
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6995] =>      6995 nucs 'mol-32-1f16-082388_6995'

Score:        6981
Aligned:      6996        nucs
Identic:      6993 (100%) nucs =>      2677 (100%)      4316 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29689415,29692091] EXCISED REGION [29692095,29696413]
 second seq =>  [       3,    2679] EXCISED REGION [    2680,    6995]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094] to [29692095,29692097]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29689415 CTCAAGAGCCATTTCAAGCTGGGCTGCACCAGAAATTGATTGGAATAGGGACTATGAGAA 29689474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        3 CTCAAGAGCCATTTCAAGCTGGGCTGCACCAGAAATTGATTGGAATAGGGACTATGAGAA 62

 29689475 AATAGTCGGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGTGGAGTCTCAAAGCCATTTCAACCTTC 29689534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       63 AATAGTCGGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGTGGAGTCTCAAAGCCATTTCAACCTTC 122

 29689535 CCGCCCCAGCCAGTCGAAGCAGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCCAGGAGCCGGAGATGGA 29689594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      123 CCGCCCCAGCCAGTCGAAGCAGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCCAGGAGCCGGAGATGGA 182

 29689595 GGAGGTGGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTTTGCAGCTTTCCACCCTAGGCGGAGGGAACCT 29689654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      183 GGAGGTGGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTTTGCAGCTTTCCACCCTAGGCGGAGGGAACCT 242

 29689655 GCCAGGGGGCGTGCGGAGGTCCGCAATCTGAGACCGCGAAATGGCTTACAGCTGGACGTG 29689714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 GCCAGGGGGCGTGCGGAGGTCCGCAATCTGAGACCGCGAAATGGCTTACAGCTGGACGTG 302

 29689715 ATTGCCAAGACCCTTCTGGGCTGCTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCTGTGCGCACT 29689774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 ATTGCCAAGACCCTTCTGGGCTGCTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCTGTGCGCACT 362

 29689775 GGGGAGCACATGAGGGGACATGCAGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAACCCTACGCCC 29689834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 GGGGAGCACATGAGGGGACATGCAGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAACCCTACGCCC 422

 29689835 CCCACCCCACATTTCACAGTTGCCATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCAGCGGGTACA 29689894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 CCCACCCCACATTTCACAGTTGCCATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCAGCGGGTACA 482

 29689895 AGTCATTGAGGCCAAGAGGCGAGTCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTCAGCTGGGCT 29689954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 AGTCATTGAGGCCAAGAGGCGAGTCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTCAGCTGGGCT 542

 29689955 GCGCTGGAAATTGACCGGAACAGGAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATGAGAAGTAAG 29690014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 GCGCTGGAAATTGACCGGAACAGGAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATGAGAAGTAAG 602

 29690015 CTCAAAAGCGTAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATTGACCAGAAC 29690074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 CTCAAAAGCGTAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATTGACCAGAAC 662

 29690075 AGGGACTATGAGAAAAGAGTCAGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGAGGCTCAAGA 29690134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 AGGGACTATGAGAAAAGAGTCAGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGAGGCTCAAGA 722

 29690135 GCTGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTC 29690194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 GCTGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTC 782

 29690195 GGGCAAACCAGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTG 29690254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 GGGCAAACCAGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTG 842

 29690255 CCAGAAATTGACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGC 29690314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 CCAGAAATTGACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGC 902

 29690315 AAAAGCAGAGTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCG 29690374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 AAAAGCAGAGTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCG 962

 29690375 CGGGGCCTCCCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCC 29690434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 CGGGGCCTCCCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCC 1022

 29690435 TCTGAAGCTTTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGT 29690494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 TCTGAAGCTTTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGT 1082

 29690495 CTGAGATGGCTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGT 29690554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 CTGAGATGGCTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGT 1142

 29690555 TGATCCATAATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGT 29690614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 TGATCCATAATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGT 1202

 29690615 TCTCCAGCAGGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAG 29690674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TCTCCAGCAGGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAG 1262

 29690675 CCGCATGGCGCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGG 29690734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 CCGCATGGCGCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGG 1322

 29690735 TGTCTAGTAGCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAA 29690794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 TGTCTAGTAGCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAA 1382

 29690795 GCCCCATTAGTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATG 29690854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 GCCCCATTAGTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATG 1442

 29690855 TCACAATAAGGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGA 29690914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 TCACAATAAGGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGA 1502

 29690915 TTAGCTGGCTCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATG 29690974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TTAGCTGGCTCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATG 1562

 29690975 GAGTAAAAAAAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATA 29691034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 GAGTAAAAAAAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATA 1622

 29691035 TTGCCCGATTGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCT 29691094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TTGCCCGATTGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCT 1682

 29691095 TATTTATGCACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTT 29691154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 TATTTATGCACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTT 1742

 29691155 TCTGTACCATAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCC 29691214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TCTGTACCATAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCC 1802

 29691215 TGGCCCTAAGTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTC 29691274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 TGGCCCTAAGTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTC 1862

 29691275 AATTATTGTAATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCA 29691334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 AATTATTGTAATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCA 1922

 29691335 CACTTGAAGTGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGA 29691394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 CACTTGAAGTGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGA 1982

 29691395 TATCTAATTATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAA 29691454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TATCTAATTATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAA 2042

 29691455 GCTGTACTGCCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAAC 29691514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 GCTGTACTGCCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAAC 2102

 29691515 CCTAGAGTTTGGTGAATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGA 29691574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 CCTAGAGTTTGGTGAATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGA 2162

 29691575 ACAAATGCTTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTG 29691634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 ACAAATGCTTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTG 2222

 29691635 AGATTCGAATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGT 29691694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 AGATTCGAATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGT 2282

 29691695 CAGAGGCTGATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGT 29691754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 CAGAGGCTGATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGT 2342

 29691755 AGGCTGAAATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGA 29691814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 AGGCTGAAATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGA 2402

 29691815 GACCAGCCTTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAG 29691874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 GACCAGCCTTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAG 2462

 29691875 GAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACAT 29691934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 GAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACAT 2522

 29691935 AAAATTAATCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACA 29691994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 AAAATTAATCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACA 2582

 29691995 CCAAACAATTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCA 29692054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 CCAAACAATTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCA 2642

 29692055 GCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAG 29692091
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 GCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAG 2679

EXCISED REGION

 29692095 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 29692154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 2739

 29692155 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 29692214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 2799

 29692215 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 29692274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 2859

 29692275 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 29692334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 2919

 29692335 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 29692394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 2979

 29692395 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 29692454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 3039

 29692455 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 29692514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 3099

 29692515 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 29692574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 3159

 29692575 AACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACAT 29692634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 AACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACAT 3219

 29692635 GGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGT 29692694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 GGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGT 3279

 29692695 TTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAA 29692754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 TTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAA 3339

 29692755 ATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTG 29692814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 ATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTG 3399

 29692815 AGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAA 29692874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 AGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAA 3459

 29692875 AAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTG 29692934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 AAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTG 3519

 29692935 GCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGAC 29692994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 GCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGAC 3579

 29692995 TGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATA 29693054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 TGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATA 3639

 29693055 AGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCATCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTG 29693114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 AGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCATCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTG 3699

 29693115 GTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAGACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGC 29693174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 GTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAGACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGC 3759

 29693175 TGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCTTTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCC 29693234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 TGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCTTTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCC 3819

 29693235 AGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGAAATAGGATACAAATATAGTTGAATAGTTGTAT 29693294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 AGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGAAATAGGATACAAATATAGTTGAATAGTTGTAT 3879

 29693295 ATTTTAAAATTAATGAAGCCTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATT 29693354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 ATTTTAAAATTAATGAAGCCTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATT 3939

 29693355 CTTCAACCTTTTAAAAATTATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGG 29693414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 CTTCAACCTTTTAAAAATTATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGG 3999

 29693415 GCCATACTTTGCCTATCCTGGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAA 29693474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 GCCATACTTTGCCTATCCTGGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAA 4059

 29693475 GCCCAGGACAGTTAGTAACATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACA 29693534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 GCCCAGGACAGTTAGTAACATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACA 4119

 29693535 TTGCAATTTTTTAATTTTTAAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCAT 29693594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 TTGCAATTTTTTAATTTTTAAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCAT 4179

 29693595 TTATTTTGTTAGCCAAGTGGAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTT 29693654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 TTATTTTGTTAGCCAAGTGGAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTT 4239

 29693655 ATAAGATGACTTGCCAAGTATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCA 29693714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 ATAAGATGACTTGCCAAGTATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCA 4299

 29693715 GAAGGGAGGTGGGACTTCTGGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAA 29693774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 GAAGGGAGGTGGGACTTCTGGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAA 4359

 29693775 AATACTTGGAAAATTATCAAAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTT 29693834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 AATACTTGGAAAATTATCAAAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTT 4419

 29693835 ACAACAATCTAAAGGGCATTAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACAGCAAA 29693894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 ACAACAATCTAAAGGGCATTAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACAGCAAA 4479

 29693895 GTTTGTGGTGCTTTAACTTGTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCC 29693954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 GTTTGTGGTGCTTTAACTTGTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCC 4539

 29693955 TTGAAAACAAGCAATTCCCCAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAA 29694014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 TTGAAAACAAGCAATTCCCCAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAA 4599

 29694015 AAGCTCCATACCCAGAGCAGTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGG 29694074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 AAGCTCCATACCCAGAGCAGTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGG 4659

 29694075 GTGCTGGCACAGGTGACTCCAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTCTGG 29694134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 GTGCTGGCACAGGTGACTCCAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTCTGG 4719

 29694135 GCGCTTGCAAAGAGCTTGCAATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATG 29694194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 GCGCTTGCAAAGAGCTTGCAATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATG 4779

 29694195 TGCCGCTGAGGAAGTGATTGCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACTGATCT 29694254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 TGCCGCTGAGGAAGTGATTGCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACTGATCT 4839

 29694255 AGAGTGGCTCCTCTTGGTTAGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAA 29694314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 AGAGTGGCTCCTCTTGGTTAGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAA 4899

 29694315 AAATTTCATATAAAGGAATAGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTA 29694374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 AAATTTCATATAAAGGAATAGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTA 4959

 29694375 TAATTCCATCACTCTTATCAATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTT 29694434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 TAATTCCATCACTCTTATCAATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTT 5019

 29694435 GCTTGTCAAGCCCCGCTGCAGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTCCTGGA 29694494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 GCTTGTCAAGCCCCGCTGCAGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTCCTGGA 5079

 29694495 TTTTTTCCTATGCTCATAGAGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTT 29694554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 TTTTTTCCTATGCTCATAGAGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTT 5139

 29694555 TCTAGACATGTAAAATAATACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGC 29694614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 TCTAGACATGTAAAATAATACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGC 5199

 29694615 AGCTTTTAATAACTTTTCTTTTTTTCTTTATTCCAGCCGTCTTTGTGGCAATTTTACATT 29694674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 AGCTTTTAATAACTTTTCTTTTTTTCTTTATTCCAGCCGTCTTTGTGGCAATTTTACATT 5259

 29694675 GGTAAGATTTAGTTTCAGTTTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCAC 29694734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 GGTAAGATTTAGTTTCAGTTTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCAC 5319

 29694735 TCTTTGCATACAGTAAAACAGCTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAA 29694794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 TCTTTGCATACAGTAAAACAGCTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAA 5379

 29694795 TTTATACGTATACTTTGCTTTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAG 29694854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 TTTATACGTATACTTTGCTTTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAG 5439

 29694855 ATGCATTAGGGGAATAGTAACTTGTGAATTAAAATCGTTTTGCTACCAAATAATTCACTA 29694914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 ATGCATTAGGGGAATAGTAACTTGTGAATTAAAATCGTTTTGCTACCAAATAATTCACTA 5499

 29694915 CACGTTTCTTTAAATATCTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAAC 29694974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 CACGTTTCTTTAAATATCTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAAC 5559

 29694975 CCTCCTTTATTTTATGGTAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTT 29695034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 CCTCCTTTATTTTATGGTAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTT 5619

 29695035 TTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCAC 29695094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 TTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCAC 5679

 29695095 TGCCTCCCAGGCTGAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGT 29695154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 TGCCTCCCAGGCTGAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGT 5739

 29695155 GTGCACCATCACACCCAGCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGT 29695214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 GTGCACCATCACACCCAGCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGT 5799

 29695215 TGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAG 29695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 TGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAG 5859

 29695275 TGTTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCT 29695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 TGTTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCT 5919

 29695335 AGGCGCGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCGGATCAC 29695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 AGGCGCGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCGGATCAC 5979

 29695395 AAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTACTAAAAAT 29695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 AAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTACTAAAAAT 6039

 29695455 ACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGGGCTGAA 29695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 ACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGGGCTGAA 6099

 29695515 GCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGCGCCACTG 29695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 GCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGCGCCACTG 6159

 29695575 CACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGACTCCGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAC 29695634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||
     6160 CACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGACTCCGTCCC---AAAAAAAAAAAAAAAAAATAC 6216

 29695635 TTTGGTCATAAAATTTTAGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGAAGACAAA 29695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6217 TTTGGTCATAAAATTTTAGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGAAGACAAA 6276

 29695695 GATTCTGCAGTGGTTATACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAAGCCTGTG 29695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6277 GATTCTGCAGTGGTTATACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAAGCCTGTG 6336

 29695755 TACATTATTTTACAAAAGTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCTGGAATAT 29695814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6337 TACATTATTTTACAAAAGTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCTGGAATAT 6396

 29695815 TTTATTTTTACCTGTGCTCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATGTGCCCCTATG 29695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6397 TTTATTTTTACCTGTGCTCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATGTGCCCCTATG 6456

 29695875 TTCTGTTGACACAGTGCTGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTCGATATTAGAAC 29695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6457 TTCTGTTGACACAGTGCTGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTCGATATTAGAAC 6516

 29695935 TGAGGCTGCAATGGTAGGGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATGGCCTACA 29695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6517 TGAGGCTGCAATGGTAGGGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATGGCCTACA 6576

 29695995 TGTAAAGAACGGTTAGTGGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATTTTCAACT 29696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6577 TGTAAAGAACGGTTAGTGGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATTTTCAACT 6636

 29696055 TCACTGGAAAGTACTGACTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACAGCTAATT 29696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6637 TCACTGGAAAGTACTGACTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACAGCTAATT 6696

 29696115 TTGTTTATCACATATGCTCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACTACTAAAA 29696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6697 TTGTTTATCACATATGCTCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACTACTAAAA 6756

 29696175 GGTCTTCAAGTACACACCTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATGTGATATT 29696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6757 GGTCTTCAAGTACACACCTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATGTGATATT 6816

 29696235 ATACTTATTGTAAGTCTGCTTTGATCTAAAGTAATTTTATTTAAAATTATATTCGGAACC 29696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6817 ATACTTATTGTAAGTCTGCTTTGATCTAAAGTAATTTTATTTAAAATTATATTCGGAACC 6876

 29696295 CTTTTCAACAGTTATGGAGGTATTTCCCAAGGCCGGTACACTAGAATCACTTGAAACTTA 29696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6877 CTTTTCAACAGTTATGGAGGTATTTCCCAAGGCCGGTACACTAGAATCACTTGAAACTTA 6936

 29696355 AAAAACAAACAATAACCTGCCTCTGTTCTGATTTTGAGGCCTGGGACGGAAGGGAGCGT 29696413
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6937 AAAAACAAACAATAACCTGCCTCTGTTCTGATTTTGAGGCCTGGGACGGAAGGGAGCGT 6995

Alignment time is 6.57356 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4045] =>      4045 nucs 'mol-32-1f21-047812_4045'

Score:        3880
Aligned:      4045        nucs
Identic:      4030 (100%) nucs =>      2540 (100%)      1490 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685906,29688451] EXCISED REGION [29690144,29691641]
 second seq =>  [       1,    2546] EXCISED REGION [    2547,    4045]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29685906 CCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAG 29685965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAG 60

 29685966 CTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACA 29686025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACA 120

 29686026 GTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCAT 29686085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCAT 180

 29686086 TAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAA 29686145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAA 240

 29686146 GCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCT 29686205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCT 300

 29686206 TTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGG 29686265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGG 360

 29686266 CCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAA 29686325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAA 420

 29686326 TGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTC 29686385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTC 480

 29686386 CTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTC 29686445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTC 540

 29686446 ACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAG 29686505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAG 600

 29686506 CCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGT 29686565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGT 660

 29686566 ACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATA 29686625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATA 720

 29686626 TATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGAT 29686685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGAT 780

 29686686 TACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGC 29686745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGC 840

 29686746 AAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCA 29686805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCA 900

 29686806 CCCTAGAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACT 29686865
          ||.|||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTTAGAAACAAATTCTCCAGCTTCAGTACATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACT 960

 29686866 ATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGA 29686925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGA 1020

 29686926 ATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGT 29686985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGT 1080

 29686986 AATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTC 29687045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTC 1140

 29687046 TGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAA 29687105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAA 1200

 29687106 AATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAG 29687165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAG 1260

 29687166 CCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACT 29687225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACT 1320

 29687226 GCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAA 29687285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAA 1380

 29687286 TTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTT 29687345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTT 1440

 29687346 ATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACA 29687405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACA 1500

 29687406 TTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTG 29687465
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTG 1560

 29687466 TTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCC 29687525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCC 1620

 29687526 CTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCT 29687585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCT 1680

 29687586 GCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCA 29687645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCA 1740

 29687646 CACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTC 29687705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTC 1800

 29687706 TGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAG 29687765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAG 1860

 29687766 TATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGT 29687825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGT 1920

 29687826 TCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCC 29687885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCC 1980

 29687886 CACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATT 29687945
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1981 CACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATT 2040

 29687946 TGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCT 29688005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCT 2100

 29688006 AACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAA 29688065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAA 2160

 29688066 GAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTG 29688125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTG 2220

 29688126 CTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGC 29688185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGC 2280

 29688186 CTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGC 29688245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGC 2340

 29688246 ACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACAC 29688305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACAC 2400

 29688306 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGA 29688365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGA 2460

 29688366 GACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGG 29688425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGG 2520

 29688426 GCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          ||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 2546

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 2606

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 2666

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 2726

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 2786

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 2846

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 2906

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 2966

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 3026

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3027 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 3086

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 3146

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 3206

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 3266

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 3326

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 3386

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 3446

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3447 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 3506

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 3566

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3567 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 3626

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 3686

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 3746

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 3806

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3807 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 3866

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 3926

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 3986

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCG 29691641
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCG 4045

Alignment time is 4.43403 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5513] =>      5513 nucs 'mol-32-1f58-242630_5513'

Score:        5282
Aligned:      5513        nucs
Identic:      5492 (100%) nucs =>      3258 (100%)      2234 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685185,29688451] EXCISED REGION [29690144,29692388]
 second seq =>  [       1,    3267] EXCISED REGION [    3268,    5513]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29685185 CAGGACTCTGTCCTCCAGCATCCTGGAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCA 29685244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGACTCTGTCCTCCAGCATCCTGGAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCA 60

 29685245 TGGCCATTTCCCTCCCAGAAAGACAGAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGA 29685304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCCATTTCCCTCCCAGAAAGACAGAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGA 120

 29685305 TTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGGCCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAG 29685364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGGCCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAG 180

 29685365 AAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGGAACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGC 29685424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGGAACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGC 240

 29685425 CGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCGAGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGG 29685484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCGAGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGG 300

 29685485 GCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAAGTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCA 29685544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAAGTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCA 360

 29685545 GGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCGAGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCG 29685604
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCCAGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCG 420

 29685605 AAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTATACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTG 29685664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTATACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTG 480

 29685665 AAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGA 29685724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGA 540

 29685725 TAGTTACAGAAAAATACACAGTTCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAA 29685784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTTACAGAAAAATACACAGTTCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAA 600

 29685785 TGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACTGAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCC 29685844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      601 TGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACTGAGCACGTCCCCAGGAGTTGCTGGTACAGCTTGCC 660

 29685845 TCAATATCTTATCAGTAAGTGCATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTAT 29685904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAATATCTTATCAGTAAGTGCATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTAT 720

 29685905 TCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCA 29685964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCA 780

 29685965 GCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGAC 29686024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGAC 840

 29686025 AGTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCA 29686084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCA 900

 29686085 TTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTA 29686144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTA 960

 29686145 AGCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGC 29686204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGC 1020

 29686205 TTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAG 29686264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAG 1080

 29686265 GCCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGA 29686324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGA 1140

 29686325 ATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCT 29686384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCT 1200

 29686385 CCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTT 29686444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTT 1260

 29686445 CACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAA 29686504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAA 1320

 29686505 GCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATG 29686564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATG 1380

 29686565 TACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGAT 29686624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGAT 1440

 29686625 ATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGA 29686684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGA 1500

 29686685 TTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAG 29686744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAG 1560

 29686745 CAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTC 29686804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTC 1620

 29686805 ACCCTAGAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCAC 29686864
          |||.|||||.||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCTTAGAAACAAATTCTCCAGCTTCAGTACATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCAC 1680

 29686865 TATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTG 29686924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTG 1740

 29686925 AATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAG 29686984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAG 1800

 29686985 TAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCT 29687044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCT 1860

 29687045 CTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATA 29687104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATA 1920

 29687105 AAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCA 29687164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCA 1980

 29687165 GCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATAC 29687224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATAC 2040

 29687225 TGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAA 29687284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAA 2100

 29687285 ATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACT 29687344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACT 2160

 29687345 TATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCAC 29687404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCAC 2220

 29687405 ATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCT 29687464
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCT 2280

 29687465 GTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTC 29687524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTC 2340

 29687525 CCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTC 29687584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTC 2400

 29687585 TGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTC 29687644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTC 2460

 29687645 ACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACT 29687704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACT 2520

 29687705 CTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATA 29687764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATA 2580

 29687765 GTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATG 29687824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATG 2640

 29687825 TTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATC 29687884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATC 2700

 29687885 CCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCAT 29687944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2701 CCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCAT 2760

 29687945 TTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTC 29688004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTC 2820

 29688005 TAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTA 29688064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTA 2880

 29688065 AGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTT 29688124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2881 AGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCCT 2940

 29688125 GCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTG 29688184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTG 3000

 29688185 CCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAG 29688244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAG 3060

 29688245 CACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACA 29688304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACA 3120

 29688305 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTG 29688364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTG 3180

 29688365 AGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACG 29688424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACG 3240

 29688425 GGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          |||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 3267

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 3327

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 3387

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 3447

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 3507

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 3567

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 3627

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 3687

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 3747

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3748 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 3807

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 3867

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 3927

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 3987

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 4047

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 4107

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 4167

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4168 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 4227

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 4287

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4288 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 4347

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 4407

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 4467

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 4527

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4528 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 4587

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 4647

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 4707

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 4767

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 4827

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 4887

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4888 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGCTGATTGAGACCAGCC 4947

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 5007

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 5067

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5068 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 5127

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 29692062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 5187

 29692063 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 29692122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 5247

 29692123 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 29692182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 5307

 29692183 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 29692242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 5367

 29692243 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 29692302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 5427

 29692303 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 29692362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 5487

 29692363 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTA 29692388
          ||||||||||||||||||||||||||
     5488 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTA 5513

Alignment time is 5.30849 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2246] =>      2246 nucs 'mol-32-1f58-242630_2246'

Score:        2130
Aligned:      2240        nucs
Identic:      2230 (100%) nucs =>      1395 (100%)       835 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29690144,29691544] EXCISED REGION [29691551,29692388]
 second seq =>  [       1,    1402] EXCISED REGION [    1409,    2246]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [29691545,29691550]
 second seq =>         6 nucs [1403,1408]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29691545,29691547] to [29691551,29691553]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29691544,29691544] to [29691551,29691551]
 second seq =>         1 nucs [1402,1402] to [1409,1409]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 60

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 120

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 180

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 240

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 300

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 360

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 420

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 480

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      481 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 540

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 600

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 660

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 720

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 780

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 840

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 900

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      901 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 960

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 1020

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1021 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 1080

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 1140

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 1200

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 1260

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1261 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 1320

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 1380

 29691524 TGGTGAA-TAATGCGTGACTAT 29691544
          ||||||| ||||||||||||||
     1381 TGGTGAAATAATGCGTGACTAT 1402

EXCISED REGION

 29691551 TGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATC 29691610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 TGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATC 1468

 29691611 AGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATA 29691670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 AGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATA 1528

 29691671 TGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGG 29691730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGG 1588

 29691731 AGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGG 29691790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 AGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGG 1648

 29691791 AAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGT 29691850
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 AAATAAGTTGAGAAGGCTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGT 1708

 29691851 AAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTT 29691910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1709 AAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTT 1768

 29691911 TAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCA 29691970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 TAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCA 1828

 29691971 TATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAG 29692030
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1829 TATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGATTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAG 1888

 29692031 TGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAA 29692090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAA 1948

 29692091 GAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCAC 29692150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 GAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCAC 2008

 29692151 AGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGAT 29692210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 AGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGAT 2068

 29692211 GGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGA 29692270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 GGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGA 2128

 29692271 ATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAA 29692330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 ATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAA 2188

 29692331 ACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTA 29692388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 ACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTA 2246

Alignment time is 2.17175 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2691] =>      2691 nucs 'mol-32-208c-047464_2691'

Score:        2691
Aligned:      2691        nucs
Identic:      2691 (100%) nucs =>      2176 (100%)       515 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29686391,29688566] EXCISED REGION [29688568,29689082]
 second seq =>  [       1,    2176] EXCISED REGION [    2177,    2691]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [29688567,29688567]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [29688567,29688583] to [29688568,29688584]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29686391 TTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCC 29686450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCC 60

 29686451 TCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCC 29686510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCC 120

 29686511 CATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATC 29686570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATC 180

 29686571 CTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGG 29686630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGG 240

 29686631 GAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTA 29686690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTA 300

 29686691 AGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGA 29686750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGA 360

 29686751 ACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTA 29686810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTA 420

 29686811 GAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTT 29686870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTT 480

 29686871 ATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCC 29686930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCC 540

 29686931 TGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTT 29686990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTT 600

 29686991 GCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGG 29687050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGG 660

 29687051 TTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCT 29687110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCT 720

 29687111 AAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCA 29687170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCA 780

 29687171 TCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACC 29687230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACC 840

 29687231 TTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGA 29687290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGA 900

 29687291 ATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACT 29687350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACT 960

 29687351 AAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAA 29687410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAA 1020

 29687411 TAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCAC 29687470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCAC 1080

 29687471 TTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCC 29687530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCC 1140

 29687531 CTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACA 29687590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACA 1200

 29687591 ACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCT 29687650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCT 1260

 29687651 CTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGC 29687710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGC 1320

 29687711 TTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATAT 29687770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATAT 1380

 29687771 TCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGC 29687830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGC 1440

 29687831 ATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTT 29687890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTT 1500

 29687891 TTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAA 29687950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAA 1560

 29687951 ATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAA 29688010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAA 1620

 29688011 GCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACT 29688070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACT 1680

 29688071 GACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCC 29688130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCC 1740

 29688131 TGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCT 29688190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCT 1800

 29688191 TCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCAT 29688250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCAT 1860

 29688251 ATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTA 29688310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTA 1920

 29688311 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCA 29688370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCA 1980

 29688371 GCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATG 29688430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATG 2040

 29688431 GTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAATC 29688490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAATC 2100

 29688491 TGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGTGCCGAGATCGCGCCACTGCACCCCAGCTTGGATGTCAG 29688550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGTGCCGAGATCGCGCCACTGCACCCCAGCTTGGATGTCAG 2160

 29688551 AGTGAGACCCCATCTC 29688566
          ||||||||||||||||
     2161 AGTGAGACCCCATCTC 2176

EXCISED REGION

 29688568 AAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGTTACAGCATGTGCCTTAGAAATATAAGCCAAGAGAGCAC 29688627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 AAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGTTACAGCATGTGCCTTAGAAATATAAGCCAAGAGAGCAC 2236

 29688628 TGTGGTTAATACTGCGAGTTCTAGAGTAAAATTCCCTGGGCTTAGATCCCAACTCTACTG 29688687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 TGTGGTTAATACTGCGAGTTCTAGAGTAAAATTCCCTGGGCTTAGATCCCAACTCTACTG 2296

 29688688 TTTATTAGCTGTATAGTTTTGCATGAGGCCCTGAGACTTAAGATTCTTCATTGGAGAATG 29688747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 TTTATTAGCTGTATAGTTTTGCATGAGGCCCTGAGACTTAAGATTCTTCATTGGAGAATG 2356

 29688748 GAAACGCAGCATCTGGAACATAGCATGTACTCAGTAAATGTCAGCTGTCACCACTGTCAT 29688807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 GAAACGCAGCATCTGGAACATAGCATGTACTCAGTAAATGTCAGCTGTCACCACTGTCAT 2416

 29688808 TGCCAATCCACTCAGGCCATAGGCAGGTATGTGTGGGCCTGGCAAAAGAAGTTAAGACGA 29688867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 TGCCAATCCACTCAGGCCATAGGCAGGTATGTGTGGGCCTGGCAAAAGAAGTTAAGACGA 2476

 29688868 GGCTGCAGGCCCTGGGGAGCACGTGGAGAGGCTGCATTGAGCTGCGCGCTGTGGGGGCTG 29688927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 GGCTGCAGGCCCTGGGGAGCACGTGGAGAGGCTGCATTGAGCTGCGCGCTGTGGGGGCTG 2536

 29688928 CACGCCCAGTGAAGCGCGTGAAGAGCGAGTAGTGATGGGTTCTGCGCCACTGGGGCTGTG 29688987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 CACGCCCAGTGAAGCGCGTGAAGAGCGAGTAGTGATGGGTTCTGCGCCACTGGGGCTGTG 2596

 29688988 AACGTATGAGGGGCTGTACATGGAGCTGTGTGCAAGGTGGGGGCTGCACGTGCGGGCTTG 29689047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 AACGTATGAGGGGCTGTACATGGAGCTGTGTGCAAGGTGGGGGCTGCACGTGCGGGCTTG 2656

 29689048 GGGACTGCGTGCACCAGGGGCTGCAGGCGCTGGGG 29689082
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 GGGACTGCGTGCACCAGGGGCTGCAGGCGCTGGGG 2691

Alignment time is 2.57172 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3981] =>      3981 nucs 'mol-32-2110-071332_3981'

Score:        3970
Aligned:      3981        nucs
Identic:      3980 (100%) nucs =>      3494 (100%)       486 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29688598,29692091] EXCISED REGION [29692095,29692581]
 second seq =>  [       1,    3494] EXCISED REGION [    3495,    3981]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094] to [29692095,29692097]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29688598 GTGCCTTAGAAATATAAGCCAAGAGAGCACTGTGGTTAATACTGCGAGTTCTAGAGTAAA 29688657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCCTTAGAAATATAAGCCAAGAGAGCACTGTGGTTAATACTGCGAGTTCTAGAGTAAA 60

 29688658 ATTCCCTGGGCTTAGATCCCAACTCTACTGTTTATTAGCTGTATAGTTTTGCATGAGGCC 29688717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTCCCTGGGCTTAGATCCCAACTCTACTGTTTATTAGCTGTATAGTTTTGCATGAGGCC 120

 29688718 CTGAGACTTAAGATTCTTCATTGGAGAATGGAAACGCAGCATCTGGAACATAGCATGTAC 29688777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAGACTTAAGATTCTTCATTGGAGAATGGAAACGCAGCATCTGGAACATAGCATGTAC 180

 29688778 TCAGTAAATGTCAGCTGTCACCACTGTCATTGCCAATCCACTCAGGCCATAGGCAGGTAT 29688837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGTAAATGTCAGCTGTCACCACTGTCATTGCCAATCCACTCAGGCCATAGGCAGGTAT 240

 29688838 GTGTGGGCCTGGCAAAAGAAGTTAAGACGAGGCTGCAGGCCCTGGGGAGCACGTGGAGAG 29688897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTGGGCCTGGCAAAAGAAGTTAAGACGAGGCTGCAGGCCCTGGGGAGCACGTGGAGAG 300

 29688898 GCTGCATTGAGCTGCGCGCTGTGGGGGCTGCACGCCCAGTGAAGCGCGTGAAGAGCGAGT 29688957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGCATTGAGCTGCGCGCTGTGGGGGCTGCACGCCCAGTGAAGCGCGTGAAGAGCGAGT 360

 29688958 AGTGATGGGTTCTGCGCCACTGGGGCTGTGAACGTATGAGGGGCTGTACATGGAGCTGTG 29689017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGATGGGTTCTGCGCCACTGGGGCTGTGAACGTATGAGGGGCTGTACATGGAGCTGTG 420

 29689018 TGCAAGGTGGGGGCTGCACGTGCGGGCTTGGGGACTGCGTGCACCAGGGGCTGCAGGCGC 29689077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAAGGTGGGGGCTGCACGTGCGGGCTTGGGGACTGCGTGCACCAGGGGCTGCAGGCGC 480

 29689078 TGGGGAGGGTGTGGGGGGCTGTGCGTGGGGCTGCCCTCACCAAAGGCTGCACGCTCAGGG 29689137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGGAGGGTGTGGGGGGCTGTGCGTGGGGCTGCCCTCACCAAAGGCTGCACGCTCAGGG 540

 29689138 AAGCGTGGAGGCGGGGGTGCCGCGTGCACTGGGGAGCACGTGAGGGGACATGCAGGGACT 29689197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGCGTGGAGGCGGGGGTGCCGCGTGCACTGGGGAGCACGTGAGGGGACATGCAGGGACT 600

 29689198 GCCCGTGTGAACGGCTTCAACCGCATGCCCCCCACCCCACAGTCGCCAAGAAGACTGGGA 29689257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCCGTGTGAACGGCTTCAACCGCATGCCCCCCACCCCACAGTCGCCAAGAAGACTGGGA 660

 29689258 GGTCCGCATCGGCGGTGGGTACAAGTCATTCAGGCTGCGAGGCGAGTCAGGCCTTTCCAG 29689317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTCCGCATCGGCGGTGGGTACAAGTCATTCAGGCTGCGAGGCGAGTCAGGCCTTTCCAG 720

 29689318 ACCTCGCCGGACTGGGCTGGGCTGCGCCGGAAATTGACCGGAACAGGGACTATGAGAAAA 29689377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCTCGCCGGACTGGGCTGGGCTGCGCCGGAAATTGACCGGAACAGGGACTATGAGAAAA 780

 29689378 TAGTTGAGCAATCGAGGAGTCAGCTGAAAAGCGGAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGCTGGG 29689437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGTTGAGCAATCGAGGAGTCAGCTGAAAAGCGGAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGCTGGG 840

 29689438 CTGCACCAGAAATTGATTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAAGGAGGAGTA 29689497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCACCAGAAATTGATTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAAGGAGGAGTA 900

 29689498 AGCTCAAAAGTGGAGTCTCAAAGCCATTTCAACCTTCCCGCCCCAGCCAGTCGAAGCAGT 29689557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTCAAAAGTGGAGTCTCAAAGCCATTTCAACCTTCCCGCCCCAGCCAGTCGAAGCAGT 960

 29689558 GGCGCGGGGCCTCCCAAGCCCAGGAGCCGGAGATGGAGGAGGTGGTGGAAGAGTTGGGGC 29689617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCGCGGGGCCTCCCAAGCCCAGGAGCCGGAGATGGAGGAGGTGGTGGAAGAGTTGGGGC 1020

 29689618 TGCCTTTGCAGCTTTCCACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGCGTGCGGAGGTCCG 29689677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCCTTTGCAGCTTTCCACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGCGTGCGGAGGTCCG 1080

 29689678 CAATCTGAGACCGCGAAATGGCTTACAGCTGGACGTGATTGCCAAGACCCTTCTGGGCTG 29689737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATCTGAGACCGCGAAATGGCTTACAGCTGGACGTGATTGCCAAGACCCTTCTGGGCTG 1140

 29689738 CTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCTGTGCGCACTGGGGAGCACATGAGGGGACATGC 29689797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCTGTGCGCACTGGGGAGCACATGAGGGGACATGC 1200

 29689798 AGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAACCCTACGCCCCCCACCCCACATTTCACAGTTGC 29689857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAACCCTACGCCCCCCACCCCACATTTCACAGTTGC 1260

 29689858 CATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCAGCGGGTACAAGTCATTGAGGCCAAGAGGCGAG 29689917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCAGCGGGTACAAGTCATTGAGGCCAAGAGGCGAG 1320

 29689918 TCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTCAGCTGGGCTGCGCTGGAAATTGACCGGAACAG 29689977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTCAGCTGGGCTGCGCTGGAAATTGACCGGAACAG 1380

 29689978 GAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATGAGAAGTAAGCTCAAAAGCGTAGGCTCAAGAGC 29690037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATGAGAAGTAAGCTCAAAAGCGTAGGCTCAAGAGC 1440

 29690038 CATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATTGACCAGAACAGGGACTATGAGAAAAGAGTCAG 29690097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATTGACCAGAACAGGGACTATGAGAAAAGAGTCAG 1500

 29690098 GCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGAGGCTCAAGAGCTGTTTCAAGCTGGGCTGTGCC 29690157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGAGGCTCAAGAGCTGTTTCAAGCTGGGCTGTGCC 1560

 29690158 GGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTAAGCTCAA 29690217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTAAGCTCAA 1620

 29690218 AATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGAATAGGGA 29690277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGAATAGGGA 1680

 29690278 CTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAAGAGCCGT 29690337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAAGAGCCGT 1740

 29690338 TTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCTGGGAGC 29690397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCTGGGAGC 1800

 29690398 CAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACCCTAGGCG 29690457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACCCTAGGCG 1860

 29690458 GAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATAGCTGGAT 29690517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATAGCTGGAT 1920

 29690518 GTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCTGGTGCAG 29690577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCTGGTGCAG 1980

 29690578 CTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCACTCTCGGC 29690637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCACTCTCGGC 2040

 29690638 ATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTCTTGAGTC 29690697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTCTTGAGTC 2100

 29690698 TTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATAATAGCAA 29690757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATAATAGCAA 2160

 29690758 GGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTGTTTTAAA 29690817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTGTTTTAAA 2220

 29690818 ACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAAGGATATGTTATCTG 29690877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAAGGATATGTTATCTG 2280

 29690878 AATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGGGAACAGA 29690937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGGGAACAGA 2340

 29690938 CATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTAGTTGAGA 29690997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTAGTTGAGA 2400

 29690998 ACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGATTGACTTCCATCTTG 29691057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGATTGACTTCCATCTTG 2460

 29691058 CTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGCACTTGAAGGGTTTT 29691117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGCACTTGAAGGGTTTT 2520

 29691118 TCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGGGAGCTTA 29691177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGGGAGCTTA 2580

 29691178 AATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGACTGGCTGC 29691237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGACTGGCTGC 2640

 29691238 TGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGTAATTTTCTCACTGT 29691297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGTAATTTTCTCACTGT 2700

 29691298 AAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAACAGTACTT 29691357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAACAGTACTT 2760

 29691358 GAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATTATGCCAGTGAACAC 29691417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATTATGCCAGTGAACAC 2820

 29691418 ATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCCCAACACA 29691477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCCCAACACA 2880

 29691478 AGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAATAATGCG 29691537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAATAATGCG 2940

 29691538 TGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAAT 29691597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAAT 3000

 29691598 GGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGGC 29691657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGGC 3060

 29691658 TTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATGA 29691717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATGA 3120

 29691718 TCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAGA 29691777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAGA 3180

 29691778 AAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAATT 29691837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAATT 3240

 29691838 CAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTA 29691897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTA 3300

 29691898 AAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGAA 29691957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGAA 3360

 29691958 CAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAGAGTG 29692017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAGAGTG 3420

 29692018 ACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGA 29692077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGA 3480

 29692078 AAGGAAGCAGAAAG 29692091
          ||||||||||||||
     3481 AAGGAAGCAGAAAG 3494

EXCISED REGION

 29692095 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 29692154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 3554

 29692155 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 29692214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 3614

 29692215 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 29692274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 3674

 29692275 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 29692334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 3734

 29692335 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 29692394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 3794

 29692395 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 29692454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 3854

 29692455 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 29692514
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 TGGTGTGATGAAGGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 3914

 29692515 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 29692574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 3974

 29692575 AACTTAG 29692581
          |||||||
     3975 AACTTAG 3981

Alignment time is 3.91541 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3795] =>      3795 nucs 'mol-32-238e-037229_3795'

Score:        3795
Aligned:      3795        nucs
Identic:      3795 (100%) nucs =>      2806 (100%)       989 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29689286,29692091] EXCISED REGION [29692095,29693083]
 second seq =>  [       1,    2806] EXCISED REGION [    2807,    3795]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094] to [29692095,29692097]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29689286 TTCAGGCTGCGAGGCGAGTCAGGCCTTTCCAGACCTCGCCGGACTGGGCTGGGCTGCGCC 29689345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCAGGCTGCGAGGCGAGTCAGGCCTTTCCAGACCTCGCCGGACTGGGCTGGGCTGCGCC 60

 29689346 GGAAATTGACCGGAACAGGGACTATGAGAAAATAGTTGAGCAATCGAGGAGTCAGCTGAA 29689405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAATTGACCGGAACAGGGACTATGAGAAAATAGTTGAGCAATCGAGGAGTCAGCTGAA 120

 29689406 AAGCGGAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGCTGGGCTGCACCAGAAATTGATTGGAATAGGGA 29689465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGCGGAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGCTGGGCTGCACCAGAAATTGATTGGAATAGGGA 180

 29689466 CTATGAGAAAATAGTCGGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGTGGAGTCTCAAAGCCATT 29689525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATGAGAAAATAGTCGGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGTGGAGTCTCAAAGCCATT 240

 29689526 TCAACCTTCCCGCCCCAGCCAGTCGAAGCAGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCCAGGAGCC 29689585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAACCTTCCCGCCCCAGCCAGTCGAAGCAGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCCAGGAGCC 300

 29689586 GGAGATGGAGGAGGTGGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTTTGCAGCTTTCCACCCTAGGCGG 29689645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAGATGGAGGAGGTGGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTTTGCAGCTTTCCACCCTAGGCGG 360

 29689646 AGGGAACCTGCCAGGGGGCGTGCGGAGGTCCGCAATCTGAGACCGCGAAATGGCTTACAG 29689705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGGAACCTGCCAGGGGGCGTGCGGAGGTCCGCAATCTGAGACCGCGAAATGGCTTACAG 420

 29689706 CTGGACGTGATTGCCAAGACCCTTCTGGGCTGCTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCT 29689765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGACGTGATTGCCAAGACCCTTCTGGGCTGCTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCT 480

 29689766 GTGCGCACTGGGGAGCACATGAGGGGACATGCAGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAAC 29689825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGCGCACTGGGGAGCACATGAGGGGACATGCAGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAAC 540

 29689826 CCTACGCCCCCCACCCCACATTTCACAGTTGCCATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCA 29689885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTACGCCCCCCACCCCACATTTCACAGTTGCCATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCA 600

 29689886 GCGGGTACAAGTCATTGAGGCCAAGAGGCGAGTCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTC 29689945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCGGGTACAAGTCATTGAGGCCAAGAGGCGAGTCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTC 660

 29689946 AGCTGGGCTGCGCTGGAAATTGACCGGAACAGGAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATG 29690005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCTGGGCTGCGCTGGAAATTGACCGGAACAGGAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATG 720

 29690006 AGAAGTAAGCTCAAAAGCGTAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATT 29690065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAGTAAGCTCAAAAGCGTAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATT 780

 29690066 GACCAGAACAGGGACTATGAGAAAAGAGTCAGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGA 29690125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACCAGAACAGGGACTATGAGAAAAGAGTCAGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGA 840

 29690126 GGCTCAAGAGCTGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAG 29690185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTCAAGAGCTGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAG 900

 29690186 AAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGC 29690245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGC 960

 29690246 TGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGC 29690305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGC 1020

 29690306 AGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAA 29690365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAA 1080

 29690366 GCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTT 29690425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTT 1140

 29690426 GGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAG 29690485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAG 1200

 29690486 GTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCT 29690545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCT 1260

 29690546 GCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGG 29690605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGG 1320

 29690606 CGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCT 29690665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCT 1380

 29690666 AGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGG 29690725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGG 1440

 29690726 GTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAG 29690785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAG 1500

 29690786 AATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTC 29690845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTC 1560

 29690846 ACCCCTATGTCACAATAAGGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAG 29690905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCCCTATGTCACAATAAGGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAG 1620

 29690906 TAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAG 29690965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAG 1680

 29690966 AATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGT 29691025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGT 1740

 29691026 AGATATATATTGCCCGATTGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGG 29691085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGATATATATTGCCCGATTGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGG 1800

 29691086 AGATTTCCTTATTTATGCACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTC 29691145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGATTTCCTTATTTATGCACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTC 1860

 29691146 GCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAG 29691205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAG 1920

 29691206 TTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCT 29691265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCT 1980

 29691266 CTTAATGTCAATTATTGTAATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAAT 29691325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTAATGTCAATTATTGTAATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAAT 2040

 29691326 GTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGAT 29691385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGAT 2100

 29691386 TTTATCAGATATCTAATTATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCT 29691445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTATCAGATATCTAATTATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCT 2160

 29691446 GGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCAT 29691505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCAT 2220

 29691506 TGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCA 29691565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCA 2280

 29691566 GAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAG 29691625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAG 2340

 29691626 GAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATC 29691685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATC 2400

 29691686 AATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGA 29691745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGA 2460

 29691746 AAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAG 29691805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAG 2520

 29691806 GTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTC 29691865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTC 2580

 29691866 CATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATC 29691925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATC 2640

 29691926 ACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCA 29691985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCA 2700

 29691986 ATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATT 29692045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATT 2760

 29692046 AACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAG 29692091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAG 2806

EXCISED REGION

 29692095 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 29692154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 2866

 29692155 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 29692214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 2926

 29692215 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 29692274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 2986

 29692275 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 29692334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 3046

 29692335 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 29692394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 3106

 29692395 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 29692454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 3166

 29692455 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 29692514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 3226

 29692515 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 29692574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 3286

 29692575 AACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACAT 29692634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 AACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACAT 3346

 29692635 GGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGT 29692694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 GGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGT 3406

 29692695 TTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAA 29692754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 TTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAA 3466

 29692755 ATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTG 29692814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 ATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTG 3526

 29692815 AGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAA 29692874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 AGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAA 3586

 29692875 AAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTG 29692934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 AAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTG 3646

 29692935 GCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGAC 29692994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 GCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGAC 3706

 29692995 TGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATA 29693054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 TGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATA 3766

 29693055 AGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCAT 29693083
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3767 AGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCAT 3795

Alignment time is 3.6055 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7036] =>      7036 nucs 'mol-32-2399-062228_7036'

Score:        6960
Aligned:      7037        nucs
Identic:      7030 (100%) nucs =>      2896 (100%)      4134 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29689194,29692091] EXCISED REGION [29692095,29696232]
 second seq =>  [       1,    2898] EXCISED REGION [    2899,    7036]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094] to [29692095,29692097]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29689194 GACTGCCCGTGTGAACGGCTTCAACCGCATGCCCCCCACCCCACAGTCGCCAAGAAGACT 29689253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACTGCCCGTGTGAACGGCTTCAACCGCATGCCCCCCACCCCACAGTCGCCAAGAAGACT 60

 29689254 GGGAGGTCCGCATCGGCGGTGGGTACAAGTCATTCAGGCTGCGAGGCGAGTCAGGCCTTT 29689313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAGGTCCGCATCGGCGGTGGGTACAAGTCATTCAGGCTGCGAGGCGAGTCAGGCCTTT 120

 29689314 CCAGACCTCGCCGGACTGGGCTGGGCTGCGCCGGAAATTGACCGGAACAGGGACTATGAG 29689373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGACCTCGCCGGACTGGGCTGGGCTGCGCCGGAAATTGACCGGAACAGGGACTATGAG 180

 29689374 AAAATAGTTGAGCAATCGAGGAGTCAGCTGAAAAGCGGAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGC 29689433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATAGTTGAGCAATCGAGGAGTCAGCTGAAAAGCGGAGGCTCAAGAGCCATTTCAAGC 240

 29689434 TGGGCTGCACCAGAAATTGATTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAAGGAGG 29689493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGGCTGCACCAGAAATTGATTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAAGGAGG 300

 29689494 AGTAAGCTCAAAAGTGGAGTCTCAAAGCCATTTCAACCTTCCCGCCCCAGCCAGTCGAAG 29689553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTAAGCTCAAAAGTGGAGTCTCAAAGCCATTTCAACCTTCCCGCCCCAGCCAGTCGAAG 360

 29689554 CAGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCCAGGAGCCGGAGATGGAGGAGGTGGTGGAAGAGTTG 29689613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCCAGGAGCCGGAGATGGAGGAGGTGGTGGAAGAGTTG 420

 29689614 GGGCTGCCTTTGCAGCTTTCCACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGCGTGCGGAGG 29689673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGCTGCCTTTGCAGCTTTCCACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGCGTGCGGAGG 480

 29689674 TCCGCAATCTGAGACCGCGAAATGGCTTACAGCTGGACGTGATTGCCAAGACCCTTCTGG 29689733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCGCAATCTGAGACCGCGAAATGGCTTACAGCTGGACGTGATTGCCAAGACCCTTCTGG 540

 29689734 GCTGCTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCTGTGCGCACTGGGGAGCACATGAGGGGAC 29689793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTGCTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCTGTGCGCACTGGGGAGCACATGAGGGGAC 600

 29689794 ATGCAGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAACCCTACGCCCCCCACCCCACATTTCACAG 29689853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGCAGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAACCCTACGCCCCCCACCCCACATTTCACAG 660

 29689854 TTGCCATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCAGCGGGTACAAGTCATTGAGGCCAAGAGG 29689913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCCATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCAGCGGGTACAAGTCATTGAGGCCAAGAGG 720

 29689914 CGAGTCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTCAGCTGGGCTGCGCTGGAAATTGACCGGA 29689973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGAGTCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTCAGCTGGGCTGCGCTGGAAATTGACCGGA 780

 29689974 ACAGGAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATGAGAAGTAAGCTCAAAAGCGTAGGCTCAA 29690033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      781 ACAGGAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATGAGAAGTAAGCCCAAAAGCGTAGGCTCAA 840

 29690034 GAGCCATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATTGACCAGAACAGGGACTATGAGAAAAGAG 29690093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGCCATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATTGACCAGAACAGGGACTATGAGAAAAGAG 900

 29690094 TCAGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGAGGCTCAAGAGCTGTTTCAAGCTGGGCTG 29690153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGAGGCTCAAGAGCTGTTTCAAGCTGGGCTG 960

 29690154 TGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTAAGC 29690213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTAAGC 1020

 29690214 TCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGAATA 29690273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGAATA 1080

 29690274 GGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAAGAG 29690333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAAGAG 1140

 29690334 CCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCTGG 29690393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCTGG 1200

 29690394 GAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACCCTA 29690453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACCCTA 1260

 29690454 GGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATAGCT 29690513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATAGCT 1320

 29690514 GGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCTGGT 29690573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCTGGT 1380

 29690574 GCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCACTCT 29690633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCACTCT 1440

 29690634 CGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTCTTG 29690693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTCTTG 1500

 29690694 AGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATAATA 29690753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATAATA 1560

 29690754 GCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTGTTT 29690813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTGTTT 1620

 29690814 TAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAAGGATATGTTA 29690873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAAGGATATGTTA 1680

 29690874 TCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGGGAA 29690933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGGGAA 1740

 29690934 CAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTAGTT 29690993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTAGTT 1800

 29690994 GAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGATTGACTTCCAT 29691053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGATTGACTTCCAT 1860

 29691054 CTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGCACTTGAAGGG 29691113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGCACTTGAAGGG 1920

 29691114 TTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGGGAG 29691173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGGGAG 1980

 29691174 CTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGACTGG 29691233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGACTGG 2040

 29691234 CTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGTAATTTTCTCA 29691293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGTAATTTTCTCA 2100

 29691294 CTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAACAGT 29691353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAACAGT 2160

 29691354 ACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATTATGCCAGTGA 29691413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATTATGCCAGTGA 2220

 29691414 ACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCCCAA 29691473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCCCAA 2280

 29691474 CACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAATAA 29691533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAATAA 2340

 29691534 TGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGG 29691593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGG 2400

 29691594 AAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAA 29691653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAA 2460

 29691654 AGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGC 29691713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCTATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGC 2520

 29691714 ATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCAT 29691773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCAT 2580

 29691774 GAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCT 29691833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCT 2640

 29691834 AATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTC 29691893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTC 2700

 29691894 TTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAG 29691953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAG 2760

 29691954 TGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAG 29692013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAG 2820

 29692014 AGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACT 29692073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACT 2880

 29692074 GAGAAAGGAAGCAGAAAG 29692091
          ||||||||||||||||||
     2881 GAGAAAGGAAGCAGAAAG 2898

EXCISED REGION

 29692095 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 29692154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 2958

 29692155 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 29692214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 3018

 29692215 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 29692274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 3078

 29692275 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 29692334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 3138

 29692335 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 29692394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 3198

 29692395 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 29692454
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3199 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAACAGAACTGGGAAAGT 3258

 29692455 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 29692514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 3318

 29692515 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 29692574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     3319 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTT-AAAAAAAAAACTTACGGG 3377

 29692575 AACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACAT 29692634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 AACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACAT 3437

 29692635 GGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGT 29692694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 GGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGT 3497

 29692695 TTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAA 29692754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 TTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAA 3557

 29692755 ATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTG 29692814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 ATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTG 3617

 29692815 AGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAA 29692874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 AGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAA 3677

 29692875 AAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTG 29692934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 AAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTG 3737

 29692935 GCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGAC 29692994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 GCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGAC 3797

 29692995 TGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATA 29693054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 TGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATA 3857

 29693055 AGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCATCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTG 29693114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 AGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCATCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTG 3917

 29693115 GTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAGACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGC 29693174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 GTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAGACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGC 3977

 29693175 TGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCTTTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCC 29693234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 TGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCTTTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCC 4037

 29693235 AGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGAAATAGGATACAAATATAGTTGAATAGTTGTAT 29693294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 AGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGAAATAGGATACAAATATAGTTGAATAGTTGTAT 4097

 29693295 ATTTTAAAATTAATGAAGCCTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATT 29693354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 ATTTTAAAATTAATGAAGCCTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATT 4157

 29693355 CTTCAACCTTTTAAAAATTATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGG 29693414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 CTTCAACCTTTTAAAAATTATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGG 4217

 29693415 GCCATACTTTGCCTATCCTGGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAA 29693474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4218 GCCATACTTTGCCTATCCTGGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAA 4277

 29693475 GCCCAGGACAGTTAGTAACATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACA 29693534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 GCCCAGGACAGTTAGTAACATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACA 4337

 29693535 TTGCAATTTTTTAATTTTTAAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCAT 29693594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 TTGCAATTTTTTAATTTTTAAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCAT 4397

 29693595 TTATTTTGTTAGCCAAGTGGAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTT 29693654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 TTATTTTGTTAGCCAAGTGGAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTT 4457

 29693655 ATAAGATGACTTGCCAAGTATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCA 29693714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 ATAAGATGACTTGCCAAGTATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCA 4517

 29693715 GAAGGGAGGTGGGACTTCTGGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAA 29693774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 GAAGGGAGGTGGGACTTCTGGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAA 4577

 29693775 AATACTTGGAAAATTATCAAAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTT 29693834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 AATACTTGGAAAATTATCAAAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTT 4637

 29693835 ACAACAATCTAAAGGGCATTAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACAGCAAA 29693894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 ACAACAATCTAAAGGGCATTAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACAGCAAA 4697

 29693895 GTTTGTGGTGCTTTAACTTGTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCC 29693954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 GTTTGTGGTGCTTTAACTTGTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCC 4757

 29693955 TTGAAAACAAGCAATTCCCCAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAA 29694014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 TTGAAAACAAGCAATTCCCCAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAA 4817

 29694015 AAGCTCCATACCCAGAGCAGTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGG 29694074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 AAGCTCCATACCCAGAGCAGTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGG 4877

 29694075 GTGCTGGCACAGGTGACTCCAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTCTGG 29694134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 GTGCTGGCACAGGTGACTCCAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTCTGG 4937

 29694135 GCGCTTGCAAAGAGCTTGCAATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATG 29694194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 GCGCTTGCAAAGAGCTTGCAATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATG 4997

 29694195 TGCCGCTGAGGAAGTGATTGCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACTGATCT 29694254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 TGCCGCTGAGGAAGTGATTGCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACTGATCT 5057

 29694255 AGAGTGGCTCCTCTTGGTTAGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAA 29694314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 AGAGTGGCTCCTCTTGGTTAGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAA 5117

 29694315 AAATTTCATATAAAGGAATAGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTA 29694374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 AAATTTCATATAAAGGAATAGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTA 5177

 29694375 TAATTCCATCACTCTTATCAATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTT 29694434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 TAATTCCATCACTCTTATCAATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTT 5237

 29694435 GCTTGTCAAGCCCCGCTGCAGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTCCTGGA 29694494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 GCTTGTCAAGCCCCGCTGCAGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTCCTGGA 5297

 29694495 TTTTTTCCTATGCTCATAGAGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTT 29694554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 TTTTTTCCTATGCTCATAGAGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTT 5357

 29694555 TCTAGACATGTAAAATAATACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGC 29694614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 TCTAGACATGTAAAATAATACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGC 5417

 29694615 AGCTTTTAATAACTTTTCTTTTTTTCTTTATTCCAGCCGTCTTTGTGGCAATTTTACATT 29694674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 AGCTTTTAATAACTTTTCTTTTTTTCTTTATTCCAGCCGTCTTTGTGGCAATTTTACATT 5477

 29694675 GGTAAGATTTAGTTTCAGTTTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCAC 29694734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 GGTAAGATTTAGTTTCAGTTTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCAC 5537

 29694735 TCTTTGCATACAGTAAAACAGCTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAA 29694794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 TCTTTGCATACAGTAAAACAGCTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAA 5597

 29694795 TTTATACGTATACTTTGCTTTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAG 29694854
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 TTTATACGTATACTTTGCTTTTTTACAAGCCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAG 5657

 29694855 ATGCATTAGGGGAATAGTAACTTGTGAATTAAAATCGTTTTGCTACCAAATAATTCACTA 29694914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5658 ATGCATTAGGGGAATAGTAACTTGTGAATTAAAATCGTTTTGCTACCAAATAATTCACTA 5717

 29694915 CACGTTTCTTTAAATATCTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAAC 29694974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5718 CACGTTTCTTTAAATATCTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAAC 5777

 29694975 CCTCCTTTATTTTATGGTAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTT 29695034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5778 CCTCCTTTATTTTATGGTAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTT 5837

 29695035 TTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCAC 29695094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5838 TTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCAC 5897

 29695095 TGCCTCCCAGGCTGAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGT 29695154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5898 TGCCTCCCAGGCTGAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGT 5957

 29695155 GTGCACCATCACACCCAGCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGT 29695214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5958 GTGCACCATCACACCCAGCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGT 6017

 29695215 TGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAG 29695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6018 TGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAG 6077

 29695275 TGTTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCT 29695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 TGTTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCT 6137

 29695335 AGGCGCGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCGGATCAC 29695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 AGGCGCGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCGGATCAC 6197

 29695395 AAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTACTAAAAAT 29695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 AAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTACTAAAAAT 6257

 29695455 ACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGGGCTGAA 29695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 ACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGGGCTGAA 6317

 29695515 GCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGCGCCACTG 29695574
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 GCACGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGCGCCACTG 6377

 29695575 CACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGACTCCGTCCC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATA 29695633
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     6378 CACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGACTCCGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATA 6437

 29695634 CTTTGGTCATAAAATTTTAGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGAAGACAA 29695693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 CTTTGGTCATAAAATTTTAGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGAAGACAA 6497

 29695694 AGATTCTGCAGTGGTTATACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAAGCCTGT 29695753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 AGATTCTGCAGTGGTTATACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAAGCCTGT 6557

 29695754 GTACATTATTTTACAAAAGTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCTGGAATA 29695813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6558 GTACATTATTTTACAAAAGTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCTGGAATA 6617

 29695814 TTTTATTTTTACCTGTGCTCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATGTGCCCCTAT 29695873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6618 TTTTATTTTTACCTGTGCTCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATGTGCCCCTAT 6677

 29695874 GTTCTGTTGACACAGTGCTGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTCGATATTAGAA 29695933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6678 GTTCTGTTGACACAGTGCTGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTCGATATTAGAA 6737

 29695934 CTGAGGCTGCAATGGTAGGGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATGGCCTAC 29695993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6738 CTGAGGCTGCAATGGTAGGGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATGGCCTAC 6797

 29695994 ATGTAAAGAACGGTTAGTGGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATTTTCAAC 29696053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6798 ATGTAAAGAACGGTTAGTGGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATTTTCAAC 6857

 29696054 TTCACTGGAAAGTACTGACTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACAGCTAAT 29696113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6858 TTCACTGGAAAGTACTGACTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACAGCTAAT 6917

 29696114 TTTGTTTATCACATATGCTCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACTACTAAA 29696173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6918 TTTGTTTATCACATATGCTCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACTACTAAA 6977

 29696174 AGGTCTTCAAGTACACACCTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATGTGATA 29696232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6978 AGGTCTTCAAGTACACACCTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATGTGATA 7036

Alignment time is 6.61502 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3333] =>      3333 nucs 'mol-32-2e15-147086_3333'

Score:        3210
Aligned:      3320        nucs
Identic:      3310 (100%) nucs =>      2503 (100%)       807 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685941,29688451] EXCISED REGION [29690144,29690952]
 second seq =>  [       1,    2511] EXCISED REGION [    2512,    3320]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29685941 AGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAA 29686000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAA 60

 29686001 CAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTA 29686060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTA 120

 29686061 CTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGA 29686120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGA 180

 29686121 ATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTC 29686180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTC 240

 29686181 AATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGC 29686240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGC 300

 29686241 TTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAA 29686300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAA 360

 29686301 GTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTA 29686360
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGTAGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTA 420

 29686361 CAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACA 29686420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACA 480

 29686421 TCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCC 29686480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCC 540

 29686481 AAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACC 29686540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACC 600

 29686541 CCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGG 29686600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGG 660

 29686601 GCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAG 29686660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAG 720

 29686661 TTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAA 29686720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAA 780

 29686721 GTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTA 29686780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTA 840

 29686781 CCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGTGCATCCT 29686840
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||.||||||
      841 CCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCTTAGAAACAAATTCTCCAGCTTCAGTACATCCT 900

 29686841 TTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAG 29686900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAG 960

 29686901 AACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTA 29686960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTA 1020

 29686961 CTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATT 29687020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATT 1080

 29687021 TCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAA 29687080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAA 1140

 29687081 GGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTAC 29687140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTAC 1200

 29687141 AAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCAT 29687200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCAT 1260

 29687201 CACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAG 29687260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAG 1320

 29687261 ACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTG 29687320
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTTCTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTG 1380

 29687321 GTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAA 29687380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAA 1440

 29687381 GTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAAT 29687440
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1441 GTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTGCTAAAT 1500

 29687441 CTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATC 29687500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATC 1560

 29687501 ACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCC 29687560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCC 1620

 29687561 CTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCT 29687620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCT 1680

 29687621 GCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTG 29687680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTG 1740

 29687681 TTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGA 29687740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGA 1800

 29687741 CGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTC 29687800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTC 1860

 29687801 TAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAA 29687860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAA 1920

 29687861 GCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAG 29687920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAG 1980

 29687921 GTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGA 29687980
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGA 2040

 29687981 AGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATG 29688040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATG 2100

 29688041 ATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGA 29688100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGA 2160

 29688101 TAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCAC 29688160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCAC 2220

 29688161 CACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAA 29688220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAA 2280

 29688221 ATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTT 29688280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTT 2340

 29688281 ATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGC 29688340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGC 2400

 29688341 GGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCT 29688400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCT 2460

 29688401 ACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 2511

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 2571

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 2631

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 2691

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 2751

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 2811

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 2871

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 2931

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 2991

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2992 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 3051

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 3111

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 3171

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 3231

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 3291

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAG 29690952
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3292 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAG 3320

Alignment time is 3.16585 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4663] =>      4663 nucs 'mol-32-2ee6-177464_4663'

Score:        4454
Aligned:      4663        nucs
Identic:      4644 (100%) nucs =>      2524 (100%)      2120 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685921,29688451] EXCISED REGION [29690144,29692274]
 second seq =>  [       1,    2531] EXCISED REGION [    2532,    4663]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29685921 GATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGA 29685980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
        1 GATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGCCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGA 60

 29685981 GAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGT 29686040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGT 120

 29686041 AACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGT 29686100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGT 180

 29686101 GTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCT 29686160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCT 240

 29686161 ATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTC 29686220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTC 300

 29686221 CCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTG 29686280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTG 360

 29686281 GAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGC 29686340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGC 420

 29686341 TCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTT 29686400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTT 480

 29686401 GCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCC 29686460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCC 540

 29686461 CATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAA 29686520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAA 600

 29686521 AACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGG 29686580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGG 660

 29686581 ACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAG 29686640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAG 720

 29686641 GTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGT 29686700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGT 780

 29686701 CATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCT 29686760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCT 840

 29686761 CCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATT 29686820
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
      841 CCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCTTAGAAACAAATT 900

 29686821 CTCCAGCTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACC 29686880
          ||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCCAGCTTCAGTACATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACC 960

 29686881 TCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAG 29686940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAG 1020

 29686941 AAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGC 29687000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGC 1080

 29687001 CATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCC 29687060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCC 1140

 29687061 CTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTA 29687120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTA 1200

 29687121 ACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCAC 29687180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCAC 1260

 29687181 TCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATG 29687240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATG 1320

 29687241 CGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATA 29687300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATA 1380

 29687301 AACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTG 29687360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTG 1440

 29687361 CATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCT 29687420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1441 CATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCC 1500

 29687421 TGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCC 29687480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCC 1560

 29687481 TGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACT 29687540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACT 1620

 29687541 CGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCT 29687600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCT 1680

 29687601 AGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACC 29687660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACC 1740

 29687661 ACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGT 29687720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGT 1800

 29687721 CAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTA 29687780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTA 1860

 29687781 CAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAAC 29687840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAAC 1920

 29687841 TCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGA 29687900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGA 1980

 29687901 GGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGA 29687960
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGA 2040

 29687961 AGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATA 29688020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATA 2100

 29688021 TTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAG 29688080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAG 2160

 29688081 CTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTC 29688140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTC 2220

 29688141 CCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAA 29688200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAA 2280

 29688201 ATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACC 29688260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACC 2340

 29688261 TCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCAC 29688320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCAC 2400

 29688321 TTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAA 29688380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAA 2460

 29688381 CATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTG 29688440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTG 2520

 29688441 CCTGTAATCCT 29688451
          |||||||||||
     2521 CCTGTAATCCT 2531

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 2591

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 2651

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 2711

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 2771

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 2831

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 2891

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 2951

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 3011

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3012 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 3071

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          ||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GCTTTTCTCGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 3131

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 3191

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 3251

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 3311

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 3371

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 3431

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3432 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 3491

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 3551

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3552 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 3611

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 3671

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 3731

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 3791

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3792 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 3851

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 3911

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 3971

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 4031

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 4091

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 4151

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 4211

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 4271

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 4331

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4332 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 4391

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 29692062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 4451

 29692063 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 29692122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 4511

 29692123 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 29692182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 4571

 29692183 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 29692242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 4631

 29692243 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 29692274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 4663

Alignment time is 4.69876 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2132] =>      2132 nucs 'mol-32-2ee6-177464_2132'

Score:        2016
Aligned:      2126        nucs
Identic:      2116 (100%) nucs =>      1394 ( 99%)       722 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29690144,29691544] EXCISED REGION [29691551,29692274]
 second seq =>  [       1,    1402] EXCISED REGION [    1409,    2132]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [29691545,29691550]
 second seq =>         6 nucs [1403,1408]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29691545,29691547] to [29691551,29691553]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29691544,29691544] to [29691551,29691551]
 second seq =>         1 nucs [1402,1402] to [1409,1409]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 60

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 120

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 180

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 240

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 300

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 360

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 420

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 480

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      481 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 540

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          ||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTTTCTCGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 600

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 660

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 720

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 780

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 840

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 900

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      901 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 960

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 1020

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1021 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 1080

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 1140

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 1200

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 1260

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1261 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 1320

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 1380

 29691524 TGGTGAA-TAATGCGTGACTAT 29691544
          ||||||| ||||||||||||||
     1381 TGGTGAAATAATGCGTGACTAT 1402

EXCISED REGION

 29691551 TGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATC 29691610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 TGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATC 1468

 29691611 AGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATA 29691670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 AGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATA 1528

 29691671 TGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGG 29691730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGG 1588

 29691731 AGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGG 29691790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 AGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGG 1648

 29691791 AAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGT 29691850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 AAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGT 1708

 29691851 AAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTT 29691910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1709 AAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTT 1768

 29691911 TAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCA 29691970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 TAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCA 1828

 29691971 TATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAG 29692030
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1829 TATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGATTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAG 1888

 29692031 TGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAA 29692090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAA 1948

 29692091 GAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCAC 29692150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 GAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCAC 2008

 29692151 AGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGAT 29692210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 AGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGAT 2068

 29692211 GGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGA 29692270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 GGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGA 2128

 29692271 ATGA 29692274
          ||||
     2129 ATGA 2132

Alignment time is 2.0241 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3515] =>      3515 nucs 'mol-32-2fc2-101473_3515'

Score:        3515
Aligned:      3515        nucs
Identic:      3515 (100%) nucs =>      2355 (100%)      1160 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29689737,29692091] EXCISED REGION [29692095,29693254]
 second seq =>  [       1,    2355] EXCISED REGION [    2356,    3515]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29692092,29692094] to [29692095,29692097]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29689737 GCTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCTGTGCGCACTGGGGAGCACATGAGGGGACATG 29689796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTCCAGAAGCGCGGAGGCTGGGGTGCTGTGCGCACTGGGGAGCACATGAGGGGACATG 60

 29689797 CAGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAACCCTACGCCCCCCACCCCACATTTCACAGTTG 29689856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGGACTACCGGCGCGAATGGCTTCAACCCTACGCCCCCCACCCCACATTTCACAGTTG 120

 29689857 CCATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCAGCGGGTACAAGTCATTGAGGCCAAGAGGCGA 29689916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATGAAGACCGGGAGGTCTGCAAAAGCAGCGGGTACAAGTCATTGAGGCCAAGAGGCGA 180

 29689917 GTCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTCAGCTGGGCTGCGCTGGAAATTGACCGGAACA 29689976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCAGGCCTTTCTAGACCTCGCCCAACTCAGCTGGGCTGCGCTGGAAATTGACCGGAACA 240

 29689977 GGAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATGAGAAGTAAGCTCAAAAGCGTAGGCTCAAGAG 29690036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAATGAGAAGTAAGCTCAAAAGCGTAGGCTCAAGAG 300

 29690037 CCATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATTGACCAGAACAGGGACTATGAGAAAAGAGTCA 29690096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATTTCAAGCCGGGCTGCGCCGGAAATTGACCAGAACAGGGACTATGAGAAAAGAGTCA 360

 29690097 GGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGAGGCTCAAGAGCTGTTTCAAGCTGGGCTGTGC 29690156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCAAAGGAGGAGTAAGCTCAAAAGGGGAGGCTCAAGAGCTGTTTCAAGCTGGGCTGTGC 420

 29690157 CGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTAAGCTCA 29690216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTAAGCTCA 480

 29690217 AAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGAATAGGG 29690276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGAATAGGG 540

 29690277 ACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAAGAGCCG 29690336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAAGAGCCG 600

 29690337 TTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCTGGGAG 29690396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCCTGGGAG 660

 29690397 CCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACCCTAGGC 29690456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACCCTAGGC 720

 29690457 GGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATAGCTGGA 29690516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATAGCTGGA 780

 29690517 TGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCTGGTGCA 29690576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCTGGTGCA 840

 29690577 GCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCACTCTCGG 29690636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCACTCTCGG 900

 29690637 CATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTCTTGAGT 29690696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTCTTGAGT 960

 29690697 CTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATAATAGCA 29690756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATAATAGCA 1020

 29690757 AGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTGTTTTAA 29690816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTGTTTTAA 1080

 29690817 AACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAAGGATATGTTATCT 29690876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAAGGATATGTTATCT 1140

 29690877 GAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGGGAACAG 29690936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGGGAACAG 1200

 29690937 ACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTAGTTGAG 29690996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTAGTTGAG 1260

 29690997 AACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGATTGACTTCCATCTT 29691056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGATTGACTTCCATCTT 1320

 29691057 GCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGCACTTGAAGGGTTT 29691116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGCACTTGAAGGGTTT 1380

 29691117 TTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGGGAGCTT 29691176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGGGAGCTT 1440

 29691177 AAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGACTGGCTG 29691236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGACTGGCTG 1500

 29691237 CTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGTAATTTTCTCACTG 29691296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGTAATTTTCTCACTG 1560

 29691297 TAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAACAGTACT 29691356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAACAGTACT 1620

 29691357 TGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATTATGCCAGTGAACA 29691416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATTATGCCAGTGAACA 1680

 29691417 CATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCCCAACAC 29691476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCCCAACAC 1740

 29691477 AAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAATAATGC 29691536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAATAATGC 1800

 29691537 GTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAA 29691596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGATGGGAAA 1860

 29691597 TGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGG 29691656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGACAAAAGG 1920

 29691657 CTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATG 29691716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAACAGCATG 1980

 29691717 ATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAG 29691776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGGGCATGAG 2040

 29691777 AAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAAT 29691836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGAGTCTAAT 2100

 29691837 TCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTT 29691896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCTTTTCTTT 2160

 29691897 AAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGA 29691956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTTAAAGTGA 2220

 29691957 ACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAGAGT 29692016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAAATAGAGT 2280

 29692017 GACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAG 29692076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGAGACTGAG 2340

 29692077 AAAGGAAGCAGAAAG 29692091
          |||||||||||||||
     2341 AAAGGAAGCAGAAAG 2355

EXCISED REGION

 29692095 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 29692154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 AATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAA 2415

 29692155 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 29692214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 GACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGT 2475

 29692215 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 29692274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 GGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGA 2535

 29692275 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 29692334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 AGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTG 2595

 29692335 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 29692394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 CCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGAT 2655

 29692395 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 29692454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 GAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGT 2715

 29692455 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 29692514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 TGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAG 2775

 29692515 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 29692574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 ACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGG 2835

 29692575 AACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACAT 29692634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 AACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACAT 2895

 29692635 GGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGT 29692694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 GGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGT 2955

 29692695 TTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAA 29692754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAA 3015

 29692755 ATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTG 29692814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 ATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTG 3075

 29692815 AGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAA 29692874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 AGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAA 3135

 29692875 AAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTG 29692934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 AAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTG 3195

 29692935 GCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGAC 29692994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 GCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGAC 3255

 29692995 TGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATA 29693054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 TGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATA 3315

 29693055 AGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCATCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTG 29693114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 AGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCATCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTG 3375

 29693115 GTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAGACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGC 29693174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 GTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAGACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGC 3435

 29693175 TGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCTTTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCC 29693234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 TGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCTTTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCC 3495

 29693235 AGTGTATATGGTTGTTAGGA 29693254
          ||||||||||||||||||||
     3496 AGTGTATATGGTTGTTAGGA 3515

Alignment time is 3.32739 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3936] =>      3936 nucs 'mol-32-2fd8-090476_3936'

Score:        3925
Aligned:      3936        nucs
Identic:      3935 (100%) nucs =>        79 (100%)      3856 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685067,29685145] EXCISED REGION [29685147,29689003]
 second seq =>  [       1,      79] EXCISED REGION [      81,    3936]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [29685146,29685146]
 second seq =>         1 nucs [80,80]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [29688567,29688567]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29685145,29685145] to [29685147,29685147]
 second seq =>         1 nucs [79,79] to [81,81]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29685067 ATATATATGTATGTATATATACACATATATGTGTATATATACACACACATATATATGTGT 29685126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATATATGTATGTATATATACACATATATGTGTATATATACACACACATATATATGTGT 60

 29685127 GTGTTTATATATATATATA 29685145
          |||||||||||||||||||
       61 GTGTTTATATATATATATA 79

EXCISED REGION

 29685147 AGAGAGAGAGAAGCTTAACAGAGAAACATGACAGAAACCAGGACTCTGTCCTCCAGCATC 29685206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       81 AGAGAGAGAGAAGCTTAACAGAGAAACATGACAGAAACCAGGACTCTGTCCTCCAGCATC 140

 29685207 CTGGAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAG 29685266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      141 CTGGAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAG 200

 29685267 ACAGAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATT 29685326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      201 ACAGAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATT 260

 29685327 TGGCCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCC 29685386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 TGGCCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCC 320

 29685387 TGGAACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGA 29685446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      321 TGGAACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGA 380

 29685447 GCGAGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAG 29685506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 GCGAGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAG 440

 29685507 CAAGTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGA 29685566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 CAAGTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGA 500

 29685567 CCGAGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTT 29685626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 CCGAGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTT 560

 29685627 TATACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGA 29685686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 TATACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGA 620

 29685687 ACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGT 29685746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 ACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGT 680

 29685747 TCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCC 29685806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 TCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCC 740

 29685807 ACTGAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGC 29685866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 ACTGAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGC 800

 29685867 ATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAG 29685926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 ATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAG 860

 29685927 GGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGT 29685986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 GGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGT 920

 29685987 CACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGA 29686046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 CACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGA 980

 29686047 TGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGA 29686106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 TGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGA 1040

 29686107 TTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCA 29686166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 TTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCA 1100

 29686167 CCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTG 29686226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 CCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTG 1160

 29686227 TCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCAT 29686286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 TCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCAT 1220

 29686287 GCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTG 29686346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 GCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTG 1280

 29686347 CTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCA 29686406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 CTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCA 1340

 29686407 CCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCAT 29686466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 CCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCAT 1400

 29686467 TCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAG 29686526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 TCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAG 1460

 29686527 CCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTC 29686586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 CCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTC 1520

 29686587 CTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCA 29686646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 CTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCA 1580

 29686647 TGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTT 29686706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 TGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTT 1640

 29686707 GTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCT 29686766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 GTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCT 1700

 29686767 GACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAG 29686826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 GACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAG 1760

 29686827 CTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGA 29686886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 CTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGA 1820

 29686887 GAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTG 29686946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 GAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTG 1880

 29686947 GGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGA 29687006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 GGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGA 1940

 29687007 AAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGG 29687066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 AAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGG 2000

 29687067 TTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAG 29687126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 TTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAG 2060

 29687127 CATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCC 29687186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 CATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCC 2120

 29687187 TTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACA 29687246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 TTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACA 2180

 29687247 GATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAAT 29687306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 GATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAAT 2240

 29687307 GAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGAC 29687366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 GAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGAC 2300

 29687367 ACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACT 29687426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 ACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACT 2360

 29687427 TTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCA 29687486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCA 2420

 29687487 GCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCC 29687546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 GCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCC 2480

 29687547 AGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATG 29687606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 AGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATG 2540

 29687607 GGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACAC 29687666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 GGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACAC 2600

 29687667 TTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCA 29687726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 TTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCA 2660

 29687727 CTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTA 29687786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 CTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTA 2720

 29687787 CTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTG 29687846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 CTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTG 2780

 29687847 AATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATC 29687906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 AATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATC 2840

 29687907 TGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGG 29687966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGG 2900

 29687967 GGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCT 29688026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 GGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCT 2960

 29688027 CTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGT 29688086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 CTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGT 3020

 29688087 TTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCT 29688146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 TTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCT 3080

 29688147 CTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCT 29688206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 CTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCT 3140

 29688207 TCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTA 29688266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 TCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTA 3200

 29688267 AAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 29688326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 AAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 3260

 29688327 AGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGC 29688386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 AGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGC 3320

 29688387 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTA 29688446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTA 3380

 29688447 ATCCTAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAATCTGGGAGGCGAAGGTTG 29688506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 ATCCTAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAATCTGGGAGGCGAAGGTTG 3440

 29688507 CAGTGTGCCGAGATCGCGCCACTGCACCCCAGCTTGGATGTCAGAGTGAGACCCCATCTC 29688566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 CAGTGTGCCGAGATCGCGCCACTGCACCCCAGCTTGGATGTCAGAGTGAGACCCCATCTC 3500

 29688567 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGTTACAGCATGTGCCTTAGAAATATAAGCCAAGAGAGCA 29688626
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 -AAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGTTACAGCATGTGCCTTAGAAATATAAGCCAAGAGAGCA 3559

 29688627 CTGTGGTTAATACTGCGAGTTCTAGAGTAAAATTCCCTGGGCTTAGATCCCAACTCTACT 29688686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 CTGTGGTTAATACTGCGAGTTCTAGAGTAAAATTCCCTGGGCTTAGATCCCAACTCTACT 3619

 29688687 GTTTATTAGCTGTATAGTTTTGCATGAGGCCCTGAGACTTAAGATTCTTCATTGGAGAAT 29688746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 GTTTATTAGCTGTATAGTTTTGCATGAGGCCCTGAGACTTAAGATTCTTCATTGGAGAAT 3679

 29688747 GGAAACGCAGCATCTGGAACATAGCATGTACTCAGTAAATGTCAGCTGTCACCACTGTCA 29688806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 GGAAACGCAGCATCTGGAACATAGCATGTACTCAGTAAATGTCAGCTGTCACCACTGTCA 3739

 29688807 TTGCCAATCCACTCAGGCCATAGGCAGGTATGTGTGGGCCTGGCAAAAGAAGTTAAGACG 29688866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 TTGCCAATCCACTCAGGCCATAGGCAGGTATGTGTGGGCCTGGCAAAAGAAGTTAAGACG 3799

 29688867 AGGCTGCAGGCCCTGGGGAGCACGTGGAGAGGCTGCATTGAGCTGCGCGCTGTGGGGGCT 29688926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 AGGCTGCAGGCCCTGGGGAGCACGTGGAGAGGCTGCATTGAGCTGCGCGCTGTGGGGGCT 3859

 29688927 GCACGCCCAGTGAAGCGCGTGAAGAGCGAGTAGTGATGGGTTCTGCGCCACTGGGGCTGT 29688986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 GCACGCCCAGTGAAGCGCGTGAAGAGCGAGTAGTGATGGGTTCTGCGCCACTGGGGCTGT 3919

 29688987 GAACGTATGAGGGGCTG 29689003
          |||||||||||||||||
     3920 GAACGTATGAGGGGCTG 3936

Alignment time is 3.72306 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3152] =>      3152 nucs 'mol-32-2fe3-041683_3152'

Score:        3081
Aligned:      3125        nucs
Identic:      3121 (100%) nucs =>      1508 (100%)      1613 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685298,29686807] EXCISED REGION [29686835,29688449]
 second seq =>  [       1,    1510] EXCISED REGION [    1538,    3152]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        27 nucs [29686808,29686834]
 second seq =>        27 nucs [1511,1537]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29686808,29686808] to [29686835,29686835]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29686807,29686807] to [29686835,29686835]
 second seq =>         1 nucs [1510,1510] to [1538,1538]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29685298 CCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGGCCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCC 29685357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGGCCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCC 60

 29685358 CCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGGAACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATA 29685417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGGAACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATA 120

 29685418 AGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCGAGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCT 29685477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCGAGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCT 180

 29685478 CACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAAGTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGAC 29685537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAAGTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGAC 240

 29685538 TAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCGAGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTC 29685597
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCCAGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTC 300

 29685598 AGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTATACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGC 29685657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTATACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGC 360

 29685658 CTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTT 29685717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTT 420

 29685718 ACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGTTCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAG 29685777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGTTCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAG 480

 29685778 AGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACTGAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACA 29685837
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      481 AGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACTGAGCACGTCCCCAGGAGTTGCTGGTACA 540

 29685838 GCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGCATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCAC 29685897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGCATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCAC 600

 29685898 TAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGT 29685957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGT 660

 29685958 CTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCA 29686017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCA 720

 29686018 GATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCC 29686077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCC 780

 29686078 ATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTT 29686137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTT 840

 29686138 CTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAAC 29686197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAAC 900

 29686198 TCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTC 29686257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTC 960

 29686258 TCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCC 29686317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCC 1020

 29686318 TCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACC 29686377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACC 1080

 29686378 CCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGC 29686437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGC 1140

 29686438 CTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCAC 29686497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCAC 1200

 29686498 CATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTC 29686557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTC 1260

 29686558 TTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCA 29686617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCA 1320

 29686618 CTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTG 29686677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTG 1380

 29686678 TCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGT 29686737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGT 1440

 29686738 CCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGA 29686797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGA 1500

 29686798 GTGAGTCACC 29686807
          ||||||||||
     1501 GTGAGTCACC 1510

EXCISED REGION

 29686835 CATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTC 29686894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 CATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTC 1597

 29686895 AGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAA 29686954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 AGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAA 1657

 29686955 TGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACA 29687014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACA 1717

 29687015 CTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCT 29687074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 CTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCT 1777

 29687075 CTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTT 29687134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 CTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTT 1837

 29687135 TTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCC 29687194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCC 1897

 29687195 CTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAAT 29687254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAAT 1957

 29687255 TGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATG 29687314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATG 2017

 29687315 TGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTC 29687374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTC 2077

 29687375 TTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTG 29687434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2078 TTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTG 2137

 29687435 CTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGC 29687494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 CTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGC 2197

 29687495 TGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCA 29687554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCA 2257

 29687555 GTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGAT 29687614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 GTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGAT 2317

 29687615 GTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAG 29687674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 GTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAG 2377

 29687675 TATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTA 29687734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTA 2437

 29687735 CCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGAT 29687794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 CCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGAT 2497

 29687795 TTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCA 29687854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCA 2557

 29687855 TATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAG 29687914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAG 2617

 29687915 AAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAA 29687974
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 AAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAA 2677

 29687975 GCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAG 29688034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 GCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAG 2737

 29688035 TGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAA 29688094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 TGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAA 2797

 29688095 ACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCC 29688154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 ACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCC 2857

 29688155 AGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTT 29688214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 AGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTT 2917

 29688215 CTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGA 29688274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 CTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGA 2977

 29688275 ATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 29688334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 ATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 3037

 29688335 ATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCC 29688394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 ATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCC 3097

 29688395 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATC 29688449
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATC 3152

Alignment time is 2.9829 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7013] =>      7013 nucs 'mol-32-2fee-107700_7013'

Score:        6520
Aligned:      7017        nucs
Identic:      6962 ( 99%) nucs =>      1778 (100%)      5184 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29686668,29688451] EXCISED REGION [29690144,29695364]
 second seq =>  [       1,    1784] EXCISED REGION [    1785,    7013]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29686668 CACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCC 29686727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCC 60

 29686728 TATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCC 29686787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCC 120

 29686788 AACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGTGCATCCTTTAGATA 29686847
          ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||
      121 AACCATTAGAGTGAGTCACCTTAGAAACAAATTCTCCAGCTTCAGTACATCCTTTAGATA 180

 29686848 ACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACC 29686907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACC 240

 29686908 CAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTA 29686967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTA 300

 29686968 AGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGT 29687027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGT 360

 29687028 GCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCA 29687087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCA 420

 29687088 TCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGC 29687147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGC 480

 29687148 CTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCA 29687207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCA 540

 29687208 GCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTC 29687267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTC 600

 29687268 ATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATAC 29687327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATAC 660

 29687328 AATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTA 29687387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTA 720

 29687388 TTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAA 29687447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAA 780

 29687448 CCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAG 29687507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAG 840

 29687508 CTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAA 29687567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAA 900

 29687568 GCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAG 29687627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAG 960

 29687628 GCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCT 29687687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCT 1020

 29687688 GTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCT 29687747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCT 1080

 29687748 TCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTA 29687807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTA 1140

 29687808 GTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAG 29687867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAG 1200

 29687868 GAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGT 29687927
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1201 GAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGC 1260

 29687928 GACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGA 29687987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGA 1320

 29687988 CTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTG 29688047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTG 1380

 29688048 CTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGT 29688107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGT 1440

 29688108 CTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACA 29688167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACA 1500

 29688168 GAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGA 29688227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGA 1560

 29688228 CTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCA 29688287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCA 1620

 29688288 GGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCAC 29688347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCAC 1680

 29688348 CTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 29688407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 1740

 29688408 ATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 1784

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 1844

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 1904

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 1964

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 2024

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 2084

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 2144

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 2204

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 2264

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2265 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 2324

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 2384

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 2444

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 2504

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 2564

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 2624

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 2684

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2685 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 2744

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 2804

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2805 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 2864

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 2924

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 2984

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 3044

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3045 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 3104

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 3164

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 3224

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 3284

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 3344

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 3404

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 3464

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 3524

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 3584

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3585 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 3644

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 29692062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 3704

 29692063 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 29692122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 3764

 29692123 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 29692182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 3824

 29692183 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 29692242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 3884

 29692243 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 29692302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 3944

 29692303 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 29692362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 4004

 29692363 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 29692422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 4064

 29692423 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 29692482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 4124

 29692483 GAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 29692542
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 GATCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 4184

 29692543 TTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGA 29692602
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||
     4185 TTGTTGGTCATTAAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGACGTTGGCCGAAGA 4244

 29692603 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 29692662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4245 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAATATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 4304

 29692663 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 29692722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 4364

 29692723 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 29692782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 4424

 29692783 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 29692842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 4484

 29692843 GAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 29692902
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 GAATTCCTTTTCTGAAATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 4544

 29692903 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 29692962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 4604

 29692963 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAC 29693022
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4605 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAT 4664

 29693023 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 29693082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 4724

 29693083 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 29693142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 4784

 29693143 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 29693202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 4844

 29693203 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGA 29693262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4845 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATAGTTGTTAGGAGAATTAGA 4904

 29693263 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAGT---------TGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 29693313
          ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||
     4905 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAG-GATAGTCTCTGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 4963

 29693314 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 29693373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 5023

 29693374 ATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 29693433
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 ATAGCAACCGTGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 5083

 29693434 GGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAAGCCCAGGACAGTTAGTAAC 29693493
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5084 GGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAAGCCCAGAACAGTTAGTAAC 5143

 29693494 ATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACATTGCAATTTTTTAATTTTT 29693553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 ATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACATTGCAATTTTTTAATTTTT 5203

 29693554 AAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTG 29693613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 AAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTG 5263

 29693614 GAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTTATAAGATGACTTGCCAAGT 29693673
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 GAGTAATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTTATAAGATGACTTGCCAAGT 5323

 29693674 ATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCT 29693733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 ATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCT 5383

 29693734 GGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAAAATACTTGGAAAATTATCA 29693793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 GGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAAAATACTTGGAAAATTATCA 5443

 29693794 AAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTTACAACAATCTAAAGGGCAT 29693853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 AAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTTACAACAATCTAAAGGGCAT 5503

 29693854 TAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACAGCAAAGTTTGTGGTGCTTTAACTT 29693913
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5504 TAATTCAAGAAAAGCTGCTGAACCTCTATAAGAACAGCAGAGTTTGTGGTGCTTTAACTT 5563

 29693914 GTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCCTTGAAAACAAGCAATTCCC 29693973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 GTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCCTTGAAAACAAGCAATTCCC 5623

 29693974 CAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCA 29694033
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 CAACCAAACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCA 5683

 29694034 GTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTC 29694093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 GTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTC 5743

 29694094 CAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTCTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGC 29694153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5744 CAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTTTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGC 5803

 29694154 AATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATT 29694213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 AATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATT 5863

 29694214 GCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACTGATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTT 29694273
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 GCCTGCATTTGTCTCCTGATGAATGCTAGAGAAACTGATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTT 5923

 29694274 AGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAAAAATTTCATATAAAGGAAT 29694333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 AGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAAAAATTTCATATAAAGGAAT 5983

 29694334 AGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTATAATTCCATCACTCTTATC 29694393
          |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 AGAAAATAATACT---AAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTATAATTCCATCACTCTTATC 6040

 29694394 AATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGC 29694453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 AATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGC 6100

 29694454 AGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTCCTGGATTTTTTCCTATGCTCATAG 29694513
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 AGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATCTGCTTTGTGTCCTGGATTTTTTCCTATGCTCATAG 6160

 29694514 AGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTTTCTAGACATGTAAAATAAT 29694573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 AGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTTTCTAGACATGTAAAATAAT 6220

 29694574 ACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGCAGCTTTTAATAACTTTTCT 29694633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 ACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGCAGCTTTTAATAACTTTTCT 6280

 29694634 TTTTTTCTTTATTCCAGCCGTCTTTGTGGCAATTTTACATTGGTAAGATTTAGTTTCAGT 29694693
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 TTTTTTCTTTATTCCAGCCATCTTTGTGGCAATTTTACATTGGTAAGATTTAGTTTCAGT 6340

 29694694 TTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCACTCTTTGCATACAGTAAAAC 29694753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 TTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCACTCTTTGCATACAGTAAAAC 6400

 29694754 AGCTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAATTTATACGTATACTTTGCT 29694813
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 AACTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAATTTATACGTATACTTTGCT 6460

 29694814 TTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAGATGCATTAGGGGAATAGTA 29694873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 TTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAGATGCATTAGGGGAATAGTA 6520

 29694874 ACTTGTGAATTAAAATCGTTTTGC--TACCAAATAATTCACTACACGTTTCTTTAAATAT 29694931
          ||||||||||||||||.|||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 ACTTGTGAATTAAAATAGTTTTGCTTTACCAAATAATTCACTACACGTTTCTTTAAATAT 6580

 29694932 CTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAACCCTCCTTTATTTTATGG 29694991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 CTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAACCCTCCTTTATTTTATGG 6640

 29694992 TAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGC 29695051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 TAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGC 6700

 29695052 TCTGTCTCTCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCACTGCCTCCCAGGCTGAAG 29695111
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6701 TCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCACTGCCTCCCAGGCTCAAG 6760

 29695112 TGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGTGTGCACCATCACACCCA 29695171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGTGTGCACCATCACACCCA 6820

 29695172 GCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCA 29695231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6821 GCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCA 6880

 29695232 AACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTA 29695291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6881 AACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTA 6940

 29695292 TGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCTAGGCGCGGTGACTCACG 29695351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6941 TGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCTAGGCGCGGTGACTCACG 7000

 29695352 CCTGTAATCCCAG 29695364
          |||||||||||||
     7001 CCTGTAATCCCAG 7013

Alignment time is 6.68837 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9126] =>      9126 nucs 'mol-32-3004-200970_9126'

Score:        8563
Aligned:      9123        nucs
Identic:      9059 ( 99%) nucs =>      2774 (100%)      6285 ( 99%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685671,29688451] EXCISED REGION [29690144,29696473]
 second seq =>  [       1,    2781] EXCISED REGION [    2782,    9112]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29685671 TTTTTACAGAAGCAGAACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTA 29685730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTACAGAAGCAGAACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTA 60

 29685731 CAGAAAAATACACAGTTCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGG 29685790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAAAAATACACAGTTCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGG 120

 29685791 GGCTTGGGTACCATCCACTGAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATA 29685850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      121 GGCTTGGGTACCATCCACTGAGCACGTCCCCAGGAGTTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATA 180

 29685851 TCTTATCAGTAAGTGCATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTT 29685910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTATCAGTAAGTGCATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTT 240

 29685911 AAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTC 29685970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTC 300

 29685971 TCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCA 29686030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCA 360

 29686031 TTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAA 29686090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAA 420

 29686091 CTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACA 29686150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACA 480

 29686151 TTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGG 29686210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGG 540

 29686211 GTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACA 29686270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACA 600

 29686271 ACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCT 29686330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCT 660

 29686331 TTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTC 29686390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTC 720

 29686391 TTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCC 29686450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCC 780

 29686451 TCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCC 29686510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCC 840

 29686511 CATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATC 29686570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATC 900

 29686571 CTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGG 29686630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGG 960

 29686631 GAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTA 29686690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTA 1020

 29686691 AGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGA 29686750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGA 1080

 29686751 ACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTA 29686810
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1081 ACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCTTA 1140

 29686811 GAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTT 29686870
          |||.||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAACAAATTCTCCAGCTTCAGTACATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTT 1200

 29686871 ATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCC 29686930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCC 1260

 29686931 TGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTT 29686990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTT 1320

 29686991 GCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGG 29687050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGG 1380

 29687051 TTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCT 29687110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCT 1440

 29687111 AAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCA 29687170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCA 1500

 29687171 TCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACC 29687230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACC 1560

 29687231 TTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGA 29687290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGA 1620

 29687291 ATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACT 29687350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACT 1680

 29687351 AAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAA 29687410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAA 1740

 29687411 TAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCAC 29687470
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCAC 1800

 29687471 TTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCC 29687530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCC 1860

 29687531 CTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACA 29687590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACA 1920

 29687591 ACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCT 29687650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCT 1980

 29687651 CTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGC 29687710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGC 2040

 29687711 TTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATAT 29687770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATAT 2100

 29687771 TCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGC 29687830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGC 2160

 29687831 ATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTT 29687890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTT 2220

 29687891 TTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAA 29687950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2221 TTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAA 2280

 29687951 ATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAA 29688010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAA 2340

 29688011 GCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACT 29688070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACT 2400

 29688071 GACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCC 29688130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCC 2460

 29688131 TGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCT 29688190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCT 2520

 29688191 TCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCAT 29688250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCAT 2580

 29688251 ATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTA 29688310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTA 2640

 29688311 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCA 29688370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCA 2700

 29688371 GCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATG 29688430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATG 2760

 29688431 GTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          |||||||||||||||||||||
     2761 GTGGCATGTGCCTGTAATCCT 2781

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 2841

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 2901

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 2961

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 3021

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 3081

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 3141

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 3201

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 3261

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3262 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 3321

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 3381

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 3441

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 3501

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 3561

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 3621

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 3681

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3682 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 3741

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 3801

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3802 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 3861

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 3921

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 3981

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 4041

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4042 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 4101

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 4161

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 4221

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 4281

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 4341

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 4401

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 4461

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 4521

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 4581

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4582 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 4641

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 29692062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 4701

 29692063 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 29692122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 4761

 29692123 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 29692182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 4821

 29692183 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 29692242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 4881

 29692243 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 29692302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 4941

 29692303 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 29692362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 5001

 29692363 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 29692422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 5061

 29692423 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 29692482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 5121

 29692483 GAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 29692542
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 GATCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 5181

 29692543 TTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGA 29692602
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||
     5182 TTGTTGGTCA-TTAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGACGTTGGCCGAAGA 5240

 29692603 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 29692662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5241 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAATATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 5300

 29692663 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 29692722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 5360

 29692723 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 29692782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 5420

 29692783 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 29692842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 5480

 29692843 GAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 29692902
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5481 GAATTCCTTTTCTGAAATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 5540

 29692903 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 29692962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5541 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 5600

 29692963 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAC 29693022
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5601 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAT 5660

 29693023 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 29693082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 5720

 29693083 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 29693142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 5780

 29693143 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 29693202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 5840

 29693203 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGA 29693262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5841 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATAGTTGTTAGGAGAATTAGA 5900

 29693263 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAGT---------TGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 29693313
          ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||
     5901 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAG-GATAGTCTCTGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 5959

 29693314 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 29693373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 6019

 29693374 ATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 29693433
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 ATAGCAACCGTGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 6079

 29693434 GGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAAGCCCAGGACAGTTAGTAAC 29693493
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6080 GGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAAGCCCAGAACAGTTAGTAAC 6139

 29693494 ATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACATTGCAATTTTTTAATTTTT 29693553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 ATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACATTGCAATTTTTTAATTTTT 6199

 29693554 AAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTG 29693613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 AAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTG 6259

 29693614 GAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTTATAAGATGACTTGCCAAGT 29693673
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 GAGTAATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTTATAAGATGACTTGCCAAGT 6319

 29693674 ATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCT 29693733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 ATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCT 6379

 29693734 GGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAAAATACTTGGAAAATTATCA 29693793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 GGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAAAATACTTGGAAAATTATCA 6439

 29693794 AAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTTACAACAATCTAAAGGGCAT 29693853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 AAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTTACAACAATCTAAAGGGCAT 6499

 29693854 TAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACAGCAAAGTTTGTGGTGCTTTAACTT 29693913
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6500 TAATTCAAGAAAAGCTGCTGAACCTCTATAAGAACAGCAGAGTTTGTGGTGCTTTAACTT 6559

 29693914 GTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCCTTGAAAACAAGCAATTCCC 29693973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 GTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCCTTGAAAACAAGCAATTCCC 6619

 29693974 CAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCA 29694033
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 CAACCAAACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCA 6679

 29694034 GTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTC 29694093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 GTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTC 6739

 29694094 CAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTCTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGC 29694153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6740 CAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTTTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGC 6799

 29694154 AATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATT 29694213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 AATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATT 6859

 29694214 GCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACTGATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTT 29694273
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6860 GCCTGCATTTGTCTCCTGATGAATGCTAGAGAAACTGATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTT 6919

 29694274 AGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAAAAATTTCATATAAAGGAAT 29694333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6920 AGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAAAAATTTCATATAAAGGAAT 6979

 29694334 AGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTATAATTCCATCACTCTTATC 29694393
          |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6980 AGAAAATAATACT---AAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTATAATTCCATCACTCTTATC 7036

 29694394 AATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGC 29694453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7037 AATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGC 7096

 29694454 AGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTCCTGGATTTTTTCCTATGCTCATAG 29694513
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7097 AGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATCTGCTTTGTGTCCTGGATTTTTTCCTATGCTCATAG 7156

 29694514 AGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTTTCTAGACATGTAAAATAAT 29694573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7157 AGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTTTCTAGACATGTAAAATAAT 7216

 29694574 ACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGCAGCTTTTAATAACTTTTCT 29694633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7217 ACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGCAGCTTTTAATAACTTTTCT 7276

 29694634 TTTTTTCTTTATTCCAGCCGTCTTTGTGGCAATTTTACATTGGTAAGATTTAGTTTCAGT 29694693
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7277 TTTTTTCTTTATTCCAGCCATCTTTGTGGCAATTTTACATTGGTAAGATTTAGTTTCAGT 7336

 29694694 TTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCACTCTTTGCATACAGTAAAAC 29694753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7337 TTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCACTCTTTGCATACAGTAAAAC 7396

 29694754 AGCTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAATTTATACGTATACTTTGCT 29694813
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7397 AACTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAATTTATACGTATACTTTGCT 7456

 29694814 TTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAGATGCATTAGGGGAATAGTA 29694873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7457 TTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAGATGCATTAGGGGAATAGTA 7516

 29694874 ACTTGTGAATTAAAATCGTTTTGC--TACCAAATAATTCACTACACGTTTCTTTAAATAT 29694931
          ||||||||||||||||.|||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7517 ACTTGTGAATTAAAATAGTTTTGCTTTACCAAATAATTCACTACACGTTTCTTTAAATAT 7576

 29694932 CTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAACCCTCCTTTATTTTATGG 29694991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7577 CTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAACCCTCCTTTATTTTATGG 7636

 29694992 TAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGC 29695051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7637 TAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGC 7696

 29695052 TCTGTCTCTCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCACTGCCTCCCAGGCTGAAG 29695111
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7697 TCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCACTGCCTCCCAGGCTCAAG 7756

 29695112 TGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGTGTGCACCATCACACCCA 29695171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7757 TGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGTGTGCACCATCACACCCA 7816

 29695172 GCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCA 29695231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7817 GCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCA 7876

 29695232 AACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTA 29695291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7877 AACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTA 7936

 29695292 TGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCTAGGCGCGGTGACTCACG 29695351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7937 TGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCTAGGCGCGGTGACTCACG 7996

 29695352 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCGGATCACAAGGTTAGGAGATCGAG 29695411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7997 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCGGATCACAAGGTTAGGAGATCGAG 8056

 29695412 ACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGG 29695471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8057 ACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGG 8116

 29695472 TGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGGGCTGAAGCAGGAGAATGGCGTGA 29695531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8117 TGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGGGCTGAAGCAGGAGAATGGCGTGA 8176

 29695532 ACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAA 29695591
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     8177 ACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGCGCCACTGCAC-CCAGCCTGGGTAA 8235

 29695592 CAGAGCAAGACTCCGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACTTTGGTCATAAAATTTT 29695651
          ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8236 CAGAGCAAGACTCCGTCC-----AAAAAAAAAAAAAAAAATACTTTGGTCATAAAATTTT 8290

 29695652 AGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGAAGACAAAGATTCTGCAGTGGTTAT 29695711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8291 AGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGAAGACAAAGATTCTGCAGTGGTTAT 8350

 29695712 ACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAAGCCTGTGTACATTATTTTACAAAA 29695771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8351 ACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAAGCCTGTGTACATTATTTTACAAAA 8410

 29695772 GTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCTGGAATATTTTATTTTTACCTGTGC 29695831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8411 GTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCTGGAATATTTTATTTTTACCTGTGC 8470

 29695832 TCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATGTGCCCCTATGTTCTGTTGACACAGTGC 29695891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     8471 TCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATCTGCCCCTATGTTCTGTTGACACAGTGC 8530

 29695892 TGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTCGATATTAGAACTGAGGCTGCAATGGTAG 29695951
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     8531 TGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTTGATATTAGAACTGAGGCTGCAATGGTAG 8590

 29695952 GGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATGGCCTACATGTAAAGAACGGTTAGT 29696011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8591 GGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATGGCCTACATGTAAAGAACGGTTAGT 8650

 29696012 GGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATTTTCAACTTCACTGGAAAGTACTGA 29696071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8651 GGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATTTTCAACTTCACTGGAAAGTACTGA 8710

 29696072 CTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACAGCTAATTTTGTTTATCACATATGC 29696131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8711 CTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACAGCTAATTTTGTTTATCACATATGC 8770

 29696132 TCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACTACTAAAAGGTCTTCAAGTACACAC 29696191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8771 TCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACTACTAAAAGGTCTTCAAGTACACAC 8830

 29696192 CTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATGTGATATTATACTTATTGTAAGTCT 29696251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8831 CTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATGTGATATTATACTTATTGTAAGTCT 8890

 29696252 GCTTTGATCTAAAGTAATTTTATTTAAAATTATATTCGGAACCCTTTTCAACAGTTATGG 29696311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8891 GCTTTGATCTAAAGTAATTTTATTTAAAATTATATTCGGAACCCTTTTCAACAGTTATGG 8950

 29696312 AGGTATTTCCCAAGGCCGGTACACTAGAATCACTTGAAACTTAAAAAACAAACAATAACC 29696371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8951 AGGTATTTCCCAAGGCCGGTACACTAGAATCACTTGAAACTTAAAAAACAAACAATAACC 9010

 29696372 TGCCTCTGTTCTGATTTTGAGGCCTGGGACGGAAGGGAGCGTGAAAAAAGCCACAAGAAT 29696431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9011 TGCCTCTGTTCTGATTTTGAGGCCTGGGACGGAAGGGAGCGTGAAAAAAGCCACAAGAAT 9070

 29696432 TTTAGATATATAATTAGGGGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTT 29696473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9071 TTTAGATATATAATTAGGGGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTT 9112

Alignment time is 8.66306 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2785] =>      2785 nucs 'mol-32-3004-200970_2785'

Score:        2725
Aligned:      2758        nucs
Identic:      2755 (100%) nucs =>      1136 (100%)      1619 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685671,29686807] EXCISED REGION [29686835,29688455]
 second seq =>  [       1,    1137] EXCISED REGION [    1165,    2785]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        27 nucs [29686808,29686834]
 second seq =>        27 nucs [1138,1164]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29686808,29686808] to [29686835,29686835]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29686807,29686807] to [29686835,29686835]
 second seq =>         1 nucs [1137,1137] to [1165,1165]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29685671 TTTTTACAGAAGCAGAACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTA 29685730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTACAGAAGCAGAACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTA 60

 29685731 CAGAAAAATACACAGTTCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGG 29685790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAAAAATACACAGTTCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGG 120

 29685791 GGCTTGGGTACCATCCACTGAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATA 29685850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      121 GGCTTGGGTACCATCCACTGAGCACGTCCCCAGGAGTTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATA 180

 29685851 TCTTATCAGTAAGTGCATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTT 29685910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTATCAGTAAGTGCATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTT 240

 29685911 AAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTC 29685970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGGAGGGGGATAAGGGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTC 300

 29685971 TCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCA 29686030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCA 360

 29686031 TTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAA 29686090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGATATGTAACTGATGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAA 420

 29686091 CTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACA 29686150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAAAACCGTGTGTGATTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACA 480

 29686151 TTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGG 29686210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAACTTCCTATTTCACCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGG 540

 29686211 GTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACA 29686270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTATGCCCTCCCACTGTCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACA 600

 29686271 ACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCT 29686330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCATTTTTGGAGCATGCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCT 660

 29686331 TTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTC 29686390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTC 720

 29686391 TTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCC 29686450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCC 780

 29686451 TCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCC 29686510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCC 840

 29686511 CATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATC 29686570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATC 900

 29686571 CTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGG 29686630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGG 960

 29686631 GAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTA 29686690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTA 1020

 29686691 AGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGA 29686750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGA 1080

 29686751 ACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACC 29686807
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACC 1137

EXCISED REGION

 29686835 CATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTC 29686894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 CATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTC 1224

 29686895 AGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAA 29686954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAA 1284

 29686955 TGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACA 29687014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 TGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACA 1344

 29687015 CTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCT 29687074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 CTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCT 1404

 29687075 CTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTT 29687134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTT 1464

 29687135 TTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCC 29687194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 TTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCC 1524

 29687195 CTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAAT 29687254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 CTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAAT 1584

 29687255 TGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATG 29687314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 TGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATG 1644

 29687315 TGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTC 29687374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTC 1704

 29687375 TTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTG 29687434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1705 TTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTG 1764

 29687435 CTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGC 29687494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 CTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGC 1824

 29687495 TGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCA 29687554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCA 1884

 29687555 GTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGAT 29687614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGAT 1944

 29687615 GTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAG 29687674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 GTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAG 2004

 29687675 TATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTA 29687734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTA 2064

 29687735 CCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGAT 29687794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGAT 2124

 29687795 TTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCA 29687854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCA 2184

 29687855 TATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAG 29687914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 TATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAG 2244

 29687915 AAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAA 29687974
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 AAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAA 2304

 29687975 GCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAG 29688034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 GCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAG 2364

 29688035 TGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAA 29688094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAA 2424

 29688095 ACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCC 29688154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 ACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCC 2484

 29688155 AGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTT 29688214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 AGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTT 2544

 29688215 CTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGA 29688274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 CTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGA 2604

 29688275 ATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 29688334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 ATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 2664

 29688335 ATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCC 29688394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 ATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCC 2724

 29688395 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGC 29688454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGC 2784

 29688455 T 29688455
          |
     2785 T 2785

Alignment time is 2.67908 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4384] =>      4384 nucs 'mol-32-3164-188903_4384'

Score:        4103
Aligned:      4385        nucs
Identic:      4352 ( 99%) nucs =>      1074 (100%)      3278 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29687376,29688451] EXCISED REGION [29690144,29693442]
 second seq =>  [       1,    1076] EXCISED REGION [    1077,    4384]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29687376 TCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGC 29687435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
        1 TCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTGC 60

 29687436 TAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCT 29687495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCT 120

 29687496 GGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAG 29687555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAG 180

 29687556 TGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATG 29687615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATG 240

 29687616 TGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGT 29687675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGT 300

 29687676 ATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTAC 29687735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTAC 360

 29687736 CACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATT 29687795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATT 420

 29687796 TACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCAT 29687855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCAT 480

 29687856 ATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGA 29687915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGA 540

 29687916 AATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAG 29687975
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAG 600

 29687976 CCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGT 29688035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGT 660

 29688036 GTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAA 29688095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAA 720

 29688096 CTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCA 29688155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCA 780

 29688156 GTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTC 29688215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTC 840

 29688216 TTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAA 29688275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAA 900

 29688276 TGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGA 29688335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGA 960

 29688336 TGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCG 29688395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCG 1020

 29688396 TCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 1076

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 1136

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 1196

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 1256

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 1316

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 1376

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 1436

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 1496

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 1556

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1557 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 1616

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 1676

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 1736

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 1796

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 1856

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 1916

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 1976

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1977 TGACTTCCATCTTGCTATGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 2036

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 2096

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2097 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 2156

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 2216

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 2276

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 2336

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2337 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 2396

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 2456

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 2516

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 2576

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 2636

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 2696

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 2756

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 2816

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 2876

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2877 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 2936

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 29692062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 2996

 29692063 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 29692122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 3056

 29692123 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 29692182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 3116

 29692183 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 29692242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 3176

 29692243 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 29692302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 3236

 29692303 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 29692362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 3296

 29692363 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 29692422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 3356

 29692423 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 29692482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 3416

 29692483 GAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 29692542
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GATCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 3476

 29692543 TTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGA 29692602
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||
     3477 TTGTTGGTCATTAAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGACGTTGGCCGAAGA 3536

 29692603 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 29692662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3537 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAATATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 3596

 29692663 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 29692722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 3656

 29692723 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 29692782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 3716

 29692783 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 29692842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 3776

 29692843 GAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 29692902
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GAATTCCTTTTCTGAAATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 3836

 29692903 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 29692962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 3896

 29692963 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAC 29693022
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3897 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAT 3956

 29693023 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 29693082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 4016

 29693083 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 29693142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 4076

 29693143 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 29693202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 4136

 29693203 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGA 29693262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4137 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATAGTTGTTAGGAGAATTAGA 4196

 29693263 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAGT---------TGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 29693313
          ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||
     4197 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAG-GATAGTCTCTGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 4255

 29693314 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 29693373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 4315

 29693374 ATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 29693433
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 ATAGCAACCGTGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 4375

 29693434 GGTATAAAA 29693442
          |||||||||
     4376 GGTATAAAA 4384

Alignment time is 4.18461 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4628] =>      4628 nucs 'mol-32-317a-132489_4628'

Score:        4375
Aligned:      4628        nucs
Identic:      4605 (100%) nucs =>      1480 (100%)      3125 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29686969,29688451] EXCISED REGION [29690144,29693287]
 second seq =>  [       1,    1483] EXCISED REGION [    1484,    4628]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29686969 GACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTG 29687028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTG 60

 29687029 CCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCAT 29687088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCAT 120

 29687089 CACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCC 29687148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCC 180

 29687149 TCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAG 29687208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAG 240

 29687209 CTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCA 29687268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCA 300

 29687269 TAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACA 29687328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACA 360

 29687329 ATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTAT 29687388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTAT 420

 29687389 TTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAAC 29687448
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAAC 480

 29687449 CCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGC 29687508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGC 540

 29687509 TCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAG 29687568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAG 600

 29687569 CCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGG 29687628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGG 660

 29687629 CTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTG 29687688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTG 720

 29687689 TCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTT 29687748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTT 780

 29687749 CAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAG 29687808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAG 840

 29687809 TTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGG 29687868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGG 900

 29687869 AGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGTG 29687928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      901 AGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGCG 960

 29687929 ACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGAC 29687988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGAC 1020

 29687989 TCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGC 29688048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGC 1080

 29688049 TTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTC 29688108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTC 1140

 29688109 TTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAG 29688168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAG 1200

 29688169 AGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGAC 29688228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGAC 1260

 29688229 TACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAG 29688288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1261 TACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATGGGCAG 1320

 29688289 GGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACC 29688348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACC 1380

 29688349 TGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA 29688408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA 1440

 29688409 TACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 1483

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 1543

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 1603

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 1663

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 1723

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 1783

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 1843

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 1903

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 1963

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1964 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 2023

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 2083

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 2143

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 2203

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 2263

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 2323

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 2383

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2384 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 2443

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 2503

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2504 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 2563

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 2623

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 2683

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 2743

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2744 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 2803

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 2863

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 2923

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 2983

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 ATTGTGACAAGAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 3043

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 3103

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 3163

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 3223

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 3283

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3284 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 3343

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 29692062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 3403

 29692063 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 29692122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 3463

 29692123 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 29692182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 3523

 29692183 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 29692242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 3583

 29692243 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 29692302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 3643

 29692303 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 29692362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 3703

 29692363 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 29692422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 3763

 29692423 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 29692482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 3823

 29692483 GAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 29692542
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 GATCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 3883

 29692543 TTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGA 29692602
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||
     3884 TTGTTGGTCATTAAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGACGTTGGCCGAAGA 3943

 29692603 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 29692662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3944 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAATATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 4003

 29692663 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 29692722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 4063

 29692723 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 29692782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 4123

 29692783 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 29692842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 4183

 29692843 GAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 29692902
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 GAATTCCTTTTCTGAAATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 4243

 29692903 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 29692962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 4303

 29692963 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAC 29693022
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4304 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAT 4363

 29693023 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 29693082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 4423

 29693083 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 29693142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 4483

 29693143 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 29693202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 4543

 29693203 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGA 29693262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4544 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATAGTTGTTAGGAGAATTAGA 4603

 29693263 AATAGGATACAAATATAGTTGAATA 29693287
          |||||||||||||||||||||||||
     4604 AATAGGATACAAATATAGTTGAATA 4628

Alignment time is 4.42815 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5207] =>      5207 nucs 'mol-32-3311-058981_5207'

Score:        4987
Aligned:      5207        nucs
Identic:      5187 (100%) nucs =>      3289 (100%)      1898 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685154,29688451] EXCISED REGION [29690144,29692051]
 second seq =>  [       1,    3298] EXCISED REGION [    3299,    5207]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29685154 GAGAAGCTTAACAGAGAAACATGACAGAAACCAGGACTCTGTCCTCCAGCATCCTGGAAT 29685213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGAAGCTTAACAGAGAAACATGACAGAAACCAGGACTCTGTCCTCCAGCATCCTGGAAT 60

 29685214 ATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAGACAGAGT 29685273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAGACAGAGT 120

 29685274 CAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGGCCGG 29685333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGGCCGG 180

 29685334 GCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGGAACG 29685393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGGAACG 240

 29685394 TCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCGAGTC 29685453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCGAGTC 300

 29685454 CGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAAGTTA 29685513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAAGTTA 360

 29685514 TAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCGAGAG 29685573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      361 TAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCCAGAG 420

 29685574 ATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTATACCG 29685633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTATACCG 480

 29685634 TGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACACGCA 29685693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACACGCA 540

 29685694 AAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGTTCCAGGT 29685753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGTTCCAGGT 600

 29685754 GCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACTGAGC 29685813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACTGAGC 660

 29685814 ACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGCATTCCTG 29685873
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACGTCCCCAGGAGTTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGCATTCCTG 720

 29685874 GATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGGACTG 29685933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGGACTG 780

 29685934 CAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAG 29685993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCACTCAG 840

 29685994 ATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGA 29686053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGATAGA 900

 29686054 TAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTT 29686113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTATGTT 960

 29686114 TCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGA 29686173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCATAGA 1020

 29686174 AACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTT 29686233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCTAGTT 1080

 29686234 TTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGC 29686293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCCCAGC 1140

 29686294 AGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGA 29686353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTGTGGA 1200

 29686354 TCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTC 29686413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCTCCTC 1260

 29686414 TCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTC 29686473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTC 1320

 29686474 CACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAA 29686533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAA 1380

 29686534 GATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACT 29686593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACT 1440

 29686594 GAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACT 29686653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACT 1500

 29686654 TCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGA 29686713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGA 1560

 29686714 GGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCC 29686773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCC 1620

 29686774 AGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGT 29686833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
     1621 AGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCTTAGAAACAAATTCTCCAGCTTCAGT 1680

 29686834 GCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCT 29686893
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCT 1740

 29686894 CAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATA 29686953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATA 1800

 29686954 ATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGAC 29687013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGAC 1860

 29687014 ACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGC 29687073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGC 1920

 29687074 TCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGT 29687133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGT 1980

 29687134 TTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTC 29687193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTC 2040

 29687194 CCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAA 29687253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAA 2100

 29687254 TTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAAT 29687313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAAT 2160

 29687314 GTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATT 29687373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATT 2220

 29687374 CTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTT 29687433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2221 CTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTT 2280

 29687434 GCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAG 29687493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAG 2340

 29687494 CTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATC 29687553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATC 2400

 29687554 AGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGA 29687613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGA 2460

 29687614 TGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAA 29687673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAA 2520

 29687674 GTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTT 29687733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTT 2580

 29687734 ACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGA 29687793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGA 2640

 29687794 TTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTC 29687853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTC 2700

 29687854 ATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACA 29687913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACA 2760

 29687914 GAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAA 29687973
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAA 2820

 29687974 AGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACA 29688033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACA 2880

 29688034 GTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCA 29688093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCA 2940

 29688094 AACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTC 29688153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTC 3000

 29688154 CAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCT 29688213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCT 3060

 29688214 TCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAG 29688273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAG 3120

 29688274 AATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGA 29688333
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATGGTTATAGGCAGGGCATGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGA 3180

 29688334 GATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCC 29688393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCC 3240

 29688394 CGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 3298

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 3358

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 3418

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 3478

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 3538

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 3598

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 3658

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 3718

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 3778

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3779 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 3838

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 3898

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 3958

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 4018

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 4078

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 4138

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 4198

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4199 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 4258

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 4318

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4319 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 4378

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 4438

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 4498

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 4558

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4559 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 4618

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 4678

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 4738

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 4798

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 4858

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 4918

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 4978

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 5038

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 5098

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5099 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 5158

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTG 29692051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTG 5207

Alignment time is 6.2987 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7728] =>      7728 nucs 'mol-32-33a0-042706_7728'

Score:        7281
Aligned:      7732        nucs
Identic:      7682 ( 99%) nucs =>      3233 (100%)      4449 ( 99%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685210,29688451] EXCISED REGION [29690144,29694623]
 second seq =>  [       1,    3242] EXCISED REGION [    3243,    7728]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29685210 GAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAGACA 29685269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAGACA 60

 29685270 GAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGG 29685329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGG 120

 29685330 CCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGG 29685389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGG 180

 29685390 AACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCG 29685449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCG 240

 29685450 AGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAA 29685509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAA 300

 29685510 GTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCG 29685569
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      301 GTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCC 360

 29685570 AGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTAT 29685629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTAT 420

 29685630 ACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACA 29685689
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACA 480

 29685690 CGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGTTCC 29685749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGTTCC 540

 29685750 AGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACT 29685809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACT 600

 29685810 GAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGCATT 29685869
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGCACGTCCCCAGGAGTTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGCATT 660

 29685870 CCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGG 29685929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGG 720

 29685930 ACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCAC 29685989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCAC 780

 29685990 TCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGA 29686049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGA 840

 29686050 TAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTA 29686109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTA 900

 29686110 TGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCA 29686169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCA 960

 29686170 TAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCT 29686229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCT 1020

 29686230 AGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCC 29686289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCC 1080

 29686290 CAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTG 29686349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTG 1140

 29686350 TGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCT 29686409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCT 1200

 29686410 CCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCT 29686469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCT 1260

 29686470 CCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCT 29686529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCT 1320

 29686530 CCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTG 29686589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTG 1380

 29686590 CACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGT 29686649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGT 1440

 29686650 GACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTG 29686709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTG 1500

 29686710 AGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGAC 29686769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGAC 1560

 29686770 AGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAGCTC 29686829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
     1561 AGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCTTAGAAACAAATTCTCCAGCTT 1620

 29686830 CAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAA 29686889
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGTACATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAA 1680

 29686890 ACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGA 29686949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGA 1740

 29686950 GATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAG 29687009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAG 1800

 29687010 TGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTA 29687069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTA 1860

 29687070 AAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCAT 29687129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCAT 1920

 29687130 AGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTT 29687189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTT 1980

 29687190 CCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGAT 29687249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGAT 2040

 29687250 AAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAA 29687309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAA 2100

 29687310 TAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACA 29687369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACA 2160

 29687370 TATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTC 29687429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2161 TATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTC 2220

 29687430 CGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCC 29687489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCC 2280

 29687490 CCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGA 29687549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGA 2340

 29687550 CATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGT 29687609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGT 2400

 29687610 CAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTT 29687669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTT 2460

 29687670 GCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTG 29687729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTG 2520

 29687730 TCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTG 29687789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTG 2580

 29687790 AAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAAT 29687849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAAT 2640

 29687850 TTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGA 29687909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGA 2700

 29687910 GACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGT 29687969
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACAGAAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGT 2760

 29687970 TCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTT 29688029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTT 2820

 29688030 TACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTC 29688089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTC 2880

 29688090 TCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTC 29688149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTC 2940

 29688150 TCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCT 29688209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCT 3000

 29688210 CCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAA 29688269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAA 3060

 29688270 AAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 29688329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 3120

 29688330 CCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAA 29688389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAA 3180

 29688390 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATC 29688449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATC 3240

 29688450 CT 29688451
          ||
     3241 CT 3242

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 3302

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 3362

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 3422

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 3482

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 3542

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 3602

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 3662

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 3722

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3723 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 3782

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 3842

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 3902

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 3962

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 4022

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 4082

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 4142

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4143 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 4202

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 4262

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4263 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 4322

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 4382

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 4442

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 4502

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4503 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 4562

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 4622

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 4682

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 4742

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 4802

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 4862

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 4922

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 4982

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 5042

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5043 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 5102

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 29692062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 5162

 29692063 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 29692122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 5222

 29692123 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 29692182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 5282

 29692183 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 29692242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 5342

 29692243 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 29692302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 5402

 29692303 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 29692362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 5462

 29692363 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 29692422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 5522

 29692423 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 29692482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 5582

 29692483 GAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 29692542
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 GATCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 5642

 29692543 TTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGA 29692602
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||
     5643 TTGTTGGTCATTAAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGACGTTGGCCGAAGA 5702

 29692603 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 29692662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5703 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAATATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 5762

 29692663 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 29692722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 5822

 29692723 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 29692782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 5882

 29692783 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 29692842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 5942

 29692843 GAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 29692902
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 GAATTCCTTTTCTGAAATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 6002

 29692903 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 29692962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 6062

 29692963 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAC 29693022
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6063 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAT 6122

 29693023 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 29693082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 6182

 29693083 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 29693142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 6242

 29693143 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 29693202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 6302

 29693203 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGA 29693262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6303 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATAGTTGTTAGGAGAATTAGA 6362

 29693263 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAGT---------TGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 29693313
          ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||
     6363 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAG-GATAGTCTCTGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 6421

 29693314 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 29693373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6422 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 6481

 29693374 ATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 29693433
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6482 ATAGCAACCGTGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 6541

 29693434 GGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAAGCCCAGGACAGTTAGTAAC 29693493
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6542 GGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAAGCCCAGAACAGTTAGTAAC 6601

 29693494 ATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACATTGCAATTTTTTAATTTTT 29693553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6602 ATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACATTGCAATTTTTTAATTTTT 6661

 29693554 AAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTG 29693613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6662 AAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTG 6721

 29693614 GAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTTATAAGATGACTTGCCAAGT 29693673
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6722 GAGTAATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTTATAAGATGACTTGCCAAGT 6781

 29693674 ATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCT 29693733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6782 ATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCT 6841

 29693734 GGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAAAATACTTGGAAAATTATCA 29693793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6842 GGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAAAATACTTGGAAAATTATCA 6901

 29693794 AAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTTACAACAATCTAAAGGGCAT 29693853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6902 AAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTTACAACAATCTAAAGGGCAT 6961

 29693854 TAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACAGCAAAGTTTGTGGTGCTTTAACTT 29693913
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6962 TAATTCAAGAAAAGCTGCTGAACCTCTATAAGAACAGCAGAGTTTGTGGTGCTTTAACTT 7021

 29693914 GTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCCTTGAAAACAAGCAATTCCC 29693973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7022 GTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCCTTGAAAACAAGCAATTCCC 7081

 29693974 CAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCA 29694033
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7082 CAACCAAACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCA 7141

 29694034 GTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTC 29694093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7142 GTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTC 7201

 29694094 CAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTCTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGC 29694153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7202 CAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTTTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGC 7261

 29694154 AATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATT 29694213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7262 AATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATT 7321

 29694214 GCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACTGATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTT 29694273
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7322 GCCTGCATTTGTCTCCTGATGAATGCTAGAGAAACTGATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTT 7381

 29694274 AGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAAAAATTTCATATAAAGGAAT 29694333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7382 AGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAAAAATTTCATATAAAGGAAT 7441

 29694334 AGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTATAATTCCATCACTCTTATC 29694393
          |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7442 AGAAAATAATACT---AAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTATAATTCCATCACTCTTATC 7498

 29694394 AATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGC 29694453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 AATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGC 7558

 29694454 AGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTCCTGGATTTTTTCCTATGCTCATAG 29694513
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7559 AGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATCTGCTTTGTGTCCTGGATTTTTTCCTATGCTCATAG 7618

 29694514 AGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTTTCTAGACATGTAAAATAAT 29694573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7619 AGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTTTCTAGACATGTAAAATAAT 7678

 29694574 ACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGCAGCTTTTAA 29694623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7679 ACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGCAGCTTTTAA 7728

Alignment time is 8.39889 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3246] =>      3246 nucs 'mol-32-33a0-042706_3246'

Score:        3164
Aligned:      3219        nucs
Identic:      3214 (100%) nucs =>      1595 (100%)      1619 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685210,29686807] EXCISED REGION [29686835,29688455]
 second seq =>  [       1,    1598] EXCISED REGION [    1626,    3246]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        27 nucs [29686808,29686834]
 second seq =>        27 nucs [1599,1625]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29686808,29686808] to [29686835,29686835]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29686807,29686807] to [29686835,29686835]
 second seq =>         1 nucs [1598,1598] to [1626,1626]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29685210 GAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAGACA 29685269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAGACA 60

 29685270 GAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGG 29685329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATTTGG 120

 29685330 CCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGG 29685389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCCTGG 180

 29685390 AACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCG 29685449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGAGCG 240

 29685450 AGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAA 29685509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAGCAA 300

 29685510 GTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCG 29685569
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      301 GTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGACCC 360

 29685570 AGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTAT 29685629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTTTAT 420

 29685630 ACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACA 29685689
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGAACA 480

 29685690 CGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGTTCC 29685749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGTTCC 540

 29685750 AGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACT 29685809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCCACT 600

 29685810 GAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGCATT 29685869
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGCACGTCCCCAGGAGTTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGCATT 660

 29685870 CCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGG 29685929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAGGGG 720

 29685930 ACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCAC 29685989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGTCAC 780

 29685990 TCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGA 29686049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGATGA 840

 29686050 TAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTA 29686109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGATTA 900

 29686110 TGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCA 29686169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCACCA 960

 29686170 TAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCT 29686229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTGTCT 1020

 29686230 AGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCC 29686289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCATGCC 1080

 29686290 CAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTG 29686349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTGCTG 1140

 29686350 TGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCT 29686409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCACCT 1200

 29686410 CCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCT 29686469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCT 1260

 29686470 CCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCT 29686529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCT 1320

 29686530 CCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTG 29686589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTG 1380

 29686590 CACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGT 29686649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGT 1440

 29686650 GACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTG 29686709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTG 1500

 29686710 AGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGAC 29686769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGAC 1560

 29686770 AGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACC 29686807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACC 1598

EXCISED REGION

 29686835 CATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTC 29686894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 CATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTC 1685

 29686895 AGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAA 29686954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAA 1745

 29686955 TGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACA 29687014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACA 1805

 29687015 CTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCT 29687074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 CTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCT 1865

 29687075 CTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTT 29687134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTT 1925

 29687135 TTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCC 29687194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCC 1985

 29687195 CTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAAT 29687254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 CTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAAT 2045

 29687255 TGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATG 29687314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATG 2105

 29687315 TGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTC 29687374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 TGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTC 2165

 29687375 TTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTG 29687434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2166 TTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTG 2225

 29687435 CTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGC 29687494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGC 2285

 29687495 TGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCA 29687554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCA 2345

 29687555 GTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGAT 29687614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGAT 2405

 29687615 GTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAG 29687674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAG 2465

 29687675 TATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTA 29687734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTA 2525

 29687735 CCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGAT 29687794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGAT 2585

 29687795 TTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCA 29687854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCA 2645

 29687855 TATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAG 29687914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAG 2705

 29687915 AAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAA 29687974
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 AAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAA 2765

 29687975 GCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAG 29688034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 GCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAG 2825

 29688035 TGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAA 29688094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAA 2885

 29688095 ACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCC 29688154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 ACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCC 2945

 29688155 AGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTT 29688214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 AGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTT 3005

 29688215 CTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGA 29688274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 CTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGA 3065

 29688275 ATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 29688334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 ATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 3125

 29688335 ATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCC 29688394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 ATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCC 3185

 29688395 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGC 29688454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGC 3245

 29688455 T 29688455
          |
     3246 T 3246

Alignment time is 3.93992 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,   10100] =>     10100 nucs 'mol-32-33f8-098431_10100'

Score:        9462
Aligned:     10111        nucs
Identic:     10034 ( 99%) nucs =>      2010 (100%)      8024 ( 99%)
Gaps:           31 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29686436,29688451] EXCISED REGION [29690144,29698218]
 second seq =>  [       1,    2016] EXCISED REGION [    2017,   10100]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1692 nucs [29688452,29690143]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29688452,29688455] to [29690144,29690147]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688452,29688452] to [29690143,29690143]
 second seq =>         0 nucs

 29686436 GCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATC 29686495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATC 60

 29686496 ACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCT 29686555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCT 120

 29686556 TCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAG 29686615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAG 180

 29686616 CACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGC 29686675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGC 240

 29686676 TGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGG 29686735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGG 300

 29686736 GTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTA 29686795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTA 360

 29686796 GAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAGCTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCAC 29686855
          ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||
      361 GAGTGAGTCACCTTAGAAACAAATTCTCCAGCTTCAGTACATCCTTTAGATAACTGCCAC 420

 29686856 TCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAG 29686915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAG 480

 29686916 TTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTA 29686975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTA 540

 29686976 AATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACA 29687035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACA 600

 29687036 CTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAAT 29687095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAAT 660

 29687096 TTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTG 29687155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTG 720

 29687156 TGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCT 29687215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCT 780

 29687216 GAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATG 29687275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATG 840

 29687276 CCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTG 29687335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTG 900

 29687336 GGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCT 29687395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCT 960

 29687396 GAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAG 29687455
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAG 1020

 29687456 ATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTT 29687515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTT 1080

 29687516 GACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGC 29687575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGC 1140

 29687576 TAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGC 29687635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGC 1200

 29687636 CCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAG 29687695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAG 1260

 29687696 TACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCC 29687755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCC 1320

 29687756 AAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGT 29687815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGT 1380

 29687816 TCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACT 29687875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACT 1440

 29687876 ATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTC 29687935
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1441 ATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAGAAATAGGTTTTGCGACTTCTC 1500

 29687936 CAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAG 29687995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAG 1560

 29687996 CCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAA 29688055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAA 1620

 29688056 ATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGC 29688115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGC 1680

 29688116 AGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAA 29688175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAA 1740

 29688176 TGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGAT 29688235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGAT 1800

 29688236 CCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGG 29688295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGG 1860

 29688296 CGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTC 29688355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTC 1920

 29688356 AGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 29688415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 1980

 29688416 AATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 29688451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCT 2016

EXCISED REGION

 29690144 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 29690203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 AGCTGGGCTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACC 2076

 29690204 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 29690263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 AGGAGTAAGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATT 2136

 29690264 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 29690323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 GACTGGAATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGA 2196

 29690324 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 29690383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 GTCTCAAGAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTC 2256

 29690384 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 29690443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 CCAAGCCTGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCT 2316

 29690444 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 29690503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 TTCGACCCTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGG 2376

 29690504 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 29690563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 CTGAATAGCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATA 2436

 29690564 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 29690623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 ATTTCCTGGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCA 2496

 29690624 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 29690683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2497 GGACCACTCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGC 2556

 29690684 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 29690743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 GCTTTTCTTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTA 2616

 29690744 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 29690803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 GCAAATAATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTA 2676

 29690804 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 29690863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GTTCTTGTTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAA 2736

 29690864 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 29690923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 GGATATGTTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGC 2796

 29690924 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 29690983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TCTTGGGGAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAA 2856

 29690984 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 29691043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 AAAATTAGTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGAT 2916

 29691044 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGC 29691103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2917 TGACTTCCATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGC 2976

 29691104 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 29691163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 ACTTGAAGGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCA 3036

 29691164 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAA 29691223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3037 TAAGAGGGAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAA 3096

 29691224 GTCAGACTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 29691283
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 GTCAGAGTGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGT 3156

 29691284 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 29691343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 AATTTTCTCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAG 3216

 29691344 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 29691403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 TGTTAACAGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATT 3276

 29691404 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTG 29691463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3277 ATGCCAGTGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTG 3336

 29691464 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 29691523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 CCATCCCCAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTT 3396

 29691524 TGGTG-AATAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 29691582
          ||||| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 TGGTGAAATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGC 3456

 29691583 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 29691642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TTTAGGATGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGA 3516

 29691643 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 29691702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 ATTGTGACAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCT 3576

 29691703 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 29691762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GATAGAACAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAA 3636

 29691763 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 29691822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 ATGAAGGGCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCC 3696

 29691823 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 29691882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 TTGGAGAGTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGT 3756

 29691883 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 29691942
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 TAATTCTTTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAA 3816

 29691943 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAA 29692002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3817 TCATTTTAAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGA 3876

 29692003 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 29692062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 TTTTTAAATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTG 3936

 29692063 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 29692122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TAAGAGAGACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGG 3996

 29692123 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 29692182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 CAATAATAGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAG 4056

 29692183 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 29692242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 CTGATGGAGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGG 4116

 29692243 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 29692302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 GAGAAAGTTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGT 4176

 29692303 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 29692362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 GAGCACCGAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAG 4236

 29692363 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 29692422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 ATACTTGGGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAAT 4296

 29692423 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 29692482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 CAGAGTAGTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGA 4356

 29692483 GAGCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 29692542
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 GATCCAAGAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGG 4416

 29692543 TTGTTGGTCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGA 29692602
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||
     4417 TTGTTGGTCATTAAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGACGTTGGCCGAAGA 4476

 29692603 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 29692662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4477 TCTTGTCATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAATATATTGGTTTGAAGGGTTGTC 4536

 29692663 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 29692722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 AGATCGCAGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGG 4596

 29692723 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 29692782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 AAGAGGATGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATAT 4656

 29692783 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 29692842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 TTGGGAGGGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGG 4716

 29692843 GAATTCCTTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 29692902
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 GAATTCCTTTTCTGAAATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGT 4776

 29692903 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 29692962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 TAAAGTGGAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAG 4836

 29692963 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAC 29693022
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4837 TATGAGGCTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACAT 4896

 29693023 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 29693082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 GCTTCTTCACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCA 4956

 29693083 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 29693142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 TCGTTACACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAG 5016

 29693143 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 29693202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 ACACAGAAAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCT 5076

 29693203 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGA 29693262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5077 TTTCCTTATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATAGTTGTTAGGAGAATTAGA 5136

 29693263 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAGT---------TGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 29693313
          ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||
     5137 AATAGGATACAAATATAGTTGAATAG-GATAGTCTCTGTATATTTTAAAATTAATGAAGC 5195

 29693314 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 29693373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 CTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTTAAATTCTTCAACCTTTTAAAAATT 5255

 29693374 ATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 29693433
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 ATAGCAACCGTGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACACCATGGGCCATACTTTGCCTATCCT 5315

 29693434 GGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAAGCCCAGGACAGTTAGTAAC 29693493
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5316 GGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAAGATAAGCCCAGAACAGTTAGTAAC 5375

 29693494 ATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACATTGCAATTTTTTAATTTTT 29693553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 ATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTTCAACATTGCAATTTTTTAATTTTT 5435

 29693554 AAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTG 29693613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 AAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATTTGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTG 5495

 29693614 GAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTTATAAGATGACTTGCCAAGT 29693673
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 GAGTAATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGTGGTTTATAAGATGACTTGCCAAGT 5555

 29693674 ATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCT 29693733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 ATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGATCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCT 5615

 29693734 GGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAAAATACTTGGAAAATTATCA 29693793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 GGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACAATGAAAATACTTGGAAAATTATCA 5675

 29693794 AAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTTACAACAATCTAAAGGGCAT 29693853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 AAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAAGGTTTACAACAATCTAAAGGGCAT 5735

 29693854 TAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACAGCAAAGTTTGTGGTGCTTTAACTT 29693913
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5736 TAATTCAAGAAAAGCTGCTGAACCTCTATAAGAACAGCAGAGTTTGTGGTGCTTTAACTT 5795

 29693914 GTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCCTTGAAAACAAGCAATTCCC 29693973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 GTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGGTATCCTTGAAAACAAGCAATTCCC 5855

 29693974 CAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCA 29694033
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 CAACCAAACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCCTGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCA 5915

 29694034 GTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTC 29694093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 GTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATACATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTC 5975

 29694094 CAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTCTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGC 29694153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5976 CAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGGTTTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGC 6035

 29694154 AATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATT 29694213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6036 AATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTTAGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATT 6095

 29694214 GCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACTGATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTT 29694273
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6096 GCCTGCATTTGTCTCCTGATGAATGCTAGAGAAACTGATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTT 6155

 29694274 AGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAAAAATTTCATATAAAGGAAT 29694333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 AGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCTTTTAAAAATTTCATATAAAGGAAT 6215

 29694334 AGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTATAATTCCATCACTCTTATC 29694393
          |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6216 AGAAAATAATACT---AAAAAAAAAAGGTCACAATCTTCTATAATTCCATCACTCTTATC 6272

 29694394 AATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGC 29694453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6273 AATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTCCCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGC 6332

 29694454 AGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTCCTGGATTTTTTCCTATGCTCATAG 29694513
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6333 AGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATCTGCTTTGTGTCCTGGATTTTTTCCTATGCTCATAG 6392

 29694514 AGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTTTCTAGACATGTAAAATAAT 29694573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6393 AGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTATCTTTTCTAGACATGTAAAATAAT 6452

 29694574 ACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGCAGCTTTTAATAACTTTTCT 29694633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6453 ACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAATAAAGCAGCTTTTAATAACTTTTCT 6512

 29694634 TTTTTTCTTTATTCCAGCCGTCTTTGTGGCAATTTTACATTGGTAAGATTTAGTTTCAGT 29694693
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6513 TTTTTTCTTTATTCCAGCCATCTTTGTGGCAATTTTACATTGGTAAGATTTAGTTTCAGT 6572

 29694694 TTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCACTCTTTGCATACAGTAAAAC 29694753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6573 TTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCCATCACTCTTTGCATACAGTAAAAC 6632

 29694754 AGCTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAATTTATACGTATACTTTGCT 29694813
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6633 AACTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGCACCAATTTATACGTATACTTTGCT 6692

 29694814 TTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAGATGCATTAGGGGAATAGTA 29694873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6693 TTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAAAACAGATGCATTAGGGGAATAGTA 6752

 29694874 ACTTGTGAATTAAAATCGTTTTGC--TACCAAATAATTCACTACACGTTTCTTTAAATAT 29694931
          ||||||||||||||||.|||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6753 ACTTGTGAATTAAAATAGTTTTGCTTTACCAAATAATTCACTACACGTTTCTTTAAATAT 6812

 29694932 CTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAACCCTCCTTTATTTTATGG 29694991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6813 CTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCATTTAAAACCCTCCTTTATTTTATGG 6872

 29694992 TAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGC 29695051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6873 TAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGC 6932

 29695052 TCTGTCTCTCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCACTGCCTCCCAGGCTGAAG 29695111
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6933 TCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTTGACTCACTGCCTCCCAGGCTCAAG 6992

 29695112 TGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGTGTGCACCATCACACCCA 29695171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6993 TGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAATTACAGGTGTGCACCATCACACCCA 7052

 29695172 GCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCA 29695231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7053 GCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCA 7112

 29695232 AACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTA 29695291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7113 AACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTA 7172

 29695292 TGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCTAGGCGCGGTGACTCACG 29695351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7173 TGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGTGATGGCTAGGCGCGGTGACTCACG 7232

 29695352 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCGGATCACAAGGTTAGGAGATCGAG 29695411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7233 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCGGATCACAAGGTTAGGAGATCGAG 7292

 29695412 ACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGG 29695471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7293 ACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGG 7352

 29695472 TGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGGGCTGAAGCAGGAGAATGGCGTGA 29695531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7353 TGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGGGCTGAAGCAGGAGAATGGCGTGA 7412

 29695532 ACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAA 29695591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7413 ACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAA 7472

 29695592 CAGAGCAAGACTCCGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACTTTGGTCATAAAATTTT 29695651
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7473 CAGAGCAAGACTCCGTCCC----AAAAAAAAAAAAAAAAATACTTTGGTCATAAAATTTT 7528

 29695652 AGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGAAGACAAAGATTCTGCAGTGGTTAT 29695711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 AGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGAAGACAAAGATTCTGCAGTGGTTAT 7588

 29695712 ACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAAGCCTGTGTACATTATTTTACAAAA 29695771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 ACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAAGCCTGTGTACATTATTTTACAAAA 7648

 29695772 GTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCTGGAATATTTTATTTTTACCTGTGC 29695831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7649 GTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCTGGAATATTTTATTTTTACCTGTGC 7708

 29695832 TCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATGTGCCCCTATGTTCTGTTGACACAGTGC 29695891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     7709 TCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATCTGCCCCTATGTTCTGTTGACACAGTGC 7768

 29695892 TGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTCGATATTAGAACTGAGGCTGCAATGGTAG 29695951
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     7769 TGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTTGATATTAGAACTGAGGCTGCAATGGTAG 7828

 29695952 GGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATGGCCTACATGTAAAGAACGGTTAGT 29696011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7829 GGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATGGCCTACATGTAAAGAACGGTTAGT 7888

 29696012 GGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATTTTCAACTTCACTGGAAAGTACTGA 29696071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7889 GGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATTTTCAACTTCACTGGAAAGTACTGA 7948

 29696072 CTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACAGCTAATTTTGTTTATCACATATGC 29696131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7949 CTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACAGCTAATTTTGTTTATCACATATGC 8008

 29696132 TCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACTACTAAAAGGTCTTCAAGTACACAC 29696191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8009 TCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACTACTAAAAGGTCTTCAAGTACACAC 8068

 29696192 CTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATGTGATATTATACTTATTGTAAGTCT 29696251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8069 CTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATGTGATATTATACTTATTGTAAGTCT 8128

 29696252 GCTTTGATCTAAAGTAATTTTATTTAAAATTATATTCGGAACCCTTTTCAACAGTTATGG 29696311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8129 GCTTTGATCTAAAGTAATTTTATTTAAAATTATATTCGGAACCCTTTTCAACAGTTATGG 8188

 29696312 AGGTATTTCCCAAGGCCGGTACACTAGAATCACTTGAAACTTAAAAAACAAACAATAACC 29696371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8189 AGGTATTTCCCAAGGCCGGTACACTAGAATCACTTGAAACTTAAAAAACAAACAATAACC 8248

 29696372 TGCCTCTGTTCTGATTTTGAGGCCTGGGACGGAAGGGAGCGTGAAAAAAGCCACAAGAAT 29696431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8249 TGCCTCTGTTCTGATTTTGAGGCCTGGGACGGAAGGGAGCGTGAAAAAAGCCACAAGAAT 8308

 29696432 TTTAGATATATAATTAGGGG-TTTTTTTTTCTTTTTTTTTT---TTTTTTGAGACAGAGT 29696487
          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
     8309 TTTAGATATATAATTAGGGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGAGACAGAGT 8368

 29696488 CTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTCACTTCAACCTCTGC 29696547
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8369 CTCATTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTCACTTCAACCTCTGC 8428

 29696548 CCCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAACCTCCCTAGCAGCCAGGATTACAGACATG 29696607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8429 CCCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAACCTCCCTAGCAGCCAGGATTACAGACATG 8488

 29696608 CACTACCATGGCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGG 29696667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8489 CACTACCATGGCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGG 8548

 29696668 CCAGGCTGGTCTCGAACTCCTCACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTCGGGCTCCCAAAGTGC 29696727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8549 CCAGGCTGGTCTCGAACTCCTCACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTCGGGCTCCCAAAGTGC 8608

 29696728 TGGGATTACAGGCATGAGCCAACGCACCCGGCAACAATTAAGTTTAAAAACCACTGAGTT 29696787
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8609 TGGGATTACAGGCATGAGCCAATGCACCCGGCAACAATTAAGTTTAAAAACCACTGAGTT 8668

 29696788 AAGGAATTTCAGGTGTGTGCCATACTGCATTATAAATGCCTAAAAACATACAAGTTGGTA 29696847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8669 AAGGAATTTCAGGTGTGTGCCATACTGCATTATAAATGCCTAAAAACATACAAGTTAGTA 8728

 29696848 AGCAAATTATAAAAACAATATTATAACAATTTATTATTTTCTTTTTCATGGCTTTCTTAC 29696907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8729 AGCAAATTATAAAAACAATATTATAACAATTTATTATTTTCTTTTTCATGGCTTTCTTAC 8788

 29696908 TTTGCTTATCGCTTATTTTAGTGTTGGTTTTGAAACTTGTTCTCACTGTAATATGATACT 29696967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8789 TTTGCTTATCGCTTATTTTAGTGTTGGTTTTGAAACTTGTTCTCACTGTAATATGATACT 8848

 29696968 TCATTTTTTTTCTAGGTTACATTTAGTAACACTTTTTGAAAATGATCGTCATTTCTCTCA 29697027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8849 TCATTTTTTTTCTAGGTTACATTTAGTAACACTTTTTGAAAATGATCGTCATTTCTCTCA 8908

 29697028 CCTCTCATCTTTGGAACGGGAGATGACTTAGATGACTTCTCCCACTGAAATGGTTAGATT 29697087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8909 CCTCTCATCTTTGGAACGGGAGATGACTTAGATGACTTCTCCCACTGAAATGGTTAGATT 8968

 29697088 TCTTCTTCTAACGAATTAATCTGTGGTTTAAGAATAGTGAGACTATGAGGTAGAAATGTA 29697147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8969 TCTTCTTCTAACGAATTAATCTGTGGTTTAAGAATAGTGAGACTATGAGGTAGAAATGTA 9028

 29697148 TTAGGAATTGAAACCAGCTTTTGGTGAACTGCACTGTTTCGTAAGCTATAACCCAGGTTT 29697207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9029 TTAGGAATTGAAACCAGCTTTTGGTGAACTGCACTGTTTCGTAAGCTATAACCCAGGTTT 9088

 29697208 ATTATTTAAATAGTAAAGTGTTTGAGATTATTTTTCTGTTACTTATTTCATTGTCTCTCA 29697267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9089 ATTATTTAAATAGTAAAGTGTTTGAGATTATTTTTCTGTTACTTATTTCATTGTCTCTCA 9148

 29697268 CCCTTTCCTAATGCAGACTTCTTTTTAAGATAATAAAGATGAATTATAATAGCTGAGGAA 29697327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9149 CCCTTTCCTAATGCAGACTTCTTTTTAAGATAATAAAGATGAATTATAATAGCTGAGGAA 9208

 29697328 GGAGGACAAAGAAAGCACTGAAGAAGTGATAAAGGGGAATGAAATAAGATGTTATCAGAA 29697387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9209 GGAGGACAAAGAAAGCACTGAAGAAGTGATAAAGGGGAATGAAATAAGATGTTATCAGAA 9268

 29697388 ATTGCTTTTTCTTTGGCTACAGTTGGGAGATCCCATGTTTTACTGGGTCTTTTACTGATG 29697447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9269 ATTGCTTTTTCTTTGGCTACAGTTGGGAGATCCCATGTTTTACTGGGTCTTTTACTGATG 9328

 29697448 ATGATTATTATTTGGCTCTCTTTTGATTTCAAGATAATCTCTTTTAAGAGATAA---CTT 29697504
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||
     9329 ATGATTATTATTTGGCTCTCTTTTGATTTCAAGATAATCTCTTTTAAGAGA---CACCTT 9385

 29697505 TTGATATAATTTTTAAATAATTTTCTGTTTTTCGATACTTAATCTTTAAAATGGAGTTCT 29697564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9386 TTGATATAATTTTTAAATAATTTTCTGTTTTTCGATACTTAATCTTTAAAATGGAGTTCT 9445

 29697565 CTGCCGTACACATCTCACATAATTATTGTGGGGAGTAAGTGGGATAGCAAATGCCAAAAT 29697624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9446 CTGCCGTACACATCTCACATAATTATTGTGGGGAGTAAGTGGGATAGCAAATGCCAAAAT 9505

 29697625 TGCAGTTTTACATTTAGAAGACACCACAACCGTCCATCTTCCAGATCTGCTCGCAGCTGG 29697684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9506 TGCAGTTTTACATTTAGAAGACACCACAACCGTCCATCTTCCAGATCTGCTCGCAGCTGG 9565

 29697685 TCGGGGGCCTAGTGAAGCACTGAAACTGACTCTCCTCACTCTAACCATTGCTTTTTGTTT 29697744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9566 TCGGGGGCCTAGTGAAGCACTGAAACTGACTCTCCTCACTCTAACCATTGCTTTTTGTTT 9625

 29697745 AAATTATGGTAAAATTTAGATTTAAATTTCTAAT-AAAAAATTTCAATACGTTTATCATT 29697803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     9626 AAATTATGGTAAAATTTAGATTTAAATTTCTAATAAAAAAATTTCAATACGTTTATCATT 9685

 29697804 TAAGCATACAATTTAGTGACATTAAGTACATTCGTGTTGTCTTGCAACTATTACCACTGT 29697863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9686 TAAGCATACAATTTAGTGACATTAAGTACATTCGTGTTGTCTTGCAACTATTACCACTGT 9745

 29697864 CCACATCCAGAACTTTTTTTGCTATCCCAAACGGAAACTCCACCCACTAAACACTAATCA 29697923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9746 CCACATCCAGAACTTTTTTTGCTATCCCAAACGGAAACTCCACCCACTAAACACTAATCA 9805

 29697924 CACCCAGCTCTATTTTCTGTCTCTATGATTTTGCCTATGCCAGGCCCCTCAGTCACTGCT 29697983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9806 CACCCAGCTCTATTTTCTGTCTCTATGATTTTGCCTATGCCAGGCCCCTCAGTCACTGCT 9865

 29697984 TTTTAATTTTCATCCCTATATTGCCCCTATAAAGTTTCAAAGCATTGGATACATTAACAT 29698043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9866 TTTTAATTTTCATCCCTATATTGCCCCTATAAAGTTTCAAAGCATTGGATACATTAACAT 9925

 29698044 ATGTATGACATCTGAACATTTTAAAGGTATTTCCAAAGACAGAATATAAAATAGTATTAA 29698103
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9926 ATGTATGACATTTGAACATTTTAAAGGTATTTCCAAAGACAGAATATAAAATAGTATTAA 9985

 29698104 ATAAAGAGTGTAACTGTGGCAGAGTCTGGACTTTGGTGACAGACTGCTGGATTCTAATAG 29698163
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     9986 ATAAAGAGTGTAACTGTGGCAGAGTCTGGACTTTGGTGACAGATTGCTGGATTCTAATAG 10045

 29698164 CAGTTCTGTGCTTTATTGTATCATGGCTAGTCAGGTCACCTCTCAGATTCTCAGT 29698218
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10046 CAGTTCTGTGCTTTATTGTATCATGGCTAGTCAGGTCACCTCTCAGATTCTCAGT 10100

Alignment time is 10.5751 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2020] =>      2020 nucs 'mol-32-33f8-098431_2020'

Score:        1971
Aligned:      1993        nucs
Identic:      1991 (100%) nucs =>       372 (100%)      1619 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29686436,29686807] EXCISED REGION [29686835,29688455]
 second seq =>  [       1,     372] EXCISED REGION [     400,    2020]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        27 nucs [29686808,29686834]
 second seq =>        27 nucs [373,399]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29686808,29686808] to [29686835,29686835]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29686807,29686807] to [29686835,29686835]
 second seq =>         1 nucs [372,372] to [400,400]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29686436 GCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATC 29686495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCATTCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATC 60

 29686496 ACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCT 29686555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAGCCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCT 120

 29686556 TCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAG 29686615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTCCTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAG 180

 29686616 CACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGC 29686675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCATGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGC 240

 29686676 TGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGG 29686735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTTGTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGG 300

 29686736 GTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTA 29686795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCTGACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTA 360

 29686796 GAGTGAGTCACC 29686807
          ||||||||||||
      361 GAGTGAGTCACC 372

EXCISED REGION

 29686835 CATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTC 29686894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      400 CATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGAGAAACCTC 459

 29686895 AGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAA 29686954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      460 AGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTGGGAGATAA 519

 29686955 TGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACA 29687014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      520 TGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGAAAGTGACA 579

 29687015 CTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCT 29687074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 CTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGGTTAAAGCT 639

 29687075 CTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTT 29687134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 CTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAGCATAGGTT 699

 29687135 TTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCC 29687194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 TTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCCTTTCCTCC 759

 29687195 CTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAAT 29687254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 CTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACAGATAAAAT 819

 29687255 TGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATG 29687314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAATGAATAATG 879

 29687315 TGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTC 29687374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 TGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGACACATATTC 939

 29687375 TTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACTTTCCGTTG 29687434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      940 TTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCCTGTACTTTCCGTTG 999

 29687435 CTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGC 29687494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 CTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCAGCCCCAGC 1059

 29687495 TGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCA 29687554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 TGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCCAGACATCA 1119

 29687555 GTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGAT 29687614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 GTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATGGGTCAGAT 1179

 29687615 GTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAG 29687674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 GTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACACTTTGCAAG 1239

 29687675 TATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTA 29687734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCACTGTCTTA 1299

 29687735 CCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGAT 29687794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 CCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTACTGAAGAT 1359

 29687795 TTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCA 29687854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTGAATTTTCA 1419

 29687855 TATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAG 29687914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 TATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATCTGAGACAG 1479

 29687915 AAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAA 29687974
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 AAATAGGTTTTGCGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGGGGTTCAAA 1539

 29687975 GCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAG 29688034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCTCTTTACAG 1599

 29688035 TGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAA 29688094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 TGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGTTTCTCCAA 1659

 29688095 ACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCC 29688154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 ACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCTCTCTCTCC 1719

 29688155 AGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTT 29688214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 AGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCTTCTCCCTT 1779

 29688215 CTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGA 29688274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 CTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTAAAAAAAGA 1839

 29688275 ATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 29688334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 ATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 1899

 29688335 ATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCC 29688394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 ATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCC 1959

 29688395 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGC 29688454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGC 2019

 29688455 T 29688455
          |
     2020 T 2020

Alignment time is 2.90238 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6486] =>      6486 nucs 'mol-32-34a8-001466_6486'

Score:        5995
Aligned:      6484        nucs
Identic:      6433 ( 99%) nucs =>      3119 ( 99%)      3314 ( 99%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29690151,29693288] EXCISED REGION [29693290,29696629]
 second seq =>  [       1,    3139] EXCISED REGION [    3149,    6486]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [29693289,29693289]
 second seq =>         9 nucs [3140,3148]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29693289,29693289] to [29693290,29693290]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29690151 CTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTA 29690210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTGCCGGAAACTGACCGGAACAGGGATTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACCAGGAGTA 60

 29690211 AGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGA 29690270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTCAAAATCGGAGGCTCAAGAGCAGTTTCAAGCTGGGCTGTGCCAGAAATTGACTGGA 120

 29690271 ATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAA 29690330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGGGACTATGAGAAAATAGTCGGGCAAACGAGCAGTAAGCGCAAAAGCAGAGTCTCAA 180

 29690331 GAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCC 29690390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCCGTTTCAATCTTCCCACCCCAGCCAGTTGAAGCGGTGGCGCGGGGCCTCCCAAGCC 240

 29690391 TGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACC 29690450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGGAGCCAGAGATGGAGGAAGAAGTGGAAGAGTTGGGGCTGCCTCTGAAGCTTTCGACC 300

 29690451 CTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATA 29690510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAGGCGGAGGGAACCTGCCAGGGGGTGCACGGAGGTCCGCAGTCTGAGATGGCTGAATA 360

 29690511 GCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCT 29690570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTGGATGTGATCGCCAAGACCCTTCTTCTTGGCTGCTTCCAGTTGATCCATAATTTCCT 420

 29690571 GGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCAC 29690630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTGCAGCTCCGGGAAAAGGTGCACGAACTGCAGGCGTGTGCGTTCTCCAGCAGGACCAC 480

 29690631 TCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGAGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTC 29690690
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCGGCATTGGTGAGGAAAGGTCAGGCGAGCCCTAGGAGGGAGCCGCATGGCGCTTTTC 540

 29690691 TTGAGTCTTGAAGGCGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATA 29690750
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGAGTCTTGAAGGAGATCAGTTTAACAAGCAAGGGTTTGTGGGTGTCTAGTAGCAAATA 600

 29690751 ATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTG 29690810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAGCAAGGTCCGAGCTCTGGAAAAGCGTGGCAAGAATCGCCAAGCCCCATTAGTTCTTG 660

 29690811 TTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAAGGATATG 29690870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTAAAACATTTTCAGGGTTTTCTGACAATAGTCACCCCTATGTCACAATAAGGATATG 720

 29690871 TTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGG 29690930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATCTGAATCAGGGCAGCCAATTATCGTACTTAGTAAAAATGATTAGCTGGCTCTTGGG 780

 29690931 GAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTA 29690990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAACAGACATTATGTTTCTCAGCACCTGAAAGCAGAATAAAATGGAGTAAAAAAAAATTA 840

 29690991 GTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGATTGACTTC 29691050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTGAGAACATTTATAATGGAAATAGGGCCAAAGTAGATATATATTGCCCGATTGACTTC 900

 29691051 CATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTAGGAGATTTCCTTATTTATGCACTTGAA 29691110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      901 CATCTTGCTGTGGAGCTTCAGTGCCTACAATTGGGAGATTTCCTTATTTATGCACTTGAA 960

 29691111 GGGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGG 29691170
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGTTTTTCTTCCCCCCATTCCCTTTCCCTCATTCGCTTCATTTTCTGTACCATAAGAGG 1020

 29691171 GAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGCCTGGCCCTAAGTCAGAC 29691230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.
     1021 GAGCTTAAATGTTGTTGCTGTTGGTATAGAATCAGTTTTGAGTCTGGCCCTAAGTCAGAG 1080

 29691231 TGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGTAATTTTC 29691290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGCTGCTGATATAAACTGTCATAGATAAATGTCTCTTAATGTCAATTATTGTAATTTTC 1140

 29691291 TCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAAC 29691350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCACTGTAAGTTGACTGTTGATGTCAAAGTAGAATGTGTCCCCACACTTGAAGTGTTAAC 1200

 29691351 AGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATTATGCCAG 29691410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTACTTGAGGAATGATGGAGGTTCAGACTTGGATTTTATCAGATATCTAATTATGCCAG 1260

 29691411 TGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTACTGCCATCCC 29691470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1261 TGAACACATCCCCCATCCAGAATCAGCGTGGTCCTGGAAACCAAGCTGTATTGCCATCCC 1320

 29691471 CAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAA 29691530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAACACAAGCTCCAGTGCACCAACATCTCGTGCATTGAAGGAACCCTAGAGTTTGGTGAA 1380

 29691531 -TAATGCGTGACTATTGTGACTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGA 29691589
           ||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATAATGCGTGACTATCGTGAGTGTTATGGGAGTTCAGAAGTGTGAACAAATGCTTTAGGA 1440

 29691590 TGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGA 29691649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGAAATGGGAAATGAGATCAGGGAAGACTTTTAGGAAAAGGTGAGATTCGAATTGTGA 1500

 29691650 CAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAA 29691709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAAAGGCTTATATTTGGATATGTGGAGCTGAGATCAATAAGTGTCAGAGGCTGATAGAA 1560

 29691710 CAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGG 29691769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGCATGATCAAAGTCATAGGAGGCAGAAAACATGAAAGCCAAGTAGGCTGAAATGAAGG 1620

 29691770 GCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGA 29691829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCATGAGAAAGAAGTAGCAGGAAATAAGTTGAGAAGGTTGATTGAGACCAGCCTTGGAGA 1680

 29691830 GTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCT 29691889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTAATTCAAGGTTAGGTGTAAGGCATTTGAACTCCATCTGTAGGAAGGCGTTAATTCT 1740

 29691890 TTTCTTTAAAAAAAATTTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTT 29691949
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTCTTTAAAAAAAAATTTTTTAATGAGATGAAATCACATAACATAAAATTAATCATTTT 1800

 29691950 AAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACAATTTTTAA 29692009
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1801 AAAGTGAACAGTTTAGTGGCATATAGTACATTCCCAATACTGACACCAAACGATTTTTAA 1860

 29692010 ATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGA 29692069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAGAGTGACATGATCAGAAGTGAGCTTCAGAGATTAACTTGGCAGCAGTGTGTAAGAGA 1920

 29692070 GACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAAT 29692129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GACTGAGAAAGGAAGCAGAAAGAATAATTGGAAAACTAGCACTAGAATCCAGGCAATAAT 1980

 29692130 AGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGG 29692189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTCTTCACGAGGGTAGCCACAGAAGACATGGAGAGGAGAGGATAGGTGAGAGCTGATGG 2040

 29692190 AGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAG 29692249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGACATTTGACAGGACTGGATGGGTGGCCTGGTAGAAGAGGAGCCTGGGAAGGGAGAAAG 2100

 29692250 TTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACC 29692309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCAGGAATGAAGGTTCAGGAATGAAGGATATGGGAGTTATCTCTGTAGACGTGAGCACC 2160

 29692310 GAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTG 29692369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAAACTTTAAGAATGAGTGAAACTGCCAAGAGAGAAAAGTCAGCAAAGGACAGATACTTG 2220

 29692370 GGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTA 29692429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGAAAACTTTTGGTTTTAAGAGATGAGAGGAAAAGGAAAAACCAGATAAAATCAGAGTA 2280

 29692430 GTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGAGCCAA 29692489
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2281 GTCACAGAAATAGAACTGGGAAAGTTGGTGTGATGAAAGATGAGAGGGGAAGAGATCCAA 2340

 29692490 GAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGG 29692549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAATCTAACCAAATGCTACAGAAAGACACAAAAGAATTGTGATAACTAAAAGGTTGTTGG 2400

 29692550 TCATTTAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGAAGTTGGCCAAAGATCTTGTC 29692609
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
     2401 TCATTAAAAAAAAAAAACTTACGGGAACTTAGTAGAAAGACGTTGGCCGAAGATCTTGTC 2460

 29692610 ATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAGTATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGC 29692669
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTGAACCAGGGGAGAGAGAGACATGGGGAATATATTGGTTTGAAGGGTTGTCAGATCGC 2520

 29692670 AGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGA 29692729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGAGAGTGTTTTAAGGTCTAGGAGTTTTAAAGGTTGAGGGGAAGGATCAAGGGAAGAGGA 2580

 29692730 TGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAG 29692789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGATATTAAGATTCCAAGAGAGGAAATAATTAGTGGAGCAAGTCTTGGAATATTTGGGAG 2640

 29692790 GGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCC 29692849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGGTAGAATTAAAGGCACAAATTTGAGAAGCTAACTGTGGAAAAGAGGAGAGGGAATTCC 2700

 29692850 TTTTCTGAGATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTG 29692909
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTCTGAAATGGCAGGGAGTAGAAAAGTGAGGATTACTATATGGAGAAATGTTAAAGTG 2760

 29692910 GAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGG 29692969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGATAAAAGAAGTCGGGAGTGCTGGCGTCTAATGGTCTTTGTTGCAGTGAAGTATGAGG 2820

 29692970 CTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACACGCTTCTT 29693029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2821 CTGTGGTCACCTTCAGAGGTGAGACTGATAGGATGCCGGGGTCCAGGGGACATGCTTCTT 2880

 29693030 CACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCATCGTTAC 29693089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CACAGCTTGGAAAGGGCATGTGATAAGCCCTTCAAGCATTTAGAATACTGGCATCGTTAC 2940

 29693090 ACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAGACACAGA 29693149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACCATATCATTTTTTTTCAGATGTGGTATGTGGGTTAAGGGAGGGAGTGAGAGACACAGA 3000

 29693150 AAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCTTTTCCTT 29693209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGATTCTGAGCATCTTTGGAAAGCTGGATGAATTTGGAAGTATATTTGACCTTTTCCTT 3060

 29693210 ATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATGGTTGTTAGGAGAATTAGAAATAGGA 29693269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3061 ATATATCATCTGAAGAGTTTTTGCCAGTGTATATAGTTGTTAGGAGAATTAGAAATAGGA 3120

 29693270 TACAAATATAGTTGAATAG 29693288
          |||||||||||||||||||
     3121 TACAAATATAGTTGAATAG 3139

EXCISED REGION

 29693290 TGTATATTTTAAAATTAATGAAGCCTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTT 29693349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 TGTATATTTTAAAATTAATGAAGCCTAATAAACAGTTAATGAGCATCTTTAGAACCTTTT 3208

 29693350 AAATTCTTCAACCTTTTAAAAATTATAGCAACCATGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACAC 29693409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3209 AAATTCTTCAACCTTTTAAAAATTATAGCAACCGTGCTTGCGGACAGTCCAAAAACACAC 3268

 29693410 CATGGGCCATACTTTGCCTATCCTGGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAA 29693469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 CATGGGCCATACTTTGCCTATCCTGGTATAAAACAAGTAAATCTTCTGAGCAGTATTTAA 3328

 29693470 GATAAGCCCAGGACAGTTAGTAACATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTT 29693529
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 GATAAGCCCAGAACAGTTAGTAACATAGGAAAAGATCTGGATAAGCCTGGTTGAGAATTT 3388

 29693530 CAACATTGCAATTTTTTAATTTTTAAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATT 29693589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 CAACATTGCAATTTTTTAATTTTTAAAAATTTAATTTCTTCAATAATTATTGAATTAATT 3448

 29693590 TGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTGGAGTGATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGT 29693649
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 TGCATTTATTTTGTTAGCCAAGTGGAGTAATTTTTGAATTTTTAAGAGGCTATTATTGGT 3508

 29693650 GGTTTATAAGATGACTTGCCAAGTATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGA 29693709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 GGTTTATAAGATGACTTGCCAAGTATATTTGGGATAACCATAAGAAATACCATTATAAGA 3568

 29693710 TCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCTGGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACA 29693769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 TCTCAGAAGGGAGGTGGGACTTCTGGAATAGCCAAGGAAATGCACTCCTCCATGACGACA 3628

 29693770 ATGAAAATACTTGGAAAATTATCAAAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAA 29693829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 ATGAAAATACTTGGAAAATTATCAAAATCATTTTCTTCAAAACTTTGGAAATTAACCAAA 3688

 29693830 GGTTTACAACAATCTAAAGGGCATTAATTCAAGAAAAGCTGCTGAAACTCTATAAGAACA 29693889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3689 GGTTTACAACAATCTAAAGGGCATTAATTCAAGAAAAGCTGCTGAACCTCTATAAGAACA 3748

 29693890 GCAAAGTTTGTGGTGCTTTAACTTGTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCCCCAGCTCCATGG 29693949
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3749 GCAGAGTTTGTGGTGCTTTAACTTGTTCTATTCCCCACTCTTCTCTCTCCAGCTCCATGG 3808

 29693950 TATCCTTGAAAACAAGCAATTCCCCAACCATACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCC 29694009
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3809 TATCCTTGAAAACAAGCAATTCCCCAACCAAACAGGGGCACAGGCTGTGTTTGCAGCTCC 3868

 29694010 TGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCAGTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATAC 29694069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 TGTAAAAGCTCCATACCCAGAGCAGTGTCTCCCAGCTCCCTGGTGAAGTCTTACGTATAC 3928

 29694070 ATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTCCAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGG 29694129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 ATGGGGTGCTGGCACAGGTGACTCCAGATTAGTTTCCTAGGCCATCTAGTAGCTCCTAGG 3988

 29694130 TCTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGCAATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTT 29694189
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 TTTGGGCGCTTGCAAAGAGCTTGCAATTCATCAAGGGTTGAGTTGCACAATGGGGCTTTT 4048

 29694190 AGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATTGCCTGCATTTGTCTCCCGATGAATGCTAGAGAAACT 29694249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4049 AGATGTGCCGCTGAGGAAGTGATTGCCTGCATTTGTCTCCTGATGAATGCTAGAGAAACT 4108

 29694250 GATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTTAGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCT 29694309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 GATCTAGAGTGGCTCCTCTTGGTTAGAATTAGCTGAAGCATACTGTATATATTTACTTCT 4168

 29694310 TTTAAAAATTTCATATAAAGGAATAGAAAATAATACTAAAAAAAAAAAAAGGTCACAATC 29694369
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||
     4169 TTTAAAAATTTCATATAAAGGAATAGAAAATAATACT---AAAAAAAAAAGGTCACAATC 4225

 29694370 TTCTATAATTCCATCACTCTTATCAATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTC 29694429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TTCTATAATTCCATCACTCTTATCAATTACCTGAAGTAAAAAAACTCTCTCAAGTCTCTC 4285

 29694430 CCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGCAGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATTTGCTTTGTGTC 29694489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4286 CCTTTGCTTGTCAAGCCCCGCTGCAGACAGGTAAGCTCTGTTCAAAATCTGCTTTGTGTC 4345

 29694490 CTGGATTTTTTCCTATGCTCATAGAGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTA 29694549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 CTGGATTTTTTCCTATGCTCATAGAGACAGGATTAGCTGGCTGTCTTGCTTTGTGTGCTA 4405

 29694550 TCTTTTCTAGACATGTAAAATAATACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAAT 29694609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TCTTTTCTAGACATGTAAAATAATACATTTGAAATACTTGTTTTAATGGTATTTTATAAT 4465

 29694610 AAAGCAGCTTTTAATAACTTTTCTTTTTTTCTTTATTCCAGCCGTCTTTGTGGCAATTTT 29694669
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4466 AAAGCAGCTTTTAATAACTTTTCTTTTTTTCTTTATTCCAGCCATCTTTGTGGCAATTTT 4525

 29694670 ACATTGGTAAGATTTAGTTTCAGTTTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCC 29694729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 ACATTGGTAAGATTTAGTTTCAGTTTGAAATATTTAAAAACATTTGAATTAAAAATTGCC 4585

 29694730 ATCACTCTTTGCATACAGTAAAACAGCTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGC 29694789
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 ATCACTCTTTGCATACAGTAAAACAACTTCTGGCTATATTTGTAGAACATCTTTATGTGC 4645

 29694790 ACCAATTTATACGTATACTTTGCTTTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAA 29694849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 ACCAATTTATACGTATACTTTGCTTTTTTACAAACCTCATATGTGAAGCAGCATTTACAA 4705

 29694850 AACAGATGCATTAGGGGAATAGTAACTTGTGAATTAAAATCGTTTTGC--TACCAAATAA 29694907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||  ||||||||||
     4706 AACAGATGCATTAGGGGAATAGTAACTTGTGAATTAAAATAGTTTTGCTTTACCAAATAA 4765

 29694908 TTCACTACACGTTTCTTTAAATATCTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCAT 29694967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 TTCACTACACGTTTCTTTAAATATCTAGCTTTTCTAGTGTATTTTGCATGTGTAGTTCAT 4825

 29694968 TTAAAACCCTCCTTTATTTTATGGTAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTC 29695027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 TTAAAACCCTCCTTTATTTTATGGTAATTATATGTTGTTAGTGAAATAACTTTTTTTTTC 4885

 29695028 TTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTT 29695087
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4886 TTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAACCTT 4945

 29695088 GACTCACTGCCTCCCAGGCTGAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAAT 29695147
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 GACTCACTGCCTCCCAGGCTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATTCTGAATAGCTGGAAT 5005

 29695148 TACAGGTGTGCACCATCACACCCAGCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTC 29695207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TACAGGTGTGCACCATCACACCCAGCCAATTTGTTGTATTTTTAGTGGAGACGAGGTTTC 5065

 29695208 ACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCT 29695267
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 ACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAACTCCTGGCCTCAAATGATCCACGTGCCTCAGCCT 5125

 29695268 CCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGT 29695327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACACCCAGCCAGTGAAATAACTTTGGT 5185

 29695328 GATGGCTAGGCGCGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGC 29695387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GATGGCTAGGCGCGGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCGGGC 5245

 29695388 GGATCACAAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTAC 29695447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 GGATCACAAGGTTAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCCCTAC 5305

 29695448 TAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGG 29695507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCAGG 5365

 29695508 GGCTGAAGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGC 29695567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 GGCTGAAGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCCTGCAGTGAGCCCAGATCGC 5425

 29695568 GCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGACTCCGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAA 29695627
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
     5426 GCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGACTCCGTCCC----AAAAAAAAAAAAA 5481

 29695628 AAAATACTTTGGTCATAAAATTTTAGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGA 29695687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 AAAATACTTTGGTCATAAAATTTTAGTAACACCTGCCAATTGGAAATCAGGTAAAAAAGA 5541

 29695688 AGACAAAGATTCTGCAGTGGTTATACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAA 29695747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 AGACAAAGATTCTGCAGTGGTTATACAGAATTAAATGGCTTTGAGCCTTTCAGTGTGCAA 5601

 29695748 GCCTGTGTACATTATTTTACAAAAGTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCT 29695807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 GCCTGTGTACATTATTTTACAAAAGTGTTTATAAAAATTTGTAAAATAATATTTCCCTCT 5661

 29695808 GGAATATTTTATTTTTACCTGTGCTCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATGTGC 29695867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5662 GGAATATTTTATTTTTACCTGTGCTCAGCGATTTCTACCCTTGGGAGGTATGAGATCTGC 5721

 29695868 CCCTATGTTCTGTTGACACAGTGCTGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTCGATA 29695927
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5722 CCCTATGTTCTGTTGACACAGTGCTGCTCTAGACATTTAGTCTGCAGGGAGATTTTGATA 5781

 29695928 TTAGAACTGAGGCTGCAATGGTAGGGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATG 29695987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 TTAGAACTGAGGCTGCAATGGTAGGGAATATTCCTGCAGTTTTTGGTACCCTGGCATATG 5841

 29695988 GCCTACATGTAAAGAACGGTTAGTGGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATT 29696047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 GCCTACATGTAAAGAACGGTTAGTGGAAAACAGGGTTAATGTATGGAACTTTGCTTTATT 5901

 29696048 TTCAACTTCACTGGAAAGTACTGACTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACA 29696107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 TTCAACTTCACTGGAAAGTACTGACTACATAAGTTAGCTATAGCATAATTGTTGACCACA 5961

 29696108 GCTAATTTTGTTTATCACATATGCTCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACT 29696167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 GCTAATTTTGTTTATCACATATGCTCCTTTCTTCACTGCCGACAGCTGCTGAGTTTCACT 6021

 29696168 ACTAAAAGGTCTTCAAGTACACACCTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATG 29696227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 ACTAAAAGGTCTTCAAGTACACACCTGTATTCTTTGGCACTTGAAAGTTGATCCCTTATG 6081

 29696228 TGATATTATACTTATTGTAAGTCTGCTTTGATCTAAAGTAATTTTATTTAAAATTATATT 29696287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 TGATATTATACTTATTGTAAGTCTGCTTTGATCTAAAGTAATTTTATTTAAAATTATATT 6141

 29696288 CGGAACCCTTTTCAACAGTTATGGAGGTATTTCCCAAGGCCGGTACACTAGAATCACTTG 29696347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 CGGAACCCTTTTCAACAGTTATGGAGGTATTTCCCAAGGCCGGTACACTAGAATCACTTG 6201

 29696348 AAACTTAAAAAACAAACAATAACCTGCCTCTGTTCTGATTTTGAGGCCTGGGACGGAAGG 29696407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 AAACTTAAAAAACAAACAATAACCTGCCTCTGTTCTGATTTTGAGGCCTGGGACGGAAGG 6261

 29696408 GAGCGTGAAAAAAGCCACAAGAATTTTAGATATATAATTAGGGGTTTTTTTTTCTTTTTT 29696467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 GAGCGTGAAAAAAGCCACAAGAATTTTAGATATATAATTAGGGGTTTTTTTTTCTTTTTT 6321

 29696468 TTTT---TTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGA 29696524
          ||||   ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 TTTTTTCTTTTTTGAGACAGAGTCTCATTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGA 6381

 29696525 TCTCTGCTCACTTCAACCTCTGCCCCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAACCTCCC 29696584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 TCTCTGCTCACTTCAACCTCTGCCCCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAACCTCCC 6441

 29696585 TAGCAGCCAGGATTACAGACATGCACTACCATGGCTGGCTAATTT 29696629
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6442 TAGCAGCCAGGATTACAGACATGCACTACCATGGCTGGCTAATTT 6486

Alignment time is 6.8585 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29678451,29700143] =>     21693 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3491] =>      3491 nucs 'mol-32-34d4-073985_3491'

Score:        3468
Aligned:      3490        nucs
Identic:      3488 (100%) nucs =>      3418 (100%)        70 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29685147,29688566] EXCISED REGION [29688569,29688638]
 second seq =>  [       2,    3421] EXCISED REGION [    3422,    3491]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [29688567,29688568]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [29688567,29688582] to [29688569,29688584]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [29688567,29688567] to [29688568,29688568]
 second seq =>         0 nucs

 29685147 AGAGAGAGAGAAGCTTAACAGAGAAACATGACAGAAACCAGGACTCTGTCCTCCAGCATC 29685206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 AGAGAGAGAGAAGCTTAACAGAGAAACATGACAGAAACCAGGACTCTGTCCTCCAGCATC 61

 29685207 CTGGAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAG 29685266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       62 CTGGAATATGGACAGAGTCTGAGGGAGGACCCTCGTCATGGCCATTTCCCTCCCAGAAAG 121

 29685267 ACAGAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATT 29685326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      122 ACAGAGTCAGATCTGACTTACCTTCCTGAGACCAGAGATTGAGGACTCAGGAGTTGAATT 181

 29685327 TGGCCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCC 29685386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      182 TGGCCGGGCACAACGGCAGTCAATCCGTTCCCCTCCAGAAGACGGTGGCCTACAGGGCCC 241

 29685387 TGGAACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGA 29685446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 TGGAACGTCTTCAGGGGGTGCCTCCCCTATAAGCCCGCCGTCTGTCCAGGGGAGCCCAGA 301

 29685447 GCGAGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAG 29685506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 GCGAGTCCGGTCTTCACCCACTAGCAGATCTCACTGGGGCCTCCAAATGTTGTAACCAAG 361

 29685507 CAAGTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGA 29685566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 CAAGTTATAGAGAAACGCCACACTCTGAGACTAATTCAGGAGTTCTTTTATTGCCAGTGA 421

 29685567 CCGAGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTT 29685626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 CCGAGAGATGGCTAGAGCTCAAAATTCTCTCAGCCCCGAAGAAGGGGATAGATTTCTTTT 481

 29685627 TATACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGA 29685686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 TATACCGTGGTCTAAATAGGGCAGGGGGAGCCTAGCTGAAGCAATTTTTACAGAAGCAGA 541

 29685687 ACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGT 29685746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 ACACGCAAAAAGTTAAAAAAAATTAATGGTTACAGAGATAGTTACAGAAAAATACACAGT 601

 29685747 TCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCC 29685806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 TCCAGGTGCAGGGGCTTAAACTATCACAAAGAGATAAATGCAGGGGCTTGGGTACCATCC 661

 29685807 ACTGAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGC 29685866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 ACTGAGCACGTCCCCAGGAGCTGCTGGTACAGCTTGCCTCAATATCTTATCAGTAAGTGC 721

 29685867 ATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAG 29685926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 ATTCCTGGATGTGCTTGGAGTCAGCTTGCACTAGTTATTCCCTTAAGGGAGGGGGATAAG 781

 29685927 GGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGT 29685986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 GGGACTGCAAGTGAAGAGGCTAAAATGGAGTCTGTCCAGCTCTCTCAGCTGAGAGAGAGT 841

 29685987 CACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGA 29686046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 CACTCAGATTAAAACAGGATAGGGTATCCCAGATAGACAGTTCATTAGATATGTAACTGA 901

 29686047 TGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGA 29686106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 TGATAGATAGACTACTTTTATGGCTCCTCCCATGTCCATTAAAACTAAAACCGTGTGTGA 961

 29686107 TTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCA 29686166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 TTATGTTTCCTTGAATCATTACCACTTTTTTCTTCCTAAGCACATTAACTTCCTATTTCA 1021

 29686167 CCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTG 29686226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 CCATAGAAACTTTCAATATTTTTTCAGAAACTCAGGGCTTTTGGGTATGCCCTCCCACTG 1081

 29686227 TCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCAT 29686286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 TCTAGTTTTTGTGCTTTCTTTTGGAGTCCTCTCTGGAGGCCACAACCATTTTTGGAGCAT 1141

 29686287 GCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTG 29686346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 GCCCAGCAGAGGAAGTGGTGGATCTAGTTCCTCCTGGAATGGCTTTGGTGATGCTCTTTG 1201

 29686347 CTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCA 29686406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 CTGTGGATCAACTACAATCTGCTCCAACACCCCTTCCTCCTTTCTTTTTTCTTTGCCTCA 1261

 29686407 CCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCAT 29686466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 CCTCCTCTCCCACATCTCTATTCCTCCCAGCCTTTCTTCACTCCTCTGTACGCCCATCAT 1321

 29686467 TCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAG 29686526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 TCTCCTCCACCTCCAAGGTCACAGGCATCACCATGTAAGCCTCCCATCCCAGAAAACCAG 1381

 29686527 CCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTC 29686586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 CCTCCAAGATAACCCCATGATCCCCACCTTCTTGTATGTACATCCTTGTGTAGGACCCTC 1441

 29686587 CTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCA 29686646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 CTGCACTGAGCAGGGCTGAGCTGTGTTAGCACTGGGATATATGGGAATGACAAGGTGGCA 1501

 29686647 TGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTT 29686706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 TGTGACTTCCAAAGTTAATGTCACTTTGCTGTCTTGGATTACTAAGCCAGCTGTCATGTT 1561

 29686707 GTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCT 29686766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 GTGAGGAGGCTCAAGTTGTCCTATGGGGGGTCCTGTAGCAAGGAACTGAGCTCTCCTGCT 1621

 29686767 GACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAG 29686826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 GACAGCCAGCAGTACCTTCCCAACCATTAGAGTGAGTCACCCTAGAAGCAAATTCTCCAG 1681

 29686827 CTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGA 29686886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 CTCCAGTGCATCCTTTAGATAACTGCCACTCTGGTCACTATCTTATCTACAACCTCATGA 1741

 29686887 GAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTG 29686946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 GAAACCTCAGCCAGAACCACCCAGCTAAGTTGCCTCTGAATTCCTGAGCCACAGAAACTG 1801

 29686947 GGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGA 29687006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 GGAGATAATGTTTACTGTTTAAGACTTTAAATTTGGAGTAATTTGCTATTCAGCCATAGA 1861

 29687007 AAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGG 29687066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 AAGTGACACTCATTTCTTCGTGCCCGACACTGCTGTCTCTGTGGTTTCACATCCCTGTGG 1921

 29687067 TTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAG 29687126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 TTAAAGCTCTCCAAGGGCTCATCACTAATTTCAGGATAAAATCTAAATCCCTTAACATAG 1981

 29687127 CATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCC 29687186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 CATAGGTTTTTTACAAACTGCCTCCTGTGTGCCTCTCAGCCCCATCCGGCCCACTCTGCC 2041

 29687187 TTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACA 29687246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 TTTCCTCCCTGCATCACTCCAGCTACTCTGAAACATACTGCACCTTCCTAAATGCGGACA 2101

 29687247 GATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAAT 29687306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 GATAAAATTGACAGACTTTTCATAGGATGCCCAGTGAAATTTGAATTTCAGATAAACAAT 2161

 29687307 GAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGAC 29687366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 GAATAATGTGTGTGGTTATACAATATTTGGGACATACTTATACTAAAAATATTGCATGAC 2221

 29687367 ACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACT 29687426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 ACATATTCTTCAAAGTTATTATTTTATCTGAAATTCACATTTAATAGGGCATCTTGTACT 2281

 29687427 TTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCA 29687486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 TTCCGTTGCTAAATCTGGCAACCCTACAGATGTGAGCTGTTCACTTTCAGCTCCTGCTCA 2341

 29687487 GCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCC 29687546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 GCCCCAGCTGGATCACTACAGCTCCCCTTGACTAATTCCCTGCCCTACAAGACTCGGCCC 2401

 29687547 AGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATG 29687606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 AGACATCAGTGCCCCTAGAAAGCCTAGGCTAACTTTTCTGCACAACACACACCTAGGATG 2461

 29687607 GGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACAC 29687666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 GGTCAGATGTGCCTGCTGCAGGCTCCCGCCCACCTGTCACACCTCTCTCACACCACACAC 2521

 29687667 TTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCA 29687726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 TTTGCAAGTATTTGTTCACCTGTCTCCAGTACTAGACTCTGAGCTTCTTGAGGTCAGGCA 2581

 29687727 CTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTA 29687786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 CTGTCTTACCACGACGTGGCTTCAGTGCCAAAAACATAGTATATTCACAGTTTACAATTA 2641

 29687787 CTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTG 29687846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 CTGAAGATTTACTCTAAGCTAGTTGCTGTTCTAAGATGTTCTGCATATATCAACTCATTG 2701

 29687847 AATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATATCCCACTTTTACTGGGGAGGAATC 29687906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2702 AATTTTCATATCAAGCCAAAGGAGGTACTATTAATAACCCACTTTTACTGGGGAGGAATC 2761

 29687907 TGAGACAGAAATAGGTTTTGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGG 29687966
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 TGAGACAGAAATAGGTTTGGTGACTTCTCCAGTGTCATTTGAAAATGGCAGGGAAGTTGG 2821

 29687967 GGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCT 29688026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 GGTTCAAAGCCAGAAGTCTGACTCCAGAGCCCACCCTCTAACAAGCTAGACATATTGCCT 2881

 29688027 CTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGT 29688086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 CTTTACAGTGTATGATAAGTGCTTGCCAAATGCATGTAAGAACTGACTATCCAGCTAAGT 2941

 29688087 TTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCT 29688146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 TTCTCCAAACTAGATAACTGTCTTTAAGCAGGGACCTTGCTGCCTGTGCCCCTCCCAGCT 3001

 29688147 CTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCT 29688206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 CTCTCTCCAGTCACCACTACAGAGCACAATGCATGGTGCCTTCTTCACAAGCAAATACCT 3061

 29688207 TCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTA 29688266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 TCTCCCTTCTTCAAATCCTGACTACAGATCCAGGGTAGCACCATATACCACACCTCCCTA 3121

 29688267 AAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 29688326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 AAAAAAGAATGGTTATAGGCAGGGCGTGGCGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 3181

 29688327 AGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGC 29688386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 AGGCCGAGATGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGC 3241

 29688387 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTA 29688446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTATACGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTA 3301

 29688447 ATCCTAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAATCTGGGAGGCGAAGGTTG 29688506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 ATCCTAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAATCTGGGAGGCGAAGGTTG 3361

 29688507 CAGTGTGCCGAGATCGCGCCACTGCACCCCAGCTTGGATGTCAGAGTGAGACCCCATCTC 29688566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 CAGTGTGCCGAGATCGCGCCACTGCACCCCAGCTTGGATGTCAGAGTGAGACCCCATCTC 3421

EXCISED REGION

 29688569 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGGTTACAGCATGTGCCTTAGAAATATAAGCCAAGAGAGCACT 29688628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGGTTACAGCATGTGCCTTAGAAATATAAGCCAAGAGAGCACT 3481

 29688629 GTGGTTAATA 29688638
          ||||||||||
     3482 GTGGTTAATA 3491

Alignment time is 4.27352 s

