
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2952] =>      2952 nucs 'mol-32-1e66-069283_2952'

Score:        2951
Aligned:      2951        nucs
Identic:      2951 (100%) nucs =>      1679 (100%)      1272 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818674,39820352] EXCISED REGION [39820354,39821625]
 second seq =>  [       1,    1679] EXCISED REGION [    1681,    2952]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39820353,39820353]
 second seq =>         1 nucs [1680,1680]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [39820351,39820352] to [39820354,39820355]
 second seq =>         2 nucs [1678,1679] to [1681,1682]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818674 ATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAA 39818733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAA 60

 39818734 TGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACT 39818793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACT 120

 39818794 CATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATG 39818853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATG 180

 39818854 TCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCC 39818913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCC 240

 39818914 AATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTT 39818973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTT 300

 39818974 CCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGA 39819033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGA 360

 39819034 TGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTG 39819093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTG 420

 39819094 CCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGT 39819153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGT 480

 39819154 TCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTC 39819213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTC 540

 39819214 CTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTA 39819273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTA 600

 39819274 TCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAA 39819333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAA 660

 39819334 TTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTG 39819393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTG 720

 39819394 AGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCAT 39819453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCAT 780

 39819454 GGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCAT 39819513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCAT 840

 39819514 GAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGT 39819573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGT 900

 39819574 AGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAG 39819633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAG 960

 39819634 AGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGA 39819693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGA 1020

 39819694 AATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAA 39819753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAA 1080

 39819754 GGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGAT 39819813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGAT 1140

 39819814 GAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAG 39819873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAG 1200

 39819874 ATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAG 39819933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAG 1260

 39819934 AAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAA 39819993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAA 1320

 39819994 GATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAG 39820053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAG 1380

 39820054 GAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCAC 39820113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCAC 1440

 39820114 TCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCC 39820173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCC 1500

 39820174 AGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCA 39820233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCA 1560

 39820234 CCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGC 39820293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGC 1620

 39820294 GCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTG 39820352
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTG 1679

EXCISED REGION

 39820354 TGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTT 39820413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTT 1740

 39820414 GTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTT 39820473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTT 1800

 39820474 TTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCA 39820533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCA 1860

 39820534 ATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCT 39820593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCT 1920

 39820594 CAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTT 39820653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTT 1980

 39820654 AGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 39820713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 2040

 39820714 TCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCC 39820773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCC 2100

 39820774 AAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAG 39820833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAG 2160

 39820834 GTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCT 39820893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCT 2220

 39820894 ACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTA 39820953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTA 2280

 39820954 AGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTT 39821013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTT 2340

 39821014 CCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGT 39821073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGT 2400

 39821074 GCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGT 39821133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGT 2460

 39821134 GTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAG 39821193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAG 2520

 39821194 ACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCT 39821253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCT 2580

 39821254 TGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCAAGCT 39821313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCAAGCT 2640

 39821314 ACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTG 39821373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTG 2700

 39821374 CTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGATCCT 39821433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGATCCT 2760

 39821434 TTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGC 39821493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGC 2820

 39821494 AGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCAC 39821553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCAC 2880

 39821554 CTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAAACTC 39821613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAAACTC 2940

 39821614 TGTTGTGAAGTG 39821625
          ||||||||||||
     2941 TGTTGTGAAGTG 2952

Alignment time is 2.75113 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6436] =>      6436 nucs 'mol-32-1e87-081095_6436'

Score:        6403
Aligned:      6436        nucs
Identic:      6433 (100%) nucs =>      3177 (100%)      3256 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818365,39821541] EXCISED REGION [39821543,39824801]
 second seq =>  [       1,    3177] EXCISED REGION [    3179,    6436]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39821542,39821542]
 second seq =>         1 nucs [3178,3178]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [39823549,39823549]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39821542,39821542] to [39821543,39821543]
 second seq =>         1 nucs [3177,3177] to [3178,3178]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818365 GGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACT 39818424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACT 60

 39818425 CCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTG 39818484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTG 120

 39818485 TATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAG 39818544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAG 180

 39818545 TCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCC 39818604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCC 240

 39818605 TCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGC 39818664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGC 300

 39818665 TATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCA 39818724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCA 360

 39818725 GCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATG 39818784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATG 420

 39818785 ATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTG 39818844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTG 480

 39818845 ATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTT 39818904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTT 540

 39818905 CAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCAC 39818964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCAC 600

 39818965 GTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTT 39819024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTT 660

 39819025 TTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGG 39819084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGG 720

 39819085 ATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACT 39819144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACT 780

 39819145 GTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACA 39819204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACA 840

 39819205 TGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACA 39819264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACA 900

 39819265 TTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGA 39819324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGA 960

 39819325 CATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGC 39819384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGC 1020

 39819385 CAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCA 39819444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCA 1080

 39819445 TCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAA 39819504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAA 1140

 39819505 GTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAG 39819564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAG 1200

 39819565 GAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGA 39819624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGA 1260

 39819625 GACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCAT 39819684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCAT 1320

 39819685 AGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGG 39819744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGG 1380

 39819745 GGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAG 39819804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAG 1440

 39819805 TAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAG 39819864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAG 1500

 39819865 GGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTT 39819924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTT 1560

 39819925 TTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGA 39819984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGA 1620

 39819985 TAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCA 39820044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCA 1680

 39820045 GGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACA 39820104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACA 1740

 39820105 GGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGT 39820164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGT 1800

 39820165 AGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGG 39820224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGG 1860

 39820225 TATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCA 39820284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCA 1920

 39820285 CTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTC 39820344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTC 1980

 39820345 CCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTC 39820404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTC 2040

 39820405 TCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAA 39820464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAA 2100

 39820465 TTAATACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGC 39820524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAATACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGC 2160

 39820525 TAGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATT 39820584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATT 2220

 39820585 CTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTT 39820644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTT 2280

 39820645 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 39820704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 2340

 39820705 CTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGG 39820764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGG 2400

 39820765 TGCCTGGCCAAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTT 39820824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCCTGGCCAAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTT 2460

 39820825 TGATACCAGGTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACT 39820884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGATACCAGGTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACT 2520

 39820885 GCAGCCTCTACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 39820944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCAGCCTCTACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 2580

 39820945 TTACAGGTAAGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTC 39821004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTACAGGTAAGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTC 2640

 39821005 GCCATGTTTCCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCC 39821064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCATGTTTCCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCC 2700

 39821065 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGA 39821124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGA 2760

 39821125 GTGGTTTGTGTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACC 39821184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGGTTTGTGTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACC 2820

 39821185 AGGAGATAGACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGC 39821244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGGAGATAGACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGC 2880

 39821245 TGAGCTCCTTGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATG 39821304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGAGCTCCTTGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATG 2940

 39821305 ACTCAAGCTACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGC 39821364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTCAAGCTACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGC 3000

 39821365 TTAGGGGTGCTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGG 39821424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTAGGGGTGCTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGG 3060

 39821425 ATGGATCCTTTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAG 39821484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATGGATCCTTTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAG 3120

 39821485 GTGAGCAGCAGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGC 39821541
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTGAGCAGCAGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGC 3177

EXCISED REGION

 39821543 TGCATGACCACCTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGG 39821602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TGCATGACCACCTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGG 3238

 39821603 AGCACAAACTCTGTTGTGAAGTGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGTGTACTCCTTATGAG 39821662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGCACAAACTCTGTTGTGAAGTGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGTGTACTCCTTATGAG 3298

 39821663 AATCTAATGCCTGATATTCTGTTACTGTTTCCCATCACCCCAGATGGACAGTCTAGTTGC 39821722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AATCTAATGCCTGATATTCTGTTACTGTTTCCCATCACCCCAGATGGACAGTCTAGTTGC 3358

 39821723 AGGAAAACAAGCTCAGAGATCCCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGTTGTAGAATCATTTC 39821782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AGGAAAACAAGCTCAGAGATCCCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGTTGTAGAATCATTTC 3418

 39821783 ATTATATATTACTATGTAGTAATAATAGAAATAAAGTGCTCAATATATGTATTGCACTTG 39821842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 ATTATATATTACTATGTAGTAATAATAGAAATAAAGTGCTCAATATATGTATTGCACTTG 3478

 39821843 AATCATCCTGAAATTATTCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTGCCTTCCACATATTC 39821902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AATCATCCTGAAATTATTCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTGCCTTCCACATATTC 3538

 39821903 ACTCTGTTTTTTGGTACAGGCAAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTCCT 39821962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 ACTCTGTTTTTTGGTACAGGCAAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTCCT 3598

 39821963 GGCCTCAAGTAATATACCTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATAAACCA 39822022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GGCCTCAAGTAATATACCTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATAAACCA 3658

 39822023 CCACCCTCAACCAAGACTTTCTTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAGATTACTTGAGCCCA 39822082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CCACCCTCAACCAAGACTTTCTTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAGATTACTTGAGCCCA 3718

 39822083 TGTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAAT 39822142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TGTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAAT 3778

 39822143 GAGACTGTCTCAAAAAATAAAATAAAATACAAATGAACCCTTTATGACATTGCCAGTAAC 39822202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GAGACTGTCTCAAAAAATAAAATAAAATACAAATGAACCCTTTATGACATTGCCAGTAAC 3838

 39822203 TTTCCCTCCTAAGTGTTCCCCACAAGTCTTTGAATTCTGTTTAATTTTCACATAACATTT 39822262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TTTCCCTCCTAAGTGTTCCCCACAAGTCTTTGAATTCTGTTTAATTTTCACATAACATTT 3898

 39822263 AAGACGTTTAAGAACTTATGTCTGTCTGTGTCATCCCTTTATGTCAAAAGATGCCTTTTT 39822322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 AAGACGTTTAAGAACTTATGTCTGTCTGTGTCATCCCTTTATGTCAAAAGATGCCTTTTT 3958

 39822323 GTCACTTCCAGCTGGATCTACCATGAAAGACTTCTGAATCCAGGAAGAGAGACTGACTGG 39822382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GTCACTTCCAGCTGGATCTACCATGAAAGACTTCTGAATCCAGGAAGAGAGACTGACTGG 4018

 39822383 GCAACATGTTATTCAGGTACAAAAAGATTTGGAGTGTAACTCAAAAATGATCAAATAATA 39822442
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4019 GCAACATGTTATTCAGGTACAAAAAGATTTGGACTGTAACTCAAAAATGATCAAATAATA 4078

 39822443 GTGCATGCATCAAGTGCAATGGGAAGCTCTTCGGGAGAGTGAGAGAAGCTTCCAGTTAAG 39822502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GTGCATGCATCAAGTGCAATGGGAAGCTCTTCGGGAGAGTGAGAGAAGCTTCCAGTTAAG 4138

 39822503 GTGACATTGAAGCCAAGTCCTGAAAGATGAGGAAGAGTTGTATGAGAGTGGGGAGGAAAG 39822562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 GTGACATTGAAGCCAAGTCCTGAAAGATGAGGAAGAGTTGTATGAGAGTGGGGAGGAAAG 4198

 39822563 GGGGAGGTGGAGGGATGGGGAATGGGCTGGGATGGGATGGAGCAAACTGCCCGGGAAGGG 39822622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 GGGGAGGTGGAGGGATGGGGAATGGGCTGGGATGGGATGGAGCAAACTGCCCGGGAAGGG 4258

 39822623 AAACCAGCACTGTACAGACCTGAACAACGAAGATGGCATATTTTGTTCACGGAACGGTGA 39822682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AAACCAGCACTGTACAGACCTGAACAACGAAGATGGCATATTTTGTTCACGGAACGGTGA 4318

 39822683 ATTAAGTGTGGCAGGAATGCTTTGTAGAGACAGTAAGTTGCTTGTATGGAATTTTGCCCA 39822742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 ATTAAGTGTGGCAGGAATGCTTTGTAGAGACAGTAAGTTGCTTGTATGGAATTTTGCCCA 4378

 39822743 AGAGACCTCATTGCAGTTTCTGATTTTTTGATGTCATCATCCATCACTGTCCTTGTCAAA 39822802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 AGAGACCTCATTGCAGTTTCTGATTTTTTGATGTCATCATCCATCACTGTCCTTGTCAAA 4438

 39822803 TAGTTTGGAATAGGTATAATGATCACAATAACCCCAAGCATAATATTTCATTAATTCTCA 39822862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TAGTTTGGAATAGGTATAATGATCACAATAACCCCAAGCATAATATTTCATTAATTCTCA 4498

 39822863 CAGAATCACAGGTAGGTGCCACAGTTATCCCCATTTTATGAATGGAGTGATGAAGCCTTA 39822922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 CAGAATCACAGGTAGGTGCCACAGTTATCCCCATTTTATGAATGGAGTGATGAAGCCTTA 4558

 39822923 GGAATAATGAATGATTTGCCCAAGCTCACCTGGATATTAAGACTGAGTCAAATGTTGGGT 39822982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GGAATAATGAATGATTTGCCCAAGCTCACCTGGATATTAAGACTGAGTCAAATGTTGGGT 4618

 39822983 CTGGTCTGACTTTAATGTTTGCTTTGTTCATGAGCACCACGTATTGCCTCTCCTATGCAG 39823042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CTGGTCTGACTTTAATGTTTGCTTTGTTCATGAGCACCACGTATTGCCTCTCCTATGCAG 4678

 39823043 TTAAGCAGGTAGACAAGTGACAGAAAAGCCCATGTTTGTCTCTACTCACACACTTCCGAC 39823102
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4679 TTAAGCAGGTAGACAAGTGACAGAAAAGCCCATGTTTGTCTCTACTCGCACACTTCCGAC 4738

 39823103 TGAATGTATGTATGGAGTTTCTACACCAAATTCTTCAGTGCTCTGGATATTAACTGGGTA 39823162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TGAATGTATGTATGGAGTTTCTACACCAAATTCTTCAGTGCTCTGGATATTAACTGGGTA 4798

 39823163 TCCCATGACTTTATTCTGACACTACCTGGAGTTAGCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTC 39823222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TCCCATGACTTTATTCTGACACTACCTGGAGTTAGCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTC 4858

 39823223 AGTCCCACGAGGCCATCCTCACTTCAGATGCCAATGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTA 39823282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 AGTCCCACGAGGCCATCCTCACTTCAGATGCCAATGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTA 4918

 39823283 CTTTTGACCAACCTCTTACAAATCGGGGGTTCCCATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAAT 39823342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CTTTTGACCAACCTCTTACAAATCGGGGGTTCCCATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAAT 4978

 39823343 TTGCTAGAACAGTTTACGGAACTCAGAAAAACAGTTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGA 39823402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TTGCTAGAACAGTTTACGGAACTCAGAAAAACAGTTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGA 5038

 39823403 GGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAATGGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCT 39823462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 GGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAATGGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCT 5098

 39823463 TGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATG 39823522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATG 5158

 39823523 CCTGCACCACCACATCTGGCTAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTT 39823582
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 CCTGCACCACCACATCTGGCTAGTTT-TTTTTTTTTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTT 5217

 39823583 GTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACAACAAATTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAG 39823642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 GTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACAACAAATTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAG 5277

 39823643 CCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCACCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTAT 39823702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 CCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCACCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTAT 5337

 39823703 TACTGGTTCATTGTGAAGGATACATCCCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTG 39823762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 TACTGGTTCATTGTGAAGGATACATCCCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTG 5397

 39823763 GATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCT 39823822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 GATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCT 5457

 39823823 TAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAA 39823882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 TAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAA 5517

 39823883 TTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGG 39823942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGG 5577

 39823943 AAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGT 39824002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 AAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGT 5637

 39824003 GAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAG 39824062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 GAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAG 5697

 39824063 AAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAA 39824122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 AAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAA 5757

 39824123 CATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATT 39824182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 CATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATT 5817

 39824183 CAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGT 39824242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 CAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGT 5877

 39824243 GATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTC 39824302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 GATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTC 5937

 39824303 CAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGC 39824362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 CAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGC 5997

 39824363 TTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATC 39824422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATC 6057

 39824423 CCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAA 39824482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 CCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAA 6117

 39824483 AAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAG 39824542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 AAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAG 6177

 39824543 GAACCAGGGACAGAGATTAAATATATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCT 39824602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 GAACCAGGGACAGAGATTAAATATATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCT 6237

 39824603 GTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTG 39824662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 GTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTG 6297

 39824663 AGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCAC 39824722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 AGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCAC 6357

 39824723 CCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGT 39824782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 CCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGT 6417

 39824783 TGGCCAGATGGGGTCTTCT 39824801
          |||||||||||||||||||
     6418 TGGCCAGATGGGGTCTTCT 6436

Alignment time is 5.95549 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9717] =>      9717 nucs 'mol-32-1eea-080407_9717'

Score:        9675
Aligned:      9719        nucs
Identic:      9715 (100%) nucs =>      2511 (100%)      7204 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39815807,39818319] EXCISED REGION [39818324,39825529]
 second seq =>  [       1,    2512] EXCISED REGION [    2513,    9717]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [39818320,39818323]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [39818320,39818341] to [39818324,39818345]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [39818320,39818321] to [39818322,39818323]
 second seq =>         0 nucs

 39815807 CAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCCAGATGATTTTTGTATTTTTA 39815866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCCAGATGATTTTTGTATTTTTA 60

 39815867 GTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCATCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGAT 39815926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCATCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGAT 120

 39815927 CTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAATGCAGGGATTACAGACATGAGCTACCACTCCGGGCCT 39815986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAATGCAGGGATTACAGACATGAGCTACCACTCCGGGCCT 180

 39815987 CCATTTCTTTTTTGTAGTCTTTAATAAACAGCTGCTATCGTTGCAGACTTGCTATTTAGG 39816046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATTTCTTTTTTGTAGTCTTTAATAAACAGCTGCTATCGTTGCAGACTTGCTATTTAGG 240

 39816047 CACTTAGGAATTTTTCACTAGAAGGCGTGTAAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAAT 39816106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTTAGGAATTTTTCACTAGAAGGCGTGTAAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAAT 300

 39816107 TTAGCATTCATTCTTTGACTACATGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTT 39816166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGCATTCATTCTTTGACTACATGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTT 360

 39816167 TTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAACTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTG 39816226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAACTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTG 420

 39816227 CTCTTTTTTTATTGTCTATTTCTCCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGTAATAAAAACT 39816286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      421 CTCTTTTTTTATTGTCTATTTCTCCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGTGATAAAAACT 480

 39816287 TGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTA 39816346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTA 540

 39816347 CAGTGACATGATCATGGTTCACTGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCAC 39816406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTGACATGATCATGGTTCACTGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCAC 600

 39816407 TTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTC 39816466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTC 660

 39816467 ATTTTTTATCACAGAGACAGGATCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGA 39816526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTTTATCACAGAGACAGGATCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGA 720

 39816527 CTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACC 39816586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACC 780

 39816587 ACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTC 39816646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTC 840

 39816647 ACATACCATTCACTTTATTTATTGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAG 39816706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACATACCATTCACTTTATTTATTGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAG 900

 39816707 AGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCC 39816766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCC 960

 39816767 ATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTT 39816826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTT 1020

 39816827 AGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATT 39816886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATT 1080

 39816887 GCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCC 39816946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCC 1140

 39816947 TTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGA 39817006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGA 1200

 39817007 CACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTAT 39817066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTAT 1260

 39817067 TGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATA 39817126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATA 1320

 39817127 TTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTA 39817186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTA 1380

 39817187 CATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGC 39817246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGC 1440

 39817247 AATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCA 39817306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCA 1500

 39817307 TGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAA 39817366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1501 TGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAA- 1559

 39817367 TCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTC 39817426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTC 1619

 39817427 CCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTT 39817486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTT 1679

 39817487 TTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCA 39817546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCA 1739

 39817547 TTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGA 39817606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGA 1799

 39817607 AAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTT 39817666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTT 1859

 39817667 GCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGT 39817726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGT 1919

 39817727 TCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTT 39817786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTT 1979

 39817787 TTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATA 39817846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATA 2039

 39817847 TAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTT 39817906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTT 2099

 39817907 TGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCC 39817966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCC 2159

 39817967 CAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAG 39818026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAG 2219

 39818027 TAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAG 39818086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAG 2279

 39818087 TCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCT 39818146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCT 2339

 39818147 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCC 39818206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCC 2399

 39818207 AGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAA 39818266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAA 2459

 39818267 ATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTG 39818319
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTG 2512

EXCISED REGION

 39818324 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTG 39818383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTG 2572

 39818384 AAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAA 39818443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 AAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAA 2632

 39818444 TCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTC 39818503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTC 2692

 39818504 TATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCC 39818563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCC 2752

 39818564 CACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGA 39818623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 CACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGA 2812

 39818624 ACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCAT 39818683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 ACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCAT 2872

 39818684 CAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGG 39818743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 CAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGG 2932

 39818744 GAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGA 39818803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 GAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGA 2992

 39818804 GAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTT 39818863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 GAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTT 3052

 39818864 CTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCT 39818923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 CTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCT 3112

 39818924 CATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCT 39818983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 CATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCT 3172

 39818984 GGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCA 39819043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 GGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCA 3232

 39819044 CTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTC 39819103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 CTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTC 3292

 39819104 CCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTT 39819163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 CCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTT 3352

 39819164 CTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTC 39819223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 CTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTC 3412

 39819224 CAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCT 39819283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 CAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCT 3472

 39819284 TAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCA 39819343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 TAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCA 3532

 39819344 GGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCAC 39819403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 GGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCAC 3592

 39819404 TGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCA 39819463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 TGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCA 3652

 39819464 CCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGA 39819523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 CCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGA 3712

 39819524 TGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAA 39819583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 TGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAA 3772

 39819584 GGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGA 39819643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 GGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGA 3832

 39819644 GTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGG 39819703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 GTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGG 3892

 39819704 GGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGA 39819763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 GGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGA 3952

 39819764 CTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATG 39819823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 CTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATG 4012

 39819824 GATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAAT 39819883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 GATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAAT 4072

 39819884 GGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTG 39819943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 GGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTG 4132

 39819944 AGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAA 39820003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 AGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAA 4192

 39820004 AGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCT 39820063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 AGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCT 4252

 39820064 TAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCC 39820123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 TAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCC 4312

 39820124 AGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGG 39820183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 AGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGG 4372

 39820184 GATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCACACC 39820243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 GATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCACACC 4432

 39820244 TGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGT 39820303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 TGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGT 4492

 39820304 CTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACA 39820363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 CTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACA 4552

 39820364 GGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTT 39820423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 GGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTT 4612

 39820424 TGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAG 39820483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAG 4672

 39820484 ATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCACTAT 39820543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 ATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCACTAT 4732

 39820544 CTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCG 39820603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 CTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCG 4792

 39820604 AGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATG 39820663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 AGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATG 4852

 39820664 GGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCC 39820723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 GGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCC 4912

 39820724 TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCCAAAATTAATA 39820783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCCAAAATTAATA 4972

 39820784 CTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAGGTCTCATGCT 39820843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 CTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAGGTCTCATGCT 5032

 39820844 CTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCTACCTGCCAGG 39820903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 CTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCTACCTGCCAGG 5092

 39820904 CTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAAGTGCCACCA 39820963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 CTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAAGTGCCACCA 5152

 39820964 CACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTTCCCAGACTGG 39821023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 CACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTTCCCAGACTGG 5212

 39821024 TCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 39821083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 TCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 5272

 39821084 CAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGTGTCTCCTGAT 39821143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 CAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGTGTCTCCTGAT 5332

 39821144 TGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAGACCCACACAG 39821203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 TGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAGACCCACACAG 5392

 39821204 ATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCTTGCTAATGGG 39821263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 ATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCTTGCTAATGGG 5452

 39821264 ATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACATACT 39821323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 ATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACATACT 5512

 39821324 GTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTGCTACAAGTTG 39821383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 GTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTGCTACAAGTTG 5572

 39821384 ACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGATCCTTTCGAATGCA 39821443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 ACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGATCCTTTCGAATGCA 5632

 39821444 CTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGCAGGCAAGTGA 39821503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 CTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGCAGGCAAGTGA 5692

 39821504 AGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCACCTGAGCTCCA 39821563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 AGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCACCTGAGCTCCA 5752

 39821564 TGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAAACTCTGTTGTGAAG 39821623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 TGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAAACTCTGTTGTGAAG 5812

 39821624 TGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGTGTACTCCTTATGAGAATCTAATGCCTGATATTCTG 39821683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 TGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGTGTACTCCTTATGAGAATCTAATGCCTGATATTCTG 5872

 39821684 TTACTGTTTCCCATCACCCCAGATGGACAGTCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGAGATC 39821743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 TTACTGTTTCCCATCACCCCAGATGGACAGTCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGAGATC 5932

 39821744 CCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGTTGTAGAATCATTTCATTATATATTACTATGTAGTA 39821803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 CCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGTTGTAGAATCATTTCATTATATATTACTATGTAGTA 5992

 39821804 ATAATAGAAATAAAGTGCTCAATATATGTATTGCACTTGAATCATCCTGAAATTATTCCC 39821863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 ATAATAGAAATAAAGTGCTCAATATATGTATTGCACTTGAATCATCCTGAAATTATTCCC 6052

 39821864 TCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTGCCTTCCACATATTCACTCTGTTTTTTGGTACAGGC 39821923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 TCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTGCCTTCCACATATTCACTCTGTTTTTTGGTACAGGC 6112

 39821924 AAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATATACCTCT 39821983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 AAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATATACCTCT 6172

 39821984 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATAAACCACCACCCTCAACCAAGACTTTC 39822043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATAAACCACCACCCTCAACCAAGACTTTC 6232

 39822044 TTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAGATTACTTGAGCCCATGTGGTCAAGGCTGCAGTGAG 39822103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 TTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAGATTACTTGAGCCCATGTGGTCAAGGCTGCAGTGAG 6292

 39822104 CCTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAATGAGACTGTCTCAAAAAATAAA 39822163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 CCTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAATGAGACTGTCTCAAAAAATAAA 6352

 39822164 ATAAAATACAAATGAACCCTTTATGACATTGCCAGTAACTTTCCCTCCTAAGTGTTCCCC 39822223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 ATAAAATACAAATGAACCCTTTATGACATTGCCAGTAACTTTCCCTCCTAAGTGTTCCCC 6412

 39822224 ACAAGTCTTTGAATTCTGTTTAATTTTCACATAACATTTAAGACGTTTAAGAACTTATGT 39822283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 ACAAGTCTTTGAATTCTGTTTAATTTTCACATAACATTTAAGACGTTTAAGAACTTATGT 6472

 39822284 CTGTCTGTGTCATCCCTTTATGTCAAAAGATGCCTTTTTGTCACTTCCAGCTGGATCTAC 39822343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 CTGTCTGTGTCATCCCTTTATGTCAAAAGATGCCTTTTTGTCACTTCCAGCTGGATCTAC 6532

 39822344 CATGAAAGACTTCTGAATCCAGGAAGAGAGACTGACTGGGCAACATGTTATTCAGGTACA 39822403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 CATGAAAGACTTCTGAATCCAGGAAGAGAGACTGACTGGGCAACATGTTATTCAGGTACA 6592

 39822404 AAAAGATTTGGAGTGTAACTCAAAAATGATCAAATAATAGTGCATGCATCAAGTGCAATG 39822463
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 AAAAGATTTGGACTGTAACTCAAAAATGATCAAATAATAGTGCATGCATCAAGTGCAATG 6652

 39822464 GGAAGCTCTTCGGGAGAGTGAGAGAAGCTTCCAGTTAAGGTGACATTGAAGCCAAGTCCT 39822523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 GGAAGCTCTTCGGGAGAGTGAGAGAAGCTTCCAGTTAAGGTGACATTGAAGCCAAGTCCT 6712

 39822524 GAAAGATGAGGAAGAGTTGTATGAGAGTGGGGAGGAAAGGGGGAGGTGGAGGGATGGGGA 39822583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 GAAAGATGAGGAAGAGTTGTATGAGAGTGGGGAGGAAAGGGGGAGGTGGAGGGATGGGGA 6772

 39822584 ATGGGCTGGGATGGGATGGAGCAAACTGCCCGGGAAGGGAAACCAGCACTGTACAGACCT 39822643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 ATGGGCTGGGATGGGATGGAGCAAACTGCCCGGGAAGGGAAACCAGCACTGTACAGACCT 6832

 39822644 GAACAACGAAGATGGCATATTTTGTTCACGGAACGGTGAATTAAGTGTGGCAGGAATGCT 39822703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 GAACAACGAAGATGGCATATTTTGTTCACGGAACGGTGAATTAAGTGTGGCAGGAATGCT 6892

 39822704 TTGTAGAGACAGTAAGTTGCTTGTATGGAATTTTGCCCAAGAGACCTCATTGCAGTTTCT 39822763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 TTGTAGAGACAGTAAGTTGCTTGTATGGAATTTTGCCCAAGAGACCTCATTGCAGTTTCT 6952

 39822764 GATTTTTTGATGTCATCATCCATCACTGTCCTTGTCAAATAGTTTGGAATAGGTATAATG 39822823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 GATTTTTTGATGTCATCATCCATCACTGTCCTTGTCAAATAGTTTGGAATAGGTATAATG 7012

 39822824 ATCACAATAACCCCAAGCATAATATTTCATTAATTCTCACAGAATCACAGGTAGGTGCCA 39822883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 ATCACAATAACCCCAAGCATAATATTTCATTAATTCTCACAGAATCACAGGTAGGTGCCA 7072

 39822884 CAGTTATCCCCATTTTATGAATGGAGTGATGAAGCCTTAGGAATAATGAATGATTTGCCC 39822943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 CAGTTATCCCCATTTTATGAATGGAGTGATGAAGCCTTAGGAATAATGAATGATTTGCCC 7132

 39822944 AAGCTCACCTGGATATTAAGACTGAGTCAAATGTTGGGTCTGGTCTGACTTTAATGTTTG 39823003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 AAGCTCACCTGGATATTAAGACTGAGTCAAATGTTGGGTCTGGTCTGACTTTAATGTTTG 7192

 39823004 CTTTGTTCATGAGCACCACGTATTGCCTCTCCTATGCAGTTAAGCAGGTAGACAAGTGAC 39823063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 CTTTGTTCATGAGCACCACGTATTGCCTCTCCTATGCAGTTAAGCAGGTAGACAAGTGAC 7252

 39823064 AGAAAAGCCCATGTTTGTCTCTACTCACACACTTCCGACTGAATGTATGTATGGAGTTTC 39823123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 AGAAAAGCCCATGTTTGTCTCTACTCACACACTTCCGACTGAATGTATGTATGGAGTTTC 7312

 39823124 TACACCAAATTCTTCAGTGCTCTGGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCTGACA 39823183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 TACACCAAATTCTTCAGTGCTCTGGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCTGACA 7372

 39823184 CTACCTGGAGTTAGCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCA 39823243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 CTACCTGGAGTTAGCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCA 7432

 39823244 CTTCAGATGCCAATGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAA 39823303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 CTTCAGATGCCAATGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAA 7492

 39823304 ATCGGGGGTTCCCATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAA 39823363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 ATCGGGGGTTCCCATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAA 7552

 39823364 CTCAGAAAAACAGTTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAG 39823423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 CTCAGAAAAACAGTTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAG 7612

 39823424 GCTGGTGTGCAATGGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGG 39823483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 GCTGGTGTGCAATGGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGG 7672

 39823484 TTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCT 39823543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 TTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCT 7732

 39823544 AGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCC 39823603
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7733 AGTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCC 7791

 39823604 ACAACAAATTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTA 39823663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7792 ACAACAAATTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTA 7851

 39823664 CAGATGTCAGCCACCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGAT 39823723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7852 CAGATGTCAGCCACCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGAT 7911

 39823724 ACATCCCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGT 39823783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7912 ACATCCCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGT 7971

 39823784 AATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACC 39823843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7972 AATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACC 8031

 39823844 AGCCTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAAC 39823903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8032 AGCCTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAAC 8091

 39823904 CAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTC 39823963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8092 CAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTC 8151

 39823964 TTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCT 39824023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8152 TTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCT 8211

 39824024 AGCTTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTA 39824083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8212 AGCTTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTA 8271

 39824084 AGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCT 39824143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8272 AGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCT 8331

 39824144 CCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTT 39824203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8332 CCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTT 8391

 39824204 ATTATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCC 39824263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8392 ATTATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCC 8451

 39824264 CTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTT 39824323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8452 CTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTT 8511

 39824324 GCATGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTC 39824383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8512 GCATGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTC 8571

 39824384 AACAACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTT 39824443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8572 AACAACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTT 8631

 39824444 GTGTTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTA 39824503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8632 GTGTTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTA 8691

 39824504 TCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAA 39824563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8692 TCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAA 8751

 39824564 TATATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGC 39824623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8752 TATATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGC 8811

 39824624 AGTCTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATC 39824683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8812 AGTCTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATC 8871

 39824684 TCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGT 39824743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8872 TCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGT 8931

 39824744 AGAGTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTT 39824803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8932 AGAGTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTT 8991

 39824804 TGTTGCCCAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTA 39824863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8992 TGTTGCCCAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTA 9051

 39824864 GAGATGAGATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGT 39824923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9052 GAGATGAGATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGT 9111

 39824924 CTCACCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATA 39824983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9112 CTCACCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATA 9171

 39824984 TTTATTTTTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAA 39825043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9172 TTTATTTTTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAA 9231

 39825044 CTTCGGGCCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGG 39825103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9232 CTTCGGGCCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGG 9291

 39825104 AGCCACCATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATT 39825163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9292 AGCCACCATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATT 9351

 39825164 CAGAATTGGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGAT 39825223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9352 CAGAATTGGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGAT 9411

 39825224 GCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCT 39825283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9412 GCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCT 9471

 39825284 TCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGC 39825343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9472 TCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGC 9531

 39825344 TGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAA 39825403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9532 TGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAA 9591

 39825404 GATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAG 39825463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9592 GATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAG 9651

 39825464 CAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACT 39825523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9652 CAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACT 9711

 39825524 TTAGGA 39825529
          ||||||
     9712 TTAGGA 9717

Alignment time is 8.92182 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8972] =>      8972 nucs 'mol-32-1f0b-133372_8972'

Score:        8949
Aligned:      8971        nucs
Identic:      8969 (100%) nucs =>       865 (100%)      8104 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39813164,39814028] EXCISED REGION [39814030,39822134]
 second seq =>  [       1,     865] EXCISED REGION [     867,    8972]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39814029,39814029]
 second seq =>         1 nucs [866,866]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5157,5157]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [866,866] to [867,867]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39813164 GATGTGGTGAAGGAAGAAGAGGTCAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTGCACTTCTGGCCT 39813223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATGTGGTGAAGGAAGAAGAGGTCAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTGCACTTCTGGCCT 60

 39813224 TGAATATGGAGTCAGAGGCCATCTTCAAGGTGAGTCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAA 39813283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAATATGGAGTCAGAGGCCATCTTCAAGGTGAGTCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAA 120

 39813284 GCTGGAAAAGGCAAAGGAGCTCATTCTCTCTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCCCTCT 39813343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGGAAAAGGCAAAGGAGCTCATTCTCTCTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCCCTCT 180

 39813344 GACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTGGGCTTCTGGTCCGTAGAACTGTAAGG 39813403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTGGGCTTCTGGTCCGTAGAACTGTAAGG 240

 39813404 TGGTAGATTTATGATGTTTCAAGCCACTAAATGTAGGGTAGTTTGTTGTAGCAGCAAGTA 39813463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTAGATTTATGATGTTTCAAGCCACTAAATGTAGGGTAGTTTGTTGTAGCAGCAAGTA 300

 39813464 AAAAATGAACATGAAGCCAGGGCTTCATGTTACAGTTGCTCATGCCTGTAATCCCAGGAC 39813523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAATGAACATGAAGCCAGGGCTTCATGTTACAGTTGCTCATGCCTGTAATCCCAGGAC 360

 39813524 TTTAGGAGGCTGAGGTAGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGCTTAAGACCAGCCTGGGCAA 39813583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAGGAGGCTGAGGTAGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGCTTAAGACCAGCCTGGGCAA 420

 39813584 CATAATGAGACCTCATGTCTAAAAGAATTTTTTTAAAAAGGCCAGGCGCAGTGGCTCACA 39813643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATAATGAGACCTCATGTCTAAAAGAATTTTTTTAAAAAGGCCAGGCGCAGTGGCTCACA 480

 39813644 TTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTGGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGAAGTTCAAG 39813703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTGGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGAAGTTCAAG 540

 39813704 ACCAGCATGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCCAGGT 39813763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCAGCATGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCCAGGT 600

 39813764 GTGGTGGTAGGTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGGTGAGGCAGAGAATCACTTGAACCTG 39813823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGGTGGTAGGTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGGTGAGGCAGAGAATCACTTGAACCTG 660

 39813824 AAAGGCAGACATTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCTGTTGCACTTCAGCCTGGGCGACCGAG 39813883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGGCAGACATTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCTGTTGCACTTCAGCCTGGGCGACCGAG 720

 39813884 ACTATGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGTTGTGGCATGCAGCTGTAGTC 39813943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTATGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGTGTTGTGGCATGCAGCTGTAGTC 780

 39813944 TCAGTTCCTAGGGAAGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTAAGCCTAGGAGGTTGAAGTTGCTG 39814003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGTTCCTAGGGAAGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTAAGCCTAGGAGGTTGAAGTTGCTG 840

 39814004 TGAGCTATGATTGCACCACTGTACT 39814028
          |||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGCTATGATTGCACCACTGTACT 865

EXCISED REGION

 39814030 CAGCCTGGGCAATAGAGCAAGACCTTGTTTCAAAAAGAAAGAAAGAAATGAGCATGGTGG 39814089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 CAGCCTGGGCAATAGAGCAAGACCTTGTTTCAAAAAGAAAGAAAGAAATGAGCATGGTGG 926

 39814090 GAATGGGGACAGATGGCAATGTTAAGTAGCGTGGTCAGGGTTGGCCTCATAAGTGAATAT 39814149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 GAATGGGGACAGATGGCAATGTTAAGTAGCGTGGTCAGGGTTGGCCTCATAAGTGAATAT 986

 39814150 TGAGCAAAAGTTTGAAGCAGGTGATGGAGCTGGCCAAAGTGCTGAGGGAAAAGCATTGTA 39814209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 TGAGCAAAAGTTTGAAGCAGGTGATGGAGCTGGCCAAAGTGCTGAGGGAAAAGCATTGTA 1046

 39814210 GGCTGAGTCAACAGGATAAAGGCATTAGGAGGAAATTCCCTGGTGTGTCTGAGGCTCTGG 39814269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 GGCTGAGTCAACAGGATAAAGGCATTAGGAGGAAATTCCCTGGTGTGTCTGAGGCTCTGG 1106

 39814270 AAGGCCAGTGGAGCAAAGAGATAGAGGGAGCGAAGTCGGCAAGGAGGCCAGGGAGTTGCT 39814329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 AAGGCCAGTGGAGCAAAGAGATAGAGGGAGCGAAGTCGGCAAGGAGGCCAGGGAGTTGCT 1166

 39814330 GGGCTGGGATCGGTACAGACCGTGTAAGCCCTGGGACACTGTTGCTGGGGCTTTGGCTTT 39814389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 GGGCTGGGATCGGTACAGACCGTGTAAGCCCTGGGACACTGTTGCTGGGGCTTTGGCTTT 1226

 39814390 TACTCTGACTAAAATGGGAACCACCGAGGGCTTCTGAGCCGAGAGGCGACGTGATCTGTC 39814449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TACTCTGACTAAAATGGGAACCACCGAGGGCTTCTGAGCCGAGAGGCGACGTGATCTGTC 1286

 39814450 TCCTGATTTAAAAGCACGCCCTGGCTGCCAAGTTGAGAAGACTATGGGAAGATTTGGGTA 39814509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 TCCTGATTTAAAAGCACGCCCTGGCTGCCAAGTTGAGAAGACTATGGGAAGATTTGGGTA 1346

 39814510 GAAGCATGGGGGCCAAGCTGTGGCAACATCCCGGTGGGAGAGGATAGTGATCCTGACCGG 39814569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 GAAGCATGGGGGCCAAGCTGTGGCAACATCCCGGTGGGAGAGGATAGTGATCCTGACCGG 1406

 39814570 GTGCACGGTGGTGGTGAGAGATGGTCAGAGCCTGGATACATGTTGAAGTCAGTCAGTAGG 39814629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 GTGCACGGTGGTGGTGAGAGATGGTCAGAGCCTGGATACATGTTGAAGTCAGTCAGTAGG 1466

 39814630 ATTTCCTGACATTACCCAAAGCTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTCT 39814689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 ATTTCCTGACATTACCCAAAGCTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTCT 1526

 39814690 AATTGAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTAAA 39814749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 AATTGAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTAAA 1586

 39814750 GGATGCTAGATAAAAGAAATCTCAAGTCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTATAGTTC 39814809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 GGATGCTAGATAAAAGAAATCTCAAGTCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTATAGTTC 1646

 39814810 CAACAGTTTGAGAGGCAGAGATGGGAGTATGTTTTAAGGCCATGAGTTTGAGAGCAGCCT 39814869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 CAACAGTTTGAGAGGCAGAGATGGGAGTATGTTTTAAGGCCATGAGTTTGAGAGCAGCCT 1706

 39814870 GGGCAACATAGCAAGACCGCTCTACAAAAATAAAAGAAATAAATATAATAAAATAAATAT 39814929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 GGGCAACATAGCAAGACCGCTCTACAAAAATAAAAGAAATAAATATAATAAAATAAATAT 1766

 39814930 AGCCAAGCATGATGGTGTGTACCTGTGGCCCCACTTACTCAGGAGGCTGAGATGGGCAGA 39814989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 AGCCAAGCATGATGGTGTGTACCTGTGGCCCCACTTACTCAGGAGGCTGAGATGGGCAGA 1826

 39814990 TCTCTTGATTCTAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATATCAAGATTTCTCTCTCTAC 39815049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TCTCTTGATTCTAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATATCAAGATTTCTCTCTCTAC 1886

 39815050 AAAAATTGAAAGAAAAAAAAAAGCCTGACATGGTGGTACTTGCCTGTATTCCCAGGTATT 39815109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 AAAAATTGAAAGAAAAAAAAAAGCCTGACATGGTGGTACTTGCCTGTATTCCCAGGTATT 1946

 39815110 GGGGCAGCTGAGGCAGGAGCATCTCTTGAGCCCAGTTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCTATG 39815169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 GGGGCAGCTGAGGCAGGAGCATCTCTTGAGCCCAGTTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCTATG 2006

 39815170 ATTATACCACTGCACTCCATCCTGGGTGACAGAGTGGGACCCTGTCTCAAAATACAAATA 39815229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 ATTATACCACTGCACTCCATCCTGGGTGACAGAGTGGGACCCTGTCTCAAAATACAAATA 2066

 39815230 CAAATGAAATGAAATCTCAAGTCAGACCAGTCCCTTCTAGGCTATGTAGGCCTTGCAACC 39815289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 CAAATGAAATGAAATCTCAAGTCAGACCAGTCCCTTCTAGGCTATGTAGGCCTTGCAACC 2126

 39815290 ACATAGCTGTGTGATCTGGTTTGTGTGGCTGTGGATGAGGAAACCCCTGCCAATTGTTAT 39815349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 ACATAGCTGTGTGATCTGGTTTGTGTGGCTGTGGATGAGGAAACCCCTGCCAATTGTTAT 2186

 39815350 TGGCTATATAATCAGTTTATTTTTCAATATAGTAATCAAATATATTTCATCATATTTGAT 39815409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 TGGCTATATAATCAGTTTATTTTTCAATATAGTAATCAAATATATTTCATCATATTTGAT 2246

 39815410 GGTCTCAAATATGTGTGGGTTTTGGAATTCCCCTTGGAACAGGTTGTAACATCTTATTGG 39815469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 GGTCTCAAATATGTGTGGGTTTTGGAATTCCCCTTGGAACAGGTTGTAACATCTTATTGG 2306

 39815470 CTCCATCATTCCATAATTTTTTGAATCTGATCAGTTTTTAATAAGGTCAGAATTGATATT 39815529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 CTCCATCATTCCATAATTTTTTGAATCTGATCAGTTTTTAATAAGGTCAGAATTGATATT 2366

 39815530 AGACTACCTAATCAGTTTTTAATGAGAAAATGAAATTGTGTTGTTTGCACTTTATCCAAG 39815589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 AGACTACCTAATCAGTTTTTAATGAGAAAATGAAATTGTGTTGTTTGCACTTTATCCAAG 2426

 39815590 ATTGGTGTCATATTGGCTAAATCTAATCAATACTTGAACAAATGCAAAATTAGAGCTTCT 39815649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 ATTGGTGTCATATTGGCTAAATCTAATCAATACTTGAACAAATGCAAAATTAGAGCTTCT 2486

 39815650 TTATCATGAAACACTATGTCATTCTTTAAGAAGATGCCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAA 39815709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 TTATCATGAAACACTATGTCATTCTTTAAGAAGATGCCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAA 2546

 39815710 GATAGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATTTTGGCTCACTGC 39815769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 GATAGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATTTTGGCTCACTGC 2606

 39815770 AACCCTTGCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 39815829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 AACCCTTGCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 2666

 39815830 ACAGGTGCCCGCCACCCAGATGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGT 39815889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 ACAGGTGCCCGCCACCCAGATGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGT 2726

 39815890 TGGCCAGGCTCATCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAA 39815949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TGGCCAGGCTCATCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAA 2786

 39815950 TGCAGGGATTACAGACATGAGCTACCACTCCGGGCCTCCATTTCTTTTTTGTAGTCTTTA 39816009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TGCAGGGATTACAGACATGAGCTACCACTCCGGGCCTCCATTTCTTTTTTGTAGTCTTTA 2846

 39816010 ATAAACAGCTGCTATCGTTGCAGACTTGCTATTTAGGCACTTAGGAATTTTTCACTAGAA 39816069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 ATAAACAGCTGCTATCGTTGCAGACTTGCTATTTAGGCACTTAGGAATTTTTCACTAGAA 2906

 39816070 GGCGTGTAAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTACA 39816129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 GGCGTGTAAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTACA 2966

 39816130 TGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAA 39816189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAA 3026

 39816190 CTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTCT 39816249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 CTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTCT 3086

 39816250 CCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGTAATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTC 39816309
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 CCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGTGATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTC 3146

 39816310 AGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCACT 39816369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 AGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCACT 3206

 39816370 GTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGA 39816429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 GTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGA 3266

 39816430 CTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGAT 39816489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 CTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGAT 3326

 39816490 CTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCA 39816549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 CTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCA 3386

 39816550 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTAT 39816609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTAT 3446

 39816610 TATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATT 39816669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATT 3506

 39816670 GAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGT 39816729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 GAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGT 3566

 39816730 CACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTA 39816789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 CACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTA 3626

 39816790 CCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTT 39816849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 CCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTT 3686

 39816850 GTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGG 39816909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 GTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGG 3746

 39816910 CTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAAT 39816969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 CTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAAT 3806

 39816970 ATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGT 39817029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 ATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGT 3866

 39817030 TCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCT 39817089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 TCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCT 3926

 39817090 ATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATG 39817149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 ATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATG 3986

 39817150 CCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGC 39817209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 CCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGC 4046

 39817210 CACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCA 39817269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 CACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCA 4106

 39817270 GCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCA 39817329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 GCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCA 4166

 39817330 AGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAG 39817389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 AGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAG 4226

 39817390 AACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTC 39817449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 AACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTC 4286

 39817450 CAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGT 39817509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 CAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGT 4346

 39817510 CTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCA 39817569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 CTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCA 4406

 39817570 AAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCAT 39817629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 AAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCAT 4466

 39817630 GCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCT 39817689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 GCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCT 4526

 39817690 GGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCAC 39817749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 GGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCAC 4586

 39817750 CATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCA 39817809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 CATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCA 4646

 39817810 GTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCT 39817869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 GTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCT 4706

 39817870 AAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTG 39817929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 AAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTG 4766

 39817930 GTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGA 39817989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 GTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGA 4826

 39817990 TCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGC 39818049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 TCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGC 4886

 39818050 CACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCA 39818109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 CACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCA 4946

 39818110 CACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGG 39818169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 CACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGG 5006

 39818170 GATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGC 39818229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 GATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGC 5066

 39818230 AACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCT 39818289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 AACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCT 5126

 39818290 GCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACT 39818348
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     5127 GCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACT 5186

 39818349 TTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTT 39818408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 TTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTT 5246

 39818409 ACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTA 39818468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 ACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTA 5306

 39818469 GTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGC 39818528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5307 GTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGC 5366

 39818529 TCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGA 39818588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 TCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGA 5426

 39818589 GCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCC 39818648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5427 GCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCC 5486

 39818649 TTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGT 39818708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5487 TTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGT 5546

 39818709 CCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGT 39818768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5547 CCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGT 5606

 39818769 GAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAG 39818828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5607 GAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAG 5666

 39818829 GATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGT 39818888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 GATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGT 5726

 39818889 CACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCT 39818948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 CACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCT 5786

 39818949 CAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAA 39819008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5787 CAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAA 5846

 39819009 TTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAA 39819068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 TTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAA 5906

 39819069 CTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATG 39819128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 CTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATG 5966

 39819129 AGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAG 39819188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5967 AGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAG 6026

 39819189 AATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAG 39819248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6027 AATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAG 6086

 39819249 CTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGT 39819308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6087 CTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGT 6146

 39819309 GCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCA 39819368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6147 GCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCA 6206

 39819369 CCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACA 39819428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6207 CCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACA 6266

 39819429 CACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAAT 39819488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6267 CACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAAT 6326

 39819489 CTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGG 39819548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6327 CTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGG 6386

 39819549 AGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGA 39819608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6387 AGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGA 6446

 39819609 TATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGG 39819668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6447 TATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGG 6506

 39819669 CTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAA 39819728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6507 CTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAA 6566

 39819729 GGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGT 39819788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6567 GGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGT 6626

 39819789 GATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCT 39819848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6627 GATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCT 6686

 39819849 GTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGA 39819908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6687 GTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGA 6746

 39819909 GTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGG 39819968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6747 GTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGG 6806

 39819969 CGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGA 39820028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6807 CGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGA 6866

 39820029 GGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCT 39820088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6867 GGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCT 6926

 39820089 TTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCT 39820148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6927 TTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCT 6986

 39820149 TGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAG 39820208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6987 TGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAG 7046

 39820209 TAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGG 39820268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7047 TAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGG 7106

 39820269 TAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 39820328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7107 TAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 7166

 39820329 CTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTC 39820388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7167 CTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTC 7226

 39820389 TGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGC 39820448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7227 TGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGC 7286

 39820449 TGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAG 39820508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7287 TGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAG 7346

 39820509 GCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTG 39820568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7347 GCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTG 7406

 39820569 CCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCAC 39820628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7407 CCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCAC 7466

 39820629 CATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTG 39820688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7467 CATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTG 7526

 39820689 GTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 39820748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7527 GTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 7586

 39820749 CAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCCAAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTACATATAT 39820808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7587 CAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCCAAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTACATATAT 7646

 39820809 ATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAGGTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGC 39820868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7647 ATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAGGTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGC 7706

 39820869 ACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCTACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCC 39820928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7707 ACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCTACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCC 7766

 39820929 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAAGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTT 39820988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7767 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAAGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTT 7826

 39820989 GTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTTCCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAA 39821048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7827 GTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTTCCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAA 7886

 39821049 TTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTC 39821108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7887 TTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTC 7946

 39821109 TAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGTGTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGA 39821168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7947 TAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGTGTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGA 8006

 39821169 TGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAGACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTT 39821228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8007 TGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAGACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTT 8066

 39821229 ATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCTTGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGG 39821288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8067 ATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCTTGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGG 8126

 39821289 AAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAG 39821348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8127 AAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAG 8186

 39821349 CATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTGCTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTC 39821408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8187 CATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTGCTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTC 8246

 39821409 TGAAGAATGGCATGGGATGGATCCTTTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAG 39821468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8247 TGAAGAATGGCATGGGATGGATCCTTTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAG 8306

 39821469 GGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGCAGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAG 39821528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8307 GGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGCAGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAG 8366

 39821529 CCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCACCTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCAT 39821588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8367 CCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCACCTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCAT 8426

 39821589 TAGATTCTCATAGGAGCACAAACTCTGTTGTGAAGTGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGT 39821648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8427 TAGATTCTCATAGGAGCACAAACTCTGTTGTGAAGTGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGT 8486

 39821649 GTACTCCTTATGAGAATCTAATGCCTGATATTCTGTTACTGTTTCCCATCACCCCAGATG 39821708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8487 GTACTCCTTATGAGAATCTAATGCCTGATATTCTGTTACTGTTTCCCATCACCCCAGATG 8546

 39821709 GACAGTCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGAGATCCCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGT 39821768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8547 GACAGTCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGAGATCCCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGT 8606

 39821769 TGTAGAATCATTTCATTATATATTACTATGTAGTAATAATAGAAATAAAGTGCTCAATAT 39821828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8607 TGTAGAATCATTTCATTATATATTACTATGTAGTAATAATAGAAATAAAGTGCTCAATAT 8666

 39821829 ATGTATTGCACTTGAATCATCCTGAAATTATTCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTG 39821888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8667 ATGTATTGCACTTGAATCATCCTGAAATTATTCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTG 8726

 39821889 CCTTCCACATATTCACTCTGTTTTTTGGTACAGGCAAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCT 39821948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8727 CCTTCCACATATTCACTCTGTTTTTTGGTACAGGCAAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCT 8786

 39821949 GATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATATACCTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATT 39822008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8787 GATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATATACCTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATT 8846

 39822009 ACAGGCATAAACCACCACCCTCAACCAAGACTTTCTTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAG 39822068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8847 ACAGGCATAAACCACCACCCTCAACCAAGACTTTCTTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAG 8906

 39822069 ATTACTTGAGCCCATGTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCTGATTGCACCACTGCACTCCAGC 39822128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8907 ATTACTTGAGCCCATGTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCTGATTGCACCACTGCACTCCAGC 8966

 39822129 CTAGGT 39822134
          ||||||
     8967 CTAGGT 8972

Alignment time is 8.35051 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8523] =>      8523 nucs 'mol-32-1f0b-144236_8523'

Score:        8523
Aligned:      8523        nucs
Identic:      8523 (100%) nucs =>      2756 (100%)      5767 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39823147,39825902] EXCISED REGION [39825908,39831674]
 second seq =>  [       1,    2756] EXCISED REGION [    2757,    8523]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [39825903,39825907]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        36 nucs [39825903,39825938] to [39825908,39825943]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39823147 GGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCTGACACTACCTGGAGTTAGCACAGACCC 39823206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCTGACACTACCTGGAGTTAGCACAGACCC 60

 39823207 CACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCACTTCAGATGCCAATGGCAAGTCC 39823266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCACTTCAGATGCCAATGGCAAGTCC 120

 39823267 TAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAAATCGGGGGTTCCCATAACTGTCT 39823326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAAATCGGGGGTTCCCATAACTGTCT 180

 39823327 TCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAACTCAGAAAAACAGTTTATTTTCT 39823386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAACTCAGAAAAACAGTTTATTTTCT 240

 39823387 TTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAATGGTGCAGTCA 39823446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAATGGTGCAGTCA 300

 39823447 TAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAG 39823506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAG 360

 39823507 TAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCTAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 39823566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCTAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 420

 39823567 GTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACAACAAATTCCTGGTCTCAAGT 39823626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACAACAAATTCCTGGTCTCAAGT 480

 39823627 GATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCACCACATCTGG 39823686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCACCACATCTGG 540

 39823687 CCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGATACATCCCAGAAACAGTCAATGAA 39823746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGATACATCCCAGAAACAGTCAATGAA 600

 39823747 AGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCA 39823806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCA 660

 39823807 AGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAAAC 39823866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAAAC 720

 39823867 CTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGA 39823926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGA 780

 39823927 GTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCT 39823986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCT 840

 39823987 TAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCTGATC 39824046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCTGATC 900

 39824047 CTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCC 39824106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCC 960

 39824107 CATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAG 39824166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAG 1020

 39824167 TTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAAGATTGATAAA 39824226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAAGATTGATAAA 1080

 39824227 ATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGC 39824286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGC 1140

 39824287 ATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGTAATCAGCCCTCCTCTT 39824346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGTAATCAGCCCTCCTCTT 1200

 39824347 GAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACATCCCCAAATGCATTCT 39824406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACATCCCCAAATGCATTCT 1260

 39824407 TACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAGAAACCTGGGACCAAGA 39824466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAGAAACCTGGGACCAAGA 1320

 39824467 CCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTT 39824526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTT 1380

 39824527 AGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATATATTTCTTTTCTTTTTTTT 39824586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATATATTTCTTTTCTTTTTTTT 1440

 39824587 GAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTGTGATCATAGCTCACTA 39824646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTGTGATCATAGCTCACTA 1500

 39824647 TAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGAC 39824706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGAC 1560

 39824707 TACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCGGAGTTTCACCATGGTG 39824766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCGGAGTTTCACCATGGTG 1620

 39824767 GCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTGCCCAGGCTGGCCACAAAT 39824826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTGCCCAGGCTGGCCACAAAT 1680

 39824827 TCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGATGAGATTTAGTTATGTTGT 39824886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGATGAGATTTAGTTATGTTGT 1740

 39824887 CCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCACCTCAGCCTCTCAAGTAGC 39824946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCACCTCAGCCTCTCAAGTAGC 1800

 39824947 TGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTATTTTTATTTTTTTCTAGAG 39825006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTATTTTTATTTTTTTCTAGAG 1860

 39825007 GTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCGGGCCTCAAGTGTTCCTCC 39825066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCGGGCCTCAAGTGTTCCTCC 1920

 39825067 TGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCACCATGCCCAGCAATCACA 39825126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCACCATGCCCAGCAATCACA 1980

 39825127 AGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAATTGGAGCAGGAGATGTGG 39825186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAATTGGAGCAGGAGATGTGG 2040

 39825187 TGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGAT 39825246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGAT 2100

 39825247 GGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGG 39825306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGG 2160

 39825307 GAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAA 39825366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAA 2220

 39825367 TAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTA 39825426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTA 2280

 39825427 AGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAA 39825486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAA 2340

 39825487 GCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATC 39825546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATC 2400

 39825547 ACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAA 39825606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAA 2460

 39825607 AAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGC 39825666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGC 2520

 39825667 CGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAA 39825726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAA 2580

 39825727 CCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCC 39825786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCC 2640

 39825787 AGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 39825846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 2700

 39825847 AGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 39825902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 2756

EXCISED REGION

 39825908 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 39825967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 2816

 39825968 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 39826027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 2876

 39826028 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 39826087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 2936

 39826088 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 39826147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 2996

 39826148 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 39826207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 3056

 39826208 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 39826267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 3116

 39826268 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 39826327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 3176

 39826328 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 39826387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 3236

 39826388 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 39826447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 3296

 39826448 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 39826507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 3356

 39826508 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 39826567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 3416

 39826568 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 39826627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 3476

 39826628 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 39826687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 3536

 39826688 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 39826747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 3596

 39826748 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 39826807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 3656

 39826808 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 39826867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 3716

 39826868 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATC 39826927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATC 3776

 39826928 TTTTAAGGGCAAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAA 39826987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TTTTAAGGGCAAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAA 3836

 39826988 AATATTTTTCAAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAG 39827047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 AATATTTTTCAAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAG 3896

 39827048 CTACTCAGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGG 39827107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 CTACTCAGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGG 3956

 39827108 CAACATAGCAAGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCA 39827167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 CAACATAGCAAGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCA 4016

 39827168 CTCAGCTGTACTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGG 39827227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CTCAGCTGTACTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGG 4076

 39827228 TCGAGGCTGCAGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGA 39827287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 TCGAGGCTGCAGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGA 4136

 39827288 CCTGTCTCAAATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTT 39827347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 CCTGTCTCAAATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTT 4196

 39827348 TGGCTCTGCAGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGA 39827407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TGGCTCTGCAGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGA 4256

 39827408 GGAGACCCCTGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCG 39827467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 GGAGACCCCTGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCG 4316

 39827468 GGGTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGA 39827527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 GGGTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGA 4376

 39827528 TCACCTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTA 39827587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 TCACCTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTA 4436

 39827588 AGAAAATACAATAATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA 39827647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 AGAAAATACAATAATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA 4496

 39827648 GGCTGAGGTAGGAAAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATT 39827707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 GGCTGAGGTAGGAAAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATT 4556

 39827708 GCGCCACTTCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGT 39827767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 GCGCCACTTCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGT 4616

 39827768 ATTATATCAACATGTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAA 39827827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 ATTATATCAACATGTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAA 4676

 39827828 ATCTTCTATTATATTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAA 39827887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 ATCTTCTATTATATTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAA 4736

 39827888 TTTTTGTCTTATTTTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGAT 39827947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TTTTTGTCTTATTTTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGAT 4796

 39827948 CTTCAATAAAGTTAAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAG 39828007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 CTTCAATAAAGTTAAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAG 4856

 39828008 TTTAGAAATATTCAGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTG 39828067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TTTAGAAATATTCAGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTG 4916

 39828068 TTTTTTATTTTAGGAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTA 39828127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 TTTTTTATTTTAGGAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTA 4976

 39828128 TCACAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGA 39828187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 TCACAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGA 5036

 39828188 GTAGCTGGGACTGTAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGA 39828247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 GTAGCTGGGACTGTAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGA 5096

 39828248 CATGGGGTCTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTC 39828307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 CATGGGGTCTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTC 5156

 39828308 CACCCCTGCCTCCCATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCT 39828367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CACCCCTGCCTCCCATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCT 5216

 39828368 AAAAAAAAAATTTCTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAG 39828427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 AAAAAAAAAATTTCTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAG 5276

 39828428 AATAAGTTAAAATGACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTAT 39828487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 AATAAGTTAAAATGACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTAT 5336

 39828488 ATACATTCCTTACAAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACAC 39828547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 ATACATTCCTTACAAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACAC 5396

 39828548 ACACTGTACAATATTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGA 39828607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 ACACTGTACAATATTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGA 5456

 39828608 GTGTCGCTACCAGTATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACT 39828667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 GTGTCGCTACCAGTATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACT 5516

 39828668 TCTCTCCAAGGTATGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTT 39828727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TCTCTCCAAGGTATGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTT 5576

 39828728 CCTATTAAACATGTAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTT 39828787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CCTATTAAACATGTAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTT 5636

 39828788 GCATTTTCCTTACTTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACC 39828847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GCATTTTCCTTACTTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACC 5696

 39828848 ATTTGCTTTATTAATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACA 39828907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 ATTTGCTTTATTAATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACA 5756

 39828908 ATTTCTAACCTGTTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTG 39828967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 ATTTCTAACCTGTTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTG 5816

 39828968 TCCAAGGCTGGAGTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTG 39829027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TCCAAGGCTGGAGTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTG 5876

 39829028 AAGCGATCCTCCCATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGC 39829087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 AAGCGATCCTCCCATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGC 5936

 39829088 CCAACTAATATTTGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGA 39829147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CCAACTAATATTTGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGA 5996

 39829148 GTAAGCATGGATTTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAG 39829207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 GTAAGCATGGATTTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAG 6056

 39829208 GGAGGACTGTATATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGA 39829267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GGAGGACTGTATATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGA 6116

 39829268 AAATAATAATTTTTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCA 39829327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 AAATAATAATTTTTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCA 6176

 39829328 GGTGTGGTGGCTCACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCT 39829387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 GGTGTGGTGGCTCACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCT 6236

 39829388 TGAGGCCAAGAGTTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAA 39829447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TGAGGCCAAGAGTTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAA 6296

 39829448 ATATATGAATTAGCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 39829507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 ATATATGAATTAGCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 6356

 39829508 AGCTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCT 39829567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 AGCTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCT 6416

 39829568 CTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAG 39829627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 CTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAG 6476

 39829628 CTAACATCAACTGACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAAC 39829687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 CTAACATCAACTGACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAAC 6536

 39829688 TTTCTTATTTCACTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTA 39829747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TTTCTTATTTCACTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTA 6596

 39829748 CAGATGACCTTTTGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATG 39829807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 CAGATGACCTTTTGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATG 6656

 39829808 GCGAATGGACATTGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGC 39829867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 GCGAATGGACATTGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGC 6716

 39829868 TATAATCTTAGCACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAG 39829927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 TATAATCTTAGCACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAG 6776

 39829928 GAGGCAGTATGGCAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTT 39829987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GAGGCAGTATGGCAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTT 6836

 39829988 TACCCTGGAAGGCTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTT 39830047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 TACCCTGGAAGGCTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTT 6896

 39830048 CACTGCACCTTTGCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTA 39830107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 CACTGCACCTTTGCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTA 6956

 39830108 AATAGATAAAAGACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTA 39830167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 AATAGATAAAAGACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTA 7016

 39830168 TTAGCTCTATTTCTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGG 39830227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 TTAGCTCTATTTCTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGG 7076

 39830228 TCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGAC 39830287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGAC 7136

 39830288 CTCCCAGGCTCAAACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTC 39830347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 CTCCCAGGCTCAAACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTC 7196

 39830348 CCAGCTAATTTTTTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGG 39830407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 CCAGCTAATTTTTTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGG 7256

 39830408 TCTCTAGCTCCTGGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTC 39830467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 TCTCTAGCTCCTGGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTC 7316

 39830468 AGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACT 39830527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 AGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACT 7376

 39830528 TTGTGCTAGCCAATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATT 39830587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 TTGTGCTAGCCAATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATT 7436

 39830588 AAATTTTACCACTTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATA 39830647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 AAATTTTACCACTTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATA 7496

 39830648 TGTTAGGAAGGGTCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTT 39830707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 TGTTAGGAAGGGTCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTT 7556

 39830708 TCCCAGGGGGCAGTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGG 39830767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 TCCCAGGGGGCAGTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGG 7616

 39830768 AAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTG 39830827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 AAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTG 7676

 39830828 AGGCACATGCCTTGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGG 39830887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 AGGCACATGCCTTGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGG 7736

 39830888 GAAGGGTCGTTTTGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTA 39830947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 GAAGGGTCGTTTTGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTA 7796

 39830948 AGGAGCCACACAGCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGT 39831007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 AGGAGCCACACAGCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGT 7856

 39831008 ATTTACAACCACTCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCA 39831067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 ATTTACAACCACTCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCA 7916

 39831068 GTAGCATTAGATTCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCT 39831127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 GTAGCATTAGATTCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCT 7976

 39831128 AGGTTGCGCTGTCCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACG 39831187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 AGGTTGCGCTGTCCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACG 8036

 39831188 CTCAGGTGGGACCATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATT 39831247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 CTCAGGTGGGACCATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATT 8096

 39831248 ATGGTGAGTTCTATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCC 39831307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 ATGGTGAGTTCTATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCC 8156

 39831308 TAATAAATGTAATCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCA 39831367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 TAATAAATGTAATCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCA 8216

 39831368 GGCCCAGAACTTTCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTAT 39831427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 GGCCCAGAACTTTCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTAT 8276

 39831428 TTAGGCCCATACCCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGC 39831487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 TTAGGCCCATACCCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGC 8336

 39831488 CTCCACAGGCACAGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAG 39831547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 CTCCACAGGCACAGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAG 8396

 39831548 CCTTCTCTCTAGGCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCT 39831607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 CCTTCTCTCTAGGCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCT 8456

 39831608 TGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCAT 39831667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8457 TGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCAT 8516

 39831668 CAAGTCG 39831674
          |||||||
     8517 CAAGTCG 8523

Alignment time is 7.53649 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5852] =>      5852 nucs 'mol-32-1f63-163116_5852'

Score:        5851
Aligned:      5851        nucs
Identic:      5851 (100%) nucs =>      4046 (100%)      1805 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818370,39822415] EXCISED REGION [39822417,39824221]
 second seq =>  [       1,    4046] EXCISED REGION [    4048,    5852]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39822416,39822416]
 second seq =>         1 nucs [4047,4047]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818370 TGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGG 39818429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGG 60

 39818430 GATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGC 39818489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGC 120

 39818490 CACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTC 39818549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTC 180

 39818550 TCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTAC 39818609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTAC 240

 39818610 CCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTT 39818669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTT 300

 39818670 CCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACA 39818729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACA 360

 39818730 GAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTT 39818789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTT 420

 39818790 TACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCC 39818849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCC 480

 39818850 AATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTG 39818909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTG 540

 39818910 GTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAG 39818969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAG 600

 39818970 TCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTA 39819029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTA 660

 39819030 GAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTT 39819089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTT 720

 39819090 CCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTC 39819149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTC 780

 39819150 TGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGC 39819209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGC 840

 39819210 TCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAAT 39819269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAAT 900

 39819270 TTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGA 39819329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGA 960

 39819330 GCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGT 39819389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGT 1020

 39819390 ACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCAT 39819449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCAT 1080

 39819450 TCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTT 39819509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTT 1140

 39819510 CCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGA 39819569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGA 1200

 39819570 GAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTC 39819629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTC 1260

 39819630 CCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAG 39819689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAG 1320

 39819690 GTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTG 39819749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTG 1380

 39819750 TTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACA 39819809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACA 1440

 39819810 TGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGA 39819869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGA 1500

 39819870 GCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAA 39819929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAA 1560

 39819930 ACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGT 39819989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGT 1620

 39819990 TAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGA 39820049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGA 1680

 39820050 AGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTC 39820109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTC 1740

 39820110 TCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACT 39820169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACT 1800

 39820170 TCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGC 39820229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGC 1860

 39820230 ACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATG 39820289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATG 1920

 39820290 TTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAA 39820349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAA 1980

 39820350 TTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAG 39820409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAG 2040

 39820410 AGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAAT 39820469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAAT 2100

 39820470 ACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAG 39820529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAG 2160

 39820530 TGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCT 39820589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCT 2220

 39820590 GCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTAT 39820649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTAT 2280

 39820650 TTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAG 39820709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAG 2340

 39820710 GTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCT 39820769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCT 2400

 39820770 GGCCAAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATA 39820829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGCCAAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATA 2460

 39820830 CCAGGTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGC 39820889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCAGGTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGC 2520

 39820890 CTCTACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 39820949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTCTACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 2580

 39820950 GGTAAGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCAT 39821009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTAAGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCAT 2640

 39821010 GTTTCCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCA 39821069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTTCCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCA 2700

 39821070 AAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGT 39821129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGT 2760

 39821130 TTGTGTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAG 39821189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGTGTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAG 2820

 39821190 ATAGACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGC 39821249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATAGACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGC 2880

 39821250 TCCTTGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCA 39821309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCTTGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCA 2940

 39821310 AGCTACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGG 39821369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGCTACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGG 3000

 39821370 GGTGCTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGA 39821429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGTGCTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGA 3060

 39821430 TCCTTTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAG 39821489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCCTTTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAG 3120

 39821490 CAGCAGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGA 39821549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAGCAGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGA 3180

 39821550 CCACCTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAA 39821609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCACCTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAA 3240

 39821610 ACTCTGTTGTGAAGTGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGTGTACTCCTTATGAGAATCTAA 39821669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACTCTGTTGTGAAGTGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGTGTACTCCTTATGAGAATCTAA 3300

 39821670 TGCCTGATATTCTGTTACTGTTTCCCATCACCCCAGATGGACAGTCTAGTTGCAGGAAAA 39821729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGCCTGATATTCTGTTACTGTTTCCCATCACCCCAGATGGACAGTCTAGTTGCAGGAAAA 3360

 39821730 CAAGCTCAGAGATCCCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGTTGTAGAATCATTTCATTATAT 39821789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAAGCTCAGAGATCCCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGTTGTAGAATCATTTCATTATAT 3420

 39821790 ATTACTATGTAGTAATAATAGAAATAAAGTGCTCAATATATGTATTGCACTTGAATCATC 39821849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTACTATGTAGTAATAATAGAAATAAAGTGCTCAATATATGTATTGCACTTGAATCATC 3480

 39821850 CTGAAATTATTCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTGCCTTCCACATATTCACTCTGT 39821909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTGAAATTATTCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTGCCTTCCACATATTCACTCTGT 3540

 39821910 TTTTTGGTACAGGCAAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCA 39821969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTTTGGTACAGGCAAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCA 3600

 39821970 AGTAATATACCTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATAAACCACCACCCT 39822029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGTAATATACCTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATAAACCACCACCCT 3660

 39822030 CAACCAAGACTTTCTTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAGATTACTTGAGCCCATGTGGTC 39822089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAACCAAGACTTTCTTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAGATTACTTGAGCCCATGTGGTC 3720

 39822090 AAGGCTGCAGTGAGCCTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAATGAGACTG 39822149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGGCTGCAGTGAGCCTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAATGAGACTG 3780

 39822150 TCTCAAAAAATAAAATAAAATACAAATGAACCCTTTATGACATTGCCAGTAACTTTCCCT 39822209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCTCAAAAAATAAAATAAAATACAAATGAACCCTTTATGACATTGCCAGTAACTTTCCCT 3840

 39822210 CCTAAGTGTTCCCCACAAGTCTTTGAATTCTGTTTAATTTTCACATAACATTTAAGACGT 39822269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCTAAGTGTTCCCCACAAGTCTTTGAATTCTGTTTAATTTTCACATAACATTTAAGACGT 3900

 39822270 TTAAGAACTTATGTCTGTCTGTGTCATCCCTTTATGTCAAAAGATGCCTTTTTGTCACTT 39822329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTAAGAACTTATGTCTGTCTGTGTCATCCCTTTATGTCAAAAGATGCCTTTTTGTCACTT 3960

 39822330 CCAGCTGGATCTACCATGAAAGACTTCTGAATCCAGGAAGAGAGACTGACTGGGCAACAT 39822389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCAGCTGGATCTACCATGAAAGACTTCTGAATCCAGGAAGAGAGACTGACTGGGCAACAT 4020

 39822390 GTTATTCAGGTACAAAAAGATTTGGA 39822415
          ||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTTATTCAGGTACAAAAAGATTTGGA 4046

EXCISED REGION

 39822417 TGTAACTCAAAAATGATCAAATAATAGTGCATGCATCAAGTGCAATGGGAAGCTCTTCGG 39822476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TGTAACTCAAAAATGATCAAATAATAGTGCATGCATCAAGTGCAATGGGAAGCTCTTCGG 4107

 39822477 GAGAGTGAGAGAAGCTTCCAGTTAAGGTGACATTGAAGCCAAGTCCTGAAAGATGAGGAA 39822536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 GAGAGTGAGAGAAGCTTCCAGTTAAGGTGACATTGAAGCCAAGTCCTGAAAGATGAGGAA 4167

 39822537 GAGTTGTATGAGAGTGGGGAGGAAAGGGGGAGGTGGAGGGATGGGGAATGGGCTGGGATG 39822596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 GAGTTGTATGAGAGTGGGGAGGAAAGGGGGAGGTGGAGGGATGGGGAATGGGCTGGGATG 4227

 39822597 GGATGGAGCAAACTGCCCGGGAAGGGAAACCAGCACTGTACAGACCTGAACAACGAAGAT 39822656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 GGATGGAGCAAACTGCCCGGGAAGGGAAACCAGCACTGTACAGACCTGAACAACGAAGAT 4287

 39822657 GGCATATTTTGTTCACGGAACGGTGAATTAAGTGTGGCAGGAATGCTTTGTAGAGACAGT 39822716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 GGCATATTTTGTTCACGGAACGGTGAATTAAGTGTGGCAGGAATGCTTTGTAGAGACAGT 4347

 39822717 AAGTTGCTTGTATGGAATTTTGCCCAAGAGACCTCATTGCAGTTTCTGATTTTTTGATGT 39822776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 AAGTTGCTTGTATGGAATTTTGCCCAAGAGACCTCATTGCAGTTTCTGATTTTTTGATGT 4407

 39822777 CATCATCCATCACTGTCCTTGTCAAATAGTTTGGAATAGGTATAATGATCACAATAACCC 39822836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 CATCATCCATCACTGTCCTTGTCAAATAGTTTGGAATAGGTATAATGATCACAATAACCC 4467

 39822837 CAAGCATAATATTTCATTAATTCTCACAGAATCACAGGTAGGTGCCACAGTTATCCCCAT 39822896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 CAAGCATAATATTTCATTAATTCTCACAGAATCACAGGTAGGTGCCACAGTTATCCCCAT 4527

 39822897 TTTATGAATGGAGTGATGAAGCCTTAGGAATAATGAATGATTTGCCCAAGCTCACCTGGA 39822956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 TTTATGAATGGAGTGATGAAGCCTTAGGAATAATGAATGATTTGCCCAAGCTCACCTGGA 4587

 39822957 TATTAAGACTGAGTCAAATGTTGGGTCTGGTCTGACTTTAATGTTTGCTTTGTTCATGAG 39823016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 TATTAAGACTGAGTCAAATGTTGGGTCTGGTCTGACTTTAATGTTTGCTTTGTTCATGAG 4647

 39823017 CACCACGTATTGCCTCTCCTATGCAGTTAAGCAGGTAGACAAGTGACAGAAAAGCCCATG 39823076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 CACCACGTATTGCCTCTCCTATGCAGTTAAGCAGGTAGACAAGTGACAGAAAAGCCCATG 4707

 39823077 TTTGTCTCTACTCACACACTTCCGACTGAATGTATGTATGGAGTTTCTACACCAAATTCT 39823136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 TTTGTCTCTACTCACACACTTCCGACTGAATGTATGTATGGAGTTTCTACACCAAATTCT 4767

 39823137 TCAGTGCTCTGGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCTGACACTACCTGGAGTTA 39823196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TCAGTGCTCTGGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCTGACACTACCTGGAGTTA 4827

 39823197 GCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCACTTCAGATGCCAA 39823256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 GCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCACTTCAGATGCCAA 4887

 39823257 TGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAAATCGGGGGTTCCC 39823316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 TGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAAATCGGGGGTTCCC 4947

 39823317 ATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAACTCAGAAAAACAG 39823376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 ATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAACTCAGAAAAACAG 5007

 39823377 TTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAAT 39823436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 TTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAAT 5067

 39823437 GGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTCTCCCACCTCA 39823496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 GGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTCTCCCACCTCA 5127

 39823497 GCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCTAGTTTCTTTTTTT 39823556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 GCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCTAGTTTCTTTTTTT 5187

 39823557 TTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACAACAAATTCCT 39823616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 TTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACAACAAATTCCT 5247

 39823617 GGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCA 39823676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 GGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCA 5307

 39823677 CCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGATACATCCCAGAAAC 39823736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 CCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGATACATCCCAGAAAC 5367

 39823737 AGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTT 39823796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 AGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTT 5427

 39823797 TGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACA 39823856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 TGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACA 5487

 39823857 TGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTG 39823916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 TGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTG 5547

 39823917 TGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGAC 39823976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 TGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGAC 5607

 39823977 TGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAA 39824036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 TGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAA 5667

 39824037 GAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGC 39824096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 GAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGC 5727

 39824097 ACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCA 39824156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 ACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCA 5787

 39824157 ACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAA 39824216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 ACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAA 5847

 39824217 GATTG 39824221
          |||||
     5848 GATTG 5852

Alignment time is 5.36863 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2021] =>      2021 nucs 'mol-32-2399-007258_2021'

Score:        2021
Aligned:      2021        nucs
Identic:      2021 (100%) nucs =>      1485 (100%)       536 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818613,39820097] EXCISED REGION [39825202,39825737]
 second seq =>  [       1,    1485] EXCISED REGION [    1486,    2021]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818613 GCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCT 39818672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCT 60

 39818673 AATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAA 39818732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAA 120

 39818733 ATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTAC 39818792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTAC 180

 39818793 TCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAAT 39818852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAAT 240

 39818853 GTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTC 39818912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTC 300

 39818913 CAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCT 39818972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCT 360

 39818973 TCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAG 39819032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAG 420

 39819033 ATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCT 39819092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCT 480

 39819093 GCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGG 39819152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGG 540

 39819153 TTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCT 39819212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCT 600

 39819213 CCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTT 39819272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTT 660

 39819273 ATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCA 39819332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCA 720

 39819333 ATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACT 39819392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACT 780

 39819393 GAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCA 39819452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCA 840

 39819453 TGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCA 39819512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCA 900

 39819513 TGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAG 39819572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAG 960

 39819573 TAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCA 39819632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCA 1020

 39819633 GAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTG 39819692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTG 1080

 39819693 AAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTA 39819752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTA 1140

 39819753 AGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGA 39819812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGA 1200

 39819813 TGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCA 39819872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCA 1260

 39819873 GATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACA 39819932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACA 1320

 39819933 GAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAA 39819992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAA 1380

 39819993 AGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGA 39820052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGA 1440

 39820053 GGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 1485

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1545

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1605

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1665

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1725

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 1785

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 1845

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 1905

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 1965

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTA 39825737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTA 2021

Alignment time is 1.85694 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4848] =>      4848 nucs 'mol-32-2b55-117276_4848'

Score:        4780
Aligned:      4867        nucs
Identic:      4846 (100%) nucs =>      3995 (100%)       851 ( 98%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39816097,39820097] EXCISED REGION [39825202,39826067]
 second seq =>  [       1,    3997] EXCISED REGION [    3998,    4848]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39816097 TGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTACATGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTAC 39816156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTACATGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTAC 60

 39816157 TAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAACTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCG 39816216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAACTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCG 120

 39816217 TTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTCTCCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGT 39816276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTCTCCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGT 180

 39816277 AATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCA 39816336
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCA 240

 39816337 GGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCACTGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCA 39816396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCACTGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCA 300

 39816397 GTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGC 39816456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGC 360

 39816457 TAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGATCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCA 39816516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGATCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCA 420

 39816517 AAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 39816576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 480

 39816577 AGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAA 39816636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAA 540

 39816637 AATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATTGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGA 39816696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATTGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGA 600

 39816697 TTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGT 39816756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGT 660

 39816757 AGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGC 39816816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGC 720

 39816817 CCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGAC 39816876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGAC 780

 39816877 AAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTT 39816936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTT 840

 39816937 TCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCC 39816996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCC 900

 39816997 ATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGT 39817056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGT 960

 39817057 TTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTG 39817116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTG 1020

 39817117 TGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTAT 39817176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTAT 1080

 39817177 GATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACC 39817236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACC 1140

 39817237 AGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGA 39817296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGA 1200

 39817297 ATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAA 39817356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAA 1260

 39817357 AAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGA 39817416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGA 1320

 39817417 TTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATT 39817476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATT 1380

 39817477 TTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCA 39817536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCA 1440

 39817537 TCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCT 39817596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCT 1500

 39817597 GAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATT 39817656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATT 1560

 39817657 TTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGC 39817716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGC 1620

 39817717 CTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTC 39817776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTC 1680

 39817777 ATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATA 39817836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATA 1740

 39817837 GGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGG 39817896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGG 1800

 39817897 AGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCA 39817956
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1801 AGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTTT-AAGATAGAGTCTCA 1859

 39817957 CTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCA 39818016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCA 1919

 39818017 GCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATT 39818076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATT 1979

 39818077 TTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGG 39818136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGG 2039

 39818137 TGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCA 39818196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCA 2099

 39818197 GCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGA 39818256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGA 2159

 39818257 ATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCT 39818316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCT 2219

 39818317 CTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACC 39818376
          ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---ACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACC 2276

 39818377 CAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAG 39818436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAG 2336

 39818437 TGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAG 39818496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAG 2396

 39818497 GTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTT 39818556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTT 2456

 39818557 GGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCT 39818616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCT 2516

 39818617 ATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATT 39818676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATT 2576

 39818677 GCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGA 39818736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGA 2636

 39818737 GGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCAT 39818796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCAT 2696

 39818797 TTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCC 39818856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCC 2756

 39818857 TTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAAT 39818916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAAT 2816

 39818917 CATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCC 39818976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCC 2876

 39818977 AGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGG 39819036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 AGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGG 2936

 39819037 GGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCT 39819096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCT 2996

 39819097 TGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCT 39819156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCT 3056

 39819157 TAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTA 39819216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTA 3116

 39819217 GATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCT 39819276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 GATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCT 3176

 39819277 GCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTA 39819336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 GCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTA 3236

 39819337 GTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGC 39819396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGC 3296

 39819397 TAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGG 39819456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGG 3356

 39819457 AGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAG 39819516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAG 3416

 39819517 GAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGA 39819576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGA 3476

 39819577 GGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGG 39819636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGG 3536

 39819637 AGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAAT 39819696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAAT 3596

 39819697 GGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGA 39819756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGA 3656

 39819757 GTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAG 39819816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAG 3716

 39819817 ATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATG 39819876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 ATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATG 3776

 39819877 GCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAG 39819936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAG 3836

 39819937 AAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGAT 39819996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 AAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGAT 3896

 39819997 ACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAG 39820056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 ACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAG 3956

 39820057 ATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 ATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 3997

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 4057

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 4117

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 4177

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 4237

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 4297

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 4357

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 4417

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 4477

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 4537

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 4597

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 4657

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     4658 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 4702

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4703 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 4762

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4763 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 4822

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCAC 39826067
          ||||||||||||||||||||||||||
     4823 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCAC 4848

Alignment time is 4.48166 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2148] =>      2148 nucs 'mol-32-2b55-139705_2148'

Score:        2121
Aligned:      2121        nucs
Identic:      2121 (100%) nucs =>      1605 (100%)       516 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818493,39820097] EXCISED REGION [39825202,39825717]
 second seq =>  [      28,    1632] EXCISED REGION [    1633,    2148]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818493 CCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCA 39818552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       28 CCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCA 87

 39818553 CCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCT 39818612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       88 CCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCT 147

 39818613 GCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCT 39818672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      148 GCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCT 207

 39818673 AATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAA 39818732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      208 AATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAA 267

 39818733 ATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTAC 39818792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      268 ATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTAC 327

 39818793 TCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAAT 39818852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      328 TCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAAT 387

 39818853 GTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTC 39818912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 GTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTC 447

 39818913 CAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCT 39818972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      448 CAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCT 507

 39818973 TCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAG 39819032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      508 TCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAG 567

 39819033 ATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCT 39819092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 ATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCT 627

 39819093 GCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGG 39819152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 GCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGG 687

 39819153 TTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCT 39819212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 TTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCT 747

 39819213 CCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTT 39819272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 CCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTT 807

 39819273 ATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCA 39819332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 ATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCA 867

 39819333 ATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACT 39819392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 ATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACT 927

 39819393 GAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCA 39819452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 GAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCA 987

 39819453 TGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCA 39819512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 TGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCA 1047

 39819513 TGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAG 39819572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 TGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAG 1107

 39819573 TAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCA 39819632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 TAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCA 1167

 39819633 GAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTG 39819692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 GAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTG 1227

 39819693 AAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTA 39819752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 AAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTA 1287

 39819753 AGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGA 39819812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGA 1347

 39819813 TGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCA 39819872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 TGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCA 1407

 39819873 GATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACA 39819932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 GATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACA 1467

 39819933 GAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAA 39819992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 GAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAA 1527

 39819993 AGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGA 39820052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 AGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGA 1587

 39820053 GGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 GGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 1632

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1692

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1752

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1812

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1872

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 1932

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 1992

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 2052

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 2112

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAAC 39825717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAAC 2148

Alignment time is 1.98428 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3734] =>      3734 nucs 'mol-32-2dff-032625_3734'

Score:        3713
Aligned:      3735        nucs
Identic:      3733 (100%) nucs =>      2714 (100%)      1019 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39823187,39825902] EXCISED REGION [39825908,39826926]
 second seq =>  [       1,    2715] EXCISED REGION [    2716,    3734]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [39825903,39825907]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        36 nucs [39825903,39825938] to [39825908,39825943]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39823187 CCTGGAGTTAGCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCACTT 39823246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGGAGTTAGCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCACTT 60

 39823247 CAGATGCCAATGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAAATC 39823306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGATGCCAATGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAAATC 120

 39823307 GGGGGTTCCCATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAACTC 39823366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGGTTCCCATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAACTC 180

 39823367 AGAAAAACAGTTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCT 39823426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAAAACAGTTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCT 240

 39823427 GGTGTGCAATGGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTC 39823486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTGTGCAATGGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTC 300

 39823487 TCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCTAGT 39823546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCTAGT 360

 39823547 TTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACA 39823606
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTTTTTTTTTTTTTTT-GTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACA 419

 39823607 ACAAATTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAG 39823666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 ACAAATTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAG 479

 39823667 ATGTCAGCCACCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGATACA 39823726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 ATGTCAGCCACCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGATACA 539

 39823727 TCCCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAAT 39823786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TCCCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAAT 599

 39823787 CTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGC 39823846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGC 659

 39823847 CTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAG 39823906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAG 719

 39823907 TGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTG 39823966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTG 779

 39823967 AGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGC 39824026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGC 839

 39824027 TTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGT 39824086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGT 899

 39824087 TCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCT 39824146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCT 959

 39824147 GTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATT 39824206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATT 1019

 39824207 ATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTC 39824266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTC 1079

 39824267 TTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCA 39824326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCA 1139

 39824327 TGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAAC 39824386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAAC 1199

 39824387 AACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTG 39824446
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGGGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTG 1259

 39824447 TTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCA 39824506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCA 1319

 39824507 CTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATAT 39824566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATAT 1379

 39824567 ATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGT 39824626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGT 1439

 39824627 CTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCA 39824686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCA 1499

 39824687 ACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGA 39824746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGA 1559

 39824747 GTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGT 39824806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGT 1619

 39824807 TGCCCAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAG 39824866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGCCCAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAG 1679

 39824867 ATGAGATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTC 39824926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATGAGATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTC 1739

 39824927 ACCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTT 39824986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ACCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTT 1799

 39824987 ATTTTTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTT 39825046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATTTTTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTT 1859

 39825047 CGGGCCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGC 39825106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CGGGCCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGC 1919

 39825107 CACCATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAG 39825166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CACCATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAG 1979

 39825167 AATTGGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCT 39825226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AATTGGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCT 2039

 39825227 TCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCT 39825286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCT 2099

 39825287 AGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGA 39825346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGA 2159

 39825347 CACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGAT 39825406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGAT 2219

 39825407 GGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAG 39825466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAG 2279

 39825467 CAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTA 39825526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTA 2339

 39825527 GGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAG 39825586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAG 2399

 39825587 TAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTA 39825646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTA 2459

 39825647 ATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCA 39825706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCA 2519

 39825707 GCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGG 39825766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGG 2579

 39825767 TGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCT 39825826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCT 2639

 39825827 GGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAG 39825886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAG 2699

 39825887 AGTGAAACTCTGTCTC 39825902
          ||||||||||||||||
     2700 AGTGAAACTCTGTCTC 2715

EXCISED REGION

 39825908 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 39825967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 2775

 39825968 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 39826027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 2835

 39826028 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 39826087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 2895

 39826088 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 39826147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 2955

 39826148 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 39826207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 3015

 39826208 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 39826267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 3075

 39826268 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 39826327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 3135

 39826328 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 39826387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 3195

 39826388 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 39826447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 3255

 39826448 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 39826507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 3315

 39826508 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 39826567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 3375

 39826568 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 39826627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 3435

 39826628 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 39826687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 3495

 39826688 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 39826747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 3555

 39826748 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 39826807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 3615

 39826808 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 39826867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 3675

 39826868 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTAT 39826926
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTAT 3734

Alignment time is 3.4378 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6529] =>      6529 nucs 'mol-32-2e20-179971_6529'

Score:        6529
Aligned:      6529        nucs
Identic:      6529 (100%) nucs =>      2174 (100%)      4355 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39823729,39825902] EXCISED REGION [39825908,39830262]
 second seq =>  [       1,    2174] EXCISED REGION [    2175,    6529]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [39825903,39825907]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        36 nucs [39825903,39825938] to [39825908,39825943]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39823729 CCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCT 39823788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCT 60

 39823789 CAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 39823848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 120

 39823849 GGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTG 39823908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTG 180

 39823909 TGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAG 39823968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAG 240

 39823969 CTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTT 39824028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTT 300

 39824029 GGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTC 39824088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTC 360

 39824089 GGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGT 39824148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGT 420

 39824149 GTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTAT 39824208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTAT 480

 39824209 GCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTT 39824268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTT 540

 39824269 CCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATG 39824328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATG 600

 39824329 GTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAA 39824388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAA 660

 39824389 CATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTT 39824448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTT 720

 39824449 AGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACT 39824508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACT 780

 39824509 GAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATAT 39824568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATAT 840

 39824569 ATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCT 39824628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCT 900

 39824629 TGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAAC 39824688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAAC 960

 39824689 CTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGT 39824748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGT 1020

 39824749 CGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTG 39824808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTG 1080

 39824809 CCCAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGAT 39824868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGAT 1140

 39824869 GAGATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCAC 39824928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCAC 1200

 39824929 CTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTAT 39824988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTAT 1260

 39824989 TTTTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCG 39825048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCG 1320

 39825049 GGCCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCA 39825108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCA 1380

 39825109 CCATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAA 39825168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAA 1440

 39825169 TTGGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTC 39825228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTC 1500

 39825229 ACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAG 39825288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAG 1560

 39825289 AAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACA 39825348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACA 1620

 39825349 CCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGG 39825408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGG 1680

 39825409 TAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCA 39825468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCA 1740

 39825469 AGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGG 39825528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGG 1800

 39825529 AATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTA 39825588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTA 1860

 39825589 AGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAAT 39825648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAAT 1920

 39825649 TCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGC 39825708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGC 1980

 39825709 CTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTG 39825768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTG 2040

 39825769 GCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGG 39825828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGG 2100

 39825829 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAG 39825888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAG 2160

 39825889 TGAAACTCTGTCTC 39825902
          ||||||||||||||
     2161 TGAAACTCTGTCTC 2174

EXCISED REGION

 39825908 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 39825967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 2234

 39825968 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 39826027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 2294

 39826028 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 39826087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 2354

 39826088 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 39826147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 2414

 39826148 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 39826207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 2474

 39826208 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 39826267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 2534

 39826268 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 39826327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 2594

 39826328 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 39826387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 2654

 39826388 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 39826447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 2714

 39826448 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 39826507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 2774

 39826508 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 39826567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 2834

 39826568 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 39826627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 2894

 39826628 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 39826687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 2954

 39826688 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 39826747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 3014

 39826748 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 39826807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 3074

 39826808 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 39826867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 3134

 39826868 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATC 39826927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATC 3194

 39826928 TTTTAAGGGCAAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAA 39826987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 TTTTAAGGGCAAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAA 3254

 39826988 AATATTTTTCAAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAG 39827047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 AATATTTTTCAAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAG 3314

 39827048 CTACTCAGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGG 39827107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 CTACTCAGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGG 3374

 39827108 CAACATAGCAAGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCA 39827167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 CAACATAGCAAGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCA 3434

 39827168 CTCAGCTGTACTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGG 39827227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 CTCAGCTGTACTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGG 3494

 39827228 TCGAGGCTGCAGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGA 39827287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 TCGAGGCTGCAGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGA 3554

 39827288 CCTGTCTCAAATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTT 39827347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 CCTGTCTCAAATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTT 3614

 39827348 TGGCTCTGCAGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGA 39827407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 TGGCTCTGCAGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGA 3674

 39827408 GGAGACCCCTGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCG 39827467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 GGAGACCCCTGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCG 3734

 39827468 GGGTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGA 39827527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 GGGTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGA 3794

 39827528 TCACCTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTA 39827587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 TCACCTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTA 3854

 39827588 AGAAAATACAATAATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA 39827647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 AGAAAATACAATAATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA 3914

 39827648 GGCTGAGGTAGGAAAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATT 39827707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 GGCTGAGGTAGGAAAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATT 3974

 39827708 GCGCCACTTCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGT 39827767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 GCGCCACTTCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGT 4034

 39827768 ATTATATCAACATGTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAA 39827827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 ATTATATCAACATGTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAA 4094

 39827828 ATCTTCTATTATATTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAA 39827887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 ATCTTCTATTATATTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAA 4154

 39827888 TTTTTGTCTTATTTTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGAT 39827947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 TTTTTGTCTTATTTTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGAT 4214

 39827948 CTTCAATAAAGTTAAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAG 39828007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 CTTCAATAAAGTTAAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAG 4274

 39828008 TTTAGAAATATTCAGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTG 39828067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 TTTAGAAATATTCAGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTG 4334

 39828068 TTTTTTATTTTAGGAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTA 39828127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 TTTTTTATTTTAGGAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTA 4394

 39828128 TCACAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGA 39828187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 TCACAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGA 4454

 39828188 GTAGCTGGGACTGTAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGA 39828247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 GTAGCTGGGACTGTAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGA 4514

 39828248 CATGGGGTCTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTC 39828307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 CATGGGGTCTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTC 4574

 39828308 CACCCCTGCCTCCCATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCT 39828367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 CACCCCTGCCTCCCATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCT 4634

 39828368 AAAAAAAAAATTTCTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAG 39828427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 AAAAAAAAAATTTCTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAG 4694

 39828428 AATAAGTTAAAATGACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTAT 39828487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 AATAAGTTAAAATGACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTAT 4754

 39828488 ATACATTCCTTACAAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACAC 39828547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 ATACATTCCTTACAAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACAC 4814

 39828548 ACACTGTACAATATTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGA 39828607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 ACACTGTACAATATTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGA 4874

 39828608 GTGTCGCTACCAGTATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACT 39828667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 GTGTCGCTACCAGTATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACT 4934

 39828668 TCTCTCCAAGGTATGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTT 39828727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 TCTCTCCAAGGTATGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTT 4994

 39828728 CCTATTAAACATGTAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTT 39828787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 CCTATTAAACATGTAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTT 5054

 39828788 GCATTTTCCTTACTTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACC 39828847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 GCATTTTCCTTACTTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACC 5114

 39828848 ATTTGCTTTATTAATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACA 39828907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 ATTTGCTTTATTAATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACA 5174

 39828908 ATTTCTAACCTGTTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTG 39828967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 ATTTCTAACCTGTTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTG 5234

 39828968 TCCAAGGCTGGAGTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTG 39829027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 TCCAAGGCTGGAGTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTG 5294

 39829028 AAGCGATCCTCCCATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGC 39829087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 AAGCGATCCTCCCATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGC 5354

 39829088 CCAACTAATATTTGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGA 39829147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 CCAACTAATATTTGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGA 5414

 39829148 GTAAGCATGGATTTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAG 39829207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 GTAAGCATGGATTTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAG 5474

 39829208 GGAGGACTGTATATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGA 39829267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 GGAGGACTGTATATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGA 5534

 39829268 AAATAATAATTTTTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCA 39829327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 AAATAATAATTTTTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCA 5594

 39829328 GGTGTGGTGGCTCACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCT 39829387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 GGTGTGGTGGCTCACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCT 5654

 39829388 TGAGGCCAAGAGTTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAA 39829447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 TGAGGCCAAGAGTTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAA 5714

 39829448 ATATATGAATTAGCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 39829507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 ATATATGAATTAGCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 5774

 39829508 AGCTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCT 39829567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 AGCTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCT 5834

 39829568 CTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAG 39829627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 CTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAG 5894

 39829628 CTAACATCAACTGACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAAC 39829687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 CTAACATCAACTGACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAAC 5954

 39829688 TTTCTTATTTCACTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTA 39829747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 TTTCTTATTTCACTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTA 6014

 39829748 CAGATGACCTTTTGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATG 39829807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 CAGATGACCTTTTGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATG 6074

 39829808 GCGAATGGACATTGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGC 39829867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 GCGAATGGACATTGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGC 6134

 39829868 TATAATCTTAGCACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAG 39829927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 TATAATCTTAGCACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAG 6194

 39829928 GAGGCAGTATGGCAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTT 39829987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 GAGGCAGTATGGCAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTT 6254

 39829988 TACCCTGGAAGGCTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTT 39830047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 TACCCTGGAAGGCTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTT 6314

 39830048 CACTGCACCTTTGCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTA 39830107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6315 CACTGCACCTTTGCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTA 6374

 39830108 AATAGATAAAAGACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTA 39830167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6375 AATAGATAAAAGACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTA 6434

 39830168 TTAGCTCTATTTCTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGG 39830227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6435 TTAGCTCTATTTCTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGG 6494

 39830228 TCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGACTGTAGTGGCAT 39830262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6495 TCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGACTGTAGTGGCAT 6529

Alignment time is 5.91522 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7089] =>      7089 nucs 'mol-32-2f12-089366_7089'

Score:        7057
Aligned:      7092        nucs
Identic:      7088 (100%) nucs =>       613 (100%)      6475 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39817702,39818315] EXCISED REGION [39818320,39824797]
 second seq =>  [       1,     613] EXCISED REGION [     614,    7089]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [39818316,39818319]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39818316,39818316] to [39818320,39818320]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39817702 TCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCCGGCCT 39817761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCCGGCCT 60

 39817762 TCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACGA 39817821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACGA 120

 39817822 GTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAGA 39817881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAGA 180

 39817882 TGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTTT 39817941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTTT 240

 39817942 TAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCACT 39818001
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 -AAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCACT 299

 39818002 GCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCCG 39818061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCCG 359

 39818062 GCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCGA 39818121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCGA 419

 39818122 ACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCAT 39818181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 ACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCAT 479

 39818182 GAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAGA 39818241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAGA 539

 39818242 CCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCTC 39818301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCTC 599

 39818302 TCTCCCTCTCTCTC 39818315
          ||||||||||||||
      600 TCTCCCTCTCTCTC 613

EXCISED REGION

 39818320 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAG 39818379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      614 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAG 673

 39818380 GCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGA 39818439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      674 GCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGA 733

 39818440 TGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTC 39818499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      734 TGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTC 793

 39818500 TTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGC 39818559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 TTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGC 853

 39818560 CCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATT 39818619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 CCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATT 913

 39818620 GAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCT 39818679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 GAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCT 973

 39818680 TCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGT 39818739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 TCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGT 1033

 39818740 AAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTG 39818799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 AAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTG 1093

 39818800 CAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTT 39818859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 CAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTT 1153

 39818860 TTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCAT 39818919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 TTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCAT 1213

 39818920 GGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGT 39818979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 GGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGT 1273

 39818980 AGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGC 39819039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 AGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGC 1333

 39819040 CGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGG 39819099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 CGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGG 1393

 39819100 CCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAA 39819159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 CCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAA 1453

 39819160 CCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGAT 39819219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 CCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGAT 1513

 39819220 ACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCA 39819279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 ACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCA 1573

 39819280 CTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTT 39819339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 CTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTT 1633

 39819340 GGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAA 39819399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 GGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAA 1693

 39819400 CCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGG 39819459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 CCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGG 1753

 39819460 AGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAG 39819519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 AGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAG 1813

 39819520 GTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGT 39819579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 GTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGT 1873

 39819580 TTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGA 39819639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 TTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGA 1933

 39819640 AAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGA 39819699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 AAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGA 1993

 39819700 GAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTT 39819759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 GAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTT 2053

 39819760 TGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATT 39819819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATT 2113

 39819820 CATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCT 39819879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 CATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCT 2173

 39819880 CAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAG 39819939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 CAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAG 2233

 39819940 TTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACA 39819999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACA 2293

 39820000 GGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATT 39820059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 GGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATT 2353

 39820060 CCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTC 39820119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 CCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTC 2413

 39820120 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTC 39820179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTC 2473

 39820180 AAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCA 39820239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 AAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCA 2533

 39820240 CACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGAC 39820299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 CACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGAC 2593

 39820300 AGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGAT 39820359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 AGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGAT 2653

 39820360 TACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTT 39820419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTT 2713

 39820420 ACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTT 39820479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 ACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTT 2773

 39820480 TGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCA 39820539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 TGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCA 2833

 39820540 CTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 39820599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 CTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 2893

 39820600 TCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGA 39820659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 TCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGA 2953

 39820660 GATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCC 39820719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 GATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCC 3013

 39820720 TGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCCAAAATT 39820779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 TGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCCAAAATT 3073

 39820780 AATACTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAGGTCTCA 39820839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 AATACTTTCTATATTAAATTTACATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAGGTCTCA 3133

 39820840 TGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCTACCTGC 39820899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 TGCTCTCACTCAGGCTGCAGTACAGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCTACCTGC 3193

 39820900 CAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAAGTGCC 39820959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 CAGGCTCAAGCAATTCTCCTGACTTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAAGTGCC 3253

 39820960 ACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTTCCCAGA 39821019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 ACCACACCAAGCTAAATTTTGTGTTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTTCCCAGA 3313

 39821020 CTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 39821079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 CTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAAAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 3373

 39821080 ATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGTGTCTCC 39821139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 ATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCTCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGTGTCTCC 3433

 39821140 TGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAGACCCAC 39821199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 TGATTGGACTCCTACAAATACAGAATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAGACCCAC 3493

 39821200 ACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCTTGCTAA 39821259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 ACAGATGGGATTTGGGAATAGGTTTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCTTGCTAA 3553

 39821260 TGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACA 39821319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 TGGGATATGGGAGGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACA 3613

 39821320 TACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTGCTACAA 39821379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 TACTGTTCATTGTGAAATGCCAGTTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTGCTACAA 3673

 39821380 GTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGATCCTTTCGAA 39821439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GTTGACCACTGCAGCAGTAAAGATGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGATCCTTTCGAA 3733

 39821440 TGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGCAGGCAA 39821499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 TGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAACCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGCAGGCAA 3793

 39821500 GTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCACCTGAGC 39821559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 GTGAAGGGAAACTTCATCTGTATTTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCACCTGAGC 3853

 39821560 TCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAAACTCTGTTGT 39821619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 TCCATGTCCTGTCAGATCAGCAGCAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAAACTCTGTTGT 3913

 39821620 GAAGTGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGTGTACTCCTTATGAGAATCTAATGCCTGATAT 39821679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 GAAGTGTGCATGCGAGGGATCTAGGTTGTGTACTCCTTATGAGAATCTAATGCCTGATAT 3973

 39821680 TCTGTTACTGTTTCCCATCACCCCAGATGGACAGTCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGA 39821739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 TCTGTTACTGTTTCCCATCACCCCAGATGGACAGTCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGA 4033

 39821740 GATCCCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGTTGTAGAATCATTTCATTATATATTACTATGT 39821799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 GATCCCACTGAGTCTACGTTATAGTGAGTTGTAGAATCATTTCATTATATATTACTATGT 4093

 39821800 AGTAATAATAGAAATAAAGTGCTCAATATATGTATTGCACTTGAATCATCCTGAAATTAT 39821859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 AGTAATAATAGAAATAAAGTGCTCAATATATGTATTGCACTTGAATCATCCTGAAATTAT 4153

 39821860 TCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTGCCTTCCACATATTCACTCTGTTTTTTGGTAC 39821919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 TCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAAAAATTGCCTTCCACATATTCACTCTGTTTTTTGGTAC 4213

 39821920 AGGCAAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATATAC 39821979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 AGGCAAGGTCTTAATATATTGCCCAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATATAC 4273

 39821980 CTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATAAACCACCACCCTCAACCAAGAC 39822039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 CTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATAAACCACCACCCTCAACCAAGAC 4333

 39822040 TTTCTTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAGATTACTTGAGCCCATGTGGTCAAGGCTGCAG 39822099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 TTTCTTAAACCAAATAAAAATTAAGTGAGATTACTTGAGCCCATGTGGTCAAGGCTGCAG 4393

 39822100 TGAGCCTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAATGAGACTGTCTCAAAAAA 39822159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 TGAGCCTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAATGAGACTGTCTCAAAAAA 4453

 39822160 TAAAATAAAATACAAATGAACCCTTTATGACATTGCCAGTAACTTTCCCTCCTAAGTGTT 39822219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 TAAAATAAAATACAAATGAACCCTTTATGACATTGCCAGTAACTTTCCCTCCTAAGTGTT 4513

 39822220 CCCCACAAGTCTTTGAATTCTGTTTAATTTTCACATAACATTTAAGACGTTTAAGAACTT 39822279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 CCCCACAAGTCTTTGAATTCTGTTTAATTTTCACATAACATTTAAGACGTTTAAGAACTT 4573

 39822280 ATGTCTGTCTGTGTCATCCCTTTATGTCAAAAGATGCCTTTTTGTCACTTCCAGCTGGAT 39822339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 ATGTCTGTCTGTGTCATCCCTTTATGTCAAAAGATGCCTTTTTGTCACTTCCAGCTGGAT 4633

 39822340 CTACCATGAAAGACTTCTGAATCCAGGAAGAGAGACTGACTGGGCAACATGTTATTCAGG 39822399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 CTACCATGAAAGACTTCTGAATCCAGGAAGAGAGACTGACTGGGCAACATGTTATTCAGG 4693

 39822400 TACAAAAAGATTTGGAGTGTAACTCAAAAATGATCAAATAATAGTGCATGCATCAAGTGC 39822459
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 TACAAAAAGATTTGGACTGTAACTCAAAAATGATCAAATAATAGTGCATGCATCAAGTGC 4753

 39822460 AATGGGAAGCTCTTCGGGAGAGTGAGAGAAGCTTCCAGTTAAGGTGACATTGAAGCCAAG 39822519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 AATGGGAAGCTCTTCGGGAGAGTGAGAGAAGCTTCCAGTTAAGGTGACATTGAAGCCAAG 4813

 39822520 TCCTGAAAGATGAGGAAGAGTTGTATGAGAGTGGGGAGGAAAGGGGGAGGTGGAGGGATG 39822579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 TCCTGAAAGATGAGGAAGAGTTGTATGAGAGTGGGGAGGAAAGGGGGAGGTGGAGGGATG 4873

 39822580 GGGAATGGGCTGGGATGGGATGGAGCAAACTGCCCGGGAAGGGAAACCAGCACTGTACAG 39822639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 GGGAATGGGCTGGGATGGGATGGAGCAAACTGCCCGGGAAGGGAAACCAGCACTGTACAG 4933

 39822640 ACCTGAACAACGAAGATGGCATATTTTGTTCACGGAACGGTGAATTAAGTGTGGCAGGAA 39822699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 ACCTGAACAACGAAGATGGCATATTTTGTTCACGGAACGGTGAATTAAGTGTGGCAGGAA 4993

 39822700 TGCTTTGTAGAGACAGTAAGTTGCTTGTATGGAATTTTGCCCAAGAGACCTCATTGCAGT 39822759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 TGCTTTGTAGAGACAGTAAGTTGCTTGTATGGAATTTTGCCCAAGAGACCTCATTGCAGT 5053

 39822760 TTCTGATTTTTTGATGTCATCATCCATCACTGTCCTTGTCAAATAGTTTGGAATAGGTAT 39822819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 TTCTGATTTTTTGATGTCATCATCCATCACTGTCCTTGTCAAATAGTTTGGAATAGGTAT 5113

 39822820 AATGATCACAATAACCCCAAGCATAATATTTCATTAATTCTCACAGAATCACAGGTAGGT 39822879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 AATGATCACAATAACCCCAAGCATAATATTTCATTAATTCTCACAGAATCACAGGTAGGT 5173

 39822880 GCCACAGTTATCCCCATTTTATGAATGGAGTGATGAAGCCTTAGGAATAATGAATGATTT 39822939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 GCCACAGTTATCCCCATTTTATGAATGGAGTGATGAAGCCTTAGGAATAATGAATGATTT 5233

 39822940 GCCCAAGCTCACCTGGATATTAAGACTGAGTCAAATGTTGGGTCTGGTCTGACTTTAATG 39822999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 GCCCAAGCTCACCTGGATATTAAGACTGAGTCAAATGTTGGGTCTGGTCTGACTTTAATG 5293

 39823000 TTTGCTTTGTTCATGAGCACCACGTATTGCCTCTCCTATGCAGTTAAGCAGGTAGACAAG 39823059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 TTTGCTTTGTTCATGAGCACCACGTATTGCCTCTCCTATGCAGTTAAGCAGGTAGACAAG 5353

 39823060 TGACAGAAAAGCCCATGTTTGTCTCTACTCACACACTTCCGACTGAATGTATGTATGGAG 39823119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 TGACAGAAAAGCCCATGTTTGTCTCTACTCACACACTTCCGACTGAATGTATGTATGGAG 5413

 39823120 TTTCTACACCAAATTCTTCAGTGCTCTGGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCT 39823179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 TTTCTACACCAAATTCTTCAGTGCTCTGGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCT 5473

 39823180 GACACTACCTGGAGTTAGCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATC 39823239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 GACACTACCTGGAGTTAGCACAGACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATC 5533

 39823240 CTCACTTCAGATGCCAATGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTT 39823299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 CTCACTTCAGATGCCAATGGCAAGTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTT 5593

 39823300 ACAAATCGGGGGTTCCCATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTAC 39823359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 ACAAATCGGGGGTTCCCATAACTGTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTAC 5653

 39823360 GGAACTCAGAAAAACAGTTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGC 39823419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 GGAACTCAGAAAAACAGTTTATTTTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGC 5713

 39823420 CCAGGCTGGTGTGCAATGGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCA 39823479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 CCAGGCTGGTGTGCAATGGTGCAGTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCA 5773

 39823480 GTGGTTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCT 39823539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 GTGGTTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCT 5833

 39823540 GGCTAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCT 39823599
          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 GGCTAGTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCT 5891

 39823600 GGCCACAACAAATTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGG 39823659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5892 GGCCACAACAAATTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGG 5951

 39823660 ATTACAGATGTCAGCCACCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAA 39823719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5952 ATTACAGATGTCAGCCACCACATCTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAA 6011

 39823720 GGATACATCCCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGC 39823779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6012 GGATACATCCCAGAAACAGTCAATGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGC 6071

 39823780 CTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGA 39823839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6072 CTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGA 6131

 39823840 GACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAA 39823899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6132 GACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAA 6191

 39823900 TAACCAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGA 39823959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6192 TAACCAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGA 6251

 39823960 TGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCA 39824019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6252 TGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCA 6311

 39824020 CTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAA 39824079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6312 CTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAA 6371

 39824080 GTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGC 39824139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6372 GTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGC 6431

 39824140 ATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGG 39824199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6432 ATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGG 6491

 39824200 CTTTATTATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCA 39824259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6492 CTTTATTATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCA 6551

 39824260 GCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGT 39824319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6552 GCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGT 6611

 39824320 GGTTGCATGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCA 39824379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6612 GGTTGCATGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCA 6671

 39824380 TCTCAACAACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGC 39824439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6672 TCTCAACAACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGC 6731

 39824440 TCTTGTGTTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACA 39824499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6732 TCTTGTGTTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACA 6791

 39824500 TCTATCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGAT 39824559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6792 TCTATCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGAT 6851

 39824560 TAAATATATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGA 39824619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6852 TAAATATATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGA 6911

 39824620 GTGCAGTCTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCC 39824679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6912 GTGCAGTCTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCC 6971

 39824680 CATCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTT 39824739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6972 CATCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTT 7031

 39824740 TTGTAGAGTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTC 39824797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7032 TTGTAGAGTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTC 7089

Alignment time is 6.51783 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3831] =>      3831 nucs 'mol-32-2f1d-015569_3831'

Score:        3774
Aligned:      3846        nucs
Identic:      3828 (100%) nucs =>      1734 (100%)      2094 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818364,39820097] EXCISED REGION [39825202,39827312]
 second seq =>  [       1,    1734] EXCISED REGION [    1735,    3831]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818364 TGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAAC 39818423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAAC 60

 39818424 TCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGT 39818483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGT 120

 39818484 GTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCA 39818543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCA 180

 39818544 GTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGC 39818603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGC 240

 39818604 CTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAG 39818663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAG 300

 39818664 CTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGC 39818723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGC 360

 39818724 AGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGAT 39818783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGAT 420

 39818784 GATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCT 39818843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCT 480

 39818844 GATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGT 39818903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGT 540

 39818904 TCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCA 39818963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCA 600

 39818964 CGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTT 39819023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTT 660

 39819024 TTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGG 39819083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGG 720

 39819084 GATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCAC 39819143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCAC 780

 39819144 TGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTAC 39819203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTAC 840

 39819204 ATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAAC 39819263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAAC 900

 39819264 ATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGG 39819323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGG 960

 39819324 ACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTG 39819383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTG 1020

 39819384 CCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCC 39819443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCC 1080

 39819444 ATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGA 39819503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGA 1140

 39819504 AGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCA 39819563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCA 1200

 39819564 GGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAG 39819623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAG 1260

 39819624 AGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCA 39819683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCA 1320

 39819684 TAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGG 39819743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGG 1380

 39819744 GGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAA 39819803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAA 1440

 39819804 GTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCA 39819863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCA 1500

 39819864 GGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTT 39819923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTT 1560

 39819924 TTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAG 39819983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAG 1620

 39819984 ATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGC 39820043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGC 1680

 39820044 AGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 1734

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1794

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1854

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1914

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1974

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 2034

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 2094

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 2154

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 2214

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 2274

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 2334

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 2394

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     2395 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 2439

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 2499

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 2559

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 2619

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 2679

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 2739

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 2799

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 2859

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 2919

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 2979

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 3039

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 3099

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 3159

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 3219

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 3279

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 3339

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 3399

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3400 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 3459

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 3519

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 3579

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 3639

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 3699

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3700 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 3759

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     3760 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 3819

 39827301 CAAATAAACATA 39827312
          ||||||||||||
     3820 CAAATAAACATA 3831

Alignment time is 3.68814 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7710] =>      7710 nucs 'mol-32-2fb7-095371_7710'

Score:        7621
Aligned:      7728        nucs
Identic:      7706 (100%) nucs =>      6483 (100%)      1223 ( 99%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39813609,39820097] EXCISED REGION [39825202,39826440]
 second seq =>  [       1,    6486] EXCISED REGION [    6487,    7710]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39813609 AATTTTTTTAAAAAGGCCAGGCGCAGTGGCTCACATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 39813668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTTTTTTAAAAAGGCCAGGCGCAGTGGCTCACATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 60

 39813669 TGGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGAAGTTCAAGACCAGCATGGCCAAGATGGTGAAAC 39813728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGAAGTTCAAGACCAGCATGGCCAAGATGGTGAAAC 120

 39813729 CCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCCAGGTGTGGTGGTAGGTGTAATCCCAGCTA 39813788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCCAGGTGTGGTGGTAGGTGTAATCCCAGCTA 180

 39813789 CTCGGGAGGGTGAGGCAGAGAATCACTTGAACCTGAAAGGCAGACATTGCAGTGAGCTGA 39813848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCGGGAGGGTGAGGCAGAGAATCACTTGAACCTGAAAGGCAGACATTGCAGTGAGCTGA 240

 39813849 GATCGTGCTGTTGCACTTCAGCCTGGGCGACCGAGACTATGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA 39813908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATCGTGCTGTTGCACTTCAGCCTGGGCGACCGAGACTATGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA 300

 39813909 AAATTAGCCAGGTGTTGTGGCATGCAGCTGTAGTCTCAGTTCCTAGGGAAGCTGAGGTGG 39813968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATTAGCCAGGTGTTGTGGCATGCAGCTGTAGTCTCAGTTCCTAGGGAAGCTGAGGTGG 360

 39813969 GAGAATTGTTTAAGCCTAGGAGGTTGAAGTTGCTGTGAGCTATGATTGCACCACTGTACT 39814028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGAATTGTTTAAGCCTAGGAGGTTGAAGTTGCTGTGAGCTATGATTGCACCACTGTACT 420

 39814029 GCAGCCTGGGCAATAGAGCAAGACCTTGTTTCAAAAAGAAAGAAAGAAATGAGCATGGTG 39814088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGCCTGGGCAATAGAGCAAGACCTTGTTTCAAAAAGAAAGAAAGAAATGAGCATGGTG 480

 39814089 GGAATGGGGACAGATGGCAATGTTAAGTAGCGTGGTCAGGGTTGGCCTCATAAGTGAATA 39814148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAATGGGGACAGATGGCAATGTTAAGTAGCGTGGTCAGGGTTGGCCTCATAAGTGAATA 540

 39814149 TTGAGCAAAAGTTTGAAGCAGGTGATGGAGCTGGCCAAAGTGCTGAGGGAAAAGCATTGT 39814208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGAGCAAAAGTTTGAAGCAGGTGATGGAGCTGGCCAAAGTGCTGAGGGAAAAGCATTGT 600

 39814209 AGGCTGAGTCAACAGGATAAAGGCATTAGGAGGAAATTCCCTGGTGTGTCTGAGGCTCTG 39814268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCTGAGTCAACAGGATAAAGGCATTAGGAGGAAATTCCCTGGTGTGTCTGAGGCTCTG 660

 39814269 GAAGGCCAGTGGAGCAAAGAGATAGAGGGAGCGAAGTCGGCAAGGAGGCCAGGGAGTTGC 39814328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAGGCCAGTGGAGCAAAGAGATAGAGGGAGCGAAGTCGGCAAGGAGGCCAGGGAGTTGC 720

 39814329 TGGGCTGGGATCGGTACAGACCGTGTAAGCCCTGGGACACTGTTGCTGGGGCTTTGGCTT 39814388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGGCTGGGATCGGTACAGACCGTGTAAGCCCTGGGACACTGTTGCTGGGGCTTTGGCTT 780

 39814389 TTACTCTGACTAAAATGGGAACCACCGAGGGCTTCTGAGCCGAGAGGCGACGTGATCTGT 39814448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTACTCTGACTAAAATGGGAACCACCGAGGGCTTCTGAGCCGAGAGGCGACGTGATCTGT 840

 39814449 CTCCTGATTTAAAAGCACGCCCTGGCTGCCAAGTTGAGAAGACTATGGGAAGATTTGGGT 39814508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCTGATTTAAAAGCACGCCCTGGCTGCCAAGTTGAGAAGACTATGGGAAGATTTGGGT 900

 39814509 AGAAGCATGGGGGCCAAGCTGTGGCAACATCCCGGTGGGAGAGGATAGTGATCCTGACCG 39814568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAAGCATGGGGGCCAAGCTGTGGCAACATCCCGGTGGGAGAGGATAGTGATCCTGACCG 960

 39814569 GGTGCACGGTGGTGGTGAGAGATGGTCAGAGCCTGGATACATGTTGAAGTCAGTCAGTAG 39814628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGCACGGTGGTGGTGAGAGATGGTCAGAGCCTGGATACATGTTGAAGTCAGTCAGTAG 1020

 39814629 GATTTCCTGACATTACCCAAAGCTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTC 39814688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATTTCCTGACATTACCCAAAGCTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTC 1080

 39814689 TAATTGAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTAA 39814748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATTGAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTAA 1140

 39814749 AGGATGCTAGATAAAAGAAATCTCAAGTCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTATAGTT 39814808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGATGCTAGATAAAAGAAATCTCAAGTCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTATAGTT 1200

 39814809 CCAACAGTTTGAGAGGCAGAGATGGGAGTATGTTTTAAGGCCATGAGTTTGAGAGCAGCC 39814868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAACAGTTTGAGAGGCAGAGATGGGAGTATGTTTTAAGGCCATGAGTTTGAGAGCAGCC 1260

 39814869 TGGGCAACATAGCAAGACCGCTCTACAAAAATAAAAGAAATAAATATAATAAAATAAATA 39814928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGCAACATAGCAAGACCGCTCTACAAAAATAAAAGAAATAAATATAATAAAATAAATA 1320

 39814929 TAGCCAAGCATGATGGTGTGTACCTGTGGCCCCACTTACTCAGGAGGCTGAGATGGGCAG 39814988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGCCAAGCATGATGGTGTGTACCTGTGGCCCCACTTACTCAGGAGGCTGAGATGGGCAG 1380

 39814989 ATCTCTTGATTCTAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATATCAAGATTTCTCTCTCTA 39815048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTCTTGATTCTAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATATCAAGATTTCTCTCTCTA 1440

 39815049 CAAAAATTGAAAGAAAAAAAAAAGCCTGACATGGTGGTACTTGCCTGTATTCCCAGGTAT 39815108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAAAATTGAAAGAAAAAAAAAAGCCTGACATGGTGGTACTTGCCTGTATTCCCAGGTAT 1500

 39815109 TGGGGCAGCTGAGGCAGGAGCATCTCTTGAGCCCAGTTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCTAT 39815168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGGCAGCTGAGGCAGGAGCATCTCTTGAGCCCAGTTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCTAT 1560

 39815169 GATTATACCACTGCACTCCATCCTGGGTGACAGAGTGGGACCCTGTCTCAAAATACAAAT 39815228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATTATACCACTGCACTCCATCCTGGGTGACAGAGTGGGACCCTGTCTCAAAATACAAAT 1620

 39815229 ACAAATGAAATGAAATCTCAAGTCAGACCAGTCCCTTCTAGGCTATGTAGGCCTTGCAAC 39815288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAAATGAAATGAAATCTCAAGTCAGACCAGTCCCTTCTAGGCTATGTAGGCCTTGCAAC 1680

 39815289 CACATAGCTGTGTGATCTGGTTTGTGTGGCTGTGGATGAGGAAACCCCTGCCAATTGTTA 39815348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACATAGCTGTGTGATCTGGTTTGTGTGGCTGTGGATGAGGAAACCCCTGCCAATTGTTA 1740

 39815349 TTGGCTATATAATCAGTTTATTTTTCAATATAGTAATCAAATATATTTCATCATATTTGA 39815408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGGCTATATAATCAGTTTATTTTTCAATATAGTAATCAAATATATTTCATCATATTTGA 1800

 39815409 TGGTCTCAAATATGTGTGGGTTTTGGAATTCCCCTTGGAACAGGTTGTAACATCTTATTG 39815468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGTCTCAAATATGTGTGGGTTTTGGAATTCCCCTTGGAACAGGTTGTAACATCTTATTG 1860

 39815469 GCTCCATCATTCCATAATTTTTTGAATCTGATCAGTTTTTAATAAGGTCAGAATTGATAT 39815528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTCCATCATTCCATAATTTTTTGAATCTGATCAGTTTTTAATAAGGTCAGAATTGATAT 1920

 39815529 TAGACTACCTAATCAGTTTTTAATGAGAAAATGAAATTGTGTTGTTTGCACTTTATCCAA 39815588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGACTACCTAATCAGTTTTTAATGAGAAAATGAAATTGTGTTGTTTGCACTTTATCCAA 1980

 39815589 GATTGGTGTCATATTGGCTAAATCTAATCAATACTTGAACAAATGCAAAATTAGAGCTTC 39815648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATTGGTGTCATATTGGCTAAATCTAATCAATACTTGAACAAATGCAAAATTAGAGCTTC 2040

 39815649 TTTATCATGAAACACTATGTCATTCTTTAAGAAGATGCCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTA 39815708
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
     2041 TTTATCATGAAACACTATGTCATTCTTTAAGAAGATGCCATTTTTTTTTTTTTTTTT--A 2098

 39815709 AGATAGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATTTTGGCTCACTG 39815768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AGATAGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATTTTGGCTCACTG 2158

 39815769 CAACCCTTGCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 39815828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CAACCCTTGCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 2218

 39815829 TACAGGTGCCCGCCACCCAGATGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATG 39815888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TACAGGTGCCCGCCACCCAGATGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATG 2278

 39815889 TTGGCCAGGCTCATCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAA 39815948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTGGCCAGGCTCATCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAA 2338

 39815949 ATGCAGGGATTACAGACATGAGCTACCACTCCGGGCCTCCATTTCTTTTTTGTAGTCTTT 39816008
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GTGCAGGGATTACAGACATGAGCTACCACTCCGGGCCTCCATTTCTTTTTTGTAGTCTTT 2398

 39816009 AATAAACAGCTGCTATCGTTGCAGACTTGCTATTTAGGCACTTAGGAATTTTTCACTAGA 39816068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AATAAACAGCTGCTATCGTTGCAGACTTGCTATTTAGGCACTTAGGAATTTTTCACTAGA 2458

 39816069 AGGCGTGTAAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTAC 39816128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AGGCGTGTAAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTAC 2518

 39816129 ATGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCA 39816188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCA 2578

 39816189 ACTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTC 39816248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ACTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTC 2638

 39816249 TCCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGTAATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTT 39816308
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TCCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGTGATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTT 2698

 39816309 CAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCAC 39816368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCAC 2758

 39816369 TGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGG 39816428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGG 2818

 39816429 ACTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGA 39816488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ACTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGA 2878

 39816489 TCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTC 39816548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTC 2938

 39816549 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTA 39816608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTA 2998

 39816609 TTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTAT 39816668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTAT 3058

 39816669 TGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAG 39816728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAG 3118

 39816729 TCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACT 39816788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACT 3178

 39816789 ACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTT 39816848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTT 3238

 39816849 TGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTG 39816908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTG 3298

 39816909 GCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAA 39816968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAA 3358

 39816969 TATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTG 39817028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTG 3418

 39817029 TTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGC 39817088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGC 3478

 39817089 TATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATAT 39817148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATAT 3538

 39817149 GCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTG 39817208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTG 3598

 39817209 CCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCC 39817268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCC 3658

 39817269 AGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGC 39817328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 AGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGC 3718

 39817329 AAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACA 39817388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACA 3778

 39817389 GAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTT 39817448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTT 3838

 39817449 CCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTG 39817508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTG 3898

 39817509 TCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGC 39817568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGC 3958

 39817569 AAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCA 39817628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCA 4018

 39817629 TGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCC 39817688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCC 4078

 39817689 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCA 39817748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCA 4138

 39817749 CCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGC 39817808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 CCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGC 4198

 39817809 AGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGC 39817868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGC 4258

 39817869 TAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTT 39817928
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4259 TAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTT 4318

 39817929 GGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCG 39817988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCG 4378

 39817989 ATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATG 39818048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 ATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATG 4438

 39818049 CCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCC 39818108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 CCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCC 4498

 39818109 ACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 39818168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 ACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 4558

 39818169 GGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGG 39818228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGG 4618

 39818229 CAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACC 39818288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACC 4678

 39818289 TGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACT 39818348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     4679 TGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-ACT 4737

 39818349 TTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTT 39818408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTT 4797

 39818409 ACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTA 39818468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 ACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTA 4857

 39818469 GTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGC 39818528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 GTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGC 4917

 39818529 TCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGA 39818588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 TCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGA 4977

 39818589 GCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCC 39818648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCC 5037

 39818649 TTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGT 39818708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 TTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGT 5097

 39818709 CCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGT 39818768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 CCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGT 5157

 39818769 GAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAG 39818828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 GAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAG 5217

 39818829 GATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGT 39818888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 GATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGT 5277

 39818889 CACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCT 39818948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 CACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCT 5337

 39818949 CAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAA 39819008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 CAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAA 5397

 39819009 TTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAA 39819068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAA 5457

 39819069 CTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATG 39819128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 CTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATG 5517

 39819129 AGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAG 39819188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAG 5577

 39819189 AATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAG 39819248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 AATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAG 5637

 39819249 CTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGT 39819308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 CTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGT 5697

 39819309 GCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCA 39819368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 GCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCA 5757

 39819369 CCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACA 39819428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 CCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACA 5817

 39819429 CACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAAT 39819488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 CACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAAT 5877

 39819489 CTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGG 39819548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 CTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGG 5937

 39819549 AGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGA 39819608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 AGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGA 5997

 39819609 TATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGG 39819668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGG 6057

 39819669 CTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAA 39819728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 CTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAA 6117

 39819729 GGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGT 39819788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 GGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGT 6177

 39819789 GATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCT 39819848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 GATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCT 6237

 39819849 GTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGA 39819908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 GTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGA 6297

 39819909 GTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGG 39819968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 GTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGG 6357

 39819969 CGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGA 39820028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 CGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGA 6417

 39820029 GGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCT 39820088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 GGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCT 6477

 39820089 TTTTCTTTC 39820097
          |||||||||
     6478 TTTTCTTTC 6486

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 6546

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6547 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGGGTC 6606

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 6666

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 6726

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 6786

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 6846

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 6906

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 6966

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 7026

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 7086

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 7146

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     7147 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 7191

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 7251

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7252 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 7311

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7312 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 7371

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7372 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 7431

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7432 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 7491

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7492 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 7551

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7552 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 7611

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7612 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 7671

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACT 39826440
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7672 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACT 7710

Alignment time is 7.24407 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9897] =>      9897 nucs 'mol-32-3046-183641_9897'

Score:        9717
Aligned:      9918        nucs
Identic:      9885 (100%) nucs =>      3544 (100%)      6341 (100%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39816549,39820097] EXCISED REGION [39825202,39831566]
 second seq =>  [       1,    3548] EXCISED REGION [    3549,    9897]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39816549 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTA 39816608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTA 60

 39816609 TTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTAT 39816668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTAT 120

 39816669 TGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAG 39816728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAG 180

 39816729 TCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACT 39816788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACT 240

 39816789 ACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTT 39816848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTT 300

 39816849 TGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTG 39816908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTG 360

 39816909 GCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAA 39816968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAA 420

 39816969 TATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTG 39817028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTG 480

 39817029 TTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGC 39817088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGC 540

 39817089 TATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATAT 39817148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATAT 600

 39817149 GCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTG 39817208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTG 660

 39817209 CCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCC 39817268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCC 720

 39817269 AGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGC 39817328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGC 780

 39817329 AAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACA 39817388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACA 840

 39817389 GAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTT 39817448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTT 900

 39817449 CCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTG 39817508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTG 960

 39817509 TCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGC 39817568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGC 1020

 39817569 AAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCA 39817628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCA 1080

 39817629 TGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCC 39817688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCC 1140

 39817689 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCA 39817748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCA 1200

 39817749 CCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGC 39817808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGC 1260

 39817809 AGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGC 39817868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGC 1320

 39817869 TAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTT 39817928
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1321 TAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTT 1380

 39817929 GGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCG 39817988
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTTTTTTTTTTT-AAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCG 1439

 39817989 ATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATG 39818048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATG 1499

 39818049 CCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCC 39818108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCC 1559

 39818109 ACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 39818168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 1619

 39818169 GGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGG 39818228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGG 1679

 39818229 CAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACC 39818288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACC 1739

 39818289 TGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAC- 39818347
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
     1740 TGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--T 1797

 39818348 -TTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGC 39818406
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1798 TTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCATGGC 1857

 39818407 TTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAG 39818466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAG 1917

 39818467 TAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGA 39818526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGA 1977

 39818527 GCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTAT 39818586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTAT 2037

 39818587 GAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCT 39818646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCT 2097

 39818647 CCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGT 39818706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 CCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGT 2157

 39818707 GTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCT 39818766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCT 2217

 39818767 GTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTT 39818826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTT 2277

 39818827 AGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCT 39818886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCT 2337

 39818887 GTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGG 39818946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 GTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGG 2397

 39818947 CTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTG 39819006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTG 2457

 39819007 AATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTG 39819066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 AATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTG 2517

 39819067 AACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCA 39819126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 AACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCA 2577

 39819127 TGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAA 39819186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAA 2637

 39819187 AGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTC 39819246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTC 2697

 39819247 AGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATT 39819306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATT 2757

 39819307 GTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGC 39819366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGC 2817

 39819367 CACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACA 39819426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACA 2877

 39819427 CACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGA 39819486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGA 2937

 39819487 ATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGA 39819546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGA 2997

 39819547 GGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAG 39819606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAG 3057

 39819607 GATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGA 39819666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGA 3117

 39819667 GGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGC 39819726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGC 3177

 39819727 AAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAA 39819786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAA 3237

 39819787 GTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTT 39819846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTT 3297

 39819847 CTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACT 39819906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACT 3357

 39819907 GAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAA 39819966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAA 3417

 39819967 GGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGT 39820026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 GGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGT 3477

 39820027 GAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTT 39820086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTT 3537

 39820087 CTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||
     3538 CTTTTTCTTTC 3548

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 3608

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 3668

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 3728

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 3788

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 3848

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 3908

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 3968

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 4028

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 4088

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 4148

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 4208

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     4209 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 4253

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 4313

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 4373

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 4433

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 4493

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 4553

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 4613

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 4673

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 4733

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 4793

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 4853

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 4913

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 4973

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 5033

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 5093

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 5153

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 5213

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5214 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 5273

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 5333

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 5393

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 5453

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 5513

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5514 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 5573

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     5574 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 5633

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 5693

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5694 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 5753

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 5813

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 5873

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 5933

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 5993

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 6053

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 6113

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 6173

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 6233

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 6293

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6294 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 6353

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 6413

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 6473

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 6533

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 6593

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 6653

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 6713

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 6773

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 6833

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 6893

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 6953

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 7013

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 7073

 39828741 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 39828800
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTA--CTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 7131

 39828801 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 39828860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 7191

 39828861 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 39828920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 7251

 39828921 TTTATTTATTTA-TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 39828979
          |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7252 TTTATTTA-TTATTTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 7310

 39828980 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 39829039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 7370

 39829040 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 39829099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 7430

 39829100 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 39829159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 7490

 39829160 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 39829219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 7550

 39829220 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 39829279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 7610

 39829280 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 39829339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 7670

 39829340 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 39829399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 7730

 39829400 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 39829459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 7790

 39829460 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 39829519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 7850

 39829520 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 39829579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 7910

 39829580 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 39829639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 7970

 39829640 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 39829699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 8030

 39829700 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 39829759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8031 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 8090

 39829760 TGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 39829819
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 TGTTTAGATTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 8150

 39829820 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 39829879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8151 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 8210

 39829880 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 39829939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8211 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 8270

 39829940 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 39829999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     8271 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAGTTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 8330

 39830000 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 39830059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8331 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 8390

 39830060 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 39830119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8391 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 8450

 39830120 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 39830179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8451 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 8510

 39830180 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 39830239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8511 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 8570

 39830240 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 39830299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8571 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 8630

 39830300 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 39830359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8631 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 8690

 39830360 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 39830419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8691 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 8750

 39830420 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 39830479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8751 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 8810

 39830480 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 39830539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8811 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 8870

 39830540 ATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATTAAATTTTACCAC 39830599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8871 ATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATTAAATTTTACCAC 8930

 39830600 TTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATATGTTAGGAAGGG 39830659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8931 TTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATATGTTAGGAAGGG 8990

 39830660 TCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTTTCCCAGGGGGCA 39830719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8991 TCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTTTCCCAGGGGGCA 9050

 39830720 GTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCAC 39830779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9051 GTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCAC 9110

 39830780 AATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTGAGGCACATGCCT 39830839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9111 AATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTGAGGCACATGCCT 9170

 39830840 TGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGGGAAGGGTCGTTT 39830899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9171 TGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGGGAAGGGTCGTTT 9230

 39830900 TGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTAAGGAGCCACACA 39830959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9231 TGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTAAGGAGCCACACA 9290

 39830960 GCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGTATTTACAACCAC 39831019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9291 GCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGTATTTACAACCAC 9350

 39831020 TCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCAGTAGCATTAGAT 39831079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9351 TCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCAGTAGCATTAGAT 9410

 39831080 TCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCTAGGTTGCGCTGT 39831139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9411 TCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCTAGGTTGCGCTGT 9470

 39831140 CCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACGCTCAGGTGGGAC 39831199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9471 CCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACGCTCAGGTGGGAC 9530

 39831200 CATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATTATGGTGAGTTCT 39831259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9531 CATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATTATGGTGAGTTCT 9590

 39831260 ATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCCTAATAAATGTAA 39831319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9591 ATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCCTAATAAATGTAA 9650

 39831320 TCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGAACTT 39831379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9651 TCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGAACTT 9710

 39831380 TCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTATTTAGGCCCATAC 39831439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9711 TCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTATTTAGGCCCATAC 9770

 39831440 CCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGCCTCCACAGGCAC 39831499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9771 CCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGCCTCCACAGGCAC 9830

 39831500 AGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAGCCTTCTCTCTAG 39831559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9831 AGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAGCCTTCTCTCTAG 9890

 39831560 GCCCTGA 39831566
          |||||||
     9891 GCCCTGA 9897

Alignment time is 9.1081 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3553] =>      3553 nucs 'mol-32-3046-183641_3553'

Score:        3519
Aligned:      3552        nucs
Identic:      3549 (100%) nucs =>      1795 (100%)      1754 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39816549,39818345] EXCISED REGION [39818348,39820102]
 second seq =>  [       1,    1796] EXCISED REGION [    1799,    3553]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [39818346,39818347]
 second seq =>         2 nucs [1797,1798]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        31 nucs [1771,1801] to [1773,1803]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39818341,39818345] to [39818348,39818352]
 second seq =>         5 nucs [1792,1796] to [1799,1803]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1797,1797] to [1798,1798]

 39816549 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTA 39816608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTA 60

 39816609 TTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTAT 39816668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTAT 120

 39816669 TGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAG 39816728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAG 180

 39816729 TCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACT 39816788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACT 240

 39816789 ACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTT 39816848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTT 300

 39816849 TGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTG 39816908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTG 360

 39816909 GCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAA 39816968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAA 420

 39816969 TATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTG 39817028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTG 480

 39817029 TTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGC 39817088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGC 540

 39817089 TATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATAT 39817148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATAT 600

 39817149 GCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTG 39817208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTG 660

 39817209 CCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCC 39817268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCC 720

 39817269 AGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGC 39817328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGC 780

 39817329 AAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACA 39817388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACA 840

 39817389 GAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTT 39817448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTT 900

 39817449 CCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTG 39817508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTG 960

 39817509 TCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGC 39817568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGC 1020

 39817569 AAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCA 39817628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCA 1080

 39817629 TGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCC 39817688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCC 1140

 39817689 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCA 39817748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCA 1200

 39817749 CCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGC 39817808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGC 1260

 39817809 AGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGC 39817868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGC 1320

 39817869 TAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTT 39817928
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1321 TAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTT 1380

 39817929 GGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCG 39817988
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTTTTTTTTTTT-AAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCG 1439

 39817989 ATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATG 39818048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATG 1499

 39818049 CCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCC 39818108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCC 1559

 39818109 ACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 39818168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 1619

 39818169 GGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGG 39818228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGG 1679

 39818229 CAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACC 39818288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACC 1739

 39818289 TGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 39818345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 1796

EXCISED REGION

 39818348 TTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCT 39818407
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1799 TTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCATGGCT 1858

 39818408 TACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGT 39818467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGT 1918

 39818468 AGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAG 39818527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAG 1978

 39818528 CTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATG 39818587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATG 2038

 39818588 AGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTC 39818647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTC 2098

 39818648 CTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTG 39818707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTG 2158

 39818708 TCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTG 39818767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTG 2218

 39818768 TGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTA 39818827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTA 2278

 39818828 GGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTG 39818887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTG 2338

 39818888 TCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGC 39818947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGC 2398

 39818948 TCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGA 39819007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGA 2458

 39819008 ATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGA 39819067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 ATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGA 2518

 39819068 ACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCAT 39819127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCAT 2578

 39819128 GAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAA 39819187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAA 2638

 39819188 GAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCA 39819247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCA 2698

 39819248 GCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTG 39819307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTG 2758

 39819308 TGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCC 39819367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCC 2818

 39819368 ACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACAC 39819427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACAC 2878

 39819428 ACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAA 39819487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAA 2938

 39819488 TCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAG 39819547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAG 2998

 39819548 GAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGG 39819607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGG 3058

 39819608 ATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAG 39819667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAG 3118

 39819668 GCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCA 39819727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCA 3178

 39819728 AGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAG 39819787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 AGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAG 3238

 39819788 TGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTC 39819847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTC 3298

 39819848 TGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTG 39819907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTG 3358

 39819908 AGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAG 39819967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAG 3418

 39819968 GCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTG 39820027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 GCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTG 3478

 39820028 AGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTC 39820087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTC 3538

 39820088 TTTTTCTTTCTAAGA 39820102
          |||||||||||||||
     3539 TTTTTCTTTCTAAGA 3553

Alignment time is 3.32117 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7078] =>      7078 nucs 'mol-32-30eb-117112_7078'

Score:        6934
Aligned:      7096        nucs
Identic:      7069 (100%) nucs =>       522 (100%)      6547 (100%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39819576,39820097] EXCISED REGION [39825202,39831773]
 second seq =>  [       1,     522] EXCISED REGION [     523,    7078]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39819576 AGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAG 39819635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAG 60

 39819636 GAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAA 39819695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAA 120

 39819696 TGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGG 39819755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGG 180

 39819756 AGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGA 39819815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGA 240

 39819816 GATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGAT 39819875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGAT 300

 39819876 GGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAA 39819935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAA 360

 39819936 GAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGA 39819995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGA 420

 39819996 TACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGA 39820055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGA 480

 39820056 GATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 522

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      523 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 582

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 642

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 702

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 762

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 822

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 882

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 942

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 1002

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 1062

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 1122

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 1182

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     1183 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 1227

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 1287

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 1347

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 1407

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 1467

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 1527

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 1587

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 1647

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 1707

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 1767

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 1827

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 1887

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 1947

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 2007

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 2067

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 2127

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 2187

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2188 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 2247

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 2307

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 2367

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 2427

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 2487

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2488 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 2547

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     2548 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 2607

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 2667

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2668 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 2727

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 2787

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 2847

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 2907

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 2967

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 3027

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 3087

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 3147

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 3207

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 3267

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3268 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 3327

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 3387

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 3447

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 3507

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 3567

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 3627

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 3687

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 3747

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 3807

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 3867

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 3927

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 3987

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 4047

 39828741 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 39828800
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTA--CTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 4105

 39828801 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 39828860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 4165

 39828861 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 39828920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 4225

 39828921 TTTATTTATTTA-TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 39828979
          |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TTTATTTA-TTATTTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 4284

 39828980 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 39829039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 4344

 39829040 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 39829099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 4404

 39829100 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 39829159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 4464

 39829160 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 39829219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 4524

 39829220 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 39829279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 4584

 39829280 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 39829339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 4644

 39829340 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 39829399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 4704

 39829400 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 39829459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 4764

 39829460 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 39829519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 4824

 39829520 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 39829579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 4884

 39829580 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 39829639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 4944

 39829640 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 39829699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 5004

 39829700 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 39829759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 5064

 39829760 TGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 39829819
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 TGTTTAGATTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 5124

 39829820 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 39829879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 5184

 39829880 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 39829939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 5244

 39829940 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 39829999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5245 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAGTTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 5304

 39830000 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 39830059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 5364

 39830060 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 39830119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 5424

 39830120 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 39830179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 5484

 39830180 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 39830239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 5544

 39830240 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 39830299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 5604

 39830300 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 39830359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 5664

 39830360 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 39830419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 5724

 39830420 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 39830479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 5784

 39830480 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 39830539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 5844

 39830540 ATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATTAAATTTTACCAC 39830599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 ATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATTAAATTTTACCAC 5904

 39830600 TTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATATGTTAGGAAGGG 39830659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 TTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATATGTTAGGAAGGG 5964

 39830660 TCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTTTCCCAGGGGGCA 39830719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 TCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTTTCCCAGGGGGCA 6024

 39830720 GTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCAC 39830779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 GTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCAC 6084

 39830780 AATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTGAGGCACATGCCT 39830839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 AATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTGAGGCACATGCCT 6144

 39830840 TGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGGGAAGGGTCGTTT 39830899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 TGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGGGAAGGGTCGTTT 6204

 39830900 TGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTAAGGAGCCACACA 39830959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 TGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTAAGGAGCCACACA 6264

 39830960 GCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGTATTTACAACCAC 39831019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 GCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGTATTTACAACCAC 6324

 39831020 TCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCAGTAGCATTAGAT 39831079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 TCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCAGTAGCATTAGAT 6384

 39831080 TCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCTAGGTTGCGCTGT 39831139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 TCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCTAGGTTGCGCTGT 6444

 39831140 CCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACGCTCAGGTGGGAC 39831199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 CCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACGCTCAGGTGGGAC 6504

 39831200 CATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATTATGGTGAGTTCT 39831259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 CATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATTATGGTGAGTTCT 6564

 39831260 ATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCCTAATAAATGTAA 39831319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 ATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCCTAATAAATGTAA 6624

 39831320 TCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGAACTT 39831379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 TCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGAACTT 6684

 39831380 TCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTATTTAGGCCCATAC 39831439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 TCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTATTTAGGCCCATAC 6744

 39831440 CCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGCCTCCACAGGCAC 39831499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 CCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGCCTCCACAGGCAC 6804

 39831500 AGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAGCCTTCTCTCTAG 39831559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 AGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAGCCTTCTCTCTAG 6864

 39831560 GCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCTTGGCAGCCTCTC 39831619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 GCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCTTGGCAGCCTCTC 6924

 39831620 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCATCAAGTCGGCCTG 39831679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6925 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCATCAAGTCGGCCTG 6984

 39831680 TCCAGGGCCAGCTCCTGCCTCCCGGCGCCCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTCAAGTTGGC 39831739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6985 TCCAGGGCCAGCTCCTGCCTCCCGGCGCCCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTCAAGTCGGC 7044

 39831740 CTCCCCAGGCCCAGCTCCAGCCTCTCGGCGGCCT 39831773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7045 CTCCCCAGGCCCAGCTCCAGCCTCTCGGCGGCCT 7078

Alignment time is 6.79486 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7885] =>      7885 nucs 'mol-32-3101-000611_7885'

Score:        7686
Aligned:      7903        nucs
Identic:      7871 (100%) nucs =>       467 (100%)      7404 (100%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39819631,39820097] EXCISED REGION [39825202,39832632]
 second seq =>  [       1,     467] EXCISED REGION [     468,    7885]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39819631 CAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGG 39819690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGG 60

 39819691 TGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGT 39819750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGT 120

 39819751 TAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACAT 39819810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACAT 180

 39819811 GATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAG 39819870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAG 240

 39819871 CAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAA 39819930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAA 300

 39819931 CAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTT 39819990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTT 360

 39819991 AAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAA 39820050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAA 420

 39820051 GAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 467

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 527

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 587

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 647

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 707

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 767

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 827

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 887

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 947

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 ACCTGAGTTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 1007

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 1067

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 1127

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     1128 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 1172

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 1232

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 1292

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 1352

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 1412

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 1472

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 1532

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 1592

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 1652

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 1712

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 1772

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 1832

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 1892

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 1952

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 2012

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 2072

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 2132

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2133 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 2192

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 2252

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 2312

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 2372

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 2432

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2433 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 2492

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     2493 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 2552

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 2612

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2613 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 2672

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 2732

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 2792

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 2852

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 2912

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 2972

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 3032

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 3092

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 3152

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 3212

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3213 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 3272

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 3332

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 3392

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 3452

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 3512

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 3572

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 3632

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 3692

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 3752

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 3812

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 3872

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 3932

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 3992

 39828741 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 39828800
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTA--CTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 4050

 39828801 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 39828860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 4110

 39828861 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 39828920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 4170

 39828921 TTTATTTATTTA-TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 39828979
          |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 TTTATTTA-TTATTTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 4229

 39828980 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 39829039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 4289

 39829040 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 39829099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 4349

 39829100 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 39829159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 4409

 39829160 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 39829219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 4469

 39829220 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 39829279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 4529

 39829280 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 39829339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 4589

 39829340 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 39829399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 4649

 39829400 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 39829459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 4709

 39829460 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 39829519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 4769

 39829520 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 39829579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 4829

 39829580 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 39829639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 4889

 39829640 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 39829699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 4949

 39829700 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 39829759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 5009

 39829760 TGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 39829819
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 TGTTTAGATTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 5069

 39829820 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 39829879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 5129

 39829880 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 39829939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 5189

 39829940 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 39829999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5190 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAGTTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 5249

 39830000 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 39830059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 5309

 39830060 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 39830119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 5369

 39830120 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 39830179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 5429

 39830180 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 39830239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 5489

 39830240 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 39830299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 5549

 39830300 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 39830359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 5609

 39830360 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 39830419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 5669

 39830420 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 39830479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 5729

 39830480 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 39830539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5730 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 5789

 39830540 ATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATTAAATTTTACCAC 39830599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5790 ATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATTAAATTTTACCAC 5849

 39830600 TTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATATGTTAGGAAGGG 39830659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 TTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATATGTTAGGAAGGG 5909

 39830660 TCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTTTCCCAGGGGGCA 39830719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 TCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTTTCCCAGGGGGCA 5969

 39830720 GTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCAC 39830779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 GTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCAC 6029

 39830780 AATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTGAGGCACATGCCT 39830839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 AATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTGAGGCACATGCCT 6089

 39830840 TGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGGGAAGGGTCGTTT 39830899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6090 TGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGGGAAGGGTCGTTT 6149

 39830900 TGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTAAGGAGCCACACA 39830959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6150 TGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTAAGGAGCCACACA 6209

 39830960 GCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGTATTTACAACCAC 39831019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6210 GCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGTATTTACAACCAC 6269

 39831020 TCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCAGTAGCATTAGAT 39831079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6270 TCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCAGTAGCATTAGAT 6329

 39831080 TCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCTAGGTTGCGCTGT 39831139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6330 TCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCTAGGTTGCGCTGT 6389

 39831140 CCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACGCTCAGGTGGGAC 39831199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6390 CCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACGCTCAGGTGGGAC 6449

 39831200 CATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATTATGGTGAGTTCT 39831259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6450 CATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATTATGGTGAGTTCT 6509

 39831260 ATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCCTAATAAATGTAA 39831319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6510 ATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCCTAATAAATGTAA 6569

 39831320 TCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGAACTT 39831379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6570 TCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGAACTT 6629

 39831380 TCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTATTTAGGCCCATAC 39831439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6630 TCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTATTTAGGCCCATAC 6689

 39831440 CCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGCCTCCACAGGCAC 39831499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6690 CCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGCCTCCACAGGCAC 6749

 39831500 AGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAGCCTTCTCTCTAG 39831559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6750 AGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAGCCTTCTCTCTAG 6809

 39831560 GCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCTTGGCAGCCTCTC 39831619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6810 GCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCTTGGCAGCCTCTC 6869

 39831620 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCATCAAGTCGGCCTG 39831679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6870 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCATCAAGTCGGCCTG 6929

 39831680 TCCAGGGCCAGCTCCTGCCTCCCGGCGCCCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTCAAGTTGGC 39831739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6930 TCCAGGGCCAGCTCCTGCCTCCCGGCGCCCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTCAAGTCGGC 6989

 39831740 CTCCCCAGGCCCAGCTCCAGCCTCTCGGCGGCCTCTCCGGGTGCAAAAGTTCCTCGAGTC 39831799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6990 CTCCCCAGGCCCAGCTCCAGCCTCTCGGCGGCCTCTCCGGGTGCAAAAGTTCCTCGAGTC 7049

 39831800 AGCCTCTCCAGGCCCAGCTCCTCCTGCCTCCCAGT-GCCTCTTTCGGCCCAGCCCAGCTC 39831858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     7050 AGCCTCTCCAGGCCCAGCTCCTCCTGCCTCCCAGTGGCCTCTTTCGGCCCAGCCCAGCTC 7109

 39831859 ATGCCTCTGGGCGGCCTTCCCAGGCCCCGCTTTTGACTTTTGGCGGCCTCTGCAGGCCTC 39831918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7110 ATGCCTCTGGGCGGCCTTCCCAGGCCCCGCTTTTGACTTTTGGCGGCCTCTGCAGGCCTC 7169

 39831919 GACAAGGCCCGGCCTCCTGCCTCCCGAA-GCCTGCACAGGCCCAGCCTCTGCCTCACAGC 39831977
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     7170 GACAAGGCCCGGCCTCCTGCCTCCCGAAGGCCTGCACAGGCCCAGCCTCTGCCTCACAGC 7229

 39831978 AGACTCTCCACGCCCAGCTAGCTCTCGCCTCACTGCGGCCTCCCCAGTCCAAAGCTCCTG 39832037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7230 AGACTCTCCACGCCCAGCTAGCTCTCGCCTCACTGCGGCCTCCCCAGTCCAAAGCTCCTG 7289

 39832038 CCTCTCGGCCGCTTCGGCAGGCCCAGCTCCCGCCTGCCAGT-GCCTCTTCAGGCCCATGG 39832096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     7290 CCTCTCGGCCGCTTCGGCAGGCCCAGCTCCCGCCTGCCAGTGGCCTCTTCAGGCCCATGG 7349

 39832097 GGCTCATTCCTCACAACGGCCTTTCCAGGCCCCGTTTTTCCCTTCCGGCGGCCTCTCCGG 39832156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7350 GGCTCATTCCTCACAACGGCCTTTCCAGGCCCCGTTTTTCCCTTCCGGCGGCCTCTCCGG 7409

 39832157 GCCCAGAACCTCCTCAAGTTGGCCTCTCCAGACCCACTTGCACCCTCCGGGCGTCCTCTC 39832216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7410 GCCCAGAACCTCCTCAAGTTGGCCTCTCCAGACCCACTTGCACCCTCCGGGCGTCCTCTC 7469

 39832217 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCTGCGTCTCCAGGCCCGACTCCTGCCTCCCAACAACCT 39832276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7470 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCTGCGTCTCCAGGCCCGACTCCTGCCTCCCAACAACCT 7529

 39832277 CTTTGGACTCAGTGCCTGCCCATCTCCTGGCGGCCTTGGTCGGCCCACAGCTTCCTCAAG 39832336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7530 CTTTGGACTCAGTGCCTGCCCATCTCCTGGCGGCCTTGGTCGGCCCACAGCTTCCTCAAG 7589

 39832337 CCAAGCTCCCCAGGCCCAGGTCAGGCCTCACGGTGGCCTCTCCAGGATCAGCTCCTGCCC 39832396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7590 CCAAGCTCCCCAGGCCCAGGTCAGGCCTCACGGTGGCCTCTCCAGGATCAGCTCCTGCCC 7649

 39832397 TCCGATGGTGTCTCCAGGCCCCAAATGGTCTCCGGCCAGTGGGCTCCTCCACGCCCAGCT 39832456
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7650 TCCGATGGCGTCTCCAGGCCCCAAATGGTCTCCGGCCAGTGGGCTCCTCCACGCCCAGCT 7709

 39832457 TGGGCCTCCCGGCGACCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTGAAGTCGGCCTCTCCCGGCCCT 39832516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7710 TGGGCCTCCCGGCGACCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTGAAGTCGGCCTCTCCCGGCCCT 7769

 39832517 GCCTCCCAGCAAGTAAGCAAGCTTTTTTGGCTTAGCTCCTGCCCAGCTCCCAACCGCCTT 39832576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7770 GCCTCCCAGCAAGTAAGCAAGCTTTTTTGGCTTAGCTCCTGCCCAGCTCCCAACCGCCTT 7829

 39832577 TGTAGGCCCCGAACTTTCTCCAGCCAAGCTCTTCGGGCCCACCTCCTGCCTCCCGG 39832632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7830 TGTAGGCCCCGAACTTTCTCCAGCCAAGCTCTTCGGGCCCACCTCCTGCCTCCCGG 7885

Alignment time is 7.3632 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6898] =>      6898 nucs 'mol-32-310c-186285_6898'

Score:        6776
Aligned:      6914        nucs
Identic:      6890 (100%) nucs =>      4241 (100%)      2649 ( 99%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39815853,39820097] EXCISED REGION [39825202,39827868]
 second seq =>  [       1,    4245] EXCISED REGION [    4246,    6898]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39815853 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCATCTCGAACTCC 39815912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCATCTCGAACTCC 60

 39815913 TGAACTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAATGCAGGGATTACAGACATGAGCT 39815972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
       61 TGAACTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTACAGACATGAGCT 120

 39815973 ACCACTCCGGGCCTCCATTTCTTTTTTGTAGTCTTTAATAAACAGCTGCTATCGTTGCAG 39816032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCACTCCGGGCCTCCATTTCTTTTTTGTAGTCTTTAATAAACAGCTGCTATCGTTGCAG 180

 39816033 ACTTGCTATTTAGGCACTTAGGAATTTTTCACTAGAAGGCGTGTAAAGAAAGACCACGGA 39816092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTGCTATTTAGGCACTTAGGAATTTTTCACTAGAAGGCGTGTAAAGAAAGACCACGGA 240

 39816093 CCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTACATGACTGTCCCCAGAGCTATAACT 39816152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTACATGACTGTCCCCAGAGCTATAACT 300

 39816153 TTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAACTGAGCCTAATCAGCCACTCACC 39816212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAACTGAGCCTAATCAGCCACTCACC 360

 39816213 CTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTCTCCTCCAACTTGGCTATACTCACA 39816272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTCTCCTCCAACTTGGCTATACTCACA 420

 39816273 AAGTAATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTG 39816332
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTGATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTG 480

 39816333 CTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCACTGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCA 39816392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCACTGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCA 540

 39816393 AGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGACATGTGCCACCATGTC 39816452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGACATGTGCCACCATGTC 600

 39816453 CAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGATCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGG 39816512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGATCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGG 660

 39816513 CTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 39816572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 720

 39816573 AGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATTATTTTAAATAATAGCTTTA 39816632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATTATTTTAAATAATAGCTTTA 780

 39816633 TTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATTGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTT 39816692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATTGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTT 840

 39816693 TAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACTTTTAGAACCTTTCATTACC 39816752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACTTTTAGAACCTTTCATTACC 900

 39816753 CTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTCCTACTCCCCCAACATGCCT 39816812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTCCTACTCCCCCAACATGCCT 960

 39816813 TGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCT 39816872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCT 1020

 39816873 GGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGT 39816932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGT 1080

 39816933 GTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATA 39816992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATA 1140

 39816993 TTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGG 39817052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGG 1200

 39817053 TTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTT 39817112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTT 1260

 39817113 TGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATT 39817172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATT 1320

 39817173 GTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTA 39817232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTA 1380

 39817233 CACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGG 39817292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGG 1440

 39817293 AGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGAT 39817352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGAT 1500

 39817353 TAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTAC 39817412
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAAAAAAAAAAA-TCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTAC 1559

 39817413 ACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGA 39817472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGA 1619

 39817473 CATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGAT 39817532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGAT 1679

 39817533 GCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCC 39817592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCC 1739

 39817593 TCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGG 39817652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGG 1799

 39817653 GATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCT 39817712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCT 1859

 39817713 CAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATT 39817772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATT 1919

 39817773 TGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAAT 39817832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAAT 1979

 39817833 TATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGC 39817892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGC 2039

 39817893 CAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGT 39817952
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGT 2099

 39817953 CTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGC 39818012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGC 2159

 39818013 CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTA 39818072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTA 2219

 39818073 TATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTT 39818132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTT 2279

 39818133 CAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATG 39818192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATG 2339

 39818193 CCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTA 39818252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTA 2399

 39818253 CAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCT 39818312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCT 2459

 39818313 CTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-ACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTG 39818371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2460 CTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTG 2519

 39818372 TCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGA 39818431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGA 2579

 39818432 TCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCA 39818491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCA 2639

 39818492 CCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTC 39818551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTC 2699

 39818552 ACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCC 39818611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCC 2759

 39818612 TGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCC 39818671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCC 2819

 39818672 TAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGA 39818731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGA 2879

 39818732 AATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTA 39818791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTA 2939

 39818792 CTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAA 39818851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAA 2999

 39818852 TGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGT 39818911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGT 3059

 39818912 CCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTC 39818971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTC 3119

 39818972 TTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGA 39819031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGA 3179

 39819032 GATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCC 39819091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCC 3239

 39819092 TGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTG 39819151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTG 3299

 39819152 GTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTC 39819211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTC 3359

 39819212 TCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTT 39819271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTT 3419

 39819272 TATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGC 39819331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGC 3479

 39819332 AATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTAC 39819391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTAC 3539

 39819392 TGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTC 39819451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTC 3599

 39819452 ATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCC 39819511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCC 3659

 39819512 ATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGA 39819571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGA 3719

 39819572 GTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCC 39819631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCC 3779

 39819632 AGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGT 39819691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGT 3839

 39819692 GAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTT 39819751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 GAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTT 3899

 39819752 AAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATG 39819811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATG 3959

 39819812 ATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGC 39819871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 ATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGC 4019

 39819872 AGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAAC 39819931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAAC 4079

 39819932 AGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTA 39819991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTA 4139

 39819992 AAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAG 39820051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAG 4199

 39820052 AGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 4245

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 4305

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 4365

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 4425

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 4485

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 4545

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 4605

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 4665

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 4725

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 4785

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 4845

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 4905

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     4906 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 4950

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 5010

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 5070

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 5130

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 5190

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 5250

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 5310

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 5370

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 5430

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 5490

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 5550

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 5610

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 5670

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 5730

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 5790

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 5850

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 5910

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5911 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 5970

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5971 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 6030

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6031 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 6090

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6091 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 6150

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6151 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 6210

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6211 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 6270

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     6271 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 6330

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6331 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 6390

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6391 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 6450

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6451 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 6510

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6511 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 6570

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6571 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 6630

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6631 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 6690

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6691 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 6750

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6751 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 6810

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6811 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 6870

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGT 39827868
          ||||||||||||||||||||||||||||
     6871 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGT 6898

Alignment time is 6.38433 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2653] =>      2653 nucs 'mol-32-310c-186285_2653'

Score:        2609
Aligned:      2653        nucs
Identic:      2649 (100%) nucs =>       701 (100%)      1948 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39825202,39825902] EXCISED REGION [39825918,39827868]
 second seq =>  [       1,     701] EXCISED REGION [     702,    2653]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [39825903,39825917]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        26 nucs [39825903,39825928] to [39825918,39825943]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39825903,39825907] to [39825913,39825917]
 second seq =>         0 nucs

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 60

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 120

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 180

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 240

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 300

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 360

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 420

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 480

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 540

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 600

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 660

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 39825902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 701

EXCISED REGION

 39825918 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCT 39825977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCT 761

 39825978 GGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGG 39826037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 GGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGG 821

 39826038 TTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAG 39826097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 TTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAG 881

 39826098 AAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGC 39826157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 AAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGC 941

 39826158 AATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAG 39826217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 AATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAG 1001

 39826218 GAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAAT 39826277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 GAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAAT 1061

 39826278 AAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGG 39826337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 AAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGG 1121

 39826338 GAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAA 39826397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 GAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAA 1181

 39826398 GCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGG 39826457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 GCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGG 1241

 39826458 AAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTG 39826517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 AAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTG 1301

 39826518 CTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAA 39826577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 CTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAA 1361

 39826578 CATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTC 39826637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTC 1421

 39826638 AGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGT 39826697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 AGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGT 1481

 39826698 CGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGG 39826757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 CGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGG 1541

 39826758 TCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCT 39826817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCT 1601

 39826818 TTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAG 39826877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAG 1661

 39826878 TGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGC 39826937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGC 1721

 39826938 AAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTC 39826997
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 AGGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTC 1781

 39826998 AAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGA 39827057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 AAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGA 1841

 39827058 GGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCA 39827117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 GGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCA 1901

 39827118 AGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTA 39827177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 AGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTA 1961

 39827178 CTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGC 39827237
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1962 CTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGC 2021

 39827238 AGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA- 39827296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2022 AGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCAC 2081

 39827297 AATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGC 39827356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 AATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGC 2141

 39827357 AGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCC 39827416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2142 AGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCC 2201

 39827417 TGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCG 39827476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 TGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCG 2261

 39827477 CAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAG 39827536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 CAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAG 2321

 39827537 GTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATAC 39827596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 GTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATAC 2381

 39827597 AATAATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGT 39827656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 AATAATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGT 2441

 39827657 AGGAAAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTT 39827716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AGGAAAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTT 2501

 39827717 CACTCCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCA 39827776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 CACTCCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCA 2561

 39827777 ACATGTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTAT 39827836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 ACATGTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTAT 2621

 39827837 TATATTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGT 39827868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 TATATTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGT 2653

Alignment time is 2.4274 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3179] =>      3179 nucs 'mol-32-314e-173504_3179'

Score:        3155
Aligned:      3194        nucs
Identic:      3179 (100%) nucs =>      1727 (100%)      1452 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818371,39820097] EXCISED REGION [39825202,39826668]
 second seq =>  [       1,    1727] EXCISED REGION [    1728,    3179]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818371 GTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGG 39818430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGG 60

 39818431 ATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCC 39818490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCC 120

 39818491 ACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCT 39818550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCT 180

 39818551 CACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACC 39818610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACC 240

 39818611 CTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTC 39818670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTC 300

 39818671 CTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAG 39818730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAG 360

 39818731 AAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTT 39818790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTT 420

 39818791 ACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCA 39818850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCA 480

 39818851 ATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGG 39818910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGG 540

 39818911 TCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGT 39818970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGT 600

 39818971 CTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAG 39819030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAG 660

 39819031 AGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTC 39819090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTC 720

 39819091 CTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCT 39819150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCT 780

 39819151 GGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCT 39819210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCT 840

 39819211 CTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATT 39819270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATT 900

 39819271 TTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAG 39819330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAG 960

 39819331 CAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTA 39819390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTA 1020

 39819391 CTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATT 39819450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATT 1080

 39819451 CATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTC 39819510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTC 1140

 39819511 CATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAG 39819570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAG 1200

 39819571 AGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCC 39819630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCC 1260

 39819631 CAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGG 39819690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGG 1320

 39819691 TGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGT 39819750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGT 1380

 39819751 TAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACAT 39819810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACAT 1440

 39819811 GATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAG 39819870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAG 1500

 39819871 CAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAA 39819930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAA 1560

 39819931 CAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTT 39819990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTT 1620

 39819991 AAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAA 39820050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAA 1680

 39820051 GAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 1727

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1787

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1847

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1907

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1967

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 2027

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 2087

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 2147

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 2207

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 2267

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 2327

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 2387

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     2388 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 2432

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 2492

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 2552

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 2612

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 2672

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 2732

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 2792

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 2852

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 2912

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 2972

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 3032

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 3092

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 3152

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGA 39826668
          |||||||||||||||||||||||||||
     3153 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGA 3179

Alignment time is 2.90308 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2791] =>      2791 nucs 'mol-32-3159-071307_2791'

Score:        2767
Aligned:      2806        nucs
Identic:      2791 ( 99%) nucs =>      1566 (100%)      1225 ( 99%)
Gaps:           15 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818532,39820097] EXCISED REGION [39825202,39826441]
 second seq =>  [       1,    1566] EXCISED REGION [    1567,    2791]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818532 TGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCC 39818591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCC 60

 39818592 ACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTA 39818651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTA 120

 39818652 GCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCA 39818711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCA 180

 39818712 GGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAG 39818771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAG 240

 39818772 GAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGAT 39818831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGAT 300

 39818832 GGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCAC 39818891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCAC 360

 39818892 TCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAA 39818951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAA 420

 39818952 GCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTT 39819011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTT 480

 39819012 TGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTC 39819071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTC 540

 39819072 CTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGC 39819131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGC 600

 39819132 CATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAAT 39819191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAAT 660

 39819192 GCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTG 39819251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTG 720

 39819252 ATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCT 39819311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCT 780

 39819312 GTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCA 39819371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCA 840

 39819372 CAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACAC 39819431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACAC 900

 39819432 TCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTG 39819491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTG 960

 39819492 GGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGC 39819551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGC 1020

 39819552 CGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATAT 39819611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATAT 1080

 39819612 CACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTG 39819671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTG 1140

 39819672 AGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGC 39819731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGC 1200

 39819732 AGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGAT 39819791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGAT 1260

 39819792 GTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTA 39819851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTA 1320

 39819852 GAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTT 39819911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTT 1380

 39819912 GAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGC 39819971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGC 1440

 39819972 TAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGT 39820031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGT 1500

 39820032 TCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTT 39820091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTT 1560

 39820092 TCTTTC 39820097
          ||||||
     1561 TCTTTC 1566

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1626

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1686

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1746

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1806

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 1866

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 1926

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 1986

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 2046

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 2106

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 2166

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 2226

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     2227 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 2271

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 2331

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 2391

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 2451

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 2511

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 2571

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 2631

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 2691

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 2751

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTC 39826441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTC 2791

Alignment time is 2.53937 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3704] =>      3704 nucs 'mol-32-3159-150634_3704'

Score:        3659
Aligned:      3705        nucs
Identic:      3700 (100%) nucs =>      3251 (100%)       449 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39816844,39820097] EXCISED REGION [39825202,39825650]
 second seq =>  [       1,    3255] EXCISED REGION [    3256,    3704]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39816844 TTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTT 39816903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTT 60

 39816904 TTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCT 39816963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCT 120

 39816964 ATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTT 39817023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTT 180

 39817024 ATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAAT 39817083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAAT 240

 39817084 GCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGA 39817143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGA 300

 39817144 TATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGA 39817203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGA 360

 39817204 AACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATA 39817263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATA 420

 39817264 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCC 39817323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCC 480

 39817324 TGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAA 39817383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAA 540

 39817384 GAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGT 39817443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGT 600

 39817444 GGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTG 39817503
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
      601 GGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTT-CTAGATAGGGGCTTG 659

 39817504 CTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCC 39817563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCC 719

 39817564 CAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGC 39817623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGC 779

 39817624 CACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAT 39817683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAT 839

 39817684 ACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTG 39817743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTG 899

 39817744 AGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTT 39817803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTT 959

 39817804 AAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGG 39817863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGG 1019

 39817864 GAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGG 39817923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1020 GAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGG 1079

 39817924 TTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTG 39817983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTG 1139

 39817984 GTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGT 39818043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGT 1199

 39818044 ACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGT 39818103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGT 1259

 39818104 TGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAG 39818163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAG 1319

 39818164 TGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGC 39818223
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGCTGGGATAGCAAGTATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGC 1379

 39818224 CTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGG 39818283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGG 1439

 39818284 GTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 39818343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 1499

 39818344 TT--ACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATC 39818401
          ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATC 1559

 39818402 ATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTA 39818461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTA 1619

 39818462 CCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGT 39818521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGT 1679

 39818522 CTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACA 39818581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACA 1739

 39818582 GGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAA 39818641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAA 1799

 39818642 ATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTAT 39818701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTAT 1859

 39818702 TGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTC 39818761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTC 1919

 39818762 ACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCC 39818821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCC 1979

 39818822 ACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTT 39818881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTT 2039

 39818882 GCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTC 39818941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTC 2099

 39818942 CCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACT 39819001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACT 2159

 39819002 CAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGA 39819061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGA 2219

 39819062 CCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTAC 39819121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTAC 2279

 39819122 AGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACT 39819181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACT 2339

 39819182 TTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTA 39819241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTA 2399

 39819242 AGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATG 39819301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATG 2459

 39819302 TAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACT 39819361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACT 2519

 39819362 TTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAA 39819421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAA 2579

 39819422 TAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCC 39819481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCC 2639

 39819482 TGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTG 39819541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTG 2699

 39819542 ACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAG 39819601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAG 2759

 39819602 CAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCA 39819661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCA 2819

 39819662 GATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGC 39819721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGC 2879

 39819722 CTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAG 39819781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAG 2939

 39819782 GAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCA 39819841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCA 2999

 39819842 GGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTC 39819901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTC 3059

 39819902 TCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGT 39819961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGT 3119

 39819962 GGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGA 39820021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGA 3179

 39820022 CAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTT 39820081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTT 3239

 39820082 CTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          ||||||||||||||||
     3240 CTTTTCTTTTTCTTTC 3255

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 3315

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 3375

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 3435

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 3495

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 3555

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 3615

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 3675

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTC 39825650
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3676 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTC 3704

Alignment time is 3.51413 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2261] =>      2261 nucs 'mol-32-3164-250345_2261'

Score:        2261
Aligned:      2261        nucs
Identic:      2261 (100%) nucs =>      1665 (100%)       596 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818433,39820097] EXCISED REGION [39825202,39825797]
 second seq =>  [       1,    1665] EXCISED REGION [    1666,    2261]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818433 CAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCAC 39818492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCAC 60

 39818493 CCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCA 39818552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCA 120

 39818553 CCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCT 39818612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCT 180

 39818613 GCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCT 39818672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCT 240

 39818673 AATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAA 39818732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAA 300

 39818733 ATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTAC 39818792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTAC 360

 39818793 TCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAAT 39818852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAAT 420

 39818853 GTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTC 39818912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTC 480

 39818913 CAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCT 39818972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCT 540

 39818973 TCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAG 39819032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAG 600

 39819033 ATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCT 39819092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCT 660

 39819093 GCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGG 39819152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGG 720

 39819153 TTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCT 39819212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCT 780

 39819213 CCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTT 39819272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTT 840

 39819273 ATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCA 39819332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCA 900

 39819333 ATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACT 39819392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACT 960

 39819393 GAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCA 39819452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCA 1020

 39819453 TGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCA 39819512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCA 1080

 39819513 TGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAG 39819572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAG 1140

 39819573 TAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCA 39819632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCA 1200

 39819633 GAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTG 39819692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTG 1260

 39819693 AAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTA 39819752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTA 1320

 39819753 AGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGA 39819812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGA 1380

 39819813 TGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCA 39819872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCA 1440

 39819873 GATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACA 39819932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACA 1500

 39819933 GAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAA 39819992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAA 1560

 39819993 AGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGA 39820052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGA 1620

 39820053 GGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 1665

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1725

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1785

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1845

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1905

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 1965

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 2025

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 2085

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 2145

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 2205

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGA 39825797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGA 2261

Alignment time is 2.068 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6378] =>      6378 nucs 'mol-32-3190-208277_6378'

Score:        6278
Aligned:      6394        nucs
Identic:      6372 (100%) nucs =>      4034 (100%)      2338 ( 99%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39816061,39820097] EXCISED REGION [39825202,39827557]
 second seq =>  [       1,    4036] EXCISED REGION [    4037,    6378]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39816061 TCACTAGAAGGCGTGTAAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCT 39816120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACTAGAAGGCGTGTAAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCT 60

 39816121 TTGACTACATGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTT 39816180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGACTACATGACTGTCCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTT 120

 39816181 AGCTAGCAACTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTG 39816240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTAGCAACTGAGCCTAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTG 180

 39816241 TCTATTTCTCCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGTAATAAAAACTTGCATTTGTTTTCT 39816300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      181 TCTATTTCTCCTCCAACTTGGCTATACTCACAAAGTGATAAAAACTTGCATTTGTTTTCT 240

 39816301 TTCCTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCA 39816360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCCTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCA 300

 39816361 TGGTTCACTGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAG 39816420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTTCACTGTAGCCTGAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAG 360

 39816421 TAGCTGGGACTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAG 39816480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCTGGGACTACAGACATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAG 420

 39816481 AGACAGGATCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCT 39816540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGACAGGATCTTGCCAGGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCT 480

 39816541 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCC 39816600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCC 540

 39816601 CCCTATTATTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACT 39816660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTATTATTATTATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACT 600

 39816661 TTATTTATTGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGAT 39816720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATTTATTGAAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGAT 660

 39816721 CACCACAGTCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCT 39816780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACCACAGTCACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCT 720

 39816781 TAGCCACTACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGAT 39816840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCCACTACCTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGAT 780

 39816841 TTATTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGAT 39816900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATTTTTTGTCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGAT 840

 39816901 CTTTTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTG 39816960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTTGTGGCTTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTG 900

 39816961 TCTATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTG 39817020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTATCAATATTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTG 960

 39817021 TTTATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAAT 39817080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTATCTGTTCATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAAT 1020

 39817081 AATGCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTG 39817140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGCTGCTATGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTG 1080

 39817141 GGATATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTG 39817200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGATATATGCCTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTG 1140

 39817201 AGAAACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCT 39817260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAAACTGCCACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCT 1200

 39817261 ATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCA 39817320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCA 1260

 39817321 GCCTGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGA 39817380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCTGGGCAAGATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGA 1320

 39817381 CAAGAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTA 39817440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGAACAGAACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTA 1380

 39817441 TGTGGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGC 39817500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTGGGTTCCAACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGC 1440

 39817501 TTGCTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACC 39817560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGCTCTGTCTCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACC 1500

 39817561 TCCCAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTA 39817620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCCAGGCAAAAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTA 1560

 39817621 TGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCT 39817680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCT 1620

 39817681 CATACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGG 39817740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGG 1680

 39817741 CTGAGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATAC 39817800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGAGCCACCATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATAC 1740

 39817801 CTTAAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCAT 39817860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTAAAGCAGTATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCAT 1800

 39817861 TGGGAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTT 39817920
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1801 TGGGAAGCTAAGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTT 1860

 39817921 TGGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCA 39817980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCA 1920

 39817981 GTGGTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACA 39818040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGGTGCGATCTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACA 1980

 39818041 GGTACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCA 39818100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTACATGCCACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCA 2040

 39818101 TGTTGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCA 39818160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTTGGCCACACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCA 2100

 39818161 AAGTGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACC 39818220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGTGCTGGGATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACC 2160

 39818221 AGCCTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTG 39818280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCCTGGGCAACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTG 2220

 39818281 GGGGTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 39818340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGGTACCTGCCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 2280

 39818341 TTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGAT 39818400
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTT-ACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGAT 2339

 39818401 CATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCT 39818460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCT 2399

 39818461 ACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGG 39818520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGG 2459

 39818521 TCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTAC 39818580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTAC 2519

 39818581 AGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCA 39818640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCA 2579

 39818641 AATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTA 39818700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTA 2639

 39818701 TTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTT 39818760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTT 2699

 39818761 CACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGC 39818820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGC 2759

 39818821 CACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCT 39818880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCT 2819

 39818881 TGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACT 39818940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACT 2879

 39818941 CCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACAC 39819000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACAC 2939

 39819001 TCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTG 39819060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTG 2999

 39819061 ACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTA 39819120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTA 3059

 39819121 CAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCAC 39819180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCAC 3119

 39819181 TTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTT 39819240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTT 3179

 39819241 AAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTAT 39819300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTAT 3239

 39819301 GTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTAC 39819360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTAC 3299

 39819361 TTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGA 39819420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGA 3359

 39819421 ATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTC 39819480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTC 3419

 39819481 CTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGT 39819540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGT 3479

 39819541 GACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAA 39819600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAA 3539

 39819601 GCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGC 39819660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGC 3599

 39819661 AGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTG 39819720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTG 3659

 39819721 CCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAA 39819780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAA 3719

 39819781 GGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTC 39819840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTC 3779

 39819841 AGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCT 39819900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCT 3839

 39819901 CTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGG 39819960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGG 3899

 39819961 TGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTG 39820020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTG 3959

 39820021 ACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTT 39820080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 ACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTT 4019

 39820081 TCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||
     4020 TCTTTTCTTTTTCTTTC 4036

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 4096

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 4156

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 4216

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 4276

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 4336

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 4396

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 4456

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 4516

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 4576

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 4636

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 4696

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     4697 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 4741

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 4801

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 4861

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 4921

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 4981

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4982 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 5041

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5042 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 5101

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5102 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 5161

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5162 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 5221

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5222 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 5281

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5282 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 5341

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5342 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 5401

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5402 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 5461

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5462 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 5521

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5522 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 5581

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5582 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 5641

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5642 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 5701

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5702 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 5761

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5762 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 5821

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5822 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 5881

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5882 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 5941

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5942 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 6001

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6002 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 6061

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     6062 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 6121

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6122 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 6181

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6182 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 6241

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6242 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 6301

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6302 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 6361

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCC 39827557
          |||||||||||||||||
     6362 AGAGTTCAAGACCAGCC 6378

Alignment time is 5.8696 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2342] =>      2342 nucs 'mol-32-3190-208277_2342'

Score:        2298
Aligned:      2342        nucs
Identic:      2338 (100%) nucs =>       701 (100%)      1637 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39825202,39825902] EXCISED REGION [39825918,39827557]
 second seq =>  [       1,     701] EXCISED REGION [     702,    2342]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [39825903,39825917]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        26 nucs [39825903,39825928] to [39825918,39825943]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39825903,39825907] to [39825913,39825917]
 second seq =>         0 nucs

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 60

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 120

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 180

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 240

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 300

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 360

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 420

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 480

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 540

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 600

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 660

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 39825902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 701

EXCISED REGION

 39825918 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCT 39825977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCT 761

 39825978 GGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGG 39826037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 GGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGG 821

 39826038 TTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAG 39826097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 TTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAG 881

 39826098 AAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGC 39826157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 AAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGC 941

 39826158 AATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAG 39826217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 AATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAG 1001

 39826218 GAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAAT 39826277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 GAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAAT 1061

 39826278 AAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGG 39826337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 AAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGG 1121

 39826338 GAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAA 39826397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 GAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAA 1181

 39826398 GCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGG 39826457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 GCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGG 1241

 39826458 AAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTG 39826517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 AAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTG 1301

 39826518 CTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAA 39826577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 CTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAA 1361

 39826578 CATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTC 39826637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTC 1421

 39826638 AGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGT 39826697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 AGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGT 1481

 39826698 CGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGG 39826757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 CGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGG 1541

 39826758 TCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCT 39826817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCT 1601

 39826818 TTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAG 39826877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAG 1661

 39826878 TGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGC 39826937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGC 1721

 39826938 AAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTC 39826997
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 AGGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTC 1781

 39826998 AAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGA 39827057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 AAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGA 1841

 39827058 GGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCA 39827117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 GGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCA 1901

 39827118 AGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTA 39827177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 AGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTA 1961

 39827178 CTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGC 39827237
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1962 CTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGC 2021

 39827238 AGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA- 39827296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2022 AGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCAC 2081

 39827297 AATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGC 39827356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 AATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGC 2141

 39827357 AGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCC 39827416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2142 AGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCC 2201

 39827417 TGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCG 39827476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 TGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCG 2261

 39827477 CAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAG 39827536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 CAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAG 2321

 39827537 GTCAAGAGTTCAAGACCAGCC 39827557
          |||||||||||||||||||||
     2322 GTCAAGAGTTCAAGACCAGCC 2342

Alignment time is 2.18044 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7754] =>      7754 nucs 'mol-32-32f0-126628_7754'

Score:        7718
Aligned:      7729        nucs
Identic:      7728 (100%) nucs =>      7259 (100%)       469 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818643,39825902] EXCISED REGION [39825908,39826376]
 second seq =>  [       1,    7260] EXCISED REGION [    7261,    7729]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [39825903,39825907]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        36 nucs [39825903,39825938] to [39825908,39825943]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818643 TTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATT 39818702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATT 60

 39818703 GGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCA 39818762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCA 120

 39818763 CTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCA 39818822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCA 180

 39818823 CCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTG 39818882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTG 240

 39818883 CCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCC 39818942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCC 300

 39818943 CAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTC 39819002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTC 360

 39819003 AGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGAC 39819062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGAC 420

 39819063 CTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACA 39819122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACA 480

 39819123 GGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTT 39819182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTT 540

 39819183 TTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAA 39819242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAA 600

 39819243 GGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGT 39819302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGT 660

 39819303 AATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTT 39819362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTT 720

 39819363 TGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAAT 39819422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAAT 780

 39819423 AACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCT 39819482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCT 840

 39819483 GAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGA 39819542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGA 900

 39819543 CAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGC 39819602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGC 960

 39819603 AGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAG 39819662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAG 1020

 39819663 ATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCC 39819722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCC 1080

 39819723 TTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGG 39819782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGG 1140

 39819783 AGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAG 39819842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAG 1200

 39819843 GCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCT 39819902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCT 1260

 39819903 CACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTG 39819962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTG 1320

 39819963 GGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGAC 39820022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGAC 1380

 39820023 AAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTC 39820082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTC 1440

 39820083 TTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 39820142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 1500

 39820143 TGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACT 39820202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACT 1560

 39820203 CCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTT 39820262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTT 1620

 39820263 TTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAA 39820322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAA 1680

 39820323 GTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCT 39820382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCT 1740

 39820383 GGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCA 39820442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCA 1800

 39820443 TTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTT 39820502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTT 1860

 39820503 GCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTC 39820562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCCAGGCTGGATTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTC 1920

 39820563 CACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATG 39820622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACCTGCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATG 1980

 39820623 TGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTC 39820682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCCACCATGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTC 2040

 39820683 AGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 39820742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 2100

 39820743 GGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCCAAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTAC 39820802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGGCCAAAATTAATACTTTCTATATTAAATTTAC 2160

 39820803 ATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAGGTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTAC 39820862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATATATATATTTTTTTTCTTTTTGATACCAGGTCTCATGCTCTCACTCAGGCTGCAGTAC 2220

 39820863 AGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCTACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGAC 39820922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGTGGCACAACCTCTACTCACTGCAGCCTCTACCTGCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGAC 2280

 39820923 TTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAAGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTG 39820982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAAGTGCCACCACACCAAGCTAAATTTTGTG 2340

 39820983 TTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTTCCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCA 39821042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTTCCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCA 2400

 39821043 AAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGC 39821102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAGCAATTCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGC 2460

 39821103 TCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGTGTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAG 39821162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCATTCTAGTTTAAACTTTTGAGTGGTTTGTGTCTCCTGATTGGACTCCTACAAATACAG 2520

 39821163 AATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAGACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGT 39821222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATTGATGGTAGGAAGGGTACCAGGAGATAGACCCACACAGATGGGATTTGGGAATAGGT 2580

 39821223 TTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCTTGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATT 39821282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTGGTTATCCAAGGAGCAGTGCTGAGCTCCTTGCTAATGGGATATGGGAGGCTGGTGATT 2640

 39821283 TCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAG 39821342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCAGGAAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACATACTGTTCATTGTGAAATGCCAG 2700

 39821343 TTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTGCTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGA 39821402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTGAAGCATATGTCCTGTGAGCTTAGGGGTGCTACAAGTTGACCACTGCAGCAGTAAAGA 2760

 39821403 TGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGATCCTTTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAA 39821462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGATTCTGAAGAATGGCATGGGATGGATCCTTTCGAATGCACTTGAGCAGCGGTCTCCAA 2820

 39821463 CCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGCAGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTAT 39821522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCACAGGGCCACAGAGCTGGAGGTGAGCAGCAGGCAAGTGAAGGGAAACTTCATCTGTAT 2880

 39821523 TTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCACCTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAG 39821582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCTAGCCCCTCCCGTCGCTTGCATGACCACCTGAGCTCCATGTCCTGTCAGATCAGCAG 2940

 39821583 CAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAAACTCTGTTGTGAAGTGTGCATGCGAGGGATCTA 39821642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGCATTAGATTCTCATAGGAGCACAAACTCTGTTGTGAAGTGTGCATGCGAGGGATCTA 3000

 39821643 GGTTGTGTACTCCTTATGAGAATCTAATGCCTGATATTCTGTTACTGTTTCCCATCACCC 39821702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGTTGTGTACTCCTTATGAGAATCTAATGCCTGATATTCTGTTACTGTTTCCCATCACCC 3060

 39821703 CAGATGGACAGTCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGAGATCCCACTGAGTCTACGTTATA 39821762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAGATGGACAGTCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGAGATCCCACTGAGTCTACGTTATA 3120

 39821763 GTGAGTTGTAGAATCATTTCATTATATATTACTATGTAGTAATAATAGAAATAAAGTGCT 39821822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTGAGTTGTAGAATCATTTCATTATATATTACTATGTAGTAATAATAGAAATAAAGTGCT 3180

 39821823 CAATATATGTATTGCACTTGAATCATCCTGAAATTATTCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAA 39821882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAATATATGTATTGCACTTGAATCATCCTGAAATTATTCCCTCACTCCCAGTCTGTGGAA 3240

 39821883 AAATTGCCTTCCACATATTCACTCTGTTTTTTGGTACAGGCAAGGTCTTAATATATTGCC 39821942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAATTGCCTTCCACATATTCACTCTGTTTTTTGGTACAGGCAAGGTCTTAATATATTGCC 3300

 39821943 CAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATATACCTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 39822002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATATACCTCTCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 3360

 39822003 GAGATTACAGGCATAAACCACCACCCTCAACCAAGACTTTCTTAAACCAAATAAAAATTA 39822062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAGATTACAGGCATAAACCACCACCCTCAACCAAGACTTTCTTAAACCAAATAAAAATTA 3420

 39822063 AGTGAGATTACTTGAGCCCATGTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCTGATTGCACCACTGCAC 39822122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTGAGATTACTTGAGCCCATGTGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCTGATTGCACCACTGCAC 3480

 39822123 TCCAGCCTAGGTGACAGAATGAGACTGTCTCAAAAAATAAAATAAAATACAAATGAACCC 39822182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCCAGCCTAGGTGACAGAATGAGACTGTCTCAAAAAATAAAATAAAATACAAATGAACCC 3540

 39822183 TTTATGACATTGCCAGTAACTTTCCCTCCTAAGTGTTCCCCACAAGTCTTTGAATTCTGT 39822242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTATGACATTGCCAGTAACTTTCCCTCCTAAGTGTTCCCCACAAGTCTTTGAATTCTGT 3600

 39822243 TTAATTTTCACATAACATTTAAGACGTTTAAGAACTTATGTCTGTCTGTGTCATCCCTTT 39822302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTAATTTTCACATAACATTTAAGACGTTTAAGAACTTATGTCTGTCTGTGTCATCCCTTT 3660

 39822303 ATGTCAAAAGATGCCTTTTTGTCACTTCCAGCTGGATCTACCATGAAAGACTTCTGAATC 39822362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATGTCAAAAGATGCCTTTTTGTCACTTCCAGCTGGATCTACCATGAAAGACTTCTGAATC 3720

 39822363 CAGGAAGAGAGACTGACTGGGCAACATGTTATTCAGGTACAAAAAGATTTGGAGTGTAAC 39822422
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3721 CAGGAAGAGAGACTGACTGGGCAACATGTTATTCAGGTACAAAAAGATTTGGACTGTAAC 3780

 39822423 TCAAAAATGATCAAATAATAGTGCATGCATCAAGTGCAATGGGAAGCTCTTCGGGAGAGT 39822482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCAAAAATGATCAAATAATAGTGCATGCATCAAGTGCAATGGGAAGCTCTTCGGGAGAGT 3840

 39822483 GAGAGAAGCTTCCAGTTAAGGTGACATTGAAGCCAAGTCCTGAAAGATGAGGAAGAGTTG 39822542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGAGAAGCTTCCAGTTAAGGTGACATTGAAGCCAAGTCCTGAAAGATGAGGAAGAGTTG 3900

 39822543 TATGAGAGTGGGGAGGAAAGGGGGAGGTGGAGGGATGGGGAATGGGCTGGGATGGGATGG 39822602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATGAGAGTGGGGAGGAAAGGGGGAGGTGGAGGGATGGGGAATGGGCTGGGATGGGATGG 3960

 39822603 AGCAAACTGCCCGGGAAGGGAAACCAGCACTGTACAGACCTGAACAACGAAGATGGCATA 39822662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGCAAACTGCCCGGGAAGGGAAACCAGCACTGTACAGACCTGAACAACGAAGATGGCATA 4020

 39822663 TTTTGTTCACGGAACGGTGAATTAAGTGTGGCAGGAATGCTTTGTAGAGACAGTAAGTTG 39822722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTTGTTCACGGAACGGTGAATTAAGTGTGGCAGGAATGCTTTGTAGAGACAGTAAGTTG 4080

 39822723 CTTGTATGGAATTTTGCCCAAGAGACCTCATTGCAGTTTCTGATTTTTTGATGTCATCAT 39822782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTGTATGGAATTTTGCCCAAGAGACCTCATTGCAGTTTCTGATTTTTTGATGTCATCAT 4140

 39822783 CCATCACTGTCCTTGTCAAATAGTTTGGAATAGGTATAATGATCACAATAACCCCAAGCA 39822842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCATCACTGTCCTTGTCAAATAGTTTGGAATAGGTATAATGATCACAATAACCCCAAGCA 4200

 39822843 TAATATTTCATTAATTCTCACAGAATCACAGGTAGGTGCCACAGTTATCCCCATTTTATG 39822902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TAATATTTCATTAATTCTCACAGAATCACAGGTAGGTGCCACAGTTATCCCCATTTTATG 4260

 39822903 AATGGAGTGATGAAGCCTTAGGAATAATGAATGATTTGCCCAAGCTCACCTGGATATTAA 39822962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AATGGAGTGATGAAGCCTTAGGAATAATGAATGATTTGCCCAAGCTCACCTGGATATTAA 4320

 39822963 GACTGAGTCAAATGTTGGGTCTGGTCTGACTTTAATGTTTGCTTTGTTCATGAGCACCAC 39823022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GACTGAGTCAAATGTTGGGTCTGGTCTGACTTTAATGTTTGCTTTGTTCATGAGCACCAC 4380

 39823023 GTATTGCCTCTCCTATGCAGTTAAGCAGGTAGACAAGTGACAGAAAAGCCCATGTTTGTC 39823082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTATTGCCTCTCCTATGCAGTTAAGCAGGTAGACAAGTGACAGAAAAGCCCATGTTTGTC 4440

 39823083 TCTACTCACACACTTCCGACTGAATGTATGTATGGAGTTTCTACACCAAATTCTTCAGTG 39823142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCTACTCACACACTTCCGACTGAATGTATGTATGGAGTTTCTACACCAAATTCTTCAGTG 4500

 39823143 CTCTGGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCTGACACTACCTGGAGTTAGCACAG 39823202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTCTGGATATTAACTGGGTATCCCATGACTTTATTCTGACACTACCTGGAGTTAGCACAG 4560

 39823203 ACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCACTTCAGATGCCAATGGCAA 39823262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACCCCACAAGTTAGGGGCTCAGTCCCACGAGGCCATCCTCACTTCAGATGCCAATGGCAA 4620

 39823263 GTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAAATCGGGGGTTCCCATAACT 39823322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GTCCTAAGTTGTCACCTGTACTTTTGACCAACCTCTTACAAATCGGGGGTTCCCATAACT 4680

 39823323 GTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAACTCAGAAAAACAGTTTATT 39823382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTCTTCTTGGGTTTAATAATTTGCTAGAACAGTTTACGGAACTCAGAAAAACAGTTTATT 4740

 39823383 TTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAATGGTGCA 39823442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTCTTTTTTTCTGAGAGAGAGGGTCTTATTTGGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAATGGTGCA 4800

 39823443 GTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTCTCCCACCTCAGCCTCC 39823502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GTCATAGCTCATTGCAGCCTTGATTGTCTGGGCTCCAGTGGTTCTCCCACCTCAGCCTCC 4860

 39823503 CTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCTAGTTTCTTTTTTTTTTTTT 39823562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTAGTAGCTGAGGCTACATGCCTGCACCACCACATCTGGCTAGTTTCTTTTTTTTTTTTT 4920

 39823563 TTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACAACAAATTCCTGGTCTC 39823622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTTTGTATAGATGGGGTCTTGTTGTGTTGGCCAGGCTGGCCACAACAAATTCCTGGTCTC 4980

 39823623 AAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCACCACAT 39823682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCTGAAAGTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCACCACAT 5040

 39823683 CTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGATACATCCCAGAAACAGTCAA 39823742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTGGCCAGTTCATTTCCTATTACTGGTTCATTGTGAAGGATACATCCCAGAAACAGTCAA 5100

 39823743 TGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAG 39823802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TGAAAGAGACGTGCATGCTGGATGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAG 5160

 39823803 GCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGA 39823862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GCCAAGGTGGGAGGATTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGA 5220

 39823863 AAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTGTGCACC 39823922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAACCTGTCTCTATAAAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTGTGCACC 5280

 39823923 TAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGA 39823982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TAGAGTTCCAACTACTAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGA 5340

 39823983 GGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCT 39824042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCT 5400

 39824043 GATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAG 39824102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAG 5460

 39824103 CTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTG 39824162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTG 5520

 39824163 AAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAAGATTGA 39824222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAAGATTGA 5580

 39824223 TAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCA 39824282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCA 5640

 39824283 GTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGTAATCAGCCCTCC 39824342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGTAATCAGCCCTCC 5700

 39824343 TCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACATCCCCAAATGCA 39824402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACATCCCCAAATGCA 5760

 39824403 TTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAGAAACCTGGGACC 39824462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAGAAACCTGGGACC 5820

 39824463 AAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGAGGTCTTTGTAAG 39824522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGAGGTCTTTGTAAG 5880

 39824523 CTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATATATTTCTTTTCTTTT 39824582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATATATTTCTTTTCTTTT 5940

 39824583 TTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTGTGATCATAGCTC 39824642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTGTGATCATAGCTC 6000

 39824643 ACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCTCCCAAGTAGCTA 39824702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 ACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCTCCCAAGTAGCTA 6060

 39824703 GGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCGGAGTTTCACCAT 39824762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCGGAGTTTCACCAT 6120

 39824763 GGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTGCCCAGGCTGGCCAC 39824822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTGCCCAGGCTGGCCAC 6180

 39824823 AAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGATGAGATTTAGTTATG 39824882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGATGAGATTTAGTTATG 6240

 39824883 TTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCACCTCAGCCTCTCAAG 39824942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCACCTCAGCCTCTCAAG 6300

 39824943 TAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTATTTTTATTTTTTTCT 39825002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTATTTTTATTTTTTTCT 6360

 39825003 AGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCGGGCCTCAAGTGTTC 39825062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 AGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCGGGCCTCAAGTGTTC 6420

 39825063 CTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCACCATGCCCAGCAAT 39825122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCACCATGCCCAGCAAT 6480

 39825123 CACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAATTGGAGCAGGAGAT 39825182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAATTGGAGCAGGAGAT 6540

 39825183 GTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGA 39825242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGA 6600

 39825243 AGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCC 39825302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCC 6660

 39825303 AAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCC 39825362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCC 6720

 39825363 TTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGT 39825422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGT 6780

 39825423 TTTAAGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACA 39825482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TTTAAGCCACTAAATGTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACA 6840

 39825483 TGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAG 39825542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAG 6900

 39825543 GATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTA 39825602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 GATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTA 6960

 39825603 CAAAAAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGG 39825662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CAAAAAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGG 7020

 39825663 AGGCCGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGC 39825722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 AGGCCGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGC 7080

 39825723 AAAACCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAA 39825782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 AAAACCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAA 7140

 39825783 TCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGC 39825842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGC 7200

 39825843 AGTGAGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 39825902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 AGTGAGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 7260

EXCISED REGION

 39825908 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 39825967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 7320

 39825968 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 39826027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 7380

 39826028 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 39826087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 7440

 39826088 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 39826147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 7500

 39826148 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 39826207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 7560

 39826208 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 39826267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 7620

 39826268 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 39826327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 7680

 39826328 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGG 39826376
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGG 7729

Alignment time is 7.09099 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8731] =>      8731 nucs 'mol-32-3306-215493_8731'

Score:        8665
Aligned:      8731        nucs
Identic:      8725 (100%) nucs =>      1932 (100%)      6793 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39823971,39825902] EXCISED REGION [39825908,39832702]
 second seq =>  [       1,    1933] EXCISED REGION [    1934,    8731]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [39825903,39825907]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        36 nucs [39825903,39825938] to [39825908,39825943]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39823971 GGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGG 39824030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCATAAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGG 60

 39824031 ACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGG 39824090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAAAAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGG 120

 39824091 AGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGT 39824150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTGTTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGT 180

 39824151 CCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGC 39824210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACCCCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGC 240

 39824211 AAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCC 39824270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTGTTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCC 300

 39824271 TCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGT 39824330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAAAGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGT 360

 39824331 AATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACA 39824390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTAGGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACA 420

 39824391 TCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAG 39824450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGGAGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAG 480

 39824451 AAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGA 39824510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAAAACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGA 540

 39824511 GGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATATAT 39824570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGTGCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATATAT 600

 39824571 TTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTG 39824630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATCTCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTG 660

 39824631 TGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCT 39824690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCCTTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCT 720

 39824691 CCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCG 39824750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAAGTAGCTAGGACTACACATACATGTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCG 780

 39824751 GAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTGCC 39824810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGCCATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTGCC 840

 39824811 CAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGATGA 39824870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGATGA 900

 39824871 GATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCACCT 39824930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATTTCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCACCT 960

 39824931 CAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTATTT 39824990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTATTT 1020

 39824991 TTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCGGG 39825050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTCACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCGGG 1080

 39825051 CCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCACC 39825110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCACC 1140

 39825111 ATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAATT 39825170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTATATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAATT 1200

 39825171 GGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCAC 39825230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCAGAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCAC 1260

 39825231 TTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAA 39825290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAA 1320

 39825291 GCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACC 39825350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACC 1380

 39825351 TTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTA 39825410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTA 1440

 39825411 GATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAGG-AAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAA 39825469
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAGGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAA 1500

 39825470 GAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGA 39825529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGA 1560

 39825530 ATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAA 39825589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAA 1620

 39825590 GACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATT 39825649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATT 1680

 39825650 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCC 39825709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCC 1740

 39825710 TGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGG 39825769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGG 1800

 39825770 CACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGG 39825829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGG 1860

 39825830 AGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGT 39825889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGT 1920

 39825890 GAAACTCTGTCTC 39825902
          |||||||||||||
     1921 GAAACTCTGTCTC 1933

EXCISED REGION

 39825908 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 39825967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 1993

 39825968 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 39826027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 2053

 39826028 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 39826087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 2113

 39826088 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 39826147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 2173

 39826148 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 39826207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 2233

 39826208 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 39826267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 2293

 39826268 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 39826327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 2353

 39826328 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 39826387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 2413

 39826388 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 39826447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 2473

 39826448 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 39826507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 2533

 39826508 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 39826567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 2593

 39826568 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 39826627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 2653

 39826628 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 39826687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 2713

 39826688 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 39826747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 2773

 39826748 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 39826807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 2833

 39826808 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 39826867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 2893

 39826868 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATC 39826927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATC 2953

 39826928 TTTTAAGGGCAAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAA 39826987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 TTTTAAGGGCAAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAA 3013

 39826988 AATATTTTTCAAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAG 39827047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 AATATTTTTCAAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAG 3073

 39827048 CTACTCAGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGG 39827107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 CTACTCAGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGG 3133

 39827108 CAACATAGCAAGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCA 39827167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 CAACATAGCAAGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCA 3193

 39827168 CTCAGCTGTACTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGG 39827227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 CTCAGCTGTACTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGG 3253

 39827228 TCGAGGCTGCAGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGA 39827287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 TCGAGGCTGCAGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGA 3313

 39827288 CCTGTCTCAAATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTT 39827347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 CCTGTCTCAAATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTT 3373

 39827348 TGGCTCTGCAGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGA 39827407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 TGGCTCTGCAGCCCTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGA 3433

 39827408 GGAGACCCCTGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCG 39827467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 GGAGACCCCTGCTCGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCG 3493

 39827468 GGGTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGA 39827527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 GGGTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGA 3553

 39827528 TCACCTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTA 39827587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 TCACCTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTA 3613

 39827588 AGAAAATACAATAATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA 39827647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 AGAAAATACAATAATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA 3673

 39827648 GGCTGAGGTAGGAAAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATT 39827707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GGCTGAGGTAGGAAAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATT 3733

 39827708 GCGCCACTTCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGT 39827767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 GCGCCACTTCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGT 3793

 39827768 ATTATATCAACATGTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAA 39827827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 ATTATATCAACATGTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAA 3853

 39827828 ATCTTCTATTATATTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAA 39827887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 ATCTTCTATTATATTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAA 3913

 39827888 TTTTTGTCTTATTTTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGAT 39827947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 TTTTTGTCTTATTTTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGAT 3973

 39827948 CTTCAATAAAGTTAAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAG 39828007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 CTTCAATAAAGTTAAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAG 4033

 39828008 TTTAGAAATATTCAGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTG 39828067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 TTTAGAAATATTCAGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTG 4093

 39828068 TTTTTTATTTTAGGAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTA 39828127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 TTTTTTATTTTAGGAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTA 4153

 39828128 TCACAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGA 39828187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 TCACAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGA 4213

 39828188 GTAGCTGGGACTGTAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGA 39828247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 GTAGCTGGGACTGTAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGA 4273

 39828248 CATGGGGTCTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTC 39828307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 CATGGGGTCTCACTTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTC 4333

 39828308 CACCCCTGCCTCCCATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCT 39828367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 CACCCCTGCCTCCCATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCT 4393

 39828368 AAAAAAAAAATTTCTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAG 39828427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 AAAAAAAAAATTTCTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAG 4453

 39828428 AATAAGTTAAAATGACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTAT 39828487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 AATAAGTTAAAATGACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTAT 4513

 39828488 ATACATTCCTTACAAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACAC 39828547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 ATACATTCCTTACAAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACAC 4573

 39828548 ACACTGTACAATATTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGA 39828607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 ACACTGTACAATATTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGA 4633

 39828608 GTGTCGCTACCAGTATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACT 39828667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 GTGTCGCTACCAGTATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACT 4693

 39828668 TCTCTCCAAGGTATGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTT 39828727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 TCTCTCCAAGGTATGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTT 4753

 39828728 CCTATTAAACATGTAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTT 39828787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 CCTATTAAACATGTAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTT 4813

 39828788 GCATTTTCCTTACTTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACC 39828847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 GCATTTTCCTTACTTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACC 4873

 39828848 ATTTGCTTTATTAATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACA 39828907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 ATTTGCTTTATTAATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACA 4933

 39828908 ATTTCTAACCTGTTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTG 39828967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 ATTTCTAACCTGTTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTG 4993

 39828968 TCCAAGGCTGGAGTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTG 39829027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 TCCAAGGCTGGAGTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTG 5053

 39829028 AAGCGATCCTCCCATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGC 39829087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 AAGCGATCCTCCCATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGC 5113

 39829088 CCAACTAATATTTGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGA 39829147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 CCAACTAATATTTGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGA 5173

 39829148 GTAAGCATGGATTTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAG 39829207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 GTAAGCATGGATTTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAG 5233

 39829208 GGAGGACTGTATATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGA 39829267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 GGAGGACTGTATATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGA 5293

 39829268 AAATAATAATTTTTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCA 39829327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 AAATAATAATTTTTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCA 5353

 39829328 GGTGTGGTGGCTCACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCT 39829387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 GGTGTGGTGGCTCACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCT 5413

 39829388 TGAGGCCAAGAGTTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAA 39829447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 TGAGGCCAAGAGTTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAA 5473

 39829448 ATATATGAATTAGCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 39829507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 ATATATGAATTAGCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 5533

 39829508 AGCTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCT 39829567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 AGCTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCT 5593

 39829568 CTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAG 39829627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 CTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAG 5653

 39829628 CTAACATCAACTGACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAAC 39829687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 CTAACATCAACTGACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAAC 5713

 39829688 TTTCTTATTTCACTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTA 39829747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 TTTCTTATTTCACTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTA 5773

 39829748 CAGATGACCTTTTGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATG 39829807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 CAGATGACCTTTTGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATG 5833

 39829808 GCGAATGGACATTGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGC 39829867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 GCGAATGGACATTGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGC 5893

 39829868 TATAATCTTAGCACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAG 39829927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 TATAATCTTAGCACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAG 5953

 39829928 GAGGCAGTATGGCAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTT 39829987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 GAGGCAGTATGGCAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTT 6013

 39829988 TACCCTGGAAGGCTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTT 39830047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 TACCCTGGAAGGCTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTT 6073

 39830048 CACTGCACCTTTGCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTA 39830107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 CACTGCACCTTTGCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTA 6133

 39830108 AATAGATAAAAGACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTA 39830167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6134 AATAGATAAAAGACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTA 6193

 39830168 TTAGCTCTATTTCTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGG 39830227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6194 TTAGCTCTATTTCTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGG 6253

 39830228 TCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGAC 39830287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6254 TCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGAC 6313

 39830288 CTCCCAGGCTCAAACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTC 39830347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6314 CTCCCAGGCTCAAACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTC 6373

 39830348 CCAGCTAATTTTTTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGG 39830407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6374 CCAGCTAATTTTTTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGG 6433

 39830408 TCTCTAGCTCCTGGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTC 39830467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6434 TCTCTAGCTCCTGGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTC 6493

 39830468 AGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACT 39830527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6494 AGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACT 6553

 39830528 TTGTGCTAGCCAATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATT 39830587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6554 TTGTGCTAGCCAATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATT 6613

 39830588 AAATTTTACCACTTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATA 39830647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6614 AAATTTTACCACTTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATA 6673

 39830648 TGTTAGGAAGGGTCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTT 39830707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6674 TGTTAGGAAGGGTCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTT 6733

 39830708 TCCCAGGGGGCAGTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGG 39830767
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6734 TCCCAGGGGGCAGTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAGTGGGATGCTGGTGATTTCCAGG 6793

 39830768 AAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTG 39830827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6794 AAGTGACCTCACAATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTG 6853

 39830828 AGGCACATGCCTTGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGG 39830887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6854 AGGCACATGCCTTGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGG 6913

 39830888 GAAGGGTCGTTTTGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTA 39830947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6914 GAAGGGTCGTTTTGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTA 6973

 39830948 AGGAGCCACACAGCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGT 39831007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6974 AGGAGCCACACAGCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGT 7033

 39831008 ATTTACAACCACTCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCA 39831067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7034 ATTTACAACCACTCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCA 7093

 39831068 GTAGCATTAGATTCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCT 39831127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7094 GTAGCATTAGATTCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCT 7153

 39831128 AGGTTGCGCTGTCCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACG 39831187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7154 AGGTTGCGCTGTCCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACG 7213

 39831188 CTCAGGTGGGACCATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATT 39831247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7214 CTCAGGTGGGACCATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATT 7273

 39831248 ATGGTGAGTTCTATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCC 39831307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7274 ATGGTGAGTTCTATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCC 7333

 39831308 TAATAAATGTAATCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCA 39831367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7334 TAATAAATGTAATCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCA 7393

 39831368 GGCCCAGAACTTTCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTAT 39831427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7394 GGCCCAGAACTTTCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTAT 7453

 39831428 TTAGGCCCATACCCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGC 39831487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7454 TTAGGCCCATACCCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGC 7513

 39831488 CTCCACAGGCACAGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAG 39831547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7514 CTCCACAGGCACAGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAG 7573

 39831548 CCTTCTCTCTAGGCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCT 39831607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7574 CCTTCTCTCTAGGCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCT 7633

 39831608 TGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCAT 39831667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7634 TGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCAT 7693

 39831668 CAAGTCGGCCTGTCCAGGGCCAGCTCCTGCCTCCCGGCGCCCTCTGCAGGCCCAAGTCGT 39831727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7694 CAAGTCGGCCTGTCCAGGGCCAGCTCCTGCCTCCCGGCGCCCTCTGCAGGCCCAAGTCGT 7753

 39831728 CCTCAAGTTGGCCTCCCCAGGCCCAGCTCCAGCCTCTCGGCGGCCTCTCCGGGTGCAAAA 39831787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7754 CCTCAAGTTGGCCTCCCCAGGCCCAGCTCCAGCCTCTCGGCGGCCTCTCCGGGTGCAAAA 7813

 39831788 GTTCCTCGAGTCAGCCTCTCCAGGCCCAGCTCCTCCTGCCTCCCAGT-GCCTCTTTCGGC 39831846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     7814 GTTCCTCGAGTCAGCCTCTCCAGGCCCAGCTCCTCCTGCCTCCCAGTGGCCTCTTTCGGC 7873

 39831847 CCAGCCCAGCTCATGCCTCTGGGCGGCCTTCCCAGGCCCCGCTTTTGACTTTTGGCGGCC 39831906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 CCAGCCCAGCTCATGCCTCTGGGCGGCCTTCCCAGGCCCCGCTTTTGACTTTTGGCGGCC 7933

 39831907 TCTGCAGGCCTCGACAAGGCCCGGCCTCCTGCCTCCCGAA-GCCTGCACAGGCCCAGCCT 39831965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     7934 TCTGCAGGCCTCGACAAGGCCCGGCCTCCTGCCTCCCGAAGGCCTGCACAGGCCCAGCCT 7993

 39831966 CTGCCTCACAGCAGACTCTCCACGCCCAGCTAGCTCTCGCCTCACTGCGGCCTCCCCAGT 39832025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7994 CTGCCTCACAGCAGACTCTCCACGCCCAGCTAGCTCTCGCCTCACTGCGGCCTCCCCAGT 8053

 39832026 CCAAAGCTCCTGCCTCTCGGCCGCTTCGGCAGGCCCAGCTCCCGCCTGCCAGT-GCCTCT 39832084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     8054 CCAAAGCTCCTGCCTCTCGGCCGCTTCGGCAGGCCCAGCTCCCGCCTGCCAGTGGCCTCT 8113

 39832085 TCAGGCCCATGGGGCTCATTCCTCACAACGGCCTTTCCAGGCCCCGTTTTTCCCTTCCGG 39832144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8114 TCAGGCCCATGGGGCTCATTCCTCACAACGGCCTTTCCAGGCCCCGTTTTTCCCTTCCGG 8173

 39832145 CGGCCTCTCCGGGCCCAGAACCTCCTCAAGTTGGCCTCTCCAGACCCACTTGCACCCTCC 39832204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8174 CGGCCTCTCCGGGCCCAGAACCTCCTCAAGTTGGCCTCTCCAGACCCACTTGCACCCTCC 8233

 39832205 GGGCGTCCTCTCCAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCTGCGTCTCCAGGCCCGACTCCTGCC 39832264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8234 GGGCGTCCTCTCCAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCTGCGTCTCCAGGCCCGACTCCTGCC 8293

 39832265 TCCCAACAACCTCTTTGGACTCAGTGCCTGCCCATCTCCTGGCGGCCTTGGTCGGCCCAC 39832324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8294 TCCCAACAACCTCTTTGGACTCAGTGCCTGCCCATCTCCTGGCGGCCTTGGTCGGCCCAC 8353

 39832325 AGCTTCCTCAAGCCAAGCTCCCCAGGCCCAGGTCAGGCCTCACGGTGGCCTCTCCAGGAT 39832384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8354 AGCTTCCTCAAGCCAAGCTCCCCAGGCCCAGGTCAGGCCTCACGGTGGCCTCTCCAGGAT 8413

 39832385 CAGCTCCTGCCCTCCGATGGTGTCTCCAGGCCCCAAATGGTCTCCGGCCAGTGGGCTCCT 39832444
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8414 CAGCTCCTGCCCTCCGATGGCGTCTCCAGGCCCCAAATGGTCTCCGGCCAGTGGGCTCCT 8473

 39832445 CCACGCCCAGCTTGGGCCTCCCGGCGACCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTGAAGTCGGCC 39832504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8474 CCACGCCCAGCTTGGGCCTCCCGGCGACCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTGAAGTCGGCC 8533

 39832505 TCTCCCGGCCCTGCCTCCCAGCAAGTAAGCAAGCTTTTTTGGCTTAGCTCCTGCCCAGCT 39832564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8534 TCTCCCGGCCCTGCCTCCCAGCAAGTAAGCAAGCTTTTTTGGCTTAGCTCCTGCCCAGCT 8593

 39832565 CCCAACCGCCTTTGTAGGCCCCGAACTTTCTCCAGCCAAGCTCTTCGGGCCCACCTCCTG 39832624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8594 CCCAACCGCCTTTGTAGGCCCCGAACTTTCTCCAGCCAAGCTCTTCGGGCCCACCTCCTG 8653

 39832625 CCTCCCGGTGGCCTGTACAGGCCCAGCTCTGGCTGGAGAACAGCCTCTGCAGGCCCCGCT 39832684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8654 CCTCCCGGTGGCCTGTACAGGCCCAGCTCTGGCTGGAGAACAGCCTCTGCAGGCCCCGCT 8713

 39832685 CTTGCCTCCCAGGGGCCT 39832702
          ||||||||||||||||||
     8714 CTTGCCTCCCAGGGGCCT 8731

Alignment time is 8.01271 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2373] =>      2373 nucs 'mol-32-3311-150712_2373'

Score:        2372
Aligned:      2372        nucs
Identic:      2372 (100%) nucs =>      1175 (100%)      1197 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818379,39819553] EXCISED REGION [39819555,39820751]
 second seq =>  [       1,    1175] EXCISED REGION [    1177,    2373]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39819554,39819554]
 second seq =>         1 nucs [1176,1176]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39819554,39819554] to [39819555,39819555]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818379 GGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTG 39818438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTG 60

 39818439 ATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGT 39818498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGT 120

 39818499 CTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGG 39818558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGG 180

 39818559 CCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTAT 39818618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTAT 240

 39818619 TGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGC 39818678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGC 300

 39818679 TTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGG 39818738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGG 360

 39818739 TAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTT 39818798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTT 420

 39818799 GCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTT 39818858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTT 480

 39818859 TTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCA 39818918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCA 540

 39818919 TGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAG 39818978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAG 600

 39818979 TAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGG 39819038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGG 660

 39819039 CCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTG 39819098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTG 720

 39819099 GCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTA 39819158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTA 780

 39819159 ACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGA 39819218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGA 840

 39819219 TACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGC 39819278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGC 900

 39819279 ACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGT 39819338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGT 960

 39819339 TGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTA 39819398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTA 1020

 39819399 ACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAG 39819458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAG 1080

 39819459 GAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGA 39819518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGA 1140

 39819519 GGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCG 39819553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCG 1175

EXCISED REGION

 39819555 AGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCAC 39819614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 AGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCAC 1236

 39819615 CCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGT 39819674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 CCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGT 1296

 39819675 TGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGG 39819734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGG 1356

 39819735 GCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTA 39819794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 GCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTA 1416

 39819795 AATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAG 39819854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 AATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAG 1476

 39819855 AAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAG 39819914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 AAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAG 1536

 39819915 GGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAA 39819974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAA 1596

 39819975 AAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCC 39820034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 AAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCC 1656

 39820035 AGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCT 39820094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 AGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCT 1716

 39820095 TTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTC 39820154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 TTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTC 1776

 39820155 ACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTG 39820214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 ACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTG 1836

 39820215 GAATTACAGGTATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACA 39820274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 GAATTACAGGTATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACA 1896

 39820275 TATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTG 39820334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTG 1956

 39820335 CCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAG 39820394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 CCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAG 2016

 39820395 TTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCC 39820454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCC 2076

 39820455 TCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGA 39820514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 TCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGA 2136

 39820515 TTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGT 39820574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 TTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTGCCGGGT 2196

 39820575 TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCC 39820634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAGTAGCATGTGCCACCATGCC 2256

 39820635 TAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTG 39820694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 TAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTG 2316

 39820695 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 39820751
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 2373

Alignment time is 2.16635 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6655] =>      6655 nucs 'mol-32-331c-083212_6655'

Score:        6522
Aligned:      6673        nucs
Identic:      6647 (100%) nucs =>      1329 (100%)      5318 (100%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818769,39820097] EXCISED REGION [39825202,39830543]
 second seq =>  [       1,    1329] EXCISED REGION [    1330,    6655]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818769 GAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAG 39818828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAG 60

 39818829 GATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGT 39818888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGT 120

 39818889 CACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCT 39818948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCT 180

 39818949 CAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAA 39819008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAA 240

 39819009 TTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAA 39819068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAA 300

 39819069 CTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATG 39819128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATG 360

 39819129 AGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAG 39819188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAG 420

 39819189 AATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAG 39819248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAG 480

 39819249 CTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGT 39819308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGT 540

 39819309 GCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCA 39819368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCA 600

 39819369 CCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACA 39819428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACA 660

 39819429 CACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAAT 39819488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAAT 720

 39819489 CTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGG 39819548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGG 780

 39819549 AGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGA 39819608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGA 840

 39819609 TATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGG 39819668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGG 900

 39819669 CTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAA 39819728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAA 960

 39819729 GGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGT 39819788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGT 1020

 39819789 GATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCT 39819848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCT 1080

 39819849 GTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGA 39819908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGA 1140

 39819909 GTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGG 39819968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGG 1200

 39819969 CGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGA 39820028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGA 1260

 39820029 GGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCT 39820088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCT 1320

 39820089 TTTTCTTTC 39820097
          |||||||||
     1321 TTTTCTTTC 1329

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1389

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1449

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1509

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1569

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 1629

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 1689

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 1749

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 1809

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 1869

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 1929

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 1989

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     1990 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 2034

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 2094

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 2154

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 2214

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 2274

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 2334

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 2394

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 2454

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 2514

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 2574

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 2634

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 2694

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 2754

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 2814

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 2874

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 2934

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 2994

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2995 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 3054

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 3114

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 3174

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 3234

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 3294

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3295 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 3354

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     3355 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 3414

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 3474

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3475 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 3534

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 3594

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 3654

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 3714

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 3774

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 3834

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 3894

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 3954

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 4014

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 4074

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4075 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 4134

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 4194

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 4254

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 4314

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 4374

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 4434

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 4494

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 4554

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 4614

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 4674

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 4734

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 4794

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 4854

 39828741 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 39828800
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTA--CTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 4912

 39828801 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 39828860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 4972

 39828861 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 39828920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 5032

 39828921 TTTATTTATTTA-TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 39828979
          |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 TTTATTTA-TTATTTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 5091

 39828980 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 39829039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 5151

 39829040 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 39829099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 5211

 39829100 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 39829159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 5271

 39829160 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 39829219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 5331

 39829220 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 39829279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 5391

 39829280 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 39829339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 5451

 39829340 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 39829399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 5511

 39829400 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 39829459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 5571

 39829460 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 39829519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 5631

 39829520 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 39829579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 5691

 39829580 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 39829639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 5751

 39829640 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 39829699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 5811

 39829700 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 39829759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 5871

 39829760 TGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 39829819
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 TGTTTAGATTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 5931

 39829820 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 39829879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 5991

 39829880 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 39829939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 6051

 39829940 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 39829999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6052 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAGTTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 6111

 39830000 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 39830059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 6171

 39830060 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 39830119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 6231

 39830120 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 39830179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 6291

 39830180 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 39830239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 6351

 39830240 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 39830299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 6411

 39830300 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 39830359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 6471

 39830360 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 39830419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 6531

 39830420 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 39830479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 6591

 39830480 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 39830539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 6651

 39830540 ATCT 39830543
          ||||
     6652 ATCT 6655

Alignment time is 6.08904 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4546] =>      4546 nucs 'mol-32-3327-057329_4546'

Score:        4467
Aligned:      4561        nucs
Identic:      4541 (100%) nucs =>      1018 (100%)      3523 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39819080,39820097] EXCISED REGION [39825202,39828743]
 second seq =>  [       1,    1018] EXCISED REGION [    1019,    4546]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39819080 AAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGC 39819139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGC 60

 39819140 CCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAA 39819199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAA 120

 39819200 TTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAG 39819259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAG 180

 39819260 CAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACA 39819319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACA 240

 39819320 TAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACT 39819379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACT 300

 39819380 TGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAAT 39819439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAAT 360

 39819440 CTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCA 39819499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCA 420

 39819500 AGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTA 39819559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTA 480

 39819560 GCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACT 39819619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACT 540

 39819620 TCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGAC 39819679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGAC 600

 39819680 TCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGA 39819739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGA 660

 39819740 GCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGG 39819799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGG 720

 39819800 GGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGA 39819859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGA 780

 39819860 ACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGA 39819919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGA 840

 39819920 GGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTG 39819979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTG 900

 39819980 GGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGA 39820039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGA 960

 39820040 GGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 1018

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1078

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1138

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1198

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1258

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 1318

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 1378

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 1438

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 1498

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 1558

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 1618

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 1678

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     1679 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 1723

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 1783

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 1843

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 1903

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 1963

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 2023

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 2083

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 2143

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 2203

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 2263

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 2323

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 2383

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 2443

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 2503

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 2563

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 2623

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 2683

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2684 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 2743

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 2803

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 2863

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 2923

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 2983

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2984 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 3043

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     3044 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 3103

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 3163

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3164 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 3223

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 3283

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 3343

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 3403

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 3463

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 3523

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 3583

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 3643

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 3703

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 3763

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3764 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 3823

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 3883

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 3943

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 4003

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 4063

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 4123

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 4183

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 4243

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 4303

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 4363

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 4423

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 4483

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 4543

 39828741 TAG 39828743
          |||
     4544 TAG 4546

Alignment time is 4.1942 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3938] =>      3938 nucs 'mol-32-3332-051178_3938'

Score:        3938
Aligned:      3938        nucs
Identic:      3938 (100%) nucs =>      1762 (100%)      2176 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39816554,39818315] EXCISED REGION [39818320,39820495]
 second seq =>  [       1,    1762] EXCISED REGION [    1763,    3938]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [39818316,39818319]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39818316,39818316] to [39818320,39818320]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39816554 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATT 39816613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATT 60

 39816614 ATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATTGAAA 39816673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATTGAAA 120

 39816674 TCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACT 39816733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACT 180

 39816734 TTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTC 39816793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTC 240

 39816794 CTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCA 39816853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCA 300

 39816854 CTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTT 39816913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTT 360

 39816914 TTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTT 39816973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTT 420

 39816974 CATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCAT 39817033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCAT 480

 39817034 CAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGA 39817093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGA 540

 39817094 AGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTA 39817153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTA 600

 39817154 GGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACA 39817213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACA 660

 39817214 CTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTA 39817273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTA 720

 39817274 CTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGAT 39817333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGAT 780

 39817334 AGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACT 39817393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACT 840

 39817394 ACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAAC 39817453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAAC 900

 39817454 TCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCT 39817513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCT 960

 39817514 CAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAG 39817573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAG 1020

 39817574 TGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTT 39817633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTT 1080

 39817634 GGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCC 39817693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCC 1140

 39817694 TCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATG 39817753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATG 1200

 39817754 CCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTAT 39817813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTAT 1260

 39817814 AAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGA 39817873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGA 1320

 39817874 CAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTT 39817933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTT 1380

 39817934 TTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTT 39817993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTT 1440

 39817994 GGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACT 39818053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACT 1500

 39818054 ACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACT 39818113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACT 1560

 39818114 GGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATA 39818173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATA 1620

 39818174 GCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACC 39818233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACC 1680

 39818234 TAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCT 39818293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCT 1740

 39818294 ATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTC 39818315
          ||||||||||||||||||||||
     1741 ATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTC 1762

EXCISED REGION

 39818320 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAG 39818379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAG 1822

 39818380 GCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGA 39818439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 GCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGA 1882

 39818440 TGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTC 39818499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 TGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTC 1942

 39818500 TTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGC 39818559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 TTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGC 2002

 39818560 CCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATT 39818619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 CCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATT 2062

 39818620 GAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCT 39818679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 GAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCT 2122

 39818680 TCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGT 39818739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 TCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGT 2182

 39818740 AAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTG 39818799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 AAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTG 2242

 39818800 CAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTT 39818859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 CAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTT 2302

 39818860 TTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCAT 39818919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 TTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCAT 2362

 39818920 GGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGT 39818979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 GGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGT 2422

 39818980 AGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGC 39819039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 AGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGC 2482

 39819040 CGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGG 39819099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 CGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGG 2542

 39819100 CCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAA 39819159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 CCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAA 2602

 39819160 CCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGAT 39819219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 CCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGAT 2662

 39819220 ACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCA 39819279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 ACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCA 2722

 39819280 CTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTT 39819339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 CTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTT 2782

 39819340 GGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAA 39819399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 GGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAA 2842

 39819400 CCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGG 39819459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 CCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGG 2902

 39819460 AGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAG 39819519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 AGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAG 2962

 39819520 GTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGT 39819579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 GTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGT 3022

 39819580 TTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGA 39819639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGA 3082

 39819640 AAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGA 39819699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 AAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGA 3142

 39819700 GAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTT 39819759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 GAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTT 3202

 39819760 TGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATT 39819819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 TGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATT 3262

 39819820 CATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCT 39819879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 CATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCT 3322

 39819880 CAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAG 39819939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 CAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAG 3382

 39819940 TTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACA 39819999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 TTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACA 3442

 39820000 GGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATT 39820059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 GGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATT 3502

 39820060 CCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTC 39820119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 CCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTC 3562

 39820120 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTC 39820179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTC 3622

 39820180 AAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCA 39820239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 AAGGGATCCTCCCACCCCAGACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCA 3682

 39820240 CACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGAC 39820299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 CACCTGGCTAATATTTTTCTTTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGAC 3742

 39820300 AGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGAT 39820359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3743 AGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGAT 3802

 39820360 TACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTT 39820419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3803 TACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTT 3862

 39820420 ACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTT 39820479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3863 ACTTTGTGCTAGTGTGTCCCTCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTT 3922

 39820480 TGAGATGGAGTTTCAC 39820495
          ||||||||||||||||
     3923 TGAGATGGAGTTTCAC 3938

Alignment time is 3.61417 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8414] =>      8414 nucs 'mol-32-338a-199015_8414'

Score:        8253
Aligned:      8434        nucs
Identic:      8402 (100%) nucs =>      3424 (100%)      4978 ( 99%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39816671,39820097] EXCISED REGION [39825202,39830203]
 second seq =>  [       1,    3428] EXCISED REGION [    3429,    8414]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39816671 AAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTC 39816730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTC 60

 39816731 ACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTAC 39816790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTAC 120

 39816791 CTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTG 39816850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTG 180

 39816851 TCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGC 39816910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGC 240

 39816911 TTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATA 39816970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATA 300

 39816971 TTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTT 39817030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTT 360

 39817031 CATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTA 39817090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTA 420

 39817091 TGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGC 39817150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGC 480

 39817151 CTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCC 39817210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCC 540

 39817211 ACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAG 39817270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAG 600

 39817271 CTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAA 39817330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAA 660

 39817331 GATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGA 39817390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGA 720

 39817391 ACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCC 39817450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCC 780

 39817451 AACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTC 39817510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTC 840

 39817511 TCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAA 39817570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAA 900

 39817571 AAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATG 39817630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATG 960

 39817631 CTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTG 39817690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTG 1020

 39817691 GCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACC 39817750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACC 1080

 39817751 ATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAG 39817810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAG 1140

 39817811 TATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTA 39817870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTA 1200

 39817871 AGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGG 39817930
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1201 AGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGG 1260

 39817931 TTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGAT 39817990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGAT 1320

 39817991 CTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCC 39818050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCC 1380

 39818051 ACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCAC 39818110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCAC 1440

 39818111 ACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 39818170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 1500

 39818171 ATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCA 39818230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCA 1560

 39818231 ACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTG 39818290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTG 1620

 39818291 CCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAC--- 39818347
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
     1621 CCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--TTT 1678

 39818348 TTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCT 39818407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCT 1738

 39818408 TACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGT 39818467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGT 1798

 39818468 AGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAG 39818527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAG 1858

 39818528 CTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATG 39818587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATG 1918

 39818588 AGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTC 39818647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTC 1978

 39818648 CTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTG 39818707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTG 2038

 39818708 TCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTG 39818767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTG 2098

 39818768 TGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTA 39818827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTA 2158

 39818828 GGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTG 39818887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTG 2218

 39818888 TCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGC 39818947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGC 2278

 39818948 TCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGA 39819007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGA 2338

 39819008 ATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGA 39819067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGA 2398

 39819068 ACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCAT 39819127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCAT 2458

 39819128 GAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAA 39819187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAA 2518

 39819188 GAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCA 39819247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCA 2578

 39819248 GCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTG 39819307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTG 2638

 39819308 TGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCC 39819367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCC 2698

 39819368 ACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACAC 39819427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACAC 2758

 39819428 ACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAA 39819487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAA 2818

 39819488 TCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAG 39819547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAG 2878

 39819548 GAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGG 39819607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGG 2938

 39819608 ATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAG 39819667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAG 2998

 39819668 GCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCA 39819727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCA 3058

 39819728 AGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAG 39819787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAG 3118

 39819788 TGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTC 39819847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTC 3178

 39819848 TGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTG 39819907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTG 3238

 39819908 AGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAG 39819967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAG 3298

 39819968 GCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTG 39820027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTG 3358

 39820028 AGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTC 39820087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTC 3418

 39820088 TTTTTCTTTC 39820097
          ||||||||||
     3419 TTTTTCTTTC 3428

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 3488

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 3548

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 3608

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 3668

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 3728

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 3788

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 3848

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 3908

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 3968

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 4028

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 4088

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     4089 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 4133

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 4193

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 4253

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 4313

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 4373

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 4433

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 4493

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 4553

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 4613

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 4673

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 4733

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 4793

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 4853

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 4913

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 4973

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 5033

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 5093

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5094 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 5153

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 5213

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 5273

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 5333

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 5393

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5394 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 5453

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     5454 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 5513

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 5573

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5574 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 5633

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 5693

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 5753

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 5813

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 5873

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 5933

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 5993

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 6053

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 6113

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 6173

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6174 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 6233

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 6293

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 6353

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 6413

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 6473

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 6533

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 6593

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 6653

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 6713

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 6773

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 6833

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 6893

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 6953

 39828741 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 39828800
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTA--CTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 7011

 39828801 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 39828860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 7071

 39828861 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 39828920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 7131

 39828921 TTTATTTATTTA-TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 39828979
          |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 TTTATTTA-TTATTTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 7190

 39828980 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 39829039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7191 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 7250

 39829040 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 39829099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 7310

 39829100 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 39829159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 7370

 39829160 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 39829219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 7430

 39829220 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 39829279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 7490

 39829280 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 39829339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 7550

 39829340 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 39829399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 7610

 39829400 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 39829459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 7670

 39829460 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 39829519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 7730

 39829520 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 39829579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 7790

 39829580 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 39829639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 7850

 39829640 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 39829699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 7910

 39829700 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 39829759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 7970

 39829760 TGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 39829819
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 TGTTTAGATTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 8030

 39829820 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 39829879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8031 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 8090

 39829880 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 39829939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 8150

 39829940 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 39829999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     8151 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAGTTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 8210

 39830000 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 39830059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8211 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 8270

 39830060 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 39830119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8271 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 8330

 39830120 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 39830179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8331 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 8390

 39830180 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTT 39830203
          ||||||||||||||||||||||||
     8391 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTT 8414

Alignment time is 7.77459 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3433] =>      3433 nucs 'mol-32-338a-199015_3433'

Score:        3419
Aligned:      3430        nucs
Identic:      3429 (100%) nucs =>      1674 (100%)      1755 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39816671,39818345] EXCISED REGION [39818348,39820102]
 second seq =>  [       1,    1675] EXCISED REGION [    1679,    3433]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [39818346,39818347]
 second seq =>         3 nucs [1676,1678]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        31 nucs [1650,1680] to [1653,1683]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39818341,39818345] to [39818348,39818352]
 second seq =>         5 nucs [1671,1675] to [1679,1683]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1676,1676] to [1678,1678]

 39816671 AAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTC 39816730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATCTGCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTC 60

 39816731 ACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTAC 39816790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTTTAGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTAC 120

 39816791 CTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTG 39816850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCTACTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTG 180

 39816851 TCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGC 39816910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACTATAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGC 240

 39816911 TTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATA 39816970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTTTCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATA 300

 39816971 TTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTT 39817030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCATTCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTT 360

 39817031 CATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTA 39817090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATCAGTTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTA 420

 39817091 TGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGC 39817150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAGACTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGC 480

 39817151 CTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCC 39817210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGGAGTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCC 540

 39817211 ACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAG 39817270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACACTGTTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAG 600

 39817271 CTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAA 39817330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACTCAGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAA 660

 39817331 GATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGA 39817390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATAGTGAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGA 720

 39817391 ACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCC 39817450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTACCCAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCC 780

 39817451 AACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTC 39817510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACTCCTCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTC 840

 39817511 TCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAA 39817570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCAGGCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAA 900

 39817571 AAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATG 39817630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTGATTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATG 960

 39817631 CTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTG 39817690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGGCTAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTG 1020

 39817691 GCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACC 39817750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCTCAAGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACC 1080

 39817751 ATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAG 39817810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGCCCGGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAG 1140

 39817811 TATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTA 39817870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATAAGAACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTA 1200

 39817871 AGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGG 39817930
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1201 AGACAGGAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGG 1260

 39817931 TTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGAT 39817990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTTTTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGAT 1320

 39817991 CTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCC 39818050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTGGCCCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCC 1380

 39818051 ACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCAC 39818110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTACTGCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCAC 1440

 39818111 ACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 39818170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 1500

 39818171 ATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCA 39818230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAGCAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCA 1560

 39818231 ACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTG 39818290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTAGCAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTG 1620

 39818291 CCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 39818345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTATAGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 1675

EXCISED REGION

 39818348 TTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCT 39818407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCT 1738

 39818408 TACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGT 39818467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGT 1798

 39818468 AGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAG 39818527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAG 1858

 39818528 CTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATG 39818587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATG 1918

 39818588 AGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTC 39818647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTC 1978

 39818648 CTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTG 39818707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTG 2038

 39818708 TCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTG 39818767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTG 2098

 39818768 TGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTA 39818827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTA 2158

 39818828 GGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTG 39818887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTG 2218

 39818888 TCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGC 39818947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGC 2278

 39818948 TCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGA 39819007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGA 2338

 39819008 ATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGA 39819067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGA 2398

 39819068 ACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCAT 39819127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCAT 2458

 39819128 GAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAA 39819187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAA 2518

 39819188 GAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCA 39819247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCA 2578

 39819248 GCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTG 39819307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTG 2638

 39819308 TGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCC 39819367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCC 2698

 39819368 ACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACAC 39819427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACAC 2758

 39819428 ACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAA 39819487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAA 2818

 39819488 TCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAG 39819547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAG 2878

 39819548 GAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGG 39819607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGG 2938

 39819608 ATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAG 39819667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAG 2998

 39819668 GCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCA 39819727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCA 3058

 39819728 AGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAG 39819787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAG 3118

 39819788 TGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTC 39819847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTC 3178

 39819848 TGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTG 39819907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTG 3238

 39819908 AGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAG 39819967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAG 3298

 39819968 GCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTG 39820027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTG 3358

 39820028 AGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTC 39820087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTC 3418

 39820088 TTTTTCTTTCTAAGA 39820102
          |||||||||||||||
     3419 TTTTTCTTTCTAAGA 3433

Alignment time is 3.22169 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2527] =>      2527 nucs 'mol-32-3395-027743_2527'

Score:        2503
Aligned:      2542        nucs
Identic:      2527 ( 99%) nucs =>      1749 (100%)       778 ( 98%)
Gaps:           15 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818349,39820097] EXCISED REGION [39825202,39825994]
 second seq =>  [       1,    1749] EXCISED REGION [    1750,    2527]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818349 TTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTT 39818408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTT 60

 39818409 ACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTA 39818468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTA 120

 39818469 GTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGC 39818528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGC 180

 39818529 TCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGA 39818588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGA 240

 39818589 GCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCC 39818648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCC 300

 39818649 TTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGT 39818708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGT 360

 39818709 CCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGT 39818768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGT 420

 39818769 GAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAG 39818828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAG 480

 39818829 GATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGT 39818888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGT 540

 39818889 CACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCT 39818948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCT 600

 39818949 CAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAA 39819008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAA 660

 39819009 TTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAA 39819068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAA 720

 39819069 CTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATG 39819128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATG 780

 39819129 AGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAG 39819188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAG 840

 39819189 AATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAG 39819248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAG 900

 39819249 CTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGT 39819308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGT 960

 39819309 GCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCA 39819368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCA 1020

 39819369 CCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACA 39819428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACA 1080

 39819429 CACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAAT 39819488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAAT 1140

 39819489 CTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGG 39819548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGG 1200

 39819549 AGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGA 39819608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGA 1260

 39819609 TATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGG 39819668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGG 1320

 39819669 CTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAA 39819728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAA 1380

 39819729 GGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGT 39819788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGT 1440

 39819789 GATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCT 39819848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCT 1500

 39819849 GTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGA 39819908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGA 1560

 39819909 GTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGG 39819968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGG 1620

 39819969 CGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGA 39820028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGA 1680

 39820029 GGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCT 39820088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCT 1740

 39820089 TTTTCTTTC 39820097
          |||||||||
     1741 TTTTCTTTC 1749

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1809

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1869

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1929

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1989

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 2049

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 2109

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 2169

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 2229

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 2289

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 2349

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 2409

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     2410 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 2454

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 2514

 39825982 TCCCAGCTACTTG 39825994
          |||||||||||||
     2515 TCCCAGCTACTTG 2527

Alignment time is 2.31917 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5192] =>      5192 nucs 'mol-32-33a0-035524_5192'

Score:        5103
Aligned:      5208        nucs
Identic:      5187 (100%) nucs =>      4317 (100%)       870 ( 98%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39815777,39820097] EXCISED REGION [39825202,39826087]
 second seq =>  [       1,    4321] EXCISED REGION [    4322,    5192]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39815777 GCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTG 39815836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTG 60

 39815837 CCCGCCACCCAGATGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAG 39815896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCGCCACCCAGATGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAG 120

 39815897 GCTCATCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAATGCAGGG 39815956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      121 GCTCATCTCGAACTCCTGAACTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCAGGG 180

 39815957 ATTACAGACATGAGCTACCACTCCGGGCCTCCATTTCTTTTTTGTAGTCTTTAATAAACA 39816016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTACAGACATGAGCTACCACTCCGGGCCTCCATTTCTTTTTTGTAGTCTTTAATAAACA 240

 39816017 GCTGCTATCGTTGCAGACTTGCTATTTAGGCACTTAGGAATTTTTCACTAGAAGGCGTGT 39816076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGCTATCGTTGCAGACTTGCTATTTAGGCACTTAGGAATTTTTCACTAGAAGGCGTGT 300

 39816077 AAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTACATGACTGT 39816136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGAAAGACCACGGACCTTTGTAAGGAATTTAGCATTCATTCTTTGACTACATGACTGT 360

 39816137 CCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAACTGAGCC 39816196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCCAGAGCTATAACTTTACTAATGAATTTTTTAGAAGCCACTTAGCTAGCAACTGAGCC 420

 39816197 TAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTCTCCTCCAA 39816256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATCAGCCACTCACCCTCGTTATTCAGTGCTCTTTTTTTATTGTCTATTTCTCCTCCAA 480

 39816257 CTTGGCTATACTCACAAAGTAATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGAGACA 39816316
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGGCTATACTCACAAAGTGATAAAAACTTGCATTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGAGACA 540

 39816317 GGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCACTGTAGCCT 39816376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGCAGTACAGTGACATGATCATGGTTCACTGTAGCCT 600

 39816377 GAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGA 39816436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAATCCTGGGCTCAAGCAGTTCTCCCACTTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGA 660

 39816437 CATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGATCTTGCCA 39816496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGTGCCACCATGTCCAGCTAATTTTTTCATTTTTTATCACAGAGACAGGATCTTGCCA 720

 39816497 GGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCC 39816556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTGCTCAGACTGGGCTCAAAACTCCTGACTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCC 780

 39816557 AAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATTATT 39816616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTGCTGGGATTACAGGCAGACATGACCACCTGTGCCCAGCCCCCTATTATTATTATT 840

 39816617 TTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATTGAAATCT 39816676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAAATAATAGCTTTATTAAAATATGATTCACATACCATTCACTTTATTTATTGAAATCT 900

 39816677 GCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACTTTT 39816736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAATTCAGTAGGTTTTAGATTATTCACAGAGCTGTGCATCGATCACCACAGTCACTTTT 960

 39816737 AGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTCCTA 39816796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAACCTTTCATTACCCTGTAGAGAAATCCATATCCATACCCCTTAGCCACTACCTCCTA 1020

 39816797 CTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCACTA 39816856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCCCCAACATGCCTTGGCCCCCAGCCTTAGGCAGCCATTGATTTATTTTTTGTCACTA 1080

 39816857 TAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTTTTT 39816916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGATTTGCCTAATCTGGACAAATAGAATTGCACAATATGTGATCTTTTGTGGCTTTTTT 1140

 39816917 TCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTTCAT 39816976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCCTCTTAGCACAGTGTTTTCAAAGTTCCTTTATGTCATAGTGTCTATCAATATTTCAT 1200

 39816977 TCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCATCAG 39817036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCTTCTATGGCAATATTCCATGGTAGAGACACACTGCGTTTTGTTTATCTGTTCATCAG 1260

 39817037 TTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGAAGA 39817096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGGTGGACATTTGGGTTGTTTCCATGTATTGGCCATTATGAATAATGCTGCTATGAAGA 1320

 39817097 CTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTAGGA 39817156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGTTGTACAAGTTTTTGTGTGGATATATATTTTTATTTCTCTGGGATATATGCCTAGGA 1380

 39817157 GTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACACTG 39817216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGAAATTGTTGCATTGTATGATGACTGTACATTTAGCCTTTTGAGAAACTGCCACACTG 1440

 39817217 TTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTACTC 39817276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTCTAAAGTGGCTACACCAGTTGGGTGCAATGGCTCACACCTATAATCCCAGCTACTC 1500

 39817277 AGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGATAGT 39817336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGAGGCTCAGTTGGGAGGAATTGAGCCCATGAATTCAAGTCCAGCCTGGGCAAGATAGT 1560

 39817337 GAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACTACC 39817396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAACCCTGTCTTGATTAAAAAAAAAAAAATCCAATTAAAATGACAAGAACAGAACTACC 1620

 39817397 CAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAACTCC 39817456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAACAAAGAGGTTACACGATTTCATGTTCCCACCAGTGATGTATGTGGGTTCCAACTCC 1680

 39817457 TCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTTTCTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCTCAG 39817516
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCACATCTTCACTGACATTTTTTTTTTTTT-CTAGATAGGGGCTTGCTCTGTCTCTCAG 1739

 39817517 GCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAGTGA 39817576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GCTGCAGCGCAATGATGCCATCACAGTTCATTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCAAAAGTGA 1799

 39817577 TTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTTGGC 39817636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTCTCTCATCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGAAAATTACAGGTGTATGCCACCATGCTTGGC 1859

 39817637 TAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCCTCA 39817696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TAATTTTTATAGATGGGATTTTACCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCATACTCCTGGCCTCA 1919

 39817697 AGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCC 39817756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCTGAGCCACCATGCCC 1979

 39817757 GGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAG 39817816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GGCCTTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAG 2039

 39817817 AACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAG 39817876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AACGAGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAG 2099

 39817877 GAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTT 39817936
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2100 GAAGATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTT 2159

 39817937 TTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGC 39817996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTTTTTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGC 2219

 39817997 CCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACT 39818056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCACTGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACT 2279

 39818057 GCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGT 39818116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GCCCGGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGT 2339

 39818117 CTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCA 39818176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCA 2399

 39818177 AGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAG 39818236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGCATGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAG 2459

 39818237 CAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATA 39818296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CAAGACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATA 2519

 39818297 GTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-ACTTTTTGAG 39818355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2520 GTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAG 2579

 39818356 ACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAG 39818415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAG 2639

 39818416 CCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGA 39818475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGA 2699

 39818476 CCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGC 39818535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGC 2759

 39818536 CTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCA 39818595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCA 2819

 39818596 TGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTC 39818655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTC 2879

 39818656 AACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCC 39818715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCC 2939

 39818716 TCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGT 39818775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGT 2999

 39818776 TGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAG 39818835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAG 3059

 39818836 GGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAG 39818895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAG 3119

 39818896 GATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAA 39818955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAA 3179

 39818956 TCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTT 39819015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTT 3239

 39819016 TTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGC 39819075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGC 3299

 39819076 ACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATT 39819135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATT 3359

 39819136 GTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTT 39819195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTT 3419

 39819196 GTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGA 39819255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGA 3479

 39819256 TGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGT 39819315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGT 3539

 39819316 AACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGT 39819375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGT 3599

 39819376 AACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCC 39819435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCC 3659

 39819436 TAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGA 39819495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGA 3719

 39819496 GTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAA 39819555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAA 3779

 39819556 GCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACC 39819615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACC 3839

 39819616 CACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTT 39819675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTT 3899

 39819676 GGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGG 39819735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGG 3959

 39819736 CAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAA 39819795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAA 4019

 39819796 ATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGA 39819855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 ATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGA 4079

 39819856 AGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGG 39819915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGG 4139

 39819916 GAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAA 39819975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAA 4199

 39819976 AGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCA 39820035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCA 4259

 39820036 GAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTT 39820095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 GAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTT 4319

 39820096 TC 39820097
          ||
     4320 TC 4321

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 4381

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4382 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 4441

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 4501

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 TTTCTGGCCCCTAGGACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 4561

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 4621

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 4681

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 4741

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 4801

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 4861

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 4921

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 4981

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     4982 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 5026

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 5086

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 5146

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 39826087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 5192

Alignment time is 4.83671 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4838] =>      4838 nucs 'mol-32-33a0-113098_4838'

Score:        4705
Aligned:      4856        nucs
Identic:      4830 ( 99%) nucs =>        51 (100%)      4779 ( 99%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39820047,39820097] EXCISED REGION [39825202,39830004]
 second seq =>  [       1,      51] EXCISED REGION [      52,    4838]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39820047 AGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 51

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       52 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 111

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 171

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 231

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 291

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 351

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 411

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 471

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 531

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 591

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 651

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 711

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
      712 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 756

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 816

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 876

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 936

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 996

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 1056

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 1116

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 1176

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 1236

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 1296

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 1356

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 1416

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 1476

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 1536

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 1596

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 1656

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 1716

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1717 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 1776

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 1836

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 1896

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 1956

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 2016

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2017 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 2076

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     2077 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 2136

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 2196

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2197 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 2256

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 2316

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 2376

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 2436

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 2496

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 2556

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 2616

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 2676

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 2736

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 2796

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2797 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 2856

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 2916

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 2976

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 3036

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 3096

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 3156

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 3216

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 3276

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 3336

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 3396

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 3456

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 3516

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 3576

 39828741 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 39828800
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTA--CTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 3634

 39828801 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 39828860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 3694

 39828861 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 39828920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 3754

 39828921 TTTATTTATTTA-TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 39828979
          |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 TTTATTTA-TTATTTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 3813

 39828980 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 39829039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 3873

 39829040 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 39829099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 3933

 39829100 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 39829159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 3993

 39829160 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 39829219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 4053

 39829220 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 39829279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 4113

 39829280 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 39829339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 4173

 39829340 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 39829399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 4233

 39829400 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 39829459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 4293

 39829460 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 39829519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 4353

 39829520 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 39829579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 4413

 39829580 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 39829639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 4473

 39829640 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 39829699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 4533

 39829700 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 39829759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 4593

 39829760 TGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 39829819
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 TGTTTAGATTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 4653

 39829820 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 39829879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 4713

 39829880 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 39829939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 4773

 39829940 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 39829999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4774 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAGTTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 4833

 39830000 CTTAT 39830004
          |||||
     4834 CTTAT 4838

Alignment time is 4.5293 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6717] =>      6717 nucs 'mol-32-33a0-176628_6717'

Score:        6584
Aligned:      6735        nucs
Identic:      6709 (100%) nucs =>      1743 (100%)      4966 ( 99%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818355,39820097] EXCISED REGION [39825202,39830191]
 second seq =>  [       1,    1743] EXCISED REGION [    1744,    6717]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39818355 GACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCA 39818414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCA 60

 39818415 GCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGG 39818474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGG 120

 39818475 ACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGG 39818534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGG 180

 39818535 CCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACC 39818594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACC 240

 39818595 ATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCT 39818654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCT 300

 39818655 CAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGC 39818714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGC 360

 39818715 CTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAG 39818774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAG 420

 39818775 TTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGA 39818834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGA 480

 39818835 GGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCA 39818894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCA 540

 39818895 GGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCA 39818954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCA 600

 39818955 ATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGT 39819014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGT 660

 39819015 TTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTG 39819074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTG 720

 39819075 CACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCAT 39819134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCAT 780

 39819135 TGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCT 39819194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCT 840

 39819195 TGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATG 39819254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATG 900

 39819255 ATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTG 39819314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTG 960

 39819315 TAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAG 39819374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAG 1020

 39819375 TAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCC 39819434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCC 1080

 39819435 CTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGG 39819494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGG 1140

 39819495 AGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGA 39819554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGA 1200

 39819555 AGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCAC 39819614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCAC 1260

 39819615 CCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGT 39819674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGT 1320

 39819675 TGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGG 39819734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGG 1380

 39819735 GCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTA 39819794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTA 1440

 39819795 AATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAG 39819854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAG 1500

 39819855 AAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAG 39819914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAG 1560

 39819915 GGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAA 39819974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAA 1620

 39819975 AAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCC 39820034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCC 1680

 39820035 AGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCT 39820094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCT 1740

 39820095 TTC 39820097
          |||
     1741 TTC 1743

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 1803

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 1863

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 1923

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 1983

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 2043

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 2103

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 2163

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 2223

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 2283

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 2343

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 2403

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     2404 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 2448

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 2508

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 2568

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 2628

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 2688

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 2748

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 2808

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 2868

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 2928

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 2988

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 3048

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 3108

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 3168

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 3228

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 3288

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 3348

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 3408

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3409 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 3468

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 3528

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 3588

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 3648

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 3708

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3709 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 3768

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     3769 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 3828

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 3888

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3889 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 3948

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 4008

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 4068

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 4128

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 4188

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 4248

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 4308

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 4368

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 4428

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 4488

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4489 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 4548

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 4608

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 4668

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 4728

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 4788

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 4848

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 4908

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 4968

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 5028

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 5088

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 5148

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 5208

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 5268

 39828741 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 39828800
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTA--CTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 5326

 39828801 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 39828860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 5386

 39828861 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 39828920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 5446

 39828921 TTTATTTATTTA-TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 39828979
          |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 TTTATTTA-TTATTTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 5505

 39828980 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 39829039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 5565

 39829040 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 39829099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 5625

 39829100 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 39829159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 5685

 39829160 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 39829219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5686 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 5745

 39829220 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 39829279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5746 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 5805

 39829280 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 39829339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5806 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 5865

 39829340 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 39829399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5866 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 5925

 39829400 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 39829459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 5985

 39829460 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 39829519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5986 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 6045

 39829520 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 39829579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6046 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 6105

 39829580 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 39829639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6106 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 6165

 39829640 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 39829699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6166 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 6225

 39829700 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 39829759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6226 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 6285

 39829760 TGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 39829819
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6286 TGTTTAGATTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 6345

 39829820 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 39829879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6346 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 6405

 39829880 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 39829939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6406 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 6465

 39829940 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 39829999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6466 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAGTTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 6525

 39830000 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 39830059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6526 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 6585

 39830060 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 39830119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6586 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 6645

 39830120 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 39830179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6646 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 6705

 39830180 CTTTTCTGTCTG 39830191
          ||||||||||||
     6706 CTTTTCTGTCTG 6717

Alignment time is 6.30518 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9370] =>      9370 nucs 'mol-32-33ab-159982_9370'

Score:        9171
Aligned:      9390        nucs
Identic:      9357 (100%) nucs =>      2334 (100%)      7023 (100%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39817761,39820097] EXCISED REGION [39825202,39832249]
 second seq =>  [       1,    2335] EXCISED REGION [    2336,    9370]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5104 nucs [39820098,39825201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [39820098,39820102] to [39825202,39825206]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39817761 TTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACG 39817820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACG 60

 39817821 AGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAG 39817880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAG 120

 39817881 ATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTT 39817940
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTT 180

 39817941 TTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCAC 39818000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCAC 240

 39818001 TGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCC 39818060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCC 300

 39818061 GGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCG 39818120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCG 360

 39818121 AACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCA 39818180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCA 420

 39818181 TGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAG 39818240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAG 480

 39818241 ACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCT 39818300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCT 540

 39818301 CTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATG 39818360
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
      541 CTCTCCCTCTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--ACTTTTTGAGACATG 598

 39818361 GTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGA 39818420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 GTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGA 658

 39818421 AACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACA 39818480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 AACTCCTGGGATCAAGTGATGAATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACA 718

 39818481 GGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAA 39818540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAA 778

 39818541 GCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCT 39818600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCT 838

 39818601 GGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTT 39818660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTT 898

 39818661 GAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCA 39818720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 GAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCA 958

 39818721 AGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAG 39818780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAG 1018

 39818781 GATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGAC 39818840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGAC 1078

 39818841 CCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGG 39818900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGG 1138

 39818901 AGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTA 39818960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTA 1198

 39818961 CCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTAT 39819020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTAT 1258

 39819021 TTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCA 39819080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCA 1318

 39819081 AGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCC 39819140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCC 1378

 39819141 CACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAAT 39819200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAAT 1438

 39819201 TACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGC 39819260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGC 1498

 39819261 AACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACAT 39819320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACAT 1558

 39819321 AGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTT 39819380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTT 1618

 39819381 GTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATC 39819440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATC 1678

 39819441 TCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAA 39819500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAA 1738

 39819501 GGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAG 39819560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAG 1798

 39819561 CCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTT 39819620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTT 1858

 39819621 CAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACT 39819680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACT 1918

 39819681 CCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAG 39819740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAG 1978

 39819741 CGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGG 39819800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGG 2038

 39819801 GAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAA 39819860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAA 2098

 39819861 CCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAG 39819920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAG 2158

 39819921 GTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGG 39819980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGG 2218

 39819981 GAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAG 39820040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAG 2278

 39820041 GGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 39820097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTC 2335

EXCISED REGION

 39825202 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 39825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGGCCAT 2395

 39825262 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 39825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 GATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAGAGTC 2455

 39825322 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 39825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTTTGGG 2515

 39825382 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 39825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAATGTAG 2575

 39825442 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 39825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGATGGC 2635

 39825502 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 39825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAG 2695

 39825562 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 39825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAATTGG 2755

 39825622 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 39825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATT 2815

 39825682 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 39825741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTACTAA 2875

 39825742 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 39825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 AAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGC 2935

 39825802 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 39825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACC 2995

 39825862 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAATAAAATAAAATAAAA 39825921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||
     2996 ATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC---------------AAAA 3040

 39825922 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 39825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATGGCATGAATCTGGAG 3100

 39825982 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 39826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGAAATTTGAGGTTGC 3160

 39826042 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 39826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 AGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGAGATCTTGAAGAAAA 3220

 39826102 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 39826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 GAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGGGACAGATGGCAATG 3280

 39826162 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 39826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAAAGACTTGAAGGAGG 3340

 39826222 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 39826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 GGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAAACAATAGAATAAAA 3400

 39826282 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 39826341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGACGGAGAGAGGGAGA 3460

 39826342 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 39826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 GAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACAGATCACATAAGCCC 3520

 39826402 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 39826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGGGAACTGCGGGAAGG 3580

 39826462 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 39826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCATTCTCTGGCTGCTGA 3640

 39826522 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 39826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 GTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAAGCTTTGGCAACATC 3700

 39826582 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 39826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 CAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTGAGAGATGGTCAGAG 3760

 39826642 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 39826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 GGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTTTAGTACATGTCGAA 3820

 39826702 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 39826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 GACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAGAAGGCAGGGGTCAA 3880

 39826762 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 39826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 GGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAACACTACTGCCTTTCC 3940

 39826822 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 39826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 CAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGGCTCATTGCAGTGGC 4000

 39826882 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAAGT 39826941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4001 TCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATCTTTTAAGGGCAGGT 4060

 39826942 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 39827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 GTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAAAATATTTTTCAAAA 4120

 39827002 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 39827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAGCTACTCAGGAGGCT 4180

 39827062 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 39827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 GAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGGCAACATAGCAAGAC 4240

 39827122 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 39827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 CCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCACTCAGCTGTACTAC 4300

 39827182 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGGTCGAGGCTGCAGTG 39827241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4301 CAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTG 4360

 39827242 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCA-AATA 39827300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4361 AGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGACCTGTCTCACAATA 4420

 39827301 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 39827360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 CAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTTTGGCTCTGCAGCC 4480

 39827361 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTGGGAATGAGGAGACCCCTGCT 39827420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4481 CTTGCAATCGCTCAGCCGTGCAGTGGGGTTTGCGTCGCTAGGAATGAGGAGACCCCTGCT 4540

 39827421 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 39827480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 CGGTGTTGTTGCCTGACTAATCAGTGTTTTAAAACATATATTAATCGGGGTGGGCGCAGT 4600

 39827481 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 39827540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCA 4660

 39827541 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 39827600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 AGAGTTCAAGACCAGCCTTCTCTACTAAGAAAACTCCTTCTCTACTAAGAAAATACAATA 4720

 39827601 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 39827660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 ATTAGCCAGATATGGTAGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGA 4780

 39827661 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 39827720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 AAATCGCTTGAACCTCTGCGGGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATTGCGCCACTTCACT 4840

 39827721 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 39827780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 CCAGCCTGGGCAAAAGAACAAGACTTTGTATCAAAGAAAAAAAAAGTATTATATCAACAT 4900

 39827781 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 39827840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 GTAATGGTTTTATTATTAATATATAAAGAATATTAAATATTTTTAAAATCTTCTATTATA 4960

 39827841 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 39827900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TTAACATGTAATGGCTTTATTAATATGTGATGAGTAATATTTAAAAATTTTTGTCTTATT 5020

 39827901 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 39827960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 TTCTAGTTTTAATATAATTATTTACAGAAAGAAATAGTCTTAGAGATCTTCAATAAAGTT 5080

 39827961 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATTC 39828020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5081 AAAAAATGTAAAGGGATGTTAGACCCCAAAAGATTGAGAATTTCTAGTTTAGAAATATAC 5140

 39828021 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 39828080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 AGAGTAAGCCACATACAACTTGCTACTTGAACTATTTTTTTTCTTTGTTTTTTATTTTAG 5200

 39828081 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 39828140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 GAGATGGGGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTTGAGTACAGTAGTGCTATCACAGCTCACTG 5260

 39828141 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 39828200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 CAGCCTTGAACTCCTGGGCTAAGGATCCTCCTACCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 5320

 39828201 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 39828260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TAGGTATACATGACGATACTTGGCTAATTTTTAAATTGTTTTGTAGACATGGGGTCTCAC 5380

 39828261 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 39828320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 TTTGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCATGGCCTCAAGTGACCCTTCCACCCCTGCCTCC 5440

 39828321 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 39828380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 CATCCTAGAGGTATGTGCCACCACAAGGAGCACTTGTTCAATTTTCTAAAAAAAAAATTT 5500

 39828381 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 39828440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 CTAAAGTAAGGCTGTGGGATGATGGCAGGAAGATAAGAGAAAAACAGAATAAGTTAAAAT 5560

 39828441 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 39828500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 GACTTATTCACACATATTCTTTTGACAGCAAGAAGAACTTTTAGTATATACATTCCTTAC 5620

 39828501 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 39828560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 AAACAAACAAAAGGCAGATAAACAATGTTGTATAGGAACTTCAACACACACTGTACAATA 5680

 39828561 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 39828620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 TTCCCACTTTGCTGACATAAGTTATGGAAATTTCGTGGTTTACTTGAGTGTCGCTACCAG 5740

 39828621 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 39828680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 TATTTTGCTTCTCTGATCATTTTTATCAACTTCCTCATCTGTTAACTTCTCTCCAAGGTA 5800

 39828681 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 39828740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 TGTCATATCATGACATACTGCTGCTGCACGAACATGGCCAGTGTCTTCCTATTAAACATG 5860

 39828741 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTACTCTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 39828800
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 TAGAATGCTTTCCTAATTTCTCTTTTTA--CTCTGTCTTTGTGTTTTGCATTTTCCTTAC 5918

 39828801 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 39828860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5919 TTTTATTGTCAGAAACTCCAGAAAGTCAATTGTACTAATTTATCACCATTTGCTTTATTA 5978

 39828861 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 39828920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5979 ATTTATACTTTGCTTATATGGAATTTTGCCCAACAGACCTCATTACAATTTCTAACCTGT 6038

 39828921 TTTATTTATTTA-TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 39828979
          |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 TTTATTTA-TTATTTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCCCTCTGTTGTCCAAGGCTGGA 6097

 39828980 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 39829039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6098 GTGTAGTAGTGCTATCACAGCTGACTGCAGCCTCAACCTTCCAGGCTGAAGCGATCCTCC 6157

 39829040 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 39829099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6158 CATCTCAACCTCCCACGTGGCTGAGACTACAGGCGCTTGCCACTATGCCCAACTAATATT 6217

 39829100 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 39829159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 TGGAATTTTCCTATACGTGGATTCCAGAGGGGTGACAGCGAAACGTGAGTAAGCATGGAT 6277

 39829160 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 39829219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 TTTGGTATATGCAGAGATGGGGGGCTGGAACTAATTCTGTATACTGAGGGAGGACTGTAT 6337

 39829220 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 39829279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 ATGTTTTTACAATTACGCTGTAGGATACATACTGTTGCGTAGCCTTGAAAATAATAATTT 6397

 39829280 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 39829339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 TTAATTGAGTGGAATAATAATAATATTGATAAAAGTAGCAGCTGGTCAGGTGTGGTGGCT 6457

 39829340 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 39829399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 CACACTGGTAATCGCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCTTGAGGCCAAGAG 6517

 39829400 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 39829459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6518 TTTGCGATAGGCCTTGGAAACAAAGGGAGTCACCATCCCTACAGAAAAATATATGAATTA 6577

 39829460 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 39829519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 GCCTAGTGTGGTGGCATGTTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCTGGGAGGAT 6637

 39829520 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 39829579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6638 CACTTGAGCCCAGGGAGGCTGAGACTGCAGTGAGTCATGATCAGGCCTCTGCATTCCAGC 6697

 39829580 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 39829639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6698 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAACAACAAAAAAGTAGCAGCTAACATCAACT 6757

 39829640 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 39829699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6758 GACCTTTTACCAGGTGCCTATTGATACCATAGTTTAATTTCTTATAACTTTCTTATTTCA 6817

 39829700 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 39829759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6818 CTTACCAACTCTGTCTTCAGTTACTCCCAGATTTTTACTGTGTTTGTACAGATGACCTTT 6877

 39829760 TGTTTAGACTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 39829819
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6878 TGTTTAGATTGAATTGTCTCCCCAGAAGTAAGATTACTGTGAGTCATGGCGAATGGACAT 6937

 39829820 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 39829879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6938 TGTCATTACCCTTGATGTAAATTGACAAGGTTTTGGGTGCCTCCCAGCTATAATCTTAGC 6997

 39829880 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 39829939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6998 ACTTTGGGAGGCTAAGACAGGAGGATTGCTTGAGGCCAAGAGTTTGAGGAGGCAGTATGG 7057

 39829940 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAATTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 39829999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7058 CAGTATGGTGAGACCCTGTCTCTATTATTTTAAAAAGTTGACAAGCTTTACCCTGGAAGG 7117

 39830000 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 39830059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7118 CTTATACACAATTTAAACACCCCTCATAGTATAAGAAAGTGCCCATTTCACTGCACCTTT 7177

 39830060 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 39830119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7178 GCCAGCACAGGGTATTATAATTAAGTCATTTTTTGTTTGATTATTTTAAATAGATAAAAG 7237

 39830120 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 39830179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7238 ACCTCATATTACTTTGCTTGTCACATTTCAACATCTTTCCTTAGCTTATTAGCTCTATTT 7297

 39830180 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 39830239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7298 CTTTTCTGTCTGTAAATGGTTGTTGTTGTTTTGTTCTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTC 7357

 39830240 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 39830299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7358 ACCAGGCTGGACTGTAGTGGCATAATCATGCCTGACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCA 7417

 39830300 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 39830359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7418 AACTTTAGCATTCCGAGTAGCTGGGACTACAAGTGTGCACCATCACTCCCAGCTAATTTT 7477

 39830360 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 39830419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7478 TTTCTTTTTTTGGATAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGTCCAGACCGGTCTCTAGCTCCT 7537

 39830420 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 39830479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7538 GGCCTTAAGCAATCCTCCTGCATTAGCTTCTCAAATTGCTGGAATTTCAGGCATGAGCCA 7597

 39830480 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 39830539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7598 CCATGCCTGGCCTGGGCTAGTCCTATATTCTCTAGAGTTCTCTTTACTTTGTGCTAGCCA 7657

 39830540 ATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATTAAATTTTACCAC 39830599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7658 ATCTCTCATTATGCTGCTCACCTGTTATAATGAATAATTCTCTGTATTAAATTTTACCAC 7717

 39830600 TTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATATGTTAGGAAGGG 39830659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7718 TTTAAACTTTTGAGTGGTTTATGCTTCCTGATTGGACTCTGACTAATATGTTAGGAAGGG 7777

 39830660 TCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTTTCCCAGGGGGCA 39830719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7778 TCCCAGGAGATAAACCCACACAGATGGGATTTGGGCATAGGTTTGGTTTCCCAGGGGGCA 7837

 39830720 GTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCAC 39830779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7838 GTGCTGAGCTCTTTGCCAGTGGGAAATGGGATGCTGGTGATTTCCAGGAAGTGACCTCAC 7897

 39830780 AATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTGAGGCACATGCCT 39830839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7898 AATGACTCAAGCTACCACTTACTGTTGATTGTGATGACATGCCAGCTGAGGCACATGCCT 7957

 39830840 TGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGGGAAGGGTCGTTT 39830899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7958 TGGGAGCTAAGTGGTTGCTGCACTTGACCACTATGAAGACTGGTGTGGGAAGGGTCGTTT 8017

 39830900 TGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTAAGGAGCCACACA 39830959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8018 TGGATGCTCTTGAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGAGCCATGGAGCCGTAAGGAGCCACACA 8077

 39830960 GCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGTATTTACAACCAC 39831019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8078 GCAGGAGGTGAGTGTGTCGAGTGAGGGAGTGAGGGAAGCTTCGTCTGTATTTACAACCAC 8137

 39831020 TCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCAGTAGCATTAGAT 39831079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8138 TCCCCTTTGCTCACATTCCCGCCTGAGCTCCACCTTCTCACATCAGCAGTAGCATTAGAT 8197

 39831080 TCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCTAGGTTGCGCTGT 39831139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8198 TCTCATAGGAGAACGCACCCTGTTGTGAACCGTGCATGTGAGGGATCTAGGTTGCGCTGT 8257

 39831140 CCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACGCTCAGGTGGGAC 39831199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8258 CCTTATGAGACTCTAATACCTATTGATCTGTCACTTTCTCCCATCACGCTCAGGTGGGAC 8317

 39831200 CATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATTATGGTGAGTTCT 39831259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8318 CATCCAGTTGCAGGAAAACGAGCTTAACACGCCCACTGATTCTACATTATGGTGAGTTCT 8377

 39831260 ATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCCTAATAAATGTAA 39831319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8378 ATAATTATTTTATTATATATTACAGTGTACTAATGGAAATAAAGTGCCTAATAAATGTAA 8437

 39831320 TCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGAACTT 39831379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8438 TCTGCTTAAATCTTTTGGCCCAGCTCCTACCTCCCGGCAGCCTCTCCAGGCCCAGAACTT 8497

 39831380 TCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTATTTAGGCCCATAC 39831439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8498 TCTCCAGTCGGCCTCCACAGACCAAGCTCATGACTCACAATGGCCTATTTAGGCCCATAC 8557

 39831440 CCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGCCTCCACAGGCAC 39831499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8558 CCTACCTCACGGCAGTCTCCGCAGATGAGGCTACTGCCTCACAACAGCCTCCACAGGCAC 8617

 39831500 AGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAGCCTTCTCTCTAG 39831559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8618 AGCTCCATCGTTACAATGGCCTCTTTAGACCCAGCTCCTGCCTCCCAGCCTTCTCTCTAG 8677

 39831560 GCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCTTGGCAGCCTCTC 39831619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8678 GCCCTGAACTTTCTCAAGTCGACGTCACCAGGCCCAGCTCATGCTTCTTGGCAGCCTCTC 8737

 39831620 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCATCAAGTCGGCCTG 39831679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8738 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCGGCCTCTGCAGGCCCAGACTGTCATCAAGTCGGCCTG 8797

 39831680 TCCAGGGCCAGCTCCTGCCTCCCGGCGCCCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTCAAGTTGGC 39831739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8798 TCCAGGGCCAGCTCCTGCCTCCCGGCGCCCTCTGCAGGCCCAAGTCGTCCTCAAGTCGGC 8857

 39831740 CTCCCCAGGCCCAGCTCCAGCCTCTCGGCGGCCTCTCCGGGTGCAAAAGTTCCTCGAGTC 39831799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8858 CTCCCCAGGCCCAGCTCCAGCCTCTCGGCGGCCTCTCCGGGTGCAAAAGTTCCTCGAGTC 8917

 39831800 AGCCTCTCCAGGCCCAGCTCCTCCTGCCTCCCAGT-GCCTCTTTCGGCCCAGCCCAGCTC 39831858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     8918 AGCCTCTCCAGGCCCAGCTCCTCCTGCCTCCCAGTGGCCTCTTTCGGCCCAGCCCAGCTC 8977

 39831859 ATGCCTCTGGGCGGCCTTCCCAGGCCCCGCTTTTGACTTTTGGCGGCCTCTGCAGGCCTC 39831918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8978 ATGCCTCTGGGCGGCCTTCCCAGGCCCCGCTTTTGACTTTTGGCGGCCTCTGCAGGCCTC 9037

 39831919 GACAAGGCCCGGCCTCCTGCCTCCCGAA-GCCTGCACAGGCCCAGCCTCTGCCTCACAGC 39831977
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     9038 GACAAGGCCCGGCCTCCTGCCTCCCGAAGGCCTGCACAGGCCCAGCCTCTGCCTCACAGC 9097

 39831978 AGACTCTCCACGCCCAGCTAGCTCTCGCCTCACTGCGGCCTCCCCAGTCCAAAGCTCCTG 39832037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9098 AGACTCTCCACGCCCAGCTAGCTCTCGCCTCACTGCGGCCTCCCCAGTCCAAAGCTCCTG 9157

 39832038 CCTCTCGGCCGCTTCGGCAGGCCCAGCTCCCGCCTGCCAGT-GCCTCTTCAGGCCCATGG 39832096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     9158 CCTCTCGGCCGCTTCGGCAGGCCCAGCTCCCGCCTGCCAGTGGCCTCTTCAGGCCCATGG 9217

 39832097 GGCTCATTCCTCACAACGGCCTTTCCAGGCCCCGTTTTTCCCTTCCGGCGGCCTCTCCGG 39832156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9218 GGCTCATTCCTCACAACGGCCTTTCCAGGCCCCGTTTTTCCCTTCCGGCGGCCTCTCCGG 9277

 39832157 GCCCAGAACCTCCTCAAGTTGGCCTCTCCAGACCCACTTGCACCCTCCGGGCGTCCTCTC 39832216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9278 GCCCAGAACCTCCTCAAGTTGGCCTCTCCAGACCCACTTGCACCCTCCGGGCGTCCTCTC 9337

 39832217 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCTGCGTCTCCA 39832249
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     9338 CAGGCCCAGCTCTTCCTCCCGGCTGCGTCTCCA 9370

Alignment time is 8.7083 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2340] =>      2340 nucs 'mol-32-33ab-159982_2340'

Score:        2329
Aligned:      2340        nucs
Identic:      2339 (100%) nucs =>       558 (100%)      1781 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39817761,39818319] EXCISED REGION [39818322,39820102]
 second seq =>  [       1,     559] EXCISED REGION [     560,    2340]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [39818320,39818321]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [39818320,39818343] to [39818322,39818345]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39818320,39818320] to [39818321,39818321]
 second seq =>         0 nucs

 39817761 TTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACG 39817820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCACCAACATTTGTCATTATGGTTTTTTTTTCTTTATACCTTAAAGCAGTATAAGAACG 60

 39817821 AGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAG 39817880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTTCTTCAATTATAGGAAACAATATAATCCCAGGGCATTGGGAAGCTAAGACAGGAAG 120

 39817881 ATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTT 39817940
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTCTTGATGCCAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTTTT 180

 39817941 TTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCAC 39818000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAGATAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCCCAC 240

 39818001 TGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCC 39818060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAACCTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTACAGGTACATGCCACTACTGCCC 300

 39818061 GGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCG 39818120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTTATTTTTATATTTTTAGTAGAGTCAGAGTTTCACCATGTTGGCCACACTGGTCTCG 360

 39818121 AACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCA 39818180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTCCTGACTTCAGGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAGCAAGCA 420

 39818181 TGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAG 39818240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGCCACCATGCCCAGCCTGATGCCAGGAGTTTTAGACCAGCCTGGGCAACCTAGCAAG 480

 39818241 ACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCT 39818300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTGGTCTCTACAGAATATTTAAAAATTAGCCAAATGTGGGGGTACCTGCCTATAGTCT 540

 39818301 CTCTCCCTCTCTCTCTCTG 39818319
          |||||||||||||||||||
      541 CTCTCCCTCTCTCTCTCTG 559

EXCISED REGION

 39818322 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGC 39818381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTGAGACATGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGC 619

 39818382 TGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATG 39818441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 TGAAGTGCAGTGGTGTGATCATGGCTTACTGCAGCCTGAAACTCCTGGGATCAAGTGATG 679

 39818442 AATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTT 39818501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 AATCCTCCCACCTCATCCTACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTT 739

 39818502 TCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCC 39818561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 TCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCC 799

 39818562 CCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGA 39818621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 CCCACAGTGCAAGGATTACAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGA 859

 39818622 GAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTC 39818681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 GAACCAAAAGAAGGATCCAAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTC 919

 39818682 ATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAA 39818741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 ATCAGCAAGGTGCTGGTTATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAA 979

 39818742 GGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCA 39818801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 GGGAGTTTTCCTGCTGCTTCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCA 1039

 39818802 GAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTT 39818861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 GAGAGAGATGCCTTGTAGCCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTT 1099

 39818862 TTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGG 39818921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TTCTTTAGAAACAGGACCTTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGG 1159

 39818922 CTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAG 39818981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 CTCATTGTAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAG 1219

 39818982 CTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCG 39819041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 CTGGTAAGCACCATGACACTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCG 1279

 39819042 CACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCC 39819101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 CACTATGTTGCCATGGCTGACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCC 1339

 39819102 TCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACC 39819161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TCCCAAAGTATTGGTATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACC 1399

 39819162 TTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATAC 39819221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 TTCTGCCTCCCTCTTCCACTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATAC 1459

 39819222 TCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACT 39819281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 TCCAGGATAATCTTGTTTTAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACT 1519

 39819282 CTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGG 39819341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 CTTAATTCCCCCTTCCTATGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGG 1579

 39819342 CAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACC 39819401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 CAGGGTGGGGGGTTATTACTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACC 1639

 39819402 ACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAG 39819461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 ACTGGTGAATTAAGCATGAATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAG 1699

 39819462 CACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGT 39819521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 CACCTCACCTGCCATGCTCCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGT 1759

 39819522 GATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTT 39819581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 GATGCCAAAGCGGACAAGTGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTT 1819

 39819582 AAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAA 39819641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 AAGGGGAAGCATATTATAAGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAA 1879

 39819642 GAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGA 39819701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 GAGTGTGCATTCAGGGGGCAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGA 1939

 39819702 GGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTG 39819761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 GGGGCAAGCAGTGAGGCTGCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTG 1999

 39819762 GACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCA 39819821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 GACTTAATCCCCAAGGCAAGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCA 2059

 39819822 TGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCA 39819881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TGGATTAGAGACATGGCTCAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCA 2119

 39819882 ATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTT 39819941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 ATGGGTGTGCAGGAGACCTCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTT 2179

 39819942 TGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGG 39820001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 TGAGTAATTTAAATGATGGTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGG 2239

 39820002 AAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCC 39820061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 AAAGTGGGAGGAAGAACTGACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCC 2299

 39820062 CTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGA 39820102
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CTTAGGGGGATTAACACTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGA 2340

Alignment time is 2.14163 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2029] =>      2029 nucs 'mol-32-33b6-090741_2029'

Score:        2029
Aligned:      2029        nucs
Identic:      2029 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39818460,39820488]
 second seq =>  [       1,    2029]

 39818460 TACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTG 39818519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCAAGTAGTAGGGACCACAGGTGTATGCCACCCAGGTCTTTCTATGTTGCCCAGGCTG 60

 39818520 GTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTA 39818579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTCTCACCTTGGCCCCCCACAGTGCAAGGATTA 120

 39818580 CAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCC 39818639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGTATGAGCCACCATGCCTGGCCTCTACCCTGCCTATTGAGAACCAAAAGAAGGATCC 180

 39818640 AAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTT 39818699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATTCTCCTTAGCTCAACTTGAGCTATTTCCTAATTGCTTCATCAGCAAGGTGCTGGTT 240

 39818700 ATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCT 39818759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGGGTGTCCAGGCCTCCCAAGCAGCACAGAAATGAGGTAAGGGAGTTTTCCTGCTGCT 300

 39818760 TCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAG 39818819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACTCTGTGAGGAGTTGGAGGATGATGTTTACTCATTTGCAGAGAGAGATGCCTTGTAG 360

 39818820 CCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACC 39818879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACCTTAGGATGGAGGGGACCCTGATTCCAATGTCCTTTTTTTCTTTAGAAACAGGACC 420

 39818880 TTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAAC 39818939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCCCTGTCACTCAGGATGGAGTTCAGTGGTCCAATCATGGCTCATTGTAGCCTCAAAC 480

 39818940 TCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACA 39818999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCCAGGCTCAAGCAATCCTACCACGTCAGTCTTCCCAGTAGCTGGTAAGCACCATGACA 540

 39819000 CTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCT 39819059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAGTGAATTTTGTTTTTATTTTTTTGTAGAGATGGGGCCGCACTATGTTGCCATGGCT 600

 39819060 GACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATT 39819119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACCTTGAACTCCTGCACTCAAGGGATTTTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTATTGGTATT 660

 39819120 ACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCA 39819179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAGGCATGAGCCATTGTGCCCACTGTCTCTGGTTCTTAACCTTCTGCCTCCCTCTTCCA 720

 39819180 CTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTT 39819239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTTAAAGAATGCTTGTAATTACATGGGCTCTCCTAGATACTCCAGGATAATCTTGTTT 780

 39819240 TAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTA 39819299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAGGTCAGCTGATGATGAGCAACATTAATTTTATCTGCACTCTTAATTCCCCCTTCCTA 840

 39819300 TGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTA 39819359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAATTGTGCTGTGTAACATAGGACATGAGCAATTAGTTGGCAGGGTGGGGGGTTATTA 900

 39819360 CTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATG 39819419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTGGCCACCACAGTAACTTGTGCCAGGTACTGAGCTAACCACTGGTGAATTAAGCATG 960

 39819420 AATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCT 39819479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAACACACACTCCCTAATCTCCATCCATTCATGGGAGGAGCACCTCACCTGCCATGCT 1020

 39819480 CCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAG 39819539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTGAGAATCTGGGGAGTCAAGGAAGTCTTCCATGAGGAGGTGATGCCAAAGCGGACAAG 1080

 39819540 TGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATA 39819599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGACAGAGGAGCCGAAGCTAGCCAGGAAGAGAGTAGAGGTTTAAGGGGAAGCATATTATA 1140

 39819600 AGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGG 39819659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCAGAGGATATCACCCACTTCAGAGACTCCCAGAGGAGAAAGAGTGTGCATTCAGGGGG 1200

 39819660 CAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCT 39819719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGATGAGGCTGAGTTGGACTCCATAGCAGGTGAAATGGAGAGGGGCAAGCAGTGAGGCT 1260

 39819720 GCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCA 39819779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCTTGCAAGGCAGGGCAGAGCGGGGGCTGTTAAGGAGTTTGGACTTAATCCCCAAGGCA 1320

 39819780 AGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCT 39819839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGAGAAGTGATGTAAATGGGGAAGTAACATGATGAGATTCATGGATTAGAGACATGGCT 1380

 39819840 CAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACC 39819899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGCTTCTGTAGAGAAGGAACCAGGGAGAGCAGATGGCTCAATGGGTGTGCAGGAGACC 1440

 39819900 TCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATG 39819959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCACTGAGTTGAGGGAGAGGTTTTTAAAACAGAAGAAGTTTGAGTAATTTAAATGATG 1500

 39819960 GTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACT 39820019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGGGAAGGCGCTAAAAGTGGGAGATAGGTTAAAGATACAGGAAAGTGGGAGGAAGAACT 1560

 39820020 GACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACT 39820079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACAAGTGAGGTTCCAGAGAGGGCAGGAGAAGAGGAGATTCCCTTAGGGGGATTAACACT 1620

 39820080 TTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 39820139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTTTTCTTTTTCTTTCTAAGACAGGGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 1680

 39820140 GCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAG 39820199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCATGATCTTGGCTCACTGTAGTGTAGACTTCCCAGCCTCAAGGGATCCTCCCACCCCAG 1740

 39820200 ACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCT 39820259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTATGCACCACCACCACACCTGGCTAATATTTTTCT 1800

 39820260 TTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCT 39820319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTTTGGTAGACATATAGTCTCACTATGTTGCGCTGACAGGTCTCCAACTCCTGGCCT 1860

 39820320 CAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTG 39820379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAGTGATCCTCCTGCCTAGGCTTCCCAAATTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTG 1920

 39820380 CCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCC 39820439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTGGCCTCTGCTAGTTCTGTATTCTCTAGAGTTGTCTTTACTTTGTGCTAGTGTGTCCC 1980

 39820440 TCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAGATGGA 39820488
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCATTATGCTGATCCTCTGCTAAAATTAATACTTTTTTTTTGAGATGGA 2029

Alignment time is 1.67035 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39810097,39835201] =>     25105 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3528] =>      3528 nucs 'mol-32-33f8-032603_3528'

Score:        3517
Aligned:      3528        nucs
Identic:      3527 (100%) nucs =>      2084 (100%)      1443 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39823818,39825902] EXCISED REGION [39825908,39827350]
 second seq =>  [       1,    2085] EXCISED REGION [    2086,    3528]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [39825903,39825907]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        36 nucs [39825903,39825938] to [39825908,39825943]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39823818 TTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATA 39823877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCTTAAACTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAAACCTGTCTCTATA 60

 39823878 AAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTAC 39823937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAATTAAAAAATAATAATAATAACCAGTGTGGTGTTGTGCACCTAGAGTTCCAACTAC 120

 39823938 TAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCAT 39823997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGGGAAGCTGAGATGAGAGGATGTCTTGAGCTGGGGACTGGGGAGGCTTAGGTTACCAT 180

 39823998 AAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAA 39824057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGTGAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCTTGGACAAAAGAGCCTGATCCTGTCTCAAAA 240

 39824058 AAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTG 39824117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGAGAAAGATACCCAGGGCAAGTTAAGTTCGGAGGGGCACAGAGCTCCCATGCCCTCTG 300

 39824118 TTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACC 39824177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAACATGCGACCCTCCCAGCATCTCCTGTGTCCAGCAACCCTGAAAGTTCTGCAAACC 360

 39824178 CCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTG 39824237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCATTCAGGGTGTTTATGGAGGCTTTATTATGCAAGCAAGATTGATAAAATCTTTGGCTG 420

 39824238 TTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAA 39824297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGGTGATTAAGTCAGTCTCCAGCCCCTCTTCCTCCTGGAGTTCAGTGCATGAGGCTGAA 480

 39824298 AGTTCCAAGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTA 39824357
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTTCCAGGCCTCTTACCATGTGGTTGCATGGTAATCAGCCCTCCTCTTGAAGAAATTTA 540

 39824358 GGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGG 39824417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGCTTGCAGTCACCCAGTCATCTCAACAACATCCCCAAATGCATTCTTACCATGCTGG 600

 39824418 AGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAA 39824477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATCCCAAAGTTCTTAGAGGCTCTTGTGTTAGAAACCTGGGACCAAGACCAAATATTAA 660

 39824478 AACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGT 39824537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACAAAAGATGTTCCTGTCACATCTATCACTGAGGTCTTTGTAAGCTTTAGAAGCTCTGT 720

 39824538 GCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATC 39824597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCAGGAACCAGGGACAGAGATTAAATATATATTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAATC 780

 39824598 TCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCC 39824657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCTGTGTCATCCAGACTGGAGTGCAGTCTTGTGATCATAGCTCACTATAGCTTTGGCC 840

 39824658 TTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACAT 39824717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGAGATCAAGCAATCCTCCCATCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACACATACAT 900

 39824718 GTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGC 39824777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCACCCATGCCCAGCTCATTTTTGTAGAGTCGGAGTTTCACCATGGTGGCCAGGTTGGC 960

 39824778 CATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTGCCCAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCA 39824837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATGTTGGCCAGATGGGGTCTTCTTTTGTTGCCCAGGCTGGCCACAAATTCCTGGGCTCA 1020

 39824838 AGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGATGAGATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATT 39824897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTGATCCTCCCACCTCGTCCTTGTAGAGATGAGATTTAGTTATGTTGTCCAGGCTGATT 1080

 39824898 TCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCACCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAG 39824957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAAACTCCTGGGCTAAATCGATTGTCTCACCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGACTACAG 1140

 39824958 GCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTATTTTTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTC 39825017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCGCATACCACCATGTCGGGCTAATATTTATTTTTATTTTTTTCTAGAGGTGGGGGTCTC 1200

 39825018 ACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCGGGCCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCT 39825077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTATGTTGTTCATGCTAGTTTCAAACTTCGGGCCTCAAGTGTTCCTCCTGCCTTGACCT 1260

 39825078 CCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCACCATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTAT 39825137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCAAAGTGTTGGGATTCTGGGTGGGAGCCACCATGCCCAGCAATCACAAGGGTCTTTAT 1320

 39825138 ATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAATTGGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCA 39825197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAAAAAAAAAAGAGGGTAGGAGATTCAGAATTGGAGCAGGAGATGTGGTGATGAAAGCA 1380

 39825198 GAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGG 39825257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGTAAGAGAGGGAGATTTGAAGATGCTTCACTTCTGGCTTTGAAGATGGAGTCAGGGG 1440

 39825258 CCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAG 39825317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCATGATCCAAGGAATGGGGGTGGCTTCTAGAAGCTGGAAAAGCCAAGGGAACACTTTAG 1500

 39825318 AGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTT 39825377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTCTCCAGAAGGAATGCAGCCATGCTGACACCTTGACTTTAGCCTTAATAGACCTAGTT 1560

 39825378 TGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAAT 39825437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGGTTTCTGGCCCCTAGAACTGTAAGATGGTAGATTTGTGGTGTTTTAAGCCACTAAAT 1620

 39825438 GTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGA 39825497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAGGAAACTGCAAACTATGTTGCAGCAGCAAGAAGAAATGAACATGAAGCCAGGCATGA 1680

 39825498 TGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCA 39825557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGCTCATGCCGGTAATCCCAGCACTTTAGGAATTTAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCA 1740

 39825558 GGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAA 39825617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAATATAGTAAGACCTTGTCTCTACAAAAAATGAAAAAA 1800

 39825618 TTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCA 39825677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCA 1860

 39825678 GATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTA 39825737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATTGCAAAACCCCGGCTCTA 1920

 39825738 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGA 39825797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGA 1980

 39825798 AGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCG 39825857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGGGATCG 2040

 39825858 CACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 39825902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACCATTACACTACAGCCTGGGCAAGAAGAGTGAAACTCTGTCTC 2085

EXCISED REGION

 39825908 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 39825967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATACAAAAAATTTAGCCAGGCATGATG 2145

 39825968 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 39826027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GCATGAATCTGGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGG 2205

 39826028 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 39826087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 AAATTTGAGGTTGCAGTGAGCTGTGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTTCGTGACAGTGA 2265

 39826088 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 39826147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 GATCTTGAAGAAAAGAAAGAAGAAAGTAAAGAAAGAAGAAATGAGCATGGTGGGCATGGG 2325

 39826148 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 39826207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 GACAGATGGCAATGTTAAATAGAATGGTCAGGGGTGGCCTCCTAAGTGAAAATTGAGTAA 2385

 39826208 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 39826267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 AGACTTGAAGGAGGGGAAGGAGCTGGCCAAGGTGCTGAGGGAAGAGGATCATAGGCAGAA 2445

 39826268 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 39826327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 ACAATAGAATAAAATGTCTGAGGTGTGTCTGAGGCTCTGGAAGGAGGCCCATGGAGCAGA 2505

 39826328 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 39826387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 CGGAGAGAGGGAGAGAATTAGGGGAGGGGGCCAGGGAGTTGCTGGGTGGGGATCAGTACA 2565

 39826388 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 39826447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GATCACATAAGCCCTGGGAGGTTATTGCTGGGGCTTTGGCTTTTACTCTGACTCAGATGG 2625

 39826448 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 39826507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 GAACTGCGGGAAGGTTCTGAGCAGAGAGGCGACATGATCTGTCTCCCGATTTAAAAGCAT 2685

 39826508 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 39826567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TCTCTGGCTGCTGAGTTGAGAAAGACTGTGGGAAGATGTGGGTAGAAGCATGGGGGCCAA 2745

 39826568 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 39826627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 GCTTTGGCAACATCCAGGCGGGAGATGATGGTGATCCTGACCAGGGCCATGGTGGTGTTG 2805

 39826628 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 39826687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 AGAGATGGTCAGAGGGGAGAAGTAGGGGAGGAGGCCAGGGAGTTACTGGGTGGGGATCTT 2865

 39826688 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 39826747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TAGTACATGTCGAAGACAGTCAACAGGATTTCCTGACAGACTGGATATGGGGTGTGAGAG 2925

 39826748 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 39826807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 AAGGCAGGGGTCAAGGTTGAGTTTGATTGTTACTAAAATTATTAAGTAATTTTAAAAAAC 2985

 39826808 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 39826867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 ACTACTGCCTTTCCCAATCCTACCAAGTATGGGATGCTAGATTAAAGAAATCTCTTCAGG 3045

 39826868 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATC 39826927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 CTCATTGCAGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGTTTGGTAAGCAGAGGTGGGAGTATC 3105

 39826928 TTTTAAGGGCAAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAA 39826987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 TTTTAAGGGCAAGTGTTCAAGACCAGCCTGGACAACACAGCAAGATCTGCTCTTTACAAA 3165

 39826988 AATATTTTTCAAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAG 39827047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 AATATTTTTCAAAATTAAATAAATGTAGCTAGGCATGGTGATGTGTACTTGTAGTTTCAG 3225

 39827048 CTACTCAGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGG 39827107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 CTACTCAGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCTTGGG 3285

 39827108 CAACATAGCAAGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCA 39827167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 CAACATAGCAAGACCCCTCACTCTACAAAAAAATTAAAAAAATAACCAGGCATGGTGGCA 3345

 39827168 CTCAGCTGTACTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGG 39827227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 CTCAGCTGTACTACCAGCTACTGGGGAGCTGAGGCAGGAAGATGGCTTGAGCCCAGGTGG 3405

 39827228 TCGAGGCTGCAGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGA 39827287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 TCGAGGCTGCAGTGAGCTGTAAGTGCACAGCTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAGGA 3465

 39827288 CCTGTCTCAAATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTT 39827347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 CCTGTCTCAAATACAAATAAACATACAAGTAAAATAATGAAATCTCAAGTCAGAGCCTTT 3525

 39827348 TGG 39827350
          |||
     3526 TGG 3528

Alignment time is 3.28298 s

