
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3783] =>      3783 nucs 'mol-32-1e7c-057395_3783'

Score:        3656
Aligned:      3700        nucs
Identic:      3696 (100%) nucs =>      2230 (100%)      1466 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541052,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548067]
 second seq =>  [       1,    2231] EXCISED REGION [    2315,    3783]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [2232,2314]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [2230,2231] to [2315,2316]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541052 GGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAA 96541111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAA 60

 96541112 AAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTA 96541171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTA 120

 96541172 TAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCAC 96541231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCAC 180

 96541232 ATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACC 96541291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACC 240

 96541292 ATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGA 96541351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGA 300

 96541352 ATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATT 96541411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATT 360

 96541412 TAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAA 96541471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAA 420

 96541472 ACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAAT 96541531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAAT 480

 96541532 AATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATC 96541591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATC 540

 96541592 ATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATAT 96541651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATAT 600

 96541652 ATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATA 96541711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATA 660

 96541712 ATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAA 96541771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAA 720

 96541772 AACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCT 96541831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCT 780

 96541832 TTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATC 96541891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATC 840

 96541892 AGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTC 96541951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTC 900

 96541952 TGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGA 96542011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGA 960

 96542012 GGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAAC 96542071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAAC 1020

 96542072 ATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAG 96542131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAG 1080

 96542132 ACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACT 96542191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACT 1140

 96542192 GTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTT 96542251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTT 1200

 96542252 TCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATAC 96542311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATAC 1260

 96542312 TCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGG 96542371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGG 1320

 96542372 AAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGT 96542431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGT 1380

 96542432 GGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCT 96542491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCT 1440

 96542492 TTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGA 96542551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGA 1500

 96542552 TTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCAT 96542611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCAT 1560

 96542612 GGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCA 96542671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCA 1620

 96542672 CTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTT 96542731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTT 1680

 96542732 TCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTC 96542791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTC 1740

 96542792 CTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCT 96542851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCT 1800

 96542852 TACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCA 96542911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCA 1860

 96542912 GGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTT 96542971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTT 1920

 96542972 CTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATC 96543031
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATC 1980

 96543032 CCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCT 96543091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCT 2040

 96543092 GAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCT 96543151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCT 2100

 96543152 TCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTA 96543211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTA 2160

 96543212 CAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCT 96543271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCT 2220

 96543272 TACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||
     2221 TACTTTCAACT 2231

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 2374

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 2434

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 2494

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 2554

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2614

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2674

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2734

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2794

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 2854

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2914

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2974

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 3034

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 3094

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 3154

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 3214

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 3274

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 3334

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 3394

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 3454

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 3514

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 3574

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 3634

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 3694

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 3754

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACT 96548067
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3755 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACT 3783

Alignment time is 5.41007 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2299] =>      2299 nucs 'mol-32-1e7c-227243_2299'

Score:        2172
Aligned:      2216        nucs
Identic:      2212 (100%) nucs =>       745 (100%)      1467 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542537,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548068]
 second seq =>  [       1,     746] EXCISED REGION [     830,    2299]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [747,829]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [745,746] to [830,831]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96542537 GGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGA 96542596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGA 60

 96542597 TACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAA 96542656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAA 120

 96542657 GCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAA 96542716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAA 180

 96542717 GGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGAT 96542776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGAT 240

 96542777 ACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTAT 96542836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTAT 300

 96542837 TCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTG 96542896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTG 360

 96542897 AACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAG 96542956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAG 420

 96542957 GCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGC 96543016
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGC 480

 96543017 AATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTC 96543076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTC 540

 96543077 CTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAA 96543136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAA 600

 96543137 ATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAG 96543196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAG 660

 96543197 CTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTC 96543256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTC 720

 96543257 ATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 746

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 889

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 949

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1009

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 1069

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 1129

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 1189

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 1249

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 1309

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 1369

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 1429

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 1489

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 1549

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 1609

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 1669

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 1729

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 1789

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 1849

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 1909

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 1969

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 2029

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 2089

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 2149

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 2209

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 2269

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTT 96548068
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTT 2299

Alignment time is 3.16629 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2786] =>      2786 nucs 'mol-32-1e87-105926_2786'

Score:        2659
Aligned:      2703        nucs
Identic:      2699 (100%) nucs =>      1227 (100%)      1472 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542055,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548073]
 second seq =>  [       1,    1228] EXCISED REGION [    1312,    2786]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1229,1311]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1227,1228] to [1312,1313]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96542055 CTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGT 96542114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGT 60

 96542115 TATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATG 96542174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATG 120

 96542175 GTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGG 96542234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGG 180

 96542235 CTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGA 96542294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGA 240

 96542295 AGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTG 96542354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTG 300

 96542355 CCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCA 96542414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCA 360

 96542415 TAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGT 96542474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGT 420

 96542475 TCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTG 96542534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTG 480

 96542535 GGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACAT 96542594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACAT 540

 96542595 GATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCT 96542654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCT 600

 96542655 AAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAAC 96542714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAAC 660

 96542715 AAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAG 96542774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAG 720

 96542775 ATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTT 96542834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTT 780

 96542835 ATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGC 96542894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGC 840

 96542895 TGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACA 96542954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACA 900

 96542955 AGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCG 96543014
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCG 960

 96543015 GCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGAT 96543074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGAT 1020

 96543075 TCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCA 96543134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCA 1080

 96543135 AAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTA 96543194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTA 1140

 96543195 AGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTT 96543254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTT 1200

 96543255 TCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 1228

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1371

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1431

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1491

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 1551

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 1611

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 1671

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 1731

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 1791

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 1851

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 1911

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 1971

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2031

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 2091

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 2151

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 2211

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 2271

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 2331

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 2391

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 2451

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 2511

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 2571

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 2631

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 2691

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 2751

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTA 96548073
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTA 2786

Alignment time is 4.18966 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3694] =>      3694 nucs 'mol-32-1f16-000807_3694'

Score:        3513
Aligned:      3612        nucs
Identic:      3603 (100%) nucs =>      1724 (100%)      1879 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541558,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548485]
 second seq =>  [       1,    1725] EXCISED REGION [    1809,    3694]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1726,1808]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1724,1725] to [1809,1810]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541558 CCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGT 96541617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGT 60

 96541618 CTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATG 96541677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATG 120

 96541678 CATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTG 96541737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTG 180

 96541738 AAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTC 96541797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTC 240

 96541798 AAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATG 96541857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATG 300

 96541858 GATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTA 96541917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTA 360

 96541918 GAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAA 96541977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAA 420

 96541978 GCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGC 96542037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGC 480

 96542038 CATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTG 96542097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTG 540

 96542098 TAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGT 96542157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGT 600

 96542158 GTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTC 96542217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTC 660

 96542218 AAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCA 96542277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCA 720

 96542278 CTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCAT 96542337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCAT 780

 96542338 GCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAA 96542397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAA 840

 96542398 TACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATT 96542457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATT 900

 96542458 ATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATA 96542517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATA 960

 96542518 CTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGT 96542577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGT 1020

 96542578 CAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTA 96542637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTA 1080

 96542638 TACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCC 96542697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCC 1140

 96542698 AGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGT 96542757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGT 1200

 96542758 ACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGA 96542817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGA 1260

 96542818 TGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTG 96542877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTG 1320

 96542878 TTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTT 96542937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTT 1380

 96542938 TGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTT 96542997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1381 TGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTT 1440

 96542998 TCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCT 96543057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCT 1500

 96543058 GCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGT 96543117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGT 1560

 96543118 CAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACC 96543177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACC 1620

 96543178 ATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGT 96543237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGT 1680

 96543238 TACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 1725

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1868

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1928

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1988

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 2048

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2108

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2168

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2228

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2288

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 2348

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2408

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2468

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2528

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 2588

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 2648

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 2708

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 2768

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 2828

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 2888

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 2948

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 3008

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 3068

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 3128

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 3188

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 3248

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     3249 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTG 3307

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3308 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 3367

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3368 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 3427

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 3487

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 3547

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 3607

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 3667

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCT 96548485
          |||||||||||||||||||||||||||
     3668 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCT 3694

Alignment time is 5.31947 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2058] =>      2058 nucs 'mol-32-1f21-038590_2058'

Score:        1931
Aligned:      1975        nucs
Identic:      1971 (100%) nucs =>       502 (100%)      1469 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542780,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548070]
 second seq =>  [       1,     503] EXCISED REGION [     587,    2058]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [504,586]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [502,503] to [587,588]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96542780 ATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCC 96542839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCC 60

 96542840 TTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAAC 96542899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAAC 120

 96542900 TATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCT 96542959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCT 180

 96542960 CCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAAT 96543019
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAAT 240

 96543020 CACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTG 96543079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTG 300

 96543080 CTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATA 96543139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATA 360

 96543140 AGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTC 96543199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTC 420

 96543200 AAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATT 96543259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATT 480

 96543260 TAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||
      481 TAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 503

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 646

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 706

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 766

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 826

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 886

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 946

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 1006

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 1066

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 1126

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 1186

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 1246

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 1306

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 1366

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 1426

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 1486

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 1546

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 1606

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 1666

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 1726

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 1786

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 1846

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 1906

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 1966

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 2026

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGG 96548070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGG 2058

Alignment time is 3.1065 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2597] =>      2597 nucs 'mol-32-1f63-013689_2597'

Score:        2448
Aligned:      2516        nucs
Identic:      2509 (100%) nucs =>       928 (100%)      1581 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542354,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548185]
 second seq =>  [       1,     929] EXCISED REGION [    1013,    2597]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [930,1012]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [928,929] to [1013,1014]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96542354 GCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATC 96542413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATC 60

 96542414 ATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGG 96542473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGG 120

 96542474 TTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATT 96542533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATT 180

 96542534 GGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACA 96542593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACA 240

 96542594 TGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTC 96542653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTC 300

 96542654 TAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAA 96542713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAA 360

 96542714 CAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTA 96542773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTA 420

 96542774 GATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTT 96542833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTT 480

 96542834 TATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAG 96542893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAG 540

 96542894 CTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCAC 96542953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCAC 600

 96542954 AAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTC 96543013
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTC 660

 96543014 GGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGA 96543073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGA 720

 96543074 TTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCC 96543133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCC 780

 96543134 AAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTT 96543193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTT 840

 96543194 AAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTT 96543253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTT 900

 96543254 TTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 929

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1072

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1132

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1192

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 1252

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 1312

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 1372

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 1432

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 1492

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 1552

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 1612

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 1672

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 1732

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 1792

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 1852

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 1912

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 1972

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 2032

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 2092

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 2152

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 2212

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 2272

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 2332

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 2392

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 2452

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
     2453 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCAT--TTTTTTTTTTTTTTTTTG 2510

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2511 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 2570

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCAT 96548185
          |||||||||||||||||||||||||||
     2571 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCAT 2597

Alignment time is 3.85318 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5446] =>      5446 nucs 'mol-32-206b-105406_5446'

Score:        5250
Aligned:      5443        nucs
Identic:      5423 (100%) nucs =>      3483 (100%)      1940 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541553,96545044] EXCISED REGION [96545045,96546994]
 second seq =>  [       1,    3493] EXCISED REGION [    3502,    5446]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3494,3501]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3494,3532] to [3502,3540]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [3492,3493] to [3502,3503]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3494,3497] to [3498,3501]

 96541553 TAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTC 96541612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTC 60

 96541613 TGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAA 96541672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAA 120

 96541673 ATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAA 96541732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAA 180

 96541733 TTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTT 96541792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTT 240

 96541793 TTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTT 96541852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTT 300

 96541853 TAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGG 96541912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGG 360

 96541913 TACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAG 96541972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAG 420

 96541973 GGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCT 96542032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCT 480

 96542033 GTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAAT 96542092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAAT 540

 96542093 GCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTG 96542152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTG 600

 96542153 CATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAA 96542212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAA 660

 96542213 AGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGT 96542272
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGT 720

 96542273 ATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATA 96542332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATA 780

 96542333 TTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGAT 96542392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGAT 840

 96542393 TAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGG 96542452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGG 900

 96542453 CCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAA 96542512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAA 960

 96542513 AAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATG 96542572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATG 1020

 96542573 TTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAG 96542632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAG 1080

 96542633 CTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATT 96542692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATT 1140

 96542693 CCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGA 96542752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGA 1200

 96542753 TCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTT 96542812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTT 1260

 96542813 CCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTC 96542872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTC 1320

 96542873 TCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCAT 96542932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCAT 1380

 96542933 CCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAAT 96542992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAAT 1440

 96542993 CTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATG 96543052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATG 1500

 96543053 CTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCC 96543112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCC 1560

 96543113 AAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTA 96543172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTA 1620

 96543173 GCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAA 96543232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAA 1680

 96543233 TTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCC 96543292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCC 1740

 96543293 ATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAG 96543352
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1741 ATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAG 1800

 96543353 AATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAA 96543412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAA 1860

 96543413 AAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACT 96543472
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACT 1920

 96543473 CTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTC 96543532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTC 1980

 96543533 AAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACA 96543592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACA 2040

 96543593 CGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACA 96543652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACA 2100

 96543653 GCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTC 96543712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTC 2160

 96543713 CAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAG 96543772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||
     2161 CAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAG 2220

 96543773 CCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTC 96543832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTC 2280

 96543833 CTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGA 96543892
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2281 CTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGA 2340

 96543893 AATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAG 96543952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAG 2400

 96543953 CACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCC 96544012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCC 2460

 96544013 TCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTT 96544072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTT 2520

 96544073 TTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATA 96544132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATA 2580

 96544133 GCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACAT 96544191
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     2581 GGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACAT 2640

 96544192 ACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATC 96544251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2641 ACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATC 2700

 96544252 CATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTC 96544311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTC 2760

 96544312 CCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTAC 96544371
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTAC 2820

 96544372 CCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTA 96544431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTA 2880

 96544432 CAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATA 96544491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATA 2940

 96544492 CTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGA 96544551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGA 3000

 96544552 GTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATC 96544611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATC 3060

 96544612 ACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATG 96544671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATG 3120

 96544672 GTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAG 96544731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAG 3180

 96544732 TAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGG 96544791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGG 3240

 96544792 GAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGG 96544851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGG 3300

 96544852 AGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAA 96544911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAA 3360

 96544912 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGC 96544971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGC 3420

 96544972 AGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTC 96545031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTC 3480

 96545032 AATGCATACATAT 96545044
          |||||||||||||
     3481 AATGCATACATAT 3493

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 3561

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3562 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 3621

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3681

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 3741

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCGCCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 3801

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 3861

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 3921

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 3981

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 4041

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 4101

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4102 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 4161

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 4221

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 4281

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 4341

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 4401

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 4461

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 4521

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 4581

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4582 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 4641

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4701

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 4761

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 4821

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 4881

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
     4882 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC--TTTTTTTTTTTTTTT 4939

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 4999

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     5000 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 5056

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 5116

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 5176

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 5236

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 5296

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 5356

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 5416

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAG 96546994
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAG 5446

Alignment time is 7.76144 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4205] =>      4205 nucs 'mol-32-206b-124938_4205'

Score:        4058
Aligned:      4198        nucs
Identic:      4182 (100%) nucs =>      2672 (100%)      1510 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96545678,96548359] EXCISED REGION [96548360,96549871]
 second seq =>  [       7,    2686] EXCISED REGION [    2691,    4205]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2687,2690]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [2687,2691] to [2691,2695]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96545678 GGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCT 96545737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 GGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCT 66

 96545738 GGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTA 96545797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 GGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTA 126

 96545798 TTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTA 96545857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 TTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTA 186

 96545858 AAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACAC 96545917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 AAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACAC 246

 96545918 AGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCA 96545977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 AGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCA 306

 96545978 ACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATT 96546037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 ACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATT 366

 96546038 GAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAAC 96546097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 GAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAAC 426

 96546098 TGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCT 96546157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 TGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCT 486

 96546158 TACAAATGAAATAATGATTAGTATGTCTATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATG 96546217
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      487 TACAAATGAAATAATTATTAGTATGTCTATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAG 546

 96546218 AGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTT 96546277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 AGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTT 606

 96546278 TGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACC 96546337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 TGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACC 666

 96546338 CAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATA 96546397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 CAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATA 726

 96546398 AATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGG 96546457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 AATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGG 786

 96546458 CTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGG 96546517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 CTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGG 846

 96546518 AGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTT 96546577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      847 AGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCT- 905

 96546578 CTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTT 96546637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 --GCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTT 963

 96546638 TTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 96546697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 TTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 1023

 96546698 CCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAG 96546757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 CCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAG 1083

 96546758 CACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAA 96546817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 CACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAA 1143

 96546818 ATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTA 96546877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 ATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTA 1203

 96546878 CCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCC 96546937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCC 1263

 96546938 TATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAAT 96546997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAAT 1323

 96546998 GATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTC 96547057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 GATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTC 1383

 96547058 AGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTA 96547117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 AGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTA 1443

 96547118 GCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGT 96547177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 GCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGT 1503

 96547178 ATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGG 96547237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 ATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGG 1563

 96547238 CTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTT 96547297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTT 1623

 96547298 AGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTT 96547357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 AGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTT 1683

 96547358 CATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTG 96547417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1684 CATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTG 1743

 96547418 AAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAA 96547477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAA 1803

 96547478 TATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTT 96547537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 TATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTT 1863

 96547538 CTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATT 96547597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 CTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATT 1923

 96547598 TCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCC 96547657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCC 1983

 96547658 TTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCT 96547717
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCT 2043

 96547718 AACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATC 96547777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATC 2103

 96547778 CCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTG 96547837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTG 2163

 96547838 AACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTA 96547897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTA 2223

 96547898 AACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTA 96547957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 AACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTA 2283

 96547958 ATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTC 96548017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTC 2343

 96548018 TTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCA 96548077
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTTTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCA 2403

 96548078 TTCTTTTTTTTTTTTTTTTT-GAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAG 96548136
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 TTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAG 2463

 96548137 TGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTC 96548196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTC 2523

 96548197 AGTCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTA 96548256
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2524 AGCCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCACCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTA 2583

 96548257 TTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCG 96548316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCG 2643

 96548317 TGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGC 96548359
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 TGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGC 2686

EXCISED REGION

 96548360 GTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAA 96548419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 GTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAA 2750

 96548420 TGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACA 96548479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 TGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACA 2810

 96548480 AACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATT 96548539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATT 2870

 96548540 TTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGT 96548599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 TTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGT 2930

 96548600 TAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGAT 96548659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 TAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGAT 2990

 96548660 AAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAA 96548719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 AAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAA 3050

 96548720 AAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAA 96548779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 AAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAA 3110

 96548780 GTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAATATCTTTATAGTGTGGTT 96548839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 GTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAATATCTTTATAGTGTGGTT 3170

 96548840 AATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAAGAAAAAAATAACTCAAGTTTT 96548899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 AATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAAGAAAAAAATAACTCAAGTTTT 3230

 96548900 TTTAAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAGAAGAAACAAATGTACAACAAA 96548959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 TTTAAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAGAAGAAACAAATGTACAACAAA 3290

 96548960 CACAAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAAAAAAACCTAAAATAATGTGTC 96549019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CACAAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAAAAAAACCTAAAATAATGTGTC 3350

 96549020 ATTTTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATGGTAATACTTTATAAATAAAAA 96549079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3351 ATTTTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATGGTAATACTTTATGAATAAAAA 3410

 96549080 TGTATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATACCATGTTTCTGGGCAAAAATT 96549139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TGTATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATACCATGTTTCTGGGCAAAAATT 3470

 96549140 ACCCAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTTGCCAGGATTTTAAAAAAAATT 96549199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 ACCCAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTTGCCAGGATTTTAAAAAAAATT 3530

 96549200 TTTTCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATAGTTACAGAACGTTTCTTGCAG 96549259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TTTTCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATAGTTACAGAACGTTTCTTGCAG 3590

 96549260 CCTTGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGTATCTAATAATAATGAATTTTT 96549319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 CCTTGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGTATCTAATAATAATGAATTTTT 3650

 96549320 TTAAATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTAAAAAGAAGTGTGCAAGCCACA 96549379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TTAAATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTAAAAAGAAGTGTGCAAGCCACA 3710

 96549380 GTACAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACATATGTGTGGATATGGGTATCT 96549439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GTACAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACATATGTGTGGATATGGGTATCT 3770

 96549440 AGATGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACCAACAAATATTTCTTGAGTGAA 96549499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 AGATGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACCAACAAATATTTCTTGAGTGAA 3830

 96549500 TGAGTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTATCAGTATTATGGATGATTGTG 96549559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TGAGTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTATCAGTATTATGGATGATTGTG 3890

 96549560 TATGTTTTGCTGATTTACATTTTGTTTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTCTTTCTT 96549619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 TATGTTTTGCTGATTTACATTTTGTTTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTCTTTCTT 3950

 96549620 TCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTTCTTTCT---TTTTCTCTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTT 96549676
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTTCTTTCTTTCTTTTCTCTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTT 4010

 96549677 CTCTCTTTTCTCTCCTTTTTGATCCCATTCTTCCTTGTTTTCAACCTACACTGGCTTTCT 96549736
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4011 CTCTCTTTTCTCTCCTTTTTGATCCCATTCTTCCTTGCTTTCAACCTACACTGGCTTTCT 4070

 96549737 CAGCCATGTATGAACTTCTCTCTCCCTTCACCTACATGGTAAAATGTAAAAAGTCTTATA 96549796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 CAGCCATGTATGAACTTCTCTCTCCCTTCACCTACATGGTAAAATGTAAAAAGTCTTATA 4130

 96549797 TTCTACTCAAAAGGAAGATATTGCTGACTTGAGTACAACTTTTTTGAAGCAATATAGATG 96549856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TTCTACTCAAAAGGAAGATATTGCTGACTTGAGTACAACTTTTTTGAAGCAATATAGATG 4190

 96549857 CCTTGCATTCACCCT 96549871
          |||||||||||||||
     4191 CCTTGCATTCACCCT 4205

Alignment time is 6.24215 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3106] =>      3106 nucs 'mol-32-208c-050886_3106'

Score:        2935
Aligned:      3023        nucs
Identic:      3015 (100%) nucs =>       798 (100%)      2217 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542484,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548822]
 second seq =>  [       1,     799] EXCISED REGION [     883,    3106]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [800,882]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [798,799] to [883,884]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 60

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 120

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 180

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 240

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 300

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 360

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 420

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 480

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 540

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 600

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 660

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 720

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 780

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||
      781 ATGCTCCTTACTTTCAACT 799

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 942

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1002

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1062

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 1122

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 1182

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 1242

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 1302

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 1362

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 1422

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 1482

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 1542

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 1602

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 1662

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 1722

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 1782

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 1842

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 1902

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 1962

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 2022

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 2082

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 2142

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 2202

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 2262

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 2322

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 2382

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2383 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 2442

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2443 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 2502

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 2562

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 2622

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 2682

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 2742

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 96548518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 2802

 96548519 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 96548578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 2862

 96548579 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 96548638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 2922

 96548639 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 96548698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 2982

 96548699 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 96548758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 3042

 96548759 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 96548818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 3102

 96548819 GAAT 96548822
          ||||
     3103 GAAT 3106

Alignment time is 4.76496 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7395] =>      7395 nucs 'mol-32-2105-065685_7395'

Score:        7179
Aligned:      7388        nucs
Identic:      7369 (100%) nucs =>      5904 (100%)      1465 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539129,96545044] EXCISED REGION [96545045,96546514]
 second seq =>  [       1,    5918] EXCISED REGION [    5927,    7395]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [5919,5926]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [5919,5957] to [5927,5965]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [5917,5918] to [5927,5928]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [5919,5922] to [5923,5926]

 96539129 AGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATA 96539188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATA 60

 96539189 GATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAAT 96539248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAAT 120

 96539249 GTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGT 96539308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGT 180

 96539309 ACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAG 96539368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAG 240

 96539369 AAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCC 96539428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCC 300

 96539429 TTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGA 96539488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGA 360

 96539489 TTACTAAGCAAAAAAAAAAA-TGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCC 96539547
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTACTAAGCAAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCC 420

 96539548 TTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATT 96539607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATT 480

 96539608 GAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCT 96539667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCT 540

 96539668 TTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAA 96539727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAA 600

 96539728 GTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTG 96539787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTG 660

 96539788 TATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGA 96539847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGA 720

 96539848 GGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACA 96539907
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACA 780

 96539908 CTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAG 96539967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAG 840

 96539968 CAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCT 96540027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCT 900

 96540028 GCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATAT 96540087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATAT 960

 96540088 GGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGG 96540147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGG 1020

 96540148 TTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTC 96540207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTC 1080

 96540208 TTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCA 96540267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCA 1140

 96540268 AATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAAT 96540327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAAT 1200

 96540328 GGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCT 96540387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCT 1260

 96540388 CATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAAT 96540447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAAT 1320

 96540448 ATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAAT 96540507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAAT 1380

 96540508 CAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTA 96540567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTA 1440

 96540568 AGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGAT 96540627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGAT 1500

 96540628 AGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAAT 96540687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAAT 1560

 96540688 ACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTG 96540747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTG 1620

 96540748 CAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAAT 96540807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAAT 1680

 96540808 GAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGC 96540867
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGC 1740

 96540868 TGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATG 96540927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATG 1800

 96540928 GCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAG 96540987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAG 1860

 96540988 TTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATAC 96541047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATAC 1920

 96541048 AGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTT 96541107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTT 1980

 96541108 GAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTG 96541167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTG 2040

 96541168 TCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACAT 96541227
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACAT 2100

 96541228 CCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATT 96541287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATT 2160

 96541288 TACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGG 96541347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGG 2220

 96541348 AAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCT 96541407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCT 2280

 96541408 AATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTG 96541467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTG 2340

 96541468 TAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCT 96541527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCT 2400

 96541528 AAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTG 96541587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTG 2460

 96541588 TATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACC 96541647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACC 2520

 96541648 ATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTT 96541707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTT 2580

 96541708 AATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCT 96541767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCT 2640

 96541768 GCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGC 96541827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGC 2700

 96541828 ATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAG 96541887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAG 2760

 96541888 AATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTT 96541947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTT 2820

 96541948 TTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAG 96542007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAG 2880

 96542008 AGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCA 96542067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCA 2940

 96542068 TAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGAT 96542127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGAT 3000

 96542128 ATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCAT 96542187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCAT 3060

 96542188 TACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATA 96542247
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3061 TACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATA 3120

 96542248 ATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCT 96542307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCT 3180

 96542308 ATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATC 96542367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATC 3240

 96542368 TTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTAT 96542427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTAT 3300

 96542428 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 96542487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 3360

 96542488 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 96542547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 3420

 96542548 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 96542607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 3480

 96542608 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 96542667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 3540

 96542668 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 96542727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 3600

 96542728 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 96542787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 3660

 96542788 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 96542847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 3720

 96542848 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 96542907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 3780

 96542908 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 96542967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 3840

 96542968 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 96543027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 3900

 96543028 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 96543087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 3960

 96543088 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 96543147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 4020

 96543148 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 96543207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 4080

 96543208 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 96543267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 4140

 96543268 TCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCAC 96543327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCAC 4200

 96543328 TGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACA 96543387
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACA 4260

 96543388 GTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTG 96543447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4261 GTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTG 4320

 96543448 AGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCC 96543507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCC 4380

 96543508 ACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAA 96543567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAA 4440

 96543568 TAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTAT 96543627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTAT 4500

 96543628 TAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTG 96543687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTG 4560

 96543688 CTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGT 96543747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGT 4620

 96543748 TACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACA 96543807
          |||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACA 4680

 96543808 TTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAA 96543867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAA 4740

 96543868 CGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACT 96543927
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACT 4800

 96543928 AGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAA 96543987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAA 4860

 96543988 GCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAG 96544047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAG 4920

 96544048 GGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAG 96544107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAG 4980

 96544108 AAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA- 96544166
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4981 AAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAA 5040

 96544167 CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTG 96544226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTG 5100

 96544227 CTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACAT 96544286
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACAT 5160

 96544287 ATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGT 96544346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5161 ATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGT 5220

 96544347 GATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATAT 96544406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATAT 5280

 96544407 TGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACT 96544466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACT 5340

 96544467 GAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACC 96544526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACC 5400

 96544527 ACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTAC 96544586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTAC 5460

 96544587 ATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATT 96544646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATT 5520

 96544647 TGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAAC 96544706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAAC 5580

 96544707 TTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCT 96544766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCT 5640

 96544767 CATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAG 96544826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAG 5700

 96544827 TTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGC 96544886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGC 5760

 96544887 AGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCA 96544946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCA 5820

 96544947 CTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTG 96545006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTG 5880

 96545007 GGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 5918

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 5986

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5987 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 6046

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 6106

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 6166

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 6226

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 6286

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 6346

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 6406

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 6466

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 6526

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6527 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 6586

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 6646

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 6706

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 6766

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 6826

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 6886

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 6946

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 7006

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7007 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 7066

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     7067 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 7126

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 7186

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 7246

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 7306

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     7307 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC-TTTTTTTTTTTTTTTT 7365

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGC 96546514
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     7366 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGC 7395

Alignment time is 10.2215 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5181] =>      5181 nucs 'mol-32-2218-042772_5181'

Score:        5010
Aligned:      5098        nucs
Identic:      5090 (100%) nucs =>      2155 (100%)      2935 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541127,96543282] EXCISED REGION [96546599,96549540]
 second seq =>  [       1,    2156] EXCISED REGION [    2240,    5181]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [2157,2239]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [2155,2156] to [2240,2241]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541127 CTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATG 96541186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATG 60

 96541187 CAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCT 96541246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCT 120

 96541247 GACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATC 96541306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATC 180

 96541307 AGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAA 96541366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAA 240

 96541367 AAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCT 96541426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCT 300

 96541427 TTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACAC 96541486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACAC 360

 96541487 TATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGG 96541546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGG 420

 96541547 ATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTT 96541606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTT 480

 96541607 ATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTAT 96541666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTAT 540

 96541667 AAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGT 96541726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGT 600

 96541727 CAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCC 96541786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCC 660

 96541787 ACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTA 96541846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTA 720

 96541847 ATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTG 96541906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTG 780

 96541907 AAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGA 96541966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGA 840

 96541967 AACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCT 96542026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCT 900

 96542027 TTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGAT 96542086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGAT 960

 96542087 GTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATG 96542146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATG 1020

 96542147 TTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTG 96542206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTG 1080

 96542207 CAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAAC 96542266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAAC 1140

 96542267 ATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAAT 96542326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAAT 1200

 96542327 CTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTG 96542386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTG 1260

 96542387 TTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATT 96542446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATT 1320

 96542447 ACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTG 96542506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTG 1380

 96542507 GTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATG 96542566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATG 1440

 96542567 GCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAG 96542626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAG 1500

 96542627 TCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAG 96542686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAG 1560

 96542687 CCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCT 96542746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCT 1620

 96542747 GGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCT 96542806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCT 1680

 96542807 GAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATC 96542866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATC 1740

 96542867 TGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCT 96542926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCT 1800

 96542927 TTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGT 96542986
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1801 TTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGT 1860

 96542987 TGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCT 96543046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCT 1920

 96543047 TTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGA 96543106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGA 1980

 96543107 TATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTA 96543166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTA 2040

 96543167 TAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCC 96543226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCC 2100

 96543227 ATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 2156

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 2299

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 2359

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 2419

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 2479

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2539

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2599

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2659

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2719

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 2779

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2839

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2899

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2959

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 3019

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 3079

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 3139

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 3199

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 3259

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 3319

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 3379

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 3439

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 3499

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 3559

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 3619

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 3679

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 3739

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3740 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 3799

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3800 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 3859

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 3919

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 3979

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 4039

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 4099

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 96548518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 4159

 96548519 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 96548578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 4219

 96548579 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 96548638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 4279

 96548639 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 96548698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 4339

 96548699 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 96548758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 4399

 96548759 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 96548818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 4459

 96548819 GAATATCTTTATAGTGTGGTTAATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAA 96548878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 GAATATCTTTATAGTGTGGTTAATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAA 4519

 96548879 GAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTTAAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAG 96548938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 GAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTTAAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAG 4579

 96548939 AAGAAACAAATGTACAACAAACACAAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAA 96548998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 AAGAAACAAATGTACAACAAACACAAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAA 4639

 96548999 AAAAACCTAAAATAATGTGTCATTTTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATG 96549058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 AAAAACCTAAAATAATGTGTCATTTTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATG 4699

 96549059 GTAATACTTTATAAATAAAAATGTATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATA 96549118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 GTAATACTTTATAAATAAAAATGTATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATA 4759

 96549119 CCATGTTTCTGGGCAAAAATTACCCAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTT 96549178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 CCATGTTTCTGGGCAAAAATTACCCAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTT 4819

 96549179 GCCAGGATTTTAAAAAAAATTTTTTCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATA 96549238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 GCCAGGATTTTAAAAAAAATTTTTTCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATA 4879

 96549239 GTTACAGAACGTTTCTTGCAGCCTTGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGT 96549298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GTTACAGAACGTTTCTTGCAGCCTTGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGT 4939

 96549299 ATCTAATAATAATGAATTTTTTTAAATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTA 96549358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 ATCTAATAATAATGAATTTTTTTAAATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTA 4999

 96549359 AAAAGAAGTGTGCAAGCCACAGTACAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACA 96549418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 AAAAGAAGTGTGCAAGCCACAGTACAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACA 5059

 96549419 TATGTGTGGATATGGGTATCTAGATGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACC 96549478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 TATGTGTGGATATGGGTATCTAGATGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACC 5119

 96549479 AACAAATATTTCTTGAGTGAATGAGTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTA 96549538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 AACAAATATTTCTTGAGTGAATGAGTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTA 5179

 96549539 TC 96549540
          ||
     5180 TC 5181

Alignment time is 7.57781 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2156] =>      2156 nucs 'mol-32-2218-042772_2156'

Score:        2155
Aligned:      2155        nucs
Identic:      2155 (100%) nucs =>      1855 (100%)       300 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541127,96542981] EXCISED REGION [96542983,96543282]
 second seq =>  [       1,    1855] EXCISED REGION [    1857,    2156]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [96542982,96542982]
 second seq =>         1 nucs [1856,1856]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [96542980,96542982] to [96542981,96542983]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96542981,96542981] to [96542983,96542983]
 second seq =>         1 nucs [1855,1855] to [1857,1857]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541127 CTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATG 96541186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATG 60

 96541187 CAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCT 96541246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCT 120

 96541247 GACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATC 96541306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATC 180

 96541307 AGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAA 96541366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAA 240

 96541367 AAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCT 96541426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCT 300

 96541427 TTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACAC 96541486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACAC 360

 96541487 TATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGG 96541546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGG 420

 96541547 ATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTT 96541606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTT 480

 96541607 ATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTAT 96541666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTAT 540

 96541667 AAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGT 96541726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGT 600

 96541727 CAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCC 96541786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCC 660

 96541787 ACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTA 96541846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTA 720

 96541847 ATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTG 96541906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTG 780

 96541907 AAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGA 96541966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGA 840

 96541967 AACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCT 96542026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCT 900

 96542027 TTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGAT 96542086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGAT 960

 96542087 GTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATG 96542146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATG 1020

 96542147 TTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTG 96542206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTG 1080

 96542207 CAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAAC 96542266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAAC 1140

 96542267 ATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAAT 96542326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAAT 1200

 96542327 CTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTG 96542386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTG 1260

 96542387 TTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATT 96542446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATT 1320

 96542447 ACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTG 96542506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTG 1380

 96542507 GTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATG 96542566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATG 1440

 96542567 GCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAG 96542626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAG 1500

 96542627 TCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAG 96542686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAG 1560

 96542687 CCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCT 96542746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCT 1620

 96542747 GGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCT 96542806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCT 1680

 96542807 GAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATC 96542866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATC 1740

 96542867 TGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCT 96542926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCT 1800

 96542927 TTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTT 96542981
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTT 1855

EXCISED REGION

 96542983 TAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGC 96543042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGC 1916

 96543043 CTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCA 96543102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 CTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCA 1976

 96543103 TTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTT 96543162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTT 2036

 96543163 ATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTAC 96543222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 ATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTAC 2096

 96543223 CGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 2156

Alignment time is 3.11623 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3402] =>      3402 nucs 'mol-32-229c-055629_3402'

Score:        3210
Aligned:      3320        nucs
Identic:      3310 (100%) nucs =>      1262 (100%)      2048 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542020,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548655]
 second seq =>  [       1,    1263] EXCISED REGION [    1347,    3402]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1264,1346]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1262,1263] to [1347,1348]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96542020 TGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGC 96542079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGC 60

 96542080 TGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAG 96542139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAG 120

 96542140 TCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACT 96542199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACT 180

 96542200 ATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCAT 96542259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCAT 240

 96542260 CATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGC 96542319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGC 300

 96542320 CCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGT 96542379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGT 360

 96542380 TGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACT 96542439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACT 420

 96542440 TTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTG 96542499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTG 480

 96542500 CTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAA 96542559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAA 540

 96542560 TGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCC 96542619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCC 600

 96542620 ATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCT 96542679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCT 660

 96542680 GTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTAT 96542739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTAT 720

 96542740 TCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGA 96542799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGA 780

 96542800 GTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGC 96542859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGC 840

 96542860 CTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCT 96542919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCT 900

 96542920 GTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTC 96542979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTC 960

 96542980 TTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACC 96543039
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACC 1020

 96543040 TGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTC 96543099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTC 1080

 96543100 CCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCAT 96543159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCAT 1140

 96543160 CTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTC 96543219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTC 1200

 96543220 TACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCA 96543279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCA 1260

 96543280 ACT 96543282
          |||
     1261 ACT 1263

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1406

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1466

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1526

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 1586

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 1646

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 1706

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 1766

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 1826

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 1886

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 1946

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2006

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2066

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 2126

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 2186

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 2246

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 2306

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 2366

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 2426

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 2486

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATACAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 2546

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 2606

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 2666

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 2726

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 2786

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2787 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTG 2845

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2846 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 2905

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2906 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 2965

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 3025

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 3085

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 3145

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 3205

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 96548518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 3265

 96548519 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 96548578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 3325

 96548579 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 96548638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 3385

 96548639 TATCCAGATCTTCAGTT 96548655
          |||||||||||||||||
     3386 TATCCAGATCTTCAGTT 3402

Alignment time is 4.47827 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2335] =>      2335 nucs 'mol-32-2383-001619_2335'

Score:        2219
Aligned:      2252        nucs
Identic:      2249 (100%) nucs =>      1328 (100%)       921 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541954,96543282] EXCISED REGION [96546599,96547521]
 second seq =>  [       1,    1329] EXCISED REGION [    1413,    2335]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1330,1412]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1328,1329] to [1413,1414]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541954 ATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGG 96542013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGG 60

 96542014 AAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACAT 96542073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACAT 120

 96542074 GAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGAC 96542133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGAC 180

 96542134 TTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGT 96542193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGT 240

 96542194 CATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTC 96542253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTC 300

 96542254 ATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTC 96542313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTC 360

 96542314 TCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAA 96542373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAA 420

 96542374 ATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGG 96542433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGG 480

 96542434 TTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTT 96542493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTT 540

 96542494 ATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATT 96542553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATT 600

 96542554 TTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGG 96542613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGG 660

 96542614 CCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACT 96542673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACT 720

 96542674 ACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTC 96542733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTC 780

 96542734 AAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCT 96542793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCT 840

 96542794 GCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTA 96542853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTA 900

 96542854 CAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGG 96542913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGG 960

 96542914 GCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCT 96542973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCT 1020

 96542974 CCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCC 96543033
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCC 1080

 96543034 CACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGA 96543093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGA 1140

 96543094 AAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTC 96543153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTC 1200

 96543154 TCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACA 96543213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACA 1260

 96543214 GTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTA 96543273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTA 1320

 96543274 CTTTCAACT 96543282
          |||||||||
     1321 CTTTCAACT 1329

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1472

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1532

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1592

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 1652

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 1712

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 1772

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 1832

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 1892

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 1952

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2012

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2072

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2132

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 2192

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 2252

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 2312

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAA 96547521
          |||||||||||||||||||||||
     2313 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAA 2335

Alignment time is 3.39191 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3273] =>      3273 nucs 'mol-32-2383-034634_3273'

Score:        3166
Aligned:      3269        nucs
Identic:      3258 (100%) nucs =>       118 (100%)      3140 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96544927,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548195]
 second seq =>  [       1,     118] EXCISED REGION [     127,    3273]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [119,126]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [119,157] to [127,165]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [117,118] to [127,128]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [119,122] to [123,126]

 96544927 AGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCA 96544986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCA 60

 96544987 TGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 118

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 186

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      187 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 246

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 306

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 366

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 426

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 486

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 546

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 606

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 666

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 726

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      727 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 786

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 846

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 906

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 966

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 1026

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 1086

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 1146

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 1206

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1207 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 1266

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1267 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 1326

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 1386

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 1446

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 1506

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     1507 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC-TTTTTTTTTTTTTTTT 1565

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 1625

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     1626 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 1682

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 1742

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 1802

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 1862

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 1922

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 1982

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 2042

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 2102

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 2162

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 2222

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 2282

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 2342

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 2402

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 2462

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 2522

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 2582

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 2642

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 2702

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 2762

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 2822

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 2882

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 2942

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 3002

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 3062

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3063 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 3122

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 96548104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 3182

 96548105 AGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 96548164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 AGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 3242

 96548165 CGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCT 96548195
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 CGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCT 3273

Alignment time is 4.58969 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3318] =>      3318 nucs 'mol-32-2853-010418_3318'

Score:        3191
Aligned:      3235        nucs
Identic:      3231 (100%) nucs =>      1796 (100%)      1435 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541486,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548036]
 second seq =>  [       1,    1797] EXCISED REGION [    1881,    3318]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1798,1880]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1796,1797] to [1881,1882]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541486 CTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGG 96541545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGG 60

 96541546 GATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATT 96541605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATT 120

 96541606 TATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTA 96541665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTA 180

 96541666 TAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAG 96541725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAG 240

 96541726 TCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATC 96541785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATC 300

 96541786 CACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTT 96541845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTT 360

 96541846 AATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCT 96541905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCT 420

 96541906 GAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATG 96541965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATG 480

 96541966 AAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGC 96542025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGC 540

 96542026 TTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGA 96542085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGA 600

 96542086 TGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAAT 96542145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAAT 660

 96542146 GTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGT 96542205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGT 720

 96542206 GCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAA 96542265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAA 780

 96542266 CATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAA 96542325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAA 840

 96542326 TCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTT 96542385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTT 900

 96542386 GTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATAT 96542445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATAT 960

 96542446 TACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGT 96542505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGT 1020

 96542506 GGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGAT 96542565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGAT 1080

 96542566 GGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTA 96542625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTA 1140

 96542626 GTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGA 96542685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGA 1200

 96542686 GCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCC 96542745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCC 1260

 96542746 TGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTC 96542805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTC 1320

 96542806 TGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCAT 96542865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCAT 1380

 96542866 CTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTC 96542925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTC 1440

 96542926 TTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAG 96542985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1441 TTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAG 1500

 96542986 TTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTC 96543045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTC 1560

 96543046 TTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTG 96543105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTG 1620

 96543106 ATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATT 96543165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATT 1680

 96543166 ATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGC 96543225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGC 1740

 96543226 CATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 1797

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1940

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 2000

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 2060

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 2120

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2180

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2240

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2300

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2360

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 2420

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2480

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2540

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2600

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 2660

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 2720

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 2780

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 2840

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 2900

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 2960

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 3020

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 3080

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 3140

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 3200

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 3260

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGG 96548036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGG 3318

Alignment time is 4.79171 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2127] =>      2127 nucs 'mol-32-2874-013168_2127'

Score:        2068
Aligned:      2123        nucs
Identic:      2118 (100%) nucs =>      1768 (100%)       350 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96546587,96548359] EXCISED REGION [96548360,96548709]
 second seq =>  [       1,    1773] EXCISED REGION [    1778,    2127]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1774,1777]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [1774,1778] to [1778,1782]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96546587 CCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTT 96546646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTT 60

 96546647 TAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGAT 96546706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGAT 120

 96546707 CCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCC 96546766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCC 180

 96546767 CAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTA 96546826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTA 240

 96546827 CCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGA 96546886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGA 300

 96546887 ATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGG 96546946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGG 360

 96546947 ATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCA 96547006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCA 420

 96547007 AGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATA 96547066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATA 480

 96547067 AGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAAC 96547126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAAC 540

 96547127 AAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAG 96547186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAG 600

 96547187 ACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTAC 96547246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTAC 660

 96547247 TTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGA 96547306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGA 720

 96547307 GTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAG 96547366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAG 780

 96547367 AAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGC 96547426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      781 AAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGC 840

 96547427 ATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCA 96547486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCA 900

 96547487 GAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTG 96547546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTG 960

 96547547 TTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATG 96547606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATG 1020

 96547607 TCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTT 96547666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTT 1080

 96547667 TCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAAT 96547726
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAAT 1140

 96547727 GTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAAT 96547786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAAT 1200

 96547787 AACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGT 96547846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGT 1260

 96547847 TCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTC 96547906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTC 1320

 96547907 GTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAA 96547966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAA 1380

 96547967 AATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCT 96548026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCT 1440

 96548027 ACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTT 96548086
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACAGAAAGGGCCCATTTTTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTT 1500

 96548087 TTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATC 96548146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATC 1560

 96548147 TCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAA 96548206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1561 TCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 1620

 96548207 ATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAG 96548266
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTGCTGGGACTACAGGCGTCCACCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAG 1680

 96548267 AGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCC 96548326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCC 1740

 96548327 GCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGC 96548359
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGC 1773

EXCISED REGION

 96548360 GTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAA 96548419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAA 1837

 96548420 TGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACA 96548479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACA 1897

 96548480 AACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATT 96548539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATT 1957

 96548540 TTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGT 96548599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGT 2017

 96548600 TAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGAT 96548659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGAT 2077

 96548660 AAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGC 96548709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 AAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGC 2127

Alignment time is 3.33959 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6390] =>      6390 nucs 'mol-32-2874-013503_6390'

Score:        6181
Aligned:      6379        nucs
Identic:      6361 (100%) nucs =>      4834 (100%)      1527 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96540199,96545044] EXCISED REGION [96545045,96546576]
 second seq =>  [       1,    4847] EXCISED REGION [    4856,    6386]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [4848,4855]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [4848,4886] to [4856,4894]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [4846,4847] to [4856,4857]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [4848,4851] to [4852,4855]

 96540199 TCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTG 96540258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTG 60

 96540259 AGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAA 96540318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAA 120

 96540319 GATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTA 96540378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTA 180

 96540379 AATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGA 96540438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGA 240

 96540439 ATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAG 96540498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAG 300

 96540499 TTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCT 96540558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCT 360

 96540559 TTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGA 96540618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGA 420

 96540619 ATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTG 96540678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTG 480

 96540679 GCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCT 96540738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCT 540

 96540739 GTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAAT 96540798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAAT 600

 96540799 TACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTT 96540858
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      601 TACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTT 660

 96540859 TAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATT 96540918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATT 720

 96540919 CCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAA 96540978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAA 780

 96540979 TTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCC 96541038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCC 840

 96541039 ACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACA 96541098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACA 900

 96541099 GTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAA 96541158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAA 960

 96541159 TTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAA 96541218
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAA 1020

 96541219 TGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAA 96541278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAA 1080

 96541279 AGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAAT 96541338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAAT 1140

 96541339 GCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTA 96541398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTA 1200

 96541399 TTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATT 96541458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATT 1260

 96541459 GCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACC 96541518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACC 1320

 96541519 TGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTC 96541578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTC 1380

 96541579 TTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATA 96541638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATA 1440

 96541639 AATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCT 96541698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCT 1500

 96541699 CAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAA 96541758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAA 1560

 96541759 TGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGC 96541818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGC 1620

 96541819 TCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTG 96541878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTG 1680

 96541879 AAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTT 96541938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTT 1740

 96541939 CTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTT 96541998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTT 1800

 96541999 TACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCA 96542058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCA 1860

 96542059 TCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATG 96542118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATG 1920

 96542119 GGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAG 96542178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAG 1980

 96542179 TTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAA 96542238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1981 TTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAA 2040

 96542239 CAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTC 96542298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTC 2100

 96542299 TTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTT 96542358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTT 2160

 96542359 TGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAAC 96542418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAAC 2220

 96542419 ACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCA 96542478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCA 2280

 96542479 ACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGG 96542538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGG 2340

 96542539 CTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATA 96542598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATA 2400

 96542599 CCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGC 96542658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGC 2460

 96542659 TCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGG 96542718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGG 2520

 96542719 TAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATAC 96542778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATAC 2580

 96542779 AATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTC 96542838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTC 2640

 96542839 CTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAA 96542898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAA 2700

 96542899 CTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGC 96542958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGC 2760

 96542959 TCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAA 96543018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAA 2820

 96543019 TCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCT 96543078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCT 2880

 96543079 GCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAAT 96543138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAAT 2940

 96543139 AAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCT 96543198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCT 3000

 96543199 CAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCAT 96543258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCAT 3060

 96543259 TTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCA 96543318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCA 3120

 96543319 GACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGC 96543378
          ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GACCTGCACTGCCCCACCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGC 3180

 96543379 TGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTC 96543438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3181 TGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTC 3240

 96543439 AAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTA 96543498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTA 3300

 96543499 GCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGA 96543558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGA 3360

 96543559 ATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGT 96543618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGT 3420

 96543619 ATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAA 96543678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAA 3480

 96543679 AACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGAT 96543738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGAT 3540

 96543739 AATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATT 96543798
          ||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATT 3600

 96543799 TTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGT 96543858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGT 3660

 96543859 ATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGT 96543918
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGT 3720

 96543919 CCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAG 96543978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAG 3780

 96543979 TTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTC 96544038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTC 3840

 96544039 CCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAA 96544098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAA 3900

 96544099 ACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACA 96544158
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3901 ACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACA 3960

 96544159 AAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATA 96544217
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATA 4020

 96544218 TACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGC 96544277
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGC 4080

 96544278 CATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAA 96544337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAA 4140

 96544338 TTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACA 96544397
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACA 4200

 96544398 ATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATT 96544457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATT 4260

 96544458 TGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCAC 96544517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCAC 4320

 96544518 CTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACAT 96544577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACAT 4380

 96544578 ACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGA 96544637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGA 4440

 96544638 AAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTAC 96544697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTAC 4500

 96544698 AAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGC 96544757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGC 4560

 96544758 ACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGA 96544817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGA 4620

 96544818 GGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATAC 96544877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATAC 4680

 96544878 AAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 96544937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 4740

 96544938 GTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCAC 96544997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCAC 4800

 96544998 TCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 4847

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 4915

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4916 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 4975

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 5035

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 5095

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 5155

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 5215

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 5275

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 5335

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 5395

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 5455

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5456 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 5515

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 5575

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 5635

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 5695

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 5755

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 5815

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 5875

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 5935

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5936 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 5995

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5996 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 6055

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 6115

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 6175

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 6235

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     6236 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC-TTTTTTTTTTTTTTTT 6294

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 6354

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCT 96546576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCT 6386

Alignment time is 9.06715 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7673] =>      7673 nucs 'mol-32-2895-130029_7673'

Score:        7436
Aligned:      7601        nucs
Identic:      7577 (100%) nucs =>      5946 (100%)      1631 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96537322,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548236]
 second seq =>  [       1,    5953] EXCISED REGION [    6037,    7672]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [5954,6036]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [5952,5953] to [6037,6038]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96537322 AGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTAT 96537381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTAT 60

 96537382 TTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGA 96537441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGA 120

 96537442 GCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGC 96537501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGC 180

 96537502 AGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCC 96537561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCC 240

 96537562 AGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGA 96537621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGA 300

 96537622 TAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTG 96537681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTG 360

 96537682 GCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAA 96537741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAA 420

 96537742 GAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAG 96537801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAG 480

 96537802 ACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTG 96537861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTG 540

 96537862 ATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTC 96537921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTC 600

 96537922 TTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCT 96537981
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACCGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCT 660

 96537982 CCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATG 96538041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATG 720

 96538042 AACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAG 96538101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAG 780

 96538102 ACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGG 96538161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGG 840

 96538162 ATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAA-- 96538219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
      841 ATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 900

 96538220 GACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCT 96538279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCT 960

 96538280 TTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTAC 96538339
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTAC 1020

 96538340 TTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACA 96538399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACA 1080

 96538400 TGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGT 96538459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGT 1140

 96538460 GTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTCTGTGT 96538519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTCTGTGT 1200

 96538520 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTC 96538579
          |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||
     1201 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG----------ACGCCAAATTTCACAAAACTCTC 1250

 96538580 CAGTTTATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGG 96538639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 CAGTTTATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGG 1310

 96538640 ATCTTTCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTAC 96538699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 ATCTTTCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTAC 1370

 96538700 TTTGAAGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCT 96538759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 TTTGAAGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCT 1430

 96538760 CCTATCTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTT 96538819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 CCTATCTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTT 1490

 96538820 TTAGGCCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCA 96538879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 TTAGGCCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCA 1550

 96538880 GAGAGACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATT 96538939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 GAGAGACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATT 1610

 96538940 TTTGTGTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTT 96538999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 TTTGTGTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTT 1670

 96539000 GGTTGCTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCAT 96539059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GGTTGCTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCAT 1730

 96539060 TGAGAAAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACA 96539119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TGAGAAAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACA 1790

 96539120 CCATCCAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGA 96539179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 CCATCCAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGA 1850

 96539180 TAGATGATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAG 96539239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TAGATGATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAG 1910

 96539240 GGAGGAAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAA 96539299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GGAGGAAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAA 1970

 96539300 ATCCTACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCA 96539359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 ATCCTACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCA 2030

 96539360 AGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGA 96539419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 AGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGA 2090

 96539420 CTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTA 96539479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 CTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTA 2150

 96539480 TTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAA 96539539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAA 2210

 96539540 TTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAA 96539599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 TTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAA 2270

 96539600 CTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTA 96539659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 CTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTA 2330

 96539660 ACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATG 96539719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 ACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATG 2390

 96539720 CATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGG 96539779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 CATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGG 2450

 96539780 GAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGA 96539839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 GAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGA 2510

 96539840 CCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGC 96539899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 CCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGC 2570

 96539900 AGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTAC 96539959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 AGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTAC 2630

 96539960 ACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTT 96540019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 ACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTT 2690

 96540020 CAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCC 96540079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCC 2750

 96540080 ATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCA 96540139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 ATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCA 2810

 96540140 GACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTT 96540199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 GACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTT 2870

 96540200 CAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGA 96540259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGA 2930

 96540260 GAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAG 96540319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 GAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAG 2990

 96540320 ATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAA 96540379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 ATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAA 3050

 96540380 ATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAA 96540439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAA 3110

 96540440 TATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGT 96540499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 TATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGT 3170

 96540500 TCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTT 96540559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTT 3230

 96540560 TCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAA 96540619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 TCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAA 3290

 96540620 TGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGG 96540679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3291 TGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGG 3350

 96540680 CCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTG 96540739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTG 3410

 96540740 TTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATT 96540799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATT 3470

 96540800 ACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTT 96540859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 ACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTT 3530

 96540860 AATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTC 96540919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 AATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTC 3590

 96540920 CTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAAT 96540979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 CTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAAT 3650

 96540980 TGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCA 96541039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCA 3710

 96541040 CCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAG 96541099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 CCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAG 3770

 96541100 TAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAAT 96541159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAAT 3830

 96541160 TGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAAT 96541219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAAT 3890

 96541220 GTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAA 96541279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 GTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAA 3950

 96541280 GTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATG 96541339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 GTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATG 4010

 96541340 CTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTAT 96541399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 CTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTAT 4070

 96541400 TTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTG 96541459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTG 4130

 96541460 CTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCT 96541519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 CTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCT 4190

 96541520 GTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCT 96541579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 GTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCT 4250

 96541580 TTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAA 96541639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 TTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAA 4310

 96541640 ATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTC 96541699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 ATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTC 4370

 96541700 AATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAAT 96541759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 AATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAAT 4430

 96541760 GTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCT 96541819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 GTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCT 4490

 96541820 CAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGA 96541879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 CAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGA 4550

 96541880 AGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTC 96541939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 AGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTC 4610

 96541940 TCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTT 96541999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTT 4670

 96542000 ACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCAT 96542059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 ACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCAT 4730

 96542060 CCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGG 96542119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 CCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGG 4790

 96542120 GTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGT 96542179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 GTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGT 4850

 96542180 TGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAAC 96542239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 TGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAAC 4910

 96542240 AGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCT 96542299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 AGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCT 4970

 96542300 TTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTT 96542359
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4971 TTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTACATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTT 5030

 96542360 GCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACA 96542419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 GCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACA 5090

 96542420 CTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAA 96542479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 CTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAA 5150

 96542480 CTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGC 96542539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 CTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGC 5210

 96542540 TTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATAC 96542599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 TTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATAC 5270

 96542600 CCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCT 96542659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 CCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCT 5330

 96542660 CTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGT 96542719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 CTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGT 5390

 96542720 AGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACA 96542779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 AGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACA 5450

 96542780 ATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCC 96542839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 ATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCC 5510

 96542840 TTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAAC 96542899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 TTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAAC 5570

 96542900 TATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCT 96542959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 TATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCT 5630

 96542960 CCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAAT 96543019
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 CCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAAT 5690

 96543020 CACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTG 96543079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 CACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTG 5750

 96543080 CTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATA 96543139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 CTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATA 5810

 96543140 AGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTC 96543199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 AGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTC 5870

 96543200 AAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATT 96543259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 AAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATT 5930

 96543260 TAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||
     5931 TAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 5953

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6037 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 6096

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6097 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 6156

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6157 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 6216

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6217 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 6276

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6277 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 6336

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6337 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 6396

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6397 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 6456

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6457 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 6516

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6517 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 6576

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6577 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 6636

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6637 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 6696

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6697 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 6756

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6757 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 6816

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6817 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 6876

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6877 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 6936

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6937 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 6996

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6997 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 7056

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7057 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 7116

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7117 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 7176

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7177 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 7236

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7237 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 7296

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7297 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 7356

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7357 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 7416

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7417 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 7476

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
     7477 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC--TTTTTTTTTTTTTTTG 7534

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7535 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 7594

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7595 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 7654

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCAC 96548236
          ||||||||||||||||||
     7655 ACAGGCGTCCGCCACCAC 7672

Alignment time is 10.4427 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4069] =>      4069 nucs 'mol-32-29a8-057926_4069'

Score:        3920
Aligned:      3986        nucs
Identic:      3980 (100%) nucs =>      2401 (100%)      1579 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96540881,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548182]
 second seq =>  [       1,    2402] EXCISED REGION [    2486,    4069]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [2403,2485]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [2401,2402] to [2486,2487]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96540881 CTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCA 96540940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCA 60

 96540941 TCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTT 96541000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTT 120

 96541001 GTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGA 96541060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGA 180

 96541061 TTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTG 96541120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTG 240

 96541121 AAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAAT 96541180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAAT 300

 96541181 AGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAG 96541240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAG 360

 96541241 ATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATA 96541300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATA 420

 96541301 AAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCAT 96541360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCAT 480

 96541361 TTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTT 96541420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTT 540

 96541421 TAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAG 96541480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAG 600

 96541481 TCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAA 96541540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAA 660

 96541541 AGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCC 96541600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCC 720

 96541601 CAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATA 96541660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATA 780

 96541661 ACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTG 96541720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTG 840

 96541721 CAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAG 96541780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAG 900

 96541781 TAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAA 96541840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAA 960

 96541841 TTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTA 96541900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTA 1020

 96541901 TTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGA 96541960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGA 1080

 96541961 AAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACAT 96542020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACAT 1140

 96542021 GGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCT 96542080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCT 1200

 96542081 GCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGT 96542140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGT 1260

 96542141 CAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTA 96542200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTA 1320

 96542201 TTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATC 96542260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATC 1380

 96542261 ATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCC 96542320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCC 1440

 96542321 CTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTT 96542380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTT 1500

 96542381 GATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTT 96542440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTT 1560

 96542441 TATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGC 96542500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGC 1620

 96542501 TTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAAT 96542560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAAT 1680

 96542561 GAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCA 96542620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCA 1740

 96542621 TGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTG 96542680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTG 1800

 96542681 TTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATT 96542740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATT 1860

 96542741 CTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAG 96542800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAG 1920

 96542801 TTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCC 96542860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCC 1980

 96542861 TTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTG 96542920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTG 2040

 96542921 TCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCT 96542980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCT 2100

 96542981 TTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCT 96543040
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCT 2160

 96543041 GCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCC 96543100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCC 2220

 96543101 CATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATC 96543160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATC 2280

 96543161 TTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCT 96543220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCT 2340

 96543221 ACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAA 96543280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAA 2400

 96543281 CT 96543282
          ||
     2401 CT 2402

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 2545

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 2605

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 2665

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 2725

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2785

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2845

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2905

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2965

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 3025

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 3085

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 3145

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 3205

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 3265

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 3325

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 3385

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 3445

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 3505

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 3565

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 3625

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 3685

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 3745

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 3805

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 AAAAGATTGAGATGTAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 3865

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 3925

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 3985

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3986 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 4045

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 96548182
          ||||||||||||||||||||||||
     4046 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 4069

Alignment time is 6.05702 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4725] =>      4725 nucs 'mol-32-2afd-094904_4725'

Score:        4526
Aligned:      4716        nucs
Identic:      4693 (100%) nucs =>      4660 (100%)        33 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541787,96546459] EXCISED REGION [96546468,96546500]
 second seq =>  [       1,    4683] EXCISED REGION [    4693,    4725]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [96546460,96546467]
 second seq =>         9 nucs [4684,4692]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [4683,4686] to [4692,4695]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96546459,96546459] to [96546468,96546468]
 second seq =>         1 nucs [4683,4683] to [4693,4693]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [4684,4686] to [4690,4692]

 96541787 ACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTA 96541846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTA 60

 96541847 ATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTG 96541906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTG 120

 96541907 AAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCA-TTTTTTTTCTGATGAGGAAAATG 96541965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
      121 AAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCACTTTTTTTTCTGATGAGGAAAATG 180

 96541966 AAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGC 96542025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGC 240

 96542026 TTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGA 96542085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGA 300

 96542086 TGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAAT 96542145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAAT 360

 96542146 GTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGT 96542205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGT 420

 96542206 GCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAA 96542265
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAA 480

 96542266 CATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAA 96542325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAA 540

 96542326 TCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTT 96542385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTT 600

 96542386 GTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATAT 96542445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATAT 660

 96542446 TACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGT 96542505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGT 720

 96542506 GGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGAT 96542565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGAT 780

 96542566 GGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTA 96542625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTA 840

 96542626 GTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGA 96542685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGA 900

 96542686 GCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCC 96542745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCC 960

 96542746 TGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTC 96542805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTC 1020

 96542806 TGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCAT 96542865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCAT 1080

 96542866 CTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTC 96542925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTC 1140

 96542926 TTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAG 96542985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAG 1200

 96542986 TTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTC 96543045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTC 1260

 96543046 TTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTG 96543105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTG 1320

 96543106 ATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATT 96543165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATT 1380

 96543166 ATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGC 96543225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGC 1440

 96543226 CATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTT 96543285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTT 1500

 96543286 TCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAAC 96543345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1501 TCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAAC 1560

 96543346 ATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAAC 96543405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAAC 1620

 96543406 ATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACT 96543465
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACT 1680

 96543466 AAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCT 96543525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCT 1740

 96543526 CTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTA 96543585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTA 1800

 96543586 AAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATAT 96543645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATAT 1860

 96543646 GCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAG 96543705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAG 1920

 96543706 ACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATA 96543765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|
     1921 ACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGA 1980

 96543766 AACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAAT 96543825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAAT 2040

 96543826 AAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCA 96543885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCA 2100

 96543886 AGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTC 96543945
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTC 2160

 96543946 CCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGG 96544005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGG 2220

 96544006 CCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGAC 96544065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGAC 2280

 96544066 CTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCT 96544125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCT 2340

 96544126 TCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAA 96544184
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     2341 TCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAA 2400

 96544185 GCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGT 96544244
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2401 GCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGC 2460

 96544245 ATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAG 96544304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAG 2520

 96544305 TTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAA 96544364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAA 2580

 96544365 GATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTA 96544424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTA 2640

 96544425 TGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTG 96544484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTG 2700

 96544485 ACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTC 96544544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTC 2760

 96544545 TCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGAT 96544604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGAT 2820

 96544605 ACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCC 96544664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCC 2880

 96544665 TTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAA 96544724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAA 2940

 96544725 AGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGC 96544784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGC 3000

 96544785 ACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACA 96544844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACA 3060

 96544845 AACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATA 96544904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATA 3120

 96544905 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAG 96544964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAG 3180

 96544965 AGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGT 96545024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGT 3240

 96545025 CCATCTCAATGCATACATATATACATACATACATACATACATACATACATACATACATA- 96545083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3241 CCATCTCAATGCATACATATATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAC 3300

 96545084 -------AAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTT 96545136
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTT 3360

 96545137 AAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTA 96545196
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTA 3420

 96545197 AGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTA 96545256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTA 3480

 96545257 AAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACC 96545316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACC 3540

 96545317 AAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATA 96545376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATA 3600

 96545377 TAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAAT 96545436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAAT 3660

 96545437 CGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGA 96545496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGA 3720

 96545497 AAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAA 96545556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAA 3780

 96545557 CTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTT 96545616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTT 3840

 96545617 ATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCC 96545676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCC 3900

 96545677 TGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCC 96545736
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCC 3960

 96545737 TGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGT 96545796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGT 4020

 96545797 ATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTT 96545856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTT 4080

 96545857 AAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACA 96545916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACA 4140

 96545917 CAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGC 96545976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGC 4200

 96545977 AACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAAT 96546036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAAT 4260

 96546037 TGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAA 96546096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAA 4320

 96546097 CTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGC 96546156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGC 4380

 96546157 TTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTCTATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAT 96546216
          ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4381 TTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTCTATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAA 4440

 96546217 GAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATT 96546276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATT 4500

 96546277 TTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTAC 96546336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTAC 4560

 96546337 CCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTAT 96546396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTAT 4620

 96546397 AAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATG 96546456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATG 4680

 96546457 GCT 96546459
          |||
     4681 GCT 4683

EXCISED REGION

 96546468 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGC 96546500
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGC 4725

Alignment time is 6.70463 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9332] =>      9332 nucs 'mol-32-2afd-124145_9332'

Score:        9077
Aligned:      9258        nucs
Identic:      9235 (100%) nucs =>      5930 (100%)      3305 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96537340,96543282] EXCISED REGION [96546599,96549911]
 second seq =>  [       1,    5936] EXCISED REGION [    6020,    9332]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [5937,6019]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [5935,5936] to [6020,6021]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96537340 AACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAA 96537399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAA 60

 96537400 ATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACT 96537459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACT 120

 96537460 GGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAA 96537519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAA 180

 96537520 GGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACAC 96537579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACAC 240

 96537580 TTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGC 96537639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGC 300

 96537640 CTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAA 96537699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAA 360

 96537700 TAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGAC 96537759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGAC 420

 96537760 TATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTC 96537819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTC 480

 96537820 TAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGT 96537879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGT 540

 96537880 ATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAAC 96537939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAAC 600

 96537940 ATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCA 96537999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCA 660

 96538000 CTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAAT 96538059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAAT 720

 96538060 CATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATC 96538119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATC 780

 96538120 TAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGAT 96538179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGAT 840

 96538180 AGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAA--GACAGGAGACAGTGGGTT 96538237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
      841 AGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGGAGACAGTGGGTT 900

 96538238 TCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGA 96538297
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCACTGCTCCTGAC-TCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGA 959

 96538298 AACCCAAGGGTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGG 96538357
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AACCCAAGGTTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGG 1019

 96538358 AGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGA 96538417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGA 1079

 96538418 AAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGAT 96538477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGAT 1139

 96538478 ATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 96538537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1199

 96538538 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTATAGTTCAATTC 96538597
          |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GTGTGTGTGTG--------ACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTATAGTTCAATTC 1251

 96538598 CCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTCTGCATCTCTAT 96538657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTCTGCATCTCTAT 1311

 96538658 CAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAGTGATGTGAAAC 96538717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAGTGATGTGAAAC 1371

 96538718 CCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCTTTGACCCCATA 96538777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 CCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCTTTGACCCCATA 1431

 96538778 TGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCCATCACTGCTGA 96538837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCCATCACTGCTGA 1491

 96538838 AATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGACTAACAGGAAAT 96538897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 AATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGACTAACAGGAAAT 1551

 96538898 TGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGTTTGGTTTTTAC 96538957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGTTTGGTTTTTAC 1611

 96538958 TCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCTTCGCTTTGGCT 96539017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCTTCGCTTTGGCT 1671

 96539018 CATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAAACAATTATTTT 96539077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAAACAATTATTTT 1731

 96539078 TAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCAAGAGGCTTTTG 96539137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 TAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCAAGAGGCTTTTG 1791

 96539138 CATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATAGATAGATAG 96539197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATAGATAGATAG 1851

 96539198 AAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAATGTCTCCATT 96539257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 AAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAATGTCTCCATT 1911

 96539258 TTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGTACCCATTTT 96539317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGTACCCATTTT 1971

 96539318 CTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAA 96539377
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 CCAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAA 2031

 96539378 ATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAAT 96539437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAAT 2091

 96539438 CAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGC 96539497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGC 2151

 96539498 AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTT 96539557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTT 2211

 96539558 ATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATAT 96539617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 ATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATAT 2271

 96539618 CGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATA 96539677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 CGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATA 2331

 96539678 TCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTT 96539737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTT 2391

 96539738 CCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCC 96539797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 CCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCC 2451

 96539798 CTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATG 96539857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 CTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATG 2511

 96539858 TGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTAT 96539917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTAT 2571

 96539918 TTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCT 96539977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCT 2631

 96539978 GGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACC 96540037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 GGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACC 2691

 96540038 AGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTC 96540097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 AGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTC 2751

 96540098 CACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTG 96540157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 CACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTG 2811

 96540158 CCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGC 96540217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 CCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGC 2871

 96540218 CTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCC 96540277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 CTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCC 2931

 96540278 TTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAA 96540337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 TTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAA 2991

 96540338 TGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTG 96540397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 TGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTG 3051

 96540398 GACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTT 96540457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 GACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTT 3111

 96540458 GTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCC 96540517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 GTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCC 3171

 96540518 CGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGG 96540577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 CGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGG 3231

 96540578 AGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTG 96540637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 AGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTG 3291

 96540638 GGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCC 96540697
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 GGAGTCTCTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCC 3351

 96540698 TGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTT 96540757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 TGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTT 3411

 96540758 GTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTT 96540817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 GTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTT 3471

 96540818 AATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAA 96540877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 AATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAA 3531

 96540878 CTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCT 96540937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 CTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCT 3591

 96540938 GCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGA 96540997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 GCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGA 3651

 96540998 TTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATT 96541057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATT 3711

 96541058 TGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGAT 96541117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 TGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGAT 3771

 96541118 TTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAA 96541177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 TTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAA 3831

 96541178 AATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGA 96541237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 AATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGA 3891

 96541238 GAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTG 96541297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 GAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTG 3951

 96541298 ATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGT 96541357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 ATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGT 4011

 96541358 CATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACAT 96541417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 CATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACAT 4071

 96541418 GTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTAT 96541477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 GTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTAT 4131

 96541478 TAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTC 96541537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 TAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTC 4191

 96541538 CAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTT 96541597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 CAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTT 4251

 96541598 TCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTAT 96541657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 TCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTAT 4311

 96541658 ATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAG 96541717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 ATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAG 4371

 96541718 GTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTG 96541777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 GTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTG 4431

 96541778 CAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTT 96541837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 CAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTT 4491

 96541838 GAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACC 96541897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 GAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACC 4551

 96541898 TTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGA 96541957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 TTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGA 4611

 96541958 GGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAA 96542017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 GGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAA 4671

 96542018 CATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGT 96542077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 CATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGT 4731

 96542078 GCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCC 96542137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 GCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCC 4791

 96542138 AGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATA 96542197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 AGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATA 4851

 96542198 CTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTC 96542257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 CTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTC 4911

 96542258 ATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTG 96542317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 ATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTG 4971

 96542318 GCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGT 96542377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 GCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGT 5031

 96542378 GTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAA 96542437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 GTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAA 5091

 96542438 CTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTT 96542497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 CTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTT 5151

 96542498 TGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTAT 96542557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 TGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTAT 5211

 96542558 AATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGC 96542617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 AATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGC 5271

 96542618 CCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCC 96542677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 CCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCC 5331

 96542678 CTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGT 96542737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 CTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGT 5391

 96542738 ATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTC 96542797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 ATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTC 5451

 96542798 GAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAA 96542857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 GAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAA 5511

 96542858 GCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTC 96542917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 GCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTC 5571

 96542918 CTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTC 96542977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 CTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTC 5631

 96542978 TCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACA 96543037
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 TCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACA 5691

 96543038 CCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAG 96543097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 CCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAG 5751

 96543098 TCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTC 96543157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 TCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTC 5811

 96543158 ATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCT 96543217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 ATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCT 5871

 96543218 TCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTT 96543277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 TCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTT 5931

 96543278 CAACT 96543282
          |||||
     5932 CAACT 5936

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 6079

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 6139

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 6199

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 6259

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 6319

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 6379

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 6439

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 6499

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 6559

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6560 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTCGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 6619

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 6679

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 6739

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 6799

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 6859

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6860 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 6919

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6920 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 6979

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6980 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 7039

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7040 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 7099

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7100 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 7159

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7160 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 7219

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7220 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 7279

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7280 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 7339

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7340 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 7399

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7400 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 7459

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7460 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 7519

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7520 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 7579

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7580 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 7639

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7640 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 7699

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7700 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 7759

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7760 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 7819

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7820 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 7879

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 96548518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7880 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 7939

 96548519 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 96548578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7940 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 7999

 96548579 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 96548638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8000 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 8059

 96548639 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 96548698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8060 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 8119

 96548699 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 96548758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8120 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 8179

 96548759 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 96548818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8180 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 8239

 96548819 GAATATCTTTATAGTGTGGTTAATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAA 96548878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8240 GAATATCTTTATAGTGTGGTTAATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAA 8299

 96548879 GAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTTAAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAG 96548938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8300 GAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTTAAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAG 8359

 96548939 AAGAAACAAATGTACAACAAACACAAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAA 96548998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8360 AAGAAACAAATGTACAACAAACACAAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAA 8419

 96548999 AAAAACCTAAAATAATGTGTCATTTTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATG 96549058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8420 AAAAACCTAAAATAATGTGTCATTTTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATG 8479

 96549059 GTAATACTTTATAAATAAAAATGTATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATA 96549118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8480 GTAATACTTTATAAATAAAAATGTATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATA 8539

 96549119 CCATGTTTCTGGGCAAAAATTACCCAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTT 96549178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8540 CCATGTTTCTGGGCAAAAATTACCCAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTT 8599

 96549179 GCCAGGATTTTAAAAAAAATTTTTTCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATA 96549238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8600 GCCAGGATTTTAAAAAAAATTTTTTCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATA 8659

 96549239 GTTACAGAACGTTTCTTGCAGCCTTGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGT 96549298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8660 GTTACAGAACGTTTCTTGCAGCCTTGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGT 8719

 96549299 ATCTAATAATAATGAATTTTTTTAAATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTA 96549358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8720 ATCTAATAATAATGAATTTTTTTAAATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTA 8779

 96549359 AAAAGAAGTGTGCAAGCCACAGTACAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACA 96549418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8780 AAAAGAAGTGTGCAAGCCACAGTACAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACA 8839

 96549419 TATGTGTGGATATGGGTATCTAGATGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACC 96549478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8840 TATGTGTGGATATGGGTATCTAGATGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACC 8899

 96549479 AACAAATATTTCTTGAGTGAATGAGTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTA 96549538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8900 AACAAATATTTCTTGAGTGAATGAGTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTA 8959

 96549539 TCAGTATTATGGATGATTGTGTATGTTTTGCTGATTTACATTTTGTTTCCTTCTTTCCTT 96549598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8960 TCAGTATTATGGATGATTGTGTATGTTTTGCTGATTTACATTTTGTTTCCTTCTTTCCTT 9019

 96549599 CCTTCCTTCCTTCTCTTTCTTTCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTTCTTTCTTTTTCTCTTCT 96549658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9020 CCTTCCTTCCTTCTCTTTCTTTCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTTCTTTCTTTTTCTCTTCT 9079

 96549659 TTCTCTTTCTTTCTTTTTCTCTCTTTTCTCTCCTTTTTGATCCCATTCTTCCTTGTTTTC 96549718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9080 TTCTCTTTCTTTCTTTTTCTCTCTTTTCTCTCCTTTTTGATCCCATTCTTCCTTGTTTTC 9139

 96549719 AACCTACACTGGCTTTCTCAGCCATGTATGAACTTCTCTCTCCCTTCACCTACATGGTAA 96549778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9140 AACCTACACTGGCTTTCTCAGCCATGTATGAACTTCTCTCTCCCTTCACCTACATGGTAA 9199

 96549779 AATGTAAAAAGTCTTATATTCTACTCAAAAGGAAGATATTGCTGACTTGAGTACAACTTT 96549838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9200 AATGTAAAAAGTCTTATATTCTACTCAAAAGGAAGATATTGCTGACTTGAGTACAACTTT 9259

 96549839 TTTGAAGCAATATAGATGCCTTGCATTCACCCTTAGGTTGTATGATAACAGGAAAACCAA 96549898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9260 TTTGAAGCAATATAGATGCCTTGCATTCACCCTTAGGTTGTATGATAACAGGAAAACCAA 9319

 96549899 ATGAAGCCAAAAA 96549911
          |||||||||||||
     9320 ATGAAGCCAAAAA 9332

Alignment time is 12.6725 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3313] =>      3313 nucs 'mol-32-2afd-124145_3313'

Score:        3235
Aligned:      3312        nucs
Identic:      3305 (100%) nucs =>        23 (100%)      3282 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96546599,96546621] EXCISED REGION [96546623,96549911]
 second seq =>  [       1,      23] EXCISED REGION [      25,    3313]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [96546622,96546622]
 second seq =>         1 nucs [24,24]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96546618,96546621] to [96546623,96546626]
 second seq =>         4 nucs [20,23] to [25,28]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACC 96546621
          |||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACC 23

EXCISED REGION

 96546623 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATG 96546682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       25 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATG 84

 96546683 GTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 96546742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       85 GTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 144

 96546743 AGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCT 96546802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      145 AGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCT 204

 96546803 CAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGA 96546862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 CAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGA 264

 96546863 GGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTC 96546922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 GGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTC 324

 96546923 TTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCT 96546982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 TTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCT 384

 96546983 CTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTG 96547042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTG 444

 96547043 GATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGT 96547102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGT 504

 96547103 CTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATG 96547162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      505 CTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTGAAGAATATG 564

 96547163 AAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGAT 96547222
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 AAGAGGGTCGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGAT 624

 96547223 TTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTT 96547282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTT 684

 96547283 AGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTC 96547342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 AGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTC 744

 96547343 TAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTA 96547402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTA 804

 96547403 CTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACT 96547462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACT 864

 96547463 AAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAAT 96547522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 AAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAAT 924

 96547523 CATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTT 96547582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 CATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTT 984

 96547583 ATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAA 96547642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 ATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAA 1044

 96547643 CAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGACACAGTGG 96547702
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1045 CAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGACACAGTGG 1104

 96547703 GCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAA 96547762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAA 1164

 96547763 AACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAAT 96547822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAAT 1224

 96547823 AATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGA 96547882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGA 1284

 96547883 ATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCA 96547942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 ATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCA 1344

 96547943 TTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTG 96548002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTG 1404

 96548003 CCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTA 96548062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTA 1464

 96548063 CTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 96548122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 1524

 96548123 AGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 96548182
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 AGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 1584

 96548183 CATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAG 96548242
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1585 CATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAG 1644

 96548243 CTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACAACGGTCTCG 96548302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1645 CTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACTACGGTCTCG 1704

 96548303 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTG 96548362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTG 1764

 96548363 AGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAATGG 96548422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAATGG 1824

 96548423 TTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACAAAC 96548482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACAAAC 1884

 96548483 TCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATTTTT 96548542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATTTTT 1944

 96548543 ACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAG 96548602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAG 2004

 96548603 AAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGATAAA 96548662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGATAAA 2064

 96548663 TCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAA 96548722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAA 2124

 96548723 CCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTG 96548782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTG 2184

 96548783 AAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAATATCTTTATAGTGTGGTTAAT 96548842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAATATCTTTATAGTGTGGTTAAT 2244

 96548843 ATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAAGAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTT 96548902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 ATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAAGAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTT 2304

 96548903 AAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAGAAGAAACAAATGTACAACAAACAC 96548962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 AAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAGAAGAAACAAATGTACAACAAACAC 2364

 96548963 AAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAAAAAAACCTAAAATAATGTGTCATT 96549022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 AAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAAAAAAACCTAAAATAATGTGTCATT 2424

 96549023 TTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATGGTAATACTTTATAAATAAAAATGT 96549082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATGGTAATACTTTATAAATAAAAATGT 2484

 96549083 ATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATACCATGTTTCTGGGCAAAAATTACC 96549142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 ATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATACCATGTTTCTGGGCAAAAATTACC 2544

 96549143 CAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTTGCCAGGATTTTAAAAAAAATTTTT 96549202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 CAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTTGCCAGGATTTTAAAAAAAATTTTT 2604

 96549203 TCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATAGTTACAGAACGTTTCTTGCAGCCT 96549262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATAGTTACAGAACGTTTCTTGCAGCCT 2664

 96549263 TGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGTATCTAATAATAATGAATTTTTTTA 96549322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGTATCTAATAATAATGAATTTTTTTA 2724

 96549323 AATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTAAAAAGAAGTGTGCAAGCCACAGTA 96549382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 AATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTAAAAAGAAGTGTGCAAGCCACAGTA 2784

 96549383 CAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACATATGTGTGGATATGGGTATCTAGA 96549442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 CAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACATATGTGTGGATATGGGTATCTAGA 2844

 96549443 TGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACCAACAAATATTTCTTGAGTGAATGA 96549502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 TGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACCAACAAATATTTCTTGAGTGAATGA 2904

 96549503 GTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTATCAGTATTATGGATGATTGTGTAT 96549562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 GTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTATCAGTATTATGGATGATTGTGTAT 2964

 96549563 GTTTTGCTGATTTACATTTTGTTTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTCTTTCTTTCT 96549622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 GTTTTGCTGATTTACATTTTGTTTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTCTTTCTTTCT 3024

 96549623 TCCTTCCTTTCTTCCTTTTCTTTCTTTTTCTCTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTCTCTCT 96549682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 TCCTTCCTTTCTTCCTTTTCTTTCTTTTTCTCTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTCTCTCT 3084

 96549683 TTTCTCTCCTTTTTGATCCCATTCTTCCTTGTTTTCAACCTACACTGGCTTTCTCAGCCA 96549742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TTTCTCTCCTTTTTGATCCCATTCTTCCTTGTTTTCAACCTACACTGGCTTTCTCAGCCA 3144

 96549743 TGTATGAACTTCTCTCTCCCTTCACCTACATGGTAAAATGTAAAAAGTCTTATATTCTAC 96549802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TGTATGAACTTCTCTCTCCCTTCACCTACATGGTAAAATGTAAAAAGTCTTATATTCTAC 3204

 96549803 TCAAAAGGAAGATATTGCTGACTTGAGTACAACTTTTTTGAAGCAATATAGATGCCTTGC 96549862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 TCAAAAGGAAGATATTGCTGACTTGAGTACAACTTTTTTGAAGCAATATAGATGCCTTGC 3264

 96549863 ATTCACCCTTAGGTTGTATGATAACAGGAAAACCAAATGAAGCCAAAAA 96549911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 ATTCACCCTTAGGTTGTATGATAACAGGAAAACCAAATGAAGCCAAAAA 3313

Alignment time is 4.75002 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8979] =>      8979 nucs 'mol-32-2dff-072022_8979'

Score:        8732
Aligned:      8908        nucs
Identic:      8883 (100%) nucs =>      8588 (100%)       295 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96534673,96543282] EXCISED REGION [96546599,96546894]
 second seq =>  [       1,    8600] EXCISED REGION [    8684,    8979]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [8601,8683]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [8599,8600] to [8684,8685]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96534673 CTTCCTGACCAAGGCCTGCTCCCTAGATAGCACTGGCTATTTTCCCCAATCACTTCAGCT 96534732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCCTGACCAAGGCCTGCTCCCTAGATAGCACTGGCTATTTTCCCCAATCACTTCAGCT 60

 96534733 GAACACTAATGTTTTGGTGATACTGATGTCCATAGAGAACAGCAGTGGGATTTCACTAAG 96534792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAACACTAATGTTTTGGTGATACTGATGTCCATAGAGAACAGCAGTGGGATTTCACTAAG 120

 96534793 ATGGGAAGTTACTGTGTTCACCTGCCATAAACATGAAACAATACAGCAGGTATTCATTCA 96534852
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGGGAAGTTACTGTGTTCCCCTGCCATAAACATGAAACAATACAGCAGGTATTCATTCA 180

 96534853 CCCATCTCTTATTCAGATCAGAGACATTCTCACAGACCATATCCAGACTAAAGAGCATTC 96534912
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      181 CCCATCTCTTATTCAGATCAGAGACATTCTCACAGACCATATCCAGACTAAAGAGGATTC 240

 96534913 TGAATATTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTT-AATTTTAGAGACAGGGTCTCACTCTGCTG 96534971
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAATATTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTAGAGACAGGGTCTCACTCTGCTG 300

 96534972 CCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCTCAGCCTCAACATTCTGGGCTCA 96535031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCTCAGCCTCAACATTCTGGGCTCA 360

 96535032 AGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACAGGCATCCACCCCAGGCCC 96535091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACAGGCATCCACCCCAGGCCC 420

 96535092 AGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGTCCAGGCTGTCTTGAACTC 96535151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGTCCAGGCTGTCTTGAACTC 480

 96535152 TTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATGAAGGCATGAAAC 96535211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATGAAGGCATGAAAC 540

 96535212 ATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTAAAATCCAACTCAAATGGC 96535271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTAAAATCCAACTCAAATGGC 600

 96535272 ATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACACACTCCAGGCAGAATCCTAGAAAGCTCTGAGCA 96535331
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACATACTCCAGGCAGAATCCTAGAAAGCTCTGAGCA 660

 96535332 CTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCTGTTTCTTCACAAAGTCAC 96535391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCTGTTTCTTCACAAAGTCAC 720

 96535392 TATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAAGGTATGAGACACAATCAC 96535451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAAGGTATGAGACACAATCAC 780

 96535452 TATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAATTGTTAGCCACAGGG 96535511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAATTGTTAGCCACAGGG 840

 96535512 TGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCATTCGTGGTTCAGTTC 96535571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCATTCGTGGTTCAGTTC 900

 96535572 TCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATTCGGTTAATACTTTC 96535631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATTCGGTTAATACTTTC 960

 96535632 TCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTTTCTACAGGAGCTTA 96535691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTTTCTACAGGAGCTTA 1020

 96535692 GAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTATCCTGCAACCTGATA 96535751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTATCCTGCAACCTGATA 1080

 96535752 AATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGACCCCAAAACTAAAG 96535811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGACCCCAAAACTAAAG 1140

 96535812 CTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAAAAAATCAATGTCTA 96535871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAAAAAATCAATGTCTA 1200

 96535872 TCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGTTATATGTTTCCATA 96535931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGTTATATGTTTCCATA 1260

 96535932 ATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAATTGTGATTTGGGTT 96535991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAATTGTGATTTGGGTT 1320

 96535992 TTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGATGCTGTGAATTTTC 96536051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGATGCTGTGAATTTTC 1380

 96536052 TCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGTTGTGTTATACAAAA 96536111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGTTGTGTTATACAAAA 1440

 96536112 ATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATTCATATGCACTCATAGAAATCTGTAC 96536171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATTCATATGCACTCATAGAAATCTGTAC 1500

 96536172 CCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTAGATGGAGAA 96536231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTAGATGGAGAA 1560

 96536232 GTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACAGGTAATTAA 96536291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACAGGTAATTAA 1620

 96536292 CCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGGTATTAACCA 96536351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGGTATTAACCA 1680

 96536352 CCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAGAATTTCACA 96536411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAGAATTTCACA 1740

 96536412 TGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGTTTGGATTGC 96536471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGTTTGGATTGC 1800

 96536472 TGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTAATTAGAAAT 96536531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTAATTAGAAAT 1860

 96536532 TACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGGCTAGAGCTA 96536591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGGCTAGAGCTA 1920

 96536592 GTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTATTGATATCCA 96536651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTATTGATATCCA 1980

 96536652 TGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCACTGAAATCAG 96536711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCACTGAAATCAG 2040

 96536712 ATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGCCTTTAAAATGATCTAAGTGTGCAA 96536771
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGTCTTTAAAATGATCTAAGTGTGCAA 2100

 96536772 ATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGAGGAAGCTCT 96536831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGAGGAAGCTCT 2160

 96536832 AGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGTATCTTGTAA 96536891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGTATCTTGTAA 2220

 96536892 TAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACACATGGTGTGA 96536951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACACATGGTGTGA 2280

 96536952 AAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATATTAGCTCCT 96537011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATATTAGCTCCT 2340

 96537012 TCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCACCAAAATTT 96537071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCACCAAAATTT 2400

 96537072 ATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGT 96537131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGT 2460

 96537132 GATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAA 96537191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAA 2520

 96537192 CTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCA 96537251
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTAGTTAGACCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCA 2580

 96537252 CTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTT 96537311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTT 2640

 96537312 TGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAG 96537371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAG 2700

 96537372 GCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGT 96537431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGT 2760

 96537432 AGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACT 96537491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACT 2820

 96537492 GGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTC 96537551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTC 2880

 96537552 TTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAG 96537611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAG 2940

 96537612 TCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGA 96537671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGA 3000

 96537672 ATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTG 96537731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTG 3060

 96537732 TGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCT 96537791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCT 3120

 96537792 GGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTT 96537851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTT 3180

 96537852 AATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTT 96537911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTT 3240

 96537912 AATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTG 96537971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTG 3300

 96537972 TGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTA 96538031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTA 3360

 96538032 TTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAAT 96538091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAAT 3420

 96538092 AGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAAC 96538151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAAC 3480

 96538152 AGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAA 96538211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAA 3540

 96538212 AAAAAAAA-GACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCAT 96538270
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAAAAAAAGACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCAT 3600

 96538271 TTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAACTCATCCTGGAAG 96538330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3601 TTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATGTCAAACTCATCCTGGAAG 3660

 96538331 CCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAG 96538390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAG 3720

 96538391 GGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTA 96538450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTA 3780

 96538451 TCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCC 96538510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCC 3840

 96538511 ACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCAC 96538570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||
     3841 ACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG------------ACGCCAAATTTCAC 3888

 96538571 AAAACTCTCCAGTTTATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATG 96538630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 AAAACTCTCCAGTTTATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATG 3948

 96538631 ACAGGAGGGATCTTTCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGG 96538690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 ACAGGAGGGATCTTTCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGG 4008

 96538691 TATCCTTACTTTGAAGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCT 96538750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 TATCCTTACTTTGAAGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCT 4068

 96538751 AAGAACCCTCCTATCTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCAC 96538810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 AAGAACCCTCCTATCTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCAC 4128

 96538811 CAGAACCTTTTAGGCCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTA 96538870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 CAGAACCTTTTAGGCCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTA 4188

 96538871 GAAAAGTCAGAGAGACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAG 96538930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 GAAAAGTCAGAGAGACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAG 4248

 96538931 AGAGAGATTTTTGTGTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTAC 96538990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 AGAGAGATTTTTGTGTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTAC 4308

 96538991 AGTATTCTTGGTTGCTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATT 96539050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 AGTATTCTTGGTTGCTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATT 4368

 96539051 ACAGAGCATTGAGAAAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTA 96539110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 ACAGAGCATTGAGAAAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTA 4428

 96539111 TAAGACACACCATCCAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATA 96539170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TAAGACACACCATCCAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATA 4488

 96539171 TTTTTGAGATAGATGATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGAT 96539230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 TTTTTGAGATAGATGATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGAT 4548

 96539231 ATAAAGCAGGGAGGAAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATT 96539290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 ATAAAGCAGGGAGGAAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATT 4608

 96539291 TCAAAGTAAATCCTACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGAT 96539350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 TCAAAGTAAATCCTACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGAT 4668

 96539351 CAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTC 96539410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 CAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTC 4728

 96539411 CTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACA 96539470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 CTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACA 4788

 96539471 TTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGC 96539530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 TTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGC 4848

 96539531 TAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAAC 96539590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 TAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAAC 4908

 96539591 TTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAG 96539650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 TTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAG 4968

 96539651 GAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTG 96539710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 GAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTG 5028

 96539711 GACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACAT 96539770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 GACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACAT 5088

 96539771 TTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAA 96539830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 TTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAA 5148

 96539831 AAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGG 96539890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 AAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGG 5208

 96539891 ATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTA 96539950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 ATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTA 5268

 96539951 AGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTC 96540010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 AGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTC 5328

 96540011 TTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACT 96540070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 TTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACT 5388

 96540071 ACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACG 96540130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 ACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACG 5448

 96540131 TGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCT 96540190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 TGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCT 5508

 96540191 TCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAA 96540250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 TCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAA 5568

 96540251 GGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGA 96540310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 GGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGA 5628

 96540311 GAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAA 96540370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 GAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAA 5688

 96540371 AGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGT 96540430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 AGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGT 5748

 96540431 GTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCAC 96540490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 GTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCAC 5808

 96540491 CTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCT 96540550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 CTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCT 5868

 96540551 CACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCAT 96540610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5869 CACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCAT 5928

 96540611 AGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTG 96540670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5929 AGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTG 5988

 96540671 TCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTG 96540730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 TCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTG 6048

 96540731 TCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATA 96540790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6049 TCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATA 6108

 96540791 GAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTA 96540850
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 GGAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTA 6168

 96540851 ATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTA 96540910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 ATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTA 6228

 96540911 AAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTA 96540970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6229 AAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTA 6288

 96540971 TTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCT 96541030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6289 TTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCT 6348

 96541031 TCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAG 96541090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6349 TCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAG 6408

 96541091 TTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGA 96541150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6409 TTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGA 6468

 96541151 CTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAA 96541210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6469 CTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAA 6528

 96541211 ATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATG 96541270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6529 ATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATG 6588

 96541271 TTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTG 96541330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6589 TTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTG 6648

 96541331 TCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTAT 96541390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6649 TCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTAT 6708

 96541391 TTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATA 96541450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6709 TTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATA 6768

 96541451 AAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAG 96541510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6769 AAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAG 6828

 96541511 CAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCT 96541570
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6829 CAAAAACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCT 6888

 96541571 TGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATG 96541630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6889 TGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATG 6948

 96541631 TATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAG 96541690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6949 TATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAG 7008

 96541691 TTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTC 96541750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 TTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTC 7068

 96541751 TACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAA 96541810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 TACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAA 7128

 96541811 TCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGAT 96541870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 TCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGAT 7188

 96541871 GGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTAT 96541930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 GGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTAT 7248

 96541931 CCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGA 96541990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 CCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGA 7308

 96541991 CCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCT 96542050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7309 CCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCT 7368

 96542051 TATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATAC 96542110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 TATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATAC 7428

 96542111 ATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTC 96542170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 ATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTC 7488

 96542171 CATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCT 96542230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7489 CATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCT 7548

 96542231 TGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAA 96542290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7549 TGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAA 7608

 96542291 CTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATA 96542350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7609 CTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATA 7668

 96542351 ACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAA 96542410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7669 ACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAA 7728

 96542411 ATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTT 96542470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 ATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTT 7788

 96542471 TGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGA 96542530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 TGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGA 7848

 96542531 ATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACC 96542590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7849 ATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACC 7908

 96542591 ACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCA 96542650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7909 ACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCA 7968

 96542651 TTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACAT 96542710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7969 TTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACAT 8028

 96542711 AAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTG 96542770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 AAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTG 8088

 96542771 TTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCT 96542830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8089 TTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCT 8148

 96542831 GTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCAT 96542890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8149 GTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCAT 8208

 96542891 AAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGC 96542950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8209 AAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGC 8268

 96542951 CACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAAC 96543010
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     8269 CACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAAC 8328

 96543011 TTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAAC 96543070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8329 TTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAAC 8388

 96543071 AGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCAT 96543130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8389 AGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCAT 8448

 96543131 CCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCT 96543190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8449 CCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCT 8508

 96543191 CTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAA 96543250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8509 CTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAA 8568

 96543251 GTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     8569 GTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 8600

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8684 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 8743

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8744 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 8803

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8804 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 8863

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8864 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 8923

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTA 96546894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8924 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTA 8979

Alignment time is 12.0991 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5048] =>      5048 nucs 'mol-32-2e15-047443_5048'

Score:        4888
Aligned:      4965        nucs
Identic:      4958 (100%) nucs =>      3367 (100%)      1591 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539914,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548193]
 second seq =>  [       1,    3369] EXCISED REGION [    3453,    5048]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3370,3452]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3368,3369] to [3453,3454]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96539914 GTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAG 96539973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAG 60

 96539974 AGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTG 96540033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTG 120

 96540034 CACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGC 96540093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGC 180

 96540094 CTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCA 96540153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCA 240

 96540154 GCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAA 96540213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAA 300

 96540214 GTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTT 96540273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTT 360

 96540274 ATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGC 96540333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGC 420

 96540334 CAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTT 96540393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTT 480

 96540394 TTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTA 96540453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTA 540

 96540454 TTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCC 96540513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCC 600

 96540514 TGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAG 96540573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAG 660

 96540574 AAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACC 96540633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACC 720

 96540634 CTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGA 96540693
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGA 780

 96540694 TCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTG 96540753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTG 840

 96540754 AGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTC 96540813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTC 900

 96540814 ATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATAT 96540873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATAT 960

 96540874 TAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAG 96540933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAG 1020

 96540934 ATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATT 96540993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATT 1080

 96540994 TAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGG 96541053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGG 1140

 96541054 TATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAA 96541113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAA 1200

 96541114 GGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATA 96541173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATA 1260

 96541174 ATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACAT 96541233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACAT 1320

 96541234 CAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCAT 96541293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCAT 1380

 96541294 GTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAAT 96541353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAAT 1440

 96541354 TTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTA 96541413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTA 1500

 96541414 ACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAAC 96541473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAAC 1560

 96541474 TTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAA 96541533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAA 1620

 96541534 TCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCAT 96541593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCAT 1680

 96541594 ACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATAT 96541653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATAT 1740

 96541654 GTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAAT 96541713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAAT 1800

 96541714 GGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAA 96541773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAA 1860

 96541774 CCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTT 96541833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTT 1920

 96541834 TCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAG 96541893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAG 1980

 96541894 AACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTG 96541953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTG 2040

 96541954 ATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGG 96542013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGG 2100

 96542014 AAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACAT 96542073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACAT 2160

 96542074 GAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGAC 96542133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGAC 2220

 96542134 TTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGT 96542193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGT 2280

 96542194 CATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTC 96542253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTC 2340

 96542254 ATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTC 96542313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTC 2400

 96542314 TCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAA 96542373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAA 2460

 96542374 ATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGG 96542433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGG 2520

 96542434 TTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTT 96542493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTT 2580

 96542494 ATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATT 96542553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATT 2640

 96542554 TTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGG 96542613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGG 2700

 96542614 CCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACT 96542673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACT 2760

 96542674 ACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTC 96542733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTC 2820

 96542734 AAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCT 96542793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCT 2880

 96542794 GCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTA 96542853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTA 2940

 96542854 CAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGG 96542913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGG 3000

 96542914 GCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCT 96542973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCT 3060

 96542974 CCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCC 96543033
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCC 3120

 96543034 CACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGA 96543093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGA 3180

 96543094 AAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTC 96543153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTC 3240

 96543154 TCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACA 96543213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACA 3300

 96543214 GTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTA 96543273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTA 3360

 96543274 CTTTCAACT 96543282
          |||||||||
     3361 CTTTCAACT 3369

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3512

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 3572

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 3632

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 3692

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 3752

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 3812

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 3872

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 3932

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 3992

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 4052

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 4112

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 4172

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 4232

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 4292

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 4352

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 4412

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 4472

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 4532

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 4592

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 4652

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 4712

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 4772

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 4832

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 4892

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTT 96548097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     4893 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 4952

 96548098 GAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTG 96548157
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4953 GAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTG 5012

 96548158 CAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGC 96548193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 CAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGC 5048

Alignment time is 7.07477 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4638] =>      4638 nucs 'mol-32-2e15-187525_4638'

Score:        4500
Aligned:      4555        nucs
Identic:      4550 (100%) nucs =>      3377 (100%)      1173 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539904,96543282] EXCISED REGION [96546599,96547774]
 second seq =>  [       1,    3379] EXCISED REGION [    3463,    4638]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3380,3462]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3378,3379] to [3463,3464]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96539904 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 96539963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 60

 96539964 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 96540023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 120

 96540024 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 96540083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 180

 96540084 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 96540143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 240

 96540144 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 96540203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 300

 96540204 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 96540263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 360

 96540264 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 96540323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 420

 96540324 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 96540383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 480

 96540384 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 96540443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 540

 96540444 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 96540503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 600

 96540504 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 96540563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 660

 96540564 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 96540623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 720

 96540624 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 96540683
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 780

 96540684 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 96540743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 840

 96540744 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 96540803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 900

 96540804 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 96540863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 960

 96540864 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 96540923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 1020

 96540924 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 96540983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 1080

 96540984 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 96541043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 1140

 96541044 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 96541103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 1200

 96541104 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 96541163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 1260

 96541164 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 96541223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 1320

 96541224 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 96541283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 1380

 96541284 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 96541343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 1440

 96541344 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 96541403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 1500

 96541404 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 96541463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 1560

 96541464 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 96541523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 1620

 96541524 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 96541583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 1680

 96541584 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 96541643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 1740

 96541644 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 96541703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 1800

 96541704 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 96541763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 1860

 96541764 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 96541823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 1920

 96541824 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 96541883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 1980

 96541884 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 96541943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 2040

 96541944 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 96542003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 2100

 96542004 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 96542063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 2160

 96542064 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 96542123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 2220

 96542124 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 96542183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 2280

 96542184 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 96542243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 2340

 96542244 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 96542303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 2400

 96542304 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 96542363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 2460

 96542364 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 96542423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 2520

 96542424 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 96542483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 2580

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 2640

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 2700

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 2760

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 2820

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 2880

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 2940

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 3000

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 3060

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 3120

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 3180

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 3240

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 3300

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 3360

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||
     3361 ATGCTCCTTACTTTCAACT 3379

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3522

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 3582

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 3642

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 3702

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 3762

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 3822

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 3882

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 3942

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 4002

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 4062

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 4122

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 4182

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 4242

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 4302

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 4362

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 4422

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 4482

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 4542

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 4602

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATAT 96547774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATAT 4638

Alignment time is 6.50538 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5377] =>      5377 nucs 'mol-32-2e20-211686_5377'

Score:        5181
Aligned:      5372        nucs
Identic:      5353 (100%) nucs =>      2330 (100%)      3023 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542707,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548077]
 second seq =>  [       1,    2339] EXCISED REGION [    2348,    5377]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [2340,2347]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [2340,2378] to [2348,2386]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [2338,2339] to [2348,2349]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2340,2343] to [2344,2347]

 96542707 ACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCC 96542766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCC 60

 96542767 ATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACC 96542826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACC 120

 96542827 ATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTC 96542886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTC 180

 96542887 TCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGC 96542946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGC 240

 96542947 ATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACA 96543006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACA 300

 96543007 GAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAG 96543066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAG 360

 96543067 CAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATT 96543126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATT 420

 96543127 TCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACA 96543186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACA 480

 96543187 ATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATC 96543246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATC 540

 96543247 CTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGA 96543306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGA 600

 96543307 CAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAA 96543366
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAA 660

 96543367 CAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGA 96543426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGA 720

 96543427 CGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGT 96543486
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGT 780

 96543487 TTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTT 96543546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTT 840

 96543547 GACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAA 96543606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAA 900

 96543607 GTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCC 96543666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCC 960

 96543667 CTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAAT 96543726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAAT 1020

 96543727 ATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAG 96543786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAG 1080

 96543787 ATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGAT 96543846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGAT 1140

 96543847 TTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGG 96543906
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1141 TTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGG 1200

 96543907 GTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGA 96543966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGA 1260

 96543967 GCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCA 96544026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCA 1320

 96544027 GAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCAC 96544086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCAC 1380

 96544087 AGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTAT 96544146
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1381 AGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTAT 1440

 96544147 CAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTAC 96544205
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTAC 1500

 96544206 ATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAA 96544265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1501 ATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAA 1560

 96544266 CACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATT 96544325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATT 1620

 96544326 TGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAAT 96544385
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAAT 1680

 96544386 TTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAG 96544445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAG 1740

 96544446 CACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTC 96544505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTC 1800

 96544506 TCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTA 96544565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTA 1860

 96544566 GATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCA 96544625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCA 1920

 96544626 ATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAA 96544685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAA 1980

 96544686 CAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAA 96544745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAA 2040

 96544746 GCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGG 96544805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGG 2100

 96544806 TGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTC 96544865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTC 2160

 96544866 TACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAG 96544925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAG 2220

 96544926 GAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATC 96544985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATC 2280

 96544986 ATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 2339

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 2407

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2408 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 2467

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 2527

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 2587

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 2647

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 2707

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 2767

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 2827

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 2887

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 2947

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2948 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 3007

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 3067

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 3127

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 3187

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 3247

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 3307

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 3367

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 3427

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3428 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 3487

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3488 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 3547

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 3607

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 3667

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 3727

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 3787

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 3847

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     3848 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 3904

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 3964

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 4024

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 4084

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 4144

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 4204

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 4264

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 4324

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 4384

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 4444

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 4504

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 4564

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 4624

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 4684

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 4744

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 4804

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 4864

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 4924

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 4984

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 5044

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 5104

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 5164

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 5224

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 5284

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5285 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 5344

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCA 96548077
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCA 5377

Alignment time is 7.60615 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8836] =>      8836 nucs 'mol-32-2e4c-094651_8836'

Score:        8503
Aligned:      8836        nucs
Identic:      8800 (100%) nucs =>      1434 ( 99%)      7366 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96537072,96538514] EXCISED REGION [96538527,96545909]
 second seq =>  [       1,    1443] EXCISED REGION [    1444,    8836]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [96538515,96538526]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        30 nucs [96538515,96538544] to [96538527,96538556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [96538515,96538520] to [96538521,96538526]
 second seq =>         0 nucs

 96537072 ATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGT 96537131
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTGTCGAAACTTAAATCCCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGT 60

 96537132 GATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAA 96537191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAA 120

 96537192 CTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCA 96537251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCA 180

 96537252 CTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTT 96537311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTT 240

 96537312 TGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAG 96537371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAG 300

 96537372 GCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGT 96537431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGT 360

 96537432 AGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACT 96537491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACT 420

 96537492 GGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTC 96537551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTC 480

 96537552 TTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAG 96537611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      481 TTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCGCAG 540

 96537612 TCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGA 96537671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGA 600

 96537672 ATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTG 96537731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTG 660

 96537732 TGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCT 96537791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCT 720

 96537792 GGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTT 96537851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTT 780

 96537852 AATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTT 96537911
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTCTACTGATCACGGAATTAAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTT 840

 96537912 AATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTG 96537971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTG 900

 96537972 TGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTA 96538031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTA 960

 96538032 TTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAAT 96538091
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTCCAACGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAAT 1020

 96538092 AGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAAC 96538151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAAC 1080

 96538152 AGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAA 96538211
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTATACAGGATACTGGGACTCCCAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAA 1140

 96538212 AAAAAAAAGACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATT 96538271
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAAAAAACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATT 1200

 96538272 TGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGC 96538331
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||
     1201 TGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATATCAAACTCATCCTGGAAGC 1260

 96538332 CTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGG 96538391
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATATATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGG 1320

 96538392 GCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTAT 96538451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTAT 1380

 96538452 CTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCA 96538511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCA 1440

 96538512 CTC 96538514
          |||
     1441 CTC 1443

EXCISED REGION

 96538527 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTA 96538586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTA 1503

 96538587 TAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTC 96538646
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCATCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTC 1563

 96538647 TGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAG 96538706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAG 1623

 96538707 TGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCT 96538766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 TGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCT 1683

 96538767 TTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCC 96538826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCC 1743

 96538827 ATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGAC 96538886
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 ATCACTGCTGAAATTGGTACTGAAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGAC 1803

 96538887 TAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGT 96538946
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1804 TAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAATGCAGAGAGAGATTTTTGTGT 1863

 96538947 TTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCT 96539006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCT 1923

 96539007 TCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAA 96539066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAA 1983

 96539067 ACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCA 96539126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 ACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCA 2043

 96539127 AGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGA 96539186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGA 2103

 96539187 TAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAA 96539246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAA 2163

 96539247 ATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTAC 96539306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 ATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTAC 2223

 96539307 GTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAA 96539366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 GTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAA 2283

 96539367 AGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAG 96539426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 AGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAG 2343

 96539427 CCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAA 96539486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAA 2403

 96539487 GATTACTAAGC-AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTC 96539545
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 GATTACTAAGCAAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTC 2463

 96539546 CCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAA 96539605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 CCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAA 2523

 96539606 TTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATAT 96539665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 TTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATAT 2583

 96539666 CTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCA 96539725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 CTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCA 2643

 96539726 AAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCT 96539785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 AAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCT 2703

 96539786 TGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCA 96539845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCA 2763

 96539846 GAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAA 96539905
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 GAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAA 2823

 96539906 CACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTC 96539965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 CACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTC 2883

 96539966 AGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGT 96540025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 AGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGT 2943

 96540026 CTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAAT 96540085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 CTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAAT 3003

 96540086 ATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTT 96540145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 ATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTT 3063

 96540146 GGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATC 96540205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 GGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATC 3123

 96540206 TCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATG 96540265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 TCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATG 3183

 96540266 CAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAA 96540325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 CAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAA 3243

 96540326 ATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTG 96540385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 ATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTG 3303

 96540386 CTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAA 96540445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 CTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAA 3363

 96540446 ATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGA 96540505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 ATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGA 3423

 96540506 ATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCT 96540565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 ATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCT 3483

 96540566 TAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGG 96540625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 TAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGG 3543

 96540626 ATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGA 96540685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 ATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGA 3603

 96540686 ATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGC 96540745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 ATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGC 3663

 96540746 TGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGA 96540805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 TGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGA 3723

 96540806 ATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGA 96540865
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3724 ATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGA 3783

 96540866 GCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGA 96540925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 GCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGA 3843

 96540926 TGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCA 96540985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 TGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCA 3903

 96540986 AGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATAT 96541045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 AGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATAT 3963

 96541046 ACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAAT 96541105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 ACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAAT 4023

 96541106 TTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCC 96541165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 TTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCC 4083

 96541166 TGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAAC 96541225
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 TGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAAC 4143

 96541226 ATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGA 96541285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 ATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGA 4203

 96541286 TTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTT 96541345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 TTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTT 4263

 96541346 GGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTC 96541405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 GGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTC 4323

 96541406 CTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGT 96541465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 CTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGT 4383

 96541466 TGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCT 96541525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 TGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCT 4443

 96541526 CTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCT 96541585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 CTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCT 4503

 96541586 TGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGA 96541645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 TGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGA 4563

 96541646 CCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTT 96541705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 CCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTT 4623

 96541706 TTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGC 96541765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 TTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGC 4683

 96541766 CTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAA 96541825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 CTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAA 4743

 96541826 GCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAG 96541885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 GCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAG 4803

 96541886 AGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTT 96541945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 AGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTT 4863

 96541946 TTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTAT 96542005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 TTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTAT 4923

 96542006 AGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAAT 96542065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 AGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAAT 4983

 96542066 CATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTG 96542125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 CATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTG 5043

 96542126 ATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATC 96542185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 ATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATC 5103

 96542186 ATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACA 96542245
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5104 ATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACA 5163

 96542246 TAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGC 96542305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 TAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGC 5223

 96542306 CTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAA 96542365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 CTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAA 5283

 96542366 TCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACT 96542425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 TCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACT 5343

 96542426 ATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTG 96542485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 ATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTG 5403

 96542486 TGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTA 96542545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 TGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTA 5463

 96542546 TCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACT 96542605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 TCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACT 5523

 96542606 CTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTT 96542665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 CTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTT 5583

 96542666 CTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCC 96542725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 CTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCC 5643

 96542726 TTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTC 96542785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 TTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTC 5703

 96542786 CTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGA 96542845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 CTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGA 5763

 96542846 TTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTC 96542905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 TTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTC 5823

 96542906 CTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCC 96542965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 CTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCC 5883

 96542966 TGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCAC 96543025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5884 TGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCAC 5943

 96543026 TCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATAC 96543085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5944 TCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATAC 6003

 96543086 TTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCT 96543145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6004 TTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCT 6063

 96543146 CCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACC 96543205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6064 CCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACC 6123

 96543206 TTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAAT 96543265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6124 TTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAAT 6183

 96543266 GCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGC 96543325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6184 GCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGC 6243

 96543326 ACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGA 96543385
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6244 ACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGA 6303

 96543386 CAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTG 96543445
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6304 CAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTG 6363

 96543446 TGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTC 96543505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6364 TGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTC 6423

 96543506 CCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAA 96543565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6424 CCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAA 6483

 96543566 AATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATT 96543625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6484 AATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATT 6543

 96543626 ATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATAT 96543685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6544 ATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATAT 6603

 96543686 TGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATT 96543745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6604 TGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATT 6663

 96543746 GTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAA 96543805
          |||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 GTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAA 6723

 96543806 CATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAA 96543865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6724 CATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAA 6783

 96543866 AACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAA 96543925
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 AACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAA 6843

 96543926 CTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAA 96543985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 CTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAA 6903

 96543986 AAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCA 96544045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 AAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCA 6963

 96544046 AGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTC 96544105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6964 AGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTC 7023

 96544106 AGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAAAA 96544164
          ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| |||||||
     7024 AGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAA 7083

 96544165 AACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACT 96544224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7084 AACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACT 7143

 96544225 TGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAAC 96544284
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7144 TGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAAC 7203

 96544285 ATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTT 96544344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     7204 ATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTT 7263

 96544345 GTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAAT 96544404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7264 GTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAAT 7323

 96544405 ATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAA 96544464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7324 ATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAA 7383

 96544465 CTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAA 96544524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 CTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAA 7443

 96544525 CCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGT 96544584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 CCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGT 7503

 96544585 ACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCA 96544644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 ACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCA 7563

 96544645 TTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGA 96544704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 TTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGA 7623

 96544705 ACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGG 96544764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 ACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGG 7683

 96544765 CTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGG 96544824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7684 CTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGG 7743

 96544825 AGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTA 96544884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7744 AGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTA 7803

 96544885 GCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAAT 96544944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7804 GCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAAT 7863

 96544945 CACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCC 96545004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7864 CACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCC 7923

 96545005 TGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT--------ATACATACATAC 96545056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     7924 TGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATATATACATACATACATACATAC 7983

 96545057 ATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTGAA 96545116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7984 ATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTGAA 8043

 96545117 AAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCCTT 96545176
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     8044 AAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCCTT 8103

 96545177 CTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATCT 96545236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8104 CTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATCT 8163

 96545237 AAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGCAG 96545296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 AAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGCAG 8223

 96545297 AAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGTTG 96545356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 AAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGTTG 8283

 96545357 CAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACAAC 96545416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8284 CAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACAAC 8343

 96545417 CCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACGAA 96545476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8344 CCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACGAA 8403

 96545477 CAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAAAG 96545536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8404 CAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAAAG 8463

 96545537 AACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAAGT 96545596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8464 AACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAAGT 8523

 96545597 TAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCCA 96545656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8524 TAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCCA 8583

 96545657 TGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTT 96545716
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8584 TGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTT 8643

 96545717 GAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCA 96545776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8644 GAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCA 8703

 96545777 TGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAA 96545836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8704 TGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAA 8763

 96545837 AAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTA 96545896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8764 AAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTA 8823

 96545897 AAACATTGATTGC 96545909
          |||||||||||||
     8824 AAACATTGATTGC 8836

Alignment time is 12.1399 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7696] =>      7696 nucs 'mol-32-2e57-078999_7696'

Score:        7453
Aligned:      7697        nucs
Identic:      7674 (100%) nucs =>      2529 ( 99%)      5145 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96535975,96538514] EXCISED REGION [96538525,96543678]
 second seq =>  [       1,    2541] EXCISED REGION [    2542,    7696]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [96538515,96538524]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [96538515,96538546] to [96538525,96538556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96538515,96538518] to [96538521,96538524]
 second seq =>         0 nucs

 96535975 AAATTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAA 96536034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAA 60

 96536035 AGATGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGC 96536094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGC 120

 96536095 TGTTGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATTCATATGCA 96536154
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      121 TGTTGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAATATTTCATTCATTCATATGCA 180

 96536155 CTCATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATA 96536214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATA 240

 96536215 CCCTTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTC 96536274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTC 300

 96536275 ACCACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTT 96536334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTT 360

 96536335 GCCTCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAG 96536394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCTCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAG 420

 96536395 CTGGGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAA 96536454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAA 480

 96536455 AAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTC 96536514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTC 540

 96536515 TGCAGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAA 96536574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCAGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAA 600

 96536575 GTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATAC 96536634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATAC 660

 96536635 AAAAGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTA 96536694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTA 720

 96536695 ATTGTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGCCTTTAAA 96536754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      721 ATTGTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGTCTTTAAA 780

 96536755 ATGATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTA 96536814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTA 840

 96536815 ATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGG 96536874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGG 900

 96536875 AATAAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATG 96536934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATAAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATG 960

 96536935 GCTGACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAAT 96536994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAAT 1020

 96536995 TAATCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCA 96537054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCA 1080

 96537055 AATATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGT 96537114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1081 AATATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCCCCATTGTGATAGTATTAATAGGT 1140

 96537115 GGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTT 96537174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTT 1200

 96537175 CAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAG 96537234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAG 1260

 96537235 GATGCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACT 96537294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATGCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACT 1320

 96537295 TGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCT 96537354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCT 1380

 96537355 TTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGG 96537414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGG 1440

 96537415 AGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGAC 96537474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGAC 1500

 96537475 ACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACC 96537534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACC 1560

 96537535 TCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATT 96537594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATT 1620

 96537595 TTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAA 96537654
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTATTTAATCCTCGCAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAA 1680

 96537655 GGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGC 96537714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGC 1740

 96537715 AGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCC 96537774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCC 1800

 96537775 TAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCC 96537834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCC 1860

 96537835 TTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGA 96537894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1861 TTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTAAGAAGTATGCTATTAGATGGA 1920

 96537895 GGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAAC 96537954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAAC 1980

 96537955 TGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCC 96538014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCC 2040

 96538015 CTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTT 96538074
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAACGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTT 2100

 96538075 GTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCT 96538134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCT 2160

 96538135 ACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAA 96538194
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2161 ACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCCCAGATAGTGACTTCTAAAAA 2220

 96538195 AAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACC 96538254
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAA-ACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACC 2279

 96538255 TCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTC 96538314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||
     2280 TCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATATC 2339

 96538315 AAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAA 96538374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2340 AAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATATATTGGATGTAA 2399

 96538375 AGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACC 96538434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACC 2459

 96538435 TCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTG 96538494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTG 2519

 96538495 T--ATGTATATATTCTCCACTC 96538514
          |  |||||||||||||||||||
     2520 TGTATGTATATATTCTCCACTC 2541

EXCISED REGION

 96538525 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 96538584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 2601

 96538585 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 96538644
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCATCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 2661

 96538645 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 96538704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 2721

 96538705 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 96538764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 2781

 96538765 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 96538824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 2841

 96538825 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 96538884
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGAAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 2901

 96538885 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGT 96538944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2902 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAATGCAGAGAGAGATTTTTGT 2961

 96538945 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 96539004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 3021

 96539005 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 96539064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 3081

 96539065 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 96539124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 3141

 96539125 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 96539184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 3201

 96539185 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 96539244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 3261

 96539245 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 96539304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 3321

 96539305 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 96539364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 3381

 96539365 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 96539424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 3441

 96539425 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 96539484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 3501

 96539485 AAGATTACTAAGC-AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 96539543
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 AAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 3561

 96539544 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 96539603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 3621

 96539604 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 96539663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 3681

 96539664 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 96539723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 3741

 96539724 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 96539783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 3801

 96539784 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 96539843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 3861

 96539844 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 96539903
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 3921

 96539904 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 96539963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 3981

 96539964 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 96540023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 4041

 96540024 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 96540083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 4101

 96540084 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 96540143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 4161

 96540144 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 96540203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 4221

 96540204 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 96540263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 4281

 96540264 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 96540323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 4341

 96540324 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 96540383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 4401

 96540384 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 96540443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 4461

 96540444 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 96540503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 4521

 96540504 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 96540563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 4581

 96540564 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 96540623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 4641

 96540624 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 96540683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 4701

 96540684 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 96540743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 4761

 96540744 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 96540803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 4821

 96540804 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 96540863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4822 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 4881

 96540864 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 96540923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 4941

 96540924 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 96540983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 5001

 96540984 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 96541043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 5061

 96541044 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 96541103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 5121

 96541104 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 96541163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 5181

 96541164 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 96541223
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 5241

 96541224 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 96541283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 5301

 96541284 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 96541343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 5361

 96541344 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 96541403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 5421

 96541404 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 96541463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 5481

 96541464 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 96541523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 5541

 96541524 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 96541583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 5601

 96541584 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 96541643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 5661

 96541644 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 96541703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 5721

 96541704 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 96541763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 5781

 96541764 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 96541823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 5841

 96541824 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 96541883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 5901

 96541884 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 96541943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 5961

 96541944 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 96542003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 6021

 96542004 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 96542063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 6081

 96542064 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 96542123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 6141

 96542124 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 96542183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 6201

 96542184 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 96542243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6202 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCA 6261

 96542244 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 96542303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 6321

 96542304 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 96542363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 6381

 96542364 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 96542423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 6441

 96542424 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 96542483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6442 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 6501

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6502 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 6561

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6562 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 6621

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6622 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 6681

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6682 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 6741

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6742 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 6801

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6802 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 6861

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6862 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 6921

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6922 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 6981

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6982 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 7041

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7042 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 7101

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7102 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 7161

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7162 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 7221

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7222 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 7281

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 96543323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7282 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 7341

 96543324 GCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 96543383
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7342 GCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 7401

 96543384 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACG 96543443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     7402 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACG 7461

 96543444 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 96543503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7462 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 7521

 96543504 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 96543563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7522 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 7581

 96543564 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 96543623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7582 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 7641

 96543624 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAA 96543678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7642 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAA 7696

Alignment time is 10.4364 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3665] =>      3665 nucs 'mol-32-2edb-186041_3665'

Score:        3491
Aligned:      3660        nucs
Identic:      3643 (100%) nucs =>      2005 (100%)      1638 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96543032,96545044] EXCISED REGION [96545045,96546689]
 second seq =>  [       1,    2014] EXCISED REGION [    2023,    3665]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [2015,2022]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [2015,2053] to [2023,2061]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [2013,2014] to [2023,2024]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2015,2018] to [2019,2022]

 96543032 CCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCT 96543091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCT 60

 96543092 GAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCT 96543151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCT 120

 96543152 TCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTA 96543211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTA 180

 96543212 CAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCT 96543271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCT 240

 96543272 TACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCC 96543331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCC 300

 96543332 CCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAG 96543391
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAG 360

 96543392 AGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAA 96543451
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      361 AGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAA 420

 96543452 AATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACAT 96543511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACAT 480

 96543512 TTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGT 96543571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGT 540

 96543572 ACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAAT 96543631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAAT 600

 96543632 TTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCC 96543691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCC 660

 96543692 GCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACT 96543751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACT 720

 96543752 GGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTC 96543811
          |||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTC 780

 96543812 ATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTC 96543871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTC 840

 96543872 TGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCT 96543931
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCT 900

 96543932 GCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAA 96543991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAA 960

 96543992 ACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCA 96544051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCA 1020

 96544052 ACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAAT 96544111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAAT 1080

 96544112 AAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATT 96544170
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     1081 AAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATT 1140

 96544171 TTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGA 96544230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGA 1200

 96544231 GTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCC 96544290
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCC 1260

 96544291 ATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATA 96544350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1261 ATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATA 1320

 96544351 GGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTT 96544410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTT 1380

 96544411 AATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAA 96544470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAA 1440

 96544471 CTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTA 96544530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTA 1500

 96544531 TTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTA 96544590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTA 1560

 96544591 GCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGAC 96544650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGAC 1620

 96544651 AAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTAC 96544710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTAC 1680

 96544711 CTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATG 96544770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATG 1740

 96544771 TCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCG 96544830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCG 1800

 96544831 AGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGG 96544890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGG 1860

 96544891 CATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTC 96544950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTC 1920

 96544951 AACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTG 96545010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTG 1980

 96545011 ACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 2014

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 2082

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2083 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 2142

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 2202

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 2262

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 2322

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 2382

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 2442

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 2502

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 2562

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 2622

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2623 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 2682

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 2742

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 2802

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 2862

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 2922

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 2982

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 3042

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 3102

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3103 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 3162

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3163 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 3222

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 3282

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 3342

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 3402

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC-TTTTTTTTTTTTTTTT 96546483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     3403 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 3462

 96546484 TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAC 96546543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAC 3522

 96546544 TGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGG 96546603
          |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGG 3579

 96546604 ACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTT 96546663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 ACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTT 3639

 96546664 CACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA 96546689
          ||||||||||||||||||||||||||
     3640 CACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA 3665

Alignment time is 5.44588 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3217] =>      3217 nucs 'mol-32-2ee6-009362_3217'

Score:        3101
Aligned:      3134        nucs
Identic:      3131 (100%) nucs =>      3043 (100%)        88 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96540238,96543282] EXCISED REGION [96546599,96546687]
 second seq =>  [       1,    3045] EXCISED REGION [    3129,    3217]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3046,3128]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3044,3045] to [3129,3130]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96540238 TCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGG 96540297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGG 60

 96540298 GGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAG 96540357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAG 120

 96540358 CGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGAC 96540417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGAC 180

 96540418 CTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGC 96540477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGC 240

 96540478 TATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAG 96540537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAG 300

 96540538 CTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAG 96540597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAG 360

 96540598 GATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGA 96540657
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      361 GATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGA 420

 96540658 GCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTT 96540717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTT 480

 96540718 CCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGA 96540777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGA 540

 96540778 ATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATAT 96540837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATAT 600

 96540838 TGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAA 96540897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAA 660

 96540898 GGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAG 96540957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAG 720

 96540958 TAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGT 96541017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGT 780

 96541018 GTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATT 96541077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATT 840

 96541078 TTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTT 96541137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTT 900

 96541138 TAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTC 96541197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTC 960

 96541198 TGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAG 96541257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAG 1020

 96541258 GGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTT 96541317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTT 1080

 96541318 CAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAAC 96541377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAAC 1140

 96541378 AACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACT 96541437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACT 1200

 96541438 TTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTT 96541497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTT 1260

 96541498 TAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATC 96541557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATC 1320

 96541558 CCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGT 96541617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGT 1380

 96541618 CTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATG 96541677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATG 1440

 96541678 CATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTG 96541737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTG 1500

 96541738 AAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTC 96541797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTC 1560

 96541798 AAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATG 96541857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATG 1620

 96541858 GATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTA 96541917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTA 1680

 96541918 GAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAA 96541977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAA 1740

 96541978 GCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGC 96542037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGC 1800

 96542038 CATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTG 96542097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTG 1860

 96542098 TAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGT 96542157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGT 1920

 96542158 GTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTC 96542217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTC 1980

 96542218 AAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCA 96542277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCA 2040

 96542278 CTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCAT 96542337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCAT 2100

 96542338 GCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAA 96542397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAA 2160

 96542398 TACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATT 96542457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATT 2220

 96542458 ATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATA 96542517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATA 2280

 96542518 CTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGT 96542577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGT 2340

 96542578 CAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTA 96542637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTA 2400

 96542638 TACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCC 96542697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCC 2460

 96542698 AGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGT 96542757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGT 2520

 96542758 ACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGA 96542817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGA 2580

 96542818 TGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTG 96542877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTG 2640

 96542878 TTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTT 96542937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTT 2700

 96542938 TGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTT 96542997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2701 TGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTT 2760

 96542998 TCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCT 96543057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCT 2820

 96543058 GCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGT 96543117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGT 2880

 96543118 CAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACC 96543177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACC 2940

 96543178 ATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGT 96543237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGT 3000

 96543238 TACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 3045

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3188

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTC 96546687
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTC 3217

Alignment time is 4.75759 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3897] =>      3897 nucs 'mol-32-2ef1-142796_3897'

Score:        3748
Aligned:      3814        nucs
Identic:      3808 (100%) nucs =>      2285 (100%)      1523 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96540996,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548124]
 second seq =>  [       1,    2287] EXCISED REGION [    2371,    3897]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [2288,2370]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [2286,2287] to [2371,2372]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96540996 GATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTA 96541055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTA 60

 96541056 TTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGG 96541115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGG 120

 96541116 ATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAAT 96541175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAAT 180

 96541176 AAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCA 96541235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCA 240

 96541236 GAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGT 96541295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGT 300

 96541296 TGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTT 96541355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTT 360

 96541356 GTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAAC 96541415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAAC 420

 96541416 ATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTT 96541475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTT 480

 96541476 ATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATC 96541535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATC 540

 96541536 TCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATAC 96541595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATAC 600

 96541596 TTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGT 96541655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGT 660

 96541656 ATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGG 96541715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGG 720

 96541716 AGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACC 96541775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACC 780

 96541776 TGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTC 96541835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTC 840

 96541836 TTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAA 96541895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAA 900

 96541896 CCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGAT 96541955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGAT 960

 96541956 GAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAA 96542015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAA 1020

 96542016 AACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGA 96542075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGA 1080

 96542076 GTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTT 96542135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTT 1140

 96542136 CCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCA 96542195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCA 1200

 96542196 TACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCAT 96542255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCAT 1260

 96542256 TCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTC 96542315
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATCATTAACATTTGTACTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTC 1320

 96542316 TGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAAT 96542375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAAT 1380

 96542376 GTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTT 96542435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTT 1440

 96542436 AACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTAT 96542495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTAT 1500

 96542496 TTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTT 96542555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTT 1560

 96542556 ATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCC 96542615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCC 1620

 96542616 GCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTAC 96542675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTAC 1680

 96542676 CCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAA 96542735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAA 1740

 96542736 GTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGC 96542795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGC 1800

 96542796 TCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACA 96542855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACA 1860

 96542856 AAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGC 96542915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGC 1920

 96542916 TCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCC 96542975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCC 1980

 96542976 TCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCA 96543035
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCA 2040

 96543036 CACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAA 96543095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAA 2100

 96543096 AGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTC 96543155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTC 2160

 96543156 TCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGT 96543215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGT 2220

 96543216 CTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACT 96543275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACT 2280

 96543276 TTCAACT 96543282
          |||||||
     2281 TTCAACT 2287

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACA-GCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG 96546657
          ||||||||||| ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 CTGGGACCACAGGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG 2430

 96546658 GGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTC 96546717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 GGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTC 2490

 96546718 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGC 96546777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGC 2550

 96546778 TATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATA 96546837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 TATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATA 2610

 96546838 GTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATG 96546897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 GTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATG 2670

 96546898 CCGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGC 96546957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 CCGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGC 2730

 96546958 CCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTC 96547017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 CCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTC 2790

 96547018 ACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAAT 96547077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 ACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAAT 2850

 96547078 TTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCA 96547137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 TTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCA 2910

 96547138 TACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGC 96547197
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGC 2970

 96547198 TCATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCT 96547257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TCATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCT 3030

 96547258 ATAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAG 96547317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 ATAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAG 3090

 96547318 TCCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAA 96547377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TCCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAA 3150

 96547378 AGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTT 96547437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 AGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTT 3210

 96547438 TGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCT 96547497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 TGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCT 3270

 96547498 GGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGAT 96547557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 GGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGAT 3330

 96547558 AACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATAT 96547617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 AACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATAT 3390

 96547618 CAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGAC 96547677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 CAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGAC 3450

 96547678 TTCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGG 96547737
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TTCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGG 3510

 96547738 GAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTA 96547797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 GAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTA 3570

 96547798 CTGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGA 96547857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 CTGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGA 3630

 96547858 AAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAAC 96547917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 AAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAAC 3690

 96547918 AAAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATC 96547977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 AAAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATC 3750

 96547978 TCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGC 96548037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 TCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGC 3810

 96548038 CCATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96548097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 CCATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 3870

 96548098 GAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAG 96548124
          |||||||||||||||||||||||||||
     3871 GAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAG 3897

Alignment time is 5.74553 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9587] =>      9587 nucs 'mol-32-2f07-007371_9587'

Score:        9230
Aligned:      9588        nucs
Identic:      9553 (100%) nucs =>      4132 ( 99%)      5421 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96534365,96538514] EXCISED REGION [96538525,96543957]
 second seq =>  [       1,    4153] EXCISED REGION [    4154,    9587]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [96538515,96538524]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [96538515,96538546] to [96538525,96538556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96538515,96538518] to [96538521,96538524]
 second seq =>         0 nucs

 96534365 AGGCTTGCCTGTCACTACTTCTATCCAAATGACTATTTCATAACACTCAGGAAGAATCAG 96534424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCTTGCCTGTCACTACTTCTATCCAAATGACTATTTCATAACACTCAGGAAGAATCAG 60

 96534425 AAGGACATACCTAATAATTTCTCTGCCCTCCCCTACCCTTCCACCCAATTCCATGCTGGG 96534484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGACATACCTAATAATTTCTCTGCCCTCCCCTACCCTTCCACCCAATTCCATGCTGGG 120

 96534485 CAGCCTCTTTTATATCCAAAAACCTTATACATTTCGCCAAAGGAATCAGTACTAATGGGA 96534544
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCCTCTTTTATATCCAAAAACCTTATACGTTTCGCCAAAGGAATCAGTACTAATGGGA 180

 96534545 GCATCTGTAACTTGGTTGTTCTCAGGTTTGAGATCTTGAGAGAGAAAATGGAAAAGTTAA 96534604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATCTGTAACTTGGTTGTTCTCAGGTTTGAGATCTTGAGAGAGAAAATGGAAAAGTTAA 240

 96534605 CACTGAAGACCTCAGGTGACTGGGATTTCTGGAGGTCACAGGAACAAATTCAGTTATGCT 96534664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTGAAGACCTCAGGTGACTGGGATTTCTGGAGGTCACAGGAACAAATTCAGTTATGCT 300

 96534665 CTACTGTCCTTCCTGACCAAGGCCTGCTCCCTAGATAGCACTGGCTATTTTCCCCAATCA 96534724
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACTGTCCCTCCTGACCAAGGCCTGCTCCCTAGATAGCACTGGCTATTTTCCCCAATCA 360

 96534725 CTTCAGCTGAACACTAATGTTTTGGTGATACTGATGTCCATAGAGAACAGCAGTGGGATT 96534784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCAGCTGAACACTAATGTTTTGGTGATACTGATGTCCATAGAGAACAGCAGTGGGATT 420

 96534785 TCACTAAGATGGGAAGTTACTGTGTTCACCTGCCATAAACATGAAACAATACAGCAGGTA 96534844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCACTAAGATGGGAAGTTACTGTGTTCACCTGCCATAAACATGAAACAATACAGCAGGTA 480

 96534845 TTCATTCACCCATCTCTTATTCAGATCAGAGACATTCTCACAGACCATATCCAGACTAAA 96534904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCATTCACCCATCTCTTATTCAGATCAGAGACATTCTCACAGACCATATCCAGACTAAA 540

 96534905 GAGCATTCTGAATATTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAATTTTAGAGACAGGGTCTCAC 96534964
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGGATTCTGAATATTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAATTTTAGAGACAGGGTCTCAC 600

 96534965 TCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCTCAGCCTCAACATTCT 96535024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      601 TCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCGCAGCCTCAACATTCT 660

 96535025 GGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACAGGCATCCACCC 96535084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACAGGCATCCACCC 720

 96535085 CAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGTCCAGGCTGTCT 96535144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGTCCAGGCTGTCT 780

 96535145 TGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATGAAGGC 96535204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATGAAGGC 840

 96535205 ATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTAAAATCCAACTC 96535264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTAAAATCCAACTC 900

 96535265 AAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACACACTCCAGGCAGAATCCTAGAAAGCT 96535324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      901 AAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACATACTCCAGGCAGAATCCTAGAAAGCT 960

 96535325 CTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCTGTTTCTTCACA 96535384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCTGTTTCTTCACA 1020

 96535385 AAGTCACTATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAAGGTATGAGACA 96535444
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTCACTATTTTAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAAGGTATGAGACA 1080

 96535445 CAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAATTGTTAGC 96535504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAATTGTTAGC 1140

 96535505 CACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCATTCGTGGT 96535564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCATTCGTGGT 1200

 96535565 TCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATTCGGTTAA 96535624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATTCGGTTAA 1260

 96535625 TACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTTTCTACAG 96535684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTTTCTACAG 1320

 96535685 GAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTATCCTGCAA 96535744
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGCTTATAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTATCCTGCAA 1380

 96535745 CCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGACCCCAAA 96535804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGACCCCAAA 1440

 96535805 ACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAAAAAATCA 96535864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAAAAAATCA 1500

 96535865 ATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGTTATATGT 96535924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGTTATATGT 1560

 96535925 TTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAATTGTGAT 96535984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAATTGTGAT 1620

 96535985 TTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGATGCTGTG 96536044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGATGCTGTG 1680

 96536045 AATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGTTGTGTTA 96536104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGTTGTGTTA 1740

 96536105 TACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATTCATATGCACTCATAGAAA 96536164
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAATATTTCATTCATTCATATGCACTCATAGAAA 1800

 96536165 TCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTAGA 96536224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTAGA 1860

 96536225 TGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACAGG 96536284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACAGG 1920

 96536285 TAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGGTA 96536344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGGTA 1980

 96536345 TTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAGAA 96536404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAGAA 2040

 96536405 TTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGTTT 96536464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGTTT 2100

 96536465 GGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTAAT 96536524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTAAT 2160

 96536525 TAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGGCT 96536584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGGCT 2220

 96536585 AGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTATTG 96536644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTATTG 2280

 96536645 ATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCACTG 96536704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCACTG 2340

 96536705 AAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGCCTTTAAAATGATCTAAG 96536764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2341 AAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGTCTTTAAAATGATCTAAG 2400

 96536765 TGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGAGG 96536824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGAGG 2460

 96536825 AAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGTAT 96536884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGTAT 2520

 96536885 CTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACACAT 96536944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACACAT 2580

 96536945 GGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATATT 96537004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATATT 2640

 96537005 AGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCACC 96537064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCACC 2700

 96537065 AAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGG 96537124
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCCCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGG 2760

 96537125 GTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTG 96537184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTG 2820

 96537185 GAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAA 96537244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAA 2880

 96537245 CAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCT 96537304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCT 2940

 96537305 TTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAAT 96537364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAAT 3000

 96537365 TACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGAC 96537424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGAC 3060

 96537425 TGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAG 96537484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAG 3120

 96537485 AGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAA 96537544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAA 3180

 96537545 TGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATC 96537604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATC 3240

 96537605 CTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAG 96537664
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCGCAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAG 3300

 96537665 GTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGC 96537724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGC 3360

 96537725 CTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCAT 96537784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCAT 3420

 96537785 TTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAAT 96537844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAAT 3480

 96537845 CAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTT 96537904
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTAAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTT 3540

 96537905 CTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAA 96537964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAA 3600

 96537965 TATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAG 96538024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAG 3660

 96538025 ACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTG 96538084
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACTACTATTGTCCAACGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTG 3720

 96538085 AGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCC 96538144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCC 3780

 96538145 AGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCA 96538204
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCCCAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCA 3840

 96538205 AAAAAAAAAAAAAAAG--ACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGT 96538262
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAAAAAAAAAAAAAA-AAACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGT 3899

 96538263 AAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAACTCAT 96538322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
     3900 AAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATATCAAACTCAT 3959

 96538323 CCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACT 96538382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3960 CCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATATATTGGATGTAAAGAAAACT 4019

 96538383 TACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTAT 96538442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTAT 4079

 96538443 CTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGT--ATGTA 96538500
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     4080 CTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTA 4139

 96538501 TATATTCTCCACTC 96538514
          ||||||||||||||
     4140 TATATTCTCCACTC 4153

EXCISED REGION

 96538525 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 96538584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 4213

 96538585 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 96538644
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCATCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 4273

 96538645 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 96538704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 4333

 96538705 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 96538764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 4393

 96538765 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 96538824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 4453

 96538825 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 96538884
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGAAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 4513

 96538885 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGT 96538944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4514 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAATGCAGAGAGAGATTTTTGT 4573

 96538945 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 96539004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 4633

 96539005 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 96539064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 4693

 96539065 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 96539124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 4753

 96539125 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 96539184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 4813

 96539185 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 96539244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 4873

 96539245 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 96539304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 4933

 96539305 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 96539364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 4993

 96539365 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 96539424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 5053

 96539425 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 96539484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 5113

 96539485 AAGATTACTAAGC-AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 96539543
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 AAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 5173

 96539544 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 96539603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 5233

 96539604 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 96539663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 5293

 96539664 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 96539723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 5353

 96539724 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 96539783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 5413

 96539784 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 96539843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 5473

 96539844 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 96539903
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 5533

 96539904 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 96539963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 5593

 96539964 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 96540023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 5653

 96540024 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 96540083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 5713

 96540084 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 96540143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 5773

 96540144 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 96540203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 5833

 96540204 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 96540263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 5893

 96540264 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 96540323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 5953

 96540324 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 96540383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 6013

 96540384 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 96540443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 6073

 96540444 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 96540503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 6133

 96540504 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 96540563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6134 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 6193

 96540564 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 96540623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6194 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 6253

 96540624 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 96540683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6254 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 6313

 96540684 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 96540743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6314 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 6373

 96540744 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 96540803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6374 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 6433

 96540804 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 96540863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6434 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 6493

 96540864 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 96540923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6494 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 6553

 96540924 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 96540983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6554 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 6613

 96540984 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 96541043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6614 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 6673

 96541044 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 96541103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6674 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 6733

 96541104 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 96541163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6734 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 6793

 96541164 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 96541223
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6794 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 6853

 96541224 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 96541283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6854 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 6913

 96541284 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 96541343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6914 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 6973

 96541344 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 96541403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6974 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 7033

 96541404 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 96541463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7034 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 7093

 96541464 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 96541523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7094 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 7153

 96541524 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 96541583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7154 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 7213

 96541584 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 96541643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7214 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 7273

 96541644 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 96541703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7274 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 7333

 96541704 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 96541763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7334 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 7393

 96541764 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 96541823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7394 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 7453

 96541824 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 96541883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7454 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 7513

 96541884 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 96541943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7514 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 7573

 96541944 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 96542003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7574 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 7633

 96542004 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 96542063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7634 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 7693

 96542064 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 96542123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7694 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 7753

 96542124 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 96542183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7754 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 7813

 96542184 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 96542243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     7814 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCA 7873

 96542244 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 96542303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 7933

 96542304 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 96542363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7934 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 7993

 96542364 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 96542423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7994 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 8053

 96542424 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 96542483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8054 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 8113

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8114 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 8173

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8174 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 8233

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8234 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 8293

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8294 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 8353

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8354 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 8413

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8414 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 8473

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8474 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 8533

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8534 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 8593

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8594 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 8653

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8654 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 8713

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8714 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 8773

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8774 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 8833

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8834 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 8893

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 96543323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8894 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 8953

 96543324 GCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 96543383
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8954 GCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 9013

 96543384 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACG 96543443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     9014 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACG 9073

 96543444 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 96543503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9074 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 9133

 96543504 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 96543563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9134 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 9193

 96543564 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 96543623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9194 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 9253

 96543624 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 96543683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9254 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 9313

 96543684 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 96543743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9314 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 9373

 96543744 TTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 96543803
          |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9374 TTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 9433

 96543804 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 96543863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9434 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 9493

 96543864 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 96543923
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     9494 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 9553

 96543924 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAG 96543957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9554 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAG 9587

Alignment time is 13.0795 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5366] =>      5366 nucs 'mol-32-2fc2-116300_5366'

Score:        5228
Aligned:      5283        nucs
Identic:      5278 (100%) nucs =>      3823 (100%)      1455 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539458,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548056]
 second seq =>  [       1,    3825] EXCISED REGION [    3909,    5366]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3826,3908]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3824,3825] to [3909,3910]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96539458 AAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTC 96539517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTC 60

 96539518 TGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAG 96539577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAG 120

 96539578 ACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAG 96539637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAG 180

 96539638 TATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTT 96539697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTT 240

 96539698 TTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTG 96539757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTG 300

 96539758 GTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACA 96539817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACA 360

 96539818 ATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTC 96539877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTC 420

 96539878 TGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTA 96539937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTA 480

 96539938 ATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGG 96539997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGG 540

 96539998 ATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGC 96540057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGC 600

 96540058 TACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACT 96540117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACT 660

 96540118 AGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAG 96540177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAG 720

 96540178 CCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAA 96540237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAA 780

 96540238 TCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGG 96540297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGG 840

 96540298 GGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAG 96540357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAG 900

 96540358 CGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGAC 96540417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGAC 960

 96540418 CTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGC 96540477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGC 1020

 96540478 TATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAG 96540537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAG 1080

 96540538 CTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAG 96540597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAG 1140

 96540598 GATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGA 96540657
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1141 GATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGA 1200

 96540658 GCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTT 96540717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTT 1260

 96540718 CCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGA 96540777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGA 1320

 96540778 ATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATAT 96540837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATAT 1380

 96540838 TGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAA 96540897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAA 1440

 96540898 GGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAG 96540957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAG 1500

 96540958 TAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGT 96541017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGT 1560

 96541018 GTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATT 96541077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATT 1620

 96541078 TTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTT 96541137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTT 1680

 96541138 TAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTC 96541197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTC 1740

 96541198 TGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAG 96541257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAG 1800

 96541258 GGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTT 96541317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTT 1860

 96541318 CAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAAC 96541377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAAC 1920

 96541378 AACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACT 96541437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACT 1980

 96541438 TTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTT 96541497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTT 2040

 96541498 TAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATC 96541557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATC 2100

 96541558 CCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGT 96541617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGT 2160

 96541618 CTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATG 96541677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATG 2220

 96541678 CATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTG 96541737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTG 2280

 96541738 AAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTC 96541797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTC 2340

 96541798 AAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATG 96541857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATG 2400

 96541858 GATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTA 96541917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTA 2460

 96541918 GAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAA 96541977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAA 2520

 96541978 GCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGC 96542037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGC 2580

 96542038 CATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTG 96542097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTG 2640

 96542098 TAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGT 96542157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGT 2700

 96542158 GTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTC 96542217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTC 2760

 96542218 AAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCA 96542277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCA 2820

 96542278 CTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCAT 96542337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCAT 2880

 96542338 GCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAA 96542397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAA 2940

 96542398 TACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATT 96542457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATT 3000

 96542458 ATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATA 96542517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATA 3060

 96542518 CTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGT 96542577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGT 3120

 96542578 CAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTA 96542637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTA 3180

 96542638 TACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCC 96542697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCC 3240

 96542698 AGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGT 96542757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGT 3300

 96542758 ACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGA 96542817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGA 3360

 96542818 TGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTG 96542877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTG 3420

 96542878 TTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTT 96542937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTT 3480

 96542938 TGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTT 96542997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3481 TGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTT 3540

 96542998 TCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCT 96543057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCT 3600

 96543058 GCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGT 96543117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGT 3660

 96543118 CAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACC 96543177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACC 3720

 96543178 ATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGT 96543237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGT 3780

 96543238 TACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 3825

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3968

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 4028

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 4088

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 4148

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 4208

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 4268

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 4328

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 4388

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 4448

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 4508

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 4568

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 4628

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4629 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 4688

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 4748

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 4808

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 4868

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 4928

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 4988

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4989 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 5048

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5049 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 5108

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5109 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 5168

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5169 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 5228

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5229 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 5288

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5289 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 5348

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTT 96548056
          ||||||||||||||||||
     5349 CATTATTCTCCATGGGTT 5366

Alignment time is 7.57946 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10775] =>     10775 nucs 'mol-32-2fd8-031121_10775'

Score:       10533
Aligned:     10701        nucs
Identic:     10680 (100%) nucs =>      9160 (100%)      1520 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96534108,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548122]
 second seq =>  [       1,    9169] EXCISED REGION [    9253,   10775]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [9170,9252]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [9168,9169] to [9253,9254]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96534108 TCCTAGAAGCCGGAAGAAACTTAGAAAAGATTAGCAGGAAAATCTGTACTAATTCCTGTG 96534167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTAGAAGCCGGAAGAAACTTAGAAAAGATTAGCAGGAAAATCTGTACTAATTCCTGTG 60

 96534168 GGTTTCCCATGTATTTTATTTTTAGTTTGTTAATTAGGGTATATTTGTGGTTTTTTATTC 96534227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTTTCCCATGTATTTTATTTTTAGTTTGTTAATTAGGGTATATTTGTGGTTTTTTATTC 120

 96534228 TGCTTCATTTTTTAAAATACAATCAGACTGTGTGACTTCTTGTTTCAGATCTCTTTCACA 96534287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTTCATTTTTTAAAATACAATCAGACTGTGTGACTTCTTGTTTCAGATCTCTTTCACA 180

 96534288 CACAGTAAAAAAATAATGGATTCTTGGGTACTGTGTGTTTATGTGTATTATTTTGGGTTC 96534347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACAGTAAAAAAATAATGGATTCTTGGGTACTGTGTGTTTATGTGTATTATTTTGGGTTC 240

 96534348 AGTTGGGTTTCTCTGTTAGGCTTGCCTGTCACTACTTCTATCCAAATGACTATTTCATAA 96534407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTTGGGTTTCTCTGTTAGGCTTGCCTGTCACTACTTCTATCCAAATGACTATTTCATAA 300

 96534408 CACTCAGGAAGAATCAGAAGGACATACCTAATAATTTCTCTGCCCTCCCCTACCCTTCCA 96534467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTCAGGAAGAATCAGAAGGACATACCTAATAATTTCTCTGCCCTCCCCTACCCTTCCA 360

 96534468 CCCAATTCCATGCTGGGCAGCCTCTTTTATATCCAAAAACCTTATACATTTCGCCAAAGG 96534527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCAATTCCATGCTGGGCAGCCTCTTTTATATCCAAAAACCTTATACATTTCGCCAAAGG 420

 96534528 AATCAGTACTAATGGGAGCATCTGTAACTTGGTTGTTCTCAGGTTTGAGATCTTGAGAGA 96534587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCAGTACTAATGGGAGCATCTGTAACTTGGTTGTTCTCAGGTTTGAGATCTTGAGAGA 480

 96534588 GAAAATGGAAAAGTTAACACTGAAGACCTCAGGTGACTGGGATTTCTGGAGGTCACAGGA 96534647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAATGGAAAAGTTAACACTGAAGACCTCAGGTGACTGGGATTTCTGGAGGTCACAGGA 540

 96534648 ACAAATTCAGTTATGCTCTACTGTCCTTCCTGACCAAGGCCTGCTCCCTAGATAGCACTG 96534707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAATTCAGTTATGCTCTACTGTCCTTCCTGACCAAGGCCTGCTCCCTAGATAGCACTG 600

 96534708 GCTATTTTCCCCAATCACTTCAGCTGAACACTAATGTTTTGGTGATACTGATGTCCATAG 96534767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTATTTTCCCCAATCACTTCAGCTGAACACTAATGTTTTGGTGATACTGATGTCCATAG 660

 96534768 AGAACAGCAGTGGGATTTCACTAAGATGGGAAGTTACTGTGTTCACCTGCCATAAACATG 96534827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAACAGCAGTGGGATTTCACTAAGATGGGAAGTTACTGTGTTCACCTGCCATAAACATG 720

 96534828 AAACAATACAGCAGGTATTCATTCACCCATCTCTTATTCAGATCAGAGACATTCTCACAG 96534887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACAATACAGCAGGTATTCATTCACCCATCTCTTATTCAGATCAGAGACATTCTCACAG 780

 96534888 ACCATATCCAGACTAAAGAGCATTCTGAATATTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTT-AATT 96534946
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
      781 ACCATATCCAGACTAAAGAGGATTCTGAATATTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAATT 840

 96534947 TTAGAGACAGGGTCTCACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCA 96535006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAGAGACAGGGTCTCACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCA 900

 96535007 CCTCAGCCTCAACATTCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGA 96535066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTCAGCCTCAACATTCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGA 960

 96535067 GACTACAGGCATCCACCCCAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCT 96535126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACTACAGGCATCCACCCCAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCT 1020

 96535127 ATATTGTCCAGGCTGTCTTGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCA 96535186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATTGTCCAGGCTGTCTTGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCA 1080

 96535187 AAGTGCTGGTATGAAGGCATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGT 96535246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGTGCTGGTATGAAGGCATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGT 1140

 96535247 ACATTTAAAATCCAACTCAAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACACACTCCAG 96535306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1141 ACATTTAAAATCCAACTCAAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACATACTCCAG 1200

 96535307 GCAGAATCCTAGAAAGCTCTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAAC 96535366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGAATCCTAGAAAGCTCTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAAC 1260

 96535367 CACTGCTGTTTCTTCACAAAGTCACTATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTT 96535426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACTGCTGTTTCTTCACAAAGTCACTATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTT 1320

 96535427 CAAGAAAGGTATGAGACACAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATAC 96535486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGAAAGGTATGAGACACAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATAC 1380

 96535487 TGTCCATAAATTGTTAGCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCAC 96535546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTCCATAAATTGTTAGCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCAC 1440

 96535547 ATAGCTGCCATTCGTGGTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTT 96535606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAGCTGCCATTCGTGGTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTT 1500

 96535607 CTGTGCTGATTCGGTTAATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTT 96535666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGTGCTGATTCGGTTAATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTT 1560

 96535667 ACTTATAATTTTCTACAGGAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGT 96535726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTTATAATTTTCTACAGGAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGT 1620

 96535727 TTCATAATTATCCTGCAACCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTT 96535786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCATAATTATCCTGCAACCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTT 1680

 96535787 TTAACTCCTGACCCCAAAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAA 96535846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAACTCCTGACCCCAAAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAA 1740

 96535847 ATGCCACAAAAAAAATCAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATT 96535906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGCCACAAAAAAAATCAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATT 1800

 96535907 AAAGTGACTGTTATATGTTTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTA 96535966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAGTGACTGTTATATGTTTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTA 1860

 96535967 CATTAAGAAAATTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCC 96536026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTAAGAAAATTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCC 1920

 96536027 TAGCATAAAGATGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTAT 96536086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGCATAAAGATGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTAT 1980

 96536087 TTCTTGGCTGTTGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATT 96536146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTTGGCTGTTGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATT 2040

 96536147 CATATGCACTCATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTC 96536206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATATGCACTCATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTC 2100

 96536207 AAGTTATACCCTTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACT 96536266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGTTATACCCTTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACT 2160

 96536267 TAAGCCTCACCACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTC 96536326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAAGCCTCACCACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTC 2220

 96536327 TAAATTTTGCCTCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTG 96536386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAAATTTTGCCTCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTG 2280

 96536387 GCAAATAGCTGGGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAA 96536446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCAAATAGCTGGGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAA 2340

 96536447 AAAATTAAAAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGA 96536506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAATTAAAAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGA 2400

 96536507 AAATTTTCTGCAGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTC 96536566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAATTTTCTGCAGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTC 2460

 96536567 CCCTTCAAGTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGAT 96536626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCTTCAAGTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGAT 2520

 96536627 ATCAATACAAAAGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGA 96536686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCAATACAAAAGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGA 2580

 96536687 GCATTCTAATTGTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTG 96536746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCATTCTAATTGTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTG 2640

 96536747 CCTTTAAAATGATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAA 96536806
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTTTAAAATGATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAA 2700

 96536807 CTATTCTAATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAA 96536866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTATTCTAATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAA 2760

 96536867 TGTCCTGGAATAAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAG 96536926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTCCTGGAATAAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAG 2820

 96536927 TACCCATGGCTGACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCT 96536986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TACCCATGGCTGACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCT 2880

 96536987 TAGTCAATTAATCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCT 96537046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAGTCAATTAATCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCT 2940

 96537047 ATGGTCCAAATATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTAT 96537106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGGTCCAAATATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTAT 3000

 96537107 TAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAA 96537166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAA 3060

 96537167 TACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCC 96537226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3061 TACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGACCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCC 3120

 96537227 ATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGAC 96537286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGAC 3180

 96537287 ACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAA 96537346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAA 3240

 96537347 TTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACC 96537406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACC 3300

 96537407 AAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAG 96537466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAG 3360

 96537467 CCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCC 96537526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCC 3420

 96537527 TCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACAT 96537586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACAT 3480

 96537587 GCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTC 96537646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTC 3540

 96537647 TCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCT 96537706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCT 3600

 96537707 GTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTC 96537766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTC 3660

 96537767 TACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAA 96537826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAA 3720

 96537827 AGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTAT 96537886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTAT 3780

 96537887 TAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACG 96537946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACG 3840

 96537947 TGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTA 96538006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTA 3900

 96538007 TTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGA 96538066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGA 3960

 96538067 AGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCC 96538126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCC 4020

 96538127 CTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACT 96538186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACT 4080

 96538187 TCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAA-GACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTG 96538245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTG 4140

 96538246 CTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAG 96538305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAG 4200

 96538306 GGTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACAT 96538365
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACAT 4260

 96538366 TGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCT 96538425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCT 4320

 96538426 TTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGT 96538485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGT 4380

 96538486 GTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 96538545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 4440

 96538546 GTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTATAGTTCAATTCCCCACTCA 96538605
          |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GTG--------ACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTATAGTTCAATTCCCCACTCA 4492

 96538606 GGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTCTGCATCTCTATCAATATGA 96538665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 GGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTCTGCATCTCTATCAATATGA 4552

 96538666 CAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAGTGATGTGAAACCCCACCGC 96538725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 CAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAGTGATGTGAAACCCCACCGC 4612

 96538726 TTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCTTTGACCCCATATGGAGTCT 96538785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCTTTGACCCCATATGGAGTCT 4672

 96538786 TATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCCATCACTGCTGAAATTGGTA 96538845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 TATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCCATCACTGCTGAAATTGGTA 4732

 96538846 CTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGACTAACAGGAAATTGTGTGAG 96538905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 CTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGACTAACAGGAAATTGTGTGAG 4792

 96538906 GAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGTTTGGTTTTTACTCACACTT 96538965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 GAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGTTTGGTTTTTACTCACACTT 4852

 96538966 TTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCTTCGCTTTGGCTCATTGGTT 96539025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 TTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCTTCGCTTTGGCTCATTGGTT 4912

 96539026 TTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAAACAATTATTTTTAAGGAGT 96539085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAAACAATTATTTTTAAGGAGT 4972

 96539086 TTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCAAGAGGCTTTTGCATCAATG 96539145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 TTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCAAGAGGCTTTTGCATCAATG 5032

 96539146 ACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATAGATAGATAGAAAACAGC 96539205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 ACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATAGATAGATAGAAAACAGC 5092

 96539206 ACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAATGTCTCCATTTTTTATTT 96539265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 ACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAATGTCTCCATTTTTTATTT 5152

 96539266 ATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGTACCCATTTTCTAATGTG 96539325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 ATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGTACCCATTTTCTAATGTG 5212

 96539326 TATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTG 96539385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 TATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTG 5272

 96539386 TCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAA 96539445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 TCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAA 5332

 96539446 AACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAA 96539505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 AACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAA 5392

 96539506 AAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGG 96539565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 AAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGG 5452

 96539566 ATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAA 96539625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 ATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAA 5512

 96539626 CAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTT 96539685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 CAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTT 5572

 96539686 GTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGA 96539745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 GTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGA 5632

 96539746 AGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGG 96539805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 AGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGG 5692

 96539806 GATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGT 96539865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 GATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGT 5752

 96539866 CAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTA 96539925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 CAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTA 5812

 96539926 GAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGC 96539985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 GAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGC 5872

 96539986 CTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCA 96540045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 CTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCA 5932

 96540046 GAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATG 96540105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 GAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATG 5992

 96540106 ATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTT 96540165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 ATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTT 6052

 96540166 GCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACA 96540225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 GCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACA 6112

 96540226 ATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGC 96540285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 ATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGC 6172

 96540286 TTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAA 96540345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 TTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAA 6232

 96540346 GACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATC 96540405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 GACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATC 6292

 96540406 TCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAA 96540465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 TCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAA 6352

 96540466 AATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGG 96540525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 AATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGG 6412

 96540526 AAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGAT 96540585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 AAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGAT 6472

 96540586 GACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTC 96540645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 GACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTC 6532

 96540646 TGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCA 96540705
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 TGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCA 6592

 96540706 GCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACG 96540765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 GCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACG 6652

 96540766 CTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTT 96540825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 CTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTT 6712

 96540826 GGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTT 96540885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 GGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTT 6772

 96540886 TTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTA 96540945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 TTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTA 6832

 96540946 TGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTA 96541005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 TGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTA 6892

 96541006 AAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGT 96541065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 AAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGT 6952

 96541066 CAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGAT 96541125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 CAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGAT 7012

 96541126 GCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAAT 96541185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 GCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAAT 7072

 96541186 GCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGC 96541245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 GCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGC 7132

 96541246 TGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAAT 96541305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 TGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAAT 7192

 96541306 CAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGA 96541365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 CAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGA 7252

 96541366 AAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGC 96541425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 AAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGC 7312

 96541426 TTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACA 96541485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 TTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACA 7372

 96541486 CTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGG 96541545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 CTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGG 7432

 96541546 GATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATT 96541605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 GATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATT 7492

 96541606 TATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTA 96541665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 TATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTA 7552

 96541666 TAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAG 96541725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 TAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAG 7612

 96541726 TCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATC 96541785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 TCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATC 7672

 96541786 CACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTT 96541845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 CACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTT 7732

 96541846 AATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCT 96541905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7733 AATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCT 7792

 96541906 GAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATG 96541965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7793 GAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATG 7852

 96541966 AAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGC 96542025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7853 AAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGC 7912

 96542026 TTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGA 96542085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7913 TTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGA 7972

 96542086 TGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAAT 96542145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7973 TGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAAT 8032

 96542146 GTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGT 96542205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8033 GTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGT 8092

 96542206 GCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAA 96542265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8093 GCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAA 8152

 96542266 CATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAA 96542325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8153 CATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAA 8212

 96542326 TCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTT 96542385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8213 TCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTT 8272

 96542386 GTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATAT 96542445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8273 GTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATAT 8332

 96542446 TACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGT 96542505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8333 TACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGT 8392

 96542506 GGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGAT 96542565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8393 GGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGAT 8452

 96542566 GGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTA 96542625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8453 GGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTA 8512

 96542626 GTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGA 96542685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8513 GTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGA 8572

 96542686 GCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCC 96542745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8573 GCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCC 8632

 96542746 TGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTC 96542805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8633 TGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTC 8692

 96542806 TGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCAT 96542865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8693 TGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCAT 8752

 96542866 CTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTC 96542925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8753 CTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTC 8812

 96542926 TTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAG 96542985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8813 TTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAG 8872

 96542986 TTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTC 96543045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8873 TTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTC 8932

 96543046 TTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTG 96543105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8933 TTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTG 8992

 96543106 ATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATT 96543165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8993 ATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATT 9052

 96543166 ATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGC 96543225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9053 ATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGC 9112

 96543226 CATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9113 CATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 9169

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9253 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 9312

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9313 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 9372

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9373 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 9432

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9433 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 9492

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9493 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 9552

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9553 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 9612

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9613 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 9672

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9673 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 9732

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9733 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 9792

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9793 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 9852

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9853 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 9912

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9913 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 9972

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9973 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 10032

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10033 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 10092

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10093 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 10152

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10153 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 10212

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10213 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 10272

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10273 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 10332

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10333 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 10392

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10393 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 10452

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10453 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 10512

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10513 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 10572

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10573 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 10632

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10633 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 10692

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
    10693 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTG 10751

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 96548122
          ||||||||||||||||||||||||
    10752 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 10775

Alignment time is 14.6901 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5162] =>      5162 nucs 'mol-32-2fee-087189_5162'

Score:        4955
Aligned:      5157        nucs
Identic:      5137 (100%) nucs =>      2062 (100%)      3075 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542975,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548129]
 second seq =>  [       1,    2071] EXCISED REGION [    2080,    5162]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [2072,2079]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [2072,2110] to [2080,2118]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [2070,2071] to [2080,2081]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2072,2075] to [2076,2079]

 96542975 CTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCC 96543034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCC 60

 96543035 ACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAA 96543094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAA 120

 96543095 AAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCT 96543154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCT 180

 96543155 CTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAG 96543214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAG 240

 96543215 TCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTAC 96543274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTAC 300

 96543275 TTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCA 96543334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCA 360

 96543335 TCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGG 96543394
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGG 420

 96543395 AAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAAT 96543454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      421 AAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAAT 480

 96543455 GTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTT 96543514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTT 540

 96543515 CCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACC 96543574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACC 600

 96543575 TTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTA 96543634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTA 660

 96543635 CAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCA 96543694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCA 720

 96543695 ACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGT 96543754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGT 780

 96543755 TTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATA 96543814
          ||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATA 840

 96543815 TGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGA 96543874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGA 900

 96543875 ATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCA 96543934
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCA 960

 96543935 GCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACA 96543994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACA 1020

 96543995 TCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACT 96544054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACT 1080

 96544055 TCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAA 96544114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAA 1140

 96544115 ATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTA 96544173
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     1141 ATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTA 1200

 96544174 TTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTT 96544233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTT 1260

 96544234 TGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATC 96544293
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATC 1320

 96544294 ACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGA 96544353
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1321 ACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGA 1380

 96544354 ACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAAT 96544413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAAT 1440

 96544414 TATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTT 96544473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTT 1500

 96544474 TGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTC 96544533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTC 1560

 96544534 TACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCA 96544593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCA 1620

 96544594 GAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAA 96544653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAA 1680

 96544654 CTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTC 96544713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTC 1740

 96544714 AACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCT 96544773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCT 1800

 96544774 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGA 96544833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGA 1860

 96544834 CCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCAT 96544893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCAT 1920

 96544894 GGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAAC 96544953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAAC 1980

 96544954 CCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACA 96545013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACA 2040

 96545014 AGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 2071

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 2139

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2140 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 2199

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 2259

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 2319

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 2379

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 2439

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 2499

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 2559

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 2619

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 2679

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2680 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 2739

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 2799

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 2859

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 2919

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 2979

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 3039

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 3099

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 3159

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3160 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 3219

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3220 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 3279

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 3339

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 3399

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 3459

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 3519

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 3579

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     3580 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 3636

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 3696

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 3756

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 3816

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 3876

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 3936

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 3996

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 4056

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 4116

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 4176

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 4236

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 4296

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 4356

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 4416

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 4476

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 4536

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 4596

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 4656

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 4716

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 4776

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 4836

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 4896

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 4956

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 5016

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5017 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 5076

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACG 96548103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     5077 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACG 5136

 96548104 GAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGG 96548129
          ||||||||||||||||||||||||||
     5137 GAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGG 5162

Alignment time is 7.1716 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4060] =>      4060 nucs 'mol-32-2ff9-004801_4060'

Score:        3868
Aligned:      3980        nucs
Identic:      3969 (100%) nucs =>      1858 (100%)      2111 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541424,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548719]
 second seq =>  [       1,    1859] EXCISED REGION [    1943,    4060]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1860,1942]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1858,1859] to [1943,1944]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541424 GCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCA 96541483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCA 60

 96541484 CACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGT 96541543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGT 120

 96541544 GGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAA 96541603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAA 180

 96541604 TTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACT 96541663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACT 240

 96541664 TATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAA 96541723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAA 300

 96541724 AGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAA 96541783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAA 360

 96541784 TCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTT 96541843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTT 420

 96541844 TTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTT 96541903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTT 480

 96541904 CTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAA 96541963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAA 540

 96541964 TGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGT 96542023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGT 600

 96542024 GCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCT 96542083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCT 660

 96542084 GATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAA 96542143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAA 720

 96542144 ATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTA 96542203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTA 780

 96542204 GTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATT 96542263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATT 840

 96542264 AACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTA 96542323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTA 900

 96542324 AATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGAT 96542383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGAT 960

 96542384 TTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTAT 96542443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTAT 1020

 96542444 ATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTA 96542503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTA 1080

 96542504 GTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAG 96542563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAG 1140

 96542564 ATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGC 96542623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGC 1200

 96542624 TAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTA 96542683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTA 1260

 96542684 GAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTC 96542743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTC 1320

 96542744 CCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTT 96542803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTT 1380

 96542804 TCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTC 96542863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTC 1440

 96542864 ATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCC 96542923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCC 1500

 96542924 TCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTT 96542983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1501 TCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCT 1560

 96542984 AGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCC 96543043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCC 1620

 96543044 TCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCAT 96543103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCAT 1680

 96543104 TGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTA 96543163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTA 1740

 96543164 TTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACC 96543223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACC 1800

 96543224 GCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 1859

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 2002

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 2062

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 2122

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 2182

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2242

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2302

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2362

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2422

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 2482

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2542

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2602

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2662

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 2722

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 2782

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 2842

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 2902

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 2962

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 3022

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 3082

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 3142

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 3202

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 3262

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 3322

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 3382

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
     3383 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC--TTTTTTTTTTTTTTTG 3440

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3441 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 3500

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3501 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 3560

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAAT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 3619

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 3679

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 3739

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 3799

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 96548518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 3859

 96548519 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 96548578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 3919

 96548579 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 96548638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 3979

 96548639 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 96548698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 4039

 96548699 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAA 96548719
          |||||||||||||||||||||
     4040 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAA 4060

Alignment time is 6.07211 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4035] =>      4035 nucs 'mol-32-2ff9-074945_4035'

Score:        3873
Aligned:      4027        nucs
Identic:      4013 (100%) nucs =>      2608 (100%)      1405 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542428,96545044] EXCISED REGION [96545045,96546454]
 second seq =>  [       1,    2617] EXCISED REGION [    2626,    4035]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [2618,2625]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [2618,2656] to [2626,2664]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [2616,2617] to [2626,2627]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2618,2621] to [2622,2625]

 96542428 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 96542487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 60

 96542488 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 96542547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 120

 96542548 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 96542607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 180

 96542608 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 96542667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 240

 96542668 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 96542727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 300

 96542728 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 96542787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 360

 96542788 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 96542847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 420

 96542848 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 96542907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 480

 96542908 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 96542967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 540

 96542968 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 96543027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 600

 96543028 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 96543087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 660

 96543088 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 96543147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 720

 96543148 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 96543207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 780

 96543208 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 96543267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 840

 96543268 TCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCAC 96543327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCAC 900

 96543328 TGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACA 96543387
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACA 960

 96543388 GTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTG 96543447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      961 GTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTG 1020

 96543448 AGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCC 96543507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCC 1080

 96543508 ACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAA 96543567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAA 1140

 96543568 TAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTAT 96543627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTAT 1200

 96543628 TAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTG 96543687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTG 1260

 96543688 CTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGT 96543747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGT 1320

 96543748 TACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACA 96543807
          |||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACA 1380

 96543808 TTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAA 96543867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAA 1440

 96543868 CGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACT 96543927
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACT 1500

 96543928 AGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAA 96543987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAA 1560

 96543988 GCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAG 96544047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAG 1620

 96544048 GGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAG 96544107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAG 1680

 96544108 AAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAC 96544167
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAC 1740

 96544168 ATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGC 96544227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGC 1800

 96544228 TGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATA 96544287
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATA 1860

 96544288 TCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTG 96544347
          ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1861 TCCAACACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTG 1920

 96544348 ATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATT 96544407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATT 1980

 96544408 GTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTG 96544467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTG 2040

 96544468 AAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCA 96544527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCA 2100

 96544528 CTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACA 96544587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACA 2160

 96544588 TTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTT 96544647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTT 2220

 96544648 GACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACT 96544707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACT 2280

 96544708 TACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTC 96544767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTC 2340

 96544768 ATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGT 96544827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGT 2400

 96544828 TCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCA 96544887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCA 2460

 96544888 GGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCAC 96544947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCAC 2520

 96544948 TTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGG 96545007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGG 2580

 96545008 GTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 2617

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 2685

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2686 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 2745

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 2805

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 2865

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 2925

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 2985

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 3045

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 3105

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 3165

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 3225

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3226 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 3285

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 3345

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 3405

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 3465

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 3525

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 3585

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 3645

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 3705

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3706 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 3765

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3766 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 3825

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3826 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATTATTCTGCATAGTGCCAAG 3885

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 3945

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 4005

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTA 96546454
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTA 4035

Alignment time is 6.00278 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9929] =>      9929 nucs 'mol-32-3025-066394_9929'

Score:        9527
Aligned:      9934        nucs
Identic:      9888 (100%) nucs =>      1748 ( 99%)      8140 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96536758,96538514] EXCISED REGION [96538525,96546689]
 second seq =>  [       1,    1759] EXCISED REGION [    1760,    9929]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [96538515,96538524]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [96538515,96538546] to [96538525,96538556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96538515,96538518] to [96538521,96538524]
 second seq =>         0 nucs

 96536758 ATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATT 96536817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATT 60

 96536818 AAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAAT 96536877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAAT 120

 96536878 AAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCT 96536937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCT 180

 96536938 GACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAA 96536997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAA 240

 96536998 TCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAAT 96537057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAAT 300

 96537058 ATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGA 96537117
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCCCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGA 360

 96537118 GTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAA 96537177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAA 420

 96537178 AGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGAT 96537237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGAT 480

 96537238 GCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGC 96537297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGC 540

 96537298 TAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTT 96537357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTT 600

 96537358 TATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGA 96537417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGA 660

 96537418 ACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACC 96537477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACC 720

 96537478 AGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCA 96537537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCA 780

 96537538 TAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTA 96537597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTA 840

 96537598 TTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGA 96537657
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAATCCTCGCAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGA 900

 96537658 TATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGT 96537717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGT 960

 96537718 GCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAA 96537777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAA 1020

 96537778 GCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTC 96537837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTC 1080

 96537838 TCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGT 96537897
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTAAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGT 1140

 96537898 GAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGA 96537957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGA 1200

 96537958 ATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTC 96538017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTC 1260

 96538018 CTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTA 96538077
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTCAAGACTACTATTGTCCAACGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTA 1320

 96538078 CATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACT 96538137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACT 1380

 96538138 GGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAA 96538197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1381 GGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCCCAGATAGTGACTTCTAAAAAAAA 1440

 96538198 GAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCC 96538257
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCC 1500

 96538258 CCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAA 96538317
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
     1501 CCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATATCAAA 1560

 96538318 CTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGA 96538377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1561 CTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATATATTGGATGTAAAGA 1620

 96538378 AAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCA 96538437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCA 1680

 96538438 AGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGT-- 96538495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     1681 AGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1740

 96538496 ATGTATATATTCTCCACTC 96538514
          |||||||||||||||||||
     1741 ATGTATATATTCTCCACTC 1759

EXCISED REGION

 96538525 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 96538584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 1819

 96538585 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 96538644
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCATCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 1879

 96538645 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 96538704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 1939

 96538705 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 96538764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 1999

 96538765 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 96538824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 2059

 96538825 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 96538884
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGAAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 2119

 96538885 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGT 96538944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2120 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAATGCAGAGAGAGATTTTTGT 2179

 96538945 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 96539004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 2239

 96539005 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 96539064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 2299

 96539065 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 96539124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 2359

 96539125 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 96539184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 2419

 96539185 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 96539244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 2479

 96539245 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 96539304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 2539

 96539305 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 96539364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 2599

 96539365 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 96539424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 2659

 96539425 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 96539484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 2719

 96539485 AAGATTACTAAGC-AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 96539543
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 2779

 96539544 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 96539603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 2839

 96539604 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 96539663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 2899

 96539664 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 96539723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 2959

 96539724 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 96539783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 3019

 96539784 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 96539843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 3079

 96539844 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 96539903
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 3139

 96539904 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 96539963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 3199

 96539964 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 96540023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 3259

 96540024 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 96540083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 3319

 96540084 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 96540143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 3379

 96540144 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 96540203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 3439

 96540204 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 96540263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 3499

 96540264 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 96540323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 3559

 96540324 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 96540383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 3619

 96540384 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 96540443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 3679

 96540444 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 96540503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 3739

 96540504 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 96540563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 3799

 96540564 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 96540623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 3859

 96540624 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 96540683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 3919

 96540684 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 96540743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 3979

 96540744 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 96540803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 4039

 96540804 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 96540863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4040 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 4099

 96540864 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 96540923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 4159

 96540924 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 96540983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 4219

 96540984 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 96541043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 4279

 96541044 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 96541103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 4339

 96541104 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 96541163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 4399

 96541164 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 96541223
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 4459

 96541224 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 96541283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 4519

 96541284 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 96541343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 4579

 96541344 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 96541403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 4639

 96541404 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 96541463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 4699

 96541464 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 96541523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 4759

 96541524 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 96541583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 4819

 96541584 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 96541643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 4879

 96541644 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 96541703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 4939

 96541704 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 96541763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 4999

 96541764 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 96541823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 5059

 96541824 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 96541883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 5119

 96541884 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 96541943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 5179

 96541944 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 96542003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 5239

 96542004 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 96542063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 5299

 96542064 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 96542123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 5359

 96542124 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 96542183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 5419

 96542184 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 96542243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5420 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCA 5479

 96542244 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 96542303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 5539

 96542304 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 96542363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 5599

 96542364 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 96542423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 5659

 96542424 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 96542483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 5719

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 5779

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 5839

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 5899

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 5959

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 6019

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 6079

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 6139

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 6199

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 6259

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 6319

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 6379

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 6439

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 6499

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 96543323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 6559

 96543324 GCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 96543383
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 GCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 6619

 96543384 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACG 96543443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6620 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACG 6679

 96543444 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 96543503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 6739

 96543504 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 96543563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 6799

 96543564 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 96543623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 6859

 96543624 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 96543683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6860 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 6919

 96543684 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 96543743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6920 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 6979

 96543744 TTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 96543803
          |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6980 TTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 7039

 96543804 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 96543863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7040 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 7099

 96543864 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 96543923
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     7100 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 7159

 96543924 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 96543983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7160 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 7219

 96543984 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 96544043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7220 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 7279

 96544044 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 96544103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7280 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 7339

 96544104 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAA 96544162
          ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| |||||
     7340 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAA 7399

 96544163 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 96544222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7400 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 7459

 96544223 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 96544282
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7460 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 7519

 96544283 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTT 96544342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7520 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTT 7579

 96544343 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 96544402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7580 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 7639

 96544403 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 96544462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7640 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 7699

 96544463 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 96544522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7700 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 7759

 96544523 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 96544582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7760 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 7819

 96544583 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 96544642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7820 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 7879

 96544643 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 96544702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7880 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 7939

 96544703 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 96544762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7940 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 7999

 96544763 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 96544822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8000 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 8059

 96544823 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 96544882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8060 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 8119

 96544883 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 96544942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8120 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 8179

 96544943 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 96545002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8180 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 8239

 96545003 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT--------ATACATACAT 96545054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||
     8240 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATATATACATACATACATACAT 8299

 96545055 ACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTG 96545114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8300 ACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTG 8359

 96545115 AAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCC 96545174
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     8360 AAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCC 8419

 96545175 TTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCAT 96545234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8420 TTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCAT 8479

 96545235 CTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGC 96545294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8480 CTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGC 8539

 96545295 AGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGT 96545354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8540 AGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGT 8599

 96545355 TGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACA 96545414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8600 TGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACA 8659

 96545415 ACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACG 96545474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8660 ACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACG 8719

 96545475 AACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAA 96545534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8720 AACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAA 8779

 96545535 AGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAA 96545594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8780 AGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAA 8839

 96545595 GTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACC 96545654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8840 GTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACC 8899

 96545655 CATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGC 96545714
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8900 CATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGC 8959

 96545715 TTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTC 96545774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8960 TTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTC 9019

 96545775 CATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAG 96545834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9020 CATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAG 9079

 96545835 AAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAAT 96545894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9080 AAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAAT 9139

 96545895 TAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCT 96545954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9140 TAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCT 9199

 96545955 CCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAG 96546014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9200 CCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAG 9259

 96546015 GTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACAT 96546074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9260 GTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACAT 9319

 96546075 TATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGC 96546134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9320 TATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGC 9379

 96546135 TGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTCTATACAAATA 96546194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     9380 TGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTCTATACAAATA 9439

 96546195 GAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAAT 96546254
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9440 GAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAAT 9499

 96546255 ACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAAC 96546314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9500 ACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAAC 9559

 96546315 TGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATAT 96546374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9560 TGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATAT 9619

 96546375 TTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATA 96546434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9620 TTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATA 9679

 96546435 AAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAG 96546494
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||  |||||||||||||||||||||||||
     9680 AAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATTATTTC--TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAG 9737

 96546495 TCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGG 96546554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9738 TCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGG 9797

 96546555 CCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCC 96546614
          ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9798 CCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCC 9854

 96546615 CGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAG 96546674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9855 CGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAG 9914

 96546675 CCAGGATGGTCTCGA 96546689
          |||||||||||||||
     9915 CCAGGATGGTCTCGA 9929

Alignment time is 13.3541 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6346] =>      6346 nucs 'mol-32-3030-001019_6346'

Score:        6139
Aligned:      6341        nucs
Identic:      6321 (100%) nucs =>      3257 (100%)      3064 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541779,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548118]
 second seq =>  [       1,    3267] EXCISED REGION [    3276,    6346]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3268,3275]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3268,3306] to [3276,3314]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [3266,3267] to [3276,3277]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3268,3271] to [3272,3275]

 96541779 AGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTG 96541838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTG 60

 96541839 AATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCT 96541898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCT 120

 96541899 TATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAG 96541958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAG 180

 96541959 GAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAAC 96542018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAAC 240

 96542019 ATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTG 96542078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTG 300

 96542079 CTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCA 96542138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCA 360

 96542139 GTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATAC 96542198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATAC 420

 96542199 TATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCA 96542258
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCA 480

 96542259 TCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGG 96542318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGG 540

 96542319 CCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTG 96542378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTG 600

 96542379 TTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAAC 96542438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAAC 660

 96542439 TTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTT 96542498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTT 720

 96542499 GCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATA 96542558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATA 780

 96542559 ATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCC 96542618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCC 840

 96542619 CATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCC 96542678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCC 900

 96542679 TGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTA 96542738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTA 960

 96542739 TTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCG 96542798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCG 1020

 96542799 AGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAG 96542858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAG 1080

 96542859 CCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCC 96542918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCC 1140

 96542919 TGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCT 96542978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCT 1200

 96542979 CTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACAC 96543038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACAC 1260

 96543039 CTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGT 96543098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGT 1320

 96543099 CCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCA 96543158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCA 1380

 96543159 TCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTT 96543218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTT 1440

 96543219 CTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTC 96543278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTC 1500

 96543279 AACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCAT 96543338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCAT 1560

 96543339 GATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAAT 96543398
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAAT 1620

 96543399 GTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGG 96543458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGG 1680

 96543459 CATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAG 96543518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAG 1740

 96543519 GGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTAT 96543578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTAT 1800

 96543579 TTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAAT 96543638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAAT 1860

 96543639 GAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCT 96543698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCT 1920

 96543699 GCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTA 96543758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTA 1980

 96543759 AGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGAC 96543818
          .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGAC 2040

 96543819 AAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGC 96543878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGC 2100

 96543879 AAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCC 96543938
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCC 2160

 96543939 CCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAG 96543998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAG 2220

 96543999 CCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCT 96544058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCT 2280

 96544059 GGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGT 96544118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGT 2340

 96544119 TATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGA 96544177
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     2341 TATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGA 2400

 96544178 GGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGA 96544237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGA 2460

 96544238 GACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTT 96544297
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTT 2520

 96544298 CAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAG 96544357
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2521 CAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAG 2580

 96544358 AATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATG 96544417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATG 2640

 96544418 GGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTA 96544477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTA 2700

 96544478 CCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACT 96544537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACT 2760

 96544538 CTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAAT 96544597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAAT 2820

 96544598 GAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTC 96544657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTC 2880

 96544658 AACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACA 96544717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACA 2940

 96544718 TAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAA 96544777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAA 3000

 96544778 TCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAG 96544837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAG 3060

 96544838 CCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTG 96544897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTG 3120

 96544898 GCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAG 96544957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAG 3180

 96544958 GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAG 96545017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAG 3240

 96545018 CAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          |||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 3267

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 3335

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3336 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 3395

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3455

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 3515

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 3575

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 3635

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 3695

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 3755

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 3815

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 3875

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3876 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 3935

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 3995

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 4055

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 4115

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 4175

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 4235

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 4295

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 4355

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4356 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 4415

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4416 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4475

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 4535

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 4595

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 4655

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 4715

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 4775

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     4776 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 4832

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 4892

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 4952

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 5012

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 5072

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 5132

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 5192

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 5252

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 5312

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 5372

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 5432

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 5492

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 5552

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 5612

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 5672

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5673 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 5732

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5733 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 5792

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5793 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 5852

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5853 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 5912

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5913 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 5972

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5973 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 6032

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6033 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 6092

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6093 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 6152

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6153 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 6212

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6213 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 6272

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 96548104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6273 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 6332

 96548105 AGATTCGCTCTGTC 96548118
          ||||||||||||||
     6333 AGATTCGCTCTGTC 6346

Alignment time is 8.85616 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5093] =>      5093 nucs 'mol-32-3046-026525_5093'

Score:        4920
Aligned:      5085        nucs
Identic:      5070 (100%) nucs =>      3767 (100%)      1303 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541268,96545044] EXCISED REGION [96545045,96546351]
 second seq =>  [       1,    3778] EXCISED REGION [    3787,    5093]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3779,3786]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3779,3817] to [3787,3825]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [3777,3778] to [3787,3788]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3779,3782] to [3783,3786]

 96541268 ATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTA 96541327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTA 60

 96541328 CTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTT 96541387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTT 120

 96541388 TATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAA 96541447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAA 180

 96541448 ATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGG 96541507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGG 240

 96541508 TAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTA 96541567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTA 300

 96541568 CCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATA 96541627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATA 360

 96541628 ATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAG 96541687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAG 420

 96541688 TAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCA 96541747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCA 480

 96541748 TTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATT 96541807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATT 540

 96541808 CAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAA 96541867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAA 600

 96541868 GATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATAT 96541927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATAT 660

 96541928 TATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATG 96541987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATG 720

 96541988 TGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCT 96542047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCT 780

 96542048 GCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCA 96542107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCA 840

 96542108 TACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCA 96542167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCA 900

 96542168 GTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACT 96542227
          ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      901 GTCCATGGTAGTTGCACCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCT 960

 96542228 TCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTC 96542287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTC 1020

 96542288 AAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTAC 96542347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTAC 1080

 96542348 ATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATA 96542407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATA 1140

 96542408 AAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTC 96542467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTC 1200

 96542468 TTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTAT 96542527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTAT 1260

 96542528 AGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTT 96542587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTT 1320

 96542588 ACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTA 96542647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTA 1380

 96542648 GCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAA 96542707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAA 1440

 96542708 CATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCA 96542767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCA 1500

 96542768 TTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCA 96542827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCA 1560

 96542828 TCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCT 96542887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCT 1620

 96542888 CATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCA 96542947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCA 1680

 96542948 TGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAG 96543007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAG 1740

 96543008 AACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGC 96543067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGC 1800

 96543068 AACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTT 96543127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTT 1860

 96543128 CATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAA 96543187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAA 1920

 96543188 TCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCC 96543247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCC 1980

 96543248 TAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGAC 96543307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGAC 2040

 96543308 AGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAAC 96543367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAAC 2100

 96543368 AGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGAC 96543427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGAC 2160

 96543428 GGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTT 96543487
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTT 2220

 96543488 TTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTG 96543547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTG 2280

 96543548 ACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAG 96543607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAG 2340

 96543608 TAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCC 96543667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCC 2400

 96543668 TCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATA 96543727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATA 2460

 96543728 TCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGA 96543787
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
     2461 TCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGA 2520

 96543788 TTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATT 96543847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATT 2580

 96543848 TAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGG 96543907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2581 TAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGG 2640

 96543908 TGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAG 96543967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAG 2700

 96543968 CCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAG 96544027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAG 2760

 96544028 AACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACA 96544087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACA 2820

 96544088 GTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATC 96544147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2821 GTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATC 2880

 96544148 AAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACA 96544206
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACA 2940

 96544207 TATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAAC 96544266
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2941 TATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAAC 3000

 96544267 ACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTT 96544326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTT 3060

 96544327 GTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATT 96544386
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATT 3120

 96544387 TTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGC 96544446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGC 3180

 96544447 ACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCT 96544506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCT 3240

 96544507 CACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAG 96544566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAG 3300

 96544567 ATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAA 96544626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAA 3360

 96544627 TAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAAC 96544686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAAC 3420

 96544687 AAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAG 96544746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAG 3480

 96544747 CTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGT 96544806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGT 3540

 96544807 GGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCT 96544866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCT 3600

 96544867 ACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGG 96544926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGG 3660

 96544927 AGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCA 96544986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCA 3720

 96544987 TGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 3778

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 3846

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3847 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 3906

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3966

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 4026

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 4086

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 4146

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 4206

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 4266

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 4326

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 4386

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4387 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 4446

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 4506

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 4566

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 4626

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 4686

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 4746

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 4806

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 4866

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4867 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 4926

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4986

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 5046

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCT 96546351
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCT 5093

Alignment time is 7.09929 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9371] =>      9371 nucs 'mol-32-30f6-160815_9371'

Score:        9018
Aligned:      9372        nucs
Identic:      9339 (100%) nucs =>      3656 (100%)      5683 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96534843,96538514] EXCISED REGION [96538525,96544220]
 second seq =>  [       1,    3673] EXCISED REGION [    3674,    9371]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [96538515,96538524]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [96538515,96538546] to [96538525,96538556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96538515,96538518] to [96538521,96538524]
 second seq =>         0 nucs

 96534843 TATTCATTCACCCATCTCTTATTCAGATCAGAGACATTCTCACAGACCATATCCAGACTA 96534902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTCATTCACCCATCTCTTATTCAGATCAGAGACATTCTCACAGACCATATCCAGACTA 60

 96534903 AAGAGCATTCTGAATATTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAATTTTAGAGACAGGGTCTC 96534962
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGAGGATTCTGAATATTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAATTTTAGAGACAGGGTCTC 120

 96534963 ACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCTCAGCCTCAACATT 96535022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      121 ACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCGCAGCCTCAACATT 180

 96535023 CTGGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACAGGCATCCAC 96535082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACAGGCATCCAC 240

 96535083 CCCAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGTCCAGGCTGT 96535142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGTCCAGGCTGT 300

 96535143 CTTGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATGAAG 96535202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATGAAG 360

 96535203 GCATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTAAAATCCAAC 96535262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTAAAATCCAAC 420

 96535263 TCAAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACACACTCCAGGCAGAATCCTAGAAAG 96535322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      421 TCAAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACATACTCCAGGCAGAATCCTAGAAAG 480

 96535323 CTCTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCTGTTTCTTCA 96535382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCTGTTTCTTCA 540

 96535383 CAAAGTCACTATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAAGGTATGAGA 96535442
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAGTCACTATTTTAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAAGGTATGAGA 600

 96535443 CACAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAATTGTTA 96535502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAATTGTTA 660

 96535503 GCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCATTCGTG 96535562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCATTCGTG 720

 96535563 GTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATTCGGTT 96535622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATTCGGTT 780

 96535623 AATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTTTCTAC 96535682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTTTCTAC 840

 96535683 AGGAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTATCCTGC 96535742
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGAGCTTATAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTATCCTGC 900

 96535743 AACCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGACCCCA 96535802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGACCCCA 960

 96535803 AAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAAAAAAT 96535862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAAAAAAT 1020

 96535863 CAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGTTATAT 96535922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGTTATAT 1080

 96535923 GTTTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAATTGTG 96535982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAATTGTG 1140

 96535983 ATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGATGCTG 96536042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGATGCTG 1200

 96536043 TGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGTTGTGT 96536102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGTTGTGT 1260

 96536103 TATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATTCATATGCACTCATAGA 96536162
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAATATTTCATTCATTCATATGCACTCATAGA 1320

 96536163 AATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTA 96536222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTA 1380

 96536223 GATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACA 96536282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACA 1440

 96536283 GGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGG 96536342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGG 1500

 96536343 TATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAG 96536402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAG 1560

 96536403 AATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGT 96536462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGT 1620

 96536463 TTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTA 96536522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTA 1680

 96536523 ATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGG 96536582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGG 1740

 96536583 CTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTAT 96536642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTAT 1800

 96536643 TGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCAC 96536702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCAC 1860

 96536703 TGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGCCTTTAAAATGATCTA 96536762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1861 TGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGTCTTTAAAATGATCTA 1920

 96536763 AGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGA 96536822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGA 1980

 96536823 GGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGT 96536882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGT 2040

 96536883 ATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACAC 96536942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACAC 2100

 96536943 ATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATA 96537002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATA 2160

 96537003 TTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCA 96537062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCA 2220

 96537063 CCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTT 96537122
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCCCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTT 2280

 96537123 GGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGC 96537182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGC 2340

 96537183 TGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGC 96537242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGC 2400

 96537243 AACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTG 96537302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTG 2460

 96537303 CTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAA 96537362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAA 2520

 96537363 ATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAG 96537422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAG 2580

 96537423 ACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAG 96537482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAG 2640

 96537483 AGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATT 96537542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATT 2700

 96537543 AATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAA 96537602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAA 2760

 96537603 TCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCG 96537662
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCCTCGCAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCG 2820

 96537663 AGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAA 96537722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAA 2880

 96537723 GCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATC 96537782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATC 2940

 96537783 ATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGA 96537842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGA 3000

 96537843 ATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAG 96537902
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTAAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAG 3060

 96537903 TTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACA 96537962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACA 3120

 96537963 AATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCA 96538022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCA 3180

 96538023 AGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATAT 96538082
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGACTACTATTGTCCAACGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATAT 3240

 96538083 TGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCC 96538142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCC 3300

 96538143 CCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAAC 96538202
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCCCAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAAC 3360

 96538203 CAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGT 96538262
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAAAAAAAAAAAAAAAA-ACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGT 3419

 96538263 AAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAACTCAT 96538322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
     3420 AAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATATCAAACTCAT 3479

 96538323 CCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACT 96538382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3480 CCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATATATTGGATGTAAAGAAAACT 3539

 96538383 TACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTAT 96538442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTAT 3599

 96538443 CTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGT--ATGTA 96538500
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     3600 CTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTA 3659

 96538501 TATATTCTCCACTC 96538514
          ||||||||||||||
     3660 TATATTCTCCACTC 3673

EXCISED REGION

 96538525 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 96538584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 3733

 96538585 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 96538644
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCATCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 3793

 96538645 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 96538704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 3853

 96538705 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 96538764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 3913

 96538765 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 96538824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 3973

 96538825 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 96538884
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGAAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 4033

 96538885 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGT 96538944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4034 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAATGCAGAGAGAGATTTTTGT 4093

 96538945 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 96539004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 4153

 96539005 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 96539064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 4213

 96539065 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 96539124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 4273

 96539125 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 96539184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 4333

 96539185 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 96539244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 4393

 96539245 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 96539304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 4453

 96539305 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 96539364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 4513

 96539365 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 96539424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 4573

 96539425 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 96539484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 4633

 96539485 AAGATTACTAAGC-AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 96539543
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 AAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 4693

 96539544 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 96539603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 4753

 96539604 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 96539663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 4813

 96539664 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 96539723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 4873

 96539724 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 96539783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 4933

 96539784 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 96539843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 4993

 96539844 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 96539903
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 5053

 96539904 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 96539963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 5113

 96539964 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 96540023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 5173

 96540024 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 96540083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 5233

 96540084 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 96540143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 5293

 96540144 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 96540203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 5353

 96540204 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 96540263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 5413

 96540264 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 96540323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 5473

 96540324 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 96540383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 5533

 96540384 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 96540443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 5593

 96540444 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 96540503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 5653

 96540504 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 96540563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 5713

 96540564 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 96540623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 5773

 96540624 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 96540683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 5833

 96540684 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 96540743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 5893

 96540744 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 96540803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 5953

 96540804 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 96540863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5954 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 6013

 96540864 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 96540923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 6073

 96540924 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 96540983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 6133

 96540984 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 96541043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6134 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 6193

 96541044 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 96541103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6194 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 6253

 96541104 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 96541163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6254 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 6313

 96541164 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 96541223
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6314 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 6373

 96541224 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 96541283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6374 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 6433

 96541284 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 96541343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6434 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 6493

 96541344 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 96541403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6494 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 6553

 96541404 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 96541463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6554 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 6613

 96541464 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 96541523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6614 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 6673

 96541524 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 96541583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6674 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 6733

 96541584 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 96541643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6734 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 6793

 96541644 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 96541703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6794 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 6853

 96541704 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 96541763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6854 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 6913

 96541764 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 96541823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6914 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 6973

 96541824 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 96541883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6974 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 7033

 96541884 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 96541943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7034 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 7093

 96541944 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 96542003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7094 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 7153

 96542004 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 96542063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7154 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 7213

 96542064 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 96542123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7214 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 7273

 96542124 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 96542183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7274 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 7333

 96542184 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 96542243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     7334 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCA 7393

 96542244 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 96542303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7394 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 7453

 96542304 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 96542363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7454 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 7513

 96542364 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 96542423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7514 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 7573

 96542424 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 96542483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7574 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 7633

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7634 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 7693

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7694 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 7753

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7754 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 7813

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7814 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 7873

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 7933

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7934 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 7993

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7994 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 8053

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8054 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 8113

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8114 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 8173

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8174 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 8233

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8234 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 8293

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8294 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 8353

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8354 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 8413

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 96543323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8414 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 8473

 96543324 GCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 96543383
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8474 GCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 8533

 96543384 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACG 96543443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     8534 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACG 8593

 96543444 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 96543503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8594 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 8653

 96543504 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 96543563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8654 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 8713

 96543564 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 96543623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8714 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 8773

 96543624 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 96543683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8774 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 8833

 96543684 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 96543743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8834 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 8893

 96543744 TTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 96543803
          |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8894 TTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 8953

 96543804 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 96543863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8954 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 9013

 96543864 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 96543923
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     9014 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 9073

 96543924 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 96543983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9074 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 9133

 96543984 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 96544043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9134 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 9193

 96544044 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 96544103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9194 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 9253

 96544104 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAA 96544162
          ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| |||||
     9254 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAA 9313

 96544163 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATAC 96544220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9314 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATAC 9371

Alignment time is 12.6939 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9599] =>      9599 nucs 'mol-32-3101-054489_9599'

Score:        9387
Aligned:      9524        nucs
Identic:      9505 (100%) nucs =>      8311 (100%)      1194 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96534958,96543282] EXCISED REGION [96546599,96547795]
 second seq =>  [       1,    8319] EXCISED REGION [    8403,    9599]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [8320,8402]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [8318,8319] to [8403,8404]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96534958 GTCTCACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCTCAGCCTCA 96535017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCTCAGCCTCA 60

 96535018 ACATTCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACAGGCA 96535077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATTCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACAGGCA 120

 96535078 TCCACCCCAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGTCCAG 96535137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCACCCCAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGTCCAG 180

 96535138 GCTGTCTTGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGTA 96535197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGTCTTGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGTA 240

 96535198 TGAAGGCATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTAAAAT 96535257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAGGCATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTAAAAT 300

 96535258 CCAACTCAAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACACACTCCAGGCAGAATCCTA 96535317
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      301 CCAACTCAAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACATACTCCAGGCAGAATCCTA 360

 96535318 GAAAGCTCTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCTGTTT 96535377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAGCTCTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCTGTTT 420

 96535378 CTTCACAAAGTCACTATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAAGGTA 96535437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCACAAAGTCACTATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAAGGTA 480

 96535438 TGAGACACAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAAT 96535497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGACACAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAAT 540

 96535498 TGTTAGCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCAT 96535557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTTAGCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCAT 600

 96535558 TCGTGGTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATT 96535617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCGTGGTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATT 660

 96535618 CGGTTAATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTT 96535677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGGTTAATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTT 720

 96535678 TCTACAGGAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTAT 96535737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTACAGGAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTAT 780

 96535738 CCTGCAACCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGA 96535797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGCAACCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGA 840

 96535798 CCCCAAAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAA 96535857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCCAAAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAA 900

 96535858 AAAATCAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGT 96535917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATCAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGT 960

 96535918 TATATGTTTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAA 96535977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATATGTTTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAA 1020

 96535978 TTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGA 96536037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGA 1080

 96536038 TGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGT 96536097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGT 1140

 96536098 TGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATTCATATGCACTC 96536157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATTCATATGCACTC 1200

 96536158 ATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCC 96536217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCC 1260

 96536218 TTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACC 96536277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACC 1320

 96536278 ACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCC 96536337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCC 1380

 96536338 TCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTG 96536397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTG 1440

 96536398 GGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAG 96536457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAG 1500

 96536458 CTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGC 96536517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGC 1560

 96536518 AGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTG 96536577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTG 1620

 96536578 TTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAA 96536637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAA 1680

 96536638 AGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATT 96536697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATT 1740

 96536698 GTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGCCTTTAAAATG 96536757
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1741 GTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGTCTTTAAAATG 1800

 96536758 ATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATT 96536817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATT 1860

 96536818 AAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAAT 96536877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAAT 1920

 96536878 AAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCT 96536937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCT 1980

 96536938 GACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAA 96536997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAA 2040

 96536998 TCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAAT 96537057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAAT 2100

 96537058 ATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGA 96537117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGA 2160

 96537118 GTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAA 96537177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAA 2220

 96537178 AGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGAT 96537237
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGACCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGAT 2280

 96537238 GCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGC 96537297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGC 2340

 96537298 TAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTT 96537357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTT 2400

 96537358 TATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGA 96537417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGA 2460

 96537418 ACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACC 96537477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACC 2520

 96537478 AGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCA 96537537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCA 2580

 96537538 TAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTA 96537597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTA 2640

 96537598 TTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGA 96537657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGA 2700

 96537658 TATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGT 96537717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGT 2760

 96537718 GCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAA 96537777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAA 2820

 96537778 GCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTC 96537837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTC 2880

 96537838 TCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGT 96537897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGT 2940

 96537898 GAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGA 96537957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGA 3000

 96537958 ATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTC 96538017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTC 3060

 96538018 CTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTA 96538077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTA 3120

 96538078 CATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACT 96538137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACT 3180

 96538138 GGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAA 96538197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAA 3240

 96538198 GAAACCAAAAAAAAAAAAAAAA--GACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCT 96538255
          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCT 3300

 96538256 CCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCA 96538315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3301 CCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATGTCA 3360

 96538316 AACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAA 96538375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAA 3420

 96538376 GAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCT 96538435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCT 3480

 96538436 CAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGT 96538495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGT 3540

 96538496 ATGTATATATTCTCCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 96538555
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
     3541 ATGTATATATTCTCCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG------- 3593

 96538556 GACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGT 96538615
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 -ACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGT 3652

 96538616 GTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGA 96538675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 GTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGA 3712

 96538676 ATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTG 96538735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 ATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTG 3772

 96538736 TTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAG 96538795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAG 3832

 96538796 TCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGG 96538855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGG 3892

 96538856 GAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTA 96538915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 GAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTA 3952

 96538916 GAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAA 96538975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAA 4012

 96538976 CTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATC 96539035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 CTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATC 4072

 96539036 AGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATG 96539095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 AGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATG 4132

 96539096 CTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAAT 96539155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 CTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAAT 4192

 96539156 ATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTA 96539215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 ATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTA 4252

 96539216 ATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTA 96539275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 ATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTA 4312

 96539276 CAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAA 96539335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 CAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAA 4372

 96539336 ATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGA 96539395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 ATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGA 4432

 96539396 TGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAA 96539455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 TGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAA 4492

 96539456 AGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTT 96539515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 AGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTT 4552

 96539516 TCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAA 96539575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 TCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAA 4612

 96539576 AGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAA 96539635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 AGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAA 4672

 96539636 AGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGC 96539695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 AGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGC 4732

 96539696 TTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAG 96539755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 TTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAG 4792

 96539756 TGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTA 96539815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTA 4852

 96539816 CAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCT 96539875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 CAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCT 4912

 96539876 TCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATT 96539935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATT 4972

 96539936 TAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGG 96539995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 TAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGG 5032

 96539996 GGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACT 96540055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 GGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACT 5092

 96540056 GCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGA 96540115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 GCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGA 5152

 96540116 CTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGAC 96540175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 CTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGAC 5212

 96540176 AGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAG 96540235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 AGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAG 5272

 96540236 AATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACA 96540295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 AATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACA 5332

 96540296 GGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATAT 96540355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 GGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATAT 5392

 96540356 AGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAG 96540415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 AGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAG 5452

 96540416 ACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGT 96540475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 ACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGT 5512

 96540476 GCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTG 96540535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 GCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTG 5572

 96540536 AGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTA 96540595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 AGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTA 5632

 96540596 AGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCT 96540655
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5633 AGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCC 5692

 96540656 GAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAG 96540715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 GAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAG 5752

 96540716 TTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGAT 96540775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 TTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGAT 5812

 96540776 GAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAAT 96540835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 GAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAAT 5872

 96540836 ATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATA 96540895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 ATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATA 5932

 96540896 AAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTAT 96540955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 AAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTAT 5992

 96540956 AGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGAC 96541015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 AGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGAC 6052

 96541016 GTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCA 96541075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 GTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCA 6112

 96541076 TTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAG 96541135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 TTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAG 6172

 96541136 TTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTAT 96541195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 TTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTAT 6232

 96541196 TCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACA 96541255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 TCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACA 6292

 96541256 AGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGC 96541315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 AGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGC 6352

 96541316 TTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGA 96541375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGA 6412

 96541376 ACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATA 96541435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 ACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATA 6472

 96541436 CTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTC 96541495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 CTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTC 6532

 96541496 TTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAA 96541555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 TTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAA 6592

 96541556 TCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGT 96541615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 TCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGT 6652

 96541616 GTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATA 96541675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 GTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATA 6712

 96541676 TGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTT 96541735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 TGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTT 6772

 96541736 TGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTC 96541795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 TGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTC 6832

 96541796 TCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAA 96541855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 TCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAA 6892

 96541856 TGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTAC 96541915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 TGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTAC 6952

 96541916 TAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGA 96541975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 TAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGA 7012

 96541976 AAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTA 96542035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 AAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTA 7072

 96542036 GCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCC 96542095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 GCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCC 7132

 96542096 TGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCAT 96542155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 TGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCAT 7192

 96542156 GTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGG 96542215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 GTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGG 7252

 96542216 TCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATT 96542275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 TCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATT 7312

 96542276 CACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTC 96542335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 CACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTC 7372

 96542336 ATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAA 96542395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 ATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAA 7432

 96542396 AATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCA 96542455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 AATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCA 7492

 96542456 TTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAA 96542515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 TTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAA 7552

 96542516 TACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTT 96542575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 TACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTT 7612

 96542576 GTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTT 96542635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 GTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTT 7672

 96542636 TATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCT 96542695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 TATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCT 7732

 96542696 CCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCG 96542755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7733 CCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCG 7792

 96542756 GTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCT 96542815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7793 GTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCT 7852

 96542816 GATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCC 96542875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7853 GATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCC 7912

 96542876 TGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCC 96542935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7913 TGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCC 7972

 96542936 TTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTC 96542995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     7973 TTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTC 8032

 96542996 TTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTT 96543055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8033 TTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTT 8092

 96543056 CTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAG 96543115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8093 CTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAG 8152

 96543116 GTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCA 96543175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8153 GTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCA 8212

 96543176 CCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTA 96543235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8213 CCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTA 8272

 96543236 GTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8273 GTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 8319

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8403 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 8462

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8463 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 8522

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8523 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 8582

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8583 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 8642

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8643 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 8702

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8703 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 8762

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8763 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 8822

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8823 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 8882

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8883 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 8942

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8943 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 9002

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9003 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 9062

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9063 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 9122

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9123 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 9182

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9183 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 9242

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9243 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 9302

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9303 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 9362

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9363 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 9422

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9423 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 9482

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9483 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 9542

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCT 96547795
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9543 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCT 9599

Alignment time is 13.0306 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2624] =>      2624 nucs 'mol-32-3143-024555_2624'

Score:        2541
Aligned:      2618        nucs
Identic:      2611 (100%) nucs =>      2102 (100%)       509 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541654,96543758] EXCISED REGION [96543765,96544276]
 second seq =>  [       1,    2105] EXCISED REGION [    2112,    2624]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [96543759,96543764]
 second seq =>         6 nucs [2106,2111]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543759,96543759] to [96543765,96543765]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543758,96543758] to [96543765,96543765]
 second seq =>         1 nucs [2105,2105] to [2112,2112]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2106,2106] to [2111,2111]

 96541654 GTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAAT 96541713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAAT 60

 96541714 GGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAA 96541773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAA 120

 96541774 CCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTT 96541833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTT 180

 96541834 TCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAG 96541893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAG 240

 96541894 AACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTG 96541953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTG 300

 96541954 ATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGG 96542013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGG 360

 96542014 AAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACAT 96542073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACAT 420

 96542074 GAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGAC 96542133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGAC 480

 96542134 TTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGT 96542193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGT 540

 96542194 CATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTC 96542253
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTC 600

 96542254 ATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTC 96542313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTC 660

 96542314 TCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAA 96542373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAA 720

 96542374 ATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGG 96542433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGG 780

 96542434 TTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTT 96542493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTT 840

 96542494 ATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATT 96542553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATT 900

 96542554 TTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGG 96542613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGG 960

 96542614 CCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACT 96542673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACT 1020

 96542674 ACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTC 96542733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTC 1080

 96542734 AAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCT 96542793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCT 1140

 96542794 GCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTA 96542853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTA 1200

 96542854 CAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGG 96542913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGG 1260

 96542914 GCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCT 96542973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCT 1320

 96542974 CCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCC 96543033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCC 1380

 96543034 CACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGA 96543093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGA 1440

 96543094 AAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTC 96543153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTC 1500

 96543154 TCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACA 96543213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACA 1560

 96543214 GTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTA 96543273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTA 1620

 96543274 CTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCC 96543333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCC 1680

 96543334 ATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAG 96543393
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAG 1740

 96543394 GAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAA 96543453
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1741 GAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAA 1800

 96543454 TGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTT 96543513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTT 1860

 96543514 TCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTAC 96543573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTAC 1920

 96543574 CTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTT 96543633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTT 1980

 96543634 ACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGC 96543693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGC 2040

 96543694 AACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGG 96543753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGG 2100

 96543754 TTTTA 96543758
          |||||
     2101 TTTTA 2105

EXCISED REGION

 96543765 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 96543824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 2171

 96543825 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 96543884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 2231

 96543885 AAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 96543944
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 AAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 2291

 96543945 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 96544004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 2351

 96544005 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 96544064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 2411

 96544065 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 96544124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 2471

 96544125 TTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACA 96544183
          |||||||||.||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2472 TTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACA 2531

 96544184 AGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAG 96544243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAG 2591

 96544244 TATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATG 96544276
          .||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 CATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATG 2624

Alignment time is 4.11962 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5914] =>      5914 nucs 'mol-32-3143-250735_5914'

Score:        5740
Aligned:      5909        nucs
Identic:      5892 (100%) nucs =>      3540 (100%)      2352 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541496,96545044] EXCISED REGION [96545045,96547403]
 second seq =>  [       1,    3550] EXCISED REGION [    3559,    5914]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3551,3558]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3551,3589] to [3559,3597]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [3549,3550] to [3559,3560]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3551,3554] to [3555,3558]

 96541496 TTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAA 96541555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAA 60

 96541556 TCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGT 96541615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGT 120

 96541616 GTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATA 96541675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATA 180

 96541676 TGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTT 96541735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTT 240

 96541736 TGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTC 96541795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTC 300

 96541796 TCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAA 96541855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAA 360

 96541856 TGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTAC 96541915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTAC 420

 96541916 TAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGA 96541975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGA 480

 96541976 AAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTA 96542035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTA 540

 96542036 GCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCC 96542095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCC 600

 96542096 TGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCAT 96542155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCAT 660

 96542156 GTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGG 96542215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGG 720

 96542216 TCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATT 96542275
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATT 780

 96542276 CACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTC 96542335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTC 840

 96542336 ATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAA 96542395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAA 900

 96542396 AATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCA 96542455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCA 960

 96542456 TTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAA 96542515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAA 1020

 96542516 TACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTT 96542575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTT 1080

 96542576 GTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTT 96542635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTT 1140

 96542636 TATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCT 96542695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCT 1200

 96542696 CCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCG 96542755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCG 1260

 96542756 GTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCT 96542815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCT 1320

 96542816 GATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCC 96542875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCC 1380

 96542876 TGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCC 96542935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCC 1440

 96542936 TTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTC 96542995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTC 1500

 96542996 TTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTT 96543055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTT 1560

 96543056 CTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAG 96543115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAG 1620

 96543116 GTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCA 96543175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCA 1680

 96543176 CCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTA 96543235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTA 1740

 96543236 GTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATT 96543295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATT 1800

 96543296 TTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAAT 96543355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1801 TTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAAT 1860

 96543356 GAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAG 96543415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAG 1920

 96543416 GCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTT 96543475
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTT 1980

 96543476 TCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAA 96543535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAA 2040

 96543536 AAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGT 96543595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGT 2100

 96543596 TGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCC 96543655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCC 2160

 96543656 AACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAA 96543715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAA 2220

 96543716 CTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCC 96543775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||
     2221 CTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCC 2280

 96543776 TAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTT 96543835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTT 2340

 96543836 TTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAAT 96543895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2341 TTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAAT 2400

 96543896 TCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCAC 96543955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCAC 2460

 96543956 AGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCT 96544015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCT 2520

 96544016 GGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTT 96544075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTT 2580

 96544076 CTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCC 96544135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2581 CTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGC 2640

 96544136 TTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACA 96544194
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACA 2700

 96544195 AAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCAT 96544254
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2701 AAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCAT 2760

 96544255 GAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCA 96544314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCA 2820

 96544315 CCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCT 96544374
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCT 2880

 96544375 CTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAG 96544434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAG 2940

 96544435 TAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTT 96544494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTT 3000

 96544495 CCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTT 96544554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTT 3060

 96544555 TGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACA 96544614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACA 3120

 96544615 TGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTA 96544674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTA 3180

 96544675 AAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAA 96544734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAA 3240

 96544735 ATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 96544794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 3300

 96544795 GCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGA 96544854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGA 3360

 96544855 AACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCC 96544914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCC 3420

 96544915 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 96544974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 3480

 96544975 GAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAAT 96545034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAAT 3540

 96545035 GCATACATAT 96545044
          ||||||||||
     3541 GCATACATAT 3550

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 3618

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3619 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 3678

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3738

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 3798

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 3858

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 3918

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 3978

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 4038

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 4098

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 4158

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4159 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 4218

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 4278

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 4338

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 4398

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 4458

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 4518

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 4578

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 4638

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4639 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 4698

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4699 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4758

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 4818

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 4878

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 4938

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 4998

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 5058

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     5059 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 5115

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5116 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 5175

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5176 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 5235

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5236 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 5295

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5296 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 5355

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5356 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 5415

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5416 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 5475

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 5535

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 5595

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 5655

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 5715

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 5775

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5776 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 5835

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 5895

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTAC 96547403
          |||||||||||||||||||
     5896 CTTGTATTAAGTGAACTAC 5914

Alignment time is 8.18083 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2188] =>      2188 nucs 'mol-32-314e-024898_2188'

Score:        2094
Aligned:      2182        nucs
Identic:      2174 (100%) nucs =>      1328 (100%)       846 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542428,96543758] EXCISED REGION [96543765,96544614]
 second seq =>  [       1,    1331] EXCISED REGION [    1338,    2188]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [96543759,96543764]
 second seq =>         6 nucs [1332,1337]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543759,96543759] to [96543765,96543765]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543758,96543758] to [96543765,96543765]
 second seq =>         1 nucs [1331,1331] to [1338,1338]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1332,1332] to [1337,1337]

 96542428 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 96542487
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGGTTAACTTCATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 60

 96542488 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 96542547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 120

 96542548 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 96542607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 180

 96542608 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 96542667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 240

 96542668 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 96542727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 300

 96542728 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 96542787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 360

 96542788 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 96542847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 420

 96542848 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 96542907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 480

 96542908 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 96542967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 540

 96542968 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 96543027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 600

 96543028 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 96543087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 660

 96543088 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 96543147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 720

 96543148 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 96543207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 780

 96543208 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 96543267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 840

 96543268 TCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCAC 96543327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCAC 900

 96543328 TGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACA 96543387
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACA 960

 96543388 GTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTG 96543447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      961 GTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTG 1020

 96543448 AGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCC 96543507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCC 1080

 96543508 ACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAA 96543567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAA 1140

 96543568 TAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTAT 96543627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTAT 1200

 96543628 TAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTG 96543687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTG 1260

 96543688 CTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGT 96543747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGT 1320

 96543748 TACTGGTTTTA 96543758
          |||||||||||
     1321 TACTGGTTTTA 1331

EXCISED REGION

 96543765 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 96543824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 1397

 96543825 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 96543884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 1457

 96543885 AAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 96543944
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 AAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 1517

 96543945 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 96544004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 1577

 96544005 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 96544064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 1637

 96544065 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 96544124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 1697

 96544125 TTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACA 96544183
          |||||||||.||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     1698 TTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACA 1757

 96544184 AGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAG 96544243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 AGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAG 1817

 96544244 TATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAA 96544303
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 CATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAA 1877

 96544304 GTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTA 96544363
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1878 GTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTA 1937

 96544364 AGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATT 96544423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 AGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATT 1997

 96544424 ATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTT 96544483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 ATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTT 2057

 96544484 GACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGT 96544543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 GACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGT 2117

 96544544 CTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGA 96544603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 CTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGA 2177

 96544604 TACAAATCACA 96544614
          |||||||||||
     2178 TACAAATCACA 2188

Alignment time is 3.46854 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2001] =>      2001 nucs 'mol-32-314e-165011_2001'

Score:        1885
Aligned:      1918        nucs
Identic:      1915 (100%) nucs =>      1788 (100%)       127 ( 98%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541494,96543282] EXCISED REGION [96546599,96546727]
 second seq =>  [       1,    1789] EXCISED REGION [    1873,    2001]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1790,1872]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1788,1789] to [1873,1874]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541494 TCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCT 96541553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCT 60

 96541554 AATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCT 96541613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCT 120

 96541614 GTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAA 96541673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAA 180

 96541674 TATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAAT 96541733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAAT 240

 96541734 TTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTT 96541793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTT 300

 96541794 TCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTT 96541853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTT 360

 96541854 AATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGT 96541913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGT 420

 96541914 ACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGG 96541973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGG 480

 96541974 GAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTG 96542033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTG 540

 96542034 TAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATG 96542093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATG 600

 96542094 CCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGC 96542153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGC 660

 96542154 ATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAA 96542213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAA 720

 96542214 GGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTA 96542273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTA 780

 96542274 TTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATAT 96542333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATAT 840

 96542334 TCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATT 96542393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATT 900

 96542394 AAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGC 96542453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGC 960

 96542454 CATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAA 96542513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAA 1020

 96542514 AATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGT 96542573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGT 1080

 96542574 TTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGC 96542633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGC 1140

 96542634 TTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTC 96542693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTC 1200

 96542694 CTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGAT 96542753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGAT 1260

 96542754 CGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTC 96542813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTC 1320

 96542814 CTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCT 96542873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCT 1380

 96542874 CCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATC 96542933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATC 1440

 96542934 CCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATC 96542993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1441 CCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATC 1500

 96542994 TCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGC 96543053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGC 1560

 96543054 TTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCA 96543113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCA 1620

 96543114 AGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAG 96543173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAG 1680

 96543174 CACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAAT 96543233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAAT 1740

 96543234 TAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 1789

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1932

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1933 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGACCCGCCCGCCTCG 1992

 96546719 GCCTCCCAA 96546727
          |||||||||
     1993 GCCTCCCAA 2001

Alignment time is 3.06935 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3659] =>      3659 nucs 'mol-32-314e-260478_3659'

Score:        3505
Aligned:      3659        nucs
Identic:      3645 (100%) nucs =>      2252 (100%)      1393 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542784,96545044] EXCISED REGION [96545061,96546457]
 second seq =>  [       1,    2262] EXCISED REGION [    2263,    3659]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        16 nucs [96545045,96545060]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        23 nucs [96545045,96545067] to [96545061,96545083]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545061,96545062]
 second seq =>         2 nucs [2261,2262] to [2263,2264]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [96545045,96545052] to [96545053,96545060]
 second seq =>         0 nucs

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 60

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 120

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 180

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 240

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 300

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 360

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 420

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 480

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 96543323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 540

 96543324 GCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 96543383
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 600

 96543384 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACG 96543443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      601 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACG 660

 96543444 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 96543503
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGAGGAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 720

 96543504 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 96543563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 780

 96543564 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 96543623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 840

 96543624 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 96543683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 900

 96543684 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 96543743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 960

 96543744 TTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 96543803
          |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 1020

 96543804 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 96543863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 1080

 96543864 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 96543923
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 1140

 96543924 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 96543983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 1200

 96543984 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 96544043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 1260

 96544044 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 96544103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 1320

 96544104 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAA 96544163
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAA 1380

 96544164 AAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 96544222
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 1440

 96544223 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 96544282
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 1500

 96544283 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTT 96544342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1501 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTT 1560

 96544343 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 96544402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 1620

 96544403 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 96544462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 1680

 96544463 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 96544522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 1740

 96544523 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 96544582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 1800

 96544583 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 96544642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 1860

 96544643 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 96544702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 1920

 96544703 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 96544762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 1980

 96544763 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 96544822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 2040

 96544823 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 96544882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 2100

 96544883 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 96544942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 2160

 96544943 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 96545002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 2220

 96545003 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 2262

EXCISED REGION

 96545061 ATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTGAAAAAC 96545120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 ATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTGAAAAAC 2322

 96545121 TGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCCTTCTAT 96545180
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCCTTCTAT 2382

 96545181 TCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATCTAAAT 96545240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 TCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATCTAAAT 2442

 96545241 CAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGCAGAAAA 96545300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 CAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGCAGAAAA 2502

 96545301 TCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGTTGCAGA 96545360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 TCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGTTGCAGA 2562

 96545361 ATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACAACCCGA 96545420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 ATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACAACCCGA 2622

 96545421 AAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACGAACAAA 96545480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 AAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACGAACAAA 2682

 96545481 CTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAAAGAACT 96545540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 CTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAAAGAACT 2742

 96545541 TTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAAGTTAGG 96545600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAAGTTAGG 2802

 96545601 AAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCCATGGT 96545660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 AAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCCATGGT 2862

 96545661 TCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTTGAGT 96545720
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 TCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTTGAGT 2922

 96545721 CTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCATGTG 96545780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 CTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCATGTG 2982

 96545781 GGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAAAAAA 96545840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 GGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAAAAAA 3042

 96545841 ACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTAAAAC 96545900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 ACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTAAAAC 3102

 96545901 ATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTG 96545960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 ATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTG 3162

 96545961 ACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGAC 96546020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 ACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGAC 3222

 96546021 CAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGG 96546080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 CAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGG 3282

 96546081 TCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTAC 96546140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 TCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTAC 3342

 96546141 TAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTCTATACAAATAGAATAT 96546200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3343 TAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTCTATACAAATAGAATAT 3402

 96546201 TTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGT 96546260
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGT 3462

 96546261 TTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGT 96546320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 TTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGT 3522

 96546321 ATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTA 96546380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 ATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTA 3582

 96546381 TGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTC 96546440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTC 3642

 96546441 TTTTTAGATATCTATGG 96546457
          |||||||||||||||||
     3643 TTTTTAGATATCTATGG 3659

Alignment time is 5.37806 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2557] =>      2557 nucs 'mol-32-3164-183213_2557'

Score:        2507
Aligned:      2551        nucs
Identic:      2547 (100%) nucs =>      2222 (100%)       325 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541534,96543758] EXCISED REGION [96543765,96544090]
 second seq =>  [       1,    2225] EXCISED REGION [    2232,    2557]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [96543759,96543764]
 second seq =>         6 nucs [2226,2231]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543759,96543759] to [96543765,96543765]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543758,96543758] to [96543765,96543765]
 second seq =>         1 nucs [2225,2225] to [2232,2232]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2226,2226] to [2231,2231]

 96541534 TCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCAT 96541593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCAT 60

 96541594 ACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATAT 96541653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATAT 120

 96541654 GTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAAT 96541713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAAT 180

 96541714 GGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAA 96541773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAA 240

 96541774 CCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTT 96541833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTT 300

 96541834 TCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAG 96541893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAG 360

 96541894 AACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTG 96541953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTG 420

 96541954 ATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGG 96542013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGG 480

 96542014 AAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACAT 96542073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACAT 540

 96542074 GAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGAC 96542133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGAC 600

 96542134 TTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGT 96542193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGT 660

 96542194 CATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTC 96542253
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTC 720

 96542254 ATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTC 96542313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTC 780

 96542314 TCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAA 96542373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAA 840

 96542374 ATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGG 96542433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGG 900

 96542434 TTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTT 96542493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTT 960

 96542494 ATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATT 96542553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATT 1020

 96542554 TTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGG 96542613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGG 1080

 96542614 CCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACT 96542673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACT 1140

 96542674 ACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTC 96542733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTC 1200

 96542734 AAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCT 96542793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCT 1260

 96542794 GCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTA 96542853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTA 1320

 96542854 CAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGG 96542913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGG 1380

 96542914 GCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCT 96542973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCT 1440

 96542974 CCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCC 96543033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCC 1500

 96543034 CACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGA 96543093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGA 1560

 96543094 AAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTC 96543153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTC 1620

 96543154 TCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACA 96543213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACA 1680

 96543214 GTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTA 96543273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTA 1740

 96543274 CTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCC 96543333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCC 1800

 96543334 ATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAG 96543393
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAG 1860

 96543394 GAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAA 96543453
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1861 GAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAA 1920

 96543454 TGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTT 96543513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTT 1980

 96543514 TCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTAC 96543573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTAC 2040

 96543574 CTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTT 96543633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTT 2100

 96543634 ACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGC 96543693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGC 2160

 96543694 AACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGG 96543753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGG 2220

 96543754 TTTTA 96543758
          |||||
     2221 TTTTA 2225

EXCISED REGION

 96543765 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 96543824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 2291

 96543825 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 96543884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 2351

 96543885 AAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 96543944
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 AAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 2411

 96543945 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 96544004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 2471

 96544005 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 96544064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 2531

 96544065 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTG 96544090
          ||||||||||||||||||||||||||
     2532 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTG 2557

Alignment time is 3.8287 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2012] =>      2012 nucs 'mol-32-317a-163054_2012'

Score:        1989
Aligned:      2011        nucs
Identic:      2009 (100%) nucs =>       647 (100%)      1362 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541578,96542224] EXCISED REGION [96542226,96543589]
 second seq =>  [       1,     647] EXCISED REGION [     649,    2012]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [96542225,96542225]
 second seq =>         1 nucs [648,648]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541578 CTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTAT 96541637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTAT 60

 96541638 AAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGC 96541697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGC 120

 96541698 TCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAA 96541757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAA 180

 96541758 ATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAG 96541817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAG 240

 96541818 CTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTT 96541877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTT 300

 96541878 GAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTT 96541937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTT 360

 96541938 TCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTT 96541997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTT 420

 96541998 TTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTC 96542057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTC 480

 96542058 ATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTAT 96542117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTAT 540

 96542118 GGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTA 96542177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTA 600

 96542178 GTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAAT 96542224
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAAT 647

EXCISED REGION

 96542226 CTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTT 96542285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 CTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTT 708

 96542286 TCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTT 96542345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 TCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTT 768

 96542346 ACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGA 96542405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 ACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGA 828

 96542406 TAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTC 96542465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 TAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTC 888

 96542466 TCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTT 96542525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 TCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTT 948

 96542526 ATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGT 96542585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 ATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGT 1008

 96542586 TTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGG 96542645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 TTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGG 1068

 96542646 TAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACC 96542705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACC 1128

 96542706 AACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTC 96542765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 AACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTC 1188

 96542766 CATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGAC 96542825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 CATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGAC 1248

 96542826 CATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTT 96542885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 CATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTT 1308

 96542886 CTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAG 96542945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 CTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAG 1368

 96542946 CATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCAC 96543005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 CATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCAC 1428

 96543006 AGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAA 96543065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 AGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAA 1488

 96543066 GCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATAT 96543125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 GCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATAT 1548

 96543126 TTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTAC 96543185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTAC 1608

 96543186 AATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTAT 96543245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 AATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTAT 1668

 96543246 CCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTG 96543305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 CCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTG 1728

 96543306 ACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTA 96543365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1729 ACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTA 1788

 96543366 ACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCG 96543425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 ACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCG 1848

 96543426 ACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTG 96543485
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 ACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTG 1908

 96543486 TTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATT 96543545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 TTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATT 1968

 96543546 TGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGA 96543589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGA 2012

Alignment time is 3.26726 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6604] =>      6604 nucs 'mol-32-3190-043537_6604'

Score:        6387
Aligned:      6600        nucs
Identic:      6579 (100%) nucs =>      3540 (100%)      3039 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541496,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548094]
 second seq =>  [       1,    3550] EXCISED REGION [    3559,    6604]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3551,3558]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3551,3589] to [3559,3597]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [3549,3550] to [3559,3560]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3551,3554] to [3555,3558]

 96541496 TTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAA 96541555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAA 60

 96541556 TCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGT 96541615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGT 120

 96541616 GTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATA 96541675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATA 180

 96541676 TGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTT 96541735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTT 240

 96541736 TGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTC 96541795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTC 300

 96541796 TCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAA 96541855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAA 360

 96541856 TGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTAC 96541915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTAC 420

 96541916 TAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGA 96541975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGA 480

 96541976 AAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTA 96542035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTA 540

 96542036 GCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCC 96542095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCC 600

 96542096 TGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCAT 96542155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCAT 660

 96542156 GTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGG 96542215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGG 720

 96542216 TCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATT 96542275
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATT 780

 96542276 CACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTC 96542335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTC 840

 96542336 ATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAA 96542395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAA 900

 96542396 AATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCA 96542455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCA 960

 96542456 TTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAA 96542515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAA 1020

 96542516 TACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTT 96542575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTT 1080

 96542576 GTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTT 96542635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTT 1140

 96542636 TATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCT 96542695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCT 1200

 96542696 CCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCG 96542755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCG 1260

 96542756 GTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCT 96542815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCT 1320

 96542816 GATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCC 96542875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCC 1380

 96542876 TGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCC 96542935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCC 1440

 96542936 TTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTC 96542995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTC 1500

 96542996 TTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTT 96543055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTT 1560

 96543056 CTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAG 96543115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAG 1620

 96543116 GTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCA 96543175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCA 1680

 96543176 CCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTA 96543235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTA 1740

 96543236 GTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATT 96543295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATT 1800

 96543296 TTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAAT 96543355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1801 TTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAAT 1860

 96543356 GAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAG 96543415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAG 1920

 96543416 GCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTT 96543475
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTT 1980

 96543476 TCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAA 96543535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAA 2040

 96543536 AAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGT 96543595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGT 2100

 96543596 TGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCC 96543655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCC 2160

 96543656 AACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAA 96543715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAA 2220

 96543716 CTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCC 96543775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||
     2221 CTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCC 2280

 96543776 TAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTT 96543835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTT 2340

 96543836 TTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAAT 96543895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2341 TTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAAT 2400

 96543896 TCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCAC 96543955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCAC 2460

 96543956 AGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCT 96544015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCT 2520

 96544016 GGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTT 96544075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTT 2580

 96544076 CTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCC 96544135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2581 CTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGC 2640

 96544136 TTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACA 96544194
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACA 2700

 96544195 AAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCAT 96544254
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2701 AAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCAT 2760

 96544255 GAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCA 96544314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCA 2820

 96544315 CCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCT 96544374
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCT 2880

 96544375 CTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAG 96544434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAG 2940

 96544435 TAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTT 96544494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTT 3000

 96544495 CCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTT 96544554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTT 3060

 96544555 TGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACA 96544614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACA 3120

 96544615 TGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTA 96544674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTA 3180

 96544675 AAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAA 96544734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAA 3240

 96544735 ATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 96544794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 3300

 96544795 GCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGA 96544854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGA 3360

 96544855 AACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCC 96544914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCC 3420

 96544915 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 96544974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 3480

 96544975 GAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAAT 96545034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAAT 3540

 96545035 GCATACATAT 96545044
          ||||||||||
     3541 GCATACATAT 3550

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 3618

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3619 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 3678

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3738

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 3798

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 3858

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 3918

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 3978

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 4038

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 4098

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 4158

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4159 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 4218

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 4278

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 4338

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 4398

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 4458

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 4518

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 4578

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 4638

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4639 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 4698

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4699 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4758

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 4818

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 4878

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 4938

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     4939 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTT-TTTTTTTTTTTTTTTTT 4997

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 5057

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     5058 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 5114

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 5174

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 5234

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 5294

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 5354

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 5414

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 5474

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 5534

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 5594

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 5654

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 5714

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 5774

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 5834

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 5894

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 5954

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 6014

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 6074

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 6134

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 6194

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 6254

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 6314

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6315 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 6374

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6375 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 6434

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6435 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 6494

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6495 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 6554

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTT 96548094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6555 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTT 6604

Alignment time is 9.28919 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3877] =>      3877 nucs 'mol-32-3190-120083_3877'

Score:        3750
Aligned:      3794        nucs
Identic:      3790 (100%) nucs =>      3723 (100%)        67 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539557,96543282] EXCISED REGION [96546599,96546666]
 second seq =>  [       1,    3726] EXCISED REGION [    3810,    3877]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3727,3809]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3725,3726] to [3810,3811]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96539557 TATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATA 96539616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATA 60

 96539617 TCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGAT 96539676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGAT 120

 96539677 ATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACT 96539736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACT 180

 96539737 TCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGC 96539796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGC 240

 96539797 CCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAAT 96539856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAAT 300

 96539857 GTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTA 96539916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTA 360

 96539917 TTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGC 96539976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGC 420

 96539977 TGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCAC 96540036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCAC 480

 96540037 CAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTT 96540096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTT 540

 96540097 CCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCT 96540156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCT 600

 96540157 GCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTG 96540216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTG 660

 96540217 CCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATC 96540276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATC 720

 96540277 CTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAA 96540336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAA 780

 96540337 ATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTT 96540396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTT 840

 96540397 GGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTT 96540456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTT 900

 96540457 TGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGC 96540516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGC 960

 96540517 CCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAG 96540576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAG 1020

 96540577 GAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTT 96540636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTT 1080

 96540637 GGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCC 96540696
          ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAACTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCC 1140

 96540697 CTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGT 96540756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGT 1200

 96540757 TGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATT 96540816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATT 1260

 96540817 TAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAA 96540876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAA 1320

 96540877 ACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATC 96540936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATC 1380

 96540937 TGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAG 96540996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAG 1440

 96540997 ATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTAT 96541056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTAT 1500

 96541057 TTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGA 96541116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGA 1560

 96541117 TTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATA 96541176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATA 1620

 96541177 AAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAG 96541236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAG 1680

 96541237 AGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTT 96541296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTT 1740

 96541297 GATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTG 96541356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTG 1800

 96541357 TCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACA 96541416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACA 1860

 96541417 TGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTA 96541476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTA 1920

 96541477 TTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCT 96541536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCT 1980

 96541537 CCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACT 96541596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACT 2040

 96541597 TTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTA 96541656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTA 2100

 96541657 TATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGA 96541716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGA 2160

 96541717 GGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCT 96541776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCT 2220

 96541777 GCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCT 96541836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCT 2280

 96541837 TGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAAC 96541896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAAC 2340

 96541897 CTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATG 96541956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATG 2400

 96541957 AGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAA 96542016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAA 2460

 96542017 ACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAG 96542076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAG 2520

 96542077 TGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTC 96542136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTC 2580

 96542137 CAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCAT 96542196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCAT 2640

 96542197 ACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATT 96542256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATT 2700

 96542257 CATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCT 96542316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCT 2760

 96542317 GGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATG 96542376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATG 2820

 96542377 TGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTA 96542436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTA 2880

 96542437 ACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATT 96542496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATT 2940

 96542497 TTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTA 96542556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTA 3000

 96542557 TAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCG 96542616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCG 3060

 96542617 CCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACC 96542676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACC 3120

 96542677 CCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAG 96542736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAG 3180

 96542737 TATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCT 96542796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCT 3240

 96542797 CGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAA 96542856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAA 3300

 96542857 AGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCT 96542916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCT 3360

 96542917 CCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCT 96542976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCT 3420

 96542977 CTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCAC 96543036
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCAC 3480

 96543037 ACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAA 96543096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAA 3540

 96543097 GTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCT 96543156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCT 3600

 96543157 CATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTC 96543216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTC 3660

 96543217 TTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTT 96543276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTT 3720

 96543277 TCAACT 96543282
          ||||||
     3721 TCAACT 3726

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3869

 96546659 GGTTTCAC 96546666
          ||||||||
     3870 GGTTTCAC 3877

Alignment time is 5.73784 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8744] =>      8744 nucs 'mol-32-321f-038818_8744'

Score:        8472
Aligned:      8742        nucs
Identic:      8715 (100%) nucs =>      5705 (100%)      3010 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539326,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548066]
 second seq =>  [       1,    5718] EXCISED REGION [    5727,    8744]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [5719,5726]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [5719,5757] to [5727,5765]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [5717,5718] to [5727,5728]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [5719,5722] to [5723,5726]

 96539326 TATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTG 96539385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAGAAGATAAAAATAATTTG 60

 96539386 TCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAA 96539445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAA 120

 96539446 AACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAA 96539505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAA 180

 96539506 AAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGG 96539565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGG 240

 96539566 ATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAA 96539625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAA 300

 96539626 CAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTT 96539685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTT 360

 96539686 GTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGA 96539745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGA 420

 96539746 AGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGG 96539805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGG 480

 96539806 GATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGT 96539865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGT 540

 96539866 CAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTA 96539925
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTA 600

 96539926 GAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGC 96539985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGC 660

 96539986 CTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCA 96540045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCA 720

 96540046 GAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATG 96540105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATG 780

 96540106 ATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTT 96540165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTT 840

 96540166 GCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACA 96540225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACA 900

 96540226 ATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGC 96540285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGC 960

 96540286 TTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAA 96540345
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAG--CAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAA 1018

 96540346 GACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATC 96540405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATC 1078

 96540406 TCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAA 96540465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAA 1138

 96540466 AATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGG 96540525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGG 1198

 96540526 AAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGAT 96540585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 AAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGAT 1258

 96540586 GACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTC 96540645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTC 1318

 96540646 TGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCA 96540705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCA 1378

 96540706 GCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACG 96540765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACG 1438

 96540766 CTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTT 96540825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTT 1498

 96540826 GGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTT 96540885
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTT 1558

 96540886 TTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTA 96540945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTA 1618

 96540946 TGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTA 96541005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTA 1678

 96541006 AAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGT 96541065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGT 1738

 96541066 CAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGAT 96541125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGAT 1798

 96541126 GCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAAT 96541185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAAT 1858

 96541186 GCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGC 96541245
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGC 1918

 96541246 TGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAAT 96541305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAAT 1978

 96541306 CAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGA 96541365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGA 2038

 96541366 AAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGC 96541425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGC 2098

 96541426 TTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACA 96541485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACA 2158

 96541486 CTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGG 96541545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGG 2218

 96541546 GATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATT 96541605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATT 2278

 96541606 TATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTA 96541665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTA 2338

 96541666 TAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAG 96541725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAG 2398

 96541726 TCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATC 96541785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATC 2458

 96541786 CACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTT 96541845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTT 2518

 96541846 AATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCT 96541905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCT 2578

 96541906 GAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATG 96541965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATG 2638

 96541966 AAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGC 96542025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGC 2698

 96542026 TTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGA 96542085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGA 2758

 96542086 TGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAAT 96542145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAAT 2818

 96542146 GTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGT 96542205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGT 2878

 96542206 GCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAA 96542265
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAA 2938

 96542266 CATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAA 96542325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAA 2998

 96542326 TCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTT 96542385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTT 3058

 96542386 GTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATAT 96542445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATAT 3118

 96542446 TACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGT 96542505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGT 3178

 96542506 GGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGAT 96542565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGAT 3238

 96542566 GGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTA 96542625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTA 3298

 96542626 GTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGA 96542685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGA 3358

 96542686 GCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCC 96542745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCC 3418

 96542746 TGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTC 96542805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTC 3478

 96542806 TGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCAT 96542865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCAT 3538

 96542866 CTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTC 96542925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTC 3598

 96542926 TTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAG 96542985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAG 3658

 96542986 TTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTC 96543045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTC 3718

 96543046 TTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTG 96543105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTG 3778

 96543106 ATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATT 96543165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 ATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATT 3838

 96543166 ATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGC 96543225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 ATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGC 3898

 96543226 CATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTT 96543285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTT 3958

 96543286 TCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAAC 96543345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3959 TCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAAC 4018

 96543346 ATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAAC 96543405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 ATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAAC 4078

 96543406 ATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACT 96543465
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 ATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACT 4138

 96543466 AAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCT 96543525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCT 4198

 96543526 CTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTA 96543585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 CTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTA 4258

 96543586 AAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATAT 96543645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATAT 4318

 96543646 GCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAG 96543705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAG 4378

 96543706 ACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATA 96543765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|
     4379 ACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGA 4438

 96543766 AACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAAT 96543825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAAT 4498

 96543826 AAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCA 96543885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 AAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCA 4558

 96543886 AGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTC 96543945
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 AGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTC 4618

 96543946 CCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGG 96544005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGG 4678

 96544006 CCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGAC 96544065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 CCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGAC 4738

 96544066 CTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCT 96544125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 CTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCT 4798

 96544126 TCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAA 96544184
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     4799 TCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAA 4858

 96544185 GCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGT 96544244
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4859 GCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGC 4918

 96544245 ATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAG 96544304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAG 4978

 96544305 TTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAA 96544364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4979 TTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAA 5038

 96544365 GATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTA 96544424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 GATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTA 5098

 96544425 TGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTG 96544484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTG 5158

 96544485 ACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTC 96544544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 ACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTC 5218

 96544545 TCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGAT 96544604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGAT 5278

 96544605 ACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCC 96544664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 ACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCC 5338

 96544665 TTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAA 96544724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 TTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAA 5398

 96544725 AGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGC 96544784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGC 5458

 96544785 ACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACA 96544844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 ACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACA 5518

 96544845 AACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATA 96544904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 AACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATA 5578

 96544905 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAG 96544964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAG 5638

 96544965 AGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGT 96545024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 AGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGT 5698

 96545025 CCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||
     5699 CCATCTCAATGCATACATAT 5718

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 5786

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5787 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 5846

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 5906

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 5966

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5967 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 6026

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6027 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 6086

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6087 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 6146

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6147 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 6206

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6207 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 6266

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6267 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 6326

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6327 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 6386

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6387 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 6446

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6447 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 6506

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6507 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 6566

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6567 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 6626

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6627 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 6686

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6687 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 6746

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6747 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 6806

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6807 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 6866

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6867 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 6926

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6927 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 6986

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6987 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 7046

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7047 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 7106

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     7107 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC-TTTTTTTTTTTTTTTT 7165

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 7225

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     7226 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 7282

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7283 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 7342

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7343 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 7402

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7403 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 7462

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7463 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 7522

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7523 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 7582

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7583 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 7642

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7643 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 7702

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7703 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 7762

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7763 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAGACTAAGCCATACAAAA 7822

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7823 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 7882

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7883 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 7942

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7943 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 8002

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8003 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 8062

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     8063 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 8122

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8123 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 8182

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8183 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 8242

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8243 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 8302

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8303 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 8362

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8363 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 8422

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8423 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 8482

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8483 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 8542

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8543 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 8602

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8603 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 8662

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     8663 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 8722

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTAC 96548066
          ||||||||||||||||||||||
     8723 TCTCCATGGGTTATAGTACTAC 8744

Alignment time is 11.7398 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2418] =>      2418 nucs 'mol-32-321f-106056_2418'

Score:        2302
Aligned:      2335        nucs
Identic:      2332 (100%) nucs =>      1621 (100%)       711 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541661,96543282] EXCISED REGION [96546599,96547311]
 second seq =>  [       1,    1622] EXCISED REGION [    1706,    2418]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1623,1705]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1621,1622] to [1706,1707]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541661 ACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTG 96541720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTG 60

 96541721 CAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAG 96541780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAG 120

 96541781 TAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAA 96541840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAA 180

 96541841 TTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTA 96541900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTA 240

 96541901 TTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGA 96541960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGA 300

 96541961 AAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACAT 96542020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACAT 360

 96542021 GGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCT 96542080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCT 420

 96542081 GCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGT 96542140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGT 480

 96542141 CAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTA 96542200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTA 540

 96542201 TTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATC 96542260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATC 600

 96542261 ATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCC 96542320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCC 660

 96542321 CTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTT 96542380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTT 720

 96542381 GATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTT 96542440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTT 780

 96542441 TATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGC 96542500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGC 840

 96542501 TTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAAT 96542560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAAT 900

 96542561 GAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCA 96542620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCA 960

 96542621 TGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTG 96542680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTG 1020

 96542681 TTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATT 96542740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATT 1080

 96542741 CTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAG 96542800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAG 1140

 96542801 TTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCC 96542860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCC 1200

 96542861 TTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTG 96542920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTG 1260

 96542921 TCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCT 96542980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCT 1320

 96542981 TTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCT 96543040
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCT 1380

 96543041 GCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCC 96543100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCC 1440

 96543101 CATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATC 96543160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATC 1500

 96543161 TTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCT 96543220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCT 1560

 96543221 ACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAA 96543280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAA 1620

 96543281 CT 96543282
          ||
     1621 CT 1622

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1765

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1825

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1885

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 1945

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2005

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2065

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2125

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2185

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 2245

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2305

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2365

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGG 96547311
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGG 2418

Alignment time is 3.39657 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2162] =>      2162 nucs 'mol-32-3235-078383_2162'

Score:        2079
Aligned:      2156        nucs
Identic:      2149 (100%) nucs =>      1454 (100%)       695 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542303,96543758] EXCISED REGION [96543765,96544463]
 second seq =>  [       1,    1456] EXCISED REGION [    1463,    2162]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [96543759,96543764]
 second seq =>         6 nucs [1457,1462]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543759,96543759] to [96543765,96543765]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543758,96543758] to [96543765,96543765]
 second seq =>         1 nucs [1456,1456] to [1463,1463]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1457,1457] to [1462,1462]

 96542303 AGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCT 96542362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCT 60

 96542363 GAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTA 96542422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTA 120

 96542423 ACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTT 96542482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTT 180

 96542483 TTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTT 96542542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTT 240

 96542543 CTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCC 96542602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCC 300

 96542603 ACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTT 96542662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTT 360

 96542663 GTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGA 96542722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGA 420

 96542723 CCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATG 96542782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATG 480

 96542783 GTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTT 96542842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTT 540

 96542843 GGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTAT 96542902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTAT 600

 96542903 CTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCA 96542962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCA 660

 96542963 TCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCAC 96543022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCAC 720

 96543023 CACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTA 96543082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTA 780

 96543083 TACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGT 96543142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGT 840

 96543143 CCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAA 96543202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAA 900

 96543203 ACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAA 96543262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAA 960

 96543263 AATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACC 96543322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACC 1020

 96543323 TGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCA 96543382
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCA 1080

 96543383 AGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAAC 96543442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1081 AGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAAC 1140

 96543443 GTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTC 96543502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTC 1200

 96543503 CTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTA 96543562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTA 1260

 96543563 GAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTT 96543622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTT 1320

 96543623 ATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACA 96543682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACA 1380

 96543683 TATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATA 96543742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATA 1440

 96543743 ATTGTTACTGGTTTTA 96543758
          ||||||||||||||||
     1441 ATTGTTACTGGTTTTA 1456

EXCISED REGION

 96543765 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 96543824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 1522

 96543825 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 96543884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 1582

 96543885 AAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 96543944
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 AAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 1642

 96543945 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 96544004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 1702

 96544005 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 96544064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 1762

 96544065 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 96544124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 1822

 96544125 TTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACA 96544183
          |||||||||.||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     1823 TTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACA 1882

 96544184 AGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAG 96544243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 AGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAG 1942

 96544244 TATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAA 96544303
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAA 2002

 96544304 GTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTA 96544363
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2003 GTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTA 2062

 96544364 AGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATT 96544423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 AGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATT 2122

 96544424 ATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATA 96544463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 ATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATA 2162

Alignment time is 3.40418 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4050] =>      4050 nucs 'mol-32-3235-173973_4050'

Score:        3923
Aligned:      3967        nucs
Identic:      3963 (100%) nucs =>      3245 (100%)       718 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96540036,96543282] EXCISED REGION [96546599,96547318]
 second seq =>  [       1,    3247] EXCISED REGION [    3331,    4050]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3248,3330]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3246,3247] to [3331,3332]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96540036 CCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCT 96540095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCT 60

 96540096 TCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGC 96540155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGC 120

 96540156 TGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGT 96540215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGT 180

 96540216 GCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTAT 96540275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTAT 240

 96540276 CCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCA 96540335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCA 300

 96540336 AATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTT 96540395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTT 360

 96540396 TGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATT 96540455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATT 420

 96540456 TTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTG 96540515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTG 480

 96540516 CCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAA 96540575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAA 540

 96540576 GGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCT 96540635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCT 600

 96540636 TGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATC 96540695
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATC 660

 96540696 CCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAG 96540755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAG 720

 96540756 TTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCAT 96540815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCAT 780

 96540816 TTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTA 96540875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTA 840

 96540876 AACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGAT 96540935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGAT 900

 96540936 CTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTA 96540995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTA 960

 96540996 GATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTA 96541055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTA 1020

 96541056 TTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGG 96541115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGG 1080

 96541116 ATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAAT 96541175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAAT 1140

 96541176 AAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCA 96541235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCA 1200

 96541236 GAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGT 96541295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGT 1260

 96541296 TGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTT 96541355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTT 1320

 96541356 GTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAAC 96541415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAAC 1380

 96541416 ATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTT 96541475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTT 1440

 96541476 ATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATC 96541535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATC 1500

 96541536 TCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATAC 96541595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATAC 1560

 96541596 TTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGT 96541655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGT 1620

 96541656 ATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGG 96541715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGG 1680

 96541716 AGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACC 96541775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACC 1740

 96541776 TGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTC 96541835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTC 1800

 96541836 TTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAA 96541895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAA 1860

 96541896 CCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGAT 96541955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGAT 1920

 96541956 GAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAA 96542015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAA 1980

 96542016 AACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGA 96542075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGA 2040

 96542076 GTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTT 96542135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTT 2100

 96542136 CCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCA 96542195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCA 2160

 96542196 TACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCAT 96542255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCAT 2220

 96542256 TCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTC 96542315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTC 2280

 96542316 TGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAAT 96542375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAAT 2340

 96542376 GTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTT 96542435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTT 2400

 96542436 AACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTAT 96542495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTAT 2460

 96542496 TTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTT 96542555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTT 2520

 96542556 ATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCC 96542615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCC 2580

 96542616 GCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTAC 96542675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTAC 2640

 96542676 CCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAA 96542735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAA 2700

 96542736 GTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGC 96542795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGC 2760

 96542796 TCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACA 96542855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACA 2820

 96542856 AAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGC 96542915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGC 2880

 96542916 TCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCC 96542975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCC 2940

 96542976 TCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCA 96543035
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCA 3000

 96543036 CACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAA 96543095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAA 3060

 96543096 AGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTC 96543155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTC 3120

 96543156 TCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGT 96543215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGT 3180

 96543216 CTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACT 96543275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACT 3240

 96543276 TTCAACT 96543282
          |||||||
     3241 TTCAACT 3247

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3390

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 3450

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 3510

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 3570

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 3630

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 3690

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 3750

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 3810

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 3870

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 3930

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 3990

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 4050

Alignment time is 5.37933 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2208] =>      2208 nucs 'mol-32-3240-192774_2208'

Score:        2126
Aligned:      2211        nucs
Identic:      2200 (100%) nucs =>      2186 ( 99%)        14 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96545901,96548097] EXCISED REGION [96548101,96548114]
 second seq =>  [       1,    2191] EXCISED REGION [    2195,    2208]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [96548098,96548100]
 second seq =>         3 nucs [2192,2194]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2191,2191] to [2194,2194]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96548098,96548098] to [96548100,96548100]
 second seq =>         1 nucs [2192,2192] to [2194,2194]

 96545901 ATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTG 96545960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTG 60

 96545961 ACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGAC 96546020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGAC 120

 96546021 CAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGG 96546080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGG 180

 96546081 TCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTAC 96546140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTAC 240

 96546141 TAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTCTATACAAATAGAATAT 96546200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      241 TAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTCTATACAAATAGAATAT 300

 96546201 TTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGT 96546260
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGT 360

 96546261 TTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGT 96546320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGT 420

 96546321 ATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTA 96546380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTA 480

 96546381 TGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTC 96546440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTC 540

 96546441 TTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGC 96546500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
      541 TTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTT---GAGATGGAGTCTCGC 597

 96546501 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGGCCTCCC 96546560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGGCCTCCC 657

 96546561 CGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCCCGCCAC 96546620
          ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 CGGTTCACGCCATTCT---GCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCCCGCCAC 714

 96546621 CACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGA 96546680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 CACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGA 774

 96546681 TGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 96546740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 TGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 834

 96546741 CAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCT 96546800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 CAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCT 894

 96546801 CTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAA 96546860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 CTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAA 954

 96546861 GAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTT 96546920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 GAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTT 1014

 96546921 TCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCT 96546980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 TCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCT 1074

 96546981 CTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACC 96547040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 CTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACC 1134

 96547041 TGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCA 96547100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 TGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCA 1194

 96547101 GTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATA 96547160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 GTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATA 1254

 96547161 TGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAG 96547220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 TGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAG 1314

 96547221 ATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAAT 96547280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 ATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAAT 1374

 96547281 TTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGT 96547340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGT 1434

 96547341 TCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAAC 96547400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAAC 1494

 96547401 TACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCA 96547460
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCA 1554

 96547461 CTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAA 96547520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 CTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAA 1614

 96547521 ATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTT 96547580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 ATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTT 1674

 96547581 TTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAA 96547640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAA 1734

 96547641 AACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGACACAGT 96547700
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1735 AACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGACACAGT 1794

 96547701 GGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTC 96547760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 GGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTC 1854

 96547761 AAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTA 96547820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 AAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTA 1914

 96547821 ATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGA 96547880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 ATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGA 1974

 96547881 GAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTT 96547940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 GAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTT 2034

 96547941 CATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTG 96548000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 CATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTG 2094

 96548001 TGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAG 96548060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2095 TGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTTTCTCCATGGGTTATAG 2154

 96548061 TACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96548097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 2191

EXCISED REGION

 96548101 ACGGAGATTCGCTC 96548114
          ||||||||||||||
     2195 ACGGAGATTCGCTC 2208

Alignment time is 3.53778 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3938] =>      3938 nucs 'mol-32-3240-252921_3938'

Score:        3822
Aligned:      3855        nucs
Identic:      3852 (100%) nucs =>      3762 (100%)        90 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539519,96543282] EXCISED REGION [96546599,96546689]
 second seq =>  [       1,    3764] EXCISED REGION [    3848,    3938]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3765,3847]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3763,3764] to [3848,3849]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96539519 GGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGA 96539578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGA 60

 96539579 CCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGT 96539638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGT 120

 96539639 ATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTT 96539698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTT 180

 96539699 TAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGG 96539758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGG 240

 96539759 TGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAA 96539818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAA 300

 96539819 TACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCT 96539878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCT 360

 96539879 GTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAA 96539938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAA 420

 96539939 TGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGA 96539998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGA 480

 96539999 TTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCT 96540058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCT 540

 96540059 ACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTA 96540118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTA 600

 96540119 GACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGC 96540178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGC 660

 96540179 CTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAAT 96540238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAAT 720

 96540239 CTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGG 96540298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGG 780

 96540299 GAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGC 96540358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGC 840

 96540359 GTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACC 96540418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACC 900

 96540419 TTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCT 96540478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCT 960

 96540479 ATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGC 96540538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGC 1020

 96540539 TACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGG 96540598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGG 1080

 96540599 ATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAG 96540658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1081 ATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAG 1140

 96540659 CTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTC 96540718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTC 1200

 96540719 CAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAA 96540778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAA 1260

 96540779 TCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATT 96540838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATT 1320

 96540839 GGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAG 96540898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAG 1380

 96540899 GCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGT 96540958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGT 1440

 96540959 AGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTG 96541018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTG 1500

 96541019 TAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTT 96541078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTT 1560

 96541079 TTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTT 96541138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTT 1620

 96541139 AGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCT 96541198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCT 1680

 96541199 GCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGG 96541258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGG 1740

 96541259 GCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTC 96541318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTC 1800

 96541319 AAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACA 96541378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACA 1860

 96541379 ACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTT 96541438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTT 1920

 96541439 TCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTT 96541498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTT 1980

 96541499 AGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCC 96541558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCC 2040

 96541559 CATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTC 96541618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTC 2100

 96541619 TTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGC 96541678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGC 2160

 96541679 ATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGA 96541738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGA 2220

 96541739 AGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCA 96541798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCA 2280

 96541799 AACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGG 96541858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGG 2340

 96541859 ATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAG 96541918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAG 2400

 96541919 AGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAG 96541978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAG 2460

 96541979 CTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCC 96542038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCC 2520

 96542039 ATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGT 96542098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGT 2580

 96542099 AATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTG 96542158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTG 2640

 96542159 TCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCA 96542218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCA 2700

 96542219 AGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCAC 96542278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCAC 2760

 96542279 TATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATG 96542338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATG 2820

 96542339 CAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAAT 96542398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAAT 2880

 96542399 ACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTA 96542458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTA 2940

 96542459 TGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATAC 96542518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATAC 3000

 96542519 TAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTC 96542578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTC 3060

 96542579 AGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTAT 96542638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTAT 3120

 96542639 ACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCA 96542698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCA 3180

 96542699 GGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTA 96542758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTA 3240

 96542759 CTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGAT 96542818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGAT 3300

 96542819 GGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGT 96542878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGT 3360

 96542879 TTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTT 96542938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTT 3420

 96542939 GTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTT 96542998
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3421 GTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTT 3480

 96542999 CATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTG 96543058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTG 3540

 96543059 CTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTC 96543118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTC 3600

 96543119 AATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCA 96543178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCA 3660

 96543179 TTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTT 96543238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTT 3720

 96543239 ACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 3764

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3907

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA 96546689
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA 3938

Alignment time is 5.56362 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3480] =>      3480 nucs 'mol-32-3240-283010_3480'

Score:        3329
Aligned:      3472        nucs
Identic:      3459 (100%) nucs =>      2136 (100%)      1323 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542901,96545044] EXCISED REGION [96545045,96546371]
 second seq =>  [       1,    2145] EXCISED REGION [    2154,    3480]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [2146,2153]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [2146,2184] to [2154,2192]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [2144,2145] to [2154,2155]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2146,2149] to [2150,2153]

 96542901 ATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTC 96542960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTC 60

 96542961 CATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATC 96543020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATC 120

 96543021 ACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGC 96543080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGC 180

 96543081 TATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAA 96543140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAA 240

 96543141 GTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCA 96543200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCA 300

 96543201 AAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTT 96543260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTT 360

 96543261 AAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGA 96543320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGA 420

 96543321 CCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTG 96543380
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTG 480

 96543381 CAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAA 96543440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      481 CAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAA 540

 96543441 ACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGC 96543500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGC 600

 96543501 TCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAAT 96543560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAAT 660

 96543561 TAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTAT 96543620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTAT 720

 96543621 TTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAA 96543680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAA 780

 96543681 CATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAA 96543740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAA 840

 96543741 TAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTT 96543800
          ||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTT 900

 96543801 ATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTAT 96543860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTAT 960

 96543861 CTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCC 96543920
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCC 1020

 96543921 CCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTT 96543980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTT 1080

 96543981 AAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCC 96544040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCC 1140

 96544041 ACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAAC 96544100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAAC 1200

 96544101 CTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAA 96544160
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAA 1260

 96544161 AAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATA 96544219
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATA 1320

 96544220 CAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCA 96544279
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCA 1380

 96544280 TAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATT 96544339
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1381 TAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATG 1440

 96544340 TTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAAT 96544399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAAT 1500

 96544400 GCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTG 96544459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTG 1560

 96544460 TATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCT 96544519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCT 1620

 96544520 GGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATAC 96544579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATAC 1680

 96544580 GTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAA 96544639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAA 1740

 96544640 AAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAA 96544699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAA 1800

 96544700 AAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCAC 96544759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCAC 1860

 96544760 AGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGG 96544819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGG 1920

 96544820 TCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAA 96544879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAA 1980

 96544880 AATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGT 96544939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGT 2040

 96544940 AGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTC 96544999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTC 2100

 96545000 CAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 2145

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 2213

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2214 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 2273

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 2333

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 2393

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 2453

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 2513

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 2573

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 2633

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 2693

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 2753

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2754 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 2813

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 2873

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 2933

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 2993

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 3053

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 3113

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 3173

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 3233

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3234 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 3293

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 3353

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 3413

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 3473

 96546365 ATTTGAA 96546371
          |||||||
     3474 ATTTGAA 3480

Alignment time is 5.28667 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5682] =>      5682 nucs 'mol-32-32fb-059389_5682'

Score:        5500
Aligned:      5599        nucs
Identic:      5590 (100%) nucs =>      3373 (100%)      2217 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539908,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548822]
 second seq =>  [       1,    3375] EXCISED REGION [    3459,    5682]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3376,3458]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3374,3375] to [3459,3460]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96539908 CTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAG 96539967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAG 60

 96539968 CAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCT 96540027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCT 120

 96540028 GCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATAT 96540087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATAT 180

 96540088 GGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGG 96540147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGG 240

 96540148 TTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTC 96540207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTC 300

 96540208 TTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCA 96540267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCA 360

 96540268 AATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAAT 96540327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAAT 420

 96540328 GGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCT 96540387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCT 480

 96540388 CATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAAT 96540447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAAT 540

 96540448 ATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAAT 96540507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAAT 600

 96540508 CAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTA 96540567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTA 660

 96540568 AGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGAT 96540627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGAT 720

 96540628 AGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAAT 96540687
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAAT 780

 96540688 ACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTG 96540747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTG 840

 96540748 CAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAAT 96540807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAAT 900

 96540808 GAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGC 96540867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGC 960

 96540868 TGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATG 96540927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATG 1020

 96540928 GCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAG 96540987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAG 1080

 96540988 TTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATAC 96541047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATAC 1140

 96541048 AGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTT 96541107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTT 1200

 96541108 GAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTG 96541167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTG 1260

 96541168 TCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACAT 96541227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACAT 1320

 96541228 CCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATT 96541287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATT 1380

 96541288 TACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGG 96541347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGG 1440

 96541348 AAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCT 96541407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCT 1500

 96541408 AATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTG 96541467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTG 1560

 96541468 TAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCT 96541527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCT 1620

 96541528 AAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTG 96541587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTG 1680

 96541588 TATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACC 96541647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACC 1740

 96541648 ATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTT 96541707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTT 1800

 96541708 AATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCT 96541767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCT 1860

 96541768 GCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGC 96541827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGC 1920

 96541828 ATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAG 96541887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAG 1980

 96541888 AATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTT 96541947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTT 2040

 96541948 TTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAG 96542007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAG 2100

 96542008 AGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCA 96542067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCA 2160

 96542068 TAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGAT 96542127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGAT 2220

 96542128 ATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCAT 96542187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCAT 2280

 96542188 TACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATA 96542247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATA 2340

 96542248 ATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCT 96542307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCT 2400

 96542308 ATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATC 96542367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATC 2460

 96542368 TTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTAT 96542427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTAT 2520

 96542428 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 96542487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 2580

 96542488 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 96542547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 2640

 96542548 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 96542607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 2700

 96542608 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 96542667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 2760

 96542668 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 96542727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 2820

 96542728 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 96542787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 2880

 96542788 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 96542847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 2940

 96542848 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 96542907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 3000

 96542908 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 96542967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 3060

 96542968 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 96543027
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 3120

 96543028 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 96543087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 3180

 96543088 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 96543147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 3240

 96543148 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 96543207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 3300

 96543208 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 96543267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 3360

 96543268 TCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||
     3361 TCCTTACTTTCAACT 3375

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3518

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 3578

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 3638

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 3698

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 3758

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 3818

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 3878

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 3938

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3939 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 3998

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3999 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 4058

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4059 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 4118

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4119 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 4178

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4179 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 4238

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4239 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 4298

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4299 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 4358

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4359 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 4418

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4419 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 4478

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4479 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 4538

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4539 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 4598

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4599 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 4658

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4659 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 4718

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4719 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 4778

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4779 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 4838

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4839 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 4898

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4899 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 4958

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4959 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 5018

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5019 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 5078

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5079 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 5138

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5139 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 5198

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5199 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 5258

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5259 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 5318

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 96548518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5319 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 5378

 96548519 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 96548578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5379 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 5438

 96548579 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 96548638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5439 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 5498

 96548639 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 96548698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5499 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 5558

 96548699 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 96548758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5559 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 5618

 96548759 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 96548818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5619 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 5678

 96548819 GAAT 96548822
          ||||
     5679 GAAT 5682

Alignment time is 7.90611 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2224] =>      2224 nucs 'mol-32-32fb-059389_2224'

Score:        2157
Aligned:      2223        nucs
Identic:      2217 (100%) nucs =>        23 (100%)      2194 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96546599,96546621] EXCISED REGION [96546623,96548822]
 second seq =>  [       1,      23] EXCISED REGION [      25,    2224]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [96546622,96546622]
 second seq =>         1 nucs [24,24]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96546618,96546621] to [96546623,96546626]
 second seq =>         4 nucs [20,23] to [25,28]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACC 96546621
          |||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACC 23

EXCISED REGION

 96546623 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATG 96546682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       25 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATG 84

 96546683 GTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 96546742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       85 GTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 144

 96546743 AGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCT 96546802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      145 AGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCT 204

 96546803 CAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGA 96546862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 CAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGA 264

 96546863 GGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTC 96546922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 GGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTC 324

 96546923 TTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCT 96546982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 TTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCT 384

 96546983 CTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTG 96547042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTG 444

 96547043 GATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGT 96547102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGT 504

 96547103 CTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATG 96547162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      505 CTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTGAAGAATATG 564

 96547163 AAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGAT 96547222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 AAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGAT 624

 96547223 TTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTT 96547282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTT 684

 96547283 AGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTC 96547342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 AGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTC 744

 96547343 TAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTA 96547402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTA 804

 96547403 CTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACT 96547462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACT 864

 96547463 AAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAAT 96547522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 AAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAAT 924

 96547523 CATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTT 96547582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 CATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTT 984

 96547583 ATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAA 96547642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 ATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAA 1044

 96547643 CAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGACACAGTGG 96547702
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1045 CAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGACACAGTGG 1104

 96547703 GCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAA 96547762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAA 1164

 96547763 AACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAAT 96547822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAAT 1224

 96547823 AATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGA 96547882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGA 1284

 96547883 ATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCA 96547942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 ATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCA 1344

 96547943 TTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTG 96548002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTG 1404

 96548003 CCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTA 96548062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTA 1464

 96548063 CTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 96548122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 1524

 96548123 AGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 96548182
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 AGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 1584

 96548183 CATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAG 96548242
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1585 CATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAG 1644

 96548243 CTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACAACGGTCTCG 96548302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1645 CTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACTACGGTCTCG 1704

 96548303 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTG 96548362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTG 1764

 96548363 AGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAATGG 96548422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAATGG 1824

 96548423 TTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACAAAC 96548482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACAAAC 1884

 96548483 TCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATTTTT 96548542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATTTTT 1944

 96548543 ACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAG 96548602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAG 2004

 96548603 AAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGATAAA 96548662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGATAAA 2064

 96548663 TCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAA 96548722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAA 2124

 96548723 CCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTG 96548782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTG 2184

 96548783 AAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAAT 96548822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAAT 2224

Alignment time is 3.45106 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2981] =>      2981 nucs 'mol-32-32fb-136760_2981'

Score:        2905
Aligned:      2982        nucs
Identic:      2975 (100%) nucs =>      1357 (100%)      1618 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96545212,96546572] EXCISED REGION [96546576,96548196]
 second seq =>  [       1,    1360] EXCISED REGION [    1361,    2981]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [96546573,96546575]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96546573,96546576] to [96546576,96546579]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96545212 TAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTT 96545271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTT 60

 96545272 TTAGATGACTTGATCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAA 96545331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGATGACTTGATCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAA 120

 96545332 CTAATAAATGAATTCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTA 96545391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATAAATGAATTCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTA 180

 96545392 TTTTTGTACACTAATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGC 96545451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTGTACACTAATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGC 240

 96545452 ATCAAAATAATAAAATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTG 96545511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCAAAATAATAAAATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTG 300

 96545512 AACACTATAAAACATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAA 96545571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACACTATAAAACATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAA 360

 96545572 CTCATTATGTAACTTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTA 96545631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCATTATGTAACTTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTA 420

 96545632 GTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCA 96545691
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      421 GTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCA 480

 96545692 TGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAG 96545751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTCACACTGCCTTCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAG 540

 96545752 GGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATT 96545811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGTCGGGCTTGGATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATT 600

 96545812 GTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGT 96545871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGT 660

 96545872 CTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAG 96545931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTACAATTTGCCTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAG 720

 96545932 AGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATAT 96545991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATGTTGCTGATTTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATAT 780

 96545992 GAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACA 96546051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAACACACAAAGTGGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACA 840

 96546052 GGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTAT 96546111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAAAGAGAAGTGGTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTAT 900

 96546112 AAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAA 96546171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTGAGCATTCATAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAA 960

 96546172 TGATTAGTATGTCTATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAG 96546231
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      961 TTATTAGTATGTCTATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAG 1020

 96546232 AAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCT 96546291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATAACAAGTTTTAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCT 1080

 96546292 GCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCT 96546351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCATAGTGCCAAGAGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCT 1140

 96546352 GACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAG 96546411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACATTTTACAGCATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAG 1200

 96546412 TAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTT 96546471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAAATTTATTTGTTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTT 1260

 96546472 TTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCG 96546531
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTTTTTTTTT-GAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCG 1319

 96546532 ATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA 96546572
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA 1360

EXCISED REGION

 96546576 TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATT 96546635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATT 1420

 96546636 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCT 96546695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCT 1480

 96546696 GACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCAC 96546755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 GACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCAC 1540

 96546756 AGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTA 96546815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 AGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTA 1600

 96546816 AAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTC 96546875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 AAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTC 1660

 96546876 TACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATT 96546935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATT 1720

 96546936 CCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGA 96546995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 CCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGA 1780

 96546996 ATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACT 96547055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 ATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACT 1840

 96547056 TCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTG 96547115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 TCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTG 1900

 96547116 TAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAA 96547175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAA 1960

 96547176 GTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATAT 96547235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 GTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATAT 2020

 96547236 GGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGC 96547295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGC 2080

 96547296 TTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACT 96547355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 TTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACT 2140

 96547356 TTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATT 96547415
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2141 TTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTT 2200

 96547416 TGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCA 96547475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCA 2260

 96547476 AATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATT 96547535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATT 2320

 96547536 TTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTA 96547595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTA 2380

 96547596 TTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTAT 96547655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTAT 2440

 96547656 CCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATT 96547715
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2441 CCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATT 2500

 96547716 CTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATA 96547775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATA 2560

 96547776 TCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAAC 96547835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAAC 2620

 96547836 TGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTT 96547895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTT 2680

 96547896 TAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAG 96547955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAG 2740

 96547956 TAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATC 96548015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATC 2800

 96548016 TCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATG 96548075
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTTTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATG 2860

 96548076 CATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCA 96548135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 CATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCA 2920

 96548136 GTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCT 96548195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 GTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCT 2980

 96548196 C 96548196
          |
     2981 C 2981

Alignment time is 4.28724 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5209] =>      5209 nucs 'mol-32-3306-053760_5209'

Score:        5027
Aligned:      5126        nucs
Identic:      5117 (100%) nucs =>      2806 (100%)      2311 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96540475,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548916]
 second seq =>  [       1,    2808] EXCISED REGION [    2892,    5209]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [2809,2891]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [2807,2808] to [2892,2893]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96540475 TGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTT 96540534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTT 60

 96540535 GAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGT 96540594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGT 120

 96540595 AAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCC 96540654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCC 180

 96540655 TGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCA 96540714
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCA 240

 96540715 GTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGA 96540774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGA 300

 96540775 TGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAA 96540834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAA 360

 96540835 TATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAAT 96540894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAAT 420

 96540895 AAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTA 96540954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTA 480

 96540955 TAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGA 96541014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGA 540

 96541015 CGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTC 96541074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTC 600

 96541075 ATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATA 96541134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATA 660

 96541135 GTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTA 96541194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTA 720

 96541195 TTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATAC 96541254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATAC 780

 96541255 AAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGG 96541314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGG 840

 96541315 CTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGG 96541374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGG 900

 96541375 AACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAAT 96541434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAAT 960

 96541435 ACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGT 96541494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGT 1020

 96541495 CTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTA 96541554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTA 1080

 96541555 ATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTG 96541614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTG 1140

 96541615 TGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAAT 96541674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAAT 1200

 96541675 ATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATT 96541734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATT 1260

 96541735 TTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTT 96541794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTT 1320

 96541795 CTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTA 96541854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTA 1380

 96541855 ATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTA 96541914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTA 1440

 96541915 CTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGG 96541974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGG 1500

 96541975 AAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGT 96542034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGT 1560

 96542035 AGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGC 96542094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGC 1620

 96542095 CTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCA 96542154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCA 1680

 96542155 TGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAG 96542214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAG 1740

 96542215 GTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTAT 96542274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTAT 1800

 96542275 TCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATT 96542334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATT 1860

 96542335 CATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTA 96542394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTA 1920

 96542395 AAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCC 96542454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCC 1980

 96542455 ATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAA 96542514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAA 2040

 96542515 ATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTT 96542574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTT 2100

 96542575 TGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCT 96542634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCT 2160

 96542635 TTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCC 96542694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCC 2220

 96542695 TCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATC 96542754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATC 2280

 96542755 GGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCC 96542814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCC 2340

 96542815 TGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTC 96542874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTC 2400

 96542875 CTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCC 96542934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCC 2460

 96542935 CTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCT 96542994
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2461 CTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCT 2520

 96542995 CTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCT 96543054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCT 2580

 96543055 TCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAA 96543114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAA 2640

 96543115 GGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGC 96543174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGC 2700

 96543175 ACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATT 96543234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATT 2760

 96543235 AGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 2808

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 2951

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 3011

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 3071

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 3131

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 3191

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 3251

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 3311

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 3371

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 3431

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 3491

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 3551

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 3611

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 3671

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 3731

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 3791

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 3851

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 3911

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 3971

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 4031

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 4091

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 4151

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 4211

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 4271

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 4331

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 4391

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4392 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 4451

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4452 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 4511

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 4571

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 4631

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 4691

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 4751

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 96548518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 4811

 96548519 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 96548578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 4871

 96548579 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 96548638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 4931

 96548639 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 96548698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4932 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 4991

 96548699 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 96548758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4992 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 5051

 96548759 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 96548818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5052 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 5111

 96548819 GAATATCTTTATAGTGTGGTTAATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAA 96548878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5112 GAATATCTTTATAGTGTGGTTAATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAA 5171

 96548879 GAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTTAAATAAGGCAGAAA 96548916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5172 GAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTTAAATAAGGCAGAAA 5209

Alignment time is 7.71762 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2318] =>      2318 nucs 'mol-32-3306-053760_2318'

Score:        2251
Aligned:      2317        nucs
Identic:      2311 (100%) nucs =>        23 (100%)      2288 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96546599,96546621] EXCISED REGION [96546623,96548916]
 second seq =>  [       1,      23] EXCISED REGION [      25,    2318]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [96546622,96546622]
 second seq =>         1 nucs [24,24]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96546618,96546621] to [96546623,96546626]
 second seq =>         4 nucs [20,23] to [25,28]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACC 96546621
          |||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACC 23

EXCISED REGION

 96546623 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATG 96546682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       25 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATG 84

 96546683 GTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 96546742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       85 GTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 144

 96546743 AGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCT 96546802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      145 AGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCT 204

 96546803 CAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGA 96546862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 CAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGA 264

 96546863 GGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTC 96546922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 GGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTC 324

 96546923 TTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCT 96546982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 TTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCT 384

 96546983 CTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTG 96547042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTG 444

 96547043 GATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGT 96547102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGT 504

 96547103 CTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATG 96547162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      505 CTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTGAAGAATATG 564

 96547163 AAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGAT 96547222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 AAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGAT 624

 96547223 TTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTT 96547282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTT 684

 96547283 AGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTC 96547342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 AGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTC 744

 96547343 TAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTA 96547402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTA 804

 96547403 CTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACT 96547462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACT 864

 96547463 AAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAAT 96547522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 AAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAAT 924

 96547523 CATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTT 96547582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 CATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTT 984

 96547583 ATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAA 96547642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 ATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAA 1044

 96547643 CAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGACACAGTGG 96547702
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1045 CAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGACACAGTGG 1104

 96547703 GCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAA 96547762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAA 1164

 96547763 AACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAAT 96547822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAAT 1224

 96547823 AATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGA 96547882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGA 1284

 96547883 ATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCA 96547942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 ATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCA 1344

 96547943 TTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTG 96548002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTG 1404

 96548003 CCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTA 96548062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTA 1464

 96548063 CTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 96548122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 1524

 96548123 AGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 96548182
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 AGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 1584

 96548183 CATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAG 96548242
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1585 CATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAG 1644

 96548243 CTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACAACGGTCTCG 96548302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1645 CTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACTACGGTCTCG 1704

 96548303 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTG 96548362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTG 1764

 96548363 AGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAATGG 96548422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAATGG 1824

 96548423 TTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACAAAC 96548482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACAAAC 1884

 96548483 TCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATTTTT 96548542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATTTTT 1944

 96548543 ACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAG 96548602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAG 2004

 96548603 AAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGATAAA 96548662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGATAAA 2064

 96548663 TCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAA 96548722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAA 2124

 96548723 CCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTG 96548782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTG 2184

 96548783 AAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAATATCTTTATAGTGTGGTTAAT 96548842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAATATCTTTATAGTGTGGTTAAT 2244

 96548843 ATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAAGAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTT 96548902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 ATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAAGAAAAAAATAACTCAAGTTTTTTT 2304

 96548903 AAATAAGGCAGAAA 96548916
          ||||||||||||||
     2305 AAATAAGGCAGAAA 2318

Alignment time is 3.27213 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10133] =>     10133 nucs 'mol-32-331c-102619_10133'

Score:        9880
Aligned:     10059        nucs
Identic:     10037 (100%) nucs =>      7801 (100%)      2236 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96535469,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548843]
 second seq =>  [       1,    7806] EXCISED REGION [    7890,   10133]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [7807,7889]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [7805,7806] to [7890,7891]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96535469 TTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAATTGTTAGCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGG 96535528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCATTTGAATATCATACTGTCCATAAATTGTTAGCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGG 60

 96535529 GGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCATTCGTGGTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGG 96535588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTGCCATTCGTGGTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGG 120

 96535589 AGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATTCGGTTAATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGA 96535648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCTGATTCGGTTAATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGA 180

 96535649 ACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTTTCTACAGGAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTT 96535708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCTTCCTGATAATATTTACTTATAATTTTCTACAGGAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTT 240

 96535709 ATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTATCCTGCAACCTGATAAATTATCTTAAATTGAT 96535768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAAAATATCCATTGGTTTCATAATTATCCTGCAACCTGATAAATTATCTTAAATTGAT 300

 96535769 GGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGACCCCAAAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTT 96535828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTCCTGACCCCAAAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTT 360

 96535829 CAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAAAAAATCAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAA 96535888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACTTTAAAACTAATAAATGCCACAAAAAAAATCAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAA 420

 96535889 GAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGTTATATGTTTCCATAATTCTTTTAAATACATT 96535948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGACTGTTATATGTTTCCATAATTCTTTTAAATACATT 480

 96535949 ACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAATTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAA 96536008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATGTAGACATTAAGTACATTAAGAAAATTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAA 540

 96536009 TGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGATGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTT 96536068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAAATTATCCTGACCCTAGCATAAAGATGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTT 600

 96536069 CACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGTTGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAA 96536128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACTGACTCCTATTTTATTTCTTGGCTGTTGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAA 660

 96536129 AATAAAATTTCATTCATTCATATGCACTCATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAA 96536188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATAAAATTTCATTCATTCATATGCACTCATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAA 720

 96536189 ATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATT 96536248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATT 780

 96536249 TTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGA 96536308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGA 840

 96536309 ACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGC 96536368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGC 900

 96536369 TGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTT 96536428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTT 960

 96536429 TACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCT 96536488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCT 1020

 96536489 TGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAG 96536548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAG 1080

 96536549 CAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATA 96536608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATA 1140

 96536609 TGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTA 96536668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTA 1200

 96536669 TCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAA 96536728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAA 1260

 96536729 CAGGATTTTCTTAGACTGCCTTTAAAATGATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTA 96536788
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGATTTTCTTAGACTGTCTTTAAAATGATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTA 1320

 96536789 ATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGA 96536848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGA 1380

 96536849 CTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATAT 96536908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATAT 1440

 96536909 TACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTA 96536968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTA 1500

 96536969 AGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAA 96537028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAA 1560

 96537029 AACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAA 96537088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAA 1620

 96537089 TCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGC 96537148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGC 1680

 96537149 TTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGA 96537208
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1681 TTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGACCATGTGA 1740

 96537209 GGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGAC 96537268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGAC 1800

 96537269 ACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCC 96537328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCC 1860

 96537329 AGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTA 96537388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTA 1920

 96537389 TAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGAC 96537448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGAC 1980

 96537449 TCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAG 96537508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAG 2040

 96537509 TTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTT 96537568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTT 2100

 96537569 GGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTC 96537628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTC 2160

 96537629 TCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAA 96537688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAA 2220

 96537689 CTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACA 96537748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACA 2280

 96537749 GCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAA 96537808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAA 2340

 96537809 GTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGG 96537868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGG 2400

 96537869 AATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTG 96537928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTG 2460

 96537929 GCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACAT 96537988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACAT 2520

 96537989 CCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACA 96538048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACA 2580

 96538049 TCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGT 96538108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGT 2640

 96538109 CACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGG 96538168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGG 2700

 96538169 GACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGGAGA 96538228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGGAGA 2760

 96538229 CAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAG 96538288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAG 2820

 96538289 CATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAA 96538348
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATGTGGGAAACCCAAGGTTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAA 2880

 96538349 ATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCT 96538408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCT 2940

 96538409 AATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATA 96538468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATA 3000

 96538469 CATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTCTGTGTGTGTGTGTG 96538528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTCTGTGTGTGTGTGTG 3060

 96538529 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTATA 96538588
          ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG--------ACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTTTATA 3112

 96538589 GTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTCTG 96538648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 GTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTTTCTG 3172

 96538649 CATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAGTG 96538708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 CATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGAAGTG 3232

 96538709 ATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCTTT 96538768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 ATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTATCTTT 3292

 96538769 GACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCCAT 96538828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 GACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGGCCAT 3352

 96538829 CACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGACTA 96538888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 CACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAGACTA 3412

 96538889 ACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGTTT 96538948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 ACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGTGTTT 3472

 96538949 GGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCTTC 96539008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 GGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTGCTTC 3532

 96539009 GCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAAAC 96539068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 GCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGAAAAC 3592

 96539069 AATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCAAG 96539128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 AATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATCCAAG 3652

 96539129 AGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATA 96539188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 AGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGATGATA 3712

 96539189 GATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAAT 96539248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 GATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGGAAAT 3772

 96539249 GTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGT 96539308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 GTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCTACGT 3832

 96539309 ACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAG 96539368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 ACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAGAAAG 3892

 96539369 AAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCC 96539428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 AAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCC 3952

 96539429 TTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGA 96539488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGA 4012

 96539489 TTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCT 96539548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCT 4072

 96539549 TAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTG 96539608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 TAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTG 4132

 96539609 AAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTT 96539668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 AAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTT 4192

 96539669 TTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAG 96539728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 TTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAG 4252

 96539729 TTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGT 96539788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 TTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGT 4312

 96539789 ATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAG 96539848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 ATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAG 4372

 96539849 GTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACAC 96539908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 GTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACAC 4432

 96539909 TCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGC 96539968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 TCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGC 4492

 96539969 AGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTG 96540028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 AGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTG 4552

 96540029 CTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATG 96540088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 CTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATG 4612

 96540089 GCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGT 96540148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 GCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGT 4672

 96540149 TGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCT 96540208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 TGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCT 4732

 96540209 TCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAA 96540268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 TCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAA 4792

 96540269 ATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATG 96540328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 ATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATG 4852

 96540329 GATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTC 96540388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 GATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTC 4912

 96540389 ATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATA 96540448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 ATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATA 4972

 96540449 TGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATC 96540508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 TGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATC 5032

 96540509 AGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAA 96540568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 AGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAA 5092

 96540569 GAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATA 96540628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 GAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATA 5152

 96540629 GAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATA 96540688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 GAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATA 5212

 96540689 CAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGC 96540748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 CAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGC 5272

 96540749 AAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATG 96540808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 AAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATG 5332

 96540809 AATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCT 96540868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 AATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCT 5392

 96540869 GATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGG 96540928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 GATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGG 5452

 96540929 CATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGT 96540988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 CATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGT 5512

 96540989 TTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACA 96541048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 TTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACA 5572

 96541049 GTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTG 96541108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 GTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTG 5632

 96541109 AAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGT 96541168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 AAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGT 5692

 96541169 CTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATC 96541228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 CTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATC 5752

 96541229 CACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTT 96541288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 CACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTT 5812

 96541289 ACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGA 96541348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 ACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGA 5872

 96541349 AGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTA 96541408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 AGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTA 5932

 96541409 ATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGT 96541468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 ATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGT 5992

 96541469 AAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTA 96541528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 AAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTA 6052

 96541529 AATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGT 96541588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 AATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGT 6112

 96541589 ATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCA 96541648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 ATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCA 6172

 96541649 TATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTA 96541708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 TATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTA 6232

 96541709 ATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTG 96541768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 ATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTG 6292

 96541769 CAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCA 96541828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 CAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCA 6352

 96541829 TCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGA 96541888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGA 6412

 96541889 ATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTT 96541948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 ATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTT 6472

 96541949 TTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGA 96542008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 TTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGA 6532

 96542009 GGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCAT 96542068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 GGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCAT 6592

 96542069 AACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATA 96542128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 AACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATA 6652

 96542129 TAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATT 96542188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 TAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATT 6712

 96542189 ACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAA 96542248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 ACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAA 6772

 96542249 TTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTA 96542308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 TTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTA 6832

 96542309 TACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCT 96542368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 TACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCT 6892

 96542369 TGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATG 96542428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 TGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATG 6952

 96542429 TGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGC 96542488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 TGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGC 7012

 96542489 TCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCT 96542548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 TCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCT 7072

 96542549 CGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTT 96542608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 CGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTT 7132

 96542609 CATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTC 96542668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 CATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTC 7192

 96542669 CCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTT 96542728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 CCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTT 7252

 96542729 CTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTG 96542788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 CTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTG 7312

 96542789 CTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTC 96542848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 CTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTC 7372

 96542849 TCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTT 96542908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 TCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTT 7432

 96542909 TCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGT 96542968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 TCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGT 7492

 96542969 CTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCT 96543028
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 CTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCT 7552

 96543029 ATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTA 96543088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 ATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTA 7612

 96543089 CCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCT 96543148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 CCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCT 7672

 96543149 GCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTT 96543208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 GCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTT 7732

 96543209 CTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCT 96543268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7733 CTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCT 7792

 96543269 CCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||
     7793 CCTTACTTTCAACT 7806

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7890 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 7949

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7950 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 8009

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8010 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 8069

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8070 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 8129

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8130 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 8189

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8190 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 8249

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8250 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 8309

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8310 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 8369

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8370 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 8429

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8430 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 8489

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8490 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 8549

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8550 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 8609

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8610 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 8669

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8670 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACCTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 8729

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8730 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 8789

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8790 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 8849

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8850 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 8909

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8910 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 8969

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8970 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 9029

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9030 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 9089

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9090 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 9149

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9150 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 9209

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9210 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 9269

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9270 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 9329

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     9330 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTG 9388

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 96548158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     9389 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGC 9448

 96548159 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACT 96548218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     9449 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACT 9508

 96548219 ACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 96548278
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9509 ACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 9568

 96548279 ACCATGTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96548338
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9569 ACCATGTTAGCCACTACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 9628

 96548339 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 96548398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9629 CAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCT 9688

 96548399 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 96548458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9689 TAATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAAT 9748

 96548459 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 96548518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9749 TTGTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGAC 9808

 96548519 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 96548578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9809 ATTTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGG 9868

 96548579 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 96548638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9869 GTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTA 9928

 96548639 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 96548698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9929 TATCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAA 9988

 96548699 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 96548758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9989 GACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCT 10048

 96548759 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 96548818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10049 GCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCAT 10108

 96548819 GAATATCTTTATAGTGTGGTTAATA 96548843
          |||||||||||||||||||||||||
    10109 GAATATCTTTATAGTGTGGTTAATA 10133

Alignment time is 13.5515 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2244] =>      2244 nucs 'mol-32-331c-102619_2244'

Score:        2156
Aligned:      2244        nucs
Identic:      2236 (100%) nucs =>        23 (100%)      2213 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96546599,96546621] EXCISED REGION [96546623,96548843]
 second seq =>  [       1,      23] EXCISED REGION [      25,    2244]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [96546622,96546622]
 second seq =>         1 nucs [24,24]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [96548081,96548081]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96546618,96546621] to [96546623,96546626]
 second seq =>         4 nucs [20,23] to [25,28]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACC 96546621
          |||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACC 23

EXCISED REGION

 96546623 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATG 96546682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       25 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATG 84

 96546683 GTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 96546742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       85 GTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 144

 96546743 AGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCT 96546802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      145 AGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCT 204

 96546803 CAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGA 96546862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 CAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGA 264

 96546863 GGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTC 96546922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 GGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGATTGGGTTTC 324

 96546923 TTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCT 96546982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 TTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCT 384

 96546983 CTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTG 96547042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTG 444

 96547043 GATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGT 96547102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAATTACCCAGT 504

 96547103 CTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAAAGAATATG 96547162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      505 CTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTGAAGAATATG 564

 96547163 AAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGAT 96547222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 AAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATTATTGAGAT 624

 96547223 TTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTT 96547282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGATAGAAATTT 684

 96547283 AGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTC 96547342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 AGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGATTATTGTTC 744

 96547343 TAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTA 96547402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTA 804

 96547403 CTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACT 96547462
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CCTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAGAATTCACT 864

 96547463 AAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAAT 96547522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 AAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAAT 924

 96547523 CATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTT 96547582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 CATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACACAAGTTTT 984

 96547583 ATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAA 96547642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 ATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAA 1044

 96547643 CAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGACACAGTGG 96547702
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1045 CAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGACACAGTGG 1104

 96547703 GCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAA 96547762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAA 1164

 96547763 AACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAAT 96547822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAATCTGGTAAT 1224

 96547823 AATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGA 96547882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGATGGAGGAGA 1284

 96547883 ATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCA 96547942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 ATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAAATATTTCA 1344

 96547943 TTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTG 96548002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTG 1404

 96548003 CCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTA 96548062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGGTTATAGTA 1464

 96548063 CTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 96548122
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCC 1523

 96548123 AGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 96548182
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 AGGCTGGAGTGCTGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGC 1583

 96548183 CATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACGCCCAG 96548242
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1584 CATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACCACCCCCAG 1643

 96548243 CTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACAACGGTCTCG 96548302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1644 CTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCACTACGGTCTCG 1703

 96548303 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTG 96548362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGATTACAGGCGTG 1763

 96548363 AGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAATGG 96548422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 AGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAATGG 1823

 96548423 TTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACAAAC 96548482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 TTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACAAAC 1883

 96548483 TCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATTTTT 96548542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATTTTT 1943

 96548543 ACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAG 96548602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 ACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGTTAG 2003

 96548603 AAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGATAAA 96548662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 AAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGATAAA 2063

 96548663 TCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAA 96548722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAA 2123

 96548723 CCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTG 96548782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 CCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAAGTG 2183

 96548783 AAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAATATCTTTATAGTGTGGTTAAT 96548842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 AAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAATATCTTTATAGTGTGGTTAAT 2243

 96548843 A 96548843
          |
     2244 A 2244

Alignment time is 2.95739 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3020] =>      3020 nucs 'mol-32-338a-121445_3020'

Score:        2893
Aligned:      2937        nucs
Identic:      2933 (100%) nucs =>      1644 (100%)      1289 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541638,96543282] EXCISED REGION [96546599,96547890]
 second seq =>  [       1,    1645] EXCISED REGION [    1729,    3020]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1646,1728]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1644,1645] to [1729,1730]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541638 AAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGC 96541697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGC 60

 96541698 TCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAA 96541757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAA 120

 96541758 ATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAG 96541817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAG 180

 96541818 CTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTT 96541877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTT 240

 96541878 GAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTT 96541937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTT 300

 96541938 TCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTT 96541997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTT 360

 96541998 TTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTC 96542057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTC 420

 96542058 ATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTAT 96542117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTAT 480

 96542118 GGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTA 96542177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTA 540

 96542178 GTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTA 96542237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTA 600

 96542238 ACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGT 96542297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGT 660

 96542298 CTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCT 96542357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCT 720

 96542358 TTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAA 96542417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAA 780

 96542418 CACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCC 96542477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCC 840

 96542478 AACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGG 96542537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGG 900

 96542538 GCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGAT 96542597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGAT 960

 96542598 ACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAG 96542657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAG 1020

 96542658 CTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAG 96542717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAG 1080

 96542718 GTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATA 96542777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATA 1140

 96542778 CAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATT 96542837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATT 1200

 96542838 CCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGA 96542897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGA 1260

 96542898 ACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGG 96542957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGG 1320

 96542958 CTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCA 96543017
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCA 1380

 96543018 ATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCC 96543077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCC 1440

 96543078 TGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAA 96543137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAA 1500

 96543138 TAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGC 96543197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGC 1560

 96543198 TCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCA 96543257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCA 1620

 96543258 TTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 1645

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1788

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1848

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 1908

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 1968

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2028

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2088

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2148

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2208

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 2268

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2328

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2388

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2448

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 2508

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 2568

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 2628

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 2688

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 2748

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 2808

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 2868

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 2928

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 2988

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTAT 96547890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTAT 3020

Alignment time is 3.99872 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3240] =>      3240 nucs 'mol-32-338a-166181_3240'

Score:        3136
Aligned:      3239        nucs
Identic:      3228 (100%) nucs =>      2765 (100%)       463 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96545584,96548359] EXCISED REGION [96548360,96548822]
 second seq =>  [       1,    2773] EXCISED REGION [    2778,    3240]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2774,2777]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [2774,2778] to [2778,2782]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96545584 CTTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCA 96545643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCA 60

 96545644 GGATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCC 96545703
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCC 120

 96545704 TTCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTG 96545763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTG 180

 96545764 GATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTC 96545823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTC 240

 96545824 AAAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTG 96545883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTG 300

 96545884 CCTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGA 96545943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGA 360

 96545944 TTTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAG 96546003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAG 420

 96546004 TGGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGT 96546063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGT 480

 96546064 GGTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTC 96546123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTC 540

 96546124 ATAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGT 96546183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      541 ATAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGT 600

 96546184 CTATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTT 96546243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      601 CTATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTT 660

 96546244 TTAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAA 96546303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAA 720

 96546304 GAGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAG 96546363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAG 780

 96546364 CATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTT 96546423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTT 840

 96546424 GTTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTT 96546483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTT 900

 96546484 TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAC 96546543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAC 960

 96546544 TGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGG 96546603
          |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
      961 TGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCT---GCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGG 1017

 96546604 ACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTT 96546663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 ACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTT 1077

 96546664 CACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTC 96546723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTC 1137

 96546724 CCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGAT 96546783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGAT 1197

 96546784 TTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTA 96546843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTA 1257

 96546844 AGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCA 96546903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 AGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCA 1317

 96546904 TTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTC 96546963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTC 1377

 96546964 TTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGA 96547023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGA 1437

 96547024 TGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGT 96547083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGT 1497

 96547084 CCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAA 96547143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAA 1557

 96547144 ATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGA 96547203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 ATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGA 1617

 96547204 TTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGAT 96547263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGAT 1677

 96547264 TATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAA 96547323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAA 1737

 96547324 CCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTT 96547383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 CCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTT 1797

 96547384 TCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGG 96547443
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGG 1857

 96547444 ACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAA 96547503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAA 1917

 96547504 GTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTAC 96547563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTAC 1977

 96547564 CATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCT 96547623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 CATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCT 2037

 96547624 TTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGA 96547683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGA 2097

 96547684 TGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGT 96547743
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGT 2157

 96547744 TTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAA 96547803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAA 2217

 96547804 CCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAA 96547863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAA 2277

 96547864 AGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAG 96547923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAG 2337

 96547924 ATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAG 96547983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAG 2397

 96547984 CCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTA 96548043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2398 CCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTT 2457

 96548044 TTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACG 96548103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACG 2517

 96548104 GAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCT 96548163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCT 2577

 96548164 CCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGG 96548223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2578 CCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGG 2637

 96548224 CGTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAT 96548283
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CGTCCACCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAT 2697

 96548284 GTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAG 96548343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GTTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAG 2757

 96548344 GGCTGAGATTACAGGC 96548359
          ||||||||||||||||
     2758 GGCTGAGATTACAGGC 2773

EXCISED REGION

 96548360 GTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAA 96548419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 GTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAGCTGCAAATAAA 2837

 96548420 TGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACA 96548479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 TGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTAAAAATCCAACA 2897

 96548480 AACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATT 96548539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 AACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTTTAAAAAATATT 2957

 96548540 TTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGT 96548599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 TTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAAAGTCCTTTAGT 3017

 96548600 TAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGAT 96548659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATCTTCAGTTTGAT 3077

 96548660 AAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAA 96548719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 AAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGACTCAGAAGCCTTCAGAAAA 3137

 96548720 AAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAA 96548779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 AAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGCTAAACAAGAAATGGAAGAA 3197

 96548780 GTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAAT 96548822
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 GTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGAAT 3240

Alignment time is 4.29283 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3385] =>      3385 nucs 'mol-32-338a-167386_3385'

Score:        3248
Aligned:      3303        nucs
Identic:      3298 (100%) nucs =>      1772 (100%)      1526 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541510,96543282] EXCISED REGION [96546599,96548128]
 second seq =>  [       1,    1773] EXCISED REGION [    1857,    3385]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [1774,1856]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [1772,1773] to [1857,1858]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96541510 GCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACC 96541569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACC 60

 96541570 TTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAAT 96541629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAAT 120

 96541630 GTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTA 96541689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTA 180

 96541690 GTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATT 96541749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATT 240

 96541750 CTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCA 96541809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCA 300

 96541810 ATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGA 96541869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGA 360

 96541870 TGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTA 96541929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTA 420

 96541930 TCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTG 96541989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTG 480

 96541990 ACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGC 96542049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGC 540

 96542050 TTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATA 96542109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATA 600

 96542110 CATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGT 96542169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGT 660

 96542170 CCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTC 96542229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTC 720

 96542230 TTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAA 96542289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAA 780

 96542290 ACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACAT 96542349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACAT 840

 96542350 AACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAA 96542409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAA 900

 96542410 AATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTT 96542469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTT 960

 96542470 TTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAG 96542529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAG 1020

 96542530 AATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTAC 96542589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTAC 1080

 96542590 CACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGC 96542649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGC 1140

 96542650 ATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACA 96542709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACA 1200

 96542710 TAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATT 96542769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATT 1260

 96542770 GTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATC 96542829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATC 1320

 96542830 TGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCA 96542889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCA 1380

 96542890 TAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATG 96542949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATG 1440

 96542950 CCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAA 96543009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAA 1500

 96543010 CTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAA 96543069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAA 1560

 96543070 CAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCA 96543129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCA 1620

 96543130 TCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATC 96543189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATC 1680

 96543190 TCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTA 96543249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTA 1740

 96543250 AGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 1773

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 96546658
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 1916

 96546659 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 96546718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 GGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCG 1976

 96546719 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 96546778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCT 2036

 96546779 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 96546838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 ATGATTTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAG 2096

 96546839 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 96546898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TATTAAGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGC 2156

 96546899 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 96546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 CGCCATTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCC 2216

 96546959 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 96547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 CCCTCTTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCA 2276

 96547019 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 96547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CCAGATGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATT 2336

 96547079 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 96547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TCTGTCCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCAT 2396

 96547139 ACAAAATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 96547198
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 ACAAAATAATATTTGAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCT 2456

 96547199 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 96547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CATGATTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTA 2516

 96547259 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 96547318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TAGATTATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGT 2576

 96547319 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 96547378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CCCAACCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAA 2636

 96547379 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 96547438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GTTTTTCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTT 2696

 96547439 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 96547498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GAAGGACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTG 2756

 96547499 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 96547558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GTTAAGTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATA 2816

 96547559 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 96547618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ACTACCATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATC 2876

 96547619 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 96547678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 AGCCTTTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACT 2936

 96547679 TCAGATGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 96547738
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TCAGATGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGG 2996

 96547739 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 96547798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AAAGTTTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTAC 3056

 96547799 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 96547858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TGAAACCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAA 3116

 96547859 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 96547918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 AACAAAGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACA 3176

 96547919 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 96547978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 AAAAGATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCT 3236

 96547979 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 96548038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CAAAGCCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCC 3296

 96548039 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 96548098
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     3297 CATTATTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTG 3355

 96548099 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTG 96548128
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 AGACGGAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTG 3385

Alignment time is 4.77869 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9976] =>      9976 nucs 'mol-32-3395-125171_9976'

Score:        9609
Aligned:      9977        nucs
Identic:      9937 (100%) nucs =>      2327 ( 99%)      7610 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96536178,96538514] EXCISED REGION [96538525,96546152]
 second seq =>  [       1,    2338] EXCISED REGION [    2339,    9976]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [96538515,96538524]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [96538515,96538546] to [96538525,96538556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96538515,96538518] to [96538521,96538524]
 second seq =>         0 nucs

 96536178 CTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTAGATGGAGAAGTGAAC 96536237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTATACCCTTCTAGATGGAGAAGTGAAC 60

 96536238 AGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACAGGTAATTAACCTCAA 96536297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCTCACCACACAGGTAATTAACCTCAA 120

 96536298 GTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGGTATTAACCACCCAAA 96536357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTTTGCCTCAGGTATTAACCACCCAAA 180

 96536358 AAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAGAATTTCACATGGCAT 96536417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATAGCTGGGTAGAATTTCACATGGCAT 240

 96536418 AATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGT 96536477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTAAAAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGT 300

 96536478 TGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTAATTAGAAATTACACA 96536537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTTCTGCAGCTAATTAGAAATTACACA 360

 96536538 CGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTA 96536597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCAAGTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTA 420

 96536598 AAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTATTGATATCCATGGTTT 96536657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATACAAAAGTATTGATATCCATGGTTT 480

 96536658 GAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCACTGAAATCAGATATGA 96536717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCTAATTGTCACTGAAATCAGATATGA 540

 96536718 CCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGCCTTTAAAATGATCTAAGTGTGCAAATTACC 96536777
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGTCTTTAAAATGATCTAAGTGTGCAAATTACC 600

 96536778 ATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGA 96536837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCTAATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGA 660

 96536838 ATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGTATCTTGTAATAAATG 96536897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTGGAATAAAGTATCTTGTAATAAATG 720

 96536898 GATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACACATGGTGTGAAAGAAC 96536957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCATGGCTGACACATGGTGTGAAAGAAC 780

 96536958 TCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATATTAGCTCCTTCCTGA 96537017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAATTAATCATATTAGCTCCTTCCTGA 840

 96537018 ATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCACCAAAATTTATGTGT 96537077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCCAAATATCCACCAAAATTTATGTGT 900

 96537078 CGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAA 96537137
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGAAACTTAAATCCCCATTGTGATAGTATTAATAGGTGGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAA 960

 96537138 GTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTT 96537197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTTTCAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTT 1020

 96537198 AGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCACTATCT 96537257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGAGGATGCAGCAACAAGTCACTATCT 1080

 96537258 TGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACT 96537317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAACTTGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACT 1140

 96537318 TCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGG 96537377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGCTTTTTATAAATTACCCAGGCTTGG 1200

 96537378 GTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGC 96537437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAGGAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGC 1260

 96537438 GAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGG 96537497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGACACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGG 1320

 96537498 GAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATA 96537557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAACCTCATAATTAATGAGCTCTTTATA 1380

 96537558 TGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCACAGTCATAT 96537617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1381 TGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCATTTTATTTAATCCTCGCAGTCATAT 1440

 96537618 GAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGA 96537677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATAAGGATATCGAGGTTTAGAATGGGA 1500

 96537678 AGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGG 96537737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTGCAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGG 1560

 96537738 TTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTC 96537797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACCCTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTC 1620

 96537798 AAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCT 96537857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGCCTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCT 1680

 96537858 ACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGA 96537917
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTGATCACGGAATTAAGAAGTATGCTATTAGATGGAGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGA 1740

 96537918 ATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTAC 96537977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAACTGAATACAAATATTCTGTGGTAC 1800

 96537978 TTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCC 96538037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCC 1860

 96538038 AATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATAC 96538097
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATAC 1920

 96538098 AAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATA 96538157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATA 1980

 96538158 CAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAA 96538217
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGGATACTGGGACTCCCAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAA 2040

 96538218 AAGACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTC 96538277
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AA-ACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTC 2099

 96538278 CTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGT 96538337
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
     2100 CTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATATCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGT 2159

 96538338 ACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGA 96538397
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATATATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGA 2219

 96538398 CATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGG 96538457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGG 2279

 96538458 GTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGT--ATGTATATATTCTCCACTC 96538514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
     2280 GTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTC 2338

EXCISED REGION

 96538525 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 96538584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 2398

 96538585 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 96538644
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCATCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 2458

 96538645 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 96538704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2459 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTAGTATCCTTACTTTGA 2518

 96538705 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 96538764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 2578

 96538765 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 96538824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 2638

 96538825 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 96538884
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGAAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 2698

 96538885 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGT 96538944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2699 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAATGCAGAGAGAGATTTTTGT 2758

 96538945 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 96539004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 2818

 96539005 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 96539064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 2878

 96539065 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 96539124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 2938

 96539125 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 96539184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 2998

 96539185 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 96539244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 3058

 96539245 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 96539304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 3118

 96539305 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 96539364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 3178

 96539365 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 96539424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 3238

 96539425 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 96539484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 3298

 96539485 AAGATTACTAAGC-AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 96539543
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 3358

 96539544 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 96539603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 3418

 96539604 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 96539663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 3478

 96539664 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 96539723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 3538

 96539724 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 96539783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 3598

 96539784 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 96539843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 3658

 96539844 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 96539903
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 3718

 96539904 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 96539963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 3778

 96539964 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 96540023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 3838

 96540024 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 96540083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 3898

 96540084 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 96540143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 3958

 96540144 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 96540203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 4018

 96540204 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 96540263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 4078

 96540264 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 96540323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 4138

 96540324 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 96540383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 4198

 96540384 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 96540443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 4258

 96540444 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 96540503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 4318

 96540504 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 96540563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 4378

 96540564 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 96540623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 4438

 96540624 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 96540683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 4498

 96540684 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 96540743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 4558

 96540744 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 96540803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 4618

 96540804 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 96540863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4619 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 4678

 96540864 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 96540923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 4738

 96540924 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 96540983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 4798

 96540984 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 96541043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 4858

 96541044 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 96541103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 4918

 96541104 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 96541163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 4978

 96541164 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 96541223
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 5038

 96541224 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 96541283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 5098

 96541284 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 96541343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 5158

 96541344 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 96541403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 5218

 96541404 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 96541463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 5278

 96541464 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 96541523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 5338

 96541524 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 96541583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 5398

 96541584 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 96541643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 5458

 96541644 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 96541703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 5518

 96541704 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 96541763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 5578

 96541764 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 96541823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 5638

 96541824 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 96541883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 5698

 96541884 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 96541943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 5758

 96541944 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 96542003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 5818

 96542004 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 96542063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 5878

 96542064 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 96542123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 5938

 96542124 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 96542183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 5998

 96542184 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 96542243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5999 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCA 6058

 96542244 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 96542303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 6118

 96542304 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 96542363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 6178

 96542364 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 96542423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 6238

 96542424 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 96542483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 6298

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 6358

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 6418

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 6478

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 6538

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 6598

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 6658

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 6718

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 6778

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 6838

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 6898

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 6958

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 7018

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 7078

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 96543323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 7138

 96543324 GCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 96543383
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 GCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 7198

 96543384 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACG 96543443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     7199 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACG 7258

 96543444 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 96543503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 7318

 96543504 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 96543563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 7378

 96543564 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 96543623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7379 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 7438

 96543624 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 96543683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7439 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 7498

 96543684 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 96543743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 7558

 96543744 TTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 96543803
          |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7559 TTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 7618

 96543804 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 96543863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7619 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 7678

 96543864 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 96543923
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     7679 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 7738

 96543924 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 96543983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7739 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 7798

 96543984 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 96544043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7799 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 7858

 96544044 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 96544103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7859 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 7918

 96544104 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAA 96544162
          ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| |||||
     7919 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAA 7978

 96544163 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 96544222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7979 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 8038

 96544223 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 96544282
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8039 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 8098

 96544283 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTT 96544342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8099 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTT 8158

 96544343 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 96544402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8159 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 8218

 96544403 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 96544462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8219 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 8278

 96544463 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 96544522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8279 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 8338

 96544523 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 96544582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8339 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 8398

 96544583 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 96544642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8399 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 8458

 96544643 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 96544702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8459 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 8518

 96544703 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 96544762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8519 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 8578

 96544763 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 96544822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8579 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 8638

 96544823 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 96544882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8639 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 8698

 96544883 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 96544942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8699 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 8758

 96544943 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 96545002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8759 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 8818

 96545003 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT--------ATACATACAT 96545054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||
     8819 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATATATACATACATACATACAT 8878

 96545055 ACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTG 96545114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8879 ACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTG 8938

 96545115 AAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCC 96545174
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     8939 AAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCC 8998

 96545175 TTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCAT 96545234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8999 TTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCAT 9058

 96545235 CTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGC 96545294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9059 CTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGC 9118

 96545295 AGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGT 96545354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9119 AGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGT 9178

 96545355 TGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACA 96545414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9179 TGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACA 9238

 96545415 ACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACG 96545474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9239 ACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACG 9298

 96545475 AACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAA 96545534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9299 AACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAA 9358

 96545535 AGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAA 96545594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9359 AGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAA 9418

 96545595 GTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACC 96545654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9419 GTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACC 9478

 96545655 CATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGC 96545714
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9479 CATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGC 9538

 96545715 TTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTC 96545774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9539 TTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTC 9598

 96545775 CATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAG 96545834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9599 CATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAG 9658

 96545835 AAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAAT 96545894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9659 AAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAAT 9718

 96545895 TAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCT 96545954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9719 TAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCT 9778

 96545955 CCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAG 96546014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9779 CCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAG 9838

 96546015 GTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACAT 96546074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9839 GTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACAT 9898

 96546075 TATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGC 96546134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9899 TATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGC 9958

 96546135 TGGTACTAACAGTAAGTC 96546152
          ||||||||||||||||||
     9959 TGGTACTAACAGTAAGTC 9976

Alignment time is 13.3209 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7223] =>      7223 nucs 'mol-32-33a0-137117_7223'

Score:        6954
Aligned:      7230        nucs
Identic:      7200 (100%) nucs =>      3568 (100%)      3632 ( 99%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541468,96545044] EXCISED REGION [96545053,96548700]
 second seq =>  [       1,    3578] EXCISED REGION [    3579,    7223]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [96545045,96545052]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        31 nucs [96545045,96545075] to [96545053,96545083]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545053,96545054]
 second seq =>         2 nucs [3577,3578] to [3579,3580]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96545045,96545048] to [96545049,96545052]
 second seq =>         0 nucs

 96541468 TAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCT 96541527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCT 60

 96541528 AAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTG 96541587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTG 120

 96541588 TATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACC 96541647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACC 180

 96541648 ATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTT 96541707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTT 240

 96541708 AATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCT 96541767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCT 300

 96541768 GCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGC 96541827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGC 360

 96541828 ATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAG 96541887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAG 420

 96541888 AATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTT 96541947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTT 480

 96541948 TTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAG 96542007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAG 540

 96542008 AGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCA 96542067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCA 600

 96542068 TAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGAT 96542127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGAT 660

 96542128 ATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCAT 96542187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCAT 720

 96542188 TACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATA 96542247
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      721 TACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATA 780

 96542248 ATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCT 96542307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCT 840

 96542308 ATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATC 96542367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATC 900

 96542368 TTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTAT 96542427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTAT 960

 96542428 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 96542487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTG 1020

 96542488 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 96542547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATC 1080

 96542548 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 96542607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCT 1140

 96542608 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 96542667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCT 1200

 96542668 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 96542727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTT 1260

 96542728 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 96542787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCT 1320

 96542788 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 96542847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATT 1380

 96542848 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 96542907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCT 1440

 96542908 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 96542967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTG 1500

 96542968 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 96543027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTC 1560

 96543028 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 96543087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTT 1620

 96543088 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 96543147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCC 1680

 96543148 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 96543207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTT 1740

 96543208 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 96543267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGC 1800

 96543268 TCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCAC 96543327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCAC 1860

 96543328 TGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACA 96543387
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACA 1920

 96543388 GTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTG 96543447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1921 GTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTG 1980

 96543448 AGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCC 96543507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCC 2040

 96543508 ACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAA 96543567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAA 2100

 96543568 TAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTAT 96543627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTAT 2160

 96543628 TAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTG 96543687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTG 2220

 96543688 CTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGT 96543747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGT 2280

 96543748 TACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACA 96543807
          |||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACA 2340

 96543808 TTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAA 96543867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAA 2400

 96543868 CGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACT 96543927
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACT 2460

 96543928 AGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAA 96543987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAA 2520

 96543988 GCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAG 96544047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAG 2580

 96544048 GGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAG 96544107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAG 2640

 96544108 AAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA- 96544166
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2641 AAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAA 2700

 96544167 CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTG 96544226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTG 2760

 96544227 CTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACAT 96544286
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACAT 2820

 96544287 ATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGT 96544346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2821 ATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGT 2880

 96544347 GATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATAT 96544406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATAT 2940

 96544407 TGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACT 96544466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACT 3000

 96544467 GAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACC 96544526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACC 3060

 96544527 ACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTAC 96544586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTAC 3120

 96544587 ATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATT 96544646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATT 3180

 96544647 TGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAAC 96544706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAAC 3240

 96544707 TTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCT 96544766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCT 3300

 96544767 CATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAG 96544826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAG 3360

 96544827 TTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGC 96544886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGC 3420

 96544887 AGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCA 96544946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCA 3480

 96544947 CTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTG 96545006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTG 3540

 96545007 GGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 3578

EXCISED REGION

 96545053 ATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGG 96545112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 ATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGG 3638

 96545113 TGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACC 96545172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3639 TGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACC 3698

 96545173 CCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGC 96545232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 CCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGC 3758

 96545233 ATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACAT 96545292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 ATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACAT 3818

 96545293 GCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAA 96545352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 GCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAA 3878

 96545353 GTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAA 96545412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 GTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAA 3938

 96545413 CAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTA 96545472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3939 CAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTA 3998

 96545473 CGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTA 96545532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3999 CGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTA 4058

 96545533 AAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAG 96545592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4059 AAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAG 4118

 96545593 AAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAA 96545652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4119 AAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAA 4178

 96545653 CCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCA 96545712
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4179 CCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCA 4238

 96545713 GCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGAT 96545772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4239 GCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGAT 4298

 96545773 TCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCA 96545832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4299 TCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCA 4358

 96545833 AGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGA 96545892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4359 AGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGA 4418

 96545893 ATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGG 96545952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4419 ATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGG 4478

 96545953 CTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTA 96546012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4479 CTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTA 4538

 96546013 AGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTAC 96546072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4539 AGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTAC 4598

 96546073 ATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATA 96546132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4599 ATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATA 4658

 96546133 GCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTCTATACAAA 96546192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4659 GCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTCTATACAAA 4718

 96546193 TAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCA 96546252
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4719 TAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCA 4778

 96546253 ATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGA 96546312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4779 ATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGA 4838

 96546313 ACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAAT 96546372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4839 ACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAAT 4898

 96546373 ATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAA 96546432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4899 ATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAA 4958

 96546433 TAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGG 96546492
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
     4959 TAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC--TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGG 5016

 96546493 AGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTC 96546552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 AGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTC 5076

 96546553 GGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCT 96546612
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 GGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCT 5133

 96546613 CCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTT 96546672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 CCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTT 5193

 96546673 AGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 96546732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 AGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 5253

 96546733 TGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTT 96546792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 TGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTT 5313

 96546793 TGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAA 96546852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 TGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAA 5373

 96546853 ACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGG 96546912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 ACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGG 5433

 96546913 ATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCT 96546972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 ATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCT 5493

 96546973 CTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCC 96547032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 CTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCC 5553

 96547033 CTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAA 96547092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 CTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAA 5613

 96547093 ATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTT 96547152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 ATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTT 5673

 96547153 AAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAA 96547212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 AAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAA 5733

 96547213 TTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAG 96547272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 TTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAG 5793

 96547273 ATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGG 96547332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 ATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGG 5853

 96547333 ATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATT 96547392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 ATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATT 5913

 96547393 AAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGC 96547452
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 AAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGC 5973

 96547453 AGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCT 96547512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 AGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCT 6033

 96547513 CCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGA 96547572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 CCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGA 6093

 96547573 CACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAG 96547632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 CACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAG 6153

 96547633 GTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCA 96547692
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6154 GTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCA 6213

 96547693 GACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTT 96547752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 GACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTT 6273

 96547753 TAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCA 96547812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 TAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCA 6333

 96547813 ATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGG 96547872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6334 ATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGG 6393

 96547873 ATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATG 96547932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 ATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATG 6453

 96547933 AAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAG 96547992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 AAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAG 6513

 96547993 GAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATG 96548052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     6514 GAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTTTCTCCATG 6573

 96548053 GGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGC 96548112
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 GGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGATTCGC 6632

 96548113 TCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCC 96548172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6633 TCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCC 6692

 96548173 GGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCA 96548232
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6693 GGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGCGTCCACCA 6752

 96548233 CCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAC 96548292
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6753 CCACGCCCAGCTAAT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAC 6811

 96548293 AACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGAT 96548352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 AACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGAGAT 6871

 96548353 TACAGGC----GTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAG 96548408
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 TACAGGCGTGAGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTAATCCAGAG 6931

 96548409 CTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTA 96548468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 CTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTTGTTTCTTA 6991

 96548469 AAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTT 96548528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 AAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACATTTATTTTT 7051

 96548529 TAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAA 96548588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 TAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGTAAAAATAA 7111

 96548589 AGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATC 96548648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7112 AGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATATCCAGATC 7171

 96548649 TTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGA 96548700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 TTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGA 7223

Alignment time is 9.47012 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5947] =>      5947 nucs 'mol-32-33b6-023217_5947'

Score:        5740
Aligned:      5942        nucs
Identic:      5922 (100%) nucs =>      2826 (100%)      3096 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96542210,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548150]
 second seq =>  [       1,    2836] EXCISED REGION [    2845,    5947]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [2837,2844]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [2837,2875] to [2845,2883]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [2835,2836] to [2845,2846]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2837,2840] to [2841,2844]

 96542210 GAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATT 96542269
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATT 60

 96542270 TGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTT 96542329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTT 120

 96542330 ATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTG 96542389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTG 180

 96542390 GATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACA 96542449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACA 240

 96542450 AGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTG 96542509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTG 300

 96542510 AAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCC 96542569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCC 360

 96542570 ATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCT 96542629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCT 420

 96542630 CAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCA 96542689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCA 480

 96542690 ATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGC 96542749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGC 540

 96542750 TGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAA 96542809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAA 600

 96542810 GTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGG 96542869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGG 660

 96542870 TTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTC 96542929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTC 720

 96542930 CATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGA 96542989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGA 780

 96542990 AATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTC 96543049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTC 840

 96543050 ATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATAT 96543109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATAT 900

 96543110 CCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAA 96543169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAA 960

 96543170 GTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATC 96543229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATC 1020

 96543230 TAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTT 96543289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTT 1080

 96543290 TCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCA 96543349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1081 TCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCA 1140

 96543350 TAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAG 96543409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAG 1200

 96543410 AAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAAT 96543469
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAAT 1260

 96543470 ACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGA 96543529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGA 1320

 96543530 CTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGA 96543589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGA 1380

 96543590 ACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTG 96543649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTG 1440

 96543650 ACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCT 96543709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCT 1500

 96543710 GTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACT 96543769
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
     1501 GTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACT 1560

 96543770 TAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAG 96543829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAG 1620

 96543830 TTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTT 96543889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTT 1680

 96543890 TGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCAT 96543949
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCAT 1740

 96543950 CAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTC 96544009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTC 1800

 96544010 TCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTT 96544069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTT 1860

 96544070 GTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTC 96544129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTC 1920

 96544130 ATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGA 96544188
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     1921 ATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGA 1980

 96544189 CATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATAT 96544248
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1981 CATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATAT 2040

 96544249 ATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTC 96544308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTC 2100

 96544309 CTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATC 96544368
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATC 2160

 96544369 TACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCT 96544428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCT 2220

 96544429 GTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTA 96544488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTA 2280

 96544489 ATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTA 96544548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTA 2340

 96544549 TGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAA 96544608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAA 2400

 96544609 ATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTT 96544668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTT 2460

 96544669 ATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCC 96544728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCC 2520

 96544729 AAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTT 96544788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTT 2580

 96544789 TGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACA 96544848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACA 2640

 96544849 TGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTG 96544908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTG 2700

 96544909 TAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGT 96544968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGT 2760

 96544969 TGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCAT 96545028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCAT 2820

 96545029 CTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||
     2821 CTCAATGCATACATAT 2836

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 2904

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2905 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 2964

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3024

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 3084

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 3144

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 3204

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 3264

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 3324

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 3384

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 3444

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3445 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 3504

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 3564

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 3624

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 3684

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 3744

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 3804

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 3864

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 3924

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3925 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 3984

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4044

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 4104

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 4164

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 4224

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 4284

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 4344

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     4345 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 4401

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 4461

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 4521

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 4581

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 4641

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 4701

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 4761

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 4821

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 4881

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 4941

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 5001

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 5061

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 5121

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 5181

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 5241

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 5301

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 5361

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 5421

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 5481

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 5541

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 5601

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 5661

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 5721

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 5781

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5782 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 5841

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 96548104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 5901

 96548105 AGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGG 96548150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 AGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGG 5947

Alignment time is 8.05368 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2487] =>      2487 nucs 'mol-32-33f8-154912_2487'

Score:        2437
Aligned:      2481        nucs
Identic:      2477 (100%) nucs =>      2116 (100%)       361 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541640,96543758] EXCISED REGION [96543765,96544126]
 second seq =>  [       1,    2119] EXCISED REGION [    2126,    2487]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [96543759,96543764]
 second seq =>         6 nucs [2120,2125]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543759,96543759] to [96543765,96543765]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543758,96543758] to [96543765,96543765]
 second seq =>         1 nucs [2119,2119] to [2126,2126]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2120,2120] to [2125,2125]

 96541640 ATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTC 96541699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTC 60

 96541700 AATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAAT 96541759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAAT 120

 96541760 GTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCT 96541819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCT 180

 96541820 CAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGA 96541879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGA 240

 96541880 AGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTC 96541939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTC 300

 96541940 TCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTT 96541999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTT 360

 96542000 ACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCAT 96542059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCAT 420

 96542060 CCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGG 96542119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGG 480

 96542120 GTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGT 96542179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGT 540

 96542180 TGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAAC 96542239
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      541 TGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAAC 600

 96542240 AGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCT 96542299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCT 660

 96542300 TTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTT 96542359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTT 720

 96542360 GCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACA 96542419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACA 780

 96542420 CTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAA 96542479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAA 840

 96542480 CTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGC 96542539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGC 900

 96542540 TTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATAC 96542599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATAC 960

 96542600 CCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCT 96542659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCT 1020

 96542660 CTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGT 96542719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGT 1080

 96542720 AGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACA 96542779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACA 1140

 96542780 ATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCC 96542839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCC 1200

 96542840 TTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAAC 96542899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAAC 1260

 96542900 TATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCT 96542959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCT 1320

 96542960 CCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAAT 96543019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAAT 1380

 96543020 CACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTG 96543079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTG 1440

 96543080 CTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATA 96543139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATA 1500

 96543140 AGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTC 96543199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTC 1560

 96543200 AAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATT 96543259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATT 1620

 96543260 TAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAG 96543319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAG 1680

 96543320 ACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCT 96543379
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCT 1740

 96543380 GCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCA 96543439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1741 GCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCA 1800

 96543440 AACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAG 96543499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAG 1860

 96543500 CTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAA 96543559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAA 1920

 96543560 TTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTA 96543619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTA 1980

 96543620 TTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAA 96543679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAA 2040

 96543680 ACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATA 96543739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATA 2100

 96543740 ATAATTGTTACTGGTTTTA 96543758
          |||||||||||||||||||
     2101 ATAATTGTTACTGGTTTTA 2119

EXCISED REGION

 96543765 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 96543824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 2185

 96543825 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 96543884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 2245

 96543885 AAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 96543944
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 AAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 2305

 96543945 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 96544004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 2365

 96544005 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 96544064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 2425

 96544065 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 96544124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 2485

 96544125 TT 96544126
          ||
     2486 TT 2487

Alignment time is 3.53993 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6446] =>      6446 nucs 'mol-32-33f8-175240_6446'

Score:        6229
Aligned:      6442        nucs
Identic:      6421 (100%) nucs =>      3392 (100%)      3029 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541644,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548084]
 second seq =>  [       1,    3402] EXCISED REGION [    3411,    6446]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3403,3410]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3403,3441] to [3411,3449]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [3401,3402] to [3411,3412]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3403,3406] to [3407,3410]

 96541644 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 96541703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 60

 96541704 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 96541763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 120

 96541764 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 96541823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 180

 96541824 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 96541883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 240

 96541884 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 96541943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 300

 96541944 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 96542003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 360

 96542004 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 96542063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 420

 96542064 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 96542123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 480

 96542124 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 96542183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 540

 96542184 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 96542243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      541 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCA 600

 96542244 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 96542303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 660

 96542304 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 96542363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 720

 96542364 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 96542423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 780

 96542424 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 96542483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 840

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 900

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 960

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 1020

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 1080

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 1140

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 1200

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 1260

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 1320

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 1380

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 1440

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 1500

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 1560

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 1620

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 96543323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 1680

 96543324 GCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 96543383
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 1740

 96543384 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACG 96543443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1741 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACG 1800

 96543444 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 96543503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 1860

 96543504 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 96543563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 1920

 96543564 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 96543623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 1980

 96543624 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 96543683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 2040

 96543684 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 96543743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 2100

 96543744 TTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 96543803
          |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 2160

 96543804 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 96543863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 2220

 96543864 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 96543923
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 2280

 96543924 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 96543983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 2340

 96543984 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 96544043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 2400

 96544044 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 96544103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 2460

 96544104 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAA 96544163
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAA 2520

 96544164 AAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 96544222
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 2580

 96544223 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 96544282
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 2640

 96544283 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTT 96544342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2641 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTT 2700

 96544343 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 96544402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 2760

 96544403 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 96544462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 2820

 96544463 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 96544522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 2880

 96544523 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 96544582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 2940

 96544583 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 96544642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 3000

 96544643 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 96544702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 3060

 96544703 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 96544762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 3120

 96544763 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 96544822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 3180

 96544823 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 96544882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 3240

 96544883 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 96544942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 3300

 96544943 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 96545002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 3360

 96545003 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 3402

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 3470

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3471 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 3530

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3590

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 3650

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 3710

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 3770

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 3830

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 3890

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 3950

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 4010

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4011 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 4070

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 4130

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 4190

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 4250

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 4310

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 4370

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 4430

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 4490

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4491 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 4550

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4610

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 4670

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 4730

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 4790

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     4791 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC-TTTTTTTTTTTTTTTT 4849

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 4909

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     4910 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 4966

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 5026

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 5086

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 5146

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 5206

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 5266

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 5326

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 5386

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 5446

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 5506

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 5566

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 5626

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 5686

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 5746

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 5806

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 5866

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 5926

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 5986

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 6046

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 6106

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 6166

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 6226

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 6286

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 6346

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6347 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 6406

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTT 96548084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTT 6446

Alignment time is 8.39175 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8809] =>      8809 nucs 'mol-32-3403-088757_8809'

Score:        8504
Aligned:      8806        nucs
Identic:      8772 (100%) nucs =>      3231 (100%)      5541 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541805,96545044] EXCISED REGION [96545045,96550602]
 second seq =>  [       1,    3241] EXCISED REGION [    3250,    8809]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3242,3249]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3242,3280] to [3250,3288]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [3240,3241] to [3250,3251]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3242,3245] to [3246,3249]

 96541805 ATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTG 96541864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTG 60

 96541865 GAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAA 96541924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAA 120

 96541925 TATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACA 96541984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACA 180

 96541985 ATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAA 96542044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAA 240

 96542045 TCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGG 96542104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGG 300

 96542105 CCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCT 96542164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCT 360

 96542165 TCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAAT 96542224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAAT 420

 96542225 ACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCT 96542284
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCT 480

 96542285 TTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATT 96542344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATT 540

 96542345 TACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAG 96542404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAG 600

 96542405 ATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTT 96542464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTT 660

 96542465 CTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCT 96542524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCT 720

 96542525 TATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCG 96542584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCG 780

 96542585 TTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGG 96542644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGG 840

 96542645 GTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACAC 96542704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACAC 900

 96542705 CAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCT 96542764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCT 960

 96542765 CCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGA 96542824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGA 1020

 96542825 CCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATT 96542884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATT 1080

 96542885 TCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGA 96542944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGA 1140

 96542945 GCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCA 96543004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCA 1200

 96543005 CAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAA 96543064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAA 1260

 96543065 AGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATA 96543124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATA 1320

 96543125 TTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTA 96543184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTA 1380

 96543185 CAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTA 96543244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTA 1440

 96543245 TCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCT 96543304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCT 1500

 96543305 GACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCT 96543364
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1501 GACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCT 1560

 96543365 AACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATC 96543424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATC 1620

 96543425 GACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGT 96543484
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGT 1680

 96543485 GTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAAT 96543544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAAT 1740

 96543545 TTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAG 96543604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAG 1800

 96543605 AAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTT 96543664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTT 1860

 96543665 CCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAA 96543724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAA 1920

 96543725 ATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAG 96543784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||
     1921 ATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAG 1980

 96543785 AGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGG 96543844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGG 2040

 96543845 ATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTT 96543904
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2041 ATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTT 2100

 96543905 GGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTG 96543964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTG 2160

 96543965 GAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGT 96544024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGT 2220

 96544025 CAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTC 96544084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTC 2280

 96544085 ACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTT 96544144
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2281 ACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTT 2340

 96544145 ATCAAAAAACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGT 96544203
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGT 2400

 96544204 ACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTT 96544263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2401 ACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTT 2460

 96544264 AACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCA 96544323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCA 2520

 96544324 TTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAA 96544383
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAA 2580

 96544384 ATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCC 96544443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCC 2640

 96544444 AGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCT 96544503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCT 2700

 96544504 TCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTT 96544563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTT 2760

 96544564 TAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCT 96544623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCT 2820

 96544624 CAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTC 96544683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAATAGATTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTC 2880

 96544684 AACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATA 96544743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AACAAATTAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATA 2940

 96544744 AAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCT 96544803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGCTCGGCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCT 3000

 96544804 GGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATC 96544863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATC 3060

 96544864 TCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTC 96544923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTC 3120

 96544924 AGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAA 96544983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAA 3180

 96544984 TCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATA 96545043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATA 3240

 96545044 T 96545044
          |
     3241 T 3241

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 3309

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3310 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 3369

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3429

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 3489

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 3549

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 3609

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 3669

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 3729

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 3789

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 3849

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3850 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 3909

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 3969

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 4029

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 4089

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 4149

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 4209

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 4269

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 4329

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4330 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 4389

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4390 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4449

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 4509

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 4569

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 4629

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 96546484
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
     4630 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC--TTTTTTTTTTTTTTT 4687

 96546485 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 96546544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 4747

 96546545 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 96546604
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     4748 GCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGA 4804

 96546605 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 96546664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 CCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC 4864

 96546665 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 96546724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 ACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC 4924

 96546725 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 96546784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 CAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATT 4984

 96546785 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 96546844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 TCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAA 5044

 96546845 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 96546904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 GAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCAT 5104

 96546905 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 96546964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 TATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCT 5164

 96546965 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 96547024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 TGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGAT 5224

 96547025 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 96547084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 GCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTC 5284

 96547085 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 96547144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 CATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAA 5344

 96547145 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 96547204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 TAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGAT 5404

 96547205 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 96547264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 TTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATT 5464

 96547265 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 96547324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 ATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAAC 5524

 96547325 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 96547384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 CAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTT 5584

 96547385 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 96547444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 CTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGA 5644

 96547445 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 96547504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 CAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAG 5704

 96547505 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 96547564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 TGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACC 5764

 96547565 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 96547624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 ATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTT 5824

 96547625 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 96547684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 TCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGAT 5884

 96547685 GCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 96547744
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 GTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTT 5944

 96547745 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 96547804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 TAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAAC 6004

 96547805 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 96547864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 CACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAA 6064

 96547865 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 96547924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 GAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGA 6124

 96547925 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 96547984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 TTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGC 6184

 96547985 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTAT 96548044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6185 CTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTT 6244

 96548045 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 96548104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 TCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 6304

 96548105 AGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 96548164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6305 AGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 6364

 96548165 CGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGC 96548224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     6365 CGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATTGCTGGGACTACAGGC 6424

 96548225 GTCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATG 96548284
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6425 GTCCACCACCACGCCCAGCTAATGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATG 6484

 96548285 TTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGG 96548344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6485 TTAGCCACAACGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGG 6544

 96548345 GCTGAGATTACAGGC----GTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTA 96548400
          |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6545 GCTGAGATTACAGGCGTGAGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTACTTGGGTATGCATTCTTA 6604

 96548401 ATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTT 96548460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6605 ATCCAGAGCTGCAAATAAATGGTTCTTTCCAAACCTATTAATTATTTATCATGACAATTT 6664

 96548461 GTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACAT 96548520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6665 GTTTCTTAAAAATCCAACAAACTCTGGAACTGTGAGAATATACCCTTGTCAAGTAGACAT 6724

 96548521 TTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGT 96548580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6725 TTATTTTTTAAAAAATATTTTTACATGATGCCACATGGTACCAAAAGCAGGTATAGGGGT 6784

 96548581 AAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATA 96548640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6785 AAAAATAAAGTCCTTTAGTTAGAAAAGGAGCAGAGTCACATTGCTTTTTGGTATTCTATA 6844

 96548641 TCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGA 96548700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6845 TCCAGATCTTCAGTTTGATAAATCCCTTTTATGGCTCTCAATGTACACATTTTCAGAAGA 6904

 96548701 CTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGC 96548760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6905 CTCAGAAGCCTTCAGAAAAAAACCAAAGCAACATTATATTTCATGAAAGTTCTCCTCTGC 6964

 96548761 TAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGA 96548820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6965 TAAACAAGAAATGGAAGAAGTGAAAAACAATAAACAAAAGGAAAAGTTAACATCTCATGA 7024

 96548821 ATATCTTTATAGTGTGGTTAATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAAGA 96548880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7025 ATATCTTTATAGTGTGGTTAATATTTTTAATATATAATGAGTTTTTAAAAATCAATAAGA 7084

 96548881 AAAAAATAACTCAAGTTTTTTTAAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAGAA 96548940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7085 AAAAAATAACTCAAGTTTTTTTAAATAAGGCAGAAACTGTATAGGCAATTCATGAAAGAA 7144

 96548941 GAAACAAATGTACAACAAACACAAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAAAA 96549000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7145 GAAACAAATGTACAACAAACACAAAGTCATGTTCAACACAACTAACAAGTCAATAAAAAA 7204

 96549001 AAACCTAAAATAATGTGTCATTTTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATGGT 96549060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7205 AAACCTAAAATAATGTGTCATTTTTTACATATCAGATTAGCAAAACTTATAAAGAATGGT 7264

 96549061 AATACTTTATAAATAAAAATGTATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATACC 96549120
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7265 AATACTTTATGAATAAAAATGTATGGGTGGGGTGGGAAAGGCACTCTAAAGAGTGATACC 7324

 96549121 ATGTTTCTGGGCAAAAATTACCCAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTTGC 96549180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7325 ATGTTTCTGGGCAAAAATTACCCAAATATACCAAAACCTTTTAAAGTTGCAATTTTTTGC 7384

 96549181 CAGGATTTTAAAAAAAATTTTTTCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATAGT 96549240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7385 CAGGATTTTAAAAAAAATTTTTTCTAAGGAAACAATTAGACAAGGAGACAAAGAAATAGT 7444

 96549241 TACAGAACGTTTCTTGCAGCCTTGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGTAT 96549300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7445 TACAGAACGTTTCTTGCAGCCTTGTTTATAATAGCAAAATATTAGAAACAGCCAAAGTAT 7504

 96549301 CTAATAATAATGAATTTTTTTAAATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTAAA 96549360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7505 CTAATAATAATGAATTTTTTTAAATAAATCATGGTAATCCATATAACAAATTGGCCTAAA 7564

 96549361 AAGAAGTGTGCAAGCCACAGTACAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACATA 96549420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7565 AAGAAGTGTGCAAGCCACAGTACAATAAAGATATTCTGATTTCATTCCTGTAAACACATA 7624

 96549421 TGTGTGGATATGGGTATCTAGATGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACCAA 96549480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7625 TGTGTGGATATGGGTATCTAGATGCAATAAAAGACTCAGGAAATAAAATGTATATACCAA 7684

 96549481 CAAATATTTCTTGAGTGAATGAGTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTATC 96549540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7685 CAAATATTTCTTGAGTGAATGAGTCAATGAATATGGTAACAGTGATTATCTCCAGGTATC 7744

 96549541 AGTATTATGGATGATTGTGTATGTTTTGCTGATTTACATTTTGTTTCCTTCTTTCCTTCC 96549600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7745 AGTATTATGGATGATTGTGTATGTTTTGCTGATTTACATTTTGTTTCCTTCTTTCCTTCC 7804

 96549601 TTCCTTCCTTCTCTTTCTTTCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTTCTTTCT---TTTTCTCTTC 96549657
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
     7805 TTCCTTCCTTCTCTTTCTTTCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTTCTTTCTTTCTTTTCTCTTC 7864

 96549658 TTTCTCTTTCTTTCTTTTTCTCTCTTTTCTCTCCTTTTTGATCCCATTCTTCCTTGTTTT 96549717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7865 TTTCTCTTTCTTTCTTTTTCTCTCTTTTCTCTCCTTTTTGATCCCATTCTTCCTTGCTTT 7924

 96549718 CAACCTACACTGGCTTTCTCAGCCATGTATGAACTTCTCTCTCCCTTCACCTACATGGTA 96549777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7925 CAACCTACACTGGCTTTCTCAGCCATGTATGAACTTCTCTCTCCCTTCACCTACATGGTA 7984

 96549778 AAATGTAAAAAGTCTTATATTCTACTCAAAAGGAAGATATTGCTGACTTGAGTACAACTT 96549837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7985 AAATGTAAAAAGTCTTATATTCTACTCAAAAGGAAGATATTGCTGACTTGAGTACAACTT 8044

 96549838 TTTTGAAGCAATATAGATGCCTTGCATTCACCCTTAGGTTGTATGATAACAGGAAAACCA 96549897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8045 TTTTGAAGCAATATAGATGCCTTGCATTCACCCTTAGGTTGTATGATAACAGGAAAACCA 8104

 96549898 AATGAAGCCAAAAATCCAGAGCATGTGTTAAAAATCAGATTTCATCATTAACAAATATCA 96549957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8105 AATGAAGCCAAAAATCCAGAGCATGTGTTAAAAATCAGATTTCATCATTAACAAATATCA 8164

 96549958 TCATAACTAAAATTCAGATAACTAAAGGTTTCCACCATATGGCTAGAGCAAAGTTTATTC 96550017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8165 TCATAACTAAAATTCAGATAACTAAAGGTTTCCACCATATGGCTAGAGCAAAGTTTATTC 8224

 96550018 TATACCTATCACTGTGCAGAACCACAAAAAGCACTGAGAATACAGAAAGGAACAAAAAAC 96550077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8225 TATACCTATCACTGTGCAGAACCACAAAAAGCACTGAGAATACAGAAAGGAACAAAAAAC 8284

 96550078 AGTTTCTAAACTCTAGAAAGTCACAATCCCAAGGGGTAATCGAATGTGCCAATGTTAGTC 96550137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8285 AGTTTCTAAACTCTAGAAAGTCACAATCCCAAGGGGTAATCGAATGTGCCAATGTTAGTC 8344

 96550138 TTAATTTAAACAAAGCTCCTCATGAGTAACCAGTTCTGCCTGAGGACACAGAAAAGGTAG 96550197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8345 TTAATTTAAACAAAGCTCCTCATGAGTAACCAGTTCTGCCTGAGGACACAGAAAAGGTAG 8404

 96550198 GGAAGAACTTAAAGGTGGAATTTAGAAAGTGAGTATGCATTCCTCAGGTATAAAAAGACT 96550257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8405 GGAAGAACTTAAAGGTGGAATTTAGAAAGTGAGTATGCATTCCTCAGGTATAAAAAGACT 8464

 96550258 GGAAGGGCATTTCAAGTAAACAGACTAGCCAGCAAAAAGATAAGGAAGCAGAAAAGTTCC 96550317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8465 GGAAGGGCATTTCAAGTAAACAGACTAGCCAGCAAAAAGATAAGGAAGCAGAAAAGTTCC 8524

 96550318 TGCAATAGTAGGTGTGGCAAAAGTTCTAGCTCTGCAGAAGAATTTGGAAGTAAAGGTGGA 96550377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8525 TGCAATAGTAGGTGTGGCAAAAGTTCTAGCTCTGCAGAAGAATTTGGAAGTAAAGGTGGA 8584

 96550378 AAGTGCATTTGGCCTGAATGACAATTAACAGTTACCTGGATAGTTCAGTTTGCATGTGGC 96550437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8585 AAGTGCATTTGGCCTGAATGACAATTAACAGTTACCTGGATAGTTCAGTTTGCATGTGGC 8644

 96550438 TGAGTTTTACAGATTCAAAGCCCCCTACATTTAAATGATAGTGTCTCAAACTATTAATAG 96550497
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8645 TGAGTTTTACAGATTCAAAGACCCCTACATTTAAATGATAGTGTCTCAAACTATTAATAG 8704

 96550498 GTCCTTGTTCAGCTATAGTGGCAGGCAATTGCCTTTGTTCATTAAAGTGGAATATTTTTG 96550557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8705 GTCCTTGTTCAGCTATAGTGGCAGGCAATTGCCTTTGTTCATTAAAGTGGAATATTTTTG 8764

 96550558 TTTTCCTTGCCAAGAAAGGAGTGATTTCACTTTTGTCTTTTTTCC 96550602
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8765 TTTTCCTTGCCAAGAAAGGAGTGATTTCACTTTTGTCTTTTTTCC 8809

Alignment time is 11.4657 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5217] =>      5217 nucs 'mol-32-340e-107109_5217'

Score:        5068
Aligned:      5211        nucs
Identic:      5198 (100%) nucs =>      4362 (100%)       836 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539390,96543758] EXCISED REGION [96543765,96544604]
 second seq =>  [       1,    4370] EXCISED REGION [    4377,    5217]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [96543759,96543764]
 second seq =>         6 nucs [4371,4376]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543759,96543759] to [96543765,96543765]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [96543758,96543758] to [96543765,96543765]
 second seq =>         1 nucs [4370,4370] to [4377,4377]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4371,4371] to [4376,4376]

 96539390 GAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACC 96539449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTGAGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACC 60

 96539450 AAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAA- 96539508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
       61 AAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAAA 120

 96539509 TGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATC 96539568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATC 180

 96539569 ATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAG 96539628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAAACAG 240

 96539629 AGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTG 96539688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTG 300

 96539689 AATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGA 96539748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGA 360

 96539749 CCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGAT 96539808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGAT 420

 96539809 ATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAA 96539868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAA 480

 96539869 AAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAA 96539928
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAA 540

 96539929 AGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTG 96539988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTG 600

 96539989 AGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAA 96540048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAA 660

 96540049 AATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATG 96540108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCATGATG 720

 96540109 CTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCA 96540168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCA 780

 96540169 GGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATA 96540228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATA 840

 96540229 TATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTT 96540288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTT 900

 96540289 CAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGAC 96540348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAAAGAC 960

 96540349 AGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCC 96540408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCC 1020

 96540409 AATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAAT 96540468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGAAAAT 1080

 96540469 GTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAA 96540528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAA 1140

 96540529 GTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGAC 96540588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGAC 1200

 96540589 CCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGT 96540648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGT 1260

 96540649 GGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCA 96540708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACCAGCA 1320

 96540709 GACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTT 96540768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTT 1380

 96540769 TAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGT 96540828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCTTGGT 1440

 96540829 GAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTC 96540888
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGTTTTC 1500

 96540889 TAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGT 96540948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCTATGT 1560

 96540949 TTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAG 96541008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAG 1620

 96541009 AAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAG 96541068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAG 1680

 96541069 GGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCT 96541128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCT 1740

 96541129 TTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCA 96541188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1741 TTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAATGCT 1800

 96541189 AATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGA 96541248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGGCTGA 1860

 96541249 CAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAG 96541308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAATCAG 1920

 96541309 ACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAA 96541368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAA 1980

 96541369 GCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTT 96541428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTT 2040

 96541429 AGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTA 96541488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTA 2100

 96541489 TTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGAT 96541548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGAT 2160

 96541549 GTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTAT 96541608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTAT 2220

 96541609 TTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAA 96541668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAA 2280

 96541669 ATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCA 96541728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCA 2340

 96541729 ATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCAC 96541788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCAC 2400

 96541789 CCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAAT 96541848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAAT 2460

 96541849 ATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAA 96541908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAA 2520

 96541909 AGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAA 96541968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAA 2580

 96541969 CCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTT 96542028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTT 2640

 96542029 TCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGT 96542088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGT 2700

 96542089 CAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTT 96542148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTT 2760

 96542149 ACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCA 96542208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCA 2820

 96542209 GGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACAT 96542268
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACAT 2880

 96542269 TTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCT 96542328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCT 2940

 96542329 TATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTT 96542388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTT 3000

 96542389 GGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTAC 96542448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTAC 3060

 96542449 AAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGT 96542508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGT 3120

 96542509 GAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGC 96542568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGC 3180

 96542569 CATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTC 96542628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTC 3240

 96542629 TCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCC 96542688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCC 3300

 96542689 AATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGG 96542748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGG 3360

 96542749 CTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGA 96542808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGA 3420

 96542809 AGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTG 96542868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTG 3480

 96542869 GTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTT 96542928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTT 3540

 96542929 CCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTG 96542988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3541 CCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGCTG 3600

 96542989 AAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTT 96543048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTT 3660

 96543049 CATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATA 96543108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATA 3720

 96543109 TCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATA 96543168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATA 3780

 96543169 AGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCAT 96543228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCAT 3840

 96543229 CTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCT 96543288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCT 3900

 96543289 TTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATC 96543348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3901 TTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATC 3960

 96543349 ATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATA 96543408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATA 4020

 96543409 GAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAA 96543468
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAA 4080

 96543469 TACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTG 96543528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTG 4140

 96543529 ACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAG 96543588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAG 4200

 96543589 AACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCT 96543648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCT 4260

 96543649 GACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACC 96543708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACC 4320

 96543709 TGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTA 96543758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTA 4370

EXCISED REGION

 96543765 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 96543824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 AAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAA 4436

 96543825 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 96543884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGC 4496

 96543885 AAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 96543944
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 AAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATT 4556

 96543945 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 96544004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 CCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTG 4616

 96544005 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 96544064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 GCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGA 4676

 96544065 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 96544124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 CCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTC 4736

 96544125 TTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACA 96544183
          |||||||||.||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     4737 TTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACA 4796

 96544184 AGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAG 96544243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 AGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAG 4856

 96544244 TATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAA 96544303
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 CATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAA 4916

 96544304 GTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTA 96544363
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4917 GTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTA 4976

 96544364 AGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATT 96544423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 AGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATT 5036

 96544424 ATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTT 96544483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 ATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTT 5096

 96544484 GACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGT 96544543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 GACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGT 5156

 96544544 CTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGA 96544603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGA 5216

 96544604 T 96544604
          |
     5217 T 5217

Alignment time is 7.15614 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6757] =>      6757 nucs 'mol-32-34a8-134808_6757'

Score:        6529
Aligned:      6753        nucs
Identic:      6731 (100%) nucs =>      3644 (100%)      3087 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96541392,96545044] EXCISED REGION [96545045,96548142]
 second seq =>  [       1,    3654] EXCISED REGION [    3663,    6757]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3655,3662]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3655,3693] to [3663,3701]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96545043,96545044] to [96545045,96545046]
 second seq =>         2 nucs [3653,3654] to [3663,3664]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3655,3658] to [3659,3662]

 96541392 TATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAA 96541451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAA 60

 96541452 AATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGC 96541511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGC 120

 96541512 AAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTT 96541571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTT 180

 96541572 GGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGT 96541631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGT 240

 96541632 ATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGT 96541691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGT 300

 96541692 TTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCT 96541751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCT 360

 96541752 ACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAAT 96541811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAAT 420

 96541812 CAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATG 96541871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATG 480

 96541872 GTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATC 96541931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATC 540

 96541932 CAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGAC 96541991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGAC 600

 96541992 CTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTT 96542051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTT 660

 96542052 ATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACA 96542111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACA 720

 96542112 TGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCC 96542171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCC 780

 96542172 ATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTT 96542231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      781 ATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTT 840

 96542232 GGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAAC 96542291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAAC 900

 96542292 TGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAA 96542351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAA 960

 96542352 CTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAA 96542411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAA 1020

 96542412 TCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTT 96542471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTT 1080

 96542472 GGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAA 96542531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAA 1140

 96542532 TTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCA 96542591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCA 1200

 96542592 CATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCAT 96542651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCAT 1260

 96542652 TCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATA 96542711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATA 1320

 96542712 AACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGT 96542771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGT 1380

 96542772 TAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTG 96542831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTG 1440

 96542832 TTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATA 96542891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATA 1500

 96542892 AGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCC 96542951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCC 1560

 96542952 ACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACT 96543011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACT 1620

 96543012 TCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACA 96543071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACA 1680

 96543072 GATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATC 96543131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATC 1740

 96543132 CCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTC 96543191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTC 1800

 96543192 TTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAG 96543251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAG 1860

 96543252 TTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCC 96543311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCC 1920

 96543312 CTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCA 96543371
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTTCAGACCTGCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCA 1980

 96543372 TGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCT 96543431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTCTGCTGCAAGACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCT 2040

 96543432 TGAAGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTC 96543491
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAGGTCAAACGTGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTC 2100

 96543492 TAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCA 96543551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGTTTAGCTCCTCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCA 2160

 96543552 ATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAA 96543611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCTAGAATTAGAAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAA 2220

 96543612 TGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTA 96543671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAACGTATTTATTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTA 2280

 96543672 AAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTG 96543731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAGAAAAACATATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTG 2340

 96543732 AAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTT 96543791
          |||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGTGATAATAATTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTT 2400

 96543792 TATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGC 96543851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATTATTTTATTAACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGC 2460

 96543852 ACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTG 96543911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2461 ACAAAGTATCTTAAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTG 2520

 96543912 CTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCAC 96543971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGGCGTCCCCCAACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCAC 2580

 96543972 CATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACC 96544031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATCGAGTTAAAAAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACC 2640

 96544032 CACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGA 96544091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACTCTCCCACCCAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGA 2700

 96544092 CCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAA 96544151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2701 CCTTGAAACCTCTCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAA 2760

 96544152 AACAACAAAAAAAAA-CATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATT 96544210
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AACAACAAAAAAAAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATT 2820

 96544211 CAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAA 96544270
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAATATATACAACTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAA 2880

 96544271 TCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTA 96544330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCTATGCCATAAACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTA 2940

 96544331 TCAGTAATTTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAA 96544390
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCAGTAATGTTTTTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAA 3000

 96544391 GTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTT 96544450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTACACAATGCAATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTT 3060

 96544451 ATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACC 96544510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTTATTTGTATAACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACC 3120

 96544511 CCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTC 96544570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCAGCACCTGGCAACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTC 3180

 96544571 CTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGA 96544630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCACATACGTGGTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGA 3240

 96544631 TTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAAT 96544690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGGAGAAAAAGCATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAAT 3300

 96544691 TAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCG 96544750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TAGGTACAAAAGGAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCG 3360

 96544751 GCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGAT 96544810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCCGGGCACAGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGAT 3420

 96544811 CACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTA 96544870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTA 3480

 96544871 AAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 96544930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 3540

 96544931 TGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCC 96544990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGAGGCAGTAGAATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCC 3600

 96544991 ATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 96545044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT 3654

EXCISED REGION

 96545045 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 96545104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 ATACATACATACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACA 3722

 96545105 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCA 96545164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3723 CTCAATGGTGAAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCA 3782

 96545165 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 96545224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 CTCTCACCCCTTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAA 3842

 96545225 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 96545284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 CAAAAGGCATCTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGA 3902

 96545285 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 96545344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 TCTTACATGCAGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAAT 3962

 96545345 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 96545404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 TCAGTCAAGTTGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTA 4022

 96545405 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 96545464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 ATAACAAACAACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAA 4082

 96545465 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 96545524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 AATACTTACGAACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAAC 4142

 96545525 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 96545584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 ATTGATTAAAAGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAAC 4202

 96545585 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 96545644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 TTCCTGAGAAGTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAG 4262

 96545645 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 96545704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4263 GATTAAAACCCATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCT 4322

 96545705 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 96545764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 TCCACCCAGCTTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGG 4382

 96545765 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 96545824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 ATAGTGATTCCATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCA 4442

 96545825 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 96545884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 AAATCCCAAGAAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGC 4502

 96545885 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 96545944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 CTGCAAGAATTAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGAT 4562

 96545945 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 96546004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 TTGAAGGGCTCCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGT 4622

 96546005 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 96546064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 GGAGGTTAAGGTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTG 4682

 96546065 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 96546124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 GTCACTACATTATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCA 4742

 96546125 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTC 96546184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4743 TAGCCATAGCTGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTC 4802

 96546185 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 96546244
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4803 TATACAAATAGAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTT 4862

 96546245 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 96546304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 TAGAAGCAATACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAG 4922

 96546305 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 96546364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 AGATCTGAACTGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGC 4982

 96546365 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 96546424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 ATTTGAATATTTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTG 5042

 96546425 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC-TTTTTTTTTTTTTTTT 96546483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     5043 TTAAAAAATAAAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 5102

 96546484 TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAC 96546543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAC 5162

 96546544 TGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGG 96546603
          |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||
     5163 TGCAAGCTCGGCCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGG 5219

 96546604 ACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTT 96546663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 ACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTT 5279

 96546664 CACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTC 96546723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 CACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTC 5339

 96546724 CCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGAT 96546783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 CCAAAGTGCTGGGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGAT 5399

 96546784 TTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTA 96546843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 TTCAATGTTTGTTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTA 5459

 96546844 AGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCA 96546903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 AGAGGTGAAACCTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCA 5519

 96546904 TTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTC 96546963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 TTATACAGGATTGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTC 5579

 96546964 TTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGA 96547023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TTGCTTTCTCTCACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGA 5639

 96547024 TGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGT 96547083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 TGCTAGCCCCTTGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGT 5699

 96547084 CCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAA 96547143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 CCATTAAAAATTACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAA 5759

 96547144 ATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGA 96547203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 ATAATATTTAAAGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGA 5819

 96547204 TTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGAT 96547263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 TTTAAGAAATTATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGAT 5879

 96547264 TATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAA 96547323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TATGATCAGATAGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAA 5939

 96547324 CCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTT 96547383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 CCAGCATGGATTATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTT 5999

 96547384 TCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGG 96547443
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 TCTTGTATTAAGTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGG 6059

 96547444 ACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAA 96547503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 ACAAAAAGCAGAATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAA 6119

 96547504 GTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTAC 96547563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 GTGTTACCTCCCCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTAC 6179

 96547564 CATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCT 96547623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 CATTTTTGACACAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCT 6239

 96547624 TTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGA 96547683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 TTCCTCCAGGTTGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGA 6299

 96547684 TGCTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGT 96547743
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 TGTTGCTCAGACACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGT 6359

 96547744 TTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAA 96547803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 TTAACTTTTTAAAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAA 6419

 96547804 CCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAA 96547863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 CCACATTCAATCTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAA 6479

 96547864 AGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAG 96547923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 AGAACTAGGATGGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAG 6539

 96547924 ATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAG 96547983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 ATTGAGATGAAATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAG 6599

 96547984 CCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTA 96548043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6600 CCTGATGAGGAAGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTT 6659

 96548044 TTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACG 96548103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     6660 TTCTCCATGGGTTATAGTACTACTTGGGTATGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACG 6718

 96548104 GAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGC 96548142
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 GAGATTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGC 6757

Alignment time is 8.79372 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3978] =>      3978 nucs 'mol-32-34b3-032323_3978'

Score:        3851
Aligned:      3895        nucs
Identic:      3891 (100%) nucs =>      3835 (100%)        56 ( 98%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96539445,96543282] EXCISED REGION [96546599,96546655]
 second seq =>  [       1,    3838] EXCISED REGION [    3922,    3978]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3316 nucs [96543283,96546598]
 second seq =>        83 nucs [3839,3921]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [96543281,96543282] to [96546599,96546600]
 second seq =>         2 nucs [3837,3838] to [3922,3923]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 96539445 AAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAA 96539504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATCAAGATTACTAAGCAAAAAAA 60

 96539505 AAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAG 96539564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGTCCCTTAAATTCTTATGTAAG 120

 96539565 GATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAA 96539624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCAATTGAAATTATATCGCAGAA 180

 96539625 ACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTT 96539684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATATCTTTTTTCGATATCTGTTT 240

 96539685 TGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATG 96539744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTCAAAGTTTTAACTTCCCAATG 300

 96539745 AAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAG 96539804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGCTTGTATGTGTGCCCTAAAAG 360

 96539805 GGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGG 96539864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTCAGAGGTATCAATGTGTAGGG 420

 96539865 TCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGT 96539924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAAACACTCTAGGTATTTCCAGT 480

 96539925 AGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAG 96539984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACTCAGCAGAAGAGCTGGAAAAG 540

 96539985 CCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTC 96540044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGGTCTGCTGTGCACCAGATTTC 600

 96540045 AGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCAT 96540104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAATATGGCTGCCTTCCACTCAT 660

 96540105 GATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGT 96540164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCTTGGTTGTCAGCTGCCACTGT 720

 96540165 TGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCAC 96540224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAATCTCTTCCAAGTGCCTATCAC 780

 96540225 AATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGG 96540284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAATGCAAATTTTATCCTTCCAGG 840

 96540285 CTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCAAATGCCCAA 96540344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      841 CTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATAAATGGATGCCGAATGCCCAA 900

 96540345 AGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGAT 96540404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTTGCTCATGTTTTTGGACAGAT 960

 96540405 CTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGA 96540464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGAAATATGTTATTTTGTCTAGA 1020

 96540465 AAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTG 96540524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTGAATCAGTCCTGCCCGAAGTG 1080

 96540525 GAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGA 96540584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTCTTAAGAGAGAAGGAGGAAGA 1140

 96540585 TGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCT 96540644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAGGATAGAACCCTTGGGAGTCT 1200

 96540645 CTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACC 96540704
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTGGTTCCCGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAGAATACAAGATCCCTGGAACC 1260

 96540705 AGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCAC 96540764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTGCTGCAAGTGAGTTGTGTCAC 1320

 96540765 GCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCT 96540824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTGAATGAATTCATTTAATTGCT 1380

 96540825 TGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGT 96540884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAGAGCTGATATTAAACTACTGT 1440

 96540885 TTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCT 96540944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAGATGGCATAGATCTGCATCCT 1500

 96540945 ATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTT 96541004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGCAAGTTTATTTAGATTTGTTT 1560

 96541005 AAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAG 96541064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATATACAGTTGGTATTTGATTAG 1620

 96541065 TCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGA 96541124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAATTTGAAAAAGGATTTGAAGA 1680

 96541125 TGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAA 96541184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTCCTGTCTATAATAAAATAGAA 1740

 96541185 TGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGG 96541244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAACATCCACATCAGAGAGATGG 1800

 96541245 CTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAA 96541304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAGATTTACCATGTTGATAAAAA 1860

 96541305 TCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTG 96541364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCTTGGAAGAATTTGTCATTTTG 1920

 96541365 AAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAG 96541424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATTCCTAATTTAACATGTTTAAG 1980

 96541425 CTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCAC 96541484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAGTTGTAAAACTTATTAGTCAC 2040

 96541485 ACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTG 96541544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTCTCTAAATAATCTCCAAAGTG 2100

 96541545 GGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAAT 96541604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTCTTGTATCATACTTTCCCAAT 2160

 96541605 TTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTT 96541664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTGACCATATATGTATATAACTT 2220

 96541665 ATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAA 96541724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTTTTTAATAATGGAGGTGCAAA 2280

 96541725 GTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAAT 96541784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGGCCTGCAAAACCTGCAGTAAT 2340

 96541785 CCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTT 96541844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCAAGCATCTTTTCTTGAATTTT 2400

 96541845 TAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTC 96541904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCAGAGAATCAGAACCTTATTTC 2460

 96541905 TGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAAT 96541964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATTTTTTTTCTGATGAGGAAAAT 2520

 96541965 GAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTG 96542024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTATAGAGGAGGAAAACATGGTG 2580

 96542025 CTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTG 96542084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAATCATAACATGAGTGCTGCTG 2640

 96542085 ATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAA 96542144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGTGATATAGACTTCCAGTCAAA 2700

 96542145 TGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAG 96542204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCATCATTACTGTCATACTATTAG 2760

 96542205 TGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTA 96542264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCACATAATTTTCATTCATCATTA 2820

 96542265 ACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAA 96542324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAGCCTATACTCTCTGGCCCTAA 2880

 96542325 ATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATT 96542384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGAATCTTGGAAATGTGTTGATT 2940

 96542385 TGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATA 96542444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAACTATGTGTGGTTAACTTTATA 3000

 96542445 TTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAG 96542504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTTGTGCTCTTTATTTTGCTTAG 3060

 96542505 TGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGA 96542564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCTATCTCGATTTTATAATGAGA 3120

 96542565 TGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCT 96542624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCACTCTTCATGGCCGCCCATGCT 3180

 96542625 AGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAG 96542684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGTTCTCCCACTACCCCTGTTAG 3240

 96542685 AGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCC 96542744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACCCTTTCTTTCAAGTATTCTCC 3300

 96542745 CTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTT 96542804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGTCCTGCTCCTGCTCGAGTTTT 3360

 96542805 CTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCA 96542864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGGATTCTCTTACAAAGCCTTCA 3420

 96542865 TCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCT 96542924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCTCCTTTCAGGGCTCCTGTCCT 3480

 96542925 CTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTTTA 96542984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3481 CTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATCCTGTCTTCTCCTCTCTTCTA 3540

 96542985 GTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCT 96543044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCACTCTATCCCCACACCTGCCT 3600

 96543045 CTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATT 96543104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATACTTACCTGAAAAGTCCCATT 3660

 96543105 GATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTAT 96543164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCCTCCTGCTTCTCTCATCTTAT 3720

 96543165 TATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCG 96543224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAACCTTTCTACAGTCTTCTACCG 3780

 96543225 CCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 96543282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAATGCTCCTTACTTTCAACT 3838

EXCISED REGION

 96546599 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 96546655
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 CTGGGACCACAGCTCCCGCCACCGCACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 3978

Alignment time is 5.41774 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10093] =>     10093 nucs 'mol-32-34be-029853_10093'

Score:        9681
Aligned:     10097        nucs
Identic:     10051 (100%) nucs =>       525 ( 98%)      9526 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96537984,96538514] EXCISED REGION [96538525,96548078]
 second seq =>  [       1,     533] EXCISED REGION [     534,   10093]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [96538515,96538524]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [96538515,96538546] to [96538525,96538556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96538515,96538518] to [96538521,96538524]
 second seq =>         0 nucs

 96537984 AACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAA 96538043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
        1 AACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTCCCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAACGAA 60

 96538044 CGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGAC 96538103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCTTGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGAC 120

 96538104 AAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGAT 96538163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCCTACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGAT 180

 96538164 ACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGACA 96538223
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      181 ACTGGGACTCCCAGATAGTGACTTCTAAAAAAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAACA 240

 96538224 GGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCT 96538283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTGACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCT 300

 96538284 CTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGATGTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCA 96538343
          |||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGATATCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCA 360

 96538344 GTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCA 96538403
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTAAATCTCCTGGAGATATATTGGATGTAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCA 420

 96538404 TTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGT 96538463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCAACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGT 480

 96538464 CTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGT--ATGTATATATTCTCCACTC 96538514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
      481 CTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATTCTCCACTC 533

EXCISED REGION

 96538525 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 96538584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 593

 96538585 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 96538644
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCATCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 653

 96538645 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 96538704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 713

 96538705 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 96538764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 773

 96538765 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 96538824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 833

 96538825 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 96538884
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGAAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 893

 96538885 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGT 96538944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      894 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAATGCAGAGAGAGATTTTTGT 953

 96538945 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 96539004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 1013

 96539005 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 96539064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 1073

 96539065 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 96539124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 1133

 96539125 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 96539184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 1193

 96539185 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 96539244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 1253

 96539245 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 96539304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 1313

 96539305 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 96539364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 1373

 96539365 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 96539424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 1433

 96539425 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 96539484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 1493

 96539485 AAGATTACTAAGC-AAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 96539543
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 AAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGG 1553

 96539544 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 96539603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TCCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCC 1613

 96539604 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 96539663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 AATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACAT 1673

 96539664 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 96539723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ATCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATT 1733

 96539724 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 96539783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 CAAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAG 1793

 96539784 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 96539843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 CTTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTT 1853

 96539844 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 96539903
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CAGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCA 1913

 96539904 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 96539963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 AACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACAC 1973

 96539964 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 96540023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 TCAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAG 2033

 96540024 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 96540083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 GTCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGA 2093

 96540084 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 96540143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 ATATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACC 2153

 96540144 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 96540203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TTGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAA 2213

 96540204 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 96540263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TCTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAA 2273

 96540264 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 96540323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 TGCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATAT 2333

 96540324 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 96540383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 AAATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTT 2393

 96540384 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 96540443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TGCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATG 2453

 96540444 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 96540503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 AAATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCT 2513

 96540504 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 96540563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GAATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTT 2573

 96540564 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 96540623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CTTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAA 2633

 96540624 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 96540683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GGATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCA 2693

 96540684 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 96540743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GAATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGT 2753

 96540744 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 96540803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GCTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTT 2813

 96540804 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 96540863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2814 GAATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATA 2873

 96540864 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 96540923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 GAGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGA 2933

 96540924 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 96540983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 GATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAG 2993

 96540984 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 96541043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CAAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCAT 3053

 96541044 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 96541103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 ATACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGA 3113

 96541104 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 96541163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTT 3173

 96541164 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 96541223
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CCTGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAA 3233

 96541224 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 96541283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 ACATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCA 3293

 96541284 GATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 96541343
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 GATTTACCATGTTGATAAAAATTAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTC 3353

 96541344 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 96541403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TTGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTAT 3413

 96541404 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 96541463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 TCCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAA 3473

 96541464 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 96541523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 GTTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCT 3533

 96541524 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 96541583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CTCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTT 3593

 96541584 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 96541643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CTTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCT 3653

 96541644 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 96541703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 GACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATT 3713

 96541704 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 96541763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 TTTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTG 3773

 96541764 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 96541823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GCCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGC 3833

 96541824 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 96541883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AAGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTC 3893

 96541884 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 96541943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 AGAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCAT 3953

 96541944 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 96542003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TTTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCT 4013

 96542004 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 96542063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 ATAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAA 4073

 96542064 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 96542123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 ATCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAG 4133

 96542124 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 96542183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TGATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCA 4193

 96542184 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCA 96542243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4194 TCATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCA 4253

 96542244 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 96542303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 CATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGA 4313

 96542304 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 96542363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 GCCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTG 4373

 96542364 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 96542423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAA 4433

 96542424 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 96542483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 CTATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTT 4493

 96542484 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 96542543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TGTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTC 4553

 96542544 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 96542603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 TATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCA 4613

 96542604 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 96542663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 CTCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTG 4673

 96542664 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 96542723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 TTCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGAC 4733

 96542724 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 96542783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 CCTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGG 4793

 96542784 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 96542843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 TCCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTG 4853

 96542844 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 96542903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 GATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATC 4913

 96542904 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 96542963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 TCCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCAT 4973

 96542964 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 96543023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 CCTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACC 5033

 96543024 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 96543083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 ACTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTAT 5093

 96543084 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 96543143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 ACTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTC 5153

 96543144 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 96543203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 CTCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAA 5213

 96543204 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 96543263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CCTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAA 5273

 96543264 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 96543323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 ATGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCT 5333

 96543324 GCACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 96543383
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 GCACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAA 5393

 96543384 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACG 96543443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
     5394 GACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCTAACG 5453

 96543444 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 96543503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 TGTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCC 5513

 96543504 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 96543563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 TCCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAG 5573

 96543564 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 96543623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 AAAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTA 5633

 96543624 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 96543683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 TTATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACAT 5693

 96543684 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 96543743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 ATTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAA 5753

 96543744 TTGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 96543803
          |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 TTGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATT 5813

 96543804 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 96543863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTT 5873

 96543864 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 96543923
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 AAAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCC 5933

 96543924 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 96543983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 AACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAA 5993

 96543984 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 96544043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 AAAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACC 6053

 96544044 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 96544103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 CAAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTC 6113

 96544104 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAA 96544162
          ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| |||||
     6114 TCAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAA 6173

 96544163 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 96544222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 AAAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAA 6233

 96544223 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 96544282
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 CTTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAA 6293

 96544283 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTT 96544342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6294 ACATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTT 6353

 96544343 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 96544402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 TTGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCA 6413

 96544403 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 96544462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 ATATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTAT 6473

 96544463 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 96544522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 AACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGC 6533

 96544523 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 96544582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 AACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTG 6593

 96544583 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 96544642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 GTACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAG 6653

 96544643 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 96544702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 CATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAG 6713

 96544703 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 96544762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 GAACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGT 6773

 96544763 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 96544822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 GGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCG 6833

 96544823 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 96544882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAAT 6893

 96544883 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 96544942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 TAGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGA 6953

 96544943 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 96545002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 ATCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAG 7013

 96545003 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT--------ATACATACAT 96545054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||
     7014 CCTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATATATACATACATACATACAT 7073

 96545055 ACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTG 96545114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 ACATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTG 7133

 96545115 AAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCC 96545174
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     7134 AAAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCC 7193

 96545175 TTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCAT 96545234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 TTCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCAT 7253

 96545235 CTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGC 96545294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 CTAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGC 7313

 96545295 AGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGT 96545354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 AGAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGT 7373

 96545355 TGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACA 96545414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 TGCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACA 7433

 96545415 ACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACG 96545474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 ACCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACG 7493

 96545475 AACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAA 96545534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 AACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAA 7553

 96545535 AGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAA 96545594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7554 AGAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAA 7613

 96545595 GTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACC 96545654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7614 GTTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACC 7673

 96545655 CATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCTGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGC 96545714
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 CATGGTTCCTGAAGTCTGGTCCCGGGTGACTCTGTCATGTCACACTGCCTTCCACCCAGC 7733

 96545715 TTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTC 96545774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 TTGAGTCTACAAGGAGCAGCCCTGGTCAGTCCCAAAGGGGTCGGGCTTGGATAGTGATTC 7793

 96545775 CATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAG 96545834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7794 CATGTGGGAATGCCTTCCTAGTATTTCTTGGGAAATTGTTGTGTTTTTCAAAATCCCAAG 7853

 96545835 AAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAAT 96545894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 AAAAAAACTCTCAAGAAATTTTAAAGACTGGAAAAGTCTTTACAATTTGCCTGCAAGAAT 7913

 96545895 TAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCT 96545954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 TAAAACATTGATTGCTAAAACACAGCAATCAATGTAGAGATGTTGCTGATTTGAAGGGCT 7973

 96545955 CCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAG 96546014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 CCACTGACATCAGGTGGAAAGCAACCGAAGGAAATATGAACACACAAAGTGGAGGTTAAG 8033

 96546015 GTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACAT 96546074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 GTTGACCAGCATGTCTAGGAATTGAGACAGGAGCACAGGAAAGAGAAGTGGTCACTACAT 8093

 96546075 TATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGC 96546134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 TATGGGTCAGTCTTGTCTATAACTGTTGCAATGTTATAAGTGAGCATTCATAGCCATAGC 8153

 96546135 TGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATGATTAGTATGTCTATACAAATA 96546194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     8154 TGGTACTAACAGTAAGTCAAGCTTACAAATGAAATAATTATTAGTATGTCTATACAAATA 8213

 96546195 GAATATTTTAAACAAATCCTATGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAAT 96546254
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8214 GAATATTTTAAACAAATCCTAAGAGTGGTATTCCAAGAAATAACAAGTTTTAGAAGCAAT 8273

 96546255 ACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAAC 96546314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8274 ACAAGTTTTTTAATTGGCAATTTTGAGACATGATTCTGCATAGTGCCAAGAGATCTGAAC 8333

 96546315 TGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATAT 96546374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8334 TGTGGTATTAATCAAATACTACCCAATAGTCTGGGCTGACATTTTACAGCATTTGAATAT 8393

 96546375 TTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATA 96546434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8394 TTGCTATGGGAAAAAAAATTATAAATACTACTAAAAGTAAAATTTATTTGTTAAAAAATA 8453

 96546435 AAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAG 96546494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     8454 AAACTCTTTTTAGATATCTATGGCTATGATTTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAG 8512

 96546495 TCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGG 96546554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8513 TCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCGG 8572

 96546555 CCTCCCCGGTTCACGCCATTCTTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCC 96546614
          ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8573 CCTCCCCGGTTCACGCCA---TTCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGCTCC 8629

 96546615 CGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAG 96546674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8630 CGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAG 8689

 96546675 CCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 96546734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8690 CCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 8749

 96546735 GGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTG 96546794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8750 GGATTACAAGGCATGAGCCACAGCACCTGGCCCAATCTATAGCTATGATTTCAATGTTTG 8809

 96546795 TTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAAC 96546854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8810 TTTTCTCTCAAACTTATGTTAAAATTTAATTACCATTGTAATAGTATTAAGAGGTGAAAC 8869

 96546855 CTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGAT 96546914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8870 CTTGAAGAGGTGATTAAGCTCTACCTTCATGAATGAATTAATGCCGCCATTATACAGGAT 8929

 96546915 TGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCT 96546974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8930 TGGGTTTCTTAAGAGAGAATTCCTATAAAAGGATGAGTTTGGCCCCCTCTTGCTTTCTCT 8989

 96546975 CACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCT 96547034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8990 CACCCTCTCTTTGCCCATAGAATGATGCAGCAAGAAAGTGCTCACCAGATGCTAGCCCCT 9049

 96547035 TGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAAT 96547094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9050 TGAACCTGGATTTCCCAAACTTCAGAATCATAAGCCAATAAATTTCTGTCCATTAAAAAT 9109

 96547095 TACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAA 96547154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9110 TACCCAGTCTGTGGTATTCTGTAGCACAAAACAAACTAAGCCATACAAAATAATATTTAA 9169

 96547155 AGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATT 96547214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9170 AGAATATGAAGAGGGTTGGAAGTATTTTAAAGACAAAAACAGCTCATGATTTAAGAAATT 9229

 96547215 ATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGAT 96547274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9230 ATTGAGATTTCCTGGGAATATGGCTCTCTTACTTTCATATCCTATAGATTATGATCAGAT 9289

 96547275 AGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGAT 96547334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9290 AGAAATTTAGAAATACTGGGCTTAGGTCATGAGTGGGACATAGTCCCAACCAGCATGGAT 9349

 96547335 TATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAA 96547394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9350 TATTGTTCTAATTTAGAAACTTTCATAAAGAGAAAAAAGTAAAAGTTTTTCTTGTATTAA 9409

 96547395 GTGAACTACTTAATACTGATTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAG 96547454
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9410 GTGAACTACTTAATACTGGTTTGAAATTTTGCATAAAATATTTTGAAGGACAAAAAGCAG 9469

 96547455 AATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCC 96547514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9470 AATTCACTAAGAATTCAACCAAATATTCTGCAGAAAAATAGCTGGTTAAGTGTTACCTCC 9529

 96547515 CCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACA 96547574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9530 CCCCAAATCATTCCATGCATTTTCTCTCTCTGTTCATTGTGATAACTACCATTTTTGACA 9589

 96547575 CAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGT 96547634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9590 CAAGTTTTATTGGACATTCTATTTCCAAAATGTCATAGAATATCAGCCTTTCCTCCAGGT 9649

 96547635 TGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGCTGCTCAGA 96547694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     9650 TGAAAAAACAAAACTGCCTATCCTTGGTGGTTTCCTTTGGGACTTCAGATGTTGCTCAGA 9709

 96547695 CACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTA 96547754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9710 CACAGTGGGCCTTCTATAATTCTAACCCAAATGTGGACGATGGGAAAGTTTAACTTTTTA 9769

 96547755 AAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAAT 96547814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9770 AAGGTCAAAACATGCAATATATCCCTACTAATAACTATTCTTACTGAAACCACATTCAAT 9829

 96547815 CTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGAT 96547874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9830 CTGGTAATAATTTTATTTAACTGAACGATTGTTCACATCTAGAAAACAAAGAACTAGGAT 9889

 96547875 GGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAA 96547934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9890 GGAGGAGAATATTTATTACTTTAAACAAATTCGTATGAATAACAAAAAGATTGAGATGAA 9949

 96547935 ATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGA 96547994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9950 ATATTTCATTTGGATGAAAAGTAATAGAGAAAAATCTGCTATCTCAAAGCCTGATGAGGA 10009

 96547995 AGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTATTCTCCATGGG 96548054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    10010 AGATTGTGCCCTAAAATCATCTCTTCTTATCTACAGAAAGGGCCCATTTTTCTCCATGGG 10069

 96548055 TTATAGTACTACTTGGGTATGCAT 96548078
          ||||||||||||||||||||||||
    10070 TTATAGTACTACTTGGGTATGCAT 10093

Alignment time is 13.3863 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [96533282,96556598] =>     23317 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10707] =>     10707 nucs 'mol-32-34d4-068239_10707'

Score:       10314
Aligned:     10708        nucs
Identic:     10664 (100%) nucs =>      3546 ( 99%)      7118 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [96534954,96538514] EXCISED REGION [96538525,96545658]
 second seq =>  [       1,    3564] EXCISED REGION [    3565,   10707]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [96538515,96538524]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [96538515,96538546] to [96538525,96538556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [96538515,96538518] to [96538521,96538524]
 second seq =>         0 nucs

 96534954 CAGGGTCTCACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCTCAGC 96535013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
        1 CAGGGTCTCACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGAATCACCACTCACCGCAGC 60

 96535014 CTCAACATTCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACA 96535073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCAACATTCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCACATCAGCCTTCTGATTAGCTGAGACTACA 120

 96535074 GGCATCCACCCCAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGT 96535133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCATCCACCCCAGGCCCAGTTATTTTTTTCTTTTTAGGGATGAGGTGTTGCTATATTGT 180

 96535134 CCAGGCTGTCTTGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCT 96535193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGCTGTCTTGAACTCTTGGCCTCAAGAGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCT 240

 96535194 GGTATGAAGGCATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTA 96535253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTATGAAGGCATGAAACATCATACCTGACTGATTCTGAATATTTCAAACTGTACATTTA 300

 96535254 AAATCCAACTCAAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACACACTCCAGGCAGAAT 96535313
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      301 AAATCCAACTCAAATGGCATGGCACACCCTGCTGTGAAAGCAACATACTCCAGGCAGAAT 360

 96535314 CCTAGAAAGCTCTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCT 96535373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTAGAAAGCTCTGAGCACTCAGCATAATCCTAATTGTCATCAGGTCTGTAACCACTGCT 420

 96535374 GTTTCTTCACAAAGTCACTATTTGAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAA 96535433
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTCTTCACAAAGTCACTATTTTAGCCATTTTACTCAAAGTTGACTGAATTTCAAGAAA 480

 96535434 GGTATGAGACACAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCAT 96535493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTATGAGACACAATCACTATCACTTGTATTAGTTTTCATTTGAATATCATACTGTCCAT 540

 96535494 AAATTGTTAGCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTG 96535553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATTGTTAGCCACAGGGTGGGAGGAAGTATGTGGGGGCCAGTTTGTGCGCACATAGCTG 600

 96535554 CCATTCGTGGTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCT 96535613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATTCGTGGTTCAGTTCTCCATGCTAAGAAAAGGAGAACAAACTAGAACTTTCTGTGCT 660

 96535614 GATTCGGTTAATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATA 96535673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATTCGGTTAATACTTTCTCTGTAGATGACTCAGAACCTTCCTGATAATATTTACTTATA 720

 96535674 ATTTTCTACAGGAGCTTAGAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAA 96535733
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTTCTACAGGAGCTTATAATCTGTATCTGTTTTATGAAAATATCCATTGGTTTCATAA 780

 96535734 TTATCCTGCAACCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTC 96535793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATCCTGCAACCTGATAAATTATCTTAAATTGATGGCATACCCAGCTGTGTTTTAACTC 840

 96535794 CTGACCCCAAAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCAC 96535853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGACCCCAAAACTAAAGCTAAAATGTTGCCATTTCAACTTTAAAACTAATAAATGCCAC 900

 96535854 AAAAAAAATCAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGA 96535913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAAAAATCAATGTCTATCTCAAGTAAAAACCAAGAGCAATTAATGGCAATTAAAGTGA 960

 96535914 CTGTTATATGTTTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAG 96535973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGTTATATGTTTCCATAATTCTTTTAAATACATTACATGTAGACATTAAGTACATTAAG 1020

 96535974 AAAATTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATA 96536033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAATTGTGATTTGGGTTTTTTACTTTCAGAGAAATGGAAATTATCCTGACCCTAGCATA 1080

 96536034 AAGATGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGG 96536093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGATGCTGTGAATTTTCTCATCTATGTGAAATTTCACTGACTCCTATTTTATTTCTTGG 1140

 96536094 CTGTTGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAAAATTTCATTCATTCATATGC 96536153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1141 CTGTTGTGTTATACAAAAATACATTTTTAAAATAAAATAATATTTCATTCATTCATATGC 1200

 96536154 ACTCATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTAT 96536213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTCATAGAAATCTGTACCCAAAACTCCACTGAAAATAACATATCTTCAGTTCAAGTTAT 1260

 96536214 ACCCTTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCT 96536273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCCTTCTAGATGGAGAAGTGAACAGATCAGTATTTTACATAAGCTGAATACTTAAGCCT 1320

 96536274 CACCACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTT 96536333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACCACACAGGTAATTAACCTCAAGTAGTACAAGAACTTTCATGTTTCTTTTCTAAATTT 1380

 96536334 TGCCTCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATA 96536393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCTCAGGTATTAACCACCCAAAAAGTAGCAGGCTGCCTTTAAACATCTCTGGCAAATA 1440

 96536394 GCTGGGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTA 96536453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGGGTAGAATTTCACATGGCATAATAAGAACTTTACTAACATAACTTCCAAAAAATTA 1500

 96536454 AAAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTT 96536513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAGCTAGTTTGGATTGCTGTTGTTGTTGGGTGCTTGGGGCTATTTGGAGTGAAAATTTT 1560

 96536514 CTGCAGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCA 96536573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGCAGCTAATTAGAAATTACACACGATTAGGAAGCAGAGTCTGGCATTGTTCCCCTTCA 1620

 96536574 AGTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATA 96536633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTGTTGGGCTAGAGCTAGTTCTAAAGAGAGAATATGTTGAAGTTTACAAGATATCAATA 1680

 96536634 CAAAAGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCT 96536693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAAGTATTGATATCCATGGTTTGAGTCTGGCTATCTTAGCCTCAACGAAGAGCATTCT 1740

 96536694 AATTGTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGCCTTTAA 96536753
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1741 AATTGTCACTGAAATCAGATATGACCAGGTGGAAACAGGATTTTCTTAGACTGTCTTTAA 1800

 96536754 AATGATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCT 96536813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATGATCTAAGTGTGCAAATTACCATCCTAATCTAATTCCTGAATATGCAAAACTATTCT 1860

 96536814 AATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTG 96536873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATTAAAGAGGAAGCTCTAGAAGAATTAATAATGACTGACTGTCATTCTTCAATGTCCTG 1920

 96536874 GAATAAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCAT 96536933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAATAAAGTATCTTGTAATAAATGGATTTTCATATTACTTTCCCCTTTGTGAGTACCCAT 1980

 96536934 GGCTGACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAA 96536993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCTGACACATGGTGTGAAAGAACTCTGCTCAGTAAGAAGATAGTATTTAGCTTAGTCAA 2040

 96536994 TTAATCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCC 96537053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTAATCATATTAGCTCCTTCCTGAATGCCAAATAAAACATATAGGGAAATGCTATGGTCC 2100

 96537054 AAATATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCTCCATTGTGATAGTATTAATAGG 96537113
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2101 AAATATCCACCAAAATTTATGTGTCGAAACTTAAATCCCCATTGTGATAGTATTAATAGG 2160

 96537114 TGGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTT 96537173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGAGTTTTGGGTGAAGTGATTAAGTCATGAGGGCTTATCTCTCATGGATTAATACTTTT 2220

 96537174 TCAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGA 96537233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAAAGGGCTGGAGGGAACTAGTTAGGCCATGTGAGGATACAGAGTTCATCCCATCTGGA 2280

 96537234 GGATGCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAAC 96537293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGATGCAGCAACAAGTCACTATCTTGGAAGCAGACACAGGGCCCTATCCAGACACAAAAC 2340

 96537294 TTGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGC 96537353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGCTAGTGCTTTGGTTTTGAACTTCCCAGCCTCCAGAACTATGAGAACTAAATTTCTGC 2400

 96537354 TTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAG 96537413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTTATAAATTACCCAGGCTTGGGTATTTTGTTATAGCAGCACAAATAGACCAAGACAG 2460

 96537414 GAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGA 96537473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGAACCAGACTGTCAGTAGTGGCGAGAGCATGACTCAGATGCACTGGGAGAGCCAGAGA 2520

 96537474 CACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAAC 96537533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CACCAGGAGAGAGCCACTGGGAGGGAGCAGGAGAGTTTGTTTCTAAGGCTGCCTCAGAAC 2580

 96537534 CTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCAT 96537593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCATAATTAATGAGCTCTTTATATGCCAGGCCTTGGGTTGAACACTTCACATGCATCAT 2640

 96537594 TTTATTTAATCCTCACAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATA 96537653
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTATTTAATCCTCGCAGTCATATGAGATAGATTCTCTTACTGTGCCTATTTCTCATATA 2700

 96537654 AGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTG 96537713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGGATATCGAGGTTTAGAATGGGAAGTGGCCAGAACTCCAACCAAATAGATCTGTGATTG 2760

 96537714 CAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACC 96537773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGTGCAAAGCCTGGCTGTGCTGGTTAAGAGCACAGCCAGAACGACTATGGTCTACTACC 2820

 96537774 CTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGC 96537833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAAGCATCATTTCCTCTGGTTTCAAAGACACAAAGTAGCATTTTCTAAAGAAAGTAAGC 2880

 96537834 CTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTGAGAAGTATGCTATTAGATGG 96537893
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2881 CTTCTCTGAATCAGTGTTAATTCTACTGATCACGGAATTAAGAAGTATGCTATTAGATGG 2940

 96537894 AGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAA 96537953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGTGAAAGTTCTTAGTTAATGGAATTCTTATGTGGCTTTCAGAACATTAACGTGGAAAA 3000

 96537954 CTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTC 96538013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGAATACAAATATTCTGTGGTACTTCTCCAACATCCTAAAAAGCACTAATTATTTACTC 3060

 96538014 CCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAATGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCT 96538073
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTCCTTCAAGACTACTATTGTCCAACGAACGACATCACTAAGAATCATTAGAAGTGGCT 3120

 96538074 TGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCC 96538133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGTACATATTGAGACAATAGATACAAAGACAAAGTCACAAGAAATCTAAGTCCCTTTGCC 3180

 96538134 TACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCACAGATAGTGACTTCTAAAA 96538193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3181 TACTGGTCCCCAGACAACAGTATACAGGATACTGGGACTCCCAGATAGTGACTTCTAAAA 3240

 96538194 AAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAG--ACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTG 96538251
          ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAA-AAACAGGAGACAGTGGGTTTCTCACTGCTCCTG 3299

 96538252 ACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGGTGAT 96538311
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3300 ACCTCCCCAGTAAGATCATTTGGCTCCTTTCTCTCAGCATGTGGGAAACCCAAGGTTGAT 3359

 96538312 GTCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATACATTGGATG 96538371
          .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3360 ATCAAACTCATCCTGGAAGCCTCTGTACTTCAGTTAAATCTCCTGGAGATATATTGGATG 3419

 96538372 TAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCA 96538431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TAAAGAAAACTTACTAGAGGGCAAGACATGCATTGCTAATATATGAAAATCTCTTTCTCA 3479

 96538432 ACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGT 96538491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ACCTCAAGTATCTGTGGTATCTGTGGGTGTGTCTATACATATAGATATGTGTGTGTGTGT 3539

 96538492 GTGT--ATGTATATATTCTCCACTC 96538514
          ||||  |||||||||||||||||||
     3540 GTGTGTATGTATATATTCTCCACTC 3564

EXCISED REGION

 96538525 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 96538584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGCCAAATTTCACAAAACTCTCCAGTT 3624

 96538585 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCGTCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 96538644
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 TATAGTTCAATTCCCCACTCAGGCCATCAGTGTTCCCACTGACATGACAGGAGGGATCTT 3684

 96538645 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 96538704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 TCTGCATCTCTATCAATATGACAAGAAGAGAATCTGCTTCTATTGGTATCCTTACTTTGA 3744

 96538705 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 96538764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 AGTGATGTGAAACCCCACCGCTTTTATTTTGTTGGTAAAAATCCCTAAGAACCCTCCTAT 3804

 96538765 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 96538824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 CTTTGACCCCATATGGAGTCTTATAATCTAGTCTCACTTGGGGCACCAGAACCTTTTAGG 3864

 96538825 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGGAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 96538884
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 CCATCACTGCTGAAATTGGTACTGAAAAAGGGAATAATATCTCTTAGAAAAGTCAGAGAG 3924

 96538885 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAAAGCAGAGAGAGATTTTTGT 96538944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3925 ACTAACAGGAAATTGTGTGAGGAGAATATTAGAAGGAAAAATGCAGAGAGAGATTTTTGT 3984

 96538945 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 96539004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 GTTTGGTTTTTACTCACACTTTTAAAGTTAACTCTTCACTGTTTACAGTATTCTTGGTTG 4044

 96539005 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 96539064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 CTTCGCTTTGGCTCATTGGTTTTTATGAATCAGCTTTAGGACTATTACAGAGCATTGAGA 4104

 96539065 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 96539124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 AAACAATTATTTTTAAGGAGTTTCTTTGATGCTATTATTTTGTGTATAAGACACACCATC 4164

 96539125 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 96539184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 CAAGAGGCTTTTGCATCAATGACTAAGAAATATAAAATGAGAGATATTTTTGAGATAGAT 4224

 96539185 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 96539244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 GATAGATAGATAGAAAACAGCACTGAGGCTAATAACAGTTATTGATATAAAGCAGGGAGG 4284

 96539245 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 96539304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 AAATGTCTCCATTTTTTATTTATGTATTGTACAGATATCCCTTATTTCAAAGTAAATCCT 4344

 96539305 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 96539364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 ACGTACCCATTTTCTAATGTGTATAATTAAAATAGAAATAAATGATCAGAAACCAAGAAG 4404

 96539365 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 96539424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 AAAGAAGATAAAAATAATTTGTCCAGAAAGATGCCACACTTAATTCCTAATATGACTTTG 4464

 96539425 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 96539484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 AGCCTTTGAAAATCAGAACAAAACCAAGGAAAGAAAATGGATTACATTATTCTTATTATC 4524

 96539485 AAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGT 96539544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 AAGATTACTAAGCAAAAAAAAAAATGTTTTTTCTGGCAATAAATGCTAGTAGAAATTGGT 4584

 96539545 CCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCA 96539604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 CCCTTAAATTCTTATGTAAGGATCATTTGAAAGACCCATATGCAACTTTCAATAACTCCA 4644

 96539605 ATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATA 96539664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 ATTGAAATTATATCGCAGAAACAGAGCTTAAAGTATGCAGAGGAAGGAAGAGTTAACATA 4704

 96539665 TCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTC 96539724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 TCTTTTTTCGATATCTGTTTTGTGAATTGGCTTTTAGGAGGTGCTGGACAACATGCATTC 4764

 96539725 AAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGC 96539784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 AAAGTTTTAACTTCCCAATGAAGACCTGAAGTGGTGAAATTGACATTTTGTCTGGGAAGC 4824

 96539785 TTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTC 96539844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TTGTATGTGTGCCCTAAAAGGGATATCTGTACAATACGTAAATAAAAAATGGAGACCTTC 4884

 96539845 AGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAGTCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAA 96539904
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 AGAGGTATCAATGTGTAGGGTCAAAAATCCTTCTGTCTCTATCTGGATATAGTGCAGCAA 4944

 96539905 ACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACT 96539964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 ACACTCTAGGTATTTCCAGTAGAAAGAGATTTAATGCAGGAAACTAAGTGATTACACACT 5004

 96539965 CAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGG 96540024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 CAGCAGAAGAGCTGGAAAAGCCTGAGTCAGGGGATTGCAACATGTCTTTTGGCTTCAAGG 5064

 96540025 TCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAA 96540084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 TCTGCTGTGCACCAGATTTCAGAAAATTACTGCTACTGTTAATACTACTGCTGCCATGAA 5124

 96540085 TATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCT 96540144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 TATGGCTGCCTTCCACTCATGATGCTGCTGACTAGACCGAGAAACGTGGAGTCCAGACCT 5184

 96540145 TGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAAT 96540204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 TGGTTGTCAGCTGCCACTGTTGCAGGAAGACAGCCTTTAACTTTCTTCCACTTTTCAAAT 5244

 96540205 CTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAAT 96540264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 CTCTTCCAAGTGCCTATCACAATATATCCAGAATCTTAGTTGCAAAGGAATCTGAGAAAT 5304

 96540265 GCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATA 96540324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 GCAAATTTTATCCTTCCAGGCTTTCAGTACAGGGGAGGGAGAGAGAGAGAGCAAGATATA 5364

 96540325 AATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTT 96540384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 AATGGATGCCAAATGCCCAAAGACAGTATATAGCGTACCCCTCCAAAGAGATTAAATTTT 5424

 96540385 GCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGA 96540444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 GCTCATGTTTTTGGACAGATCTCCAATTGAGACCTTTAAGTTCTGTGTCATAGAATATGA 5484

 96540445 AATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTG 96540504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 AATATGTTATTTTGTCTAGAAAATGTTAAGTGCTATGTGTTGTCACCTCTTCAGTTCCTG 5544

 96540505 AATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTC 96540564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 AATCAGTCCTGCCCGAAGTGGAAAGTACTTGAGCTACTCCAGCCCTCACCATCTTTCTTC 5604

 96540565 TTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAG 96540624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 TTAAGAGAGAAGGAGGAAGATGACCCCAGTAAGGATGGGTCAGCATAGTTCAGAATGAAG 5664

 96540625 GATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAG 96540684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 GATAGAACCCTTGGGAGTCTCTGTGGTTCCTGAGCTGACCTTGCTGTCTCCTTGGCCCAG 5724

 96540685 AATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTG 96540744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 AATACAAGATCCCTGGAACCAGCAGACCCAGTTCCAGCCTCTCTTGTCAATTCTGTTGTG 5784

 96540745 CTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTG 96540804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 CTGCAAGTGAGTTGTGTCACGCTTTAGGGATGAATCTTAATATATAGAAACAATTACTTG 5844

 96540805 AATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATATTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAG 96540864
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5845 AATGAATTCATTTAATTGCTTGGTGAATAATGTTGGCTAAAAAGTAATTTATTTTAATAG 5904

 96540865 AGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAG 96540924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 AGCTGATATTAAACTACTGTTTTCTAGAATAAAGGCCAACAAGTTAAAGCCATTCCTGAG 5964

 96540925 ATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGC 96540984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 ATGGCATAGATCTGCATCCTATGTTTGTTATAGTAGAGAGGAATTATTTCTGAATTGAGC 6024

 96540985 AAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATA 96541044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 AAGTTTATTTAGATTTGTTTAAAGAAATGACGTGTAGATCAAGCCTTCTTTTCCACCATA 6084

 96541045 TACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAA 96541104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 TACAGTTGGTATTTGATTAGTCAGGGAGTCATTTTTGCCTCTTTAGTTCTGACAGTAGAA 6144

 96541105 TTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTC 96541164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 TTTGAAAAAGGATTTGAAGATGCTTTAATAGTTTAGACAGCTTAGACTCCATAATTGTTC 6204

 96541165 CTGTCTATAATAAAATAGAATGCAAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAA 96541224
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 CTGTCTATAATAAAATAGAATGCTAATCTATTCTGCATGATCTAAAATCACAAATGTAAA 6264

 96541225 CATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAG 96541284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 CATCCACATCAGAGAGATGGCTGACAATACAAGGGCAAGCTTCATGTTGGCAAAAGTCAG 6324

 96541285 ATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCT 96541344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 ATTTACCATGTTGATAAAAATCAGACTAGGCTTCAAATTGTTACTGTCAAAAATGCTTCT 6384

 96541345 TGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATT 96541404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 TGGAAGAATTTGTCATTTTGAAAAGCAAGGAACAACTATGTTTTATTTATTTTATTTATT 6444

 96541405 CCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAG 96541464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 CCTAATTTAACATGTTTAAGCTTTAGGAATACTTTCTCATCAAATAAAATGATTGCTAAG 6504

 96541465 TTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTC 96541524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 TTGTAAAACTTATTAGTCACACTATTAGGTCTTTAGTGTAAGGTAGCAAACACCTGTCTC 6564

 96541525 TCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTC 96541584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 TCTAAATAATCTCCAAAGTGGGATGTGCTAATCCCATGGAGTACCTTGGATTTCTTTTTC 6624

 96541585 TTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTG 96541644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 TTGTATCATACTTTCCCAATTTATTTTCTGTGTCTTTTTTATAATGTATGTATAAATCTG 6684

 96541645 ACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTT 96541704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 ACCATATATGTATATAACTTATAAATAAATATGCATATATTAGTAGTTTGTGCTCAATTT 6744

 96541705 TTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGG 96541764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 TTTAATAATGGAGGTGCAAAGTCAATAATTTTGAAGATTACCATTCTACACAAATGTTGG 6804

 96541765 CCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCA 96541824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 CCTGCAAAACCTGCAGTAATCCACCCTTTTCTCAAACTTCATTCAATCAAGAGCTCAGCA 6864

 96541825 AGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCA 96541884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 AGCATCTTTTCTTGAATTTTTAATATTTTAATGGATATTGGAAGATGGTCCTTGAAGTCA 6924

 96541885 GAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATT 96541944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6925 GAGAATCAGAACCTTATTTCTGAAAGGGTACTAGAGATAATATTATCCAACTTTCTCATT 6984

 96541945 TTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTA 96542004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6985 TTTTTTCTGATGAGGAAAATGAAACCAGGGAAAGCTGACAATGTGACCTCCTTTTACCTA 7044

 96542005 TAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAA 96542064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7045 TAGAGGAGGAAAACATGGTGCTTTTCCTGTAGCCATCAAATCTGCTTATGCTCATCCAAA 7104

 96542065 TCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGT 96542124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7105 TCATAACATGAGTGCTGCTGATGTCAATGCCTGTAATCGGCCATACATGTTATGGGTAGT 7164

 96542125 GATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCAT 96542184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7165 GATATAGACTTCCAGTCAAATGTTACTGCATGTGTCTGCTTCAGTCCATGGTAGTTGCAT 7224

 96542185 CATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATACTTCTTGGGCTAACAGCAC 96542244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7225 CATTACTGTCATACTATTAGTGCAGGAAAGGTCAAGTAATGCTTCTTGGGCTAACAGCAC 7284

 96542245 ATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAG 96542304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7285 ATAATTTTCATTCATCATTAACATTTGTATTCACTATTCTTTCAAACTGAAGTCTTTGAG 7344

 96542305 CCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGA 96542364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7345 CCTATACTCTCTGGCCCTAAATCTTATATTCATGCAAATTTACATAACTGCCTTTGCTGA 7404

 96542365 ATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAAC 96542424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7405 ATCTTGGAAATGTGTTGATTTGTTGGATTAAAATACACAGATAAAAATCATAACACTAAC 7464

 96542425 TATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTT 96542484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7465 TATGTGTGGTTAACTTTATATTACAAGGCCATTATGATTTCTCTTTTGGTTCCAACTTTT 7524

 96542485 GTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCT 96542544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7525 GTGCTCTTTATTTTGCTTAGTGGTGAAAAAATACTAACCTTATAGAATTGGGGGCTTTCT 7584

 96542545 ATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCAC 96542604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7585 ATCTCGATTTTATAATGAGATGGCCATGTTTGTCAGCCCGTTTACCACATGATACCCCAC 7644

 96542605 TCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGT 96542664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7645 TCTTCATGGCCGCCCATGCTAGTCTCAGCTTTATACTAGGGTAGCATTCTAAGCTCTTGT 7704

 96542665 TCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACC 96542724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7705 TCTCCCACTACCCCTGTTAGAGCCAATTCCTCCAGGACACCAACATAAACAAGGTAGACC 7764

 96542725 CTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGT 96542784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7765 CTTTCTTTCAAGTATTCTCCCTGGCTGATCGGTACTTTCTCCATTGTTAGATACAATGGT 7824

 96542785 CCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGG 96542844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7825 CCTGCTCCTGCTCGAGTTTTCTGAAGTTCCTGATGGCTGACCATCTGTTTATTCCTTTGG 7884

 96542845 ATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCT 96542904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7885 ATTCTCTTACAAAGCCTTCATCTGGTTCTCCTGTTTTATTTCTCATAAGCTGAACTATCT 7944

 96542905 CCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATC 96542964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7945 CCTTTCAGGGCTCCTGTCCTCTTTCCATCCCTTTGTGTGAGCATGCCACAAGGCTCCATC 8004

 96542965 CTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCA 96543024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8005 CTGTCTTCTCCTCTCTTTTAGTTGAAATCTCTTTCATTCACAGAACTTCGGCAATCACCA 8064

 96543025 CTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATA 96543084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8065 CTCTATCCCCACACCTGCCTCTTTCATGCTTCTGCTATAAAGCAACAGATTCCTGCTATA 8124

 96543085 CTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCC 96543144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8125 CTTACCTGAAAAGTCCCATTGATATCCCAAGGTCAATATATTTCATCCCAAAATAAGTCC 8184

 96543145 TCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAAC 96543204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8185 TCCTGCTTCTCTCATCTTATTATAAGTAGCACCATTTCTACAATCTCTTAAGCTCAAAAC 8244

 96543205 CTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAA 96543264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8245 CTTTCTACAGTCTTCTACCGCCATCTAATTAGTTACAGTATCCTAAGTTTTCATTTAAAA 8304

 96543265 TGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTG 96543324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8305 TGCTCCTTACTTTCAACTTTTTCTTTCCATTTTAGATGCTGACAGCCCTCTTCAGACCTG 8364

 96543325 CACTGCCCCATCATGATCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAG 96543384
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8365 CACTGCCCCATCATGGTCAACATCATAGAATGAAATATCTAACAGCATGTCTGCTGCAAG 8424

 96543385 ACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAAGTCAAACGT 96543444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     8425 ACAGTAGAGGAAATGTCTAACATAGAAAAAGGCCTGGATCGACGGCTTGAGGTCAAACGT 8484

 96543445 GTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCT 96543504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8485 GTGAGAAAATGTGGCATAACTAAATACTCTTTCCCAAAGTGTTTTTCTAGTTTAGCTCCT 8544

 96543505 CCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGA 96543564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8545 CCCACATTTTCCAGGGCTCCTCTGACTCAAAAAAATTAATTTGACCAATCTAGAATTAGA 8604

 96543565 AAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTAT 96543624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8605 AAATAGTACCTTATTTCAGTAAAGAACACGTTGATCCCAGAAGTAAATGAACGTATTTAT 8664

 96543625 TATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATA 96543684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8665 TATTAATTTACAATGAAATATGCTGACAGCCAACCCCTTTCCCTCTAAAAGAAAAACATA 8724

 96543685 TTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAAT 96543744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8725 TTGCTCCGCAACCTGCCCCAGACCTGTCCAACTTATAGAAATATCTGAAGTGATAATAAT 8784

 96543745 TGTTACTGGTTTTAAGTTATAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTA 96543804
          ||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8785 TGTTACTGGTTTTAGGTTAGAAACTTAGCCCTAATGAGAGAGATTTTTATTATTTTATTA 8844

 96543805 ACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTA 96543864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8845 ACATTTCATATGACAAACAATAAAGTTCCTTTTGATTTGGATTTAGCACAAAGTATCTTA 8904

 96543865 AAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTTGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCA 96543924
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8905 AAACGTCTGAATGCAAAGGCAAGTTGGAAATTCGCCAGTTGGGTGTGCTGGCGTCCCCCA 8964

 96543925 ACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAA 96543984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8965 ACTAGCTGCAGCCCCCAATTCCCATCAGCACAGGTGGCTGGAGCCACCATCGAGTTAAAA 9024

 96543985 AAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCC 96544044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9025 AAAGCAAACATCAGCCACTGGCCTCTCCTCTGGTGACTGTCAGAACCCACTCTCCCACCC 9084

 96544045 AAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCT 96544104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9085 AAGGGCAACTTCCTGGCAGACCTTTGTTTTTCTGCCCCTCACAGTGACCTTGAAACCTCT 9144

 96544105 CAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGCCTTTCAGCTTATCAAAAAACAAC-AAAAAA 96544163
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| ||||||
     9145 CAGAAATAAAATGTTATTTCTTCTCATAGGCTTTCAGCTTATCAAAAAACAACAAAAAAA 9204

 96544164 AAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAAC 96544223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9205 AAACATTTTATTGAGGTACAAGCGACATACAAAAGGCTGTACATATTCAATATATACAAC 9264

 96544224 TTGCTGAGTTTGGAGACAAGTATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAA 96544283
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9265 TTGCTGAGTTTGGAGACAAGCATATATCCATGAAACTCTTAACACAATCTATGCCATAAA 9324

 96544284 CATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATTTTTT 96544343
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     9325 CATATCCATCACTTCAGAAAGTTTCCTCCCACCCTCTTCATTTGTTATCAGTAATGTTTT 9384

 96544344 TGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAA 96544403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9385 TGTGATAGGAACAGAATGTAAGATCTACCCTCTTAGCAAAATTTTAAGTACACAATGCAA 9444

 96544404 TATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATA 96544463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9445 TATTGTTAATTATGGGCATTATGCTGTACAGTAGATCTCCAGCACTTATTTATTTGTATA 9504

 96544464 ACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCA 96544523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9505 ACTGAAACTTTGTACCATTTGACTAATACTTCCATTTCCTTCTCACCCCAGCACCTGGCA 9564

 96544524 ACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGG 96544583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9565 ACCACTATTCTACTCTCTGTCTCTATGAGTTTGAATTTTTTAGATTCCTCACATACGTGG 9624

 96544584 TACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGC 96544643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9625 TACATTAGCAGAATGAAGGATACAAATCACATGATTATCTCAATAGATTGGAGAAAAAGC 9684

 96544644 ATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGG 96544703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9685 ATTTGACAAACTTCAACACCCTTTTATGGTAAAAACTCTCAACAAATTAGGTACAAAAGG 9744

 96544704 AACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTG 96544763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9745 AACTTACCTCAACATAATAAAAGCCAAGTAAATAAAAATAAAGCTCGGCCGGGCACAGTG 9804

 96544764 GCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGG 96544823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9805 GCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTGAGGTCGG 9864

 96544824 GAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATT 96544883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9865 GAGTTCGAGACCAGCCTGACAAACATGGAGAAACCCGATCTCTACTAAAAATACAAAATT 9924

 96544884 AGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAA 96544943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9925 AGCAGGGCATGGTGGCGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGTAGAA 9984

 96544944 TCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGC 96545003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9985 TCACTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAATCATGCCATTGCACTCCAGC 10044

 96545004 CTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATAT--------ATACATACATA 96545055
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||
    10045 CTGGGTGACAAGAGCAAAAGTCCATCTCAATGCATACATATATACATACATACATACATA 10104

 96545056 CATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTGA 96545115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10105 CATACATACATACATACATACATACATAAAGCTCACAGCTAACATCACACTCAATGGTGA 10164

 96545116 AAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGGAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCCT 96545175
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
    10165 AAAACTGAAAACTTTTCCTTTAAGATCTGTAACACTGCAAGGATGCCCACTCTCACCCCT 10224

 96545176 TCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATC 96545235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10225 TCTATTCAACATAGGACTCTAAGTCTTAGCATTAGGTAAGAAAAAGAAACAAAAGGCATC 10284

 96545236 TAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGCA 96545295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10285 TAAATCAGAAAAAGGGAAGTAAAATGATCTCTGTTTTTAGATGACTTGATCTTACATGCA 10344

 96545296 GAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGTT 96545355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10345 GAAAATCCTAAAGACACCACCAAAAAATTGTTAGAACTAATAAATGAATTCAGTCAAGTT 10404

 96545356 GCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACAA 96545415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10405 GCAGAATACAAAATCAACATATAAAAATCAGTTGTATTTTTGTACACTAATAACAAACAA 10464

 96545416 CCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACGA 96545475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10465 CCCGAAAATAAAGAGAACAATCGCATTTACAACAGCATCAAAATAATAAAATACTTACGA 10524

 96545476 ACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAAA 96545535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10525 ACAAACTTAACTAGGAGGTGAAAGACCTGTACACTGAACACTATAAAACATTGATTAAAA 10584

 96545536 GAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAAG 96545595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10585 GAACTTTTAGCTTCCCTTAAACTCATTATGTACAAACTCATTATGTAACTTCCTGAGAAG 10644

 96545596 TTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCC 96545655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10645 TTAGGAAACCGACTTCAGGTTATACAACTATAGTTAGTGGGGCAGTCAGGATTAAAACCC 10704

 96545656 ATG 96545658
          |||
    10705 ATG 10707

Alignment time is 14.2038 s

