
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5154] =>      5154 nucs 'mol-32-1e66-007602_5154'

Score:        4714
Aligned:      5163        nucs
Identic:      5114 ( 99%) nucs =>      1188 ( 99%)      3926 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667776,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673498]
 second seq =>  [       1,    1198] EXCISED REGION [    1199,    5154]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54667776 TGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAG 54667835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAG 60

 54667836 GTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCA 54667895
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCA 120

 54667896 GCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGT 54667955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGT 180

 54667956 GGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTC 54668015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTC 240

 54668016 TCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTAC 54668075
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTAC 300

 54668076 TAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTT 54668135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTT 360

 54668136 GGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATC 54668195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      361 GGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATC 420

 54668196 TCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCA 54668255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCA 480

 54668256 CACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCT 54668315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCT 540

 54668316 TTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCA 54668375
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.
      541 TTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCC 600

 54668376 CAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGG 54668435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGG 660

 54668436 GTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTA 54668495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTA 720

 54668496 TTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTAT 54668555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTAT 780

 54668556 GCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGG 54668615
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      781 GCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGG 840

 54668616 TGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTC 54668675
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTC 900

 54668676 AACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGA 54668735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      901 AACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGA 960

 54668736 CTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCA 54668795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCA 1020

 54668796 GTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGA 54668855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGA 1080

 54668856 CCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTG 54668915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTG 1140

 54668916 AATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1141 AATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 1198

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 1258

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 1318

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 1378

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 1438

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 1498

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1499 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 1558

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 1618

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 1678

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1679 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 1738

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 1798

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 1858

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1859 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGCGCCCTGGGAGCGCCATCAA 1918

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 1978

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 2038

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 2098

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     2099 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 2158

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2159 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 2218

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 2278

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     2279 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 2336

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 2396

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 2455

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 2515

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 2575

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 2635

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 2695

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 2755

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 2815

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 2875

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 2935

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 2995

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     2996 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 3053

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 3113

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 3173

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 3233

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 3293

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3294 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 3353

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3354 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 3413

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 3473

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3474 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 3533

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3534 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 3593

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 3653

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     3654 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 3713

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3714 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 3773

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 3833

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 3893

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 3953

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 4013

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 4073

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 4133

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 4193

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 4253

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4254 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 4313

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4314 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 4373

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 4433

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 4493

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4494 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 4553

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4554 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 4613

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4614 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 4673

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 4733

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     4734 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 4793

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 4853

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 4913

 54673257 TGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 54673313
          ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 TGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 4969

 54673314 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 54673373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 5029

 54673374 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 54673433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 5089

 54673434 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 54673493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 5149

 54673494 AGAAG 54673498
          |||||
     5150 AGAAG 5154

Alignment time is 3.84111 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3949] =>      3949 nucs 'mol-32-2081-062614_3949'

Score:        3948
Aligned:      3948        nucs
Identic:      3948 (100%) nucs =>      2195 (100%)      1753 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54668304,54670498] EXCISED REGION [54670499,54672251]
 second seq =>  [       1,    2195] EXCISED REGION [    2197,    3949]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2196,2196]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [2196,2201] to [2197,2202]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54668304 GTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCC 54668363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCC 60

 54668364 CCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAA 54668423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAA 120

 54668424 GGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAA 54668483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAA 180

 54668484 AGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAG 54668543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAG 240

 54668544 CTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCAC 54668603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCAC 300

 54668604 ATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAG 54668663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAG 360

 54668664 GACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGA 54668723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGA 420

 54668724 CTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTA 54668783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTA 480

 54668784 GACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTG 54668843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTG 540

 54668844 GCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAA 54668903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAA 600

 54668904 ATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCG 54668963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCG 660

 54668964 CCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGG 54669023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGG 720

 54669024 CTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGG 54669083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGG 780

 54669084 GCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGA 54669143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGA 840

 54669144 TTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCC 54669203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCC 900

 54669204 TCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGG 54669263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGG 960

 54669264 TCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATG 54669323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATG 1020

 54669324 CAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAG 54669383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAG 1080

 54669384 CAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCT 54669443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCT 1140

 54669444 TAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCAT 54669503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCAT 1200

 54669504 GGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCC 54669563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCC 1260

 54669564 TAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAA 54669623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAA 1320

 54669624 GAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACC 54669683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACC 1380

 54669684 CTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAG 54669743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAG 1440

 54669744 CAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCAT 54669803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCAT 1500

 54669804 TGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTC 54669863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTC 1560

 54669864 TCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCT 54669923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCT 1620

 54669924 GGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCAC 54669983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCAC 1680

 54669984 AGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAAT 54670043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAAT 1740

 54670044 ATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCT 54670103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCT 1800

 54670104 GCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACA 54670163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACA 1860

 54670164 GCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAG 54670223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAG 1920

 54670224 ATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTG 54670283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTG 1980

 54670284 GCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGG 54670343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGG 2040

 54670344 TGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGC 54670403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGC 2100

 54670404 CCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATC 54670463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATC 2160

 54670464 AGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA 2195

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 2256

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 2316

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 2376

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 2436

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 2496

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 2556

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 2616

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 2676

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 2736

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 2796

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 2856

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 2916

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 2976

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 3036

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 3096

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 3156

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 3216

 54671519 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 54671578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 3276

 54671579 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 54671638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 3336

 54671639 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 54671698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 3396

 54671699 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 54671758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 3456

 54671759 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 54671818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 3516

 54671819 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 54671878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 3576

 54671879 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 54671938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 3636

 54671939 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 54671998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 3696

 54671999 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 54672058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 3756

 54672059 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 54672118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 3816

 54672119 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 54672178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 3876

 54672179 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 54672238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 3936

 54672239 CAGAACAGAAACG 54672251
          |||||||||||||
     3937 CAGAACAGAAACG 3949

Alignment time is 3.01767 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7142] =>      7142 nucs 'mol-32-2105-093502_7142'

Score:        7130
Aligned:      7141        nucs
Identic:      7140 (100%) nucs =>       102 (100%)      7038 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54661888,54661989] EXCISED REGION [54661991,54669029]
 second seq =>  [       1,     102] EXCISED REGION [     104,    7142]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54661990,54661990]
 second seq =>         1 nucs [103,103]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54661989,54661989] to [54661991,54661991]
 second seq =>         1 nucs [102,102] to [104,104]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54661888 CAGAAAGATGTAAATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACA 54661947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGAAAGATGTAAATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACA 60

 54661948 CAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTG 54661989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTG 102

EXCISED REGION

 54661991 GGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGA 54662050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      104 GGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGA 163

 54662051 GACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAA 54662110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      164 GACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAA 223

 54662111 ACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTT 54662170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      224 ACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTT 283

 54662171 TTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGC 54662230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      284 TTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGC 343

 54662231 CAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGG 54662290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      344 CAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGG 403

 54662291 CTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGA 54662350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      404 CTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGA 463

 54662351 GCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAA 54662410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      464 GCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAA 523

 54662411 GTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGT 54662470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      524 GTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGT 583

 54662471 CATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCA 54662530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 CATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCA 643

 54662531 AGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTT 54662590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 AGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTT 703

 54662591 CCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAA 54662650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 CCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAA 763

 54662651 CACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACA 54662710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 CACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACA 823

 54662711 AAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCAT 54662770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 AAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCAT 883

 54662771 AAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTC 54662830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 AAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTC 943

 54662831 GAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAA 54662890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 GAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAA 1003

 54662891 TCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAA 54662950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 TCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAA 1063

 54662951 GAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTC 54663010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 GAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTC 1123

 54663011 AGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAA 54663070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 AGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAA 1183

 54663071 AAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGG 54663130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 AAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGG 1243

 54663131 AGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATC 54663190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 AGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATC 1303

 54663191 TGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTT 54663250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 TGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTT 1363

 54663251 TGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGC 54663310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 TGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGC 1423

 54663311 TCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTAC 54663370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 TCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTAC 1483

 54663371 AGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCT 54663430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 AGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCT 1543

 54663431 CTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAG 54663490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 CTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAG 1603

 54663491 ATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTA 54663550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 ATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTA 1663

 54663551 TTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGG 54663610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGG 1723

 54663611 AAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAA 54663670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 AAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAA 1783

 54663671 TAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATAT 54663730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 TAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATAT 1843

 54663731 TTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTG 54663790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 TTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTG 1903

 54663791 TACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATA 54663850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATA 1963

 54663851 TAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGT 54663910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGT 2023

 54663911 TTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGT 54663970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 TTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGT 2083

 54663971 AATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAG 54664030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 AATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAG 2143

 54664031 TTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTT 54664090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTT 2203

 54664091 CCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAA 54664150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 CCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAA 2263

 54664151 GACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAA 54664210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 GACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAA 2323

 54664211 ACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAA 54664270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 ACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAA 2383

 54664271 GCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCT 54664330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 GCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCT 2443

 54664331 CTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGC 54664390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 CTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGC 2503

 54664391 TCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCC 54664450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 TCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCC 2563

 54664451 AGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAA 54664510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 AGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAA 2623

 54664511 GAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACA 54664570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 GAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACA 2683

 54664571 GGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTG 54664630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 GGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTG 2743

 54664631 AATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGG 54664690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 AATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGG 2803

 54664691 ATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGT 54664750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 ATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGT 2863

 54664751 TAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATAT 54664810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATAT 2923

 54664811 TGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATT 54664870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 TGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATT 2983

 54664871 ATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTT 54664930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 ATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTT 3043

 54664931 CCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCAT 54664990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 CCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCAT 3103

 54664991 CCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAA 54665050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 CCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAA 3163

 54665051 CACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAAT 54665110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 CACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAAT 3223

 54665111 GTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACA 54665170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 GTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACA 3283

 54665171 ATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCAC 54665230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 ATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCAC 3343

 54665231 TAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTC 54665290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 TAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTC 3403

 54665291 TGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATT 54665350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATT 3463

 54665351 CTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGT 54665410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 CTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGT 3523

 54665411 GATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAA 54665470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 GATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAA 3583

 54665471 ATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAA 54665530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 ATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAA 3643

 54665531 AATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCA 54665590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 AATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCA 3703

 54665591 GTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATC 54665650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 GTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATC 3763

 54665651 ATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCT 54665710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 ATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCT 3823

 54665711 GGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAAC 54665770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 GGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAAC 3883

 54665771 TAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCAC 54665830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3884 TAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACGACACCAC 3943

 54665831 CAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAG 54665890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 CAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAG 4003

 54665891 TGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAG 54665950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 TGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAG 4063

 54665951 TTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGA 54666010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 TTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGA 4123

 54666011 CCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAA 54666070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 CCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAA 4183

 54666071 TACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATT 54666130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 TACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATT 4243

 54666131 TTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAG 54666190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 TTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAG 4303

 54666191 CAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTG 54666250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 CAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTG 4363

 54666251 GAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTT 54666310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 GAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTT 4423

 54666311 TCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTC 54666370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 TCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTC 4483

 54666371 CTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCA 54666430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 CTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCA 4543

 54666431 GAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAA 54666490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 GAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAA 4603

 54666491 GGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTC 54666550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 GGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTC 4663

 54666551 GGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCT 54666610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 GGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCT 4723

 54666611 TCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCC 54666670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 TCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCC 4783

 54666671 ACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAAC 54666730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 ACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAAC 4843

 54666731 ATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGA 54666790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 ATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGA 4903

 54666791 AACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGG 54666850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 AACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGG 4963

 54666851 ACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAAT 54666910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 ACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAAT 5023

 54666911 AAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTAT 54666970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 AAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTAT 5083

 54666971 AGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAG 54667030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 AGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAG 5143

 54667031 TGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGT 54667090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 TGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGT 5203

 54667091 TTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCA 54667150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 TTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCA 5263

 54667151 GGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCA 54667210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 GGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCA 5323

 54667211 ACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAAT 54667270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 ACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAAT 5383

 54667271 TAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCC 54667330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 TAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCC 5443

 54667331 TGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAG 54667390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 TGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAG 5503

 54667391 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 54667450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 5563

 54667451 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 54667510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 5623

 54667511 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 54667570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 5683

 54667571 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 54667630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 5743

 54667631 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 54667690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 5803

 54667691 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 54667750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 5863

 54667751 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 54667810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 5923

 54667811 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 54667870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 5983

 54667871 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 54667930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 6043

 54667931 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 54667990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 6103

 54667991 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 54668050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 6163

 54668051 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 54668110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 6223

 54668111 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 54668170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 6283

 54668171 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 54668230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 6343

 54668231 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 54668290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 6403

 54668291 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 54668350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 6463

 54668351 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 54668410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 6523

 54668411 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 54668470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 6583

 54668471 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 54668530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 6643

 54668531 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTG 54668590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTG 6703

 54668591 GCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACA 54668650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 GCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACA 6763

 54668651 ATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGG 54668710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 ATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGG 6823

 54668711 TAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCT 54668770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 TAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCT 6883

 54668771 GGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCT 54668830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 GGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCT 6943

 54668831 TCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGA 54668890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 TCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGA 7003

 54668891 ATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATC 54668950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 ATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATC 7063

 54668951 CTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACC 54669010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7064 CTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACC 7123

 54669011 AGCAGTCATGTGGCTGACC 54669029
          |||||||||||||||||||
     7124 AGCAGTCATGTGGCTGACC 7142

Alignment time is 5.3678 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2876] =>      2876 nucs 'mol-32-211b-049136_2876'

Score:        2876
Aligned:      2876        nucs
Identic:      2876 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54666965,54669840]
 second seq =>  [       1,    2876]

 54666965 CCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTA 54667024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTA 60

 54667025 GAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGA 54667084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGA 120

 54667085 AGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAG 54667144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAG 180

 54667145 ATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAA 54667204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAA 240

 54667205 ATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATA 54667264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATA 300

 54667265 TCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTT 54667324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTT 360

 54667325 ATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAA 54667384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAA 420

 54667385 CTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAG 54667444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAG 480

 54667445 AGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACAT 54667504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACAT 540

 54667505 CTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACC 54667564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACC 600

 54667565 TTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACA 54667624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACA 660

 54667625 CACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGAC 54667684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGAC 720

 54667685 AAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGC 54667744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGC 780

 54667745 CAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGA 54667804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGA 840

 54667805 CCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCAC 54667864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCAC 900

 54667865 TTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTA 54667924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTA 960

 54667925 GGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTG 54667984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTG 1020

 54667985 CAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAAC 54668044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAAC 1080

 54668045 TTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGG 54668104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGG 1140

 54668105 CTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTA 54668164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTA 1200

 54668165 GGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTT 54668224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTT 1260

 54668225 TTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGA 54668284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGA 1320

 54668285 GTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTA 54668344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTA 1380

 54668345 GGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTAT 54668404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTAT 1440

 54668405 ACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGC 54668464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGC 1500

 54668465 TCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCT 54668524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCT 1560

 54668525 GATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGT 54668584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGT 1620

 54668585 CCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTT 54668644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTT 1680

 54668645 CCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAA 54668704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAA 1740

 54668705 ACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTC 54668764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTC 1800

 54668765 TTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGA 54668824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGA 1860

 54668825 AATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTG 54668884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTG 1920

 54668885 TAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTAT 54668944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTAT 1980

 54668945 CACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCC 54669004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCC 2040

 54669005 CTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAG 54669064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAG 2100

 54669065 TGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGAC 54669124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGAC 2160

 54669125 TCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAG 54669184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAG 2220

 54669185 AAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGT 54669244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGT 2280

 54669245 CTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGG 54669304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGG 2340

 54669305 TGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCT 54669364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCT 2400

 54669365 GAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTA 54669424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTA 2460

 54669425 CAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCA 54669484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCA 2520

 54669485 GACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACA 54669544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACA 2580

 54669545 AATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAA 54669604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAA 2640

 54669605 GCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTT 54669664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTT 2700

 54669665 TTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCT 54669724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCT 2760

 54669725 CTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTC 54669784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTC 2820

 54669785 ACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGC 54669840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGC 2876

Alignment time is 1.94524 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3805] =>      3805 nucs 'mol-32-21ec-023483_3805'

Score:        3640
Aligned:      3805        nucs
Identic:      3790 (100%) nucs =>      3494 (100%)       296 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54665466,54668973] EXCISED REGION [54669540,54669835]
 second seq =>  [       1,    3509] EXCISED REGION [    3510,    3805]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54665466 GACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAA 54665525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAA 60

 54665526 ACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGA 54665585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGA 120

 54665586 AGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTG 54665645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTG 180

 54665646 GAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTG 54665705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTG 240

 54665706 TTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACA 54665765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACA 300

 54665766 GAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAAC 54665825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAAC 360

 54665826 ACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAA 54665885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAA 420

 54665886 GCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCT 54665945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCT 480

 54665946 CT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTA 54666004
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTA 540

 54666005 CCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAG 54666064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAG 600

 54666065 GAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCT 54666124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCT 660

 54666125 CCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTT 54666184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTT 720

 54666185 TTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCA 54666244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCA 780

 54666245 GTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTT 54666304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTT 840

 54666305 CACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGG 54666364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGG 900

 54666365 GGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAA 54666424
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAA 960

 54666425 GGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGC 54666484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGC 1020

 54666485 TGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAG 54666544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAG 1080

 54666545 GATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATG 54666604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATG 1140

 54666605 GAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATT 54666664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATT 1200

 54666665 CTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAG 54666724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAG 1260

 54666725 TGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCT 54666784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCT 1320

 54666785 CCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGA 54666844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGA 1380

 54666845 AGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAA 54666904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAA 1440

 54666905 GAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGT 54666964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGT 1500

 54666965 CCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTA 54667024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTA 1560

 54667025 GAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGA 54667084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGA 1620

 54667085 AGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAG 54667144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAG 1680

 54667145 ATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAA 54667204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAA 1740

 54667205 ATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATA 54667264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATA 1800

 54667265 TCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTT 54667324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTT 1860

 54667325 ATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAA 54667384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1861 ATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGA 1920

 54667385 CTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAG 54667444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAG 1980

 54667445 AGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACAT 54667504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACAT 2040

 54667505 CTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACC 54667564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACC 2100

 54667565 TTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACA 54667624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACA 2160

 54667625 CACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGAC 54667684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGAC 2220

 54667685 AAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGC 54667744
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2221 AAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGT 2280

 54667745 CAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGA 54667804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGA 2340

 54667805 CCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCAC 54667864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCAC 2400

 54667865 TTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTA 54667924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTA 2460

 54667925 GGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTG 54667984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTG 2520

 54667985 CAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAAC 54668044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2521 CAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAAC 2580

 54668045 TTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGG 54668104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGG 2640

 54668105 CTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTA 54668164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTA 2700

 54668165 GGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTT 54668224
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTT 2760

 54668225 TTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGA 54668284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGA 2820

 54668285 GTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTA 54668344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2821 GTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCA 2880

 54668345 GGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTAT 54668404
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTAT 2940

 54668405 ACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGC 54668464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGC 3000

 54668465 TCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCT 54668524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCT 3060

 54668525 GATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGT 54668584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3061 GATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGT 3120

 54668585 CCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTT 54668644
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||
     3121 CCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTT 3180

 54668645 CCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAA 54668704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAA 3240

 54668705 ACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTC 54668764
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTC 3300

 54668765 TTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGA 54668824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGA 3360

 54668825 AATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTG 54668884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTG 3420

 54668885 TAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTAT 54668944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTAT 3480

 54668945 CACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||.|||||||||||||||||||||
     3481 CACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 3509

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 3569

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 3629

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 3689

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 3749

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGC 54669835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGC 3805

Alignment time is 2.86442 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3902] =>      3902 nucs 'mol-32-22b2-041040_3902'

Score:        3901
Aligned:      3901        nucs
Identic:      3901 (100%) nucs =>      1736 (100%)      2165 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54665700,54667435] EXCISED REGION [54667437,54669601]
 second seq =>  [       1,    1736] EXCISED REGION [    1738,    3902]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54667436,54667436]
 second seq =>         1 nucs [1737,1737]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54667435,54667435] to [54667436,54667436]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54665700 TTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTG 54665759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTG 60

 54665760 GAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAG 54665819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAG 120

 54665820 AACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAG 54665879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAG 180

 54665880 AACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTA 54665939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTA 240

 54665940 GAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAAT 54665999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAAT 300

 54666000 TTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAA 54666059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAA 360

 54666060 AAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTT 54666119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTT 420

 54666120 TTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACA 54666179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACA 480

 54666180 ATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCC 54666239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCC 540

 54666240 TTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTG 54666299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTG 600

 54666300 GTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTA 54666359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTA 660

 54666360 AAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGG 54666419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGG 720

 54666420 GAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGA 54666479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGA 780

 54666480 GTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTT 54666539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTT 840

 54666540 CTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGG 54666599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGG 900

 54666600 GAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCT 54666659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCT 960

 54666660 ACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAA 54666719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAA 1020

 54666720 TTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAA 54666779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAA 1080

 54666780 TAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCAT 54666839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCAT 1140

 54666840 AGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAG 54666899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAG 1200

 54666900 TGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAA 54666959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAA 1260

 54666960 TTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAG 54667019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAG 1320

 54667020 CTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATG 54667079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATG 1380

 54667080 TCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTG 54667139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTG 1440

 54667140 GATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAAC 54667199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAAC 1500

 54667200 CCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGT 54667259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGT 1560

 54667260 GAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATC 54667319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATC 1620

 54667320 TCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCA 54667379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCA 1680

 54667380 CAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTC 54667435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTC 1736

EXCISED REGION

 54667437 TGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAAC 54667496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAAC 1797

 54667497 TCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGC 54667556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGC 1857

 54667557 ATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCC 54667616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCC 1917

 54667617 TCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACA 54667676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACA 1977

 54667677 GCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTAC 54667736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTAC 2037

 54667737 TATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGT 54667796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGT 2097

 54667797 GCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCT 54667856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCT 2157

 54667857 GCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATC 54667916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATC 2217

 54667917 ATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGC 54667976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 ATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGC 2277

 54667977 AAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATC 54668036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATC 2337

 54668037 TGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAG 54668096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAG 2397

 54668097 AGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCAC 54668156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCAC 2457

 54668157 AAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCAC 54668216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 AAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCAC 2517

 54668217 CAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAG 54668276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAG 2577

 54668277 AGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATG 54668336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 AGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATG 2637

 54668337 TGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTA 54668396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTA 2697

 54668397 ATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACC 54668456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 ATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACC 2757

 54668457 CCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGA 54668516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGA 2817

 54668517 CTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGT 54668576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGT 2877

 54668577 TGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACT 54668636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACT 2937

 54668637 GTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGT 54668696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 GTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGT 2997

 54668697 CCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTC 54668756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 CCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTC 3057

 54668757 CTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAG 54668816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAG 3117

 54668817 CCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATAC 54668876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATAC 3177

 54668877 CATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAG 54668936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 CATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAG 3237

 54668937 TAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCC 54668996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCC 3297

 54668997 TGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAA 54669056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAA 3357

 54669057 CCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTA 54669116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 CCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTA 3417

 54669117 TCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACC 54669176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACC 3477

 54669177 GTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTG 54669236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTG 3537

 54669237 TGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCG 54669296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCG 3597

 54669297 TTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCC 54669356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCC 3657

 54669357 CAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTA 54669416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTA 3717

 54669417 CCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACC 54669476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 CCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACC 3777

 54669477 TATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAG 54669536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAG 3837

 54669537 TCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTT 54669596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 TCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTT 3897

 54669597 ATGCC 54669601
          |||||
     3898 ATGCC 3902

Alignment time is 2.90227 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8136] =>      8136 nucs 'mol-32-23c5-040870_8136'

Score:        7770
Aligned:      8141        nucs
Identic:      8104 (100%) nucs =>      5855 (100%)      2249 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663100,54668973] EXCISED REGION [54669540,54671802]
 second seq =>  [       1,    5875] EXCISED REGION [    5876,    8136]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54663100 TCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAA 54663159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAA 60

 54663160 TACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCA 54663219
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCA 120

 54663220 GGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATT 54663279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATT 180

 54663280 TTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAA 54663339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAA 240

 54663340 TGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACAC 54663399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACAC 300

 54663400 AGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTG 54663459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTG 360

 54663460 AGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTA 54663519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTA 420

 54663520 AGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGA 54663579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGA 480

 54663580 AAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGA 54663639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGA 540

 54663640 AAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATAT 54663699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATAT 600

 54663700 TTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTA 54663759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTA 660

 54663760 TATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAG 54663819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAG 720

 54663820 TAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAG 54663879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAG 780

 54663880 ATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAA 54663939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAA 840

 54663940 CCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAA 54663999
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAATTTCTTTTTTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAA 900

 54664000 GCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGA 54664059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGA 960

 54664060 CTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAG 54664119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAG 1020

 54664120 TAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTG 54664179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTG 1080

 54664180 GGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGG 54664239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGG 1140

 54664240 GCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGC 54664299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGC 1200

 54664300 CATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCC 54664359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCC 1260

 54664360 TTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCC 54664419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCC 1320

 54664420 TAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCAC 54664479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCAC 1380

 54664480 TTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGA 54664539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGA 1440

 54664540 TGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAG 54664599
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAG 1500

 54664600 TGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTC 54664659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTC 1560

 54664660 AGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAA 54664719
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAA 1620

 54664720 TGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCT 54664779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCT 1680

 54664780 AACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTC 54664839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTC 1740

 54664840 ATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGG 54664899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGG 1800

 54664900 TCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAA 54664959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAA 1860

 54664960 CATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACAT 54665019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACAT 1920

 54665020 CTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATG 54665079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATG 1980

 54665080 TTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAG 54665139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1981 TTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAG 2040

 54665140 GGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCT 54665199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCT 2100

 54665200 TTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCT 54665259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCT 2160

 54665260 TTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAG 54665319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAG 2220

 54665320 AAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGA 54665379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGA 2280

 54665380 GGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGT 54665439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGT 2340

 54665440 GGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGG 54665499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGG 2400

 54665500 TAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATC 54665559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATC 2460

 54665560 AGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAG 54665619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAG 2520

 54665620 CTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGA 54665679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGA 2580

 54665680 ATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCC 54665739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCC 2640

 54665740 ATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAG 54665799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAG 2700

 54665800 CCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGAC 54665859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGAC 2760

 54665860 AAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAG 54665919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAG 2820

 54665920 CAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAA 54665978
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAA 2880

 54665979 GAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAA 54666038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAA 2940

 54666039 CGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATA 54666098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATA 3000

 54666099 CCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAA 54666158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAA 3060

 54666159 CAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCT 54666218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCT 3120

 54666219 TCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTT 54666278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTT 3180

 54666279 ACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGG 54666338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGG 3240

 54666339 CTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCG 54666398
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3241 CTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCA 3300

 54666399 ATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGC 54666458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGC 3360

 54666459 TCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCT 54666518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCT 3420

 54666519 CTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGG 54666578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGG 3480

 54666579 CTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGT 54666638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGT 3540

 54666639 ACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAA 54666698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAA 3600

 54666699 ACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGA 54666758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGA 3660

 54666759 TACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGA 54666818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGA 3720

 54666819 TTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGA 54666878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGA 3780

 54666879 TCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAG 54666938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAG 3840

 54666939 AAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGG 54666998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGG 3900

 54666999 CATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCC 54667058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCC 3960

 54667059 TCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAA 54667118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAA 4020

 54667119 GGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTA 54667178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTA 4080

 54667179 CAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCC 54667238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCC 4140

 54667239 TAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCT 54667298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCT 4200

 54667299 CTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAG 54667358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAG 4260

 54667359 ACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGC 54667418
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4261 ACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCAC 4320

 54667419 ACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGAC 54667478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGAC 4380

 54667479 AGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAG 54667538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAG 4440

 54667539 GAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACA 54667598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACA 4500

 54667599 AGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTA 54667658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTA 4560

 54667659 AAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATAT 54667718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATAT 4620

 54667719 CTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGA 54667778
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGA 4680

 54667779 GAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTC 54667838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4681 GAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGAC 4740

 54667839 ATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCT 54667898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCT 4800

 54667899 CTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGT 54667958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGT 4860

 54667959 TTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCT 54668018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCT 4920

 54668019 GGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAG 54668078
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAG 4980

 54668079 TCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGG 54668138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGG 5040

 54668139 GGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCT 54668198
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5041 GGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCT 5100

 54668199 GGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACAC 54668258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACAC 5160

 54668259 AAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTG 54668318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTG 5220

 54668319 GAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAA 54668378
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5221 GAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAA 5280

 54668379 AGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTG 54668438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTG 5340

 54668439 CTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTA 54668498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTA 5400

 54668499 AACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCC 54668558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCC 5460

 54668559 CCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGA 54668618
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5461 CTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGA 5520

 54668619 TAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAAC 54668678
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAAC 5580

 54668679 CTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTC 54668738
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5581 CTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTC 5640

 54668739 AACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTA 54668798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTA 5700

 54668799 GAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCG 54668858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCG 5760

 54668859 TCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAAT 54668918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAAT 5820

 54668919 GTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5821 GTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 5875

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 5935

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 5995

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 6055

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 6115

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 6175

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6176 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 6235

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 6295

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 6355

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6356 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 6415

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6416 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 6475

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6476 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 6535

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6536 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 6595

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6596 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 6655

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6656 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 6715

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6716 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 6775

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     6776 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 6835

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6836 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 6895

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6896 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 6955

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     6956 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 7013

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 7073

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 7132

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 7192

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 7252

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 7312

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 7372

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 7432

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 7492

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 7552

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 7612

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 7672

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     7673 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 7730

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 7790

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 7850

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 7910

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 7970

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     7971 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 8030

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     8031 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 8090

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGT 54671802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGT 8136

Alignment time is 6.05227 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2261] =>      2261 nucs 'mol-32-23c5-040870_2261'

Score:        2128
Aligned:      2262        nucs
Identic:      2249 ( 99%) nucs =>      1830 (100%)       419 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54671377] EXCISED REGION [54671380,54671802]
 second seq =>  [       1,    1836] EXCISED REGION [    1839,    2261]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [54671378,54671379]
 second seq =>         2 nucs [1837,1838]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54671377,54671377] to [54671379,54671379]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54671376,54671377] to [54671380,54671381]
 second seq =>         2 nucs [1835,1836] to [1839,1840]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1837,1837] to [1838,1838]

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 54671377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 1836

EXCISED REGION

 54671380 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 54671439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1839 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 1898

 54671440 TTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 54671499
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TTTCAATTATCTCAATGTTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 1958

 54671500 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 54671559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 2018

 54671560 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 54671619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 2078

 54671620 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGA 54671679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2079 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGA 2138

 54671680 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 54671739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 2198

 54671740 GAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 54671799
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 GAAAAGTTAAAAATCACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 2258

 54671800 TGT 54671802
          |||
     2259 TGT 2261

Alignment time is 1.71441 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4926] =>      4926 nucs 'mol-32-2848-006890_4926'

Score:        4925
Aligned:      4925        nucs
Identic:      4925 (100%) nucs =>      3446 (100%)      1479 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667053,54670498] EXCISED REGION [54670499,54671977]
 second seq =>  [       1,    3446] EXCISED REGION [    3448,    4926]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3447,3447]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [3447,3452] to [3448,3453]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54667053 TGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGG 54667112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGG 60

 54667113 ATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTAC 54667172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTAC 120

 54667173 AATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACT 54667232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACT 180

 54667233 GTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAA 54667292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAA 240

 54667293 GAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGA 54667352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGA 300

 54667353 TGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGG 54667412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGG 360

 54667413 CCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCA 54667472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCA 420

 54667473 GAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCAT 54667532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCAT 480

 54667533 GAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTAC 54667592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTAC 540

 54667593 GCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCA 54667652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCA 600

 54667653 TAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAA 54667712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAA 660

 54667713 GGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGA 54667772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGA 720

 54667773 ATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAG 54667832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAG 780

 54667833 CAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCAT 54667892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCAT 840

 54667893 CCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAAC 54667952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAAC 900

 54667953 AGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGA 54668012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGA 960

 54668013 TTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGC 54668072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGC 1020

 54668073 TACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCA 54668132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCA 1080

 54668133 CTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGA 54668192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGA 1140

 54668193 ATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTG 54668252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTG 1200

 54668253 GCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGT 54668312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGT 1260

 54668313 TCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATG 54668372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATG 1320

 54668373 TCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCC 54668432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCC 1380

 54668433 AGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCT 54668492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCT 1440

 54668493 TTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATC 54668552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATC 1500

 54668553 TATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTG 54668612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTG 1560

 54668613 AGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGG 54668672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGG 1620

 54668673 TTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAAT 54668732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAAT 1680

 54668733 AGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAAT 54668792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAAT 1740

 54668793 CCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCA 54668852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCA 1800

 54668853 AGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCA 54668912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCA 1860

 54668913 CTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGC 54668972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGC 1920

 54668973 CTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCT 54669032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCT 1980

 54669033 ACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGC 54669092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGC 2040

 54669093 CTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACT 54669152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACT 2100

 54669153 TCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCT 54669212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCT 2160

 54669213 GCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCG 54669272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCG 2220

 54669273 TACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGT 54669332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGT 2280

 54669333 GTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGA 54669392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGA 2340

 54669393 GACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGG 54669452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGG 2400

 54669453 GCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGA 54669512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGA 2460

 54669513 AGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTC 54669572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTC 2520

 54669573 AGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAG 54669632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAG 2580

 54669633 TCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATC 54669692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATC 2640

 54669693 ACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGA 54669752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGA 2700

 54669753 CCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGA 54669812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGA 2760

 54669813 TAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAA 54669872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAA 2820

 54669873 AGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGA 54669932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGA 2880

 54669933 CGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTC 54669992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTC 2940

 54669993 CCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGC 54670052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGC 3000

 54670053 TTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATT 54670112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATT 3060

 54670113 TTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAG 54670172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAG 3120

 54670173 GCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGA 54670232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGA 3180

 54670233 TGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGT 54670292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGT 3240

 54670293 TTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTG 54670352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTG 3300

 54670353 AGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACAC 54670412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACAC 3360

 54670413 AGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGG 54670472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGG 3420

 54670473 GTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA 54670498
          ||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA 3446

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 3507

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 3567

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 3627

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 3687

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 3747

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 3807

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 3867

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 3927

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 3987

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 4047

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 4107

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 4167

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 4227

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 4287

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 4347

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 4407

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 4467

 54671519 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 54671578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 4527

 54671579 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 54671638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 4587

 54671639 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 54671698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 4647

 54671699 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 54671758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 4707

 54671759 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 54671818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 4767

 54671819 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 54671878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 4827

 54671879 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 54671938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 4887

 54671939 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTC 54671977
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTC 4926

Alignment time is 3.88386 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4901] =>      4901 nucs 'mol-32-285e-004736_4901'

Score:        4900
Aligned:      4900        nucs
Identic:      4900 (100%) nucs =>       738 (100%)      4162 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54664383,54665120] EXCISED REGION [54665122,54669283]
 second seq =>  [       1,     738] EXCISED REGION [     740,    4901]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54665121,54665121]
 second seq =>         1 nucs [739,739]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54665121,54665122] to [54665122,54665123]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54664383 ACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAG 54664442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAG 60

 54664443 TGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATT 54664502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATT 120

 54664503 GTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCA 54664562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCA 180

 54664563 TGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTC 54664622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTC 240

 54664623 ACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTA 54664682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTA 300

 54664683 AAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGA 54664742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGA 360

 54664743 AAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGA 54664802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGA 420

 54664803 AATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTT 54664862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTT 480

 54664863 AATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCT 54664922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCT 540

 54664923 TTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGA 54664982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGA 600

 54664983 GTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCA 54665042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCA 660

 54665043 AAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAA 54665102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAA 720

 54665103 ACAACAATGTATTATTCA 54665120
          ||||||||||||||||||
      721 ACAACAATGTATTATTCA 738

EXCISED REGION

 54665122 TTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTT 54665181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 TTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTT 799

 54665182 TTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCC 54665241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCC 859

 54665242 AAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGC 54665301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 AAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGC 919

 54665302 TACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGT 54665361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 TACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGT 979

 54665362 AAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAA 54665421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 AAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAA 1039

 54665422 TGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAG 54665481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 TGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAG 1099

 54665482 GTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAAT 54665541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 GTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAAT 1159

 54665542 CAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGAC 54665601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 CAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGAC 1219

 54665602 AAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAA 54665661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 AAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAA 1279

 54665662 GGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAG 54665721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 GGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAG 1339

 54665722 TAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATG 54665781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATG 1399

 54665782 GCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAA 54665841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 GCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAA 1459

 54665842 GGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAG 54665901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 GGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAG 1519

 54665902 ATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAA 54665961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 ATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAA 1579

 54665962 TTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAAT 54666021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAAT 1639

 54666022 GGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACAC 54666081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 GGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACAC 1699

 54666082 ACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGT 54666141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 ACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGT 1759

 54666142 CTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGT 54666201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 CTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGT 1819

 54666202 GTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCT 54666261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCT 1879

 54666262 TCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTG 54666321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTG 1939

 54666322 TTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATC 54666381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATC 1999

 54666382 TTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAG 54666441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 TTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAG 2059

 54666442 GGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACC 54666501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 GGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACC 2119

 54666502 ACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCC 54666561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 ACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCC 2179

 54666562 CTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTAC 54666621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 CTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTAC 2239

 54666622 TAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTA 54666681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 TAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTA 2299

 54666682 AATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCT 54666741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 AATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCT 2359

 54666742 GCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTC 54666801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTC 2419

 54666802 AACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAAC 54666861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 AACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAAC 2479

 54666862 CAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGT 54666921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 CAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGT 2539

 54666922 AGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATAT 54666981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 AGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATAT 2599

 54666982 GGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAAC 54667041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 GGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAAC 2659

 54667042 TGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTC 54667101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 TGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTC 2719

 54667102 ATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTT 54667161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 ATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTT 2779

 54667162 AAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAA 54667221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 AAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAA 2839

 54667222 GTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGT 54667281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 GTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGT 2899

 54667282 GTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGG 54667341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 GTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGG 2959

 54667342 GGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTA 54667401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 GGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTA 3019

 54667402 GCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGA 54667461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 GCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGA 3079

 54667462 CAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTT 54667521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 CAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTT 3139

 54667522 AACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACC 54667581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 AACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACC 3199

 54667582 TAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGC 54667641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 TAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGC 3259

 54667642 CTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCT 54667701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 CTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCT 3319

 54667702 TCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGG 54667761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 TCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGG 3379

 54667762 GCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCA 54667821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 GCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCA 3439

 54667822 TGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTA 54667881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTA 3499

 54667882 ATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGC 54667941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 ATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGC 3559

 54667942 TGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGT 54668001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 TGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGT 3619

 54668002 TCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAA 54668061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 TCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAA 3679

 54668062 AGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCA 54668121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 AGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCA 3739

 54668122 CATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCA 54668181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 CATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCA 3799

 54668182 ATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGAT 54668241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 ATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGAT 3859

 54668242 GATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGG 54668301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 GATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGG 3919

 54668302 AAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATC 54668361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 AAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATC 3979

 54668362 CCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAAC 54668421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 CCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAAC 4039

 54668422 AAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGT 54668481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 AAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGT 4099

 54668482 AAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCT 54668541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 AAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCT 4159

 54668542 AGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGC 54668601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 AGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGC 4219

 54668602 ACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGA 54668661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 ACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGA 4279

 54668662 AGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATA 54668721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 AGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATA 4339

 54668722 GACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAAT 54668781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 GACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAAT 4399

 54668782 TAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCAC 54668841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 TAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCAC 4459

 54668842 TGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCT 54668901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 TGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCT 4519

 54668902 AAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCT 54668961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 AAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCT 4579

 54668962 CGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGT 54669021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 CGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGT 4639

 54669022 GGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGA 54669081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 GGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGA 4699

 54669082 GGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGA 54669141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 GGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGA 4759

 54669142 GATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTG 54669201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 GATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTG 4819

 54669202 CCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGT 54669261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 CCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGT 4879

 54669262 GGTCCTGCCCGTACTACATCTG 54669283
          ||||||||||||||||||||||
     4880 GGTCCTGCCCGTACTACATCTG 4901

Alignment time is 3.69083 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8348] =>      8348 nucs 'mol-32-2874-105492_8348'

Score:        8325
Aligned:      8347        nucs
Identic:      8345 (100%) nucs =>      1881 (100%)      6464 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663099,54664979] EXCISED REGION [54664981,54671445]
 second seq =>  [       1,    1881] EXCISED REGION [    1883,    8348]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54664980,54664980]
 second seq =>         1 nucs [1882,1882]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [7401,7401]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1881,1882] to [1882,1883]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54664979,54664979] to [54664981,54664981]
 second seq =>         1 nucs [1881,1881] to [1883,1883]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54663099 CTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGA 54663158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGA 60

 54663159 ATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTC 54663218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTC 120

 54663219 AGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAAT 54663278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAAT 180

 54663279 TTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAA 54663338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAA 240

 54663339 ATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACA 54663398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACA 300

 54663399 CAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGT 54663458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGT 360

 54663459 GAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCT 54663518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCT 420

 54663519 AAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTG 54663578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTG 480

 54663579 AAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAG 54663638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAG 540

 54663639 AAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATA 54663698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATA 600

 54663699 TTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCT 54663758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCT 660

 54663759 ATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTA 54663818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTA 720

 54663819 GTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCA 54663878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCA 780

 54663879 GATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAA 54663938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAA 840

 54663939 ACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCA 54663998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCA 900

 54663999 AGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGG 54664058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGG 960

 54664059 ACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACA 54664118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACA 1020

 54664119 GTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGT 54664178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGT 1080

 54664179 GGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTG 54664238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTG 1140

 54664239 GGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTG 54664298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTG 1200

 54664299 CCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTC 54664358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTC 1260

 54664359 CTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTC 54664418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTC 1320

 54664419 CTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCA 54664478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCA 1380

 54664479 CTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATG 54664538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATG 1440

 54664539 ATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGA 54664598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGA 1500

 54664599 GTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCT 54664658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCT 1560

 54664659 CAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATA 54664718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATA 1620

 54664719 ATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGC 54664778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGC 1680

 54664779 TAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCT 54664838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCT 1740

 54664839 CATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTG 54664898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTG 1800

 54664899 GTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTA 54664958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTA 1860

 54664959 ACATCTAACTGATAATTTGTG 54664979
          |||||||||||||||||||||
     1861 ACATCTAACTGATAATTTGTG 1881

EXCISED REGION

 54664981 GAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGG 54665040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 GAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGG 1942

 54665041 CAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGT 54665100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGT 2002

 54665101 AAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGT 54665160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 AAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGT 2062

 54665161 TTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATAT 54665220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 TTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATAT 2122

 54665221 TTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGG 54665280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 TTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGG 2182

 54665281 AGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGA 54665340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 AGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGA 2242

 54665341 GGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTT 54665400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 GGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTT 2302

 54665401 GAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAA 54665460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 GAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAA 2362

 54665461 GGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTT 54665520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 GGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTT 2422

 54665521 ACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATA 54665580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 ACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATA 2482

 54665581 ATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGC 54665640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 ATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGC 2542

 54665641 CTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGT 54665700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 CTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGT 2602

 54665701 TTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGG 54665760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 TTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGG 2662

 54665761 AGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGA 54665820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 AGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGA 2722

 54665821 ACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGA 54665880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 ACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGA 2782

 54665881 ACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAG 54665940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 ACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAG 2842

 54665941 AATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATT 54666000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 AATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATT 2902

 54666001 TTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAA 54666060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 TTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAA 2962

 54666061 AGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTT 54666120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 AGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTT 3022

 54666121 TTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAA 54666180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAA 3082

 54666181 TCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCT 54666240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 TCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCT 3142

 54666241 TCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGG 54666300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 TCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGG 3202

 54666301 TCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAA 54666360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 TCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAA 3262

 54666361 AGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGG 54666420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 AGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGG 3322

 54666421 AGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAG 54666480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 AGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAG 3382

 54666481 TTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTC 54666540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 TTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTC 3442

 54666541 TGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGG 54666600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 TGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGG 3502

 54666601 AATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTA 54666660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 AATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTA 3562

 54666661 CATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAAT 54666720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 CATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAAT 3622

 54666721 TGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAAT 54666780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 TGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAAT 3682

 54666781 AGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATA 54666840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 AGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATA 3742

 54666841 GGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGT 54666900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3743 GGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGT 3802

 54666901 GGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAAT 54666960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3803 GGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAAT 3862

 54666961 TAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGC 54667020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3863 TAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTTTGATAGC 3922

 54667021 TTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGT 54667080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3923 TTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGT 3982

 54667081 CTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGG 54667140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3983 CTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGG 4042

 54667141 ATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACC 54667200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4043 ATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACC 4102

 54667201 CAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTG 54667260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4103 CAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTG 4162

 54667261 AATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCT 54667320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4163 AATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCT 4222

 54667321 CCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCAC 54667380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4223 CCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCAC 4282

 54667381 AGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCT 54667440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4283 AGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCT 4342

 54667441 ACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCC 54667500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4343 ACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCC 4402

 54667501 ACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAA 54667560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4403 ACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAA 4462

 54667561 AACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAG 54667620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4463 AACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAG 4522

 54667621 AACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCA 54667680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4523 AACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCA 4582

 54667681 GGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATC 54667740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4583 GGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATC 4642

 54667741 ACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCAT 54667800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4643 ACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCAT 4702

 54667801 CAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCAC 54667860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4703 CAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCAC 4762

 54667861 TCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCC 54667920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4763 TCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCC 4822

 54667921 GCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAAT 54667980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4823 GCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAAT 4882

 54667981 CCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGG 54668040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4883 CCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGG 4942

 54668041 GAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCA 54668100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4943 GAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCA 5002

 54668101 GTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAG 54668160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5003 GTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAG 5062

 54668161 CTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGT 54668220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5063 CTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGT 5122

 54668221 GCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGA 54668280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5123 GCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGA 5182

 54668281 AGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAA 54668340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5183 AGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAA 5242

 54668341 TTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCA 54668400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5243 TTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCA 5302

 54668401 GTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCT 54668460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5303 GTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCT 5362

 54668461 GTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAG 54668520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5363 GTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAG 5422

 54668521 CTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCT 54668580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5423 CTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCT 5482

 54668581 GTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGT 54668640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5483 GTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGT 5542

 54668641 CCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCT 54668700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5543 CCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCT 5602

 54668701 GAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTG 54668760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5603 GAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTG 5662

 54668761 TTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCC 54668820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5663 TTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCC 5722

 54668821 TGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATT 54668880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5723 TGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATT 5782

 54668881 TCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAAC 54668940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5783 TCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAAC 5842

 54668941 CTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGA 54669000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5843 CTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGA 5902

 54669001 CTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCAC 54669060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5903 CTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCAC 5962

 54669061 AGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTT 54669120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5963 AGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTT 6022

 54669121 GGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTG 54669180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6023 GGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTG 6082

 54669181 GTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGA 54669240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6083 GTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGA 6142

 54669241 ATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTT 54669300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6143 ATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTT 6202

 54669301 CTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGA 54669360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6203 CTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGA 6262

 54669361 TGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCAT 54669420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6263 TGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCAT 6322

 54669421 CTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATG 54669480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6323 CTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATG 6382

 54669481 GTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTG 54669540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6383 GTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTG 6442

 54669541 GACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGC 54669600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6443 GACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGC 6502

 54669601 CCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGA 54669660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6503 CCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGA 6562

 54669661 CTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTA 54669720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6563 CTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTA 6622

 54669721 CTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCT 54669780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6623 CTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCT 6682

 54669781 TGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGC 54669840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6683 TGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGC 6742

 54669841 TACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAG 54669900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6743 TACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAG 6802

 54669901 CATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCAT 54669960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6803 CATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCAT 6862

 54669961 GTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACC 54670020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6863 GTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACC 6922

 54670021 ACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACAT 54670080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6923 ACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACAT 6982

 54670081 CTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGG 54670140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6983 CTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGG 7042

 54670141 GCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATG 54670200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7043 GCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATG 7102

 54670201 AGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAAT 54670260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7103 AGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAAT 7162

 54670261 GAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATA 54670320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7163 GAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATA 7222

 54670321 AGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTG 54670380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7223 AGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTG 7282

 54670381 GCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTC 54670440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7283 GCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTC 7342

 54670441 GCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA-C 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     7343 GCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCACC 7402

 54670500 CCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTAT 54670559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7403 CCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTAT 7462

 54670560 TAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACT 54670619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7463 TAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACT 7522

 54670620 GATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATAT 54670679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7523 GATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATAT 7582

 54670680 CTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGC 54670739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7583 CTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGC 7642

 54670740 ATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGAT 54670799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7643 ATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGAT 7702

 54670800 TGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCA 54670859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7703 TGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCA 7762

 54670860 AGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTC 54670919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7763 AGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTC 7822

 54670920 TTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACA 54670979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7823 TTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACA 7882

 54670980 TTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTT 54671039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7883 TTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTT 7942

 54671040 GAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGC 54671099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7943 GAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGC 8002

 54671100 TCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTT 54671159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8003 TCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTT 8062

 54671160 CCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACAC 54671219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8063 CCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACAC 8122

 54671220 ATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAG 54671279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8123 ATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAG 8182

 54671280 TGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAG 54671339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8183 TGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAG 8242

 54671340 GTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAA 54671399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8243 GTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAA 8302

 54671400 TCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAA 54671445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8303 TCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAA 8348

Alignment time is 6.09927 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5045] =>      5045 nucs 'mol-32-288a-078995_5045'

Score:        4616
Aligned:      5054        nucs
Identic:      5006 ( 99%) nucs =>      1013 ( 99%)      3993 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667952,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673565]
 second seq =>  [       1,    1022] EXCISED REGION [    1023,    5045]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54667952 CAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAG 54668011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAG 60

 54668012 ATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTG 54668071
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTG 120

 54668072 CTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGC 54668131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGC 180

 54668132 ACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAG 54668191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      181 ACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAG 240

 54668192 AATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTT 54668251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTT 300

 54668252 GGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGG 54668311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGG 360

 54668312 TTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGAT 54668371
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGAT 420

 54668372 GTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTC 54668431
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTC 480

 54668432 CAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTC 54668491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTC 540

 54668492 TTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCAT 54668551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCAT 600

 54668552 CTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTT 54668611
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTT 660

 54668612 GAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGG 54668671
          .|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGG 720

 54668672 GTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAA 54668731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      721 GTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAA 780

 54668732 TAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAA 54668791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAA 840

 54668792 TCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACC 54668851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACC 900

 54668852 AAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCC 54668911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCC 960

 54668912 ACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTG 54668971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      961 ACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTG 1020

 54668972 CC 54668973
          ||
     1021 CC 1022

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 1082

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 1142

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 1202

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 1262

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 1322

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1323 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 1382

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 1442

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 1502

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1503 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 1562

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 1622

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 1682

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 1742

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 1802

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 1862

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 1922

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     1923 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 1982

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1983 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 2042

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 2102

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     2103 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 2160

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 2220

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 2279

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 2339

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 2399

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 2459

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 2519

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 2579

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 2639

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 2699

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 2759

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 2819

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     2820 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 2877

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 2937

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 2997

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 3057

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 3117

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3118 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 3177

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3178 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 3237

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 3297

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3298 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 3357

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3358 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 3417

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 3477

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     3478 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 3537

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3538 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 3597

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 3657

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 3717

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 3777

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 3837

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 3897

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 3957

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 4017

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 4077

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4078 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 4137

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4138 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 4197

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 4257

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 4317

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4318 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 4377

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4378 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 4437

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4438 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 4497

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 4557

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     4558 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 4617

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 4677

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 4737

 54673257 TGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 54673313
          ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 4793

 54673314 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 54673373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 4853

 54673374 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 54673433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 4913

 54673434 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 54673493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 4973

 54673494 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTG 54673553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4974 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATATAGTGGTG 5033

 54673554 GGGGTTGCACAG 54673565
          ||||||||||||
     5034 GGGGTTGCACAG 5045

Alignment time is 3.77719 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7067] =>      7067 nucs 'mol-32-29b3-023406_7067'

Score:        7066
Aligned:      7066        nucs
Identic:      7066 (100%) nucs =>      3874 (100%)      3192 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54666625,54670498] EXCISED REGION [54670499,54673690]
 second seq =>  [       1,    3874] EXCISED REGION [    3876,    7067]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3875,3875]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [3875,3880] to [3876,3881]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54666625 ATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAAT 54666684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAAT 60

 54666685 AGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCT 54666744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCT 120

 54666745 GGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAAC 54666804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAAC 180

 54666805 ATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAA 54666864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAA 240

 54666865 CTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGA 54666924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGA 300

 54666925 GGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGA 54666984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGA 360

 54666985 TTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGG 54667044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGG 420

 54667045 TGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATA 54667104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATA 480

 54667105 ACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAA 54667164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAA 540

 54667165 CACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTT 54667224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTT 600

 54667225 GAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTA 54667284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTA 660

 54667285 GAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGC 54667344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGC 720

 54667345 AGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCC 54667404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCC 780

 54667405 CTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAA 54667464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAA 840

 54667465 TAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAAC 54667524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAAC 900

 54667525 TTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAA 54667584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAA 960

 54667585 ACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTA 54667644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTA 1020

 54667645 CAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCT 54667704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCT 1080

 54667705 CTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCC 54667764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCC 1140

 54667765 TGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGA 54667824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGA 1200

 54667825 AGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATG 54667884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATG 1260

 54667885 TGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGA 54667944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGA 1320

 54667945 AACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCT 54668004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCT 1380

 54668005 GGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGC 54668064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGC 1440

 54668065 TACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACAT 54668124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACAT 1500

 54668125 CAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATG 54668184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATG 1560

 54668185 AAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGAT 54668244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGAT 1620

 54668245 TCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAG 54668304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAG 1680

 54668305 TGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCC 54668364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCC 1740

 54668365 CCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAG 54668424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAG 1800

 54668425 GACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAA 54668484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAA 1860

 54668485 GAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGC 54668544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGC 1920

 54668545 TCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACA 54668604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACA 1980

 54668605 TGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGG 54668664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGG 2040

 54668665 ACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGAC 54668724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGAC 2100

 54668725 TCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAG 54668784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAG 2160

 54668785 ACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGG 54668844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGG 2220

 54668845 CCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAA 54668904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAA 2280

 54668905 TGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGC 54668964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGC 2340

 54668965 CTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGC 54669024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGC 2400

 54669025 TGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGG 54669084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGG 2460

 54669085 CGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGAT 54669144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGAT 2520

 54669145 TACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCT 54669204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCT 2580

 54669205 CTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGT 54669264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGT 2640

 54669265 CCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGC 54669324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGC 2700

 54669325 AATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGC 54669384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGC 2760

 54669385 AGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTT 54669444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTT 2820

 54669445 AACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATG 54669504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATG 2880

 54669505 GAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCT 54669564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCT 2940

 54669565 AGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAG 54669624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAG 3000

 54669625 AAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCC 54669684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCC 3060

 54669685 TTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGC 54669744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGC 3120

 54669745 AAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATT 54669804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATT 3180

 54669805 GGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCT 54669864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCT 3240

 54669865 CCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTG 54669924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTG 3300

 54669925 GAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACA 54669984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACA 3360

 54669985 GTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATA 54670044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATA 3420

 54670045 TTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTG 54670104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTG 3480

 54670105 CGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAG 54670164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAG 3540

 54670165 CAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGA 54670224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGA 3600

 54670225 TCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGG 54670284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGG 3660

 54670285 CTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGT 54670344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGT 3720

 54670345 GGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCC 54670404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCC 3780

 54670405 CAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCA 54670464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCA 3840

 54670465 GGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA 54670498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA 3874

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 3935

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 3995

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 4055

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 4115

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 4175

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 4235

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 4295

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 4355

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 4415

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 4475

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 4535

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 4595

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 4655

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 4715

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 4775

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 4835

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 4895

 54671519 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 54671578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 4955

 54671579 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 54671638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 5015

 54671639 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 54671698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 5075

 54671699 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 54671758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 5135

 54671759 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 54671818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 5195

 54671819 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 54671878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 5255

 54671879 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 54671938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 5315

 54671939 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 54671998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 5375

 54671999 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 54672058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 5435

 54672059 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 54672118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 5495

 54672119 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 54672178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 5555

 54672179 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 54672238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 5615

 54672239 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 54672298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 5675

 54672299 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 54672358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 5735

 54672359 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 54672418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 5795

 54672419 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 54672478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 5855

 54672479 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 54672538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 5915

 54672539 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 54672598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 5975

 54672599 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 54672658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5976 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 6035

 54672659 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 54672718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6036 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 6095

 54672719 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 54672778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6096 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 6155

 54672779 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 54672838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 6215

 54672839 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 54672898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6216 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 6275

 54672899 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 54672958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6276 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 6335

 54672959 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 54673018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6336 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 6395

 54673019 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 54673078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6396 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 6455

 54673079 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 54673138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6456 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 6515

 54673139 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 54673198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6516 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 6575

 54673199 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 54673258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6576 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 6635

 54673259 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 54673318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6636 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 6695

 54673319 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 54673378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6696 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 6755

 54673379 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCC 54673438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6756 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCC 6815

 54673439 TGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAG 54673498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6816 TGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAG 6875

 54673499 CTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGT 54673558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6876 CTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGT 6935

 54673559 TGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTT 54673618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6936 TGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTT 6995

 54673619 TAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACAAATAT 54673678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6996 TAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACAAATAT 7055

 54673679 ATATATTGAGGA 54673690
          ||||||||||||
     7056 ATATATTGAGGA 7067

Alignment time is 5.41705 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5269] =>      5269 nucs 'mol-32-29b3-024284_5269'

Score:        5269
Aligned:      5269        nucs
Identic:      5269 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54664398,54669666]
 second seq =>  [       1,    5269]

 54664398 CTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATT 54664457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATT 60

 54664458 TACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATG 54664517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATG 120

 54664518 TAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAG 54664577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAG 180

 54664578 ACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGT 54664637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGT 240

 54664638 TTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAG 54664697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAG 300

 54664698 AATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCA 54664757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCA 360

 54664758 GTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATC 54664817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATC 420

 54664818 AGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGT 54664877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGT 480

 54664878 TTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCC 54664937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCC 540

 54664938 AGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCA 54664997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCA 600

 54664998 AATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTG 54665057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTG 660

 54665058 TTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTAT 54665117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTAT 720

 54665118 TCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAA 54665177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAA 780

 54665178 TTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCT 54665237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCT 840

 54665238 GCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGT 54665297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGT 900

 54665298 AGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTA 54665357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTA 960

 54665358 GAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGT 54665417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGT 1020

 54665418 TTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGT 54665477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGT 1080

 54665478 GCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATT 54665537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATT 1140

 54665538 TAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGA 54665597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGA 1200

 54665598 GGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGA 54665657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGA 1260

 54665658 ACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGG 54665717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGG 1320

 54665718 CCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAAC 54665777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAAC 1380

 54665778 CATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAA 54665837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAA 1440

 54665838 ATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGA 54665897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGA 1500

 54665898 GGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGA 54665957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGA 1560

 54665958 GCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACA 54666017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACA 1620

 54666018 AAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGC 54666077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGC 1680

 54666078 ACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAA 54666137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAA 1740

 54666138 CTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCT 54666197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCT 1800

 54666198 CTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACAT 54666257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACAT 1860

 54666258 AGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCAT 54666317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCAT 1920

 54666318 CCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCC 54666377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCC 1980

 54666378 CATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGA 54666437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGA 2040

 54666438 AGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCC 54666497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCC 2100

 54666498 AACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGC 54666557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGC 2160

 54666558 TTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCA 54666617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCA 2220

 54666618 CTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTA 54666677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTA 2280

 54666678 TGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTT 54666737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTT 2340

 54666738 TCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCC 54666797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCC 2400

 54666798 CCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAG 54666857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAG 2460

 54666858 TAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGC 54666917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGC 2520

 54666918 AAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGA 54666977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGA 2580

 54666978 ATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCT 54667037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCT 2640

 54667038 CAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGAT 54667097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGAT 2700

 54667098 GGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATAC 54667157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATAC 2760

 54667158 AGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGA 54667217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGA 2820

 54667218 TGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAAC 54667277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAAC 2880

 54667278 ATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTC 54667337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTC 2940

 54667338 AGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATA 54667397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATA 3000

 54667398 CTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCA 54667457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCA 3060

 54667458 TAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCC 54667517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCC 3120

 54667518 CCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTT 54667577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTT 3180

 54667578 TACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCC 54667637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCC 3240

 54667638 ATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAG 54667697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAG 3300

 54667698 GGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGG 54667757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGG 3360

 54667758 CAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTA 54667817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTA 3420

 54667818 GGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTA 54667877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTA 3480

 54667878 TTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTG 54667937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTG 3540

 54667938 AAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGC 54667997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGC 3600

 54667998 ATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATAC 54668057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATAC 3660

 54668058 AAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCA 54668117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCA 3720

 54668118 GTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAG 54668177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAG 3780

 54668178 ACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCC 54668237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCC 3840

 54668238 AGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCA 54668297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCA 3900

 54668298 GAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACG 54668357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACG 3960

 54668358 AATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGA 54668417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGA 4020

 54668418 GAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACAT 54668477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACAT 4080

 54668478 TTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGA 54668537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGA 4140

 54668538 CTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAG 54668597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAG 4200

 54668598 TGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGC 54668657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGC 4260

 54668658 TAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGAT 54668717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGAT 4320

 54668718 GATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAAT 54668777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAAT 4380

 54668778 AAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTC 54668837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTC 4440

 54668838 CCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAA 54668897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAA 4500

 54668898 AGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTC 54668957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTC 4560

 54668958 ACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTC 54669017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTC 4620

 54669018 ATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCAC 54669077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCAC 4680

 54669078 ATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGA 54669137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGA 4740

 54669138 GAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCC 54669197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCC 4800

 54669198 ATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTT 54669257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTT 4860

 54669258 GTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTG 54669317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTG 4920

 54669318 GCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTA 54669377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTA 4980

 54669378 TTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGG 54669437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGG 5040

 54669438 ATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCA 54669497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCA 5100

 54669498 GGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTG 54669557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTG 5160

 54669558 AGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTT 54669617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTT 5220

 54669618 CACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTT 54669666
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTT 5269

Alignment time is 3.48686 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4670] =>      4670 nucs 'mol-32-29c9-036159_4670'

Score:        4259
Aligned:      4669        nucs
Identic:      4626 ( 99%) nucs =>      1307 ( 99%)      3319 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667654,54668973] EXCISED REGION [54669540,54672884]
 second seq =>  [       1,    1320] EXCISED REGION [    1321,    4662]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54667654 AGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAG 54667713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAG 60

 54667714 GATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAA 54667773
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAA 120

 54667774 TGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGC 54667833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGC 180

 54667834 AGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATC 54667893
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATC 240

 54667894 CAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACA 54667953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACA 300

 54667954 GTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGAT 54668013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGAT 360

 54668014 TCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCT 54668073
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCT 420

 54668074 ACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCAC 54668133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCAC 480

 54668134 TTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAA 54668193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      481 TTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAA 540

 54668194 TCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGG 54668253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGG 600

 54668254 CACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTT 54668313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTT 660

 54668314 CTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGT 54668373
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGT 720

 54668374 CACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCA 54668433
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCA 780

 54668434 GGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTT 54668493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTT 840

 54668494 TATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCT 54668553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCT 900

 54668554 ATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGA 54668613
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      901 ATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCA 960

 54668614 GGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGT 54668673
          |||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGACAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGT 1020

 54668674 TCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATA 54668733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1021 TCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATA 1080

 54668734 GACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATC 54668793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATC 1140

 54668794 CAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAA 54668853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATACTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAA 1200

 54668854 GACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCAC 54668913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCAC 1260

 54668914 TGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1261 TGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 1320

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 1380

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 1440

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 1500

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 1560

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 1620

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1621 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 1680

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 1740

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 1800

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1801 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 1860

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 1920

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 1980

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 2040

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 2100

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 2160

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 2220

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     2221 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 2280

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2281 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 2340

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 2400

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGT-TTTTTTTTCTTTCTATGCTAT 54670677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
     2401 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT----GTTTTTTTTCTTTCTATGCTAT 2456

 54670678 ATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAAT 54670737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 ATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAAT 2516

 54670738 GCATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGG 54670797
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 GCATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGG 2575

 54670798 ATTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAAT 54670857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 ATTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAAT 2635

 54670858 CAAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCC 54670917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CAAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCC 2695

 54670918 TCTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAA 54670977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TCTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAA 2755

 54670978 CATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCAT 54671037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCAT 2815

 54671038 TTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCAT 54671097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCAT 2875

 54671098 GCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAAT 54671157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAAT 2935

 54671158 TTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAAC 54671217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAAC 2995

 54671218 ACATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATA 54671277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 ACATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATA 3055

 54671278 AGTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTC 54671337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AGTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTC 3115

 54671338 AGGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGT 54671395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
     3116 AGGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGT 3173

 54671396 TGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAAT 54671455
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 TGAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAAT 3233

 54671456 GTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAA 54671515
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GTTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAA 3293

 54671516 TAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTAT 54671575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTAT 3353

 54671576 TGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGA 54671635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGA 3413

 54671636 AGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTT 54671695
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3414 AGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTT 3473

 54671696 CTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTA 54671755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3474 CTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCA 3533

 54671756 CCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTAT 54671815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTAT 3593

 54671816 ATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTT 54671875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3594 ATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTT 3653

 54671876 TGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTT 54671935
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3654 TGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTT 3713

 54671936 TCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAA 54671995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 TCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAA 3773

 54671996 TAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGG 54672055
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
     3774 TAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAG 3833

 54672056 TCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCA 54672115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3834 TCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCA 3893

 54672116 TAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGA 54672175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 TAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGA 3953

 54672176 CAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCT 54672235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 CAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCT 4013

 54672236 GGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTA 54672295
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 GGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTA 4073

 54672296 ATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATA 54672355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 ATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATA 4133

 54672356 AGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTA 54672415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 AGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTA 4193

 54672416 TGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGG 54672475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGG 4253

 54672476 TAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGG 54672535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGG 4313

 54672536 TAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTG 54672595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTG 4373

 54672596 CTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTT 54672655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4374 CTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTT 4433

 54672656 GATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTT 54672715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4434 GATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTT 4493

 54672716 TAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCAC 54672775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCAC 4553

 54672776 AAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCC 54672835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 AAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCC 4613

 54672836 AGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGC 54672884
          |||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 AGGTGCGATGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGC 4662

Alignment time is 3.55478 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6052] =>      6052 nucs 'mol-32-2af2-061941_6052'

Score:        6051
Aligned:      6051        nucs
Identic:      6051 (100%) nucs =>      1710 (100%)      4341 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54664085,54665794] EXCISED REGION [54665796,54670136]
 second seq =>  [       1,    1710] EXCISED REGION [    1712,    6052]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54665795,54665795]
 second seq =>         1 nucs [1711,1711]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54665795,54665795] to [54665796,54665796]
 second seq =>         1 nucs [1710,1710] to [1711,1711]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54664085 TATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCA 54664144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCA 60

 54664145 GGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCT 54664204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCT 120

 54664205 ATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCA 54664264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCA 180

 54664265 CCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAA 54664324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAA 240

 54664325 GCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAAC 54664384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAAC 300

 54664385 CTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTG 54664444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTG 360

 54664445 AACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGT 54664504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGT 420

 54664505 TTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATG 54664564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATG 480

 54664565 GTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCAC 54664624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCAC 540

 54664625 TAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAA 54664684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAA 600

 54664685 ATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAA 54664744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAA 660

 54664745 AGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAA 54664804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAA 720

 54664805 TAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAA 54664864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAA 780

 54664865 TACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTT 54664924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTT 840

 54664925 TGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGT 54664984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGT 900

 54664985 GGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAA 54665044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAA 960

 54665045 AGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAAC 54665104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAAC 1020

 54665105 AACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTT 54665164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTT 1080

 54665165 ACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCC 54665224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCC 1140

 54665225 TAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGT 54665284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGT 1200

 54665285 GACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGC 54665344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGC 1260

 54665345 TTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGA 54665404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGA 1320

 54665405 GGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGAT 54665464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGAT 1380

 54665465 GGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAA 54665524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAA 1440

 54665525 AACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTG 54665584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTG 1500

 54665585 AAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTT 54665644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTT 1560

 54665645 GGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCT 54665704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCT 1620

 54665705 GTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGAC 54665764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGAC 1680

 54665765 AGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCT 54665794
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCT 1710

EXCISED REGION

 54665796 ACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTT 54665855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTT 1771

 54665856 GGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATG 54665915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 GGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATG 1831

 54665916 GAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGC 54665975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGC 1891

 54665976 TAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCC 54666035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCC 1951

 54666036 TAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACAC 54666095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACAC 2011

 54666096 ATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTT 54666155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 ATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTT 2071

 54666156 TAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTT 54666215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTT 2131

 54666216 TCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGT 54666275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGT 2191

 54666276 CTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGA 54666335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 CTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGA 2251

 54666336 AGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTG 54666395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 AGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTG 2311

 54666396 CCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCA 54666455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 CCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCA 2371

 54666456 GGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTC 54666515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 GGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTC 2431

 54666516 TCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTC 54666575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTC 2491

 54666576 TGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGC 54666635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGC 2551

 54666636 TGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGAT 54666695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 TGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGAT 2611

 54666696 TAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAAC 54666755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 TAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAAC 2671

 54666756 TGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTA 54666815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTA 2731

 54666816 GGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGG 54666875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 GGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGG 2791

 54666876 AGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGT 54666935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGT 2851

 54666936 TAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCA 54666995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 TAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCA 2911

 54666996 TGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGG 54667055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 TGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGG 2971

 54667056 CCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATG 54667115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATG 3031

 54667116 GAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAAT 54667175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 GAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAAT 3091

 54667176 GTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTG 54667235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 GTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTG 3151

 54667236 CCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAG 54667295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 CCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAG 3211

 54667296 TCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGA 54667355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 TCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGA 3271

 54667356 AAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCT 54667415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 AAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCT 3331

 54667416 CGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAA 54667475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 CGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAA 3391

 54667476 GACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAG 54667535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 GACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAG 3451

 54667536 AAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCC 54667595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 AAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCC 3511

 54667596 ACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAG 54667655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 ACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAG 3571

 54667656 TTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGA 54667715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 TTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGA 3631

 54667716 TATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATG 54667775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 TATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATG 3691

 54667776 TGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAG 54667835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 TGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAG 3751

 54667836 GTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCA 54667895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 GTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCA 3811

 54667896 GCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGT 54667955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 GCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGT 3871

 54667956 GGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTC 54668015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 GGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTC 3931

 54668016 TCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTAC 54668075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3932 TCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTAC 3991

 54668076 TAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTT 54668135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 TAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTT 4051

 54668136 GGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATC 54668195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 GGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATC 4111

 54668196 TCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCA 54668255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 TCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCA 4171

 54668256 CACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCT 54668315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 CACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCT 4231

 54668316 TTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCA 54668375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 TTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCA 4291

 54668376 CAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGG 54668435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 CAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGG 4351

 54668436 GTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTA 54668495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 GTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTA 4411

 54668496 TTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTAT 54668555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 TTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTAT 4471

 54668556 GCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGG 54668615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 GCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGG 4531

 54668616 TGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTC 54668675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 TGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTC 4591

 54668676 AACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGA 54668735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 AACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGA 4651

 54668736 CTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCA 54668795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 CTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCA 4711

 54668796 GTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGA 54668855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4712 GTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGA 4771

 54668856 CCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTG 54668915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 CCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTG 4831

 54668916 AATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTA 54668975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 AATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTA 4891

 54668976 GTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACT 54669035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 GTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACT 4951

 54669036 GTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTG 54669095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 GTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTG 5011

 54669096 CTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCT 54669155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 CTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCT 5071

 54669156 CTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCC 54669215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 CTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCC 5131

 54669216 AATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTAC 54669275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 AATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTAC 5191

 54669276 TACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTT 54669335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 TACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTT 5251

 54669336 CTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGAC 54669395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 CTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGAC 5311

 54669396 AGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCT 54669455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 AGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCT 5371

 54669456 AATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGT 54669515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 AATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGT 5431

 54669516 GTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGC 54669575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 GTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGC 5491

 54669576 CGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCA 54669635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 CGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCA 5551

 54669636 TGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACC 54669695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 TGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACC 5611

 54669696 AAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCA 54669755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 AAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCA 5671

 54669756 ATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAG 54669815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 ATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAG 5731

 54669816 AACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGG 54669875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 AACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGG 5791

 54669876 ACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGA 54669935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 ACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGA 5851

 54669936 CAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCT 54669995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 CAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCT 5911

 54669996 TGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTC 54670055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 TGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTC 5971

 54670056 AGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTC 54670115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 AGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTC 6031

 54670116 TGGGTTCCCTATGTTGAGGAC 54670136
          |||||||||||||||||||||
     6032 TGGGTTCCCTATGTTGAGGAC 6052

Alignment time is 4.51994 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9492] =>      9492 nucs 'mol-32-2afd-103889_9492'

Score:        8131
Aligned:      9505        nucs
Identic:      9079 ( 96%) nucs =>      3382 (100%)      5697 ( 93%)
Gaps:          378 (  4%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54665578,54668973] EXCISED REGION [54669540,54675284]
 second seq =>  [       1,    3397] EXCISED REGION [    3398,    9491]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54665578 ATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCA 54665637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCA 60

 54665638 GGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTT 54665697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTT 120

 54665698 AGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCAC 54665757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCAC 180

 54665758 TGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAAC 54665817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAAC 240

 54665818 AGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAA 54665877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAA 300

 54665878 AGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGG 54665937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGG 360

 54665938 TAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGT 54665996
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGT 420

 54665997 AATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAG 54666056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAG 480

 54666057 GAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATT 54666116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATT 540

 54666117 TTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTG 54666176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTG 600

 54666177 ACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCT 54666236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCT 660

 54666237 CCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAAT 54666296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAAT 720

 54666297 CTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTG 54666356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTG 780

 54666357 GTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGA 54666416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      781 GTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAGCAGA 840

 54666417 AGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGG 54666476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGG 900

 54666477 AGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTG 54666536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTG 960

 54666537 GTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGT 54666596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGT 1020

 54666597 TGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTC 54666656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTC 1080

 54666657 CCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTC 54666716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTC 1140

 54666717 AAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAG 54666776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAG 1200

 54666777 AAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGC 54666836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGC 1260

 54666837 CATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTA 54666896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTA 1320

 54666897 AAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAG 54666956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAG 1380

 54666957 CAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGA 54667016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGA 1440

 54667017 TAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCA 54667076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCA 1500

 54667077 ATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTA 54667136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTA 1560

 54667137 GTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCC 54667196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCC 1620

 54667197 AACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGC 54667256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGC 1680

 54667257 AGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAG 54667316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAG 1740

 54667317 ATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGA 54667376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGA 1800

 54667377 TCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCC 54667436
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1801 TCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCC 1860

 54667437 TGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAAC 54667496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAAC 1920

 54667497 TCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGC 54667556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGC 1980

 54667557 ATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCC 54667616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCC 2040

 54667617 TCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACA 54667676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACA 2100

 54667677 GCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTAC 54667736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTAC 2160

 54667737 TATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGT 54667796
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGT 2220

 54667797 GCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCT 54667856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2221 GCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCT 2280

 54667857 GCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATC 54667916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATC 2340

 54667917 ATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGC 54667976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGC 2400

 54667977 AAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATC 54668036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2401 AAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATC 2460

 54668037 TGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAG 54668096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAG 2520

 54668097 AGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCAC 54668156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCAC 2580

 54668157 AAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCAC 54668216
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCAC 2640

 54668217 CAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAG 54668276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAG 2700

 54668277 AGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATG 54668336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATG 2760

 54668337 TGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTA 54668396
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2761 TGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTA 2820

 54668397 ATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACC 54668456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACC 2880

 54668457 CCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGA 54668516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGA 2940

 54668517 CTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGT 54668576
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2941 CTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGT 3000

 54668577 TGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACT 54668636
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||
     3001 TGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCT 3060

 54668637 GTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGT 54668696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGT 3120

 54668697 CCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTC 54668756
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTC 3180

 54668757 CTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAG 54668816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAG 3240

 54668817 CCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATAC 54668876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATAC 3300

 54668877 CATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAG 54668936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAG 3360

 54668937 TAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3361 TAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 3397

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 3457

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 3517

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 3577

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 3637

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 3697

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3698 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 3757

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 3817

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 3877

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3878 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 3937

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 3997

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 4057

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 4117

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 4177

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 4237

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 4297

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     4298 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 4357

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4358 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 4417

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 4477

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     4478 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 4535

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 4595

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 4654

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 4714

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 4774

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 4834

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 4894

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 4954

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 5014

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 5074

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 5134

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 5194

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     5195 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 5252

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 5312

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 5372

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 5432

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 5492

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5493 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 5552

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5553 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 5612

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 5672

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5673 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 5732

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5733 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 5792

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5793 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 5852

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     5853 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 5912

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5913 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 5972

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5973 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 6032

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6033 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 6092

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6093 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 6152

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6153 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 6212

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6213 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 6272

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6273 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 6332

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6333 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 6392

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6393 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 6452

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6453 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 6512

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6513 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 6572

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6573 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 6632

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6633 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 6692

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6693 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 6752

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6753 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 6812

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6813 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 6872

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6873 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 6932

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     6933 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 6992

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6993 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 7052

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7053 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 7112

 54673257 TGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 54673313
          ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7113 TGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 7168

 54673314 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 54673373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7169 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 7228

 54673374 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 54673433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7229 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 7288

 54673434 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 54673493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7289 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 7348

 54673494 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTG 54673553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     7349 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATATAGTGGTG 7408

 54673554 GGGGTTGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATA 54673613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 GGGGTTGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATA 7468

 54673614 AATTTTAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACA 54673673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 AATTTTAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACA 7528

 54673674 AATATATATATTGAGGAGTATGTTTATATCTCAAATCCATCTTCCCAATCCTATTTTAGA 54673733
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 AATATATATATTGAGGGGTATGTTTATATCTCAAATCCATCTTCCCAATCCTATTTTAGA 7588

 54673734 ATATTTTAGAAATTCTAGAGCATAGAGAAAAGGGAAATAATACATATAAGACTTGGAAAA 54673793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 ATATTTTAGAAATTCTAGAGCATAGAGAAAAGGGAAATAATACATATAAGACTTGGAAAA 7648

 54673794 AATAAAGACAATTTCTATTATTCACACATGATATTATTATCTATATTAAAAAC------- 54673846
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
     7649 AATAAAGACAATTTCTATTATTCACACATGATATTATTATCTATATTAAAAACCTTAAAG 7708

          ------------------------------------------------------------
                                                                      
     7709 TAGCTACAGAAAAATTACTAGCAAAGTTTAACAGCATTGCCAGATCTAAAATCAGTATAA 7768

          ------------------------------------------------------------
                                                                      
     7769 AAATGTAATATGCACTTTATTTGCTGGAAACAAGTAGAAAATTAAATTTTAAAAGATGGA 7828

          ------------------------------------------------------------
                                                                      
     7829 TAGTAATAAAAAATAAAACTACCTGGTAAAGGATAACTATGATCTTTAAATAGAGAATTT 7888

          ------------------------------------------------------------
                                                                      
     7889 AAAAACATTATTTAGTCACTAAGTTATGGCATTATTTAAGATCCTAAAAAGAACCACAAA 7948

          ------------------------------------------------------------
                                                                      
     7949 GGCATACTATGATAATGGAAAGTCAGACTCAATATTGTAAAGAGATTCATTTTACTCAAA 8008

 54673847 ------------------------------------------------AGAAGAAAGAGA 54673858
                                                          ||||||||||||
     8009 CTAGTTTTTACAAAAAATATGACAAACCAATTATAAAATTTATATGGTAGAAGAAAGAGA 8068

 54673859 TAAGGAAAGCTAAAACTTTTCTGAATAGCAAAAATATGTGAGGGCCTTTGTCTCAGTATT 54673918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8069 TAAGGAAAGCTAAAACTTTTCTGAATAGCAAAAATATGTGAGGGCCTTTGTCTCAGTATT 8128

 54673919 TTTCAAGCCCTATTATAAAAAAAATTTTTATTAAGATAATGTGGAGTTGTTACAGGGATA 54673978
          |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8129 TTTCAAGCCTTATTATAAAAAAAAATTTTATTAAGATAATGTGGAGTTGTTACAGGGATA 8188

 54673979 GGTAAATTTTAACAGGAACAGAATAGAGATCTTAGAAACAGCCCCATGCAGATACGCAAA 54674038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     8189 GGTAAATTTTAACAGGAACAGAATAGAGATCTTAGAAACAGCTCCATGCAGATACGCAAA 8248

 54674039 TTTTAAAAATATCACAGATGTAACGTAAGTTATCAGCGTGGAAAGGATGCACTTATTTAG 54674098
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     8249 TTTTAAAAATATCACAGATGTAATGTAAGTTATCAGCGTGGAAAGGATACACTTATTTAG 8308

 54674099 GATGATACAAAAGGTTTAGAAGAAAAGAAAACTAGGATCTCAAATTCCACCATACACTTT 54674158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8309 GATGATACAAAAGGTTTAGAAGAAAAGAAAACTAGGATCTCAAATTCCACCATACACTTT 8368

 54674159 AAAACAATTCCTGGTGAATAAAAGGTTCACATTTCAAAGTGAAACTTTAAAATTTTTATA 54674218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     8369 AAAACAATTCCTGGTGAATAAAAGGTTCACATTTCAAAGTGAGACTTTAAAATTTTTATA 8428

 54674219 AGGAAATATAGCAGGATAACTTTAAGACATCAAAATAAAGTATTTCTTAAATAAAGCATT 54674278
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||
     8429 AGGAAATATAGCAGGATACCTTTAAGACATCAAAATA----ATTTCTTAAATAAAGCATT 8484

 54674279 AAAAGGGCAATTCAAAAGTAGATTGATAAATTTGACTACATTAAAATTAAGAACTTTTGT 54674338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8485 AAAAGGGCAATTCAAAAGTAGATTGATAAATTTGACTACATTAAAATTAAGAACTTTTGT 8544

 54674339 TCAT--AAAAAAAAACACCACAGAGTAAAAAAACAAATCAGAAACTGGAATGTATTTACA 54674396
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8545 TCATAAAAAAAAAAACACCACAGAGTAAAAAAACAAATCAGAAACTGGAATGTATTTACA 8604

 54674397 ACAAAAATAACTTTCAAAAAGTGAATAGCTAGGATATACTATAATTTATTTTAGTCCTAT 54674456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8605 ACAAAAATAACTTTCAAAAAGTGAATAGCTAGGATATACTATAATTTATTTTAGTCCTAT 8664

 54674457 ATTGAACAGTTAGGTTATTTTTCTTTGTGTTTTTTTCTTCAACAAATTGATGATATGCTA 54674516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8665 ATTGAACAGTTAGGTTATTTTTCTTTGTGTTTTTTTCTTCAACAAATTGATGATATGCTA 8724

 54674517 AACATCTTCGTATGCATCTCCTTTTGCTGAGTGTAATTGCTATGTCAAAAATGCCATGAT 54674576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8725 AACATCTTCGTATGCATCTCCTTTTGCTGAGTGTAATTGCTATGTCAAAAATGCCATGAT 8784

 54674577 TTTAGTTTACATAGATATGGCCCTACAGAGATGTTTTTTCAGTTAACACTGTAGCAGGCT 54674636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8785 TTTAGTTTACATAGATATGGCCCTACAGAGATGTTTTTTCAGTTAACACTGTAGCAGGCT 8844

 54674637 GATCATAGCTCTGAGAGATACGTCCTCACACTAATTCCCAGAACCCAAGAATGTTGCCTT 54674696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8845 GATCATAGCTCTGAGAGATACGTCCTCACACTAATTCCCAGAACCCAAGAATGTTGCCTT 8904

 54674697 ATTTGGAAAAAGGGTCTTTTCAGATGTGATTAAATTAAGGATTTTGAAAGTAAGAAATTG 54674756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8905 ATTTGGAAAAAGGGTCTTTTCAGATGTGATTAAATTAAGGATTTTGAAAGTAAGAAATTG 8964

 54674757 TCTTAGGCTATCCAAGAGTCTCTAAATGCCATCACAATTGCCCCTGACCAAGGGAGATCA 54674816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     8965 TCTTAGGCTATCCAAGAGTCTCTAAATGCCATCACAATTGTCCCTGACCAAGGGAGATCA 9024

 54674817 GACACACACAGGAGAGGAAGATGGGAATGTGAACATGGAGGCAGAAATTGAAGTGATGCA 54674876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     9025 GACACACACAGGAGAGGAAGATGGGAATGTGAACATGGAGGCAGAAATTGAAGTGACGCA 9084

 54674877 GCCACAAGTCCAGGAATGTCAGCAGTTAGGAGAAGAGAATACATTTCGGTTATTTTAAGC 54674936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9085 GCCACAAGTCCAGGAATGTCAGCAGTTAGGAGAAGAGAATACATTTCGGTTATTTTAAGC 9144

 54674937 CACCAAACGTTTGGCAATTTGTTAGAGCAGCCACCAAGTAATGCTCACTGTCACGAAAAT 54674996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9145 CACCAAACGTTTGGCAATTTGTTAGAGCAGCCACCAAGTAATGCTCACTGTCACGAAAAT 9204

 54674997 AAGTGCATGAGAATGCTATTTTTCCCATCCCCTGCCAACATACAGATTCTCATAGAGGAA 54675056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9205 AAGTGCATGAGAATGCTATTTTTCCCATCCCCTGCCAACATACAGATTCTCATAGAGGAA 9264

 54675057 AAATAGTATATTATATATTTAGTTCATATATTTCTTCTTACAAAAAATATTTGAGCATCA 54675116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9265 AAATAGTATATTATATATTTAGTTCATATATTTCTTCTTACAAAAAATATTTGAGCATCA 9324

 54675117 TGCTTAAGACTAATTTATATTTCCTTTCTCTGAACTGTTTGTTCATGTCTTCATCCAGAT 54675176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9325 TGCTTAAGACTAATTTATATTTCCTTTCTCTGAACTGTTTGTTCATGTCTTCATCCAGAT 9384

 54675177 TTGTATTGGACTATAATTTTCCTAGAAGTTCTGTAGACCCTTTTTTTTCTTTTCTTTTCT 54675236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     9385 TTGTATTGGACTATAATTTTCCTAGAAGTTCTGTAGACCCTTTTTTTTCTTTTCTTTTC- 9443

 54675237 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCT 54675284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9444 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCT 9491

Alignment time is 7.02645 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3397] =>      3397 nucs 'mol-32-2afd-103889_3397'

Score:        3242
Aligned:      3396        nucs
Identic:      3382 (100%) nucs =>       369 (100%)      3013 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54665578,54665946] EXCISED REGION [54665947,54668973]
 second seq =>  [       1,     369] EXCISED REGION [     371,    3397]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [370,370]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [54666398,54666398]
 second seq =>         1 nucs [822,822]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [370,370] to [371,371]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54665578 ATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCA 54665637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCA 60

 54665638 GGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTT 54665697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTT 120

 54665698 AGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCAC 54665757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCAC 180

 54665758 TGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAAC 54665817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAAC 240

 54665818 AGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAA 54665877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAA 300

 54665878 AGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGG 54665937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGG 360

 54665938 TAGAATCTC 54665946
          |||||||||
      361 TAGAATCTC 369

EXCISED REGION

 54665947 TAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACC 54666006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 TAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACC 430

 54666007 TTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGA 54666066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 TTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGA 490

 54666067 GGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCC 54666126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 GGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCC 550

 54666127 CATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTT 54666186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 CATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTT 610

 54666187 CAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGT 54666246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 CAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGT 670

 54666247 ACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCA 54666306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 ACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCA 730

 54666307 CCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGG 54666366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 CCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGG 790

 54666367 GTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGG 54666426
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      791 GTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGG 850

 54666427 AGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTG 54666486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 AGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTG 910

 54666487 GCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGA 54666546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 GCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGA 970

 54666547 TTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGA 54666606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 TTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGA 1030

 54666607 GCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCT 54666666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 GCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCT 1090

 54666667 GCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTG 54666726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 GCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTG 1150

 54666727 TAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCC 54666786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 TAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCC 1210

 54666787 AGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAG 54666846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 AGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAG 1270

 54666847 GGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGA 54666906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 GGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGA 1330

 54666907 GAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCC 54666966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCC 1390

 54666967 CTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGA 54667026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 CTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGA 1450

 54667027 GCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAG 54667086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 GCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAG 1510

 54667087 ACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGAT 54667146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 ACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGAT 1570

 54667147 ACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAAT 54667206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 ACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAAT 1630

 54667207 GTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATC 54667266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 GTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATC 1690

 54667267 AAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTAT 54667326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 AAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTAT 1750

 54667327 CTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACT 54667386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1751 CTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACT 1810

 54667387 GCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAG 54667446
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1811 GCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAG 1870

 54667447 GCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCT 54667506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 GCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCT 1930

 54667507 TTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTT 54667566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 TTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTT 1990

 54667567 AGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACA 54667626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 AGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACA 2050

 54667627 CCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAA 54667686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 CCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAA 2110

 54667687 AGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCA 54667746
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2111 AGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCA 2170

 54667747 AACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACC 54667806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACC 2230

 54667807 AAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTT 54667866
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2231 AAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTT 2290

 54667867 CAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGG 54667926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 CAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGG 2350

 54667927 TTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCA 54667986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCA 2410

 54667987 ACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTT 54668046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2411 ACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTT 2470

 54668047 GCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCT 54668106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 GCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCT 2530

 54668107 TTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGG 54668166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGG 2590

 54668167 TCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTT 54668226
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTT 2650

 54668227 TGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGT 54668286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 TGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGT 2710

 54668287 CCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGG 54668346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2711 CCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGG 2770

 54668347 AGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATAC 54668406
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 AGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATAC 2830

 54668407 TGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTC 54668466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 TGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTC 2890

 54668467 TGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGA 54668526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 TGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGA 2950

 54668527 TCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCC 54668586
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2951 TCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCC 3010

 54668587 CCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCC 54668646
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3011 CCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCC 3070

 54668647 CACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAAC 54668706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 CACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAAC 3130

 54668707 ACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTT 54668766
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 ACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTT 3190

 54668767 TTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAA 54668826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 TTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAA 3250

 54668827 TGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTA 54668886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 TGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTA 3310

 54668887 GAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCA 54668946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 GAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCA 3370

 54668947 CATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||.|||||||||||||||||||||
     3371 CATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 3397

Alignment time is 2.52775 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7072] =>      7072 nucs 'mol-32-2b4a-127753_7072'

Score:        7038
Aligned:      7071        nucs
Identic:      7068 (100%) nucs =>      1142 (100%)      5926 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54666425,54667566] EXCISED REGION [54667568,54673495]
 second seq =>  [       1,    1142] EXCISED REGION [    1144,    7072]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54667567,54667567]
 second seq =>         1 nucs [1143,1143]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4075,4075]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1143,1143] to [1144,1144]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54666425 GGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGC 54666484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGC 60

 54666485 TGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAG 54666544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAG 120

 54666545 GATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATG 54666604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATG 180

 54666605 GAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATT 54666664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATT 240

 54666665 CTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAG 54666724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAG 300

 54666725 TGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCT 54666784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCT 360

 54666785 CCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGA 54666844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGA 420

 54666845 AGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAA 54666904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAA 480

 54666905 GAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGT 54666964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGT 540

 54666965 CCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTA 54667024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTA 600

 54667025 GAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGA 54667084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGA 660

 54667085 AGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAG 54667144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAG 720

 54667145 ATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAA 54667204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAA 780

 54667205 ATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATA 54667264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATA 840

 54667265 TCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTT 54667324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTT 900

 54667325 ATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAA 54667384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAA 960

 54667385 CTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAG 54667444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAG 1020

 54667445 AGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACAT 54667504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACAT 1080

 54667505 CTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACC 54667564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACC 1140

 54667565 TT 54667566
          ||
     1141 TT 1142

EXCISED REGION

 54667568 GAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACAC 54667627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 GAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACAC 1203

 54667628 CCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAA 54667687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAA 1263

 54667688 GAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAA 54667747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAA 1323

 54667748 ACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCA 54667807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 ACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCA 1383

 54667808 AGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTC 54667867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 AGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTC 1443

 54667868 AGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGT 54667927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 AGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGT 1503

 54667928 TGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAA 54667987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAA 1563

 54667988 CTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTG 54668047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTG 1623

 54668048 CTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTT 54668107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 CTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTT 1683

 54668108 TCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGT 54668167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGT 1743

 54668168 CACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTT 54668227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 CACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTT 1803

 54668228 GAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTC 54668287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 GAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTC 1863

 54668288 CAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGA 54668347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 CAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGA 1923

 54668348 GTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACT 54668407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 GTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACT 1983

 54668408 GATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCT 54668467
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 GATGCAGTGAGCACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCT 2043

 54668468 GCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGAT 54668527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 GCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGAT 2103

 54668528 CTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCC 54668587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCC 2163

 54668588 CTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCC 54668647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCC 2223

 54668648 ACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACA 54668707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 ACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACA 2283

 54668708 CGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTT 54668767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 CGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTT 2343

 54668768 TCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAAT 54668827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAAT 2403

 54668828 GCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAG 54668887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 GCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAG 2463

 54668888 AGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCAC 54668947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 AGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCAC 2523

 54668948 ATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTC 54669007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 ATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTC 2583

 54669008 ACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGT 54669067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 ACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGT 2643

 54669068 GACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCC 54669127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 GACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCC 2703

 54669128 TTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAA 54669187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAA 2763

 54669188 TTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTC 54669247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 TTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTC 2823

 54669248 ATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGA 54669307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 ATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGA 2883

 54669308 AGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAA 54669367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 AGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAA 2943

 54669368 AGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAG 54669427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 AGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAG 3003

 54669428 GACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGAC 54669487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 GACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGAC 3063

 54669488 TCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAAT 54669547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 TCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAAT 3123

 54669548 GTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCA 54669607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 GTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCA 3183

 54669608 AACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTC 54669667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 AACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTC 3243

 54669668 TGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTC 54669727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 TGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTC 3303

 54669728 TTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACT 54669787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 TTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACT 3363

 54669788 AGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGA 54669847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 AGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGA 3423

 54669848 AGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACG 54669907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 AGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACG 3483

 54669908 AGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGA 54669967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 AGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGA 3543

 54669968 GCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCC 54670027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 GCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCC 3603

 54670028 CCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCA 54670087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 CCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCA 3663

 54670088 TGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTT 54670147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 TGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTT 3723

 54670148 ACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTG 54670207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 ACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTG 3783

 54670208 TACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACA 54670267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 TACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACA 3843

 54670268 GAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATG 54670327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 GAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATG 3903

 54670328 GAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCA 54670387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 GAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCA 3963

 54670388 CAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTT 54670447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 CAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTT 4023

 54670448 CGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA-CCCCCCTC 54670506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     4024 CGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCACCCCCCCTC 4083

 54670507 CCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTC 54670566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 CCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTC 4143

 54670567 TCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAG 54670626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 TCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAG 4203

 54670627 TTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAG 54670686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 TTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAG 4263

 54670687 GATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTC 54670746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 GATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTC 4323

 54670747 TTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTC 54670806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 TTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTC 4383

 54670807 TGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTAT 54670866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 TGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTAT 4443

 54670867 TTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTA 54670926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 TTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTA 4503

 54670927 TGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCT 54670986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 TGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCT 4563

 54670987 TGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCA 54671046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 TGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCA 4623

 54671047 TTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCC 54671106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 TTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCC 4683

 54671107 CAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGA 54671166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 CAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGA 4743

 54671167 ATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAA 54671226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 ATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAA 4803

 54671227 ATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAG 54671286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 ATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAG 4863

 54671287 AATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAA 54671346
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4864 AATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAG 4923

 54671347 TATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGA 54671406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 TATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGA 4983

 54671407 CTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTG 54671466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 CTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTG 5043

 54671467 ACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAG 54671526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 ACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAG 5103

 54671527 CACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTC 54671586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 CACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTC 5163

 54671587 ATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGA 54671646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 ATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGA 5223

 54671647 AGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAA 54671706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 AGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAA 5283

 54671707 TTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTA 54671766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 TTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTA 5343

 54671767 CTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCA 54671826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 CTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCA 5403

 54671827 TAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTT 54671886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 TAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTT 5463

 54671887 CCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAAT 54671946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 CCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAAT 5523

 54671947 GTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGG 54672006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 GTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGG 5583

 54672007 GACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATC 54672066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 GACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATC 5643

 54672067 ACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAA 54672126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 ACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAA 5703

 54672127 GAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGA 54672186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 GAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGA 5763

 54672187 ACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAG 54672246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 ACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAG 5823

 54672247 AAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTT 54672306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 AAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTT 5883

 54672307 TATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTC 54672366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5884 TATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTC 5943

 54672367 AAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCA 54672426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5944 AAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCA 6003

 54672427 AGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGG 54672486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6004 AGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGG 6063

 54672487 TCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAAT 54672546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6064 TCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAAT 6123

 54672547 GGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTA 54672606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6124 GGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTA 6183

 54672607 GTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGC 54672666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6184 GTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGC 6243

 54672667 TGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTA 54672726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6244 TGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTA 6303

 54672727 TTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGAT 54672786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6304 TTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGAT 6363

 54672787 CTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGG 54672846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6364 CTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGG 6423

 54672847 TTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGG 54672906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6424 TTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGG 6483

 54672907 AGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 54672966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6484 AGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 6543

 54672967 TTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAA 54673026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6544 TTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAA 6603

 54673027 TTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGC 54673086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6604 TTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGC 6663

 54673087 CTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACT 54673146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 CTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACT 6723

 54673147 CTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCA 54673206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6724 CTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCA 6783

 54673207 GAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGA 54673266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 GAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGA 6843

 54673267 TAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTAT 54673326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 TAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTAT 6903

 54673327 CCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCA 54673386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 CCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCA 6963

 54673387 TTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATA 54673446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6964 TTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATA 7023

 54673447 TGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAG 54673495
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7024 TGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAG 7072

Alignment time is 5.16137 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3431] =>      3431 nucs 'mol-32-2b55-079198_3431'

Score:        3408
Aligned:      3430        nucs
Identic:      3428 (100%) nucs =>       967 (100%)      2461 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669532,54670498] EXCISED REGION [54670499,54672961]
 second seq =>  [       1,     967] EXCISED REGION [     969,    3431]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [968,968]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [54671511,54671511]
 second seq =>         1 nucs [1981,1981]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [968,973] to [969,974]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54669532 AGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAG 54669591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAG 60

 54669592 GTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAG 54669651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAG 120

 54669652 AAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAG 54669711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAG 180

 54669712 AAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAG 54669771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAG 240

 54669772 GAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCA 54669831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCA 300

 54669832 TGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGA 54669891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGA 360

 54669892 CTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGC 54669951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGC 420

 54669952 AGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGC 54670011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGC 480

 54670012 TGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCA 54670071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCA 540

 54670072 TATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTG 54670131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTG 600

 54670132 AGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTAC 54670191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTAC 660

 54670192 AGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGC 54670251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGC 720

 54670252 GCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAA 54670311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAA 780

 54670312 GCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGAC 54670371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGAC 840

 54670372 TAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGA 54670431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGA 900

 54670432 TCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGC 54670491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGC 960

 54670492 TTCCTCA 54670498
          |||||||
      961 TTCCTCA 967

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 1028

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1088

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1148

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1208

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1268

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1328

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1388

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1448

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1508

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1568

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1628

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1688

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1748

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1808

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 1868

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 1928

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1929 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACAACAATAG 1988

 54671519 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 54671578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 2048

 54671579 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 54671638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 2108

 54671639 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 54671698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 2168

 54671699 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 54671758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 2228

 54671759 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 54671818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 2288

 54671819 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 54671878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 2348

 54671879 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 54671938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 2408

 54671939 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 54671998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2409 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCACCAGAAAAAGGTATGAATAA 2468

 54671999 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 54672058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 2528

 54672059 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 54672118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 2588

 54672119 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 54672178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 2648

 54672179 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 54672238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 2708

 54672239 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 54672298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 2768

 54672299 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 54672358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 2828

 54672359 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 54672418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 2888

 54672419 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 54672478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 2948

 54672479 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 54672538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 3008

 54672539 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 54672598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 3068

 54672599 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 54672658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 3128

 54672659 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 54672718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 3188

 54672719 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 54672778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 3248

 54672779 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 54672838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 3308

 54672839 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 54672898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 3368

 54672899 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 54672958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 3428

 54672959 ATA 54672961
          |||
     3429 ATA 3431

Alignment time is 2.55366 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2082] =>      2082 nucs 'mol-32-2b55-079199_2082'

Score:        2044
Aligned:      2044        nucs
Identic:      2044 (100%) nucs =>        12 (100%)      2032 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54661888,54661899] EXCISED REGION [54667497,54669528]
 second seq =>  [      35,      46] EXCISED REGION [      51,    2082]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5597 nucs [54661900,54667496]
 second seq =>         4 nucs [47,50]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [46,46] to [50,50]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54661888 CAGAAAGATGTA 54661899
          ||||||||||||
       35 CAGAAAGATGTA 46

EXCISED REGION

 54667497 TCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGC 54667556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       51 TCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGC 110

 54667557 ATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCC 54667616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      111 ATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCC 170

 54667617 TCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACA 54667676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      171 TCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACA 230

 54667677 GCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTAC 54667736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 GCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTAC 290

 54667737 TATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGT 54667796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 TATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGT 350

 54667797 GCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCT 54667856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 GCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCT 410

 54667857 GCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATC 54667916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 GCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATC 470

 54667917 ATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGC 54667976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 ATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGC 530

 54667977 AAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATC 54668036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 AAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATC 590

 54668037 TGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAG 54668096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 TGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAG 650

 54668097 AGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCAC 54668156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 AGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCAC 710

 54668157 AAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCAC 54668216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 AAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCAC 770

 54668217 CAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAG 54668276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 CAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAG 830

 54668277 AGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATG 54668336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 AGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATG 890

 54668337 TGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTA 54668396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 TGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTA 950

 54668397 ATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACC 54668456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 ATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACC 1010

 54668457 CCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGA 54668516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 CCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGA 1070

 54668517 CTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGT 54668576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 CTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGT 1130

 54668577 TGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACT 54668636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACT 1190

 54668637 GTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGT 54668696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 GTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGT 1250

 54668697 CCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTC 54668756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 CCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTC 1310

 54668757 CTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAG 54668816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 CTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAG 1370

 54668817 CCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATAC 54668876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 CCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATAC 1430

 54668877 CATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAG 54668936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 CATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAG 1490

 54668937 TAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCC 54668996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 TAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCC 1550

 54668997 TGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAA 54669056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 TGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAA 1610

 54669057 CCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTA 54669116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 CCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTA 1670

 54669117 TCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACC 54669176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 TCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACC 1730

 54669177 GTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTG 54669236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 GTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTG 1790

 54669237 TGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCG 54669296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCG 1850

 54669297 TTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCC 54669356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCC 1910

 54669357 CAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTA 54669416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 CAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTA 1970

 54669417 CCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACC 54669476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 CCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACC 2030

 54669477 TATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACT 54669528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 TATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACT 2082

Alignment time is 1.55308 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9983] =>      9983 nucs 'mol-32-2efc-107181_9983'

Score:        9938
Aligned:      9982        nucs
Identic:      9978 (100%) nucs =>       415 (100%)      9563 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663687,54664101] EXCISED REGION [54664103,54673668]
 second seq =>  [       1,     415] EXCISED REGION [     417,    9983]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54664102,54664102]
 second seq =>         1 nucs [416,416]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [6813,6813]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54663687 TATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTAT 54663746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTAT 60

 54663747 ATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTT 54663806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTT 120

 54663807 CATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAA 54663866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAA 180

 54663867 ATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAA 54663926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAA 240

 54663927 AGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGA 54663986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGA 300

 54663987 CATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAA 54664046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAA 360

 54664047 AAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTT 54664101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTT 415

EXCISED REGION

 54664103 CCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGC 54664162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 CCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGC 476

 54664163 ATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTG 54664222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 ATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTG 536

 54664223 ATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAA 54664282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 ATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAA 596

 54664283 AATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAG 54664342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 AATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAG 656

 54664343 GGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGT 54664402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 GGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGT 716

 54664403 CATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCC 54664462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 CATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCC 776

 54664463 CAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGC 54664522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 CAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGC 836

 54664523 TGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTT 54664582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTT 896

 54664583 GCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTG 54664642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTG 956

 54664643 CATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTC 54664702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTC 1016

 54664703 TTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCC 54664762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCC 1076

 54664763 TATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAG 54664822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAG 1136

 54664823 TAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAA 54664882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAA 1196

 54664883 AGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATA 54664942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 AGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATA 1256

 54664943 ATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCC 54665002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 ATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCC 1316

 54665003 CTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTA 54665062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTA 1376

 54665063 ATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATT 54665122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 ATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATT 1436

 54665123 TAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTT 54665182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTT 1496

 54665183 TAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCA 54665242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCA 1556

 54665243 AATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCT 54665302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 AATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCT 1616

 54665303 ACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTA 54665362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 ACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTA 1676

 54665363 AGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAAT 54665422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAAT 1736

 54665423 GTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGG 54665482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGG 1796

 54665483 TTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATC 54665542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATC 1856

 54665543 AATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACA 54665602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 AATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACA 1916

 54665603 AGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAG 54665662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAG 1976

 54665663 GTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGT 54665722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGT 2036

 54665723 AAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGG 54665782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGG 2096

 54665783 CTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAG 54665842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAG 2156

 54665843 GGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGA 54665902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGA 2216

 54665903 TGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAAT 54665962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAAT 2276

 54665963 TGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATG 54666022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATG 2336

 54666023 GGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACA 54666082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACA 2396

 54666083 CATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTC 54666142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTC 2456

 54666143 TCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTG 54666202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTG 2516

 54666203 TCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTT 54666262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTT 2576

 54666263 CTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGT 54666322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGT 2636

 54666323 TGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCT 54666382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCT 2696

 54666383 TGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGG 54666442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGG 2756

 54666443 GGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCA 54666502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCA 2816

 54666503 CCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCC 54666562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCC 2876

 54666563 TTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACT 54666622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACT 2936

 54666623 AAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAA 54666682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 AAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAA 2996

 54666683 ATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTG 54666742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 ATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTG 3056

 54666743 CTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCA 54666802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCA 3116

 54666803 ACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACC 54666862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 ACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACC 3176

 54666863 AACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTA 54666922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 AACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTA 3236

 54666923 GAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATG 54666982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATG 3296

 54666983 GATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACT 54667042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACT 3356

 54667043 GGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCA 54667102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCA 3416

 54667103 TAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTA 54667162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTA 3476

 54667163 AACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAG 54667222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 AACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAG 3536

 54667223 TTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTG 54667282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTG 3596

 54667283 TAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGG 54667342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 TAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGG 3656

 54667343 GCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAG 54667402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAG 3716

 54667403 CCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGAC 54667462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGAC 3776

 54667463 AATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTA 54667522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 AATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTA 3836

 54667523 ACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCT 54667582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 ACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCT 3896

 54667583 AAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCC 54667642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 AAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCC 3956

 54667643 TACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTT 54667702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 TACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTT 4016

 54667703 CTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGG 54667762
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CTCTGGAAAACGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGG 4076

 54667763 CCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCAT 54667822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 CCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCAT 4136

 54667823 GAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAA 54667882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAA 4196

 54667883 TGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCT 54667942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCT 4256

 54667943 GAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTT 54668002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 GAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTT 4316

 54668003 CTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAA 54668062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 CTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAA 4376

 54668063 GCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCAC 54668122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCAC 4436

 54668123 ATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAA 54668182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 ATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAA 4496

 54668183 TGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATG 54668242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 TGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATG 4556

 54668243 ATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGA 54668302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 ATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGA 4616

 54668303 AGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCC 54668362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 AGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCC 4676

 54668363 CCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACA 54668422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 CCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACA 4736

 54668423 AGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTA 54668482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 AGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTA 4796

 54668483 AAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTA 54668542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 AAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTA 4856

 54668543 GCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCA 54668602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 GCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCA 4916

 54668603 CATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAA 54668662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 CATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAA 4976

 54668663 GGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAG 54668722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAG 5036

 54668723 ACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATT 54668782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 ACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATT 5096

 54668783 AGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACT 54668842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 AGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACT 5156

 54668843 GGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTA 54668902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 GGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTA 5216

 54668903 AATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTC 54668962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 AATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTC 5276

 54668963 GCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTG 54669022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 GCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTG 5336

 54669023 GCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAG 54669082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 GCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAG 5396

 54669083 GGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAG 54669142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 GGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAG 5456

 54669143 ATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGC 54669202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 ATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGC 5516

 54669203 CTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTG 54669262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 CTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTG 5576

 54669263 GTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAAT 54669322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 GTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAAT 5636

 54669323 GCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATA 54669382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATA 5696

 54669383 GCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCC 54669442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 GCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCC 5756

 54669443 TTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCA 54669502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 TTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCA 5816

 54669503 TGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCC 54669562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCC 5876

 54669563 CTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCA 54669622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCA 5936

 54669623 AGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGAC 54669682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 AGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGAC 5996

 54669683 CCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGA 54669742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 CCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGA 6056

 54669743 GCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCA 54669802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCA 6116

 54669803 TTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCT 54669862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 TTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCT 6176

 54669863 CTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGC 54669922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 CTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGC 6236

 54669923 TGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCA 54669982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCA 6296

 54669983 CAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAA 54670042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 CAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAA 6356

 54670043 TATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGC 54670102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 TATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGC 6416

 54670103 TGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGAC 54670162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 TGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGAC 6476

 54670163 AGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTA 54670222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 AGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTA 6536

 54670223 GATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCT 54670282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 GATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCT 6596

 54670283 GGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGG 54670342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 GGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGG 6656

 54670343 GTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTG 54670402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 GTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTG 6716

 54670403 CCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCAT 54670462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 CCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCAT 6776

 54670463 CAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA-CCCCCCTCCCCACACACGCCTCC 54670521
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     6777 CAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCACCCCCCCTCCCCACACACGCCTCC 6836

 54670522 CTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTCTCCTCAAATTACCCA 54670581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 CTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTCTCCTCAAATTACCCA 6896

 54670582 ATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGA 54670641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 ATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGA 6956

 54670642 GTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCT 54670701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 GTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCT 7016

 54670702 AATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTCTTTTCTTTTAACATT 54670761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 AATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTCTTTTCTTTTAACATT 7076

 54670762 TTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTCTGCCAAATTACACTG 54670821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTCTGCCAAATTACACTG 7136

 54670822 TAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTATTTGCAAATTTATTTT 54670881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 TAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTATTTGCAAATTTATTTT 7196

 54670882 GCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTATGGGAAATATTTTAA 54670941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 GCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTATGGGAAATATTTTAA 7256

 54670942 CAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCTTGCCTGTGTATATCT 54671001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 CAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCTTGCCTGTGTATATCT 7316

 54671002 AATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTG 54671061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 AATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTG 7376

 54671062 TGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGA 54671121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 TGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGA 7436

 54671122 ATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTA 54671181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 ATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTA 7496

 54671182 GCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAAATCCAAACACAGGCA 54671241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 GCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAAATCCAAACACAGGCA 7556

 54671242 AAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAGAATAACATGATATTT 54671301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 AAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAGAATAACATGATATTT 7616

 54671302 AGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAATATACTTCAATAGCT 54671361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 AGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAATATACTTCAATAGCT 7676

 54671362 TGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATG 54671421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 TGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATG 7736

 54671422 CTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCA 54671481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 CTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCA 7796

 54671482 GTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCA 54671541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 GTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCA 7856

 54671542 AAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCA 54671601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 AAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCA 7916

 54671602 AAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCA 54671661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 AAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCA 7976

 54671662 TAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATT 54671721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 TAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATT 8036

 54671722 CAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAG 54671781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 CAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAG 8096

 54671782 AAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATA 54671841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 AAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATA 8156

 54671842 TATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATC 54671901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 TATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATC 8216

 54671902 TTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTT 54671961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 TTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTT 8276

 54671962 CAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCAC 54672021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 CAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCAC 8336

 54672022 CCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGG 54672081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 CCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGG 8396

 54672082 TTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAA 54672141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 TTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAA 8456

 54672142 AGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCA 54672201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8457 AGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCA 8516

 54672202 TGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCG 54672261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8517 TGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCG 8576

 54672262 GGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTA 54672321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8577 GGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTA 8636

 54672322 AAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCA 54672381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8637 AAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCA 8696

 54672382 CTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCG 54672441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8697 CTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCG 8756

 54672442 GTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAG 54672501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8757 GTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAG 8816

 54672502 CCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAG 54672561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8817 CCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAG 8876

 54672562 GACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCC 54672621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8877 GACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCC 8936

 54672622 CACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGA 54672681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8937 CACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGA 8996

 54672682 AAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATT 54672741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8997 AAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATT 9056

 54672742 ACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAG 54672801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9057 ACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAG 9116

 54672802 TTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATC 54672861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9117 TTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATC 9176

 54672862 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCC 54672921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9177 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCC 9236

 54672922 TGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGG 54672981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9237 TGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGG 9296

 54672982 TGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGG 54673041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9297 TGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGG 9356

 54673042 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGT 54673101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9357 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGT 9416

 54673102 GAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACTCTTTTACACTATATT 54673161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9417 GAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACTCTTTTACACTATATT 9476

 54673162 CTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATG 54673221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9477 CTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATG 9536

 54673222 AGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGATAAACTCTGTTCTCT 54673281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9537 AGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGATAAACTCTGTTCTCT 9596

 54673282 TGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGA 54673341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9597 TGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGA 9656

 54673342 CTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTT 54673401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9657 CTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTT 9716

 54673402 TTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAG 54673461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9717 TTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAG 9776

 54673462 AAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAAT 54673521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9777 AAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAAT 9836

 54673522 AGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGTTGCACAGCTGTATATGTTTGTCA 54673581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9837 AGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGTTGCACAGCTGTATATGTTTGTCA 9896

 54673582 AAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTTTAAGTTTTACTGCATGTATCATA 54673641
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
     9897 AAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTTCAAGTTTTACTGCATGTATCATG 9956

 54673642 TACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATT 54673668
          |||||||||||||||||||||||||||
     9957 TACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATT 9983

Alignment time is 7.23677 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   12375] =>     12375 nucs 'mol-32-2fc2-123435_12375'

Score:       12352
Aligned:     12374        nucs
Identic:     12372 (100%) nucs =>       803 (100%)     11569 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54661187,54661989] EXCISED REGION [54661991,54673560]
 second seq =>  [       1,     803] EXCISED REGION [     805,   12375]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54661990,54661990]
 second seq =>         1 nucs [804,804]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [9313,9313]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54661989,54661989] to [54661991,54661991]
 second seq =>         1 nucs [803,803] to [805,805]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54661187 TTATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGGAGTTTTAAATGAAAAATAACTGAT 54661246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGGAGTTTTAAATGAAAAATAACTGAT 60

 54661247 GCTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATAATTTCTATTTATGAAAACGGTCCC 54661306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATAATTTCTATTTATGAAAACGGTCCC 120

 54661307 TCTTTAATAACTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAAGAATTTTCCTCTGAGAGATTTTAC 54661366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTTAATAACTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAAGAATTTTCCTCTGAGAGATTTTAC 180

 54661367 ATTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTAAACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAA 54661426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTAAACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAA 240

 54661427 GAAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGTTTAACTGCTGCTGTCACATGGAAA 54661486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGTTTAACTGCTGCTGTCACATGGAAA 300

 54661487 AAAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTGAAAACATAAATATCACAAATGACC 54661546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTGAAAACATAAATATCACAAATGACC 360

 54661547 TTGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGGCTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGA 54661606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGGCTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGA 420

 54661607 ATGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAA 54661666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAA 480

 54661667 AAAATGAGCAGATAGGGAGGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTT 54661726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATGAGCAGATAGGGAGGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTT 540

 54661727 TTAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAA 54661786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAA 600

 54661787 AAAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGG 54661846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGG 660

 54661847 AATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAA 54661906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAA 720

 54661907 TGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTG 54661966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTG 780

 54661967 AGAGAGATGCAGGTATATTGGTG 54661989
          |||||||||||||||||||||||
      781 AGAGAGATGCAGGTATATTGGTG 803

EXCISED REGION

 54661991 GGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGA 54662050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 GGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGA 864

 54662051 GACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAA 54662110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 GACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAA 924

 54662111 ACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTT 54662170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 ACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTT 984

 54662171 TTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGC 54662230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 TTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGC 1044

 54662231 CAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGG 54662290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 CAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGG 1104

 54662291 CTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGA 54662350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 CTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGA 1164

 54662351 GCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAA 54662410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 GCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAA 1224

 54662411 GTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGT 54662470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGT 1284

 54662471 CATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCA 54662530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 CATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCA 1344

 54662531 AGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTT 54662590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 AGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTT 1404

 54662591 CCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAA 54662650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAA 1464

 54662651 CACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACA 54662710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACA 1524

 54662711 AAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCAT 54662770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 AAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCAT 1584

 54662771 AAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTC 54662830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 AAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTC 1644

 54662831 GAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAA 54662890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 GAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAA 1704

 54662891 TCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAA 54662950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAA 1764

 54662951 GAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTC 54663010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 GAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTC 1824

 54663011 AGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAA 54663070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 AGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAA 1884

 54663071 AAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGG 54663130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 AAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGG 1944

 54663131 AGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATC 54663190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 AGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATC 2004

 54663191 TGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTT 54663250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTT 2064

 54663251 TGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGC 54663310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGC 2124

 54663311 TCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTAC 54663370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTAC 2184

 54663371 AGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCT 54663430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCT 2244

 54663431 CTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAG 54663490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 CTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAG 2304

 54663491 ATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTA 54663550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 ATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTA 2364

 54663551 TTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGG 54663610
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAGTAATACATGATCTCAACTGATATTTTGG 2424

 54663611 AAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAA 54663670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 AAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAA 2484

 54663671 TAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATAT 54663730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATAT 2544

 54663731 TTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTG 54663790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 TTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTG 2604

 54663791 TACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATA 54663850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATA 2664

 54663851 TAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGT 54663910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGT 2724

 54663911 TTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGT 54663970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGT 2784

 54663971 AATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAG 54664030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 AATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAG 2844

 54664031 TTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTT 54664090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 TTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTT 2904

 54664091 CCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAA 54664150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 CCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAA 2964

 54664151 GACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAA 54664210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 GACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAA 3024

 54664211 ACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAA 54664270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 ACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAA 3084

 54664271 GCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCT 54664330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 GCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCT 3144

 54664331 CTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGC 54664390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 CTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGC 3204

 54664391 TCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCC 54664450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 TCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCC 3264

 54664451 AGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAA 54664510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 AGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAA 3324

 54664511 GAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACA 54664570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 GAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACA 3384

 54664571 GGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTG 54664630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 GGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTG 3444

 54664631 AATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGG 54664690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 AATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGG 3504

 54664691 ATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGT 54664750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 ATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGT 3564

 54664751 TAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATAT 54664810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 TAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATAT 3624

 54664811 TGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATT 54664870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 TGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATT 3684

 54664871 ATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTT 54664930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 ATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTT 3744

 54664931 CCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCAT 54664990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 CCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCAT 3804

 54664991 CCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAA 54665050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 CCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAA 3864

 54665051 CACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAAT 54665110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 CACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAAT 3924

 54665111 GTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACA 54665170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 GTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACA 3984

 54665171 ATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCAC 54665230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 ATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCAC 4044

 54665231 TAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTC 54665290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 TAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTC 4104

 54665291 TGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATT 54665350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATT 4164

 54665351 CTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGT 54665410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 CTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGT 4224

 54665411 GATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAA 54665470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 GATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAA 4284

 54665471 ATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAA 54665530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 ATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAA 4344

 54665531 AATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCA 54665590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 AATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCA 4404

 54665591 GTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATC 54665650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 GTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATC 4464

 54665651 ATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCT 54665710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 ATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCT 4524

 54665711 GGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAAC 54665770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 GGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAAC 4584

 54665771 TAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCAC 54665830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 TAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCAC 4644

 54665831 CAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAG 54665890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 CAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAG 4704

 54665891 TGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAG 54665950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 TGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAG 4764

 54665951 TTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGA 54666010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 TTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGA 4824

 54666011 CCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAA 54666070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 CCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAA 4884

 54666071 TACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATT 54666130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 TACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATT 4944

 54666131 TTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAG 54666190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 TTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAG 5004

 54666191 CAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTG 54666250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 CAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTG 5064

 54666251 GAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTT 54666310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 GAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTT 5124

 54666311 TCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTC 54666370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 TCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTC 5184

 54666371 CTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCA 54666430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 CTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCA 5244

 54666431 GAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAA 54666490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 GAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAA 5304

 54666491 GGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTC 54666550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 GGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTC 5364

 54666551 GGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCT 54666610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 GGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCT 5424

 54666611 TCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCC 54666670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 TCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCC 5484

 54666671 ACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAAC 54666730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 ACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAAC 5544

 54666731 ATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGA 54666790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 ATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGA 5604

 54666791 AACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGG 54666850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 AACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGG 5664

 54666851 ACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAAT 54666910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 ACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAAT 5724

 54666911 AAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTAT 54666970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 AAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTAT 5784

 54666971 AGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAG 54667030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 AGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAG 5844

 54667031 TGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGT 54667090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 TGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGT 5904

 54667091 TTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCA 54667150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 TTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCA 5964

 54667151 GGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCA 54667210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 GGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCA 6024

 54667211 ACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAAT 54667270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 ACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAAT 6084

 54667271 TAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCC 54667330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 TAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCC 6144

 54667331 TGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAG 54667390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 TGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAG 6204

 54667391 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 54667450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 6264

 54667451 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 54667510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 6324

 54667511 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 54667570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 6384

 54667571 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 54667630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 6444

 54667631 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 54667690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 6504

 54667691 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 54667750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 6564

 54667751 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 54667810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 6624

 54667811 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 54667870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 6684

 54667871 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 54667930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 6744

 54667931 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 54667990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 6804

 54667991 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 54668050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 6864

 54668051 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 54668110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 6924

 54668111 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 54668170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6925 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 6984

 54668171 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 54668230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6985 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 7044

 54668231 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 54668290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7045 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 7104

 54668291 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 54668350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7105 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 7164

 54668351 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 54668410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7165 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 7224

 54668411 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 54668470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7225 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 7284

 54668471 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 54668530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7285 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 7344

 54668531 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTG 54668590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7345 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTG 7404

 54668591 GCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACA 54668650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7405 GCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACA 7464

 54668651 ATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGG 54668710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7465 ATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGG 7524

 54668711 TAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCT 54668770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7525 TAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCT 7584

 54668771 GGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCT 54668830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7585 GGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCT 7644

 54668831 TCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGA 54668890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7645 TCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGA 7704

 54668891 ATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATC 54668950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7705 ATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATC 7764

 54668951 CTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACC 54669010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7765 CTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACC 7824

 54669011 AGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGAC 54669070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7825 AGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGAC 7884

 54669071 TTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTT 54669130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7885 TTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTT 7944

 54669131 CCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTG 54669190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7945 CCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTG 8004

 54669191 GGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATC 54669250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8005 GGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATC 8064

 54669251 CATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGG 54669310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8065 CATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGG 8124

 54669311 ATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGT 54669370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8125 ATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGT 8184

 54669371 TCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGAC 54669430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8185 TCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGAC 8244

 54669431 ACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCA 54669490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8245 ACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCA 8304

 54669491 AGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTT 54669550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8305 AGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTT 8364

 54669551 TGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAAC 54669610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8365 TGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAAC 8424

 54669611 TATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGG 54669670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8425 TATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGG 8484

 54669671 GCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTA 54669730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8485 GCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTA 8544

 54669731 TCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGA 54669790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8545 TCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGA 8604

 54669791 GAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGA 54669850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8605 GAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGA 8664

 54669851 TGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGA 54669910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8665 TGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGA 8724

 54669911 ATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCC 54669970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8725 ATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCC 8784

 54669971 AGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCT 54670030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8785 AGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCT 8844

 54670031 GGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGA 54670090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8845 GGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGA 8904

 54670091 TGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACC 54670150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8905 TGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACC 8964

 54670151 TGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTAC 54670210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8965 TGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTAC 9024

 54670211 ACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAG 54670270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9025 ACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAG 9084

 54670271 CCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAA 54670330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9085 CCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAA 9144

 54670331 GGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAG 54670390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9145 GGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAG 9204

 54670391 AGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGG 54670450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9205 AGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGG 9264

 54670451 CCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA-CCCCCCTCCCC 54670509
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     9265 CCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCACCCCCCCTCCCC 9324

 54670510 ACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTCTCC 54670569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9325 ACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTCTCC 9384

 54670570 TCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAGTTT 54670629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9385 TCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAGTTT 9444

 54670630 CTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAGGAT 54670689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9445 CTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAGGAT 9504

 54670690 TTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTCTTT 54670749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9505 TTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTCTTT 9564

 54670750 TCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTCTGC 54670809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9565 TCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTCTGC 9624

 54670810 CAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTATTTG 54670869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9625 CAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTATTTG 9684

 54670870 CAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTATGG 54670929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9685 CAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTATGG 9744

 54670930 GAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCTTGC 54670989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9745 GAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCTTGC 9804

 54670990 CTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCATTT 54671049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9805 CTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCATTT 9864

 54671050 GCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCCCAG 54671109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9865 GCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCCCAG 9924

 54671110 CTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGAATC 54671169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9925 CTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGAATC 9984

 54671170 TTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAAATC 54671229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9985 TTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAAATC 10044

 54671230 CAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAGAAT 54671289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10045 CAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAGAAT 10104

 54671290 AACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAATAT 54671349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10105 AACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAATAT 10164

 54671350 ACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTA 54671409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10165 ACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTA 10224

 54671410 TATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACT 54671469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10225 TATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACT 10284

 54671470 CATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCAC 54671529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10285 CATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCAC 10344

 54671530 TTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATC 54671589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10345 TTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATC 10404

 54671590 AGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGG 54671649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10405 AGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGG 10464

 54671650 TGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTT 54671709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10465 TGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTT 10524

 54671710 GAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTT 54671769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10525 GAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTT 10584

 54671770 TGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAG 54671829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10585 TGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAG 10644

 54671830 TATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCT 54671889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10645 TATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCT 10704

 54671890 GGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTT 54671949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10705 GGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTT 10764

 54671950 GACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGAC 54672009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10765 GACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGAC 10824

 54672010 TTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACC 54672069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10825 TTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACC 10884

 54672070 AAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAG 54672129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10885 AAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAG 10944

 54672130 AACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACA 54672189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10945 AACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACA 11004

 54672190 AGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAA 54672249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11005 AGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAA 11064

 54672250 CGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTAT 54672309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11065 CGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTAT 11124

 54672310 TCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAG 54672369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11125 TCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAG 11184

 54672370 TTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGT 54672429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11185 TTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGT 11244

 54672430 TGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCT 54672489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11245 TGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCT 11304

 54672490 TGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGA 54672549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11305 TGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGA 11364

 54672550 ACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTG 54672609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11365 ACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTG 11424

 54672610 GTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGT 54672669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11425 GTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGT 11484

 54672670 AAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTA 54672729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11485 AAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTA 11544

 54672730 AATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTG 54672789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11545 AATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTG 11604

 54672790 TTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTC 54672849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11605 TTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTC 11664

 54672850 ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGT 54672909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11665 ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGT 11724

 54672910 TCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTA 54672969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11725 TCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTA 11784

 54672970 GCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTG 54673029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11785 GCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTG 11844

 54673030 CTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 54673089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11845 CTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 11904

 54673090 GGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACTCTT 54673149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11905 GGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACTCTT 11964

 54673150 TTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCAGAA 54673209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11965 TTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCAGAA 12024

 54673210 AAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGATAA 54673269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12025 AAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGATAA 12084

 54673270 ACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCC 54673329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12085 ACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCC 12144

 54673330 AGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTA 54673389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12145 AGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTA 12204

 54673390 GGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGC 54673449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12205 GGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGC 12264

 54673450 CATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATT 54673509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12265 CATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATT 12324

 54673510 TTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGTTG 54673560
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12325 TTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGTTG 12375

Alignment time is 8.93786 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6406] =>      6406 nucs 'mol-32-2fcd-060599_6406'

Score:        6120
Aligned:      6408        nucs
Identic:      6381 (100%) nucs =>      5242 (100%)      1139 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663714,54668973] EXCISED REGION [54669540,54670685]
 second seq =>  [       1,    5261] EXCISED REGION [    5262,    6406]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54663714 ATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATAT 54663773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATAT 60

 54663774 CTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATA 54663833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATA 120

 54663834 AAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATG 54663893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATG 180

 54663894 GGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTC 54663953
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      181 GGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTT 240

 54663954 AACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCA 54664013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCA 300

 54664014 CAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAA 54664073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAA 360

 54664074 AATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATAT 54664133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATAT 420

 54664134 GGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTT 54664193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTT 480

 54664194 CTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATC 54664253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATC 540

 54664254 AGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTC 54664313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTC 600

 54664314 TCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTT 54664373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTT 660

 54664374 GCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGC 54664433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGC 720

 54664434 AAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTT 54664493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTT 780

 54664494 CTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGT 54664553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      781 CTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTTTGTGGT 840

 54664554 TCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGAT 54664613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGAT 900

 54664614 GTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCC 54664673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCC 960

 54664674 TCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAG 54664733
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAG 1020

 54664734 TGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGC 54664793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGC 1080

 54664794 TGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTA 54664853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTA 1140

 54664854 TAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATT 54664913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATT 1200

 54664914 GGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAA 54664973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAA 1260

 54664974 TTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTT 54665033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTT 1320

 54665034 TAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGAT 54665093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGAT 1380

 54665094 CAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACAT 54665153
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACAT 1440

 54665154 TAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAA 54665213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAA 1500

 54665214 ATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTG 54665273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTG 1560

 54665274 ATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTG 54665333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTG 1620

 54665334 GTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGG 54665393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGG 1680

 54665394 AGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAG 54665453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAG 1740

 54665454 AAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAAC 54665513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAAC 1800

 54665514 TTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAG 54665573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAG 1860

 54665574 AATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAAT 54665633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAAT 1920

 54665634 GTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGT 54665693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGT 1980

 54665694 TCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTA 54665753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTA 2040

 54665754 TCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACA 54665813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACA 2100

 54665814 AAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGA 54665873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGA 2160

 54665874 AGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCC 54665933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCC 2220

 54665934 GAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCA 54665992
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCA 2280

 54665993 CTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATA 54666052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATA 2340

 54666053 TGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGG 54666112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGG 2400

 54666113 GATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCT 54666172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCT 2460

 54666173 GCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGT 54666232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGT 2520

 54666233 TCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCT 54666292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCT 2580

 54666293 AAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACAC 54666352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACAC 2640

 54666353 CTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAG 54666412
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2641 CTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAG 2700

 54666413 CAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTG 54666472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTG 2760

 54666473 CAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAA 54666532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAA 2820

 54666533 ATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTA 54666592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTA 2880

 54666593 GAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGG 54666652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGG 2940

 54666653 TTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATT 54666712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATT 3000

 54666713 GCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTA 54666772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTA 3060

 54666773 CTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCT 54666832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCT 3120

 54666833 TTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAA 54666892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAA 3180

 54666893 ATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCT 54666952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCT 3240

 54666953 GTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTT 54667012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTT 3300

 54667013 CTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTT 54667072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTT 3360

 54667073 GGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCA 54667132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCA 3420

 54667133 TCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTT 54667192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTT 3480

 54667193 ATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGA 54667252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGA 3540

 54667253 AAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTG 54667312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTG 3600

 54667313 AAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCAT 54667372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCAT 3660

 54667373 CTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGT 54667432
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3661 CTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGT 3720

 54667433 GTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTA 54667492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTA 3780

 54667493 GAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCT 54667552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCT 3840

 54667553 TTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTT 54667612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTT 3900

 54667613 TTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAG 54667672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAG 3960

 54667673 TACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGT 54667732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGT 4020

 54667733 CTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCA 54667792
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCA 4080

 54667793 GGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAAT 54667852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4081 GGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAAT 4140

 54667853 CTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTA 54667912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTA 4200

 54667913 GATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAA 54667972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAA 4260

 54667973 GTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGT 54668032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4261 GTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGT 4320

 54668033 CATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATT 54668092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATT 4380

 54668093 CTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAAT 54668152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAAT 4440

 54668153 TCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAA 54668212
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAA 4500

 54668213 GCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCA 54668272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCA 4560

 54668273 CCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGC 54668332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGC 4620

 54668333 AATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGAC 54668392
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4621 AATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGAC 4680

 54668393 ATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGT 54668452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGT 4740

 54668453 GACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAAT 54668512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAAT 4800

 54668513 TAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGA 54668572
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4801 TAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGA 4860

 54668573 TAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATG 54668632
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4861 TAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATG 4920

 54668633 AACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGC 54668692
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGC 4980

 54668693 CAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAA 54668752
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAA 5040

 54668753 TTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATG 54668812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATG 5100

 54668813 GAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAA 54668872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAA 5160

 54668873 ATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCT 54668932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCT 5220

 54668933 TGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5221 TGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 5261

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 5321

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 5381

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 5441

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 5501

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 5561

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5562 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 5621

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 5681

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 5741

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5742 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 5801

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 5861

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 5921

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 5981

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 6041

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 6101

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 6161

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     6162 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 6221

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6222 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 6281

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 6341

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     6342 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 6399

 54670679 TCTAAAA 54670685
          |||||||
     6400 TCTAAAA 6406

Alignment time is 4.70788 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7597] =>      7597 nucs 'mol-32-2fe3-007357_7597'

Score:        7279
Aligned:      7600        nucs
Identic:      7570 (100%) nucs =>      5894 (100%)      1676 ( 99%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663061,54668973] EXCISED REGION [54669540,54671224]
 second seq =>  [       1,    5914] EXCISED REGION [    5915,    7597]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54663061 TATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGG 54663120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGG 60

 54663121 AAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAG 54663180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
       61 AAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAAAACAGGCCAAGAAATTAGAAG 120

 54663181 CCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCG 54663240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCG 180

 54663241 TCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTC 54663300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTC 240

 54663301 AAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTC 54663360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTC 300

 54663361 CCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGC 54663420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGC 360

 54663421 ATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCC 54663480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCC 420

 54663481 CAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAA 54663540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAA 480

 54663541 CATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACT 54663600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACT 540

 54663601 GATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATA 54663660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATA 600

 54663661 ATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACA 54663720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACA 660

 54663721 TTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAA 54663780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAA 720

 54663781 AACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGC 54663840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGC 780

 54663841 TCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCC 54663900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCC 840

 54663901 TCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAG 54663960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      841 TCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTTAACAAAG 900

 54663961 AGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGA 54664020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGA 960

 54664021 ATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCG 54664080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCG 1020

 54664081 GTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCA 54664140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCA 1080

 54664141 GCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTG 54664200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTG 1140

 54664201 TGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACT 54664260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACT 1200

 54664261 GCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTC 54664320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTC 1260

 54664321 AGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATT 54664380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATT 1320

 54664381 AAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGAC 54664440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGAC 1380

 54664441 AGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAA 54664500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAA 1440

 54664501 TTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGT 54664560
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1441 TTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTTTGTGGTTCTGTGT 1500

 54664561 CATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCAT 54664620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCAT 1560

 54664621 TCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTG 54664680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTG 1620

 54664681 TAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATA 54664740
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATA 1680

 54664741 GAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTA 54664800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTA 1740

 54664801 GAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTG 54664860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTG 1800

 54664861 TTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGT 54664920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGT 1860

 54664921 CTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGA 54664980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGA 1920

 54664981 GAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGG 54665040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGG 1980

 54665041 CAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGT 54665100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGT 2040

 54665101 AAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGT 54665160
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGT 2100

 54665161 TTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATAT 54665220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATAT 2160

 54665221 TTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGG 54665280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGG 2220

 54665281 AGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGA 54665340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGA 2280

 54665341 GGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTT 54665400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTT 2340

 54665401 GAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAA 54665460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAA 2400

 54665461 GGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTT 54665520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTT 2460

 54665521 ACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATA 54665580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATA 2520

 54665581 ATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGC 54665640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGC 2580

 54665641 CTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGT 54665700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGT 2640

 54665701 TTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGG 54665760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGG 2700

 54665761 AGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGA 54665820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGA 2760

 54665821 ACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGA 54665880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGA 2820

 54665881 ACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAG 54665940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAG 2880

 54665941 AATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAAT 54665999
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAAT 2940

 54666000 TTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAA 54666059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAA 3000

 54666060 AAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTT 54666119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTT 3060

 54666120 TTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACA 54666179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACA 3120

 54666180 ATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCC 54666239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCC 3180

 54666240 TTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTG 54666299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTG 3240

 54666300 GTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTA 54666359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTA 3300

 54666360 AAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGG 54666419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3301 AAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAGCAGAAGG 3360

 54666420 GAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGA 54666479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGA 3420

 54666480 GTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTT 54666539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTT 3480

 54666540 CTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGG 54666599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGG 3540

 54666600 GAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCT 54666659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCT 3600

 54666660 ACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAA 54666719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAA 3660

 54666720 TTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAA 54666779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAA 3720

 54666780 TAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCAT 54666839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCAT 3780

 54666840 AGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAG 54666899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAG 3840

 54666900 TGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAA 54666959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAA 3900

 54666960 TTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAG 54667019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAG 3960

 54667020 CTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATG 54667079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATG 4020

 54667080 TCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTG 54667139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTG 4080

 54667140 GATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAAC 54667199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAAC 4140

 54667200 CCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGT 54667259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGT 4200

 54667260 GAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATC 54667319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATC 4260

 54667320 TCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCA 54667379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCA 4320

 54667380 CAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGC 54667439
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4321 CAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGC 4380

 54667440 TACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCC 54667499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCC 4440

 54667500 CACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATA 54667559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATA 4500

 54667560 AAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCA 54667619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCA 4560

 54667620 GAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCC 54667679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCC 4620

 54667680 AGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTAT 54667739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTAT 4680

 54667740 CACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCA 54667799
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCA 4740

 54667800 TCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCA 54667859
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4741 TCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCA 4800

 54667860 CTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATC 54667919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATC 4860

 54667920 CGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAA 54667979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAA 4920

 54667980 TCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGG 54668039
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4921 TCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGG 4980

 54668040 GGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGC 54668099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGC 5040

 54668100 AGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAA 54668159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAA 5100

 54668160 GCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAG 54668219
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAG 5160

 54668220 TGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGG 54668279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGG 5220

 54668280 AAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGA 54668339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGA 5280

 54668340 ATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATC 54668399
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5281 ATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATC 5340

 54668400 AGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCC 54668459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCC 5400

 54668460 TGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTA 54668519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTA 5460

 54668520 GCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGC 54668579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5461 GCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGC 5520

 54668580 TGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTG 54668639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||
     5521 TGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTG 5580

 54668640 TCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCC 54668699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCC 5640

 54668700 TGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTT 54668759
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTT 5700

 54668760 GTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCC 54668819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCC 5760

 54668820 CTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCAT 54668879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCAT 5820

 54668880 TTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAA 54668939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAA 5880

 54668940 CCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5881 CCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 5914

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 5974

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 6034

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 6094

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 6154

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6155 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGACACAG 6214

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6215 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 6274

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 6334

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 6394

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6395 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 6454

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 6514

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 6574

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 6634

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 6694

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6695 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 6754

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 6814

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     6815 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 6874

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6875 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 6934

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 6994

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     6995 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 7052

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7053 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 7112

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7113 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 7171

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 7231

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 7291

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 7351

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7352 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 7411

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7412 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 7471

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7472 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 7531

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7532 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 7591

 54671219 CATTTA 54671224
          ||||||
     7592 CATTTA 7597

Alignment time is 5.58728 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8835] =>      8835 nucs 'mol-32-3004-217418_8835'

Score:        8834
Aligned:      8834        nucs
Identic:      8834 (100%) nucs =>      7812 (100%)      1022 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54662687,54670498] EXCISED REGION [54670499,54671520]
 second seq =>  [       1,    7812] EXCISED REGION [    7814,    8835]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [7813,7813]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [7813,7818] to [7814,7819]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54662687 ATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTC 54662746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTC 60

 54662747 GTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATT 54662806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATT 120

 54662807 CAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAA 54662866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAA 180

 54662867 ACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGA 54662926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGA 240

 54662927 ACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGA 54662986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGA 300

 54662987 GATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATG 54663046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATG 360

 54663047 AATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAAC 54663106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAAC 420

 54663107 TACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGC 54663166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGC 480

 54663167 CAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGC 54663226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGC 540

 54663227 AGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTA 54663286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTA 600

 54663287 AATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAAT 54663346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAAT 660

 54663347 TCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATC 54663406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATC 720

 54663407 CAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCT 54663466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCT 780

 54663467 CTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTG 54663526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTG 840

 54663527 TTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAAT 54663586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAAT 900

 54663587 ACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCC 54663646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCC 960

 54663647 TCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATT 54663706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATT 1020

 54663707 ATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATT 54663766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATT 1080

 54663767 CAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATG 54663826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATG 1140

 54663827 ATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGA 54663886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGA 1200

 54663887 GGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTT 54663946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTT 1260

 54663947 CTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAA 54664006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAA 1320

 54664007 GCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCA 54664066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCA 1380

 54664067 TGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAG 54664126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAG 1440

 54664127 AAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAAC 54664186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAAC 1500

 54664187 CAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAA 54664246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAA 1560

 54664247 TTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGC 54664306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGC 1620

 54664307 GGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCT 54664366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCT 1680

 54664367 TTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCT 54664426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCT 1740

 54664427 TCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATC 54664486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATC 1800

 54664487 GATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCT 54664546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCT 1860

 54664547 TTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACT 54664606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACT 1920

 54664607 CCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTT 54664666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTT 1980

 54664667 CAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCT 54664726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCT 2040

 54664727 TGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGC 54664786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGC 2100

 54664787 GTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTG 54664846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTG 2160

 54664847 GGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAAC 54664906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAAC 2220

 54664907 TTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAA 54664966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAA 2280

 54664967 CTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCAT 54665026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCAT 2340

 54665027 GACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAG 54665086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAG 2400

 54665087 TGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGAT 54665146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGAT 2460

 54665147 GTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCA 54665206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCA 2520

 54665207 CATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGG 54665266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGG 2580

 54665267 AATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATG 54665326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATG 2640

 54665327 GCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGG 54665386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGG 2700

 54665387 AATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGA 54665446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGA 2760

 54665447 ATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTT 54665506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTT 2820

 54665507 TGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTT 54665566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTT 2880

 54665567 GTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAAC 54665626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAAC 2940

 54665627 ACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGC 54665686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGC 3000

 54665687 TATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTT 54665746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTT 3060

 54665747 CCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAA 54665806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAA 3120

 54665807 CAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTG 54665866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTG 3180

 54665867 GTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGAC 54665926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGAC 3240

 54665927 TGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAAT 54665986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAAT 3300

 54665987 TTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGG 54666046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGG 3360

 54666047 AGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTAT 54666106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTAT 3420

 54666107 TTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCT 54666166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCT 3480

 54666167 CTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCA 54666226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCA 3540

 54666227 ATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGC 54666286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGC 3600

 54666287 TCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAA 54666346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAA 3660

 54666347 TCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGAC 54666406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGAC 3720

 54666407 CACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCC 54666466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCC 3780

 54666467 TCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCT 54666526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCT 3840

 54666527 CTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCA 54666586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCA 3900

 54666587 GTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCT 54666646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCT 3960

 54666647 TTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGT 54666706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGT 4020

 54666707 CAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAA 54666766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAA 4080

 54666767 TTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTA 54666826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTA 4140

 54666827 CTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATT 54666886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATT 4200

 54666887 ATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGA 54666946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGA 4260

 54666947 GTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGT 54667006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGT 4320

 54667007 GGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAG 54667066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAG 4380

 54667067 ACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTA 54667126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTA 4440

 54667127 TTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACT 54667186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACT 4500

 54667187 GCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGG 54667246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGG 4560

 54667247 ACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACA 54667306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACA 4620

 54667307 AATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCC 54667366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCC 4680

 54667367 AGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAAT 54667426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAAT 4740

 54667427 ATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAG 54667486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAG 4800

 54667487 GATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGT 54667546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGT 4860

 54667547 CTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATG 54667606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATG 4920

 54667607 CCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGA 54667666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGA 4980

 54667667 TTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGA 54667726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGA 5040

 54667727 AAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAG 54667786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAG 5100

 54667787 ATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAA 54667846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAA 5160

 54667847 TAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCT 54667906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCT 5220

 54667907 AATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTC 54667966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTC 5280

 54667967 TGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTAT 54668026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTAT 5340

 54668027 CAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCT 54668086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCT 5400

 54668087 ACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTT 54668146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTT 5460

 54668147 CAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGG 54668206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGG 5520

 54668207 CACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGA 54668266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGA 5580

 54668267 CAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGC 54668326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGC 5640

 54668327 CCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCT 54668386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCT 5700

 54668387 ATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAG 54668446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAG 5760

 54668447 CACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCC 54668506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCC 5820

 54668507 TCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGA 54668566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGA 5880

 54668567 CATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGA 54668626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGA 5940

 54668627 GCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTG 54668686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTG 6000

 54668687 CTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTG 54668746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTG 6060

 54668747 AGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGC 54668806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGC 6120

 54668807 TAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCAT 54668866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCAT 6180

 54668867 AATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAA 54668926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAA 6240

 54668927 ACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGG 54668986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGG 6300

 54668987 ACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGC 54669046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGC 6360

 54669047 AATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGG 54669106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 AATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGG 6420

 54669107 CAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGA 54669166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGA 6480

 54669167 CAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATT 54669226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATT 6540

 54669227 CACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTC 54669286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTC 6600

 54669287 CAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTG 54669346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 CAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTG 6660

 54669347 CTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCC 54669406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 CTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCC 6720

 54669407 AAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTG 54669466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTG 6780

 54669467 CTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTA 54669526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 CTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTA 6840

 54669527 CTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATT 54669586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATT 6900

 54669587 CAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAA 54669646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAA 6960

 54669647 TTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAA 54669706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAA 7020

 54669707 CAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGA 54669766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGA 7080

 54669767 ACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGA 54669826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 ACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGA 7140

 54669827 CCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGAT 54669886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGAT 7200

 54669887 GCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGT 54669946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 GCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGT 7260

 54669947 GCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTC 54670006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 GCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTC 7320

 54670007 TCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTA 54670066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTA 7380

 54670067 TGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTA 54670126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 TGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTA 7440

 54670127 TGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGT 54670186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 TGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGT 7500

 54670187 GGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTG 54670246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 GGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTG 7560

 54670247 GGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCAT 54670306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCAT 7620

 54670307 AGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTA 54670366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 AGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTA 7680

 54670367 TGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCT 54670426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 TGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCT 7740

 54670427 CTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCAC 54670486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 CTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCAC 7800

 54670487 GGTGCTTCCTCA 54670498
          ||||||||||||
     7801 GGTGCTTCCTCA 7812

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7814 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 7873

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 7933

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7934 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 7993

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7994 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 8053

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8054 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 8113

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8114 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 8173

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8174 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 8233

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8234 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 8293

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8294 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 8353

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8354 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 8413

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8414 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 8473

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8474 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 8533

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8534 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 8593

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8594 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 8653

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8654 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 8713

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8714 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 8773

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8774 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 8833

 54671519 GC 54671520
          ||
     8834 GC 8835

Alignment time is 6.41453 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9813] =>      9813 nucs 'mol-32-3004-337849_9813'

Score:        9812
Aligned:      9812        nucs
Identic:      9812 (100%) nucs =>      1847 (100%)      7965 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54660143,54661989] EXCISED REGION [54661991,54669955]
 second seq =>  [       1,    1847] EXCISED REGION [    1849,    9813]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54661990,54661990]
 second seq =>         1 nucs [1848,1848]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54661989,54661989] to [54661991,54661991]
 second seq =>         1 nucs [1847,1847] to [1849,1849]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54660143 CCAGATTTTTGGTGTCACTCTGGTTTTCTTGACTGCTTTGCCCACCAGTAAGAGAGAGTG 54660202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGATTTTTGGTGTCACTCTGGTTTTCTTGACTGCTTTGCCCACCAGTAAGAGAGAGTG 60

 54660203 TCATTGAAATGGAGGAAGGTGATTACCATTTGGGCAGATGCCTTGGTAATCTCAAACTTT 54660262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATTGAAATGGAGGAAGGTGATTACCATTTGGGCAGATGCCTTGGTAATCTCAAACTTT 120

 54660263 CAAAAGAGAATATCAACACTACCTCAAGTGATTATTTGTTAAGTCAAGTGGCTTGTTCCC 54660322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAAAGAGAATATCAACACTACCTCAAGTGATTATTTGTTAAGTCAAGTGGCTTGTTCCC 180

 54660323 CATTAGGAAGCAGATTCAGTGCACTCAAGCTACTCATCTGGGGCACACAGCCTTGAGCTC 54660382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTAGGAAGCAGATTCAGTGCACTCAAGCTACTCATCTGGGGCACACAGCCTTGAGCTC 240

 54660383 ATTGCTACTCAGAATTTATTAAAATTCTATTGAGCTAATCCACACTTCAGGGGAAAGACT 54660442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGCTACTCAGAATTTATTAAAATTCTATTGAGCTAATCCACACTTCAGGGGAAAGACT 300

 54660443 GCTATCTTTCCCTGCCTGAAGATACTTCCTCATCTCTAAGTCAAAAGAAATCAGACATCT 54660502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTATCTTTCCCTGCCTGAAGATACTTCCTCATCTCTAAGTCAAAAGAAATCAGACATCT 360

 54660503 AGGTAGCTAGGCCTTGTCACACTGGCCATGAGAATACTTACTCTCATTCTAGTTCACTTT 54660562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTAGCTAGGCCTTGTCACACTGGCCATGAGAATACTTACTCTCATTCTAGTTCACTTT 420

 54660563 AGTGTGATAGCACATACATCTAATGAGTATCATATGAAAAATAAAAAAGCTGTGAACACA 54660622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGTGATAGCACATACATCTAATGAGTATCATATGAAAAATAAAAAAGCTGTGAACACA 480

 54660623 TTAACGGAGCTTATGTAAATGATGCTGTCAAGGATAATTTTATGTACCGCATGCAGTGAT 54660682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAACGGAGCTTATGTAAATGATGCTGTCAAGGATAATTTTATGTACCGCATGCAGTGAT 540

 54660683 TATCTCTGAGAGGAAGTCCTCTTCGGTGCTCATAAGAAATTAGTTGTATGTCTTCTGAAA 54660742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCTCTGAGAGGAAGTCCTCTTCGGTGCTCATAAGAAATTAGTTGTATGTCTTCTGAAA 600

 54660743 ATTTAGTTTATTTTCATCTTGTGGACAATGATTTATGTAACGAAAAGGCTTTCCTTTCTG 54660802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTAGTTTATTTTCATCTTGTGGACAATGATTTATGTAACGAAAAGGCTTTCCTTTCTG 660

 54660803 CTTTCTCTGCTGGAAAGCTTCTGGCTGACCCAGTTTTTTCAACTTTGTCTGATTTCTGGC 54660862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCTCTGCTGGAAAGCTTCTGGCTGACCCAGTTTTTTCAACTTTGTCTGATTTCTGGC 720

 54660863 ACCATTTTTTGTCTCCATCTTTAGTCTATTTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTA 54660922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCATTTTTTGTCTCCATCTTTAGTCTATTTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTA 780

 54660923 TCTGCTTGGATTTTAATTTTCTTTGTAAACTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAA 54660982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGCTTGGATTTTAATTTTCTTTGTAAACTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAA 840

 54660983 GTTAACAGCAGAGACAGGTGACTGCCATCAGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCA 54661042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTAACAGCAGAGACAGGTGACTGCCATCAGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCA 900

 54661043 CACATGAAGGACACATCCTTCTGAACAATGCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTG 54661102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACATGAAGGACACATCCTTCTGAACAATGCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTG 960

 54661103 TGCACTTTAATTTCTTATTAAACAAAATAACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGC 54661162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCACTTTAATTTCTTATTAAACAAAATAACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGC 1020

 54661163 AAAACTTTACTGACCACGAGATTCTTATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGG 54661222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAACTTTACTGACCACGAGATTCTTATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGG 1080

 54661223 AGTTTTAAATGAAAAATAACTGATGCTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATA 54661282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTTTTAAATGAAAAATAACTGATGCTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATA 1140

 54661283 ATTTCTATTTATGAAAACGGTCCCTCTTTAATAACTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAA 54661342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTCTATTTATGAAAACGGTCCCTCTTTAATAACTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAA 1200

 54661343 GAATTTTCCTCTGAGAGATTTTACATTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTA 54661402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAATTTTCCTCTGAGAGATTTTACATTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTA 1260

 54661403 AACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAAGAAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGT 54661462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAAGAAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGT 1320

 54661463 TTAACTGCTGCTGTCACATGGAAAAAAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTG 54661522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAACTGCTGCTGTCACATGGAAAAAAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTG 1380

 54661523 AAAACATAAATATCACAAATGACCTTGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGG 54661582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAACATAAATATCACAAATGACCTTGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGG 1440

 54661583 CTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGAATGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAA 54661642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGAATGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAA 1500

 54661643 AATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAAAAATGAGCAGATAGGGAGGGCATTGCTGGAGGGGA 54661702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAAAAATGAGCAGATAGGGAGGGCATTGCTGGAGGGGA 1560

 54661703 ACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGAT 54661762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGAT 1620

 54661763 GAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAAAAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAG 54661822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAAAAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAG 1680

 54661823 CACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGAATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTT 54661882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGAATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTT 1740

 54661883 AGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAAC 54661942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAAC 1800

 54661943 ACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTG 54661989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTG 1847

EXCISED REGION

 54661991 GGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGA 54662050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 GGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGA 1908

 54662051 GACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAA 54662110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 GACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAA 1968

 54662111 ACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTT 54662170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 ACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTT 2028

 54662171 TTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGC 54662230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGC 2088

 54662231 CAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGG 54662290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 CAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGG 2148

 54662291 CTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGA 54662350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGA 2208

 54662351 GCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAA 54662410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 GCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAA 2268

 54662411 GTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGT 54662470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 GTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGT 2328

 54662471 CATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCA 54662530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 CATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCA 2388

 54662531 AGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTT 54662590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 AGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTT 2448

 54662591 CCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAA 54662650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 CCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAA 2508

 54662651 CACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACA 54662710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 CACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACA 2568

 54662711 AAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCAT 54662770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 AAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCAT 2628

 54662771 AAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTC 54662830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 AAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTC 2688

 54662831 GAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAA 54662890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 GAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAA 2748

 54662891 TCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAA 54662950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAA 2808

 54662951 GAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTC 54663010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 GAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTC 2868

 54663011 AGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAA 54663070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 AGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAA 2928

 54663071 AAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGG 54663130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 AAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGG 2988

 54663131 AGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATC 54663190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 AGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATC 3048

 54663191 TGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTT 54663250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTT 3108

 54663251 TGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGC 54663310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGC 3168

 54663311 TCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTAC 54663370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 TCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTAC 3228

 54663371 AGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCT 54663430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 AGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCT 3288

 54663431 CTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAG 54663490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 CTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAG 3348

 54663491 ATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTA 54663550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 ATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTA 3408

 54663551 TTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGG 54663610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGG 3468

 54663611 AAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAA 54663670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 AAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAA 3528

 54663671 TAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATAT 54663730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATAT 3588

 54663731 TTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTG 54663790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 TTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTG 3648

 54663791 TACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATA 54663850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 TACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATA 3708

 54663851 TAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGT 54663910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 TAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGT 3768

 54663911 TTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGT 54663970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 TTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGT 3828

 54663971 AATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAG 54664030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 AATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAG 3888

 54664031 TTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTT 54664090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 TTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTT 3948

 54664091 CCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAA 54664150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 CCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAA 4008

 54664151 GACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAA 54664210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 GACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAA 4068

 54664211 ACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAA 54664270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 ACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAA 4128

 54664271 GCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCT 54664330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 GCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCT 4188

 54664331 CTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGC 54664390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 CTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGC 4248

 54664391 TCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCC 54664450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 TCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCC 4308

 54664451 AGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAA 54664510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 AGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAA 4368

 54664511 GAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACA 54664570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 GAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACA 4428

 54664571 GGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTG 54664630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 GGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTG 4488

 54664631 AATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGG 54664690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 AATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGG 4548

 54664691 ATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGT 54664750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 ATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGT 4608

 54664751 TAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATAT 54664810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 TAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATAT 4668

 54664811 TGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATT 54664870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 TGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATT 4728

 54664871 ATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTT 54664930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 ATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTT 4788

 54664931 CCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCAT 54664990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 CCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCAT 4848

 54664991 CCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAA 54665050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 CCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAA 4908

 54665051 CACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAAT 54665110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 CACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAAT 4968

 54665111 GTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACA 54665170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 GTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACA 5028

 54665171 ATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCAC 54665230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 ATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCAC 5088

 54665231 TAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTC 54665290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 TAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTC 5148

 54665291 TGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATT 54665350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 TGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATT 5208

 54665351 CTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGT 54665410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 CTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGT 5268

 54665411 GATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAA 54665470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 GATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAA 5328

 54665471 ATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAA 54665530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 ATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAA 5388

 54665531 AATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCA 54665590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 AATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCA 5448

 54665591 GTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATC 54665650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 GTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATC 5508

 54665651 ATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCT 54665710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 ATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCT 5568

 54665711 GGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAAC 54665770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 GGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAAC 5628

 54665771 TAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCAC 54665830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 TAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCAC 5688

 54665831 CAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAG 54665890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 CAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAG 5748

 54665891 TGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAG 54665950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 TGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAG 5808

 54665951 TTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGA 54666010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 TTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGA 5868

 54666011 CCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAA 54666070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5869 CCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAA 5928

 54666071 TACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATT 54666130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 TACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATT 5988

 54666131 TTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAG 54666190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 TTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAG 6048

 54666191 CAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTG 54666250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6049 CAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTG 6108

 54666251 GAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTT 54666310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 GAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTT 6168

 54666311 TCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTC 54666370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 TCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTC 6228

 54666371 CTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCA 54666430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6229 CTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCA 6288

 54666431 GAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAA 54666490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6289 GAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAA 6348

 54666491 GGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTC 54666550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6349 GGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTC 6408

 54666551 GGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCT 54666610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6409 GGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCT 6468

 54666611 TCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCC 54666670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6469 TCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCC 6528

 54666671 ACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAAC 54666730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6529 ACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAAC 6588

 54666731 ATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGA 54666790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6589 ATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGA 6648

 54666791 AACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGG 54666850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6649 AACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGG 6708

 54666851 ACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAAT 54666910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6709 ACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAAT 6768

 54666911 AAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTAT 54666970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6769 AAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTAT 6828

 54666971 AGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAG 54667030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6829 AGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAG 6888

 54667031 TGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGT 54667090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6889 TGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGT 6948

 54667091 TTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCA 54667150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6949 TTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCA 7008

 54667151 GGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCA 54667210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 GGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCA 7068

 54667211 ACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAAT 54667270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 ACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAAT 7128

 54667271 TAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCC 54667330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 TAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCC 7188

 54667331 TGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAG 54667390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 TGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAG 7248

 54667391 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 54667450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 7308

 54667451 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 54667510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7309 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 7368

 54667511 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 54667570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 7428

 54667571 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 54667630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 7488

 54667631 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 54667690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7489 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 7548

 54667691 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 54667750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7549 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 7608

 54667751 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 54667810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7609 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 7668

 54667811 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 54667870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7669 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 7728

 54667871 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 54667930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 7788

 54667931 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 54667990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 7848

 54667991 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 54668050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7849 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 7908

 54668051 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 54668110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7909 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 7968

 54668111 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 54668170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7969 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 8028

 54668171 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 54668230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 8088

 54668231 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 54668290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8089 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 8148

 54668291 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 54668350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8149 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 8208

 54668351 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 54668410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8209 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 8268

 54668411 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 54668470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8269 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 8328

 54668471 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 54668530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8329 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 8388

 54668531 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTG 54668590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8389 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTG 8448

 54668591 GCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACA 54668650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8449 GCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACA 8508

 54668651 ATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGG 54668710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8509 ATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGG 8568

 54668711 TAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCT 54668770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8569 TAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCT 8628

 54668771 GGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCT 54668830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8629 GGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCT 8688

 54668831 TCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGA 54668890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8689 TCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGA 8748

 54668891 ATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATC 54668950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8749 ATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATC 8808

 54668951 CTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACC 54669010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8809 CTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACC 8868

 54669011 AGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGAC 54669070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8869 AGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGAC 8928

 54669071 TTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTT 54669130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8929 TTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTT 8988

 54669131 CCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTG 54669190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8989 CCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTG 9048

 54669191 GGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATC 54669250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9049 GGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATC 9108

 54669251 CATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGG 54669310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9109 CATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGG 9168

 54669311 ATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGT 54669370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9169 ATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGT 9228

 54669371 TCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGAC 54669430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9229 TCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGAC 9288

 54669431 ACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCA 54669490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9289 ACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCA 9348

 54669491 AGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTT 54669550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9349 AGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTT 9408

 54669551 TGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAAC 54669610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9409 TGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAAC 9468

 54669611 TATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGG 54669670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9469 TATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGG 9528

 54669671 GCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTA 54669730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9529 GCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTA 9588

 54669731 TCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGA 54669790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9589 TCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGA 9648

 54669791 GAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGA 54669850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9649 GAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGA 9708

 54669851 TGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGA 54669910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9709 TGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGA 9768

 54669911 ATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAG 54669955
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9769 ATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAG 9813

Alignment time is 7.2193 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6742] =>      6742 nucs 'mol-32-301a-150904_6742'

Score:        6730
Aligned:      6741        nucs
Identic:      6740 (100%) nucs =>      1726 (100%)      5014 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54665263,54666988] EXCISED REGION [54666990,54672003]
 second seq =>  [       1,    1726] EXCISED REGION [    1728,    6742]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54666989,54666989]
 second seq =>         1 nucs [1727,1727]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5237,5237]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54666989,54666989] to [54666990,54666990]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54665263 ATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAG 54665322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAG 60

 54665323 CATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGT 54665382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGT 120

 54665383 GTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGG 54665442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGG 180

 54665443 TAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAA 54665502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAA 240

 54665503 GTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGA 54665562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGA 300

 54665563 TTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTG 54665622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTG 360

 54665623 AAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATA 54665682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATA 420

 54665683 CAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATT 54665742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATT 480

 54665743 TTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCT 54665802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCT 540

 54665803 AAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAG 54665862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAG 600

 54665863 CTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAA 54665922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAA 660

 54665923 GGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGA 54665982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGA 720

 54665983 AAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGAC 54666042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGAC 780

 54666043 TTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCT 54666102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCT 840

 54666103 TTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAAT 54666162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAAT 900

 54666163 CTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTC 54666222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTC 960

 54666223 CCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTT 54666282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTT 1020

 54666283 TTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGA 54666342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGA 1080

 54666343 TCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAA 54666402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAA 1140

 54666403 GGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCA 54666462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCA 1200

 54666463 GCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCC 54666522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCC 1260

 54666523 ATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTA 54666582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTA 1320

 54666583 TTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACAC 54666642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACAC 1380

 54666643 TTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTG 54666702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTG 1440

 54666703 TTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACA 54666762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACA 1500

 54666763 GAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGA 54666822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGA 1560

 54666823 GTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCAT 54666882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCAT 1620

 54666883 GATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAA 54666942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAA 1680

 54666943 TCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGC 54666988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGC 1726

EXCISED REGION

 54666990 AGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCA 54667049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 AGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCA 1787

 54667050 ATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTG 54667109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 ATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTG 1847

 54667110 GGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCC 54667169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 GGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCC 1907

 54667170 TACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAA 54667229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 TACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAA 1967

 54667230 ACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAAT 54667289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 ACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAAT 2027

 54667290 CAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTG 54667349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 CAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTG 2087

 54667350 GGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCAC 54667409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 GGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCAC 2147

 54667410 AGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGAC 54667469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 AGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGAC 2207

 54667470 CCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCC 54667529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 CCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCC 2267

 54667530 CATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCAT 54667589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 CATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCAT 2327

 54667590 TACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGC 54667649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 TACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGC 2387

 54667650 CCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGA 54667709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 CCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGA 2447

 54667710 AAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGG 54667769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 AAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGG 2507

 54667770 AGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCT 54667829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 AGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCT 2567

 54667830 GAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTG 54667889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 GAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTG 2627

 54667890 CATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTC 54667949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 CATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTC 2687

 54667950 AACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAG 54668009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 AACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAG 2747

 54668010 AGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTC 54668069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 AGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTC 2807

 54668070 TGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAG 54668129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 TGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAG 2867

 54668130 GCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATC 54668189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATC 2927

 54668190 AGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTAC 54668249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 AGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTAC 2987

 54668250 TTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTG 54668309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 TTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTG 3047

 54668310 GGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATG 54668369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 GGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATG 3107

 54668370 ATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACAT 54668429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 ATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACAT 3167

 54668430 TCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTC 54668489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 TCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTC 3227

 54668490 TCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCC 54668549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 TCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCC 3287

 54668550 ATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAG 54668609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 ATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAG 3347

 54668610 TTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGG 54668669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 TTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGG 3407

 54668670 GGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTT 54668729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 GGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTT 3467

 54668730 AATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACC 54668789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 AATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACC 3527

 54668790 AATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCA 54668849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 AATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCA 3587

 54668850 CCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTC 54668909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 CCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTC 3647

 54668910 CCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCT 54668969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCT 3707

 54668970 TGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACC 54669029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 TGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACC 3767

 54669030 CCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACC 54669089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 CCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACC 3827

 54669090 AGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTG 54669149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 AGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTG 3887

 54669150 ACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCT 54669209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 ACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCT 3947

 54669210 TCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGC 54669269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 TCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGC 4007

 54669270 CCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTC 54669329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 CCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTC 4067

 54669330 AGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTG 54669389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 AGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTG 4127

 54669390 GGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTA 54669449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 GGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTA 4187

 54669450 GGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGT 54669509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 GGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGT 4247

 54669510 AGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAAT 54669569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 AGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAAT 4307

 54669570 CTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACA 54669629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 CTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACA 4367

 54669630 TAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCAT 54669689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 TAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCAT 4427

 54669690 ATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGA 54669749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 ATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGA 4487

 54669750 GGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGA 54669809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGA 4547

 54669810 AGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGG 54669869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 AGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGG 4607

 54669870 CAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTA 54669929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 CAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTA 4667

 54669930 AGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACT 54669989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 AGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACT 4727

 54669990 CTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCA 54670049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 CTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCA 4787

 54670050 GGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGG 54670109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 GGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGG 4847

 54670110 ATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTG 54670169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 ATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTG 4907

 54670170 AAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCAC 54670229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 AAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCAC 4967

 54670230 AGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCC 54670289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 AGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCC 5027

 54670290 GGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGA 54670349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 GGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGA 5087

 54670350 GTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACA 54670409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 GTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACA 5147

 54670410 CACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCC 54670469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 CACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCC 5207

 54670470 GGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA-CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCT 54670528
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     5208 GGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCACCCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCT 5267

 54670529 CTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAG 54670588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 CTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAG 5327

 54670589 TGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTT 54670648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 TGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTT 5387

 54670649 TGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAA 54670708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 TGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAA 5447

 54670709 AGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGAT 54670768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 AGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGAT 5507

 54670769 GATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAG 54670828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5508 GATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAG 5567

 54670829 CTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAA 54670888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5568 CTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAA 5627

 54670889 TCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTG 54670948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5628 TCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTG 5687

 54670949 AGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGC 54671008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5688 AGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGC 5747

 54671009 CAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCC 54671068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 CAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCC 5807

 54671069 TTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGC 54671128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 TTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGC 5867

 54671129 ACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAG 54671188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5868 ACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAG 5927

 54671189 AAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAA 54671248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 AAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAA 5987

 54671249 AGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATA 54671308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 AGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATA 6047

 54671309 ACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTT 54671368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6048 ACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTT 6107

 54671369 GTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATT 54671428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 GTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATT 6167

 54671429 TCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTA 54671488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 TCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTA 6227

 54671489 TTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAG 54671548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6228 TTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAG 6287

 54671549 CTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTA 54671608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6288 CTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTA 6347

 54671609 TCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAA 54671668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6348 TCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAA 6407

 54671669 GCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTG 54671728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6408 GCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTG 6467

 54671729 GTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACT 54671788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6468 GTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACT 6527

 54671789 GAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCAT 54671848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6528 GAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCAT 6587

 54671849 GGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAAT 54671908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6588 GGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAAT 6647

 54671909 CCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTG 54671968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6648 CCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTG 6707

 54671969 GGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGT 54672003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6708 GGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGT 6742

Alignment time is 4.97014 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4580] =>      4580 nucs 'mol-32-301a-191445_4580'

Score:        4569
Aligned:      4580        nucs
Identic:      4579 (100%) nucs =>        20 (100%)      4559 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54666095,54666114] EXCISED REGION [54666116,54670674]
 second seq =>  [       1,      20] EXCISED REGION [      21,    4580]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54666115,54666115]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4404,4404]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [54666115,54666121] to [54666116,54666122]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54666095 CATACCCTTTATTTTGGGGA 54666114
          ||||||||||||||||||||
        1 CATACCCTTTATTTTGGGGA 20

EXCISED REGION

 54666116 TTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCT 54666175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       21 TTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCT 80

 54666176 GACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCC 54666235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       81 GACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCC 140

 54666236 TCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAA 54666295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      141 TCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAA 200

 54666296 TCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTT 54666355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      201 TCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTT 260

 54666356 GGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAG 54666415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 GGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAG 320

 54666416 AAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAG 54666475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      321 AAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAG 380

 54666476 GAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATT 54666535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 GAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATT 440

 54666536 GGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAG 54666595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 GGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAG 500

 54666596 TTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTT 54666655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 TTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTT 560

 54666656 CCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCT 54666715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 CCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCT 620

 54666716 CAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTA 54666775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 CAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTA 680

 54666776 GAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTG 54666835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 GAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTG 740

 54666836 CCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATT 54666895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 CCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATT 800

 54666896 AAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTA 54666955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 AAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTA 860

 54666956 GCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTG 54667015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 GCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTG 920

 54667016 ATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGC 54667075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 ATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGC 980

 54667076 AATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCT 54667135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 AATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCT 1040

 54667136 AGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATC 54667195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 AGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATC 1100

 54667196 CAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAG 54667255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 CAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAG 1160

 54667256 CAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAA 54667315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 CAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAA 1220

 54667316 GATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTG 54667375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 GATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTG 1280

 54667376 ATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTC 54667435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 ATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTC 1340

 54667436 CTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAA 54667495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 CTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAA 1400

 54667496 CTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTG 54667555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 CTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTG 1460

 54667556 CATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTC 54667615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 CATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTC 1520

 54667616 CTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTAC 54667675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 CTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTAC 1580

 54667676 AGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTA 54667735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 AGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTA 1640

 54667736 CTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGG 54667795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 CTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGG 1700

 54667796 TGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTC 54667855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 TGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTC 1760

 54667856 TGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGAT 54667915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 TGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGAT 1820

 54667916 CATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTG 54667975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 CATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTG 1880

 54667976 CAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCAT 54668035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 CAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCAT 1940

 54668036 CTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTA 54668095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 CTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTA 2000

 54668096 GAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCA 54668155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 GAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCA 2060

 54668156 CAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCA 54668215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 CAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCA 2120

 54668216 CCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCA 54668275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 CCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCA 2180

 54668276 GAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAAT 54668335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 GAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAAT 2240

 54668336 GTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATT 54668395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 GTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATT 2300

 54668396 AATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGAC 54668455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 AATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGAC 2360

 54668456 CCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAG 54668515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 CCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAG 2420

 54668516 ACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAG 54668575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 ACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAG 2480

 54668576 TTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAAC 54668635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAAC 2540

 54668636 TGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAG 54668695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 TGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAG 2600

 54668696 TCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTT 54668755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 TCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTT 2660

 54668756 CCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAA 54668815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 CCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAA 2720

 54668816 GCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATA 54668875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 GCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATA 2780

 54668876 CCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGA 54668935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 CCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGA 2840

 54668936 GTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTC 54668995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 GTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTC 2900

 54668996 CTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCA 54669055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 CTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCA 2960

 54669056 ACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTT 54669115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 ACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTT 3020

 54669116 ATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACAC 54669175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 ATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACAC 3080

 54669176 CGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCT 54669235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 CGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCT 3140

 54669236 GTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTC 54669295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 GTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTC 3200

 54669296 GTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATC 54669355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 GTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATC 3260

 54669356 CCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGT 54669415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 CCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGT 3320

 54669416 ACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCAC 54669475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 ACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCAC 3380

 54669476 CTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAA 54669535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 CTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAA 3440

 54669536 GTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTT 54669595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 GTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTT 3500

 54669596 TATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGC 54669655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 TATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGC 3560

 54669656 AGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAG 54669715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 AGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAG 3620

 54669716 GGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGA 54669775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 GGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGA 3680

 54669776 TTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGC 54669835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 TTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGC 3740

 54669836 ACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAG 54669895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 ACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAG 3800

 54669896 CAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAG 54669955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 CAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAG 3860

 54669956 GCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCC 54670015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 GCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCC 3920

 54670016 TTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATC 54670075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 TTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATC 3980

 54670076 AACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGA 54670135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 AACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGA 4040

 54670136 CATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGAC 54670195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 CATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGAC 4100

 54670196 TGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCA 54670255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 TGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCA 4160

 54670256 TCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCC 54670315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 TCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCC 4220

 54670316 TAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGC 54670375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 TAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGC 4280

 54670376 AACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCT 54670435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 AACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCT 4340

 54670436 GGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCC 54670495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 GGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCC 4400

 54670496 TCA-CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTC 54670554
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 TCACCCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTC 4460

 54670555 TTTATTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCC 54670614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 TTTATTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCC 4520

 54670615 TGACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGC 54670674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 TGACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGC 4580

Alignment time is 3.36966 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3877] =>      3877 nucs 'mol-32-3025-272223_3877'

Score:        3566
Aligned:      3882        nucs
Identic:      3850 ( 99%) nucs =>       155 ( 99%)      3695 ( 99%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54668818,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673262]
 second seq =>  [       1,     156] EXCISED REGION [     157,    3877]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54668818 CCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACC 54668877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACC 60

 54668878 ATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGT 54668937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGT 120

 54668938 AACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      121 AACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 156

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 216

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 276

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 336

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 396

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 456

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      457 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 516

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 576

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 636

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      637 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 696

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 756

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 816

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 876

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 936

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 996

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 1056

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     1057 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 1116

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1117 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1176

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1236

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     1237 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1294

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1354

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1413

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1473

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1533

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1593

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1653

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1713

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1773

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1833

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1893

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1953

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     1954 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 2011

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 2071

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 2131

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 2191

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 2251

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2252 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 2311

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2312 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 2371

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 2431

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2432 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 2491

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2492 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 2551

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 2611

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     2612 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 2671

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2672 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 2731

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 2791

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 2851

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 2911

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 2971

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 3031

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 3091

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 3151

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 3211

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3212 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 3271

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3272 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 3331

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 3391

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 3451

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3452 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 3511

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3512 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 3571

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3572 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 3631

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 3691

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     3692 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 3751

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 3811

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 3871

 54673257 TGTGAA 54673262
          ||||||
     3872 TGTGAA 3877

Alignment time is 2.86831 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2359] =>      2359 nucs 'mol-32-3046-235273_2359'

Score:        2194
Aligned:      2359        nucs
Identic:      2344 ( 99%) nucs =>      1797 ( 99%)       547 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667164,54668973] EXCISED REGION [54669540,54670088]
 second seq =>  [       1,    1810] EXCISED REGION [    1811,    2359]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54667164 ACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGT 54667223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGT 60

 54667224 TGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGT 54667283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGT 120

 54667284 AGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGG 54667343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGG 180

 54667344 CAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGC 54667403
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      181 CAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGC 240

 54667404 CCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACA 54667463
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACA 300

 54667464 ATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAA 54667523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAA 360

 54667524 CTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTA 54667583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTA 420

 54667584 AACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCT 54667643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCT 480

 54667644 ACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTC 54667703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTC 540

 54667704 TCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGC 54667763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      541 TCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGC 600

 54667764 CTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATG 54667823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATG 660

 54667824 AAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAAT 54667883
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAAT 720

 54667884 GTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTG 54667943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTG 780

 54667944 AAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTC 54668003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTC 840

 54668004 TGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAG 54668063
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAG 900

 54668064 CTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACA 54668123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACA 960

 54668124 TCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAAT 54668183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAAT 1020

 54668184 GAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGA 54668243
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGA 1080

 54668244 TTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAA 54668303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAA 1140

 54668304 GTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCC 54668363
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1141 GTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCC 1200

 54668364 CCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAA 54668423
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAA 1260

 54668424 GGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAA 54668483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAA 1320

 54668484 AGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAG 54668543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAG 1380

 54668544 CTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCAC 54668603
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCAC 1440

 54668604 ATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAG 54668663
          ||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAG 1500

 54668664 GACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGA 54668723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1501 GACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGA 1560

 54668724 CTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTA 54668783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTA 1620

 54668784 GACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTG 54668843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTG 1680

 54668844 GCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAA 54668903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAA 1740

 54668904 ATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCG 54668963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1741 ATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCG 1800

 54668964 CCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||
     1801 CCTGCTTGCC 1810

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 1870

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 1930

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 1990

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 2050

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 2110

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2111 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 2170

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 2230

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 2290

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2291 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 2350

 54670080 TCTCCCCAT 54670088
          |||||||||
     2351 TCTCCCCAT 2359

Alignment time is 1.77661 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9483] =>      9483 nucs 'mol-32-3046-246739_9483'

Score:        9132
Aligned:      9484        nucs
Identic:      9452 (100%) nucs =>      8904 (100%)       548 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54660041,54668973] EXCISED REGION [54669540,54670089]
 second seq =>  [       1,    8933] EXCISED REGION [    8934,    9483]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54660041 TCTACACACTGAGCATTCTATATTGACATTAGTAGGTGTTAACTCCTGGGCTCATACCCT 54660100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTACACACTGAGCATTCTATATTGACATTAGTAGGTGTTAACTCCTGGGCTCATACCCT 60

 54660101 GTGTCCTAACATGACTGTAATTATCTGCTCTTATTCAATGAACCAGATTTTTGGTGTCAC 54660160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGTCCTAACATGACTGTAATTATCTGCTCTTATTCAATGAACCAGATTTTTGGTGTCAC 120

 54660161 TCTGGTTTTCTTGACTGCTTTGCCCACCAGTAAGAGAGAGTGTCATTGAAATGGAGGAAG 54660220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGGTTTTCTTGACTGCTTTGCCCACCAGTAAGAGAGAGTGTCATTGAAATGGAGGAAG 180

 54660221 GTGATTACCATTTGGGCAGATGCCTTGGTAATCTCAAACTTTCAAAAGAGAATATCAACA 54660280
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      181 GTGATTACCATTTGGGCAGATGCCTTGGTAATCTCAAGCTTTCAAAAGAGAATATCAACA 240

 54660281 CTACCTCAAGTGATTATTTGTTAAGTCAAGTGGCTTGTTCCCCATTAGGAAGCAGATTCA 54660340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTACCTCAAGTGATTATTTGTTAAGTCAAGTGGCTTGTTCCCCATTAGGAAGCAGATTCA 300

 54660341 GTGCACTCAAGCTACTCATCTGGGGCACACAGCCTTGAGCTCATTGCTACTCAGAATTTA 54660400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGCACTCAAGCTACTCATCTGGGGCACACAGCCTTGAGCTCATTGCTACTCAGAATTTA 360

 54660401 TTAAAATTCTATTGAGCTAATCCACACTTCAGGGGAAAGACTGCTATCTTTCCCTGCCTG 54660460
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAATTCTATTGAGCTAACCCACACTTCAGGGGAAAGACTGCTATCTTTCCCTGCCTG 420

 54660461 AAGATACTTCCTCATCTCTAAGTCAAAAGAAATCAGACATCTAGGTAGCTAGGCCTTGTC 54660520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGATACTTCCTCATCTCTAAGTCAAAAGAAATCAGACATCTAGGTAGCTAGGCCTTGTC 480

 54660521 ACACTGGCCATGAGAATACTTACTCTCATTCTAGTTCACTTTAGTGTGATAGCACATACA 54660580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      481 ACACTGGCCATGAGAATACTTACTCTCATTCTAGTTCACTTTAGTGTGATAGTACATACA 540

 54660581 TCTAATGAGTATCATATGAAAAATAAAAAAGCTGTGAACACATTAACGGAGCTTATGTAA 54660640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTAATGAGTATCATATGAAAAATAAAAAAGCTGTGAACACATTAACGGAGCTTATGTAA 600

 54660641 ATGATGCTGTCAAGGATAATTTTATGTACCGCATGCAGTGATTATCTCTGAGAGGAAGTC 54660700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGATGCTGTCAAGGATAATTTTATGTACCGCATGCAGTGATTATCTCTGAGAGGAAGTC 660

 54660701 CTCTTCGGTGCTCATAAGAAATTAGTTGTATGTCTTCTGAAAATTTAGTTTATTTTCATC 54660760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTTCGGTGCTCATAAGAAATTAGTTGTATGTCTTCTGAAAATTTAGTTTATTTTCATC 720

 54660761 TTGTGGACAATGATTTATGTAACGAAAAGGCTTTCCTTTCTGCTTTCTCTGCTGGAAAGC 54660820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTGGACAATGATTTATGTAACGAAAAGGCTTTCCTTTCTGCTTTCTCTGCTGGAAAGC 780

 54660821 TTCTGGCTGACCCAGTTTTTTCAACTTTGTCTGATTTCTGGCACCATTTTTTGTCTCCAT 54660880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTGGCTGACCCAGTTTTTTCAACTTTGTCTGATTTCTGGCACCATTTTTTGTCTCCAT 840

 54660881 CTTTAGTCTATTTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTATCTGCTTGGATTTTAATT 54660940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTAGTCTATTTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTATCTGCTTGGATTTTAATT 900

 54660941 TTCTTTGTAAACTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAAGTTAACAGCAGAGACAGG 54661000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCTTTGTAAACTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAAGTTAACAGCAGAGACAGG 960

 54661001 TGACTGCCATCAGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCACACATGAAGGACACATCC 54661060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACTGCCATCAGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCACACATGAAGGACACATCC 1020

 54661061 TTCTGAACAATGCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTGTGCACTTTAATTTCTTAT 54661120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTGAACAATGCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTGTGCACTTTAATTTCTTAT 1080

 54661121 TAAACAAAATAACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGCAAAACTTTACTGACCACG 54661180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAACAAAATAACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGCAAAACTTTACTGACCACG 1140

 54661181 AGATTCTTATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGGAGTTTTAAATGAAAAATA 54661240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATTCTTATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGGAGTTTTAAATGAAAAATA 1200

 54661241 ACTGATGCTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATAATTTCTATTTATGAAAAC 54661300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTGATGCTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATAATTTCTATTTATGAAAAC 1260

 54661301 GGTCCCTCTTTAATAACTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAAGAATTTTCCTCTGAGAGA 54661360
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTCCCTCTTTAATAATTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAAGAATTTTCCTCTGAGAGA 1320

 54661361 TTTTACATTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTAAACTATTCCCTGAAGCCA 54661420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTACATTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTAAACTATTCCCTGAAGCCA 1380

 54661421 AGTGAAGAAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGTTTAACTGCTGCTGTCACA 54661480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTGAAGAAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGTTTAACTGCTGCTGTCACA 1440

 54661481 TGGAAAAAAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTGAAAACATAAATATCACAA 54661540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGAAAAAAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTGAAAACATAAATATCACAA 1500

 54661541 ATGACCTTGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGGCTTGTTGCACGGGTTCAA 54661600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGACCTTGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGGCTTGTTGCACGGGTTCAA 1560

 54661601 GAAGGAATGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTT 54661660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAGGAATGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTT 1620

 54661661 TTCTAAAAAATGAGCAGATAGGGAGGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGG 54661720
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTAAAAAATGAGCAGATAAGGAGGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGG 1680

 54661721 ACTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAG 54661780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAG 1740

 54661781 AAAAAAAAAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAA 54661840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAAAAAAAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAA 1800

 54661841 ATAGGGAATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAA 54661900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAGGGAATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAA 1860

 54661901 ATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACACAGAAAGAGTGAG 54661960
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     1861 ATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATA-CACACACAGAAAGAGTGAG 1919

 54661961 TGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTGCGGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATT 54662020
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTGCAGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATT 1979

 54662021 TTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGAC 54662080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGAC 2039

 54662081 TAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTA 54662140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTA 2099

 54662141 ATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGG 54662200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGG 2159

 54662201 AATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGA 54662260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGA 2219

 54662261 CAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTG 54662320
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTTGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTG 2279

 54662321 GGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAAT 54662380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAAT 2339

 54662381 GAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAA 54662440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAA 2399

 54662441 TACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAA 54662500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAA 2459

 54662501 AAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAA 54662560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAA 2519

 54662561 TGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGT 54662620
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2520 TGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATATTGGCATAACCAAGAGAGT 2579

 54662621 ATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAA 54662680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAA 2639

 54662681 AAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAAT 54662740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAAT 2699

 54662741 GTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTA 54662800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTA 2759

 54662801 TAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAA 54662860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAA 2819

 54662861 AAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGA 54662920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGA 2879

 54662921 TAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGG 54662980
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2880 TAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGATCAAGAAAGCCTTTCAAAGG 2939

 54662981 CCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCG 54663040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCG 2999

 54663041 GCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCT 54663100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCT 3059

 54663101 CCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAAT 54663160
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3060 CCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAAA 3119

 54663161 ACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAG 54663220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAG 3179

 54663221 GAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTT 54663280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTT 3239

 54663281 TCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAAT 54663340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAAT 3299

 54663341 GTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACA 54663400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACA 3359

 54663401 GCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGA 54663460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGA 3419

 54663461 GAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAA 54663520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAA 3479

 54663521 GGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAA 54663580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAA 3539

 54663581 AATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAA 54663640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAA 3599

 54663641 AAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATT 54663700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATT 3659

 54663701 TGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTAT 54663760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTAT 3719

 54663761 ATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGT 54663820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGT 3779

 54663821 AGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGA 54663880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGA 3839

 54663881 TAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAAC 54663940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAAC 3899

 54663941 CAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAG 54664000
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CAATTTCTTTTTTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAG 3959

 54664001 CTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGAC 54664060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGAC 4019

 54664061 TAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGT 54664120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGT 4079

 54664121 AAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGG 54664180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGG 4139

 54664181 GGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGG 54664240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGG 4199

 54664241 CCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCC 54664300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCC 4259

 54664301 ATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCT 54664360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 ATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCT 4319

 54664361 TTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCT 54664420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCT 4379

 54664421 AAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACT 54664480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 AAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACT 4439

 54664481 TTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGAT 54664540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGAT 4499

 54664541 GCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGT 54664600
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GGTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGT 4559

 54664601 GTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCA 54664660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 GTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCA 4619

 54664661 GAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAAT 54664720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4620 GAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAAT 4679

 54664721 GAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTA 54664780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 GAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTA 4739

 54664781 ACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCA 54664840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 ACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCA 4799

 54664841 TTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGT 54664900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGT 4859

 54664901 CACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAAC 54664960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 CACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAAC 4919

 54664961 ATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATC 54665020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 ATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATC 4979

 54665021 TGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGT 54665080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGT 5039

 54665081 TAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGG 54665140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5040 TAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGG 5099

 54665141 GTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTT 54665200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 GTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTT 5159

 54665201 TATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTT 54665260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 TATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTT 5219

 54665261 TCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGA 54665320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 TCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGA 5279

 54665321 AGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAG 54665380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 AGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAG 5339

 54665381 GTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTG 54665440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 GTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTG 5399

 54665441 GGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGT 54665500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGT 5459

 54665501 AAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCA 54665560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 AAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCA 5519

 54665561 GATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGC 54665620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 GATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGC 5579

 54665621 TGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAA 54665680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAA 5639

 54665681 TACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCA 54665740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 TACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCA 5699

 54665741 TTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGC 54665800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 TTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGC 5759

 54665801 CTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACA 54665860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 CTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACA 5819

 54665861 AGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGC 54665920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 AGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGC 5879

 54665921 AAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAG 54665979
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 AAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAG 5939

 54665980 AGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAAC 54666039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 AGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAAC 5999

 54666040 GACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATAC 54666099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 GACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATAC 6059

 54666100 CCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAAC 54666159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAAC 6119

 54666160 AATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTT 54666219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 AATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTT 6179

 54666220 CTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTA 54666279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 CTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTA 6239

 54666280 CTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGC 54666339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 CTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGC 6299

 54666340 TGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGA 54666399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6300 TGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAA 6359

 54666400 TAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCT 54666459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 TAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCT 6419

 54666460 CCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTC 54666519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 CCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTC 6479

 54666520 TCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGC 54666579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 TCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGC 6539

 54666580 TTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTA 54666639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 TTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTA 6599

 54666640 CACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAA 54666699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 CACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAA 6659

 54666700 CTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGAT 54666759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 CTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGAT 6719

 54666760 ACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGAT 54666819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 ACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGAT 6779

 54666820 TGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGAT 54666879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 TGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGAT 6839

 54666880 CATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGA 54666939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 CATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGA 6899

 54666940 AAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGC 54666999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 AAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGC 6959

 54667000 ATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCT 54667059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 ATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCT 7019

 54667060 CCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAG 54667119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 CCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAG 7079

 54667120 GTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTAC 54667179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 GTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTAC 7139

 54667180 AACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCT 54667239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 AACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCT 7199

 54667240 AAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTC 54667299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 AAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTC 7259

 54667300 TGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGA 54667359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 TGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGA 7319

 54667360 CCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCA 54667419
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7320 CCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACA 7379

 54667420 CACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACA 54667479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 CACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACA 7439

 54667480 GGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGG 54667539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 GGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGG 7499

 54667540 AGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAA 54667599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 AGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAA 7559

 54667600 GCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAA 54667659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 GCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAA 7619

 54667660 AGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATC 54667719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 AGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATC 7679

 54667720 TATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAG 54667779
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 TATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAG 7739

 54667780 AGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCA 54667839
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7740 AGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACA 7799

 54667840 TTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTC 54667899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 TTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTC 7859

 54667900 TTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTT 54667959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 TTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTT 7919

 54667960 TACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTG 54668019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 TACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTG 7979

 54668020 GTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGT 54668079
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 GTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGT 8039

 54668080 CTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGG 54668139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8040 CTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGG 8099

 54668140 GAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTG 54668199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     8100 GAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTG 8159

 54668200 GGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACA 54668259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 GGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACA 8219

 54668260 AGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGG 54668319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 AGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGG 8279

 54668320 AAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAA 54668379
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     8280 AAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAA 8339

 54668380 GGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGC 54668439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 GGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGC 8399

 54668440 TTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAA 54668499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 TTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAA 8459

 54668500 ACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCC 54668559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 ACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCC 8519

 54668560 CTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGAT 54668619
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     8520 TTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGAT 8579

 54668620 AGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACC 54668679
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8580 AGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACC 8639

 54668680 TGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCA 54668739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     8640 TGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCA 8699

 54668740 ACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAG 54668799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8700 ACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAG 8759

 54668800 AAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGT 54668859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8760 AAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGT 8819

 54668860 CAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATG 54668919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8820 CAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATG 8879

 54668920 TTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     8880 TTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 8933

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8934 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 8993

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8994 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 9053

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9054 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 9113

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9114 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 9173

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9174 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 9233

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     9234 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 9293

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9294 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 9353

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9354 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 9413

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     9414 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 9473

 54670080 TCTCCCCATG 54670089
          ||||||||||
     9474 TCTCCCCATG 9483

Alignment time is 6.99096 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4304] =>      4304 nucs 'mol-32-310c-069637_4304'

Score:        3979
Aligned:      4306        nucs
Identic:      4273 ( 99%) nucs =>      3703 ( 99%)       570 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54673270] EXCISED REGION [54673275,54673846]
 second seq =>  [       1,    3729] EXCISED REGION [    3733,    4304]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [54673271,54673274]
 second seq =>         3 nucs [3730,3732]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3729,3729] to [3732,3732]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54673271,54673272] to [54673273,54673274]
 second seq =>         0 nucs

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 1855

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 1915

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 1975

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 2035

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 2095

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2096 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 2155

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2156 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 2215

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 2275

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2276 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 2335

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2336 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 2395

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 2455

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     2456 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 2515

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2516 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 2575

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 2635

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 2695

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 2755

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 2815

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 2875

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 2935

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 2995

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 3055

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3056 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 3115

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 3175

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 3235

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 3295

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3296 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 3355

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3356 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 3415

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3416 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 3475

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 3535

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     3536 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 3595

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 3655

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 3715

 54673257 TGTGAACAGATAAA 54673270
          ||||||||||||||
     3716 TGTGAACAGATAAA 3729

EXCISED REGION

 54673275 GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAA 54673334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAA 3792

 54673335 TTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTG 54673394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTG 3852

 54673395 AATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTT 54673454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 AATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTT 3912

 54673455 GGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTATG 54673514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 GGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTATG 3972

 54673515 GGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGTTGCACAGCTGTATATG 54673574
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3973 GGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATATAGTGGTGGGGGTTGCACAGCTGTATATG 4032

 54673575 TTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTTTAAGTTTTACTGCATG 54673634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 TTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTTTAAGTTTTACTGCATG 4092

 54673635 TATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACAAATATATATATTGAGGAGTAT 54673694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4093 TATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACAAATATATATATTGAGGGGTAT 4152

 54673695 GTTTATATCTCAAATCCATCTTCCCAATCCTATTTTAGAATATTTTAGAAATTCTAGAGC 54673754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 GTTTATATCTCAAATCCATCTTCCCAATCCTATTTTAGAATATTTTAGAAATTCTAGAGC 4212

 54673755 ATAGAGAAAAGGGAAATAATACATATAAGACTTGGAAAAAATAAAGACAATTTCTATTAT 54673814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 ATAGAGAAAAGGGAAATAATACATATAAGACTTGGAAAAAATAAAGACAATTTCTATTAT 4272

 54673815 TCACACATGATATTATTATCTATATTAAAAAC 54673846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 TCACACATGATATTATTATCTATATTAAAAAC 4304

Alignment time is 3.25146 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8979] =>      8979 nucs 'mol-32-310c-111810_8979'

Score:        8978
Aligned:      8978        nucs
Identic:      8978 (100%) nucs =>      8048 (100%)       930 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54662451,54670498] EXCISED REGION [54670499,54671428]
 second seq =>  [       1,    8048] EXCISED REGION [    8050,    8979]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [8049,8049]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [8049,8054] to [8050,8055]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54662451 TGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGA 54662510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGA 60

 54662511 CTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGC 54662570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGC 120

 54662571 CAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATG 54662630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATG 180

 54662631 AGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTA 54662690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTA 240

 54662691 TAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAG 54662750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAG 300

 54662751 ATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGA 54662810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGA 360

 54662811 GTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAA 54662870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAA 420

 54662871 AAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAA 54662930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAA 480

 54662931 ATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATC 54662990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATC 540

 54662991 AGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATT 54663050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATT 600

 54663051 CAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACT 54663110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACT 660

 54663111 CATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAG 54663170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAG 720

 54663171 AAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTT 54663230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTT 780

 54663231 ATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATC 54663290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATC 840

 54663291 AATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTC 54663350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTC 900

 54663351 AGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAA 54663410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAA 960

 54663411 TCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGG 54663470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGG 1020

 54663471 CTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCT 54663530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCT 1080

 54663531 AGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACAT 54663590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACAT 1140

 54663591 GATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTA 54663650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTA 1200

 54663651 CAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGT 54663710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGT 1260

 54663711 GGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAA 54663770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAA 1320

 54663771 TATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTT 54663830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTT 1380

 54663831 ATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGT 54663890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGT 1440

 54663891 ATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTT 54663950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTT 1500

 54663951 TTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTT 54664010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTT 1560

 54664011 GCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTT 54664070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTT 1620

 54664071 CAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAA 54664130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAA 1680

 54664131 TATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGC 54664190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGC 1740

 54664191 CTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAA 54664250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAA 1800

 54664251 ATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGA 54664310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGA 1860

 54664311 TTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCT 54664370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCT 1920

 54664371 TTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTT 54664430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTT 1980

 54664431 GGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATG 54664490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATG 2040

 54664491 GTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGT 54664550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGT 2100

 54664551 GGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAA 54664610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAA 2160

 54664611 GATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGT 54664670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGT 2220

 54664671 TCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAA 54664730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAA 2280

 54664731 CAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGA 54664790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGA 2340

 54664791 GGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTC 54664850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTC 2400

 54664851 TTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGG 54664910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGG 2460

 54664911 ATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGA 54664970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGA 2520

 54664971 TAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACC 54665030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACC 2580

 54665031 GTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTT 54665090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTT 2640

 54665091 GATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTA 54665150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTA 2700

 54665151 CATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATA 54665210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATA 2760

 54665211 AAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATA 54665270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATA 2820

 54665271 TTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGG 54665330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGG 2880

 54665331 GTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATG 54665390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATG 2940

 54665391 AGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTT 54665450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTT 3000

 54665451 CAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTA 54665510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTA 3060

 54665511 AACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTT 54665570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTT 3120

 54665571 TAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAA 54665630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAA 3180

 54665631 AATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATG 54665690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATG 3240

 54665691 CGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGC 54665750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGC 3300

 54665751 TTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAA 54665810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAA 3360

 54665811 ACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCT 54665870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCT 3420

 54665871 AGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTT 54665930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTT 3480

 54665931 TCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAG 54665990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAG 3540

 54665991 CACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAA 54666050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAA 3600

 54666051 TATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTG 54666110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTG 3660

 54666111 GGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTG 54666170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTG 3720

 54666171 CTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGT 54666230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGT 3780

 54666231 GTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCT 54666290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCT 3840

 54666291 CTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCAC 54666350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCAC 3900

 54666351 ACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACC 54666410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACC 3960

 54666411 AGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTC 54666470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTC 4020

 54666471 TGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCC 54666530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCC 4080

 54666531 AAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCC 54666590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCC 4140

 54666591 TAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTT 54666650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTT 4200

 54666651 GGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAA 54666710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAA 4260

 54666711 TTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGG 54666770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGG 4320

 54666771 TACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCT 54666830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCT 4380

 54666831 CTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTC 54666890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTC 4440

 54666891 AAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTG 54666950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTG 4500

 54666951 CTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGAT 54667010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGAT 4560

 54667011 TTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTT 54667070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTT 4620

 54667071 TTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGG 54667130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGG 4680

 54667131 CATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAG 54667190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAG 4740

 54667191 TTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTG 54667250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTG 4800

 54667251 GAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATT 54667310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATT 4860

 54667311 TGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGC 54667370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGC 4920

 54667371 ATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCA 54667430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCA 4980

 54667431 GTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATG 54667490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATG 5040

 54667491 TAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTC 54667550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTC 5100

 54667551 CTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAG 54667610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAG 5160

 54667611 TTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCC 54667670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCC 5220

 54667671 AGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAAT 54667730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAAT 5280

 54667731 GTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTG 54667790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTG 5340

 54667791 CAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAA 54667850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAA 5400

 54667851 ATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATG 54667910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATG 5460

 54667911 TAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTG 54667970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTG 5520

 54667971 AAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAG 54668030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAG 5580

 54668031 GTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTA 54668090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTA 5640

 54668091 TTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGA 54668150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGA 5700

 54668151 ATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACC 54668210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACC 5760

 54668211 AAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAAT 54668270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAAT 5820

 54668271 CACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCT 54668330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCT 5880

 54668331 GCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCG 54668390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCG 5940

 54668391 ACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACT 54668450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACT 6000

 54668451 GTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAA 54668510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAA 6060

 54668511 ATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATA 54668570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATA 6120

 54668571 GATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCA 54668630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCA 6180

 54668631 TGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGC 54668690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGC 6240

 54668691 GCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAG 54668750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAG 6300

 54668751 AATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGA 54668810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGA 6360

 54668811 TGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATA 54668870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATA 6420

 54668871 AAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTG 54668930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTG 6480

 54668931 CTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACAT 54668990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACAT 6540

 54668991 GGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATT 54669050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATT 6600

 54669051 GACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAG 54669110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 GACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAG 6660

 54669111 TTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGA 54669170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGA 6720

 54669171 CACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACA 54669230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 CACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACA 6780

 54669231 GTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGA 54669290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGA 6840

 54669291 AGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCT 54669350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 AGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCT 6900

 54669351 TTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGC 54669410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGC 6960

 54669411 TGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGT 54669470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGT 7020

 54669471 ATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAA 54669530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAA 7080

 54669531 TAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGA 54669590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGA 7140

 54669591 GGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTA 54669650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTA 7200

 54669651 GAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGA 54669710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 GAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGA 7260

 54669711 GAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCA 54669770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 GAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCA 7320

 54669771 GGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTC 54669830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 GGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTC 7380

 54669831 ATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAG 54669890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 ATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAG 7440

 54669891 ACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAG 54669950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 ACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAG 7500

 54669951 CAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTG 54670010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 CAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTG 7560

 54670011 CTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTC 54670070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 CTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTC 7620

 54670071 ATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTT 54670130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 ATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTT 7680

 54670131 GAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTA 54670190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 GAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTA 7740

 54670191 CAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAG 54670250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 CAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAG 7800

 54670251 CGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGA 54670310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 CGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGA 7860

 54670311 AGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGA 54670370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 AGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGA 7920

 54670371 CTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAG 54670430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 CTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAG 7980

 54670431 ATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTG 54670490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 ATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTG 8040

 54670491 CTTCCTCA 54670498
          ||||||||
     8041 CTTCCTCA 8048

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8050 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 8109

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8110 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 8169

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8170 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 8229

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8230 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 8289

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8290 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 8349

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8350 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 8409

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8410 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 8469

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8470 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 8529

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8530 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 8589

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8590 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 8649

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8650 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 8709

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8710 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 8769

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8770 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 8829

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8830 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 8889

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8890 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 8949

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATT 54671428
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     8950 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATT 8979

Alignment time is 6.64564 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9339] =>      9339 nucs 'mol-32-314e-203887_9339'

Score:        8852
Aligned:      9344        nucs
Identic:      9296 ( 99%) nucs =>      5978 (100%)      3318 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54662975,54668973] EXCISED REGION [54669540,54672880]
 second seq =>  [       1,    6000] EXCISED REGION [    6001,    9339]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54662975 CAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAAC 54663034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAAC 60

 54663035 AATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAA 54663094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAA 120

 54663095 AGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAG 54663154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAG 180

 54663155 TAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACG 54663214
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGAAAACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACG 240

 54663215 TCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAA 54663274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAA 300

 54663275 CAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTG 54663334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTG 360

 54663335 AAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGG 54663394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGG 420

 54663395 GACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAG 54663454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAG 480

 54663455 GTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTT 54663514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTT 540

 54663515 CCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTAT 54663574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTAT 600

 54663575 TTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAA 54663634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAA 660

 54663635 AAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATA 54663694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATA 720

 54663695 TATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATT 54663754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATT 780

 54663755 TTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATAT 54663814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATAT 840

 54663815 AGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTA 54663874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTA 900

 54663875 GGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCC 54663934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCC 960

 54663935 CAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACA 54663994
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAAACCAATTTCTTTTTTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACA 1020

 54663995 AGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACC 54664054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACC 1080

 54664055 TGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGG 54664114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGG 1140

 54664115 TACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTA 54664174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTA 1200

 54664175 GGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATC 54664234
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGTGGGGCAACCAGCCTCCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATC 1260

 54664235 TGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAG 54664294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAG 1320

 54664295 TCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGT 54664354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGT 1380

 54664355 TCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTG 54664414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTG 1440

 54664415 TGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCAC 54664474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCAC 1500

 54664475 TTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTT 54664534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTT 1560

 54664535 CATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGAC 54664594
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATGATGGTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGAC 1620

 54664595 CTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCAC 54664654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCAC 1680

 54664655 CTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAAT 54664714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1681 CTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAAT 1740

 54664715 CATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAA 54664774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAA 1800

 54664775 CTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACAT 54664834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACAT 1860

 54664835 GTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTAT 54664894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTAT 1920

 54664895 TGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGC 54664954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGC 1980

 54664955 TTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGG 54665014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGG 2040

 54665015 GACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGT 54665074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGT 2100

 54665075 TTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATT 54665134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2101 TTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATT 2160

 54665135 AAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAAT 54665194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAAT 2220

 54665195 ATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTT 54665254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTT 2280

 54665255 AAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCC 54665314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCC 2340

 54665315 CTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAG 54665374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAG 2400

 54665375 GAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAA 54665434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAA 2460

 54665435 TATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGC 54665494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGC 2520

 54665495 TATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCA 54665554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCA 2580

 54665555 TTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAA 54665614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAA 2640

 54665615 GAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGC 54665674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGC 2700

 54665675 AGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCT 54665734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCT 2760

 54665735 CATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCT 54665794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCT 2820

 54665795 AACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGT 54665854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGT 2880

 54665855 TGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAAT 54665914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAAT 2940

 54665915 GGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGT 54665973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGT 3000

 54665974 GCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCAC 54666033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCAC 3060

 54666034 CCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACAC 54666093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACAC 3120

 54666094 ACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCAT 54666153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCAT 3180

 54666154 TTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTT 54666213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTT 3240

 54666214 TTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAAT 54666273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAAT 3300

 54666274 GTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCT 54666333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCT 3360

 54666334 GAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGC 54666393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGC 3420

 54666394 TGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTC 54666453
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGCCAATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTC 3480

 54666454 CAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGC 54666513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGC 3540

 54666514 TCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCT 54666573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCT 3600

 54666574 TCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGT 54666633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGT 3660

 54666634 GCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTG 54666693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTG 3720

 54666694 ATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTA 54666753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTA 3780

 54666754 ACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTC 54666813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTC 3840

 54666814 TAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTG 54666873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTG 3900

 54666874 GGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTT 54666933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTT 3960

 54666934 GTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGAT 54666993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGAT 4020

 54666994 CATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTT 54667053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTT 4080

 54667054 GGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGA 54667113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGA 4140

 54667114 TGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACA 54667173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACA 4200

 54667174 ATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTG 54667233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTG 4260

 54667234 TGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAG 54667293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAG 4320

 54667294 AGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGAT 54667353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGAT 4380

 54667354 GAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGC 54667413
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGC 4440

 54667414 CTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAG 54667473
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAG 4500

 54667474 AAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATG 54667533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATG 4560

 54667534 AGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACG 54667593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACG 4620

 54667594 CCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCAT 54667653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCAT 4680

 54667654 AGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAG 54667713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAG 4740

 54667714 GATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAA 54667773
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAA 4800

 54667774 TGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGC 54667833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGC 4860

 54667834 AGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATC 54667893
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATC 4920

 54667894 CAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACA 54667953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACA 4980

 54667954 GTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGAT 54668013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGAT 5040

 54668014 TCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCT 54668073
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCT 5100

 54668074 ACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCAC 54668133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCAC 5160

 54668134 TTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAA 54668193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5161 TTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAA 5220

 54668194 TCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGG 54668253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGG 5280

 54668254 CACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTT 54668313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTT 5340

 54668314 CTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGT 54668373
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGT 5400

 54668374 CACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCA 54668433
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCA 5460

 54668434 GGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTT 54668493
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GGGTACTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTT 5520

 54668494 TATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCT 54668553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCT 5580

 54668554 ATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGA 54668613
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5581 ATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCA 5640

 54668614 GGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGT 54668673
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGT 5700

 54668674 TCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATA 54668733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5701 TCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATA 5760

 54668734 GACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATC 54668793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATC 5820

 54668794 CAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAA 54668853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAA 5880

 54668854 GACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCAC 54668913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCAC 5940

 54668914 TGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5941 TGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 6000

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 6060

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 6120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 6180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 6240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 6300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 6360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 6420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 6480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 6540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 6600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 6660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 6720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 6780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 6840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 6900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     6901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 6960

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 7020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 7080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     7081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 7138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 7198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 7257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 7317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 7377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 7437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 7497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 7557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 7617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 7677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 7737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 7797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     7798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 7855

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7856 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 7915

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7916 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 7975

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7976 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 8035

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8036 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 8095

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     8096 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 8155

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     8156 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 8215

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8216 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 8275

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     8276 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 8335

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     8336 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 8395

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8396 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 8455

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     8456 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 8515

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     8516 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 8575

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8576 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 8635

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8636 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 8695

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8696 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 8755

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8756 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 8815

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8816 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 8875

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8876 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 8935

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8936 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 8995

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8996 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 9055

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     9056 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 9115

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     9116 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 9175

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9176 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 9235

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9236 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 9295

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCG 54672880
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9296 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCG 9339

Alignment time is 6.97274 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3339] =>      3339 nucs 'mol-32-314e-203887_3339'

Score:        3107
Aligned:      3340        nucs
Identic:      3318 ( 99%) nucs =>      1830 (100%)      1488 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54671377] EXCISED REGION [54671380,54672880]
 second seq =>  [       1,    1836] EXCISED REGION [    1839,    3339]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [54671378,54671379]
 second seq =>         2 nucs [1837,1838]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54671377,54671377] to [54671379,54671379]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54671376,54671377] to [54671380,54671381]
 second seq =>         2 nucs [1835,1836] to [1839,1840]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1837,1837] to [1838,1838]

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 54671377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 1836

EXCISED REGION

 54671380 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 54671439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1839 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 1898

 54671440 TTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 54671499
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TTTCAATTATCTCAATGTTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 1958

 54671500 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 54671559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 2018

 54671560 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 54671619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 2078

 54671620 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGA 54671679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2079 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGA 2138

 54671680 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 54671739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 2198

 54671740 GAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 54671799
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 GAAAAGTTAAAAATCACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 2258

 54671800 TGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAA 54671859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2259 TGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAA 2318

 54671860 ATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCT 54671919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 ATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCT 2378

 54671920 TCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCAT 54671979
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TCAAAATGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCAT 2438

 54671980 CAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGA 54672039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2439 CAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGA 2498

 54672040 AGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTA 54672099
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2499 AGAGAGGAGATGAAAGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTA 2558

 54672100 TATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTG 54672159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 TATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTG 2618

 54672160 AGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCC 54672219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 AGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCC 2678

 54672220 CTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCA 54672279
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2679 CTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCA 2738

 54672280 CTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAA 54672339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 CTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAA 2798

 54672340 ACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCA 54672399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 ACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCA 2858

 54672400 ACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGT 54672459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 ACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGT 2918

 54672460 CTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATC 54672519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 CTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATC 2978

 54672520 TGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCT 54672579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 TGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCT 3038

 54672580 GCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCAC 54672639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 GCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCAC 3098

 54672640 AGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGA 54672699
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3099 AGAAGTGTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGA 3158

 54672700 TTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCC 54672759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 TTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCC 3218

 54672760 TTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAA 54672819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 TTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAA 3278

 54672820 AGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 54672879
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 AGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 3338

 54672880 G 54672880
          |
     3339 G 3339

Alignment time is 2.52508 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5748] =>      5748 nucs 'mol-32-3159-169130_5748'

Score:        5264
Aligned:      5757        nucs
Identic:      5704 ( 99%) nucs =>      1712 ( 99%)      3992 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667248,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673564]
 second seq =>  [       1,    1726] EXCISED REGION [    1727,    5748]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54667248 CTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAA 54667307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAA 60

 54667308 ATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCA 54667367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCA 120

 54667368 GGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATA 54667427
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      121 GGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATA 180

 54667428 TCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGG 54667487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGG 240

 54667488 ATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTC 54667547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTC 300

 54667548 TTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGC 54667607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGC 360

 54667608 CAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGAT 54667667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGAT 420

 54667668 TCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAA 54667727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAA 480

 54667728 AATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGA 54667787
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGA 540

 54667788 TTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAAT 54667847
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      541 TTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAAT 600

 54667848 AAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTA 54667907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTA 660

 54667908 ATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCT 54667967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCT 720

 54667968 GTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATC 54668027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATC 780

 54668028 AAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTA 54668087
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTA 840

 54668088 CTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTC 54668147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTC 900

 54668148 AGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGC 54668207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      901 AGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGC 960

 54668208 ACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGAC 54668267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGAC 1020

 54668268 AATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCC 54668327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCC 1080

 54668328 CCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTA 54668387
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1081 CCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTA 1140

 54668388 TCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGC 54668447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGC 1200

 54668448 ACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCT 54668507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCT 1260

 54668508 CAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGAC 54668567
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1261 CAAATTAGACTTGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGAC 1320

 54668568 ATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAG 54668627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1321 ATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAG 1380

 54668628 CCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGC 54668687
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGC 1440

 54668688 TGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGA 54668747
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGA 1500

 54668748 GAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCT 54668807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCT 1560

 54668808 AGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATA 54668867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATA 1620

 54668868 ATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAA 54668927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAA 1680

 54668928 CTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1681 CTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 1726

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 1786

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 1846

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 1906

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 1966

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 2026

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2027 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 2086

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 2146

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 2206

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2207 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 2266

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 2326

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 2386

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 2446

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 2506

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 2566

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 2626

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     2627 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 2686

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2687 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 2746

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 2806

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     2807 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 2864

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 2924

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 2983

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 3043

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 3103

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 3163

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 3223

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 3283

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 3343

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 3403

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 3463

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 3523

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     3524 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 3581

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 3641

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 3701

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 3761

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 3821

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3822 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 3881

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3882 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 3941

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 4001

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4002 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 4061

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4062 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 4121

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 4181

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     4182 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 4241

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4242 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 4301

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 4361

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 4421

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 4481

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 4541

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 4601

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 4661

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 4721

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 4781

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4782 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 4841

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4842 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 4901

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 4961

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 5021

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5022 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 5081

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5082 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 5141

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5142 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 5201

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 5261

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     5262 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 5321

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 5381

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 5441

 54673257 TGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 54673313
          ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 TGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 5497

 54673314 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 54673373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5498 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 5557

 54673374 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 54673433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5558 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 5617

 54673434 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 54673493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5618 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 5677

 54673494 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTG 54673553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5678 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATATAGTGGTG 5737

 54673554 GGGGTTGCACA 54673564
          |||||||||||
     5738 GGGGTTGCACA 5748

Alignment time is 4.36185 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4573] =>      4573 nucs 'mol-32-3164-006018_4573'

Score:        4572
Aligned:      4572        nucs
Identic:      4572 (100%) nucs =>      1504 (100%)      3068 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54668995,54670498] EXCISED REGION [54670499,54673566]
 second seq =>  [       1,    1504] EXCISED REGION [    1506,    4573]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1505,1505]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [1505,1510] to [1506,1511]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54668995 CCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACC 54669054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACC 60

 54669055 AACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGT 54669114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGT 120

 54669115 TATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACA 54669174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACA 180

 54669175 CCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCC 54669234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCC 240

 54669235 TGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCT 54669294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCT 300

 54669295 CGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTAT 54669354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTAT 360

 54669355 CCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGG 54669414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGG 420

 54669415 TACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCA 54669474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCA 480

 54669475 CCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGA 54669534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGA 540

 54669535 AGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTT 54669594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTT 600

 54669595 TTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAG 54669654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAG 660

 54669655 CAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAA 54669714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAA 720

 54669715 GGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAG 54669774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAG 780

 54669775 ATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGG 54669834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGG 840

 54669835 CACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTA 54669894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTA 900

 54669895 GCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGA 54669954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGA 960

 54669955 GGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGC 54670014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGC 1020

 54670015 CTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATAT 54670074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATAT 1080

 54670075 CAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGG 54670134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGG 1140

 54670135 ACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGA 54670194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGA 1200

 54670195 CTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCC 54670254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCC 1260

 54670255 ATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCC 54670314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCC 1320

 54670315 CTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAG 54670374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAG 1380

 54670375 CAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCC 54670434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCC 1440

 54670435 TGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTC 54670494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTC 1500

 54670495 CTCA 54670498
          ||||
     1501 CTCA 1504

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 1565

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1625

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1685

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1745

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1805

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1865

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1925

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1985

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 2045

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 2105

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 2165

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 2225

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 2285

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 2345

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 2405

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 2465

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 2525

 54671519 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 54671578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 2585

 54671579 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 54671638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 2645

 54671639 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 54671698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 2705

 54671699 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 54671758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 2765

 54671759 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 54671818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 2825

 54671819 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 54671878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 2885

 54671879 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 54671938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 2945

 54671939 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 54671998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 3005

 54671999 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 54672058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 3065

 54672059 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 54672118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 3125

 54672119 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 54672178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 3185

 54672179 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 54672238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 3245

 54672239 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 54672298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 3305

 54672299 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 54672358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 3365

 54672359 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 54672418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 3425

 54672419 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 54672478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 3485

 54672479 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 54672538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 3545

 54672539 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 54672598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 3605

 54672599 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 54672658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 3665

 54672659 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 54672718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 3725

 54672719 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 54672778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 3785

 54672779 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 54672838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 3845

 54672839 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 54672898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 3905

 54672899 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 54672958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 3965

 54672959 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 54673018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 4025

 54673019 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 54673078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 4085

 54673079 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 54673138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 4145

 54673139 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 54673198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 4205

 54673199 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 54673258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 4265

 54673259 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 54673318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 4325

 54673319 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 54673378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 4385

 54673379 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCC 54673438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCC 4445

 54673439 TGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAG 54673498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 TGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAG 4505

 54673499 CTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGT 54673558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 CTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGT 4565

 54673559 TGCACAGC 54673566
          ||||||||
     4566 TGCACAGC 4573

Alignment time is 3.4141 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5715] =>      5715 nucs 'mol-32-3164-239542_5715'

Score:        5681
Aligned:      5714        nucs
Identic:      5711 (100%) nucs =>      1186 (100%)      4525 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667391,54668576] EXCISED REGION [54668578,54673104]
 second seq =>  [       1,    1186] EXCISED REGION [    1188,    5715]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54668577,54668577]
 second seq =>         1 nucs [1187,1187]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3109,3109]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668576,54668576] to [54668577,54668577]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54667391 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 54667450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 60

 54667451 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 54667510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 120

 54667511 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 54667570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 180

 54667571 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 54667630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 240

 54667631 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 54667690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 300

 54667691 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 54667750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 360

 54667751 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 54667810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 420

 54667811 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 54667870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 480

 54667871 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 54667930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 540

 54667931 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 54667990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 600

 54667991 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 54668050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 660

 54668051 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 54668110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 720

 54668111 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 54668170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 780

 54668171 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 54668230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 840

 54668231 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 54668290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 900

 54668291 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 54668350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 960

 54668351 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 54668410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 1020

 54668411 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 54668470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 1080

 54668471 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 54668530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 1140

 54668531 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGT 54668576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGT 1186

EXCISED REGION

 54668578 GCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTG 54668637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 GCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTG 1247

 54668638 TGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTC 54668697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 TGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTC 1307

 54668698 CCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCC 54668757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 CCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCC 1367

 54668758 TTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGC 54668817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 TTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGC 1427

 54668818 CCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACC 54668877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 CCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACC 1487

 54668878 ATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGT 54668937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 ATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGT 1547

 54668938 AACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCT 54668997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 AACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCT 1607

 54668998 GGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAAC 54669057
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1608 GGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTCCTGTGGTGTGTGCAATTGACCAAC 1667

 54669058 CACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTAT 54669117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 CACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTAT 1727

 54669118 CTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCG 54669177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 CTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCG 1787

 54669178 TTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGT 54669237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 TTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGT 1847

 54669238 GGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGT 54669297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 GGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGT 1907

 54669298 TTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCC 54669357
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 TTTCTGGTGGAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCC 1967

 54669358 AGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTAC 54669417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 AGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTAC 2027

 54669418 CATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCT 54669477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 CATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCT 2087

 54669478 ATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGT 54669537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 ATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGT 2147

 54669538 CTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTA 54669597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 CTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTA 2207

 54669598 TGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAG 54669657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 TGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAG 2267

 54669658 AGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGG 54669717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 AGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGG 2327

 54669718 CTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATT 54669777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 CTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATT 2387

 54669778 CCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCAC 54669837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 CCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCAC 2447

 54669838 AGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCA 54669897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 AGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCA 2507

 54669898 GAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGC 54669957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 GAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGC 2567

 54669958 CATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTT 54670017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 CATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTT 2627

 54670018 ACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAA 54670077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 ACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAA 2687

 54670078 CATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACA 54670137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 CATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACA 2747

 54670138 TGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTG 54670197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 TGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTG 2807

 54670198 ATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATC 54670257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 ATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATC 2867

 54670258 AATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTA 54670317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 AATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTA 2927

 54670318 ATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAA 54670377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 ATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAA 2987

 54670378 CTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGG 54670437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 CTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGG 3047

 54670438 TTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTC 54670497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 TTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTC 3107

 54670498 A-CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTT 54670556
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 ACCCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTT 3167

 54670557 TATTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTG 54670616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 TATTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTG 3227

 54670617 ACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTA 54670676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 ACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTA 3287

 54670677 TATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAA 54670736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 TATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAA 3347

 54670737 TGCATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTG 54670796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 TGCATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTG 3407

 54670797 GATTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAA 54670856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 GATTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAA 3467

 54670857 TCAAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATC 54670916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 TCAAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATC 3527

 54670917 CTCTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAA 54670976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 CTCTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAA 3587

 54670977 ACATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCA 54671036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 ACATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCA 3647

 54671037 TTTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCA 54671096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 TTTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCA 3707

 54671097 TGCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAA 54671156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 TGCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAA 3767

 54671157 TTTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAA 54671216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 TTTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAA 3827

 54671217 CACATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAAT 54671276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 CACATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAAT 3887

 54671277 AAGTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTT 54671336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 AAGTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTT 3947

 54671337 CAGGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTT 54671396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 CAGGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTT 4007

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 4067

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 4127

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 4187

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 4247

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 4307

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 4367

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 4427

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 4487

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 4547

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 4607

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 4667

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 4727

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 4787

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 4847

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 4907

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 4967

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 5027

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 5087

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 5147

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 5207

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5208 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 5267

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 5327

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 5387

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 5447

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 5507

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5508 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 5567

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5568 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 5627

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5628 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 5687

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAA 54673104
          ||||||||||||||||||||||||||||
     5688 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAA 5715

Alignment time is 4.24446 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3089] =>      3089 nucs 'mol-32-317a-138503_3089'

Score:        2847
Aligned:      3091        nucs
Identic:      3068 ( 99%) nucs =>      1920 ( 99%)      1148 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667040,54668973] EXCISED REGION [54669540,54670695]
 second seq =>  [       1,    1934] EXCISED REGION [    1935,    3089]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54667040 ACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGG 54667099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGG 60

 54667100 TCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAG 54667159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAG 120

 54667160 TTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATG 54667219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATG 180

 54667220 AAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACAT 54667279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACAT 240

 54667280 GTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAG 54667339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAG 300

 54667340 GGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACT 54667399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      301 GGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACT 360

 54667400 TAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATA 54667459
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATA 420

 54667460 GACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCC 54667519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCC 480

 54667520 TTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTA 54667579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTA 540

 54667580 CCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCAT 54667639
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTAAACTATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCAT 600

 54667640 GCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGG 54667699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGG 660

 54667700 CTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCA 54667759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      661 CTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCA 720

 54667760 GGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGG 54667819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGG 780

 54667820 CATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATT 54667879
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATT 840

 54667880 TAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAA 54667939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAA 900

 54667940 GCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCAT 54667999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCAT 960

 54668000 GTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAA 54668059
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAA 1020

 54668060 AAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGT 54668119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGT 1080

 54668120 CACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGAC 54668179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGAC 1140

 54668180 CAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAG 54668239
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAG 1200

 54668240 ATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGA 54668299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGA 1260

 54668300 GGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAA 54668359
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1261 GGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAA 1320

 54668360 TCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGA 54668419
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGA 1380

 54668420 ACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTT 54668479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTT 1440

 54668480 GTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACT 54668539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACT 1500

 54668540 CTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTG 54668599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTG 1560

 54668600 GCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTA 54668659
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1561 GCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTA 1620

 54668660 GAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGA 54668719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1621 GAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAA 1680

 54668720 TAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAA 54668779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAA 1740

 54668780 ATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCC 54668839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCC 1800

 54668840 ACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAG 54668899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAG 1860

 54668900 CTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCAC 54668959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1861 CTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCAC 1920

 54668960 CTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||
     1921 CTCGCCTGCTTGCC 1934

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 1994

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 2054

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 2114

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 2174

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 2234

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2235 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 2294

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 2354

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 2414

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2415 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 2474

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 2534

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2535 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGCGGTACAGACTGAT 2594

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 2654

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 2714

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 2774

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 2834

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     2835 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 2894

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2895 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 2954

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 3014

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     3015 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 3072

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGA 54670695
          |||||||||||||||||
     3073 TCTAAAAGGATTTAGGA 3089

Alignment time is 2.34282 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   12050] =>     12050 nucs 'mol-32-322a-136006_12050'

Score:       11422
Aligned:     12064        nucs
Identic:     11995 ( 99%) nucs =>      8054 (100%)      3941 ( 99%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54660892,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673513]
 second seq =>  [       1,    8080] EXCISED REGION [    8081,   12050]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54660892 TTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTATCTGCTTGGATTTTAATTTTCTTTGTAAA 54660951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTATCTGCTTGGATTTTAATTTTCTTTGTAAA 60

 54660952 CTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAAGTTAACAGCAGAGACAGGTGACTGCCATC 54661011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAAGTTAACAGCAGAGACAGGTGACTGCCATC 120

 54661012 AGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCACACATGAAGGACACATCCTTCTGAACAAT 54661071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCACACATGAAGGACACATCCTTCTGAACAAT 180

 54661072 GCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTGTGCACTTTAATTTCTTATTAAACAAAATA 54661131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTGTGCACTTTAATTTCTTATTAAACAAAATA 240

 54661132 ACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGCAAAACTTTACTGACCACGAGATTCTTATT 54661191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGCAAAACTTTACTGACCACGAGATTCTTATT 300

 54661192 CCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGGAGTTTTAAATGAAAAATAACTGATGCTTA 54661251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGGAGTTTTAAATGAAAAATAACTGATGCTTA 360

 54661252 CTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATAATTTCTATTTATGAAAACGGTCCCTCTTT 54661311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATAATTTCTATTTATGAAAACGGTCCCTCTTT 420

 54661312 AATAACTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAAGAATTTTCCTCTGAGAGATTTTACATTAT 54661371
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAATTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAAGAATTTTCCTCTGAGAGATTTTACATTAT 480

 54661372 CAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTAAACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAAGAAAC 54661431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTAAACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAAGAAAC 540

 54661432 TTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGTTTAACTGCTGCTGTCACATGGAAAAAAAT 54661491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGTTTAACTGCTGCTGTCACATGGAAAAAAAT 600

 54661492 GAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTGAAAACATAAATATCACAAATGACCTTGAG 54661551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTGAAAACATAAATATCACAAATGACCTTGAG 660

 54661552 TGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGGCTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGAATGAG 54661611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGGCTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGAATGAG 720

 54661612 AGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAAAAAT 54661671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAAAAAT 780

 54661672 GAGCAGATAGGGAGGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTTTAGT 54661731
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGCAGATAAGGAGGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTTTAGT 840

 54661732 TTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAAAAAA 54661791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      841 TTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAAAAA- 899

 54661792 ACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGAATAA 54661851
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 -CCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGAATAA 958

 54661852 ATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAATGGAA 54661911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 ATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAATGGAA 1018

 54661912 GACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGA 54661971
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATA-CACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGA 1077

 54661972 GATGCAGGTATATTGGTGCGGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAA 54662031
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GATGCAGGTATATTGGTGCAGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAA 1137

 54662032 ATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATAT 54662091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 ATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATAT 1197

 54662092 GGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCC 54662151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCC 1257

 54662152 ACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTA 54662211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTA 1317

 54662212 ACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAAT 54662271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 ACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAAT 1377

 54662272 GACAAGGGGGCTTCTTCGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGG 54662331
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GACAAGGGGGCTTCTTTGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGG 1437

 54662332 ACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGT 54662391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGT 1497

 54662392 GTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATT 54662451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATT 1557

 54662452 GAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGAC 54662511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGAC 1617

 54662512 TGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCC 54662571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCC 1677

 54662572 AGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGA 54662631
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1678 AGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATATTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGA 1737

 54662632 GTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTAT 54662691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTAT 1797

 54662692 AACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGA 54662751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGA 1857

 54662752 TAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAG 54662811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAG 1917

 54662812 TAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAA 54662871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAA 1977

 54662872 AACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAA 54662931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAA 2037

 54662932 TCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCA 54662991
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGATCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCA 2097

 54662992 GTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTC 54663051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTC 2157

 54663052 AAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTC 54663111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 AAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTC 2217

 54663112 ATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGA 54663171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2218 ATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAAAACAGGCCAAGA 2277

 54663172 AATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTA 54663231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTA 2337

 54663232 TGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCA 54663291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCA 2397

 54663292 ATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCA 54663351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 ATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCA 2457

 54663352 GGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAAT 54663411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAAT 2517

 54663412 CCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGC 54663471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGC 2577

 54663472 TGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTA 54663531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTA 2637

 54663532 GGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATG 54663591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATG 2697

 54663592 ATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTAC 54663651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 ATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTAC 2757

 54663652 AATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTG 54663711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTG 2817

 54663712 GCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAAT 54663771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAAT 2877

 54663772 ATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTA 54663831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTA 2937

 54663832 TAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTA 54663891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTA 2997

 54663892 TGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTT 54663951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTT 3057

 54663952 TCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTG 54664011
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTG 3117

 54664012 CACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTC 54664071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTC 3177

 54664072 AAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAAT 54664131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAAT 3237

 54664132 ATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCC 54664191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 ATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCC 3297

 54664192 TTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAA 54664251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAA 3357

 54664252 TCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGAT 54664311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGAT 3417

 54664312 TCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTT 54664371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTT 3477

 54664372 TTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTG 54664431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTG 3537

 54664432 GCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGG 54664491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 GCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGG 3597

 54664492 TTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTG 54664551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3598 TTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTTTGTG 3657

 54664552 GTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAG 54664611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAG 3717

 54664612 ATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTT 54664671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 ATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTT 3777

 54664672 CCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAAC 54664731
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 CCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAAC 3837

 54664732 AGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAG 54664791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 AGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAG 3897

 54664792 GCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCT 54664851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCT 3957

 54664852 TATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGA 54664911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGA 4017

 54664912 TTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGAT 54664971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGAT 4077

 54664972 AATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCG 54665031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 AATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCG 4137

 54665032 TTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTG 54665091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTG 4197

 54665092 ATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTAC 54665151
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 ATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTAC 4257

 54665152 ATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAA 54665211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 ATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAA 4317

 54665212 AAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATAT 54665271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 AAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATAT 4377

 54665272 TGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGG 54665331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGG 4437

 54665332 TGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGA 54665391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGA 4497

 54665392 GGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTC 54665451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTC 4557

 54665452 AGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAA 54665511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAA 4617

 54665512 ACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTT 54665571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 ACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTT 4677

 54665572 AGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAA 54665631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 AGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAA 4737

 54665632 ATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGC 54665691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 ATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGC 4797

 54665692 GTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCT 54665751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 GTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCT 4857

 54665752 TATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAA 54665811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAA 4917

 54665812 CAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTA 54665871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 CAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTA 4977

 54665872 GAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTT 54665931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTT 5037

 54665932 CCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAG 54665990
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 CCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAG 5097

 54665991 CACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAA 54666050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 CACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAA 5157

 54666051 TATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTG 54666110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTG 5217

 54666111 GGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTG 54666170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 GGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTG 5277

 54666171 CTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGT 54666230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 CTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGT 5337

 54666231 GTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCT 54666290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 GTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCT 5397

 54666291 CTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCAC 54666350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCAC 5457

 54666351 ACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACC 54666410
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5458 ACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACC 5517

 54666411 AGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTC 54666470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTC 5577

 54666471 TGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCC 54666530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 TGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCC 5637

 54666531 AAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCC 54666590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 AAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCC 5697

 54666591 TAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTT 54666650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTT 5757

 54666651 GGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAA 54666710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 GGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAA 5817

 54666711 TTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGG 54666770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGG 5877

 54666771 TACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCT 54666830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCT 5937

 54666831 CTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTC 54666890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 CTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTC 5997

 54666891 AAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTG 54666950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 AAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTG 6057

 54666951 CTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGAT 54667010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 CTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGAT 6117

 54667011 TTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTT 54667070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 TTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTT 6177

 54667071 TTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGG 54667130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 TTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGG 6237

 54667131 CATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAG 54667190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 CATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAG 6297

 54667191 TTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTG 54667250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 TTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTG 6357

 54667251 GAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATT 54667310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 GAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATT 6417

 54667311 TGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGC 54667370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 TGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGC 6477

 54667371 ATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCA 54667430
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6478 ATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCA 6537

 54667431 GTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATG 54667490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 GTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATG 6597

 54667491 TAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTC 54667550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 TAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTC 6657

 54667551 CTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAG 54667610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 CTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAG 6717

 54667611 TTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCC 54667670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 TTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCC 6777

 54667671 AGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAAT 54667730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 AGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAAT 6837

 54667731 GTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTG 54667790
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 GTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTG 6897

 54667791 CAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAA 54667850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6898 CAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAA 6957

 54667851 ATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATG 54667910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 ATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATG 7017

 54667911 TAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTG 54667970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 TAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTG 7077

 54667971 AAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAG 54668030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7078 AAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGG 7137

 54668031 GTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTA 54668090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 GTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTA 7197

 54668091 TTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGA 54668150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 TTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGA 7257

 54668151 ATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACC 54668210
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7258 ATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACC 7317

 54668211 AAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAAT 54668270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 AAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAAT 7377

 54668271 CACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCT 54668330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 CACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCT 7437

 54668331 GCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCG 54668390
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     7438 GCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCG 7497

 54668391 ACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACT 54668450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 ACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACT 7557

 54668451 GTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAA 54668510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 GTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAA 7617

 54668511 ATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATA 54668570
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     7618 ATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATA 7677

 54668571 GATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCA 54668630
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     7678 GATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCA 7737

 54668631 TGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGC 54668690
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 TGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGC 7797

 54668691 GCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAG 54668750
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7798 GCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAG 7857

 54668751 AATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGA 54668810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7858 AATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGA 7917

 54668811 TGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATA 54668870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7918 TGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATA 7977

 54668871 AAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTG 54668930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7978 AAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTG 8037

 54668931 CTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     8038 CTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 8080

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8081 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 8140

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8141 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 8200

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8201 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 8260

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8261 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 8320

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8321 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 8380

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     8381 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 8440

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8441 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 8500

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8501 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 8560

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     8561 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 8620

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8621 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 8680

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8681 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 8740

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8741 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 8800

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8801 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 8860

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8861 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 8920

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8921 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 8980

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     8981 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 9040

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     9041 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 9100

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9101 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 9160

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     9161 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 9218

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9219 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 9278

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9279 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 9337

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9338 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 9397

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9398 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 9457

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9458 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 9517

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9518 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 9577

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9578 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 9637

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9638 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 9697

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9698 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 9757

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9758 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 9817

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9818 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 9877

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     9878 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 9935

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9936 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 9995

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9996 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 10055

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10056 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 10115

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10116 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 10175

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
    10176 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 10235

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
    10236 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 10295

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10296 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 10355

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
    10356 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 10415

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    10416 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 10475

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10476 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 10535

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
    10536 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 10595

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
    10596 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 10655

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10656 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 10715

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10716 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 10775

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10776 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 10835

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10836 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 10895

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10896 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 10955

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10956 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 11015

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11016 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 11075

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11076 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 11135

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
    11136 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 11195

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
    11196 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 11255

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11256 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 11315

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11316 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 11375

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    11376 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 11435

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
    11436 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 11495

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
    11496 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 11555

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11556 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 11615

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA-TTTCCATA 54673135
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||   ||||||||
    11616 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAA--TTTTCCATA 11673

 54673136 TTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAA 54673195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11674 TTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAA 11733

 54673196 TACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAA 54673255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11734 TACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAA 11793

 54673256 ATGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAA 54673312
          |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11794 ATGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAA 11849

 54673313 ACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCAC 54673372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11850 ACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCAC 11909

 54673373 GAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTA 54673432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11910 GAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTA 11969

 54673433 TTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGG 54673492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11970 TTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGG 12029

 54673493 GAGAAGCTTGGGTAATTTTAT 54673513
          |||||||||||||||||||||
    12030 GAGAAGCTTGGGTAATTTTAT 12050

Alignment time is 8.9776 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3970] =>      3970 nucs 'mol-32-322a-136006_3970'

Score:        3665
Aligned:      3974        nucs
Identic:      3941 ( 99%) nucs =>      3702 ( 99%)       239 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54673270] EXCISED REGION [54673275,54673513]
 second seq =>  [       1,    3728] EXCISED REGION [    3732,    3970]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [54673271,54673274]
 second seq =>         3 nucs [3729,3731]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3728,3728] to [3731,3731]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54673271,54673272] to [54673273,54673274]
 second seq =>         0 nucs

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 1855

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 1915

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 1975

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 2035

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 2095

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2096 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 2155

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2156 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 2215

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 2275

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2276 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 2335

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2336 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 2395

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 2455

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     2456 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 2515

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2516 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 2575

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 2635

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 2695

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 2755

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 2815

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 2875

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 2935

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 2995

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 3055

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3056 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 3115

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 3175

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 3235

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 3295

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3296 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 3355

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3356 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 3415

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3416 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 3475

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 3535

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA-TTTCCATA 54673135
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||   ||||||||
     3536 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAA--TTTTCCATA 3593

 54673136 TTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAA 54673195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAA 3653

 54673196 TACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAA 54673255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAA 3713

 54673256 ATGTGAACAGATAAA 54673270
          |||||||||||||||
     3714 ATGTGAACAGATAAA 3728

EXCISED REGION

 54673275 GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAA 54673334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAA 3791

 54673335 TTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTG 54673394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 TTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTG 3851

 54673395 AATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTT 54673454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 AATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTT 3911

 54673455 GGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTAT 54673513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 GGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTAT 3970

Alignment time is 2.98639 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3497] =>      3497 nucs 'mol-32-3235-233749_3497'

Score:        3497
Aligned:      3497        nucs
Identic:      3497 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54665890,54669386]
 second seq =>  [       1,    3497]

 54665890 GTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAA 54665949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAA 60

 54665950 GTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTG 54666009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTG 120

 54666010 ACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGA 54666069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGA 180

 54666070 ATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCAT 54666129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCAT 240

 54666130 TTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAA 54666189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAA 300

 54666190 GCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACT 54666249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACT 360

 54666250 GGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCT 54666309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCT 420

 54666310 TTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTT 54666369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTT 480

 54666370 CCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGC 54666429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGC 540

 54666430 AGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCA 54666489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCA 600

 54666490 AGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTT 54666549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTT 660

 54666550 CGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCC 54666609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCC 720

 54666610 TTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCC 54666669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCC 780

 54666670 CACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAA 54666729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAA 840

 54666730 CATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGG 54666789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGG 900

 54666790 AAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGG 54666849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGG 960

 54666850 GACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAA 54666909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAA 1020

 54666910 TAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTA 54666969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTA 1080

 54666970 TAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCA 54667029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCA 1140

 54667030 GTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACG 54667089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACG 1200

 54667090 TTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACC 54667149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACC 1260

 54667150 AGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTC 54667209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTC 1320

 54667210 AACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAA 54667269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAA 1380

 54667270 TTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTC 54667329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTC 1440

 54667330 CTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCA 54667389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCA 1500

 54667390 GAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCA 54667449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCA 1560

 54667450 TGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTC 54667509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTC 1620

 54667510 TGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGA 54667569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGA 1680

 54667570 AATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCC 54667629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCC 1740

 54667630 TCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGA 54667689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGA 1800

 54667690 AGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAAC 54667749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAAC 1860

 54667750 TCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAG 54667809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAG 1920

 54667810 GAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAG 54667869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAG 1980

 54667870 GCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTG 54667929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTG 2040

 54667930 GCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACT 54667989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACT 2100

 54667990 ACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCT 54668049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCT 2160

 54668050 AAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTC 54668109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTC 2220

 54668110 AAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCA 54668169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCA 2280

 54668170 CCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGA 54668229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGA 2340

 54668230 AGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCA 54668289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCA 2400

 54668290 AAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGT 54668349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGT 2460

 54668350 CTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGA 54668409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGA 2520

 54668410 TGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGC 54668469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGC 2580

 54668470 CCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCT 54668529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCT 2640

 54668530 GACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCT 54668589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCT 2700

 54668590 GGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCAC 54668649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCAC 2760

 54668650 AATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACG 54668709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACG 2820

 54668710 GTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTC 54668769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTC 2880

 54668770 TGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGC 54668829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGC 2940

 54668830 TTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAG 54668889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAG 3000

 54668890 AATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACAT 54668949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACAT 3060

 54668950 CCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCAC 54669009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCAC 3120

 54669010 CAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGA 54669069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGA 3180

 54669070 CTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTT 54669129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTT 3240

 54669130 TCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATT 54669189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATT 3300

 54669190 GGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCAT 54669249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCAT 3360

 54669250 CCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAG 54669309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAG 3420

 54669310 GATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAG 54669369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAG 3480

 54669370 TTCAGTTATTATAGCAG 54669386
          |||||||||||||||||
     3481 TTCAGTTATTATAGCAG 3497

Alignment time is 2.26538 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6511] =>      6511 nucs 'mol-32-32f0-139597_6511'

Score:        6027
Aligned:      6520        nucs
Identic:      6467 ( 99%) nucs =>      2366 ( 99%)      4101 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54666595,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673674]
 second seq =>  [       1,    2379] EXCISED REGION [    2380,    6511]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54666595 GTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTT 54666654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTT 60

 54666655 TCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGC 54666714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGC 120

 54666715 TCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACT 54666774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACT 180

 54666775 AGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTT 54666834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTT 240

 54666835 GCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAAT 54666894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAAT 300

 54666895 TAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGT 54666954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGT 360

 54666955 AGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCT 54667014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCT 420

 54667015 GATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGG 54667074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGG 480

 54667075 CAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATC 54667134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATC 540

 54667135 TAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTAT 54667194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTAT 600

 54667195 CCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAA 54667254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAA 660

 54667255 GCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAA 54667314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAA 720

 54667315 AGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCT 54667374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCT 780

 54667375 GATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGT 54667434
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      781 GATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGT 840

 54667435 CCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGA 54667494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGA 900

 54667495 ACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTT 54667554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTT 960

 54667555 GCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTT 54667614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTT 1020

 54667615 CCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTA 54667674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTA 1080

 54667675 CAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCT 54667734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCT 1140

 54667735 ACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGG 54667794
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGG 1200

 54667795 GTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCT 54667854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1201 GTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCT 1260

 54667855 CTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGA 54667914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGA 1320

 54667915 TCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGT 54667974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGT 1380

 54667975 GCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCA 54668034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1381 GCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCA 1440

 54668035 TCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCT 54668094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCT 1500

 54668095 AGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTC 54668154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTC 1560

 54668155 ACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGC 54668214
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGC 1620

 54668215 ACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACC 54668274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACC 1680

 54668275 AGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAA 54668334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAA 1740

 54668335 TGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACAT 54668394
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1741 TGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACAT 1800

 54668395 TAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGA 54668454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGA 1860

 54668455 CCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTA 54668514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTA 1920

 54668515 GACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATA 54668574
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1921 GACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATA 1980

 54668575 GTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAA 54668634
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
     1981 GTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGAC 2040

 54668635 CTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCA 54668694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCA 2100

 54668695 GTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATT 54668754
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATT 2160

 54668755 TCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGA 54668814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGA 2220

 54668815 AGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAAT 54668874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAAT 2280

 54668875 ACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTG 54668934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTG 2340

 54668935 AGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2341 AGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 2379

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 2439

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 2499

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 2559

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 2619

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 2679

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2680 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 2739

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 2799

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 2859

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2860 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 2919

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 2979

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 3039

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 3099

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 3159

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 3219

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 3279

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     3280 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 3339

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
     3340 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCCCTTTA 3399

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 3459

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     3460 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 3517

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 3577

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 3636

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 3696

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 3756

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 3816

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 3876

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 3936

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 3996

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 4056

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 4116

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 4176

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     4177 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 4234

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 4294

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 4354

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 4414

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 4474

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4475 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 4534

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4535 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 4594

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 4654

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4655 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 4714

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4715 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 4774

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 4834

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     4835 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 4894

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4895 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 4954

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 5014

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 5074

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 5134

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 5194

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 5254

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 5314

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 5374

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 5434

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5435 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 5494

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5495 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 5554

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 5614

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 5674

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5675 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 5734

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5735 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 5794

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5795 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 5854

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 5914

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     5915 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 5974

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 6034

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 6094

 54673257 TGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 54673313
          ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 TGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 6150

 54673314 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 54673373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6151 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 6210

 54673374 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 54673433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6211 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 6270

 54673434 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 54673493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6271 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 6330

 54673494 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTG 54673553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6331 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATATAGTGGTG 6390

 54673554 GGGGTTGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATA 54673613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6391 GGGGTTGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATA 6450

 54673614 AATTTTAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACA 54673673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6451 AATTTTAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACA 6510

 54673674 A 54673674
          |
     6511 A 6511

Alignment time is 4.69951 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2379] =>      2379 nucs 'mol-32-32f0-139597_2379'

Score:        2246
Aligned:      2378        nucs
Identic:      2366 ( 99%) nucs =>       788 (100%)      1578 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54666595,54667382] EXCISED REGION [54667384,54668973]
 second seq =>  [       1,     788] EXCISED REGION [     790,    2379]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54667383,54667383]
 second seq =>         1 nucs [789,789]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54667383,54667383] to [54667384,54667384]
 second seq =>         1 nucs [788,788] to [789,789]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54666595 GTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTT 54666654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTT 60

 54666655 TCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGC 54666714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGC 120

 54666715 TCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACT 54666774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACT 180

 54666775 AGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTT 54666834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTT 240

 54666835 GCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAAT 54666894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAAT 300

 54666895 TAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGT 54666954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGT 360

 54666955 AGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCT 54667014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCT 420

 54667015 GATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGG 54667074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGG 480

 54667075 CAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATC 54667134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATC 540

 54667135 TAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTAT 54667194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTAT 600

 54667195 CCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAA 54667254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAA 660

 54667255 GCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAA 54667314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAA 720

 54667315 AGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCT 54667374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCT 780

 54667375 GATCACAG 54667382
          ||||||||
      781 GATCACAG 788

EXCISED REGION

 54667384 ACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACA 54667443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      790 ACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACA 849

 54667444 GAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACA 54667503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 GAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACA 909

 54667504 TCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAAC 54667563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 TCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAAC 969

 54667564 CTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAAC 54667623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 CTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAAC 1029

 54667624 ACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGA 54667683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 ACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGA 1089

 54667684 CAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACG 54667743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 CAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACG 1149

 54667744 CCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAG 54667803
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAG 1209

 54667804 ACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCA 54667863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1210 ACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCA 1269

 54667864 CTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCT 54667923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 CTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCT 1329

 54667924 AGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCT 54667983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCT 1389

 54667984 GCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAA 54668043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1390 GCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAA 1449

 54668044 CTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTG 54668103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTG 1509

 54668104 GCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTT 54668163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 GCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTT 1569

 54668164 AGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCT 54668223
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 AGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCT 1629

 54668224 TTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGG 54668283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGG 1689

 54668284 AGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTT 54668343
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1690 AGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTC 1749

 54668344 AGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTA 54668403
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1750 AGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTA 1809

 54668404 TACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTG 54668463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 TACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTG 1869

 54668464 CTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTC 54668523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 CTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTC 1929

 54668524 TGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTG 54668583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1930 TGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTG 1989

 54668584 TCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCT 54668643
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||
     1990 TCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCT 2049

 54668644 TCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAA 54668703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 TCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAA 2109

 54668704 AACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTT 54668763
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 AACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTT 2169

 54668764 CTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGG 54668823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 CTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGG 2229

 54668824 AAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCT 54668883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 AAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCT 2289

 54668884 GTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTA 54668943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 GTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTA 2349

 54668944 TCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||.|||||||||||||||||||||
     2350 TCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 2379

Alignment time is 1.764 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8708] =>      8708 nucs 'mol-32-32f0-151658_8708'

Score:        8696
Aligned:      8707        nucs
Identic:      8706 (100%) nucs =>       202 (100%)      8504 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54661788,54661989] EXCISED REGION [54661991,54670495]
 second seq =>  [       1,     202] EXCISED REGION [     204,    8708]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54661990,54661990]
 second seq =>         1 nucs [203,203]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54661989,54661989] to [54661991,54661991]
 second seq =>         1 nucs [202,202] to [204,204]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54661788 AAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGA 54661847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGA 60

 54661848 ATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAAT 54661907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAAT 120

 54661908 GGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGA 54661967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGA 180

 54661968 GAGAGATGCAGGTATATTGGTG 54661989
          ||||||||||||||||||||||
      181 GAGAGATGCAGGTATATTGGTG 202

EXCISED REGION

 54661991 GGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGA 54662050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 GGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGA 263

 54662051 GACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAA 54662110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 GACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAA 323

 54662111 ACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTT 54662170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      324 ACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTT 383

 54662171 TTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGC 54662230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 TTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGC 443

 54662231 CAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGG 54662290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 CAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGG 503

 54662291 CTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGA 54662350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 CTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGA 563

 54662351 GCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAA 54662410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 GCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAA 623

 54662411 GTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGT 54662470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 GTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGT 683

 54662471 CATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCA 54662530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 CATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCA 743

 54662531 AGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTT 54662590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 AGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTT 803

 54662591 CCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAA 54662650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 CCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAA 863

 54662651 CACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACA 54662710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 CACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACA 923

 54662711 AAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCAT 54662770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 AAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCAT 983

 54662771 AAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTC 54662830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 AAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTC 1043

 54662831 GAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAA 54662890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 GAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAA 1103

 54662891 TCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAA 54662950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 TCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAA 1163

 54662951 GAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTC 54663010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 GAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTC 1223

 54663011 AGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAA 54663070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 AGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAA 1283

 54663071 AAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGG 54663130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 AAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGG 1343

 54663131 AGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATC 54663190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 AGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATC 1403

 54663191 TGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTT 54663250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 TGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTT 1463

 54663251 TGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGC 54663310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 TGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGC 1523

 54663311 TCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTAC 54663370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTAC 1583

 54663371 AGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCT 54663430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 AGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCT 1643

 54663431 CTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAG 54663490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 CTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAG 1703

 54663491 ATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTA 54663550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 ATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTA 1763

 54663551 TTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGG 54663610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGG 1823

 54663611 AAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAA 54663670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 AAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAA 1883

 54663671 TAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATAT 54663730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATAT 1943

 54663731 TTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTG 54663790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 TTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTG 2003

 54663791 TACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATA 54663850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATA 2063

 54663851 TAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGT 54663910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGT 2123

 54663911 TTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGT 54663970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 TTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGT 2183

 54663971 AATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAG 54664030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 AATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAG 2243

 54664031 TTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTT 54664090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 TTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTT 2303

 54664091 CCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAA 54664150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 CCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAA 2363

 54664151 GACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAA 54664210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 GACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAA 2423

 54664211 ACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAA 54664270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 ACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAA 2483

 54664271 GCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCT 54664330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 GCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCT 2543

 54664331 CTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGC 54664390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 CTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGC 2603

 54664391 TCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCC 54664450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 TCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCC 2663

 54664451 AGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAA 54664510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAA 2723

 54664511 GAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACA 54664570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 GAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACA 2783

 54664571 GGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTG 54664630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 GGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTG 2843

 54664631 AATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGG 54664690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 AATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGG 2903

 54664691 ATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGT 54664750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 ATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGT 2963

 54664751 TAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATAT 54664810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 TAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATAT 3023

 54664811 TGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATT 54664870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATT 3083

 54664871 ATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTT 54664930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 ATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTT 3143

 54664931 CCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCAT 54664990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 CCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCAT 3203

 54664991 CCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAA 54665050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 CCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAA 3263

 54665051 CACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAAT 54665110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 CACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAAT 3323

 54665111 GTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACA 54665170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 GTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACA 3383

 54665171 ATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCAC 54665230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 ATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCAC 3443

 54665231 TAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTC 54665290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 TAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTC 3503

 54665291 TGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATT 54665350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 TGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATT 3563

 54665351 CTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGT 54665410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 CTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGT 3623

 54665411 GATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAA 54665470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 GATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAA 3683

 54665471 ATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAA 54665530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 ATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAA 3743

 54665531 AATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCA 54665590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 AATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCA 3803

 54665591 GTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATC 54665650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 GTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATC 3863

 54665651 ATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCT 54665710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 ATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCT 3923

 54665711 GGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAAC 54665770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 GGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAAC 3983

 54665771 TAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCAC 54665830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 TAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCAC 4043

 54665831 CAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAG 54665890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 CAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAG 4103

 54665891 TGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAG 54665950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 TGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAG 4163

 54665951 TTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGA 54666010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 TTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGA 4223

 54666011 CCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAA 54666070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAA 4283

 54666071 TACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATT 54666130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 TACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATT 4343

 54666131 TTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAG 54666190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 TTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAG 4403

 54666191 CAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTG 54666250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 CAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTG 4463

 54666251 GAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTT 54666310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 GAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTT 4523

 54666311 TCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTC 54666370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 TCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTC 4583

 54666371 CTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCA 54666430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 CTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCA 4643

 54666431 GAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAA 54666490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 GAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAA 4703

 54666491 GGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTC 54666550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 GGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTC 4763

 54666551 GGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCT 54666610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 GGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCT 4823

 54666611 TCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCC 54666670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 TCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCC 4883

 54666671 ACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAAC 54666730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 ACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAAC 4943

 54666731 ATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGA 54666790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 ATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGA 5003

 54666791 AACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGG 54666850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 AACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGG 5063

 54666851 ACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAAT 54666910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 ACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAAT 5123

 54666911 AAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTAT 54666970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 AAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTAT 5183

 54666971 AGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAG 54667030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 AGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAG 5243

 54667031 TGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGT 54667090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 TGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGT 5303

 54667091 TTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCA 54667150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 TTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCA 5363

 54667151 GGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCA 54667210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 GGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCA 5423

 54667211 ACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAAT 54667270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5424 ACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAAT 5483

 54667271 TAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCC 54667330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 TAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCC 5543

 54667331 TGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAG 54667390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 TGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAG 5603

 54667391 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 54667450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 AGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCAT 5663

 54667451 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 54667510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 GGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCT 5723

 54667511 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 54667570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 GAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAA 5783

 54667571 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 54667630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5784 ATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCT 5843

 54667631 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 54667690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 CTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAA 5903

 54667691 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 54667750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 GTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACT 5963

 54667751 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 54667810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 CTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGG 6023

 54667811 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 54667870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6024 AGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGG 6083

 54667871 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 54667930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 CTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGG 6143

 54667931 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 54667990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6144 CTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTA 6203

 54667991 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 54668050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 CCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTA 6263

 54668051 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 54668110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 AAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCA 6323

 54668111 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 54668170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 AACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCAC 6383

 54668171 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 54668230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 CTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAA 6443

 54668231 GCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 54668290
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 GCTTCCCAGATGACTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAA 6503

 54668291 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 54668350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6504 AGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTC 6563

 54668351 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 54668410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6564 TATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGAT 6623

 54668411 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 54668470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6624 GCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCC 6683

 54668471 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 54668530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6684 CACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTG 6743

 54668531 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTG 54668590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6744 ACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTG 6803

 54668591 GCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACA 54668650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6804 GCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACA 6863

 54668651 ATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGG 54668710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6864 ATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGG 6923

 54668711 TAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCT 54668770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6924 TAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCT 6983

 54668771 GGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCT 54668830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6984 GGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCT 7043

 54668831 TCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGA 54668890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7044 TCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGA 7103

 54668891 ATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATC 54668950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7104 ATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATC 7163

 54668951 CTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACC 54669010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7164 CTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACC 7223

 54669011 AGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGAC 54669070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7224 AGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGAC 7283

 54669071 TTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTT 54669130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7284 TTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTT 7343

 54669131 CCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTG 54669190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7344 CCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTG 7403

 54669191 GGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATC 54669250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7404 GGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATC 7463

 54669251 CATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGG 54669310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7464 CATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGG 7523

 54669311 ATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGT 54669370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7524 ATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGT 7583

 54669371 TCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGAC 54669430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7584 TCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGAC 7643

 54669431 ACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCA 54669490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7644 ACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCA 7703

 54669491 AGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTT 54669550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7704 AGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTT 7763

 54669551 TGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAAC 54669610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7764 TGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAAC 7823

 54669611 TATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGG 54669670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7824 TATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGG 7883

 54669671 GCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTA 54669730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7884 GCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTA 7943

 54669731 TCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGA 54669790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7944 TCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGA 8003

 54669791 GAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGA 54669850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8004 GAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGA 8063

 54669851 TGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGA 54669910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8064 TGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGA 8123

 54669911 ATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCC 54669970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8124 ATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCC 8183

 54669971 AGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCT 54670030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8184 AGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCT 8243

 54670031 GGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGA 54670090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8244 GGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGA 8303

 54670091 TGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACC 54670150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8304 TGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACC 8363

 54670151 TGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTAC 54670210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8364 TGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTAC 8423

 54670211 ACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAG 54670270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8424 ACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAG 8483

 54670271 CCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAA 54670330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8484 CCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAA 8543

 54670331 GGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAG 54670390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8544 GGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAG 8603

 54670391 AGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGG 54670450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8604 AGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGG 8663

 54670451 CCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCC 54670495
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8664 CCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCC 8708

Alignment time is 6.28981 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8416] =>      8416 nucs 'mol-32-3306-161894_8416'

Score:        8044
Aligned:      8418        nucs
Identic:      8384 (100%) nucs =>      7322 (100%)      1062 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54661625,54668973] EXCISED REGION [54669540,54670606]
 second seq =>  [       1,    7348] EXCISED REGION [    7349,    8416]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54661625 AAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAAAAATGAGCAGATAGGGA 54661684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
        1 AAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAAAAATGAGCAGATAAGGA 60

 54661685 GGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTAA 54661744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTAA 120

 54661745 GCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAAAAAAACCTAATAATATA 54661804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      121 GCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAAAAAA-CCTAATAATATA 179

 54661805 AAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGAATAAATGTGAGTACAGG 54661864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 AAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGAATAAATGTGAGTACAGG 239

 54661865 AATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGA 54661924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 AATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGA 299

 54661925 AAAAAGCATACACATAACACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATAT 54661984
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AAAAAGCATACACATA-CACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATAT 358

 54661985 TGGTGCGGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACT 54662044
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 TGGTGCAGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACT 418

 54662045 AAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCA 54662104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 AAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCA 478

 54662105 CCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTG 54662164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 CCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTG 538

 54662165 CATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACA 54662224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACA 598

 54662225 TTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTT 54662284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTT 658

 54662285 CTTCGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGC 54662344
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CTTTGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGC 718

 54662345 TGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAA 54662404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAA 778

 54662405 GCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGG 54662464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGG 838

 54662465 GGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTG 54662524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTG 898

 54662525 TGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAA 54662584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAA 958

 54662585 CATTTTCCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAA 54662644
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CATTTTCCATGAAAATATTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAA 1018

 54662645 AAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTAC 54662704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTAC 1078

 54662705 AAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAA 54662764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAA 1138

 54662765 TATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAA 54662824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAA 1198

 54662825 AATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACAT 54662884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 AATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACAT 1258

 54662885 AAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCC 54662944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCC 1318

 54662945 AAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGA 54663004
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AAGAAAGAAAACCAGATCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGA 1378

 54663005 CTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATT 54663064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATT 1438

 54663065 TCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGT 54663124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGT 1498

 54663125 TAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCAT 54663184
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1499 TAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAAAACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCAT 1558

 54663185 GAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCAT 54663244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCAT 1618

 54663245 AAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAAT 54663304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAAT 1678

 54663305 AGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAG 54663364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAG 1738

 54663365 ATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTT 54663424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTT 1798

 54663425 AGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAAT 54663484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAAT 1858

 54663485 TCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATG 54663544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATG 1918

 54663545 GGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATA 54663604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATA 1978

 54663605 TTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCC 54663664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCC 2038

 54663665 AGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTT 54663724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTT 2098

 54663725 TAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACC 54663784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACC 2158

 54663785 CTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTT 54663844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTT 2218

 54663845 TTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAG 54663904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAG 2278

 54663905 TAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCA 54663964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2279 TAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTTAACAAAGAGCA 2338

 54663965 GCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGT 54664024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGT 2398

 54664025 TGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTC 54664084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTC 2458

 54664085 TATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCA 54664144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCA 2518

 54664145 GGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCT 54664204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCT 2578

 54664205 ATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCA 54664264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCA 2638

 54664265 CCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAA 54664324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAA 2698

 54664325 GCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAAC 54664384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAAC 2758

 54664385 CTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTG 54664444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTG 2818

 54664445 AACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGT 54664504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGT 2878

 54664505 TTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATG 54664564
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2879 TTGAAAGAATATATAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATG 2938

 54664565 GTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCAC 54664624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCAC 2998

 54664625 TAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAA 54664684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAA 3058

 54664685 ATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAA 54664744
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAA 3118

 54664745 AGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAA 54664804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAA 3178

 54664805 TAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAA 54664864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAA 3238

 54664865 TACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTT 54664924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTT 3298

 54664925 TGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGT 54664984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGT 3358

 54664985 GGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAA 54665044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAA 3418

 54665045 AGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAAC 54665104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAAC 3478

 54665105 AACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTT 54665164
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTT 3538

 54665165 ACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCC 54665224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 ACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCC 3598

 54665225 TAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGT 54665284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGT 3658

 54665285 GACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGC 54665344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 GACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGC 3718

 54665345 TTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGA 54665404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGA 3778

 54665405 GGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGAT 54665464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGAT 3838

 54665465 GGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAA 54665524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAA 3898

 54665525 AACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTG 54665584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 AACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTG 3958

 54665585 AAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTT 54665644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTT 4018

 54665645 GGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCT 54665704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCT 4078

 54665705 GTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGAC 54665764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGAC 4138

 54665765 AGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAA 54665824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAA 4198

 54665825 CACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAA 54665884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 CACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAA 4258

 54665885 AGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATC 54665944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATC 4318

 54665945 TCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTT 54666003
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTT 4378

 54666004 ACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGA 54666063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 ACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGA 4438

 54666064 GGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTC 54666123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 GGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTC 4498

 54666124 TCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCT 54666183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCT 4558

 54666184 TTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCC 54666243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCC 4618

 54666244 AGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCT 54666303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 AGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCT 4678

 54666304 TCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGG 54666363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGG 4738

 54666364 GGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGA 54666423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4739 GGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGA 4798

 54666424 AGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTG 54666483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 AGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTG 4858

 54666484 CTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGA 54666543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 CTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGA 4918

 54666544 GGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAAT 54666603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 GGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAAT 4978

 54666604 GGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACAT 54666663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 GGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACAT 5038

 54666664 TCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGA 54666723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGA 5098

 54666724 GTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGC 54666783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 GTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGC 5158

 54666784 TCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGG 54666843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGG 5218

 54666844 AAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGA 54666903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 AAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGA 5278

 54666904 AGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAG 54666963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 AGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAG 5338

 54666964 TCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTT 54667023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 TCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTT 5398

 54667024 AGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTG 54667083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTG 5458

 54667084 AAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATA 54667143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 AAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATA 5518

 54667144 GATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAA 54667203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 GATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAA 5578

 54667204 AATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAAT 54667263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 AATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAAT 5638

 54667264 ATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCT 54667323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 ATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCT 5698

 54667324 TATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGA 54667383
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5699 TATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGG 5758

 54667384 ACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACA 54667443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5759 ACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACA 5818

 54667444 GAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACA 54667503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 GAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACA 5878

 54667504 TCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAAC 54667563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 TCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAAC 5938

 54667564 CTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAAC 54667623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 CTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAAC 5998

 54667624 ACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGA 54667683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 ACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGA 6058

 54667684 CAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACG 54667743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 CAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACG 6118

 54667744 CCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAG 54667803
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 TCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAG 6178

 54667804 ACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCA 54667863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     6179 ACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCA 6238

 54667864 CTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCT 54667923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 CTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCT 6298

 54667924 AGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCT 54667983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 AGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCT 6358

 54667984 GCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAA 54668043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6359 GCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAA 6418

 54668044 CTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTG 54668103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 CTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTG 6478

 54668104 GCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTT 54668163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 GCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTT 6538

 54668164 AGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCT 54668223
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 AGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCT 6598

 54668224 TTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGG 54668283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGG 6658

 54668284 AGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTT 54668343
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6659 AGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTC 6718

 54668344 AGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTA 54668403
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6719 AGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTA 6778

 54668404 TACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTG 54668463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 TACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTG 6838

 54668464 CTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTC 54668523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 CTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTC 6898

 54668524 TGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTG 54668583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6899 TGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTG 6958

 54668584 TCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCT 54668643
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||
     6959 TCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCT 7018

 54668644 TCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAA 54668703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 TCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAA 7078

 54668704 AACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTT 54668763
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 AACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTT 7138

 54668764 CTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGG 54668823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 CTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGG 7198

 54668824 AAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCT 54668883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 AAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCT 7258

 54668884 GTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTA 54668943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 GTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTA 7318

 54668944 TCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||.|||||||||||||||||||||
     7319 TCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 7348

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7349 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 7408

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 7468

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 7528

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 7588

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 7648

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7649 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 7708

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7709 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 7768

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7769 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 7828

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     7829 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 7888

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7889 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 7948

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7949 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 8008

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8009 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 8068

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8069 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 8128

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8129 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 8188

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8189 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 8248

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     8249 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 8308

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     8309 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 8368

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGC 54670606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8369 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGC 8416

Alignment time is 6.18111 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   11908] =>     11908 nucs 'mol-32-3311-061331_11908'

Score:       11346
Aligned:     11915        nucs
Identic:     11860 (100%) nucs =>      9161 (100%)      2699 ( 99%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54659783,54668973] EXCISED REGION [54669540,54672257]
 second seq =>  [       1,    9192] EXCISED REGION [    9193,   11908]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54659783 ATTTTAACAAGGCAGGAGTAATTTTATGTGATTGTAGGCTGTTTGTTATGCACTGGTGAT 54659842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTTAACAAGGCAGGAGTAATTTTATGTGATTGTAGGCTGTTTGTTATGCACTGGTGAT 60

 54659843 TTATTTAATTGAACATGATAGAGAAGACTCCAGTATTACAAATACACATCACCAACAACC 54659902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTTAATTGAACATGATAGAGAAGACTCCAGTATTACAAATACACATCACCAACAACC 120

 54659903 GCTTTACACGCATCTGAAAATAGAAAGGGAACACGAGATGATGAAAGCATCGAGGCATTT 54659962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTTACACGCATCTGAAAATAGAAAGGGAACACGAGATGATGAAAGCATCGAGGCATTT 180

 54659963 TTAAACTCATGAAGAGAAAAGGCACTCAGGAAAAGTGGACATCTAGAATGTCCACTTGTC 54660022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAACTCATGAAGAGAAAAGGCACTCAGGAAAAGTGGACATCTAGAATGTCCACTTGTC 240

 54660023 TAGTTGGTATTTAATTTGTCTACACACTGAGCATTCTATATTGACATTAGTAGGTGTTAA 54660082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGTTGGTATTTAATTTGTCTACACACTGAGCATTCTATATTGACATTAGTAGGTGTTAA 300

 54660083 CTCCTGGGCTCATACCCTGTGTCCTAACATGACTGTAATTATCTGCTCTTATTCAATGAA 54660142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCTGGGCTCATACCCTGTGTCCTAACATGACTGTAATTATCTGCTCTTATTCAATGAA 360

 54660143 CCAGATTTTTGGTGTCACTCTGGTTTTCTTGACTGCTTTGCCCACCAGTAAGAGAGAGTG 54660202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAGATTTTTGGTGTCACTCTGGTTTTCTTGACTGCTTTGCCCACCAGTAAGAGAGAGTG 420

 54660203 TCATTGAAATGGAGGAAGGTGATTACCATTTGGGCAGATGCCTTGGTAATCTCAAACTTT 54660262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      421 TCATTGAAATGGAGGAAGGTGATTACCATTTGGGCAGATGCCTTGGTAATCTCAAGCTTT 480

 54660263 CAAAAGAGAATATCAACACTACCTCAAGTGATTATTTGTTAAGTCAAGTGGCTTGTTCCC 54660322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAAAGAGAATATCAACACTACCTCAAGTGATTATTTGTTAAGTCAAGTGGCTTGTTCCC 540

 54660323 CATTAGGAAGCAGATTCAGTGCACTCAAGCTACTCATCTGGGGCACACAGCCTTGAGCTC 54660382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATTAGGAAGCAGATTCAGTGCACTCAAGCTACTCATCTGGGGCACACAGCCTTGAGCTC 600

 54660383 ATTGCTACTCAGAATTTATTAAAATTCTATTGAGCTAATCCACACTTCAGGGGAAAGACT 54660442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      601 ATTGCTACTCAGAATTTATTAAAATTCTATTGAGCTAACCCACACTTCAGGGGAAAGACT 660

 54660443 GCTATCTTTCCCTGCCTGAAGATACTTCCTCATCTCTAAGTCAAAAGAAATCAGACATCT 54660502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTATCTTTCCCTGCCTGAAGATACTTCCTCATCTCTAAGTCAAAAGAAATCAGACATCT 720

 54660503 AGGTAGCTAGGCCTTGTCACACTGGCCATGAGAATACTTACTCTCATTCTAGTTCACTTT 54660562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTAGCTAGGCCTTGTCACACTGGCCATGAGAATACTTACTCTCATTCTAGTTCACTTT 780

 54660563 AGTGTGATAGCACATACATCTAATGAGTATCATATGAAAAATAAAAAAGCTGTGAACACA 54660622
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTGTGATAGTACATACATCTAATGAGTATCATATGAAAAATAAAAAAGCTGTGAACACA 840

 54660623 TTAACGGAGCTTATGTAAATGATGCTGTCAAGGATAATTTTATGTACCGCATGCAGTGAT 54660682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAACGGAGCTTATGTAAATGATGCTGTCAAGGATAATTTTATGTACCGCATGCAGTGAT 900

 54660683 TATCTCTGAGAGGAAGTCCTCTTCGGTGCTCATAAGAAATTAGTTGTATGTCTTCTGAAA 54660742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATCTCTGAGAGGAAGTCCTCTTCGGTGCTCATAAGAAATTAGTTGTATGTCTTCTGAAA 960

 54660743 ATTTAGTTTATTTTCATCTTGTGGACAATGATTTATGTAACGAAAAGGCTTTCCTTTCTG 54660802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTAGTTTATTTTCATCTTGTGGACAATGATTTATGTAACGAAAAGGCTTTCCTTTCTG 1020

 54660803 CTTTCTCTGCTGGAAAGCTTCTGGCTGACCCAGTTTTTTCAACTTTGTCTGATTTCTGGC 54660862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTCTCTGCTGGAAAGCTTCTGGCTGACCCAGTTTTTTCAACTTTGTCTGATTTCTGGC 1080

 54660863 ACCATTTTTTGTCTCCATCTTTAGTCTATTTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTA 54660922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCATTTTTTGTCTCCATCTTTAGTCTATTTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTA 1140

 54660923 TCTGCTTGGATTTTAATTTTCTTTGTAAACTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAA 54660982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTGCTTGGATTTTAATTTTCTTTGTAAACTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAA 1200

 54660983 GTTAACAGCAGAGACAGGTGACTGCCATCAGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCA 54661042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTAACAGCAGAGACAGGTGACTGCCATCAGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCA 1260

 54661043 CACATGAAGGACACATCCTTCTGAACAATGCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTG 54661102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACATGAAGGACACATCCTTCTGAACAATGCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTG 1320

 54661103 TGCACTTTAATTTCTTATTAAACAAAATAACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGC 54661162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCACTTTAATTTCTTATTAAACAAAATAACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGC 1380

 54661163 AAAACTTTACTGACCACGAGATTCTTATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGG 54661222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAACTTTACTGACCACGAGATTCTTATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGG 1440

 54661223 AGTTTTAAATGAAAAATAACTGATGCTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATA 54661282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTTTTAAATGAAAAATAACTGATGCTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATA 1500

 54661283 ATTTCTATTTATGAAAACGGTCCCTCTTTAATAACTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAA 54661342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTCTATTTATGAAAACGGTCCCTCTTTAATAATTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAA 1560

 54661343 GAATTTTCCTCTGAGAGATTTTACATTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTA 54661402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAATTTTCCTCTGAGAGATTTTACATTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTA 1620

 54661403 AACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAAGAAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGT 54661462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAAGAAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGT 1680

 54661463 TTAACTGCTGCTGTCACATGGAAAAAAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTG 54661522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAACTGCTGCTGTCACATGGAAAAAAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTG 1740

 54661523 AAAACATAAATATCACAAATGACCTTGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGG 54661582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAACATAAATATCACAAATGACCTTGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGG 1800

 54661583 CTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGAATGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAA 54661642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGAATGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAA 1860

 54661643 AATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAAAAATGAGCAGATAGGGAGGGCATTGCTGGAGGGGA 54661702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1861 AATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAAAAATGAGCAGATAAGGAGGGCATTGCTGGAGGGGA 1920

 54661703 ACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGAT 54661762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGAT 1980

 54661763 GAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAAAAAAA-CCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAA 54661821
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAAAAAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAA 2040

 54661822 GCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGAATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTT 54661881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGAATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTT 2100

 54661882 TAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAA 54661941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2101 TAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAATGGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATA- 2159

 54661942 CACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTGCGGGAGCTATGA 54662001
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2160 CACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTGCAGGAGCTATGA 2219

 54662002 ACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAA 54662061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAA 2279

 54662062 AAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAG 54662121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAG 2339

 54662122 TACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTC 54662181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TACACTGATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTC 2399

 54662182 TCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAA 54662241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAA 2459

 54662242 GGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGGCTAGGAACGAA 54662301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2460 GGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTTGGCTAGGAACGAA 2519

 54662302 AGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTG 54662361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTG 2579

 54662362 GAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAG 54662421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAG 2639

 54662422 TGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTA 54662481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTA 2699

 54662482 ATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGA 54662541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGA 2759

 54662542 AGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATA 54662601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATA 2819

 54662602 CTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAAT 54662661
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAAT 2879

 54662662 ACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAA 54662721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAA 2939

 54662722 AAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAA 54662781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAA 2999

 54662782 TGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCAC 54662841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCAC 3059

 54662842 AGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTG 54662901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTG 3119

 54662902 AAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCT 54662961
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|
     3120 AAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAGAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGAT 3179

 54662962 CAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCT 54663021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCT 3239

 54663022 GACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAA 54663081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GACACCGAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAA 3299

 54663082 AGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTT 54663141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTT 3359

 54663142 CATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAG 54663201
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CATTGGAGAAAAGTAGAAAACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAG 3419

 54663202 AGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGA 54663261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGA 3479

 54663262 AAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCAC 54663321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCAC 3539

 54663322 CTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAAT 54663381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAAT 3599

 54663382 CCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTC 54663441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTC 3659

 54663442 TGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTT 54663501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTT 3719

 54663502 GTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGA 54663561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGA 3779

 54663562 GTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAA 54663621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAA 3839

 54663622 AAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAA 54663681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAA 3899

 54663682 ACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAA 54663741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 ACATGTATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAA 3959

 54663742 TTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCA 54663801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TTTATATAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCA 4019

 54663802 TGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAG 54663861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAG 4079

 54663862 AAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAA 54663921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAA 4139

 54663922 TGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTT-TTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGC 54663980
          |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
     4140 TGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTCTTT-AACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGC 4198

 54663981 TGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAAT 54664040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAAT 4258

 54664041 AGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTT 54664100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTT 4318

 54664101 TGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTT 54664160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTT 4378

 54664161 GCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACC 54664220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACC 4438

 54664221 TGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTAT 54664280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTAT 4498

 54664281 AAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATA 54664340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 AAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATA 4558

 54664341 AGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTT 54664400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 AGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTT 4618

 54664401 GTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTAC 54664460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 GTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTAC 4678

 54664461 CCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAA 54664520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 CCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAA 4738

 54664521 GCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACT 54664580
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACT 4798

 54664581 TTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTT 54664640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTT 4858

 54664641 TGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAAT 54664700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4859 TGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAAT 4918

 54664701 TCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTG 54664760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTG 4978

 54664761 CCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGG 54664820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGG 5038

 54664821 AGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTT 54664880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 AGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTT 5098

 54664881 AAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGA 54664940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 AAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGA 5158

 54664941 TAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAAT 54665000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAAT 5218

 54665001 CCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTG 54665060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTG 5278

 54665061 TAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCA 54665120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5279 TAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCA 5338

 54665121 TTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTT 54665180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 TTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTT 5398

 54665181 TTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCC 54665240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 TTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCC 5458

 54665241 CAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGG 54665300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 CAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGG 5518

 54665301 CTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAG 54665360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 CTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAG 5578

 54665361 TAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTA 54665420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTA 5638

 54665421 ATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCA 54665480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 ATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCA 5698

 54665481 GGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAA 54665540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 GGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAA 5758

 54665541 TCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGA 54665600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 TCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGA 5818

 54665601 CAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACA 54665660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 CAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACA 5878

 54665661 AGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCA 54665720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 AGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCA 5938

 54665721 GTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCAT 54665780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 GTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCAT 5998

 54665781 GGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATA 54665840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 GGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATA 6058

 54665841 AGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGA 54665900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 AGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGA 6118

 54665901 GATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGC 54665959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     6119 GATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGC 6178

 54665960 AATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAA 54666019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 AATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAA 6238

 54666020 ATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCAC 54666079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 ATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCAC 6298

 54666080 ACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACT 54666139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 ACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACT 6358

 54666140 GTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCT 54666199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 GTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCT 6418

 54666200 GTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAG 54666259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 GTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAG 6478

 54666260 CTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCC 54666319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 CTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCC 6538

 54666320 TGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCA 54666379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 TGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCA 6598

 54666380 TCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAG 54666439
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAG 6658

 54666440 AGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAA 54666499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 AGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAA 6718

 54666500 CCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTT 54666559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 CCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTT 6778

 54666560 CCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACT 54666619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 CCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACT 6838

 54666620 ACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATG 54666679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 ACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATG 6898

 54666680 TAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTC 54666739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 TAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTC 6958

 54666740 CTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCC 54666799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 CTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCC 7018

 54666800 TCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTA 54666859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 TCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTA 7078

 54666860 ACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAA 54666919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 ACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAA 7138

 54666920 GTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAAT 54666979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 GTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAAT 7198

 54666980 ATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCA 54667039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 ATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCA 7258

 54667040 ACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGG 54667099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 ACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGG 7318

 54667100 TCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAG 54667159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 TCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAG 7378

 54667160 TTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATG 54667219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7379 TTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATG 7438

 54667220 AAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACAT 54667279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7439 AAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACAT 7498

 54667280 GTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAG 54667339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 GTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAG 7558

 54667340 GGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACT 54667399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7559 GGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACT 7618

 54667400 TAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATA 54667459
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7619 TAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATA 7678

 54667460 GACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCC 54667519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7679 GACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCC 7738

 54667520 TTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTA 54667579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7739 TTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTA 7798

 54667580 CCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCAT 54667639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7799 CCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCAT 7858

 54667640 GCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGG 54667699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7859 GCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGG 7918

 54667700 CTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCA 54667759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     7919 CTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCA 7978

 54667760 GGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGG 54667819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7979 GGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGG 8038

 54667820 CATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATT 54667879
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8039 CATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATT 8098

 54667880 TAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAA 54667939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8099 TAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAA 8158

 54667940 GCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCAT 54667999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8159 GCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCAT 8218

 54668000 GTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAA 54668059
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     8219 GTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAA 8278

 54668060 AAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGT 54668119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8279 AAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGT 8338

 54668120 CACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGAC 54668179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8339 CACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGAC 8398

 54668180 CAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAG 54668239
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8399 CAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAG 8458

 54668240 ATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGA 54668299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8459 ATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGA 8518

 54668300 GGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAA 54668359
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     8519 GGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAA 8578

 54668360 TCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGA 54668419
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8579 TCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGA 8638

 54668420 ACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTT 54668479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8639 ACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTT 8698

 54668480 GTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACT 54668539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8699 GTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACT 8758

 54668540 CTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTG 54668599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8759 CTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTG 8818

 54668600 GCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTA 54668659
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     8819 GCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTA 8878

 54668660 GAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGA 54668719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     8879 GAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAA 8938

 54668720 TAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAA 54668779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8939 TAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAA 8998

 54668780 ATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCC 54668839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8999 ATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCC 9058

 54668840 ACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAG 54668899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9059 ACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAG 9118

 54668900 CTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCAC 54668959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     9119 CTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCAC 9178

 54668960 CTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||
     9179 CTCGCCTGCTTGCC 9192

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9193 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 9252

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9253 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 9312

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9313 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 9372

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9373 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 9432

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9433 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 9492

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     9493 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 9552

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9553 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 9612

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9613 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 9672

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     9673 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 9732

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9733 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 9792

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9793 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 9852

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9853 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 9912

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9913 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 9972

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9973 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 10032

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10033 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 10092

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
    10093 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 10152

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    10153 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 10212

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10213 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 10272

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
    10273 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 10330

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10331 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 10390

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10391 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 10449

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10450 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 10509

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10510 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 10569

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10570 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 10629

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10630 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 10689

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10690 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 10749

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10750 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 10809

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10810 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 10869

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10870 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 10929

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10930 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 10989

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
    10990 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 11047

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11048 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 11107

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11108 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 11167

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11168 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 11227

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11228 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 11287

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
    11288 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 11347

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
    11348 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 11407

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11408 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 11467

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
    11468 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 11527

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    11528 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 11587

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11588 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 11647

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
    11648 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 11707

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
    11708 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 11767

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11768 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 11827

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11828 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 11887

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCA 54672257
          |||||||||||||||||||||
    11888 GACAGAACAGAAACGTCTGCA 11908

Alignment time is 8.70234 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2716] =>      2716 nucs 'mol-32-3311-061331_2716'

Score:        2528
Aligned:      2717        nucs
Identic:      2699 ( 99%) nucs =>      1830 (100%)       869 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54671377] EXCISED REGION [54671380,54672257]
 second seq =>  [       1,    1836] EXCISED REGION [    1839,    2716]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [54671378,54671379]
 second seq =>         2 nucs [1837,1838]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54671377,54671377] to [54671379,54671379]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54671376,54671377] to [54671380,54671381]
 second seq =>         2 nucs [1835,1836] to [1839,1840]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1837,1837] to [1838,1838]

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 54671377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 1836

EXCISED REGION

 54671380 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 54671439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1839 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 1898

 54671440 TTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 54671499
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TTTCAATTATCTCAATGTTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 1958

 54671500 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 54671559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 2018

 54671560 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 54671619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 2078

 54671620 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGA 54671679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2079 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGA 2138

 54671680 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 54671739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 2198

 54671740 GAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 54671799
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 GAAAAGTTAAAAATCACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 2258

 54671800 TGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAA 54671859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2259 TGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAA 2318

 54671860 ATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCT 54671919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 ATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCT 2378

 54671920 TCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCAT 54671979
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TCAAAATGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCAT 2438

 54671980 CAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGA 54672039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2439 CAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGA 2498

 54672040 AGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTA 54672099
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2499 AGAGAGGAGATGAAAGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTA 2558

 54672100 TATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTG 54672159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 TATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTG 2618

 54672160 AGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCC 54672219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 AGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCC 2678

 54672220 CTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCA 54672257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 CTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCA 2716

Alignment time is 2.00189 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10848] =>     10848 nucs 'mol-32-3311-188845_10848'

Score:       10243
Aligned:     10857        nucs
Identic:     10793 ( 99%) nucs =>      6984 (100%)      3809 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54661967,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673382]
 second seq =>  [       1,    7008] EXCISED REGION [    7009,   10848]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54661967 AGAGAGATGCAGGTATATTGGTGCGGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCA 54662026
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGAGATGCAGGTATATTGGTGCAGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCA 60

 54662027 GAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGA 54662086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGA 120

 54662087 AATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGA 54662146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGA 180

 54662147 GACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGG 54662206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGG 240

 54662207 AATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAG 54662266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAG 300

 54662267 CAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCT 54662326
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAATGACAAGGGGGCTTCTTTGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCT 360

 54662327 GAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTT 54662386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTT 420

 54662387 GGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTA 54662446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTA 480

 54662447 AAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAA 54662506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAA 540

 54662507 ATGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAA 54662566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAA 600

 54662567 GTGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAAT 54662626
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATATTGGCATAACCAAGAGAGTATGAAT 660

 54662627 CATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAA 54662686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAA 720

 54662687 ATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTC 54662746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTC 780

 54662747 GTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATT 54662806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATT 840

 54662807 CAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAA 54662866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAA 900

 54662867 ACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGA 54662926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGA 960

 54662927 ACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGA 54662986
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGATCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGA 1020

 54662987 GATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATG 54663046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATG 1080

 54663047 AATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAAC 54663106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAAC 1140

 54663107 TACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGC 54663166
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1141 TACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAAAACAGGC 1200

 54663167 CAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGC 54663226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGC 1260

 54663227 AGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTA 54663286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTA 1320

 54663287 AATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAAT 54663346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAAT 1380

 54663347 TCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATC 54663406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATC 1440

 54663407 CAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCT 54663466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCT 1500

 54663467 CTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTG 54663526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTG 1560

 54663527 TTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAAT 54663586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAAT 1620

 54663587 ACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCC 54663646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCC 1680

 54663647 TCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATT 54663706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATT 1740

 54663707 ATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATT 54663766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATT 1800

 54663767 CAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATG 54663826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATG 1860

 54663827 ATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGA 54663886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGA 1920

 54663887 GGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTT 54663946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTT 1980

 54663947 CTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAA 54664006
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTTTTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAA 2040

 54664007 GCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCA 54664066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCA 2100

 54664067 TGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAG 54664126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAG 2160

 54664127 AAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAAC 54664186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAAC 2220

 54664187 CAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAA 54664246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAA 2280

 54664247 TTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGC 54664306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGC 2340

 54664307 GGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCT 54664366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCT 2400

 54664367 TTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCT 54664426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCT 2460

 54664427 TCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATC 54664486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATC 2520

 54664487 GATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCT 54664546
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2521 GATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCT 2580

 54664547 TTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACT 54664606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACT 2640

 54664607 CCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTT 54664666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTT 2700

 54664667 CAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCT 54664726
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCT 2760

 54664727 TGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGC 54664786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGC 2820

 54664787 GTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTG 54664846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTG 2880

 54664847 GGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAAC 54664906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAAC 2940

 54664907 TTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAA 54664966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAA 3000

 54664967 CTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCAT 54665026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCAT 3060

 54665027 GACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAG 54665086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAG 3120

 54665087 TGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGAT 54665146
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGAT 3180

 54665147 GTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCA 54665206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCA 3240

 54665207 CATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGG 54665266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGG 3300

 54665267 AATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATG 54665326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATG 3360

 54665327 GCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGG 54665386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGG 3420

 54665387 AATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGA 54665446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGA 3480

 54665447 ATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTT 54665506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTT 3540

 54665507 TGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTT 54665566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTT 3600

 54665567 GTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAAC 54665626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAAC 3660

 54665627 ACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGC 54665686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGC 3720

 54665687 TATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTT 54665746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTT 3780

 54665747 CCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAA 54665806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAA 3840

 54665807 CAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTG 54665866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTG 3900

 54665867 GTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGAC 54665926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGAC 3960

 54665927 TGTTTCCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAA 54665985
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGTTTCCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAA 4020

 54665986 TTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTG 54666045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTG 4080

 54666046 GAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTA 54666105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTA 4140

 54666106 TTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTC 54666165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTC 4200

 54666166 TCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCC 54666225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCC 4260

 54666226 AATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTG 54666285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTG 4320

 54666286 CTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCA 54666345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCA 4380

 54666346 ATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGA 54666405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4381 ATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGA 4440

 54666406 CCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCC 54666465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCC 4500

 54666466 CTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATC 54666525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATC 4560

 54666526 TCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTC 54666585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTC 4620

 54666586 AGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTC 54666645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTC 4680

 54666646 TTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTG 54666705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTG 4740

 54666706 TCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAA 54666765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAA 4800

 54666766 ATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTT 54666825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTT 4860

 54666826 ACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGAT 54666885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGAT 4920

 54666886 TATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCG 54666945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCG 4980

 54666946 AGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATG 54667005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATG 5040

 54667006 TGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGA 54667065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGA 5100

 54667066 GACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACT 54667125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACT 5160

 54667126 ATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCAC 54667185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCAC 5220

 54667186 TGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTG 54667245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTG 5280

 54667246 GACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAAC 54667305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAAC 5340

 54667306 AAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGC 54667365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGC 5400

 54667366 CAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAA 54667425
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5401 CAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAA 5460

 54667426 TATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCA 54667485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCA 5520

 54667486 GGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAG 54667545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAG 5580

 54667546 TCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGAT 54667605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGAT 5640

 54667606 GCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAG 54667665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAG 5700

 54667666 ATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAG 54667725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAG 5760

 54667726 AAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTA 54667785
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTA 5820

 54667786 GATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCA 54667845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5821 GATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCA 5880

 54667846 ATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGC 54667905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGC 5940

 54667906 TAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGT 54667965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGT 6000

 54667966 CTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTA 54668025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTA 6060

 54668026 TCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTC 54668085
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTC 6120

 54668086 TACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCT 54668145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCT 6180

 54668146 TCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTG 54668205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6181 TCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTG 6240

 54668206 GCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTG 54668265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTG 6300

 54668266 ACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGG 54668325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGG 6360

 54668326 CCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTC 54668385
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6361 CCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTC 6420

 54668386 TATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGA 54668445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGA 6480

 54668446 GCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTC 54668505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTC 6540

 54668506 CTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAG 54668565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6541 CTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAG 6600

 54668566 ACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGG 54668625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6601 ACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGG 6660

 54668626 AGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGT 54668685
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGT 6720

 54668686 GCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCT 54668745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6721 GCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCT 6780

 54668746 GAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGG 54668805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGG 6840

 54668806 CTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCA 54668865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCA 6900

 54668866 TAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAA 54668925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAA 6960

 54668926 AACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6961 AACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 7008

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTGGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 7068

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 7128

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 7188

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 7248

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 7308

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7309 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 7368

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 7428

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 7488

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     7489 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 7548

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7549 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 7608

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7609 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 7668

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7669 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 7728

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 7788

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 7848

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7849 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 7908

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     7909 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 7968

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7969 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 8028

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 8088

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     8089 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 8146

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8147 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 8206

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8207 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 8265

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8266 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 8325

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8326 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 8385

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8386 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 8445

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8446 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 8505

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8506 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 8565

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8566 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 8625

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8626 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 8685

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8686 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 8745

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8746 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 8805

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     8806 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 8863

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8864 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 8923

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8924 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 8983

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8984 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 9043

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9044 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 9103

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     9104 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 9163

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     9164 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 9223

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9224 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 9283

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     9284 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 9343

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     9344 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 9403

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     9404 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGCCATCAGAAAAAGGTATGAAT 9463

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     9464 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 9523

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     9524 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 9583

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9584 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 9643

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9644 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 9703

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9704 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 9763

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9764 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 9823

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9824 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 9883

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9884 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 9943

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9944 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 10003

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10004 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 10063

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
    10064 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 10123

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
    10124 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 10183

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10184 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 10243

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10244 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 10303

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    10304 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 10363

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
    10364 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 10423

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
    10424 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 10483

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10484 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 10543

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
    10544 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 10603

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10604 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 10663

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10664 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 10723

 54673257 TGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 54673313
          ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10724 TGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 10779

 54673314 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 54673373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10780 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 10839

 54673374 AATCTCAAA 54673382
          |||||||||
    10840 AATCTCAAA 10848

Alignment time is 7.81315 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3840] =>      3840 nucs 'mol-32-3311-188845_3840'

Score:        3515
Aligned:      3842        nucs
Identic:      3809 ( 99%) nucs =>      3701 ( 99%)       108 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54673270] EXCISED REGION [54673275,54673382]
 second seq =>  [       1,    3729] EXCISED REGION [    3733,    3840]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [54673271,54673274]
 second seq =>         3 nucs [3730,3732]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3729,3729] to [3732,3732]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54673271,54673272] to [54673273,54673274]
 second seq =>         0 nucs

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTGGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 1855

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 1915

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 1975

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 2035

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 2095

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2096 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 2155

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2156 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 2215

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 2275

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2276 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 2335

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2336 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 2395

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2396 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGCCATCAGAAAAAGGTATGAAT 2455

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     2456 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 2515

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2516 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 2575

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 2635

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 2695

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 2755

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 2815

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 2875

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 2935

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 2995

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 3055

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3056 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 3115

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 3175

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 3235

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 3295

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3296 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 3355

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3356 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 3415

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3416 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 3475

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 3535

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     3536 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 3595

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 3655

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 3715

 54673257 TGTGAACAGATAAA 54673270
          ||||||||||||||
     3716 TGTGAACAGATAAA 3729

EXCISED REGION

 54673275 GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAA 54673334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAA 3792

 54673335 TTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAA 54673382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAA 3840

Alignment time is 2.81356 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9088] =>      9088 nucs 'mol-32-3311-229997_9088'

Score:        8634
Aligned:      9093        nucs
Identic:      9048 (100%) nucs =>      5728 (100%)      3320 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663228,54668973] EXCISED REGION [54669540,54672882]
 second seq =>  [       1,    5747] EXCISED REGION [    5748,    9088]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54663228 GTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAA 54663287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAA 60

 54663288 ATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATT 54663347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATT 120

 54663348 CTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCC 54663407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCC 180

 54663408 AAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTC 54663467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTC 240

 54663468 TGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGT 54663527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGT 300

 54663528 TCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATA 54663587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATA 360

 54663588 CATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCT 54663647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCT 420

 54663648 CTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTA 54663707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTA 480

 54663708 TGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTC 54663767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTC 540

 54663768 AAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGA 54663827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGA 600

 54663828 TTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAG 54663887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAG 660

 54663888 GGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTC 54663947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTC 720

 54663948 TTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAG 54664007
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAG 780

 54664008 CTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCAT 54664067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCAT 840

 54664068 GTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGA 54664127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGA 900

 54664128 AAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACC 54664187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACC 960

 54664188 AGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAAT 54664247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAAT 1020

 54664248 TAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCG 54664307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCG 1080

 54664308 GGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTT 54664367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTT 1140

 54664368 TCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTT 54664427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTT 1200

 54664428 CTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCG 54664487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCG 1260

 54664488 ATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTT 54664547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1261 ATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTT 1320

 54664548 TGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTC 54664607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTC 1380

 54664608 CAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTC 54664667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTC 1440

 54664668 AGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTT 54664727
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTT 1500

 54664728 GAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCG 54664787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCG 1560

 54664788 TGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGG 54664847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGG 1620

 54664848 GTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACT 54664907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACT 1680

 54664908 TGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAAC 54664967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAAC 1740

 54664968 TGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATG 54665027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATG 1800

 54665028 ACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGT 54665087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGT 1860

 54665088 GTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATG 54665147
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATG 1920

 54665148 TTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCAC 54665207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCAC 1980

 54665208 ATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGA 54665267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGA 2040

 54665268 ATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGG 54665327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGG 2100

 54665328 CGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGA 54665387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGA 2160

 54665388 ATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAA 54665447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAA 2220

 54665448 TTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTT 54665507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTT 2280

 54665508 GTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTG 54665567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTG 2340

 54665568 TTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACA 54665627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACA 2400

 54665628 CAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCT 54665687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCT 2460

 54665688 ATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTC 54665747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTC 2520

 54665748 CGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAAC 54665807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAAC 2580

 54665808 AAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGG 54665867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGG 2640

 54665868 TCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACT 54665927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACT 2700

 54665928 GTTTCCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAAT 54665986
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTTCCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAAT 2760

 54665987 TTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGG 54666046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGG 2820

 54666047 AGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTAT 54666106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTAT 2880

 54666107 TTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCT 54666166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCT 2940

 54666167 CTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCA 54666226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCA 3000

 54666227 ATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGC 54666286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGC 3060

 54666287 TCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAA 54666346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAA 3120

 54666347 TCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGAC 54666406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3121 TCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGAC 3180

 54666407 CACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCC 54666466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCC 3240

 54666467 TCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCT 54666526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCT 3300

 54666527 CTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCA 54666586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCA 3360

 54666587 GTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCT 54666646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCT 3420

 54666647 TTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGT 54666706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGT 3480

 54666707 CAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAA 54666766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAA 3540

 54666767 TTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTA 54666826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTA 3600

 54666827 CTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATT 54666886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATT 3660

 54666887 ATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGA 54666946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGA 3720

 54666947 GTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGT 54667006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGT 3780

 54667007 GGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAG 54667066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAG 3840

 54667067 ACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTA 54667126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTA 3900

 54667127 TTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACT 54667186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACT 3960

 54667187 GCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGG 54667246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGG 4020

 54667247 ACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACA 54667306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACA 4080

 54667307 AATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCC 54667366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCC 4140

 54667367 AGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAAT 54667426
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4141 AGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAAT 4200

 54667427 ATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAG 54667486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAG 4260

 54667487 GATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGT 54667546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGT 4320

 54667547 CTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATG 54667606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATG 4380

 54667607 CCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGA 54667666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGA 4440

 54667667 TTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGA 54667726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGA 4500

 54667727 AAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAG 54667786
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAG 4560

 54667787 ATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAA 54667846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4561 ATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAA 4620

 54667847 TAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCT 54667906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCT 4680

 54667907 AATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTC 54667966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTC 4740

 54667967 TGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTAT 54668026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTAT 4800

 54668027 CAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCT 54668086
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCT 4860

 54668087 ACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTT 54668146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTT 4920

 54668147 CAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGG 54668206
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4921 CAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGG 4980

 54668207 CACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGA 54668266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGA 5040

 54668267 CAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGC 54668326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGC 5100

 54668327 CCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCT 54668386
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5101 CCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCT 5160

 54668387 ATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAG 54668446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAG 5220

 54668447 CACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCC 54668506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCC 5280

 54668507 TCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGA 54668566
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5281 TCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGA 5340

 54668567 CATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGA 54668626
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5341 CATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGA 5400

 54668627 GCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTG 54668686
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTG 5460

 54668687 CTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTG 54668746
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTG 5520

 54668747 AGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGC 54668806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGC 5580

 54668807 TAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCAT 54668866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCAT 5640

 54668867 AATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAA 54668926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAA 5700

 54668927 ACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5701 ACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 5747

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 5807

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 5867

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5868 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 5927

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 5987

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 6047

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6048 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 6107

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 6167

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 6227

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6228 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 6287

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6288 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 6347

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6348 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 6407

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6408 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 6467

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6468 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 6527

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6528 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 6587

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6588 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 6647

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     6648 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 6707

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6708 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 6767

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6768 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 6827

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     6828 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 6885

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6886 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 6945

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6946 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 7004

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7005 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 7064

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7065 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 7124

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7125 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 7184

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7185 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 7244

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7245 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 7304

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7305 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 7364

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7365 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 7424

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7425 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 7484

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7485 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 7544

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     7545 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 7602

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 7662

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 7722

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 7782

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 7842

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     7843 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 7902

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7903 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 7962

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7963 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 8022

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     8023 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 8082

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     8083 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 8142

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8143 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 8202

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     8203 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 8262

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     8263 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 8322

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8323 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 8382

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8383 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 8442

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8443 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 8502

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8503 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 8562

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8563 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 8622

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8623 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 8682

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8683 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 8742

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8743 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 8802

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     8803 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 8862

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     8863 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 8922

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8923 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 8982

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8983 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 9042

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 54672882
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9043 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 9088

Alignment time is 6.56774 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3341] =>      3341 nucs 'mol-32-3311-229997_3341'

Score:        3109
Aligned:      3342        nucs
Identic:      3320 ( 99%) nucs =>      1830 (100%)      1490 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54671377] EXCISED REGION [54671380,54672882]
 second seq =>  [       1,    1836] EXCISED REGION [    1839,    3341]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [54671378,54671379]
 second seq =>         2 nucs [1837,1838]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54671377,54671377] to [54671379,54671379]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54671376,54671377] to [54671380,54671381]
 second seq =>         2 nucs [1835,1836] to [1839,1840]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1837,1837] to [1838,1838]

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 54671377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 1836

EXCISED REGION

 54671380 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 54671439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1839 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 1898

 54671440 TTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 54671499
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TTTCAATTATCTCAATGTTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 1958

 54671500 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 54671559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 2018

 54671560 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 54671619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 2078

 54671620 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGA 54671679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2079 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGA 2138

 54671680 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 54671739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 2198

 54671740 GAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 54671799
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 GAAAAGTTAAAAATCACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 2258

 54671800 TGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAA 54671859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2259 TGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAA 2318

 54671860 ATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCT 54671919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 ATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCT 2378

 54671920 TCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCAT 54671979
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TCAAAATGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCAT 2438

 54671980 CAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGA 54672039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2439 CAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGA 2498

 54672040 AGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTA 54672099
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2499 AGAGAGGAGATGAAAGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTA 2558

 54672100 TATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTG 54672159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 TATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTG 2618

 54672160 AGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCC 54672219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 AGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCC 2678

 54672220 CTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCA 54672279
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2679 CTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCA 2738

 54672280 CTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAA 54672339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 CTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAA 2798

 54672340 ACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCA 54672399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 ACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCA 2858

 54672400 ACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGT 54672459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 ACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGT 2918

 54672460 CTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATC 54672519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 CTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATC 2978

 54672520 TGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCT 54672579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 TGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCT 3038

 54672580 GCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCAC 54672639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 GCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCAC 3098

 54672640 AGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGA 54672699
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3099 AGAAGTGTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGA 3158

 54672700 TTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCC 54672759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 TTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCC 3218

 54672760 TTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAA 54672819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 TTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAA 3278

 54672820 AGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 54672879
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 AGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 3338

 54672880 GAG 54672882
          |||
     3339 GAG 3341

Alignment time is 2.46758 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10559] =>     10559 nucs 'mol-32-3311-304466_10559'

Score:        9984
Aligned:     10564        nucs
Identic:     10508 ( 99%) nucs =>      7000 (100%)      3508 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54661948,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673073]
 second seq =>  [       1,    7027] EXCISED REGION [    7028,   10559]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54661948 CAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTGCGGGAGCTATGAACGTTT 54662007
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
        1 CAGAAAGAGTGAGTGTGTGAGAGAGATGCAGGTATATTGGTGCAGGAGCTATGAACGTTT 60

 54662008 TCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGG 54662067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACATTTACATTTTCTCAGAGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGG 120

 54662068 AAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACT 54662127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTAAAAAGACTAGGGAAATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACT 180

 54662128 GATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTT 54662187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTGTGAATTTAATGTGAGACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTT 240

 54662188 AAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAG 54662247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTGCATGGGGAATTGGAATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAG 300

 54662248 TATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTCGGCTAGGAACGAAAGGAAG 54662307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      301 TATGTGAAAGTGACAACAGCAAATGACAAGGGGGCTTCTTTGGCTAGGAACGAAAGGAAG 360

 54662308 TGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGAT 54662367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCGGCATGTGTGGGGTCTGAGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGAT 420

 54662368 TCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGG 54662427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCGTGAATGAATGAAGTTGGAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGG 480

 54662428 TTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACA 54662487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGAGAGTGTAATACTTAAAATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACA 540

 54662488 ATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGA 54662547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATTAAAGGTAAAAATAAATGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGA 600

 54662548 AAACTCAAGGAAATGAGAAGTGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATACTGGCA 54662607
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      601 AAACTCAAGGAAATGAGAAGTGTCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATATTGGCA 660

 54662608 TAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGT 54662667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAACCAAGAGAGTATGAATCATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGT 720

 54662668 GAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTG 54662727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAGCCATTCAAAAGAAAATTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTG 780

 54662728 AGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTC 54662787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAGATTTACAATGTGTTCGTAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTC 840

 54662788 CCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACT 54662847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAAATTAATCTATAAATTCAGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACT 900

 54662848 TGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTT 54662907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGACCAGATTGAAAAGTAAACAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTT 960

 54662908 TGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAA 54662967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      961 TGAACATCAAGGATAAAGAACAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGATCAAGAA 1020

 54662968 AGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACC 54663027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCTTTCAAAGGCCTAGAGATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACC 1080

 54663028 GAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAG 54663087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAAACAATGCGGCAATGAATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAG 1140

 54663088 AAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGG 54663147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGACAAAGATCTCCTAACTACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGG 1200

 54663148 AGAAAAGTAGAATACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGA 54663207
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAAAAGTAGAAAACAGGCCAAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGA 1260

 54663208 AGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGC 54663267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGAACGTCTCAGGAAGGCAGTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGC 1320

 54663268 CTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAA 54663327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCTTAACAATTTTCCCTAAATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAA 1380

 54663328 ACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGT 54663387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTTGTGAAAAATGTAAATTCTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGT 1440

 54663388 GGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGC 54663447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCTGGGGACACAGCAATCCAAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGC 1500

 54663448 AACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACA 54663507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACACAGGTGTGAGAGCCTCTGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACA 1560

 54663508 CCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTA 54663567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTATTTCCCTAAGGCCTGTTCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTA 1620

 54663568 GTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACAT 54663627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTTATTTTGAAAATAATACATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACAT 1680

 54663628 AAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGT 54663687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATGAAAAAGAAAAATCCTCTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGT 1740

 54663688 ATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATA 54663747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATATATATATTTGAATTATGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATA 1800

 54663748 TAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTC 54663807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATATTTTCTATATTATTCAAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTC 1860

 54663808 ATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAA 54663867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAATATAGTAGTAGTATGATTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAA 1920

 54663868 TTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAA 54663927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAA 1980

 54663928 GCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGAC 54663987
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGAC 2040

 54663988 ATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAA 54664047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAA 2100

 54664048 AGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAA 54664107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAA 2160

 54664108 CCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAAT 54664167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAAT 2220

 54664168 AATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAA 54664227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAA 2280

 54664228 ACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCT 54664287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCT 2340

 54664288 AGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGA 54664347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGA 2400

 54664348 AAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGT 54664407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGT 2460

 54664408 GTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATG 54664467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATG 2520

 54664468 ATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAA 54664527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAA 2580

 54664528 TGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGG 54664587
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGAATTTCATGATGGTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGG 2640

 54664588 CAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGT 54664647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGT 2700

 54664648 AATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCAT 54664707
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2701 AATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCAT 2760

 54664708 CTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCT 54664767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCT 2820

 54664768 GTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATA 54664827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATA 2880

 54664828 GTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCA 54664887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCA 2940

 54664888 AATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTT 54664947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTT 3000

 54664948 TTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACC 54665007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACC 3060

 54665008 AGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTG 54665067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTG 3120

 54665068 TTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGC 54665127
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3121 TTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGC 3180

 54665128 ATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGT 54665187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGT 3240

 54665188 GTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGC 54665247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGC 3300

 54665248 TTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAA 54665307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAA 3360

 54665308 TGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAG 54665367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAG 3420

 54665368 CACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACC 54665427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACC 3480

 54665428 CCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTT 54665487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTT 3540

 54665488 TTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTA 54665547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTA 3600

 54665548 ATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTG 54665607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTG 3660

 54665608 GAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGT 54665667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGT 3720

 54665668 CCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACC 54665727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACC 3780

 54665728 CCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCA 54665787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCA 3840

 54665788 GGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAA 54665847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAA 3900

 54665848 GATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGA 54665907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGA 3960

 54665908 AAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGA 54665966
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     3961 AAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGA 4020

 54665967 TTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAA 54666026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAA 4080

 54666027 TTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATG 54666086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATG 4140

 54666087 CATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCC 54666146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCC 4200

 54666147 TTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTG 54666206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTG 4260

 54666207 AATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGG 54666266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGG 4320

 54666267 GCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTG 54666326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTG 4380

 54666327 TGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCA 54666386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCA 4440

 54666387 GTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTT 54666446
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTT 4500

 54666447 GGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCAC 54666506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCAC 4560

 54666507 ACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCC 54666566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCC 4620

 54666567 CTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAAT 54666626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAAT 4680

 54666627 CAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAG 54666686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAG 4740

 54666687 TGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGG 54666746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGG 4800

 54666747 GATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACAT 54666806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACAT 4860

 54666807 GGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACT 54666866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACT 4920

 54666867 GCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGG 54666926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGG 4980

 54666927 GCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATT 54666986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATT 5040

 54666987 GCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTG 54667046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTG 5100

 54667047 GCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAAC 54667106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAAC 5160

 54667107 TTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACA 54667166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACA 5220

 54667167 CCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGA 54667226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGA 5280

 54667227 GAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGA 54667286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGA 5340

 54667287 AATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAG 54667346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAG 5400

 54667347 GTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCT 54667406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5401 GTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCT 5460

 54667407 CACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATA 54667466
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATA 5520

 54667467 GACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTT 54667526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTT 5580

 54667527 CCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAAC 54667586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAAC 5640

 54667587 CATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACA 54667646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACA 5700

 54667647 GGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCT 54667706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCT 5760

 54667707 GGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTG 54667766
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5761 GGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTG 5820

 54667767 GGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAG 54667826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAG 5880

 54667827 TCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTG 54667886
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTG 5940

 54667887 CTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAA 54667946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAA 6000

 54667947 CTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGG 54668006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||
     6001 CTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAACTCCTGCAACCACCCTGGCATGTTCTGG 6060

 54668007 CAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTA 54668066
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTA 6120

 54668067 CTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCA 54668126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 CTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCA 6180

 54668127 GAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAA 54668186
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     6181 GAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAA 6240

 54668187 ATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTC 54668246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTC 6300

 54668247 TACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTG 54668306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTG 6360

 54668307 TTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCC 54668366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6361 TTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCC 6420

 54668367 ATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGA 54668426
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 ATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGA 6480

 54668427 CATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGA 54668486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGA 6540

 54668487 GTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTC 54668546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTC 6600

 54668547 CCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATG 54668606
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 CCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATG 6660

 54668607 AAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGAC 54668666
          |||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGAC 6720

 54668667 TGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTC 54668726
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6721 TGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTC 6780

 54668727 TTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGAC 54668786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGAC 6840

 54668787 ACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCC 54668846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 ACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCC 6900

 54668847 TCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATG 54668906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATG 6960

 54668907 TTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCT 54668966
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6961 TTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCT 7020

 54668967 GCTTGCC 54668973
          |||||||
     7021 GCTTGCC 7027

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 7087

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 7147

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 7207

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 7267

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 7327

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7328 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 7387

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7388 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 7447

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7448 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 7507

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     7508 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 7567

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7568 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 7627

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7628 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 7687

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7688 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 7747

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7748 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 7807

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7808 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 7867

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7868 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 7927

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     7928 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 7987

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7988 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 8047

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8048 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 8107

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     8108 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 8165

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 8225

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 8284

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8285 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 8344

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8345 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 8404

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8405 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 8464

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8465 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 8524

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8525 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 8584

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8585 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 8644

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8645 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 8704

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8705 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 8764

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8765 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 8824

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     8825 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 8882

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8883 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 8942

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8943 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 9002

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9003 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 9062

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9063 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 9122

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     9123 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 9182

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     9183 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 9242

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9243 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 9302

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     9303 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 9362

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     9363 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 9422

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9423 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 9482

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     9483 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 9542

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     9543 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 9602

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9603 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 9662

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9663 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 9722

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9723 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 9782

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9783 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 9842

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9843 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 9902

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9903 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 9962

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9963 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 10022

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10023 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 10082

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
    10083 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 10142

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
    10143 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 10202

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10203 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 10262

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10263 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 10322

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    10323 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 10382

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
    10383 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 10442

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
    10443 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 10502

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCC 54673073
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10503 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCC 10559

Alignment time is 7.77941 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3532] =>      3532 nucs 'mol-32-3311-304466_3532'

Score:        3267
Aligned:      3533        nucs
Identic:      3508 ( 99%) nucs =>      1830 (100%)      1678 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54671377] EXCISED REGION [54671380,54673073]
 second seq =>  [       1,    1836] EXCISED REGION [    1839,    3532]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [54671378,54671379]
 second seq =>         2 nucs [1837,1838]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54671377,54671377] to [54671379,54671379]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [54671376,54671377] to [54671380,54671381]
 second seq =>         2 nucs [1835,1836] to [1839,1840]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1837,1837] to [1838,1838]

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 54671377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA 1836

EXCISED REGION

 54671380 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 54671439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1839 TACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTT 1898

 54671440 TTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 54671499
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TTTCAATTATCTCAATGTTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCA 1958

 54671500 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 54671559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 ACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAG 2018

 54671560 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 54671619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 GTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGT 2078

 54671620 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGA 54671679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2079 AGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGA 2138

 54671680 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 54671739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGT 2198

 54671740 GAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 54671799
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 GAAAAGTTAAAAATCACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTA 2258

 54671800 TGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAA 54671859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2259 TGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAA 2318

 54671860 ATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCT 54671919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 ATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCT 2378

 54671920 TCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCAT 54671979
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TCAAAATGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCAT 2438

 54671980 CAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGA 54672039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2439 CAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGA 2498

 54672040 AGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTA 54672099
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2499 AGAGAGGAGATGAAAGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTA 2558

 54672100 TATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTG 54672159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 TATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTG 2618

 54672160 AGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCC 54672219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 AGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCC 2678

 54672220 CTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCA 54672279
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2679 CTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCA 2738

 54672280 CTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAA 54672339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 CTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAA 2798

 54672340 ACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCA 54672399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 ACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCA 2858

 54672400 ACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGT 54672459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 ACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGT 2918

 54672460 CTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATC 54672519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 CTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATC 2978

 54672520 TGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCT 54672579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 TGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCT 3038

 54672580 GCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCAC 54672639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 GCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCAC 3098

 54672640 AGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGA 54672699
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3099 AGAAGTGTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGA 3158

 54672700 TTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCC 54672759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 TTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCC 3218

 54672760 TTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAA 54672819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 TTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAA 3278

 54672820 AGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 54672879
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 AGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 3338

 54672880 GAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAAC 54672939
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 GAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAAC 3398

 54672940 CCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCA 54672999
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 CCCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCA 3458

 54673000 TCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGA 54673059
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 TCTACTCGGGAACCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGA 3518

 54673060 GCCAAGATTGTGCC 54673073
          ||||||||||||||
     3519 GCCAAGATTGTGCC 3532

Alignment time is 2.59951 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5726] =>      5726 nucs 'mol-32-3395-049923_5726'

Score:        5726
Aligned:      5726        nucs
Identic:      5726 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663855,54669580]
 second seq =>  [       1,    5726]

 54663855 ACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTT 54663914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTT 60

 54663915 GTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATA 54663974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATA 120

 54663975 TCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGT 54664034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGT 180

 54664035 GCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCT 54664094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCT 240

 54664095 TCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACT 54664154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACT 300

 54664155 CCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGT 54664214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGT 360

 54664215 CACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCT 54664274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCT 420

 54664275 GTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCT 54664334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCT 480

 54664335 CTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCT 54664394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCT 540

 54664395 AAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGT 54664454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGT 600

 54664455 ATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAAT 54664514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAAT 660

 54664515 ATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCA 54664574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCA 720

 54664575 CAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATA 54664634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATA 780

 54664635 GGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGT 54664694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGT 840

 54664695 TAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGT 54664754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGT 900

 54664755 CCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGAT 54664814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGAT 960

 54664815 ATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTG 54664874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACATTATTG 1020

 54664875 GGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCT 54664934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCT 1080

 54664935 TCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTA 54664994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTA 1140

 54664995 TCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACA 54665054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACA 1200

 54665055 TTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTAT 54665114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAATGTAT 1260

 54665115 TATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAA 54665174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAA 1320

 54665175 AAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAA 54665234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAA 1380

 54665235 TCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAA 54665294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAA 1440

 54665295 AGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCA 54665354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCA 1500

 54665355 GTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATC 54665414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATC 1560

 54665415 TGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAG 54665474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAG 1620

 54665475 AGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATT 54665534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATT 1680

 54665535 ATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGA 54665594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGA 1740

 54665595 AGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCT 54665654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCT 1800

 54665655 AGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTT 54665714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTT 1860

 54665715 GGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAA 54665774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAA 1920

 54665775 AACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAAC 54665834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCACCAAC 1980

 54665835 AAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGC 54665894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGC 2040

 54665895 TGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTG 54665954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTAAGTTTG 2100

 54665955 TGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAA 54666014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAA 2160

 54666015 ACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACA 54666074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACA 2220

 54666075 TGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTC 54666134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTC 2280

 54666135 AAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGT 54666194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGT 2340

 54666195 GCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAA 54666254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAA 2400

 54666255 CATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGT 54666314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGT 2460

 54666315 CATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTG 54666374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTG 2520

 54666375 CCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAA 54666434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAA 2580

 54666435 GGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGC 54666494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGC 2640

 54666495 CCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGA 54666554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGA 2700

 54666555 CGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCC 54666614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCC 2760

 54666615 CCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACAT 54666674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACAT 2820

 54666675 CTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCT 54666734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCT 2880

 54666735 GTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACA 54666794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACA 2940

 54666795 GCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACAT 54666854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACAT 3000

 54666855 GAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAG 54666914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAG 3060

 54666915 GGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTG 54666974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTG 3120

 54666975 AGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGT 54667034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGT 3180

 54667035 TCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTT 54667094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTT 3240

 54667095 GATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGA 54667154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGA 3300

 54667155 TACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAG 54667214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAG 3360

 54667215 TGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAG 54667274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAG 3420

 54667275 AACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGA 54667334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGA 3480

 54667335 GTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGA 54667394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGA 3540

 54667395 ATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGC 54667454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGC 3600

 54667455 CCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGA 54667514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGA 3660

 54667515 GCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGT 54667574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGT 3720

 54667575 CTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCC 54667634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCC 3780

 54667635 TCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTAC 54667694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTAC 3840

 54667695 CAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTAT 54667754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTAT 3900

 54667755 CGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGAC 54667814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGAC 3960

 54667815 TTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTT 54667874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTT 4020

 54667875 GTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAA 54667934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAA 4080

 54667935 CTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCT 54667994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCT 4140

 54667995 GGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAA 54668054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAA 4200

 54668055 TACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACT 54668114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACT 4260

 54668115 CCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTC 54668174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTC 4320

 54668175 CAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTT 54668234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTT 4380

 54668235 CCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGT 54668294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGT 4440

 54668295 CCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATC 54668354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATC 4500

 54668355 ACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAG 54668414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAG 4560

 54668415 TGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACA 54668474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACA 4620

 54668475 CATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTC 54668534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTC 4680

 54668535 TGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCA 54668594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCA 4740

 54668595 AAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGG 54668654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGG 4800

 54668655 AGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAA 54668714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAA 4860

 54668715 GATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTC 54668774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTC 4920

 54668775 AATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCC 54668834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCC 4980

 54668835 TTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTT 54668894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTT 5040

 54668895 AAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTG 54668954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTG 5100

 54668955 TTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCA 54669014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCA 5160

 54669015 GTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCC 54669074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCC 5220

 54669075 CACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTC 54669134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTC 5280

 54669135 GGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTC 54669194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTC 5340

 54669195 TCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATC 54669254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATC 5400

 54669255 TTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGT 54669314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGT 5460

 54669315 GTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAG 54669374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAG 5520

 54669375 TTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAG 54669434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAG 5580

 54669435 TGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAA 54669494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAA 5640

 54669495 TCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGAT 54669554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGAT 5700

 54669555 TTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCAT 54669580
          ||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCAT 5726

Alignment time is 3.71556 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9161] =>      9161 nucs 'mol-32-33a0-150306_9161'

Score:        8568
Aligned:      9171        nucs
Identic:      9108 ( 99%) nucs =>      5122 (100%)      3986 ( 99%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663832,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673560]
 second seq =>  [       1,    5143] EXCISED REGION [    5144,    9161]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54663832 TAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTA 54663891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTA 60

 54663892 TGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTT 54663951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTT 120

 54663952 TCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTG 54664011
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTG 180

 54664012 CACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTC 54664071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTC 240

 54664072 AAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAAT 54664131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAAT 300

 54664132 ATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCC 54664191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCC 360

 54664192 TTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAA 54664251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAA 420

 54664252 TCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGAT 54664311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGAT 480

 54664312 TCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTT 54664371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTT 540

 54664372 TTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTG 54664431
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACCTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTG 600

 54664432 GCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGG 54664491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGG 660

 54664492 TTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTG 54664551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      661 TTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTTTGTG 720

 54664552 GTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAG 54664611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAG 780

 54664612 ATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTT 54664671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTT 840

 54664672 CCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAAC 54664731
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAAC 900

 54664732 AGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAG 54664791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAG 960

 54664792 GCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCT 54664851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCT 1020

 54664852 TATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGA 54664911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGA 1080

 54664912 TTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGAT 54664971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGAT 1140

 54664972 AATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCG 54665031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCG 1200

 54665032 TTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTG 54665091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTG 1260

 54665092 ATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTAC 54665151
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTAC 1320

 54665152 ATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAA 54665211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAA 1380

 54665212 AAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATAT 54665271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATAT 1440

 54665272 TGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGG 54665331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGG 1500

 54665332 TGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGA 54665391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGA 1560

 54665392 GGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTC 54665451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTC 1620

 54665452 AGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAA 54665511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAA 1680

 54665512 ACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTT 54665571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTT 1740

 54665572 AGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAA 54665631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAA 1800

 54665632 ATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGC 54665691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGC 1860

 54665692 GTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCT 54665751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCT 1920

 54665752 TATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAA 54665811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAA 1980

 54665812 CAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTA 54665871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTA 2040

 54665872 GAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTT 54665931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTT 2100

 54665932 CCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAG 54665990
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAG 2160

 54665991 CACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAA 54666050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAA 2220

 54666051 TATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTG 54666110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTG 2280

 54666111 GGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTG 54666170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTG 2340

 54666171 CTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGT 54666230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGT 2400

 54666231 GTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCT 54666290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCT 2460

 54666291 CTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCAC 54666350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCAC 2520

 54666351 ACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACC 54666410
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2521 ACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACC 2580

 54666411 AGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTC 54666470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTC 2640

 54666471 TGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCC 54666530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCC 2700

 54666531 AAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCC 54666590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCC 2760

 54666591 TAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTT 54666650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTT 2820

 54666651 GGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAA 54666710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAA 2880

 54666711 TTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGG 54666770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGG 2940

 54666771 TACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCT 54666830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCT 3000

 54666831 CTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTC 54666890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTC 3060

 54666891 AAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTG 54666950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTG 3120

 54666951 CTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGAT 54667010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGAT 3180

 54667011 TTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTT 54667070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTT 3240

 54667071 TTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGG 54667130
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3241 TTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGCAAGGTTACTATTGG 3300

 54667131 CATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAG 54667190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAG 3360

 54667191 TTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTG 54667250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTG 3420

 54667251 GAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATT 54667310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATT 3480

 54667311 TGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGC 54667370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGC 3540

 54667371 ATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCA 54667430
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3541 ATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCA 3600

 54667431 GTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATG 54667490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATG 3660

 54667491 TAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTC 54667550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTC 3720

 54667551 CTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAG 54667610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAG 3780

 54667611 TTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCC 54667670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCC 3840

 54667671 AGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAAT 54667730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAAT 3900

 54667731 GTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTG 54667790
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTG 3960

 54667791 CAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAA 54667850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3961 CAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAA 4020

 54667851 ATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATG 54667910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATG 4080

 54667911 TAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTG 54667970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTG 4140

 54667971 AAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAG 54668030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4141 AAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGG 4200

 54668031 GTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTA 54668090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTA 4260

 54668091 TTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGA 54668150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGA 4320

 54668151 ATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACC 54668210
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACC 4380

 54668211 AAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAAT 54668270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAAT 4440

 54668271 CACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCT 54668330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCT 4500

 54668331 GCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCG 54668390
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4501 GCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCG 4560

 54668391 ACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACT 54668450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACT 4620

 54668451 GTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAA 54668510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAA 4680

 54668511 ATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATA 54668570
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4681 ATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATA 4740

 54668571 GATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCA 54668630
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4741 GATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCA 4800

 54668631 TGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGC 54668690
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGC 4860

 54668691 GCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAG 54668750
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAG 4920

 54668751 AATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGA 54668810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGA 4980

 54668811 TGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATA 54668870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATA 5040

 54668871 AAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTG 54668930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTG 5100

 54668931 CTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5101 CTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 5143

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 5203

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 5263

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 5323

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 5383

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 5443

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5444 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 5503

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 5563

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 5623

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5624 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 5683

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 5743

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 5803

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 5863

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 5923

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 5983

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 6043

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     6044 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 6103

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6104 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 6163

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 6223

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     6224 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 6281

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 6341

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 6400

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 6460

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 6520

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 6580

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 6640

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 6700

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 6760

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 6820

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 6880

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6881 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 6940

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     6941 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 6998

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6999 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 7058

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7059 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 7118

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7119 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 7178

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7179 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 7238

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     7239 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 7298

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7299 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 7358

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7359 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 7418

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7419 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 7478

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7479 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 7538

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7539 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 7598

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCT-TAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGG 54672055
          |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||.|
     7599 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCA-CCTCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAG 7657

 54672056 TCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCA 54672115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7658 TCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCA 7717

 54672116 TAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGA 54672175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7718 TAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGA 7777

 54672176 CAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCT 54672235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7778 CAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCT 7837

 54672236 GGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTA 54672295
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7838 GGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTA 7897

 54672296 ATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATA 54672355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7898 ATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATA 7957

 54672356 AGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTA 54672415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7958 AGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTA 8017

 54672416 TGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGG 54672475
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8018 TGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGCCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGG 8077

 54672476 TAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGG 54672535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8078 TAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGG 8137

 54672536 TAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTG 54672595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8138 TAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTG 8197

 54672596 CTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTT 54672655
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     8198 CTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATGTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTT 8257

 54672656 GATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTT 54672715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     8258 GATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTT 8317

 54672716 TAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCAC 54672775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8318 TAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCAC 8377

 54672776 AAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCC 54672835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8378 AAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCC 8437

 54672836 AGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCAC 54672895
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     8438 AGGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCAC 8497

 54672896 CTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTA 54672955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     8498 CTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTA 8557

 54672956 AAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTG 54673015
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     8558 AAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTG 8617

 54673016 AGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCAT 54673075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8618 AGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCAT 8677

 54673076 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATA 54673135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||
     8678 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATA 8737

 54673136 TTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAA 54673195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8738 TTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAA 8797

 54673196 TACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAA 54673255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8798 TACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAA 8857

 54673256 ATGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAA 54673312
          |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8858 ATGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAA 8913

 54673313 ACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCAC 54673372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8914 ACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCAC 8973

 54673373 GAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTA 54673432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8974 GAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTA 9033

 54673433 TTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGG 54673492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9034 TTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGG 9093

 54673493 GAGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGT 54673552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     9094 GAGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATATAGTGGT 9153

 54673553 GGGGGTTG 54673560
          ||||||||
     9154 GGGGGTTG 9161

Alignment time is 6.5965 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4018] =>      4018 nucs 'mol-32-33a0-150306_4018'

Score:        3675
Aligned:      4025        nucs
Identic:      3985 ( 99%) nucs =>      2467 ( 99%)      1518 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669540,54672022] EXCISED REGION [54672025,54673560]
 second seq =>  [       1,    2481] EXCISED REGION [    2484,    4018]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [54672023,54672024]
 second seq =>         2 nucs [2482,2483]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2481,2482] to [2483,2484]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 60

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 120

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 180

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 240

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 300

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 360

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 420

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 480

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 540

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 600

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 660

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 720

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 780

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 840

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 900

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCAC 54670499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 960

 54670500 CCCCC-TCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1020

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1080

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCT--GTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1138

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1198

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTTTCTTT-CTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1257

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1317

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1377

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1437

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1497

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1557

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1617

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1677

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1737

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1797

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     1798 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 1855

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 1915

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 1975

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 2035

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 2095

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2096 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 2155

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2156 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 2215

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 2275

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2276 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 2335

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2336 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 2395

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 2455

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACC 54672022
          ||||||||||||||||||||||||||
     2456 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACC 2481

EXCISED REGION

 54672025 TAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTT 54672084
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTT 2543

 54672085 AATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGA 54672144
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 AATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGA 2603

 54672145 GCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGA 54672204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 GCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGA 2663

 54672205 GCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGC 54672264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2664 GCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGC 2723

 54672265 CCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAA 54672324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 CCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAA 2783

 54672325 TATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTC 54672384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 TATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTC 2843

 54672385 TAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTC 54672444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2844 TAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGCCGGTC 2903

 54672445 ATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCT 54672504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 ATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCT 2963

 54672505 TCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGAC 54672564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 TCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGAC 3023

 54672565 ACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCAC 54672624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 ACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCAC 3083

 54672625 ACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAA 54672684
          ||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 ACATGTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAA 3143

 54672685 ACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACA 54672744
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 ACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACA 3203

 54672745 TGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTC 54672804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 TGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTC 3263

 54672805 TAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCA 54672864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3264 TAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCA 3323

 54672865 GCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGA 54672924
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 GCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGA 3383

 54672925 CCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGC 54672984
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 CCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGC 3443

 54672985 ATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGG 54673044
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 ATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGG 3503

 54673045 CAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAA 54673104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 CAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAA 3563

 54673105 ACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTT 54673164
          |||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 ACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATATTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTT 3623

 54673165 CAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGA 54673224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 CAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGA 3683

 54673225 AATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCT 54673281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||
     3684 AATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCT 3739

 54673282 TGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGA 54673341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 TGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGA 3799

 54673342 CTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTT 54673401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 CTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTT 3859

 54673402 TTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAG 54673461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 TTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAG 3919

 54673462 AAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAAT 54673521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 AAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAAT 3979

 54673522 AGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGTTG 54673560
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3980 AGAAATAGTCTATATATTGATATATAGTGGTGGGGGTTG 4018

Alignment time is 2.9427 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9824] =>      9824 nucs 'mol-32-33b6-029528_9824'

Score:        9453
Aligned:      9816        nucs
Identic:      9783 (100%) nucs =>      8837 (100%)       946 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54660108,54668973] EXCISED REGION [54669540,54670488]
 second seq =>  [       1,    8866] EXCISED REGION [    8867,    9815]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54660108 AACATGACTGTAATTATCTGCTCTTATTCAATGAACCAGATTTTTGGTGTCACTCTGGTT 54660167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACATGACTGTAATTATCTGCTCTTATTCAATGAACCAGATTTTTGGTGTCACTCTGGTT 60

 54660168 TTCTTGACTGCTTTGCCCACCAGTAAGAGAGAGTGTCATTGAAATGGAGGAAGGTGATTA 54660227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTTGACTGCTTTGCCCACCAGTAAGAGAGAGTGTCATTGAAATGGAGGAAGGTGATTA 120

 54660228 CCATTTGGGCAGATGCCTTGGTAATCTCAAACTTTCAAAAGAGAATATCAACACTACCTC 54660287
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATTTGGGCAGATGCCTTGGTAATCTCAAGCTTTCAAAAGAGAATATCAACACTACCTC 180

 54660288 AAGTGATTATTTGTTAAGTCAAGTGGCTTGTTCCCCATTAGGAAGCAGATTCAGTGCACT 54660347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTGATTATTTGTTAAGTCAAGTGGCTTGTTCCCCATTAGGAAGCAGATTCAGTGCACT 240

 54660348 CAAGCTACTCATCTGGGGCACACAGCCTTGAGCTCATTGCTACTCAGAATTTATTAAAAT 54660407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGCTACTCATCTGGGGCACACAGCCTTGAGCTCATTGCTACTCAGAATTTATTAAAAT 300

 54660408 TCTATTGAGCTAATCCACACTTCAGGGGAAAGACTGCTATCTTTCCCTGCCTGAAGATAC 54660467
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTATTGAGCTAACCCACACTTCAGGGGAAAGACTGCTATCTTTCCCTGCCTGAAGATAC 360

 54660468 TTCCTCATCTCTAAGTCAAAAGAAATCAGACATCTAGGTAGCTAGGCCTTGTCACACTGG 54660527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCTCATCTCTAAGTCAAAAGAAATCAGACATCTAGGTAGCTAGGCCTTGTCACACTGG 420

 54660528 CCATGAGAATACTTACTCTCATTCTAGTTCACTTTAGTGTGATAGCACATACATCTAATG 54660587
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      421 CCATGAGAATACTTACTCTCATTCTAGTTCACTTTAGTGTGATAGTACATACATCTAATG 480

 54660588 AGTATCATATGAAAAATAAAAAAGCTGTGAACACATTAACGGAGCTTATGTAAATGATGC 54660647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTATCATATGAAAAATAAAAAAGCTGTGAACACATTAACGGAGCTTATGTAAATGATGC 540

 54660648 TGTCAAGGATAATTTTATGTACCGCATGCAGTGATTATCTCTGAGAGGAAGTCCTCTTCG 54660707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTCAAGGATAATTTTATGTACCGCATGCAGTGATTATCTCTGAGAGGAAGTCCTCTTCG 600

 54660708 GTGCTCATAAGAAATTAGTTGTATGTCTTCTGAAAATTTAGTTTATTTTCATCTTGTGGA 54660767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCTCATAAGAAATTAGTTGTATGTCTTCTGAAAATTTAGTTTATTTTCATCTTGTGGA 660

 54660768 CAATGATTTATGTAACGAAAAGGCTTTCCTTTCTGCTTTCTCTGCTGGAAAGCTTCTGGC 54660827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATGATTTATGTAACGAAAAGGCTTTCCTTTCTGCTTTCTCTGCTGGAAAGCTTCTGGC 720

 54660828 TGACCCAGTTTTTTCAACTTTGTCTGATTTCTGGCACCATTTTTTGTCTCCATCTTTAGT 54660887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGACCCAGTTTTTTCAACTTTGTCTGATTTCTGGCACCATTTTTTGTCTCCATCTTTAGT 780

 54660888 CTATTTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTATCTGCTTGGATTTTAATTTTCTTTG 54660947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATTTTCTGATGCGTCCACTTTTAACATTTATTATCTGCTTGGATTTTAATTTTCTTTG 840

 54660948 TAAACTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAAGTTAACAGCAGAGACAGGTGACTGC 54661007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAACTACCATAAATCTTTAATAAGAAGTAGGTAAGTTAACAGCAGAGACAGGTGACTGC 900

 54661008 CATCAGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCACACATGAAGGACACATCCTTCTGAA 54661067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATCAGGAGACCATGTGCCCACCCAAAGCCATGCACACATGAAGGACACATCCTTCTGAA 960

 54661068 CAATGCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTGTGCACTTTAATTTCTTATTAAACAA 54661127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAATGCATCTAGAAACCACCATGGGCATCCTATTGTGCACTTTAATTTCTTATTAAACAA 1020

 54661128 AATAACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGCAAAACTTTACTGACCACGAGATTCT 54661187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATAACAAAACGAAATTGCATTGATAAAACAAGGCAAAACTTTACTGACCACGAGATTCT 1080

 54661188 TATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGGAGTTTTAAATGAAAAATAACTGATG 54661247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTCCTGAGATAAACAGGCAAATGGGAGAAAAGGAGTTTTAAATGAAAAATAACTGATG 1140

 54661248 CTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATAATTTCTATTTATGAAAACGGTCCCT 54661307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTACTCACCTCCTCCATTTACATGAATAAAGATAATTTCTATTTATGAAAACGGTCCCT 1200

 54661308 CTTTAATAACTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAAGAATTTTCCTCTGAGAGATTTTACA 54661367
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTAATAATTCTCTAGAGGTTCTTGACTTCTGAAGAATTTTCCTCTGAGAGATTTTACA 1260

 54661368 TTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTAAACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAAG 54661427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTATCAGGAATACCTTGAGATGGAGGATTAATTTAAACTATTCCCTGAAGCCAAGTGAAG 1320

 54661428 AAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGTTTAACTGCTGCTGTCACATGGAAAA 54661487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACTTTTTAAAGCAAGAACAGAAGAGCAAGTTGTTTAACTGCTGCTGTCACATGGAAAA 1380

 54661488 AAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTGAAAACATAAATATCACAAATGACCT 54661547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATGAGGACCGAGAAATAGTAGTCACTGGAATTGAAAACATAAATATCACAAATGACCT 1440

 54661548 TGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGGCTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGAA 54661607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAGTGAGGTTTCTGTAGAATGGTAGGAGTGGAGGCTTGTTGCACGGGTTCAAGAAGGAA 1500

 54661608 TGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAA 54661667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGAGAATGTAAAATGAAGGAAAGAAGTGTAGAAAATGTTTTCAAGAAATTTTTCTAAA 1560

 54661668 AAATGAGCAGATAGGGAGGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTT 54661727
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATGAGCAGATAAGGAGGGCATTGCTGGAGGGGAACACAGAGTCAAGGGAGGACTTTTT 1620

 54661728 TAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAA 54661787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGTTTTTTTTTTTTAAGCTTACATGTATGATGATGAAAATGGTCCAACAGAGAAAAAAA 1680

 54661788 AAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGA 54661847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAACCTAATAATATAAAACACAGATGATTCAAGCACGTGCCTGAGTCAGAAATAGGGA 1740

 54661848 ATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAAT 54661907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAAATGTGAGTACAGGAATAGAGGAATCAGCTTTAGAGGCAGAAAGATGTAAATTTAAT 1800

 54661908 GGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATAACACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGA 54661967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGAAGACAAAGGAGGGAAAAAAGCATACACATA-CACACACAGAAAGAGTGAGTGTGTGA 1859

 54661968 GAGAGATGCAGGTATATTGGTGCGGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAG 54662027
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GAGAGATGCAGGTATATTGGTGCAGGAGCTATGAACGTTTTCACATTTACATTTTCTCAG 1919

 54662028 AGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAA 54662087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGAAATAGGGAGGGACTAAAGGAGACCTCTGGAAAAGTGGAAATTAAAAAGACTAGGGAA 1979

 54662088 ATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAG 54662147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATATGGAATTACTGTCACCAAAAACTCTCTCAAGTACACTGATTGTGAATTTAATGTGAG 2039

 54662148 ACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGA 54662207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACCCACCAGTATCATTGCATGTTTTCCGCTAGTCTCATTTAAAGTGCATGGGGAATTGGA 2099

 54662208 ATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGC 54662267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATTAACTGCATGGAACATTTTGCCAGGAATAAAAGGAAAGTATGTGAAAGTGACAACAGC 2159

 54662268 AAATGACAAGGGGGCTTCTTCGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTG 54662327
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAATGACAAGGGGGCTTCTTTGGCTAGGAACGAAAGGAAGTGCGGCATGTGTGGGGTCTG 2219

 54662328 AGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTG 54662387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGGGACAGTGGCAAAGCTGTGGAGCAACTGATTGGAGGATTCCGTGAATGAATGAAGTTG 2279

 54662388 GAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAA 54662447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GAGTGTAGAGAAAGGAAGCAGAAGTGATTCAAAGTGGTGGTTAGAGAGTGTAATACTTAA 2339

 54662448 AATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAA 54662507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AATTGAGGTTGTGGAGGGGTTGTCATTATTGGTAATAACAATATTAAAGGTAAAAATAAA 2399

 54662508 TGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAG 54662567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TGACTGACCCTTGATTGTGGGCAAGATTACTAGAAGTGGAAAACTCAAGGAAATGAGAAG 2459

 54662568 TGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATACTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATC 54662627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2460 TGCCAGGGTATTAAAAACATTTTCCATGAAAATATTGGCATAACCAAGAGAGTATGAATC 2519

 54662628 ATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAA 54662687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATGAGTTGTTAGAATAAAAAGAACACCTAGGAATACAAGTGAAAGCCATTCAAAAGAAAA 2579

 54662688 TTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCG 54662747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTATAACACATGATTACAAAACAAAAGAGCTGAAAAAGTGAGAGATTTACAATGTGTTCG 2639

 54662748 TAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTC 54662807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TAGATAGAAAGGCTAAATATCATAAAGATGACAATGCTTCCCAAATTAATCTATAAATTC 2699

 54662808 AGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAA 54662867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AGAGTAACTGTCATAAAAATCTCGAGTTATTCACAGAACTTGACCAGATTGAAAAGTAAA 2759

 54662868 CAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAA 54662927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CAAAAACAGAGCTACATAAAAAATCATAATTGTGAAATTTTGAACATCAAGGATAAAGAA 2819

 54662928 CAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGCTCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAG 54662987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2820 CAAATCTTAAAGCCTCCAAGAAAGAAAACCAGATCAAGAAAGCCTTTCAAAGGCCTAGAG 2879

 54662988 ATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGA 54663047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ATCAGTAGGGCATTTGACTTTTCAGAGCATTTCTGACACCGAAAAACAATGCGGCAATGA 2939

 54663048 ATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACT 54663107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ATTCAAAGTTGAATATTTCAAAAAAAAATTTTAAAGGAAGAAGACAAAGATCTCCTAACT 2999

 54663108 ACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAATACAGGCC 54663167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3000 ACTCATTCTCAGGAAGTTAATGGAGACTATACTTCATTGGAGAAAAGTAGAAAACAGGCC 3059

 54663168 AAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCA 54663227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AAGAAATTAGAAGCCATGAGATCTGCGGTGAGAGAGGAGAAGGAACGTCTCAGGAAGGCA 3119

 54663228 GTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAA 54663287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GTTATGAAATGCGTCATAAGTTTTGCTGCCCAGAAAGAGCCTCTTAACAATTTTCCCTAA 3179

 54663288 ATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATT 54663347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 ATCAATGATTCTCAAATAGTAGCTCTCAATTCACCTGGAAACTTGTGAAAAATGTAAATT 3239

 54663348 CTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCC 54663407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CTCAGGGCTCTTCCCAGATCTACAGGATCAAAATCCCTGTGGCTGGGGACACAGCAATCC 3299

 54663408 AAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTC 54663467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AAATCCACACTGCATTTAGCCCTCTCAAGGCTTCTGCTGCAACACAGGTGTGAGAGCCTC 3359

 54663468 TGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGT 54663527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TGGCTGGGTGCCCCAATTCTCAGATGTCTTTCTTGTCACACCTATTTCCCTAAGGCCTGT 3419

 54663528 TCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATA 54663587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TCTAGGTTTCTAACATGGGTTTATTTTTTAATGAGTTTTAGTCTTATTTTGAAAATAATA 3479

 54663588 CATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCT 54663647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CATGATCTCAACTGATATTTTGGAAAATATAGAAAAACATAAATGAAAAAGAAAAATCCT 3539

 54663648 CTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTA 54663707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CTACAATTTCATAATCCAGAAAATAATATAGTAAACATGTATATATATATATTTGAATTA 3599

 54663708 TGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTC 54663767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TGTGGCATATACATTTTTAATATTTTTATTCAAATTTATATAATATTTTCTATATTATTC 3659

 54663768 AAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGA 54663827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AAATATCTTCTAAAACCCTATTGTACTGCCTGCATGTTTCATAATATAGTAGTAGTATGA 3719

 54663828 TTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAG 54663887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TTTATAAAAATGCTCTTTTGATATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAG 3779

 54663888 GGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTC 54663947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GGTATGGGAGTCCTCAGTAAGGTTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTC 3839

 54663948 TTTTTCAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAG 54664007
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTTTTTAACAAAGAGCAGCCTGTAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAG 3899

 54664008 CTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCAT 54664067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CTTGCACAGAGGAATGTTGGCAGTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCAT 3959

 54664068 GTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGA 54664127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GTTCAAAATGGCGGTTCTATCTTCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGA 4019

 54664128 AAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACC 54664187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AAATATGGCACCAGCCAGGCAAAGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACC 4079

 54664188 AGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAAT 54664247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AGCCTTCTCCGTGTGCTATGTAAACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAAT 4139

 54664248 TAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCG 54664307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TAAATCAGACACTGCCACCTCAAGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCG 4199

 54664308 GGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTT 54664367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GGATTCTCCTTTCAGAAGCCCCTCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTT 4259

 54664368 TCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTT 54664427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TCTTTTGCTTATTAAACCTCCGCTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTT 4319

 54664428 CTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCG 54664487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 CTTGGCAAGAGACAGTGAACCCCAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCG 4379

 54664488 ATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTT 54664547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4380 ATGGTTCTTAGAATTGTTTGAAAGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTT 4439

 54664548 TGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTC 54664607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TGTGGTTCTGTGTCATGGTTACAGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTC 4499

 54664608 CAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTC 54664667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 CAAGATGTGCCATTCACTAGTTGAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTC 4559

 54664668 AGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTT 54664727
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 AGTTCCTCATCTGTAAAATGAGGATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTT 4619

 54664728 GAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCG 54664787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 GAACAGTGTAATAGAAAAGTGGTTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCG 4679

 54664788 TGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGG 54664847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TGAGGCTGCAGTAGAAATAATATTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGG 4739

 54664848 GTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACT 54664907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GTCTTATAAATTGTTAATACATTATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACT 4799

 54664908 TGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAAC 54664967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TGGATTGGTAAGTCTTTTGTTTTCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAAC 4859

 54664968 TGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATG 54665027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 TGATAATTTGTGAGAGTGGTCATCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATG 4919

 54665028 ACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGT 54665087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 ACCGTTTAATAGGCAAAAGACAACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGT 4979

 54665088 GTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATG 54665147
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 GTTGATCAATAGTAAACAACAATGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATG 5039

 54665148 TTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCAC 54665207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 TTACATTAAGTGTTTTTACCACAATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCAC 5099

 54665208 ATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGA 54665267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 ATAAAAATTATATTTCCTAGCACTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGA 5159

 54665268 ATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGG 54665327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 ATATTGATAGTGGAGGTGACTTCTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGG 5219

 54665328 CGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGA 54665387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 CGGGTGGTGTGGAGGGCTTCATTCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGA 5279

 54665388 ATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAA 54665447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 ATGAGGAGGACTTGAGAGGCCGTGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAA 5339

 54665448 TTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTT 54665507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 TTTCAGAAAACAAGGATGGACAAATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTT 5399

 54665508 GTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTG 54665567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GTAAACTTTGTTTACAAAACAAAAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTG 5459

 54665568 TTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACA 54665627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 TTTTAGAATCATAATTGAAGGCAGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACA 5519

 54665628 CAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCT 54665687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 CAAAATGTCAGGCCTTTGGAATCATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCT 5579

 54665688 ATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTC 54665747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 ATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTCTGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTC 5639

 54665748 CGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAAC 54665807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 CGCTTATCACTGGAGACAGAAACTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAAC 5699

 54665808 AAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGG 54665867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 AAAACAAAACAGAACAACACCACCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGG 5759

 54665868 TCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACT 54665927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 TCTAGAAGAAAGAACAAAGCCAGTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACT 5819

 54665928 GTTTCCGAGGTAGAATCTCT-AAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAAT 54665986
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 GTTTCCGAGGTAGAATCTCTTAAGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAAT 5879

 54665987 TTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGG 54666046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TTAGCACTGTAATTTTTACCTTGACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGG 5939

 54666047 AGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTAT 54666106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 AGAATATGAGGAAAAGAGGAGGAATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTAT 5999

 54666107 TTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCT 54666166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 TTTGGGGATTTTTTTTCTCCCATTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCT 6059

 54666167 CTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCA 54666226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CTTGCTGCTGACAATCTTTTCAAGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCA 6119

 54666227 ATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGC 54666286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 ATGTGTTCCTCCCTTCCAGTACTGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGC 6179

 54666287 TCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAA 54666346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 TCCTCTAAATCTGGTCTTCACCTTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAA 6239

 54666347 TCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGAC 54666406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6240 TCACACCTTGGTAAAGGGGGGTTCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGAC 6299

 54666407 CACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCC 54666466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 CACCAGCAGAAGGGAGAAGGAGCAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCC 6359

 54666467 TCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCT 54666526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 TCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGCAAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCT 6419

 54666527 CTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCA 54666586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 CTCCAAATTGGTTCTGAGGATTTCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCA 6479

 54666587 GTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCT 54666646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 GTCCTAGAGTTGGGAATGGAGCCTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCT 6539

 54666647 TTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGT 54666706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 TTTTGGTTTCCCTACATTCTGCCCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGT 6599

 54666707 CAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAA 54666766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 CAAATTGCTCAAATTGAGTGTAACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAA 6659

 54666767 TTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTA 54666826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 TTGGTACTAGAAATAGCTCCAGGAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTA 6719

 54666827 CTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATT 54666886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 CTCTCTTTGCCATAGGGAAGGGGGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATT 6779

 54666887 ATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGA 54666946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 ATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGA 6839

 54666947 GTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGT 54667006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 GTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGT 6899

 54667007 GGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAG 54667066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 GGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAG 6959

 54667067 ACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTA 54667126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 ACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTA 7019

 54667127 TTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACT 54667186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 TTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACT 7079

 54667187 GCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGG 54667246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 GCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGG 7139

 54667247 ACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACA 54667306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 ACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACA 7199

 54667307 AATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCC 54667366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 AATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCC 7259

 54667367 AGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAAT 54667426
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     7260 AGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAAT 7319

 54667427 ATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAG 54667486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 ATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAG 7379

 54667487 GATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGT 54667546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 GATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGT 7439

 54667547 CTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATG 54667606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 CTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATG 7499

 54667607 CCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGA 54667666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 CCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGA 7559

 54667667 TTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGA 54667726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 TTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGA 7619

 54667727 AAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAG 54667786
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 AAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAG 7679

 54667787 ATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAA 54667846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     7680 ATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAA 7739

 54667847 TAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCT 54667906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7740 TAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCT 7799

 54667907 AATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTC 54667966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 AATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTC 7859

 54667967 TGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTAT 54668026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 TGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTAT 7919

 54668027 CAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCT 54668086
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 CAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCT 7979

 54668087 ACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTT 54668146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 ACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTT 8039

 54668147 CAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGG 54668206
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     8040 CAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGG 8099

 54668207 CACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGA 54668266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 CACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGA 8159

 54668267 CAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGC 54668326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 CAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGC 8219

 54668327 CCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCT 54668386
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     8220 CCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCT 8279

 54668387 ATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAG 54668446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 ATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAG 8339

 54668447 CACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCC 54668506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 CACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCC 8399

 54668507 TCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGA 54668566
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     8400 TCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGA 8459

 54668567 CATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGA 54668626
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     8460 CATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGA 8519

 54668627 GCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTG 54668686
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 GCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTG 8579

 54668687 CTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTG 54668746
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     8580 CTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTG 8639

 54668747 AGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGC 54668806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8640 AGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGC 8699

 54668807 TAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCAT 54668866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8700 TAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCAT 8759

 54668867 AATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAA 54668926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8760 AATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAA 8819

 54668927 ACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     8820 ACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 8866

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8867 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 8926

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8927 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 8986

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8987 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 9046

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9047 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 9106

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9107 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 9166

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     9167 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 9226

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9227 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 9286

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9287 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 9346

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     9347 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 9406

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9407 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 9466

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9467 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 9526

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9527 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 9586

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9587 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 9646

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9647 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 9706

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9707 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 9766

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGG 54670488
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9767 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGG 9815

Alignment time is 7.24288 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4213] =>      4213 nucs 'mol-32-3403-136173_4213'

Score:        3861
Aligned:      4222        nucs
Identic:      4181 ( 99%) nucs =>       155 ( 99%)      4026 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54668818,54668973] EXCISED REGION [54669540,54673599]
 second seq =>  [       1,     156] EXCISED REGION [     157,    4213]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54668818 CCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACC 54668877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACC 60

 54668878 ATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGT 54668937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGT 120

 54668938 AACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      121 AACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 156

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 216

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 276

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 336

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 396

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 456

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      457 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 516

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 576

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 636

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      637 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 696

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 756

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 816

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 876

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 936

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 996

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 1056

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     1057 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 1116

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1117 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 1176

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1236

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     1237 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1294

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1354

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 CATCTTTC-TTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1413

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1473

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1474 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTCTGAGAGACCCAATCCT 1533

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1593

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1653

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1713

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1773

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1833

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1893

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1953

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACA--TACATAAAAACTATGTT 54671396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     1954 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATA--GGTACATAAAAACTATGTT 2011

 54671397 GAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 54671456
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 GAATCACTGACTATATTCTTTTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATG 2071

 54671457 TTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 54671516
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TTAAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAAT 2131

 54671517 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 54671576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 AGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATT 2191

 54671577 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 54671636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAA 2251

 54671637 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 54671696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2252 GTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAACCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTC 2311

 54671697 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTAC 54671756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2312 TGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATCAC 2371

 54671757 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 54671816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATA 2431

 54671817 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 54671876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2432 TATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGATATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTT 2491

 54671877 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTT 54671936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2492 GTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAATGCTATCTTTT 2551

 54671937 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 54671996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 CTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAAT 2611

 54671997 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGT 54672056
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
     2612 AAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCCTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAAGT 2671

 54672057 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCAT 54672116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2672 CAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACATCTATATAATGAAGCTTTCAT 2731

 54672117 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 54672176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 AAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGAC 2791

 54672177 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 54672236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTG 2851

 54672237 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 54672296
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 GACAGAACAGAAACGTCTGCACTCAGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAA 2911

 54672297 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 54672356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 TCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAA 2971

 54672357 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 54672416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 GCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTAT 3031

 54672417 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 54672476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 GGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGT 3091

 54672477 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 54672536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 AGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGT 3151

 54672537 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 54672596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 AGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGC 3211

 54672597 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTG 54672656
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3212 TCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTGTTCTGTGTTG 3271

 54672657 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 54672716
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3272 ATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACATGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTT 3331

 54672717 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 54672776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 AAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACA 3391

 54672777 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 54672836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 AGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCA 3451

 54672837 GGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACC 54672896
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3452 GGTGCGATGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACC 3511

 54672897 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAA 54672956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3512 TGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCATCTCTACTAA 3571

 54672957 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGA 54673016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3572 AAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAACCTGA 3631

 54673017 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 54673076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATT 3691

 54673077 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATAT 54673136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
     3692 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATTTTCCATAT 3751

 54673137 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 54673196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 TATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAAT 3811

 54673197 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 54673256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 ACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAA 3871

 54673257 TGTGAACAGATAAACTCT---GTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 54673313
          ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 TGTGAACAGATAAA----TTAGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAA 3927

 54673314 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 54673373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 CAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACG 3987

 54673374 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 54673433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 AATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTAT 4047

 54673434 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 54673493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGG 4107

 54673494 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTG 54673553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4108 AGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATATAGTGGTG 4167

 54673554 GGGGTTGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTAT 54673599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 GGGGTTGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTAT 4213

Alignment time is 3.0883 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6269] =>      6269 nucs 'mol-32-3403-152774_6269'

Score:        5983
Aligned:      6271        nucs
Identic:      6244 (100%) nucs =>      5106 (100%)      1138 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54663850,54668973] EXCISED REGION [54669540,54670684]
 second seq =>  [       1,    5125] EXCISED REGION [    5126,    6269]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54663850 ATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGG 54663909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAGGACTTAAGAAGAAATTACTTAGGCAGATAGTGAGGGTATGGGAGTCCTCAGTAAGG 60

 54663910 TTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTCAACAAAGAGCAGCCTG 54663969
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
       61 TTTTTGTTTTAATGAAAAGCAGCCCCAAAACCAATTTCTTTTTTAACAAAGAGCAGCCTG 120

 54663970 TAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCA 54664029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATATCAAGCTGCAGACATAGACAAGCAAGCTGGAAGCTTGCACAGAGGAATGTTGGCA 180

 54664030 GTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCT 54664089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGTGCCAATAGGAAAAAGCTACCTGGGACTAGGCATGTTCAAAATGGCGGTTCTATCT 240

 54664090 TCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAA 54664149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCCTTCTCTTTGCCAAACCACAGGTACAGTAAGAAGAAAATATGGCACCAGCCAGGCAA 300

 54664150 AGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTA 54664209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGACTCCATTTGCATAATAATATTAGGGTGGGGCAACCAGCCTTCTCCGTGTGCTATGTA 360

 54664210 AACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCA 54664269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACGTCACACCTGATCAAACCAATCTGTGGGCCCTAATTAAATCAGACACTGCCACCTCA 420

 54664270 AGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCC 54664329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCTGTCTATAAAATCTAGTGCAGTCTGCCATGGGCGGGATTCTCCTTTCAGAAGCCCC 480

 54664330 TCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCG 54664389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCTCTCATAAGGGAGAAAGCTGTTCTCCTTTCTCTTTCTTTTGCTTATTAAACCTCCG 540

 54664390 CTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCC 54664449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCCTAAACTTGTCATGTGTGTCTGTGTCCTAAATCTTCTTGGCAAGAGACAGTGAACCC 600

 54664450 CAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAA 54664509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGGTATTTACCCCAATGATACCACTTCACTTTTATCGATGGTTCTTAGAATTGTTTGAA 660

 54664510 AGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGCTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTAC 54664569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAATATGTAAGCTGAAATGAATTTCATGATGGTTCTTTGTGGTTCTGTGTCATGGTTAC 720

 54664570 AGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTT 54664629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCACAGACTTTGCAGGCAGAGACCTGAGTGTTACTCCAAGATGTGCCATTCACTAGTT 780

 54664630 GAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAG 54664689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAATAGGTTTTTGCATGTAATTCACCTCTCAGAGTTTCAGTTCCTCATCTGTAAAATGAG 840

 54664690 GATGTTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGG 54664749
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATATTAGAATTCTTCATCTAGAATCATAATGAGGCTTGAACAGTGTAATAGAAAAGTGG 900

 54664750 TTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATA 54664809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAGTCCAGTGCCTATCTGTAACAACTGCTAACAAGCGTGAGGCTGCAGTAGAAATAATA 960

 54664810 TTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACAT 54664869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGATATCAGGAGTAATAGTCACATGTCTCATTATTGGGTCTTATAAATTGTTAATACAT 1020

 54664870 TATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTT 54664929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTGGGTTTTAAAGCCAAATTTATTGTGGTCACAACTTGGATTGGTAAGTCTTTTGTTT 1080

 54664930 TCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCA 54664989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCCTTCCAGATAATGTTTTATTGCTTTAACATCTAACTGATAATTTGTGAGAGTGGTCA 1140

 54664990 TCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACA 54665049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCTATCAAATCCCTACCAGCATGGGACATCTGCCATGACCGTTTAATAGGCAAAAGACA 1200

 54665050 ACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAA 54665109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACATTGTTGTAATTTGTTGTTGTTTATGTTAACAGTGTTGATCAATAGTAAACAACAA 1260

 54665110 TGTATTATTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCAC 54665169
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTATTACTCATTTAAGCATTTATTAAGAGGGTGGATGTTACATTAAGTGTTTTTACCAC 1320

 54665170 AATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCA 54665229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATAAAAATTTTTTAAGTGTTAAATATTCTTTATGCACATAAAAATTATATTTCCTAGCA 1380

 54665230 CTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTT 54665289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTAAATCTGCCCAAATGCTTTGGTTAAGCTTTCATGGAATATTGATAGTGGAGGTGACTT 1440

 54665290 CTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCAT 54665349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGAAAGTAGGCTACTAATGTTTCCCTGAGAAGCATGGCGGGTGGTGTGGAGGGCTTCAT 1500

 54665350 TCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCG 54665409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTCAGTAGAGTAAGGAGCACACAGGAGGAGGTGTGGAATGAGGAGGACTTGAGAGGCCG 1560

 54665410 TGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACA 54665469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGATCTGTTTAATGTACCCCGGAAATATGTGGGTAGAATTTCAGAAAACAAGGATGGACA 1620

 54665470 AATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAA 54665529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATAGAGTGCAGGTTCTTTTTAAGCTATGGTAAGTTTTGTAAACTTTGTTTACAAAACAA 1680

 54665530 AAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGC 54665589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATTATTTAATCAATTAATTTGCATTATCAGATTTTGTTTTAGAATCATAATTGAAGGC 1740

 54665590 AGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAAT 54665649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTGAAGAGGACAAGTTGGAAAAAAGAAAGCTGAAACACAAAATGTCAGGCCTTTGGAAT 1800

 54665650 CATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTC 54665709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATCTAGAACAAGGTTGTCCAAGGCAGAGAATACAGCTATGCGTTCTTAGTTTCTGTTTC 1860

 54665710 TGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAA 54665769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGTTGGGCCAGTAAACCCCTTCCTCATCCATTTTTTCCGCTTATCACTGGAGACAGAAA 1920

 54665770 CTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCA 54665829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTAAAAACCATGGCTTCAGGCTGCTAACAGCCTAAAACAAAACAAAACAGAACAACACCA 1980

 54665830 CCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCA 54665889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAACAAAATAAGGGGAAGATAGGTTGGACAAGCTTGGTCTAGAAGAAAGAACAAAGCCA 2040

 54665890 GTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCT-A 54665948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2041 GTGGCTGAGGAGATGTGAAAAGAATGGAAGCAAGGACTGTTTCCGAGGTAGAATCTCTTA 2100

 54665949 AGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTT 54666008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTTTGTGAGCAATTGGATTTTAGTGCTAAGAGAAAATTTAGCACTGTAATTTTTACCTT 2160

 54666009 GACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGG 54666068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GACCAAACAAAATGGGAATTTTCACCCTAACGACTTGGAGAATATGAGGAAAAGAGGAGG 2220

 54666069 AATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCA 54666128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATACATGCACACACATGCATACACACATACCCTTTATTTTGGGGATTTTTTTTCTCCCA 2280

 54666129 TTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCA 54666188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTTCAAACTGTCTCCCTTCTCATTTTAACAATCTCTCTTGCTGCTGACAATCTTTTCA 2340

 54666189 AGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTAC 54666248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCAGTGCTCTGTGTCTGAATTTTTTTTCTTCTCCCCAATGTGTTCCTCCCTTCCAGTAC 2400

 54666249 TGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACC 54666308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGAAACATAGCTTCTGGGCTGAATGTCTTACTTTTGCTCCTCTAAATCTGGTCTTCACC 2460

 54666309 TTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGT 54666368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTCGTCATCCTGTTGTGTGTCCCTGAAGGCTGATCAATCACACCTTGGTAAAGGGGGGT 2520

 54666369 TCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCGATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAG 54666428
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCTTGCCCCATCTTGCAGTTAGGCTGCCAATAAGGACCACCAGCAGAAGGGAGAAGGAG 2580

 54666429 CAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGC 54666488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGAAAGGAAGAGGGGTTGGTTTTCCAGGCTCCAGCCCTCTCTGCAGGAGAGTTGCTGGC 2640

 54666489 AAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATT 54666548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGGGCCCCAACCACCACACAAAGCTCTCTCTCCATCTCTCCAAATTGGTTCTGAGGATT 2700

 54666549 TCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGC 54666608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCGGGACGCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTGGCTTATTCAGTCCTAGAGTTGGGAATGGAGC 2760

 54666609 CTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGC 54666668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTCCCCCACTACTAAATCAGGGGTGCTGTACACTTCTTTTTGGTTTCCCTACATTCTGC 2820

 54666669 CCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTA 54666728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCACATCTATGTAAATAGTGCCTTGATTAAACTGTTGTCAAATTGCTCAAATTGAGTGTA 2880

 54666729 ACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAG 54666788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACATCTGTTTCCTGCTGGGATGTTAACTGATACAGAAATTGGTACTAGAAATAGCTCCAG 2940

 54666789 GAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGG 54666848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAAACAGCCCCTCAACATGGGATTCTAGGATTGAGTTACTCTCTTTGCCATAGGGAAGGG 3000

 54666849 GGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGA 54666908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGACATGAGTAACCAACTGCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGA 3060

 54666909 ATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCT 54666968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATAAAGGGCAAGTAGAGGGCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCT 3120

 54666969 ATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGC 54667028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATAGTGAGAATATGGATTGCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGC 3180

 54667029 AGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGAC 54667088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTGGTTCTCAACTGGTGGCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGAC 3240

 54667089 GTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATAC 54667148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATAC 3300

 54667149 CAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGT 54667208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGT 3360

 54667209 CAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAA 54667268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAA 3420

 54667269 ATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCT 54667328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCT 3480

 54667329 CCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGC 54667388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3481 CCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGC 3540

 54667389 AGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGC 54667448
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGC 3600

 54667449 ATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTT 54667508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTT 3660

 54667509 CTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAG 54667568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAG 3720

 54667569 AAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACC 54667628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACC 3780

 54667629 CTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAG 54667688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAG 3840

 54667689 AAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAA 54667748
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3841 AAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAA 3900

 54667749 CTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAA 54667808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAA 3960

 54667809 GGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCA 54667868
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCA 4020

 54667869 GGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTT 54667928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTT 4080

 54667929 GGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAAC 54667988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAAC 4140

 54667989 TACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGC 54668048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4141 TACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGC 4200

 54668049 TAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTT 54668108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTT 4260

 54668109 CAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTC 54668168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTC 4320

 54668169 ACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTG 54668228
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACCTTCCAGACCAATCAAATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTG 4380

 54668229 AAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCC 54668288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCC 4440

 54668289 AAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAG 54668348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4441 AAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAG 4500

 54668349 TCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTG 54668408
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTG 4560

 54668409 ATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTG 54668468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTG 4620

 54668469 CCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATC 54668528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATC 4680

 54668529 TGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCC 54668588
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCC 4740

 54668589 TGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCA 54668648
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4741 TGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCA 4800

 54668649 CAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACAC 54668708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACAC 4860

 54668709 GGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTT 54668768
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GGTAAAGATAATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTT 4920

 54668769 CTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATG 54668828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATG 4980

 54668829 CTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGA 54668888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGA 5040

 54668889 GAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACA 54668948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACA 5100

 54668949 TCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 54668973
          |||.|||||||||||||||||||||
     5101 TCCCTGTTCACCTCGCCTGCTTGCC 5125

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 5185

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 5245

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 5305

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 5365

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 5425

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5426 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 5485

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 5545

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 5605

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5606 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 5665

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 5725

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 5785

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 5845

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 5905

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 5965

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 6025

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     6026 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 6085

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6086 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 6145

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 6205

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     6206 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGC--TGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 6263

 54670679 TCTAAA 54670684
          ||||||
     6264 TCTAAA 6269

Alignment time is 4.57764 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3199] =>      3199 nucs 'mol-32-340e-025478_3199'

Score:        2990
Aligned:      3199        nucs
Identic:      3180 ( 99%) nucs =>      2094 ( 99%)      1086 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54666867,54668973] EXCISED REGION [54669540,54670630]
 second seq =>  [       1,    2107] EXCISED REGION [    2108,    3199]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       566 nucs [54668974,54669539]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54668974,54668974] to [54669539,54669539]
 second seq =>         0 nucs

 54666867 GCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGG 54666926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATGTGGGAGATCATGATTATTCAAATTAAAGTGGAAGAGAATAAAGGGCAAGTAGAGG 60

 54666927 GCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATT 54666986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAAGTTGTTAGAAAATCGAGTTGCTGTAGCAATTAGTCCCTATAGTGAGAATATGGATT 120

 54666987 GCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTG 54667046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAAGATCATGGCATTATGTGGATTTCTGATAGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACTGGTG 180

 54667047 GCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAAC 54667106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAATTTGGCCCTCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAAC 240

 54667107 TTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACA 54667166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGGGATGGAAGGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACA 300

 54667167 CCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGA 54667226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCTACAATGTACAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGA 360

 54667227 GAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGA 54667286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAACTGTGCCCTAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGA 420

 54667287 AATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAG 54667346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCAAGAGTCTCTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAG 480

 54667347 GTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCT 54667406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      481 GTGGGATGAAAGACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGGACTGCAGAGGAATACTTAGCCCT 540

 54667407 CACAGGCCTCGCACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATA 54667466
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACAGGCCTCACACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATA 600

 54667467 GACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTT 54667526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACCCAGAAGACAGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTT 660

 54667527 CCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAAC 54667586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCCATGAGAAGGAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAAC 720

 54667587 CATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACA 54667646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTACGCCACAAGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACA 780

 54667647 GGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCT 54667706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCCCATAGTTAAAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCT 840

 54667707 GGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTG 54667766
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      841 GGAAAAGGATATCTATCAGAAAATGTCTACTATCACGTCAAACTCTATCGGCAGGGCCTG 900

 54667767 GGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAG 54667826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGAGAATGTGAGAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAG 960

 54667827 TCTGAGCAGGTCATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTG 54667886
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTGAGCAGGACATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTG 1020

 54667887 CTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAA 54667946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGCATCCAGCTCTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAA 1080

 54667947 CTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGG 54668006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCAACAGTGGTTTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGG 1140

 54668007 CAGAGATTCTCTGGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTA 54668066
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGAGATTCTCTGGTCCTATCAGGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTA 1200

 54668067 CTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCA 54668126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCTGCTACTAGTCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCA 1260

 54668127 GAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAA 54668186
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1261 GAGGCACTTGGGGGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATCAA 1320

 54668187 ATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTC 54668246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCAGAATCTCTGGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTC 1380

 54668247 TACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTG 54668306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACTTGGCACACAAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTG 1440

 54668307 TTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCC 54668366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGGTTCTTTGGAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTCAGGAGTCTATCACGAATCCCCCC 1500

 54668367 ATGATGTCACAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGA 54668426
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGATGTCCCAAAGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGA 1560

 54668427 CATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGA 54668486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATTCCAGGGTGCTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGA 1620

 54668487 GTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTC 54668546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTCTTTATTAAACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTC 1680

 54668547 CCCATCTATGCCCCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATG 54668606
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCATCTATGCCCTTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATG 1740

 54668607 AAGTTGAGGTGATAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGAC 54668666
          |||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGTTCAGGTGATAGATGGAGCCATGACCTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGAC 1800

 54668667 TGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTC 54668726
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1801 TGGGGGTTCAACCTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATAATAGACTC 1860

 54668727 TTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGAC 54668786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGAC 1920

 54668787 ACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCC 54668846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCC 1980

 54668847 TCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATG 54668906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATG 2040

 54668907 TTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCT 54668966
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2041 TTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCCTGTTCACCTCGCCT 2100

 54668967 GCTTGCC 54668973
          |||||||
     2101 GCTTGCC 2107

EXCISED REGION

 54669540 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 54669599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 GGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATG 2167

 54669600 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 54669659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 CCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAG 2227

 54669660 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 54669719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 ACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCT 2287

 54669720 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 54669779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 ACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCC 2347

 54669780 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 54669839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAG 2407

 54669840 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGA 54669899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2408 CTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCGGCTAGATGCAGACTAGCAGA 2467

 54669900 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 54669959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 GCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCA 2527

 54669960 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 54670019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTAC 2587

 54670020 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACA 54670079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2588 CACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATGTCAACA 2647

 54670080 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 54670139
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 TCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGAGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATG 2707

 54670140 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 54670199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 GGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGAT 2767

 54670200 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 54670259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 GAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAA 2827

 54670260 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 54670319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAAT 2887

 54670320 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 54670379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 AAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACT 2947

 54670380 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 54670439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 GGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTT 3007

 54670440 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA- 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| 
     3008 CGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGCGCTTCCTCAC 3067

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3068 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAACAAGTCTCTTTA 3127

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 3187

 54670619 TGATACAGTTTC 54670630
          ||||||||||||
     3188 TGATACAGTTTC 3199

Alignment time is 2.35106 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4002] =>      4002 nucs 'mol-32-3492-011772_4002'

Score:        4001
Aligned:      4001        nucs
Identic:      4001 (100%) nucs =>      1090 (100%)      2911 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669409,54670498] EXCISED REGION [54670499,54673409]
 second seq =>  [       1,    1090] EXCISED REGION [    1092,    4002]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1091,1091]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [1091,1096] to [1092,1097]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54669409 GCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCT 54669468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCT 60

 54669469 GTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACT 54669528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACT 120

 54669529 AATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCA 54669588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCA 180

 54669589 GAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATT 54669648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATT 240

 54669649 TAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACA 54669708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACA 300

 54669709 GAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAAC 54669768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAAC 360

 54669769 CAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACC 54669828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACC 420

 54669829 TCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGC 54669888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGC 480

 54669889 AGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGC 54669948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGC 540

 54669949 AGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTC 54670008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTC 600

 54670009 TGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATG 54670068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATG 660

 54670069 TCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATG 54670128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATG 720

 54670129 TTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGG 54670188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGG 780

 54670189 TACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGG 54670248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGG 840

 54670249 AGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAG 54670308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAG 900

 54670309 GAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATG 54670368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATG 960

 54670369 GACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCT 54670428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCT 1020

 54670429 AGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGG 54670488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGG 1080

 54670489 TGCTTCCTCA 54670498
          ||||||||||
     1081 TGCTTCCTCA 1090

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 1151

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1211

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1271

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 1331

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 1391

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 1451

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 1511

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 1571

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 1631

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 1691

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 1751

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 1811

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 1871

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 1931

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 1991

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 2051

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 2111

 54671519 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 54671578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 2171

 54671579 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 54671638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 2231

 54671639 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 54671698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 2291

 54671699 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 54671758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 2351

 54671759 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 54671818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 2411

 54671819 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 54671878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 2471

 54671879 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 54671938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 2531

 54671939 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 54671998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 2591

 54671999 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 54672058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 2651

 54672059 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 54672118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 2711

 54672119 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 54672178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 2771

 54672179 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 54672238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 2831

 54672239 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 54672298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 2891

 54672299 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 54672358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 2951

 54672359 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 54672418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 3011

 54672419 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 54672478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 3071

 54672479 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 54672538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 3131

 54672539 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 54672598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 3191

 54672599 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 54672658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 3251

 54672659 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 54672718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 3311

 54672719 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 54672778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 3371

 54672779 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 54672838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 3431

 54672839 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 54672898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 3491

 54672899 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 54672958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 3551

 54672959 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 54673018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 3611

 54673019 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 54673078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 3671

 54673079 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 54673138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 3731

 54673139 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 54673198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 3791

 54673199 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 54673258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 3851

 54673259 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 54673318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 3911

 54673319 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 54673378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 3971

 54673379 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAA 54673409
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAA 4002

Alignment time is 2.92669 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5032] =>      5032 nucs 'mol-32-3492-017548_5032'

Score:        5031
Aligned:      5031        nucs
Identic:      5031 (100%) nucs =>      1785 (100%)      3246 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54668714,54670498] EXCISED REGION [54670499,54673744]
 second seq =>  [       1,    1785] EXCISED REGION [    1787,    5032]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1786,1786]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [1786,1791] to [1787,1792]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54668714 AGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGT 54668773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATGATAGACTCTTTAATAGACTCAACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGT 60

 54668774 CAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCC 54668833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATAAATTAGACACCAATCCAGTAGAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCC 120

 54668834 CTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATT 54668893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCGTCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATT 180

 54668894 TAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTT 54668953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAATGTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTT 240

 54668954 GTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGC 54669013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTACAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGC 300

 54669014 AGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTC 54669073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTGGTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTC 360

 54669074 CCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCT 54669133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTACCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCT 420

 54669134 CGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGT 54669193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTTCACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGT 480

 54669194 CTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCAT 54669253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAATGCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCAT 540

 54669254 CTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATG 54669313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTACATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATG 600

 54669314 TGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCA 54669373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTCAGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCA 660

 54669374 GTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACA 54669433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGCATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACA 720

 54669434 GTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGA 54669493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGA 780

 54669494 ATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGA 54669553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGA 840

 54669554 TTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTAT 54669613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTAT 900

 54669614 GTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCC 54669673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCC 960

 54669674 ATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCA 54669733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCA 1020

 54669734 GATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAA 54669793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAA 1080

 54669794 CTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGT 54669853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGT 1140

 54669854 GGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATA 54669913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACCTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATA 1200

 54669914 CAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGC 54669973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAGTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGC 1260

 54669974 TCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGT 54670033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGCTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGT 1320

 54670034 TGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGA 54670093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGGCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGA 1380

 54670094 TATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGG 54670153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGGGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGG 1440

 54670154 ATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACT 54670213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAGGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACT 1500

 54670214 GGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCC 54670273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGTGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCC 1560

 54670274 GTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGA 54670333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTGTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGA 1620

 54670334 TGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGG 54670393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCAGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGG 1680

 54670394 TGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCC 54670453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGATGGGTGCCCAACACACAGCTTGCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCC 1740

 54670454 TTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA 54670498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTCCAGAGCACGGTGCTTCCTCA 1785

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 1846

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 1906

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 1966

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 2026

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 2086

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 2146

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 2206

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 2266

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 2326

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 2386

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 2446

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 2506

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 2566

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 2626

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 2686

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 2746

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 2806

 54671519 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 54671578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 2866

 54671579 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 54671638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 2926

 54671639 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 54671698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 2986

 54671699 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 54671758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 3046

 54671759 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 54671818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 3106

 54671819 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 54671878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 3166

 54671879 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 54671938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 3226

 54671939 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 54671998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 3286

 54671999 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 54672058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 3346

 54672059 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 54672118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 3406

 54672119 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 54672178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 3466

 54672179 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 54672238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 3526

 54672239 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 54672298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 3586

 54672299 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 54672358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 3646

 54672359 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 54672418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 3706

 54672419 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 54672478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 3766

 54672479 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 54672538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 3826

 54672539 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 54672598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 3886

 54672599 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 54672658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 3946

 54672659 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 54672718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 4006

 54672719 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 54672778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 4066

 54672779 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 54672838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 4126

 54672839 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 54672898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 4186

 54672899 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 54672958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 4246

 54672959 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 54673018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 4306

 54673019 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 54673078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 4366

 54673079 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 54673138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 4426

 54673139 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 54673198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 4486

 54673199 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 54673258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 4546

 54673259 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 54673318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 4606

 54673319 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 54673378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 4666

 54673379 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCC 54673438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCC 4726

 54673439 TGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAG 54673498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 TGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAG 4786

 54673499 CTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGT 54673558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 CTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGT 4846

 54673559 TGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTT 54673618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 TGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTT 4906

 54673619 TAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACAAATAT 54673678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 TAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACAAATAT 4966

 54673679 ATATATTGAGGAGTATGTTTATATCTCAAATCCATCTTCCCAATCCTATTTTAGAATATT 54673738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 ATATATTGAGGAGTATGTTTATATCTCAAATCCATCTTCCCAATCCTATTTTAGAATATT 5026

 54673739 TTAGAA 54673744
          ||||||
     5027 TTAGAA 5032

Alignment time is 3.71882 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4147] =>      4147 nucs 'mol-32-34c9-042105_4147'

Score:        4113
Aligned:      4146        nucs
Identic:      4143 (100%) nucs =>       456 (100%)      3687 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54669421,54669876] EXCISED REGION [54669878,54673566]
 second seq =>  [       1,     456] EXCISED REGION [     458,    4147]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [54669877,54669877]
 second seq =>         1 nucs [457,457]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1079,1079]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [54669877,54669877] to [54669878,54669878]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54669421 CTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATG 54669480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAATGAGTGGTGCTGTATCACCTATG 60

 54669481 GTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTG 54669540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTTCCTGGTTACTAATAGAAGTCTG 120

 54669541 GACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGC 54669600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGCATTAGATTCAGAGGTTTTATGC 180

 54669601 CCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGA 54669660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGATTCGACAATTTAGAAGCAGAGA 240

 54669661 CTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTA 54669720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAACCAGCAAACAGAGAAAGGGCTA 300

 54669721 CTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCT 54669780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATGACACCAGAACCAGGAGATTCCT 360

 54669781 TGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGC 54669840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAACACTCTTGACCTCATGGCACAGC 420

 54669841 TACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGA 54669876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGA 456

EXCISED REGION

 54669878 CTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACA 54669937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 CTGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACA 517

 54669938 GTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTG 54669997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 GTGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTG 577

 54669998 CTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAG 54670057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      578 CTTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCAGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAG 637

 54670058 GCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTG 54670117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 GCAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTG 697

 54670118 GGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGA 54670177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 GGTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGA 757

 54670178 GGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTG 54670237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 GGAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTG 817

 54670238 TGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGT 54670297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 TGTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGT 877

 54670298 GTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTC 54670357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 GTAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTC 937

 54670358 AGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTT 54670417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 AGGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTT 997

 54670418 GCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCT 54670477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 GCATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCT 1057

 54670478 CCAGAGCACGGTGCTTCCTCA-CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCAC 54670536
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 CCAGAGCACGGTGCTTCCTCACCCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCAC 1117

 54670537 ACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCAT 54670596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 ACATTTGTAATAAGTCTCTTTATTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCAT 1177

 54670597 CTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGT 54670656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 CTGTTTTTGCCAGGACCCTGACTGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGT 1237

 54670657 TTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGT 54670716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 TTTTTTTTCTTTCTATGCTATATCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGT 1297

 54670717 TTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAAT 54670776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 TTGTAAAAAGAAAATCAAAATGCATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAAT 1357

 54670777 TCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATT 54670836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 TCTAAAGAGCCATGATTTTGGATTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATT 1417

 54670837 TGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAAC 54670896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 TGGAATTGTGTGCCCTAGAATCAAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAAC 1477

 54670897 CAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAAT 54670956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 CAGGTTTGAGAGACCCAATCCTCTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAAT 1537

 54670957 TGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACA 54671016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 TGTAGAAGGAAAGTATAGAAACATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACA 1597

 54671017 AACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCA 54671076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 AACAATATTTAAGCCATTCATTTGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCA 1657

 54671077 GAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACT 54671136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 GAACTATAGTTCTCTCAGCATGCTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACT 1717

 54671137 CTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAAC 54671196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 CTTAGTACACTGAGTCAGAATTTCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAAC 1777

 54671197 ACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCT 54671256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 ACATTTTATTCCTCTTCAAACACATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCT 1837

 54671257 CAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACT 54671316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CAGGATGGAAGTTATAAAATAAGTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACT 1897

 54671317 AAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTAT 54671376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AAAATTATTTCTTCTTTTTTCAGGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTAT 1957

 54671377 ACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCT 54671436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 ACATACATAAAAACTATGTTGAATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCT 2017

 54671437 GTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCC 54671496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 GTTTTTCAATTATCTCAATGTTCAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCC 2077

 54671497 CCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCC 54671556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CCAACATTCAAGACGACAATAGGCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCC 2137

 54671557 TAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTA 54671616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TAGGTCAACTCAGAAGTATTGGAGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTA 2197

 54671617 TGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATG 54671676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGTAGCAAGATGACCTTGAAGTTCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATG 2257

 54671677 TGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACT 54671736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TGAGTATCAGTGCTTTCTTCTGACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACT 2317

 54671737 TGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATC 54671796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TGTGAAAAGTTAAAAATTACCAAAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATC 2377

 54671797 CTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGT 54671856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 CTATGTTATGAGATTTTATATATAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGT 2437

 54671857 GAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAA 54671916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 GAAATATGTATTTGGTCTTTGTCCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAA 2497

 54671917 TCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGT 54671976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TCTTCAAAGTGCTATCTTTTCTATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGT 2557

 54671977 CATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGG 54672036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 CATCAGAAAAAGGTATGAATAAAGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGG 2617

 54672037 AGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACAC 54672096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 AGAAGAGAGGAGATGAAGGTCAAATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACAC 2677

 54672097 CTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAG 54672156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 CTATATAATGAAGCTTTCATAAAACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAG 2737

 54672157 CTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTG 54672216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 CTGAGCACATGGAGACTGACAGGAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTG 2797

 54672217 GCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACC 54672276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 GCCCTCCGGGACTCCACCTGGACAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACC 2857

 54672277 TCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAA 54672336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TCACTCTGTGTATCCCTTAATCAGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAA 2917

 54672337 TAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAAT 54672396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 TAAACTGATAAACATAATAAGCATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAAT 2977

 54672397 CCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGA 54672456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 CCAACCAAAGAGGAGGTTATGGGAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGA 3037

 54672457 GGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGG 54672516
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3038 GGTCTGGACTTGGAACTGGTAGGAAAGAGGTCTTGCGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGG 3097

 54672517 ATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATG 54672576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 ATCTGAGGCTATGTCCAGGTAGACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATG 3157

 54672577 TCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGT 54672636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 TCTGCTACAGAACTGATTGCTCCCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGT 3217

 54672637 CACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAA 54672696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 CACAGAAGTCTTCTGTGTTGATCGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAA 3277

 54672697 GGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATC 54672756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 GGATTTTTCAAAACAATTTTAAATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATC 3337

 54672757 TCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGT 54672816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 TCCTTTATGAAGAAACCACAAGGCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGT 3397

 54672817 AAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 54672876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 AAAAGAAAATTTCCAGGCCAGGTGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 3457

 54672877 GCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGA 54672936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 GCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGA 3517

 54672937 AACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATT 54672996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 AACCCCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATT 3577

 54672997 CCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAG 54673056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 CCATCTACTCGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAG 3637

 54673057 TGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAA 54673116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 TGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAA 3697

 54673117 AAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTT 54673176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 AAAAAAAAAAATTTCCATATTATAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTT 3757

 54673177 TGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTAC 54673236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 TGAGGAGAGTTTATTTTAATACCAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTAC 3817

 54673237 AAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCA 54673296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 AAGTTAAACTCACTTACAAATGTGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCA 3877

 54673297 GCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTT 54673356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 GCAATGAATGAGAAAAACAAATAAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTT 3937

 54673357 ATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAA 54673416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 ATCCAATAACATGCACGAATCTCAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAA 3997

 54673417 AAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGT 54673476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 AAGGCTACATATTTTATTATCCTGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGT 4057

 54673477 TTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATAT 54673536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 TTGTCTGGAGATGCGGGAGAAGCTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATAT 4117

 54673537 ATTGATATGTAGTGGTGGGGGTTGCACAGC 54673566
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 ATTGATATGTAGTGGTGGGGGTTGCACAGC 4147

Alignment time is 3.06871 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [54658973,54679539] =>     20567 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6643] =>      6643 nucs 'mol-32-34c9-164840_6643'

Score:        6642
Aligned:      6642        nucs
Identic:      6642 (100%) nucs =>      3440 (100%)      3202 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [54667059,54670498] EXCISED REGION [54670499,54673700]
 second seq =>  [       1,    3440] EXCISED REGION [    3442,    6643]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3441,3441]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [3441,3446] to [3442,3447]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 54667059 TCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAA 54667118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCAGGAGACTTTTGGCAATGTCTGAAGACGTTTTTGATGGTCATAACTTGGGGATGGAA 60

 54667119 GGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTA 54667178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTTACTATTGGCATCTAGTGGATAGATACCAGGGATACAGTTAAACACCCTACAATGTA 120

 54667179 CAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCC 54667238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAACCACTGCAGTTATCCAACCCAAAATGTCAACAGTGATGAAGTTGAGAAACTGTGCCC 180

 54667239 TAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCT 54667298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAGGTGGACTGGAAAGCAGTGAATATCAAATTAAGAACATGTGTAGAAATCAAGAGTCT 240

 54667299 CTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAG 54667358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCAACAAATTTGAAAGATCTCCTTATCTCCTGGAGTCAGGGGGCAGGTGGGATGAAAG 300

 54667359 ACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGC 54667418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCAAGCCAGGCATCTGATCACAGAACTGCAGAGGAATACTTAGCCCTCACAGGCCTCGC 360

 54667419 ACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGAC 54667478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACACCAATATCAGTGTCCTGCTACAGAGGCATGGGCCCATAGACAATAGACCCAGAAGAC 420

 54667479 AGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAG 54667538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGCTCAGGATGTAGAACTCCCACATCTTTCTGAGAGCCCCTTAACTTCCCCATGAGAAG 480

 54667539 GAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACA 54667598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGCCAGTCTTCCTTTGCATAAAACCTTAGAAATGTCTTTACCTAAACCATTACGCCACA 540

 54667599 AGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTA 54667658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCTGATGCCAGTTTTCCTCAGAACACACCCTCTCCTCCATGCCTACAGGCCCATAGTTA 600

 54667659 AAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATAT 54667718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGTTAGATTCCAGTACAGCCAGGACAAAGAAGTACCAGGGCTTCTCTGGAAAAGGATAT 660

 54667719 CTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGA 54667778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTATCAGAAAATGTCTACTATCACGCCAAACTCTATCGGCAGGGCCTGGGGAGAATGTGA 720

 54667779 GAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTC 54667838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAGTAGATTGCAGGGTGCATCAGACCAAGGAGACTTAGGCATGAAGTCTGAGCAGGTC 780

 54667839 ATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCT 54667898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGTCAATAAAATCTCTGCACTCACTTCAGGCTTTGTATTTAATGTGCTGCATCCAGCT 840

 54667899 CTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGT 54667958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGGGCTAATGTAGATCATCCGCTAGGTTGGCTAACTGAAGCTGAAACTCAACAGTGGT 900

 54667959 TTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCT 54668018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTACAGTCTGTGAAGTGCAAATCCTGCAACTACCCTGGCATGTTCTGGCAGAGATTCTCT 960

 54668019 GGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAG 54668078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTCCTATCAAGGTCATCTGGGGAACTTGCTAAAAATACAAAAAGCTACTCTGCTACTAG 1020

 54668079 TCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGG 54668138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTCTCTACTATTCTAGAGCAGTGGCTTTCAAACTCCAGTCACATCAGAGGCACTTGGG 1080

 54668139 GGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCT 54668198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAGCCTTCAGAATTCACAAAGCTTAGGTCACCTTCCAGACCAATGAAATCAGAATCTCT 1140

 54668199 GGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACAC 54668258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGGGTGGCACCAAGCACCAGTGCTTTTTGAAGCTTCCCAGATGATTCTACTTGGCACAC 1200

 54668259 AAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTG 54668318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGATTGACAATCACCAGAGGAAGGAGTCCAAAGGTCCAGAGGAAGTGTTGGGTTCTTTG 1260

 54668319 GAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAA 54668378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAGCGGCCCCTGCAATGTGAATTTAGGAGTCTATCACGAATCCCCCCATGATGTCACAA 1320

 54668379 AGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTG 54668438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGAGTCTATCGACATTAATCAGTATACTGATGCAGTGAGAACAAGGACATTCCAGGGTG 1380

 54668439 CTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTA 54668498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTCAGAGCACTGTGACCCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAAAGAGTCTCTTTATTA 1440

 54668499 AACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCC 54668558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACTGTCCTCAAATTAGACTAGCTCTGATCTGACTCTGACTCTAGCTCCCCATCTATGCC 1500

 54668559 CCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGA 54668618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTGGAGACATAGATAGTTGCTGTGTCCCCTGGCCAAAGTGGCACATGAAGTTGAGGTGA 1560

 54668619 TAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAAC 54668678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGATGGAGCCATGAACTGTGTCCTTCCCACAATGGAGCTAGAAGGACTGGGGGTTCAAC 1620

 54668679 CTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTC 54668738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGCGGTGCTGCGCCAGTCCCTGAAAACACGGTAAAGATGATAGACTCTTTAATAGACTC 1680

 54668739 AACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTA 54668798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTGCTGAGAGAATTTCCTTGTTTCTTTTCTGGTCAATAAATTAGACACCAATCCAGTA 1740

 54668799 GAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCG 54668858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAAAGGCTAGATGGAAGCCCCTGGAAATGCTTCCCTTCCCACTGGCCTCACCAAGACCG 1800

 54668859 TCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAAT 54668918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAACCATAATAAAATACCATTTCTGTAGAGAATTTAAAAGCTAAATGTTCCCACTGAAT 1860

 54668919 GTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTA 54668978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTAAAAACTGCTTGAGTAACCTATCACATCCTTGTTCACCTCGCCTGCTTGCCTAGTA 1920

 54668979 CAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTG 54669038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAAAGGGACATGGGTCCTGGACTCCCTCACCAGCAGTCATGTGGCTGACCCCTACTGTG 1980

 54669039 GTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTA 54669098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGTGTGCAATTGACCAACCACAGAGTGTGACTTCCCACATGAGGGCGACCAGCCTGCTA 2040

 54669099 CCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTT 54669158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGATGGCAAGTTGTTATCTTGGACTCCTTTCCTCGGAGAGAGATTACTGACTTCTCTT 2100

 54669159 CACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAAT 54669218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACAGGGACAGACACACCGTTGGTAGAAATTGGGTCTCCATTGCCTCTGCTTCTGCCAAT 2160

 54669219 GCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTAC 54669278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCACATTCACAGTCCTGTGGAATGTCTCATCCATCTTTGTGTGGTCCTGCCCGTACTAC 2220

 54669279 ATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTC 54669338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATCTGTTCCAGAAGCTCGTTTTCTGGTGAAGGATGTGTGGCAATGCAATTCAGTGTTCTC 2280

 54669339 AGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGC 54669398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGCACCTGCTCTTTATCCCAGATGCTGAAAGTTCAGTTATTATAGCAGCTGGGAGACAGC 2340

 54669399 ATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAAT 54669458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTCTGCCAAGCTGGGTACCATCTTACAGGACACAGTGGATCCCTTAACTAGGGGCTAAT 2400

 54669459 GAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTT 54669518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGTGGTGCTGTATCACCTATGGTCAGACTCAAGAATCAGGGCATGGAGGTAGAAGTGTT 2460

 54669519 CCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGC 54669578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTGGTTACTAATAGAAGTCTGGACAAATGTTTGATTTGAGTCCCTAGAATCTCAGCCGC 2520

 54669579 ATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGA 54669638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTAGATTCAGAGGTTTTATGCCCAAGCAAACTATGTTTCACCAAGAAACATAGTCATGA 2580

 54669639 TTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAA 54669698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCGACAATTTAGAAGCAGAGACTTTTTCTGGGCCATTTTGGACCCTTCATATCACCAAA 2640

 54669699 CCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATG 54669758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCAGCAAACAGAGAAAGGGCTACTCTCTCTTATCAGATATGAGAGCAAGGAGGACCAATG 2700

 54669759 ACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAAC 54669818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACACCAGAACCAGGAGATTCCTTGTCACTAGAGAACTACGGCCATTGGTGAAGATAGAAC 2760

 54669819 ACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACC 54669878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACTCTTGACCTCATGGCACAGCTACGTGAAGATGTGGGTCGTCTCTCCAGGCAAAGGACC 2820

 54669879 TGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAG 54669938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGCTAGATGCAGACTAGCAGAGCATAACGAGAATACAGAAAGGCTGGAGTAAGACGACAG 2880

 54669939 TGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGC 54669998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGATGAGTGCAGCAGAGGCCATGTGGCGAGCCAGCTCTGACGCACAGTACTCTCCCTTGC 2940

 54669999 TTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGG 54670058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTCATTCTCTGCTGCCTTACCACAGGCCCCTGGTTGCAGCTAATATTTCAGGCTTCAGG 3000

 54670059 CAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGG 54670118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGGAGTATGTCATATCAACATCTCCCCATGATGATATGCTAGCTGCGGGGATTTTCTGG 3060

 54670119 GTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAG 54670178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTTCCCTATGTTGAGGACATGGGCTTCTTACCTGGATGAAGGACAGCAGTGAAGGCTGAG 3120

 54670179 GAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGT 54670238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAACCAGTGGTACAGACTGATGAGTACTGTACACTGGCCCCTTAGATCCACAGATGCTGT 3180

 54670239 GTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTG 54670298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTGCCCTGGGAGCGCCATCAATGAGAACAGAGCCCGTGGGCTCTGGCTTCCGGTTTAGTG 3240

 54670299 TAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCA 54670358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAGACCATAGGAAGCCCTAATAAGAAATGGAAGGATGGTGAGGGGTGGAGAGTGAGGTCA 3300

 54670359 GGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTG 54670418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGGTCCTATGGACTAGCAACTGGCTTCCACAGAGGTGATGGGTGCCCAACACACAGCTTG 3360

 54670419 CATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTC 54670478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CATCTTCTCTAGATCCTGGTTCGCTGCTTCGGCCCTTTGCCCATCAGGCCCGGGGTGCTC 3420

 54670479 CAGAGCACGGTGCTTCCTCA 54670498
          ||||||||||||||||||||
     3421 CAGAGCACGGTGCTTCCTCA 3440

EXCISED REGION

 54670499 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 54670558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 CCCCCCTCCCCACACACGCCTCCCTGTGCTCTGCCCACACATTTGTAATAAGTCTCTTTA 3501

 54670559 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 54670618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 TTAAACTCTCCTCAAATTACCCAATTTAAGTGTGCCATCTGTTTTTGCCAGGACCCTGAC 3561

 54670619 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 54670678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TGATACAGTTTCTCTTTTAATGAGTTTTTTTGCTATGTTTTTTTTTCTTTCTATGCTATA 3621

 54670679 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 54670738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 TCTAAAAGGATTTAGGAATTTCTAATTAAAAGGAAAGTTTGTAAAAAGAAAATCAAAATG 3681

 54670739 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 54670798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 CATCTTTCTTTTCTTTTAACATTTTGGGATGATGAAATTCTAAAGAGCCATGATTTTGGA 3741

 54670799 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 54670858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 TTGCAGTCTGCCAAATTACACTGTAAATAGCTTTGATTTGGAATTGTGTGCCCTAGAATC 3801

 54670859 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 54670918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 AAGGTTATTTGCAAATTTATTTTGCCAAAATCAGAAACCAGGTTTGAGAGACCCAATCCT 3861

 54670919 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 54670978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 CTTATTTATGGGAAATATTTTAACAAACTGAGCATAATTGTAGAAGGAAAGTATAGAAAC 3921

 54670979 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 54671038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 ATTTTTCTTGCCTGTGTATATCTAATTTGCCAACCACAAACAATATTTAAGCCATTCATT 3981

 54671039 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 54671098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 TGAGCTCATTTGCTCAGTTATTGTGGTTCCTTCAATCAGAACTATAGTTCTCTCAGCATG 4041

 54671099 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 54671158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 CTCCTGCCCAGCTGAGGATGTGAATTCAGCACAGTACTCTTAGTACACTGAGTCAGAATT 4101

 54671159 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 54671218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 TCCAAAGAATCTTCAACAAGCTAGCCAAAGAAATTAACACATTTTATTCCTCTTCAAACA 4161

 54671219 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 54671278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 CATTTAAAATCCAAACACAGGCAAAAATAAAGACATCTCAGGATGGAAGTTATAAAATAA 4221

 54671279 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 54671338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 GTGTTCAGAATAACATGATATTTAGTAATAACTGGACTAAAATTATTTCTTCTTTTTTCA 4281

 54671339 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 54671398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 GGTAGCAATATACTTCAATAGCTTGTTCTTGTCACTATACATACATAAAAACTATGTTGA 4341

 54671399 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 54671458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 ATCACTGACTATATTCTTCTATGCTCAATTTCAGGGCTGTTTTTCAATTATCTCAATGTT 4401

 54671459 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 54671518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 CAAACGTGACTCATTTAGACTCAGTCATTATTAAAGCCCCAACATTCAAGACGACAATAG 4461

 54671519 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 54671578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 GCGCTGAGCACTTCCACTGCCCAAAGTGAGCTAGACCCTAGGTCAACTCAGAAGTATTGG 4521

 54671579 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 54671638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 AGAAAGTCATCAGTATTGTGGCAAAAGTTATCTAAGTATGTAGCAAGATGACCTTGAAGT 4581

 54671639 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 54671698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 TCTGATGAAGGTGTGGTTCATCATAGAGAAGCCACATGTGAGTATCAGTGCTTTCTTCTG 4641

 54671699 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 54671758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 ACAATAAATTTGAACATTTTATTCAAATTGGTCAAACTTGTGAAAAGTTAAAAATTACCA 4701

 54671759 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 54671818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AAAAATTACTTTGGAAATACTAGAAAAACTGAATGATCCTATGTTATGAGATTTTATATA 4761

 54671819 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 54671878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 TAATTGCATAGTATATTTTTATATATTCATGGTATTGTGAAATATGTATTTGGTCTTTGT 4821

 54671879 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 54671938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 CCCTGTTTCCTGGAATACAAATCTTAAAATCCTTGAAATCTTCAAAGTGCTATCTTTTCT 4881

 54671939 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 54671998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 ATGCTAATGTTGACTGATAGTTTCAGCGTGGGGCTGGTCATCAGAAAAAGGTATGAATAA 4941

 54671999 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 54672058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 AGAGTTGGGACTTTCAGCCCCACCCTTAACCTCCAGGGAGAAGAGAGGAGATGAAGGTCA 5001

 54672059 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 54672118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 AATTGATCACCAAAGGCCAATGGTTTAATCAATCACACCTATATAATGAAGCTTTCATAA 5061

 54672119 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 54672178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 AACCCCAAGAGAACAGGGTTTAAAGAGCTTCCTGATAGCTGAGCACATGGAGACTGACAG 5121

 54672179 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 54672238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 GAAGGTGAACAAGAACTCATCCATGAGCCAGGAAGGTGGCCCTCCGGGACTCCACCTGGA 5181

 54672239 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 54672298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 CAGAACAGAAACGTCTGCACTCGGGCCCCATCCAGACCTCACTCTGTGTATCCCTTAATC 5241

 54672299 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 54672358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 AGCCTGTTTATTCGTATCCTTTAAAATATCCTTTGTAATAAACTGATAAACATAATAAGC 5301

 54672359 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 54672418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 ATTTCTTCAAGTTCTGTGAGCCACTCTAGCAAAGTAATCCAACCAAAGAGGAGGTTATGG 5361

 54672419 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 54672478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 GAATCCCAAGTTGAAGCCAGTCGGTCATAAATTCCAGAGGTCTGGACTTGGAACTGGTAG 5421

 54672479 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 54672538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 GAAAGAGGTCTTGTGGAATTAAGCCTTCGCCATGTGGGATCTGAGGCTATGTCCAGGTAG 5481

 54672539 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 54672598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 ACAGTAATGGAACTGAACTGGAGGACACCCAGTTTATGTCTGCTACAGAACTGATTGCTC 5541

 54672599 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 54672658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 CCTTGCTAGTGGTGAGAAACTCCCACACATTTTGTGGTCACAGAAGTCTTCTGTGTTGAT 5601

 54672659 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 54672718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 CGCTGTGCTGTAAGAGCAGAGGAAAAACACGGATTGAAGGATTTTTCAAAACAATTTTAA 5661

 54672719 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 54672778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 ATATATTATTAAATAATCTAATTACATGCTTAATAATCTCCTTTATGAAGAAACCACAAG 5721

 54672779 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 54672838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 GCCCAGATCTGTTTCTGTGCAAGTTCTAAGAATTCAGTAAAAGAAAATTTCCAGGCCAGG 5781

 54672839 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 54672898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 TGCGGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTG 5841

 54672899 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 54672958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 AGGTTGGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCCCCGTCTCTACTAAAA 5901

 54672959 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 54673018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 ATACAAAATTAGCTGGGCGATGGTGCATGCCTGTAATTCCATCTACTCGGGAGCCTGAGG 5961

 54673019 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 54673078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 CAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 6021

 54673079 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 54673138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTCCATATTA 6081

 54673139 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 54673198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 TAGAAACTCTTTTACACTATATTCTTCAACCTAATTTTTGAGGAGAGTTTATTTTAATAC 6141

 54673199 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 54673258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 CAAAACCAGAAAAGAATAGTATGAGAAATAAAAATTACAAGTTAAACTCACTTACAAATG 6201

 54673259 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 54673318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 TGAACAGATAAACTCTGTTCTCTTGCAAACTAATTGCAGCAATGAATGAGAAAAACAAAT 6261

 54673319 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 54673378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 AAATTTATCCCAGGAATTCAAGACTGGTTTCCTGGTTTATCCAATAACATGCACGAATCT 6321

 54673379 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCC 54673438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 CAAAAGCATTAGGTTGAATTTTTTTAAAAAAGATATAAAAGGCTACATATTTTATTATCC 6381

 54673439 TGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAG 54673498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 TGTTTATATGCCATTTGGGGCAGAAATAAGGGTAGAGTTTGTCTGGAGATGCGGGAGAAG 6441

 54673499 CTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGT 54673558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6442 CTTGGGTAATTTTATGGGGTAATAGAAATAGTCTATATATTGATATGTAGTGGTGGGGGT 6501

 54673559 TGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTT 54673618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6502 TGCACAGCTGTATATGTTTGTCAAAATTCATTGAACCGTATACTTAAAAAGAATAAATTT 6561

 54673619 TAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACAAATAT 54673678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6562 TAAGTTTTACTGCATGTATCATATACCCCAATAAACCTGACTTTTAAATTTCACAAATAT 6621

 54673679 ATATATTGAGGAGTATGTTTAT 54673700
          ||||||||||||||||||||||
     6622 ATATATTGAGGAGTATGTTTAT 6643

Alignment time is 4.85257 s

