
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4324] =>      4324 nucs 'mol-32-1e7c-086045_4324'

Score:        4313
Aligned:      4324        nucs
Identic:      4323 (100%) nucs =>      1745 (100%)      2578 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292307,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299718]
 second seq =>  [        1,     1745] EXCISED REGION [     1746,     4324]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292307 GTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAA 112292366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAA 60

112292367 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTT 112292426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTT 120

112292427 GGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGAT 112292486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGAT 180

112292487 ATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCC 112292546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCC 240

112292547 TCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCC 112292606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCC 300

112292607 TATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGAT 112292666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGAT 360

112292667 ATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTC 112292726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTC 420

112292727 ACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATT 112292786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATT 480

112292787 GAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGG 112292846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGG 540

112292847 TCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAG 112292906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAG 600

112292907 ACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAAC 112292966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAAC 660

112292967 AACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTT 112293026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTT 720

112293027 ATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATT 112293086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATT 780

112293087 GCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTC 112293146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTC 840

112293147 AAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTA 112293206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTA 900

112293207 TATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGT 112293266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGT 960

112293267 GTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATT 112293326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATT 1020

112293327 TGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCA 112293386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCA 1080

112293387 CACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATC 112293446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATC 1140

112293447 TTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTT 112293506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTT 1200

112293507 TATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATC 112293566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATC 1260

112293567 ATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAG 112293626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAG 1320

112293627 TCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTAC 112293686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTAC 1380

112293687 AACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATT 112293746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATT 1440

112293747 TCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATG 112293806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATG 1500

112293807 TGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGA 112293866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGA 1560

112293867 CAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCT 112293926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCT 1620

112293927 TACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCT 112293986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCT 1680

112293987 AGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTA 112294046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTA 1740

112294047 AAAAT 112294051
          |||||
     1741 AAAAT 1745

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1805

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1865

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1925

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1985

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2045

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2105

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2165

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2225

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2285

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2345

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2405

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2465

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2525

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2585

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2645

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2705

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2765

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2825

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2885

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2945

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2946 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 3005

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 3065

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3125

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3185

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3245

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3305

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3365

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3425

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3485

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3545

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3605

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3665

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3725

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3785

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3845

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3905

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3965

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 4025

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 4085

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4145

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4205

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4265

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATC 112299718
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATC 4324

Alignment time is 3.57306 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2547] =>      2547 nucs 'mol-32-1e7c-104852_2547'

Score:        2547
Aligned:      2547        nucs
Identic:      2547 (100%) nucs =>      1861 (100%)       686 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292191,112294051] EXCISED REGION [112297140,112297825]
 second seq =>  [        1,     1861] EXCISED REGION [     1862,     2547]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292191 CGCCTCCCGGCTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGC 112292250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCCTCCCGGCTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGC 60

112292251 ACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCACCGTTT 112292310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCACCGTTT 120

112292311 AGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 112292370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 180

112292371 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTC 112292430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTC 240

112292431 AAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTG 112292490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTG 300

112292491 GGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTA 112292550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTA 360

112292551 ACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATA 112292610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATA 420

112292611 CATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGT 112292670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGT 480

112292671 GTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACAT 112292730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACAT 540

112292731 GTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAG 112292790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAG 600

112292791 ATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCT 112292850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCT 660

112292851 TAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTA 112292910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTA 720

112292911 ATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACG 112292970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACG 780

112292971 ATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTC 112293030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTC 840

112293031 CTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTT 112293090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTT 900

112293091 AGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAA 112293150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAA 960

112293151 GTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATT 112293210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATT 1020

112293211 AAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCT 112293270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCT 1080

112293271 AGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTA 112293330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTA 1140

112293331 TCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACA 112293390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACA 1200

112293391 TACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTAT 112293450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTAT 1260

112293451 TTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATT 112293510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATT 1320

112293511 GGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTT 112293570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTT 1380

112293571 CAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAA 112293630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAA 1440

112293631 ACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACC 112293690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACC 1500

112293691 TAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCT 112293750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCT 1560

112293751 CACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGG 112293810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGG 1620

112293811 CATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGG 112293870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGG 1680

112293871 AATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACC 112293930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACC 1740

112293931 CAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGC 112293990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGC 1800

112293991 TCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAA 112294050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAA 1860

112294051 T 112294051
          |
     1861 T 1861

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1921

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1981

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 2041

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 2101

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2161

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2221

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2281

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2341

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2401

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2461

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2521

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCC 112297825
          ||||||||||||||||||||||||||
     2522 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCC 2547

Alignment time is 2.09406 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2847] =>      2847 nucs 'mol-32-2110-078979_2847'

Score:        2826
Aligned:      2848        nucs
Identic:      2846 (100%) nucs =>      2241 (100%)       605 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112291809,112294051] EXCISED REGION [112297140,112297744]
 second seq =>  [        1,     2242] EXCISED REGION [     2243,     2847]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112291809 AACTTTGACCATAAACCTAGTACCTTTCAGGTATCACCTCTGGAATTTCATACGAGAAAG 112291868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTTTGACCATAAACCTAGTACCTTTCAGGTATCACCTCTGGAATTTCATACGAGAAAG 60

112291869 TTAGCATTTACCTGAGCAATGAAGAAAGTGAGTGTCTGTGAGGTTGCTGAGACAATCTTG 112291928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGCATTTACCTGAGCAATGAAGAAAGTGAGTGTCTGTGAGGTTGCTGAGACAATCTTG 120

112291929 AAAACCCTGAAGCCATAAATAGAAAGCCCAATGGGTCACTCCATTGACCTTTCTTGTCCC 112291988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      121 AAAACCCTGAAGCCATAAATAGAAAGCCCAATGGGTCACTCCATTGACCTTACTTGTCCC 180

112291989 CTGTAGTGTTGATTAAGCAGACTCTATCTGGAGCATATCCACTCCTCTTGGCAGTAATAA 112292048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTAGTGTTGATTAAGCAGACTCTATCTGGAGCATATCCACTCCTCTTGGCAGTAATAA 240

112292049 AATATGACAGGTCTCTTGAGGCTCTTGTTCAACAGGAAAACATCTCTTCTTCATTTTTTT 112292108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATATGACAGGTCTCTTGAGGCTCTTGTTCAACAGGAAAACATCTCTTCTTCATTTTTTT 300

112292109 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 112292168
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 359

112292169 GATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGCTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 112292228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGCTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 419

112292229 CCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAG 112292288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAG 479

112292289 TAAAGACGGGGTTTCACCGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCAC 112292348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TAAAGACGGGGTTTCACCGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCAC 539

112292349 CCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTC 112292408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTC 599

112292409 TTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTC 112292468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTC 659

112292469 AAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCT 112292528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCT 719

112292529 TCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTG 112292588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTG 779

112292589 TAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTT 112292648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTT 839

112292649 GGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCT 112292708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCT 899

112292709 CTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGA 112292768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGA 959

112292769 AAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTT 112292828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTT 1019

112292829 ATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCAC 112292888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCAC 1079

112292889 ATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAG 112292948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAG 1139

112292949 TTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCT 112293008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCT 1199

112293009 AAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCA 112293068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCA 1259

112293069 CCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTG 112293128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTG 1319

112293129 AAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAAT 112293188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAAT 1379

112293189 TCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATA 112293248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATA 1439

112293249 AATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATT 112293308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATT 1499

112293309 TTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCA 112293368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCA 1559

112293369 CAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTT 112293428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTT 1619

112293429 AGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATAC 112293488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATAC 1679

112293489 AAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTC 112293548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTC 1739

112293549 CTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTA 112293608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTA 1799

112293609 GTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTG 112293668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTG 1859

112293669 AATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGG 112293728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGG 1919

112293729 AGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTT 112293788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTT 1979

112293789 TGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAA 112293848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAA 2039

112293849 GGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAAT 112293908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAAT 2099

112293909 TATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTT 112293968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTT 2159

112293969 TCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAA 112294028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAA 2219

112294029 TTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||
     2220 TTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 2242

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 2302

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 2362

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 2422

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 2482

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2542

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2602

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2662

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2722

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2782

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2842

112297740 GAGAG 112297744
          |||||
     2843 GAGAG 2847

Alignment time is 2.36093 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     8245] =>      8245 nucs 'mol-32-287f-122562_8245'

Score:        8190
Aligned:      8245        nucs
Identic:      8240 (100%) nucs =>      1051 (100%)      7189 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293001,112294051] EXCISED REGION [112297140,112304333]
 second seq =>  [        1,     1051] EXCISED REGION [     1052,     8245]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293001 ACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAG 112293060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAG 60

112293061 GAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGA 112293120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGA 120

112293121 AATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATC 112293180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATC 180

112293181 AAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCAT 112293240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCAT 240

112293241 CGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTA 112293300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTA 300

112293301 TGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATAT 112293360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATAT 360

112293361 ATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGAT 112293420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGAT 420

112293421 CTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAAC 112293480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAAC 480

112293481 CAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTT 112293540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTT 540

112293541 CTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCT 112293600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCT 600

112293601 CAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAAT 112293660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAAT 660

112293661 GGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATAT 112293720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATAT 720

112293721 CACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTT 112293780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTT 780

112293781 TCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTA 112293840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTA 840

112293841 ATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAA 112293900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAA 900

112293901 CGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATAC 112293960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATAC 960

112293961 TTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAA 112294020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAA 1020

112294021 TGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1051

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1111

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1171

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 CCAAATGAGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1231

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1291

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1351

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1411

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1471

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1531

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1591

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1651

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1711

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1771

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1831

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1891

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1951

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2011

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2071

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2131

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2191

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2251

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2252 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2311

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2371

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2431

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2491

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2551

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2611

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2671

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2731

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2791

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2851

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2911

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2971

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3031

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3091

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3151

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3211

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3271

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3331

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3391

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3451

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3511

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3571

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3631

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3691

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 3751

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 112299899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 3811

112299900 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 112299959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 3871

112299960 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 112300019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 3931

112300020 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 112300079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3932 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 3991

112300080 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 112300139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 4051

112300140 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 112300199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 4111

112300200 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 112300259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 4171

112300260 ACCTTTTATATTGCAATTTTGCGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 112300319
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 ACCTTTTATATTGCAATTTTGTGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 4231

112300320 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 112300379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 4291

112300380 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 112300439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 4351

112300440 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 112300499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 4411

112300500 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 112300559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 4471

112300560 ATTACTCAATAGTTGGCAAGGCTTAATGTGAACATACTATTTAACACAAATTTTTCAAAG 112300619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 ATTACTCAATAGTTGGCAAGGCTTAATGTGAACATACTATTTAACACAAATTTTTCAAAG 4531

112300620 AGATTGAATATTTATAATGTGTAATCATATATGCACCAGTTCATTAATGTTAGTCTCTAC 112300679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 AGATTGAATATTTATAATGTGTAATCATATATGCACCAGTTCATTAATGTTAGTCTCTAC 4591

112300680 ACTATAATTTTAAAAAATAATTACAAAATAATGCCCTCAAAATTCAAAGTTTCAGGATCA 112300739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 ACTATAATTTTAAAAAATAATTACAAAATAATGCCCTCAAAATTCAAAGTTTCAGGATCA 4651

112300740 ATACACAGAATAATCATAAGGAAGCTTGAACAAATATCTTGATTCATGCAGACATAGGGG 112300799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 ATACACAGAATAATCATAAGGAAGCTTGAACAAATATCTTGATTCATGCAGACATAGGGG 4711

112300800 TACTTACCTGAGTGCCAATCAGAAAACAACTACAACAAAATTCCCTCTGAGGACAAACAT 112300859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4712 TACTTACCTGAGTGCCAATCAGAAAACAACTACAACAAAATTCCCTCTGAGGACAAACAT 4771

112300860 TTTAAAACATTATGAGGGTAAACTTTACCAATACATACCTTCCTACTCTGTAGCATATAT 112300919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 TTTAAAACATTATGAGGGTAAACTTTACCAATACATACCTTCCTACTCTGTAGCATATAT 4831

112300920 TGTACAGATATGTGTTTGTATAGGCCACATGTTTGTGAGCACTGGATTTTTAAAGACTAA 112300979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 TGTACAGATATGTGTTTGTATAGGCCACATGTTTGTGAGCACTGGATTTTTAAAGACTAA 4891

112300980 TGAGCTATTGATCCTTCCTGATCATCAATGATGTTATTTCATAATGTATACTCCATACAT 112301039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 TGAGCTATTGATCCTTCCTGATCATCAATGATGTTATTTCATAATGTATACTCCATACAT 4951

112301040 GGCTACTGATTTCCTATTCAGCTCTGCCTCCAATTTGAATACTGGCAATTTCTATCAAAG 112301099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 GGCTACTGATTTCCTATTCAGCTCTGCCTCCAATTTGAATACTGGCAATTTCTATCAAAG 5011

112301100 AAAGCAAAAGTGATCCAATTCCTAGCCAAAGTCTAAGTGAAAACAAGAATATTTGAAGCA 112301159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 AAAGCAAAAGTGATCCAATTCCTAGCCAAAGTCTAAGTGAAAACAAGAATATTTGAAGCA 5071

112301160 AACACAAATGCAGAGTTCTAGGGATTGTTAGAGGAAAAGAAATATTTAAAAGGCGGGATT 112301219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 AACACAAATGCAGAGTTCTAGGGATTGTTAGAGGAAAAGAAATATTTAAAAGGCGGGATT 5131

112301220 TTAGAATTAATACTAACAGCAGACGAGTTACCTTTTGAGAGCACAATGGAGGCAAAGAAG 112301279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 TTAGAATTAATACTAACAGCAGACGAGTTACCTTTTGAGAGCACAATGGAGGCAAAGAAG 5191

112301280 GCCTTCACATACATCAACAGGTAAAGCAAATGCACTATTACAGACTGAGCATTATCTGTA 112301339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 GCCTTCACATACATCAACAGGTAAAGCAAATGCACTATTACAGACTGAGCATTATCTGTA 5251

112301340 AATGACAATATGTATTCAGTTGAAGCTGAGCTGCTAAAATAGAACATGCAAGAGGGGAAT 112301399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 AATGACAATATGTATTCAGTTGAAGCTGAGCTGCTAAAATAGAACATGCAAGAGGGGAAT 5311

112301400 GGTAAAGAAACAGACTAGAGGGTTTTTGCTAGAGCTCAGTTTTCAAAAATTCTAAAGGAG 112301459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 GGTAAAGAAACAGACTAGAGGGTTTTTGCTAGAGCTCAGTTTTCAAAAATTCTAAAGGAG 5371

112301460 GATGAACTTAGAATAAGGACTGTTAGTATTCATATATTGTTATACTAGTATGCTTTCTTA 112301519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 GATGAACTTAGAATAAGGACTGTTAGTATTCATATATTGTTATACTAGTATGCTTTCTTA 5431

112301520 GCTCTTAGTTTTATCATGTAATTGAATCATATATTGTGTGGATTGTTGAATCTGTCTTCT 112301579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 GCTCTTAGTTTTATCATGTAATTGAATCATATATTGTGTGGATTGTTGAATCTGTCTTCT 5491

112301580 TTCACTTAGCATAATGATTCTAATATTCATTCACGCTGCTGTATATTTTAGTTGTTCATT 112301639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 TTCACTTAGCATAATGATTCTAATATTCATTCACGCTGCTGTATATTTTAGTTGTTCATT 5551

112301640 CATTTTAAATTATTGGGTAGTATTTCATTACATAGATGTCCAATACTTAGGTTATCAGTT 112301699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 CATTTTAAATTATTGGGTAGTATTTCATTACATAGATGTCCAATACTTAGGTTATCAGTT 5611

112301700 TATCAGTTGATGGACATCTGGACAAGTTCTAATTTTATGTGATTGTGAATAAAGTTACTA 112301759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 TATCAGTTGATGGACATCTGGACAAGTTCTAATTTTATGTGATTGTGAATAAAGTTACTA 5671

112301760 TTAACATTTGCTTACAGGCTTTCATGTGACATAAGCTTTCATTTCTCCTGCATAATACCT 112301819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 TTAACATTTGCTTACAGGCTTTCATGTGACATAAGCTTTCATTTCTCCTGCATAATACCT 5731

112301820 AGCAGTAATATTGCTTGAACATATGTGAAGTACAACTTCATAAGATACTGTCTATTTCCC 112301879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 AGCAGTAATATTGCTTGAACATATGTGAAGTACAACTTCATAAGATACTGTCTATTTCCC 5791

112301880 CTAGTGGCTGTTCCATTTTGCATTCCCACCAGTAATGTATAAGTTCCAATTGCTCCGTCT 112301939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 CTAGTGGCTGTTCCATTTTGCATTCCCACCAGTAATGTATAAGTTCCAATTGCTCCGTCT 5851

112301940 CCTTGTCAACATTTGTTTTTGTCCATTGTATTGGTTTTAGACTTTCTAGTAGGTACACAG 112301999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 CCTTGTCAACATTTGTTTTTGTCCATTGTATTGGTTTTAGACTTTCTAGTAGGTACACAG 5911

112302000 TAGTATCAAACTACTTTAAATTCTAGGAAGTTTTAACAGAAAGTCTTAATGTTGGTCATT 112302059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 TAGTATCAAACTACTTTAAATTCTAGGAAGTTTTAACAGAAAGTCTTAATGTTGGTCATT 5971

112302060 TGCTGTATAGATATTCCCAAGCAGCAGGTACTGTTTTTAAAAAATATATCATTTTAAGTC 112302119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 TGCTGTATAGATATTCCCAAGCAGCAGGTACTGTTTTTAAAAAATATATCATTTTAAGTC 6031

112302120 ATACTTTATTTAAAATAATTTAAAATTATAAATTTTATTATATTTTATTGTGGTTTGTTT 112302179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 ATACTTTATTTAAAATAATTTAAAATTATAAATTTTATTATATTTTATTGTGGTTTGTTT 6091

112302180 CTTTTTAAAGGCACCGATAACTGTATGATGCTCTTTTGTTTACTTTTTGGTAGCTTTTAC 112302239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 CTTTTTAAAGGCACCGATAACTGTATGATGCTCTTTTGTTTACTTTTTGGTAGCTTTTAC 6151

112302240 TGTTTGTTTTAATTCTTTTCATTATTTCTTTTCCTTCATTTTCTATTTCTTTTGAGGAAT 112302299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 TGTTTGTTTTAATTCTTTTCATTATTTCTTTTCCTTCATTTTCTATTTCTTTTGAGGAAT 6211

112302300 TACCTTTTATGCTTGTTTTATTTTATACTCCTATTTAAAGTAATGGTTTTAAATAATATT 112302359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 TACCTTTTATGCTTGTTTTATTTTATACTCCTATTTAAAGTAATGGTTTTAAATAATATT 6271

112302360 TTATTTTGCATTTCATTCATTGTCTAATATCTACTACCTCTCTACTAAGTTTTTGATTCT 112302419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 TTATTTTGCATTTCATTCATTGTCTAATATCTACTACCTCTCTACTAAGTTTTTGATTCT 6331

112302420 TATTCAAATTTTTCTTTTGTACTAACTTTGTCTTTGTTTATGGCCTCTCATTTTGAGACA 112302479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 TATTCAAATTTTTCTTTTGTACTAACTTTGTCTTTGTTTATGGCCTCTCATTTTGAGACA 6391

112302480 TTAGAAAATAAATTTTATATTTTTCAGTGGACATATCTTTCTGACATGCAGGCATATTTC 112302539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 TTAGAAAATAAATTTTATATTTTTCAGTGGACATATCTTTCTGACATGCAGGCATATTTC 6451

112302540 TAGCATCTATTTGTTCATTAATTTATTCTTTACTCTTTTTTCTTTCATTTTAAATTTGTG 112302599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 TAGCATCTATTTGTTCATTAATTTATTCTTTACTCTTTTTTCTTTCATTTTAAATTTGTG 6511

112302600 AAAGATATGACCATAATTAATTTATTTTGATAATTTTAGTTGAAATTATTTTTCTCTGAA 112302659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 AAAGATATGACCATAATTAATTTATTTTGATAATTTTAGTTGAAATTATTTTTCTCTGAA 6571

112302660 CTAGTAAGAATTAGTATACAAAAGTACCTTTTTAAAACATGGTACACTATTTCTGAGATC 112302719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 CTAGTAAGAATTAGTATACAAAAGTACCTTTTTAAAACATGGTACACTATTTCTGAGATC 6631

112302720 TTCTGGAATCCATTCTCACTGTATTTTGCAATTATCTTTCTTTTTTCTGTAATGTAACTC 112302779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 TTCTGGAATCCATTCTCACTGTATTTTGCAATTATCTTTCTTTTTTCTGTAATGTAACTC 6691

112302780 TCCTGTTCATTTTCATTTCTACTCCCAGTTTTTCACGGTGCCAGGGAGGGTGGTGGTTTC 112302839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 TCCTGTTCATTTTCATTTCTACTCCCAGTTTTTCACGGTGCCAGGGAGGGTGGTGGTTTC 6751

112302840 AGATATTTTCCAGTAGTCATAATGCTTATACTGTTCTAGCTCCTTCAGATCTTTCTGTTA 112302899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 AGATATTTTCCAGTAGTCATAATGCTTATACTGTTCTAGCTCCTTCAGATCTTTCTGTTA 6811

112302900 ACTTACCCACATGTAGGGGTGCTCAACAACTCTTCCCAGTTTTAGCTTGTTTTCACATTT 112302959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 ACTTACCCACATGTAGGGGTGCTCAACAACTCTTCCCAGTTTTAGCTTGTTTTCACATTT 6871

112302960 GCCTGCTGCATATATGAAGAAGTATCTATCTTCACTTTTTGGGTTTTCCTGTTCTTACAA 112303019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 GCCTGCTGCATATATGAAGAAGTATCTATCTTCACTTTTTGGGTTTTCCTGTTCTTACAA 6931

112303020 GCTCTGCCACCTCATTGCTTTTTTCGGACCTCTCTAGTTGCTATTATTCTGCAGGTCTTA 112303079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 GCTCTGCCACCTCATTGCTTTTTTCGGACCTCTCTAGTTGCTATTATTCTGCAGGTCTTA 6991

112303080 CAGTGTCTTTTATTTTCTTTTTGTCCTAGAGATTTTGATTTTGCTGTGCTTACTGCTCTC 112303139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 CAGTGTCTTTTATTTTCTTTTTGTCCTAGAGATTTTGATTTTGCTGTGCTTACTGCTCTC 7051

112303140 TTTGATATTATGTCGATTTTGAATAAATTCAAATATGTTACTACTGCTGCCGACTCTTTC 112303199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 TTTGATATTATGTCGATTTTGAATAAATTCAAATATGTTACTACTGCTGCCGACTCTTTC 7111

112303200 TCAATATACATAACACTTGAAAATATAATAACTATTTACTTTGCAGAGATTATCAAACAC 112303259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7112 TCAATATACATAACACTTGAAAATATAATAACTATTTACTTTGCAGAGATTATCAAACAC 7171

112303260 AAAGAAGTAAATGGAAAAGGATTACAGTTCAAGCTATATTATTATAGAGTTAAATCTTAT 112303319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 AAAGAAGTAAATGGAAAAGGATTACAGTTCAAGCTATATTATTATAGAGTTAAATCTTAT 7231

112303320 ACCTCAAGTAAGTAGGCATAAAAATGAAATAATTTGGACAAGTTAGCTTAATTGATAATG 112303379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 ACCTCAAGTAAGTAGGCATAAAAATGAAATAATTTGGACAAGTTAGCTTAATTGATAATG 7291

112303380 AAGAAACAAATTTTGAAGATACATGTGAAAAGTCTGGTTTTATGAAATAAATCTAAATAC 112303439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 AAGAAACAAATTTTGAAGATACATGTGAAAAGTCTGGTTTTATGAAATAAATCTAAATAC 7351

112303440 AGCAATAATAATTGTCTTTTATATTAGTTTGTATAAAATATATATTTATGTACTTTCAAT 112303499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7352 AGCAATAATAATTGTCTTTTATATTAGTTTGTATAAAATATATATTTATGTACTTTCAAT 7411

112303500 GAAATCAATGAATTCTGCATTATTATTGAAGTTTTTATTTCCTTTATACTCATAAAAGAA 112303559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7412 GAAATCAATGAATTCTGCATTATTATTGAAGTTTTTATTTCCTTTATACTCATAAAAGAA 7471

112303560 AAATATATTCAAGGATGCCAAATAAATATGTAAACAACAAAAAATATGAGAAAAGATTTT 112303619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7472 AAATATATTCAAGGATGCCAAATAAATATGTAAACAACAAAAAATATGAGAAAAGATTTT 7531

112303620 TCTCATTGTTCAGGGAATATATTGCTTTACATTTGGGAAGTCTTGATATATAATAAGCTT 112303679
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7532 TCTCATTGTTCAGGGAATACATTGCTTTACATTTGGGAAGTCTTGATATATAATAAGCTT 7591

112303680 TTTTTTTTAATTTTTGAGATGGAATCTTGCTCTGTGGCAAAGGCTGGAGTGCAGCAGTGC 112303739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7592 TTTTTTTTAATTTTTGAGATGGAATCTTGCTCTGTGGCAAAGGCTGGAGTGCAGCAGTGC 7651

112303740 AATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCCAGAGTTCATATAATTCTCCTGCCTCAGCC 112303799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7652 AATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCCAGAGTTCATATAATTCTCCTGCCTCAGCC 7711

112303800 TCTCGAGTAGATGGGATTACAGGCATGACACCACATCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGT 112303859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7712 TCTCGAGTAGATGGGATTACAGGCATGACACCACATCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGT 7771

112303860 AGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCATGAACTCCTGACCTCAAGTGATCC 112303919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7772 AGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCATGAACTCCTGACCTCAAGTGATCC 7831

112303920 ACCCATGTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACGGCACCCGGCAAAT 112303979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     7832 ACCCATGTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCGCGGCACCCGGCAAAT 7891

112303980 AATAAGCTATTTTAAGTAAATATTAAATATTAGATTGTTTCTATCAGGCATTGTTTTATT 112304039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7892 AATAAGCTATTTTAAGTAAATATTAAATATTAGATTGTTTCTATCAGGCATTGTTTTATT 7951

112304040 TAAATGAGCATTTTTTATTTGTTAATTCCAATTAAAAGTAACACAGTGCTAACAAAATGA 112304099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7952 TAAATGAGCATTTTTTATTTGTTAATTCCAATTAAAAGTAACACAGTGCTAACAAAATGA 8011

112304100 TAAAAGCTAATTCAAGCTTACCCTCAGATCTAGGGAGATGATAGAGAATAGTGAGTACTA 112304159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8012 TAAAAGCTAATTCAAGCTTACCCTCAGATCTAGGGAGATGATAGAGAATAGTGAGTACTA 8071

112304160 GAGTAGAGTCAATGTCCTTCTAAAAAGGAATGGATGACTCTCAGCATTGTCTGATCATTG 112304219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8072 GAGTAGAGTCAATGTCCTTCTAAAAAGGAATGGATGACTCTCAGCATTGTCTGATCATTG 8131

112304220 CTATGCAAGTATATGGGGTAAGTGTTGCCAGAGTCTTTTTTTTTTTAACAAAGAAGTTAT 112304279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8132 CTATGCAAGTATATGGGGTAAGTGTTGCCAGAGTCTTTTTTTTTTTAACAAAGAAGTTAT 8191

112304280 AAAATTAGAATTTTAAATTAAAAATAAACATTTTCATTAATTAATATTCAAGCA 112304333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8192 AAAATTAGAATTTTAAATTAAAAATAAACATTTTCATTAATTAATATTCAAGCA 8245

Alignment time is 6.60809 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     6862] =>      6862 nucs 'mol-32-2afd-125976_6862'

Score:        6840
Aligned:      6862        nucs
Identic:      6860 (100%) nucs =>      1432 (100%)      5428 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292620,112294051] EXCISED REGION [112297140,112302569]
 second seq =>  [        1,     1432] EXCISED REGION [     1433,     6862]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292620 TCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTA 112292679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTA 60

112292680 AGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTG 112292739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTG 120

112292740 ACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCC 112292799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCC 180

112292800 TCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTG 112292859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTG 240

112292860 TGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTG 112292919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTG 300

112292920 TCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATA 112292979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATA 360

112292980 TTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTG 112293039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTG 420

112293040 ATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGT 112293099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGT 480

112293100 AAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAA 112293159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAA 540

112293160 TATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAA 112293219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAA 600

112293220 AAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTG 112293279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTG 660

112293280 TATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCA 112293339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCA 720

112293340 GATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATAC 112293399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATAC 780

112293400 CAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATC 112293459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATC 840

112293460 TAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTT 112293519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTT 900

112293520 TAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTT 112293579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTT 960

112293580 GAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTAT 112293639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTAT 1020

112293640 TGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGC 112293699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGC 1080

112293700 TAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACT 112293759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACT 1140

112293760 GAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCC 112293819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCC 1200

112293820 AATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAG 112293879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAG 1260

112293880 AGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTT 112293939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTT 1320

112293940 TCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATG 112293999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATG 1380

112294000 CTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1432

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1492

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1552

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1612

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1672

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1732

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1792

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1852

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1912

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1972

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2032

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2092

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2152

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2212

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2272

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2332

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2392

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2452

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2512

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2572

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2632

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2633 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2692

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2752

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2812

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2872

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2932

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2992

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3052

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3112

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3172

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3232

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3292

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3352

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3412

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3472

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3532

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3592

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3652

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3712

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3772

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3832

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3892

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3952

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4012

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 4072

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 4132

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 112299899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 4192

112299900 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 112299959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 4252

112299960 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 112300019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 4312

112300020 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 112300079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 4372

112300080 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 112300139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 4432

112300140 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 112300199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 4492

112300200 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 112300259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 4552

112300260 ACCTTTTATATTGCAATTTTGCGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 112300319
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 ACCTTTTATATTGCAATTTTGTGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 4612

112300320 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 112300379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 4672

112300380 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 112300439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 4732

112300440 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 112300499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 4792

112300500 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 112300559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 4852

112300560 ATTACTCAATAGTTGGCAAGGCTTAATGTGAACATACTATTTAACACAAATTTTTCAAAG 112300619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 ATTACTCAATAGTTGGCAAGGCTTAATGTGAACATACTATTTAACACAAATTTTTCAAAG 4912

112300620 AGATTGAATATTTATAATGTGTAATCATATATGCACCAGTTCATTAATGTTAGTCTCTAC 112300679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 AGATTGAATATTTATAATGTGTAATCATATATGCACCAGTTCATTAATGTTAGTCTCTAC 4972

112300680 ACTATAATTTTAAAAAATAATTACAAAATAATGCCCTCAAAATTCAAAGTTTCAGGATCA 112300739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 ACTATAATTTTAAAAAATAATTACAAAATAATGCCCTCAAAATTCAAAGTTTCAGGATCA 5032

112300740 ATACACAGAATAATCATAAGGAAGCTTGAACAAATATCTTGATTCATGCAGACATAGGGG 112300799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 ATACACAGAATAATCATAAGGAAGCTTGAACAAATATCTTGATTCATGCAGACATAGGGG 5092

112300800 TACTTACCTGAGTGCCAATCAGAAAACAACTACAACAAAATTCCCTCTGAGGACAAACAT 112300859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 TACTTACCTGAGTGCCAATCAGAAAACAACTACAACAAAATTCCCTCTGAGGACAAACAT 5152

112300860 TTTAAAACATTATGAGGGTAAACTTTACCAATACATACCTTCCTACTCTGTAGCATATAT 112300919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 TTTAAAACATTATGAGGGTAAACTTTACCAATACATACCTTCCTACTCTGTAGCATATAT 5212

112300920 TGTACAGATATGTGTTTGTATAGGCCACATGTTTGTGAGCACTGGATTTTTAAAGACTAA 112300979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 TGTACAGATATGTGTTTGTATAGGCCACATGTTTGTGAGCACTGGATTTTTAAAGACTAA 5272

112300980 TGAGCTATTGATCCTTCCTGATCATCAATGATGTTATTTCATAATGTATACTCCATACAT 112301039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 TGAGCTATTGATCCTTCCTGATCATCAATGATGTTATTTCATAATGTATACTCCATACAT 5332

112301040 GGCTACTGATTTCCTATTCAGCTCTGCCTCCAATTTGAATACTGGCAATTTCTATCAAAG 112301099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 GGCTACTGATTTCCTATTCAGCTCTGCCTCCAATTTGAATACTGGCAATTTCTATCAAAG 5392

112301100 AAAGCAAAAGTGATCCAATTCCTAGCCAAAGTCTAAGTGAAAACAAGAATATTTGAAGCA 112301159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 AAAGCAAAAGTGATCCAATTCCTAGCCAAAGTCTAAGTGAAAACAAGAATATTTGAAGCA 5452

112301160 AACACAAATGCAGAGTTCTAGGGATTGTTAGAGGAAAAGAAATATTTAAAAGGCGGGATT 112301219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 AACACAAATGCAGAGTTCTAGGGATTGTTAGAGGAAAAGAAATATTTAAAAGGCGGGATT 5512

112301220 TTAGAATTAATACTAACAGCAGACGAGTTACCTTTTGAGAGCACAATGGAGGCAAAGAAG 112301279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 TTAGAATTAATACTAACAGCAGACGAGTTACCTTTTGAGAGCACAATGGAGGCAAAGAAG 5572

112301280 GCCTTCACATACATCAACAGGTAAAGCAAATGCACTATTACAGACTGAGCATTATCTGTA 112301339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 GCCTTCACATACATCAACAGGTAAAGCAAATGCACTATTACAGACTGAGCATTATCTGTA 5632

112301340 AATGACAATATGTATTCAGTTGAAGCTGAGCTGCTAAAATAGAACATGCAAGAGGGGAAT 112301399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 AATGACAATATGTATTCAGTTGAAGCTGAGCTGCTAAAATAGAACATGCAAGAGGGGAAT 5692

112301400 GGTAAAGAAACAGACTAGAGGGTTTTTGCTAGAGCTCAGTTTTCAAAAATTCTAAAGGAG 112301459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 GGTAAAGAAACAGACTAGAGGGTTTTTGCTAGAGCTCAGTTTTCAAAAATTCTAAAGGAG 5752

112301460 GATGAACTTAGAATAAGGACTGTTAGTATTCATATATTGTTATACTAGTATGCTTTCTTA 112301519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 GATGAACTTAGAATAAGGACTGTTAGTATTCATATATTGTTATACTAGTATGCTTTCTTA 5812

112301520 GCTCTTAGTTTTATCATGTAATTGAATCATATATTGTGTGGATTGTTGAATCTGTCTTCT 112301579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 GCTCTTAGTTTTATCATGTAATTGAATCATATATTGTGTGGATTGTTGAATCTGTCTTCT 5872

112301580 TTCACTTAGCATAATGATTCTAATATTCATTCACGCTGCTGTATATTTTAGTTGTTCATT 112301639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 TTCACTTAGCATAATGATTCTAATATTCATTCACGCTGCTGTATATTTTAGTTGTTCATT 5932

112301640 CATTTTAAATTATTGGGTAGTATTTCATTACATAGATGTCCAATACTTAGGTTATCAGTT 112301699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 CATTTTAAATTATTGGGTAGTATTTCATTACATAGATGTCCAATACTTAGGTTATCAGTT 5992

112301700 TATCAGTTGATGGACATCTGGACAAGTTCTAATTTTATGTGATTGTGAATAAAGTTACTA 112301759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 TATCAGTTGATGGACATCTGGACAAGTTCTAATTTTATGTGATTGTGAATAAAGTTACTA 6052

112301760 TTAACATTTGCTTACAGGCTTTCATGTGACATAAGCTTTCATTTCTCCTGCATAATACCT 112301819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 TTAACATTTGCTTACAGGCTTTCATGTGACATAAGCTTTCATTTCTCCTGCATAATACCT 6112

112301820 AGCAGTAATATTGCTTGAACATATGTGAAGTACAACTTCATAAGATACTGTCTATTTCCC 112301879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 AGCAGTAATATTGCTTGAACATATGTGAAGTACAACTTCATAAGATACTGTCTATTTCCC 6172

112301880 CTAGTGGCTGTTCCATTTTGCATTCCCACCAGTAATGTATAAGTTCCAATTGCTCCGTCT 112301939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 CTAGTGGCTGTTCCATTTTGCATTCCCACCAGTAATGTATAAGTTCCAATTGCTCCGTCT 6232

112301940 CCTTGTCAACATTTGTTTTTGTCCATTGTATTGGTTTTAGACTTTCTAGTAGGTACACAG 112301999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 CCTTGTCAACATTTGTTTTTGTCCATTGTATTGGTTTTAGACTTTCTAGTAGGTACACAG 6292

112302000 TAGTATCAAACTACTTTAAATTCTAGGAAGTTTTAACAGAAAGTCTTAATGTTGGTCATT 112302059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 TAGTATCAAACTACTTTAAATTCTAGGAAGTTTTAACAGAAAGTCTTAATGTTGGTCATT 6352

112302060 TGCTGTATAGATATTCCCAAGCAGCAGGTACTGTTTTTAAAAAATATATCATTTTAAGTC 112302119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TGCTGTATAGATATTCCCAAGCAGCAGGTACTGTTTTTAAAAAATATATCATTTTAAGTC 6412

112302120 ATACTTTATTTAAAATAATTTAAAATTATAAATTTTATTATATTTTATTGTGGTTTGTTT 112302179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 ATACTTTATTTAAAATAATTTAAAATTATAAATTTTATTATATTTTATTGTGGTTTGTTT 6472

112302180 CTTTTTAAAGGCACCGATAACTGTATGATGCTCTTTTGTTTACTTTTTGGTAGCTTTTAC 112302239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 CTTTTTAAAGGCACCGATAACTGTATGATGCTCTTTTGTTTACTTTTTGGTAGCTTTTAC 6532

112302240 TGTTTGTTTTAATTCTTTTCATTATTTCTTTTCCTTCATTTTCTATTTCTTTTGAGGAAT 112302299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 TGTTTGTTTTAATTCTTTTCATTATTTCTTTTCCTTCATTTTCTATTTCTTTTGAGGAAT 6592

112302300 TACCTTTTATGCTTGTTTTATTTTATACTCCTATTTAAAGTAATGGTTTTAAATAATATT 112302359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 TACCTTTTATGCTTGTTTTATTTTATACTCCTATTTAAAGTAATGGTTTTAAATAATATT 6652

112302360 TTATTTTGCATTTCATTCATTGTCTAATATCTACTACCTCTCTACTAAGTTTTTGATTCT 112302419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 TTATTTTGCATTTCATTCATTGTCTAATATCTACTACCTCTCTACTAAGTTTTTGATTCT 6712

112302420 TATTCAAATTTTTCTTTTGTACTAACTTTGTCTTTGTTTATGGCCTCTCATTTTGAGACA 112302479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 TATTCAAATTTTTCTTTTGTACTAACTTTGTCTTTGTTTATGGCCTCTCATTTTGAGACA 6772

112302480 TTAGAAAATAAATTTTATATTTTTCAGTGGACATATCTTTCTGACATGCAGGCATATTTC 112302539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 TTAGAAAATAAATTTTATATTTTTCAGTGGACATATCTTTCTGACATGCAGGCATATTTC 6832

112302540 TAGCATCTATTTGTTCATTAATTTATTCTT 112302569
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 TAGCATCTATTTGTTCATTAATTTATTCTT 6862

Alignment time is 5.61293 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4554] =>      4554 nucs 'mol-32-2b55-014927_4554'

Score:        4543
Aligned:      4554        nucs
Identic:      4553 (100%) nucs =>      1834 (100%)      2719 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292218,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299859]
 second seq =>  [        1,     1834] EXCISED REGION [     1835,     4554]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292218 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTT 112292277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTT 60

112292278 TATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCACCGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACC 112292337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCACCGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACC 120

112292338 TCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAC 112292397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAC 180

112292398 CCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAG 112292457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAG 240

112292458 AATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGC 112292517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGC 300

112292518 CTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAA 112292577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAA 360

112292578 AGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCT 112292637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCT 420

112292638 TTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATT 112292697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATT 480

112292698 TTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAG 112292757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAG 540

112292758 CAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATT 112292817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATT 600

112292818 TTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTG 112292877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTG 660

112292878 GTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTT 112292937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTT 720

112292938 TCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAAT 112292997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAAT 780

112292998 TGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTC 112293057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTC 840

112293058 AAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAG 112293117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAG 900

112293118 TGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATT 112293177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATT 960

112293178 ATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTT 112293237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTT 1020

112293238 CATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAAT 112293297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAAT 1080

112293298 TTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCA 112293357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCA 1140

112293358 TATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATA 112293417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATA 1200

112293418 GATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTAC 112293477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTAC 1260

112293478 AACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTG 112293537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTG 1320

112293538 CTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTAC 112293597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTAC 1380

112293598 TCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCAC 112293657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCAC 1440

112293658 AATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAA 112293717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAA 1500

112293718 TATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTT 112293777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTT 1560

112293778 TTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAA 112293837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAA 1620

112293838 TTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAG 112293897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAG 1680

112293898 CAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAA 112293957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAA 1740

112293958 TACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTAT 112294017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTAT 1800

112294018 AAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1834

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1894

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1954

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 2014

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 2074

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2134

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2194

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2254

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2314

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2374

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2434

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2494

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2554

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2614

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2674

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2734

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2794

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2854

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2914

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2974

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 3034

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3035 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 3094

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 3154

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3214

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3274

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3334

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3394

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3454

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3514

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3574

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3634

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3694

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3754

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3814

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3874

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3934

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3994

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 4054

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 4114

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 4174

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4234

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4294

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4354

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4414

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 4474

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 4534

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAA 112299859
          ||||||||||||||||||||
     4535 ATGTAAATTTAAGTTACAAA 4554

Alignment time is 3.75075 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3824] =>      3824 nucs 'mol-32-2b55-126520_3824'

Score:        3791
Aligned:      3824        nucs
Identic:      3821 (100%) nucs =>       390 (100%)      3431 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293662,112294051] EXCISED REGION [112297140,112300572]
 second seq =>  [        1,      391] EXCISED REGION [      392,     3824]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293662 GTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATC 112293721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATC 60

112293722 ACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTT 112293781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTT 120

112293782 -CCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTA 112293840
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTA 180

112293841 ATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAA 112293900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAA 240

112293901 CGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATAC 112293960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATAC 300

112293961 TTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAA 112294020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAA 360

112294021 TGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 391

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      392 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 451

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      452 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 511

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 571

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 631

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 691

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 751

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 811

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 871

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 931

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 991

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1051

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1111

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1171

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1231

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1291

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1351

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1411

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1471

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1531

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1591

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1592 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1651

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1711

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1771

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1831

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 1891

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 1951

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2011

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2071

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2131

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2191

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2251

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2311

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2371

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2431

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2491

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2551

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2611

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2671

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2731

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 2791

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 2851

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 2911

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 2971

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3031

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 3091

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 112299899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 3151

112299900 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 112299959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 3211

112299960 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 112300019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 3271

112300020 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 112300079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 3331

112300080 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 112300139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 3391

112300140 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 112300199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 3451

112300200 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 112300259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 3511

112300260 ACCTTTTATATTGCAATTTTGCGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 112300319
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 ACCTTTTATATTGCAATTTTGTGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 3571

112300320 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 112300379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 3631

112300380 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 112300439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 3691

112300440 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 112300499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 3751

112300500 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 112300559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 3811

112300560 ATTACTCAATAGT 112300572
          |||||||||||||
     3812 ATTACTCAATAGT 3824

Alignment time is 3.14204 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3921] =>      3921 nucs 'mol-32-2dff-117191_3921'

Score:        3910
Aligned:      3921        nucs
Identic:      3920 (100%) nucs =>      1191 (100%)      2729 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292861,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299869]
 second seq =>  [        1,     1191] EXCISED REGION [     1192,     3921]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292861 GATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGT 112292920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGT 60

112292921 CGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATAT 112292980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATAT 120

112292981 TTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGA 112293040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGA 180

112293041 TTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTA 112293100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTA 240

112293101 AACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAAT 112293160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAAT 300

112293161 ATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAA 112293220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAA 360

112293221 AATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGT 112293280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGT 420

112293281 ATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAG 112293340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAG 480

112293341 ATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACC 112293400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACC 540

112293401 AAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCT 112293460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCT 600

112293461 AGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTT 112293520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTT 660

112293521 AAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTG 112293580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTG 720

112293581 AGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATT 112293640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATT 780

112293641 GAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCT 112293700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCT 840

112293701 AATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTG 112293760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTG 900

112293761 AATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCA 112293820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCA 960

112293821 ATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGA 112293880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGA 1020

112293881 GAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTT 112293940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTT 1080

112293941 CTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGC 112294000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGC 1140

112294001 TTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1191

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1251

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1311

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1371

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1431

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1491

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1551

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1611

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1671

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1731

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1791

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1851

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1911

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1971

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2031

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2091

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2151

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2211

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2271

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2331

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2391

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2392 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2451

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2511

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2571

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2631

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2691

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2751

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2811

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2871

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2931

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2991

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3051

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3111

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3171

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3231

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3291

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3351

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3411

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3471

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3531

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3591

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3651

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3711

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3771

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3831

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 3891

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGG 112299869
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGG 3921

Alignment time is 3.20889 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3161] =>      3161 nucs 'mol-32-2e15-026422_3161'

Score:        3150
Aligned:      3161        nucs
Identic:      3160 (100%) nucs =>       516 (100%)      2644 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293536,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299784]
 second seq =>  [        1,      516] EXCISED REGION [      517,     3161]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293536 TGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCT 112293595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCT 60

112293596 ACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCC 112293655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCC 120

112293656 ACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAA 112293715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAA 180

112293716 AATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACT 112293775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACT 240

112293776 TTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCA 112293835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCA 300

112293836 AATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAG 112293895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAG 360

112293896 AGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCA 112293955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCA 420

112293956 AATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTT 112294015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTT 480

112294016 ATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 516

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 576

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 636

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 696

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 756

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 816

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 876

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 936

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 996

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1056

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1116

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1176

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1236

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1296

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1356

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1416

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1476

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1536

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1596

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1656

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1716

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1717 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1776

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1836

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1896

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1956

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2016

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2076

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2136

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2196

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2256

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2316

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2376

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2436

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2496

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2556

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2616

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2676

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2736

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2796

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2856

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 2916

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 2976

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3036

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3096

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3156

112299780 TAGTT 112299784
          |||||
     3157 TAGTT 3161

Alignment time is 2.7329 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3518] =>      3518 nucs 'mol-32-2e15-127520_3518'

Score:        3496
Aligned:      3518        nucs
Identic:      3516 (100%) nucs =>      1680 (100%)      1836 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292371,112294051] EXCISED REGION [112297140,112298976]
 second seq =>  [        1,     1681] EXCISED REGION [     1682,     3518]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292371 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTC 112292430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTC 60

112292431 AAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTG 112292490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTG 120

112292491 GGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTA 112292550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTA 180

112292551 ACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATA 112292610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATA 240

112292611 CATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGT 112292670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGT 300

112292671 GTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACAT 112292730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACAT 360

112292731 GTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAG 112292790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAG 420

112292791 ATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCT 112292850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCT 480

112292851 TAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTA 112292910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTA 540

112292911 ATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACG 112292970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACG 600

112292971 ATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTC 112293030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTC 660

112293031 CTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTT 112293090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTT 720

112293091 AGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAA 112293150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAA 780

112293151 GTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATT 112293210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATT 840

112293211 AAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCT 112293270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCT 900

112293271 AGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTA 112293330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTA 960

112293331 TCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACA 112293390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACACACAGTTTTTAACAAACCCACACA 1020

112293391 TACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTAT 112293450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTAT 1080

112293451 TTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATT 112293510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATT 1140

112293511 GGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTT 112293570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTT 1200

112293571 CAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAA 112293630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAA 1260

112293631 ACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACC 112293690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACC 1320

112293691 TAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCT 112293750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCT 1380

112293751 CACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGG 112293810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGG 1440

112293811 CATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGG 112293870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGG 1500

112293871 AATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACC 112293930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACC 1560

112293931 CAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGC 112293990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGC 1620

112293991 TCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAA 112294050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAA 1680

112294051 T 112294051
          |
     1681 T 1681

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1741

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1801

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1861

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1921

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1981

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2041

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2101

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2161

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2221

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2281

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2341

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2401

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2461

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2521

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2581

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2641

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2701

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2761

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2821

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2881

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2882 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2941

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 3001

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3061

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3121

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3181

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3241

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3301

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3361

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3421

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3481

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATT 112298976
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATT 3518

Alignment time is 2.88501 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4300] =>      4300 nucs 'mol-32-2e4c-047321_4300'

Score:        4289
Aligned:      4300        nucs
Identic:      4299 (100%) nucs =>      1685 (100%)      2614 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292367,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299754]
 second seq =>  [        1,     1685] EXCISED REGION [     1686,     4300]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292367 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTT 112292426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTT 60

112292427 GGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGAT 112292486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGAT 120

112292487 ATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCC 112292546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCC 180

112292547 TCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCC 112292606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCC 240

112292607 TATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGAT 112292666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGAT 300

112292667 ATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTC 112292726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTC 360

112292727 ACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATT 112292786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATT 420

112292787 GAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGG 112292846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGG 480

112292847 TCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAG 112292906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAG 540

112292907 ACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAAC 112292966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAAC 600

112292967 AACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTT 112293026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTT 660

112293027 ATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATT 112293086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATT 720

112293087 GCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTC 112293146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTC 780

112293147 AAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTA 112293206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTA 840

112293207 TATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGT 112293266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGT 900

112293267 GTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATT 112293326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATT 960

112293327 TGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCA 112293386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCA 1020

112293387 CACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATC 112293446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATC 1080

112293447 TTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTT 112293506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTT 1140

112293507 TATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATC 112293566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATC 1200

112293567 ATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAG 112293626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAG 1260

112293627 TCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTAC 112293686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTAC 1320

112293687 AACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATT 112293746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATT 1380

112293747 TCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATG 112293806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATG 1440

112293807 TGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGA 112293866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGA 1500

112293867 CAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCT 112293926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCT 1560

112293927 TACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCT 112293986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCT 1620

112293987 AGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTA 112294046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTA 1680

112294047 AAAAT 112294051
          |||||
     1681 AAAAT 1685

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1745

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1805

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1865

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1925

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1985

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2045

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2105

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2165

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2225

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2285

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2345

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2405

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2465

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2525

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2585

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2645

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2705

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2765

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2825

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2885

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2886 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2945

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 3005

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3065

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3125

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3185

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3245

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3305

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3365

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3425

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3485

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3545

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3605

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3665

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3725

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3785

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3845

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3905

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3965

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 4025

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4085

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4145

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4205

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4265

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATT 112299754
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATT 4300

Alignment time is 3.85211 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     6282] =>      6282 nucs 'mol-32-2efc-098755_6282'

Score:        6260
Aligned:      6282        nucs
Identic:      6280 (100%) nucs =>      1615 (100%)      4665 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292437,112294051] EXCISED REGION [112297140,112301806]
 second seq =>  [        1,     1615] EXCISED REGION [     1616,     6282]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292437 ATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTAC 112292496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTAC 60

112292497 AATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTG 112292556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTG 120

112292557 ACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACT 112292616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACT 180

112292617 TTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAG 112292676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAG 240

112292677 CTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAG 112292736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAG 300

112292737 CTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGAC 112292796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGAC 360

112292797 TCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACA 112292856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACA 420

112292857 CTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTA 112292916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTA 480

112292917 TTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTG 112292976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTG 540

112292977 ATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATT 112293036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATT 600

112293037 TTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTA 112293096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTA 660

112293097 AGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAA 112293156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAA 720

112293157 TAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACA 112293216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACA 780

112293217 TAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGT 112293276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGT 840

112293277 GTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTAC 112293336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTAC 900

112293337 TCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACA 112293396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACA 960

112293397 TACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTG 112293456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTG 1020

112293457 ATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTT 112293516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTT 1080

112293517 CTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGA 112293576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGA 1140

112293577 CTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAAT 112293636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAAT 1200

112293637 TATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTC 112293696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTC 1260

112293697 AGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTT 112293756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTT 1320

112293757 ACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATC 112293816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATC 1380

112293817 TCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCAT 112293876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCAT 1440

112293877 CAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGA 112293936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGA 1500

112293937 TTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGG 112293996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGG 1560

112293997 ATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1615

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1675

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1735

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1795

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1855

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1915

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1975

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2035

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2095

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2155

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2215

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2275

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2335

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2395

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2455

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2515

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2575

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2635

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2695

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2755

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2815

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2816 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2875

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2935

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2995

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3055

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3115

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3175

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3235

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3295

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3355

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3415

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3475

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3535

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3595

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3655

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3715

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3775

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3835

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3895

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3955

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4015

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4075

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4135

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4195

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 4255

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 4315

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 112299899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 4375

112299900 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 112299959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 4435

112299960 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 112300019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 4495

112300020 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 112300079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 4555

112300080 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 112300139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 4615

112300140 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 112300199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 4675

112300200 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 112300259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 4735

112300260 ACCTTTTATATTGCAATTTTGCGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 112300319
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 ACCTTTTATATTGCAATTTTGTGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 4795

112300320 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 112300379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 4855

112300380 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 112300439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 4915

112300440 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 112300499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 4975

112300500 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 112300559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 5035

112300560 ATTACTCAATAGTTGGCAAGGCTTAATGTGAACATACTATTTAACACAAATTTTTCAAAG 112300619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 ATTACTCAATAGTTGGCAAGGCTTAATGTGAACATACTATTTAACACAAATTTTTCAAAG 5095

112300620 AGATTGAATATTTATAATGTGTAATCATATATGCACCAGTTCATTAATGTTAGTCTCTAC 112300679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 AGATTGAATATTTATAATGTGTAATCATATATGCACCAGTTCATTAATGTTAGTCTCTAC 5155

112300680 ACTATAATTTTAAAAAATAATTACAAAATAATGCCCTCAAAATTCAAAGTTTCAGGATCA 112300739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 ACTATAATTTTAAAAAATAATTACAAAATAATGCCCTCAAAATTCAAAGTTTCAGGATCA 5215

112300740 ATACACAGAATAATCATAAGGAAGCTTGAACAAATATCTTGATTCATGCAGACATAGGGG 112300799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 ATACACAGAATAATCATAAGGAAGCTTGAACAAATATCTTGATTCATGCAGACATAGGGG 5275

112300800 TACTTACCTGAGTGCCAATCAGAAAACAACTACAACAAAATTCCCTCTGAGGACAAACAT 112300859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 TACTTACCTGAGTGCCAATCAGAAAACAACTACAACAAAATTCCCTCTGAGGACAAACAT 5335

112300860 TTTAAAACATTATGAGGGTAAACTTTACCAATACATACCTTCCTACTCTGTAGCATATAT 112300919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 TTTAAAACATTATGAGGGTAAACTTTACCAATACATACCTTCCTACTCTGTAGCATATAT 5395

112300920 TGTACAGATATGTGTTTGTATAGGCCACATGTTTGTGAGCACTGGATTTTTAAAGACTAA 112300979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 TGTACAGATATGTGTTTGTATAGGCCACATGTTTGTGAGCACTGGATTTTTAAAGACTAA 5455

112300980 TGAGCTATTGATCCTTCCTGATCATCAATGATGTTATTTCATAATGTATACTCCATACAT 112301039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 TGAGCTATTGATCCTTCCTGATCATCAATGATGTTATTTCATAATGTATACTCCATACAT 5515

112301040 GGCTACTGATTTCCTATTCAGCTCTGCCTCCAATTTGAATACTGGCAATTTCTATCAAAG 112301099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 GGCTACTGATTTCCTATTCAGCTCTGCCTCCAATTTGAATACTGGCAATTTCTATCAAAG 5575

112301100 AAAGCAAAAGTGATCCAATTCCTAGCCAAAGTCTAAGTGAAAACAAGAATATTTGAAGCA 112301159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 AAAGCAAAAGTGATCCAATTCCTAGCCAAAGTCTAAGTGAAAACAAGAATATTTGAAGCA 5635

112301160 AACACAAATGCAGAGTTCTAGGGATTGTTAGAGGAAAAGAAATATTTAAAAGGCGGGATT 112301219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 AACACAAATGCAGAGTTCTAGGGATTGTTAGAGGAAAAGAAATATTTAAAAGGCGGGATT 5695

112301220 TTAGAATTAATACTAACAGCAGACGAGTTACCTTTTGAGAGCACAATGGAGGCAAAGAAG 112301279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 TTAGAATTAATACTAACAGCAGACGAGTTACCTTTTGAGAGCACAATGGAGGCAAAGAAG 5755

112301280 GCCTTCACATACATCAACAGGTAAAGCAAATGCACTATTACAGACTGAGCATTATCTGTA 112301339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 GCCTTCACATACATCAACAGGTAAAGCAAATGCACTATTACAGACTGAGCATTATCTGTA 5815

112301340 AATGACAATATGTATTCAGTTGAAGCTGAGCTGCTAAAATAGAACATGCAAGAGGGGAAT 112301399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 AATGACAATATGTATTCAGTTGAAGCTGAGCTGCTAAAATAGAACATGCAAGAGGGGAAT 5875

112301400 GGTAAAGAAACAGACTAGAGGGTTTTTGCTAGAGCTCAGTTTTCAAAAATTCTAAAGGAG 112301459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 GGTAAAGAAACAGACTAGAGGGTTTTTGCTAGAGCTCAGTTTTCAAAAATTCTAAAGGAG 5935

112301460 GATGAACTTAGAATAAGGACTGTTAGTATTCATATATTGTTATACTAGTATGCTTTCTTA 112301519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 GATGAACTTAGAATAAGGACTGTTAGTATTCATATATTGTTATACTAGTATGCTTTCTTA 5995

112301520 GCTCTTAGTTTTATCATGTAATTGAATCATATATTGTGTGGATTGTTGAATCTGTCTTCT 112301579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 GCTCTTAGTTTTATCATGTAATTGAATCATATATTGTGTGGATTGTTGAATCTGTCTTCT 6055

112301580 TTCACTTAGCATAATGATTCTAATATTCATTCACGCTGCTGTATATTTTAGTTGTTCATT 112301639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 TTCACTTAGCATAATGATTCTAATATTCATTCACGCTGCTGTATATTTTAGTTGTTCATT 6115

112301640 CATTTTAAATTATTGGGTAGTATTTCATTACATAGATGTCCAATACTTAGGTTATCAGTT 112301699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 CATTTTAAATTATTGGGTAGTATTTCATTACATAGATGTCCAATACTTAGGTTATCAGTT 6175

112301700 TATCAGTTGATGGACATCTGGACAAGTTCTAATTTTATGTGATTGTGAATAAAGTTACTA 112301759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 TATCAGTTGATGGACATCTGGACAAGTTCTAATTTTATGTGATTGTGAATAAAGTTACTA 6235

112301760 TTAACATTTGCTTACAGGCTTTCATGTGACATAAGCTTTCATTTCTC 112301806
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 TTAACATTTGCTTACAGGCTTTCATGTGACATAAGCTTTCATTTCTC 6282

Alignment time is 5.32408 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4400] =>      4400 nucs 'mol-32-2fc2-143328_4400'

Score:        4380
Aligned:      4391        nucs
Identic:      4390 (100%) nucs =>      1724 (100%)      2666 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292328,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299806]
 second seq =>  [       10,     1733] EXCISED REGION [     1734,     4400]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292328 TCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 112292387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 TCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 69

112292388 GCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCA 112292447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 GCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCA 129

112292448 AGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAAC 112292507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 AGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAAC 189

112292508 CTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACAC 112292567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 CTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACAC 249

112292568 ACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTAT 112292627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 ACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTAT 309

112292628 ATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTT 112292687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 ATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTT 369

112292688 AAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGG 112292747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 AAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGG 429

112292748 ATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCT 112292807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 ATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCT 489

112292808 ACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCA 112292867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 ACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCA 549

112292868 GAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCAC 112292927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 GAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCAC 609

112292928 TATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTT 112292987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 TATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTT 669

112292988 TGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTC 112293047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTC 729

112293048 TTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATA 112293107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATA 789

112293108 CAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTC 112293167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 CAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTC 849

112293168 CCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTT 112293227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 CCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTT 909

112293228 TCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAAT 112293287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 TCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAAT 969

112293288 TTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTA 112293347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 TTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTA 1029

112293348 TTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACA 112293407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 TTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACA 1089

112293408 AATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAAT 112293467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 AATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAAT 1149

112293468 TTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATAT 112293527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATAT 1209

112293528 AAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACG 112293587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 AAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACG 1269

112293588 CTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCT 112293647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 CTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCT 1329

112293648 CAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGA 112293707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 CAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGA 1389

112293708 CATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACT 112293767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 CATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACT 1449

112293768 TGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCT 112293827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 TGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCT 1509

112293828 AGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAAC 112293887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 AGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAAC 1569

112293888 AGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCA 112293947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 AGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCA 1629

112293948 CATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACT 112294007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 CATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACT 1689

112294008 ATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 ATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1733

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1793

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1853

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1913

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1973

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2033

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2093

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2153

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2213

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2273

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2333

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2393

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2453

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2513

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2573

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2633

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2693

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2753

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2813

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2873

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2933

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2934 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2993

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 3053

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3113

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3173

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3233

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3293

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3353

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3413

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3473

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3533

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3593

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3653

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3713

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3773

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3833

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3893

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3953

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 4013

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 4073

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4133

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4193

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4253

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4313

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 4373

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTA 112299806
          |||||||||||||||||||||||||||
     4374 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTA 4400

Alignment time is 3.56226 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2994] =>      2994 nucs 'mol-32-2fe3-013629_2994'

Score:        2983
Aligned:      2994        nucs
Identic:      2993 (100%) nucs =>       310 (100%)      2683 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293742,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299823]
 second seq =>  [        1,      310] EXCISED REGION [      311,     2994]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293742 AAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTT 112293801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTT 60

112293802 TGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGA 112293861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGA 120

112293862 AGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCC 112293921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCC 180

112293922 TGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCG 112293981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCG 240

112293982 AATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACA 112294041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACA 300

112294042 CATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||
      301 CATTAAAAAT 310

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 370

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 430

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 490

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 550

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 610

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 670

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 730

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 790

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 850

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 910

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 970

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1030

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1090

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1150

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1210

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1270

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1330

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1390

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1450

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1510

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1511 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1570

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1630

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1690

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1750

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 1810

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 1870

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 1930

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 1990

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2050

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2110

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2170

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2230

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2290

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2350

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2410

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2470

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2530

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2590

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2650

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 2710

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 2770

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 2830

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 2890

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 2950

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAA 112299823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAA 2994

Alignment time is 2.45864 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2011] =>      2011 nucs 'mol-32-2fe3-188097_2011'

Score:        2000
Aligned:      2011        nucs
Identic:      2010 (100%) nucs =>       185 (100%)      1825 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293867,112294051] EXCISED REGION [112297140,112298965]
 second seq =>  [        1,      185] EXCISED REGION [      186,     2011]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293867 CAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCT 112293926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCT 60

112293927 TACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCT 112293986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCT 120

112293987 AGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTA 112294046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTA 180

112294047 AAAAT 112294051
          |||||
      181 AAAAT 185

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 245

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 305

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 365

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 425

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 485

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 545

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 605

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 665

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 725

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 785

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 845

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 905

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 965

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1025

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1085

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1145

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1205

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1265

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1325

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1385

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1386 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1445

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1505

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1565

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1625

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 1685

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 1745

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 1805

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 1865

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 1925

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 1985

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATAT 112298965
          ||||||||||||||||||||||||||
     1986 GAACACAGCCAAACCATACTATATAT 2011

Alignment time is 1.95911 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3430] =>      3430 nucs 'mol-32-2fee-207693_3430'

Score:        3397
Aligned:      3430        nucs
Identic:      3427 (100%) nucs =>       851 (100%)      2576 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293201,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299718]
 second seq =>  [        1,      851] EXCISED REGION [      852,     3430]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293201 CAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAA 112293260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAA 60

112293261 ATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTA 112293320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTA 120

112293321 GGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACA 112293380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACA 180

112293381 AACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATC 112293440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATC 240

112293441 TCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGA 112293500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGA 300

112293501 CACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTG 112293560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTG 360

112293561 TATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGT 112293620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGT 420

112293621 GATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGT 112293680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGT 480

112293681 GATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGT 112293740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGT 540

112293741 AAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGT 112293800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGT 600

112293801 TTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGG 112293860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGG 660

112293861 AAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATC 112293920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATC 720

112293921 CTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTC 112293980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTC 780

112293981 GAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTAC 112294040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTAC 840

112294041 ACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||
      841 ACATTAAAAAT 851

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 911

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 971

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1031

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1091

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1151

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1211

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1271

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1331

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1391

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1451

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1511

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1571

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1631

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1691

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1751

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1811

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1871

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1931

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1991

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2051

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2052 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2111

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2171

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2231

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2291

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 ATTGTATTAGTCCACTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2351

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2411

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2471

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2531

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2591

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2651

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2711

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2771

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2831

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2891

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 CCCTAATGCGACCATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2951

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3011

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3071

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3131

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3191

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3251

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3311

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3371

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATC 112299718
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATC 3430

Alignment time is 3.10817 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3231] =>      3231 nucs 'mol-32-3004-330592_3231'

Score:        3220
Aligned:      3231        nucs
Identic:      3230 (100%) nucs =>       569 (100%)      2661 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293483,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299801]
 second seq =>  [        1,      569] EXCISED REGION [      570,     3231]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293483 GAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCT 112293542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCT 60

112293543 TTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCA 112293602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCA 120

112293603 GCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGG 112293662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGG 180

112293663 TGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCA 112293722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCA 240

112293723 CCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTC 112293782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTC 300

112293783 CATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAAT 112293842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAAT 360

112293843 GATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACG 112293902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACG 420

112293903 ATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTT 112293962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTT 480

112293963 TACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATG 112294022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATG 540

112294023 ACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 569

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 629

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 689

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 749

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 809

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 869

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 929

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 989

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1049

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1109

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1169

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1229

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1289

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1349

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1409

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1469

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1529

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1589

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1649

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1709

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1769

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1770 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1829

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1889

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1949

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2009

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2069

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2129

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2189

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2249

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2309

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2369

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2429

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2489

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2549

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2609

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2669

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2729

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2789

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2849

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2909

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 2969

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3029

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3089

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3149

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3209

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGA 112299801
          ||||||||||||||||||||||
     3210 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGA 3231

Alignment time is 2.67087 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2882] =>      2882 nucs 'mol-32-301a-145251_2882'

Score:        2871
Aligned:      2882        nucs
Identic:      2881 (100%) nucs =>       484 (100%)      2397 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293568,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299537]
 second seq =>  [        1,      484] EXCISED REGION [      485,     2882]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293568 TTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGT 112293627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGT 60

112293628 CAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACA 112293687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACA 120

112293688 ACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTT 112293747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTT 180

112293748 CCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGT 112293807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGT 240

112293808 GGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGAC 112293867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGAC 300

112293868 AGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTT 112293927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTT 360

112293928 ACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTA 112293987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTA 420

112293988 GGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAA 112294047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAA 480

112294048 AAAT 112294051
          ||||
      481 AAAT 484

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 544

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 604

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 664

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 724

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 784

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 844

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 904

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 964

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1024

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1084

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1144

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1204

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1264

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1324

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1384

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1444

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1504

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1564

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1624

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1684

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1685 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1744

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1804

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1864

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1924

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 1984

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2044

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2104

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2164

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2224

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2284

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2344

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2404

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2464

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2524

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2584

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2644

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2704

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2764

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2824

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAAT 112299537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAAT 2882

Alignment time is 2.67555 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2119] =>      2119 nucs 'mol-32-3025-245698_2119'

Score:        2119
Aligned:      2119        nucs
Identic:      2119 (100%) nucs =>      1139 (100%)       980 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292913,112294051] EXCISED REGION [112297140,112298119]
 second seq =>  [        1,     1139] EXCISED REGION [     1140,     2119]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292913 TTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGAT 112292972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGAT 60

112292973 GTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCT 112293032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCT 120

112293033 CATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAG 112293092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAG 180

112293093 CCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGT 112293152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGT 240

112293153 TTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAA 112293212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAA 300

112293213 AACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAG 112293272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAG 360

112293273 GAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATC 112293332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATC 420

112293333 TTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATA 112293392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATA 480

112293393 CACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTT 112293452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTT 540

112293453 GGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGG 112293512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGG 600

112293513 CTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCA 112293572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCA 660

112293573 ATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAAC 112293632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAAC 720

112293633 GAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTA 112293692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTA 780

112293693 AGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCA 112293752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCA 840

112293753 CTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCA 112293812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCA 900

112293813 TATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAA 112293872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAA 960

112293873 TCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCA 112293932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCA 1020

112293933 GGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTC 112293992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTC 1080

112293993 TAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1139

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1199

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1259

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1319

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1379

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1439

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1499

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1559

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1619

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1679

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1739

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1799

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1859

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1919

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1979

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2039

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2099

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGA 112298119
          ||||||||||||||||||||
     2100 AATTTCCACAGTCAGCTTGA 2119

Alignment time is 1.7185 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3665] =>      3665 nucs 'mol-32-3030-008861_3665'

Score:        3654
Aligned:      3665        nucs
Identic:      3664 (100%) nucs =>       935 (100%)      2729 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293117,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299869]
 second seq =>  [        1,      935] EXCISED REGION [      936,     3665]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293117 GTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAAT 112293176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAAT 60

112293177 TATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTT 112293236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTT 120

112293237 TCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAA 112293296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAA 180

112293297 TTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGC 112293356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGC 240

112293357 ATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTAT 112293416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTAT 300

112293417 AGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTA 112293476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTA 360

112293477 CAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCT 112293536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCT 420

112293537 GCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTA 112293596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTA 480

112293597 CTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCA 112293656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCA 540

112293657 CAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAA 112293716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAA 600

112293717 ATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTT 112293776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTT 660

112293777 TTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAA 112293836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAA 720

112293837 ATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGA 112293896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGA 780

112293897 GCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAA 112293956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAA 840

112293957 ATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTA 112294016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTA 900

112294017 TAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 935

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 995

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1055

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1115

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1175

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1235

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1295

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1355

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1415

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1475

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1535

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1595

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1655

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1715

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1775

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1835

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1895

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1955

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2015

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2075

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2135

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2136 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2195

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2255

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2315

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2375

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2435

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2495

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2555

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2615

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2675

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2735

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2795

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2855

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2915

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2975

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3035

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3095

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3155

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3215

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3275

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3335

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3395

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3455

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3515

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3575

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 3635

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGG 112299869
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGG 3665

Alignment time is 2.96121 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     8566] =>      8566 nucs 'mol-32-30f6-015962_8566'

Score:        8518
Aligned:      8562        nucs
Identic:      8558 (100%) nucs =>      1711 (100%)      6847 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292341,112294051] EXCISED REGION [112297140,112303990]
 second seq =>  [        5,     1715] EXCISED REGION [     1716,     8566]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292341 TGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCG 112292400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 TGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCG 64

112292401 GCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAAT 112292460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 GCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAAT 124

112292461 AATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTC 112292520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 AATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTC 184

112292521 TTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGC 112292580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 TTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGC 244

112292581 TCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTT 112292640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 TCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTT 304

112292641 ATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTG 112292700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 ATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTG 364

112292701 CCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAG 112292760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 CCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAG 424

112292761 AACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTC 112292820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 AACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTC 484

112292821 TGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTT 112292880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTT 544

112292881 ACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCT 112292940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 ACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCT 604

112292941 CACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGC 112293000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 CACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGC 664

112293001 ACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAG 112293060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 ACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAG 724

112293061 GAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGA 112293120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 GAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGA 784

112293121 AATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATC 112293180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 AATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATC 844

112293181 AAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCAT 112293240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 AAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCAT 904

112293241 CGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTA 112293300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 CGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTA 964

112293301 TGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATAT 112293360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 TGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATAT 1024

112293361 ATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGAT 112293420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 ATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGAT 1084

112293421 CTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAAC 112293480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 CTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAAC 1144

112293481 CAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTT 112293540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 CAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTT 1204

112293541 CTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCT 112293600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 CTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCT 1264

112293601 CAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAAT 112293660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 CAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAAT 1324

112293661 GGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATAT 112293720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 GGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATAT 1384

112293721 CACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTT 112293780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 CACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTT 1444

112293781 TCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTA 112293840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 TCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTA 1504

112293841 ATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAA 112293900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 ATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAA 1564

112293901 CGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATAC 112293960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 CGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATAC 1624

112293961 TTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAA 112294020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 TTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAA 1684

112294021 TGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1715

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1775

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1835

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1895

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1955

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2015

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2016 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAAGTGGCATTAAGTGTATGCAT 2075

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2135

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2195

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2255

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2315

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2375

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2435

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2495

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2555

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2615

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2675

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2735

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2795

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2855

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2915

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2916 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2975

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 3035

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3095

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3155

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3215

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3275

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3335

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3395

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3455

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3515

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3575

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3635

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3695

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3755

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3815

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3875

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3935

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3995

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 4055

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4115

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4175

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4235

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4295

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 4355

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 4415

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 112299899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 4475

112299900 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 112299959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 4535

112299960 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 112300019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCTGTTAATGATTGTACT 4595

112300020 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 112300079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 AATTTTGGTTTCCTAACAGGTGAATATTTGGATTGTTTCTATTTTAAATTTGGGTTGAAA 4655

112300080 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 112300139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 TTTGAAACAGCATTTTCCTATTTCAAGCCTCACTAAGGTTGTTTGTTAAGGAGGTAAATT 4715

112300140 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 112300199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 ACATAATCCATAAAATATTCAATTAATTAATGTCTATTTAGATGGGATACAGGTCAGTAT 4775

112300200 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 112300259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 AGTTCTGCTTTCCTGCAGAGTTAAAACTCTAAATAGATACAATGGAAGAGTTTTTCATTA 4835

112300260 ACCTTTTATATTGCAATTTTGCGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 112300319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 ACCTTTTATATTGCAATTTTGCGTATACTGAATGAATAGTGCTTGATATAACTATAATAT 4895

112300320 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 112300379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 TATGATAATATGTAGTGGAAACAATATGAACTCTTGTAACCTCTTTAATTAATCAAAAAA 4955

112300380 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 112300439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 ATTACATATGAAATAATAGCTCAAAATTAATTTAAAGAATATGTTTAGCATAAAGTAAGA 5015

112300440 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 112300499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 AATTTACAAGAATATATTTTTTAAATGCATAATGTATATTTATGCAGTTTAAAAACAAAA 5075

112300500 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 112300559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 TAATTACATTGTCTTTAAACAATGGCATTTTATTATAATATACATAATATTAGAGACAGA 5135

112300560 ATTACTCAATAGTTGGCAAGGCTTAATGTGAACATACTATTTAACACAAATTTTTCAAAG 112300619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 ATTACTCAATAGTTGGCAAGGCTTAATGTGAACATACTATTTAACACAAATTTTTCAAAG 5195

112300620 AGATTGAATATTTATAATGTGTAATCATATATGCACCAGTTCATTAATGTTAGTCTCTAC 112300679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 AGATTGAATATTTATAATGTGTAATCATATATGCACCAGTTCATTAATGTTAGTCTCTAC 5255

112300680 ACTATAATTTTAAAAAATAATTACAAAATAATGCCCTCAAAATTCAAAGTTTCAGGATCA 112300739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 ACTATAATTTTAAAAAATAATTACAAAATAATGCCCTCAAAATTCAAAGTTTCAGGATCA 5315

112300740 ATACACAGAATAATCATAAGGAAGCTTGAACAAATATCTTGATTCATGCAGACATAGGGG 112300799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 ATACACAGAATAATCATAAGGAAGCTTGAACAAATATCTTGATTCATGCAGACATAGGGG 5375

112300800 TACTTACCTGAGTGCCAATCAGAAAACAACTACAACAAAATTCCCTCTGAGGACAAACAT 112300859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 TACTTACCTGAGTGCCAATCAGAAAACAACTACAACAAAATTCCCTCTGAGGACAAACAT 5435

112300860 TTTAAAACATTATGAGGGTAAACTTTACCAATACATACCTTCCTACTCTGTAGCATATAT 112300919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 TTTAAAACATTATGAGGGTAAACTTTACCAATACATACCTTCCTACTCTGTAGCATATAT 5495

112300920 TGTACAGATATGTGTTTGTATAGGCCACATGTTTGTGAGCACTGGATTTTTAAAGACTAA 112300979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 TGTACAGATATGTGTTTGTATAGGCCACATGTTTGTGAGCACTGGATTTTTAAAGACTAA 5555

112300980 TGAGCTATTGATCCTTCCTGATCATCAATGATGTTATTTCATAATGTATACTCCATACAT 112301039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 TGAGCTATTGATCCTTCCTGATCATCAATGATGTTATTTCATAATGTATACTCCATACAT 5615

112301040 GGCTACTGATTTCCTATTCAGCTCTGCCTCCAATTTGAATACTGGCAATTTCTATCAAAG 112301099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 GGCTACTGATTTCCTATTCAGCTCTGCCTCCAATTTGAATACTGGCAATTTCTATCAAAG 5675

112301100 AAAGCAAAAGTGATCCAATTCCTAGCCAAAGTCTAAGTGAAAACAAGAATATTTGAAGCA 112301159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 AAAGCAAAAGTGATCCAATTCCTAGCCAAAGTCTAAGTGAAAACAAGAATATTTGAAGCA 5735

112301160 AACACAAATGCAGAGTTCTAGGGATTGTTAGAGGAAAAGAAATATTTAAAAGGCGGGATT 112301219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 AACACAAATGCAGAGTTCTAGGGATTGTTAGAGGAAAAGAAATATTTAAAAGGCGGGATT 5795

112301220 TTAGAATTAATACTAACAGCAGACGAGTTACCTTTTGAGAGCACAATGGAGGCAAAGAAG 112301279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 TTAGAATTAATACTAACAGCAGACGAGTTACCTTTTGAGAGCACAATGGAGGCAAAGAAG 5855

112301280 GCCTTCACATACATCAACAGGTAAAGCAAATGCACTATTACAGACTGAGCATTATCTGTA 112301339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 GCCTTCACATACATCAACAGGTAAAGCAAATGCACTATTACAGACTGAGCATTATCTGTA 5915

112301340 AATGACAATATGTATTCAGTTGAAGCTGAGCTGCTAAAATAGAACATGCAAGAGGGGAAT 112301399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 AATGACAATATGTATTCAGTTGAAGCTGAGCTGCTAAAATAGAACATGCAAGAGGGGAAT 5975

112301400 GGTAAAGAAACAGACTAGAGGGTTTTTGCTAGAGCTCAGTTTTCAAAAATTCTAAAGGAG 112301459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5976 GGTAAAGAAACAGACTAGAGGGTTTTTGCTAGAGCTCAGTTTTCAAAAATTCTAAAGGAG 6035

112301460 GATGAACTTAGAATAAGGACTGTTAGTATTCATATATTGTTATACTAGTATGCTTTCTTA 112301519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6036 GATGAACTTAGAATAAGGACTGTTAGTATTCATATATTGTTATACTAGTATGCTTTCTTA 6095

112301520 GCTCTTAGTTTTATCATGTAATTGAATCATATATTGTGTGGATTGTTGAATCTGTCTTCT 112301579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6096 GCTCTTAGTTTTATCATGTAATTGAATCATATATTGTGTGGATTGTTGAATCTGTCTTCT 6155

112301580 TTCACTTAGCATAATGATTCTAATATTCATTCACGCTGCTGTATATTTTAGTTGTTCATT 112301639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 TTCACTTAGCATAATGATTCTAATATTCATTCACGCTGCTGTATATTTTAGTTGTTCATT 6215

112301640 CATTTTAAATTATTGGGTAGTATTTCATTACATAGATGTCCAATACTTAGGTTATCAGTT 112301699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6216 CATTTTAAATTATTGGGTAGTATTTCATTACATAGATGTCCAATACTTAGGTTATCAGTT 6275

112301700 TATCAGTTGATGGACATCTGGACAAGTTCTAATTTTATGTGATTGTGAATAAAGTTACTA 112301759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6276 TATCAGTTGATGGACATCTGGACAAGTTCTAATTTTATGTGATTGTGAATAAAGTTACTA 6335

112301760 TTAACATTTGCTTACAGGCTTTCATGTGACATAAGCTTTCATTTCTCCTGCATAATACCT 112301819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6336 TTAACATTTGCTTACAGGCTTTCATGTGACATAAGCTTTCATTTCTCCTGCATAATACCT 6395

112301820 AGCAGTAATATTGCTTGAACATATGTGAAGTACAACTTCATAAGATACTGTCTATTTCCC 112301879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6396 AGCAGTAATATTGCTTGAACATATGTGAAGTACAACTTCATAAGATACTGTCTATTTCCC 6455

112301880 CTAGTGGCTGTTCCATTTTGCATTCCCACCAGTAATGTATAAGTTCCAATTGCTCCGTCT 112301939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6456 CTAGTGGCTGTTCCATTTTGCATTCCCACCAGTAATGTATAAGTTCCAATTGCTCCGTCT 6515

112301940 CCTTGTCAACATTTGTTTTTGTCCATTGTATTGGTTTTAGACTTTCTAGTAGGTACACAG 112301999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6516 CCTTGTCAACATTTGTTTTTGTCCATTGTATTGGTTTTAGACTTTCTAGTAGGTACACAG 6575

112302000 TAGTATCAAACTACTTTAAATTCTAGGAAGTTTTAACAGAAAGTCTTAATGTTGGTCATT 112302059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6576 TAGTATCAAACTACTTTAAATTCTAGGAAGTTTTAACAGAAAGTCTTAATGTTGGTCATT 6635

112302060 TGCTGTATAGATATTCCCAAGCAGCAGGTACTGTTTTTAAAAAATATATCATTTTAAGTC 112302119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6636 TGCTGTATAGATATTCCCAAGCAGCAGGTACTGTTTTTAAAAAATATATCATTTTAAGTC 6695

112302120 ATACTTTATTTAAAATAATTTAAAATTATAAATTTTATTATATTTTATTGTGGTTTGTTT 112302179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6696 ATACTTTATTTAAAATAATTTAAAATTATAAATTTTATTATATTTTATTGTGGTTTGTTT 6755

112302180 CTTTTTAAAGGCACCGATAACTGTATGATGCTCTTTTGTTTACTTTTTGGTAGCTTTTAC 112302239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6756 CTTTTTAAAGGCACCGATAACTGTATGATGCTCTTTTGTTTACTTTTTGGTAGCTTTTAC 6815

112302240 TGTTTGTTTTAATTCTTTTCATTATTTCTTTTCCTTCATTTTCTATTTCTTTTGAGGAAT 112302299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6816 TGTTTGTTTTAATTCTTTTCATTATTTCTTTTCCTTCATTTTCTATTTCTTTTGAGGAAT 6875

112302300 TACCTTTTATGCTTGTTTTATTTTATACTCCTATTTAAAGTAATGGTTTTAAATAATATT 112302359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6876 TACCTTTTATGCTTGTTTTATTTTATACTCCTATTTAAAGTAATGGTTTTAAATAATATT 6935

112302360 TTATTTTGCATTTCATTCATTGTCTAATATCTACTACCTCTCTACTAAGTTTTTGATTCT 112302419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6936 TTATTTTGCATTTCATTCATTGTCTAATATCTACTACCTCTCTACTAAGTTTTTGATTCT 6995

112302420 TATTCAAATTTTTCTTTTGTACTAACTTTGTCTTTGTTTATGGCCTCTCATTTTGAGACA 112302479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6996 TATTCAAATTTTTCTTTTGTACTAACTTTGTCTTTGTTTATGGCCTCTCATTTTGAGACA 7055

112302480 TTAGAAAATAAATTTTATATTTTTCAGTGGACATATCTTTCTGACATGCAGGCATATTTC 112302539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7056 TTAGAAAATAAATTTTATATTTTTCAGTGGACATATCTTTCTGACATGCAGGCATATTTC 7115

112302540 TAGCATCTATTTGTTCATTAATTTATTCTTTACTCTTTTTTCTTTCATTTTAAATTTGTG 112302599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7116 TAGCATCTATTTGTTCATTAATTTATTCTTTACTCTTTTTTCTTTCATTTTAAATTTGTG 7175

112302600 AAAGATATGACCATAATTAATTTATTTTGATAATTTTAGTTGAAATTATTTTTCTCTGAA 112302659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7176 AAAGATATGACCATAATTAATTTATTTTGATAATTTTAGTTGAAATTATTTTTCTCTGAA 7235

112302660 CTAGTAAGAATTAGTATACAAAAGTACCTTTTTAAAACATGGTACACTATTTCTGAGATC 112302719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7236 CTAGTAAGAATTAGTATACAAAAGTACCTTTTTAAAACATGGTACACTATTTCTGAGATC 7295

112302720 TTCTGGAATCCATTCTCACTGTATTTTGCAATTATCTTTCTTTTTTCTGTAATGTAACTC 112302779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7296 TTCTGGAATCCATTCTCACTGTATTTTGCAATTATCTTTCTTTTTTCTGTAATGTAACTC 7355

112302780 TCCTGTTCATTTTCATTTCTACTCCCAGTTTTTCACGGTGCCAGGGAGGGTGGTGGTTTC 112302839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7356 TCCTGTTCATTTTCATTTCTACTCCCAGTTTTTCACGGTGCCAGGGAGGGTGGTGGTTTC 7415

112302840 AGATATTTTCCAGTAGTCATAATGCTTATACTGTTCTAGCTCCTTCAGATCTTTCTGTTA 112302899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7416 AGATATTTTCCAGTAGTCATAATGCTTATACTGTTCTAGCTCCTTCAGATCTTTCTGTTA 7475

112302900 ACTTACCCACATGTAGGGGTGCTCAACAACTCTTCCCAGTTTTAGCTTGTTTTCACATTT 112302959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7476 ACTTACCCACATGTAGGGGTGCTCAACAACTCTTCCCAGTTTTAGCTTGTTTTCACATTT 7535

112302960 GCCTGCTGCATATATGAAGAAGTATCTATCTTCACTTTTTGGGTTTTCCTGTTCTTACAA 112303019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7536 GCCTGCTGCATATATGAAGAAGTATCTATCTTCACTTTTTGGGTTTTCCTGTTCTTACAA 7595

112303020 GCTCTGCCACCTCATTGCTTTTTTCGGACCTCTCTAGTTGCTATTATTCTGCAGGTCTTA 112303079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7596 GCTCTGCCACCTCATTGCTTTTTTCGGACCTCTCTAGTTGCTATTATTCTGCAGGTCTTA 7655

112303080 CAGTGTCTTTTATTTTCTTTTTGTCCTAGAGATTTTGATTTTGCTGTGCTTACTGCTCTC 112303139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7656 CAGTGTCTTTTATTTTCTTTTTGTCCTAGAGATTTTGATTTTGCTGTGCTTACTGCTCTC 7715

112303140 TTTGATATTATGTCGATTTTGAATAAATTCAAATATGTTACTACTGCTGCCGACTCTTTC 112303199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7716 TTTGATATTATGTCGATTTTGAATAAATTCAAATATGTTACTACTGCTGCCGACTCTTTC 7775

112303200 TCAATATACATAACACTTGAAAATATAATAACTATTTACTTTGCAGAGATTATCAAACAC 112303259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7776 TCAATATACATAACACTTGAAAATATAATAACTATTTACTTTGCAGAGATTATCAAACAC 7835

112303260 AAAGAAGTAAATGGAAAAGGATTACAGTTCAAGCTATATTATTATAGAGTTAAATCTTAT 112303319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7836 AAAGAAGTAAATGGAAAAGGATTACAGTTCAAGCTATATTATTATAGAGTTAAATCTTAT 7895

112303320 ACCTCAAGTAAGTAGGCATAAAAATGAAATAATTTGGACAAGTTAGCTTAATTGATAATG 112303379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7896 ACCTCAAGTAAGTAGGCATAAAAATGAAATAATTTGGACAAGTTAGCTTAATTGATAATG 7955

112303380 AAGAAACAAATTTTGAAGATACATGTGAAAAGTCTGGTTTTATGAAATAAATCTAAATAC 112303439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7956 AAGAAACAAATTTTGAAGATACATGTGAAAAGTCTGGTTTTATGAAATAAATCTAAATAC 8015

112303440 AGCAATAATAATTGTCTTTTATATTAGTTTGTATAAAATATATATTTATGTACTTTCAAT 112303499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8016 AGCAATAATAATTGTCTTTTATATTAGTTTGTATAAAATATATATTTATGTACTTTCAAT 8075

112303500 GAAATCAATGAATTCTGCATTATTATTGAAGTTTTTATTTCCTTTATACTCATAAAAGAA 112303559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8076 GAAATCAATGAATTCTGCATTATTATTGAAGTTTTTATTTCCTTTATACTCATAAAAGAA 8135

112303560 AAATATATTCAAGGATGCCAAATAAATATGTAAACAACAAAAAATATGAGAAAAGATTTT 112303619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8136 AAATATATTCAAGGATGCCAAATAAATATGTAAACAACAAAAAATATGAGAAAAGATTTT 8195

112303620 TCTCATTGTTCAGGGAATATATTGCTTTACATTTGGGAAGTCTTGATATATAATAAGCTT 112303679
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8196 TCTCATTGTTCAGGGAATACATTGCTTTACATTTGGGAAGTCTTGATATATAATAAGCTT 8255

112303680 TTTTTTTTAATTTTTGAGATGGAATCTTGCTCTGTGGCAAAGGCTGGAGTGCAGCAGTGC 112303739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8256 TTTTTTTTAATTTTTGAGATGGAATCTTGCTCTGTGGCAAAGGCTGGAGTGCAGCAGTGC 8315

112303740 AATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCCAGAGTTCATATAATTCTCCTGCCTCAGCC 112303799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8316 AATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCCAGAGTTCATATAATTCTCCTGCCTCAGCC 8375

112303800 TCTCGAGTAGATGGGATTACAGGCATGACACCACATCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGT 112303859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8376 TCTCGAGTAGATGGGATTACAGGCATGACACCACATCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGT 8435

112303860 AGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCATGAACTCCTGACCTCAAGTGATCC 112303919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8436 AGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCATGAACTCCTGACCTCAAGTGATCC 8495

112303920 ACCCATGTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACGGCACCCGGCAAAT 112303979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     8496 ACCCATGTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCGCGGCACCCGGCAAAT 8555

112303980 AATAAGCTATT 112303990
          |||||||||||
     8556 AATAAGCTATT 8566

Alignment time is 6.92239 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3429] =>      3429 nucs 'mol-32-3101-246283_3429'

Score:        3407
Aligned:      3429        nucs
Identic:      3427 (100%) nucs =>       682 (100%)      2745 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293369,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299885]
 second seq =>  [        1,      683] EXCISED REGION [      684,     3429]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293369 CAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTT 112293428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTT 60

112293429 AGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATAC 112293488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATAC 120

112293489 AAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTC 112293548
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATGTGAAAAACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTC 180

112293549 CTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTA 112293608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTA 240

112293609 GTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTG 112293668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTG 300

112293669 AATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGG 112293728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGG 360

112293729 AGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTT 112293788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTT 420

112293789 TGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAA 112293848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAA 480

112293849 GGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAAT 112293908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAAT 540

112293909 TATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTT 112293968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTT 600

112293969 TCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAA 112294028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAA 660

112294029 TTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||
      661 TTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 683

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 743

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 803

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 863

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 923

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 983

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1043

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1103

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1163

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1223

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1283

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1343

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1403

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1463

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1523

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1583

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1643

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1703

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1763

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1823

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1883

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1884 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1943

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2003

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2063

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2123

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2183

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2243

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2303

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2363

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2423

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2483

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2543

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2603

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2663

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2723

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2783

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2843

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2903

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2963

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3023

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3083

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3143

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3203

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3263

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3323

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 3383

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAA 112299885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAA 3429

Alignment time is 2.83257 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3062] =>      3062 nucs 'mol-32-3143-151176_3062'

Score:        3040
Aligned:      3062        nucs
Identic:      3060 (100%) nucs =>       342 (100%)      2718 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293710,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299859]
 second seq =>  [        1,      342] EXCISED REGION [      343,     3062]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293710 TGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTG 112293769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTG 60

112293770 GTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAG 112293829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAG 120

112293830 ATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAG 112293889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAG 180

112293890 AAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACA 112293949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACA 240

112293950 TATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTAT 112294009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTAT 300

112294010 TACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 342

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      343 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 402

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      403 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 462

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      463 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 522

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      523 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 582

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 642

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 702

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 762

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 822

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 882

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 942

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1002

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1062

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1122

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1182

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1242

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1302

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1362

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1422

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1482

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1542

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1543 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1602

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1662

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1722

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1782

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 1842

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 1902

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 1962

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2022

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2082

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2142

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2202

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2262

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 ATATGGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2322

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2382

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2442

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2502

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2562

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2622

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2682

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 2742

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 2802

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 2862

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 2922

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 2982

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 3042

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAA 112299859
          ||||||||||||||||||||
     3043 ATGTAAATTTAAGTTACAAA 3062

Alignment time is 2.52557 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3411] =>      3411 nucs 'mol-32-314e-154501_3411'

Score:        3400
Aligned:      3411        nucs
Identic:      3410 (100%) nucs =>       719 (100%)      2691 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293333,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299831]
 second seq =>  [        1,      719] EXCISED REGION [      720,     3411]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293333 TTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATA 112293392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATA 60

112293393 CACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTT 112293452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTT 120

112293453 GGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGG 112293512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGG 180

112293513 CTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCA 112293572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCA 240

112293573 ATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAAC 112293632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAAC 300

112293633 GAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTA 112293692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTA 360

112293693 AGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCA 112293752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCA 420

112293753 CTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCA 112293812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCA 480

112293813 TATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAA 112293872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAA 540

112293873 TCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCA 112293932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCA 600

112293933 GGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTC 112293992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTC 660

112293993 TAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 719

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 779

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 839

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 899

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 959

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1019

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1079

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1139

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1199

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1259

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1319

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1379

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1439

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1499

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1559

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1619

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1679

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1739

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1799

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1859

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1919

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1920 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1979

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2039

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2099

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2159

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2219

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2279

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2339

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2399

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2459

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2519

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2579

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2639

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2699

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2759

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2819

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2879

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2939

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2999

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3059

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3119

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3179

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3239

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3299

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3359

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAAT 112299831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAAT 3411

Alignment time is 2.85898 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3409] =>      3409 nucs 'mol-32-3185-078643_3409'

Score:        3387
Aligned:      3409        nucs
Identic:      3407 (100%) nucs =>       720 (100%)      2687 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293331,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299827]
 second seq =>  [        1,      721] EXCISED REGION [      722,     3409]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293331 TCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACA 112293390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
        1 TCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCCCAGTTTTTAACAAACCCACACA 60

112293391 TACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTAT 112293450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTAT 120

112293451 TTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATT 112293510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATT 180

112293511 GGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTT 112293570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTT 240

112293571 CAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAA 112293630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAA 300

112293631 ACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACC 112293690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACC 360

112293691 TAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCT 112293750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCT 420

112293751 CACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGG 112293810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGG 480

112293811 CATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGG 112293870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGG 540

112293871 AATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACC 112293930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACC 600

112293931 CAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGC 112293990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGC 660

112293991 TCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAA 112294050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAA 720

112294051 T 112294051
          |
      721 T 721

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 781

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 841

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 901

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 961

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1021

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1081

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1141

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1201

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1261

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1321

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1381

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1441

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1501

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1561

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1621

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1681

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1741

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1801

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1861

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1921

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1922 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1981

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2041

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2101

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2161

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2221

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2281

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2341

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2401

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2461

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2521

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2581

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2641

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2701

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2761

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2821

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2881

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2941

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3001

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3061

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3121

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3181

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3241

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3301

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3361

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATA 112299827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATA 3409

Alignment time is 2.75419 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2448] =>      2448 nucs 'mol-32-3190-229202_2448'

Score:        2437
Aligned:      2448        nucs
Identic:      2447 (100%) nucs =>       576 (100%)      1871 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293476,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299011]
 second seq =>  [        1,      576] EXCISED REGION [      577,     2448]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293476 ACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCC 112293535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCC 60

112293536 TGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCT 112293595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCT 120

112293596 ACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCC 112293655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCC 180

112293656 ACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAA 112293715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAA 240

112293716 AATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACT 112293775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACT 300

112293776 TTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCA 112293835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCA 360

112293836 AATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAG 112293895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAG 420

112293896 AGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCA 112293955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCA 480

112293956 AATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTT 112294015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTT 540

112294016 ATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 576

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 636

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 696

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 756

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 816

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 876

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 936

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 996

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1056

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1116

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1176

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1236

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1296

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1356

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1416

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1476

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1536

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1596

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1656

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1716

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1776

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1777 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1836

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1896

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1956

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2016

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2076

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2136

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2196

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2256

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2316

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2376

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2436

112299000 TTATGTATATAT 112299011
          ||||||||||||
     2437 TTATGTATATAT 2448

Alignment time is 1.9815 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4750] =>      4750 nucs 'mol-32-321f-195684_4750'

Score:        4728
Aligned:      4750        nucs
Identic:      4748 (100%) nucs =>      1884 (100%)      2864 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292167,112294051] EXCISED REGION [112297140,112300004]
 second seq =>  [        1,     1885] EXCISED REGION [     1886,     4750]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292167 GCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGCTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCC 112292226
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGATCTCGGCTCACTGCACGCTCCGCCTCCCGGCTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCC 60

112292227 TCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTT 112292286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTT 120

112292287 AGTAAAGACGGGGTTTCACCGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCC 112292346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTAAAGACGGGGTTTCACCGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCC 180

112292347 ACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACC 112292406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACC 240

112292407 TCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTAC 112292466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTAC 300

112292467 TCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTT 112292526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTT 360

112292527 CTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGT 112292586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGT 420

112292587 TGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCAT 112292646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCAT 480

112292647 TTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTT 112292706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTT 540

112292707 CTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATG 112292766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATG 600

112292767 GAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGAT 112292826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGAT 660

112292827 TTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATC 112292886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATC 720

112292887 ACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTA 112292946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTA 780

112292947 AGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTG 112293006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTG 840

112293007 CTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGT 112293066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGT 900

112293067 CACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCC 112293126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCC 960

112293127 TGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAA 112293186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAA 1020

112293187 ATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAA 112293246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAA 1080

112293247 TAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTA 112293306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTA 1140

112293307 TTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACC 112293366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACC 1200

112293367 CACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTT 112293426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTT 1260

112293427 TTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAAT 112293486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAAT 1320

112293487 ACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCT 112293546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCT 1380

112293547 TCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTC 112293606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTC 1440

112293607 TAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGAT 112293666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGAT 1500

112293667 TGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTG 112293726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTG 1560

112293727 GGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATT 112293786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATT 1620

112293787 TTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATA 112293846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATA 1680

112293847 AAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGA 112293906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGA 1740

112293907 ATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACT 112293966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACT 1800

112293967 TTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACAC 112294026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACAC 1860

112294027 AATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||
     1861 AATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1885

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1945

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 2005

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 2065

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 2125

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2185

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2245

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2305

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2365

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2425

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2485

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2545

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2605

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2665

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2725

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2785

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2845

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2905

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2965

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 3025

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 3085

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3086 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 3145

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 3205

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3265

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3325

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3385

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3445

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3505

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3565

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3625

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3685

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3745

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3805

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3865

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3925

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3985

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 4045

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 4105

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 4165

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 4225

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4285

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4345

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4405

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4465

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 4525

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 4585

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 112299899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGTTGT 4645

112299900 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 112299959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 AATAAAGTTATTTTTTAAAAAAAGATATATAAATTTATCTTGAAGATATGTCATTTGGAC 4705

112299960 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCT 112300004
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 TCGGGTCTTCATTTAAGAAGTGGATTTCAAAACAAACCAATGTCT 4750

Alignment time is 3.89519 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3247] =>      3247 nucs 'mol-32-32f0-093530_3247'

Score:        3236
Aligned:      3247        nucs
Identic:      3246 (100%) nucs =>       560 (100%)      2686 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293492,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299826]
 second seq =>  [        1,      560] EXCISED REGION [      561,     3247]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293492 TGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTA 112293551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTA 60

112293552 AATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTT 112293611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTT 120

112293612 ACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAAT 112293671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAAT 180

112293672 TAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGT 112293731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGT 240

112293732 AACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGC 112293791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGC 300

112293792 ACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGC 112293851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGC 360

112293852 AACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTAT 112293911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTAT 420

112293912 GAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCA 112293971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCA 480

112293972 AATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTA 112294031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTA 540

112294032 AAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||||||||||
      541 AAAGTGTACACATTAAAAAT 560

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 620

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 680

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 740

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 800

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 860

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 920

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 980

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1040

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1100

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1160

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1220

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1280

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1340

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1400

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1460

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1520

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1580

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1640

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1700

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1760

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1761 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1820

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1880

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1940

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2000

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2060

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2120

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2180

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2240

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2300

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2360

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2420

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2480

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2540

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2600

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2660

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2720

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2780

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2840

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2900

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 2960

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3020

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3080

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3140

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3200

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACAT 112299826
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACAT 3247

Alignment time is 2.63103 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     5988] =>      5988 nucs 'mol-32-32fb-031840_5988'

Score:        5896
Aligned:      5951        nucs
Identic:      5946 (100%) nucs =>      3962 (100%)      1984 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112290086,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299124]
 second seq =>  [        1,     3965] EXCISED REGION [     3966,     5950]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112290086 TTTCTAAGATATTCATTACCCTCACATTGTATGTATCTAGTTCTCAATAAATAATAACGT 112290145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTAAGATATTCATTACCCTCACATTGTATGTATCTAGTTCTCAATAAATAATAACGT 60

112290146 TTATATAAAACTACTTTTTTAAGTTTAAACTGAATATATTTCAAAACTACTCAAAAGTTT 112290205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATATAAAACTACTTTTTTAAGTTTAAACTGAATATATTTCAAAACTACTCAAAAGTTT 120

112290206 TTCTTTTTAAAGAAAACATAATGAGAATAATCTACTTTTGAAATTGACTCAATTTTTAAC 112290265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTTTTAAAGAAAACATAATGAGAATAATCTACTTTTGAAATTGACTCAATTTTTAAC 180

112290266 ATTTTTCATTATTTAAAAAAATTTTTGTGAGTACATAGTAGATACATATATTTATGGGGT 112290325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTTCATTATTTAAAAAAATTTTTGTGAGTACATAGTAGATACATATATTTATGGGGT 240

112290326 ATGTGTGTTGTTTTGATACAGGCATAAAATGTAAAATAAGCACATCATGGAGAATAAAGT 112290385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTGTGTTGTTTTGATACAGGCATAAAATGTAAAATAAGCACATCATGGAGAATAAAGT 300

112290386 ATCCATTCCCTCAAGCATTTATCCTATGGGTTACAAACTATCCAATTTGACTCATTTTTT 112290445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCCATTCCCTCAAGCATTTATCCTATGGGTTACAAACTATCCAATTTGACTCATTTTTT 360

112290446 AATGCACCATTAACTGAATTTCAAATTAAATTGATACTGTAAAAATCTTAAACAGAACTT 112290505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGCACCATTAACTGAATTTCAAATTAAATTGATACTGTAAAAATCTTAAACAGAACTT 420

112290506 TTTATTTTTTTCTTTAAAATTAAAGATAAGTAAATACTTTTTAAAGCAGCAATACTGATG 112290565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTATTTTTTTCTTTAAAATTAAAGATAAGTAAATACTTTTTAAAGCAGCAATACTGATG 480

112290566 AAGATTGCTTATTAGTAATATATATATATTTTATTTTTAACAAGTATGTTTGTGGTTAGC 112290625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGATTGCTTATTAGTAATATATATATATTTTATTTTTAACAAGTATGTTTGTGGTTAGC 540

112290626 TTTCCAAATAATTCATGTTTTCTTTCTCATTGGTATGAGAAACATAATTCAAATCAAATT 112290685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCCAAATAATTCATGTTTTCTTTCTCATTGGTATGAGAAACATAATTCAAATCAAATT 600

112290686 ACTACCCTGAGCCTGCTATCTAGAGTGTCTTCTGAATCATTGTTGGTCCTCAGAGCATCA 112290745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      601 ACTACCCTGAGCCTGCTATCTAGAGTGTCTTCTGAATCATTGTTGGTCCTCAGAACATCA 660

112290746 TTTTTGCTCTTTCATGTCTCTATTGAGCATTTTGCCATTAACAATTATAGCCTGCACACC 112290805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTGCTCTTTCATGTCTCTATTGAGCATTTTGCCATTAACAATTATAGCCTGCACACC 720

112290806 AAGATTCCTCTACCATTTTAAACCTCTGAGGTAACAGAGTGAGATCACTGCTATTTTTTG 112290865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGATTCCTCTACCATTTTAAACCTCTGAGGTAACAGAGTGAGATCACTGCTATTTTTTG 780

112290866 CCCCCAAAACACTCAGTAATTTCCCTTATTTTATTATGCCATAAACCAACTTGTTTAGTT 112290925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCCCAAAACACTCAGTAATTTCCCTTATTTTATTATGCCATAAACCAACTTGTTTAGTT 840

112290926 GTCCTTATGAAAATATATTTTGTGATTCCTTTACACTGAGTCTAAAGAACCAATAAATCT 112290985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCCTTATGAAAATATATTTTGTGATTCCTTTACACTGAGTCTAAAGAACCAATAAATCT 900

112290986 CAAAACTGCTCTCTATGTATAAATGAGCTTTCAAGGCACAACTGGGATTATATTAGTTTT 112291045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAAACTGCTCTCTATGTATAAATGAGCTTTCAAGGCACAACTGGGATTATATTAGTTTT 960

112291046 TCTTTTTTTACATTAAACCACTAACATTATATGTTTTGAAGAGGCTTTTAAACTTGGTCA 112291105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTTTTTACATTAAACCACTAACATTATATGTTTTGAAGAGGCTTTTAAACTTGGTCA 1020

112291106 AGTCATTGAAATTGGTACATATGAATGGAAATGGACATCTAAAAACCACCAGGTCTTTAA 112291165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTCATTGAAATTGGTACATATGAATGGAAATGGACATCTAAAAACCACCAGGTCTTTAA 1080

112291166 AGCACCAAACTCTTAGGTATACGTGTGCTGGCGACCACATGCTCCTAATTGGAAATTGTT 112291225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCACCAAACTCTTAGGTATACGTGTGCTGGCGACCACATGCTCCTAATTGGAAATTGTT 1140

112291226 GATGTTTACACTGTTTTCTTCTTCCCACACTGCTGCTTTGAAGGTAAAAATTATTATATT 112291285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATGTTTACACTGTTTTCTTCTTCCCACACTGCTGCTTTGAAGGTAAAAATTATTATATT 1200

112291286 AAAAAGGGAAACAAATGTAAGACTAAAAAAAAAGGACCTATATAATAGAACAAGTGTCTT 112291345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAAGGGAAACAAATGTAAGACTAAAAAAAAAGGACCTATATAATAGAACAAGTGTCTT 1260

112291346 CCAGCTATAAAAATTTAGGCCACCTTTGTAATTATTATATTATAAAGATATTTTAAAGTA 112291405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAGCTATAAAAATTTAGGCCACCTTTGTAATTATTATATTATAAAGATATTTTAAAGTA 1320

112291406 TTAATCTTGTAAATACATGTGATATTTCTAATCCTCCTATATTTTACGTTTTAAATTCAT 112291465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAATCTTGTAAATACATGTGATATTTCTAATCCTCCTATATTTTACGTTTTAAATTCAT 1380

112291466 CAGATGATTATTTTTTGACAGTGTATGTAGTCAGTTCTATGTCAAGAATATTCAACTTTG 112291525
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGATGATTATTTTTTGACAGTGTATGTTGTCAGTTCTATGTCAAGAATATTCAACTTTG 1440

112291526 TTAAAGCATCAATTTAAATAGCATTATTCAGATATAATCTAACAAAACAAATCCTTGAAT 112291585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAAAGCATCAATTTAAATAGCATTATTCAGATATAATCTAACAAAACAAATCCTTGAAT 1500

112291586 TAGATGCTATTATTTTTTCCAATTTGGTACCGGAAAAAAAAACTGCAGCGACGTAAAATT 112291645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGATGCTATTATTTTTTCCAATTTGGTACCGGAAAAAAAAACTGCAGCGACGTAAAATT 1560

112291646 AACAGCTTAACCTCAAACAGAAAGTACATAGGTGAATCAAGTGGATTTTAGCATAGGCCT 112291705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACAGCTTAACCTCAAACAGAAAGTACATAGGTGAATCAAGTGGATTTTAGCATAGGCCT 1620

112291706 TGGCTAGAATCCTGCTGTAATCTCTTGGCTCCTCAGCCTCAGTGGGAGGTGGAACAGAAT 112291765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGCTAGAATCCTGCTGTAATCTCTTGGCTCCTCAGCCTCAGTGGGAGGTGGAACAGAAT 1680

112291766 GGAGTCTATTATAGCTTCACTCAGTTCAGATTCCCTTCATCAGAACTTTGACCATAAACC 112291825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAGTCTATTATAGCTTCACTCAGTTCAGATTCCCTTCATCAGAACTTTGACCATAAACC 1740

112291826 TAGTACCTTTCAGGTATCACCTCTGGAATTTCATACGAGAAAGTTAGCATTTACCTGAGC 112291885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGTACCTTTCAGGTATCACCTCTGGAATTTCATACGAGAAAGTTAGCATTTACCTGAGC 1800

112291886 AATGAAGAAAGTGAGTGTCTGTGAGGTTGCTGAGACAATCTTGAAAACCCTGAAGCCATA 112291945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATGAAGAAAGTGAGTGTCTGTGAGGTTGCTGAGACAATCTTGAAAACCCTGAAGCCATA 1860

112291946 AATAGAAAGCCCAATGGGTCACTCCATTGACCTTTCTTGTCCCCTGTAGTGTTGATTAAG 112292005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1861 AATAGAAAGCCCAATGGGTCACTCCATTGACCTTACTTGTCCCCTGTAGTGTTGATTAAG 1920

112292006 CAGACTCTATCTGGAGCATATCCACTCCTCTTGGCAGTAATAAAATATGACAGGTCTCTT 112292065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGACTCTATCTGGAGCATATCCACTCCTCTTGGCAGTAATAAAATATGACAGGTCTCTT 1980

112292066 GAGGCTCTTGTTCAACAGGAAAACATCTCTTCTTCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 112292125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     1981 GAGGCTCTTGTTCAACAGGAAAACATCTCTTCTTCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-GA 2039

112292126 GACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCA 112292185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCA 2099

112292186 AGCTCCGCCTCCCGGCTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTA 112292245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGCTCCGCCTCCCGGCTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTA 2159

112292246 CAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAC 112292305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAC 2219

112292306 CGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAA 112292365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAA 2279

112292366 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGT 112292425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGT 2339

112292426 TGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGA 112292485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGA 2399

112292486 TATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACC 112292545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACC 2459

112292546 CTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGC 112292605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGC 2519

112292606 CTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGA 112292665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGA 2579

112292666 TATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTT 112292725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTT 2639

112292726 CACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTAT 112292785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTAT 2699

112292786 TGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTG 112292845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTG 2759

112292846 GTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATA 112292905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATA 2819

112292906 GACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAA 112292965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAA 2879

112292966 CAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGT 112293025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGT 2939

112293026 TATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGAT 112293085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGAT 2999

112293086 TGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCT 112293145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCT 3059

112293146 CAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCT 112293205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCT 3119

112293206 ATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTG 112293265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTG 3179

112293266 TGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCAT 112293325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCAT 3239

112293326 TTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCC 112293385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCC 3299

112293386 ACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCAT 112293445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCAT 3359

112293446 CTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTT 112293505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTT 3419

112293506 TTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATAT 112293565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATAT 3479

112293566 CATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTA 112293625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTA 3539

112293626 GTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTA 112293685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTA 3599

112293686 CAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAAT 112293745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAAT 3659

112293746 TTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGAT 112293805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGAT 3719

112293806 GTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTG 112293865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTG 3779

112293866 ACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCC 112293925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCC 3839

112293926 TTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATC 112293985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATC 3899

112293986 TAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATT 112294045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATT 3959

112294046 AAAAAT 112294051
          ||||||
     3960 AAAAAT 3965

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 4025

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 4085

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 4145

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 4205

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 4265

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 4325

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 4385

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 4445

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 4505

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 4565

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 4625

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 4685

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 4745

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 4805

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 4865

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 4925

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 4985

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 5045

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 5105

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 5165

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5166 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 5225

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 5285

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 5345

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 5405

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5406 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 5465

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5466 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 5525

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5526 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 5585

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5586 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 5645

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5646 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 5705

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5706 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 5765

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5766 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 5825

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5826 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 5885

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 5945

112299120 ATTAT 112299124
          |||||
     5946 ATTAT 5950

Alignment time is 4.75642 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3245] =>      3245 nucs 'mol-32-3332-023095_3245'

Score:        3223
Aligned:      3245        nucs
Identic:      3243 (100%) nucs =>       552 (100%)      2691 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293500,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299832]
 second seq =>  [        1,      552] EXCISED REGION [      553,     3245]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293500 ACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCT 112293559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCT 60

112293560 GTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTG 112293619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTG 120

112293620 TGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATG 112293679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATG 180

112293680 TGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGG 112293739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGG 240

112293740 TAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCG 112293799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCG 300

112293800 TTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTG 112293859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTG 360

112293860 GAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGAT 112293919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGAT 420

112293920 CCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCT 112293979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCT 480

112293980 CGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTA 112294039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTA 540

112294040 CACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||
      541 CACATTAAAAAT 552

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      553 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 612

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 672

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 732

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 792

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 852

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 912

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 972

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1032

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1092

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1152

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1212

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1272

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1332

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1392

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1452

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1512

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1572

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1632

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1692

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1752

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1753 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1812

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1872

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1932

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1992

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2052

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2112

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2172

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2232

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 AACTCACGATCACAAGAACAGCATAGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2292

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2352

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2412

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2472

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2532

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2592

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2652

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2712

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2772

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2832

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2892

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 2952

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3012

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3072

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3132

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3192

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATT 112299832
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATT 3245

Alignment time is 3.22523 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3431] =>      3431 nucs 'mol-32-3395-035859_3431'

Score:        3409
Aligned:      3431        nucs
Identic:      3429 (100%) nucs =>       795 (100%)      2634 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293257,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299775]
 second seq =>  [        1,      795] EXCISED REGION [      796,     3431]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293257 ACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATA 112293316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATA 60

112293317 AGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTT 112293376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTT 120

112293377 AACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATC 112293436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAAACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATC 180

112293437 TATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGA 112293496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATCTCCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGA 240

112293497 AAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGA 112293556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGA 300

112293557 TCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAA 112293616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGTATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAA 360

112293617 TTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGA 112293676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGA 420

112293677 ATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACAT 112293736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACAT 480

112293737 GGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATT 112293796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATT 540

112293797 GCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACAT 112293856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACAT 600

112293857 TTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATT 112293916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATT 660

112293917 GATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGA 112293976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGA 720

112293977 CCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGT 112294036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGT 780

112294037 GTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||
      781 GTACACATTAAAAAT 795

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 855

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 915

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 975

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1035

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1095

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 1155

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 1215

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1275

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1335

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1395

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1455

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1515

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1575

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 TAGAGCAGTGGAGTTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1635

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1695

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1755

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1815

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1875

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1935

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1995

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1996 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2055

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2115

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 2175

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 2235

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2295

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2355

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2415

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2475

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2535

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2595

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2655

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2715

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2775

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2835

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2895

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2955

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3015

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3075

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 3135

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 3195

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 3255

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3315

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3375

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCAT 112299775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCAT 3431

Alignment time is 2.74915 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2581] =>      2581 nucs 'mol-32-3395-190552_2581'

Score:        2570
Aligned:      2581        nucs
Identic:      2580 (100%) nucs =>       461 (100%)      2119 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293591,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299259]
 second seq =>  [        1,      461] EXCISED REGION [      462,     2581]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293591 ATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAA 112293650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAA 60

112293651 AGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACAT 112293710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACAT 120

112293711 GGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGG 112293770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGG 180

112293771 TCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGA 112293830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGA 240

112293831 TACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGA 112293890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGA 300

112293891 AAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACAT 112293950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACAT 360

112293951 ATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATT 112294010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATT 420

112294011 ACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 461

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 521

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 581

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 641

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 701

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 761

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 821

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 881

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 941

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1001

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1061

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1121

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1181

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1241

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1301

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1361

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1421

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1481

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1541

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1601

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1661

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1662 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1721

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1781

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1841

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1901

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 1961

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2021

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2081

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2141

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2201

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2261

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2321

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2381

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2441

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2501

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2561

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTA 112299259
          ||||||||||||||||||||
     2562 TGCCCTCATGAATGATATTA 2581

Alignment time is 2.36343 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3209] =>      3209 nucs 'mol-32-33ab-190882_3209'

Score:        3176
Aligned:      3209        nucs
Identic:      3206 (100%) nucs =>       538 (100%)      2668 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112293513,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299809]
 second seq =>  [        1,      539] EXCISED REGION [      540,     3209]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112293513 CTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCA 112293572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCA 60

112293573 ATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAAC 112293632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAAC 120

112293633 GAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTA 112293692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTA 180

112293693 AGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCA 112293752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCA 240

112293753 CTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCA 112293812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCA 300

112293813 TATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAA 112293872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAA 360

112293873 TCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCA 112293932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCA 420

112293933 GGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTC 112293992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTC 480

112293993 TAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGGATGCTCGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 539

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 599

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 659

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 719

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 779

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 839

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 899

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 959

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 1019

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 1079

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 1139

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 1199

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 1259

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 1319

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 1379

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 1439

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 1499

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 1559

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 1619

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 1679

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 1739

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1740 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 1799

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 1859

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 1919

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 1979

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 2039

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 2099

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 2159

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 2219

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 2279

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 2339

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 2399

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 2459

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 2519

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 2579

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 2639

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 2699

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 2759

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 2819

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 2879

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 2939

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 2999

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 3059

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 3119

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 3179

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATA 112299809
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATA 3209

Alignment time is 3.10222 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4450] =>      4450 nucs 'mol-32-33f8-021051_4450'

Score:        4439
Aligned:      4450        nucs
Identic:      4449 (100%) nucs =>      1730 (100%)      2719 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292322,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299859]
 second seq =>  [        1,     1730] EXCISED REGION [     1731,     4450]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292322 TCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 112292381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 60

112292382 GCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTG 112292441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGGATGTG 120

112292442 TAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTA 112292501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTACAATTA 180

112292502 TAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCC 112292561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTGACTCC 240

112292562 CCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATC 112292621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACTTTATC 300

112292622 TTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAG 112292681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAGCTAAG 360

112292682 GCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGAC 112292741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAGCTGAC 420

112292742 AGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTC 112292801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGACTCCTC 480

112292802 TGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTG 112292861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACACTGTG 540

112292862 ATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTC 112292921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTATTGTC 600

112292922 GCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATT 112292981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTGATATT 660

112292982 TTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGAT 112293041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATTTTGAT 720

112293042 TTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAA 112293101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTAAGTAA 780

112293102 ACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATA 112293161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAATAATA 840

112293162 TAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAA 112293221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACATAAAA 900

112293222 ATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTA 112293281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGTGTGTA 960

112293282 TGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGA 112293341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTACTCAGA 1020

112293342 TTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCA 112293401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACATACCA 1080

112293402 AACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTA 112293461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTGATCTA 1140

112293462 GTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTA 112293521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTTCTTTA 1200

112293522 AAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGA 112293581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGACTTGA 1260

112293582 GGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTG 112293641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAATTATTG 1320

112293642 AGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTA 112293701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTCAGCTA 1380

112293702 ATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGA 112293761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTTACTGA 1440

112293762 ATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAA 112293821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATCTCCAA 1500

112293822 TCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAG 112293881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCATCAGAG 1560

112293882 AAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTC 112293941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGATTTTC 1620

112293942 TATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCT 112294001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGGATGCT 1680

112294002 TGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1730

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1790

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1850

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1910

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1970

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2030

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2090

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2150

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2210

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2270

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2330

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2390

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2450

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2510

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2570

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2630

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2690

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2750

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2810

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2870

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2930

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2931 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2990

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 3050

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3110

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3170

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3230

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3290

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3350

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3410

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3470

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3530

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3590

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3650

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3710

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3770

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3830

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3890

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3950

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 4010

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 4070

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4130

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4190

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4250

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4310

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 4370

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 4430

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAA 112299859
          ||||||||||||||||||||
     4431 ATGTAAATTTAAGTTACAAA 4450

Alignment time is 4.06192 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4432] =>      4432 nucs 'mol-32-34a8-064012_4432'

Score:        4421
Aligned:      4432        nucs
Identic:      4431 (100%) nucs =>      1675 (100%)      2756 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292377,112294051] EXCISED REGION [112297140,112299896]
 second seq =>  [        1,     1675] EXCISED REGION [     1676,     4432]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292377 TACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGG 112292436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATTCTGTTGGTCAAGGGG 60

112292437 ATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTAC 112292496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACATGGATATTGGGGTAC 120

112292497 AATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTG 112292556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTTTACCCTCTAACACTG 180

112292557 ACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACT 112292616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACATTGCCTATACATACT 240

112292617 TTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAG 112292676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAGGTGATATGTGTCCAG 300

112292677 CTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAG 112292736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGTATTTCACATGTGGAG 360

112292737 CTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGAC 112292796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCTGTATTGAAGATTGAC 420

112292797 TCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACA 112292856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTTTCTGGTCCTTAAACA 480

112292857 CTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTA 112292916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCAAATAGACTAATTTTA 540

112292917 TTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTG 112292976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAACAAACAACGATGTTG 600

112292977 ATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATT 112293036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGAGTGTTATTCCTCATT 660

112293037 TTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTA 112293096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGATGATTGCTTAGCCTA 720

112293097 AGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAA 112293156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCACCCTCAAAAGTTTAA 780

112293157 TAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACA 112293216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGCAGCTATATTAAAACA 840

112293217 TAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGT 112293276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAATGTGTGTCTAGGAGT 900

112293277 GTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTAC 112293336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAGGCATTTGTATCTTAC 960

112293337 TCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACA 112293396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAAACCCACACATACACA 1020

112293397 TACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTG 112293456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCTCCATCTTATTTGGTG 1080

112293457 ATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTT 112293516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGACACTTTTATTGGCTTT 1140

112293517 CTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGA 112293576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGTATATCATTTCAATGA 1200

112293577 CTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAAT 112293636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTGATTAGTCAAACGAAT 1260

112293637 TATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTC 112293696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTGATTACAACCTAAGTC 1320

112293697 AGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTT 112293756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTAAAATTTCCTCACTTT 1380

112293757 ACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATC 112293816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTTTGATGTGGGCATATC 1440

112293817 TCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCAT 112293876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGAAGTGACAGGAATCAT 1500

112293877 CAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGA 112293936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCCTGCCTTACCCAGGGA 1560

112293937 TTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGG 112293996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCGAATCTAGGCTCTAGG 1620

112293997 ATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 112294051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACACATTAAAAAT 1675

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1735

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1795

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1855

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1915

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 1975

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2035

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2095

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2155

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2215

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2275

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2335

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2395

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2455

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2515

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2575

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2635

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2695

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2755

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2815

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2875

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2876 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 2935

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 112298459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTCTAGGAAGTCCCAAACCTTCCC 2995

112298460 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 112298519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 ACATCTGCCTGTCTTCTGACCCCTCCAAACTGTTTGAACCTCTGCCTGTTATCCAGCTCC 3055

112298520 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 112298579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AAAGTTGCTTCCATATTTTCGGGTATCTTACAGCAGCACCCCACTACTCAGTACCAGTTT 3115

112298580 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 112298639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ATTGTATTAGTCCATTCTCACACTGCTAATAAAGACATAACCAAGACTGGGGAATTTATA 3175

112298640 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 112298699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 GAGGGTAGAGGTTTATTTAATTGACTCACAGTTCAACATGGCTGGGGAAGCCTCAGGAAA 3235

112298700 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 112298759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 CTTAGAATCATGACAGAAGGAGAAGCAACCATGTCTTTCTTCAAGTGGTGGCAGGAGAGA 3295

112298760 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 112298819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 AGAGTTAATGCCCACCAAAGTGGGGAGCCTATTTTAAAACCATCAGATCTTATGAGAACT 3355

112298820 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 112298879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 AACTCACGATCACAAGAACAGCATGGGGAAACAAGGCCTGTGATTCAATTATGTCCTTCT 3415

112298880 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 112298939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AGTCCCTCCCAGGACACAGGGGGATTACGGAAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTAG 3475

112298940 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 112298999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 GAACACAGCCAAACCATACTATATATGTATATATATTTGACTTTGGTATATGAGTTTTTA 3535

112299000 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 112299059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TTATGTATATATCAGCTACAAATTAAGGGCAATAGACAATTATTTAATGCACCTTAACAT 3595

112299060 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 112299119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 ATATAGCACTCAATCTGTAATATTTATGTATAAGAAAATGTTGCTAGCCCTATAACGTGA 3655

112299120 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 112299179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 ATTATTCATTGCTATGGTTTGATTAATTTTGTCCCATCAAAATTCATGTTGAAACGTTAA 3715

112299180 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 112299239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 CCCTAATGCGACTATATTAAGGGGTGTGATTTTTAGGAGATAATTGAGTCTTGAAGGCTC 3775

112299240 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 112299299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 TGCCCTCATGAATGATATTAGGTGCCCTTATAAAAGGGCTTGATAGAAGGAGCTCACCCC 3835

112299300 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 112299359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TTTTTGCCCTTCTGCTTTCCACCATGTGAGGACATTAGTCCCCGTCAAAGGATGCAGCAA 3895

112299360 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 112299419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CAAGGCTCCATTTTGGAAACAGACGCTGGGCCTTCATAAGACACTGAATCTAGCAGCACC 3955

112299420 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 112299479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TTCATCTTGGCCTCCTACTCTCCAAAACTGTGAGAAATAAATTTATGCTCTTTATTAATT 4015

112299480 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 112299539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 ACCCAGTCTCAGATATTCTGTTATAGCAGCACTAATAAACTCAGATGGCCATGAAAATAA 4075

112299540 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 112299599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TCTCTAAGAGTACTAATAGCTTAGCATCTAATAACAAATAATTTAATAATAATGGCTTAT 4135

112299600 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 112299659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 TAAAAAATTTCTTTATATTTGAAATGCCTCAATGTTTATTTCATGATTTCCAGAATATTT 4195

112299660 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 112299719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 ATTTTTTGTGTTTACTGTGTGGTCTTTTTATAACATGATCACTTATAATTTGTAAGATCA 4255

112299720 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 112299779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 GAAGTAGGCATTCTGAAATCTGCATGCAAAATATTTTATTAGAAATGAGAAGCCATTATT 4315

112299780 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 112299839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 TAGTTGTTTAATTAATTTGTGAAACTAATAACTATTTAATTCAACATATAATTAAAGTTA 4375

112299840 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGT 112299896
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 ATGTAAATTTAAGTTACAAATAATAAAGGGAGAGCAAAATAATAAAAAGCTTAAGGT 4432

Alignment time is 3.54059 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [112284051,112307139] =>     23089 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3055] =>      3055 nucs 'mol-32-34b3-018166_3055'

Score:        3027
Aligned:      3049        nucs
Identic:      3047 (100%) nucs =>      1749 (100%)      1298 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [112292302,112294051] EXCISED REGION [112297140,112298438]
 second seq =>  [        1,     1750] EXCISED REGION [     1751,     3049]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3088 nucs [112294052,112297139]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [112294052,112294052] to [112297140,112297140]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

112292302 TCACCGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTC 112292361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACCGTTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTC 60

112292362 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATT 112292421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCACCTCTTCTAATATCATT 120

112292422 CTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACA 112292481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTTGGTCAAGGGGATGTGTAGCCAAGCATGAAAGAATAATTACTCAAGAGATGAGACA 180

112292482 TGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTT 112292541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGATATTGGGGTACAATTATAAAACCTCACACTGCCTCTTTGTTCTTCCCTTCTTCCTT 240

112292542 TACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACA 112292601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACCCTCTAACACTGACTCCCCACACACTCAGCCAAAGCTCCTGTTGTAGTTAGTACACA 300

112292602 TTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAG 112292661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGCCTATACATACTTTATCTTTTATATCACAGTCTTTTATGCATTTGGGTTGGATTGAG 360

112292662 GTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGT 112292721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGATATGTGTCCAGCTAAGGCTGTTAAAAATGATTTTGCCTCTTCTCTCTGCCTTTCGT 420

112292722 ATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCT 112292781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTCACATGTGGAGCTGACAGTAGGATAAGAAGAGCAGAACATGGAAAACTAAGTTTCT 480

112292782 GTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTT 112292841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTATTGAAGATTGACTCCTCTGACCTACAGCAGATTTTCTGTGATTTATAAATTAACCTT 540

112292842 TCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCA 112292901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTGGTCCTTAAACACTGTGATTTCAGAATTTATTGGTTACTATCACATAGCTTGGCTCA 600

112292902 AATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAA 112292961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATAGACTAATTTTATTGTCGCCCACTATGAACTTTTCTCACTTAAGTTTATCTCAAAAA 660

112292962 CAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGA 112293021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAACAACGATGTTGATATTTTACTTTGATACTAATTGCACCGTGCTAAAAGGACACAGA 720

112293022 GTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGA 112293081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTTATTCCTCATTTTGATTTATTCTTTCGTTCTCAAGGAATGTCACCAAAGTACAAGA 780

112293082 TGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCA 112293141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATTGCTTAGCCTAAGTAAACAATACAAACAATAGTGAAATGCCTGAAATTTTCTGCCA 840

112293142 CCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGC 112293201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCTCAAAAGTTTAATAATATAATTCCCCTCAAATTATCAAGTAAATTCCTTGTGTCTGC 900

112293202 AGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAA 112293261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTATATTAAAACATAAAAATATTTTCTCCTTTTTCATCGTAAATAAATTAAAAACAAA 960

112293262 TGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAG 112293321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTGTGTCTAGGAGTGTGTATGTAATTTGTTCTAATTTATGTTTATTTTTTAATAAGTAG 1020

112293322 GCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAA 112293381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATTTGTATCTTACTCAGATTTCTATTTTTTTGCATATATTACCCACAGTTTTTAACAA 1080

112293382 ACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCT 112293441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCCACACATACACATACCAAACACAAATGTTTATAGATCTTTTTTTAGAATATCTATCT 1140

112293442 CCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGAC 112293501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATCTTATTTGGTGATCTAGTCAATTTAATCCTACAACCAGAATACAAATGTGAAAGAC 1200

112293502 ACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGT 112293561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTTTTATTGGCTTTCTTTAAAATATAAATTCCCTGCTTCTTTCTTCCTAAATGATCTGT 1260

112293562 ATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTG 112293621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATCATTTCAATGACTTGAGGTACGCTGATCCTACTCTCAGCTCTAGTTACAAATTGTG 1320

112293622 ATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTG 112293681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTAGTCAAACGAATTATTGAGCTCTCAAAGTCCACAATGGTGATTGAATTAAGAATGTG 1380

112293682 ATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTA 112293741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTACAACCTAAGTCAGCTAATCAGACATGGGAAAATATCACCTGGGAGTAACATGGGTA 1440

112293742 AAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTT 112293801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATTTCCTCACTTTACTGAATAACTTGGTCACTTTTTTTCCATTTTTGCACATTGCGTT 1500

112293802 TGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGA 112293861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGATGTGGGCATATCTCCAATCATCTAGATACCAAATTAATGATAAAGGCAACATTTGGA 1560

112293862 AGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCC 112293921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTGACAGGAATCATCAGAGAAAAACAGAAAGAGAGCAACGATGAATTATGAATTGATCC 1620

112293922 TGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCG 112293981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCCTTACCCAGGGATTTTCTATGCACATATGCAAATACTTTACTTTTCAAATGACCTCG 1680

112293982 AATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAAAAGTGTACA 112294041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1681 AATCTAGGCTCTAGGATGCTTGCACTATTACGTTATAAATGACACAATTAGAAGTGTACA 1740

112294042 CATTAAAAAT 112294051
          ||||||||||
     1741 CATTAAAAAT 1750

EXCISED REGION

112297140 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 112297199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 GTCCAAATTCTCATCTGAGACAAGGCAAGTCACTTCCACCTATGAGCCTGTAAAATCAAA 1810

112297200 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 112297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 AGCAAGTTAGTTACTTCCTAGACACAATGGGCATACAGGCGTTGGGTAAATACACCAGTT 1870

112297260 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 112297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CCAAATGGGAGAAATTGGTCAAAACAAAGGGGCTACAGGCCCCATGGAAGTCTGAAATCC 1930

112297320 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 112297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 AATAGGACAGTCGTTAAACATTAAAGTTCCAAAATGATCTCCTTTGACTCCATGTCTCAC 1990

112297380 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 112297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GTCCGGGTCACGCTGATGCAAGAGGCGGGCTGCCACAGCCTTGGGTAGCTCAGCCTCTGT 2050

112297440 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 112297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 GGCTTTGCAGGGTACATACCCCTCCTGACTGCTTTCACAACTGGCATTAAGTGTATGCAT 2110

112297500 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 112297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CTTTTTGAAGTACATGGCACAAGTTGTCGGTGGATCTAACATTCTGGGGTCTGGAGGACA 2170

112297560 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 112297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 GTGGCTTTCTTCTCACAGCTCCACTAGTCAGTACCCCAGTGGGGACTCTGTGTGGGGGCT 2230

112297620 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 112297679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 CCAATCCCACATTTTCTTTCTGCATTGCCCTAGCAGAAGTTCTTCATGAGTGTTCCACCC 2290

112297680 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 112297739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 CTGCAGCACACCTCTGCCTGGACATCCAGGCATTTCCGTACATCCTCTGAAATCTAGGTG 2350

112297740 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 112297799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 GAGAGTCCCACATTTCAATTCTTGATTTCTGTGCACCTGTAGGTCCAACACCATATGTAT 2410

112297800 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 112297859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 GCCAACAAGGCATGGGGCTTGCACCCTCTGAAGCAATGTCCTGAGCTGTACATTAGCCCC 2470

112297860 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 112297919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TTTTAGCCATGGCTGGAGCTGAAATGACTGAGACACAGGGCACCACAACCCCAGGCTGCA 2530

112297920 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 112297979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TAGAGCAGTGGAGCTCCCCTGGGAAGGCCCATGAAACTATTTTTCCCATGTATGCTTCCT 2590

112297980 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 112298039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TTTTACCCCTAGGCCTCCAGGCCTGTGATGGGAGGGGCTGCCATGAAGGTCTCTGACTGC 2650

112298040 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 112298099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 CCTGGAGACATTTTCCCCATTGTCTTGGTGATTAATATTCAGCTCTCAGTTACTTATGCA 2710

112298100 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 112298159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 AATTTCCACAGTCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGGTTTTTCTTTTCTGTCACATC 2770

112298160 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 112298219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 ATCAGGCCGCAAATTTTTCAAACTTTATGCTCTGCTTTCTCTTGAACACTTTGCCGCTTA 2830

112298220 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 112298279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 GAAATTTCTTCCACCGGATACTCTAAATCATCTCTCTCAAGTTCAAAGTGCCACACATCT 2890

112298280 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 112298339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 CTAGGGCAGGAGCAAAATGCTTCCAATGAATCTGCATAGCAAGAATGATCTTTACTCCAG 2950

112298340 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATTGTCCACAT 112298399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2951 TTCCCAACAAGATTCTTATTTCATCTGAGGCCACCTCAGCCTGGACTTCATCGTCCACAT 3010

112298400 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTC 112298438
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 CACTATCAGCATTTTCGTCAAAGCAATTCAACAATTCTC 3049

Alignment time is 2.45783 s

