGATGAAATAGCATGGCCACTGACAACAGGAAATGCCCCTCTTAA 7194

115085048 GATGTCATACTTTACTGACTCTGAAGAATCAAAATTCATTAGTCAAATAACAGTGTGAAA 115085107
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7195 GATGTCATACTTTACTGACTCTGAAGAATCAAACTTCATTAGTCAAATAACAGTGTGAAA 7254

115085108 TGGAGGGAGCAGAATTAGTGTGCAAAGACATTGGATGGTTTTAGTGTTTTCAGCACCTCT 115085167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7255 TGGAGGGAGCAGAATTAGTGTGCAAAGACATTGGATGGTTTTAGTGTTTTCAGCACCTCT 7314

115085168 TGTTTATCTAATGATCTCTACAAATTATAAAAAGTTAACCTTCAGCCCAAATTATAAAAA 115085227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7315 TGTTTATCTAATGATCTCTACAAATTATAAAAAGTTAACCTTCAGCCCAAATTATAAAAA 7374

115085228 GCTAACCTTCAGCCCAAATTTTAACTTGACGTTTTATATTCCAAATAATTGCCATAATTG 115085287
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     7375 GCTAACCTTCAGCCCAAATTTTAACTTGACATTTTATATTCCAAATAATTGCCATAATTG 7434

115085288 TTTTTCTATCAAAATAATATGTTGTACCACATGTGTGTATATTTGCCTCATACATTATAT 115085347
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7435 TTTTTCTATCAAAATAATATGTTGTACCACATGTGTGTATATTTGTCTCATACATTATAT 7494

115085348 TTTATTTCATAGAAAAATGTTGCTGTGAAAATCAAGCAAATAATTGCCATTTGCAAGTGT 115085407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7495 TTTATTTCATAGAAAAATGTTGCTGTGAAAATCAAGCAAATAATTGCCATTTGCAAGTGT 7554

115085408 TTCTACACAATTCTGTCTATTCTTCATAATTTTTAGAGGCAGGTGTTATTCCTGGTATTT 115085467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7555 TTCTACACAATTCTGTCTATTCTTCATAATTTTTAGAGGCAGGTGTTATTCCTGGTGTTT 7614

115085468 TGAAAGAATAGCTGATAACCAGTAGGAAAGGAAAGTGATTGATGCTGTACAAATGGTGGG 115085527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7615 TGAAAGAATAGCTGATAACCAGTAGGAAAGGAAAGTGATTGATGCTGTACAAATGGTGGG 7674

115085528 TGTGGAAGTGGAGGTGACCTAAATATATTGTTCTAATTCATTCTTATTTGACCCCTGTGT 115085587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7675 TGTGGAAGTGGAGGTGACCTAAATATATTGTTCTAATTCATTCTTATTTGACCCCTGTGT 7734

115085588 CTTAGTCCATTTGAGATGCTATATCA-----AAATGCTATAAACTGGGTAGCTTACAAAC 115085642
          ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||
     7735 CTTAGTCCATTTGAGATGCTATATCAAAATGAAATGCTATAAACTGGGTAGCTTACAAAC 7794

115085643 AACTAACATTTATTTATCACAGTTTTGGGGCCTGGGATGAAAAAAATCAAGGCAACACCA 115085702
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     7795 AACTAACATTTATTTATCACAGTTTTGGAGCCTGGGATGAAAAAAATCAAGGCAACACCA 7854

115085703 GATTCAATGCCTGGTAAGGGCCTGCTTCCTCAAAGGCAGAGC-----CTTCCTCCTGTAG 115085757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||
     7855 GATTCAATGCCTGGTAAGGGCCTGCTTCCTCAAAGG------GCCTGCTTCCTCCTGTAG 7908

115085758 CCTAACATTGTGAAAGGAGCAGGCAGCCCTCTGGGACCTCTTTAAAAAGAGAGCTAATCT 115085817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7909 CCTAACATTGTGAAAGGAGCAGGCAGCCCTCTGGGACCTCTTTAAAAAGAGAGCTAATCT 7968

115085818 CATTCACGAGGCCTCCACCCTGATGAACTAATCACCTCCCAAATGCCCGACCTTCTAATA 115085877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7969 CATTCACGAGGCCTCCACCCTGATGAACTAATCACCTCCCAAATGCCCAACCTTCTAATA 8028

115085878 CATTGCTTTGGTAATTAGGTTTCAACATAAGAATTTTTGGAGGACATAAACATTCAGACC 115085937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 CATTGCTTTGGTAATTAGGTTTCAACATAAGAATTTTTGGAGGACATAAACATTCAGACC 8088

115085938 ACAGAACTCTATAAACCAGACAGAGACGAATACCATGGAAAAATAAAATGAGGGGAAATT 115085997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8089 ACAGAACTCTATAAACCAGACAGAGACGAATACCATGGAAAAATAAAATGAGGGGAAATT 8148

115085998 AGTAATTGTCAAAATTTATAATTGTTCAGCCATTCAGGAAGTGTTGAATATATTGAGAAG 115086057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8149 AGTAATTGTCAAAATTTATAATTGTTCAGCCATTCAGGAAGTGTTGAATATATTGAGAAG 8208

115086058 CTACTATGAGGTAGGCATAGTCTTATTTGTTGGAGTTAATATGACAGGCATAATCAGACA 115086117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     8209 CTACTATGAGGTAGGCATAGTCTTATTTGTTGGAGTTAGTATGACAGGCATAATCAGACA 8268

115086118 CAGCCTGAGGGACTTTAATATTCTAAATACAAATATACCTAACGGACTTGGTTTTAGCAT 115086177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8269 CAGCCTGAGGGACTTTAATATTCTAAATACAAATATACCTAACGGACTTGGTTTTAGCAT 8328

115086178 TCTACTACTTAGCTACCTATGTAGACTTAAGTCAATAAAGCTAAACAGAATCATCTCTCG 115086237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8329 TCTACTACTTAGCTACCTATGTAGACTTAAGTCAATAAAGCTAAACAGAATCATCTCTCG 8388

115086238 CATACCTTAGAAAGCTACATTTTCTGAGAGCGTAAGAAAGGATTTGTACAGAACAGAAAA 115086297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8389 CATACCTTAGAAAGCTACATTTTCTGAGAGCGTAAGAAAGGATTTGTACAGAACAGAAAA 8448

115086298 TGTAATGGAATGTAGTAGGCTGTCTTTTAAAAAAATCATTGTGAAGCAAGTACACTGTAC 115086357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8449 TGTAATGGAATGTAGTAGGCTGTCTTTTAAAAAAATCATTGTGAAGCAAGTACACTGTAC 8508

115086358 ACTTGTTACCAATTTGTCTAAGTCCAGTGAAACAGAACACTCATGAACACAACAAGTTAC 115086417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8509 ACTTGTTACCAATTTGTCTAAGTCCAGTGAAACAGAACACTCATGAACACAACAAGTTAC 8568

115086418 ATGAAGTGGTTTATTATTTATACATAGGCAGCAAAGGACAACAGAAATCTAGGATGGTTA 115086477
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8569 ATGAAGTGGTTTATTATTTACACATAGGCAGCAAAGGACAACAGAAATCTAGGATGGTTA 8628

115086478 GGAGCTGGTTTCACAAGCCTCAGGATAGCTGCCTGGAGTGGACAGAATGTCATCTGTGCA 115086537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8629 GGAGCTGGTTTCACAAGCCTCAGGATAGCTGCCTGGAGTGGACAGAATGTCATCTGTGCA 8688

115086538 TATACCACTTGCAACACAGATGAAGAATCCTGGAAAGCCGCCCACCCCAGTTTTTATACC 115086597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8689 TATACCACTTGCAACACAGATGAAGAATCCTGGAAAGCCGCCCACCCCAGTTTTTATACC 8748

115086598 CCAGGGTAACATGACTGCCCTCGTAGAAGTAGTGAAGGATATCCTGCTTCCTGTGGGGGA 115086657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8749 CCAGGGTAACATGACTGCCCTCGTAGAAGTAGTGAAGGATATCCTGCTTCCTGTGGGGGA 8808

115086658 CTGAAACAGAGCTCAGGCTGTTGTACGGCAGGCTGTTGTACGGGTCTCTCCCTGTCGCAA 115086717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8809 CTGAAACAGAGCTCAGGCTGTTGTACGGCAGGCTGTTGTACGGGTCTCTCCCTGTCACAA 8868

115086718 GTTGTTACATTCCCAGCACATTCTAGTTATTCTTAGGAACTGCAAGTAAGAAAAGAAATA 115086777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8869 GTTGTTACATTCCCAGCACATTCTAGTTATTCTTAGGAACTGCAAGTAAGAAAAGAAATA 8928

115086778 GAACTAGATTGGCTCAAAGCCACTCACATAACTGTACTGCAGTCATTCTCTAAAAACCTG 115086837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8929 GAACTAGATTGGCTCAAAGCCACTCACATAACTGTACTGCAGTCATTCTCTAAAAACCTG 8988

115086838 CTTCAAAACTAACTAAGAAGATAAGAAGAGAGATAGAACCCACAACAGACCTAAAAACTA 115086897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8989 CTTCAAAACTAACTAAGAAGATAAGAAGAGAGATAGAACCCACAACAGACCTAAAAACTA 9048

115086898 AGAATTCCTGGGAGGTGGGGCTGAAAAAATTGGCCTTTTTTAAAATTTGCCAAATGATCA 115086957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     9049 AGAATTCCTGGGAGGTGGGGCTGAAAAAATTGGCCTTTTTTAAAACTTGCCAAATGATCA 9108

115086958 CACAAGCACTAAATCTTCAGACCTCCTAGAGTGGATCTCGAAATATATTAACAATAAGAA 115087017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9109 CACAAGCACTAAATCTTCAGACCTCCTAGAGTGGATCTCGAAATATATTAACAATAAGAA 9168

115087018 ATAAGAAATAAAATTTTAAAGGGAAAAAAAGTGTGAAAAGGTAGAGGAATGAAGGAACAA 115087077
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     9169 ATAAGAAATAAAATTTTAAAGGGAAAAAAATTGTGAAAAGGTAGAGGAATGAAGGAACAA 9228

115087078 TTTGCTTATTAATATTGATGGGCATACTCAAGAATTTTAAAAAGTATCAAGAAAAGTAGT 115087137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     9229 TTTGCTTATTAATATTGATGGGCATACTCAAGAATTTTAAAGAGTATCAAGAAAAGTAGT 9288

115087138 TTT 115087140
          |||
     9289 TTT 9291

Alignment time is 6.96396 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [115069315,115090676] =>     21362 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2819] =>      2819 nucs 'mol-32-34b3-186703_2819'

Score:        2734
Aligned:      2802        nucs
Identic:      2795 (100%) nucs =>      2101 (100%)       694 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [115076508,115078614] EXCISED REGION [115078621,115079315]
 second seq =>  [        1,     2105] EXCISED REGION [     2125,     2819]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [115078615,115078620]
 second seq =>        19 nucs [2106,2124]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2105,2106] to [2124,2125]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115078614,115078614] to [115078621,115078621]
 second seq =>         1 nucs [2105,2105] to [2125,2125]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [115078615,115078615] to [115078620,115078620]
 second seq =>         1 nucs [2106,2106] to [2124,2124]

115076508 TAAAAAAGAGAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGA 115076567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAAAAGAGAGAAAATATAAAAAGATATTTGTGTGAACACAAGATAGATATCTCTATGA 60

115076568 GTCAAAAGTAAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCAT 115076627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCAAAAGTAAGACAGAAACTAGAGAAAGTAAGTGAGTTTGAAACCACTGGTTTACTCAT 120

115076628 GGCCAGAGACTTGCAATAAAGGCCAAGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATG 115076687
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCCAGAGACTTGCAATAAAGGCCAGGAAATTATTTGGACTAAAATGTACATGAGATATG 180

115076688 GCATACTGAAGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGAT 115076747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATACTGAAGCCAGATTCACTGTTTTAAGTAAACGGATGTAGGAGAACTTATAAATGAT 240

115076748 AGTGAATGATAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGCGGATTAT 115076807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      241 AGTGAATGATAACATGACTGCCAATCTAGAGCATTGATTTTAACAGAAGTTGTGGATTAT 300

115076808 ATATCCAAATATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAA 115076867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATCCAAATATACAACAGGCAATACAGGATTATATAGAATGAGCAGGGAAGAGCAAAAA 360

115076868 CACAACATTGAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAAC 115076927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAACATTGAAAGATGAATTTAGCCAACTCTTACTAGTTTCATGACAATCTACAATAAC 420

115076928 TTCAAACATATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAA 115076987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCAAACATATAAGACTTCATTCTAGATTGGGGACTTGCCAGATTGATGGAAATGCAAAA 480

115076988 GGGCTATCTGGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAA 115077047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGCTATCTGGAAGGAAGAAAAAGAGAAAAAATACAAATAATAATAACAATGGAAGAAAA 540

115077048 ACAAAATGGCTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAA 115077107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAAATGGCTCCTACTTAAAATGAACCTGCCAACCAAAATTACAAAACACATAAAGGAA 600

115077108 TAACATGCTAAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAA 115077167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAACATGCTAAAAATATATCCTAGAAAACAACAATAATACAGGAATTCATTTGAAGTGAA 660

115077168 CTTAATTTTAAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAA 115077227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTAATTTTAAGGAAGCAATCTGGTGAAAATTTTAAAATGCACATACTTTAGAAGCTTAA 720

115077228 AGTGATAGTAAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAA 115077287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTGATAGTAAAGAAAATCATTAAAAATAAATAATGAAACAAATACAGGTAGTCATGAAA 780

115077288 GAAGAACAGATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTT 115077347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGAACAGATAGGATAATATAAACAATGGAATTGATATTTTTTGGAAAGGGTCATTTTT 840

115077348 ATTCTAGTTAACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAA 115077407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTCTAGTTAACTGTAAAGATATATTAAATTAAAATATAATATTTAGTATTAACTCAGAA 900

115077408 TGCATTACAGATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGA 115077467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCATTACAGATAAATCAAGATATAAAATATATTAAAGAAAAGGTAAGAGGCACAAAGGA 960

115077468 GAGATTGGTCTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAG 115077527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGATTGGTCTGTGCCTGCATTCTTCAAATGAAAGTAACAGAGAAAGCAGCAAATGTCAG 1020

115077528 AGTTACAATGTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAG 115077587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTACAATGTTTAAAGAGATAATTACCAAGAGTTTAGCAAAATATTTGAAAAGAGAGAG 1080

115077588 AAACTAATTTCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATA 115077647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACTAATTTCAAGTTTAAAGTGCACCCTGAATATCAGACACGATAATTATAAATTAATA 1140

115077648 CCTGCACACATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAA 115077707
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGCACACATTGTAGAAACTCTGTAGAAAACAAAAACATAGAAAAGAAATAACTTTTAA 1200

115077708 ACACTGCTTGAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTC 115077767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACTGCTTGAGAGAAAATATTATTTACAAAGACATTGCAATTAGATTGCACCCAGCTTC 1260

115077768 TGAAAAGCAACAGTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTC 115077827
          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAAAAGCAA--GTTTTCATTTATCTAATATTCAAATATTTATTAAATGCTTACTCTTTC 1318

115077828 CCTGACATTAGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTC 115077887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CCTGACATTAGTATGCATACTCCAGAGAGAGCTGTGAACAAAACAGACATAAATTCCTTC 1378

115077888 CTTTGTGGAGCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAAT 115077947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CTTTGTGGAGCATATTACATTCTAGTTTGAAAACAAGAAAATAATAGAATATGTTAAAAT 1438

115077948 TGCTGTGGCAAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAAT 115078007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TGCTGTGGCAAATAACTGTGAATCCAGTAGGTTAAAAAATGTAATAAACCATTATAAAAT 1498

115078008 AATATAAAAAATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCA 115078067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AATATAAAAAATATTTTCAGGCATATGAAGATGAAGAGAGTTCATAAAAAATTGTTGCCA 1558

115078068 AATAAAGTGAAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAG 115078127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AATAAAGTGAAACCACACTACAAAACTGATTGTACATTTATACAATTTACTGATGAAAAG 1618

115078128 CAGTATTAAAAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTA 115078187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CAGTATTAAAAGACAAAGGAGAAACATTTGTTCATTTCCATAAATACAGAAAAAGAATTA 1678

115078188 AATGCCATCCTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGA 115078247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AATGCCATCCTTTTTATTATTTTTTAAAGGTAATTACATGAATTATTTACACATAATAGA 1738

115078248 AGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAATCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACA 115078307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1739 AGAGGCTGAGAAGCTAACTAGGACACACTAAGGCAACCTAAAAATTCAGGCAGAAAGACA 1798

115078308 TGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCA 115078367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TGATTGCCCCTAGACTGGAGAGATAAATGGAGGAGGTTGGATTAAACTGAGAGATTAGCA 1858

115078368 CTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAG 115078427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTGCTTTGCAGAGGTTAGAACTTCCGCATCTGTCTGACAGGAATTGGCACTATGAAAGAG 1918

115078428 ATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCC 115078487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATGCTGCTGCTGCTAGAGGCATCTTCCAAGGTATAAGAAGGGAAAATATTGCTTTCTCCC 1978

115078488 TTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAG 115078547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTACAATTTTTTACCTCTGTTTCCAACCAACCATAAGTAGGTTGCCACTAGGATTCACAG 2038

115078548 GAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACA 115078607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GAATCAGCCCCACTTTCAAAGAGAAATTATAATGAGGAGAGGTGAGAAGTATATATAACA 2098

115078608 GAAAACA 115078614
          |||||||
     2099 GAAAACA 2105

EXCISED REGION

115078621 AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACCTAAAT 115078680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 AAGTACCTTACCTTAAATTACATGCACAAAAATCAAGTCTACATTACTAAAGACCTAAAT 2184

115078681 GTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAACAGTAT 115078740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 GTATTACTAAAGACCTAAACGTACATAGTAAAACTTCAAAAATATCAGATAAAACAGTAT 2244

115078741 CTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTAAGAAC 115078800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 CTTAGTAATCTTTGTTAGGAAAGGTTTCCTAAACAAAATACAAGCATGCAAACTAAGAAC 2304

115078801 AAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATGACAAAATTTT 115078860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 AAAATGTTTCATATTTGGTACATTACAATTAAAATTTACTTATCAACATGACAAAATTTT 2364

115078861 TAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATTACTCT 115078920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TAAAAAATCATTGATTAGAAGAAACCTTTTCATTGCATCTAATGTCTAATTAATTACTCT 2424

115078921 CTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGTTATAT 115078980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 CTAGTATATATAAAATCTTAAAAAGTAATAAGAAAATACAAATTTCTCTTCTTGTTATAT 2484

115078981 ATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCATTGTAG 115079040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 ATCCAAAGGAAATAAATTCAATATCTCAAATAGATTTCTGCACTCCCATGTTCATTGTAG 2544

115079041 ACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTAATACA 115079100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 ACTTATTCACAATAGCCAAGATGCTGAAAAAACCTAAGTGTCCCTCTATGGATTAATACA 2604

115079101 TAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTAATAACCAATC 115079160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TAAGTAAGTAATTTTACATATATAAAATGACTGGCCATTTATTTCACTTAATAACCAATC 2664

115079161 ATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAAGGGTAGGCTTTC 115079220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2665 ATTTTATATACATAAAATGTCCTTCAAGTCCATCCATGTTGTAGCAAATGGTAGGCTTTC 2724

115079221 CTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAG 115079280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 CTATTTTAAGGCTTAATAATATTCCAAATATTATTAAACCTTAAAAGGTATTTTTTAAAG 2784

115079281 GTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 115079315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 GTAAATACATGAATTATTTACACGTAATATTAGAC 2819

Alignment time is 2.1624 s

