
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3302] =>      3302 nucs 'mol-32-1e7c-213968_3302'

Score:        2992
Aligned:      3309        nucs
Identic:      3272 ( 99%) nucs =>      1804 ( 99%)      1468 ( 98%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66695671,66697485] EXCISED REGION [66699292,66700776]
 second seq =>  [       1,    1814] EXCISED REGION [    1815,    3302]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66695671 GCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTC 66695730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTC 60

 66695731 CCGGGTTCAACCAATTCTCCTGCTTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTGC 66695790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCGGGTTCAACCAATTCTCCTGCTTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTGC 120

 66695791 CAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAC 66695850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAC 180

 66695851 TCCTGACCTCAAATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGA 66695910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTGACCTCAAATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGA 240

 66695911 GCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAG 66695970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAG 300

 66695971 CTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCCTAACATACACA 66696030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      301 CTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCTTAACATACACA 360

 66696031 TACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTTC 66696090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTTC 420

 66696091 ATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAA 66696150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAA 480

 66696151 TTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTC 66696210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTC 540

 66696211 TGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTC 66696270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTC 600

 66696271 ATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCACT 66696330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCACT 660

 66696331 CTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGGGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATG 66696390
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGAGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATG 720

 66696391 TCTCTGGGATCCTGTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAG 66696450
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTCTGGGATCCCGTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAG 780

 66696451 GAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACAACTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAA 66696510
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      781 GAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACAATTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAA 840

 66696511 CGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATT 66696570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATT 900

 66696571 CCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAA 66696630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAA 960

 66696631 AGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTT 66696690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTT 1020

 66696691 TGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATC 66696750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATC 1080

 66696751 CATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATT 66696810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATT 1140

 66696811 ATTTCAATGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTTTTTCTCCTTTCTGTCTAGAACTACTA 66696870
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTCAACGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTTTT-CTCCTTTCTGTCTAGAACTACTA 1199

 66696871 AAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCT 66696930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCT 1259

 66696931 TTTTTGTCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGG 66696990
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTTTTGCCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGG 1319

 66696991 TGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTC 66697050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTC 1379

 66697051 TACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCC 66697110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCC 1439

 66697111 TGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 66697170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 1499

 66697171 TCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGC 66697230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1500 TCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTTTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGC 1559

 66697231 CTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCAT 66697290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCAT 1619

 66697291 TGGTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCA 66697350
          ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGTTTATATGCTTGTATTTGGGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCA 1679

 66697351 ACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACCTGTAATCC 66697410
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1680 ACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACTTGTAATCC 1739

 66697411 CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAAT 66697470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAAT 1799

 66697471 GAAGCCGAGATTGCG 66697485
          |||||||||||||||
     1800 GAAGCCGAGATTGCG 1814

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT-------AAAAAAAAA 66699344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||
     1815 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 1874

 66699345 AAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTG 66699404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 AAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTG 1934

 66699405 TACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAG 66699464
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 CACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAG 1994

 66699465 GAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTG 66699524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTG 2054

 66699525 AGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTG 66699584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 AGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTG 2114

 66699585 AGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGACTT 66699643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2115 AGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTT 2174

 66699644 TGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTG 66699703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTG 2234

 66699704 AAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTA 66699763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 AAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTA 2294

 66699764 GTGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAG 66699823
          ||||   |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GTGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAG 2351

 66699824 CAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGT 66699883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGT 2411

 66699884 GTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTATGGT 66699942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2412 GTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGT 2471

 66699943 AAAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTA 66700002
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 ---AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTA 2528

 66700003 GAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGA 66700062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 GAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGA 2588

 66700063 ACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAA 66700122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 ACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAA 2648

 66700123 GAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACT 66700182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||
     2649 GAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACT 2708

 66700183 CCTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCT 66700242
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 CCTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCT 2768

 66700243 TGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTAT 66700302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 TGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTAT 2828

 66700303 GTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATT 66700362
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 GTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATT 2888

 66700363 TTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCC 66700422
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 TTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTAAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCC 2948

 66700423 CAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCT 66700482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCT 3008

 66700483 TTTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACG 66700542
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 TCTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACG 3068

 66700543 GGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGG 66700602
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3069 GGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGG 3128

 66700603 GTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAA 66700662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3129 GTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAA 3188

 66700663 GGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATAC 66700722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATAC 3248

 66700723 AAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGG 66700776
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3249 AAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGG 3302

Alignment time is 2.93181 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2156] =>      2156 nucs 'mol-32-1f0b-016883_2156'

Score:        1937
Aligned:      2162        nucs
Identic:      2135 ( 99%) nucs =>       605 ( 99%)      1530 ( 99%)
Gaps:           13 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66696877,66697485] EXCISED REGION [66699292,66700837]
 second seq =>  [       1,     609] EXCISED REGION [     610,    2156]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66696877 AAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTG 66696936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTG 60

 66696937 TCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATC 66696996
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATC 120

 66696997 ACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAA 66697056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAA 180

 66697057 AAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGG 66697116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGG 240

 66697117 CTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGC 66697176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGC 300

 66697177 CATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTT 66697236
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTTTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTT 360

 66697237 TTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGGTTA 66697296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      361 TTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGTTTA 420

 66697297 TATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCA 66697356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCA 480

 66697357 TCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTA 66697416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      481 TCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACTTGTAATCCCAGCTA 540

 66697417 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCC 66697476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCC 600

 66697477 GAGATTGCG 66697485
          |||||||||
      601 GAGATTGCG 609

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT-----AAAAAAAAAAA 66699346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||
      610 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 669

 66699347 AAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGTA 66699406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      670 AAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGCA 729

 66699407 CATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGGA 66699466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 CATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGGA 789

 66699467 AGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGAG 66699526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 AGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGAG 849

 66699527 AAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGAG 66699586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 AAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGAG 909

 66699587 CTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGACTTTG 66699645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
      910 CTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTTTG 969

 66699646 GGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGAA 66699705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGAA 1029

 66699706 ATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAGT 66699765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 ATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAGT 1089

 66699766 GCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGCA 66699825
          ||   |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 GC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGCA 1146

 66699826 GTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTGT 66699885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 GTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTGT 1206

 66699886 GTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTATGGTAA 66699944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  
     1207 GTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGT-- 1264

 66699945 AAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAGA 66700004
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 -AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAGA 1323

 66700005 ACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAAC 66700064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 ACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAAC 1383

 66700065 CAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAGA 66700124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 CAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAGA 1443

 66700125 AGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACTCC 66700184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
     1444 AGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACTCC 1503

 66700185 TCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTTG 66700244
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTTG 1563

 66700245 TACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATGT 66700304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATGT 1623

 66700305 AACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTTT 66700364
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 AACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTTT 1683

 66700365 TGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCCA 66700424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCCA 1743

 66700425 GGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTTT 66700484
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1744 GGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTTC 1803

 66700485 TATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGGG 66700544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 TATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGGG 1863

 66700545 TGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGGT 66700604
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGGT 1923

 66700605 GCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAAGG 66700664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1924 GCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAAGG 1983

 66700665 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACAA 66700724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACAA 2043

 66700725 AAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG 66700784
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG 2103

 66700785 GCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGC 66700837
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 GCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGC 2156

Alignment time is 1.69259 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3748] =>      3748 nucs 'mol-32-2105-114726_3748'

Score:        3370
Aligned:      3756        nucs
Identic:      3698 ( 98%) nucs =>      2369 ( 99%)      1329 ( 98%)
Gaps:           37 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66695102,66697485] EXCISED REGION [66699292,66700634]
 second seq =>  [       1,    2400] EXCISED REGION [    2401,    3748]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66695102 TCTACTTCCTTAGGATATGGCCTAAGCACATCTATCACTTAGCTTTTTTTGGACTTTTGC 66695161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTACTTCCTTAGGATATGGCCTAAGCACATCTATCACTTAGCTTTTTTTGGACTTTTGC 60

 66695162 TCTCATTCAAAAGATAGGAATGTGACTACAACATGTTTATTATGTGGATTACACAAGATA 66695221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCATTCAAAAGATAGGAATGTGACTACAACATGTTTATTATGTGGATTACACAAGATA 120

 66695222 CAGAACCAAACATAGCACCTAGTACCCAGTAGGACACTTCACAAGGATTTGTCACTACTG 66695281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGAACCAAACATAGCACCTAGTACCCAGTAGGACACTTCACAAGGATTTGTCACTACTG 180

 66695282 TTTGCCTGCCAGTCCTCTCCTTTCCTCTGCCCTACATTTTTTGGCTGAGGTTGTTGATGT 66695341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
      181 TTTGCCTGCCAGTCCTCTCCTTTCCTCTGCCCTACATTTTTTGGCTGAGGTTGTT-ATGT 239

 66695342 GCTTTTTCCTTTCTTGGAT----ACAGTCACCACTATTTTAAACCTTATTTTTAGTTTTG 66695397
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GCTTTTTCCTTTCTTGGATGGATACAGTCACCACTATTTTAAACCTTATTTTTAGTTTTG 299

 66695398 TCAAAATTCTACATGGACAGTTAAAAAGTCCAAGTTTATTAAAAAACAAAACAAAACAAA 66695457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TCAAAATTCTACATGGACAGTTAAAAAGTCCAAGTTTATTAAAAAACAAAACAAAACAAA 359

 66695458 AAAGCAGCAGTTCCTTGTACCCTCCTCAAACACAAACACACCTCCATTTCCCCCTCTCAA 66695517
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      360 AAAACAGCAGTTCCTTGTACCCTCCTCAAACACAAACACACCTCCATATCCCCCTCTCAA 419

 66695518 GCAACAACCACTTTCAGATTTTCTAGGTGATTCATTTGGTATTTATCTCCGTATCTCTAA 66695577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GCAACAACCACTTTCAGATTTTCTAGGTGATTCATTTGGTATTTATCTCCGTATCTCTAA 479

 66695578 ATAGCATACTTATATTGCTGCTCGCCCCTGCACCCCCAACCCACCATTTTGCTTATTATC 66695637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 ATAGCATACTTATATTGCTGCTCGCCCCTGCACCCCCAACCCACCATTTTGCTTATTATC 539

 66695638 TCTTTTTTTTTTTTTTTTTT--------------GAGGCGGAGTCTTGCTCTGTCCCCCA 66695683
          ||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||
      540 TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCGGAGTCTTGCTCTGTCCCCCA 599

 66695684 GGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCGGGTTCAACCA 66695743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCGGGTTCAACCA 659

 66695744 ATTCTCCTGCTTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTGCCAGTTTTTGTATT 66695803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ATTCTCCTGCTTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTGCCAGTTTTTGTATT 719

 66695804 TTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAA 66695863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAA 779

 66695864 TGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTG 66695923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTG 839

 66695924 GCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCT 66695983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCT 899

 66695984 TCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCCTAACATACACATACCAGATTTTTA 66696043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||
      900 TCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCTTAACATACACGTACCAGATTTTTA 959

 66696044 TTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCAT 66696103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCAT 1019

 66696104 GCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTT 66696163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTT 1079

 66696164 CTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAAT 66696223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAAT 1139

 66696224 ATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGA 66696283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGA 1199

 66696284 AGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAG 66696343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAG 1259

 66696344 TTCACAGCTGTTATCCTGGGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCT 66696403
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1260 TTCACAGCTGTTATCCTGAGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCC 1319

 66696404 GTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGA 66696463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGA 1379

 66696464 AACTGGCATGTAAAAAGTACAACTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTC 66696523
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AACTGGCATGTAAAAAGTACAATTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTC 1439

 66696524 TCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGT 66696583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGT 1499

 66696584 TGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATT 66696643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATT 1559

 66696644 CCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTT 66696703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTT 1619

 66696704 TTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACC 66696763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACC 1679

 66696764 TTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAATGAATA 66696823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1680 TTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAACGAATA 1739

 66696824 TATCCTCTCTTCTATTTTTTTTTTCTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTT 66696883
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TATCCTCTCTTCTATTTTTTTTT-CTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTT 1798

 66696884 TAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGTCAGGTG 66696943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1799 TAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGCCAGGTG 1858

 66696944 CAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAG 66697003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAG 1918

 66697004 GTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 66697063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 1978

 66697064 AAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGC 66697123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGC 2038

 66697124 AGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCA 66697183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCA 2098

 66697184 CTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTT 66697243
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTCCAGCCTGGGTGACAGAGTTTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTT 2158

 66697244 TATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGGTTATATGCTT 66697303
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2159 TATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGTTTATATGCTT 2218

 66697304 GTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTC 66697363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTC 2278

 66697364 AAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGA 66697423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2279 AAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACTTGTAATCCCAGCTACTCGGGA 2338

 66697424 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTG 66697483
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGGGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTG 2398

 66697484 CG 66697485
          ||
     2399 CG 2400

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT---------AAAAAAA 66699342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||
     2401 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 2460

 66699343 AAAAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCG 66699402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCG 2520

 66699403 TGTACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGAC 66699462
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGAC 2580

 66699463 AGGAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTG 66699522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTG 2640

 66699523 TGAGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCC 66699582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGAGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCC 2700

 66699583 TGAGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGAC 66699641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2701 TGAGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGAC 2760

 66699642 TTTGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAAC 66699701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAAC 2820

 66699702 TGAAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTT 66699761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGAAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTT 2880

 66699762 TAGTGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCC 66699821
          ||||||   |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAGTGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCC 2937

 66699822 AGCAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGT 66699881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AGCAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGT 2997

 66699882 GTGTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTATG 66699940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2998 GTGTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATG 3057

 66699941 GTAAAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCT 66700000
          ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GT---AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCT 3114

 66700001 TAGAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTAT 66700060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TAGAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTAT 3174

 66700061 GAACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGG 66700120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 GAACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGG 3234

 66700121 AAGAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGA 66700180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||
     3235 AAGAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGA 3294

 66700181 CTCCTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGC 66700240
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 CTCCTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGC 3354

 66700241 CTTGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGT 66700300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 CTTGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGT 3414

 66700301 ATGTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGA 66700360
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3415 ATGTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGA 3474

 66700361 TTTTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCAC 66700420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 TTTTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCAC 3534

 66700421 CCCAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCC 66700480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 CCCAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCC 3594

 66700481 CTTTTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAA 66700540
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CTTCTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAA 3654

 66700541 CGGGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCT 66700600
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3655 CGGGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCT 3714

 66700601 GGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACT 66700634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 GGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACT 3748

Alignment time is 2.9455 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4133] =>      4133 nucs 'mol-32-23a4-071294_4133'

Score:        3679
Aligned:      4151        nucs
Identic:      4086 ( 98%) nucs =>      2896 ( 99%)      1190 ( 98%)
Gaps:           41 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66699294,66702215] EXCISED REGION [66702260,66703465]
 second seq =>  [       1,    2933] EXCISED REGION [    2934,    4133]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        44 nucs [66702216,66702259]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [66702216,66702220] to [66702260,66702264]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66699294 ACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 66699353
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGCACTCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 60

 66699354 -------GGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGTA 66699406
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
       61 AAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGCA 120

 66699407 CATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGGA 66699466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGGA 180

 66699467 AGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGAG 66699526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGAG 240

 66699527 AAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGAG 66699586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGAG 300

 66699587 CTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTT-AGACTTTG 66699645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
      301 CTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTTTG 360

 66699646 GGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGAA 66699705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGAA 420

 66699706 ATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAGT 66699765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAGT 480

 66699766 GCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGCA 66699825
          ||||   |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAG---CTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGCA 537

 66699826 GTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTGT 66699885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 GTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTGT 597

 66699886 GTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACT-GTAGGTATGGTAA 66699944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
      598 GTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGTAA 657

 66699945 AAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAGA 66700004
          ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AAAAAAAAAA---TTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAGA 714

 66700005 ACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAAC 66700064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 ACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAAC 774

 66700065 CAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAGA 66700124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 CAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAGA 834

 66700125 AGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACTCC 66700184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
      835 AGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACTCC 894

 66700185 TCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTTG 66700244
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 TCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTTG 954

 66700245 TACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATGT 66700304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 TACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATGT 1014

 66700305 AACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTTT 66700364
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 AACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTTT 1074

 66700365 TGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCCA 66700424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 TGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCCA 1134

 66700425 GGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTTT 66700484
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1135 GGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTTC 1194

 66700485 TATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGGG 66700544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 TATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGGG 1254

 66700545 TGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGGT 66700604
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1255 TGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGGT 1314

 66700605 GCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAAGG 66700664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1315 GCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAAGG 1374

 66700665 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACAA 66700724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACAA 1434

 66700725 AAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG 66700784
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 AAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG 1494

 66700785 GCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACTG 66700844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 GCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACTG 1554

 66700845 CACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAG---AAA 66700901
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||
     1555 CACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAAAAA 1613

 66700902 AAGA-----GGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGATGGCATATGTT 66700956
          ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1614 AAGAAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGACGGCATATGTT 1673

 66700957 GTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAACT 66701016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 GTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAACT 1733

 66701017 GCAGGGACCATTATAGTGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAAC 66701076
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GCAGGGACCATTATAGGGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAAC 1793

 66701077 TGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGGA 66701136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGGA 1853

 66701137 AGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGCG 66701196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGCG 1913

 66701197 TCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATTC 66701256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATTC 1973

 66701257 AGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGAG 66701316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 AGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGAG 2033

 66701317 AGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGAG 66701376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 AGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGAG 2093

 66701377 GAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGGAGAATCG 66701436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2094 GAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGCAGAATCG 2153

 66701437 ATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTCGAGG 66701496
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2154 ATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTTGAGG 2213

 66701497 CTCAGTGCCTGGGAATGACAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACAG 66701556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 CTCAGTGCCTGGGAATGATAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACAG 2273

 66701557 TCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGTT 66701616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 TCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGTT 2333

 66701617 CACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTAA 66701676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 CACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTAA 2393

 66701677 TTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAGC 66701736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAGC 2453

 66701737 TAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAGG 66701796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAGG 2513

 66701797 AACCTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTT-GTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTCA 66701855
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AACCTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTCA 2573

 66701856 TTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACTG 66701915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 TTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACTG 2633

 66701916 AGGCTAGAGTGCAGTGGCACTGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 66701975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 AGGCTAGAGTGCAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 2693

 66701976 GATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTGG 66702035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTGG 2753

 66702036 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTTGAA 66702095
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTTGAA 2813

 66702096 CGCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGCGCTGGGATGACAGGCGTG 66702155
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2814 CGCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTG 2873

 66702156 AGCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGGCGT 66702215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 AGCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGGCGT 2933

EXCISED REGION

 66702260 GGTGGATCACGAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC 66702319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 GGTGGATCACGAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC 2993

 66702320 TACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGCTGGCA--GGAGCCAGTAGTCCCAGCTAC 66702377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     2994 TACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGCTGG--TGGGAGCCAGTAGTCCCAGCTAC 3051

 66702378 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACGCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGA 66702437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACGCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGA 3111

 66702438 GATCAGGCCACTACACTCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 66702497
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||
     3112 GATCAGGCCACTACACTCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAGACTCTGTCTC-----AAAAAA 3166

 66702498 AAAAAAAAGACAGTGGCATGACAAGTACTTGTCTGTTTATGAGTCAGGTATCAGCATATT 66702557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 AAAAAAAAGACAGTGGCATGACAAGTACTTGTCTGTTTATGAGTCAGGTATCAGCATATT 3226

 66702558 AGTTAATACATTTACAGAAATGAATGCCAAAC-AATAGCTTTGAATTAAAAGCCTTCACA 66702616
          |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||
     3227 AGTTAATACATTTACAGAAATGAATGCCAAACAAAT-GCTTTG-ATTAAAAGCCTTCACA 3284

 66702617 GTTCAATTAGTATTTCCTTCTG--AGCCTCTTCAACTTTCTTTCTGTTTTCTTCATTCCA 66702674
          ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 GTTCAATTAGTATTTCCTTC--CAAGCCTCTTCAACTTTCTTTCTGTTTTCTTCATTCCA 3342

 66702675 GGTCATTATTCCACCGTGACTTTTGAGAAGCAATTTTCTTAAGAGAGTACAAATTGGATT 66702734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 GGTCATTATTCCACCGTGACTTTTGAGAAGCAATTTTCTTAAGAGAGTACAAATTGGATT 3402

 66702735 ATCCCCTCTTACTGAATTGAAATTTTTCAGGCTTTCCACTAATGAGATATTGTATCCACG 66702794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 ATCCCCTCTTACTGAATTGAAATTTTTCAGGCTTTCCACTAATGAGATATTGTATCCACG 3462

 66702795 TTAGGCCAGAAAAGCTAGTTTGAGTCATTTAGTTAGCATGTTTGAATTAGAAGTTATTGA 66702854
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 TTAAGCCAGAAAAGCTAGTTTGAGTCATTTAGTTAGCATGTTTGAATTAGAAGTTATTGA 3522

 66702855 TGAAACCTTCACTAATAACTCAAGCCAAGTTGAGTCTAAAAAGGATTCCACGAGGTGCTG 66702914
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TGAAACCTTCATTAATAACTCAAGCCAAGTTGAGTCTAAAAAGGATTCCACGAGGTGCTG 3582

 66702915 TTAACACAGCCTTGAAAATTTGTAACCGATCAAAAGCAGCAACAGCAGGAATTAGAATGA 66702974
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3583 TTAACACAGCCTTGAAAATTTGTAACCGATCAAAAGCGGCAACAGCAGGAATTAGAATGA 3642

 66702975 GTTTGAATTAGTCACATGGTAACATGGAAACATTTAACCCTGTGTCAGCGGGACTGCTTG 66703034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 GTTTGAATTAGTCACATGGTAACATGGAAACATTTAACCCTGTGTCAGCGGGACTGCTTG 3702

 66703035 AGATAAACTTGACTTGTCTTCCGGGCCCAGCAAAACTGCAGGCCCAAGGGAAAGGAAGCT 66703094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 AGATAAACTTGACTTGTCTTCCGGGCCCAGCAAAACTGCAGGCCCAAGGGAAAGGAAGCT 3762

 66703095 CTCCTGTGATTGTAGCGCATCTTGGTTTGATAGGAAGTCATGTCTGGAACATGGAAGAGG 66703154
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 CTCCTGTGATTGTAGCGCATCTTGCTTTGATAGGAAGTCATGTCTGGAACATGGAAGAGG 3822

 66703155 TTTTTTTGTGTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCTTGACGTGATAGGGAGAAAAGATCAGACT 66703214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 TTTTTTTGTGTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCTTGACGTGATAGGGAGAAAAGATCAGACT 3882

 66703215 TGTTCATGATTTTAAAAACATTCATTTTTTTTTTCTAGGGATGTTTTTACTTCTGACTTG 66703274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 TGTTCATGATTTTAAAAACATTCATTTTTTTTTTCTAGGGATGTTTTTACTTCTGACTTG 3942

 66703275 ACACATTTTTTTCTTTCCAGTTTAAAATTGGTGGTGAATGGTGGACATGGATCGATTATA 66703334
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3943 ACACATTTTTTTCTTTCCAGTTTAAAATTGGTGGTGAATGGTGGACATGGATCAATTATA 4002

 66703335 ACCGCTTCCAGGAGCTCATCCAGGAATATGAAGATAGTGGTGGATCAAAAACGTTCAGCG 66703394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 ACCGCTTCCAGGAGCTCATCCAGGAATATGAAGATAGTGGTGGATCAAAAACGTTCAGCG 4062

 66703395 CAAAGGATTATATGGCCAGAACTCCTCACTGGGCATTATTTGGTGCCAGTGAAAGAGGCT 66703454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 CAAAGGATTATATGGCCAGAACTCCTCACTGGGCATTATTTGGTGCCAGTGAAAGAGGCT 4122

 66703455 TTGATCCCAAG 66703465
          |||||||||||
     4123 TTGATCCCAAG 4133

Alignment time is 3.28862 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7083] =>      7083 nucs 'mol-32-2f07-011242_7083'

Score:        6547
Aligned:      7068        nucs
Identic:      7010 ( 99%) nucs =>       269 ( 98%)      6741 ( 99%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66690453,66690724] EXCISED REGION [66690725,66697505]
 second seq =>  [       1,     272] EXCISED REGION [     284,    7071]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [273,283]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [273,273] to [284,284]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [273,273] to [283,283]

 66690453 CCTCCTTTTTGGAGATAATAAAACTTGTAGTCTGTGAAGGGAGGGGAAGAAGAGCTATCA 66690512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCCTTTTTGGAGATAATAAAACTTGTAGTCTGTGAAGGGAGGGGAAGAAGAGCTATCA 60

 66690513 CCACCCCCACACCCTCCCATCTTGGAATAAGAAGGGACTTGTGTATCTCCATTTAGGTTT 66690572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACCCCCACACCCTCCCATCTTGGAATAAGAAGGGACTTGTGTATCTCCATTTAGGTTT 120

 66690573 TGCCAGTGTTCTCTTAGCAAAACCTAGTGACTGTGGTACATGTGGAACTCACCCTCATCA 66690632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCAGTGTTCTCTTAGCAAAACCTAGTGACTGTGGTACATGTGGAACTCACCCTCATCA 180

 66690633 GAGGCCTGATTGCTCCCAGCAGCAGTTGCTTTTAGAGAAATATCA---GAGGAAATTGGC 66690689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||
      181 GAGGCCTGATTGCTCCCAGCAGCAGTTGCTTTTAGAGAAATA---GCGGAGGAAATTGGC 237

 66690690 ATTTTGGTAACACTGCTCAGAGGATTTAGCTCCAC 66690724
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 ATTTTGGTAACACTGCTCAGAGGATTTAGCTCCAC 272

EXCISED REGION

 66690725 TGGAGATTAAGGTTGAAACTTCAGAAAATGAGTTTCCAGATAAACTTTTAGAGTTGCACT 66690784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      284 TGGAGATTAAGGTTGAAACTTCAGAAAATGAGTTTCCAGATAAACTTTTAGAATTGCACT 343

 66690785 TGGCTATGTCAAGAATGTAATCTTATGGTTATAGTTTTGTCTGTGAAAATGGTTCCACGG 66690844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      344 TGGCTATGTCAAGAATGTAATCTTATGGTTATAGTTTTGTCTGTGAAAATGGTTCCACGG 403

 66690845 GCAACTGTTACCATGTGAATCCTACTTATTACCAGTAAACTCAGAAGAAGGTGGCAACAG 66690904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      404 GCAACTGTTACCATGTGAATCCTACTTATTACCAGTAAACTCAGAAGAAGGTGGCAACAG 463

 66690905 CTCTCAGCATTCCACTATTGCAGGCAATCACAAGTCTGCCCTTGTGATCTCTGCCTCTTC 66690964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      464 CTCTCAGCATTCCACTATTGCAGGCAATCACAAGTCTGCCCTTGTGATCTCTGCCTCTTC 523

 66690965 TTACCCAAAGAAGAAACTACACAGTTGTAGCTACAACCAGCAAGAACAAATTTTGGTAAA 66691024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      524 TTACCCAAAGAAGAAACTACACAGTTGTAGCTACAACCGGCAAGAACAAATTTTGGTAAA 583

 66691025 TCTGGGAAGTTCACAAGATACCACTGTAATGAAACCACCATTGCAAAATTATGACTGAGA 66691084
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 TCTGGGAAGTTCAAAAGATACCACTGTAATGAAACCACCATTGCAAAATTATGACTGAGA 643

 66691085 CAATGAAAGAGATCTCACCTAACCGACTGCATCTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTC 66691144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 CAATGAAAGAGATCTCACCTAACCGACTGCATCTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTC 703

 66691145 TTCATTCTTGGGTATAGACTGAACTAACTTTGGGAGGAATTTAGTTTATAGTTTATAATT 66691204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 TTCATTCTTGGGTATAGACTGAACTAACTTTGGGAGGAATTTAGTTTATAGTTTATAATT 763

 66691205 TAAAACAAAGATGATAATAGCCCTTCCCTAAAACAAACCTCCTTCTTGCTAGGGACCCGA 66691264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 TAAAACAAAGATGATAATAGCCCTTCCCTAAAACAAACCTCCTTCTTGCTAGGGACCCGA 823

 66691265 TGGCCTTTGTAGGACTAAGAAATTAGCCAAACGATTAGAAATTAGTGTTTAGGAGTCATG 66691324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 TGGCCTTTGTAGGACTAAGAAATTAGCCAAACGATTAGAAATTAGTGTTTAGGAGTCATG 883

 66691325 CAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCCCCTAGGATGAGTGCTTGAGA 66691384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 CAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCCCCTAGGATGAGTGCTTGAGA 943

 66691385 AATTTTGCAGACCTTGCACTTGATGGATCAGCTGGCACCACCCAGCTCGATAAACTGGCT 66691444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 AATTTTGCAGACCTTGCACTTGATGGATCAGCTGGCACCACCCAGCTCGATAAACTGGCT 1003

 66691445 CATCTGATCTTGTGGCCACCACCCAGGAACTGACTCAGCTCAAGAGGACATCTTCAGTTC 66691504
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 CATCTGATCTTGTGGCCACCATCCAGGAACTGACTCAGCTCAAGAGGACATCTTCAGTTC 1063

 66691505 CCAGTGATGTCATCTCTGACCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCAACCCACC 66691564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 CCAGTGATGTCATCTCTGACCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCAACCCACC 1123

 66691565 AAGTTGTCCTTAAAAACTCTGCTGCTTGAATGTTCAGGGACACCGATTTGAGTAATCATA 66691624
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1124 AAGTTGTCCTTAAAAACTCTGCTGCCTGAATGTTCAGGGACACCTATTTGAGTAATCATA 1183

 66691625 AAACTCCAGTCTCCCGCACAGCTGGCTCTGTGTGAATTACTCTTTCTCCATTACAGTTCC 66691684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 AAACTCCAGTCTCCCGCACAGCTGGCTCTGTGTGAATTACTCTTTCTCCATTACAGTTCC 1243

 66691685 CCTGTCTTGATTAATTGGCTCTGTCTAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCACTGGGTGGTTT 66691744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 CCTGTCTTGATTAATTGGCTCTGTCTAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCACTGGGTGGTTT 1303

 66691745 CAGTAATACTCTTTTTTGTAGTCTAAAAATCACCCCTCAGTATTCCAAAATCACTTCTCC 66691804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 CAGTAATACTCTTTTTTGTAGTCTAAAAATCACCCCTCAGTATTCCAAAATCACTTCTCC 1363

 66691805 CTCAGACGACCCCTGGACTTCCTCTACTCCCACACAGTTAACATTAATTTTGAGTTGTGA 66691864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 CTCAGACGACCCCTGGACTTCCTCTACTCCCACACAGTTAACATTAATTTTGAGTTGTGA 1423

 66691865 GAAGGTCCGGTAGCCTCTCTTCTTTCATCAATACTTCCCCTGCTGTGTGGCTTGTAAGTA 66691924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 GAAGGTCCGGTAGCCTCTCTTCTTTCATCAATACTTCCCCTGCTGTGTGGCTTGTAAGTA 1483

 66691925 TGATTGTATGTTTGGAAGACCCATTTAGAAAATAATAATTGACACTAAGATCACATAAAA 66691984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 TGATTGTATGTTTGGAAGACCCATTTAGAAAATAATAATTGACACTAAGATCACATAAAA 1543

 66691985 GCCCTTGAGTGTAGAAATGAAAATAATATGAATGATTCGTTTTGCATTAGTGTTCTTTTT 66692044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1544 GCCCTTGAGTGTAGAAATGAAAATAATATGAATGATTCGTTTTGCATTAGTATTCTTTTT 1603

 66692045 TATTTTTGTTTTATTCCGTTTTGTCTATTATATATGGCCTTTGAAATGCTGATTGTGCAG 66692104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 TATTTTTGTTTTATTCCGTTTTGTCTATTATATATGGCCTTTGAAATGCTGATTGTGCAG 1663

 66692105 ATAGATGAATTTTACCCAAACAAAGGGCTGACCTTTGCCCTCAGCTTCTGGGAGGTGACC 66692164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 ATAGATGAATTTTACCCAAACAAAGGGCTGACCTTTGCCCTCAGCTTCTGGGAGGTGACC 1723

 66692165 TCCAAGCCCTTGGAATGTCCTGCCTGATAAGAGTACCTTTGTTTATTTGTAGGCCTTAGG 66692224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 TCCAAGCCCTTGGAATGTCCTGCCTGATAAGAGTACCTTTGTTTATTTGTAGGCCTTAGG 1783

 66692225 CCACACCAGATATTCTATTATTATTATTATTTTTTTGAGATGGGCGTCTCACTCTGTCGC 66692284
          ||||||||||||||||||.||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 CCACACCAGATATTCTATAATTATTATT-TTTTTTTGAGATGGGCGTCTCACTCTGTCGC 1842

 66692285 CCATGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCTGCTCACAGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAA 66692344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1843 CCATGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCTGCTCACAGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAA 1902

 66692345 TTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTACGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCC 66692404
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 GTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTACGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCC 1962

 66692405 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCA 66692464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCA 2022

 66692465 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCTGCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG 66692524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCTGCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG 2082

 66692525 TGAGCCACCAAACCCGGCCCCCACACCAGATATTCTCTGCCAACCAAATGGTTTCATATA 66692584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
     2083 TGAGCCACCAAACCCGGCCCCCACACCAGATATTCTCTGCCAACCAAATGATTTCATATG 2142

 66692585 GTTGGGGCTTTGGGCCATGCAGTTATTGGCTCAACCTCTGGAGGGGCTGGAAATTAAGGT 66692644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 GTTGGGGCTTTGGGCCATGCAGTTATTGGCTCAACCTCTGGAGGGGCTGGAAATTAAGGT 2202

 66692645 CAGACATGTAGCAGTCAACTGTGTCTAGGTGACTGAGCTGCAGTAAAATCTTTGGACACC 66692704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2203 CAGACATGTAGCAGTCAACTGTGTCTAGGTGACTGAGCCGCAGTAAAATCTTTGGACACC 2262

 66692705 AAGACTCAGGTGCATTTCCAAGGTTGGCAGCACTCTGTGCATATCATCACACATCCCTGC 66692764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 AAGACTCAGGTGCATTTCCAAGGTTGGCAGCACTCTGTGCATATCATCACACATCCCTGC 2322

 66692765 TGGGAGAAGTTAGCTCTGTCTATAACCCCTCTGCGATAGGACAACCGGAAGCTCCAGGCA 66692824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TGGGAGAAGTTAGCTCTGTCTATAACCCCTCTGCGATAGGACAACCGGAAGCTCCAGGCA 2382

 66692825 TGGAATTCTCCTAGACTCGGTCCCACGTGCCTGTTCCCTCGGTTAGCGTTAATGTGTGTC 66692884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2383 TGGAATTCTCCTAGACTCGGTCCCACGTGCCTCTTCCCTCGGTTAGCGTTAATGTGTGTC 2442

 66692885 CTTATGCTATAATAAAACATACATGAATATAACAGCTTTCAGAGAGTTCTGTGGGTCCTT 66692944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 CTTATGCTATAATAAAACATACATGAATATAACAGCTTTCAGAGAGTTCTGTGGGTCCTT 2502

 66692945 CTAGTGAACTGTTAAATCTGGAGGTGGTCTTGCGGGCCGCTGAACTTTGCACTGGTGAAT 66693004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 CTAGTGAACTGTTAAATCTGGAGGTGGTCTTGCGGGCCGCTGAACTTTGCACTGGTGAAT 2562

 66693005 GTGTTTTCTAATCCTCGTTTCACAGTTTCTCATTCTTAACTGCAATGTGGGAGTAGCTCT 66693064
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2563 GTGTTTTCTAATCCTCGTTTCACGGTTTCTCATTCTTAACTGCAATGTGGGAGTAGCTCA 2622

 66693065 GTTTTCTGGGGTGATTGTGACGGCTAAATGAAGTGAAGTATAAAAAGCATCTAGAATTGT 66693124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 GTTTTCTGGGGTGATTGTGACGGCTAAATGAAGTGAAGTATAAAAAGCATCTAGAATTGT 2682

 66693125 GCCTTGCCTATAGCAGTGTATTAGTCTTTTCTCACGCTGCTGATAAAGACATACCTGAGA 66693184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 GCCTTGCCTATAGCAGTGTATTAGTCTTTTCTCACGCTGCTGATAAAGACATACCTGAGA 2742

 66693185 TTGGGTAATTTATAAGAAAAAAGAGGTTTAATGGACTCACAGTTCACGTGGCTGGGGTGG 66693244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TTGGGTAATTTATAAGAAAAAAGAGGTTTAATGGACTCACAGTTCACGTGGCTGGGGTGG 2802

 66693245 CATCACAATCGTGGCGGAAGGTGAAAGTCACGTCTCACATGGAGGCAGACAAGAGAAGAG 66693304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 CATCACAATCGTGGCGGAAGGTGAAAGTCACGTCTCACATGGAGGCAGACAAGAGAAGAG 2862

 66693305 AACTTGTGCAGGGAAACCCCCCTTCGTAAAACCATCAGATCTTGTGAGATTTATTCACTA 66693364
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 AACTTGTGCAGGGAAACCCCCCTTCATAAAACCATCAGATCTTGTGAGATTTATTCACTA 2922

 66693365 TCTCAAGAACAGCACAGGAAAGGCCCTCCTCCATGATTCAATTACCTCCTACCTGGTCCC 66693424
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2923 TCTCAAGAACAGCACAGGAAAGGCCCTCCTCCATGATTCAATTACCTCCCACCTGGTCCC 2982

 66693425 TCCCACAACACATGGGAATTGTGGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGAAACAC 66693484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TCCCACAACACATGGGAATTGTGGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGAAACAC 3042

 66693485 AGCCAAACCATATCAAGCAGTTTCTTAATAAAGGCTTTTTCCTAAAGGTTCTGACCATTT 66693544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 AGCCAAACCATATCAAGCAGTTTCTTAATAAAGGCTTTTTCCTAAAGGTTCTGACCATTT 3102

 66693545 GCTTTTTAAATAAAGAATGGTATAGTGTTACGTGGAGGAATAGTCATACAAACCACCTCC 66693604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 GCTTTTTAAATAAAGAATGGTATAGTGTTACGTGGAGGAATAGTCATACAAACCACCTCC 3162

 66693605 AATGTTGATGCTAATAAATAGCTTGTGGGGTACTCTTTTTTCAGCTCATATATAAGATTT 66693664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 AATGTTGATGCTAATAAATAGCTTGTGGGGTACTCTTTTTTCAGCTCATATATAAGATTT 3222

 66693665 CCTTCTTATTTCAACTCTTGAATGTGTAGAACTATGAGACCTTTGTATGATTAGAACTTT 66693724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 CCTTCTTATTTCAACTCTTGAATGTGTAGAACTATGAGACCTTTGTATGATTAGAACTTT 3282

 66693725 TTTCAGTGACTCTGCAGTATTTGTAACAAAAGCTGGAACAACTTTCAGCAGAACCTGGTT 66693784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 TTTCAGTGACTCTGCAGTATTTGTAACAAAAGCTGGAACAACTTTCAGCAGAACCTGGTT 3342

 66693785 TGAGACAGTGGCTGGGGGCCAGCCGAATGATACAAGTTTTTTCTTTGTGACATTTTGAGT 66693844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 TGAGACAGTGGCTGGGGGCCAGCCGAATGATACAAGTTTTTTCTTTGTGACATTTTGAGT 3402

 66693845 TTGAGATGACTGGATTTCCCGTATAGATGAGTCTCTGGAGAAGTTACAAGGGAAACCGAT 66693904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TTGAGATGACTGGATTTCCCGTATAGATGAGTCTCTGGAGAAGTTACAAGGGAAACCGAT 3462

 66693905 GGGAAGTCAGTTCTTCATCTGCAACCTCTTGCCTGTAACTGTTAGGAACTAGTTCATGTA 66693964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 GGGAAGTCAGTTCTTCATCTGCAACCTCTTGCCTGTAACTGTTAGGAACTAGTTCATGTA 3522

 66693965 ATGGGAGGAGAATGTACTTCACTGTGCCAGTTTTATTTTTTTGGTTATTATTTTCTGAGA 66694024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 ATGGGAGGAGAATGTACTTCACTGTGCCAGTTTTATTTTTTTGGTTATTATTTTCTGAGA 3582

 66694025 AGGGATGGAAGCTTGTAAATAAAATCAAAGAAATCAAAGGCAGAGTACACTGACTTTAGA 66694084
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3583 AGGGATGGAAGCTTGTAAATAAAATCAAAGAAATCAAAGGCAGAGCACACTGACTTTAGA 3642

 66694085 GGTCTGCATAAAAAGCTTTCGGCTCCCCTCGTTTGCCTAAGGCCTCTTGTGCTGTACTTG 66694144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 GGTCTGCATAAAAAGCTTTCGGCTCCCCTCGTTTGCCTAAGGCCTCTTGTGCTGTACTTG 3702

 66694145 AGTAGAGAAATAATTAACAGATAGTAGGCTTTTCAGTGCACTCATTGTTTAGACTGAATG 66694204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 AGTAGAGAAATAATTAACAGATAGTAGGCTTTTCAGTGCACTCATTGTTTAGACTGAATG 3762

 66694205 CCAAGAGAAGTTGAAGTACCTTAAGAATTTAGAATATAGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGC 66694264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 CCAAGAGAAGTTGAAGTACCTTAAGAATTTAGAATATAGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGC 3822

 66694265 CTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGA 66694324
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||
     3823 CTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGA 3882

 66694325 GACCAGCCAGGCCAACGTAGCGAAACCCCATTTCTACTAAAATTGCAAAAATTAGCTGGG 66694384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 GACCAGCCAGGCCAACGTAGCGAAACCCCATTTCTACTAAAATTGCAAAAATTAGCTGGG 3942

 66694385 CCGTGGTGGGGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCTCTT 66694444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 -CGTGGTGGGGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCTCTT 4001

 66694445 GAACCTGGGAGGCAGAGGTTTCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGC 66694504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 GAACCTGGGAGGCAGAGGTTTCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGC 4061

 66694505 AACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTGGAATATACACTGTTTTCTGTAAG 66694564
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 AACAGAGTGAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAATTGGAATATACACTGTTTTCTGTAAG 4120

 66694565 TTTTAGATAAGTTAAACAAAGGGAGTTAACTTAGGGATATTGCACACAAATAAGGGGTAA 66694624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TTTTAGATAAGTTAAACAAAGGGAGTTAACTTAGGGATATTGCACACAAATAAGGGGTAA 4180

 66694625 AACAAAATCAAACAAAC-AAAAAAAACAATGCTCTGGCCAGGTGAGGTGGCTCACACATG 66694683
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 AACAAAATCAAACAAACAAAAAAAAACAATGCTCTGGCCAGGTGAGGTGGCTCACACATG 4240

 66694684 TATTCCCAGCATTTTAAGAGGCTGAAATGGGAGAATTGCTTGAGTCCTGGAATTCAAGAC 66694743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TATTCCCAGCATTTTAAGAGGCTGAAATGGGAGAATTGCTTGAGTCCTGGAATTCAAGAC 4300

 66694744 CATCCTGGGCTGCATAGCAAGACTGTCTCTCTACAAAACGTTAAAACATTAGCTGGATAT 66694803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 CATCCTGGGCTGCATAGCAAGACTGTCTCTCTACAAAACGTTAAAACATTAGCTGGATAT 4360

 66694804 GGTGGCATGCACTGTAGTCCCAGCTCTTCCAGAGACTGAGGAGGGAGGATCCTTGAGCCG 66694863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4361 GGTGGCATGCACTGTAGTCCCAGCTCTTCCAGAGACTGAGGAGGGAGGATCCTTGAGCTG 4420

 66694864 AAGAAGTTGAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGA 66694923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 AAGAAGTTGAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGA 4480

 66694924 GGAAGACCCTGTCTCTAAAACAAAACAAAACAAAAAGCCTCTCTTTGCAGTTTCCTTGAG 66694983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 GGAAGACCCTGTCTCTAAAACAAAACAAAACAAAAAGCCTCTCTTTGCAGTTTCCTTGAG 4540

 66694984 AAATATTTGAAAGACATGACTGTTAGTTCTGTCATTTTCCAGTTTGAAAGCTACCAGTCA 66695043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4541 AAATATTTGAAAGACATGACTGTTAGTTCTGTCATTTTCCAGTTTGAAAGCTACCAGTAA 4600

 66695044 CATGGGATCATGTAATGGCCACGGTCTCTTTAACACCCTCCAATTTGAATCTTGGCCC-T 66695102
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     4601 CATGGGATCATGTAATGGCCACGGTCTCTTTAACACCCTCCAATTTGAATCTTGGCCCTT 4660

 66695103 CTACTTCCTTAGGATATGGCCTAAGCACATCTATCACTTAGCTTTTTTTGGACTTTTGCT 66695162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 CTACTTCCTTAGGATATGGCCTAAGCACATCTATCACTTAGCTTTTTTTGGACTTTTGCT 4720

 66695163 CTCATTCAAAAGATAGGAATGTGACTACAACATGTTTATTATGTGGATTACACAAGATAC 66695222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 CTCATTCAAAAGATAGGAATGTGACTACAACATGTTTATTATGTGGATTACACAAGATAC 4780

 66695223 AGAACCAAACATAGCACCTAGTACCCAGTAGGACACTTCACAAGGATTTGTCACTACTGT 66695282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 AGAACCAAACATAGCACCTAGTACCCAGTAGGACACTTCACAAGGATTTGTCACTACTGT 4840

 66695283 TTGCCTGCCAGTCCTCTCCTTTCCTCTGCCCTACATTTTTTGGCTGAGGTTGTTGATGTG 66695342
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     4841 TTGCCTGCCAGTCCTCTCCTTTCCTCTGCCCTACATTTTTTGGCTGAGGTTGTT-ATGTG 4899

 66695343 CTTTTTCCTTTCT----TGGATACAGTCACCACTATTTTAAACCTTATTTTTAGTTTTGT 66695398
          |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 CTTTTTCCTTTCTTGGATGGATACAGTCACCACTATTTTAAACCTTATTTTTAGTTTTGT 4959

 66695399 CAAAATTCTACATGGACAGTTAAAAAGTCCAAGTTTATTAAAAAACAAAACAAAACAAAA 66695458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 CAAAATTCTACATGGACAGTTAAAAAGTCCAAGTTTATTAAAAAACAAAACAAAACAAAA 5019

 66695459 AAGCAGCAGTTCCTTGTACCCTCCTCAAACACAAACACACCTCCATTTCCCCCTCTCAAG 66695518
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5020 AAACAGCAGTTCCTTGTACCCTCCTCAAACACAAACACACCTCCATATCCCCCTCTCAAG 5079

 66695519 CAACAACCACTTTCAGATTTTCTAGGTGATTCATTTGGTATTTATCTCCGTATCTCTAAA 66695578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 CAACAACCACTTTCAGATTTTCTAGGTGATTCATTTGGTATTTATCTCCGTATCTCTAAA 5139

 66695579 TAGCATACTTATATTGCTGCTCGCCCCTGCACCCCCAACCCACCATTTTGCTTATTATCT 66695638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 TAGCATACTTATATTGCTGCTCGCCCCTGCACCCCCAACCCACCATTTTGCTTATTATCT 5199

 66695639 C------TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCGGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGT 66695692
          |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCGGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGT 5259

 66695693 GCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCGGGTTCAACCAATTCTCCTG 66695752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 GCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCGGGTTCAACCAATTCTCCTG 5319

 66695753 CTTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTGCCAGTTTTTGTATTTTTAGTAGA 66695812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 CTTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTGCCAGTTTTTGTATTTTTAGTAGA 5379

 66695813 GGCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACC 66695872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 GGCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACC 5439

 66695873 CACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTAT 66695932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 CACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTAT 5499

 66695933 TATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGA 66695992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 TATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGA 5559

 66695993 ACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCCTAACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGA 66696052
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 ACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCTTAACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGA 5619

 66696053 TTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCC 66696112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 TTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCC 5679

 66696113 TGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTA 66696172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 TGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTA 5739

 66696173 GATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCT 66696232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 GATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCT 5799

 66696233 CGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGC 66696292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 CGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGC 5859

 66696293 AGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCT 66696352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 AGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCT 5919

 66696353 GTTATCCTGGGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCTGTGTTTCCT 66696412
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5920 GTTATCCTGAGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCCGTGTTTCCT 5979

 66696413 AAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCAT 66696472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 AAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCAT 6039

 66696473 GTAAAAAGTACAACTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGC 66696532
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 GTAAAAAGTACAATTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGC 6099

 66696533 ATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGC 66696592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 ATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGC 6159

 66696593 TGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCT 66696652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 TGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCT 6219

 66696653 CTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTT 66696712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 CTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTT 6279

 66696713 CGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTG 66696772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 CGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTG 6339

 66696773 GAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAATGAATATATCCTCTC 66696832
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6340 GAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAACGAATATATCCTCTC 6399

 66696833 TTCTATTTTTTTTTTCTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGG 66696892
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 TTCTA-TTTTTTTTTCTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGG 6458

 66696893 TCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGTCAGGTGCAGTAGCTC 66696952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6459 TCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGCCAGGTGCAGTAGCTC 6518

 66696953 ACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGT 66697012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6519 ACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGT 6578

 66697013 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAG 66697072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6579 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAG 6638

 66697073 CCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 66697132
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6639 CCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGCCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 6698

 66697133 TCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCT 66697192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6699 TCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCT 6758

 66697193 GGGTGACAGAGTGTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCT 66697252
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6759 GGGTGACAGAGTTTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCT 6818

 66697253 ATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGGTTATATGCTTGTATTTGAG 66697312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6819 ATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGTTTATATGCTTGTATTTGAG 6878

 66697313 AATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATAC 66697372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6879 AATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATAC 6938

 66697373 AAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC 66697432
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6939 AAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC 6998

 66697433 AGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCGCCACTGC 66697492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6999 AGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCGCCACTGC 7058

 66697493 ACTCCAGCCTGGG 66697505
          |||||||||||||
     7059 ACTCCAGCCTGGG 7071

Alignment time is 5.44367 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4034] =>      4034 nucs 'mol-32-2f1d-113541_4034'

Score:        3542
Aligned:      4094        nucs
Identic:      3989 ( 97%) nucs =>       110 ( 99%)      3879 ( 97%)
Gaps:           81 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66697375,66697485] EXCISED REGION [66699292,66703253]
 second seq =>  [       1,     111] EXCISED REGION [     112,    4034]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66697375 AAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG 66697434
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG 60

 66697435 GAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 66697485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 111

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT-------AAAAAAAAA 66699344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||
      112 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 171

 66699345 AAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTG 66699404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 AAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTG 231

 66699405 TACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAG 66699464
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 CACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAG 291

 66699465 GAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTG 66699524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 GAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTG 351

 66699525 AGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTG 66699584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 AGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTG 411

 66699585 AGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGACTT 66699643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      412 AGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTT 471

 66699644 TGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTG 66699703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 TGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTG 531

 66699704 AAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTA 66699763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 AAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTA 591

 66699764 GTGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAG 66699823
          ||||   |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 GTGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAG 648

 66699824 CAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGT 66699883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 CAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGT 708

 66699884 GTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTATGGT 66699942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      709 GTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGT 768

 66699943 AAAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTA 66700002
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 ---AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTA 825

 66700003 GAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGA 66700062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 GAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGA 885

 66700063 ACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAA 66700122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 ACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAA 945

 66700123 GAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACT 66700182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||
      946 GAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACT 1005

 66700183 CCTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCT 66700242
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 CCTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCT 1065

 66700243 TGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTAT 66700302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 TGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTAT 1125

 66700303 GTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATT 66700362
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 GTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATT 1185

 66700363 TTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCC 66700422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 TTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCC 1245

 66700423 CAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCT 66700482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 CAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCT 1305

 66700483 TTTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACG 66700542
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 TCTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACG 1365

 66700543 GGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGG 66700602
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1366 GGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGG 1425

 66700603 GTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAA 66700662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1426 GTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAA 1485

 66700663 GGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATAC 66700722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 GGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATAC 1545

 66700723 AAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 66700782
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 AAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 1605

 66700783 AGGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCAC 66700842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 AGGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCAC 1665

 66700843 TGCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGA--- 66700899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|   
     1666 TGCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1725

 66700900 ---AAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGATGGCATATGTT 66700956
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1726 AAGAAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGACGGCATATGTT 1785

 66700957 GTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAACT 66701016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAACT 1845

 66701017 GCAGGGACCATTATAGTGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAAC 66701076
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 GCAGGGACCATTATAGGGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAAC 1905

 66701077 TGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGGA 66701136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGGA 1965

 66701137 AGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGCG 66701196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 AGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGCG 2025

 66701197 TCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATTC 66701256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATTC 2085

 66701257 AGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGAG 66701316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGAG 2145

 66701317 AGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGAG 66701376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 AGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGAG 2205

 66701377 GAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGGAGAATCG 66701436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2206 GAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGCAGAATCG 2265

 66701437 ATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTCGAGG 66701496
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2266 ATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTTGAGG 2325

 66701497 CTCAGTGCCTGGGAATGACAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACAG 66701556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 CTCAGTGCCTGGGAATGATAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACAG 2385

 66701557 TCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGTT 66701616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGTT 2445

 66701617 CACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTAA 66701676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 CACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTAA 2505

 66701677 TTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAGC 66701736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 TTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAGC 2565

 66701737 TAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAGG 66701796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAGG 2625

 66701797 AACCTATGTATTTTCTTTC-TTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTCA 66701855
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 AACCTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTCA 2685

 66701856 TTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACTG 66701915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACTG 2745

 66701916 AGGCTAGAGTGCAGTGGCACTGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 66701975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 AGGCTAGAGTGCAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 2805

 66701976 GATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTGG 66702035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 GATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTGG 2865

 66702036 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTTGAA 66702095
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTTGAA 2925

 66702096 CGCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGCGCTGGGATGACAGGCGTG 66702155
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2926 CGCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTG 2985

 66702156 AGCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGGCGT 66702215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 AGCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGGCGT 3045

 66702216 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCCGGTGGATCACGAGGTT 66702275
                                                      ||||||||||||||||
     3046 --------------------------------------------GGTGGATCACGAGGTT 3061

 66702276 AGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 66702335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 AGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 3121

 66702336 AATTAGCCAGGTGTGCTGGCA--GGAGCCAGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 66702393
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 AATTAGCCAGGTGTGCTGG--TGGGAGCCAGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 3179

 66702394 GGAGAATGGCATGAACGCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCAGGCCACTACAC 66702453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GGAGAATGGCATGAACGCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCAGGCCACTACAC 3239

 66702454 TCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGTGG 66702513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||
     3240 TCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAGACTCTGTCTC----AAAAAAAAAAAAAAAGACAGTGG 3295

 66702514 CATGACAAGTACTTGTCTGTTTATGAGTCAGGTATCAGCATATTAGTTAATACATTTACA 66702573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 CATGACAAGTACTTGTCTGTTTATGAGTCAGGTATCAGCATATTAGTTAATACATTTACA 3355

 66702574 GAAATGAATGCCAAAC-AATAGCTTTGAATTAAAAGCCTTCACAGTTCAATTAGTATTTC 66702632
          |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 GAAATGAATGCCAAACAAAT-GCTTTG-ATTAAAAGCCTTCACAGTTCAATTAGTATTTC 3413

 66702633 CTTCTG--AGCCTCTTCAACTTTCTTTCTGTTTTCTTCATTCCAGGTCATTATTCCACCG 66702690
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CTTC--CAAGCCTCTTCAACTTTCTTTCTGTTTTCTTCATTCCAGGTCATTATTCCACCG 3471

 66702691 TGACTTTTGAGAAGCAATTTTCTTAAGAGAGTACAAATTGGATTATCCCCTCTTACTGAA 66702750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 TGACTTTTGAGAAGCAATTTTCTTAAGAGAGTACAAATTGGATTATCCCCTCTTACTGAA 3531

 66702751 TTGAAATTTTTCAGGCTTTCCACTAATGAGATATTGTATCCACGTTAGGCCAGAAAAGCT 66702810
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3532 TTGAAATTTTTCAGGCTTTCCACTAATGAGATATTGTATCCACGTTAAGCCAGAAAAGCT 3591

 66702811 AGTTTGAGTCATTTAGTTAGCATGTTTGAATTAGAAGTTATTGATGAAACCTTCACTAAT 66702870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3592 AGTTTGAGTCATTTAGTTAGCATGTTTGAATTAGAAGTTATTGATGAAACCTTCATTAAT 3651

 66702871 AACTCAAGCCAAGTTGAGTCTAAAAAGGATTCCACGAGGTGCTGTTAACACAGCCTTGAA 66702930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 AACTCAAGCCAAGTTGAGTCTAAAAAGGATTCCACGAGGTGCTGTTAACACAGCCTTGAA 3711

 66702931 AATTTGTAACCGATCAAAAGCAGCAACAGCAGGAATTAGAATGAGTTTGAATTAGTCACA 66702990
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 AATTTGTAACCGATCAAAAGCGGCAACAGCAGGAATTAGAATGAGTTTGAATTAGTCACA 3771

 66702991 TGGTAACATGGAAACATTTAACCCTGTGTCAGCGGGACTGCTTGAGATAAACTTGACTTG 66703050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 TGGTAACATGGAAACATTTAACCCTGTGTCAGCGGGACTGCTTGAGATAAACTTGACTTG 3831

 66703051 TCTTCCGGGCCCAGCAAAACTGCAGGCCCAAGGGAAAGGAAGCTCTCCTGTGATTGTAGC 66703110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 TCTTCCGGGCCCAGCAAAACTGCAGGCCCAAGGGAAAGGAAGCTCTCCTGTGATTGTAGC 3891

 66703111 GCATCTTGGTTTGATAGGAAGTCATGTCTGGAACATGGAAGAGGTTTTTTTGTGTTTGTT 66703170
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 GCATCTTGCTTTGATAGGAAGTCATGTCTGGAACATGGAAGAGGTTTTTTTGTGTTTGTT 3951

 66703171 TTTGTTTTTGTTTTCTTGACGTGATAGGGAGAAAAGATCAGACTTGTTCATGATTTTAAA 66703230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 TTTGTTTTTGTTTTCTTGACGTGATAGGGAGAAAAGATCAGACTTGTTCATGATTTTAAA 4011

 66703231 AACATTCATTTTTTTTTTCTAGG 66703253
          |||||||||||||||||||||||
     4012 AACATTCATTTTTTTTTTCTAGG 4034

Alignment time is 3.38833 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3398] =>      3398 nucs 'mol-32-2fc2-070201_3398'

Score:        3011
Aligned:      3405        nucs
Identic:      3352 ( 98%) nucs =>      1126 ( 99%)      2226 ( 98%)
Gaps:           29 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66696351,66697485] EXCISED REGION [66699292,66701539]
 second seq =>  [       1,    1134] EXCISED REGION [    1135,    3398]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66696351 CTGTTATCCTGGGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCTGTGTTTC 66696410
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
        1 CTGTTATCCTGAGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCCGTGTTTC 60

 66696411 CTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGC 66696470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGC 120

 66696471 ATGTAAAAAGTACAACTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTAC 66696530
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTAAAAAGTACAATTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTAC 180

 66696531 GCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCT 66696590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCT 240

 66696591 GCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATC 66696650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATC 300

 66696651 CTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAAT 66696710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAAT 360

 66696711 TTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATG 66696770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATG 420

 66696771 TGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAATGAATATATCCTC 66696830
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      421 TGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAACGAATATATCCTC 480

 66696831 TCTTCTATTTTTTTTTTCTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTG 66696890
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTCTATTTTTTTTT-CTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTG 539

 66696891 GGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGTCAGGTGCAGTAGC 66696950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      540 GGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGCCAGGTGCAGTAGC 599

 66696951 TCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGA 66697010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGA 659

 66697011 GTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATT 66697070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATT 719

 66697071 AGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 66697130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 779

 66697131 TCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGC 66697190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGC 839

 66697191 CTGGGTGACAGAGTGTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCT 66697250
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTGGGTGACAGAGTTTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCT 899

 66697251 CTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGGTTATATGCTTGTATTTG 66697310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      900 CTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGTTTATATGCTTGTATTTG 959

 66697311 AGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAAT 66697370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAAT 1019

 66697371 ACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG 66697430
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG 1079

 66697431 GCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 66697485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 1134

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT-----------AAAAA 66699340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||
     1135 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 1194

 66699341 AAAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTC 66699400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 AAAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTC 1254

 66699401 CGTGTACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAG 66699460
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 CGTGCACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAG 1314

 66699461 ACAGGAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAAC 66699520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 ACAGGAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAAC 1374

 66699521 TGTGAGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAG 66699580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TGTGAGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAG 1434

 66699581 CCTGAGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAG 66699639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     1435 CCTGAGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAG 1494

 66699640 ACTTTGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCA 66699699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 ACTTTGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCA 1554

 66699700 ACTGAAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCT 66699759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 ACTGAAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCT 1614

 66699760 TTTAGTGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAG 66699819
          ||||||||   |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 TTTAGTGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAG 1671

 66699820 CCAGCAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTT 66699879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CCAGCAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTT 1731

 66699880 GTGTGTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTA 66699938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     1732 GTGTGTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTA 1791

 66699939 TGGTAAAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCT 66699998
          ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TGGT---AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCT 1848

 66699999 CTTAGAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATT 66700058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 CTTAGAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATT 1908

 66700059 ATGAACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAG 66700118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 ATGAACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAG 1968

 66700119 GGAAGAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGA 66700178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|
     1969 GGAAGAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAA 2028

 66700179 GACTCCTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGT 66700238
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 GACTCCTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGT 2088

 66700239 GCCTTGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAAT 66700298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 GCCTTGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAAT 2148

 66700299 GTATGTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCAT 66700358
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2149 GTATGTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCAT 2208

 66700359 GATTTTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTC 66700418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 GATTTTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTC 2268

 66700419 ACCCCAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGT 66700478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 ACCCCAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGT 2328

 66700479 CCCTTTTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAG 66700538
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 CCCTTCTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAG 2388

 66700539 AACGGGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGG 66700598
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2389 AACGGGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGG 2448

 66700599 CTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATC 66700658
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2449 CTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATC 2508

 66700659 ACAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAA 66700718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 ACAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAA 2568

 66700719 ATACAAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAG 66700778
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2569 ATACAAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAG 2628

 66700779 GCTGAGGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCA 66700838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GCTGAGGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCA 2688

 66700839 CCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTC----AAAAAAAAAAAAAA 66700894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||
     2689 CCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2748

 66700895 AAAGA-----AAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGATGGC 66700949
          |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2749 AAAGAAAAAGAAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGACGGC 2808

 66700950 ATATGTTGTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGA 66701009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 ATATGTTGTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGA 2868

 66701010 GGAAACTGCAGGGACCATTATAGTGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCC 66701069
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 GGAAACTGCAGGGACCATTATAGGGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCC 2928

 66701070 AGGAAACTGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGA 66701129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2929 AGGAAACTGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCTAACTAACAGGA 2988

 66701130 TTTAGGAAGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGC 66701189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 TTTAGGAAGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGC 3048

 66701190 TTGGGCGTCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTT 66701249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TTGGGCGTCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTT 3108

 66701250 TACATTCAGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGA 66701309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TACATTCAGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGA 3168

 66701310 AGTTGAGAGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGG 66701369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 AGTTGAGAGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGG 3228

 66701370 CCCAGAGGAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGG 66701429
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3229 CCCAGAGGAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGC 3288

 66701430 AGAATCGATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGT 66701489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 AGAATCGATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGT 3348

 66701490 TTCGAGGCTCAGTGCCTGGGAATGACAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGA 66701539
          ||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3349 TTTGAGGCTCAGTGCCTGGGAATGATAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGA 3398

Alignment time is 2.64192 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4601] =>      4601 nucs 'mol-32-32f0-077642_4601'

Score:        4122
Aligned:      4652        nucs
Identic:      4558 ( 98%) nucs =>      1590 ( 99%)      2968 ( 97%)
Gaps:           66 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66695885,66697485] EXCISED REGION [66699292,66702327]
 second seq =>  [       1,    1600] EXCISED REGION [    1601,    4601]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66695885 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACT 66695944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACT 60

 66695945 GTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCC 66696004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCC 120

 66696005 ATTCCCCCACCCTCCTAACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCA 66696064
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTCCCCCACCCTCTTAACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCA 180

 66696065 TTATTATAACCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTAT 66696124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATTATAACCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTAT 240

 66696125 TTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTT 66696184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTT 300

 66696185 ATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCA 66696244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCA 360

 66696245 GATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACT 66696304
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATGCACTGGATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACT 420

 66696305 TACCCACCTACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGGGA 66696364
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      421 TACCCACCTACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGAGA 480

 66696365 TCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCTGTGTTTCCTAAAGTTACTCCT 66696424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      481 TCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCCGTGTTTCCTAAAGTTACTCCT 540

 66696425 TCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACA 66696484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACA 600

 66696485 ACTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGA 66696544
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGA 660

 66696545 TATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCT 66696604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCT 720

 66696605 TTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACC 66696664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACC 780

 66696665 ATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTG 66696724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTG 840

 66696725 CCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTC 66696784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTC 900

 66696785 CTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAATGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTT 66696844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAACGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTT 960

 66696845 TTTCTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTA 66696904
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TT-CTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTA 1019

 66696905 GTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGTCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATC 66696964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGCCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATC 1079

 66696965 CCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCC 66697024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCC 1139

 66697025 TGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTG 66697084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTG 1199

 66697085 GCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGG 66697144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGG 1259

 66697145 GATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGT 66697204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGT 1319

 66697205 GTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAA 66697264
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAA 1379

 66697265 GTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGGTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTA 66697324
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGTTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTA 1439

 66697325 AAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTG 66697384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTG 1499

 66697385 GGTATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACT 66697444
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GGTATGGTGGTGCACACTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACT 1559

 66697445 TGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 66697485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 1600

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT------AAAAAAAAAA 66699345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||
     1601 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 1660

 66699346 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGT 66699405
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1661 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGC 1720

 66699406 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 66699465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 1780

 66699466 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 66699525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 1840

 66699526 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 66699585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 1900

 66699586 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGACTTT 66699644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     1901 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTTT 1960

 66699645 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 66699704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 2020

 66699705 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 66699764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 2080

 66699765 TGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 66699824
          |||   |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 TGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 2137

 66699825 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 66699884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 2197

 66699885 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTATGGTA 66699943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
     2198 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGT- 2256

 66699944 AAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 66700003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 --AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 2314

 66700004 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 66700063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 2374

 66700064 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 66700123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 2434

 66700124 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACTC 66700183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
     2435 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACTC 2494

 66700184 CTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 66700243
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 CTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 2554

 66700244 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 66700303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 2614

 66700304 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 66700363
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 2674

 66700364 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 66700423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 2734

 66700424 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 66700483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 2794

 66700484 TTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 66700543
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 CTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 2854

 66700544 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 66700603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2855 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 2914

 66700604 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAAG 66700663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2915 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAAG 2974

 66700664 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 66700723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 3034

 66700724 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 66700783
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 3094

 66700784 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 66700843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 3154

 66700844 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAGA--- 66700899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   
     3155 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAA 3214

 66700900 --AAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGATGGCATATGTTG 66700957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3215 AGAAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGACGGCATATGTTG 3274

 66700958 TTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAACTG 66701017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 TTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAACTG 3334

 66701018 CAGGGACCATTATAGTGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAACT 66701077
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 CAGGGACCATTATAGGGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAACT 3394

 66701078 GACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGGAA 66701137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 GACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGGAA 3454

 66701138 GACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGCGT 66701197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 GACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGCGT 3514

 66701198 CACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATTCA 66701257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 CACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATTCA 3574

 66701258 GGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGAGA 66701317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 GGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGAGA 3634

 66701318 GAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGAGG 66701377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 GAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGAGG 3694

 66701378 AAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGGAGAATCGA 66701437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3695 AAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGCAGAATCGA 3754

 66701438 TGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTCGAGGC 66701497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3755 TGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTTGAGGC 3814

 66701498 TCAGTGCCTGGGAATGACAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACAGT 66701557
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 TCAGTGCCTGGGAATGATAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACAGT 3874

 66701558 CTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGTTC 66701617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 CTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGTTC 3934

 66701618 ACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTAAT 66701677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 ACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTAAT 3994

 66701678 TCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAGCT 66701737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 TCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAGCT 4054

 66701738 AGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAGGA 66701797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 AGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAGGA 4114

 66701798 ACCTATGTATTTTCTTTC-TTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTCAT 66701856
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 ACCTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTCAT 4174

 66701857 TTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACTGA 66701916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 TTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACTGA 4234

 66701917 GGCTAGAGTGCAGTGGCACTGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCG 66701976
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 GGCTAGAGTGCAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCG 4294

 66701977 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTGGC 66702036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTGGC 4354

 66702037 TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTTGAAC 66702096
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTTGAAC 4414

 66702097 GCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGCGCTGGGATGACAGGCGTGA 66702156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4415 GCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGA 4474

 66702157 GCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGGCGTG 66702216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4475 GCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGGCGT- 4533

 66702217 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCCGGTGGATCACGAGGTTA 66702276
                                                     |||||||||||||||||
     4534 -------------------------------------------GGTGGATCACGAGGTTA 4550

 66702277 GGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 66702327
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 GGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 4601

Alignment time is 3.5938 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3117] =>      3117 nucs 'mol-32-32fb-163128_3117'

Score:        2824
Aligned:      3114        nucs
Identic:      3077 ( 99%) nucs =>      1634 ( 99%)      1443 ( 98%)
Gaps:           19 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66695842,66697485] EXCISED REGION [66699292,66700749]
 second seq =>  [       1,    1643] EXCISED REGION [    1644,    3107]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66695842 GTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 66695901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 60

 66695902 CAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATG 66695961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATG 120

 66695962 AGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCCTA 66696021
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      121 AGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCTTA 180

 66696022 ACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGA 66696081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGA 240

 66696082 ACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACC 66696141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACC 300

 66696142 TTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCT 66696201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCT 360

 66696202 CAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCT 66696261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCT 420

 66696262 ATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGA 66696321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGA 480

 66696322 CAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGGGATCACCAGCTCTGTCTTG 66696381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      481 CAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGAGATCACCAGCTCTGTCTTG 540

 66696382 AGTGAAATGTCTCTGGGATCCTGTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACAC 66696441
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTGAAATGTCTCTGGGATCCCGTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACAC 600

 66696442 AACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACAACTTTTTGAGACCTTTA 66696501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      601 AACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACAATTTTTTGAGACCTTTA 660

 66696502 ATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTG 66696561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTG 720

 66696562 GAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGA 66696621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGA 780

 66696622 GAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGA 66696681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGA 840

 66696682 TTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCT 66696741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCT 900

 66696742 GGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATT 66696801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATT 960

 66696802 TCCAGAATTATTTCAATGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTTTTTCTCCTTTCTGTCTA 66696861
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
      961 TCCAGAATTATTTCAACGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTTTT-CTCCTTTCTGTCTA 1019

 66696862 GAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAA 66696921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAA 1079

 66696922 AAAAAATCTTTTTTGTCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGC 66696981
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAAAAATCTTTTTTGCCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGC 1139

 66696982 CTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAA 66697041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAA 1199

 66697042 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCC 66697101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCC 1259

 66697102 CAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGT 66697161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGT 1319

 66697162 GAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGTCTGCGCCCAGCCACT 66697221
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1320 GAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTTTCTGCGCCCAGCCACT 1379

 66697222 GCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCT 66697281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCT 1439

 66697282 GATGGTCATTGGTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAA 66697341
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GATGGTCATTGTTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAA 1499

 66697342 CATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACAC 66697401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACAC 1559

 66697402 CTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGA 66697461
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGA 1619

 66697462 GGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 66697485
          ||||||||||||||||||||||||
     1620 GGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 1643

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT----------AAAAAA 66699341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||
     1644 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 1703

 66699342 AAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCC 66699401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 AAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCC 1763

 66699402 GTGTACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGA 66699461
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GTGCACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGA 1823

 66699462 CAGGAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACT 66699521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 CAGGAAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACT 1883

 66699522 GTGAGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGC 66699581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 GTGAGAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGC 1943

 66699582 CTGAGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGA 66699640
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1944 CTGAGCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGA 2003

 66699641 CTTTGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAA 66699700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CTTTGGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAA 2063

 66699701 CTGAAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTT 66699760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 CTGAAATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTT 2123

 66699761 TTAGTGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGC 66699820
          |||||||   |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 TTAGTGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGC 2180

 66699821 CAGCAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTG 66699880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 CAGCAGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTG 2240

 66699881 TGTGTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTAT 66699939
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     2241 TGTGTGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTAT 2300

 66699940 GGTAAAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTC 66699999
          |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 GGT---AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTC 2357

 66700000 TTAGAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTA 66700059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 TTAGAACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTA 2417

 66700060 TGAACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGG 66700119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 TGAACCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGG 2477

 66700120 GAAGAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAG 66700179
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
     2478 GAAGAAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAG 2537

 66700180 ACTCCTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTG 66700239
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 ACTCCTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTG 2597

 66700240 CCTTGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATG 66700299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 CCTTGTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATG 2657

 66700300 TATGTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATG 66700359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2658 TATGTAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATG 2717

 66700360 ATTTTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCA 66700419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 ATTTTTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCA 2777

 66700420 CCCCAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTC 66700479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 CCCCAGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTC 2837

 66700480 CCTTTTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGA 66700539
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 CCTTCTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGA 2897

 66700540 ACGGGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGC 66700599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2898 ACGGGTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGC 2957

 66700600 TGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCA 66700659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2958 TGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCA 3017

 66700660 CAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAA 66700719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 CAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAA 3077

 66700720 TACAAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGC 66700749
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 TACAAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGC 3107

Alignment time is 2.46924 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6637] =>      6637 nucs 'mol-32-3395-035713_6637'

Score:        5962
Aligned:      6698        nucs
Identic:      6564 ( 98%) nucs =>      3373 ( 99%)      3191 ( 97%)
Gaps:          100 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66694093,66697485] EXCISED REGION [66699292,66702557]
 second seq =>  [       1,    3407] EXCISED REGION [    3408,    6637]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66694093 TAAAAAGCTTTCGGCTCCCCTCGTTTGCCTAAGGCCTCTTGTGCTGTACTTGAGTAGAGA 66694152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAAAGCTTTCGGCTCCCCTCGTTTGCCTAAGGCCTCTTGTGCTGTACTTGAGTAGAGA 60

 66694153 AATAATTAACAGATAGTAGGCTTTTCAGTGCACTCATTGTTTAGACTGAATGCCAAGAGA 66694212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAATTAACAGATAGTAGGCTTTTCAGTGCACTCATTGTTTAGACTGAATGCCAAGAGA 120

 66694213 AGTTGAAGTACCTTAAGAATTTAGAATATAGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATC 66694272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTGAAGTACCTTAAGAATTTAGAATATAGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATC 180

 66694273 CTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 66694332
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||
      181 CTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCC 240

 66694333 AGGCCAACGTAGCGAAACCCCATTTCTACTAAAATTGCAAAAATTAGCTGGGCCGTGGTG 66694392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
      241 AGGCCAACGTAGCGAAACCCCATTTCTACTAAAATTGCAAAAATTAGCTGGGC-GTGGTG 299

 66694393 GGGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCTCTTGAACCTGG 66694452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GGGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCTCTTGAACCTGG 359

 66694453 GAGGCAGAGGTTTCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGT 66694512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GAGGCAGAGGTTTCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGT 419

 66694513 GAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTGGAATATACACTGTTTTCTGTAAGTTTTAGAT 66694572
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAA-TTGGAATATACACTGTTTTCTGTAAGTTTTAGAT 478

 66694573 AAGTTAAACAAAGGGAGTTAACTTAGGGATATTGCACACAAATAAGGGGTAAAACAAAAT 66694632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AAGTTAAACAAAGGGAGTTAACTTAGGGATATTGCACACAAATAAGGGGTAAAACAAAAT 538

 66694633 CAAACAAACAAAAAAAA--CAATGCTCTGGCCAGGTGAGGTGGCTCACACATGTATTCCC 66694690
          |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CAAACAAACAAAAAAAAAACAATGCTCTGGCCAGGTGAGGTGGCTCACACATGTATTCCC 598

 66694691 AGCATTTTAAGAGGCTGAAATGGGAGAATTGCTTGAGTCCTGGAATTCAAGACCATCCTG 66694750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 AGCATTTTAAGAGGCTGAAATGGGAGAATTGCTTGAGTCCTGGAATTCAAGACCATCCTG 658

 66694751 GGCTGCATAGCAAGACTGTCTCTCTACAAAACGTTAAAACATTAGCTGGATATGGTGGCA 66694810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GGCTGCATAGCAAGACTGTCTCTCTACAAAACGTTAAAACATTAGCTGGATATGGTGGCA 718

 66694811 TGCACTGTAGTCCCAGCTCTTCCAGAGACTGAGGAGGGAGGATCCTTGAGCCGAAGAAGT 66694870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      719 TGCACTGTAGTCCCAGCTCTTCCAGAGACTGAGGAGGGAGGATCCTTGAGCTGAAGAAGT 778

 66694871 TGAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGGAAGAC 66694930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TGAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGGAAGAC 838

 66694931 CCTGTCTCTAAAACAAAACAAAACAAAAAGCCTCTCTTTGCAGTTTCCTTGAGAAATATT 66694990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CCTGTCTCTAAAACAAAACAAAACAAAAAGCCTCTCTTTGCAGTTTCCTTGAGAAATATT 898

 66694991 TGAAAGACATGACTGTTAGTTCTGTCATTTTCCAGTTTGAAAGCTACCAGTCACATGGGA 66695050
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      899 TGAAAGACATGACTGTTAGTTCTGTCATTTTCCAGTTTGAAAGCTACCAGTAACATGGGA 958

 66695051 TCATGTAATGGCCACGGTCTCTTTAACACCCTCCAATTTGAATCTTGGCCCT-CTACTTC 66695109
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
      959 TCATGTAATGGCCACGGTCTCTTTAACACCCTCCAATTTGAATCTTGGCCCTTCTACTTC 1018

 66695110 CTTAGGATATGGCCTAAGCACATCTATCACTTAGCTTTTTTTGGACTTTTGCTCTCATTC 66695169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CTTAGGATATGGCCTAAGCACATCTATCACTTAGCTTTTTTTGGACTTTTGCTCTCATTC 1078

 66695170 AAAAGATAGGAATGTGACTACAACATGTTTATTATGTGGATTACACAAGATACAGAACCA 66695229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AAAAGATAGGAATGTGACTACAACATGTTTATTATGTGGATTACACAAGATACAGAACCA 1138

 66695230 AACATAGCACCTAGTACCCAGTAGGACACTTCACAAGGATTTGTCACTACTGTTTGCCTG 66695289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AACATAGCACCTAGTACCCAGTAGGACACTTCACAAGGATTTGTCACTACTGTTTGCCTG 1198

 66695290 CCAGTCCTCTCCTTTCCTCTGCCCTACATTTTTTGGCTGAGGTTGTTGATGTGCTTTTTC 66695349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     1199 CCAGTCCTCTCCTTTCCTCTGCCCTACATTTTTTGGCTGAGGTTGTT-ATGTGCTTTTTC 1257

 66695350 CTTTCTTGGAT----ACAGTCACCACTATTTTAAACCTTATTTTTAGTTTTGTCAAAATT 66695405
          |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 CTTTCTTGGATGGATACAGTCACCACTATTTTAAACCTTATTTTTAGTTTTGTCAAAATT 1317

 66695406 CTACATGGACAGTTAAAAAGTCCAAGTTTATTAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAGCAGC 66695465
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1318 CTACATGGACAGTTAAAAAGTCCAAGTTTATTAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACAGC 1377

 66695466 AGTTCCTTGTACCCTCCTCAAACACAAACACACCTCCATTTCCCCCTCTCAAGCAACAAC 66695525
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1378 AGTTCCTTGTACCCTCCTCAAACACAAACACACCTCCATATCCCCCTCTCAAGCAACAAC 1437

 66695526 CACTTTCAGATTTTCTAGGTGATTCATTTGGTATTTATCTCCGTATCTCTAAATAGCATA 66695585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CACTTTCAGATTTTCTAGGTGATTCATTTGGTATTTATCTCCGTATCTCTAAATAGCATA 1497

 66695586 CTTATATTGCTGCTCGCCCCTGCACCCCCAACCCACCATTTTGCTTATTATCTCTTTTTT 66695645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CTTATATTGCTGCTCGCCCCTGCACCCCCAACCCACCATTTTGCTTATTATCTCTTTTTT 1557

 66695646 TTTTTTTTTTTTG------------AGGCGGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTG 66695693
          ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTTTTTTTTTTT-TTTTTTTTTTTTAGGCGGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTG 1616

 66695694 CAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCGGGTTCAACCAATTCTCCTGC 66695753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCGGGTTCAACCAATTCTCCTGC 1676

 66695754 TTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTGCCAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAG 66695813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTGCCAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAG 1736

 66695814 GCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCC 66695873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCC 1796

 66695874 ACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTATT 66695933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 ACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTATT 1856

 66695934 ATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAA 66695993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 ATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAA 1916

 66695994 CATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCCTAACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGAT 66696053
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 CATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCTTAACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGAT 1976

 66696054 TTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCCT 66696113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCCT 2036

 66696114 GCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTAG 66696173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTAG 2096

 66696174 ATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCTC 66696233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 ATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCTC 2156

 66696234 GCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCA 66696293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCA 2216

 66696294 GGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCTG 66696353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCTG 2276

 66696354 TTATCCTGGGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCTGTGTTTCCTA 66696413
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2277 TTATCCTGAGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCCGTGTTTCCTA 2336

 66696414 AAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCATG 66696473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCATG 2396

 66696474 TAAAAAGTACAACTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCA 66696533
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TAAAAAGTACAATTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCA 2456

 66696534 TTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCT 66696593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCT 2516

 66696594 GTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCTC 66696653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 GTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCTC 2576

 66696654 TGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTC 66696713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTC 2636

 66696714 GCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTGG 66696773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTGG 2696

 66696774 AAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAATGAATATATCCTCTCT 66696833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2697 AAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAATTATTTCAACGAATATATCCTCTCT 2756

 66696834 TCTATTTTTTTTTTCTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGT 66696893
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TCTATTTTTTTTT-CTCCTTTCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGT 2815

 66696894 CTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGTCAGGTGCAGTAGCTCA 66696953
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2816 CTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGCCAGGTGCAGTAGCTCA 2875

 66696954 CGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTT 66697013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTT 2935

 66697014 CAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGC 66697073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 CAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGC 2995

 66697074 CGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCT 66697133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 CGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCT 3055

 66697134 CTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTG 66697193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 CTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTG 3115

 66697194 GGTGACAGAGTGTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTA 66697253
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GGTGACAGAGTTTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTA 3175

 66697254 TCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGGTTATATGCTTGTATTTGAGA 66697313
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3176 TCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCATTGTTTATATGCTTGTATTTGAGA 3235

 66697314 ATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATACA 66697373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 ATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATACA 3295

 66697374 AAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 66697433
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 AAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 3355

 66697434 GGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 66697485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 GGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 3407

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT------AAAAAAAAAA 66699345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||
     3408 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 3467

 66699346 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGT 66699405
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3468 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGC 3527

 66699406 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 66699465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 3587

 66699466 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 66699525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 3647

 66699526 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 66699585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 3707

 66699586 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGACTTT 66699644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     3708 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTTT 3767

 66699645 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 66699704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 3827

 66699705 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 66699764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 3887

 66699765 TGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 66699824
          |||   |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 3944

 66699825 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 66699884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 4004

 66699885 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTATGGTA 66699943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
     4005 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGT- 4063

 66699944 AAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 66700003
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 ---AAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 4120

 66700004 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 66700063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 4180

 66700064 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 66700123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 4240

 66700124 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACTC 66700183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
     4241 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACTC 4300

 66700184 CTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 66700243
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 CTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 4360

 66700244 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 66700303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 4420

 66700304 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 66700363
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 4480

 66700364 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 66700423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 4540

 66700424 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 66700483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 4600

 66700484 TTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 66700543
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 CTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 4660

 66700544 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 66700603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4661 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 4720

 66700604 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAAG 66700663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4721 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAAG 4780

 66700664 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 66700723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 4840

 66700724 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 66700783
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 4900

 66700784 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 66700843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 4960

 66700844 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGA---- 66700899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|    
     4961 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 5020

 66700900 -----AAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGATGGCATATG 66700954
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5021 AAAAGAAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGACGGCATATG 5080

 66700955 TTGTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAA 66701014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 TTGTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAA 5140

 66701015 CTGCAGGGACCATTATAGTGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAA 66701074
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 CTGCAGGGACCATTATAGGGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAA 5200

 66701075 ACTGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAG 66701134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 ACTGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAG 5260

 66701135 GAAGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGG 66701194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 GAAGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGG 5320

 66701195 CGTCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACAT 66701254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 CGTCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACAT 5380

 66701255 TCAGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTG 66701314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 TCAGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTG 5440

 66701315 AGAGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAG 66701374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 AGAGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAG 5500

 66701375 AGGAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGGAGAAT 66701434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5501 AGGAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGCAGAAT 5560

 66701435 CGATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTCGA 66701494
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5561 CGATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTTGA 5620

 66701495 GGCTCAGTGCCTGGGAATGACAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGAC 66701554
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 GGCTCAGTGCCTGGGAATGATAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGAC 5680

 66701555 AGTCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAG 66701614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 AGTCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAG 5740

 66701615 TTCACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCT 66701674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 TTCACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCT 5800

 66701675 AATTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTA 66701734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 AATTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTA 5860

 66701735 GCTAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCA 66701794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 GCTAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCA 5920

 66701795 GGAACCTATGTATTTTCTTTC-TTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTT 66701853
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 GGAACCTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTT 5980

 66701854 CATTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCAC 66701913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 CATTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCAC 6040

 66701914 TGAGGCTAGAGTGCAGTGGCACTGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAA 66701973
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 TGAGGCTAGAGTGCAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAA 6100

 66701974 GCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCT 66702033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 GCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCT 6160

 66702034 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTTG 66702093
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTTG 6220

 66702094 AACGCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGCGCTGGGATGACAGGCG 66702153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6221 AACGCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGTGCTGGGATGACAGGCG 6280

 66702154 TGAGCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGGC 66702213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 TGAGCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGGC 6340

 66702214 GTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCCGGTGGATCACGAGG 66702273
          ||                                            ||||||||||||||
     6341 GT--------------------------------------------GGTGGATCACGAGG 6356

 66702274 TTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 66702333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 TTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 6416

 66702334 AAAATTAGCCAGGTGTGCTGGCA--GGAGCCAGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 66702391
          |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 AAAATTAGCCAGGTGTGCTGG--TGGGAGCCAGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 6474

 66702392 CAGGAGAATGGCATGAACGCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCAGGCCACTAC 66702451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 CAGGAGAATGGCATGAACGCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCAGGCCACTAC 6534

 66702452 ACTCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGT 66702511
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     6535 ACTCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAGACTCTGTCTC---AAAAAAAAAAAAAAAAGACAGT 6591

 66702512 GGCATGACAAGTACTTGTCTGTTTATGAGTCAGGTATCAGCATATT 66702557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 GGCATGACAAGTACTTGTCTGTTTATGAGTCAGGTATCAGCATATT 6637

Alignment time is 5.23651 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3230] =>      3230 nucs 'mol-32-3395-035713_3230'

Score:        2887
Aligned:      3243        nucs
Identic:      3191 ( 98%) nucs =>      2898 ( 98%)       293 ( 98%)
Gaps:           34 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66699292,66702215] EXCISED REGION [66702260,66702557]
 second seq =>  [       1,    2935] EXCISED REGION [    2936,    3230]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        44 nucs [66702216,66702259]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [66702216,66702220] to [66702260,66702264]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 66699351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 60

 66699352 AA------GGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGT 66699405
          ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
       61 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGC 120

 66699406 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 66699465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 180

 66699466 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 66699525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 240

 66699526 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 66699585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 300

 66699586 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTT-AGACTTT 66699644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
      301 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTTT 360

 66699645 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 66699704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 420

 66699705 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 66699764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 480

 66699765 TGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 66699824
          |||||   |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAG---CTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 537

 66699825 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 66699884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 597

 66699885 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACT-GTAGGTATGGTA 66699943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      598 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGTA 657

 66699944 AAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 66700003
          ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AAAAAAAAAA----TTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 713

 66700004 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 66700063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 773

 66700064 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 66700123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 833

 66700124 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACTC 66700183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
      834 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACTC 893

 66700184 CTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 66700243
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 CTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 953

 66700244 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 66700303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 1013

 66700304 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 66700363
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 1073

 66700364 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 66700423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 1133

 66700424 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 66700483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 1193

 66700484 TTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 66700543
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 1253

 66700544 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 66700603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1254 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 1313

 66700604 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAAG 66700663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1314 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAAG 1373

 66700664 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 66700723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 1433

 66700724 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 66700783
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 1493

 66700784 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 66700843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 1553

 66700844 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAG----- 66700898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
     1554 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAAAA 1612

 66700899 AAAAAGA-----GGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGATGGCATAT 66700953
          |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1613 AAAAAGAAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGACGGCATAT 1672

 66700954 GTTGTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAA 66701013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 GTTGTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAA 1732

 66701014 ACTGCAGGGACCATTATAGTGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGA 66701073
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 ACTGCAGGGACCATTATAGGGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGA 1792

 66701074 AACTGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTA 66701133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AACTGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTA 1852

 66701134 GGAAGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGG 66701193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 GGAAGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGG 1912

 66701194 GCGTCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACA 66701253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 GCGTCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACA 1972

 66701254 TTCAGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTT 66701313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TTCAGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTT 2032

 66701314 GAGAGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCA 66701373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GAGAGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCA 2092

 66701374 GAGGAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGGAGAA 66701433
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2093 GAGGAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGCAGAA 2152

 66701434 TCGATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTCG 66701493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2153 TCGATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTTG 2212

 66701494 AGGCTCAGTGCCTGGGAATGACAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGA 66701553
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 AGGCTCAGTGCCTGGGAATGATAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGA 2272

 66701554 CAGTCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGA 66701613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 CAGTCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGA 2332

 66701614 GTTCACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTC 66701673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 GTTCACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTC 2392

 66701674 TAATTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTT 66701733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 TAATTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTT 2452

 66701734 AGCTAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTC 66701793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 AGCTAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTC 2512

 66701794 AGGAACCTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTT-GTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGT 66701852
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     2513 AGGAACCTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGT 2572

 66701853 TCATTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCA 66701912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 TCATTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCA 2632

 66701913 CTGAGGCTAGAGTGCAGTGGCACTGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCA 66701972
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 CTGAGGCTAGAGTGCAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCA 2692

 66701973 AGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCC 66702032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 AGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCC 2752

 66702033 TGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTT 66702092
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGGCCAAGCTAGTCTT 2812

 66702093 GAACGCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGCGCTGGGATGACAGGC 66702152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2813 GAACGCCTGACCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTTTGAAAGTGCTGGGATGACAGGC 2872

 66702153 GTGAGCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGG 66702212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 GTGAGCCACCGTGCCTGGCCATTAGTCGAAGTTTTTTAAAAGACAGTGGCATGGGCCGGG 2932

 66702213 CGT 66702215
          |||
     2933 CGT 2935

EXCISED REGION

 66702260 GGTGGATCACGAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC 66702319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GGTGGATCACGAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC 2995

 66702320 TACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGCTGGCA--GGAGCCAGTAGTCCCAGCTAC 66702377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     2996 TACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGCTGG--TGGGAGCCAGTAGTCCCAGCTAC 3053

 66702378 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACGCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGA 66702437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACGCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGA 3113

 66702438 GATCAGGCCACTACACTCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 66702497
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||
     3114 GATCAGGCCACTACACTCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAGACTCTGTCTC---AAAAAAAA 3170

 66702498 AAAAAAAAGACAGTGGCATGACAAGTACTTGTCTGTTTATGAGTCAGGTATCAGCATATT 66702557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 AAAAAAAAGACAGTGGCATGACAAGTACTTGTCTGTTTATGAGTCAGGTATCAGCATATT 3230

Alignment time is 2.49769 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3130] =>      3130 nucs 'mol-32-3395-068719_3130'

Score:        2811
Aligned:      3137        nucs
Identic:      3100 ( 99%) nucs =>      1582 ( 99%)      1518 ( 98%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66695894,66697485] EXCISED REGION [66699292,66700828]
 second seq =>  [       1,    1591] EXCISED REGION [    1592,    3130]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66695894 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCAT 66695953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCAT 60

 66695954 GGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCA 66696013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAGATGAGGCTTGAGCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCA 120

 66696014 CCCTCCTAACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAA 66696073
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCTCTTAACATACACATACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAA 180

 66696074 CCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCA 66696133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACGTGAACACTGTTCATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCA 240

 66696134 GTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTA 66696193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCCACCTTTGGTTAATTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTA 300

 66696194 ACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTG 66696253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAACTCTCAAACTCTCTGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTG 360

 66696254 GATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCT 66696313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTTGCTATCAGGTTCATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCT 420

 66696314 ACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGGGATCACCAGCT 66696373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      421 ACCTTGGACAGTTCACTCTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGAGATCACCAGCT 480

 66696374 CTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCTGTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACA 66696433
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTCTTGAGTGAAATGTCTCTGGGATCCCGTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACA 540

 66696434 GGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACAACTTTTTGA 66696493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      541 GGAAACACAACTTCTAGGAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACAATTTTTTGA 600

 66696494 GACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATT 66696553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACCTTTAATGTCCAAACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATT 660

 66696554 CTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCA 66696613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGGCTGGAAACTATTCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCA 720

 66696614 GTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTC 66696673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAATTGAGAACTCAAAAGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTC 780

 66696674 TCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACG 66696733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCATTCGATTTTCTCTTTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACG 840

 66696734 GTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTC 66696793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTGTCTGGTTTTATCCATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTC 900

 66696794 TTAACATTTCCAGAATTATTTCAATGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTTTTTCTCCTT 66696853
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||| ||||||
      901 TTAACATTTCCAGAATTATTTCAACGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTTTT-CTCCTT 959

 66696854 TCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAA 66696913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TCTGTCTAGAACTACTAAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAA 1019

 66696914 TATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGTCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTT 66696973
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TATTAAAAAAAAAATCTTTTTTGCCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTT 1079

 66696974 TGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACA 66697033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TGGGAGGCCTAGGCAGGTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACA 1139

 66697034 TGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCC 66697093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCC 1199

 66697094 TGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAG 66697153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TGTAGTCCCAGCTACCCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAG 1259

 66697154 GTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGTCTGCGCC 66697213
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1260 GTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTTTCTGCGCC 1319

 66697214 CAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTG 66697273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CAGCCACTGCCCCCAGCCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTG 1379

 66697274 AGGTGGCTGATGGTCATTGGTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGC 66697333
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AGGTGGCTGATGGTCATTGTTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGC 1439

 66697334 CTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTG 66697393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTGGCCAACATGGTGCAACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTG 1499

 66697394 GTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGA 66697453
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GTGCACACTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGA 1559

 66697454 GAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 66697485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GAGGTGGAGGTTGCAATGAAGCCGAGATTGCG 1591

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT------AAAAAAAAAA 66699345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||
     1592 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 1651

 66699346 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGT 66699405
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1652 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGC 1711

 66699406 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 66699465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 1771

 66699466 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 66699525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 1831

 66699526 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 66699585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 1891

 66699586 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGACTTT 66699644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     1892 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTTT 1951

 66699645 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 66699704
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 GGAAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 2011

 66699705 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 66699764
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGGGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 2071

 66699765 TGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 66699824
          |||   |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 2128

 66699825 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 66699884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 2188

 66699885 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTATGGTA 66699943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
     2189 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGT- 2247

 66699944 AAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 66700003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 --AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 2305

 66700004 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 66700063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 2365

 66700064 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 66700123
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2366 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGGCACAAATAGGGAAG 2425

 66700124 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACTC 66700183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
     2426 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACTC 2485

 66700184 CTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 66700243
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 CTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 2545

 66700244 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 66700303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 2605

 66700304 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 66700363
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 2665

 66700364 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 66700423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 2725

 66700424 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 66700483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 2785

 66700484 TTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 66700543
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 CTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 2845

 66700544 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 66700603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2846 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 2905

 66700604 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAAG 66700663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2906 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAAG 2965

 66700664 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 66700723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 3025

 66700724 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 66700783
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 3085

 66700784 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 66700828
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 3130

Alignment time is 2.48306 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10704] =>     10704 nucs 'mol-32-34a8-171228_10704'

Score:        9816
Aligned:     10723        nucs
Identic:     10589 ( 99%) nucs =>      7841 ( 99%)      2748 ( 99%)
Gaps:           84 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66689593,66697485] EXCISED REGION [66699292,66702061]
 second seq =>  [       1,    7918] EXCISED REGION [    7919,   10699]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1806 nucs [66697486,66699291]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [66697486,66697505] to [66699292,66699311]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 66689593 TAGAAACTCTAAATCGAGGTATTTCCTATTAGCACTTTGAAGATATTCCTCTATTGCCTT 66689652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAAACTCTAAATCGAGGTATTTCCTATTAGCACTTTGAAGATATTCCTCTATTGCCTT 60

 66689653 CCAACATAATTATTTCATTATCTTCTAGTGTCTTTCATCACCACGAAGAAAATGTCTGGT 66689712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAACATAATTATTTCATTATCTTCTAGTGTCTTTCATCACCACGAAGAAAATGTCTGGT 120

 66689713 GTCATTCCTTAGTTTCGGAGTCTGCTGATAAATTCAGCAACCAGTAACATTTATTAAGGT 66689772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCATTCCTTAGTTTCGGAGTCTGCTGATAAATTCAGCAACCAGTAACATTTATTAAGGT 180

 66689773 TACCGTGGTGAGCACTATACATGCCATAACTCATTTAATCCTTACAAAAGTCTATTGGAT 66689832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACCGTGGTGAGCACTATACATGCCATAACTCATTTAATCCTTACAAAAGTCTATTGGAT 240

 66689833 CATAGATACTATTTTTTCTCATATTCCAAAGGAGGAAACTGAGGCTTAAATGAGTACAAG 66689892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATAGATACTATTTTTTCTCATATTCCAAAGGAGGAAACTGAGGCTTAAATGAGTACAAG 300

 66689893 TCTAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCTGAGGCGGGT 66689952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCTGAGGCGGGT 360

 66689953 GGATCACCTGAGGTCAGGGGTTCAAGACCAGTCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTTT 66690012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATCACCTGAGGTCAGGGGTTCAAGACCAGTCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTTT 420

 66690013 ACTGAAAATATAAAAATTAGGTGGGCATGGTGGCACTTGCCTGTAATCCTAGCTACTTGG 66690072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGAAAATATAAAAATTAGGTGGGCATGGTGGCACTTGCCTGTAATCCTAGCTACTTGG 480

 66690073 GAGGCTGAGGCTGGAAAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATT 66690132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGCTGAGGCTGGAAAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATT 540

 66690133 GCACCACTGTACTCCAGCCTGGATGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA 66690192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCACCACTGTACTCCAGCCTGGATGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA 600

 66690193 AAAAAAAAAGTAGAAGTCTTGTCCAAGGGCAAGTAG----GACACGACTAGAATTCAATC 66690248
          |||      |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||
      601 AAA------GTAGAAGTCTTGTCCAAGGGCAA----ATGGGACACGACTAGAATTCAATC 650

 66690249 CCAAGTGTTTCCAAATACAAAGCCTACTTTGAACAAGTACGTTGCACAGACAAGGTAGGG 66690308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 CCAAGTGTTTCCAAATACAAAGCCTACTTTGAACAAGTACGTTGCACAGACAAGGTAGGG 710

 66690309 AAGGTGAAATGTCCTTTGGAAACAGGAGACAGAGTCCCTGTCCCAGCACAGCCAACAGCA 66690368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 AAGGTGAAATGTCCTTTGGAAACAGGAGACAGAGTCCCTGTCCCAGCACAGCCAACAGCA 770

 66690369 GTCTCCTTGATCTCCATGATCATTAGCTCTGAGAGTCTGGCCATAATTAAGATCCTGTAG 66690428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 GTCTCCTTGATCTCCATGATCATTAGCTCTGAGAGTCTGGCCATAATTAAGATCCTGTAG 830

 66690429 ATAATTAGGCACTGATCACAGGGACCTCCTTTTTGGAGATAATAAAACTTGTAGTCTGTG 66690488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 ATAATTAGGCACTGATCACAGGGACCTCCTTTTTGGAGATAATAAAACTTGTAGTCTGTG 890

 66690489 AAGGGAGGGGAAGAAGAGCTATCACCACCCCCACACCCTCCCATCTTGGAATAAGAAGGG 66690548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 AAGGGAGGGGAAGAAGAGCTATCACCACCCCCACACCCTCCCATCTTGGAATAAGAAGGG 950

 66690549 ACTTGTGTATCTCCATTTAGGTTTTGCCAGTGTTCTCTTAGCAAAACCTAGTGACTGTGG 66690608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 ACTTGTGTATCTCCATTTAGGTTTTGCCAGTGTTCTCTTAGCAAAACCTAGTGACTGTGG 1010

 66690609 TACATGTGGAACTCACCCTCATCAGAGGCCTGATTGCTCCCAGCAGCAGTTGCTTTTAGA 66690668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 TACATGTGGAACTCACCCTCATCAGAGGCCTGATTGCTCCCAGCAGCAGTTGCTTTTAGA 1070

 66690669 GAAATATCA---GAGGAAATTGGCATTTTGGTAACACTGCTCAGAGGATTTAGCTCCACT 66690725
          ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 GAAATA---GCGGAGGAAATTGGCATTTTGGTAACACTGCTCAGAGGATTTAGCTCCACT 1127

 66690726 -----------GGAGATTAAGGTTGAAACTTCAGAAAATGAGTTTCCAGATAAACTTTTA 66690774
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 CCAACAAAATTGGAGATTAAGGTTGAAACTTCAGAAAATGAGTTTCCAGATAAACTTTTA 1187

 66690775 GAGTTGCACTTGGCTATGTCAAGAATGTAATCTTATGGTTATAGTTTTGTCTGTGAAAAT 66690834
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 GAATTGCACTTGGCTATGTCAAGAATGTAATCTTATGGTTATAGTTTTGTCTGTGAAAAT 1247

 66690835 GGTTCCACGGGCAACTGTTACCATGTGAATCCTACTTATTACCAGTAAACTCAGAAGAAG 66690894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 GGTTCCACGGGCAACTGTTACCATGTGAATCCTACTTATTACCAGTAAACTCAGAAGAAG 1307

 66690895 GTGGCAACAGCTCTCAGCATTCCACTATTGCAGGCAATCACAAGTCTGCCCTTGTGATCT 66690954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 GTGGCAACAGCTCTCAGCATTCCACTATTGCAGGCAATCACAAGTCTGCCCTTGTGATCT 1367

 66690955 CTGCCTCTTCTTACCCAAAGAAGAAACTACACAGTTGTAGCTACAACCAGCAAGAACAAA 66691014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1368 CTGCCTCTTCTTACCCAAAGAAGAAACTACACAGTTGTAGCTACAACCGGCAAGAACAAA 1427

 66691015 TTTTGGTAAATCTGGGAAGTTCACAAGATACCACTGTAATGAAACCACCATTGCAAAATT 66691074
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 TTTTGGTAAATCTGGGAAGTTCAAAAGATACCACTGTAATGAAACCACCATTGCAAAATT 1487

 66691075 ATGACTGAGACAATGAAAGAGATCTCACCTAACCGACTGCATCTTGCTTCTAACCTCCAA 66691134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 ATGACTGAGACAATGAAAGAGATCTCACCTAACCGACTGCATCTTGCTTCTAACCTCCAA 1547

 66691135 GCTGTCCTTCTTCATTCTTGGGTATAGACTGAACTAACTTTGGGAGGAATTTAGTTTATA 66691194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 GCTGTCCTTCTTCATTCTTGGGTATAGACTGAACTAACTTTGGGAGGAATTTAGTTTATA 1607

 66691195 GTTTATAATTTAAAACAAAGATGATAATAGCCCTTCCCTAAAACAAACCTCCTTCTTGCT 66691254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 GTTTATAATTTAAAACAAAGATGATAATAGCCCTTCCCTAAAACAAACCTCCTTCTTGCT 1667

 66691255 AGGGACCCGATGGCCTTTGTAGGACTAAGAAATTAGCCAAACGATTAGAAATTAGTGTTT 66691314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 AGGGACCCGATGGCCTTTGTAGGACTAAGAAATTAGCCAAACGATTAGAAATTAGTGTTT 1727

 66691315 AGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCCCCTAGGATGA 66691374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 AGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCCCCTAGGATGA 1787

 66691375 GTGCTTGAGAAATTTTGCAGACCTTGCACTTGATGGATCAGCTGGCACCACCCAGCTCGA 66691434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 GTGCTTGAGAAATTTTGCAGACCTTGCACTTGATGGATCAGCTGGCACCACCCAGCTCGA 1847

 66691435 TAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCACCACCCAGGAACTGACTCAGCTCAAGAGGACA 66691494
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1848 TAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCACCATCCAGGAACTGACTCAGCTCAAGAGGACA 1907

 66691495 TCTTCAGTTCCCAGTGATGTCATCTCTGACCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCC 66691554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 TCTTCAGTTCCCAGTGATGTCATCTCTGACCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCC 1967

 66691555 CCAACCCACCAAGTTGTCCTTAAAAACTCTGCTGCTTGAATGTTCAGGGACACCGATTTG 66691614
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
     1968 CCAACCCACCAAGTTGTCCTTAAAAACTCTGCTGCCTGAATGTTCAGGGACACCTATTTG 2027

 66691615 AGTAATCATAAAACTCCAGTCTCCCGCACAGCTGGCTCTGTGTGAATTACTCTTTCTCCA 66691674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 AGTAATCATAAAACTCCAGTCTCCCGCACAGCTGGCTCTGTGTGAATTACTCTTTCTCCA 2087

 66691675 TTACAGTTCCCCTGTCTTGATTAATTGGCTCTGTCTAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCAC 66691734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 TTACAGTTCCCCTGTCTTGATTAATTGGCTCTGTCTAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCAC 2147

 66691735 TGGGTGGTTTCAGTAATACTCTTTTTTGTAGTCTAAAAATCACCCCTCAGTATTCCAAAA 66691794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 TGGGTGGTTTCAGTAATACTCTTTTTTGTAGTCTAAAAATCACCCCTCAGTATTCCAAAA 2207

 66691795 TCACTTCTCCCTCAGACGACCCCTGGACTTCCTCTACTCCCACACAGTTAACATTAATTT 66691854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 TCACTTCTCCCTCAGACGACCCCTGGACTTCCTCTACTCCCACACAGTTAACATTAATTT 2267

 66691855 TGAGTTGTGAGAAGGTCCGGTAGCCTCTCTTCTTTCATCAATACTTCCCCTGCTGTGTGG 66691914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 TGAGTTGTGAGAAGGTCCGGTAGCCTCTCTTCTTTCATCAATACTTCCCCTGCTGTGTGG 2327

 66691915 CTTGTAAGTATGATTGTATGTTTGGAAGACCCATTTAGAAAATAATAATTGACACTAAGA 66691974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 CTTGTAAGTATGATTGTATGTTTGGAAGACCCATTTAGAAAATAATAATTGACACTAAGA 2387

 66691975 TCACATAAAAGCCCTTGAGTGTAGAAATGAAAATAATATGAATGATTCGTTTTGCATTAG 66692034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TCACATAAAAGCCCTTGAGTGTAGAAATGAAAATAATATGAATGATTCGTTTTGCATTAG 2447

 66692035 TGTTCTTTTTTATTTTTGTTTTATTCCGTTTTGTCTATTATATATGGCCTTTGAAATGCT 66692094
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 TATTCTTTTTTATTTTTGTTTTATTCCGTTTTGTCTATTATATATGGCCTTTGAAATGCT 2507

 66692095 GATTGTGCAGATAGATGAATTTTACCCAAACAAAGGGCTGACCTTTGCCCTCAGCTTCTG 66692154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 GATTGTGCAGATAGATGAATTTTACCCAAACAAAGGGCTGACCTTTGCCCTCAGCTTCTG 2567

 66692155 GGAGGTGACCTCCAAGCCCTTGGAATGTCCTGCCTGATAAGAGTACCTTTGTTTATTTGT 66692214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 GGAGGTGACCTCCAAGCCCTTGGAATGTCCTGCCTGATAAGAGTACCTTTGTTTATTTGT 2627

 66692215 AGGCCTTAGGCCACACCAGATATTCTATTATTATTATTATTTTTTTGAGATGGGCGTCTC 66692274
          ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||||||||||||||||||||
     2628 AGGCCTTAGGCCACACCAGATATTCTATAATTATTATT-TTTTTTTGAGATGGGCGTCTC 2686

 66692275 ACTCTGTCGCCCATGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCTGCTCACAGCAACCTCCGCCTC 66692334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2687 ACTCTGTCGCCCATGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCTGCTCACAGCAACCTCTGCCTC 2746

 66692335 CCAGGTTCAATTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTACGTAGCTGGGATTACAGGCATGCAC 66692394
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 CCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTACGTAGCTGGGATTACAGGCATGCAC 2806

 66692395 CACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACCATGTTGGCCAG 66692454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 CACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACCATGTTGGCCAG 2866

 66692455 GCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCTGCCCAAAGTGCTGGG 66692514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 GCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCTGCCCAAAGTGCTGGG 2926

 66692515 ATTACAGGCGTGAGCCACCAAACCCGGCCCCCACACCAGATATTCTCTGCCAACCAAATG 66692574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 ATTACAGGCGTGAGCCACCAAACCCGGCCCCCACACCAGATATTCTCTGCCAACCAAATG 2986

 66692575 GTTTCATATAGTTGGGGCTTTGGGCCATGCAGTTATTGGCTCAACCTCTGGAGGGGCTGG 66692634
          .||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 ATTTCATATGGTTGGGGCTTTGGGCCATGCAGTTATTGGCTCAACCTCTGGAGGGGCTGG 3046

 66692635 AAATTAAGGTCAGACATGTAGCAGTCAACTGTGTCTAGGTGACTGAGCTGCAGTAAAATC 66692694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3047 AAATTAAGGTCAGACATGTAGCAGTCAACTGTGTCTAGGTGACTGAGCCGCAGTAAAATC 3106

 66692695 TTTGGACACCAAGACTCAGGTGCATTTCCAAGGTTGGCAGCACTCTGTGCATATCATCAC 66692754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 TTTGGACACCAAGACTCAGGTGCATTTCCAAGGTTGGCAGCACTCTGTGCATATCATCAC 3166

 66692755 ACATCCCTGCTGGGAGAAGTTAGCTCTGTCTATAACCCCTCTGCGATAGGACAACCGGAA 66692814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 ACATCCCTGCTGGGAGAAGTTAGCTCTGTCTATAACCCCTCTGCGATAGGACAACCGGAA 3226

 66692815 GCTCCAGGCATGGAATTCTCCTAGACTCGGTCCCACGTGCCTGTTCCCTCGGTTAGCGTT 66692874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3227 GCTCCAGGCATGGAATTCTCCTAGACTCGGTCCCACGTGCCTCTTCCCTCGGTTAGCGTT 3286

 66692875 AATGTGTGTCCTTATGCTATAATAAAACATACATGAATATAACAGCTTTCAGAGAGTTCT 66692934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 AATGTGTGTCCTTATGCTATAATAAAACATACATGAATATAACAGCTTTCAGAGAGTTCT 3346

 66692935 GTGGGTCCTTCTAGTGAACTGTTAAATCTGGAGGTGGTCTTGCGGGCCGCTGAACTTTGC 66692994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 GTGGGTCCTTCTAGTGAACTGTTAAATCTGGAGGTGGTCTTGCGGGCCGCTGAACTTTGC 3406

 66692995 ACTGGTGAATGTGTTTTCTAATCCTCGTTTCACAGTTTCTCATTCTTAACTGCAATGTGG 66693054
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3407 ACTGGTGAATGTGTTTTCTAATCCTCGTTTCACGGTTTCTCATTCTTAACTGCAATGTGG 3466

 66693055 GAGTAGCTCTGTTTTCTGGGGTGATTGTGACGGCTAAATGAAGTGAAGTATAAAAAGCAT 66693114
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 GAGTAGCTCAGTTTTCTGGGGTGATTGTGACGGCTAAATGAAGTGAAGTATAAAAAGCAT 3526

 66693115 CTAGAATTGTGCCTTGCCTATAGCAGTGTATTAGTCTTTTCTCACGCTGCTGATAAAGAC 66693174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 CTAGAATTGTGCCTTGCCTATAGCAGTGTATTAGTCTTTTCTCACGCTGCTGATAAAGAC 3586

 66693175 ATACCTGAGATTGGGTAATTTATAAGAAAAAAGAGGTTTAATGGACTCACAGTTCACGTG 66693234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 ATACCTGAGATTGGGTAATTTATAAGAAAAAAGAGGTTTAATGGACTCACAGTTCACGTG 3646

 66693235 GCTGGGGTGGCATCACAATCGTGGCGGAAGGTGAAAGTCACGTCTCACATGGAGGCAGAC 66693294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 GCTGGGGTGGCATCACAATCGTGGCGGAAGGTGAAAGTCACGTCTCACATGGAGGCAGAC 3706

 66693295 AAGAGAAGAGAACTTGTGCAGGGAAACCCCCCTTCGTAAAACCATCAGATCTTGTGAGAT 66693354
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3707 AAGAGAAGAGAACTTGTGCAGGGAAACCCCCCTTCATAAAACCATCAGATCTTGTGAGAT 3766

 66693355 TTATTCACTATCTCAAGAACAGCACAGGAAAGGCCCTCCTCCATGATTCAATTACCTCCT 66693414
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3767 TTATTCACTATCTCAAGAACAGCACAGGAAAGGCCCTCCTCCATGATTCAATTACCTCCC 3826

 66693415 ACCTGGTCCCTCCCACAACACATGGGAATTGTGGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGG 66693474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 ACCTGGTCCCTCCCACAACACATGGGAATTGTGGGAACTACAATTCAAGATGAGATTTGG 3886

 66693475 GTGGAAACACAGCCAAACCATATCAAGCAGTTTCTTAATAAAGGCTTTTTCCTAAAGGTT 66693534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 GTGGAAACACAGCCAAACCATATCAAGCAGTTTCTTAATAAAGGCTTTTTCCTAAAGGTT 3946

 66693535 CTGACCATTTGCTTTTTAAATAAAGAATGGTATAGTGTTACGTGGAGGAATAGTCATACA 66693594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 CTGACCATTTGCTTTTTAAATAAAGAATGGTATAGTGTTACGTGGAGGAATAGTCATACA 4006

 66693595 AACCACCTCCAATGTTGATGCTAATAAATAGCTTGTGGGGTACTCTTTTTTCAGCTCATA 66693654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 AACCACCTCCAATGTTGATGCTAATAAATAGCTTGTGGGGTACTCTTTTTTCAGCTCATA 4066

 66693655 TATAAGATTTCCTTCTTATTTCAACTCTTGAATGTGTAGAACTATGAGACCTTTGTATGA 66693714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 TATAAGATTTCCTTCTTATTTCAACTCTTGAATGTGTAGAACTATGAGACCTTTGTATGA 4126

 66693715 TTAGAACTTTTTTCAGTGACTCTGCAGTATTTGTAACAAAAGCTGGAACAACTTTCAGCA 66693774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 TTAGAACTTTTTTCAGTGACTCTGCAGTATTTGTAACAAAAGCTGGAACAACTTTCAGCA 4186

 66693775 GAACCTGGTTTGAGACAGTGGCTGGGGGCCAGCCGAATGATACAAGTTTTTTCTTTGTGA 66693834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 GAACCTGGTTTGAGACAGTGGCTGGGGGCCAGCCGAATGATACAAGTTTTTTCTTTGTGA 4246

 66693835 CATTTTGAGTTTGAGATGACTGGATTTCCCGTATAGATGAGTCTCTGGAGAAGTTACAAG 66693894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 CATTTTGAGTTTGAGATGACTGGATTTCCCGTATAGATGAGTCTCTGGAGAAGTTACAAG 4306

 66693895 GGAAACCGATGGGAAGTCAGTTCTTCATCTGCAACCTCTTGCCTGTAACTGTTAGGAACT 66693954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 GGAAACCGATGGGAAGTCAGTTCTTCATCTGCAACCTCTTGCCTGTAACTGTTAGGAACT 4366

 66693955 AGTTCATGTAATGGGAGGAGAATGTACTTCACTGTGCCAGTTTTATTTTTTTGGTTATTA 66694014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 AGTTCATGTAATGGGAGGAGAATGTACTTCACTGTGCCAGTTTTATTTTTTTGGTTATTA 4426

 66694015 TTTTCTGAGAAGGGATGGAAGCTTGTAAATAAAATCAAAGAAATCAAAGGCAGAGTACAC 66694074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4427 TTTTCTGAGAAGGGATGGAAGCTTGTAAATAAAATCAAAGAAATCAAAGGCAGAGCACAC 4486

 66694075 TGACTTTAGAGGTCTGCATAAAAAGCTTTCGGCTCCCCTCGTTTGCCTAAGGCCTCTTGT 66694134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 TGACTTTAGAGGTCTGCATAAAAAGCTTTCGGCTCCCCTCGTTTGCCTAAGGCCTCTTGT 4546

 66694135 GCTGTACTTGAGTAGAGAAATAATTAACAGATAGTAGGCTTTTCAGTGCACTCATTGTTT 66694194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 GCTGTACTTGAGTAGAGAAATAATTAACAGATAGTAGGCTTTTCAGTGCACTCATTGTTT 4606

 66694195 AGACTGAATGCCAAGAGAAGTTGAAGTACCTTAAGAATTTAGAATATAGGCCGGGTGCGG 66694254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 AGACTGAATGCCAAGAGAAGTTGAAGTACCTTAAGAATTTAGAATATAGGCCGGGTGCGG 4666

 66694255 TGGCTCATGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTC 66694314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4667 TGGCTCATGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTC 4726

 66694315 AGGAGTTTGAGACCAGCCAGGCCAACGTAGCGAAACCCCATTTCTACTAAAATTGCAAAA 66694374
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 AGGAGTTCGAGACCAGCCAGGCCAACGTAGCGAAACCCCATTTCTACTAAAATTGCAAAA 4786

 66694375 ATTAGCTGGGCCGTGGTGGGGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGG 66694434
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 ATTAGCTGGGC-GTGGTGGGGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGG 4845

 66694435 AGAATCTCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTTCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTC 66694494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 AGAATCTCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTTCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTC 4905

 66694495 TAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTGGAATATACACTGT 66694554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     4906 TAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAA-TTGGAATATACACTGT 4964

 66694555 TTTCTGTAAGTTTTAGATAAGTTAAACAAAGGGAGTTAACTTAGGGATATTGCACACAAA 66694614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 TTTCTGTAAGTTTTAGATAAGTTAAACAAAGGGAGTTAACTTAGGGATATTGCACACAAA 5024

 66694615 TAAGGGGTAAAACAAAATCAAACAAACAAAAAAAA-CAATGCTCTGGCCAGGTGAGGTGG 66694673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     5025 TAAGGGGTAAAACAAAATCAAACAAACAAAAAAAAACAATGCTCTGGCCAGGTGAGGTGG 5084

 66694674 CTCACACATGTATTCCCAGCATTTTAAGAGGCTGAAATGGGAGAATTGCTTGAGTCCTGG 66694733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 CTCACACATGTATTCCCAGCATTTTAAGAGGCTGAAATGGGAGAATTGCTTGAGTCCTGG 5144

 66694734 AATTCAAGACCATCCTGGGCTGCATAGCAAGACTGTCTCTCTACAAAACGTTAAAACATT 66694793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 AATTCAAGACCATCCTGGGCTGCATAGCAAGACTGTCTCTCTACAAAACGTTAAAACATT 5204

 66694794 AGCTGGATATGGTGGCATGCACTGTAGTCCCAGCTCTTCCAGAGACTGAGGAGGGAGGAT 66694853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 AGCTGGATATGGTGGCATGCACTGTAGTCCCAGCTCTTCCAGAGACTGAGGAGGGAGGAT 5264

 66694854 CCTTGAGCCGAAGAAGTTGAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCACTCCAGTCT 66694913
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 CCTTGAGCTGAAGAAGTTGAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCACTCCAGTCT 5324

 66694914 GGGTGACAGAGGAAGACCCTGTCTCTAAAACAAAACAAAACAAAAAGCCTCTCTTTGCAG 66694973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 GGGTGACAGAGGAAGACCCTGTCTCTAAAACAAAACAAAACAAAAAGCCTCTCTTTGCAG 5384

 66694974 TTTCCTTGAGAAATATTTGAAAGACATGACTGTTAGTTCTGTCATTTTCCAGTTTGAAAG 66695033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 TTTCCTTGAGAAATATTTGAAAGACATGACTGTTAGTTCTGTCATTTTCCAGTTTGAAAG 5444

 66695034 CTACCAGTCACATGGGATCATGTAATGGCCACGGTCTCTTTAACACCCTCCAATTTGAAT 66695093
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 CTACCAGTAACATGGGATCATGTAATGGCCACGGTCTCTTTAACACCCTCCAATTTGAAT 5504

 66695094 CTTGGCCCT-CTACTTCCTTAGGATATGGCCTAAGCACATCTATCACTTAGCTTTTTTTG 66695152
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 CTTGGCCCTTCTACTTCCTTAGGATATGGCCTAAGCACATCTATCACTTAGCTTTTTTTG 5564

 66695153 GACTTTTGCTCTCATTCAAAAGATAGGAATGTGACTACAACATGTTTATTATGTGGATTA 66695212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 GACTTTTGCTCTCATTCAAAAGATAGGAATGTGACTACAACATGTTTATTATGTGGATTA 5624

 66695213 CACAAGATACAGAACCAAACATAGCACCTAGTACCCAGTAGGACACTTCACAAGGATTTG 66695272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 CACAAGATACAGAACCAAACATAGCACCTAGTACCCAGTAGGACACTTCACAAGGATTTG 5684

 66695273 TCACTACTGTTTGCCTGCCAGTCCTCTCCTTTCCTCTGCCCTACATTTTTTGGCTGAGGT 66695332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 TCACTACTGTTTGCCTGCCAGTCCTCTCCTTTCCTCTGCCCTACATTTTTTGGCTGAGGT 5744

 66695333 TGTTGATGTGCTTTTTCCTTTCTTGGAT----ACAGTCACCACTATTTTAAACCTTATTT 66695388
          |||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||
     5745 TGTT-ATGTGCTTTTTCCTTTCTTGGATGGATACAGTCACCACTATTTTAAACCTTATTT 5803

 66695389 TTAGTTTTGTCAAAATTCTACATGGACAGTTAAAAAGTCCAAGTTTATTAAAAAACAAAA 66695448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 TTAGTTTTGTCAAAATTCTACATGGACAGTTAAAAAGTCCAAGTTTATTAAAAAACAAAA 5863

 66695449 CAAAACAAAAAAGCAGCAGTTCCTTGTACCCTCCTCAAACACAAACACACCTCCATTTCC 66695508
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5864 CAAAACAAAAAAACAGCAGTTCCTTGTACCCTCCTCAAACACAAACACACCTCCATATCC 5923

 66695509 CCCTCTCAAGCAACAACCACTTTCAGATTTTCTAGGTGATTCATTTGGTATTTATCTCCG 66695568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 CCCTCTCAAGCAACAACCACTTTCAGATTTTCTAGGTGATTCATTTGGTATTTATCTCCG 5983

 66695569 TATCTCTAAATAGCATACTTATATTGCTGCTCGCCCCTGCACCCCCAACCCACCATTTTG 66695628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 TATCTCTAAATAGCATACTTATATTGCTGCTCGCCCCTGCACCCCCAACCCACCATTTTG 6043

 66695629 CTTATTATCTCTTTTTTT-------------------TTTTTTTTTTTGAGGCGGAGTCT 66695669
          ||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||
     6044 CTTATTATCTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCGGAGTCT 6103

 66695670 TGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCT 66695729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 TGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCT 6163

 66695730 CCCGGGTTCAACCAATTCTCCTGCTTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTG 66695789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 CCCGGGTTCAACCAATTCTCCTGCTTTAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGAGGCTG 6223

 66695790 CCAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAA 66695849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 CCAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACCTTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAA 6283

 66695850 CTCCTGACCTCAAATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTG 66695909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 CTCCTGACCTCAAATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTG 6343

 66695910 AGCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGA 66695969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 AGCCACCATGCCTGGCTGCTTATTATCTCTTTACTGTGTACCATGGAAGATGAGGCTTGA 6403

 66695970 GCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCCTAACATACAC 66696029
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6404 GCTTGCTTCTACCTTCTCCTGGAACATCCTTTCCCATTCCCCCACCCTCTTAACATACAC 6463

 66696030 ATACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTT 66696089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 ATACCAGATTTTTATTTAGATGATTTTTTTTTGCATTATTATAACCACGTGAACACTGTT 6523

 66696090 CATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTA 66696149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 CATGGCCAAGCCATGCCATCTCCTGCAATTGCTATTTGTTTCCAGTGCCACCTTTGGTTA 6583

 66696150 ATTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCT 66696209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 ATTTTTATTATTTTCTTCATCTAGATTTCTGTGTTATTTCGCTAACAACTCTCAAACTCT 6643

 66696210 CTGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTT 66696269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 CTGCCATCTCAAATATATTGCCTCGCAGACTTTCAGATGCATTGGATTTGCTATCAGGTT 6703

 66696270 CATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCAC 66696329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 CATCTTTTTGAAGAAGTCTCTGCAGGACACTTACTTACCCACCTACCTTGGACAGTTCAC 6763

 66696330 TCTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGGGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAAT 66696389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6764 TCTCTACCACCTAGTTCACAGCTGTTATCCTGAGATCACCAGCTCTGTCTTGAGTGAAAT 6823

 66696390 GTCTCTGGGATCCTGTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTA 66696449
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 GTCTCTGGGATCCCGTGTTTCCTAAAGTTACTCCTTCATTCACAGGAAACACAACTTCTA 6883

 66696450 GGAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACAACTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAA 66696509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6884 GGAGATTCCTAAGAAACTGGCATGTAAAAAGTACAATTTTTTGAGACCTTTAATGTCCAA 6943

 66696510 ACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTAT 66696569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 ACGTGTTTTCATTCTCCCTACGCATTTGATTTGGATATAGAATTCTTGGCTGGAAACTAT 7003

 66696570 TCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAA 66696629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 TCCCCCTTTGAGGTTGGACCTGCTGTCTTTCAGCTTTCCTTGCAGTAATTGAGAACTCAA 7063

 66696630 AAGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCT 66696689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7064 AAGGCATTCAGATTCCTAATCCTCTGTGTATGACCATGTTTTTCTCATTCGATTTTCTCT 7123

 66696690 TTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTAT 66696749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7124 TTGTCTCCATTGTTTTGAAATTTCGCTATAATGTGCCTCAGACGGTGTGTCTGGTTTTAT 7183

 66696750 CCATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAAT 66696809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7184 CCATTGTAGACACCTTTAATGTGGAAACTCATGTCCTTCACTTCTTAACATTTCCAGAAT 7243

 66696810 TATTTCAATGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTTTTTCTCCTTTCTGTCTAGAACTACT 66696869
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     7244 TATTTCAACGAATATATCCTCTCTTCTATTTTTTTTT-CTCCTTTCTGTCTAGAACTACT 7302

 66696870 AAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATC 66696929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 AAAAAGAAAAGTTTTAAATTGGGTCTTATGGACTAGTTCTTTAATATTAAAAAAAAAATC 7362

 66696930 TTTTTTGTCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAG 66696989
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 TTTTTTGCCAGGTGCAGTAGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGCAG 7422

 66696990 GTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCT 66697049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 GTGAATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCT 7482

 66697050 CTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACC 66697109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 CTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTACC 7542

 66697110 CTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 66697169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7543 CTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGTACCTGGGATGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 7602

 66697170 ATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAG 66697229
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7603 ATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTTTCTGCGCCCAGCCACTGCCCCCAG 7662

 66697230 CCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCA 66697289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 CCTCTTTTTATTTTTATCCCTCTATCATGTTAGAAGTTTTTCTGAGGTGGCTGATGGTCA 7722

 66697290 TTGGTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGC 66697349
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 TTGTTTATATGCTTGTATTTGAGAATGGGAGACTAAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGC 7782

 66697350 AACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACCTGTAATC 66697409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     7783 AACCCCATCTCTTCAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGCACACTTGTAATC 7842

 66697410 CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAA 66697469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAA 7902

 66697470 TGAAGCCGAGATTGCG 66697485
          ||||||||||||||||
     7903 TGAAGCCGAGATTGCG 7918

EXCISED REGION

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTT------AAAAAAAAAA 66699345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||
     7919 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 7978

 66699346 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGT 66699405
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     7979 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGC 8038

 66699406 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 66699465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8039 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 8098

 66699466 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 66699525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8099 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 8158

 66699526 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 66699585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8159 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 8218

 66699586 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAG-TTTTTTAGACTTT 66699644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     8219 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTTT 8278

 66699645 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 66699704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8279 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 8338

 66699705 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 66699764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8339 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 8398

 66699765 TGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 66699824
          |||   |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8399 TGC---AGCTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 8455

 66699825 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 66699884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8456 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 8515

 66699885 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGAC-TGTAGGTATGGTA 66699943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
     8516 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGT- 8574

 66699944 AAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 66700003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8575 --AAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 8632

 66700004 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 66700063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8633 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 8692

 66700064 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 66700123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8693 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 8752

 66700124 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACTC 66700183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
     8753 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACTC 8812

 66700184 CTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 66700243
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8813 CTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 8872

 66700244 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 66700303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8873 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 8932

 66700304 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 66700363
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     8933 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 8992

 66700364 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 66700423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8993 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 9052

 66700424 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 66700483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9053 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 9112

 66700484 TTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 66700543
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9113 CTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 9172

 66700544 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 66700603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     9173 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 9232

 66700604 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAAG 66700663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     9233 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAAG 9292

 66700664 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 66700723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9293 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 9352

 66700724 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 66700783
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     9353 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 9412

 66700784 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 66700843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9413 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 9472

 66700844 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTC---AAAAAAAAAAAAAAAAAGA- 66700899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| 
     9473 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAA 9532

 66700900 ----AAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGATGGCATATGT 66700955
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     9533 AAAGAAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGACGGCATATGT 9592

 66700956 TGTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAAC 66701015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9593 TGTTAAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAAC 9652

 66701016 TGCAGGGACCATTATAGTGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAA 66701075
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9653 TGCAGGGACCATTATAGGGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAA 9712

 66701076 CTGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGG 66701135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9713 CTGACAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGG 9772

 66701136 AAGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGC 66701195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9773 AAGACTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGC 9832

 66701196 GTCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATT 66701255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9833 GTCACGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATT 9892

 66701256 CAGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGA 66701315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9893 CAGGATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGA 9952

 66701316 GAGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGA 66701375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9953 GAGAAGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGA 10012

 66701376 GGAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGGAGAATC 66701435
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
    10013 GGAAGGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGCAGAATC 10072

 66701436 GATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTCGAG 66701495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
    10073 GATGGAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTTGAG 10132

 66701496 GCTCAGTGCCTGGGAATGACAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACA 66701555
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10133 GCTCAGTGCCTGGGAATGATAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACA 10192

 66701556 GTCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGT 66701615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10193 GTCTGTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGT 10252

 66701616 TCACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTA 66701675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10253 TCACAGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTA 10312

 66701676 ATTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAG 66701735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10313 ATTCATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAG 10372

 66701736 CTAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAG 66701795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10373 CTAGTGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAG 10432

 66701796 GAACCTATGTATTTTCTTTC-TTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTC 66701854
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10433 GAACCTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTC 10492

 66701855 ATTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACT 66701914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10493 ATTTAGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACT 10552

 66701915 GAGGCTAGAGTGCAGTGGCACTGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAG 66701974
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10553 GAGGCTAGAGTGCAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAG 10612

 66701975 CGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTG 66702034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10613 CGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTG 10672

 66702035 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 66702061
          |||||||||||||||||||||||||||
    10673 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 10699

Alignment time is 8.26176 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [66687485,66709291] =>     21807 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2786] =>      2786 nucs 'mol-32-34a8-171228_2786'

Score:        2517
Aligned:      2777        nucs
Identic:      2746 ( 99%) nucs =>      1590 ( 99%)      1156 ( 99%)
Gaps:           15 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [66699292,66700897] EXCISED REGION [66700900,66702061]
 second seq =>  [       1,    1608] EXCISED REGION [    1619,    2781]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [66700898,66700899]
 second seq =>        10 nucs [1609,1618]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [66700897,66700897] to [66700899,66700899]
 second seq =>         3 nucs [1609,1611] to [1619,1621]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [66700894,66700897] to [66700900,66700903]
 second seq =>         4 nucs [1605,1608] to [1619,1622]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1609,1612] to [1615,1618]

 66699292 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 66699351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTATCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA 60

 66699352 AA------GGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGT 66699405
          ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
       61 AAAAAAAAGGAAGAAGAGACATGAGAGGGCCCAAGTCACTTGCTCACTCACTTTCCGTGC 120

 66699406 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 66699465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATGTACCAAGAAAAGGCCATGTGGGAAAGAGCAAGAAGGCAGCCGCCTTCAAGACAGG 180

 66699466 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 66699525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGAGAGCCCTCACCAGAAACTGAGCCAGAACCTTGGAATTCCAGCCTCCAGAACTGTGA 240

 66699526 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 66699585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAAAGAATTTTCTGTTGTTTCAGTCCCCCACACTATGGCATTTTGTTACGGCAGCCTGA 300

 66699586 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTT-AGACTTT 66699644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
      301 GCTAATACTCCTACTTTGTCCTGCATTTACTTGGTCTTCCAGTTAGTTTTTTTAGACTTT 360

 66699645 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 66699704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGAATCAGAGCAGTCAGTTGTCAGATTTTAGCTTACAGTTGTCCTACCTGTGCAACTGA 420

 66699705 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 66699764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTTCTTCCATTTTAAACCAGAGCAGAGTTTTAGAGTCAAAAGAAACCAGATCTTTTAG 480

 66699765 TGCAGAAGCTTTCACACTGTATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 66699824
          |||||   |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAG---CTTTCACACTGCATTAGAAGTGAGGAAGTTGGTTTTGTGAGTTGCAGCCAGC 537

 66699825 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 66699884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 AGTTCTCTTATGAAGTGCATTGCCTGCAGTTTTGTGAAAGTTGTATTCCCAGCTTGTGTG 597

 66699885 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACT-GTAGGTATGGTA 66699943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      598 TGTATATTTGCGTGTACTAGATTGAGATATAAAGTATATTTTTGACTTGTAGGTATGGTA 657

 66699944 AAAAAAAAAAAAAATTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 66700003
          |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AAAAAAAAAAA---TTTAAGTCCATTGTATTGCTCAAACTAATCCTTTACTCTCTCTTAG 714

 66700004 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 66700063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 AACACCCATGGTAAATGATCATGTTAGAGTTTGAGGGTGAAGGAGCATCAGGATTATGAA 774

 66700064 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 66700123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 CCAGAGGGGTCAGACTTCAGATCTAGAAATCAAAACACCAAAGGGACACAAATAGGGAAG 834

 66700124 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCCAAAGAGACTC 66700183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
      835 AAGAGAGTATGGTCATCTCTTGTCTTTCAGCAAGCAACACTGGGATCCCGAAAAAGACTC 894

 66700184 CTCTACAGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 66700243
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 CTCTACGGGGCCAAGCTTGTGTGATTTATCACACCTGTCCCTGTACTCCCCAAGTGCCTT 954

 66700244 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 66700303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 GTACATAACCTCACCTGCTATACATGCTATGTTGTATTATAATTATTTTCTAAATGTATG 1014

 66700304 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAATTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 66700363
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 TAACTGGGCCAAGTCCATAGTTGTCCCAGTTGGCCCATGTTGATGGATGGATCATGATTT 1074

 66700364 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 66700423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 TTGGCCTCATTTGACTGTCATGCATGTTGAATTACATGTTAATGTCATGTCAGTCACCCC 1134

 66700424 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 66700483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 AGGCTCAGTCAAGGGTGAGTGTCATGCCTCTGTCATGAATACACAGTGAAGCAGTCCCTT 1194

 66700484 TTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 66700543
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 CTATTCCATGGAGCCAGTAGCAGCAAAATCCCATCATGTCTCAAGATGTCAGTAGAACGG 1254

 66700544 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGATTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 66700603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1255 GTGGAATTTTGATTCTTTGTATGGTCTTCTAGCTTTGTTAAGAGGTGAGGAAGGGCTGGG 1314

 66700604 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACAAG 66700663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1315 TGCAGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCGGATCACAAG 1374

 66700664 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 66700723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACTCGGTAAAACACTGTGTCTACTGAAAATACA 1434

 66700724 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 66700783
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 AAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCAGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 1494

 66700784 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 66700843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 GGCAGGAGAATGGCGAGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCACT 1554

 66700844 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA 66700897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 GCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA 1608

EXCISED REGION

 66700900 AAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGATGGCATATGTTGTT 66700959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1619 AAAAGAGGTGAGGAAGAAAGACTGGGCCCTCGCATGTCCTGGGTGACGGCATATGTTGTT 1678

 66700960 AAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAACTGCA 66701019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AAGTTCCTATATTCACAGAGCCAGCAGGCTTGGTGGGGTGGAATGCAGGAGGAAACTGCA 1738

 66701020 GGGACCATTATAGTGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAACTGA 66701079
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GGGACCATTATAGGGTCTGCGGAAGTTCAAGACAGTGAGGTCCTGTGGCCAGGAAACTGA 1798

 66701080 CAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGGAAGA 66701139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAGAAATTGTCTAACATGGGAACTCTCTCACTGCAACCGAACTAACAGGATTTAGGAAGA 1858

 66701140 CTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGCGTCA 66701199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTTCCCAGAGCAAAGGATGAAGGACATGTGAGTTAGACAGAGGGAACAGCTTGGGCGTCA 1918

 66701200 CGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATTCAGG 66701259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CGTGAGAGGACCACAGCTCACCAAGAGATGCAGATTTGATACTCAGACTTTACATTCAGG 1978

 66701260 ATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGAGAGA 66701319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 ATCATAGGAATCAATTCTGCTGTCGGCACAGTCTCAGGCCGTCTGTGGGAAGTTGAGAGA 2038

 66701320 AGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGAGGAA 66701379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGCCACAGCTGGAATCAGAAGGTCAATTGGCTGGAAGACAGTGGCTGTGGCCCAGAGGAA 2098

 66701380 GGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGGAGAATCGATG 66701439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2099 GGGCCTGCGTGACCAAGTCACGCCACTGGCAGCAGAAGTGCTGCCCAGGCAGAATCGATG 2158

 66701440 GAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTCGAGGCTC 66701499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2159 GAGGTGGTGTGAGCGGCCAGGGAAAAGGAGGTCACCTTTGACTCTGCAGTTTTGAGGCTC 2218

 66701500 AGTGCCTGGGAATGACAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACAGTCT 66701559
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AGTGCCTGGGAATGATAGTGATTGCCTCCACAACAGTAGACAACACTTCAGGGACAGTCT 2278

 66701560 GTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGTTCAC 66701619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GTCTTGGGAGAGAAAATGATGGTGAGATATAAATTTTACATCTTGGGTTGTAGAGTTCAC 2338

 66701620 AGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTAATTC 66701679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AGGGCCCTTGAGGCACCATTTCCATGAATGGTCTTATTACAAGAAAATTTCTTCTAATTC 2398

 66701680 ATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAGCTAG 66701739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATAGAGTAATTAAACTTTTCCACATATTCAGCATTTTCCCCCTAGAAAGCTCTTAGCTAG 2458

 66701740 TGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAGGAAC 66701799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TGGGTAAAAAATCAGATGTCATTTAAATTCAGCATATTTTAATATTCTAAATTCAGGAAC 2518

 66701800 CTATGTATTTTCTTTC-TTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTCATTT 66701858
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CTATGTATTTTCTTTCTTTTTTTTTGTGGCTAGAACAGGAAATTGTTCCTTAGTTCATTT 2578

 66701859 AGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACTGAGG 66701918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AGTTCATTGGAGTTTTCTTATTTTTATTTTTGAGATGGAATTTCACTCACGTCACTGAGG 2638

 66701919 CTAGAGTGCAGTGGCACTGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGAT 66701978
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CTAGAGTGCAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGAT 2698

 66701979 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTGGCTA 66702038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACATGCACACACCACCACGCCTGGCTA 2758

 66702039 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 66702061
          |||||||||||||||||||||||
     2759 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 2781

Alignment time is 2.22749 s

