
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5678] =>      5678 nucs 'mol-32-1f0b-060569_5678'

Score:        5623
Aligned:      5678        nucs
Identic:      5673 (100%) nucs =>      4955 (100%)       718 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55671925,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678507]
 second seq =>  [       1,    4959] EXCISED REGION [    4960,    5678]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [4959,4959] to [4960,4960]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55671925 TTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACC 55671984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACC 60

 55671985 AGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTAT 55672044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTAT 120

 55672045 GAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTG 55672104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTG 180

 55672105 CATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAA 55672164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAA 240

 55672165 TATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAA 55672224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAA 300

 55672225 TTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTT 55672284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTT 360

 55672285 CAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCA 55672344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCA 420

 55672345 ATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTA 55672404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTA 480

 55672405 CTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCT 55672464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCT 540

 55672465 TGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGAT 55672524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGAT 600

 55672525 GTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGG 55672584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGG 660

 55672585 ATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCC 55672644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCC 720

 55672645 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTA 55672704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTA 780

 55672705 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCA 55672764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCA 840

 55672765 TGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCG 55672824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCG 900

 55672825 ACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTAT 55672884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTAT 960

 55672885 ACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTG 55672944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTG 1020

 55672945 GTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGC 55673004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGC 1080

 55673005 CCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCAT 55673064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCAT 1140

 55673065 GCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTA 55673124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1141 GCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTA 1200

 55673125 GAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCT 55673184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCT 1260

 55673185 CCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCT 55673244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCT 1320

 55673245 TTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGAT 55673304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGAT 1380

 55673305 TTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTAT 55673364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTAT 1440

 55673365 ATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATA 55673424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATA 1500

 55673425 ACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATAT 55673484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATAT 1560

 55673485 GATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTT 55673544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTT 1620

 55673545 AAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTA 55673604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTA 1680

 55673605 ATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATT 55673664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATT 1740

 55673665 TTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAAT 55673724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAAT 1800

 55673725 ACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAAC 55673784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAAC 1860

 55673785 AATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGG 55673844
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGG 1920

 55673845 TACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGA 55673904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGA 1980

 55673905 ATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATC 55673964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATC 2040

 55673965 ACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATT 55674024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATT 2100

 55674025 TCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAA 55674084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAA 2160

 55674085 TTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACAT 55674144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACAT 2220

 55674145 ATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTC 55674204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTC 2280

 55674205 TCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCAT 55674264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCAT 2340

 55674265 GGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTT 55674324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTT 2400

 55674325 GTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACA 55674384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACA 2460

 55674385 GGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCAT 55674444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCAT 2520

 55674445 CATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCC 55674504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCC 2580

 55674505 TTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAA 55674564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAA 2640

 55674565 ACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAA 55674624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAA 2700

 55674625 TACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGAT 55674684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGAT 2760

 55674685 GCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAG 55674744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAG 2820

 55674745 ACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAA 55674804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAA 2880

 55674805 ACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCT 55674864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCT 2940

 55674865 CAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGA 55674924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGA 3000

 55674925 AAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGA 55674984
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGA 3060

 55674985 ATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCT 55675044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3061 ATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCT 3120

 55675045 CTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTT 55675104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTT 3180

 55675105 CATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGA 55675164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGA 3240

 55675165 TGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGT 55675224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGT 3300

 55675225 GAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAA 55675284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAA 3360

 55675285 TCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAA 55675344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAA 3420

 55675345 TATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCT 55675404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCT 3480

 55675405 TCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTAT 55675464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTAT 3540

 55675465 TGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTA 55675524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTA 3600

 55675525 GAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAA 55675584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAA 3660

 55675585 GGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTT 55675644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTT 3720

 55675645 TCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTC 55675704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTC 3780

 55675705 TGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGC 55675764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGC 3840

 55675765 TATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTA 55675824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTA 3900

 55675825 CCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACC 55675884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACC 3960

 55675885 AATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACT 55675944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACT 4020

 55675945 ATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCT 55676004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCT 4080

 55676005 CTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCC 55676064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCC 4140

 55676065 AAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTT 55676124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTT 4200

 55676125 ACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACT 55676184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACT 4260

 55676185 GGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTG 55676244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTG 4320

 55676245 GTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGG 55676304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGG 4380

 55676305 AGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATG 55676364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATG 4440

 55676365 TTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAG 55676424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAG 4500

 55676425 GGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCT 55676484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCT 4560

 55676485 GCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGAT 55676544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGAT 4620

 55676545 TTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACT 55676604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACT 4680

 55676605 CCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAAT 55676664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAAT 4740

 55676665 ATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGC 55676724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGC 4800

 55676725 AAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGG 55676784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGG 4860

 55676785 AAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAA 55676844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAA 4920

 55676845 ACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 4959

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 5019

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 5079

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 5139

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 5199

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 5259

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 5319

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 5379

 55678209 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 55678268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 5439

 55678269 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 55678328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 5499

 55678329 ATTATTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 55678388
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 ATTCTTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 5559

 55678389 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 55678448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 5619

 55678449 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTG 55678507
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTG 5678

Alignment time is 4.27832 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2345] =>      2345 nucs 'mol-32-1f21-162522_2345'

Score:        2333
Aligned:      2344        nucs
Identic:      2343 (100%) nucs =>      1534 (100%)       809 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55676149,55677682] EXCISED REGION [55677685,55678493]
 second seq =>  [       1,    1534] EXCISED REGION [    1536,    2345]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [1535,1535]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55676149 TATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTT 55676208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTT 60

 55676209 GCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTT 55676268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTT 120

 55676269 GGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTC 55676328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTC 180

 55676329 TCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTT 55676388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTT 240

 55676389 CAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGG 55676448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGG 300

 55676449 GTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCC 55676508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCC 360

 55676509 AGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAG 55676568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAG 420

 55676569 AGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGC 55676628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGC 480

 55676629 CAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGT 55676688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGT 540

 55676689 AAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCT 55676748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCT 600

 55676749 CAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTG 55676808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTG 660

 55676809 GCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAA 55676868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAA 720

 55676869 GAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCA 55676928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCA 780

 55676929 GCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTC 55676988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTC 840

 55676989 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTC 55677048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTC 900

 55677049 ACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGC 55677108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGC 960

 55677109 CCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTC 55677168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTC 1020

 55677169 TCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 55677228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 1080

 55677229 ATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTT 55677288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTT 1140

 55677289 CTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAG 55677348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAG 1200

 55677349 GAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTA 55677408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTA 1260

 55677409 CAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCC 55677468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCC 1320

 55677469 ATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGG 55677528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGG 1380

 55677529 GTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTT 55677588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTT 1440

 55677589 CTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAG 55677648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAG 1500

 55677649 GACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 1534

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTC-TTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 55677743
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 1595

 55677744 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 55677803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 1655

 55677804 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 55677863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 1715

 55677864 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 55677923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 1775

 55677924 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 55677983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 1835

 55677984 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 55678043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 1895

 55678044 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 55678103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 1955

 55678104 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 55678163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 2015

 55678164 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 55678223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 2075

 55678224 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 55678283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 2135

 55678284 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 55678343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 2195

 55678344 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 55678403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 2255

 55678404 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 55678463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 2315

 55678464 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATAT 55678493
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATAT 2345

Alignment time is 1.77313 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5607] =>      5607 nucs 'mol-32-1f63-230627_5607'

Score:        5552
Aligned:      5607        nucs
Identic:      5602 (100%) nucs =>      5177 (100%)       425 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55671702,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678213]
 second seq =>  [       1,    5182] EXCISED REGION [    5183,    5607]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [5182,5182] to [5183,5183]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55671702 TAAACACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAGACACTAGGGATCACTAGAT 55671761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAACACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAGACACTAGGGATCACTAGAT 60

 55671762 GAGGGAAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGG 55671821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGGAAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGG 120

 55671822 CCTGGGAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAAC 55671881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGGGAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAAC 180

 55671882 AAACCTGCACATGTACCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATA 55671941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACCTGCACATGTACCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATA 240

 55671942 TCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAA 55672001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAA 300

 55672002 TATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTC 55672061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTC 360

 55672062 AAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCT 55672121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCT 420

 55672122 CTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAAT 55672181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAAT 480

 55672182 TCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGA 55672241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGA 540

 55672242 AAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAA 55672301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAA 600

 55672302 CTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGT 55672361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGT 660

 55672362 TTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCA 55672421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCA 720

 55672422 AAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGACATTTAT 55672481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGACATTTAT 780

 55672482 CTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACA 55672541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACA 840

 55672542 TTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGC 55672601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGC 900

 55672602 GAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGC 55672661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGC 960

 55672662 TGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGG 55672721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGG 1020

 55672722 GTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGG 55672781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGG 1080

 55672782 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTA 55672841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTA 1140

 55672842 TGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTT 55672901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTT 1200

 55672902 TTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTG 55672961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTG 1260

 55672962 CAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCAC 55673021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCAC 1320

 55673022 CTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAA 55673081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAA 1380

 55673082 AATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTA 55673141
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTA 1440

 55673142 CGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCA 55673201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCA 1500

 55673202 AAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTA 55673261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTA 1560

 55673262 GTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACT 55673321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACT 1620

 55673322 ATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATA 55673381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATA 1680

 55673382 TTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTA 55673441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTA 1740

 55673442 GATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTT 55673501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTT 1800

 55673502 ACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTA 55673561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTA 1860

 55673562 TCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATG 55673621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATG 1920

 55673622 AAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTAT 55673681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTAT 1980

 55673682 TAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTA 55673741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTA 2040

 55673742 AAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGG 55673801
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2041 AAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTTGTAACCTGG 2100

 55673802 GATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTG 55673861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTG 2160

 55673862 TCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCC 55673921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCC 2220

 55673922 TACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCT 55673981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCT 2280

 55673982 GGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGC 55674041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGC 2340

 55674042 CAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTA 55674101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTA 2400

 55674102 AAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGC 55674161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGC 2460

 55674162 AATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGA 55674221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGA 2520

 55674222 TTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGT 55674281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGT 2580

 55674282 TACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACA 55674341
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2581 TACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGGCA 2640

 55674342 AGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCT 55674401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCT 2700

 55674402 TTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATT 55674461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATT 2760

 55674462 GCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAA 55674521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAA 2820

 55674522 TTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGT 55674581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGT 2880

 55674582 CATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAG 55674641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAG 2940

 55674642 TTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGG 55674701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGG 3000

 55674702 AGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAG 55674761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAG 3060

 55674762 TGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATT 55674821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATT 3120

 55674822 CTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAA 55674881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAA 3180

 55674882 AATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCC 55674941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3181 AATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCC 3240

 55674942 TGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAA 55675001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAA 3300

 55675002 TAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTT 55675061
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3301 TAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTT 3360

 55675062 ATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTT 55675121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTT 3420

 55675122 TACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTT 55675181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTT 3480

 55675182 CGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATT 55675241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATT 3540

 55675242 TGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCT 55675301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCT 3600

 55675302 GAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGG 55675361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGG 3660

 55675362 AAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTC 55675421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTC 3720

 55675422 TCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGA 55675481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGA 3780

 55675482 CTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAA 55675541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAA 3840

 55675542 GTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACT 55675601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACT 3900

 55675602 TCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAG 55675661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAG 3960

 55675662 GATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTT 55675721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTT 4020

 55675722 TCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATC 55675781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATC 4080

 55675782 ACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAG 55675841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAG 4140

 55675842 CTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTG 55675901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTG 4200

 55675902 AAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCT 55675961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCT 4260

 55675962 CCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTT 55676021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTT 4320

 55676022 AATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACT 55676081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACT 4380

 55676082 AGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGT 55676141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGT 4440

 55676142 TGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCC 55676201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCC 4500

 55676202 TAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAA 55676261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAA 4560

 55676262 TGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAG 55676321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAG 4620

 55676322 CTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTA 55676381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTA 4680

 55676382 GGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCA 55676441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCA 4740

 55676442 TTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAAT 55676501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAAT 4800

 55676502 TCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACA 55676561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACA 4860

 55676562 TGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTT 55676621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTT 4920

 55676622 TCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTC 55676681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTC 4980

 55676682 TTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTC 55676741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTC 5040

 55676742 TCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGT 55676801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGT 5100

 55676802 GGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGAT 55676861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGAT 5160

 55676862 GTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          ||||||||||||||||||||||
     5161 GTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 5182

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5183 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 5242

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5243 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 5302

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5303 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 5362

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5363 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 5422

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5423 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 5482

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5483 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 5542

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5543 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 5602

 55678209 AGATT 55678213
          |||||
     5603 AGATT 5607

Alignment time is 4.6235 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5060] =>      5060 nucs 'mol-32-206b-010888_5060'

Score:        5026
Aligned:      5059        nucs
Identic:      5056 (100%) nucs =>      1364 (100%)      3692 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55676319,55677682] EXCISED REGION [55677685,55681378]
 second seq =>  [       1,    1364] EXCISED REGION [    1366,    5060]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [1365,1365]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55676319 AAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCC 55676378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCC 60

 55676379 CTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACC 55676438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACC 120

 55676439 CCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGA 55676498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGA 180

 55676499 AATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGA 55676558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGA 240

 55676559 ACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTC 55676618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTC 300

 55676619 TTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCT 55676678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCT 360

 55676679 GTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTT 55676738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTT 420

 55676739 CTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTG 55676798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTG 480

 55676799 GGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAA 55676858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAA 540

 55676859 GATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACA 55676918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACA 600

 55676919 GAAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTC 55676978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTC 660

 55676979 TCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACC 55677038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACC 720

 55677039 TCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCT 55677098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCT 780

 55677099 GCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGC 55677158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGC 840

 55677159 CAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGG 55677218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGG 900

 55677219 GATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATA 55677278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATA 960

 55677279 AAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGG 55677338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGG 1020

 55677339 CTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAG 55677398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAG 1080

 55677399 CAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGC 55677458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGC 1140

 55677459 CACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAAT 55677518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAAT 1200

 55677519 TAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATAC 55677578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATAC 1260

 55677579 AGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGA 55677638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGA 1320

 55677639 GCATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 1364

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTC-TTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 55677743
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 1425

 55677744 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 55677803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 1485

 55677804 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 55677863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 1545

 55677864 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 55677923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 1605

 55677924 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 55677983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 1665

 55677984 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 55678043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 1725

 55678044 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 55678103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 1785

 55678104 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 55678163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 1845

 55678164 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 55678223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 1905

 55678224 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 55678283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 1965

 55678284 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 55678343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 2025

 55678344 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 55678403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 2085

 55678404 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 55678463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 2145

 55678464 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATT 55678523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATT 2205

 55678524 TATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAA 55678583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAA 2265

 55678584 CATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAG 55678643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAG 2325

 55678644 AAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTT 55678703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 AAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTT 2385

 55678704 CCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCT 55678763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 CCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCT 2445

 55678764 ATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATG 55678823
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 ATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATG 2505

 55678824 ATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGG 55678883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 ATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGG 2565

 55678884 GAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTT 55678943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTT 2625

 55678944 TTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCAC 55679003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCAC 2685

 55679004 AAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCT 55679063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 AAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCT 2745

 55679064 GTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCC 55679123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 GTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCC 2805

 55679124 TATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTA 55679183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTA 2865

 55679184 GGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTG 55679243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTG 2925

 55679244 TCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCA 55679303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCA 2985

 55679304 ACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAA 55679363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 ACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAA 3045

 55679364 GACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGA 55679423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 GACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGA 3105

 55679424 ATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGA 55679483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 ATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGA 3165

 55679484 CTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAA 55679543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 CTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAA 3225

 55679544 GGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTC 55679603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 GGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTC 3285

 55679604 TAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTC 55679663
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3286 TAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTC 3345

 55679664 AACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTT 55679723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 AACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTT 3405

 55679724 TCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTA 55679783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 TCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTA 3465

 55679784 AGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTA 55679843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 AGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTA 3525

 55679844 TTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCA 55679903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCA 3585

 55679904 ACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCAC 55679963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 ACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCAC 3645

 55679964 TAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCC 55680023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 TAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCC 3705

 55680024 AAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTG 55680083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 AAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTG 3765

 55680084 GTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCT 55680143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 GTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCT 3825

 55680144 TAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGT 55680203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 TAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGT 3885

 55680204 TGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCA 55680263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 TGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCA 3945

 55680264 ACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGAT 55680323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 ACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGAT 4005

 55680324 TCAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGT 55680383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 TCAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGT 4065

 55680384 TCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGT 55680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 TCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGT 4125

 55680444 GTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGT 55680503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 GTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGT 4185

 55680504 CACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCA 55680563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 CACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCA 4245

 55680564 GTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAG 55680623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 GTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAG 4305

 55680624 TGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTT 55680683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 TGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTT 4365

 55680684 AATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAG 55680743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 AATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAG 4425

 55680744 ATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCAC 55680803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 ATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCAC 4485

 55680804 TGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGA 55680863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 TGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGA 4545

 55680864 GCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTT 55680923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTT 4605

 55680924 GCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAAC 55680983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 GCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAAC 4665

 55680984 AATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGA 55681043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 AATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGA 4725

 55681044 CACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCAT 55681103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 CACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCAT 4785

 55681104 TTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGT 55681163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 TTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGT 4845

 55681164 ATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAATG 55681223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 ATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAATG 4905

 55681224 AATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTAA 55681283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 AATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTAA 4965

 55681284 AAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGAT 55681343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 AAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGAT 5025

 55681344 AGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACT 55681378
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 AGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACT 5060

Alignment time is 3.76652 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5702] =>      5702 nucs 'mol-32-2202-015817_5702'

Score:        5603
Aligned:      5702        nucs
Identic:      5693 (100%) nucs =>      3277 (100%)      2416 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673604,55676883] EXCISED REGION [55677789,55680210]
 second seq =>  [       1,    3280] EXCISED REGION [    3281,    5702]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [3280,3280] to [3281,3281]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55673604 AATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGAT 55673663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGAT 60

 55673664 TTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAA 55673723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAA 120

 55673724 TACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAA 55673783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAA 180

 55673784 CAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATG 55673843
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATG 240

 55673844 GTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAG 55673903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAG 300

 55673904 AATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAAT 55673963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAAT 360

 55673964 CACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAAT 55674023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAAT 420

 55674024 TTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACA 55674083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACA 480

 55674084 ATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACA 55674143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACA 540

 55674144 TATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGT 55674203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGT 600

 55674204 CTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCA 55674263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCA 660

 55674264 TGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCT 55674323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCT 720

 55674324 TGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACAC 55674383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACAC 780

 55674384 AGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCA 55674443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCA 840

 55674444 TCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCC 55674503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCC 900

 55674504 CTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAA 55674563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAA 960

 55674564 AACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAA 55674623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAA 1020

 55674624 ATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGA 55674683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGA 1080

 55674684 TGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTA 55674743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTA 1140

 55674744 GACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTA 55674803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTA 1200

 55674804 AACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGC 55674863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGC 1260

 55674864 TCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAG 55674923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAG 1320

 55674924 AAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAG 55674983
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAG 1380

 55674984 AATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGC 55675043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1381 AATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGC 1440

 55675044 TCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTT 55675103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTT 1500

 55675104 TCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGG 55675163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGG 1560

 55675164 ATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTG 55675223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTG 1620

 55675224 TGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAA 55675283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAA 1680

 55675284 ATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATA 55675343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATA 1740

 55675344 ATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGC 55675403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGC 1800

 55675404 TTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTA 55675463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTA 1860

 55675464 TTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGT 55675523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGT 1920

 55675524 AGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGA 55675583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGA 1980

 55675584 AGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTT 55675643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTT 2040

 55675644 TTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATT 55675703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATT 2100

 55675704 CTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAG 55675763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAG 2160

 55675764 CTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTT 55675823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTT 2220

 55675824 ACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTAC 55675883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTAC 2280

 55675884 CAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACAC 55675943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACAC 2340

 55675944 TATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTC 55676003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTC 2400

 55676004 TCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATC 55676063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATC 2460

 55676064 CAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTT 55676123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTT 2520

 55676124 TACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGAC 55676183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGAC 2580

 55676184 TGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGT 55676243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGT 2640

 55676244 GGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTG 55676303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTG 2700

 55676304 GAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGAT 55676363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGAT 2760

 55676364 GTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGA 55676423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGA 2820

 55676424 GGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCC 55676483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCC 2880

 55676484 TGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGA 55676543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGA 2940

 55676544 TTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTAC 55676603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTAC 3000

 55676604 TCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAA 55676663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAA 3060

 55676664 TATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGG 55676723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGG 3120

 55676724 CAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAG 55676783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAG 3180

 55676784 GAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATA 55676843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATA 3240

 55676844 AACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 3280

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 3340

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 3400

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 3460

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 3520

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 3580

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 3640

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 3700

 55678209 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 55678268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 3760

 55678269 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 55678328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 3820

 55678329 ATTATTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 55678388
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 ATTCTTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 3880

 55678389 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 55678448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 3940

 55678449 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 55678508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 4000

 55678509 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 55678568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 4060

 55678569 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 55678628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 4120

 55678629 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 55678688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4121 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATAAGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 4180

 55678689 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 55678748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 4240

 55678749 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTT 55678808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4241 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTT 4300

 55678809 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 55678868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 4360

 55678869 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 55678928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 4420

 55678929 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 55678988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 4480

 55678989 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 55679048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 4540

 55679049 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 55679108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 4600

 55679109 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 55679168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 4660

 55679169 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 55679228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 4720

 55679229 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 55679288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 4780

 55679289 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 55679348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 4840

 55679349 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 55679408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 4900

 55679409 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 55679468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 4960

 55679469 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 55679528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 5020

 55679529 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 55679588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 5080

 55679589 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAG 55679648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5081 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAG 5140

 55679649 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 55679708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 5200

 55679709 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 55679768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 5260

 55679769 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 55679828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 5320

 55679829 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 55679888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 5380

 55679889 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 55679948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 5440

 55679949 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 55680008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 5500

 55680009 CCACATTAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAA 55680068
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5501 CCACATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCAAAAA 5560

 55680069 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 55680128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 5620

 55680129 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 55680188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 5680

 55680189 TTTTAGGACGGAAGTTGAACAT 55680210
          ||||||||||||||||||||||
     5681 TTTTAGGACGGAAGTTGAACAT 5702

Alignment time is 4.20674 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2422] =>      2422 nucs 'mol-32-2202-015817_2422'

Score:        2366
Aligned:      2421        nucs
Identic:      2416 (100%) nucs =>       543 (100%)      1873 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55677789,55678331] EXCISED REGION [55678333,55680210]
 second seq =>  [       1,     543] EXCISED REGION [     545,    2422]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55678332,55678332]
 second seq =>         1 nucs [544,544]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55678330,55678331] to [55678333,55678334]
 second seq =>         2 nucs [542,543] to [545,546]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 60

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 120

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 180

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 240

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 300

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 360

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 420

 55678209 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 55678268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 480

 55678269 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 55678328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 540

 55678329 ATT 55678331
          |||
      541 ATT 543

EXCISED REGION

 55678333 TTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTT 55678392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 TTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTT 604

 55678393 ATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCC 55678452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 ATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCC 664

 55678453 TTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATT 55678512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 TTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATT 724

 55678513 TTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAAT 55678572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 TTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAAT 784

 55678573 TCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGG 55678632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGG 844

 55678633 TATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTT 55678692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      845 TATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATAAGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTT 904

 55678693 TGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTT 55678752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 TGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTT 964

 55678753 TTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTTTGCA 55678812
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      965 TTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTTTGCA 1024

 55678813 TTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATG 55678872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 TTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATG 1084

 55678873 TCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTT 55678932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 TCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTT 1144

 55678933 GTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGAT 55678992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 GTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGAT 1204

 55678993 ATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATT 55679052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 ATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATT 1264

 55679053 TCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTC 55679112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 TCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTC 1324

 55679113 ATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTAT 55679172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 ATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTAT 1384

 55679173 GTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGA 55679232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 GTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGA 1444

 55679233 GTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATC 55679292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 GTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATC 1504

 55679293 CAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTG 55679352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 CAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTG 1564

 55679353 TCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACT 55679412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 TCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACT 1624

 55679413 CACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGAC 55679472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 CACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGAC 1684

 55679473 ACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTT 55679532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 ACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTT 1744

 55679533 AGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATT 55679592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 AGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATT 1804

 55679593 GAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAGTCAC 55679652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1805 GAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAGTCAC 1864

 55679653 TGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTT 55679712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 TGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTT 1924

 55679713 GAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAAT 55679772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 GAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAAT 1984

 55679773 ACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAAT 55679832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 ACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAAT 2044

 55679833 TCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACAT 55679892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACAT 2104

 55679893 TTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGA 55679952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGA 2164

 55679953 CCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCAC 55680012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 CCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCAC 2224

 55680013 ATTAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGT 55680072
          ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2225 ATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCAAAAAAAGT 2284

 55680073 TTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTT 55680132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTT 2344

 55680133 TTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTT 55680192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTT 2404

 55680193 AGGACGGAAGTTGAACAT 55680210
          ||||||||||||||||||
     2405 AGGACGGAAGTTGAACAT 2422

Alignment time is 1.81422 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3591] =>      3591 nucs 'mol-32-229c-041375_3591'

Score:        3557
Aligned:      3590        nucs
Identic:      3587 (100%) nucs =>        91 (100%)      3496 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55677592,55677682] EXCISED REGION [55677685,55681182]
 second seq =>  [       1,      91] EXCISED REGION [      93,    3591]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [92,92]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55677592 GGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGAC 55677651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGAC 60

 55677652 AATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          |||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 91

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTC-TTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 55677743
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
       93 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 152

 55677744 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 55677803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      153 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 212

 55677804 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 55677863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      213 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 272

 55677864 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 55677923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      273 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 332

 55677924 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 55677983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      333 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 392

 55677984 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 55678043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      393 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 452

 55678044 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 55678103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      453 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 512

 55678104 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 55678163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      513 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 572

 55678164 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 55678223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      573 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 632

 55678224 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 55678283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      633 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 692

 55678284 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 55678343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      693 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 752

 55678344 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 55678403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 812

 55678404 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 55678463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      813 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 872

 55678464 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATT 55678523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATT 932

 55678524 TATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAA 55678583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 TATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAA 992

 55678584 CATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAG 55678643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 CATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAG 1052

 55678644 AAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTT 55678703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 AAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTT 1112

 55678704 CCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCT 55678763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 CCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCT 1172

 55678764 ATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATG 55678823
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 ATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATG 1232

 55678824 ATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGG 55678883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 ATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGG 1292

 55678884 GAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTT 55678943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 GAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTT 1352

 55678944 TTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCAC 55679003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 TTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCAC 1412

 55679004 AAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCT 55679063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 AAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCT 1472

 55679064 GTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCC 55679123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 GTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCC 1532

 55679124 TATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTA 55679183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 TATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTA 1592

 55679184 GGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTG 55679243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 GGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTG 1652

 55679244 TCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCA 55679303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 TCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCA 1712

 55679304 ACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAA 55679363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 ACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAA 1772

 55679364 GACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGA 55679423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 GACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGA 1832

 55679424 ATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGA 55679483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 ATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGA 1892

 55679484 CTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAA 55679543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 CTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAA 1952

 55679544 GGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTC 55679603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 GGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTC 2012

 55679604 TAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTC 55679663
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2013 TAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTC 2072

 55679664 AACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTT 55679723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 AACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTT 2132

 55679724 TCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTA 55679783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 TCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTA 2192

 55679784 AGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTA 55679843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 AGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTA 2252

 55679844 TTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCA 55679903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCA 2312

 55679904 ACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCAC 55679963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 ACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCAC 2372

 55679964 TAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCC 55680023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 TAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCC 2432

 55680024 AAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTG 55680083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 AAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTG 2492

 55680084 GTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCT 55680143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 GTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCT 2552

 55680144 TAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGT 55680203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 TAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGT 2612

 55680204 TGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCA 55680263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 TGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCA 2672

 55680264 ACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGAT 55680323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 ACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGAT 2732

 55680324 TCAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGT 55680383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 TCAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGT 2792

 55680384 TCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGT 55680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGT 2852

 55680444 GTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGT 55680503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGT 2912

 55680504 CACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCA 55680563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 CACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCA 2972

 55680564 GTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAG 55680623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAG 3032

 55680624 TGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTT 55680683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 TGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTT 3092

 55680684 AATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAG 55680743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 AATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAG 3152

 55680744 ATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCAC 55680803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 ATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCAC 3212

 55680804 TGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGA 55680863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 TGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGA 3272

 55680864 GCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTT 55680923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 GCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTT 3332

 55680924 GCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAAC 55680983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 GCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAAC 3392

 55680984 AATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGA 55681043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 AATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGA 3452

 55681044 CACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCAT 55681103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 CACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCAT 3512

 55681104 TTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGT 55681163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 TTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGT 3572

 55681164 ATAAAGGCATTTCTGGGAG 55681182
          |||||||||||||||||||
     3573 ATAAAGGCATTTCTGGGAG 3591

Alignment time is 2.73971 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2398] =>      2398 nucs 'mol-32-2383-070934_2398'

Score:        2375
Aligned:      2397        nucs
Identic:      2395 (100%) nucs =>      1898 (100%)       497 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55675785,55677682] EXCISED REGION [55677685,55678182]
 second seq =>  [       1,    1898] EXCISED REGION [    1900,    2398]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [1899,1899]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55675785 GCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTT 55675844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTT 60

 55675845 ATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAA 55675904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAA 120

 55675905 TATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCT 55675964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCT 180

 55675965 GGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAAT 55676024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAAT 240

 55676025 AAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGA 55676084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGA 300

 55676085 AAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGA 55676144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGA 360

 55676145 CCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAG 55676204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAG 420

 55676205 GCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGA 55676264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGA 480

 55676265 ATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTC 55676324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTC 540

 55676325 ATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGG 55676384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGG 600

 55676385 CCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTC 55676444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTC 660

 55676445 CTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCA 55676504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCA 720

 55676505 CTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGC 55676564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGC 780

 55676565 AAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCT 55676624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCT 840

 55676625 CTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTT 55676684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTT 900

 55676685 CTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCG 55676744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCG 960

 55676745 TCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGT 55676804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGT 1020

 55676805 TCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTT 55676864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTT 1080

 55676865 TTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATT 55676924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATT 1140

 55676925 TTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTC 55676984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTC 1200

 55676985 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGG 55677044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGG 1260

 55677045 GTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACC 55677104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACC 1320

 55677105 ACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGAT 55677164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGAT 1380

 55677165 GGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 55677224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 1440

 55677225 AGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAG 55677284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAG 1500

 55677285 GTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGC 55677344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGC 1560

 55677345 TCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAG 55677404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAG 1620

 55677405 TGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGC 55677464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGC 1680

 55677465 CCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGG 55677524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGG 1740

 55677525 GTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTA 55677584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTA 1800

 55677585 AGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGG 55677644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGG 1860

 55677645 TGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 1898

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTC-TTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 55677743
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 1959

 55677744 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 55677803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 2019

 55677804 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 55677863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 2079

 55677864 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 55677923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 2139

 55677924 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 55677983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 2199

 55677984 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 55678043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 2259

 55678044 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 55678103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2260 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACGTATCTATGATTTCA 2319

 55678104 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 55678163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 2379

 55678164 GTAAACAATATTAACTGTA 55678182
          |||||||||||||||||||
     2380 GTAAACAATATTAACTGTA 2398

Alignment time is 1.78906 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6675] =>      6675 nucs 'mol-32-2399-051067_6675'

Score:        6576
Aligned:      6675        nucs
Identic:      6666 (100%) nucs =>      2440 (100%)      4226 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55674442,55676883] EXCISED REGION [55677789,55682020]
 second seq =>  [       1,    2442] EXCISED REGION [    2443,    6675]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [2442,2442] to [2443,2443]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55674442 CATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTG 55674501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTG 60

 55674502 CCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTC 55674561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTC 120

 55674562 AAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCC 55674621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCC 180

 55674622 AAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTG 55674681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTG 240

 55674682 GATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATT 55674741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATT 300

 55674742 TAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCAC 55674801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCAC 360

 55674802 TAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAG 55674861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAG 420

 55674862 GCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCA 55674921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCA 480

 55674922 AGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCT 55674981
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCT 540

 55674982 AGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTT 55675041
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      541 AGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTA 600

 55675042 GCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTC 55675101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTC 660

 55675102 TTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAAT 55675161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAAT 720

 55675162 GGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATC 55675221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATC 780

 55675222 TGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTA 55675281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTA 840

 55675282 AAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGA 55675341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGA 900

 55675342 TAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCT 55675401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCT 960

 55675402 GCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTC 55675461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTC 1020

 55675462 TATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTT 55675521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTT 1080

 55675522 GTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGG 55675581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGG 1140

 55675582 GAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTT 55675641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTT 1200

 55675642 TTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAA 55675701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAA 1260

 55675702 TTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTT 55675761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTT 1320

 55675762 AGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGC 55675821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGC 1380

 55675822 TTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGT 55675881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGT 1440

 55675882 ACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAAC 55675941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAAC 1500

 55675942 ACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTC 55676001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTC 1560

 55676002 TCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAA 55676061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAA 1620

 55676062 TCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCC 55676121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCC 1680

 55676122 TTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGG 55676181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGG 1740

 55676182 ACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCA 55676241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCA 1800

 55676242 GTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAG 55676301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAG 1860

 55676302 TGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAG 55676361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAG 1920

 55676362 ATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGG 55676421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGG 1980

 55676422 GAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGT 55676481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGT 2040

 55676482 CCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACA 55676541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACA 2100

 55676542 GATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCT 55676601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCT 2160

 55676602 ACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTA 55676661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTA 2220

 55676662 AATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTT 55676721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTT 2280

 55676722 GGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATT 55676781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATT 2340

 55676782 AGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGA 55676841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGA 2400

 55676842 TAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 2442

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 2502

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 2562

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 2622

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 2682

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 2742

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 2802

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 2862

 55678209 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 55678268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 2922

 55678269 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 55678328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 2982

 55678329 ATTATTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 55678388
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 ATTCTTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 3042

 55678389 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 55678448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 3102

 55678449 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 55678508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 3162

 55678509 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 55678568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 3222

 55678569 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 55678628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 3282

 55678629 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 55678688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3283 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATAAGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 3342

 55678689 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 55678748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 3402

 55678749 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTT 55678808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3403 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTT 3462

 55678809 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 55678868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 3522

 55678869 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 55678928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 3582

 55678929 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 55678988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 3642

 55678989 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 55679048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 3702

 55679049 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 55679108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 3762

 55679109 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 55679168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 3822

 55679169 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 55679228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 3882

 55679229 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 55679288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 3942

 55679289 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 55679348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 4002

 55679349 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 55679408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 4062

 55679409 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 55679468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 4122

 55679469 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 55679528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 4182

 55679529 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 55679588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 4242

 55679589 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAG 55679648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4243 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAG 4302

 55679649 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 55679708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 4362

 55679709 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 55679768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 4422

 55679769 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 55679828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 4482

 55679829 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 55679888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 4542

 55679889 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 55679948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 4602

 55679949 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 55680008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 4662

 55680009 CCACATTAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAA 55680068
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4663 CCACATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCAAAAA 4722

 55680069 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 55680128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 4782

 55680129 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 55680188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 4842

 55680189 TTTTAGGACGGAAGTTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTA 55680248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 TTTTAGGACGGAAGTTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTA 4902

 55680249 GCCCTTCAATGGCCAACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCT 55680308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 GCCCTTCAATGGCCAACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCT 4962

 55680309 GGTTGTTTCCATGATTCAGACAGG-TTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTC 55680367
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 GGTTGTTTCCATGATTCAGACAGGTTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTC 5022

 55680368 CATTTGTATACTTTGTTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACA 55680427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 CATTTGTATACTTTGTTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACA 5082

 55680428 GTTGATTCAGAATAGTGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTT 55680487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 GTTGATTCAGAATAGTGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTT 5142

 55680488 ATAAAATCTCTCAGGTCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCA 55680547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 ATAAAATCTCTCAGGTCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCA 5202

 55680548 AAAAAGTATTATTTCAGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTAT 55680607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 AAAAAGTATTATTTCAGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTAT 5262

 55680608 ACTCCTTTAAGACAAGTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCC 55680667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 ACTCCTTTAAGACAAGTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCC 5322

 55680668 AATCAGTATTTCAGTTAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCA 55680727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 AATCAGTATTTCAGTTAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCA 5382

 55680728 TAGAGCACATATAAAGATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTT 55680787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 TAGAGCACATATAAAGATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTT 5442

 55680788 CAATGAAAGTGTTCACTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAA 55680847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 CAATGAAAGTGTTCACTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAA 5502

 55680848 ATATGTTTGTAAAGGAGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACT 55680907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 ATATGTTTGTAAAGGAGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACT 5562

 55680908 TCATTTTTTATACCTTGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGG 55680967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 TCATTTTTTATACCTTGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGG 5622

 55680968 ATGCATGAATCGGAACAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTG 55681027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 ATGCATGAATCGGAACAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTG 5682

 55681028 AAATTCCCCATTAAGACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGA 55681087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 AAATTCCCCATTAAGACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGA 5742

 55681088 TAGATGAAAGTGTCATTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACAT 55681147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 TAGATGAAAGTGTCATTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACAT 5802

 55681148 CCTGGCAGACACATGTATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAA 55681207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 CCTGGCAGACACATGTATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAA 5862

 55681208 CAGTATCAATCCAATGAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTAT 55681267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 CAGTATCAATCCAATGAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTAT 5922

 55681268 TAAGATTCACGTGTAAAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAA 55681327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 TAAGATTCACGTGTAAAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAA 5982

 55681328 TGTTAATTCAATGGATAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGA 55681387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 TGTTAATTCAATGGATAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGA 6042

 55681388 CATTAGATGTTTCTAAGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTG 55681447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 CATTAGATGTTTCTAAGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTG 6102

 55681448 AATGGAAGGTCTCTCCACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAA 55681507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 AATGGAAGGTCTCTCCACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAA 6162

 55681508 TACACTTCTAAGACTGCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGA 55681567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 TACACTTCTAAGACTGCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGA 6222

 55681568 AATGCTCATCAATTCTGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCT 55681627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 AATGCTCATCAATTCTGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCT 6282

 55681628 AAGAATGCGAGTTGCACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTT 55681687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 AAGAATGCGAGTTGCACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTT 6342

 55681688 AAACCTTAAAATTTATTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTC 55681747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 AAACCTTAAAATTTATTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTC 6402

 55681748 TAGTTGCACATGTGATTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 55681807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 TAGTTGCACATGTGATTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 6462

 55681808 CATGTAAAACACTTAGTAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTAT 55681867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 CATGTAAAACACTTAGTAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTAT 6522

 55681868 GATTGAGAACAGCGTTGCTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATG 55681927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 GATTGAGAACAGCGTTGCTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATG 6582

 55681928 CTCTTATGACAAATGTATAAAATATATCTCCAAGAGTGTTAGTTGTATTCAATTCAGAAT 55681987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 CTCTTATGACAAATGTATAAAATATATCTCCAAGAGTGTTAGTTGTATTCAATTCAGAAT 6642

 55681988 ATTTTTATTTTATGGAAGTGTTCACTTTTATGT 55682020
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 ATTTTTATTTTATGGAAGTGTTCACTTTTATGT 6675

Alignment time is 5.62418 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2443] =>      2443 nucs 'mol-32-2399-051067_2443'

Score:        2431
Aligned:      2442        nucs
Identic:      2441 (100%) nucs =>       491 (100%)      1950 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55674442,55674932] EXCISED REGION [55674934,55676884]
 second seq =>  [       1,     491] EXCISED REGION [     493,    2443]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55674933,55674933]
 second seq =>         1 nucs [492,492]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55674932,55674932] to [55674933,55674933]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55674442 CATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTG 55674501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTG 60

 55674502 CCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTC 55674561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTC 120

 55674562 AAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCC 55674621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCC 180

 55674622 AAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTG 55674681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTG 240

 55674682 GATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATT 55674741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATT 300

 55674742 TAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCAC 55674801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCAC 360

 55674802 TAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAG 55674861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAG 420

 55674862 GCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCA 55674921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCA 480

 55674922 AGAAAGACAGC 55674932
          |||||||||||
      481 AGAAAGACAGC 491

EXCISED REGION

 55674934 ATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAAC 55674993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 ATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAAC 552

 55674994 AACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTG 55675053
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      553 AACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTG 612

 55675054 ACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATA 55675113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 ACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATA 672

 55675114 ACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATT 55675173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 ACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATT 732

 55675174 TTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGG 55675233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 TTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGG 792

 55675234 GAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAA 55675293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 GAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAA 852

 55675294 ATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTT 55675353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 ATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTT 912

 55675354 GACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATA 55675413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 GACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATA 972

 55675414 GTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAG 55675473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 GTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAG 1032

 55675474 TATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGA 55675533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 TATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGA 1092

 55675534 AGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTG 55675593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 AGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTG 1152

 55675594 CTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGAT 55675653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 CTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGAT 1212

 55675654 GTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAG 55675713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 GTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAG 1272

 55675714 GCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTC 55675773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 GCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTC 1332

 55675774 TAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACC 55675833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 TAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACC 1392

 55675834 CCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTT 55675893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 CCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTT 1452

 55675894 CAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAA 55675953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 CAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAA 1512

 55675954 TGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCA 55676013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 TGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCA 1572

 55676014 TTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTT 55676073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 TTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTT 1632

 55676074 AACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGG 55676133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 AACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGG 1692

 55676134 GTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATAC 55676193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 GTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATAC 1752

 55676194 CGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAG 55676253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 CGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAG 1812

 55676254 ACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTA 55676313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 ACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTA 1872

 55676314 GACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAAT 55676373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 GACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAAT 1932

 55676374 AGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAG 55676433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 AGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAG 1992

 55676434 GCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATT 55676493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 GCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATT 2052

 55676494 TTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCC 55676553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 TTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCC 2112

 55676554 CATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGA 55676613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 CATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGA 2172

 55676614 AAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTG 55676673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 AAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTG 2232

 55676674 CCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAG 55676733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 CCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAG 2292

 55676734 AACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTT 55676793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 AACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTT 2352

 55676794 ATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATA 55676853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 ATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATA 2412

 55676854 TAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTT 55676884
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTT 2443

Alignment time is 1.81774 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6656] =>      6656 nucs 'mol-32-23a4-041193_6656'

Score:        6500
Aligned:      6660        nucs
Identic:      6643 (100%) nucs =>      6416 (100%)       227 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55670452,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678015]
 second seq =>  [       1,    6429] EXCISED REGION [    6430,    6656]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [6429,6429] to [6430,6430]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55670452 AAACAGAGCCCGAATAGCCAAAGCAATTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAGCCATAGGCATC 55670511
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
        1 AAACAGAGCCCGAATAGCCAAAGCAATTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAGCCGTAGGCATC 60

 55670512 ATATTGCTTGACTTCAAACTCTACTACAGTATACAGCTACCGTAATCAAAACAGCATGAT 55670571
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTGCTTAACTTCAAACTCTACTACAGTATACAGCTACCGTAATCAAAACAGCATGAT 120

 55670572 ACTGGTACAAAAACAGACAGTGGAACAGAATGGAAAACCCAGAAATCTACCTGCACACCT 55670631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTGGTACAAAAACAGACAGTGGAACAGAATGGAAAACCCAGAAATCTACCTGCACACCT 180

 55670632 ACAACCATCTGACAAAATCAACACAAATAAGCAGCAGGGAAAGGAGTCTCTATTCAAAGA 55670691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAACCATCTGACAAAATCAACACAAATAAGCAGCAGGGAAAGGAGTCTCTATTCAAAGA 240

 55670692 ATGGTGGTGGAATATCTGCCTAGGCATATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAACTCTC 55670751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGTGGTGGAATATCTGCCTAGGCATATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAACTCTC 300

 55670752 ACCATACTCAAAAATGAACTCAAGATGGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAAACTAT 55670811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCATACTCAAAAATGAACTCAAGATGGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAAACTAT 360

 55670812 AAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAAATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATGATT 55670871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAAATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATGATT 420

 55670872 TATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTACGACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTAATT 55670931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTACGACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTAATT 480

 55670932 AAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGCCTACA 55670991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGCCTACA 540

 55670992 AAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTATGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTACAAGG 55671051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTATGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTACAAGG 600

 55671052 AACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAA-CCAATTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAACACTT 55671110
          ||||||||||||||||||||||||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAAACCAGTTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAACACTT 660

 55671111 TTCAAAAGGAGACATACACATGGCCAAAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTACTAAT 55671170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCAAAAGGAGACATACACATGGCCAAAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTACTAAT 720

 55671171 CATCAGAGACATACAAATCAAAACCAAGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAATGGC 55671230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCAGAGACATACAAATCAAAACCAAGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAATGGC 780

 55671231 AATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAACAGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAATGC 55671290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAACAGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAATGC 840

 55671291 TTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAGCTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGCTGTTTGGAGAT 55671350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      841 TTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAGCTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGTTGTTTGGAGAT 900

 55671351 TTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCACCATTCAGTGCTGCAATCCCGCTACTGGGTATAT 55671410
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||
      901 TTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCACCATTCAATGCTGCAATCCCACTACTGGGTATAT 960

 55671411 ACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTATCATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATTGCAG 55671470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTATCATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATTGCAG 1020

 55671471 CACTACTCACAATAGTAAGGACATAGAAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTGGA 55671530
          |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACTATTCACAATAGCAAGGACATAGAAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTGGA 1080

 55671531 TAAAGGATATGTGGTACACATACACCATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAATGGAA 55671590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAAGGATATGTGGTACACATACACCATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAATGGAA 1140

 55671591 TCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACCTA 55671650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACCTA 1200

 55671651 AAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACACATGTTCTCACTTACAGGTGGGAGCTAAACACTG 55671710
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||
     1201 AAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACACATGTTCTCAC----AGGTGGGAGCTAAACACTG 1256

 55671711 AAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAAGG 55671770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAAGG 1316

 55671771 AGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGAGA 55671830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 AGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGAGA 1376

 55671831 TGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCA 55671890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCA 1436

 55671891 CATGTACCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATA 55671950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 CATGTACCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATA 1496

 55671951 AAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAAT 55672010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAAT 1556

 55672011 AGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTG 55672070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 AGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTG 1616

 55672071 AGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGG 55672130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 AGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGG 1676

 55672131 AGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTG 55672190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTG 1736

 55672191 TCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCA 55672250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCA 1796

 55672251 ATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTA 55672310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 ATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTA 1856

 55672311 CTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTAT 55672370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 CTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTAT 1916

 55672371 ACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATAT 55672430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 ACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATAT 1976

 55672431 TACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACA 55672490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACA 2036

 55672491 CAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTT 55672550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 CAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTT 2096

 55672551 CCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGC 55672610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGC 2156

 55672611 TCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTAC 55672670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTAC 2216

 55672671 AGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCA 55672730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCA 2276

 55672731 TATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAA 55672790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAA 2336

 55672791 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAA 55672850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAA 2396

 55672851 GTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTA 55672910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTA 2456

 55672911 CTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTC 55672970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTC 2516

 55672971 AACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTC 55673030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 AACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTC 2576

 55673031 CCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTC 55673090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTC 2636

 55673091 CCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACA 55673150
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CCTTTCAATTTAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACA 2696

 55673151 GGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGG 55673210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGG 2756

 55673211 AATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAA 55673270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAA 2816

 55673271 ATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCT 55673330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCT 2876

 55673331 CAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTC 55673390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTC 2936

 55673391 CTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCAT 55673450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCAT 2996

 55673451 TTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTAT 55673510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTAT 3056

 55673511 AATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACT 55673570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACT 3116

 55673571 AAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGA 55673630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 AAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGA 3176

 55673631 TATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCAT 55673690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCAT 3236

 55673691 GATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATAC 55673750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATAC 3296

 55673751 TTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGA 55673810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3297 TTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGA 3356

 55673811 GATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATG 55673870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATG 3416

 55673871 TCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTA 55673930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTA 3476

 55673931 GGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGT 55673990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGT 3536

 55673991 CTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTA 55674050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTA 3596

 55674051 AATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAA 55674110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAA 3656

 55674111 AAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGT 55674170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 AAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGT 3716

 55674171 CCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAAC 55674230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAAC 3776

 55674231 CATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGG 55674290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGG 3836

 55674291 GTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGC 55674350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 GTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGC 3896

 55674351 TTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCA 55674410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCA 3956

 55674411 TGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATG 55674470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 TGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATG 4016

 55674471 GCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGA 55674530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 GCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGA 4076

 55674531 CACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTA 55674590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 CACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTA 4136

 55674591 GCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTT 55674650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTT 4196

 55674651 ACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAG 55674710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 ACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAG 4256

 55674711 AGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACT 55674770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 AGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACT 4316

 55674771 TGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAA 55674830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 TGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAA 4376

 55674831 GACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTC 55674890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTC 4436

 55674891 AAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCT 55674950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4437 AAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCT 4496

 55674951 TGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGG 55675010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 TGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGG 4556

 55675011 ATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCT 55675070
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4557 ATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCT 4616

 55675071 TATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGG 55675130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGG 4676

 55675131 GCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGA 55675190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 GCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGA 4736

 55675191 AGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAA 55675250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 AGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAA 4796

 55675251 TAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATA 55675310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATA 4856

 55675311 TGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAG 55675370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAG 4916

 55675371 CTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTA 55675430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 CTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTA 4976

 55675431 TAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGC 55675490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 TAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGC 5036

 55675491 CTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTA 55675550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 CTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTA 5096

 55675551 GTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCA 55675610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 GTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCA 5156

 55675611 GGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAAC 55675670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 GGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAAC 5216

 55675671 CAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTT 55675730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 CAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTT 5276

 55675731 AAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTC 55675790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 AAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTC 5336

 55675791 AGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGT 55675850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 AGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGT 5396

 55675851 AAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCA 55675910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCA 5456

 55675911 TCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTT 55675970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 TCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTT 5516

 55675971 CCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTT 55676030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 CCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTT 5576

 55676031 AGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGA 55676090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 AGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGA 5636

 55676091 ACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTA 55676150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 ACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTA 5696

 55676151 TGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGC 55676210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 TGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGC 5756

 55676211 ACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGG 55676270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 ACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGG 5816

 55676271 GGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTC 55676330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 GGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTC 5876

 55676331 CTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCA 55676390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCA 5936

 55676391 GTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGT 55676450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 GTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGT 5996

 55676451 AATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAG 55676510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 AATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAG 6056

 55676511 GGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAG 55676570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAG 6116

 55676571 GAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCA 55676630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 GAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCA 6176

 55676631 GGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAA 55676690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 GGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAA 6236

 55676691 GAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCA 55676750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 GAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCA 6296

 55676751 GTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGC 55676810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 GTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGC 6356

 55676811 TTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGA 55676870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 TTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGA 6416

 55676871 GAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||
     6417 GAATGCAAGTAGT 6429

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 6489

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 6549

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6550 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 6609

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTAT 55678015
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6610 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTAT 6656

Alignment time is 4.82411 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4545] =>      4545 nucs 'mol-32-23ba-006184_4545'

Score:        4500
Aligned:      4544        nucs
Identic:      4540 (100%) nucs =>      3967 (100%)       573 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673713,55677682] EXCISED REGION [55677685,55678258]
 second seq =>  [       1,    3970] EXCISED REGION [    3972,    4545]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [3971,3971]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673713 TATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTA 55673772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTA 60

 55673773 TGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGC 55673832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGC 120

 55673833 TATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTAT 55673892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTAT 180

 55673893 TAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGC 55673952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGC 240

 55673953 CTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTG 55674012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTG 300

 55674013 ATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTAT 55674072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTAT 360

 55674073 ATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACA 55674132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACA 420

 55674133 TGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGG 55674192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGG 480

 55674193 GATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAG 55674252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAG 540

 55674253 TGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGT 55674312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGT 600

 55674313 ATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCAC 55674372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCAC 660

 55674373 ACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTG 55674432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTG 720

 55674433 CTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAG 55674492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAG 780

 55674493 CTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGA 55674552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGA 840

 55674553 GATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAG 55674612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAG 900

 55674613 CTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAG 55674672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAG 960

 55674673 GCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGG 55674732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGG 1020

 55674733 CTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAG 55674792
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1021 CTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCCGATATCAAGGGTGAAG 1080

 55674793 GATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTA 55674852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTA 1140

 55674853 GTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTC 55674912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTC 1200

 55674913 GTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAG 55674972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAG 1260

 55674973 GATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCT 55675032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCT 1320

 55675033 AACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTC 55675092
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTC 1380

 55675093 ATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGC 55675152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGC 1440

 55675153 CGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCA 55675212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCA 1500

 55675213 CTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGC 55675272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGC 1560

 55675273 ATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCA 55675332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCA 1620

 55675333 CAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTAT 55675392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTAT 1680

 55675393 CTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGA 55675452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGA 1740

 55675453 CACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGA 55675512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGA 1800

 55675513 AATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAG 55675572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAG 1860

 55675573 ATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAA 55675632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAA 1920

 55675633 TTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTAT 55675692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTAT 1980

 55675693 GTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAA 55675752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAA 2040

 55675753 AAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGAC 55675812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGAC 2100

 55675813 TAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGG 55675872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGG 2160

 55675873 CTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGA 55675932
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTTACTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGA 2220

 55675933 CCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAG 55675992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAG 2280

 55675993 GTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGC 55676052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGC 2340

 55676053 AGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGT 55676112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGT 2400

 55676113 CTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATG 55676172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATG 2460

 55676173 TTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCT 55676232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCT 2520

 55676233 AAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTG 55676292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTG 2580

 55676293 GAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACAC 55676352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACAC 2640

 55676353 TGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTAC 55676412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTAC 2700

 55676413 CTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAA 55676472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAA 2760

 55676473 GGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAG 55676532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAG 2820

 55676533 GGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAAT 55676592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAAT 2880

 55676593 TTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACT 55676652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACT 2940

 55676653 TTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATG 55676712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATG 3000

 55676713 AATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGA 55676772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGA 3060

 55676773 TGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTC 55676832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTC 3120

 55676833 TTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGAT 55676892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGAT 3180

 55676893 TCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTT 55676952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTT 3240

 55676953 TTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGT 55677012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGT 3300

 55677013 GATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 55677072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 3360

 55677073 CCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAG 55677132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAG 3420

 55677133 TAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCA 55677192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCA 3480

 55677193 CCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATG 55677252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATG 3540

 55677253 CAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATT 55677312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATT 3600

 55677313 AGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAAC 55677372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAAC 3660

 55677373 AACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCA 55677432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCA 3720

 55677433 CAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTT 55677492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTT 3780

 55677493 ATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAG 55677552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAG 3840

 55677553 GGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGA 55677612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGA 3900

 55677613 GCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCA 55677672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCA 3960

 55677673 CCAGGTACCG 55677682
          ||||||||||
     3961 CCAGGTACCG 3970

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 55677744
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 4031

 55677745 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 55677804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 4091

 55677805 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 55677864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 4151

 55677865 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 55677924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 4211

 55677925 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 55677984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 4271

 55677985 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 55678044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 4331

 55678045 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 55678104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 4391

 55678105 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 55678164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 4451

 55678165 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCCA 55678224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCCA 4511

 55678225 CATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCT 55678258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 CATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCT 4545

Alignment time is 3.35488 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4308] =>      4308 nucs 'mol-32-29d4-055267_4308'

Score:        4264
Aligned:      4308        nucs
Identic:      4304 (100%) nucs =>      4179 (100%)       125 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672701,55676883] EXCISED REGION [55677789,55677913]
 second seq =>  [       1,    4183] EXCISED REGION [    4184,    4308]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [4183,4183] to [4184,4184]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55672701 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGAC 55672760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGAC 60

 55672761 CTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTG 55672820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTG 120

 55672821 CCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCA 55672880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCA 180

 55672881 GTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTG 55672940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTG 240

 55672941 CTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCT 55673000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCT 300

 55673001 TGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCA 55673060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCA 360

 55673061 TCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGT 55673120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      361 TCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATGGGGTATGT 420

 55673121 TTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAA 55673180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAA 480

 55673181 TTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCC 55673240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCC 540

 55673241 TTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAA 55673300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAA 600

 55673301 AGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATT 55673360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATT 660

 55673361 TTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAA 55673420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAA 720

 55673421 TATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAG 55673480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAG 780

 55673481 ATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCA 55673540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCA 840

 55673541 GCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGT 55673600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGT 900

 55673601 ACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATA 55673660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATA 960

 55673661 GATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCC 55673720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCC 1020

 55673721 TAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCT 55673780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCT 1080

 55673781 AAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACC 55673840
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACC 1140

 55673841 ATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATT 55673900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATT 1200

 55673901 TAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCA 55673960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCA 1260

 55673961 AATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAA 55674020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAA 1320

 55674021 AATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACAT 55674080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACAT 1380

 55674081 ACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAA 55674140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAA 1440

 55674141 ACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTT 55674200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTT 1500

 55674201 GGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGT 55674260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGT 1560

 55674261 CCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCT 55674320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCT 1620

 55674321 TCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGA 55674380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGA 1680

 55674381 CACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGT 55674440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGT 1740

 55674441 CCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGT 55674500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGT 1800

 55674501 GCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATT 55674560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATT 1860

 55674561 CAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTC 55674620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTC 1920

 55674621 CAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGT 55674680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGT 1980

 55674681 GGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGAT 55674740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGAT 2040

 55674741 TTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCA 55674800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCA 2100

 55674801 CTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAA 55674860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAA 2160

 55674861 GGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCC 55674920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCC 2220

 55674921 AAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTC 55674980
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTC 2280

 55674981 TAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTT 55675040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTT 2340

 55675041 TGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTT 55675100
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTT 2400

 55675101 CTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAA 55675160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAA 2460

 55675161 TGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATAT 55675220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATAT 2520

 55675221 CTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTT 55675280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTT 2580

 55675281 AAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATG 55675340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATG 2640

 55675341 ATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTC 55675400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTC 2700

 55675401 TGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTT 55675460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTT 2760

 55675461 CTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATT 55675520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATT 2820

 55675521 TGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATG 55675580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATG 2880

 55675581 GGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTT 55675640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTT 2940

 55675641 TTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACA 55675700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACA 3000

 55675701 ATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACT 55675760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACT 3060

 55675761 TAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAG 55675820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAG 3120

 55675821 CTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTG 55675880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTG 3180

 55675881 TACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAA 55675940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAA 3240

 55675941 CACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTT 55676000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTT 3300

 55676001 CTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACA 55676060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACA 3360

 55676061 ATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCC 55676120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCC 3420

 55676121 CTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAG 55676180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAG 3480

 55676181 GACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTC 55676240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTC 3540

 55676241 AGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAA 55676300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAA 3600

 55676301 GTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGA 55676360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGA 3660

 55676361 GATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTG 55676420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTG 3720

 55676421 GGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATG 55676480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATG 3780

 55676481 TCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAAC 55676540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAAC 3840

 55676541 AGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTC 55676600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTC 3900

 55676601 TACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGT 55676660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGT 3960

 55676661 AAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACT 55676720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACT 4020

 55676721 TGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAAT 55676780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAAT 4080

 55676781 TAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTG 55676840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTG 4140

 55676841 ATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 4183

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 4243

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 4303

 55677909 ACATG 55677913
          |||||
     4304 ACATG 4308

Alignment time is 3.43284 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2759] =>      2759 nucs 'mol-32-2af2-042866_2759'

Score:        2726
Aligned:      2759        nucs
Identic:      2756 (100%) nucs =>      1054 (100%)      1702 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55675830,55676883] EXCISED REGION [55677789,55679493]
 second seq =>  [       1,    1054] EXCISED REGION [    1055,    2759]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [1054,1054] to [1055,1055]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55675830 CACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATAC 55675889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATAC 60

 55675890 ATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAA 55675949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAA 120

 55675950 TAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTAC 55676009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTAC 180

 55676010 AGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGC 55676069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGC 240

 55676070 TGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCT 55676129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCT 300

 55676130 GGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAG 55676189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAG 360

 55676190 ATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAG 55676249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAG 420

 55676250 GGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGG 55676309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGG 480

 55676310 GCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAA 55676369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAA 540

 55676370 CAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGC 55676429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGC 600

 55676430 AGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCT 55676489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCT 660

 55676490 AATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTAT 55676549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTAT 720

 55676550 TTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAA 55676609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAA 780

 55676610 TGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTC 55676669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTC 840

 55676670 CTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCA 55676729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCA 900

 55676730 TTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATA 55676789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATA 960

 55676790 GCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGA 55676849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGA 1020

 55676850 TATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 1054

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 1114

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 1174

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 1234

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 1294

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 1354

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 1414

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 1474

 55678209 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 55678268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 1534

 55678269 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 55678328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 1594

 55678329 ATTATTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 55678388
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 ATTCTTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 1654

 55678389 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 55678448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 1714

 55678449 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 55678508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 1774

 55678509 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 55678568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 1834

 55678569 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 55678628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 1894

 55678629 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 55678688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1895 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATAGGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 1954

 55678689 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 55678748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 2014

 55678749 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTT 55678808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2015 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTT 2074

 55678809 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 55678868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 2134

 55678869 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 55678928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 2194

 55678929 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 55678988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 2254

 55678989 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 55679048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 2314

 55679049 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 55679108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 2374

 55679109 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 55679168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 2434

 55679169 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 55679228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 2494

 55679229 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 55679288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 2554

 55679289 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 55679348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 2614

 55679349 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 55679408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 2674

 55679409 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 55679468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 2734

 55679469 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAAT 55679493
          |||||||||||||||||||||||||
     2735 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAAT 2759

Alignment time is 2.04922 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3698] =>      3698 nucs 'mol-32-2af2-081700_3698'

Score:        3676
Aligned:      3698        nucs
Identic:      3696 (100%) nucs =>       937 (100%)      2759 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673839,55674775] EXCISED REGION [55674777,55677537]
 second seq =>  [       1,     937] EXCISED REGION [     939,    3698]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55674776,55674776]
 second seq =>         1 nucs [938,938]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55676949,55676949]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [937,937] to [938,938]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673839 CCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTA 55673898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTA 60

 55673899 TTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTT 55673958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTT 120

 55673959 CAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTT 55674018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTT 180

 55674019 AAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAAC 55674078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAAC 240

 55674079 ATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACA 55674138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACA 300

 55674139 AAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATG 55674198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATG 360

 55674199 TTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTG 55674258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTG 420

 55674259 GTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTT 55674318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTT 480

 55674319 CTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAA 55674378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAA 540

 55674379 GACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTG 55674438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTG 600

 55674439 GTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTT 55674498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTT 660

 55674499 GTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTA 55674558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTA 720

 55674559 TTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAAC 55674618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAAC 780

 55674619 TCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCA 55674678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCA 840

 55674679 GTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGG 55674738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGG 900

 55674739 ATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATC 55674775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATC 937

EXCISED REGION

 55674777 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 55674836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 998

 55674837 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 55674896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 1058

 55674897 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 55674956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 1118

 55674957 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 55675016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 1178

 55675017 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 55675076
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 1238

 55675077 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 55675136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 1298

 55675137 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 55675196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 1358

 55675197 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 55675256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 1418

 55675257 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 55675316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 1478

 55675317 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 55675376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 1538

 55675377 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 55675436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 1598

 55675437 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 55675496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 1658

 55675497 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 55675556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 1718

 55675557 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 55675616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 1778

 55675617 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 55675676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 1838

 55675677 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 55675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 1898

 55675737 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 55675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 1958

 55675797 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 55675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 2018

 55675857 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 55675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 2078

 55675917 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 55675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 2138

 55675977 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 55676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 2198

 55676037 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 55676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 2258

 55676097 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 55676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 2318

 55676157 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 55676216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 2378

 55676217 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 55676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 2438

 55676277 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 55676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 2498

 55676337 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 55676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 2558

 55676397 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 55676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 2618

 55676457 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 55676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 2678

 55676517 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 55676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 2738

 55676577 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 55676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 2798

 55676637 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 55676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 2858

 55676697 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 55676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 2918

 55676757 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 55676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 2978

 55676817 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 55676876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 3038

 55676877 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 55676936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 3098

 55676937 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 55676996
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3099 TGCAATGTATTC-TTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 3157

 55676997 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATT 55677056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATT 3217

 55677057 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAA 55677116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAA 3277

 55677117 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTC 55677176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTC 3337

 55677177 TTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA 55677236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 TTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA 3397

 55677237 CGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCA 55677296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 CGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCA 3457

 55677297 GGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAAT 55677356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 GGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAAT 3517

 55677357 TCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAG 55677416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 TCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAG 3577

 55677417 TGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTG 55677476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 TGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTG 3637

 55677477 CCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCA 55677536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 CCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCA 3697

 55677537 G 55677537
          |
     3698 G 3698

Alignment time is 3.08565 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3774] =>      3774 nucs 'mol-32-2b13-104941_3774'

Score:        3751
Aligned:      3773        nucs
Identic:      3771 (100%) nucs =>      3097 (100%)       674 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55674584,55677682] EXCISED REGION [55677685,55678358]
 second seq =>  [       1,    3099] EXCISED REGION [    3101,    3774]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [3100,3100]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55674584 TGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTT 55674643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTT 60

 55674644 GGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAG 55674703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAG 120

 55674704 AGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTG 55674763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTG 180

 55674764 AAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCT 55674823
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGAACTTGATCCGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCT 240

 55674824 TATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAA 55674883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAA 300

 55674884 TTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTG 55674943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTG 360

 55674944 GAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATA 55675003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATA 420

 55675004 GAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTAT 55675063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      421 GAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTAT 480

 55675064 AACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTA 55675123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTA 540

 55675124 CCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCG 55675183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCG 600

 55675184 TTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTG 55675243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTG 660

 55675244 GAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGA 55675303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGA 720

 55675304 ATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAA 55675363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAA 780

 55675364 ACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTC 55675423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTC 840

 55675424 TTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACT 55675483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACT 900

 55675484 AAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGT 55675543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGT 960

 55675544 GGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTC 55675603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTC 1020

 55675604 AGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGA 55675663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGA 1080

 55675664 TTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTC 55675723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTC 1140

 55675724 CTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCAC 55675783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCAC 1200

 55675784 TGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCT 55675843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCT 1260

 55675844 TATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAA 55675903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAA 1320

 55675904 ATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCC 55675963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCC 1380

 55675964 TGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAA 55676023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAA 1440

 55676024 TAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAG 55676083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAG 1500

 55676084 AAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTG 55676143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTG 1560

 55676144 ACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTA 55676203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTA 1620

 55676204 GGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATG 55676263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATG 1680

 55676264 AATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCT 55676323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCT 1740

 55676324 CATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGG 55676383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGG 1800

 55676384 GCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATT 55676443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATT 1860

 55676444 CCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTC 55676503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTC 1920

 55676504 ACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATG 55676563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATG 1980

 55676564 CAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTC 55676623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTC 2040

 55676624 TCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTT 55676683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTT 2100

 55676684 TCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTC 55676743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTC 2160

 55676744 GTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGG 55676803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGG 2220

 55676804 TTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGT 55676863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGT 2280

 55676864 TTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAAT 55676923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAAT 2340

 55676924 TTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACT 55676983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACT 2400

 55676984 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTG 55677043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTG 2460

 55677044 GGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCAC 55677103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCAC 2520

 55677104 CACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGA 55677163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGA 2580

 55677164 TGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 55677223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 2640

 55677224 CAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAA 55677283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAA 2700

 55677284 GGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTG 55677343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTG 2760

 55677344 CTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATA 55677403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATA 2820

 55677404 GTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAG 55677463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAG 2880

 55677464 CCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGG 55677523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGG 2940

 55677524 GGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGT 55677583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGT 3000

 55677584 AAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATG 55677643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATG 3060

 55677644 GTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 3099

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 55677744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 3160

 55677745 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 55677804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 3220

 55677805 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 55677864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 3280

 55677865 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 55677924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 3340

 55677925 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 55677984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 3400

 55677985 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 55678044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 3460

 55678045 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 55678104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 3520

 55678105 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 55678164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 3580

 55678165 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCCA 55678224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCCA 3640

 55678225 CATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTGA 55678284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTGA 3700

 55678285 TAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGATT 55678344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGATT 3760

 55678345 CCACATACAAGAGA 55678358
          ||||||||||||||
     3761 CCACATACAAGAGA 3774

Alignment time is 2.7702 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3443] =>      3443 nucs 'mol-32-2b4a-069032_3443'

Score:        3408
Aligned:      3441        nucs
Identic:      3438 (100%) nucs =>      3091 (100%)       347 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673790,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678135]
 second seq =>  [       3,    3096] EXCISED REGION [    3097,    3443]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [3096,3096] to [3097,3097]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55673790 TTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTT 55673849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        3 TTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTT 62

 55673850 ACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATA 55673909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       63 ACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATA 122

 55673910 GAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTAC 55673969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      123 GAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTAC 182

 55673970 TATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGG 55674029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      183 TATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGG 242

 55674030 AATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAA 55674089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 AATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAA 302

 55674090 TAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCA 55674149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 TAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCA 362

 55674150 CATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAA 55674209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 CATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAA 422

 55674210 TCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGG 55674269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 TCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGG 482

 55674270 CCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTC 55674329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 CCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTC 542

 55674330 CTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAAT 55674389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 CTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAAT 602

 55674390 AGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTA 55674449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 AGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTA 662

 55674450 TTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCAT 55674509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 TTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCAT 722

 55674510 ATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTAT 55674569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 ATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTAT 782

 55674570 TGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAA 55674629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 TGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAA 842

 55674630 TAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAA 55674689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 TAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAA 902

 55674690 ACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATC 55674749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 ACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATC 962

 55674750 AAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGA 55674809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 AAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGA 1022

 55674810 ATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAG 55674869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 ATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAG 1082

 55674870 GAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGAC 55674929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 GAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGAC 1142

 55674930 AGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTT 55674989
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 AGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTT 1202

 55674990 TAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCAT 55675049
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1203 TAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCAT 1262

 55675050 TCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGT 55675109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 TCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGT 1322

 55675110 CATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGG 55675169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 CATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGG 1382

 55675170 GATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTT 55675229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 GATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTT 1442

 55675230 GTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACC 55675289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACC 1502

 55675290 CAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTA 55675349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 CAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTA 1562

 55675350 TTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAA 55675409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 TTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAA 1622

 55675410 CATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACT 55675469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 CATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACT 1682

 55675470 TCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAAT 55675529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 TCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAAT 1742

 55675530 TTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACT 55675589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACT 1802

 55675590 TTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCT 55675649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 TTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCT 1862

 55675650 CGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGA 55675709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 CGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGA 1922

 55675710 TTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTT 55675769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 TTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTT 1982

 55675770 GCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTAC 55675829
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 GCTCTGGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTAC 2042

 55675830 CACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATAC 55675889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 CACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATAC 2102

 55675890 ATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAA 55675949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 ATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAA 2162

 55675950 TAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTAC 55676009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 TAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTAC 2222

 55676010 AGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGC 55676069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 AGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGC 2282

 55676070 TGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCT 55676129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCT 2342

 55676130 GGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAG 55676189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 GGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAG 2402

 55676190 ATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAG 55676249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 ATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAG 2462

 55676250 GGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGG 55676309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 GGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGG 2522

 55676310 GCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAA 55676369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 GCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAA 2582

 55676370 CAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGC 55676429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 CAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGC 2642

 55676430 AGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCT 55676489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 AGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCT 2702

 55676490 AATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTAT 55676549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 AATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTAT 2762

 55676550 TTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAA 55676609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 TTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAA 2822

 55676610 TGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTC 55676669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 TGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTC 2882

 55676670 CTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCA 55676729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 CTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCA 2942

 55676730 TTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATA 55676789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 TTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATA 3002

 55676790 GCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGA 55676849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 GCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGA 3062

 55676850 TATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 TATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 3096

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 3156

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 3216

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 3276

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 3336

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 3396

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACA 55678135
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACA 3443

Alignment time is 2.52141 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4531] =>      4531 nucs 'mol-32-2dff-007814_4531'

Score:        4476
Aligned:      4531        nucs
Identic:      4526 (100%) nucs =>      4186 (100%)       340 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672693,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678128]
 second seq =>  [       1,    4191] EXCISED REGION [    4192,    4531]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [4191,4191] to [4192,4192]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55672693 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGAC 55672752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGAC 60

 55672753 CGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAG 55672812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAG 120

 55672813 CCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTT 55672872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTT 180

 55672873 GACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACA 55672932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACA 240

 55672933 GGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTT 55672992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTT 300

 55672993 GACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGT 55673052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGT 360

 55673053 ATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATG 55673112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      361 ATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATG 420

 55673113 GGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGC 55673172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGC 480

 55673173 TCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCT 55673232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCT 540

 55673233 GCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATT 55673292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATT 600

 55673293 TCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACT 55673352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACT 660

 55673353 CTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAA 55673412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAA 720

 55673413 TTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAA 55673472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAA 780

 55673473 GCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATA 55673532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATA 840

 55673533 ATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGG 55673592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGG 900

 55673593 ATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTC 55673652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTC 960

 55673653 AAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACT 55673712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACT 1020

 55673713 TATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTA 55673772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTA 1080

 55673773 TGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGC 55673832
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTAGCTAAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGC 1140

 55673833 TATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTAT 55673892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTAT 1200

 55673893 TAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGC 55673952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGC 1260

 55673953 CTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTG 55674012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTG 1320

 55674013 ATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTAT 55674072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTAT 1380

 55674073 ATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACA 55674132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACA 1440

 55674133 TGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGG 55674192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGG 1500

 55674193 GATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAG 55674252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAG 1560

 55674253 TGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGT 55674312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGT 1620

 55674313 ATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCAC 55674372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCAC 1680

 55674373 ACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTG 55674432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTG 1740

 55674433 CTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAG 55674492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAG 1800

 55674493 CTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGA 55674552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGA 1860

 55674553 GATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAG 55674612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAG 1920

 55674613 CTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAG 55674672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAG 1980

 55674673 GCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGG 55674732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGG 2040

 55674733 CTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAG 55674792
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGGGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAG 2100

 55674793 GATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTA 55674852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTA 2160

 55674853 GTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTC 55674912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTC 2220

 55674913 GTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAG 55674972
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAG 2280

 55674973 GATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCT 55675032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCT 2340

 55675033 AACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTC 55675092
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTC 2400

 55675093 ATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGC 55675152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGC 2460

 55675153 CGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCA 55675212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCA 2520

 55675213 CTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGC 55675272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGC 2580

 55675273 ATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCA 55675332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCA 2640

 55675333 CAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTAT 55675392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTAT 2700

 55675393 CTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGA 55675452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGA 2760

 55675453 CACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGA 55675512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGA 2820

 55675513 AATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAG 55675572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAG 2880

 55675573 ATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAA 55675632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAA 2940

 55675633 TTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTAT 55675692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTAT 3000

 55675693 GTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAA 55675752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAA 3060

 55675753 AAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGAC 55675812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGAC 3120

 55675813 TAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGG 55675872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGG 3180

 55675873 CTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGA 55675932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGA 3240

 55675933 CCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAG 55675992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAG 3300

 55675993 GTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGC 55676052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGC 3360

 55676053 AGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGT 55676112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGT 3420

 55676113 CTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATG 55676172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATG 3480

 55676173 TTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCT 55676232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCT 3540

 55676233 AAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTG 55676292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTG 3600

 55676293 GAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACAC 55676352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACAC 3660

 55676353 TGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTAC 55676412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTAC 3720

 55676413 CTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAA 55676472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAA 3780

 55676473 GGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAG 55676532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAG 3840

 55676533 GGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAAT 55676592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAAT 3900

 55676593 TTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACT 55676652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACT 3960

 55676653 TTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATG 55676712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATG 4020

 55676713 AATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGA 55676772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGA 4080

 55676773 TGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTC 55676832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTC 4140

 55676833 TTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 4191

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 4251

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 4311

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 4371

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 4431

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 4491

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAA 55678128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAA 4531

Alignment time is 3.2944 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2037] =>      2037 nucs 'mol-32-2e15-003848_2037'

Score:        2036
Aligned:      2036        nucs
Identic:      2036 (100%) nucs =>      1582 (100%)       454 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55675610,55677191] EXCISED REGION [55677193,55677646]
 second seq =>  [       1,    1582] EXCISED REGION [    1584,    2037]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55677192,55677192]
 second seq =>         1 nucs [1583,1583]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55677190,55677191] to [55677193,55677194]
 second seq =>         2 nucs [1581,1582] to [1584,1585]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55675610 AGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAA 55675669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAA 60

 55675670 CCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCT 55675729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCT 120

 55675730 TAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTT 55675789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTT 180

 55675790 CAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTG 55675849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTG 240

 55675850 TAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCC 55675909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCC 300

 55675910 ATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTT 55675969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTT 360

 55675970 TCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACT 55676029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACT 420

 55676030 TAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGG 55676089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGG 480

 55676090 AACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTT 55676149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTT 540

 55676150 ATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTG 55676209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTG 600

 55676210 CACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTG 55676269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTG 660

 55676270 GGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCT 55676329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCT 720

 55676330 CCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTC 55676389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTC 780

 55676390 AGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGG 55676449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGG 840

 55676450 TAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCA 55676509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCA 900

 55676510 GGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGA 55676569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGA 960

 55676570 GGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCC 55676629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCC 1020

 55676630 AGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTA 55676689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTA 1080

 55676690 AGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTC 55676749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTC 1140

 55676750 AGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGG 55676809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGG 1200

 55676810 CTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAG 55676869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAG 1260

 55676870 AGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAG 55676929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAG 1320

 55676930 CACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCG 55676989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCG 1380

 55676990 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCA 55677049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCA 1440

 55677050 CGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCC 55677109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCC 1500

 55677110 CAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCT 55677169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCT 1560

 55677170 CAATCTCTTGACCTCGTGATCC 55677191
          ||||||||||||||||||||||
     1561 CAATCTCTTGACCTCGTGATCC 1582

EXCISED REGION

 55677193 CCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATG 55677252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 CCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATG 1643

 55677253 CAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATT 55677312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 CAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATT 1703

 55677313 AGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAAC 55677372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 AGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAAC 1763

 55677373 AACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCA 55677432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 AACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCA 1823

 55677433 CAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTT 55677492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 CAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTT 1883

 55677493 ATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAG 55677552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 ATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAG 1943

 55677553 GGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGA 55677612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 GGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGA 2003

 55677613 GCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTG 55677646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 GCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTG 2037

Alignment time is 1.54597 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9263] =>      9263 nucs 'mol-32-2e4c-086481_9263'

Score:        9208
Aligned:      9263        nucs
Identic:      9258 (100%) nucs =>      1139 (100%)      8119 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55667867,55669005] EXCISED REGION [55669007,55677130]
 second seq =>  [       1,    1139] EXCISED REGION [    1140,    9263]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55669006,55669006]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55669862,55669862]
 second seq =>         1 nucs [1995,1995]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [55669006,55669022] to [55669007,55669023]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55667867 GAGTCATTATTTTTATAGCAGATAAAACAGATTTTAAACCAACAACAATCAGGAAGGATA 55667926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTCATTATTTTTATAGCAGATAAAACAGATTTTAAACCAACAACAATCAGGAAGGATA 60

 55667927 AAGAAGAGCAGTACATGATGATAAAAGGTTTAATTCAACAAGAAGACCTGACCATTCTAA 55667986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGAAGAGCAGTACATGATGATAAAAGGTTTAATTCAACAAGAAGACCTGACCATTCTAA 120

 55667987 ACATACACGTACCCAATATAGGAGCACCCAGATTCATAAAACAAATTTTTCTTGACTAAC 55668046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATACACGTACCCAATATAGGAGCACCCAGATTCATAAAACAAATTTTTCTTGACTAAC 180

 55668047 AAAAAGACTTAGACAGTCACACAATAATAGTGGGGGACCTTAACACCCCACTGGCAGTGT 55668106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAAGACTTAGACAGTCACACAATAATAGTGGGGGACCTTAACACCCCACTGGCAGTGT 240

 55668107 TAGATCATCAAGGCTGAAAACTAACAAAGAAAATCTGGGCTTAAACTCGACATGTGACCA 55668166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGATCATCAAGGCTGAAAACTAACAAAGAAAATCTGGGCTTAAACTCGACATGTGACCA 300

 55668167 ATTGAACCTAATAGATATCTACAGAGTACTCCATCTAACAATAATAGAATATACATATGT 55668226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGAACCTAATAGATATCTACAGAGTACTCCATCTAACAATAATAGAATATACATATGT 360

 55668227 TTCATTCATACTATTCTAAGATTGACTACATGCCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCTG 55668286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCATTCATACTATTCTAAGATTGACTACATGCCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCTG 420

 55668287 TCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGCAGTGGCACGTGCCTGTAGTCCCAGCT 55668346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGCAGTGGCACGTGCCTGTAGTCCCAGCT 480

 55668347 ACTCAGAAGGCTATGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGACGGAGGCTGCAGTGAGCC 55668406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCAGAAGGCTATGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGACGGAGGCTGCAGTGAGCC 540

 55668407 AAGATCACTCTACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAATCTGTCTTTAAAAAATT 55668466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGATCACTCTACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAATCTGTCTTTAAAAAATT 600

 55668467 ATACGGCTAAATGCCTTTAACAAGAGGTTATAAAGATCTGACATGAATGACCTAACGGTG 55668526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATACGGCTAAATGCCTTTAACAAGAGGTTATAAAGATCTGACATGAATGACCTAACGGTG 660

 55668527 CAACTGGAGGAAATAGATAAAATGAAAAATCCAACCCAGAGCTGGTAGAATAAAACAAAG 55668586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACTGGAGGAAATAGATAAAATGAAAAATCCAACCCAGAGCTGGTAGAATAAAACAAAG 720

 55668587 GACTAAAATCAGAGAAGAACGGAAGGAAATTTTGACCCAAAAGTCCATACAAAAGATAAA 55668646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACTAAAATCAGAGAAGAACGGAAGGAAATTTTGACCCAAAAGTCCATACAAAAGATAAA 780

 55668647 TGAAACCAAGAGTTGGTTCTTCAAAAGAATAAATAAGATCGATGGTTGTTAGCAAGATTA 55668706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAAACCAAGAGTTGGTTCTTCAAAAGAATAAATAAGATCGATGGTTGTTAGCAAGATTA 840

 55668707 ACGAAGAAAAAAATGAGATAATCCAAATAAGCACAATAAGAAATGACAAAGACGACATTA 55668766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACGAAGAAAAAAATGAGATAATCCAAATAAGCACAATAAGAAATGACAAAGACGACATTA 900

 55668767 TTACCGATCCCACAGAAATACAAAAGATTCTCAGAGACTATTATGAACATCTTTATGCAC 55668826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTACCGATCCCACAGAAATACAAAAGATTCTCAGAGACTATTATGAACATCTTTATGCAC 960

 55668827 ACAAATTAGGAAATCTAGAGGAAACCTGTAAGTTCCTAGAAACACACAACCTCCCAAGAT 55668886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAAATTAGGAAATCTAGAGGAAACCTGTAAGTTCCTAGAAACACACAACCTCCCAAGAT 1020

 55668887 TCTTTCAGGAAGAAAGTGAAAACTTGGATAGACCAATAACAAGTTTGGAAATTGAATCAG 55668946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTTCAGGAAGAAAGTGAAAACTTGGATAGACCAATAACAAGTTTGGAAATTGAATCAG 1080

 55668947 CAATAAAAATCCTACCAACCAAAAAGAGCTCTGGACCAGGTGGATTCACATCTGAATTC 55669005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATAAAAATCCTACCAACCAAAAAGAGCTCTGGACCAGGTGGATTCACATCTGAATTC 1139

EXCISED REGION

 55669007 TTTTTTTTTTTTTTTTTAGACGGATTTTCGCTCTTGTCGGCCGGGCTGGAGTGCAATGGC 55669066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTTTTTTTTTTTTTTTTAGACGGATTTTCGCTCTTGTCGGCCGGGCTGGAGTGCAATGGC 1199

 55669067 GTGATCTCGATTCACTGCAACTTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCATCAGCC 55669126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GTGATCTCGATTCACTGCAACTTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCATCAGCC 1259

 55669127 TCCCAAGTACCTGGGATTACAGGCATGTGCCACTATGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTT 55669186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCCCAAGTACCTGGGATTACAGGCATGTGCCACTATGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTT 1319

 55669187 TCAGTGGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAGT 55669246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TCAGTGGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAGT 1379

 55669247 GATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTCACAGGCGTCAGCCACTGCACCCGGCCCCA 55669306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTCACAGGCGTCAGCCACTGCACCCGGCCCCA 1439

 55669307 CACATCCGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGAACTGATACCAATTCTATTGAAACTTTT 55669366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CACATCCGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGAACTGATACCAATTCTATTGAAACTTTT 1499

 55669367 CCAGAAAATCGAGGAGGAGGGGCTTCTCCTTAACTCATTCTAAGAAGCCAGCATCATCCT 55669426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CCAGAAAATCGAGGAGGAGGGGCTTCTCCTTAACTCATTCTAAGAAGCCAGCATCATCCT 1559

 55669427 GATACAAAAATCTGGCAGAGACACAATGAAAATGAAAAACTTCAGGCCAATATCCTTGAT 55669486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GATACAAAAATCTGGCAGAGACACAATGAAAATGAAAAACTTCAGGCCAATATCCTTGAT 1619

 55669487 AAACATAGATGTAAAAATCCTCAACAAAATACTAGCAAACCAAATCCAGCAGCACATCAA 55669546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAACATAGATGTAAAAATCCTCAACAAAATACTAGCAAACCAAATCCAGCAGCACATCAA 1679

 55669547 AAAGTTAAACCACAATGATCAAGCATACTTTATTTCTAGGATACAAGGTTGGTTCAAAAT 55669606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAAGTTAAACCACAATGATCAAGCATACTTTATTTCTAGGATACAAGGTTGGTTCAAAAT 1739

 55669607 ATGCAAATCAACAAATGTGATTCATCACTAAGCAGAACTAAAGACAAAAACCATAAGGTC 55669666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATGCAAATCAACAAATGTGATTCATCACTAAGCAGAACTAAAGACAAAAACCATAAGGTC 1799

 55669667 ATCTCAATAGATGCAGAAAAAAGCCTTTGGTAAAATCCAACGTCCCTTCATGATAAAAAC 55669726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATCTCAATAGATGCAGAAAAAAGCCTTTGGTAAAATCCAACGTCCCTTCATGATAAAAAC 1859

 55669727 TCTCAACATATTATGCTGAGAGTTCAACATATAATATTGAAGGAATATACCTCAAAATTA 55669786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TCTCAACATATTATGCTGAGAGTTCAACATATAATATTGAAGGAATATACCTCAAAATTA 1919

 55669787 TAAGAGCCATCTATGACAAACCCACAACCAACATCATACCGAATGGGCAAAAGCTGGAAC 55669846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TAAGAGCCATCTATGACAAACCCACAACCAACATCATACCGAATGGGCAAAAGCTGGAAC 1979

 55669847 CATTCCCTTTGAAAATTGGAACAAGACAAGGATTCCCACTCTCACCACTCCTATTCAACA 55669906
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CATTCCCTTTGAAAACTGGAACAAGACAAGGATTCCCACTCTCACCACTCCTATTCAACA 2039

 55669907 TAGTATTGGAAGTCCTGGTCAGATAAATCAGGCAAGAGAAGGAAAGAAAATGCATATGAA 55669966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TAGTATTGGAAGTCCTGGTCAGATAAATCAGGCAAGAGAAGGAAAGAAAATGCATATGAA 2099

 55669967 CAGGAAAAGAAGGAGTCCAAACTCTCTCTTTGCCAATATTATTCTACACCAAGAAAACCC 55670026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CAGGAAAAGAAGGAGTCCAAACTCTCTCTTTGCCAATATTATTCTACACCAAGAAAACCC 2159

 55670027 TAAAGACTCTGCCAAAAGGCTTCTGGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGGTA 55670086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAAAGACTCTGCCAAAAGGCTTCTGGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGGTA 2219

 55670087 CAAAATCAATATACAAAAATCAATAGCATTTTTATACATCAATAACATTCTACCTGAGAA 55670146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CAAAATCAATATACAAAAATCAATAGCATTTTTATACATCAATAACATTCTACCTGAGAA 2279

 55670147 CCAAATCAAGAACACAATCCCATTTACAATAGCCACAAAGGAAATGAAATACCTATGAAT 55670206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CCAAATCAAGAACACAATCCCATTTACAATAGCCACAAAGGAAATGAAATACCTATGAAT 2339

 55670207 TCATCTAACCAAGGAAGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACAAAGCACTGCTGAAAGA 55670266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TCATCTAACCAAGGAAGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACAAAGCACTGCTGAAAGA 2399

 55670267 AATCAGAGACTATACAAATAAATAAATGGAAAAATGTTCCATGCTCATGGATTAGAATGA 55670326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AATCAGAGACTATACAAATAAATAAATGGAAAAATGTTCCATGCTCATGGATTAGAATGA 2459

 55670327 TCAATATAGTTAAAATGGCCATACTGCCCAAAGCAATTTACAAGTTCAATGCAATTCTTA 55670386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCAATATAGTTAAAATGGCCATACTGCCCAAAGCAATTTACAAGTTCAATGCAATTCTTA 2519

 55670387 TTAAAATACCAACATCATTTTTCACAGAATAAGAAAAACCTATTCTAAAATTCATTTGGA 55670446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTAAAATACCAACATCATTTTTCACAGAATAAGAAAAACCTATTCTAAAATTCATTTGGA 2579

 55670447 ACCAAAAACAGAGCCCGAATAGCCAAAGCAATTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAGCCATAG 55670506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ACCAAAAACAGAGCCCGAATAGCCAAAGCAATTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAGCCATAG 2639

 55670507 GCATCATATTGCTTGACTTCAAACTCTACTACAGTATACAGCTACCGTAATCAAAACAGC 55670566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GCATCATATTGCTTGACTTCAAACTCTACTACAGTATACAGCTACCGTAATCAAAACAGC 2699

 55670567 ATGATACTGGTACAAAAACAGACAGTGGAACAGAATGGAAAACCCAGAAATCTACCTGCA 55670626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATGATACTGGTACAAAAACAGACAGTGGAACAGAATGGAAAACCCAGAAATCTACCTGCA 2759

 55670627 CACCTACAACCATCTGACAAAATCAACACAAATAAGCAGCAGGGAAAGGAGTCTCTATTC 55670686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CACCTACAACCATCTGACAAAATCAACACAAATAAGCAGCAGGGAAAGGAGTCTCTATTC 2819

 55670687 AAAGAATGGTGGTGGAATATCTGCCTAGGCATATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAA 55670746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AAAGAATGGTGGTGGAATATCTGCCTAGGCATATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAA 2879

 55670747 CTCTCACCATACTCAAAAATGAACTCAAGATGGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAA 55670806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CTCTCACCATACTCAAAAATGAACTCAAGATGGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAA 2939

 55670807 ACTATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAAATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAA 55670866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ACTATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAAATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAA 2999

 55670867 TGATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTACGACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCC 55670926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTACGACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCC 3059

 55670927 TAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGC 55670986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGC 3119

 55670987 CTACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTATGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTA 55671046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CTACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTATGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTA 3179

 55671047 CAAGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAACCAATTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAAC 55671106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CAAGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAACCAATTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAAC 3239

 55671107 ACTTTTCAAAAGGAGACATACACATGGCCAAAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTAC 55671166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ACTTTTCAAAAGGAGACATACACATGGCCAAAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTAC 3299

 55671167 TAATCATCAGAGACATACAAATCAAAACCAAGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAA 55671226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TAATCATCAGAGACATACAAATCAAAACCAAGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAA 3359

 55671227 TGGCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAACAGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGA 55671286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TGGCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAACAGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGA 3419

 55671287 ATGCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAGCTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGCTGTTTGG 55671346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATGCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAGCTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGCTGTTTGG 3479

 55671347 AGATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCACCATTCAGTGCTGCAATCCCGCTACTGGGT 55671406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AGATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCACCATTCAGTGCTGCAATCCCGCTACTGGGT 3539

 55671407 ATATACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTATCATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATT 55671466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 ATATACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTATCATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATT 3599

 55671467 GCAGCACTACTCACAATAGTAAGGACATAGAAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGAC 55671526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GCAGCACTACTCACAATAGTAAGGACATAGAAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGAC 3659

 55671527 TGGATAAAGGATATGTGGTACACATACACCATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAAT 55671586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TGGATAAAGGATATGTGGTACACATACACCATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAAT 3719

 55671587 GGAATCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGA 55671646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GGAATCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGA 3779

 55671647 CCTAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACACATGTTCTCACTTACAGGTGGGAGCTAAAC 55671706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CCTAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACACATGTTCTCACTTACAGGTGGGAGCTAAAC 3839

 55671707 ACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGG 55671766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 ACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGG 3899

 55671767 AAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGG 55671826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGG 3959

 55671827 GAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACC 55671886
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GAGATGGGAACACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACC 4019

 55671887 TGCACATGTACCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATATCTGA 55671946
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4020 TGCACATGTACCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAAATTAAAAAAGGACTTAATATCTGA 4079

 55671947 AATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGA 55672006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGA 4139

 55672007 AAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATG 55672066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATG 4199

 55672067 TCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTT 55672126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTT 4259

 55672127 CTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGT 55672186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 CTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGT 4319

 55672187 ATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCT 55672246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 ATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCT 4379

 55672247 TCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGC 55672306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGC 4439

 55672307 TGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCC 55672366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCC 4499

 55672367 TTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGC 55672426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGC 4559

 55672427 ATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCA 55672486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 ATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCA 4619

 55672487 AACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTT 55672546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 AACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTT 4679

 55672547 TTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACT 55672606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACT 4739

 55672607 TGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA 55672666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA 4799

 55672667 CTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 55672726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 CTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 4859

 55672727 ACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCC 55672786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 ACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCC 4919

 55672787 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTC 55672846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTC 4979

 55672847 AGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTT 55672906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 AGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTT 5039

 55672907 TGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTG 55672966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 TGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTG 5099

 55672967 GCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAG 55673026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 GCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAG 5159

 55673027 ACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTA 55673086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 ACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTA 5219

 55673087 TTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTG 55673146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 TTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTG 5279

 55673147 CACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTA 55673206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 CACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTA 5339

 55673207 CTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTT 55673266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 CTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTT 5399

 55673267 AAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATG 55673326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 AAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATG 5459

 55673327 ATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGA 55673386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 ATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGA 5519

 55673387 CTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAA 55673446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 CTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAA 5579

 55673447 GCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATA 55673506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 GCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATA 5639

 55673507 TTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGC 55673566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 TTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGC 5699

 55673567 TACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATA 55673626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 TACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATA 5759

 55673627 CTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATT 55673686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 CTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATT 5819

 55673687 CCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAG 55673746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 CCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAG 5879

 55673747 ATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGA 55673806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 ATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGA 5939

 55673807 CTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGA 55673866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 CTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGA 5999

 55673867 GATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTT 55673926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 GATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTT 6059

 55673927 CTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGC 55673986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGC 6119

 55673987 TGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATT 55674046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATT 6179

 55674047 GTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAAC 55674106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 GTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAAC 6239

 55674107 AAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTC 55674166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 AAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTC 6299

 55674167 CTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCT 55674226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 CTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCT 6359

 55674227 GAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTA 55674286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 GAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTA 6419

 55674287 TGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGA 55674346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 TGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGA 6479

 55674347 GAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGG 55674406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 GAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGG 6539

 55674407 CTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGA 55674466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 CTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGA 6599

 55674467 AATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATT 55674526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 AATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATT 6659

 55674527 CAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGA 55674586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 CAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGA 6719

 55674587 CTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGA 55674646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 CTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGA 6779

 55674647 AGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGG 55674706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 AGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGG 6839

 55674707 GCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAG 55674766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 GCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAG 6899

 55674767 AACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTAT 55674826
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 AACTTGATCCGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTAT 6959

 55674827 TAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTT 55674886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 TAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTT 7019

 55674887 GGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAG 55674946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 GGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAG 7079

 55674947 TTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAA 55675006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 TTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAA 7139

 55675007 GAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAAC 55675066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7140 GAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAAC 7199

 55675067 CCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCA 55675126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 CCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCA 7259

 55675127 TGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTA 55675186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 TGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTA 7319

 55675187 TAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAA 55675246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 TAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAA 7379

 55675247 CTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATA 55675306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 CTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATA 7439

 55675307 CATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACC 55675366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 CATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACC 7499

 55675367 ACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTT 55675426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 ACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTT 7559

 55675427 AGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAA 55675486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 AGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAA 7619

 55675487 AGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGT 55675546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 AGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGT 7679

 55675547 AGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGT 55675606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 AGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGT 7739

 55675607 GGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTG 55675666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7740 GGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTG 7799

 55675667 AAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTG 55675726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 AAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTG 7859

 55675727 GCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGC 55675786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 GCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGC 7919

 55675787 TTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTAT 55675846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 TTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTAT 7979

 55675847 TTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATA 55675906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 TTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATA 8039

 55675907 TCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGG 55675966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8040 TCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGG 8099

 55675967 CTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAA 55676026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 CTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAA 8159

 55676027 ACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAA 55676086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 ACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAA 8219

 55676087 GGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACC 55676146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 GGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACC 8279

 55676147 TTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGC 55676206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 TTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGC 8339

 55676207 TTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAAT 55676266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 TTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAAT 8399

 55676267 TTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCAT 55676326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 TTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCAT 8459

 55676327 TCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCC 55676386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 TCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCC 8519

 55676387 TTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCT 55676446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 TTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCT 8579

 55676447 GGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACT 55676506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8580 GGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACT 8639

 55676507 CCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAA 55676566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8640 CCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAA 8699

 55676567 AGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCT 55676626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8700 AGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCT 8759

 55676627 GCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCT 55676686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8760 GCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCT 8819

 55676687 GTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTC 55676746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8820 GTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTC 8879

 55676747 CTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTC 55676806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8880 CTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTC 8939

 55676807 TGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTT 55676866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8940 TGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTT 8999

 55676867 AAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTT 55676926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9000 AAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTT 9059

 55676927 CAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTG 55676986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9060 CAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTG 9119

 55676987 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGT 55677046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9120 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGT 9179

 55677047 TCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCAC 55677106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9180 TCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCAC 9239

 55677107 GCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTT 55677130
          ||||||||||||||||||||||||
     9240 GCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTT 9263

Alignment time is 6.81704 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6473] =>      6473 nucs 'mol-32-2ee6-010732_6473'

Score:        6328
Aligned:      6477        nucs
Identic:      6461 (100%) nucs =>      6085 (100%)       376 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55670784,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678164]
 second seq =>  [       1,    6097] EXCISED REGION [    6098,    6473]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [6097,6097] to [6098,6098]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55670784 AAGATTTAAATCTAAGATTACAAACTATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAAATACCC 55670843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGATTTAAATCTAAGATTACAAACTATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAAATACCC 60

 55670844 TTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATGATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTACGACAAA 55670903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATGATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTACGACAAA 120

 55670904 ACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAAAT 55670963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAAAT 180

 55670964 TACCAACAGAGTAAACAGACAGCCTACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTATGCATC 55671023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACCAACAGAGTAAACAGACAGCCTACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTATGCATC 240

 55671024 TAAGGTCTAATATCCAGAATTTACAAGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAA-CCAATT 55671082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.||
      241 TAAGGTCTAATATCCAGAATTTACAAGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAAACCAGTT 300

 55671083 AAGGAATGAGCAAAGGACATGAACACTTTTCAAAAGGAGACATACACATGGCCAAAACAA 55671142
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGGAATGAGCACAGGACATGAACACTTTTCAAAAGGAGACATACACATGGCCAAAACAA 360

 55671143 ACATAAAAACATGCTCAACATTACTAATCATCAGAGACATACAAATCAAAACCAAGATGA 55671202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATAAAAACATGCTCAACATTACTAATCATCAGAGACATACAAATCAAAACCAAGATGA 420

 55671203 GGTACTATCTCACACCAGTTAGAATGGCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAACAGCCGT 55671262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTACTATCTCACACCAGTTAGAATGGCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAACAGCCGT 480

 55671263 CGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAATGCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAGCTAGTT 55671322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAATGCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAGCTAGTT 540

 55671323 CAGCCACTGTGCAAAGCTGTTTGGAGATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCACCATTC 55671382
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCCACTGTGCAAAGTTGTTTGGAGATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCACCATTC 600

 55671383 AGTGCTGCAATCCCGCTACTGGGTATATACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTATCATCAA 55671442
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGCTGCAATCCCACTACTGGGTATATACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTATCATCAA 660

 55671443 GACAAATGCACCTGTATGTTCATTGCAGCACTACTCACAATAGTAAGGACATAGAAACAA 55671502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||
      661 GACAAATGCACCTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAGGACATAGAAACAA 720

 55671503 CCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTGGATAAAGGATATGTGGTACACATACACCATGGAA 55671562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTGGATAAAGGATATGTGGTACACATACACCATGGAA 780

 55671563 TACTACACAGCCATAAAAAGGAATGGAATCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATGGATGGA 55671622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACTACACAGCCATAAAAAGGAATGGAATCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATGGATGGA 840

 55671623 GCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACCTAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACACATGTT 55671682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACCTAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACACATGTT 900

 55671683 CTCACTTACAGGTGGGAGCTAAACACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAG 55671742
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCAC----AGGTGGGAGCTAAACACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAG 956

 55671743 ACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTG 55671802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 ACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTG 1016

 55671803 TTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCA 55671862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCA 1076

 55671863 CATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCACATGTACCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAA 55671922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 CATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCACATGTACCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAA 1136

 55671923 ATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAA 55671982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 ATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAA 1196

 55671983 CCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCT 55672042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 CCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCT 1256

 55672043 ATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAG 55672102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 ATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAG 1316

 55672103 TGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTC 55672162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTC 1376

 55672163 AATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGA 55672222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 AATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGA 1436

 55672223 AATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGT 55672282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 AATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGT 1496

 55672283 TTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATC 55672342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATC 1556

 55672343 CAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTC 55672402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 CAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTC 1616

 55672403 TACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATG 55672462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATG 1676

 55672463 CTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAG 55672522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAG 1736

 55672523 ATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACT 55672582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 ATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACT 1796

 55672583 GGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCG 55672642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCG 1856

 55672643 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTG 55672702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTG 1916

 55672703 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCT 55672762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCT 1976

 55672763 CATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCC 55672822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 CATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCC 2036

 55672823 CGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGT 55672882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 CGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGT 2096

 55672883 ATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCT 55672942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 ATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCT 2156

 55672943 TGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTG 55673002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTG 2216

 55673003 GCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATC 55673062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATC 2276

 55673063 ATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTT 55673122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2277 ATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATGGGGTATGTTT 2336

 55673123 TAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATT 55673182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATT 2396

 55673183 CTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTT 55673242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTT 2456

 55673243 CTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAG 55673302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAG 2516

 55673303 ATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTT 55673362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTT 2576

 55673363 ATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATA 55673422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 ATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATA 2636

 55673423 TAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGAT 55673482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGAT 2696

 55673483 ATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGC 55673542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGC 2756

 55673543 TTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTAC 55673602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTAC 2816

 55673603 TAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGA 55673662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGA 2876

 55673663 TTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTA 55673722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTA 2936

 55673723 ATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAA 55673782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 ATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAA 2996

 55673783 ACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCAT 55673842
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 ACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCAT 3056

 55673843 GGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTA 55673902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTA 3116

 55673903 GAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAA 55673962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 GAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAA 3176

 55673963 TCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAA 55674022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAA 3236

 55674023 TTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATAC 55674082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATAC 3296

 55674083 AATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAAC 55674142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAAC 3356

 55674143 ATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGG 55674202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 ATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGG 3416

 55674203 TCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCC 55674262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCC 3476

 55674263 ATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTC 55674322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTC 3536

 55674323 TTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACA 55674382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACA 3596

 55674383 CAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCC 55674442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCC 3656

 55674443 ATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGC 55674502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 ATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGC 3716

 55674503 CCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCA 55674562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCA 3776

 55674563 AAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCA 55674622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 AAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCA 3836

 55674623 AATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGG 55674682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 AATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGG 3896

 55674683 ATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTT 55674742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 ATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTT 3956

 55674743 AGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACT 55674802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACT 4016

 55674803 AAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGG 55674862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 AAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGG 4076

 55674863 CTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAA 55674922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 CTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAA 4136

 55674923 GAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTA 55674982
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTA 4196

 55674983 GAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTG 55675042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4197 GAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAG 4256

 55675043 CTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCT 55675102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCT 4316

 55675103 TTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATG 55675162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 TTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATG 4376

 55675163 GATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCT 55675222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCT 4436

 55675223 GTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAA 55675282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 GTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAA 4496

 55675283 AATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGAT 55675342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 AATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGAT 4556

 55675343 AATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTG 55675402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 AATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTG 4616

 55675403 CTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCT 55675462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 CTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCT 4676

 55675463 ATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTG 55675522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 ATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTG 4736

 55675523 TAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGG 55675582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGG 4796

 55675583 AAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTT 55675642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 AAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTT 4856

 55675643 TTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAAT 55675702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAAT 4916

 55675703 TCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTA 55675762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 TCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTA 4976

 55675763 GCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCT 55675822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCT 5036

 55675823 TACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTA 55675882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 TACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTA 5096

 55675883 CCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACA 55675942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 CCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACA 5156

 55675943 CTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCT 55676002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCT 5216

 55676003 CTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAAT 55676062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 CTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAAT 5276

 55676063 CCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCT 55676122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 CCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCT 5336

 55676123 TTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGA 55676182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 TTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGA 5396

 55676183 CTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAG 55676242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 CTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAG 5456

 55676243 TGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGT 55676302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 TGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGT 5516

 55676303 GGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGA 55676362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 GGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGA 5576

 55676363 TGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGG 55676422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 TGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGG 5636

 55676423 AGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTC 55676482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 AGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTC 5696

 55676483 CTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAG 55676542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 CTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAG 5756

 55676543 ATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTA 55676602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 ATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTA 5816

 55676603 CTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAA 55676662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 CTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAA 5876

 55676663 ATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTG 55676722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 ATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTG 5936

 55676723 GCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTA 55676782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 GCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTA 5996

 55676783 GGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGAT 55676842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 GGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGAT 6056

 55676843 AAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 AAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 6097

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6098 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 6157

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6158 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 6217

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 6277

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 6337

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 6397

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 6457

 55678149 CTTCACGAATTTCCAG 55678164
          ||||||||||||||||
     6458 CTTCACGAATTTCCAG 6473

Alignment time is 4.79906 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8689] =>      8689 nucs 'mol-32-2f1d-057226_8689'

Score:        8622
Aligned:      8688        nucs
Identic:      8682 (100%) nucs =>      2095 (100%)      6587 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55675588,55677682] EXCISED REGION [55677685,55684276]
 second seq =>  [       1,    2095] EXCISED REGION [    2097,    8689]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [2096,2096]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55675588 CTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCC 55675647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCC 60

 55675648 CTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGA 55675707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGA 120

 55675708 GATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTAT 55675767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTAT 180

 55675768 TTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCT 55675827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCT 240

 55675828 ACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAAT 55675887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAAT 300

 55675888 ACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATG 55675947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATG 360

 55675948 AATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTT 55676007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTT 420

 55676008 ACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAA 55676067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAA 480

 55676068 GCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACT 55676127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACT 540

 55676128 CTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGT 55676187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGT 600

 55676188 AGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTG 55676247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTG 660

 55676248 AGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGT 55676307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGT 720

 55676308 GGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTG 55676367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTG 780

 55676368 AACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGA 55676427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGA 840

 55676428 GCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCC 55676487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCC 900

 55676488 CTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTT 55676547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTT 960

 55676548 ATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCT 55676607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCT 1020

 55676608 AATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATT 55676667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATT 1080

 55676668 TCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAG 55676727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAG 1140

 55676728 CATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAA 55676787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAA 1200

 55676788 TAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACA 55676847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACA 1260

 55676848 GATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTAT 55676907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTAT 1320

 55676908 TTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTT 55676967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTT 1380

 55676968 GAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTA 55677027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTA 1440

 55677028 CAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAC 55677087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAC 1500

 55677088 CACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTC 55677147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTC 1560

 55677148 GTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCC 55677207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCC 1620

 55677208 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTG 55677267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTG 1680

 55677268 ACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGG 55677327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGG 1740

 55677328 AAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAA 55677387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAA 1800

 55677388 ATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCA 55677447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCA 1860

 55677448 GCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAAT 55677507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAAT 1920

 55677508 TAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACC 55677567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACC 1980

 55677568 CAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCC 55677627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCC 2040

 55677628 CATGCTAATGAGCATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATGCTAATGAGCATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 2095

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTC-TTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 55677743
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 2156

 55677744 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 55677803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 2216

 55677804 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 55677863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 2276

 55677864 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 55677923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 2336

 55677924 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 55677983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 2396

 55677984 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 55678043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 2456

 55678044 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 55678103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 2516

 55678104 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 55678163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 2576

 55678164 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 55678223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 2636

 55678224 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 55678283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 2696

 55678284 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 55678343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 2756

 55678344 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 55678403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 2816

 55678404 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 55678463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 2876

 55678464 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATT 55678523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATT 2936

 55678524 TATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAA 55678583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAA 2996

 55678584 CATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAG 55678643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 CATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAG 3056

 55678644 AAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTT 55678703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTT 3116

 55678704 CCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCT 55678763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCT 3176

 55678764 ATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATG 55678823
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 ATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATG 3236

 55678824 ATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGG 55678883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 ATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGG 3296

 55678884 GAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTT 55678943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTT 3356

 55678944 TTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCAC 55679003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCAC 3416

 55679004 AAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCT 55679063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCT 3476

 55679064 GTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCC 55679123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCC 3536

 55679124 TATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTA 55679183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTA 3596

 55679184 GGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTG 55679243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTG 3656

 55679244 TCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCA 55679303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCA 3716

 55679304 ACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAA 55679363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 ACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAA 3776

 55679364 GACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGA 55679423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGA 3836

 55679424 ATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGA 55679483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 ATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGA 3896

 55679484 CTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAA 55679543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 CTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAA 3956

 55679544 GGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTC 55679603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTC 4016

 55679604 TAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTC 55679663
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTC 4076

 55679664 AACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTT 55679723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 AACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTT 4136

 55679724 TCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTA 55679783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTA 4196

 55679784 AGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTA 55679843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 AGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTA 4256

 55679844 TTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCA 55679903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 TTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCA 4316

 55679904 ACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCAC 55679963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 ACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCAC 4376

 55679964 TAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCC 55680023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 TAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCC 4436

 55680024 AAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTG 55680083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 AAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTG 4496

 55680084 GTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCT 55680143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 GTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCT 4556

 55680144 TAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGT 55680203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGT 4616

 55680204 TGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCA 55680263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCA 4676

 55680264 ACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGAT 55680323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 ACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGAT 4736

 55680324 TCAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGT 55680383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TCAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGT 4796

 55680384 TCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGT 55680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGT 4856

 55680444 GTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGT 55680503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 GTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGT 4916

 55680504 CACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCA 55680563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 CACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCA 4976

 55680564 GTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAG 55680623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAG 5036

 55680624 TGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTT 55680683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 TGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTT 5096

 55680684 AATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAG 55680743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 AATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAG 5156

 55680744 ATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCAC 55680803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 ATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCAC 5216

 55680804 TGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGA 55680863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 TGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGA 5276

 55680864 GCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTT 55680923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 GCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTT 5336

 55680924 GCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAAC 55680983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 GCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAAC 5396

 55680984 AATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGA 55681043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGA 5456

 55681044 CACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCAT 55681103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 CACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCAT 5516

 55681104 TTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGT 55681163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGT 5576

 55681164 ATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAATG 55681223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 ATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAATG 5636

 55681224 AATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTAA 55681283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 AATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTAA 5696

 55681284 AAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGAT 55681343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 AAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGAT 5756

 55681344 AGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGACATTAGATGTTTCTAA 55681403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 AGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGACATTAGATGTTTCTAA 5816

 55681404 GAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTGAATGGAAGGTCTCTCC 55681463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 GAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTGAATGGAAGGTCTCTCC 5876

 55681464 ACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAATACACTTCTAAGACTG 55681523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 ACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAATACACTTCTAAGACTG 5936

 55681524 CTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGAAATGCTCATCAATTCT 55681583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGAAATGCTCATCAATTCT 5996

 55681584 GTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCTAAGAATGCGAGTTGCA 55681643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 GTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCTAAGAATGCGAGTTGCA 6056

 55681644 CAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTTAAACCTTAAAATTTAT 55681703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 CAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTTAAACCTTAAAATTTAT 6116

 55681704 TATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTCTAGTTGCACATGTGAT 55681763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 TATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTCTAGTTGCACATGTGAT 6176

 55681764 TCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTCCATGTAAAACACTTAG 55681823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTCCATGTAAAACACTTAG 6236

 55681824 TAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTATGATTGAGAACAGCGTT 55681883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTATGATTGAGAACAGCGTT 6296

 55681884 GCTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATGCTCTTATGACAAATGT 55681943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 GCTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATGCTCTTATGACAAATGT 6356

 55681944 ATAAAATATATCTCCAAGAGTGTTAGTTGTATTCAATTCAGAATATTTTTATTTTATGGA 55682003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 ATAAAATATATCTCCAAGAGTGTTAGTTGTATTCAATTCAGAATATTTTTATTTTATGGA 6416

 55682004 AGTGTTCACTTTTATGTCTATCTAATACTCTTTTAAGATAAGTATACAAAAGATGTTTCT 55682063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 AGTGTTCACTTTTATGTCTATCTAATACTCTTTTAAGATAAGTATACAAAAGATGTTTCT 6476

 55682064 AAGTTTCTAGCTGTGTAGTGATTCAGAATAACATGGTCACTGAAAAGAAGCGCTCAACAC 55682123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 AAGTTTCTAGCTGTGTAGTGATTCAGAATAACATGGTCACTGAAAAGAAGCGCTCAACAC 6536

 55682124 TCAAAACTCAATCTATTACATTCCATTATGACACATGTAAACTTTCTTCTAGGAGTGCTG 55682183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TCAAAACTCAATCTATTACATTCCATTATGACACATGTAAACTTTCTTCTAGGAGTGCTG 6596

 55682184 GTTGTGCACGTGATTAAGAACTGTGTAATTTCAGCTTAAAGATGTGTTTGAGGCACTTAA 55682243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 GTTGTGCACGTGATTAAGAACTGTGTAATTTCAGCTTAAAGATGTGTTTGAGGCACTTAA 6656

 55682244 TACTACTGTGGTATGACACATGTACAAAATAAGTTTCTAACACAAGTCCTTGCCTGCATG 55682303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 TACTACTGTGGTATGACACATGTACAAAATAAGTTTCTAACACAAGTCCTTGCCTGCATG 6716

 55682304 ACTCAACATTTTTTTCATTGATTAAAAGTGTTCACCATTCTTAAGTTCATTTAATACATT 55682363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 ACTCAACATTTTTTTCATTGATTAAAAGTGTTCACCATTCTTAAGTTCATTTAATACATT 6776

 55682364 CTTTTAAGACACACTTACCAGACTGTTTCTAAGGGTATGAATTATATGCTTGATTTACAA 55682423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 CTTTTAAGACACACTTACCAGACTGTTTCTAAGGGTATGAATTATATGCTTGATTTACAA 6836

 55682424 CAGTTTTATTTCAGTAAATAGAAGTGTTCATCACTCAAACTCCATCTAGTAGACTTAAAA 55682483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 CAGTTTTATTTCAGTAAATAGAAGTGTTCATCACTCAAACTCCATCTAGTAGACTTAAAA 6896

 55682484 CACATATATTAAACACATGTTGAACTTGGTAAGTTGTGCAAGTAATTCAGAATGTGTGAA 55682543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 CACATATATTAAACACATGTTGAACTTGGTAAGTTGTGCAAGTAATTCAGAATGTGTGAA 6956

 55682544 TTCAGGGAAGGGATATGTTAACTACTCTTAGCTATTGTAATACATTCTGTTAGGACACAT 55682603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 TTCAGGGAAGGGATATGTTAACTACTCTTAGCTATTGTAATACATTCTGTTAGGACACAT 7016

 55682604 GTATAAAAGATGTTTCTAAGAGTGCTGGTGTGCAGCTTATCTAGAAAAGTTTTATTTATT 55682663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 GTATAAAAGATGTTTCTAAGAGTGCTGGTGTGCAGCTTATCTAGAAAAGTTTTATTTATT 7076

 55682664 TATTGACTTATTTTTTTCTTTTTAGCATCAGGTTGGTGAAAATATTTTTTTATTTTAATT 55682723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TATTGACTTATTTTTTTCTTTTTAGCATCAGGTTGGTGAAAATATTTTTTTATTTTAATT 7136

 55682724 GACAGATAAATGCTTATTTTAATTGACATATATTTATTTATTTTTAATTGACAGATAAAA 55682783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 GACAGATAAATGCTTATTTTAATTGACATATATTTATTTATTTTTAATTGACAGATAAAA 7196

 55682784 ATATTTATTTATGTTTTTATTTTTTAGTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTCGCCCA 55682843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 ATATTTATTTATGTTTTTATTTTTTAGTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTCGCCCA 7256

 55682844 GGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCC 55682903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 GGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCC 7316

 55682904 ATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAAC 55682963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 ATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCTGCCACCACACCCAAC 7376

 55682964 TAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTCGCCAGGATGGTCTCA 55683023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 TAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTCGCCAGGATGGTCTCA 7436

 55683024 ATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTCATCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 55683083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 ATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTCATCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 7496

 55683084 AGCCACCGTGCCCGGCCAAAAATATTTATTTTTAACTGACAATTTTTAATTGACAGATGA 55683143
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 AGCCACCGTGCTCGGCCAAAAATATTTATTTTTAACTGACAATTTTTAATTGACAGATGA 7556

 55683144 CATTGTATGTTTTTATCATGTACAGTATTGTTTTGGAGTACACACATATTGTGAAATGGG 55683203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 CATTGTATGTTTTTATCATGTACAGTATTGTTTTGGAGTACACACATATTGTGAAATGGG 7616

 55683204 TATATCTAGCTTATGATTATTATGAATTTTGAGAAAGAGTGTAGCTCTGTTGCCCAGGCT 55683263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 TATATCTAGCTTATGATTATTATGAATTTTGAGAAAGAGTGTAGCTCTGTTGCCCAGGCT 7676

 55683264 GGAGTGCAATGGCCTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCCCTGGATTCAAGCAATTCT 55683323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 GGAGTGCAATGGCCTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCCCTGGATTCAAGCAATTCT 7736

 55683324 TGTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCACCACTATGCCCAGCTAATT 55683383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 TGTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCACCACTATGCCCAGCTAATT 7796

 55683384 TTGGTATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGA 55683443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 TTGGTATTTTTAGTGGAGACGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGA 7856

 55683444 CCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACT 55683503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     7857 CCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACT 7916

 55683504 GTGCCCACCCAAATCCAGCTAATTAAATGCATCAACTAACATAGTTATTATTTTTGTGGT 55683563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 GTGCCCACCCAAATCCAGCTAATTAAATGCATCAACTAACATAGTTATTATTTTTGTGGT 7976

 55683564 AAGAACATGTAACAGTAGCTCTCTTTACATTTTTTCAAGAATATAATATATTGGCTGGGC 55683623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 AAGAACATGTAACAGTAGCTCTCTTTACATTTTTTCAAGAATATAATATATTGGCTGGGC 8036

 55683624 AGGGCAACTCATGCCTGTAATCCTTGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGATCCCTTGAG 55683683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 AGGGCAACTCATGCCTGTAATCCTTGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGATCCCTTGAG 8096

 55683684 GCCAGGAGTTCAAGGGCAACCTAGACTCCATCTCTACAAAAAAATTTTTAAAAATTATTT 55683743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     8097 GCCAGGAGTTCAAGGGCAACCTAGACTCCATCTCTACAAAAAAAATTTTAAAAATTATTT 8156

 55683744 GGGCATGGTGGCACATACCTGTAATCCCAGCAACTCGTGAGGCTGTGGTGGGAGGATCAC 55683803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 GGGCATGGTGGCACATACCTGTAATCCCAGCAACTCGTGAGGCTGTGGTGGGAGGATCAC 8216

 55683804 TTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTTCAATGAGCTGTGATTGAGCCACTGCACTCCAGCCTGG 55683863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 TTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTTCAATGAGCTGTGATTGAGCCACTGCACTCCAGCCTGG 8276

 55683864 GTGACAGAGTGAGAACCTGTCTCAAAAAAACAAATGAAAGAATACAATATATCATTATTG 55683923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 GTGACAGAGTGAGAACCTGTCTCAAAAAAACAAATGAAAGAATACAATATATCATTATTG 8336

 55683924 TATTAACTGTAGTTAATCATTAACTAAACTGTATCATCTTGCTGTACAGTAGACCTCTTG 55683983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 TATTAACTGTAGTTAATCATTAACTAAACTGTATCATCTTGCTGTACAGTAGACCTCTTG 8396

 55683984 AAATTTATTCCTTTTATCTAATTGTAATTGTATATCTTTTTACCAACATCCCCCTATCCT 55684043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 AAATTTATTCCTTTTATCTAATTGTAATTGTATATCTTTTTACCAACATCCCCCTATCCT 8456

 55684044 CTCTTCCCCACTGAACACTCCAGCTTCTAGTAACTACCATTCTACTCTCTACTTTTATGA 55684103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8457 CTCTTCCCCACTGAACACTCCAGCTTCTAGTAACTACCATTCTACTCTCTACTTTTATGA 8516

 55684104 GATCAACTTTTTTAGATTCCACATGTAAGTGATATAATGTGGTATTCGTTTTTCTGTGCC 55684163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8517 GATCAACTTTTTTAGATTCCACATGTAAGTGATATAATGTGGTATTCGTTTTTCTGTGCC 8576

 55684164 TGGCTTATACCATTTAACATAACGTTCTCTAGGTTTATCCATGTTGTCAAAATGGAAGGG 55684223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8577 TGGCTTATACCATTTAACATAACGTTCTCTAGGTTTATCCATGTTGTCAAAATGGAAGGG 8636

 55684224 TTTCATTATTTTTTGTAACTAAATGGTATTACATTATGCACATAGACTGCATT 55684276
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8637 TTTCATTATTTTTTGTAACTAAATGGTATTACATTATGCACATAGACTGCATT 8689

Alignment time is 6.26607 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3405] =>      3405 nucs 'mol-32-2f33-056940_3405'

Score:        3361
Aligned:      3405        nucs
Identic:      3401 (100%) nucs =>      3144 (100%)       257 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673736,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678045]
 second seq =>  [       1,    3148] EXCISED REGION [    3149,    3405]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [3148,3148] to [3149,3149]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55673736 AGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTA 55673795
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
        1 AGGTTAAAAAGATACTTCACGATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTTGTA 60

 55673796 ACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCA 55673855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCA 120

 55673856 GTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCG 55673915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCG 180

 55673916 ATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGC 55673975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGC 240

 55673976 TGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGT 55674035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGT 300

 55674036 GCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATT 55674095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATT 360

 55674096 GTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAA 55674155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAA 420

 55674156 CAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAG 55674215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAG 480

 55674216 CCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGG 55674275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGG 540

 55674276 ACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAA 55674335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAA 600

 55674336 AGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAA 55674395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAA 660

 55674396 CTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCAC 55674455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCAC 720

 55674456 ACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAA 55674515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAA 780

 55674516 GAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAG 55674575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAG 840

 55674576 AGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGA 55674635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGA 900

 55674636 CAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACT 55674695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACT 960

 55674696 AAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGT 55674755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGT 1020

 55674756 GAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGC 55674815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGC 1080

 55674816 AGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCT 55674875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCT 1140

 55674876 AACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCAT 55674935
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1141 AACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTAT 1200

 55674936 TAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAA 55674995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAA 1260

 55674996 CCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGAC 55675055
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1261 CCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGAC 1320

 55675056 CTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAAC 55675115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAAC 1380

 55675116 TTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTT 55675175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTT 1440

 55675176 TTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGA 55675235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGA 1500

 55675236 ACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAAT 55675295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAAT 1560

 55675296 TATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGA 55675355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGA 1620

 55675356 CTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGT 55675415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGT 1680

 55675416 TTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTA 55675475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTA 1740

 55675476 TATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAG 55675535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAG 1800

 55675536 CTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCT 55675595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCT 1860

 55675596 AATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGT 55675655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGT 1920

 55675656 CATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGC 55675715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGC 1980

 55675716 ATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTA 55675775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTA 2040

 55675776 GGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCC 55675835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCC 2100

 55675836 AAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCA 55675895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCA 2160

 55675896 GTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATG 55675955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATG 2220

 55675956 TCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATT 55676015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATT 2280

 55676016 AAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAA 55676075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAA 2340

 55676076 CATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGT 55676135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGT 2400

 55676136 TATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCG 55676195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCG 2460

 55676196 TTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGAC 55676255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGAC 2520

 55676256 AGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGA 55676315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGA 2580

 55676316 CTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAG 55676375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAG 2640

 55676376 GCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGC 55676435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGC 2700

 55676436 ACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTT 55676495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTT 2760

 55676496 GGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCA 55676555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCA 2820

 55676556 TGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAA 55676615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAA 2880

 55676616 GTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCC 55676675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCC 2940

 55676676 TCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAA 55676735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAA 3000

 55676736 CTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTAT 55676795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTAT 3060

 55676796 GTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATA 55676855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATA 3120

 55676856 AAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 3148

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 3208

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 3268

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 3328

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 3388

 55678029 ACAACATGTTTTGATAT 55678045
          |||||||||||||||||
     3389 ACAACATGTTTTGATAT 3405

Alignment time is 2.51365 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10238] =>     10238 nucs 'mol-32-2fb7-045190_10238'

Score:       10106
Aligned:     10238        nucs
Identic:     10226 (100%) nucs =>      4887 (100%)      5339 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55671993,55676883] EXCISED REGION [55677789,55683134]
 second seq =>  [       1,    4891] EXCISED REGION [    4892,   10238]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [4891,4891] to [4892,4892]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55671993 TAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAG 55672052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAG 60

 55672053 TTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGA 55672112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGA 120

 55672113 GGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGA 55672172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGA 180

 55672173 AATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATT 55672232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATT 240

 55672233 TTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCC 55672292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCC 300

 55672293 TCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGC 55672352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGC 360

 55672353 TCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATT 55672412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATT 420

 55672413 GTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATT 55672472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATT 480

 55672473 GACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTG 55672532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTG 540

 55672533 AGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTG 55672592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTG 600

 55672593 CAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTC 55672652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTC 660

 55672653 CTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 55672712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 720

 55672713 AGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCAC 55672772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCAC 780

 55672773 CCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGAT 55672832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGAT 840

 55672833 TGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAAT 55672892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAAT 900

 55672893 ATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCA 55672952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCA 960

 55672953 GGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGA 55673012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGA 1020

 55673013 TCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCT 55673072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCT 1080

 55673073 AAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACG 55673132
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACG 1140

 55673133 GTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTC 55673192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTC 1200

 55673193 GGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTT 55673252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTT 1260

 55673253 CTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGG 55673312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGG 1320

 55673313 GACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATT 55673372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATT 1380

 55673373 TATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATAT 55673432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATAT 1440

 55673433 TCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATT 55673492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATT 1500

 55673493 TAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCT 55673552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCT 1560

 55673553 AAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTA 55673612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTA 1620

 55673613 ATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAAC 55673672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAAC 1680

 55673673 AAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATC 55673732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATC 1740

 55673733 TTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTT 55673792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1741 TTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTT 1800

 55673793 GTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACT 55673852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACT 1860

 55673853 GCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAG 55673912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAG 1920

 55673913 GCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTAT 55673972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTAT 1980

 55673973 TGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAAT 55674032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAAT 2040

 55674033 TGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAA 55674092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAA 2100

 55674093 ATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACAT 55674152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACAT 2160

 55674153 AAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCT 55674212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCT 2220

 55674213 GAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCC 55674272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCC 2280

 55674273 TGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTT 55674332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTT 2340

 55674333 AAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGG 55674392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGG 2400

 55674393 AAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTC 55674452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTC 2460

 55674453 CACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATT 55674512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATT 2520

 55674513 CAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGT 55674572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGT 2580

 55674573 AAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAA 55674632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAA 2640

 55674633 AGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACT 55674692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACT 2700

 55674693 ACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAG 55674752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAG 2760

 55674753 GGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATT 55674812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATT 2820

 55674813 AGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAG 55674872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAG 2880

 55674873 CCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGC 55674932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGC 2940

 55674933 CATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAA 55674992
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAA 3000

 55674993 CAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCT 55675052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3001 CAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCT 3060

 55675053 GACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCAT 55675112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCAT 3120

 55675113 AACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGAT 55675172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGAT 3180

 55675173 TTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTG 55675232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTG 3240

 55675233 GGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAA 55675292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAA 3300

 55675293 AATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTT 55675352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTT 3360

 55675353 TGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACAT 55675412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACAT 3420

 55675413 AGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCA 55675472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCA 3480

 55675473 GTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTG 55675532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTG 3540

 55675533 AAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTT 55675592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTT 3600

 55675593 GCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGA 55675652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGA 3660

 55675653 TGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTA 55675712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTA 3720

 55675713 GGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCT 55675772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCT 3780

 55675773 CTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCAC 55675832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCAC 3840

 55675833 CCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATT 55675892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATT 3900

 55675893 TCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAA 55675952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAA 3960

 55675953 ATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGC 55676012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGC 4020

 55676013 ATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGT 55676072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGT 4080

 55676073 TAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGG 55676132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGG 4140

 55676133 GGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATA 55676192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATA 4200

 55676193 CCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGA 55676252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGA 4260

 55676253 GACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCT 55676312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCT 4320

 55676313 AGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAA 55676372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAA 4380

 55676373 TAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGA 55676432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGA 4440

 55676433 GGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAAT 55676492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAAT 4500

 55676493 TTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTC 55676552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTC 4560

 55676553 CCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGG 55676612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGG 4620

 55676613 AAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTT 55676672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTT 4680

 55676673 GCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTA 55676732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTA 4740

 55676733 GAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCT 55676792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCT 4800

 55676793 TATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATAT 55676852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATAT 4860

 55676853 ATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 4891

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 4951

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 5011

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 5071

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 5131

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 5191

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 5251

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 5311

 55678209 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 55678268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 5371

 55678269 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 55678328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 5431

 55678329 ATTATTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 55678388
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 ATTCTTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 5491

 55678389 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 55678448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 5551

 55678449 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 55678508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 5611

 55678509 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 55678568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 5671

 55678569 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 55678628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 5731

 55678629 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 55678688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5732 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATAAGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 5791

 55678689 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 55678748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 5851

 55678749 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTT 55678808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5852 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTT 5911

 55678809 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 55678868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 5971

 55678869 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 55678928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 6031

 55678929 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 55678988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 6091

 55678989 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 55679048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 6151

 55679049 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 55679108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 6211

 55679109 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 55679168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 6271

 55679169 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 55679228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 6331

 55679229 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 55679288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 6391

 55679289 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 55679348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 6451

 55679349 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 55679408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 6511

 55679409 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 55679468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 6571

 55679469 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 55679528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 6631

 55679529 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 55679588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 6691

 55679589 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAG 55679648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6692 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAG 6751

 55679649 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 55679708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 6811

 55679709 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 55679768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 6871

 55679769 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 55679828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 6931

 55679829 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 55679888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 6991

 55679889 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 55679948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 7051

 55679949 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 55680008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 7111

 55680009 CCACATTAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAA 55680068
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     7112 CCACATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCAAAAA 7171

 55680069 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 55680128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 7231

 55680129 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 55680188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 7291

 55680189 TTTTAGGACGGAAGTTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTA 55680248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 TTTTAGGACGGAAGTTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTA 7351

 55680249 GCCCTTCAATGGCCAACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCT 55680308
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7352 ACCCTTCAATGGCCAACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCT 7411

 55680309 GGTTGTTTCCATGATTCAGACAGG-TTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTC 55680367
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7412 GGTTGTTTCCATGATTCAGACAGGTTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTC 7471

 55680368 CATTTGTATACTTTGTTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACA 55680427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7472 CATTTGTATACTTTGTTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACA 7531

 55680428 GTTGATTCAGAATAGTGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTT 55680487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7532 GTTGATTCAGAATAGTGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTT 7591

 55680488 ATAAAATCTCTCAGGTCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCA 55680547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7592 ATAAAATCTCTCAGGTCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCA 7651

 55680548 AAAAAGTATTATTTCAGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTAT 55680607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7652 AAAAAGTATTATTTCAGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTAT 7711

 55680608 ACTCCTTTAAGACAAGTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCC 55680667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7712 ACTCCTTTAAGACAAGTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCC 7771

 55680668 AATCAGTATTTCAGTTAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCA 55680727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7772 AATCAGTATTTCAGTTAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCA 7831

 55680728 TAGAGCACATATAAAGATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTT 55680787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7832 TAGAGCACATATAAAGATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTT 7891

 55680788 CAATGAAAGTGTTCACTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAA 55680847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7892 CAATGAAAGTGTTCACTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAA 7951

 55680848 ATATGTTTGTAAAGGAGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACT 55680907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7952 ATATGTTTGTAAAGGAGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACT 8011

 55680908 TCATTTTTTATACCTTGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGG 55680967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8012 TCATTTTTTATACCTTGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGG 8071

 55680968 ATGCATGAATCGGAACAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTG 55681027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8072 ATGCATGAATCGGAACAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTG 8131

 55681028 AAATTCCCCATTAAGACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGA 55681087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8132 AAATTCCCCATTAAGACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGA 8191

 55681088 TAGATGAAAGTGTCATTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACAT 55681147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8192 TAGATGAAAGTGTCATTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACAT 8251

 55681148 CCTGGCAGACACATGTATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAA 55681207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8252 CCTGGCAGACACATGTATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAA 8311

 55681208 CAGTATCAATCCAATGAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTAT 55681267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8312 CAGTATCAATCCAATGAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTAT 8371

 55681268 TAAGATTCACGTGTAAAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAA 55681327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8372 TAAGATTCACGTGTAAAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAA 8431

 55681328 TGTTAATTCAATGGATAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGA 55681387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8432 TGTTAATTCAATGGATAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGA 8491

 55681388 CATTAGATGTTTCTAAGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTG 55681447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8492 CATTAGATGTTTCTAAGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTG 8551

 55681448 AATGGAAGGTCTCTCCACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAA 55681507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8552 AATGGAAGGTCTCTCCACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAA 8611

 55681508 TACACTTCTAAGACTGCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGA 55681567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8612 TACACTTCTAAGACTGCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGA 8671

 55681568 AATGCTCATCAATTCTGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCT 55681627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8672 AATGCTCATCAATTCTGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCT 8731

 55681628 AAGAATGCGAGTTGCACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTT 55681687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8732 AAGAATGCGAGTTGCACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTT 8791

 55681688 AAACCTTAAAATTTATTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTC 55681747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8792 AAACCTTAAAATTTATTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTC 8851

 55681748 TAGTTGCACATGTGATTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 55681807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8852 TAGTTGCACATGTGATTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 8911

 55681808 CATGTAAAACACTTAGTAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTAT 55681867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8912 CATGTAAAACACTTAGTAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTAT 8971

 55681868 GATTGAGAACAGCGTTGCTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATG 55681927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8972 GATTGAGAACAGCGTTGCTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATG 9031

 55681928 CTCTTATGACAAATGTATAAAATATATCTCCAAGAGTGTTAGTTGTATTCAATTCAGAAT 55681987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9032 CTCTTATGACAAATGTATAAAATATATCTCCAAGAGTGTTAGTTGTATTCAATTCAGAAT 9091

 55681988 ATTTTTATTTTATGGAAGTGTTCACTTTTATGTCTATCTAATACTCTTTTAAGATAAGTA 55682047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9092 ATTTTTATTTTATGGAAGTGTTCACTTTTATGTCTATCTAATACTCTTTTAAGATAAGTA 9151

 55682048 TACAAAAGATGTTTCTAAGTTTCTAGCTGTGTAGTGATTCAGAATAACATGGTCACTGAA 55682107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9152 TACAAAAGATGTTTCTAAGTTTCTAGCTGTGTAGTGATTCAGAATAACATGGTCACTGAA 9211

 55682108 AAGAAGCGCTCAACACTCAAAACTCAATCTATTACATTCCATTATGACACATGTAAACTT 55682167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9212 AAGAAGCGCTCAACACTCAAAACTCAATCTATTACATTCCATTATGACACATGTAAACTT 9271

 55682168 TCTTCTAGGAGTGCTGGTTGTGCACGTGATTAAGAACTGTGTAATTTCAGCTTAAAGATG 55682227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9272 TCTTCTAGGAGTGCTGGTTGTGCACGTGATTAAGAACTGTGTAATTTCAGCTTAAAGATG 9331

 55682228 TGTTTGAGGCACTTAATACTACTGTGGTATGACACATGTACAAAATAAGTTTCTAACACA 55682287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9332 TGTTTGAGGCACTTAATACTACTGTGGTATGACACATGTACAAAATAAGTTTCTAACACA 9391

 55682288 AGTCCTTGCCTGCATGACTCAACATTTTTTTCATTGATTAAAAGTGTTCACCATTCTTAA 55682347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9392 AGTCCTTGCCTGCATGACTCAACATTTTTTTCATTGATTAAAAGTGTTCACCATTCTTAA 9451

 55682348 GTTCATTTAATACATTCTTTTAAGACACACTTACCAGACTGTTTCTAAGGGTATGAATTA 55682407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9452 GTTCATTTAATACATTCTTTTAAGACACACTTACCAGACTGTTTCTAAGGGTATGAATTA 9511

 55682408 TATGCTTGATTTACAACAGTTTTATTTCAGTAAATAGAAGTGTTCATCACTCAAACTCCA 55682467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9512 TATGCTTGATTTACAACAGTTTTATTTCAGTAAATAGAAGTGTTCATCACTCAAACTCCA 9571

 55682468 TCTAGTAGACTTAAAACACATATATTAAACACATGTTGAACTTGGTAAGTTGTGCAAGTA 55682527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9572 TCTAGTAGACTTAAAACACATATATTAAACACATGTTGAACTTGGTAAGTTGTGCAAGTA 9631

 55682528 ATTCAGAATGTGTGAATTCAGGGAAGGGATATGTTAACTACTCTTAGCTATTGTAATACA 55682587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9632 ATTCAGAATGTGTGAATTCAGGGAAGGGATATGTTAACTACTCTTAGCTATTGTAATACA 9691

 55682588 TTCTGTTAGGACACATGTATAAAAGATGTTTCTAAGAGTGCTGGTGTGCAGCTTATCTAG 55682647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9692 TTCTGTTAGGACACATGTATAAAAGATGTTTCTAAGAGTGCTGGTGTGCAGCTTATCTAG 9751

 55682648 AAAAGTTTTATTTATTTATTGACTTATTTTTTTCTTTTTAGCATCAGGTTGGTGAAAATA 55682707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9752 AAAAGTTTTATTTATTTATTGACTTATTTTTTTCTTTTTAGCATCAGGTTGGTGAAAATA 9811

 55682708 TTTTTTTATTTTAATTGACAGATAAATGCTTATTTTAATTGACATATATTTATTTATTTT 55682767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9812 TTTTTTTATTTTAATTGACAGATAAATGCTTATTTTAATTGACATATATTTATTTATTTT 9871

 55682768 TAATTGACAGATAAAAATATTTATTTATGTTTTTATTTTTTAGTTTTTTTGAGACGGACT 55682827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9872 TAATTGACAGATAAAAATATTTATTTATGTTTTTATTTTTTAGTTTTTTTGAGACGGACT 9931

 55682828 CTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGC 55682887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9932 CTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGC 9991

 55682888 CTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCC 55682947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9992 CTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCC 10051

 55682948 TGCCACCACACCCAACTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTT 55683007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10052 TGCCACCACACCCAACTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTT 10111

 55683008 CGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTCATCCTCCCAAAGTGC 55683067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10112 CGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTCATCCTCCCAAAGTGC 10171

 55683068 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAAATATTTATTTTTAACTGACAATT 55683127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10172 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAAATATTTATTTTTAACTGACAATT 10231

 55683128 TTTAATT 55683134
          |||||||
    10232 TTTAATT 10238

Alignment time is 7.3281 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4892] =>      4892 nucs 'mol-32-2fb7-045190_4892'

Score:        4858
Aligned:      4891        nucs
Identic:      4888 (100%) nucs =>      1108 (100%)      3780 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55671993,55673100] EXCISED REGION [55673102,55676884]
 second seq =>  [       1,    1108] EXCISED REGION [    1110,    4892]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55673101,55673101]
 second seq =>         1 nucs [1109,1109]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1107,1108] to [1108,1109]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55671993 TAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAG 55672052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAG 60

 55672053 TTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGA 55672112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGA 120

 55672113 GGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGA 55672172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGA 180

 55672173 AATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATT 55672232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATT 240

 55672233 TTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCC 55672292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCC 300

 55672293 TCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGC 55672352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGC 360

 55672353 TCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATT 55672412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATT 420

 55672413 GTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATT 55672472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATT 480

 55672473 GACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTG 55672532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTG 540

 55672533 AGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTG 55672592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTG 600

 55672593 CAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTC 55672652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTC 660

 55672653 CTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 55672712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 720

 55672713 AGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCAC 55672772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCAC 780

 55672773 CCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGAT 55672832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGAT 840

 55672833 TGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAAT 55672892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAAT 900

 55672893 ATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCA 55672952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCA 960

 55672953 GGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGA 55673012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGA 1020

 55673013 TCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCT 55673072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCT 1080

 55673073 AAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATT 55673100
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATT 1108

EXCISED REGION

 55673102 AAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATG 55673161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 AAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATG 1169

 55673162 AACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCA 55673221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 AACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCA 1229

 55673222 TGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCT 55673281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCT 1289

 55673282 ATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAAC 55673341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 ATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAAC 1349

 55673342 TTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATA 55673401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATA 1409

 55673402 CTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATT 55673461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 CTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATT 1469

 55673462 GAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATA 55673521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 GAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATA 1529

 55673522 TAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGT 55673581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 TAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGT 1589

 55673582 TTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTAC 55673641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTAC 1649

 55673642 AATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTT 55673701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 AATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTT 1709

 55673702 TCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAA 55673761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAA 1769

 55673762 AGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATAT 55673821
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 AGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATAT 1829

 55673822 ACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATA 55673881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 ACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATA 1889

 55673882 CCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATA 55673941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATA 1949

 55673942 CTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTT 55674001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 CTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTT 2009

 55674002 CATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCAT 55674061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 CATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCAT 2069

 55674062 TATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGG 55674121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGG 2129

 55674122 AGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTC 55674181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTC 2189

 55674182 AGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCT 55674241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCT 2249

 55674242 CTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACT 55674301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 CTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACT 2309

 55674302 ATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCC 55674361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 ATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCC 2369

 55674362 CAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAAC 55674421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 CAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAAC 2429

 55674422 ACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAG 55674481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 ACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAG 2489

 55674482 AATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAA 55674541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 AATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAA 2549

 55674542 ATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAA 55674601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 ATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAA 2609

 55674602 GAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAA 55674661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAA 2669

 55674662 GCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTG 55674721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 GCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTG 2729

 55674722 CTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATAT 55674781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 CTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATAT 2789

 55674782 CAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAA 55674841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 CAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAA 2849

 55674842 GTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAAT 55674901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAAT 2909

 55674902 CTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCC 55674961
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2910 CTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCC 2969

 55674962 ATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAA 55675021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 ATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAA 3029

 55675022 CCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAA 55675081
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 CCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAA 3089

 55675082 ATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCT 55675141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 ATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCT 3149

 55675142 CCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCT 55675201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 CCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCT 3209

 55675202 TTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAA 55675261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 TTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAA 3269

 55675262 GTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTC 55675321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 GTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTC 3329

 55675322 TTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGT 55675381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 TTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGT 3389

 55675382 TAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAG 55675441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 TAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAG 3449

 55675442 AGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTT 55675501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 AGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTT 3509

 55675502 CATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTAC 55675561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 CATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTAC 3569

 55675562 GGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTC 55675621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 GGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTC 3629

 55675622 TGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTC 55675681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 TGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTC 3689

 55675682 TGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTG 55675741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 TGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTG 3749

 55675742 AAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATAT 55675801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 AAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATAT 3809

 55675802 TGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTT 55675861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 TGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTT 3869

 55675862 CATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCA 55675921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 CATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCA 3929

 55675922 CACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCAT 55675981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 CACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCAT 3989

 55675982 AATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGA 55676041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 AATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGA 4049

 55676042 CCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTT 55676101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 CCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTT 4109

 55676102 ATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAG 55676161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 ATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAG 4169

 55676162 AATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTC 55676221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 AATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTC 4229

 55676222 TTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACT 55676281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 TTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACT 4289

 55676282 GGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCT 55676341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 GGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCT 4349

 55676342 AATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAA 55676401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 AATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAA 4409

 55676402 TATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAAT 55676461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 TATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAAT 4469

 55676462 AGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAG 55676521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 AGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAG 4529

 55676522 GGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAG 55676581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 GGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAG 4589

 55676582 CTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAG 55676641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 CTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAG 4649

 55676642 TCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATT 55676701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 TCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATT 4709

 55676702 CTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAA 55676761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 CTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAA 4769

 55676762 GACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCT 55676821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 GACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCT 4829

 55676822 CATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTA 55676881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 CATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTA 4889

 55676882 GTT 55676884
          |||
     4890 GTT 4892

Alignment time is 3.63315 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9299] =>      9299 nucs 'mol-32-2fc2-108945_9299'

Score:        9051
Aligned:      9307        nucs
Identic:      9269 (100%) nucs =>      8949 (100%)       320 (100%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55667912,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678108]
 second seq =>  [       1,    8979] EXCISED REGION [    8980,    9299]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [8979,8979] to [8980,8980]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55667912 CAATCAGGAAGGATAAAGAAGAGCAGTACATGATGATAAAAGGTTTAATTCAACAAGAAG 55667971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATCAGGAAGGATAAAGAAGAGCAGTACATGATGATAAAAGGTTTAATTCAACAAGAAG 60

 55667972 ACCTGACCATTCTAAACATACACGTACCCAATATAGGAGCACCCAGATTCATAAAACAAA 55668031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTGACCATTCTAAACATACACGTACCCAATATAGGAGCACCCAGATTCATAAAACAAA 120

 55668032 TTTTTCTTGACTAACAAAAAGACTTAGACAGTCACACAATAATAGTGGGGGACCTTAACA 55668091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTCTTGACTAACAAAAAGACTTAGACAGTCACACAATAATAGTGGGGGACCTTAACA 180

 55668092 CCCCACTGGCAGTGTTAGATCATCAAGGCTGAAAACTAACAAAGAAAATCTGGGCTTAAA 55668151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCCACTGGCAGTGTTAGATCATCAAGGCTGAAAACTAACAAAGAAAATCTGGGCTTAAA 240

 55668152 CTCGACATGTGACCAATTGAACCTAATAGATATCTACAGAGTACTCCATCTAACAATAAT 55668211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCGACATGTGACCAATTGAACCTAATAGATATCTACAGAGTACTCCATCTAACAATAAT 300

 55668212 AGAATATACATATGTTTCATTCATACTATTCTAAGATTGACTACATGCCATCCTGGCTAA 55668271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAATATACATATGTTTCATTCATACTATTCTAAGATTGACTACATGCCATCCTGGCTAA 360

 55668272 CATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGCAGTGGCACGTG 55668331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGCAGTGGCACGTG 420

 55668332 CCTGTAGTCCCAGCTACTCAGAAGGCTATGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGACGG 55668391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGTAGTCCCAGCTACTCAGAAGGCTATGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGACGG 480

 55668392 AGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACTCTACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAATC 55668451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACTCTACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAATC 540

 55668452 TGTCTTTAAAAAATTATACGGCTAAATGCCTTTAACAAGAGGTTATAAAGATCTGACATG 55668511
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTCTTTAAAAAATTATACGGCTAAATGTCTTTAACAAGAGGTTATAAAGATCTGACATG 600

 55668512 AATGACCTAACGGTGCAACTGGAGGAAATAGATAAAATGAAAAATCCAACCCAGAGCTGG 55668571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGACCTAACGGTGCAACTGGAGGAAATAGATAAAATGAAAAATCCAACCCAGAGCTGG 660

 55668572 TAGAATAAAACAAAGGACTAAAATCAGAGAAGAACGGAAGGAAATTTTGACCCAAAAGTC 55668631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGAATAAAACAAAGGACTAAAATCAGAGAAGAACGGAAGGAAATTTTGACCCAAAAGTC 720

 55668632 CATACAAAAGATAAATGAAACCAAGAGTTGGTTCTTCAAAAGAATAAATAAGATCGATGG 55668691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATACAAAAGATAAATGAAACCAAGAGTTGGTTCTTCAAAAGAATAAATAAGATCGATGG 780

 55668692 TTGTTAGCAAGATTAACGAAGAAAAAAATGAGATAATCCAAATAAGCACAATAAGAAATG 55668751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGTTAGCAAGATTAACGAAGAAAAAAATGAGATAATCCAAATAAGCACAATAAGAAATG 840

 55668752 ACAAAGACGACATTATTACCGATCCCACAGAAATACAAAAGATTCTCAGAGACTATTATG 55668811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAAGACGACATTATTACCGATCCCACAGAAATACAAAAGATTCTCAGAGACTATTATG 900

 55668812 AACATCTTTATGCACACAAATTAGGAAATCTAGAGGAAACCTGTAAGTTCCTAGAAACAC 55668871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACATCTTTATGCACACAAATTAGGAAATCTAGAGGAAACCTGTAAGTTCCTAGAAACAC 960

 55668872 ACAACCTCCCAAGATTCTTTCAGGAAGAAAGTGAAAACTTGGATAGACCAATAACAAGTT 55668931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAACCTCCCAAGATTCTTTCAGGAAGAAAGTGAAAACTTGGATAGACCAATAACAAGTT 1020

 55668932 TGGAAATTGAATCAGCAATAAAAATCCTACCAACCAAAAAGAGCTCTGGACCAGGTGGAT 55668991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGAAATTGAATCAGCAATAAAAATCCTACCAACCAAAAAGAGCTCTGGACCAGGTGGAT 1080

 55668992 TCACATCTGAAT--------TCTTTTTTTTTTTTTTTTTT--AGACGGATTTTCGCTCTT 55669041
          ||||||||||||        ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
     1081 TCACATCTGAATATCTGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGACGGATTTTCGCTCTT 1140

 55669042 GTCGGCCGGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGATTCACTGCAACTTCCGCCTCCTGGG 55669101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCGGCCGGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGATTCACTGCAACTTCCGCCTCCTGGG 1200

 55669102 TTCAAGTGATTCTCCTGCATCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTACAGGCATGTGCCACTA 55669161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCAAGTGATTCTCCTGCATCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTACAGGCATGTGCCACTA 1260

 55669162 TGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTTCAGTGGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGC 55669221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTTCAGTGGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGC 1320

 55669222 TGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTCACAG 55669281
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAGTGATCCATCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTCACAG 1380

 55669282 GCGTCAGCCACTGCACCCGGCCCCACACATCCGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGAAC 55669341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCGTCAGCCACTGCACCCGGCCCCACACATCCGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGAAC 1440

 55669342 TGATACCAATTCTATTGAAACTTTTCCAGAAAATCGAGGAGGAGGGGCTTCTCCTTAACT 55669401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGATACCAATTCTATTGAAACTTTTCCAGAAAATCGAGGAGGAGGGGCTTCTCCTTAACT 1500

 55669402 CATTCTAAGAAGCCAGCATCATCCTGATACAAAAATCTGGCAGAGACACAATGAAAATGA 55669461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATTCTAAGAAGCCAGCATCATCCTGATACAAAAATCTGGCAGAGACACAATGAAAATGA 1560

 55669462 AAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATAAACATAGATGTAAAAATCCTCAACAAAATACTAG 55669521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATAAACATAGATGTAAAAATCCTCAACAAAATACTAG 1620

 55669522 CAAACCAAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTAAACCACAATGATCAAGCATACTTTATTT 55669581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAACCAAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTAAACCACAATGATCAAGCATACTTTATTT 1680

 55669582 CTAGGATACAAGGTTGGTTCAAAATATGCAAATCAACAAATGTGATTCATCACTAAGCAG 55669641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTAGGATACAAGGTTGGTTCAAAATATGCAAATCAACAAATGTGATTCATCACTAAGCAG 1740

 55669642 AACTAAAGACAAAAACCATAAGGTCATCTCAATAGATGCAGAAAAAAGCCTTTGGTAAAA 55669701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACTAAAGACAAAAACCATAAGGTCATCTCAATAGATGCAGAAAAAAGCCTTTGGTAAAA 1800

 55669702 TCCAACGTC----CCTTCATGATAAAAACTCTCAACATATTATGCTGAGAGTTCAACATA 55669757
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCAA----AAATCCTTCATGATAAAAACTCTCAACATATTATGCTGAGAGTTCAACATA 1856

 55669758 TAATATTGAAGGAATATACCTCAAAATTATAAGAGCCATCTATGACAAACCCACAACCAA 55669817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TAATATTGAAGGAATATACCTCAAAATTATAAGAGCCATCTATGACAAACCCACAACCAA 1916

 55669818 CATCATACCGAATGGGCAAAAGCTGGAACCATTCCCTTTGAAAATTGGAACAAGACAAGG 55669877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1917 CATCATACCGAATGGGCAAAAGCTGGAACCATTCCCTTTGAAAACTGGAACAAGACAAGG 1976

 55669878 ATTCCCACTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCCTGGTCAGATAAATCAG 55669937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 ATTCCCACTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCCTGGTCAGATAAATCAG 2036

 55669938 GCAAGAGAAGGAAAGAAAATGCATATGAACAGGAAAAGAAGGAGTCCAAACTCTCTCTTT 55669997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GCAAGAGAAGGAAAGAAAATGCATATGAACAGGAAAAGAAGGAGTCCAAACTCTCTCTTT 2096

 55669998 GCCAATATTATTCTACACCAAGAAAACCCTAAAGACTCTGCCAAAAGGCTTCTGGAAATG 55670057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 GCCAATATTATTCTACACCAAGAAAACCCTAAAGACTCTGCCAAAAGGCTTCTGGAAATG 2156

 55670058 ATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGGTACAAAATCAATATACAAAAATCAATAGCATTT 55670117
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2157 ATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGGTACAAAATCAATGTACAAAAATCAATAGCATTT 2216

 55670118 TTATACATCAATAACATTCTACCTGAGAACCAAATCAAGAACACAATCCCATTTACAATA 55670177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTATACATCAATAACATTCTACCTGAGAACCAAATCAAGAACACAATCCCATTTACAATA 2276

 55670178 GCCACAAAGGAAATGAAATACCTATGAATTCATCTAACCAAGGAAGTGAAAGATCTCTAC 55670237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 GCCACAAAGGAAATGAAATACCTATGAATTCATCTAACCAAGGAAGTGAAAGATCTCTAC 2336

 55670238 AAGGAGAACTACAAAGCACTGCTGAAAGAAATCAGAGACTATACAAATAAATAAATGGAA 55670297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AAGGAGAACTACAAAGCACTGCTGAAAGAAATCAGAGACTATACAAATAAATAAATGGAA 2396

 55670298 AAATGTTCCATGCTCATGGATTAGAATGATCAATATAGTTAAAATGGCCATACTGCCCAA 55670357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AAATGTTCCATGCTCATGGATTAGAATGATCAATATAGTTAAAATGGCCATACTGCCCAA 2456

 55670358 AGCAATTTACAAGTTCAATGCAATTCTTATTAAAATACCAACATCATTTTTCACAGAATA 55670417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 AGCAATTTACAAGTTCAATGCAATTCTTATTAAAATACCAACATCATTTTTCACAGAATA 2516

 55670418 AGAAAAACCTATTCTAAAATTCATTTGGAACCAAAAACAGAGCCCGAATAGCCAAAGCAA 55670477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 AGAAAAACCTATTCTAAAATTCATTTGGAACCAAAAACAGAGCCCGAATAGCCAAAGCAA 2576

 55670478 TTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAGCCATAGGCATCATATTGCTTGACTTCAAACTCTACTA 55670537
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2577 TTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAGCCATAGGCATCATATTGCTTAACTTCAAACTCTACTA 2636

 55670538 CAGTATACAGCTACCGTAATCAAAACAGCATGATACTGGTACAAAAACAGACAGTGGAAC 55670597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CAGTATACAGCTACCGTAATCAAAACAGCATGATACTGGTACAAAAACAGACAGTGGAAC 2696

 55670598 AGAATGGAAAACCCAGAAATCTACCTGCACACCTACAACCATCTGACAAAATCAACACAA 55670657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AGAATGGAAAACCCAGAAATCTACCTGCACACCTACAACCATCTGACAAAATCAACACAA 2756

 55670658 ATAAGCAGCAGGGAAAGGAGTCTCTATTCAAAGAATGGTGGTGGAATATCTGCCTAGGCA 55670717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 ATAAGCAGCAGGGAAAGGAGTCTCTATTCAAAGAATGGTGGTGGAATATCTGCCTAGGCA 2816

 55670718 TATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAACTCTCACCATACTCAAAAATGAACTCAAGAT 55670777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAACTCTCACCATACTCAAAAATGAACTCAAGAT 2876

 55670778 GGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAAACTATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAA 55670837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 GGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAAACTATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAA 2936

 55670838 ATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATGATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTAC 55670897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 ATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATGATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTAC 2996

 55670898 GACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAA 55670957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAA 3056

 55670958 AGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGCCTACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTA 55671017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGCCTACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTA 3116

 55671018 TGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTACAAGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAA- 55671076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3117 TGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTACAAGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAAA 3176

 55671077 CCAATTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAACACTTTTCAAAAGGAGACATACACATGGCCA 55671136
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CCAGTTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAACACTTTTCAAAAGGAGACATACACATGGCCA 3236

 55671137 AAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTACTAATCATCAGAGACATACAAATCAAAACCA 55671196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 AAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTACTAATCATCAGAGACATACAAATCAAAACCA 3296

 55671197 AGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAATGGCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAAC 55671256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAATGGCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAAC 3356

 55671257 AGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAATGCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAG 55671316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAATGCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAG 3416

 55671317 CTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGCTGTTTGGAGATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCA 55671376
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGTTGTTTGGAGATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCA 3476

 55671377 CCATTCAGTGCTGCAATCCCGCTACTGGGTATATACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTAT 55671436
          |||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CCATTCAATGCTGCAATCCCACTACTGGGTATATACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTAT 3536

 55671437 CATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATTGCAGCACTACTCACAATAGTAAGGACATAG 55671496
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
     3537 CATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAGGACATAG 3596

 55671497 AAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTGGATAAAGGATATGTGGTACACATACACC 55671556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTGGATAAAGGATATGTGGTACACATACACC 3656

 55671557 ATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAATGGAATCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATG 55671616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 ATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAATGGAATCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATG 3716

 55671617 GATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACCTAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACA 55671676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACCTAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACA 3776

 55671677 CATGTTCTCACTTACAGGTGGGAGCTAAACACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAA 55671736
          |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CATGTTCTCAC----AGGTGGGAGCTAAACACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAA 3832

 55671737 CAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAAC 55671796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 CAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAAC 3892

 55671797 CACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCA 55671856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 CACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACCTCA 3952

 55671857 GTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCACATGTACCCTTTAATCTACAATAAAA 55671916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCACATGTACCCTTTAATCTACAATAAAA 4012

 55671917 GTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTA 55671976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 GTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAAGTA 4072

 55671977 ATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCT 55672036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 ATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCATCT 4132

 55672037 GACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAG 55672096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 GACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGCAAG 4192

 55672097 GTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTG 55672156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 GTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTG 4252

 55672157 ATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAAT 55672216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 ATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAAT 4312

 55672217 GTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGA 55672276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 GTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGA 4372

 55672277 AAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGC 55672336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 AAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGC 4432

 55672337 TGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTT 55672396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 TGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTT 4492

 55672397 CATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTA 55672456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 CATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTA 4552

 55672457 TACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCC 55672516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 TACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCC 4612

 55672517 AATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACC 55672576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 AATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACC 4672

 55672577 CAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATT 55672636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 CAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATT 4732

 55672637 CTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAA 55672696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 CTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAA 4792

 55672697 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCC 55672756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCC 4852

 55672757 TGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAC 55672816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 TGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAC 4912

 55672817 CGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACA 55672876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 CGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACA 4972

 55672877 TTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGC 55672936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 TTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGC 5032

 55672937 CTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACC 55672996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 CTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACC 5092

 55672997 TCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGC 55673056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 TCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGC 5152

 55673057 ACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGT 55673116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5153 ACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATGGGGT 5212

 55673117 ATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAA 55673176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 ATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAA 5272

 55673177 GAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCT 55673236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 GAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCT 5332

 55673237 GGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAA 55673296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 GGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAA 5392

 55673297 TAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAA 55673356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 TAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAA 5452

 55673357 TATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGT 55673416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 TATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGT 5512

 55673417 CTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTT 55673476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 CTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTT 5572

 55673477 ATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCT 55673536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 ATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCT 5632

 55673537 TTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTA 55673596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 TTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTA 5692

 55673597 TAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAA 55673656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 TAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAA 5752

 55673657 TATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATG 55673716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 TATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATG 5812

 55673717 TGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTT 55673776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 TGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTT 5872

 55673777 AGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATA 55673836
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 AGCTAAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATA 5932

 55673837 GACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAAT 55673896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 GACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAAT 5992

 55673897 TATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGG 55673956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 TATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGG 6052

 55673957 TTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTG 55674016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 TTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTG 6112

 55674017 TTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAA 55674076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 TTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAA 6172

 55674077 ACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAA 55674136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 ACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAA 6232

 55674137 CAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATA 55674196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 CAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATA 6292

 55674197 TGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGAC 55674256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 TGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGAC 6352

 55674257 TGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGG 55674316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGG 6412

 55674317 TTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACAC 55674376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 TTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACAC 6472

 55674377 AAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGC 55674436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 AAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGC 6532

 55674437 TGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTT 55674496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 TGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTT 6592

 55674497 TTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATT 55674556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 TTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATT 6652

 55674557 TATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCA 55674616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 TATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCA 6712

 55674617 ACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCAT 55674676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 ACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCAT 6772

 55674677 CAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAA 55674736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 CAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAA 6832

 55674737 GGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATT 55674796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 GGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATT 6892

 55674797 CTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCA 55674856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 CTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCA 6952

 55674857 AGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGC 55674916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 AGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGC 7012

 55674917 ACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATG 55674976
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 ACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATG 7072

 55674977 TTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACC 55675036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 TTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACC 7132

 55675037 TCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTT 55675096
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 TCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTT 7192

 55675097 TCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTC 55675156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 TCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTC 7252

 55675157 AGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTA 55675216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 AGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTA 7312

 55675217 ATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTA 55675276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 ATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTA 7372

 55675277 CTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAAT 55675336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 CTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAAT 7432

 55675337 AATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGG 55675396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 AATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGG 7492

 55675397 CTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACA 55675456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 CTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACA 7552

 55675457 GTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATG 55675516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 GTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATG 7612

 55675517 TATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGG 55675576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 TATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGG 7672

 55675577 AATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTG 55675636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 AATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTG 7732

 55675637 GGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTA 55675696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7733 GGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTA 7792

 55675697 AACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAAT 55675756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7793 AACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAAT 7852

 55675757 AACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAA 55675816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7853 AACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAA 7912

 55675817 ACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTT 55675876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7913 ACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTT 7972

 55675877 GCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCT 55675936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7973 GCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCT 8032

 55675937 AAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGG 55675996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8033 AAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGG 8092

 55675997 AGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTC 55676056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8093 AGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTC 8152

 55676057 AACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGA 55676116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8153 AACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGA 8212

 55676117 CTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTC 55676176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8213 CTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTC 8272

 55676177 CAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGC 55676236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8273 CAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGC 8332

 55676237 TCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAG 55676296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8333 TCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAG 8392

 55676297 AAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGAC 55676356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8393 AAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGAC 8452

 55676357 ATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTG 55676416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8453 ATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTG 8512

 55676417 GCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAA 55676476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8513 GCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAA 8572

 55676477 AATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCA 55676536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8573 AATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCA 8632

 55676537 AAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTC 55676596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8633 AAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTC 8692

 55676597 TCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTAC 55676656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8693 TCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTAC 8752

 55676657 TAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATC 55676716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8753 TAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATC 8812

 55676717 CACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGAC 55676776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8813 CACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGAC 8872

 55676777 GAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCT 55676836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8873 GAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCT 8932

 55676837 TCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8933 TCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 8979

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8980 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 9039

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9040 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 9099

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9100 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 9159

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9160 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 9219

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9220 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 9279

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAG 55678108
          ||||||||||||||||||||
     9280 ATATCTATGATTTCATGTAG 9299

Alignment time is 6.87942 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4760] =>      4760 nucs 'mol-32-2fd8-102351_4760'

Score:        4683
Aligned:      4760        nucs
Identic:      4753 (100%) nucs =>       657 (100%)      4096 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55676227,55676883] EXCISED REGION [55677789,55681890]
 second seq =>  [       1,     657] EXCISED REGION [     658,    4760]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [657,657] to [658,658]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55676227 GAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGG 55676286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGG 60

 55676287 AATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATAC 55676346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATAC 120

 55676347 TGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCT 55676406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCT 180

 55676407 TTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTA 55676466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTA 240

 55676467 TCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTG 55676526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTG 300

 55676527 TCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGA 55676586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGA 360

 55676587 TTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGT 55676646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGT 420

 55676647 TTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCT 55676706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCT 480

 55676707 TAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTC 55676766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTC 540

 55676767 TGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGA 55676826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGA 600

 55676827 AGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 657

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 717

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 777

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 837

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 897

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 957

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 1017

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 1077

 55678209 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 55678268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 1137

 55678269 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 55678328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 1197

 55678329 ATTATTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 55678388
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 ATTCTTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 1257

 55678389 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 55678448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 1317

 55678449 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 55678508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 1377

 55678509 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 55678568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 1437

 55678569 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 55678628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 1497

 55678629 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 55678688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1498 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATAAGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 1557

 55678689 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 55678748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 1617

 55678749 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTT 55678808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1618 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTT 1677

 55678809 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 55678868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 1737

 55678869 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 55678928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 1797

 55678929 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 55678988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 1857

 55678989 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 55679048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 1917

 55679049 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 55679108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 1977

 55679109 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 55679168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 2037

 55679169 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 55679228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 2097

 55679229 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 55679288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 2157

 55679289 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 55679348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 2217

 55679349 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 55679408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 2277

 55679409 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 55679468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 2337

 55679469 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 55679528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 2397

 55679529 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 55679588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 2457

 55679589 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAG 55679648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2458 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAG 2517

 55679649 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 55679708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 2577

 55679709 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 55679768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 2637

 55679769 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 55679828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 2697

 55679829 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 55679888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 2757

 55679889 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 55679948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 2817

 55679949 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 55680008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 2877

 55680009 CCACATTAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAA 55680068
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2878 CCACATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCAAAAA 2937

 55680069 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 55680128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 2997

 55680129 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 55680188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 3057

 55680189 TTTTAGGACGGAAGTTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTA 55680248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TTTTAGGACGGAAGTTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTA 3117

 55680249 GCCCTTCAATGGCCAACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCT 55680308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GCCCTTCAATGGCCAACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCT 3177

 55680309 GGTTGTTTCCATGATTCAGACAGG-TTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTC 55680367
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GGTTGTTTCCATGATTCAGACAGGTTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTC 3237

 55680368 CATTTGTATACTTTGTTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACA 55680427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CATTTGTATACTTTGTTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACA 3297

 55680428 GTTGATTCAGAATAGTGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTT 55680487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GTTGATTCAGAATAGTGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTT 3357

 55680488 ATAAAATCTCTCAGGTCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCA 55680547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ATAAAATCTCTCAGGTCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCA 3417

 55680548 AAAAAGTATTATTTCAGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTAT 55680607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AAAAAGTATTATTTCAGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTAT 3477

 55680608 ACTCCTTTAAGACAAGTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCC 55680667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ACTCCTTTAAGACAAGTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCC 3537

 55680668 AATCAGTATTTCAGTTAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCA 55680727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AATCAGTATTTCAGTTAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCA 3597

 55680728 TAGAGCACATATAAAGATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTT 55680787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TAGAGCACATATAAAGATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTT 3657

 55680788 CAATGAAAGTGTTCACTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAA 55680847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CAATGAAAGTGTTCACTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAA 3717

 55680848 ATATGTTTGTAAAGGAGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACT 55680907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 ATATGTTTGTAAAGGAGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACT 3777

 55680908 TCATTTTTTATACCTTGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGG 55680967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TCATTTTTTATACCTTGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGG 3837

 55680968 ATGCATGAATCGGAACAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTG 55681027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 ATGCATGAATCGGAACAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTG 3897

 55681028 AAATTCCCCATTAAGACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGA 55681087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AAATTCCCCATTAAGACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGA 3957

 55681088 TAGATGAAAGTGTCATTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACAT 55681147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TAGATGAAAGTGTCATTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACAT 4017

 55681148 CCTGGCAGACACATGTATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAA 55681207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CCTGGCAGACACATGTATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAA 4077

 55681208 CAGTATCAATCCAATGAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTAT 55681267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 CAGTATCAATCCAATGAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTAT 4137

 55681268 TAAGATTCACGTGTAAAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAA 55681327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TAAGATTCACGTGTAAAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAA 4197

 55681328 TGTTAATTCAATGGATAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGA 55681387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TGTTAATTCAATGGATAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGA 4257

 55681388 CATTAGATGTTTCTAAGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTG 55681447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CATTAGATGTTTCTAAGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTG 4317

 55681448 AATGGAAGGTCTCTCCACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAA 55681507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 AATGGAAGGTCTCTCCACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAA 4377

 55681508 TACACTTCTAAGACTGCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGA 55681567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TACACTTCTAAGACTGCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGA 4437

 55681568 AATGCTCATCAATTCTGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCT 55681627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 AATGCTCATCAATTCTGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCT 4497

 55681628 AAGAATGCGAGTTGCACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTT 55681687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 AAGAATGCGAGTTGCACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTT 4557

 55681688 AAACCTTAAAATTTATTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTC 55681747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AAACCTTAAAATTTATTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTC 4617

 55681748 TAGTTGCACATGTGATTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 55681807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TAGTTGCACATGTGATTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 4677

 55681808 CATGTAAAACACTTAGTAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTAT 55681867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 CATGTAAAACACTTAGTAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTAT 4737

 55681868 GATTGAGAACAGCGTTGCTTCAG 55681890
          |||||||||||||||||||||||
     4738 GATTGAGAACAGCGTTGCTTCAG 4760

Alignment time is 3.52287 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2389] =>      2389 nucs 'mol-32-2fe3-199962_2389'

Score:        2367
Aligned:      2389        nucs
Identic:      2387 (100%) nucs =>        72 (100%)      2315 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55674704,55674775] EXCISED REGION [55674777,55677093]
 second seq =>  [       1,      72] EXCISED REGION [      74,    2389]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55674776,55674776]
 second seq =>         1 nucs [73,73]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55676949,55676949]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [72,72] to [73,73]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55674704 AGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTG 55674763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTG 60

 55674764 AAGAACTTGATC 55674775
          ||||||||||||
       61 AAGAACTTGATC 72

EXCISED REGION

 55674777 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 55674836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       74 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 133

 55674837 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 55674896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      134 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 193

 55674897 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 55674956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      194 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 253

 55674957 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 55675016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      254 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 313

 55675017 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 55675076
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      314 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 373

 55675077 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 55675136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      374 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 433

 55675137 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 55675196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      434 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 493

 55675197 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 55675256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      494 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 553

 55675257 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 55675316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      554 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 613

 55675317 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 55675376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      614 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 673

 55675377 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 55675436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      674 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 733

 55675437 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 55675496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      734 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 793

 55675497 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 55675556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 853

 55675557 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 55675616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 913

 55675617 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 55675676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 973

 55675677 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 55675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 1033

 55675737 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 55675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 1093

 55675797 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 55675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 1153

 55675857 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 55675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 1213

 55675917 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 55675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 1273

 55675977 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 55676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 1333

 55676037 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 55676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 1393

 55676097 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 55676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 1453

 55676157 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 55676216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 1513

 55676217 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 55676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 1573

 55676277 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 55676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 1633

 55676337 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 55676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 1693

 55676397 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 55676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 1753

 55676457 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 55676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 1813

 55676517 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 55676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 1873

 55676577 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 55676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 1933

 55676637 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 55676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 1993

 55676697 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 55676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 2053

 55676757 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 55676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 2113

 55676817 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 55676876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 2173

 55676877 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 55676936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 2233

 55676937 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 55676996
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TGCAATGTATTC-TTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 2292

 55676997 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATT 55677056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATT 2352

 55677057 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGG 55677093
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGG 2389

Alignment time is 1.78187 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2153] =>      2153 nucs 'mol-32-3004-025703_2153'

Score:        2108
Aligned:      2152        nucs
Identic:      2148 (100%) nucs =>       517 (100%)      1631 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55677166,55677682] EXCISED REGION [55677685,55679318]
 second seq =>  [       1,     517] EXCISED REGION [     519,    2153]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [518,518]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55677166 GTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 55677225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 60

 55677226 GGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGG 55677285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGG 120

 55677286 TTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCT 55677345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCT 180

 55677346 CAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGT 55677405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGT 240

 55677406 GTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCC 55677465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCC 300

 55677466 CCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGG 55677525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGG 360

 55677526 TGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAA 55677585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAA 420

 55677586 GTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGT 55677645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGT 480

 55677646 GAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 517

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTC-TTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 55677743
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
      519 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAA 578

 55677744 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 55677803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      579 TCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAG 638

 55677804 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 55677863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 AATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAG 698

 55677864 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 55677923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 TTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGT 758

 55677924 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 55677983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      759 TATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACT 818

 55677984 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 55678043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 TATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGAT 878

 55678044 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 55678103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 ATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCA 938

 55678104 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 55678163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 TGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCA 998

 55678164 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 55678223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 GTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCC 1058

 55678224 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 55678283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 ACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTG 1118

 55678284 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 55678343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 ATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGAT 1178

 55678344 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 55678403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 TCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAG 1238

 55678404 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 55678463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 TACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGC 1298

 55678464 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATT 55678523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 TGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATT 1358

 55678524 TATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAA 55678583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 TATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAA 1418

 55678584 CATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAG 55678643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 CATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAG 1478

 55678644 AAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTT 55678703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 AAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTT 1538

 55678704 CCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCT 55678763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1539 CCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTCTTTCTCT 1598

 55678764 ATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATG 55678823
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 ATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATG 1658

 55678824 ATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGG 55678883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 ATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGG 1718

 55678884 GAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTT 55678943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 GAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTT 1778

 55678944 TTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCAC 55679003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCAC 1838

 55679004 AAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCT 55679063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 AAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCT 1898

 55679064 GTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCC 55679123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 GTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCC 1958

 55679124 TATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTA 55679183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 TATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTA 2018

 55679184 GGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTG 55679243
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 GGTGCTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTG 2078

 55679244 TCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCA 55679303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 TCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCA 2138

 55679304 ACACTAGATATGAAA 55679318
          |||||||||||||||
     2139 ACACTAGATATGAAA 2153

Alignment time is 1.6027 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4268] =>      4268 nucs 'mol-32-3025-021288_4268'

Score:        4245
Aligned:      4267        nucs
Identic:      4265 (100%) nucs =>      3756 (100%)       509 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673925,55677682] EXCISED REGION [55677685,55678193]
 second seq =>  [       1,    3758] EXCISED REGION [    3760,    4268]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [3759,3759]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673925 TTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGA 55673984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGA 60

 55673985 GCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAA 55674044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAA 120

 55674045 TTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAA 55674104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAA 180

 55674105 ACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAAT 55674164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAAT 240

 55674165 TCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTT 55674224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTT 300

 55674225 CTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTAC 55674284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTAC 360

 55674285 TATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGT 55674344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGT 420

 55674345 GAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTA 55674404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTA 480

 55674405 GGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCA 55674464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCA 540

 55674465 GAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTA 55674524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTA 600

 55674525 TTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCAT 55674584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCAT 660

 55674585 GACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTG 55674644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTG 720

 55674645 GAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGA 55674704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGA 780

 55674705 GGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGA 55674764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGA 840

 55674765 AGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTT 55674824
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAACTTGATCCGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTT 900

 55674825 ATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAAT 55674884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAAT 960

 55674885 TTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGG 55674944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGG 1020

 55674945 AGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAG 55675004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAG 1080

 55675005 AAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATA 55675064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1081 AAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATA 1140

 55675065 ACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTAC 55675124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTAC 1200

 55675125 CATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGT 55675184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGT 1260

 55675185 TATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGG 55675244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGG 1320

 55675245 AACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAA 55675304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAA 1380

 55675305 TACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAA 55675364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAA 1440

 55675365 CCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCT 55675424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCT 1500

 55675425 TTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTA 55675484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTA 1560

 55675485 AAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTG 55675544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTG 1620

 55675545 GTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCA 55675604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCA 1680

 55675605 GTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGAT 55675664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGAT 1740

 55675665 TGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCC 55675724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCC 1800

 55675725 TGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACT 55675784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACT 1860

 55675785 GCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTT 55675844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTT 1920

 55675845 ATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAA 55675904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAA 1980

 55675905 TATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCT 55675964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCT 2040

 55675965 GGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAAT 55676024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAAT 2100

 55676025 AAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGA 55676084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGA 2160

 55676085 AAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGA 55676144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGA 2220

 55676145 CCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAG 55676204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAG 2280

 55676205 GCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGA 55676264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGA 2340

 55676265 ATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTC 55676324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTC 2400

 55676325 ATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGG 55676384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGG 2460

 55676385 CCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTC 55676444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTC 2520

 55676445 CTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCA 55676504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCA 2580

 55676505 CTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGC 55676564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGC 2640

 55676565 AAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCT 55676624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCT 2700

 55676625 CTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTT 55676684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTT 2760

 55676685 CTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCG 55676744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCG 2820

 55676745 TCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGT 55676804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGT 2880

 55676805 TCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTT 55676864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTT 2940

 55676865 TTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATT 55676924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATT 3000

 55676925 TTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTC 55676984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTC 3060

 55676985 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGG 55677044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGG 3120

 55677045 GTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACC 55677104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACC 3180

 55677105 ACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGAT 55677164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGAT 3240

 55677165 GGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 55677224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 3300

 55677225 AGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAG 55677284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAG 3360

 55677285 GTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGC 55677344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGC 3420

 55677345 TCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAG 55677404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAG 3480

 55677405 TGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGC 55677464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGC 3540

 55677465 CCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGG 55677524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGG 3600

 55677525 GTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTA 55677584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTA 3660

 55677585 AGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGG 55677644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGG 3720

 55677645 TGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 3758

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 55677744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 3819

 55677745 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 55677804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 3879

 55677805 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 55677864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 3939

 55677865 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 55677924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 3999

 55677925 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 55677984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 4059

 55677985 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 55678044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 4119

 55678045 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 55678104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 4179

 55678105 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 55678164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 4239

 55678165 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCT 55678193
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4240 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCT 4268

Alignment time is 3.11298 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2972] =>      2972 nucs 'mol-32-3025-198945_2972'

Score:        2939
Aligned:      2972        nucs
Identic:      2969 (100%) nucs =>      2712 (100%)       257 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55674169,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678045]
 second seq =>  [       1,    2715] EXCISED REGION [    2716,    2972]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [2715,2715] to [2716,2716]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55674169 GTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGA 55674228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGA 60

 55674229 ACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATG 55674288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATG 120

 55674289 GGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGA 55674348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGA 180

 55674349 GCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCT 55674408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCT 240

 55674409 CATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAA 55674468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAA 300

 55674469 TGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCA 55674528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCA 360

 55674529 GACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACT 55674588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACT 420

 55674589 TAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAG 55674648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAG 480

 55674649 TTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGC 55674708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGC 540

 55674709 AGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAA 55674768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAA 600

 55674769 CTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTA 55674828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTA 660

 55674829 AAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGG 55674888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGG 720

 55674889 TCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTT 55674948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      721 TCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTT 780

 55674949 CTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGA 55675008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGA 840

 55675009 GGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCC 55675068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      841 GGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCC 900

 55675069 CTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATG 55675128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATG 960

 55675129 GGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATA 55675188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATA 1020

 55675189 GAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACT 55675248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACT 1080

 55675249 AATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACA 55675308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACA 1140

 55675309 TATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCAC 55675368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCAC 1200

 55675369 AGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAG 55675428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAG 1260

 55675429 TATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAG 55675488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAG 1320

 55675489 GCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAG 55675548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAG 1380

 55675549 TAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGG 55675608
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGTTCCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGG 1440

 55675609 CAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAA 55675668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAA 1500

 55675669 ACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGC 55675728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGC 1560

 55675729 TTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTT 55675788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTT 1620

 55675789 TCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTT 55675848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTT 1680

 55675849 GTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATC 55675908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATC 1740

 55675909 CATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCT 55675968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCT 1800

 55675969 TTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAAC 55676028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAAC 1860

 55676029 TTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGG 55676088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGG 1920

 55676089 GAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTT 55676148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTT 1980

 55676149 TATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTT 55676208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTT 2040

 55676209 GCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTT 55676268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTT 2100

 55676269 GGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTC 55676328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTC 2160

 55676329 TCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTT 55676388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTT 2220

 55676389 CAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGG 55676448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGG 2280

 55676449 GTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCC 55676508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCC 2340

 55676509 AGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAG 55676568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAG 2400

 55676569 AGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGC 55676628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGC 2460

 55676629 CAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGT 55676688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGT 2520

 55676689 AAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCT 55676748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCT 2580

 55676749 CAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTG 55676808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTG 2640

 55676809 GCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAA 55676868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAA 2700

 55676869 GAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||
     2701 GAGAATGCAAGTAGT 2715

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 2775

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 2835

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 2895

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 2955

 55678029 ACAACATGTTTTGATAT 55678045
          |||||||||||||||||
     2956 ACAACATGTTTTGATAT 2972

Alignment time is 2.53733 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8258] =>      8258 nucs 'mol-32-310c-100356_8258'

Score:        8126
Aligned:      8258        nucs
Identic:      8246 (100%) nucs =>      4084 (100%)      4162 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672795,55676883] EXCISED REGION [55677789,55681956]
 second seq =>  [       1,    4089] EXCISED REGION [    4090,    8258]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [4089,4089] to [4090,4090]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55672795 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGC 55672854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGC 60

 55672855 ATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTT 55672914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTT 120

 55672915 TTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACC 55672974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACC 180

 55672975 ATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAA 55673034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAA 240

 55673035 ATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTT 55673094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTT 300

 55673095 TCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCT 55673154
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAATTTAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCT 360

 55673155 GGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATT 55673214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATT 420

 55673215 ATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTC 55673274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTC 480

 55673275 ATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGT 55673334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGT 540

 55673335 TTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTT 55673394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTT 600

 55673395 TAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTT 55673454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTT 660

 55673455 ATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATA 55673514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATA 720

 55673515 TTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAA 55673574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAA 780

 55673575 TTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATA 55673634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATA 840

 55673635 TAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATT 55673694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATT 900

 55673695 CAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCA 55673754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCA 960

 55673755 CAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATT 55673814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      961 CAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATT 1020

 55673815 TTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAA 55673874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAA 1080

 55673875 AAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGC 55673934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGC 1140

 55673935 ATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTAT 55673994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTAT 1200

 55673995 TCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATC 55674054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATC 1260

 55674055 TGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAAT 55674114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAAT 1320

 55674115 AAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTT 55674174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTT 1380

 55674175 TCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATT 55674234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATT 1440

 55674235 ACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTAT 55674294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTAT 1500

 55674295 GGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCT 55674354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCT 1560

 55674355 GGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAG 55674414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAG 1620

 55674415 GTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTG 55674474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTG 1680

 55674475 CATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACT 55674534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACT 1740

 55674535 GTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAA 55674594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAA 1800

 55674595 TAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAG 55674654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAG 1860

 55674655 CCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGG 55674714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGG 1920

 55674715 ATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGAT 55674774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGAT 1980

 55674775 CAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACA 55674834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACA 2040

 55674835 GACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGG 55674894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGG 2100

 55674895 AGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAA 55674954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2101 AGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAA 2160

 55674955 CTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAA 55675014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAA 2220

 55675015 ATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATT 55675074
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATT 2280

 55675075 CTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAG 55675134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAG 2340

 55675135 CAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAA 55675194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAA 2400

 55675195 ACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAAT 55675254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAAT 2460

 55675255 TTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCA 55675314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCA 2520

 55675315 TTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGG 55675374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGG 2580

 55675375 AAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGT 55675434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGT 2640

 55675435 ATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTA 55675494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTA 2700

 55675495 GCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTT 55675554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTT 2760

 55675555 CATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGAT 55675614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGAT 2820

 55675615 AACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAAC 55675674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAAC 2880

 55675675 GTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAAC 55675734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAAC 2940

 55675735 AATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAA 55675794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAA 3000

 55675795 ATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGA 55675854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGA 3060

 55675855 CTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCAC 55675914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCAC 3120

 55675915 AAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGC 55675974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGC 3180

 55675975 TCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTT 55676034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTT 3240

 55676035 CTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAA 55676094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAA 3300

 55676095 AGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTT 55676154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3301 AGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGCTATAGTTGACCTTTATGTT 3360

 55676155 TATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACAC 55676214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACAC 3420

 55676215 ATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAG 55676274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAG 3480

 55676275 AGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGC 55676334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGC 3540

 55676335 AGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCT 55676394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCT 3600

 55676395 GAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATT 55676454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATT 3660

 55676455 TTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTG 55676514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTG 3720

 55676515 TGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGA 55676574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGA 3780

 55676575 TTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGAC 55676634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGAC 3840

 55676635 AGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAA 55676694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAA 3900

 55676695 CTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTT 55676754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTT 3960

 55676755 CCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGG 55676814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGG 4020

 55676815 CATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAAT 55676874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAAT 4080

 55676875 GCAAGTAGT 55676883
          |||||||||
     4081 GCAAGTAGT 4089

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 4149

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 4209

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 4269

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 4329

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 4389

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 4449

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 55678208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 CTTCACGAATTTCCAGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGT 4509

 55678209 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 55678268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 AGATTTATTCATCCCACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCC 4569

 55678269 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 55678328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 CTTTCCCCGCCTCTGATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATT 4629

 55678329 ATTATTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 55678388
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 ATTCTTTTTTTAGATTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTA 4689

 55678389 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 55678448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 GCTTATTTCACTCAGTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGAT 4749

 55678449 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 55678508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 CTCCTTTTCTAAGGCTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGC 4809

 55678509 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 55678568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 AATTTTTCATCTATTTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAA 4869

 55678569 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 55678628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 TAATTCTGAAATGAACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTC 4929

 55678629 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 55678688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4930 TGGGTATATACCCAGAAGAGGGATTGCTGGGTCATAAGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAA 4989

 55678689 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 55678748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 TCTTTGTATTGTTTTCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAG 5049

 55678749 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTT 55678808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5050 GGTTTTTGTTTCTCTATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTT 5109

 55678809 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 55678868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5110 TGCATTTGCCTGATGATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTT 5169

 55678869 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 55678928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5170 TATGTCTTCTTTTGGGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGT 5229

 55678929 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 55678988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 TTTTGTTTTTTTCTTTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATC 5289

 55678989 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 55679048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5290 AGATATGTGGTTCACAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGAT 5349

 55679049 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 55679108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 TATTTCCTTTGCTCTGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGC 5409

 55679109 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 55679168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5410 TTTCATTGCCTGTCCTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTC 5469

 55679169 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 55679228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 CTATGTTTTCTCCTAGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTT 5529

 55679229 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 55679288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 TTGAGTTGACTTTTGTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGA 5589

 55679289 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 55679348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5590 TATCCAGTTTTCCCAACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTT 5649

 55679349 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 55679408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5650 GGTGTCTTTGTCTAAGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGT 5709

 55679409 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 55679468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5710 GACTCACAACAGTGAATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTA 5769

 55679469 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 55679528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5770 AGACACATGTAAAGACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTA 5829

 55679529 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 55679588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5830 TTTTAGTAAATGGAAGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATG 5889

 55679589 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAG 55679648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5890 TATTGAAGCTATTTCTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAG 5949

 55679649 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 55679708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 TCACTGGGTGTGTTCAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCT 6009

 55679709 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 55679768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 GGTTGAGTGTATCTTTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTC 6069

 55679769 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 55679828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 TAATACACTCTGTTAAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCT 6129

 55679829 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 55679888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 CAATTCACAACAGTATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATT 6189

 55679889 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 55679948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 ACATTTAATTAATCAACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATA 6249

 55679949 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 55680008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 GAGACCGGGTCTCACTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTC 6309

 55680009 CCACATTAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAA 55680068
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6310 CCACATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCAAAAA 6369

 55680069 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 55680128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6370 AAGTTTCTAGGAGTGGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAA 6429

 55680129 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 55680188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 AGTTTTCAGCCCTCTTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTT 6489

 55680189 TTTTAGGACGGAAGTTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTA 55680248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 TTTTAGGACGGAAGTTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTA 6549

 55680249 GCCCTTCAATGGCCAACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCT 55680308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6550 GCCCTTCAATGGCCAACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCT 6609

 55680309 GGTTGTTTCCATGATTCAGACAGG-TTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTC 55680367
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6610 GGTTGTTTCCATGATTCAGACAGGTTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTC 6669

 55680368 CATTTGTATACTTTGTTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACA 55680427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6670 CATTTGTATACTTTGTTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACA 6729

 55680428 GTTGATTCAGAATAGTGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTT 55680487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6730 GTTGATTCAGAATAGTGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTT 6789

 55680488 ATAAAATCTCTCAGGTCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCA 55680547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6790 ATAAAATCTCTCAGGTCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCA 6849

 55680548 AAAAAGTATTATTTCAGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTAT 55680607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6850 AAAAAGTATTATTTCAGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTAT 6909

 55680608 ACTCCTTTAAGACAAGTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCC 55680667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6910 ACTCCTTTAAGACAAGTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCC 6969

 55680668 AATCAGTATTTCAGTTAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCA 55680727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6970 AATCAGTATTTCAGTTAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCA 7029

 55680728 TAGAGCACATATAAAGATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTT 55680787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7030 TAGAGCACATATAAAGATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTT 7089

 55680788 CAATGAAAGTGTTCACTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAA 55680847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7090 CAATGAAAGTGTTCACTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAA 7149

 55680848 ATATGTTTGTAAAGGAGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACT 55680907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7150 ATATGTTTGTAAAGGAGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACT 7209

 55680908 TCATTTTTTATACCTTGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGG 55680967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7210 TCATTTTTTATACCTTGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGG 7269

 55680968 ATGCATGAATCGGAACAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTG 55681027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7270 ATGCATGAATCGGAACAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTG 7329

 55681028 AAATTCCCCATTAAGACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGA 55681087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7330 AAATTCCCCATTAAGACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGA 7389

 55681088 TAGATGAAAGTGTCATTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACAT 55681147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7390 TAGATGAAAGTGTCATTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACAT 7449

 55681148 CCTGGCAGACACATGTATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAA 55681207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7450 CCTGGCAGACACATGTATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAA 7509

 55681208 CAGTATCAATCCAATGAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTAT 55681267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7510 CAGTATCAATCCAATGAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTAT 7569

 55681268 TAAGATTCACGTGTAAAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAA 55681327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7570 TAAGATTCACGTGTAAAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAA 7629

 55681328 TGTTAATTCAATGGATAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGA 55681387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7630 TGTTAATTCAATGGATAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGA 7689

 55681388 CATTAGATGTTTCTAAGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTG 55681447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7690 CATTAGATGTTTCTAAGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTG 7749

 55681448 AATGGAAGGTCTCTCCACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAA 55681507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7750 AATGGAAGGTCTCTCCACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAA 7809

 55681508 TACACTTCTAAGACTGCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGA 55681567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7810 TACACTTCTAAGACTGCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGA 7869

 55681568 AATGCTCATCAATTCTGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCT 55681627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7870 AATGCTCATCAATTCTGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCT 7929

 55681628 AAGAATGCGAGTTGCACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTT 55681687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7930 AAGAATGCGAGTTGCACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTT 7989

 55681688 AAACCTTAAAATTTATTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTC 55681747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7990 AAACCTTAAAATTTATTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTC 8049

 55681748 TAGTTGCACATGTGATTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 55681807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8050 TAGTTGCACATGTGATTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 8109

 55681808 CATGTAAAACACTTAGTAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTAT 55681867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8110 CATGTAAAACACTTAGTAACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTAT 8169

 55681868 GATTGAGAACAGCGTTGCTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATG 55681927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8170 GATTGAGAACAGCGTTGCTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATG 8229

 55681928 CTCTTATGACAAATGTATAAAATATATCT 55681956
          |||||||||||||||||||||||||||||
     8230 CTCTTATGACAAATGTATAAAATATATCT 8258

Alignment time is 6.00623 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4090] =>      4090 nucs 'mol-32-310c-100356_4090'

Score:        4045
Aligned:      4089        nucs
Identic:      4085 (100%) nucs =>       306 (100%)      3779 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672795,55673100] EXCISED REGION [55673102,55676884]
 second seq =>  [       1,     306] EXCISED REGION [     308,    4090]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55673101,55673101]
 second seq =>         1 nucs [307,307]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [305,306] to [306,307]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55672795 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGC 55672854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGC 60

 55672855 ATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTT 55672914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTT 120

 55672915 TTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACC 55672974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACC 180

 55672975 ATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAA 55673034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAA 240

 55673035 ATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTT 55673094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTT 300

 55673095 TCAATT 55673100
          ||||||
      301 TCAATT 306

EXCISED REGION

 55673102 AAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATG 55673161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 AAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATG 367

 55673162 AACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCA 55673221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 AACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCA 427

 55673222 TGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCT 55673281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 TGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCT 487

 55673282 ATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAAC 55673341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 ATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAAC 547

 55673342 TTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATA 55673401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 TTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATA 607

 55673402 CTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATT 55673461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 CTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATT 667

 55673462 GAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATA 55673521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 GAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATA 727

 55673522 TAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGT 55673581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 TAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGT 787

 55673582 TTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTAC 55673641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 TTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTAC 847

 55673642 AATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTT 55673701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 AATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTT 907

 55673702 TCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAA 55673761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 TCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAA 967

 55673762 AGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATAT 55673821
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 AGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATAT 1027

 55673822 ACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATA 55673881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 ACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATA 1087

 55673882 CCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATA 55673941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 CCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATA 1147

 55673942 CTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTT 55674001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 CTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTT 1207

 55674002 CATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCAT 55674061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 CATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCAT 1267

 55674062 TATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGG 55674121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 TATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGG 1327

 55674122 AGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTC 55674181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 AGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTC 1387

 55674182 AGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCT 55674241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 AGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCT 1447

 55674242 CTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACT 55674301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 CTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACT 1507

 55674302 ATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCC 55674361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 ATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCC 1567

 55674362 CAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAAC 55674421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 CAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAAC 1627

 55674422 ACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAG 55674481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 ACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAG 1687

 55674482 AATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAA 55674541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 AATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAA 1747

 55674542 ATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAA 55674601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 ATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAA 1807

 55674602 GAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAA 55674661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 GAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAA 1867

 55674662 GCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTG 55674721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 GCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTG 1927

 55674722 CTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATAT 55674781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 CTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATAT 1987

 55674782 CAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAA 55674841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 CAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAA 2047

 55674842 GTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAAT 55674901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 GTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAAT 2107

 55674902 CTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCC 55674961
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2108 CTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCC 2167

 55674962 ATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAA 55675021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 ATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAA 2227

 55675022 CCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAA 55675081
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 CCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAA 2287

 55675082 ATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCT 55675141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 ATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCT 2347

 55675142 CCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCT 55675201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 CCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCT 2407

 55675202 TTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAA 55675261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAA 2467

 55675262 GTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTC 55675321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 GTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTC 2527

 55675322 TTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGT 55675381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGT 2587

 55675382 TAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAG 55675441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAG 2647

 55675442 AGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTT 55675501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 AGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTT 2707

 55675502 CATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTAC 55675561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 CATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTAC 2767

 55675562 GGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTC 55675621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 GGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTC 2827

 55675622 TGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTC 55675681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTC 2887

 55675682 TGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTG 55675741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 TGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTG 2947

 55675742 AAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATAT 55675801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 AAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATAT 3007

 55675802 TGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTT 55675861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 TGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTT 3067

 55675862 CATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCA 55675921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 CATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCA 3127

 55675922 CACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCAT 55675981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 CACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCAT 3187

 55675982 AATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGA 55676041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 AATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGA 3247

 55676042 CCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTT 55676101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 CCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTT 3307

 55676102 ATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAG 55676161
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3308 ATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGCTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAG 3367

 55676162 AATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTC 55676221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 AATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTC 3427

 55676222 TTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACT 55676281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 TTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACT 3487

 55676282 GGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCT 55676341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 GGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCT 3547

 55676342 AATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAA 55676401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 AATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAA 3607

 55676402 TATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAAT 55676461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 TATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAAT 3667

 55676462 AGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAG 55676521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 AGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAG 3727

 55676522 GGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAG 55676581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 GGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAG 3787

 55676582 CTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAG 55676641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 CTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAG 3847

 55676642 TCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATT 55676701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATT 3907

 55676702 CTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAA 55676761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 CTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAA 3967

 55676762 GACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCT 55676821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 GACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCT 4027

 55676822 CATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTA 55676881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 CATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTA 4087

 55676882 GTT 55676884
          |||
     4088 GTT 4090

Alignment time is 2.99009 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3206] =>      3206 nucs 'mol-32-3159-084962_3206'

Score:        3194
Aligned:      3205        nucs
Identic:      3204 (100%) nucs =>      1007 (100%)      2197 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673769,55674775] EXCISED REGION [55674777,55676974]
 second seq =>  [       1,    1007] EXCISED REGION [    1009,    3206]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55674776,55674776]
 second seq =>         1 nucs [1008,1008]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1007,1007] to [1008,1008]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673769 ATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCA 55673828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCA 60

 55673829 GAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCC 55673888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCC 120

 55673889 CTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACA 55673948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACA 180

 55673949 TCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGA 55674008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGA 240

 55674009 AGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAA 55674068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAA 300

 55674069 TTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACA 55674128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACA 360

 55674129 GACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGG 55674188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGG 420

 55674189 ATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTAT 55674248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTAT 480

 55674249 AGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGT 55674308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGT 540

 55674309 ATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACA 55674368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACA 600

 55674369 CCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCT 55674428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCT 660

 55674429 ACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTC 55674488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTC 720

 55674489 TTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAA 55674548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAA 780

 55674549 GTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAAT 55674608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAAT 840

 55674609 TGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAAT 55674668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAAT 900

 55674669 GAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGG 55674728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGG 960

 55674729 CAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATC 55674775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATC 1007

EXCISED REGION

 55674777 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 55674836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 1068

 55674837 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 55674896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 1128

 55674897 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 55674956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 1188

 55674957 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 55675016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 1248

 55675017 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 55675076
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 1308

 55675077 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 55675136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 1368

 55675137 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 55675196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 1428

 55675197 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 55675256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 1488

 55675257 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 55675316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 1548

 55675317 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 55675376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 1608

 55675377 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 55675436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 1668

 55675437 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 55675496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 1728

 55675497 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 55675556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 1788

 55675557 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 55675616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 1848

 55675617 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 55675676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 1908

 55675677 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 55675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 1968

 55675737 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 55675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 2028

 55675797 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 55675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 2088

 55675857 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 55675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 2148

 55675917 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 55675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 2208

 55675977 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 55676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 2268

 55676037 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 55676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 2328

 55676097 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 55676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 2388

 55676157 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 55676216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 2448

 55676217 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 55676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 2508

 55676277 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 55676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 2568

 55676337 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 55676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 2628

 55676397 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 55676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 2688

 55676457 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 55676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 2748

 55676517 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 55676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 2808

 55676577 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 55676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 2868

 55676637 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 55676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 2928

 55676697 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 55676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 2988

 55676757 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 55676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 3048

 55676817 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 55676876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 3108

 55676877 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 55676936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 3168

 55676937 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGG 55676974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGG 3206

Alignment time is 2.45587 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8402] =>      8402 nucs 'mol-32-3190-091386_8402'

Score:        8112
Aligned:      8412        nucs
Identic:      8370 (100%) nucs =>      7988 ( 99%)       382 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55668866,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678170]
 second seq =>  [       1,    8020] EXCISED REGION [    8021,    8402]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [8020,8020] to [8021,8021]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55668866 AAACACACAACCTCCCAAGATTCTTTCAGGAAGAAAGTGAAAACTTGGATAGACCAATAA 55668925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACACACAACCTCCCAAGATTCTTTCAGGAAGAAAGTGAAAACTTGGATAGACCAATAA 60

 55668926 CAAGTTTGGAAATTGAATCAGCAATAAAAATCCTACCAACCAAAAAGAGCTCTGGACCAG 55668985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGTTTGGAAATTGAATCAGCAATAAAAATCCTACCAACCAAAAAGAGCTCTGGACCAG 120

 55668986 GTGGATTCACATCTGAATTC-------TTTTTTTTTTTTTTTTTTAGACGGATTTTCGCT 55669038
          ||||||||||||||||||         ||.||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGGATTCACATCTGAAT--ATCTGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTAGACGGATTTTCGCT 178

 55669039 CTTGTCGGCCGGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGATTCACTGCAACTTCCGCCTCCT 55669098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 CTTGTCGGCCGGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGATTCACTGCAACTTCCGCCTCCT 238

 55669099 GGGTTCAAGTGATTCTCCTGCATCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTACAGGCATGTGCCA 55669158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 GGGTTCAAGTGATTCTCCTGCATCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTACAGGCATGTGCCA 298

 55669159 CTATGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTTCAGTGGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCA 55669218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 CTATGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTTCAGTGGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCA 358

 55669219 GGCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTCA 55669278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      359 GGCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAGTGATCCATCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTCA 418

 55669279 CAGGCGTCAGCCACTGCACCCGGCCCCACACATCCGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAG 55669338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 CAGGCGTCAGCCACTGCACCCGGCCCCACACATCCGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAG 478

 55669339 AACTGATACCAATTCTATTGAAACTTTTCCAGAAAATCGAGGAGGAGGGGCTTCTCCTTA 55669398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AACTGATACCAATTCTATTGAAACTTTTCCAGAAAATCGAGGAGGAGGGGCTTCTCCTTA 538

 55669399 ACTCATTCTAAGAAGCCAGCATCATCCTGATACAAAAATCTGGCAGAGACACAATGAAAA 55669458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 ACTCATTCTAAGAAGCCAGCATCATCCTGATACAAAAATCTGGCAGAGACACAATGAAAA 598

 55669459 TGAAAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATAAACATAGATGTAAAAATCCTCAACAAAATAC 55669518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TGAAAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATAAACATAGATGTAAAAATCCTCAACAAAATAC 658

 55669519 TAGCAAACCAAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTAAACCACAATGATCAAGCATACTTTA 55669578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TAGCAAACCAAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTAAACCACAATGATCAAGCATACTTTA 718

 55669579 TTTCTAGGATACAAGGTTGGTTCAAAATATGCAAATCAACAAATGTGATTCATCACTAAG 55669638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TTTCTAGGATACAAGGTTGGTTCAAAATATGCAAATCAACAAATGTGATTCATCACTAAG 778

 55669639 CAGAACTAAAGACAAAAACCATAAGGTCATCTCAATAGATGCAGAAAAAAGCCTTTGGTA 55669698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CAGAACTAAAGACAAAAACCATAAGGTCATCTCAATAGATGCAGAAAAAAGCCTTTGGTA 838

 55669699 AAATCCAACGTC----CCTTCATGATAAAAACTCTCAACATATTATGCTGAGAGTTCAAC 55669754
          ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AAATCCAA----AAATCCTTCATGATAAAAACTCTCAACATATTATGCTGAGAGTTCAAC 894

 55669755 ATATAATATTGAAGGAATATACCTCAAAATTATAAGAGCCATCTATGACAAACCCACAAC 55669814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 ATATAATATTGAAGGAATATACCTCAAAATTATAAGAGCCATCTATGACAAACCCACAAC 954

 55669815 CAACATCATACCGAATGGGCAAAAGCTGGAACCATTCCCTTTGAAAATTGGAACAAGACA 55669874
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      955 CAACATCATACCGAATGGGCAAAAGCTGGAACCATTCCCTTTGAAAACTGGAACAAGACA 1014

 55669875 AGGATTCCCACTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCCTGGTCAGATAAAT 55669934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 AGGATTCCCACTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCCTGGTCAGATAAAT 1074

 55669935 CAGGCAAGAGAAGGAAAGAAAATGCATATGAACAGGAAAAGAAGGAGTCCAAACTCTCTC 55669994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 CAGGCAAGAGAAGGAAAGAAAATGCATATGAACAGGAAAAGAAGGAGTCCAAACTCTCTC 1134

 55669995 TTTGCCAATATTATTCTACACCAAGAAAACCCTAAAGACTCTGCCAAAAGGCTTCTGGAA 55670054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 TTTGCCAATATTATTCTACACCAAGAAAACCCTAAAGACTCTGCCAAAAGGCTTCTGGAA 1194

 55670055 ATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGGTACAAAATCAATATACAAAAATCAATAGCA 55670114
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
     1195 ATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGGCACAAAATCAATGTACAAAAATCAATAGCA 1254

 55670115 TTTTTATACATCAATAACATTCTACCTGAGAACCAAATCAAGAACACAATCCCATTTACA 55670174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 TTTTTATACATCAATAACATTCTACCTGAGAACCAAATCAAGAACACAATCCCATTTACA 1314

 55670175 ATAGCCACAAAGGAAATGAAATACCTATGAATTCATCTAACCAAGGAAGTGAAAGATCTC 55670234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 ATAGCCACAAAGGAAATGAAATACCTATGAATTCATCTAACCAAGGAAGTGAAAGATCTC 1374

 55670235 TACAAGGAGAACTACAAAGCACTGCTGAAAGAAATCAGAGACTATACAAATAAATAAATG 55670294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TACAAGGAGAACTACAAAGCACTGCTGAAAGAAATCAGAGACTATACAAATAAATAAATG 1434

 55670295 GAAAAATGTTCCATGCTCATGGATTAGAATGATCAATATAGTTAAAATGGCCATACTGCC 55670354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 GAAAAATGTTCCATGCTCATGGATTAGAATGATCAATATAGTTAAAATGGCCATACTGCC 1494

 55670355 CAAAGCAATTTACAAGTTCAATGCAATTCTTATTAAAATACCAACATCATTTTTCACAGA 55670414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 CAAAGCAATTTACAAGTTCAATGCAATTCTTATTAAAATACCAACATCATTTTTCACAGA 1554

 55670415 ATAAGAAAAACCTATTCTAAAATTCATTTGGAACCAAAAACAGAGCCCGAATAGCCAAAG 55670474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 ATAAGAAAAACCTATTCTAAAATTCATTTGGAACCAAAAACAGAGCCCGAATAGCCAAAG 1614

 55670475 CAATTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAGCCATAGGCATCATATTGCTTGACTTCAAACTCTA 55670534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1615 CAATTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAGCCATAGGCATCATATTGCTTAACTTCAAACTCTA 1674

 55670535 CTACAGTATACAGCTACCGTAATCAAAACAGCATGATACTGGTACAAAAACAGACAGTGG 55670594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 CTACAGTATACAGCTACCGTAATCAAAACAGCATGATACTGGTACAAAAACAGACAGTGG 1734

 55670595 AACAGAATGGAAAACCCAGAAATCTACCTGCACACCTACAACCATCTGACAAAATCAACA 55670654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 AACAGAATGGAAAACCCAGAAATCTACCTGCACACCTACAACCATCTGACAAAATCAACA 1794

 55670655 CAAATAAGCAGCAGGGAAAGGAGTCTCTATTCAAAGAATGGTGGTGGAATATCTGCCTAG 55670714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 CAAATAAGCAGCAGGGAAAGGAGTCTCTATTCAAAGAATGGTGGTGGAATATCTGCCTAG 1854

 55670715 GCATATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAACTCTCACCATACTCAAAAATGAACTCAA 55670774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 GCATATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAACTCTCACCATACTCAAAAATGAACTCAA 1914

 55670775 GATGGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAAACTATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAG 55670834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GATGGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAAACTATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAG 1974

 55670835 GAAATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATGATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAAT 55670894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 GAAATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATGATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAAT 2034

 55670895 TACGACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGC 55670954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TACGACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGC 2094

 55670955 AAAAGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGCCTACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAA 55671014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 AAAAGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGCCTACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAA 2154

 55671015 CTATGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTACAAGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAA 55671074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 CTATGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTACAAGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAA 2214

 55671075 AA-CCAATTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAACACTTTTCAAAAGGAGACATACACATGG 55671133
          || |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 AAACCAGTTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAACACTTTTCAAAAGGAGACATACACATGG 2274

 55671134 CCAAAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTACTAATCATCAGAGACATACAAATCAAAA 55671193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 CCAAAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTACTAATCATCAGAGACATACAAATCAAAA 2334

 55671194 CCAAGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAATGGCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAAT 55671253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 CCAAGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAATGGCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAAT 2394

 55671254 AACAGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAATGCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGC 55671313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 AACAGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAATGCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGC 2454

 55671314 AAGCTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGCTGTTTGGAGATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAA 55671373
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AAGCTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGTTGTTTGGAGATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAA 2514

 55671374 CCACCATTCAGTGCTGCAATCCCGCTACTGGGTATATACCCAAAGGAAAATAATTCATTC 55671433
          ||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 CCACCATTCAATGCTGCAATCCCACTACTGGGTATATACCCAAAGGAAAATAATTCATTC 2574

 55671434 TATCATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATTGCAGCACTACTCACAATAGTAAGGACA 55671493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
     2575 TATCATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAGGACA 2634

 55671494 TAGAAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTGGATAAAGGATATGTGGTACACATAC 55671553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TAGAAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTGGATAAAGGATATGTGGTACACATAC 2694

 55671554 ACCATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAATGGAATCATGCATGTCCTTTGCAGCAAC 55671613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 ACCATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAATGGAATCATGCATGTCCTTTGCAGCAAC 2754

 55671614 ATGGATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACCTAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATA 55671673
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2755 ATGGATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACCTAAAGGAAGAACGGAAAATCAAATA 2814

 55671674 ACACATGTTCTCACTTACAGGTGGGAGCTAAACACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGG 55671733
          ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 ACACATGTTCTCAC----AGGTGGGAGCTAAACACTGAAGACACATGATCGTAAAGGTGG 2870

 55671734 TAACAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAG 55671793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 TAACAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAAGGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAG 2930

 55671794 AACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACC 55671853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 AACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGAGATGGGATCACTGGGACCCCAAACC 2990

 55671854 TCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCACATGTACCCTTTAATCTACAATA 55671913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCACATGTACCCTTTAATCTACAATA 3050

 55671914 AAAGTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAA 55671973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 AAAGTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGGCAAAAAACTAAAAAAAA 3110

 55671974 GTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCA 55672033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 GTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACATGTCTCCTGAAAGTTTCA 3170

 55672034 TCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGC 55672093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACACCAACTAAGTGAAGTAGC 3230

 55672094 AAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAG 55672153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 AAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAG 3290

 55672154 CTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAA 55672213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAA 3350

 55672214 AATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACT 55672273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 AATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACT 3410

 55672274 TGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCT 55672333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCT 3470

 55672334 TGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCC 55672393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 TGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCC 3530

 55672394 TTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTT 55672453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTT 3590

 55672454 GTATACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTT 55672513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GTATACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTT 3650

 55672514 GCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTC 55672573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 GCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTC 3710

 55672574 ACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGG 55672633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 ACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGG 3770

 55672634 ATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGC 55672693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 ATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGC 3830

 55672694 TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACC 55672753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACC 3890

 55672754 GCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGC 55672813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 GCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGC 3950

 55672814 CACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTG 55672873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTG 4010

 55672874 ACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAG 55672933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 ACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAG 4070

 55672934 GGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTG 55672993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 GGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTG 4130

 55672994 ACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTA 55673053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 ACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTA 4190

 55673054 TGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGG 55673113
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4191 TGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATGG 4250

 55673114 GGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCT 55673173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 GGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCT 4310

 55673174 CAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTG 55673233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 CAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTG 4370

 55673234 CCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTT 55673293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 CCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTT 4430

 55673294 CAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTC 55673353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 CAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTC 4490

 55673354 TAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAAT 55673413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 TAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAAT 4550

 55673414 TGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAG 55673473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAG 4610

 55673474 CTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAA 55673533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 CTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAA 4670

 55673534 TCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGA 55673593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 TCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGA 4730

 55673594 TTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCA 55673653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 TTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCA 4790

 55673654 AAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTT 55673713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 AAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTT 4850

 55673714 ATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTAT 55673773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 ATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTAT 4910

 55673774 GTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCT 55673833
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4911 GTTAGCTAAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGGGCT 4970

 55673834 ATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATT 55673893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 ATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATT 5030

 55673894 AATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCC 55673953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 AATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCC 5090

 55673954 TGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGA 55674013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 TGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGA 5150

 55674014 TTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATA 55674073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5151 TTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAGTCTGGCCATTATATAATTATA 5210

 55674074 TAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACAT 55674133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 TAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACAT 5270

 55674134 GAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGG 55674193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 GAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGG 5330

 55674194 ATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGT 55674253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 ATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGT 5390

 55674254 GACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTA 55674313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 GACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTA 5450

 55674314 TGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACA 55674373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 TGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACA 5510

 55674374 CACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGC 55674433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 CACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGC 5570

 55674434 TGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGC 55674493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5571 TGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAAGTTTCTTAGC 5630

 55674494 TTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAG 55674553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 TTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAG 5690

 55674554 ATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGC 55674613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 ATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGC 5750

 55674614 TCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGG 55674673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 TCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGG 5810

 55674674 CATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGC 55674733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 CATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGC 5870

 55674734 TAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGG 55674793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 TAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGG 5930

 55674794 ATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAG 55674853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 ATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAG 5990

 55674854 TCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCG 55674913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 TCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCG 6050

 55674914 TGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGG 55674973
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6051 TGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGG 6110

 55674974 ATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTA 55675033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 ATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTA 6170

 55675034 ACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCA 55675093
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 ACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCA 6230

 55675094 TTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCC 55675153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 TTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCC 6290

 55675154 GTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCAC 55675213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 GTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCAC 6350

 55675214 TTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCA 55675273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 TTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCA 6410

 55675274 TTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCAC 55675333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 TTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCAC 6470

 55675334 AATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATC 55675393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 AATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATC 6530

 55675394 TGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGAC 55675453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 TGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGAC 6590

 55675454 ACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAA 55675513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 ACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAA 6650

 55675514 ATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGA 55675573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 ATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGA 6710

 55675574 TGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAAT 55675633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 TGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAAT 6770

 55675634 TTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATG 55675693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 TTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATG 6830

 55675694 TTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAA 55675753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 TTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAA 6890

 55675754 AATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACT 55675813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 AATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACT 6950

 55675814 AAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGC 55675873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 AAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGC 7010

 55675874 TTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGAC 55675933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 TTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGAC 7070

 55675934 CCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGG 55675993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 CCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGG 7130

 55675994 TGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCA 55676053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7131 TGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCA 7190

 55676054 GTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTC 55676113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7191 GTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTC 7250

 55676114 TGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGT 55676173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 TGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGT 7310

 55676174 TTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTA 55676233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 TTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTA 7370

 55676234 AGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGG 55676293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 AGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGG 7430

 55676294 AAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACT 55676353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 AAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACT 7490

 55676354 GACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACC 55676413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 GACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACC 7550

 55676414 TTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAG 55676473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 TTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAG 7610

 55676474 GAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGG 55676533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 GAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGG 7670

 55676534 GCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATT 55676593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 GCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATT 7730

 55676594 TTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTT 55676653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 TTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTT 7790

 55676654 TACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGA 55676713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 TACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGA 7850

 55676714 ATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGAT 55676773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 ATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGAT 7910

 55676774 GACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCT 55676833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 GACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCT 7970

 55676834 TCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 TCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 8020

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8021 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 8080

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8081 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 8140

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8141 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 8200

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8201 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 8260

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8261 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 8320

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8321 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 8380

 55678149 CTTCACGAATTTCCAGTAAACA 55678170
          ||||||||||||||||||||||
     8381 CTTCACGAATTTCCAGTAAACA 8402

Alignment time is 6.17653 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7649] =>      7649 nucs 'mol-32-321f-143702_7649'

Score:        7604
Aligned:      7648        nucs
Identic:      7644 (100%) nucs =>      3941 (100%)      3703 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673740,55677682] EXCISED REGION [55677685,55681389]
 second seq =>  [       1,    3943] EXCISED REGION [    3945,    7649]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [3944,3944]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673740 TAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCT 55673799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCT 60

 55673800 GGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGC 55673859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGC 120

 55673860 TGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATAT 55673919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATAT 180

 55673920 CCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTG 55673979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTG 240

 55673980 CTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAA 55674039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAA 300

 55674040 GCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTAT 55674099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTAT 360

 55674100 TAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAA 55674159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAA 420

 55674160 GCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAA 55674219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAA 480

 55674220 GATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTG 55674279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTG 540

 55674280 GTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGA 55674339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGA 600

 55674340 CAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCT 55674399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCT 660

 55674400 CTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTA 55674459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTA 720

 55674460 TTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAA 55674519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAA 780

 55674520 AATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGG 55674579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGG 840

 55674580 GTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGG 55674639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGG 900

 55674640 AGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAA 55674699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAA 960

 55674700 GGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGA 55674759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGA 1020

 55674760 AGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGA 55674819
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTGAAGAACTTGATCCGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGA 1080

 55674820 TTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACT 55674879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACT 1140

 55674880 AAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGC 55674939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGC 1200

 55674940 CCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCAC 55674999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCAC 1260

 55675000 AATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCT 55675059
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1261 AATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCT 1320

 55675060 TTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCT 55675119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCT 1380

 55675120 TTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGT 55675179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGT 1440

 55675180 TTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGA 55675239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGA 1500

 55675240 TTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATT 55675299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATT 1560

 55675300 CTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAA 55675359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAA 1620

 55675360 GGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTT 55675419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTT 1680

 55675420 TCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATT 55675479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATT 1740

 55675480 GACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGA 55675539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGA 1800

 55675540 AAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATA 55675599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATA 1860

 55675600 CTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATG 55675659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATG 1920

 55675660 AGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATAC 55675719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATAC 1980

 55675720 TTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAA 55675779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAA 2040

 55675780 TCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAAC 55675839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAAC 2100

 55675840 AGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCT 55675899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCT 2160

 55675900 TGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTT 55675959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTT 2220

 55675960 CTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGT 55676019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGT 2280

 55676020 TTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATA 55676079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATA 2340

 55676080 CTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATA 55676139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATA 2400

 55676140 GTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCC 55676199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCC 2460

 55676200 CCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGA 55676259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGA 2520

 55676260 AATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTA 55676319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTA 2580

 55676320 AGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCC 55676379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCC 2640

 55676380 TAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCC 55676439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCC 2700

 55676440 CATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAA 55676499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAA 2760

 55676500 ATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAA 55676559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAA 2820

 55676560 CATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCT 55676619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCT 2880

 55676620 TTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTG 55676679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTG 2940

 55676680 TCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTC 55676739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTC 3000

 55676740 TCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGG 55676799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGG 3060

 55676800 GTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAG 55676859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAG 3120

 55676860 ATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAG 55676919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAG 3180

 55676920 AAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCT 55676979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCT 3240

 55676980 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCT 55677039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCT 3300

 55677040 CCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTG 55677099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTG 3360

 55677100 CCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCC 55677159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCC 3420

 55677160 AGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 55677219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 3480

 55677220 ATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAA 55677279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAA 3540

 55677280 AAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGC 55677339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGC 3600

 55677340 TTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGC 55677399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGC 3660

 55677400 AATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCC 55677459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCC 3720

 55677460 ACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATT 55677519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATT 3780

 55677520 AAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACA 55677579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACA 3840

 55677580 GAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAG 55677639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAG 3900

 55677640 CATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 3943

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 55677744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 4004

 55677745 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 55677804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 4064

 55677805 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 55677864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 4124

 55677865 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 55677924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 4184

 55677925 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 55677984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 4244

 55677985 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 55678044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 4304

 55678045 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 55678104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 4364

 55678105 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 55678164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 4424

 55678165 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCCA 55678224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCCA 4484

 55678225 CATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTGA 55678284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 CATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTGA 4544

 55678285 TAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGATT 55678344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 TAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGATT 4604

 55678345 CCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAGT 55678404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 CCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAGT 4664

 55678405 ACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGCT 55678464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 ACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGCT 4724

 55678465 GAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATTT 55678524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 GAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATTT 4784

 55678525 ATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAAC 55678584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 ATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAAC 4844

 55678585 ATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAGA 55678644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 ATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAGA 4904

 55678645 AGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTTC 55678704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 AGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTTC 4964

 55678705 CATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCTA 55678764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 CATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCTA 5024

 55678765 TACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATGA 55678824
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 TACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATGA 5084

 55678825 TTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGGG 55678884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 TTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGGG 5144

 55678885 AAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTTT 55678944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 AAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTTT 5204

 55678945 TTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCACA 55679004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 TTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCACA 5264

 55679005 AATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCTG 55679064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 AATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCTG 5324

 55679065 TAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCCT 55679124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 TAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCCT 5384

 55679125 ATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTAG 55679184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 ATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTAG 5444

 55679185 GTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTGT 55679244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 GTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTGT 5504

 55679245 CTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCAA 55679304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 CTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCAA 5564

 55679305 CACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAAG 55679364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 CACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAAG 5624

 55679365 ACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGAA 55679424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 ACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGAA 5684

 55679425 TGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGAC 55679484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 TGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGAC 5744

 55679485 TGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAAG 55679544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5745 TGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAAG 5804

 55679545 GGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTCT 55679604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 GGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTCT 5864

 55679605 AAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTCA 55679664
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5865 AAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTCA 5924

 55679665 ACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTTT 55679724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5925 ACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTTT 5984

 55679725 CAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTAA 55679784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 CAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTAA 6044

 55679785 GATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTAT 55679844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6045 GATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTAT 6104

 55679845 TTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCAA 55679904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6105 TTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCAA 6164

 55679905 CTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCACT 55679964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6165 CTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCACT 6224

 55679965 AAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCCA 55680024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6225 AAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCCA 6284

 55680025 AAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTGG 55680084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6285 AAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTGG 6344

 55680085 TAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCTT 55680144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6345 TAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCTT 6404

 55680145 AACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGTT 55680204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6405 AACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGTT 6464

 55680205 GAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCAA 55680264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6465 GAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCAA 6524

 55680265 CACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGATT 55680324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6525 CACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGATT 6584

 55680325 CAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGTT 55680384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6585 CAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGTT 6644

 55680385 CAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGTG 55680444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6645 CAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGTG 6704

 55680445 TGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGTC 55680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6705 TGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGTC 6764

 55680505 ACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCAG 55680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6765 ACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCAG 6824

 55680565 TTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAGT 55680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6825 TTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAGT 6884

 55680625 GTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTTA 55680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6885 GTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTTA 6944

 55680685 ATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAGA 55680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6945 ATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAGA 7004

 55680745 TCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCACT 55680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7005 TCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCACT 7064

 55680805 GCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGAG 55680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7065 GCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGAG 7124

 55680865 CTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTTG 55680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7125 CTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTTG 7184

 55680925 CCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAACA 55680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7185 CCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAACA 7244

 55680985 ATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGAC 55681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7245 ATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGAC 7304

 55681045 ACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCATT 55681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7305 ACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCATT 7364

 55681105 TCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGTA 55681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7365 TCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGTA 7424

 55681165 TAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAATGA 55681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7425 TAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAATGA 7484

 55681225 ATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTAAA 55681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7485 ATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTAAA 7544

 55681285 AGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGATA 55681344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7545 AGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGATA 7604

 55681345 GATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGACA 55681389
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7605 GATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGACA 7649

Alignment time is 5.55672 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8952] =>      8952 nucs 'mol-32-3240-250397_8952'

Score:        8907
Aligned:      8951        nucs
Identic:      8947 (100%) nucs =>      4047 (100%)      4900 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673634,55677682] EXCISED REGION [55677685,55682586]
 second seq =>  [       1,    4049] EXCISED REGION [    4051,    8952]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [4050,4050]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673634 ATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGAT 55673693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGAT 60

 55673694 TCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTC 55673753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTC 120

 55673754 ACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGAT 55673813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGAT 180

 55673814 TTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCA 55673873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCA 240

 55673874 AAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGG 55673933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGG 300

 55673934 CATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTA 55673993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTA 360

 55673994 TTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAAT 55674053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAAT 420

 55674054 CTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAA 55674113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAA 480

 55674114 TAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCT 55674173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCT 540

 55674174 TTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCAT 55674233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCAT 600

 55674234 TACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTA 55674293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTA 660

 55674294 TGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTC 55674353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTC 720

 55674354 TGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGA 55674413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGA 780

 55674414 GGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCT 55674473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCT 840

 55674474 GCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACAC 55674533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACAC 900

 55674534 TGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCA 55674593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCA 960

 55674594 ATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACA 55674653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACA 1020

 55674654 GCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGG 55674713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGG 1080

 55674714 GATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGA 55674773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGA 1140

 55674774 TCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGAC 55674833
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGAC 1200

 55674834 AGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAG 55674893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAG 1260

 55674894 GAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGA 55674953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGA 1320

 55674954 ACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATA 55675013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATA 1380

 55675014 AATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTAT 55675073
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTAT 1440

 55675074 TCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCA 55675133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCA 1500

 55675134 GCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGA 55675193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGA 1560

 55675194 AACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAA 55675253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAA 1620

 55675254 TTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGC 55675313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGC 1680

 55675314 ATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTG 55675373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTG 1740

 55675374 GAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAG 55675433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAG 1800

 55675434 TATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTT 55675493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTT 1860

 55675494 AGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTT 55675553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTT 1920

 55675554 TCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGA 55675613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGA 1980

 55675614 TAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAA 55675673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAA 2040

 55675674 CGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAA 55675733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAA 2100

 55675734 CAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGA 55675793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGA 2160

 55675794 AATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAG 55675853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAG 2220

 55675854 ACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCA 55675913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCA 2280

 55675914 CAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCG 55675973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCG 2340

 55675974 CTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGT 55676033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGT 2400

 55676034 TCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACA 55676093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACA 2460

 55676094 AAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGT 55676153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGT 2520

 55676154 TTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACA 55676213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACA 2580

 55676214 CATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGA 55676273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGA 2640

 55676274 GAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTG 55676333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTG 2700

 55676334 CAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTC 55676393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTC 2760

 55676394 TGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAAT 55676453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAAT 2820

 55676454 TTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGT 55676513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGT 2880

 55676514 GTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAG 55676573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAG 2940

 55676574 ATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGA 55676633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGA 3000

 55676634 CAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAA 55676693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAA 3060

 55676694 ACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTT 55676753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTT 3120

 55676754 TCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTG 55676813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTG 3180

 55676814 GCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAA 55676873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAA 3240

 55676874 TGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACT 55676933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACT 3300

 55676934 CTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCA 55676993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCA 3360

 55676994 GGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCC 55677053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCC 3420

 55677054 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGC 55677113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGC 3480

 55677114 TAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAAT 55677173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAAT 3540

 55677174 CTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAG 55677233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAG 3600

 55677234 CCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGAT 55677293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGAT 3660

 55677294 GCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAG 55677353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAG 3720

 55677354 AATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCA 55677413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCA 3780

 55677414 AAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGG 55677473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGG 3840

 55677474 CTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTAT 55677533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTAT 3900

 55677534 TCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGG 55677593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGG 3960

 55677594 TTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGACAA 55677653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGACAA 4020

 55677654 TGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 4049

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 55677744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTAAT 4110

 55677745 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 55677804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 CAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAAGA 4170

 55677805 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 55677864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 ATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACAGT 4230

 55677865 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 55677924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 TATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGGTT 4290

 55677925 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 55677984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 ATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCACTT 4350

 55677985 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 55678044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 ATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGATA 4410

 55678045 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 55678104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 TACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTCAT 4470

 55678105 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 55678164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 GTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCCAG 4530

 55678165 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCCA 55678224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 TAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCCCA 4590

 55678225 CATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTGA 55678284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 CATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCTGA 4650

 55678285 TAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGATT 55678344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 TAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGATT 4710

 55678345 CCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAGT 55678404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 CCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCAGT 4770

 55678405 ACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGCT 55678464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 ACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGGCT 4830

 55678465 GAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATTT 55678524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 GAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTATTT 4890

 55678525 ATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAAC 55678584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 ATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGAAC 4950

 55678585 ATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAGA 55678644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 ATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCAGA 5010

 55678645 AGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTTC 55678704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 AGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTTTC 5070

 55678705 CATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCTA 55678764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 CATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTCTA 5130

 55678765 TACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATGA 55678824
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 TACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGATGA 5190

 55678825 TTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGGG 55678884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 TTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTGGG 5250

 55678885 AAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTTT 55678944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 AAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCTTT 5310

 55678945 TTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCACA 55679004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 TTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCACA 5370

 55679005 AATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCTG 55679064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 AATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTCTG 5430

 55679065 TAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCCT 55679124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 TAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTCCT 5490

 55679125 ATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTAG 55679184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 ATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCTAG 5550

 55679185 GTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTGT 55679244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 GTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTTGT 5610

 55679245 CTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCAA 55679304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 CTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCCAA 5670

 55679305 CACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAAG 55679364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 CACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTAAG 5730

 55679365 ACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGAA 55679424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 ACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTGAA 5790

 55679425 TGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGAC 55679484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 TGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAGAC 5850

 55679485 TGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAAG 55679544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 TGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGAAG 5910

 55679545 GGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTCT 55679604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5911 GGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTTCT 5970

 55679605 AAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTCA 55679664
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5971 AAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTTCA 6030

 55679665 ACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTTT 55679724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6031 ACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCTTT 6090

 55679725 CAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTAA 55679784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6091 CAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTTAA 6150

 55679785 GATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTAT 55679844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6151 GATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGTAT 6210

 55679845 TTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCAA 55679904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6211 TTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATCAA 6270

 55679905 CTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCACT 55679964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6271 CTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCACT 6330

 55679965 AAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCCA 55680024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6331 AAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCCCA 6390

 55680025 AAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTGG 55680084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6391 AAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGTGG 6450

 55680085 TAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCTT 55680144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6451 TAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTCTT 6510

 55680145 AACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGTT 55680204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6511 AACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAGTT 6570

 55680205 GAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCAA 55680264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6571 GAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCCAA 6630

 55680265 CACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGATT 55680324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6631 CACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGATT 6690

 55680325 CAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGTT 55680384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6691 CAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTGTT 6750

 55680385 CAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGTG 55680444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6751 CAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAGTG 6810

 55680445 TGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGTC 55680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6811 TGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGGTC 6870

 55680505 ACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCAG 55680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6871 ACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTCAG 6930

 55680565 TTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAGT 55680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6931 TTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAAGT 6990

 55680625 GTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTTA 55680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6991 GTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGTTA 7050

 55680685 ATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAGA 55680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7051 ATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAAGA 7110

 55680745 TCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCACT 55680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7111 TCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCACT 7170

 55680805 GCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGAG 55680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7171 GCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGGAG 7230

 55680865 CTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTTG 55680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7231 CTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCTTG 7290

 55680925 CCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAACA 55680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7291 CCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAACA 7350

 55680985 ATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGAC 55681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7351 ATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAGAC 7410

 55681045 ACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCATT 55681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7411 ACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCATT 7470

 55681105 TCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGTA 55681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7471 TCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATGTA 7530

 55681165 TAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAATGA 55681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7531 TAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAATGA 7590

 55681225 ATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTAAA 55681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7591 ATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTAAA 7650

 55681285 AGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGATA 55681344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7651 AGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGATA 7710

 55681345 GATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGACATTAGATGTTTCTAAG 55681404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7711 GATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGACATTAGATGTTTCTAAG 7770

 55681405 AATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTGAATGGAAGGTCTCTCCA 55681464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7771 AATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTGAATGGAAGGTCTCTCCA 7830

 55681465 CTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAATACACTTCTAAGACTGC 55681524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7831 CTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAATACACTTCTAAGACTGC 7890

 55681525 TAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGAAATGCTCATCAATTCTG 55681584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7891 TAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGAAATGCTCATCAATTCTG 7950

 55681585 TATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCTAAGAATGCGAGTTGCAC 55681644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7951 TATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCTAAGAATGCGAGTTGCAC 8010

 55681645 AAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTTAAACCTTAAAATTTATT 55681704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8011 AAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTTAAACCTTAAAATTTATT 8070

 55681705 ATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTCTAGTTGCACATGTGATT 55681764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8071 ATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTCTAGTTGCACATGTGATT 8130

 55681765 CTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTCCATGTAAAACACTTAGT 55681824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8131 CTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTCCATGTAAAACACTTAGT 8190

 55681825 AACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTATGATTGAGAACAGCGTTG 55681884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8191 AACACTAATATGTAAAGGACTTTACTAGGAGTGTTGCATGTATGATTGAGAACAGCGTTG 8250

 55681885 CTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATGCTCTTATGACAAATGTA 55681944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8251 CTTCAGTGAATGGGAATATTTACCATTTTTATATCGTAATATGCTCTTATGACAAATGTA 8310

 55681945 TAAAATATATCTCCAAGAGTGTTAGTTGTATTCAATTCAGAATATTTTTATTTTATGGAA 55682004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8311 TAAAATATATCTCCAAGAGTGTTAGTTGTATTCAATTCAGAATATTTTTATTTTATGGAA 8370

 55682005 GTGTTCACTTTTATGTCTATCTAATACTCTTTTAAGATAAGTATACAAAAGATGTTTCTA 55682064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8371 GTGTTCACTTTTATGTCTATCTAATACTCTTTTAAGATAAGTATACAAAAGATGTTTCTA 8430

 55682065 AGTTTCTAGCTGTGTAGTGATTCAGAATAACATGGTCACTGAAAAGAAGCGCTCAACACT 55682124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8431 AGTTTCTAGCTGTGTAGTGATTCAGAATAACATGGTCACTGAAAAGAAGCGCTCAACACT 8490

 55682125 CAAAACTCAATCTATTACATTCCATTATGACACATGTAAACTTTCTTCTAGGAGTGCTGG 55682184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8491 CAAAACTCAATCTATTACATTCCATTATGACACATGTAAACTTTCTTCTAGGAGTGCTGG 8550

 55682185 TTGTGCACGTGATTAAGAACTGTGTAATTTCAGCTTAAAGATGTGTTTGAGGCACTTAAT 55682244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8551 TTGTGCACGTGATTAAGAACTGTGTAATTTCAGCTTAAAGATGTGTTTGAGGCACTTAAT 8610

 55682245 ACTACTGTGGTATGACACATGTACAAAATAAGTTTCTAACACAAGTCCTTGCCTGCATGA 55682304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8611 ACTACTGTGGTATGACACATGTACAAAATAAGTTTCTAACACAAGTCCTTGCCTGCATGA 8670

 55682305 CTCAACATTTTTTTCATTGATTAAAAGTGTTCACCATTCTTAAGTTCATTTAATACATTC 55682364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8671 CTCAACATTTTTTTCATTGATTAAAAGTGTTCACCATTCTTAAGTTCATTTAATACATTC 8730

 55682365 TTTTAAGACACACTTACCAGACTGTTTCTAAGGGTATGAATTATATGCTTGATTTACAAC 55682424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8731 TTTTAAGACACACTTACCAGACTGTTTCTAAGGGTATGAATTATATGCTTGATTTACAAC 8790

 55682425 AGTTTTATTTCAGTAAATAGAAGTGTTCATCACTCAAACTCCATCTAGTAGACTTAAAAC 55682484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8791 AGTTTTATTTCAGTAAATAGAAGTGTTCATCACTCAAACTCCATCTAGTAGACTTAAAAC 8850

 55682485 ACATATATTAAACACATGTTGAACTTGGTAAGTTGTGCAAGTAATTCAGAATGTGTGAAT 55682544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8851 ACATATATTAAACACATGTTGAACTTGGTAAGTTGTGCAAGTAATTCAGAATGTGTGAAT 8910

 55682545 TCAGGGAAGGGATATGTTAACTACTCTTAGCTATTGTAATAC 55682586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8911 TCAGGGAAGGGATATGTTAACTACTCTTAGCTATTGTAATAC 8952

Alignment time is 6.64973 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3150] =>      3150 nucs 'mol-32-3240-264169_3150'

Score:        3138
Aligned:      3149        nucs
Identic:      3148 (100%) nucs =>      1043 (100%)      2105 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673733,55674775] EXCISED REGION [55674777,55676882]
 second seq =>  [       1,    1043] EXCISED REGION [    1045,    3150]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55674776,55674776]
 second seq =>         1 nucs [1044,1044]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1043,1043] to [1044,1044]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673733 TTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTT 55673792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTT 60

 55673793 GTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACT 55673852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACT 120

 55673853 GCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAG 55673912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAG 180

 55673913 GCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTAT 55673972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTAT 240

 55673973 TGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAAT 55674032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAAT 300

 55674033 TGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAA 55674092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAA 360

 55674093 ATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACAT 55674152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACAT 420

 55674153 AAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCT 55674212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCT 480

 55674213 GAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCC 55674272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCC 540

 55674273 TGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTT 55674332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTT 600

 55674333 AAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGG 55674392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGG 660

 55674393 AAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTC 55674452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTC 720

 55674453 CACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATT 55674512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATT 780

 55674513 CAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGT 55674572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGT 840

 55674573 AAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAA 55674632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAA 900

 55674633 AGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACT 55674692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACT 960

 55674693 ACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAG 55674752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAG 1020

 55674753 GGTGAGAAGTGAAGAACTTGATC 55674775
          |||||||||||||||||||||||
     1021 GGTGAGAAGTGAAGAACTTGATC 1043

EXCISED REGION

 55674777 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 55674836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 1104

 55674837 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 55674896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 1164

 55674897 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 55674956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 1224

 55674957 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 55675016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 1284

 55675017 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 55675076
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 1344

 55675077 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 55675136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 1404

 55675137 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 55675196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 1464

 55675197 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 55675256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 1524

 55675257 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 55675316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 1584

 55675317 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 55675376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 1644

 55675377 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 55675436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 1704

 55675437 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 55675496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 1764

 55675497 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 55675556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 1824

 55675557 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 55675616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 1884

 55675617 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 55675676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 1944

 55675677 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 55675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 2004

 55675737 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 55675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 2064

 55675797 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 55675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 2124

 55675857 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 55675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 2184

 55675917 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 55675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 2244

 55675977 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 55676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 2304

 55676037 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 55676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 2364

 55676097 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 55676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 2424

 55676157 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 55676216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 2484

 55676217 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 55676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 2544

 55676277 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 55676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 2604

 55676337 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 55676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 2664

 55676397 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 55676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 2724

 55676457 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 55676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 2784

 55676517 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 55676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 2844

 55676577 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 55676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 2904

 55676637 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 55676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 2964

 55676697 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 55676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 3024

 55676757 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 55676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 3084

 55676817 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 55676876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 3144

 55676877 AAGTAG 55676882
          ||||||
     3145 AAGTAG 3150

Alignment time is 2.39487 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4792] =>      4792 nucs 'mol-32-3306-040618_4792'

Score:        4769
Aligned:      4791        nucs
Identic:      4789 (100%) nucs =>      1983 (100%)      2806 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672793,55674775] EXCISED REGION [55674777,55677584]
 second seq =>  [       1,    1983] EXCISED REGION [    1985,    4792]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55674776,55674776]
 second seq =>         1 nucs [1984,1984]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1983,1983] to [1984,1984]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55672793 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGT 55672852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGT 60

 55672853 GCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACT 55672912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACT 120

 55672913 TTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAA 55672972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAA 180

 55672973 CCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCC 55673032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCC 240

 55673033 AAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCC 55673092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCC 300

 55673093 TTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGG 55673152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGG 360

 55673153 CTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAA 55673212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAA 420

 55673213 TTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAAT 55673272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAAT 480

 55673273 TCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCA 55673332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCA 540

 55673333 GTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCT 55673392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCT 600

 55673393 TTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTT 55673452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTT 660

 55673453 TTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAA 55673512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAA 720

 55673513 TATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAA 55673572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAA 780

 55673573 AATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATA 55673632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATA 840

 55673633 TATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGA 55673692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGA 900

 55673693 TTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTT 55673752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTT 960

 55673753 CACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGA 55673812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGA 1020

 55673813 TTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTC 55673872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTC 1080

 55673873 AAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGG 55673932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGG 1140

 55673933 GCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCT 55673992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCT 1200

 55673993 ATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAA 55674052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAA 1260

 55674053 TCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAA 55674112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAA 1320

 55674113 ATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCC 55674172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCC 1380

 55674173 TTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCA 55674232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCA 1440

 55674233 TTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGT 55674292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGT 1500

 55674293 ATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTT 55674352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTT 1560

 55674353 CTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATG 55674412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATG 1620

 55674413 AGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGC 55674472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGC 1680

 55674473 TGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACA 55674532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACA 1740

 55674533 CTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGC 55674592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGC 1800

 55674593 AATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTAC 55674652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTAC 1860

 55674653 AGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAG 55674712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAG 1920

 55674713 GGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTG 55674772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTG 1980

 55674773 ATC 55674775
          |||
     1981 ATC 1983

EXCISED REGION

 55674777 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 55674836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 2044

 55674837 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 55674896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 2104

 55674897 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 55674956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 2164

 55674957 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 55675016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 2224

 55675017 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 55675076
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 2284

 55675077 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 55675136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 2344

 55675137 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 55675196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 2404

 55675197 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 55675256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 2464

 55675257 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 55675316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 2524

 55675317 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 55675376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 2584

 55675377 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 55675436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 2644

 55675437 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 55675496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 2704

 55675497 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 55675556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 2764

 55675557 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 55675616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 2824

 55675617 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 55675676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 2884

 55675677 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 55675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 2944

 55675737 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 55675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 3004

 55675797 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 55675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 3064

 55675857 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 55675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 3124

 55675917 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 55675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 3184

 55675977 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 55676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 3244

 55676037 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 55676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 3304

 55676097 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 55676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 3364

 55676157 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 55676216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 3424

 55676217 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 55676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 3484

 55676277 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 55676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 3544

 55676337 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 55676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 3604

 55676397 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 55676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 3664

 55676457 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 55676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 3724

 55676517 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 55676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 3784

 55676577 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 55676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 3844

 55676637 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 55676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 3904

 55676697 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 55676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 3964

 55676757 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 55676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 4024

 55676817 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 55676876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 4084

 55676877 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 55676936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 4144

 55676937 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 55676996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 4204

 55676997 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATT 55677056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATT 4264

 55677057 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAA 55677116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAA 4324

 55677117 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTC 55677176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTC 4384

 55677177 TTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA 55677236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 TTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA 4444

 55677237 CGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCA 55677296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 CGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCA 4504

 55677297 GGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAAT 55677356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 GGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAAT 4564

 55677357 TCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAG 55677416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAG 4624

 55677417 TGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTG 55677476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTG 4684

 55677477 CCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCA 55677536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 CCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCA 4744

 55677537 GAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTA 55677584
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 GAATTTATTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTA 4792

Alignment time is 3.4999 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4753] =>      4753 nucs 'mol-32-3306-197357_4753'

Score:        2738
Aligned:      2793        nucs
Identic:      2788 (100%) nucs =>        12 (100%)      2776 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55669005,55669016] EXCISED REGION [55674543,55677323]
 second seq =>  [    1555,    1566] EXCISED REGION [    1973,    4753]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5526 nucs [55669017,55674542]
 second seq =>       406 nucs [1567,1972]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      1117 nucs [55673426,55674542]
 second seq =>       119 nucs [1854,1972]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55669017,55669017] to [55674543,55674543]
 second seq =>         3 nucs [1564,1566] to [1970,1972]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55669016,55669016] to [55674543,55674543]
 second seq =>         1 nucs [1566,1566] to [1973,1973]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55669005 CTTTTTTTTTTT 55669016
          ||||||||||||
     1555 CTTTTTTTTTTT 1566

EXCISED REGION

 55674543 TGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAG 55674602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAG 2032

 55674603 AGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAG 55674662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 AGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAG 2092

 55674663 CACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGC 55674722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGC 2152

 55674723 TAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATC 55674782
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2153 TAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCCGATATC 2212

 55674783 AAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAG 55674842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 AAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAG 2272

 55674843 TAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATC 55674902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATC 2332

 55674903 TTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCA 55674962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCA 2392

 55674963 TTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAAC 55675022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 TTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAAC 2452

 55675023 CCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAA 55675082
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 CCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAA 2512

 55675083 TATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTC 55675142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 TATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTC 2572

 55675143 CTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTT 55675202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTT 2632

 55675203 TCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAG 55675262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAG 2692

 55675263 TAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCT 55675322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCT 2752

 55675323 TTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTT 55675382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTT 2812

 55675383 AAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGA 55675442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 AAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGA 2872

 55675443 GAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTC 55675502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 GAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTC 2932

 55675503 ATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACG 55675562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 ATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACG 2992

 55675563 GAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCT 55675622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 GAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCT 3052

 55675623 GAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCT 55675682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCT 3112

 55675683 GTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGA 55675742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 GTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGA 3172

 55675743 AAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATT 55675802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 AAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATT 3232

 55675803 GTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTC 55675862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 GTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTC 3292

 55675863 ATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCAC 55675922
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 ATGACCCTGGCTTCGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCAC 3352

 55675923 ACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATA 55675982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 ACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATA 3412

 55675983 ATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGAC 55676042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 ATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGAC 3472

 55676043 CTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTA 55676102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 CTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTA 3532

 55676103 TTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGA 55676162
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3533 TTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTCGACCTTTATGTTTATGTAGA 3592

 55676163 ATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCT 55676222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 ATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCT 3652

 55676223 TTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTG 55676282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 TTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTG 3712

 55676283 GAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTA 55676342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 GAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTA 3772

 55676343 ATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAAT 55676402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 ATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAAT 3832

 55676403 ATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATA 55676462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 ATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATA 3892

 55676463 GCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGG 55676522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 GCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGG 3952

 55676523 GCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGC 55676582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGC 4012

 55676583 TAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGT 55676642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGT 4072

 55676643 CTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTC 55676702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 CTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTC 4132

 55676703 TCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAG 55676762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4133 TCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCCCCAAG 4192

 55676763 ACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTC 55676822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 ACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTC 4252

 55676823 ATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAG 55676882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 ATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAG 4312

 55676883 TTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTATGCAAT 55676942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 TTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTATGCAAT 4372

 55676943 GTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGT 55677002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 GTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGT 4432

 55677003 GCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTG 55677062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 GCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTG 4492

 55677063 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTT 55677122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTT 4552

 55677123 GTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACC 55677182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 GTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACC 4612

 55677183 TCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCAC 55677242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCAC 4672

 55677243 CTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCA 55677302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 CTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCA 4732

 55677303 CCCCAAAATTAGGGCTTAGCC 55677323
          |||||||||||||||||||||
     4733 CCCCAAAATTAGGGCTTAGCC 4753

Alignment time is 3.5137 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3086] =>      3086 nucs 'mol-32-3311-179330_3086'

Score:        3063
Aligned:      3085        nucs
Identic:      3083 (100%) nucs =>       915 (100%)      2168 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673861,55674775] EXCISED REGION [55674777,55676946]
 second seq =>  [       1,     915] EXCISED REGION [     917,    3086]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55674776,55674776]
 second seq =>         1 nucs [916,916]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [915,915] to [916,916]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673861 GTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATC 55673920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATC 60

 55673921 CTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGC 55673980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGC 120

 55673981 TGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAG 55674040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAG 180

 55674041 CCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATT 55674100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATT 240

 55674101 AAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAG 55674160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAG 300

 55674161 CAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAG 55674220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAG 360

 55674221 ATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGG 55674280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGG 420

 55674281 TTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGAC 55674340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGAC 480

 55674341 AAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTC 55674400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTC 540

 55674401 TTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTAT 55674460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTAT 600

 55674461 TGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAA 55674520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAA 660

 55674521 ATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGG 55674580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGG 720

 55674581 TCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGA 55674640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGA 780

 55674641 GTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAG 55674700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAG 840

 55674701 GAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAA 55674760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAA 900

 55674761 GTGAAGAACTTGATC 55674775
          |||||||||||||||
      901 GTGAAGAACTTGATC 915

EXCISED REGION

 55674777 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 55674836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 976

 55674837 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 55674896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 1036

 55674897 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 55674956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 1096

 55674957 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 55675016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1097 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTCAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 1156

 55675017 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 55675076
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 1216

 55675077 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 55675136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 1276

 55675137 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 55675196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 1336

 55675197 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 55675256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 1396

 55675257 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 55675316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 1456

 55675317 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 55675376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 1516

 55675377 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 55675436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 1576

 55675437 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 55675496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 1636

 55675497 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 55675556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 1696

 55675557 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 55675616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 1756

 55675617 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 55675676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 1816

 55675677 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 55675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 1876

 55675737 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 55675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 1936

 55675797 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 55675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 1996

 55675857 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 55675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 2056

 55675917 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 55675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 2116

 55675977 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 55676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 2176

 55676037 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 55676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 2236

 55676097 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 55676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 2296

 55676157 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 55676216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 2356

 55676217 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 55676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 2416

 55676277 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 55676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 2476

 55676337 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 55676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 2536

 55676397 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 55676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 2596

 55676457 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 55676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 2656

 55676517 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 55676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 2716

 55676577 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 55676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 2776

 55676637 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 55676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 2836

 55676697 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 55676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 2896

 55676757 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 55676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 2956

 55676817 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 55676876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 3016

 55676877 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 55676936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 3076

 55676937 TGCAATGTAT 55676946
          ||||||||||
     3077 TGCAATGTAT 3086

Alignment time is 2.27395 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4343] =>      4343 nucs 'mol-32-3395-193014_4343'

Score:        4299
Aligned:      4343        nucs
Identic:      4339 (100%) nucs =>      4082 (100%)       257 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672798,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678045]
 second seq =>  [       1,    4086] EXCISED REGION [    4087,    4343]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [4086,4086] to [4087,4087]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55672798 GATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATT 55672857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATT 60

 55672858 TGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTG 55672917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTG 120

 55672918 TGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATG 55672977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATG 180

 55672978 TTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATA 55673037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATA 240

 55673038 GCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCA 55673097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCA 300

 55673098 ATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGT 55673157
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGT 360

 55673158 TATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATA 55673217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATA 420

 55673218 GGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATA 55673277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATA 480

 55673278 TTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTA 55673337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTA 540

 55673338 AAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAA 55673397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAA 600

 55673398 AATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATA 55673457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATA 660

 55673458 AATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTA 55673517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTA 720

 55673518 AATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTT 55673577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTT 780

 55673578 CAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAG 55673637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAG 840

 55673638 TTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAG 55673697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAG 900

 55673698 ATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAA 55673757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAA 960

 55673758 TGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTT 55673817
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTT 1020

 55673818 ATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAG 55673877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAG 1080

 55673878 AATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATG 55673937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATG 1140

 55673938 TATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCA 55673997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCA 1200

 55673998 GGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGG 55674057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGG 1260

 55674058 CCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAG 55674117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAG 1320

 55674118 TTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCA 55674177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCA 1380

 55674178 TTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACC 55674237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACC 1440

 55674238 ATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGT 55674297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGT 1500

 55674298 TACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGA 55674357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGA 1560

 55674358 ACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTT 55674417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTT 1620

 55674418 GAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCAT 55674477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCAT 1680

 55674478 CTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTT 55674537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTT 1740

 55674538 AAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAA 55674597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAA 1800

 55674598 AGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCA 55674657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCA 1860

 55674658 ACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATT 55674717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATT 1920

 55674718 CTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAG 55674777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAG 1980

 55674778 ATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGAC 55674837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGAC 2040

 55674838 CAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGG 55674897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGG 2100

 55674898 AAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTC 55674957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTC 2160

 55674958 TCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATG 55675017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATG 2220

 55675018 AGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTA 55675077
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTA 2280

 55675078 GAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAA 55675137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAA 2340

 55675138 GCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACT 55675197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACT 2400

 55675198 CTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTC 55675257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTC 2460

 55675258 TGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTA 55675317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTA 2520

 55675318 TGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAG 55675377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAG 2580

 55675378 AAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATT 55675437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATT 2640

 55675438 TTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCA 55675497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCA 2700

 55675498 TGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCAT 55675557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCAT 2760

 55675558 TTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAAC 55675617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAAC 2820

 55675618 TTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTA 55675677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTA 2880

 55675678 ATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAAT 55675737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAAT 2940

 55675738 ACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATA 55675797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATA 3000

 55675798 ATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTA 55675857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTA 3060

 55675858 ATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAA 55675917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAA 3120

 55675918 ATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCC 55675977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCC 3180

 55675978 TCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTG 55676037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTG 3240

 55676038 GTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGT 55676097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGT 3300

 55676098 GTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTAT 55676157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTAT 3360

 55676158 GTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATT 55676217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATT 3420

 55676218 TTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGC 55676277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGC 3480

 55676278 AACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGC 55676337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGC 3540

 55676338 ATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAG 55676397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAG 3600

 55676398 AAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTT 55676457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTT 3660

 55676458 CAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGG 55676517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGG 3720

 55676518 GGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTC 55676577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTC 3780

 55676578 ACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGG 55676637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGG 3840

 55676638 AGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTT 55676697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTT 3900

 55676698 GATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCT 55676757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCT 3960

 55676758 CCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCAT 55676817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCAT 4020

 55676818 CTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCA 55676877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCA 4080

 55676878 AGTAGT 55676883
          ||||||
     4081 AGTAGT 4086

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 4146

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 4206

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 4266

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 4326

 55678029 ACAACATGTTTTGATAT 55678045
          |||||||||||||||||
     4327 ACAACATGTTTTGATAT 4343

Alignment time is 3.1356 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4324] =>      4324 nucs 'mol-32-33a0-131740_4324'

Score:        4308
Aligned:      4319        nucs
Identic:      4318 (100%) nucs =>      1985 (100%)      2333 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672791,55674775] EXCISED REGION [55674777,55677110]
 second seq =>  [       1,    1985] EXCISED REGION [    1987,    4320]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55674776,55674776]
 second seq =>         1 nucs [1986,1986]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1985,1985] to [1986,1986]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55672791 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAA 55672850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAA 60

 55672851 GTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTA 55672910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTA 120

 55672911 CTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTC 55672970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTC 180

 55672971 AACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTC 55673030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTC 240

 55673031 CCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTC 55673090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTC 300

 55673091 CCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACA 55673150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACA 360

 55673151 GGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGG 55673210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGG 420

 55673211 AATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAA 55673270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAA 480

 55673271 ATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCT 55673330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCT 540

 55673331 CAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTC 55673390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTC 600

 55673391 CTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCAT 55673450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCAT 660

 55673451 TTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTAT 55673510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTAT 720

 55673511 AATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACT 55673570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACT 780

 55673571 AAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGA 55673630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGA 840

 55673631 TATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCAT 55673690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCAT 900

 55673691 GATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATAC 55673750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATAC 960

 55673751 TTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGA 55673810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGA 1020

 55673811 GATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATG 55673870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATG 1080

 55673871 TCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTA 55673930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTA 1140

 55673931 GGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGT 55673990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGT 1200

 55673991 CTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTA 55674050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTA 1260

 55674051 AATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAA 55674110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAA 1320

 55674111 AAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGT 55674170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGT 1380

 55674171 CCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAAC 55674230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAAC 1440

 55674231 CATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGG 55674290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGG 1500

 55674291 GTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGC 55674350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGC 1560

 55674351 TTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCA 55674410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCA 1620

 55674411 TGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATG 55674470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATG 1680

 55674471 GCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGA 55674530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGA 1740

 55674531 CACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTA 55674590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTA 1800

 55674591 GCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTT 55674650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTT 1860

 55674651 ACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAG 55674710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAG 1920

 55674711 AGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACT 55674770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACT 1980

 55674771 TGATC 55674775
          |||||
     1981 TGATC 1985

EXCISED REGION

 55674777 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 55674836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 2046

 55674837 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 55674896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 2106

 55674897 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 55674956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 2166

 55674957 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 55675016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 2226

 55675017 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 55675076
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 2286

 55675077 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 55675136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 2346

 55675137 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 55675196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 2406

 55675197 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 55675256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 2466

 55675257 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 55675316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 2526

 55675317 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 55675376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 2586

 55675377 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 55675436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 2646

 55675437 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 55675496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 2706

 55675497 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 55675556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 2766

 55675557 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 55675616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 2826

 55675617 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 55675676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 2886

 55675677 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 55675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 2946

 55675737 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 55675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 3006

 55675797 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 55675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 3066

 55675857 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 55675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 3126

 55675917 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 55675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 3186

 55675977 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 55676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 3246

 55676037 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 55676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 3306

 55676097 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 55676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 3366

 55676157 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 55676216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 3426

 55676217 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 55676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 3486

 55676277 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 55676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 3546

 55676337 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 55676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 3606

 55676397 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 55676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 3666

 55676457 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 55676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 3726

 55676517 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 55676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 3786

 55676577 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 55676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 3846

 55676637 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 55676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 3906

 55676697 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 55676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 3966

 55676757 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 55676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 4026

 55676817 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 55676876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 4086

 55676877 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 55676936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 4146

 55676937 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 55676996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 4206

 55676997 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATT 55677056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATT 4266

 55677057 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCC 55677110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCC 4320

Alignment time is 3.1676 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8356] =>      8356 nucs 'mol-32-33f8-054004_8356'

Score:        8298
Aligned:      8355        nucs
Identic:      8349 (100%) nucs =>      4228 (100%)      4121 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55673453,55677682] EXCISED REGION [55677685,55681807]
 second seq =>  [       1,    4230] EXCISED REGION [    4232,    8356]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [4231,4231]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55673453 TTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAA 55673512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAA 60

 55673513 TATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAA 55673572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAA 120

 55673573 AATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATA 55673632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATA 180

 55673633 TATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGA 55673692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGA 240

 55673693 TTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTT 55673752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTT 300

 55673753 CACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGA 55673812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGA 360

 55673813 TTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTC 55673872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTC 420

 55673873 AAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGG 55673932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGG 480

 55673933 GCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCT 55673992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCT 540

 55673993 ATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAA 55674052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAA 600

 55674053 TCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAA 55674112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAA 660

 55674113 ATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCC 55674172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCC 720

 55674173 TTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCA 55674232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCA 780

 55674233 TTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGT 55674292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGT 840

 55674293 ATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTT 55674352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTT 900

 55674353 CTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATG 55674412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATG 960

 55674413 AGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGC 55674472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGC 1020

 55674473 TGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACA 55674532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACA 1080

 55674533 CTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGC 55674592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGC 1140

 55674593 AATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTAC 55674652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTAC 1200

 55674653 AGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAG 55674712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAG 1260

 55674713 GGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTG 55674772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTG 1320

 55674773 ATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGA 55674832
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCCGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGA 1380

 55674833 CAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAA 55674892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAA 1440

 55674893 GGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTG 55674952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTG 1500

 55674953 AACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGAT 55675012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGAT 1560

 55675013 AAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTA 55675072
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTA 1620

 55675073 TTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGC 55675132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGC 1680

 55675133 AGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAG 55675192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAG 1740

 55675193 AAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATA 55675252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATA 1800

 55675253 ATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATG 55675312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATG 1860

 55675313 CATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCT 55675372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCT 1920

 55675373 GGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATA 55675432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATA 1980

 55675433 GTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCT 55675492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCT 2040

 55675493 TAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGT 55675552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGT 2100

 55675553 TTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGG 55675612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGG 2160

 55675613 ATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCA 55675672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCA 2220

 55675673 ACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAA 55675732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAA 2280

 55675733 ACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAG 55675792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAG 2340

 55675793 AAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAA 55675852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAA 2400

 55675853 GACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATC 55675912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATC 2460

 55675913 ACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCC 55675972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCC 2520

 55675973 GCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAG 55676032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAG 2580

 55676033 TTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAAC 55676092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAAC 2640

 55676093 AAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATG 55676152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATG 2700

 55676153 TTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCAC 55676212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCAC 2760

 55676213 ACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGG 55676272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGG 2820

 55676273 AGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCT 55676332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCT 2880

 55676333 GCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGT 55676392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGT 2940

 55676393 CTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAA 55676452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAA 3000

 55676453 TTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGG 55676512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGG 3060

 55676513 TGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGA 55676572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGA 3120

 55676573 GATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGG 55676632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGG 3180

 55676633 ACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGA 55676692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGA 3240

 55676693 AACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGT 55676752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGT 3300

 55676753 TTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTT 55676812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTT 3360

 55676813 GGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGA 55676872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGA 3420

 55676873 ATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCAC 55676932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGCAAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCAC 3480

 55676933 TCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCC 55676992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCTATGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCC 3540

 55676993 AGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGC 55677052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGC 3600

 55677053 CATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAG 55677112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAG 3660

 55677113 CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAA 55677172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAA 3720

 55677173 TCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 55677232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTCTTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3780

 55677233 GCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGA 55677292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GCCACGGCACCTGGCCCATGCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGA 3840

 55677293 TGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAA 55677352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGCAGGTGCACCCCAAAATTAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAA 3900

 55677353 GAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGC 55677412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAATTCAAGAGCACACTAACAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGC 3960

 55677413 AAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGG 55677472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAGTGACCTCTCATAGGCACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGG 4020

 55677473 GCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTA 55677532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCTGCCAGCTAGCTATATTTATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTA 4080

 55677533 TTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGG 55677592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTCAGAATTTTTTAGAAAAGGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGG 4140

 55677593 GTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGACA 55677652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTTGTTGCCCATGCTAATGAGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGACA 4200

 55677653 ATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 55677682
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATGAGTGGTCACTTTTGTCACCAGGTACCG 4230

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTC--TTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTA 55677742
          ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTTA 4291

 55677743 ATCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAA 55677802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 ATCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTAA 4351

 55677803 GAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACA 55677862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 GAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAACA 4411

 55677863 GTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGG 55677922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 GTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACGG 4471

 55677923 TTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCAC 55677982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 TTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCAC 4531

 55677983 TTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGA 55678042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 TTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTGA 4591

 55678043 TATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTC 55678102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 TATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTTC 4651

 55678103 ATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCC 55678162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 ATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCTCTTCACGAATTTCC 4711

 55678163 AGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCC 55678222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4712 AGTAAACAATATTAACTGTAGTCCTCATGCTGTATTTTACATCTGTAGATTTATTCATCC 4771

 55678223 CACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCT 55678282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 CACATAACTGTTACTTTATACCTTTTAACTTAATCTCCCCATTTCCCTTTCCCCGCCTCT 4831

 55678283 GATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGA 55678342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 GATAATCACAGTACTACACTCTGCTTCTGTGTATTCAACTTTTATTATTATTTTTTTAGA 4891

 55678343 TTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCA 55678402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 TTCCACATACAAGAGAGGTTATGTAGTGTTTTTCTTTCTGTGCCTAGCTTATTTCACTCA 4951

 55678403 GTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGG 55678462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 GTACAATGTCCTTTAGGTTTATCCGTGTTGTCAAAAATGGCTGGATCTCCTTTTCTAAGG 5011

 55678463 CTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTAT 55678522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 CTGAATAATATTCAATTTTGTATATAGATATACACACAACCTCTGCAATTTTTCATCTAT 5071

 55678523 TTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGA 55678582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 TTATTTCTCGGCAATTAGATTATTTACATATCTGGGCTATTACAAATAATTCTGAAATGA 5131

 55678583 ACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCA 55678642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 ACATTGGAGTGCAGATCTCTCTACAAGGTGTTGATTTCATTTCCTCTGGGTATATACCCA 5191

 55678643 GAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTT 55678702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 GAAGAGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTTAATTTTTTTCAGCAATCTTTGTATTGTTT 5251

 55678703 TCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTC 55678762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 TCCATAATGGTTACACCAATTTACATTCTCATTAACAGTGCAAAAGGGTTTTTGTTTCTC 5311

 55678763 TATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGTCTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGAT 55678822
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 TATACCTTGCCAATTTGTTATCTATTGACTTTTTGATAATAGGCTTTGCATTTGCCTGAT 5371

 55678823 GATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTG 55678882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 GATTAATGATATCGAACACATTTTCATATACCTGTTGGCCACTTTTTATGTCTTCTTTTG 5431

 55678883 GGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCT 55678942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 GGAAATGTTTGTTTATTCTGGTACTTTGCCTATTTTTTAATTGGGTTTTTGTTTTTTTCT 5491

 55678943 TTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCA 55679002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 TTTTGCTATTGATTTTCTTAAATATTTTGGATAGTAACCTGTTATCAGATATGTGGTTCA 5551

 55679003 CAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTC 55679062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 CAAATATTTTCTCCTAATCTGTAGATTGCCTTTTCATTTTATCGATTATTTCCTTTGCTC 5611

 55679063 TGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTC 55679122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 TGTAGAAGCTTTTCGGTGTGATGTAGTCATACTTGTTTGTTCTTGCTTTCATTGCCTGTC 5671

 55679123 CTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCT 55679182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 CTATCAGAAAAATCATTGCCAAGGCCAATATGTATCAGCTTCTTTCCTATGTTTTCTCCT 5731

 55679183 AGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTT 55679242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 AGGTGTTTTACAGATTCAAGTCTTATGTTTAGGCCTTTAATCTGTTTTGAGTTGACTTTT 5791

 55679243 GTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCC 55679302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 GTCTTGGTGTAAGATAAGCGTCCAATTTCATCCTTTTGCATGTGGATATCCAGTTTTCCC 5851

 55679303 AACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTA 55679362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 AACACTAGATATGAAAGAGACTAAACTTGCCCCATTGTGTCTTCTTGGTGTCTTTGTCTA 5911

 55679363 AGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTG 55679422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 AGACACTTCTATGACAGTTTTTTCTCAGACGGGTACTTGTTTACGTGACTCACAACAGTG 5971

 55679423 AATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAG 55679482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 AATGGAAATGTTCACCACTCATCACGCCATCTAACACACTGTGTTAAGACACATGTAAAG 6031

 55679483 ACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGA 55679542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 ACTGTTCTAATAGTACCAGTTGCAACTATAACTGAAAATAGTATTATTTTAGTAAATGGA 6091

 55679543 AGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTT 55679602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 AGGGTGCACTACTCTTAACTTCATCTAAAACACTCTTAAAACAATGTATTGAAGCTATTT 6151

 55679603 CTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAAGAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTT 55679662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6152 CTAAGAATGTAAGTTGCACAGGTGATTGAGAACAGTGTTATTTCAGTCACTGGGTGTGTT 6211

 55679663 CAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCT 55679722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 CAACACTCTTAACACCATATAATAAAAGATGTTTCTAAAAAGTGCTGGTTGAGTGTATCT 6271

 55679723 TTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTT 55679782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 TTCAGAACAGTGTTATTTCAGTAAATGGAGTGTTTACCCACAATTCTAATACACTCTGTT 6331

 55679783 AAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGT 55679842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 AAGATCCATGTATGAAATATGTTTGTAAGAGTGATTTTTGCAAGCTCAATTCACAACAGT 6391

 55679843 ATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATC 55679902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 ATTTCAGTAAATGGAAGTGTTCAATATTTTTAATTCAATATTTATTACATTTAATTAATC 6451

 55679903 AACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCA 55679962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 AACTTGTATAAAAAAGTTTCTTTATATTATTTATTTATTTTTCATAGAGACCGGGTCTCA 6511

 55679963 CTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCC 55680022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 CTAAATTGCCCAGCTGGTCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCGATCCTCCCACATTAGCCTCC 6571

 55680023 CAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGT 55680082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 CAAAGTGCTGGAATTACAGGAGTGAGCCACCATCTCTGGCCGAAAAAAGTTTCTAGGAGT 6631

 55680083 GGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTC 55680142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 GGTAGTCATGCATGTGATTCAAAACAACCTTATTTCAGTGAACGAAAGTTTTCAGCCCTC 6691

 55680143 TTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAG 55680202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 TTAACTTCACTTAATGCACTCTGAGAAGATACCTACAAAAGATGTTTTTTAGGACGGAAG 6751

 55680203 TTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCC 55680262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 TTGAACATCTGATTCAGAACATCATTATTTCAGTGAACAGAGTTTAGCCCTTCAATGGCC 6811

 55680263 AACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGA 55680322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 AACACTCTGTTAATGCACATATATAAAAGGTGTTTCTAGGAGTGCTGGTTGTTTCCATGA 6871

 55680323 TTCAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTG 55680382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 TTCAGACAGGTTTTTTTTTTCTTATTATTTCATCATTTTTAACTCCATTTGTATACTTTG 6931

 55680383 TTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAG 55680442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 TTCAAACATAAGTATAAATGATATTCTCAGAATGCAAGTTGCACAGTTGATTCAGAATAG 6991

 55680443 TGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGG 55680502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 TGTGATTTCAGTGAATGGAGCAGTTCACCACTCGTAACACCATTTATAAAATCTCTCAGG 7051

 55680503 TCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTC 55680562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 TCACATGTATAAAAGACGTTTCCAAGGGTTCATGCATGTGACTCAAAAAAGTATTATTTC 7111

 55680563 AGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAA 55680622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7112 AGTTAATGGAAGTTCTTCATTCTTAACTTCACCTAATATGTGTATACTCCTTTAAGACAA 7171

 55680623 GTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGT 55680682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 GTGTGTAAAAATGTTTCTACAATTGATAGTTGTGCTTGCTACTCCAATCAGTATTTCAGT 7231

 55680683 TAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAA 55680742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 TAATGGAAGCGCTCACCACTTTTATGCCCATGTAATACACTTTCATAGAGCACATATAAA 7291

 55680743 GATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCA 55680802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 GATCTTTATAGGAGTGCTAGCTTCACATGTGCTCCAGTATTATTTCAATGAAAGTGTTCA 7351

 55680803 CTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGG 55680862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7352 CTGCTCAACTCCATTTAATACACTGTAGTGAGACACATGTACAAAATATGTTTGTAAAGG 7411

 55680863 AGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCT 55680922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7412 AGCTATTTGTGTGGCGTTTGAGAATTGTTATTACCACTCTTAACTTCATTTTTTATACCT 7471

 55680923 TGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAA 55680982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7472 TGCCAAAACACATGTATACAAGATGTTTCTATAATTGTTAATTGGATGCATGAATCGGAA 7531

 55680983 CAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAG 55681042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7532 CAATTTTGAGTGAATGAAAGTGTTCACCACTCTTAACTCCATCTGAAATTCCCCATTAAG 7591

 55681043 ACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCA 55681102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7592 ACACATGTATGAAAGATGTTTCTAAGATTGCTAATTTATGCATGATAGATGAAAGTGTCA 7651

 55681103 TTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATG 55681162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7652 TTTCAGTGAATGGTTTAGTTTGCTGCTCATCTCTTTCTAATACATCCTGGCAGACACATG 7711

 55681163 TATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAAT 55681222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7712 TATAAAGGCATTTCTGGGAGTACTCATTATGTGCATGGTTCAGAACAGTATCAATCCAAT 7771

 55681223 GAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTA 55681282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7772 GAATGAACATATTCAACTCTGTTGACTCCATCTAACACACTCTATTAAGATTCACGTGTA 7831

 55681283 AAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGA 55681342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7832 AAAGCTATTTGTAAGAGCACTACTTGTGTAAATGATTAAGAACAATGTTAATTCAATGGA 7891

 55681343 TAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGACATTAGATGTTTCTA 55681402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7892 TAGATGTTTTCATCACTCAACTGTATTTAATACACTCTGTGAAGACATTAGATGTTTCTA 7951

 55681403 AGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTGAATGGAAGGTCTCTC 55681462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7952 AGAATTCTATTTTATATATTATTTAGGACAATGTTATTTTGTGTGAATGGAAGGTCTCTC 8011

 55681463 CACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAATACACTTCTAAGACT 55681522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8012 CACTTTTATGTCATCTAATATACTCTGCTAGGCACATGTGCAAAATACACTTCTAAGACT 8071

 55681523 GCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGAAATGCTCATCAATTC 55681582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8072 GCTAGTTGCATGACTGATTCAGGACACTGTTATTTTAGGAAATGAAATGCTCATCAATTC 8131

 55681583 TGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCTAAGAATGCGAGTTGC 55681642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8132 TGTATAAATGTGCTCTGTTAAGGCATATCCACAAACTATATTTCTAAGAATGCGAGTTGC 8191

 55681643 ACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTTAAACCTTAAAATTTA 55681702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8192 ACAAGTGATTCAGCACACTTTGATTTCAATGTATTCACCACTCTTAAACCTTAAAATTTA 8251

 55681703 TTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTCTAGTTGCACATGTGA 55681762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8252 TTATATATGTTAAATCACATATATGAAAAGTACTCTCGTGAGTTCTAGTTGCACATGTGA 8311

 55681763 TTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 55681807
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8312 TTCTGAAAGTGTTATTTCAATGAATGTGTTAATCACTCTTAACTC 8356

Alignment time is 6.04254 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6332] =>      6332 nucs 'mol-32-33f8-076838_6332'

Score:        6287
Aligned:      6331        nucs
Identic:      6327 (100%) nucs =>      1147 (100%)      5180 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55670689,55671835] EXCISED REGION [55671837,55677020]
 second seq =>  [       1,    1147] EXCISED REGION [    1149,    6332]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55671836,55671836]
 second seq =>         1 nucs [1148,1148]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1147,1147] to [1148,1148]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55670689 AGAATGGTGGTGGAATATCTGCCTAGGCATATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAACT 55670748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAATGGTGGTGGAATATCTGCCTAGGCATATGCAGAAAAATAAAACTGGACCCCTAACT 60

 55670749 CTCACCATACTCAAAAATGAACTCAAGATGGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAAAC 55670808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCACCATACTCAAAAATGAACTCAAGATGGATTAAAGATTTAAATCTAAGATTACAAAC 120

 55670809 TATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAAATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATG 55670868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAAAAATCCTAGAAGAAAACCTAGGAAATACCCTTCTAGACATGGGCTTTGGCAAATG 180

 55670869 ATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTACGACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTA 55670928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTATGCTAAGTCCCCCAGAGCAATTACGACAAAACCAAAAATTGATAATTGGGGCCTA 240

 55670929 ATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGCCT 55670988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAAATTACCAACAGAGTAAACAGACAGCCT 300

 55670989 ACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTATGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTACA 55671048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAAATGGGAGAAAATACTTGCAAACTATGCATCTAAGGTCTAATATCCAGAATTTACA 360

 55671049 AGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAACCAATTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAACAC 55671108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGAACTTAAATCAATGAGAAAAAAAAACCAATTAAGGAATGAGCAAAGGACATGAACAC 420

 55671109 TTTTCAAAAGGAGACATACACATGGCCAAAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTACTA 55671168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTCAAAAGGAGACATACACATGGCCAAAACAAACATAAAAACATGCTCAACATTACTA 480

 55671169 ATCATCAGAGACATACAAATCAAAACCAAGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAATG 55671228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCATCAGAGACATACAAATCAAAACCAAGATGAGGTACTATCTCACACCAGTTAGAATG 540

 55671229 GCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAACAGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAAT 55671288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAATTATTTAAAAAGTCAAAAAATAACAGCCGTCGGCGAGGCTGCAGAGAAAAGAGAAT 600

 55671289 GCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAGCTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGCTGTTTGGAG 55671348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTTATCTACTTTTGGTGGAAATGCAAGCTAGTTCAGCCACTGTGCAAAGCTGTTTGGAG 660

 55671349 ATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCACCATTCAGTGCTGCAATCCCGCTACTGGGTAT 55671408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTCCCAAATACCTTAAAACAGAACCACCATTCAGTGCTGCAATCCCGCTACTGGGTAT 720

 55671409 ATACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTATCATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATTGC 55671468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATACCCAAAGGAAAATAATTCATTCTATCATCAAGACAAATGCACCTGTATGTTCATTGC 780

 55671469 AGCACTACTCACAATAGTAAGGACATAGAAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTG 55671528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCACTACTCACAATAGTAAGGACATAGAAACAACCTAAGTGTCCATCAACAGTGGACTG 840

 55671529 GATAAAGGATATGTGGTACACATACACCATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAATGG 55671588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATAAAGGATATGTGGTACACATACACCATGGAATACTACACAGCCATAAAAAGGAATGG 900

 55671589 AATCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACC 55671648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCATGCATGTCCTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTGGCGGCCATTATCCTAAGTGACC 960

 55671649 TAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACACATGTTCTCACTTACAGGTGGGAGCTAAACAC 55671708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAAAGAAGAACGGAAAATCAAATAACACATGTTCTCACTTACAGGTGGGAGCTAAACAC 1020

 55671709 TGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAA 55671768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAAGACACATGATCGTAAAGGTGGTAACAATAGACACTAGGGATCACTAGATGAGGGAA 1080

 55671769 GGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGA 55671828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAGGGAGGGAAGCATGTGCTGAAGAACCACCTGTTGGGTACTGAGCTTATGGCCTGGGA 1140

 55671829 GATGGGA 55671835
          |||||||
     1141 GATGGGA 1147

EXCISED REGION

 55671837 CACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCACATGTA 55671896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 CACTGGGACCCCAAACCTCAGTGTCACATAATCTACCCATGCAACAAACCTGCACATGTA 1208

 55671897 CCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAAATTTAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGG 55671956
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 CCCTTTAATCTACAATAAAAGTTGAAATTAAAAAAGGACTTAATATCTGAAATAAAAAGG 1268

 55671957 CAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACAT 55672016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 CAAAAAACTAAAAAAAAGTAATAAAACCAGCTTTTGTAAACAGAATATGAAAATAGACAT 1328

 55672017 GTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACAC 55672076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 GTCTCCTGAAAGTTTCATCTGACTCTATGAATTGAGTTCACATTCAAATGTCTGAGACAC 1388

 55672077 CAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCA 55672136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 CAACTAAGTGAAGTAGCAAGGTGAAGTGCATAGAGAGGGCGACCTCTTTTCTGGAGGCCA 1448

 55672137 GCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGAT 55672196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 GCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAATGGAAATTCAGTATTGTCTGAT 1508

 55672197 CATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACT 55672256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 CATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTTTATCTGAAAGCTTCCAATGACT 1568

 55672257 AAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAA 55672316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 AAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTCTCTAAAACTTGCTGTACTTCAA 1628

 55672317 CCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTA 55672376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 CCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTCTAAAGGTTTGCCTTATACTTTA 1688

 55672377 TGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGG 55672436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 TGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGTGTTCTCAAAAGCATATTACTGG 1748

 55672437 AATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATA 55672496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 AATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGACATTTATCTCCAAACACAAATA 1808

 55672497 ACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGA 55672556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 ACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAGACTGACATTTTTTTTTCCGAGA 1868

 55672557 CGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTG 55672616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 CGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCAGTGGTGCGAACTTGGCTCACTG 1928

 55672617 AGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCAC 55672676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCAC 1988

 55672677 GTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGG 55672736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGG 2048

 55672737 CCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 55672796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 2108

 55672797 GGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCAT 55672856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCAT 2168

 55672857 TTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTT 55672916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 TTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTT 2228

 55672917 GTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCAT 55672976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 GTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCAT 2288

 55672977 GTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAAT 55673036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 GTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAAT 2348

 55673037 AGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTC 55673096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 AGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTC 2408

 55673097 AATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGG 55673156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 AATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGG 2468

 55673157 TTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTAT 55673216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 TTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTAT 2528

 55673217 AGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCAT 55673276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 AGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCAT 2588

 55673277 ATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTT 55673336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 ATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTT 2648

 55673337 AAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTA 55673396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 AAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTA 2708

 55673397 AAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTAT 55673456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 AAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTAT 2768

 55673457 AAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATT 55673516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 AAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATT 2828

 55673517 AAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATT 55673576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 AAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATT 2888

 55673577 TCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATA 55673636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 TCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATA 2948

 55673637 GTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCA 55673696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 GTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCA 3008

 55673697 GATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACA 55673756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 GATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACA 3068

 55673757 ATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTT 55673816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 ATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTT 3128

 55673817 TATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAA 55673876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 TATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAA 3188

 55673877 GAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCAT 55673936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCAT 3248

 55673937 GTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTC 55673996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 GTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTC 3308

 55673997 AGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTG 55674056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 AGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTG 3368

 55674057 GCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAA 55674116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 GCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAA 3428

 55674117 GTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTC 55674176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 GTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTC 3488

 55674177 ATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTAC 55674236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 ATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTAC 3548

 55674237 CATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGG 55674296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 CATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGG 3608

 55674297 TTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGG 55674356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGG 3668

 55674357 AACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGT 55674416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 AACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGT 3728

 55674417 TGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCA 55674476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 TGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCA 3788

 55674477 TCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGT 55674536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 TCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGT 3848

 55674537 TAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATA 55674596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATA 3908

 55674597 AAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCC 55674656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 AAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCC 3968

 55674657 AACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGAT 55674716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 AACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGAT 4028

 55674717 TCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCA 55674776
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4029 TCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCC 4088

 55674777 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 55674836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 GATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGA 4148

 55674837 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 55674896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 CCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAG 4208

 55674897 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 55674956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 GAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACT 4268

 55674957 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 55675016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 CTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAAT 4328

 55675017 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 55675076
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 GAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCT 4388

 55675077 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 55675136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 AGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCA 4448

 55675137 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 55675196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 AGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAAC 4508

 55675197 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 55675256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 TCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTT 4568

 55675257 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 55675316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 CTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATT 4628

 55675317 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAA 55675376
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4629 ATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGGAACCACAGCTGGAA 4688

 55675377 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 55675436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 GAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTAT 4748

 55675437 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 55675496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 TTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGC 4808

 55675497 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 55675556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 ATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCA 4868

 55675557 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 55675616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 TTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAA 4928

 55675617 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 55675676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 CTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGT 4988

 55675677 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 55675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4989 AATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAA 5048

 55675737 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 55675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5049 TACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAAT 5108

 55675797 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 55675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5109 AATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACT 5168

 55675857 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 55675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5169 AATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAA 5228

 55675917 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 55675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5229 AATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTC 5288

 55675977 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 55676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5289 CTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCT 5348

 55676037 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 55676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5349 GGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAG 5408

 55676097 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 55676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5409 TGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTA 5468

 55676157 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 55676216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5469 TGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACAT 5528

 55676217 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 55676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5529 TTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAG 5588

 55676277 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 55676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 CAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAG 5648

 55676337 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 55676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 CATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGA 5708

 55676397 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 55676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 GAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTT 5768

 55676457 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 55676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 TCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTG 5828

 55676517 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 55676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 GGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATT 5888

 55676577 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 55676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 CACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAG 5948

 55676637 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 55676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 GAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACT 6008

 55676697 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 55676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 TGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCC 6068

 55676757 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 55676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 TCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCA 6128

 55676817 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 55676876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 TCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGC 6188

 55676877 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 55676936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 AAGTAGTTCAGGTGATTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTA 6248

 55676937 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 55676996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6249 TGCAATGTATTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGC 6308

 55676997 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGG 55677020
          ||||||||||||||||||||||||
     6309 TGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGG 6332

Alignment time is 4.59121 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5391] =>      5391 nucs 'mol-32-3403-073185_5391'

Score:        5331
Aligned:      5390        nucs
Identic:      5383 (100%) nucs =>      4927 (100%)       456 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672752,55677682] EXCISED REGION [55677685,55678140]
 second seq =>  [       1,    4931] EXCISED REGION [    4933,    5391]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55677683,55677684]
 second seq =>         1 nucs [4932,4932]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [4959,4961]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55672752 CCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 55672811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCGCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 60

 55672812 GCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACT 55672871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCACCGTGCCCGACTGAGATTGACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACT 120

 55672872 TGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGAC 55672931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGACATTCAGTATACTTAAATATCTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGAC 180

 55672932 AGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCT 55672991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGGCTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCT 240

 55672992 TGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGG 55673051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGACCTCCTTGGCCCAAGTGATCCTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGG 300

 55673052 TATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGAT 55673111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGCACCATCATGCCAAGCTAAATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGAT 360

 55673112 GGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGG 55673171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGGTATGTTTTAGAGACACGGTCTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGG 420

 55673172 CTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCC 55673231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAAGAAATTCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCC 480

 55673232 TGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTAT 55673291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCTAAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTAT 540

 55673292 TTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAAC 55673351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCAATAAAAGATTTTAAGGGGACTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAAC 600

 55673352 TCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCA 55673411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTAATATTTTATATTGGATTTATAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCA 660

 55673412 ATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTA 55673471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGTCTAATATAACAAATATTCCCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTA 720

 55673472 AGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCAT 55673531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCTTATAGATATGATAAATTTAAGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCAT 780

 55673532 AATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTG 55673591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATCTTTCAGCTTAAAATTCTAAATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTG 840

 55673592 GATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGT 55673651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTATAGTACTAATACATTAATATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGT 900

 55673652 CAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACAC 55673711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAAATATAGATTTTTTTAACAAAAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACAC 960

 55673712 TTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATT 55673771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATGTGCCTAATACTAAATCTTGAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATT 1020

 55673772 ATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAG 55673831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGTTAGCTAAACAATTGTTTGTAACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAG 1080

 55673832 CTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTA 55673891
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1081 CTATAGACCATGGTACTTACTGCAGTGCTGTCTGAGATGTCAAAATAATACCAAGCCCTA 1140

 55673892 TTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCG 55673951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAATTATTTAGAATATAGAGGCGATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCG 1200

 55673952 CCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGT 55674011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGGTTCAAATCACTACTATTGCTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGT 1260

 55674012 GATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTA 55674071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATTGTTAAAATTTCAGGAATTGTGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTA 1320

 55674072 TATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGAC 55674131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATAAACATACAATTAAATAAATTGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGAC 1380

 55674132 ATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATG 55674191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGAACAAAACATATGCACATAAACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATG 1440

 55674192 GGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGA 55674251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGATATGTTGGTCTCAAATCTGAGCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGA 1500

 55674252 GTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATG 55674311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGACTGGTCCATGGTGGCCCTGGACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATG 1560

 55674312 TATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCA 55674371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAAAAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCA 1620

 55674372 CACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACT 55674431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACACAAGACACAGGAATAGGAAACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACT 1680

 55674432 GCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTA 55674491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTGCTGGTCCATCATTATTCCACACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTA 1740

 55674492 GCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTG 55674551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTTTTTGTGCCCTTCATATTCAAGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTG 1800

 55674552 AGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGA 55674611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGATTTATTCAAAACTATTGTAAGAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGA 1860

 55674612 GCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAA 55674671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTCAACTCCAAATACAATAAAGACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAA 1920

 55674672 GGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAG 55674731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCATCAGTGGATGCAAAACTACTAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAG 1980

 55674732 GCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAA 55674791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1981 GCTAAGGATTTAGACATCAAGGGTGAGAAGTGAAGAACTTGATCCGATATCAAGGGTGAA 2040

 55674792 GGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTT 55674851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGATTCTCACTAAACTGAATTAGCAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTT 2100

 55674852 AGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACT 55674911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCCTAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACT 2160

 55674912 CGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCA 55674971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CGTGCACCCAAGAAAGACAGCCATTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCA 2220

 55674972 GGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCC 55675031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGATGTTTCTAGAATCTTTAACAACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCC 2280

 55675032 TAACCTCTTTGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATT 55675091
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAACCTCTTAGCTCTCATTCTGACCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATT 2340

 55675092 CATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAG 55675151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATTTTCTTCTTTCATGTCATAACTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAG 2400

 55675152 CCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATC 55675211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCGTCAGAATGGATGAGGGATTTTTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATC 2460

 55675212 ACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATG 55675271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTTAATATCTGTGAGTTGTGGGAACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATG 2520

 55675272 CATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCC 55675331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATTACTTTAAAATCACCCAAAATTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCC 2580

 55675332 ACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTA 55675391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACAATAATGATAATATTATTTTGACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTA 2640

 55675392 TCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTG 55675451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTGGCTTCTGCTTCAAACATAGTTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTG 2700

 55675452 ACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAG 55675511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACACAGTTTCTATTGACTTCAGTATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAG 2760

 55675512 AAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTA 55675571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAATGTATTTGTAGAAATTTGAAGCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTA 2820

 55675572 GATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTA 55675631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GATGGAATGGGAAGGACTTTTGCTAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTA 2880

 55675632 ATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTA 55675691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATGTCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTA 2940

 55675692 TGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTA 55675751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGTTAAACAATTCTGAGATTAGGCATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTA 3000

 55675752 AAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGA 55675811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAATAACTTAGCTATTTGCTCTAGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGA 3060

 55675812 CTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTG 55675871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAAAACAGCTTACCTACCACCCCAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTG 3120

 55675872 GCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAG 55675931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCTTTGCTGTACCAATACATTTCAGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAG 3180

 55675932 ACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAA 55675991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACCCTAAAACACTATGAATAAATGTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAA 3240

 55675992 GGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGG 55676051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGTGGAGTTCTCTCTTACAGCATTAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGG 3300

 55676052 CAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAG 55676111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAGTCAACAATCCAAAGCTGTTAACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAG 3360

 55676112 TCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACAT 55676171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTGACTCCCTTTACTCTGGGGGTTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACAT 3420

 55676172 GTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATC 55676231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTTTCCAAGGACTGGTAGATACCGTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATC 3480

 55676232 TAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGT 55676291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGACAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGT 3540

 55676292 GGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACA 55676351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAGACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACA 3600

 55676352 CTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTA 55676411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTGACATGAGATGTTGAACAATAGGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTA 3660

 55676412 CCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATA 55676471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGGCACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATA 3720

 55676472 AGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCA 55676531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGGAAAATGTCCTGCCCTAATTTTGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCA 3780

 55676532 GGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAA 55676591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGGCAAAACAGATTTTATTTCCCATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAA 3840

 55676592 TTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCAC 55676651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTTTCTCTCTACTCCTAATGGAAAGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCAC 3900

 55676652 TTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGAT 55676711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTACTAGTAAATATTTCCTTGCCTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGAT 3960

 55676712 GAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGG 55676771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GAATCCACTTGGCAAGCATTAGAACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGG 4020

 55676772 ATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTT 55676831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATGACGAATTAGGAAATAGCTTATGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTT 4080

 55676832 CTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGA 55676891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTCTTCTGATAAACAGATATATAAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGTTCAGGTGA 4140

 55676892 TTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTT 55676951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTCAGAATAGTGTTATTTTAGTGAACAGAAATTTTCAGCACTCTATGCAATGTATTCTTT 4200

 55676952 TTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTG 55677011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTG 4260

 55677012 TGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCT 55677071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGATCTTGGCTCACTACAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCT 4320

 55677072 CCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTA 55677131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTA 4380

 55677132 GTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCC 55677191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTAGAGACGTGGTTTCGTCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCC 4440

 55677192 ACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCAT 55677251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGCACCTGGCCCAT 4500

 55677252 GCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAAT 55677311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCAATGTATTCTGTTGACACATGTATAAAAAAGGTTTCTGATGCAGGTGCACCCCAAAAT 4560

 55677312 TAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTCCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAA 55677371
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAGGGCTTAGCCTGGGAAGGTTCTTGGCTTTGCTCAGGAAAGAATTCAAGAGCACACTAA 4620

 55677372 CAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGC 55677431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CAACGAAAGAAAGCAAATGTATTAGAGCAATAGTGTACAGCAAAGTGACCTCTCATAGGC 4680

 55677432 ACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATT 55677491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ACAGCAGCCCAGAGCAGCAGCCACAGCCACAGCCCCCATGGGCTGCCAGCTAGCTATATT 4740

 55677492 TATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAA 55677551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TATACCCACTCTTAATTAGATGCTAATTAAGGGGTGGGTTATTCAGAATTTTTTAGAAAA 4800

 55677552 GGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATG 55677611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GGGACAGGGGAGTACCCAGAGCCATACAGAGTAAGTTCTGGGTTGTTGCCCATGCTAATG 4860

 55677612 AGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTC 55677671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AGCATGGTCATTAGCCCATGCTAATGAGCATGGTGAGGACAATGAGTGGTCACTTTTGTC 4920

 55677672 ACCAGGTACCG 55677682
          |||||||||||
     4921 ACCAGGTACCG 4931

EXCISED REGION

 55677685 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTC---TTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTT 55677741
          ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 TTTTTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGCATCCTGTTTT 4992

 55677742 AATCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTA 55677801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4993 AATCAGTAGGGTCATTACCAGTGCTCAGAAAACAAGTCCTGTTGATCTACCTCATTTGTA 5052

 55677802 AGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAAC 55677861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 AGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCTTAATCTTGTAAAC 5112

 55677862 AGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACG 55677921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5113 AGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCATACATGATTCAACG 5172

 55677922 GTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCA 55677981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5173 GTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATTCTATTGTATAGCA 5232

 55677982 CTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTG 55678041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5233 CTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGGACAACATGTTTTG 5292

 55678042 ATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTT 55678101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5293 ATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAACATATCTATGATTT 5352

 55678102 CATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAA 55678140
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5353 CATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAA 5391

Alignment time is 3.96726 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55666883,55687788] =>     20906 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5145] =>      5145 nucs 'mol-32-34be-099726_5145'

Score:        5101
Aligned:      5145        nucs
Identic:      5141 (100%) nucs =>      4765 (100%)       376 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55672115,55676883] EXCISED REGION [55677789,55678164]
 second seq =>  [       1,    4769] EXCISED REGION [    4770,    5145]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       905 nucs [55676884,55677788]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676884,55676884] to [55677789,55677789]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55676883,55676883] to [55677789,55677789]
 second seq =>         1 nucs [4769,4769] to [4770,4770]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [55676884,55676885] to [55677787,55677788]
 second seq =>         0 nucs

 55672115 GCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAA 55672174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGACCTCTTTTCTGGAGGCCAGCGTTTCTCATCTCCAGCTGATTGTCAATATATAGAAA 60

 55672175 TGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTT 55672234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAAATTCAGTATTGTCTGATCATGAAATTTTTCATAAAATGTTGGAAATTTTAATTTT 120

 55672235 TATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTC 55672294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCTGAAAGCTTCCAATGACTAAGTGATGACAATTACTTGAAAATGTTTCAAAACCCTC 180

 55672295 TCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTC 55672354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTAAAACTTGCTGTACTTCAACCAGATGTCTATTATCTTGCTGCATCCAATCTCAGCTC 240

 55672355 TAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGT 55672414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAAGGTTTGCCTTATACTTTATGAATTCCACCTTCGCCTTTCATTTCTACTCACATTGT 300

 55672415 GTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGA 55672474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCTCAAAAGCATATTACTGGAATAAAATTACATGCTTGTATACATGCTTGTATATTGA 360

 55672475 CATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAG 55672534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTTATCTCCAAACACAAATAACCTAGGAAGACAGTTTGCCAATGAGATGTTTTTTGAG 420

 55672535 ACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCA 55672594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGACATTTTTTTTTCCGAGACGTAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGATGGAGTGCA 480

 55672595 GTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCT 55672654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGGTGCGAACTTGGCTCACTGAGACCTCTGCCTCCCGGATTCTTCCGCCTCAGCCTCCT 540

 55672655 GAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 55672714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 600

 55672715 AGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCC 55672774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTTGACCGCCTGACCTCATGATCCACCC 660

 55672775 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTG 55672834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGACTGAGATTG 720

 55672835 ACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATAT 55672894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTGTATGCTCAGAAGTGCATTTGCTTTTAAAAACTTGACATTCAGTATACTTAAATAT 780

 55672895 CTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGG 55672954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAGGTTTTTTTTGTACTTTTTGTGTGTGTGTGAGACAGGGCCTTGCTTGGTCACCCAGG 840

 55672955 CTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATC 55673014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGAGTGCAGTGGCTCAACCATGTTTCACTGCAGCCTTGACCTCCTTGGCCCAAGTGATC 900

 55673015 CTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAA 55673074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCCCACCTCAGACTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTATGCACCATCATGCCAAGCTAA 960

 55673075 ATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTCAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGT 55673134
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTAAAATTATTTCCCTTTCAATTTAAGGGGGGATGGGGTATGTTTTAGAGACACGGT 1020

 55673135 CTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGG 55673194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTGTTACGTTGCACAGGCTGGTTATGAACTCCTGGGCTCAAGAAATTCTCCCACCTCGG 1080

 55673195 CCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCT 55673254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTCCCAAAGTACTGGAATTATAGGCATGAGTCACCCTGCCTGGCCTTCTTTGTACTTCT 1140

 55673255 AAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGA 55673314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATTTAGTTTTAAAAATTCATATTCTATTTTTGTATTTCAATAAAAGATTTTAAGGGGA 1200

 55673315 CTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTA 55673374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTACTATATGATCTCAGTTTAAAACTTAATTAAACTCTAATATTTTATATTGGATTTA 1260

 55673375 TAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTC 55673434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATATATTTGACTTCCTTTTAAAATACTGTTTTGCAATTGTCTAATATAACAAATATTC 1320

 55673435 CCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTA 55673494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAGTAGATAAGCATTTTTATAAATTGAGTAAATTAAGCTTATAGATATGATAAATTTA 1380

 55673495 AGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAA 55673554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTTCTTACATATTATAATATTAAATATAAATGTCATAATCTTTCAGCTTAAAATTCTAA 1440

 55673555 ATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAAT 55673614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTTTATCAGCTACTAAAATTTCAGTTTTTAATTTGGATTATAGTACTAATACATTAAT 1500

 55673615 ATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAA 55673674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATATGAAATACTGATATATAGTTACAATGTTAGGTCAAAATATAGATTTTTTTAACAA 1560

 55673675 AAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTT 55673734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATTATTAATTCCATGATTCAGATTTTCTTAAACACTTATGTGCCTAATACTAAATCTT 1620

 55673735 GAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTGTTTGT 55673794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1621 GAGGTTAAAAAGATACTTCACAATGAAAGATATTATTATGTTAGCTAAACAATTATTTGT 1680

 55673795 AACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGC 55673854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACCTGGGATGACTGAGATTTTTATATACAACCAGAGCTATAGACCATGGTACTTACTGC 1740

 55673855 AGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGC 55673914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTGCTGTCTGAGATGTCAAAAGAATACCAAGCCCTATTAATTATTTAGAATATAGAGGC 1800

 55673915 GATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTG 55673974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATATCCTACTTCTTAGGGCATGTATACTTCACATCGCCTGGTTCAAATCACTACTATTG 1860

 55673975 CTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTG 55674034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGTGCTGGAGCTGGTCTATTCAGGTTCATAAGAAGTGATTGTTAAAATTTCAGGAATTG 1920

 55674035 TGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAAT 55674094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCAAGCCAATTGTTAAATCTGGCCATTATATAATTATATAAACATACAATTAAATAAAT 1980

 55674095 TGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAA 55674154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTATTAAAAACAAAAAAATAAGTTGGAGATACAGACATGAACAAAACATATGCACATAA 2040

 55674155 ACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGA 55674214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAAAGCAATTCCTGTCCTTTCATTTCAGAGGGGATGGGATATGTTGGTCTCAAATCTGA 2100

 55674215 GCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTG 55674274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCAAGATTTCTGAACCATTACCATCTCTGTTATAGAGTGACTGGTCCATGGTGGCCCTG 2160

 55674275 GACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAA 55674334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GACTGGTTACTATGGGGTATGGTTACTATGAGGTATGTATGGTTCTTCTTGTGTCCTTAA 2220

 55674335 AAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAA 55674394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGGACAAGTGAGAGCTTCTGGAACCCCAGTACACCACACACAAGACACAGGAATAGGAA 2280

 55674395 ACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCA 55674454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACTCTCTTTAGGCTCATGAGGTTGAACACTTTCTACTGCTGCTGGTCCATCATTATTCCA 2340

 55674455 CACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCA 55674514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CACTATTGCAGAAATGGCTGCATCTAGAATTTTCTTAGCTTTTTGTGCCCTTCATATTCA 2400

 55674515 AGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAA 55674574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGAAAAATTATTCAGACACTGTTAAAAATGGTAAGTGAGATTTATTCAAAACTATTGTAA 2460

 55674575 GAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAG 55674634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGGGGTCATGACTTAGCAATAAAGAAGAGAAATTGAGCTCAACTCCAAATACAATAAAG 2520

 55674635 ACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTAC 55674694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACAGGAGTTGGAAGTTACAGCCAACAAGCACAATGAAGGCATCAGTGGATGCAAAACTAC 2580

 55674695 TAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGG 55674754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAAAGGAGAGGGCAGAGGGATTCTTGCTAAAGGCAGGCTAAGGATTTAGACATCAAGGG 2640

 55674755 TGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAG 55674814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGAGAAGTGAAGAACTTGATCAGATATCAAGGGTGAAGGATTCTCACTAAACTGAATTAG 2700

 55674815 CAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCC 55674874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGGATTCTTATTAAAGACAGACCAAAGTAGAGGCTTAGTCAAGAAGGCTCAGAGGAGCC 2760

 55674875 TAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCCA 55674934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2761 TAACTAAAATTTGGTCAAGGAGGAAATCTTTGTCACTCGTGCACCCAAGAAAGACAGCTA 2820

 55674935 TTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACA 55674994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTAGCCCTGGAGTTCTTGAACTCTCCCATTCTCATCAGGATGTTTCTAGAATCTTTAACA 2880

 55674995 ACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTTGCTCTCATTCTGA 55675054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2881 ACCACAATAGAAGAGGATAAATGAGAACCCTGGTGCCTAACCTCTTAGCTCTCATTCTGA 2940

 55675055 CCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAA 55675114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCTCTTTATAACCCCTTATTCTAGAAAATATGGGATTCATTTTCTTCTTTCATGTCATAA 3000

 55675115 CTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTT 55675174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTCTTTTACCATGGGGCAGCAAGCCTCCTTGGAGAGCCGTCAGAATGGATGAGGGATTT 3060

 55675175 TTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGG 55675234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTGTTTCGTTATAGAAGAAACTCTCTTTCTGATATCACTTAATATCTGTGAGTTGTGGG 3120

 55675235 AACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAA 55675294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AACGATTTGGAACTAATAATTTCTGAAGTAAAAAATGCATTACTTTAAAATCACCCAAAA 3180

 55675295 TTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTG 55675354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTATTCTGAATACATATGCATTATGTCTTTAATGCCCACAATAATGATAATATTATTTTG 3240

 55675355 ACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAG 55675414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACTAAGGAAACCACAGCTGGAAGAAGTTAAATATCTATCTGGCTTCTGCTTCAAACATAG 3300

 55675415 TTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGT 55675474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTTTTTCTCTTTAGTATAGTATTTTAGAGAATCATTGACACAGTTTCTATTGACTTCAGT 3360

 55675475 ATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAA 55675534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATATTGACTAAAAGGCCTTAGCATGTTCATCTTGTAGAAATGTATTTGTAGAAATTTGAA 3420

 55675535 GCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGC 55675594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTGAAAGTGGTAGTAGTTTCATTTACGGAAAGGCTAGATGGAATGGGAAGGACTTTTGC 3480

 55675595 TAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATG 55675654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAATACTTCAGTGGCAGGATAACTTTCTGAGATATTAATTTGGGTTTTTTTCCCTCGATG 3540

 55675655 TCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGG 55675714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCATGAGGATTGAAACCAACGTAATTCTGTGTCTTTATGTTAAACAATTCTGAGATTAGG 3600

 55675715 CATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCT 55675774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATACTTTCCTGGCTTAAACAATACTGAAAACAAGTAAAAATAACTTAGCTATTTGCTCT 3660

 55675775 AGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCC 55675834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGGAATCACTGCTTTCAGAAATAATATTGTAAACCGACTAAAACAGCTTACCTACCACCC 3720

 55675835 CAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTC 55675894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAAACAGCTTATTTGTAAGACTAATTTCATGACCCTGGCTTTGCTGTACCAATACATTTC 3780

 55675895 AGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAAT 55675954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGTCTTGAAATATCCATCACAAAATCACACAACTCAGACCCTAAAACACTATGAATAAAT 3840

 55675955 GTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCAT 55676014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTCTTCTCCTGGCTTTCCGCTCCTCATAATAGGTTAAGGTGGAGTTCTCTCTTACAGCAT 3900

 55676015 TAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTA 55676074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAAGTTTAATAAACTTAGTTCTGGTGACCTTTGGGGGCAGTCAACAATCCAAAGCTGTTA 3960

 55676075 ACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGG 55676134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACATACTAGAAAGGGAACAAAGTGTTTATTTTCTGAGTCTGACTCCCTTTACTCTGGGGG 4020

 55676135 TTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACC 55676194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTATAGTTGACCTTTATGTTTATGTAGAATAAAACATGTTTCCAAGGACTGGTAGATACC 4080

 55676195 GTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGA 55676254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GTTCCCCTAGGCTTGCACACATTTTTCTTTAGGAATCTAAGCTCTCAGTGGTGAGGGAGA 4140

 55676255 CAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAG 55676314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CAGGAAATGAATTTGGGGAGAGCAACTGGAGGAATGTGGAAGAAAAGTGGAGTGGGCTAG 4200

 55676315 ACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATA 55676374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACTTAAGCTCATTCTCCTGCAGCATCTAATACTGACACTGACATGAGATGTTGAACAATA 4260

 55676375 GGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGG 55676434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGCCCTAGGGCCTTCAGTCTGAGAAAATATCTTTGTACCTTGGCTGGGAGGGAGCAGAGG 4320

 55676435 CACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTT 55676494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CACCCCATTCCTGGGTAATTTTTCAATAGCTATCATAAGGAAAATGTCCTGCCCTAATTT 4380

 55676495 TGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCC 55676554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGGAAATTCACTCCAGGGTGTGGGGAGGGCTGTCCCAGGGCAAAACAGATTTTATTTCCC 4440

 55676555 ATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAA 55676614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATGAACATGCAAAGAGGAGATTCACAGCTAGATTGAATTTTCTCTCTACTCCTAATGGAA 4500

 55676615 AGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGC 55676674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGTCTTTTCTCTGCCAGGACAGGAGAGTCTGTTTCACTTTACTAGTAAATATTTCCTTGC 4560

 55676675 CTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGA 55676734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTCTGTCTTTCTGTAAGAAACTTGATTCTCCTTAGATGAATCCACTTGGCAAGCATTAGA 4620

 55676735 ACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTA 55676794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ACTTCTCTCGTCCTCAGTTTCCTCCAAGACTCTGTGGATGACGAATTAGGAAATAGCTTA 4680

 55676795 TGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATAT 55676854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGTGGGTGGTTCTGGCTTGGCATCTCTCATGAAGTTTCTTCTTCTGATAAACAGATATAT 4740

 55676855 AAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 55676883
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AAAAGATGTTTTAAGAGAATGCAAGTAGT 4769

EXCISED REGION

 55677789 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 55677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 TACCTCATTTGTAAGAATATAAGTTGTCCAGTGATTCAGAACAATGATGTTCACTGTTCT 4829

 55677849 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 55677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 TAATCTTGTAAACAGTTATGACACATGTATAAAAGATATGTCTAACAGTGTTAGTTGCAT 4889

 55677909 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 55677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 ACATGATTCAACGGTTATTTTGGTGAATGGAAGTGTGCACCACTCTCCATCTAATACATT 4949

 55677969 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 55678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 CTATTGTATAGCACTTATATTTTATTTTTGAAACATTTTCATTGTATATATTTAAAGTGG 5009

 55678029 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 55678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 ACAACATGTTTTGATATACATATACACAGTGAAATGATTACTGCAGTCAAGTCTATTAAC 5069

 55678089 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 55678148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 ATATCTATGATTTCATGTAGTTACCATTTTTTGTGGTTAAGAGCACATACAATCTACTCT 5129

 55678149 CTTCACGAATTTCCAG 55678164
          ||||||||||||||||
     5130 CTTCACGAATTTCCAG 5145

Alignment time is 3.80407 s

