
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   7145] =>      7145 nucs 'mol-32-1ef5-007655_7145'

Score:        6912
Aligned:      7156        nucs
Identic:      7124 (100%) nucs =>      1532 (100%)      5592 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1856696,1858228] EXCISED REGION [1858252,1863869]
 second seq =>  [      1,   1533] EXCISED REGION [   1534,   7145]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        23 nucs [1858229,1858251]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [1858229,1858252] to [1858252,1858275]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1856696 ATTTCTCCAGAGAAGAGCCACACACGGCCAATGAGCTCATGCCAGGACGCTGGGCACCGG 1856755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCTCCAGAGAAGAGCCACACACGGCCAATGAGCTCATGCCAGGACGCTGGGCACCGG 60

  1856756 GGAAACGTGAACCGCAACTGAGCGAGACACGGAGCCGCCTCGCGCCGACGGCCACTGAGA 1856815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAACGTGAACCGCAACTGAGCGAGACACGGAGCCGCCTCGCGCCGACGGCCACTGAGA 120

  1856816 GCAACCACCATGAGCTGCTGGGTCGAGGGGAATCAGACCCTCCGCGTCGCTGGCGGGAGC 1856875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAACCACCATGAGCTGCTGGGTCGAGGGGAATCAGACCCTCCGCGTCGCTGGCGGGAGC 180

  1856876 GTGTGTGGTGCGGCCACTGCAAACAGCCGGCAGCTCCTCAAAGAGCTGGACGCAGAGTCC 1856935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTGTGGTGCGGCCACTGCAAACAGCCGGCAGCTCCTCAAAGAGCTGGACGCAGAGTCC 240

  1856936 ATGGGCCCAGCACCCGCCCGGGCGCGCAGCCAGGGGGTCTGAGCGCAGTCCACGCACAGA 1856995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGGCCCAGCACCCGCCCGGGCGCGCAGCCAGGGGGTCTGAGCGCAGTCCACGCACAGA 300

  1856996 CCTCGGCACGGGTGTCCACGGCAACACGATCCCATCACCAACAGATGGAACGCGGAACCA 1857055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCGGCACGGGTGTCCACGGCAACACGATCCCATCACCAACAGATGGAACGCGGAACCA 360

  1857056 GCCCTCAACCGCCGGAGGGAGACACAAAACCGGGTTTACCCGTCAACACCGCTTCGTACA 1857115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCCTCAACCGCCGGAGGGAGACACAAAACCGGGTTTACCCGTCAACACCGCTTCGTACA 420

  1857116 GCCGAACTCTGATACACGCTGCCACGCGGGCAAACCCCGAAAACACGCCCAGCCAGTCAC 1857175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCGAACTCTGATACACGCTGCCACGCGGGCAAACCCCGAAAACACGCCCAGCCAGTCAC 480

  1857176 AGAGACCTGTCGACACAACTCCGTGCCCAGGGGATGTCCTGGAGGGGCACGTCAGGGCTC 1857235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGACCTGTCGACACAACTCCGTGCCCAGGGGATGTCCTGGAGGGGCACGTCAGGGCTC 540

  1857236 AGGGCCAGTGGAAATGTGCCACGGTTAGACTGGTCGCGGCTGCGCACTGAATGTGCCGGG 1857295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGGCCAGTGGAAATGTGCCACGGTTAGACTGGTCGCGGCTGCGCACTGAATGTGCCGGG 600

  1857296 AGGAACGGAACGGTAGACTAATGGAGCGCTAGACGTGAGGGTGAGCTGCATGTGTGTGCA 1857355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGAACGGAACGGTAGACTAATGGAGCGCTAGACGTGAGGGTGAGCTGCATGTGTGTGCA 660

  1857356 TCGGAGCTCAGGAAACCGTTTTGGAAAGCGCTCCCTCCGCCCGGCAGCCCTCTGGGAACC 1857415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCGGAGCTCAGGAAACCGTTTTGGAAAGCGCTCCCTCCGCCCGGCAGCCCTCTGGGAACC 720

  1857416 CTCCCCAGGAGCCACAGGGCGGCCTGGCTCCATCCAGCTTGGTCCTGGCAGCTCCCCTGT 1857475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCCCCAGGAGCCACAGGGCGGCCTGGCTCCATCCAGCTTGGTCCTGGCAGCTCCCCTGT 780

  1857476 CCACCGGAGCATGCCTGGGCTGGGCCCCGCCCTGATGGTGTCGCCCCTCCCCTCACCACC 1857535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCACCGGAGCATGCCTGGGCTGGGCCCCGCCCTGATGGTGTCGCCCCTCCCCTCACCACC 840

  1857536 TTTGGAGCACGTGCTGCCCCAGAGGCCCTGCGACCTGACCTGTTCCTGCACCTCCTGTTT 1857595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGGAGCACGTGCTGCCCCAGAGGCCCTGCGACCTGACCTGTTCCTGCACCTCCTGTTT 900

  1857596 CTCAGGAGCCGTCCCCGTGCCCTCCCCCTGCCCTCCCCCTGTTTCTGCTGCCTTAGTACA 1857655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCAGGAGCCGTCCCCGTGCCCTCCCCCTGCCCTCCCCCTGTTTCTGCTGCCTTAGTACA 960

  1857656 TTTGGCCTTGTCATAGTTCAACACAAACCATTTTTAAACAAAAACAAGAGAAACCACTCT 1857715
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTGGCCTTGTCACAGTTCAACACAAACCATTTTTAAACAAAAACAAGAGAAACCACTCT 1020

  1857716 GACCTTTCGCTGAGAAAATCCTTTCACTTCTGCCTTCTGCTCTTGATTCTGAATTTCTCC 1857775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACCTTTCGCTGAGAAAATCCTTTCACTTCTGCCTTCTGCTCTTGATTCTGAATTTCTCC 1080

  1857776 CCCTAAATGTCAGAGGGGCTGATTCTCCTGCAGCTGCCGGGCAGGGGTGGGGAGGCAGTG 1857835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCTAAATGTCAGAGGGGCTGATTCTCCTGCAGCTGCCGGGCAGGGGTGGGGAGGCAGTG 1140

  1857836 TGGGAAGAAGTCTCCTCAGCCGGCCCTTCGCCCTCCTCCCAACCCAGGGCTGGCAACCTG 1857895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGAAGAAGTCTCCTCAGCCGGCCCTTCGCCCTCCTCCCAACCCAGGGCTGGCAACCTG 1200

  1857896 GCTGGGCCTGACGCACTGTGGTGCAGACTCTGGCCAGGCTGGACCAGAGAATAGCTGTTT 1857955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTGGGCCTGACGCACTGTGGTGCAGACTCTGGCCAGGCTGGACCAGAGAATAGCTGTTT 1260

  1857956 TCCAGGCACCCGCCTTCCCCGGCCCTCAGAGGCTGGCAGGCTTTGGGAGCCTGGCCGTTC 1858015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCAGGCACCCGCCTTCCCCGGCCCTCAGAGGCTGGCAGGCTTTGGGAGCCTGGCCGTTC 1320

  1858016 ATTTCTAAAAATATTTTTTTTTAGAGACGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 1858075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTCTAAAAATATTTTTTTTTAGAGACGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 1380

  1858076 GTGGCATGATAACGGGTCACTCAGCCTCGAGCTCCCGGACTCAAGTGATCCACCTCAGCC 1858135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGGCATGATAACGGGTCACTCAGCCTCGAGCTCCCGGACTCAAGTGATCCACCTCAGCC 1440

  1858136 TCCTGAGCAGTTGGAATGACAGGCATGTGCCAGCACACCTGGCTAATTTTTAAATTTTTT 1858195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCTGAGCAGTTGGAATGACAGGCATGTGCCAGCACACCTGGCTAATTTTTAAATTTTTT 1500

  1858196 TGAGAGATAGATAGACTTTAGCTATTTTGCCCA 1858228
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGAGATAGATAGACTTTAGCTATTTTGCCCA 1533

EXCISED REGION

  1858252 GGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTGACGTGATCCTCCTGCCTCAGCTGCCCACGACGTGAG 1858311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 GGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTGACGTGATCCTCCTGCCTCAGCTGCCCACGACGTGAG 1593

  1858312 GATTACAGGCGTGAGCTCTGATCATTCTTTATTTGAAACAGGTGCACCCCGCCAGCGTCA 1858371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 GATTACAGGCGTGAGCTCTGATCATTCTTTATTTGAAACAGGTGCACCCCGCCAGCGTCA 1653

  1858372 GCAAGACAGCTGCTCCCAATGGTAGGCCGGGCAACCCACTCACGGCTCCTACAGCACCTC 1858431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 GCAAGACAGCTGCTCCCAATGGTAGGCCGGGCAACCCACTCACGGCTCCTACAGCACCTC 1713

  1858432 CTCTCTGCCGGCCTCAGGCGGCTCTGGAAGAATGATGCCCTAATATACCGCGCTGCCCTC 1858491
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||
     1714 CTCTCTGCCGGCCTCAGGCGGCTCTGGAAGAATGACGCCCTAAGATACCGCGCTGCCCTC 1773

  1858492 CAGGTGGGGGTGGGGGTGGACGGAGACAGGCAGGAGTAACCAGTGCTACTCTCCCAGCTC 1858551
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1774 CAGGTGGGGGTGGGGGTGGACGGAGACAGGCAGGAGTGACCAGTGCTACTCTCCCAGCTC 1833

  1858552 AAACCCCACACGAAGGCAGACCCAGCGTTTGCAAAACACCAGCCCCCGGTGAACAAGTCG 1858611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 AAACCCCACACGAAGGCAGACCCAGCGTTTGCAAAACACCAGCCCCCGGTGAACAAGTCG 1893

  1858612 ACCTGCTGTGCAGCCCACCTCTGACTCCGTTTCCCCCAGCGTACCCAGCCACATTGGGAG 1858671
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1894 ACCTGCCGTGCAGCCCACCTCTGACTCCGTTTCCCCCAGTGTACCCAGCCACATTGGGAG 1953

  1858672 GCTCCACCTCGGTCTAACGCTCCGGCATTAGCAGGACCTGCTGAATGAGTGGCGCCGGGC 1858731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 GCTCCACCTCGGTCTAACGCTCCGGCATTAGCAGGACCTGCTGAATGAGTGGCGCCGGGC 2013

  1858732 CCATCCATCTCTGCCATCGCTGCTCAGCCCTCTGCCATGTTCAAATATCACACAGTCCCC 1858791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 CCATCCATCTCTGCCATCGCTGCTCAGCCCTCTGCCATGTTCAAATATCACACAGTCCCC 2073

  1858792 AGGTACCTCGTAAATCACTGTAATTACGGGCTGCTCACTTAAAATTAAACTGCAATTTTT 1858851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 AGGTACCTCGTAAATCACTGTAATTACGGGCTGCTCACTTAAAATTAAACTGCAATTTTT 2133

  1858852 TAAAAAGCAAATTGCCAGTAAGACACGTTGGCTGTGGCTGGAAATACTTCTGAGGCTGCC 1858911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2134 TAAAAAGCAAATTGCCAGTAAGACACGTTGGCTGTGGCTGGAAATATTTCTGAGGCTGCC 2193

  1858912 TGCGCGCAGGCTCTGGCTTCCTCTCCCTCTGCCTGGCCGGCCCGAGCTGCCACCTGTCTA 1858971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TGCGCGCAGGCTCTGGCTTCCTCTCCCTCTGCCTGGCCGGCCCGAGCTGCCACCTGTCTA 2253

  1858972 GTCTGCGCACATAGCGGCCCTGTGGCTGGCGGGCGCCCTGGGGGAGACTGAGACACTCAC 1859031
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 GTCTGCGCACATAGCGGCCGTGTGGCTGGCGGGCGCCCTGGGGGAGACTGAGACACTCAC 2313

  1859032 TCTTAATGAAGACACTCGCGGCGTCCATTGTGGCCACTGCACTCTAGTCCAGACCCTCGC 1859091
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TCTTAATGAAGACACTCGCGGCGTCCACTGTGGCCACTGCACTCTAGTCCAGACCCTCGC 2373

  1859092 TGGCCTGGCCTGGGGCTCACCTGCCCCTCTGGAAGCAGAGAGGGCCTGCCCTGGAGGGCC 1859151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 TGGCCTGGCCTGGGGCTCACCTGCCCCTCTGGAAGCAGAGAGGGCCTGCCCTGGAGGGCC 2433

  1859152 GGGGACCTCTGCAGCATGTCCGTGGAACACGTGGGCCAGGGATTGTGTGCCCGGCCCCCA 1859211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2434 GGGGACCTCTGCAGCATGTCCGTGGAACACGTGGGCCAGGGAGTGTGTGCCCGGCCCCCA 2493

  1859212 TTCCAGCTCTGCCACGTGAGCAGTGCTCACTCGGTGCCTAGGGCTGACTAGTCTTACTAA 1859271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TTCCAGCTCTGCCACGTGAGCAGTGCTCACTCGGTGCCTAGGGCTGACTAGTCTTACTAA 2553

  1859272 GCGCTGGTCCCACCATCCCCTGAGCCGAGCCCCATGGTGTCCCAGCGGGCACGGACAAGA 1859331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 GCGCTGGTCCCACCATCCCCTGAGCCGAGCCCCATGGTGTCCCAGCGGGCACGGACAAGA 2613

  1859332 GGCACGGAGTGAGGGAGGGGTGGGGGCTGACAAAGGGCTTGGAGAGCAGAGACAGCGCAC 1859391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 GGCACGGAGTGAGGGAGGGGTGGGGGCTGACAAAGGGCTTGGAGAGCAGAGACAGCGCAC 2673

  1859392 ACCACCAACTCTCTCCACACACCACTTTCTCCACACACCACCAACCGCAGGATGTGGTGG 1859451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 ACCACCAACTCTCTCCACACACCACTTTCTCCACACACCACCAACCGCAGGATGTGGTGG 2733

  1859452 GGCTCGGAGGCCAAGGGGGAAGTGTGAGGGATTCCTGTCAAGAACAAGACCCCCTGCTGC 1859511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 GGCTCGGAGGCCAAGGGGGAAGTGTGAGGGATTCCTGTCAAGAACAAGACCCCCTGCTGC 2793

  1859512 TGAGGGTCCAAGAGAAACTCCATGAACTGGGAAACTCGAGGGGAGGAAGCTAGAGATGGA 1859571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 TGAGGGTCCAAGAGAAACTCCATGAACTGGGAAACTCGAGGGGAGGAAGCTAGAGATGGA 2853

  1859572 ATGAAGGAAGCCCTGAATCCTGGCTCAAACAAGGAAAGCTGAAATAATGCAGTAAAATGA 1859631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 ATGAAGGAAGCCCTGAATCCTGGCTCAAACAAGGAAAGCTGAAATAATGCAGTAAAATGA 2913

  1859632 GAAGACACGCAGGAAATGGAAACGATGCTACTTCGAGATACTGGGAAGTTATGTGAATGC 1859691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 GAAGACACGCAGGAAATGGAAACGATGCTACTTCGAGATACTGGGAAGTTATGTGAATGC 2973

  1859692 TGTTCATCTGTGGGGTGGCGTGAAGAGGTGGAGGCCACACCAGTGGACATCAAAACCAGA 1859751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 TGTTCATCTGTGGGGTGGCGTGAAGAGGTGGAGGCCACACCAGTGGACATCAAAACCAGA 3033

  1859752 AACCAGTCAGAGAAAGACAACAGGAAAACTGTAAGTGCCTGGAAATTAAACAGCACACTT 1859811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 AACCAGTCAGAGAAAGACAACAGGAAAACTGTAAGTGCCTGGAAATTAAACAGCACACTT 3093

  1859812 CTAAGTAATCCACGAGTCAAATGGGATGCCTCGAAGGAAATAAAAAAGAGAACAGAATGG 1859871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 CTAAGTAATCCACGAGTCAAATGGGATGCCTCGAAGGAAATAAAAAAGAGAACAGAATGG 3153

  1859872 AAACAAGAATACAGCATAATGAAATTTGCCAGACGCACCCAAGGCAGTGCTTAGAGGGAA 1859931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 AAACAAGAATACAGCATAATGAAATTTGCCAGACGCACCCAAGGCAGTGCTTAGAGGGAA 3213

  1859932 ACGGACAGCACTCAATGCCTGTATCAGGAAAGGAGAAAGATCTCAAATCGCTTCTCTAAA 1859991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 ACGGACAGCACTCAATGCCTGTATCAGGAAAGGAGAAAGATCTCAAATCGCTTCTCTAAA 3273

  1859992 TTCCTACTTCAAGAAACGAAGGGAAAAACAAGCCCGAAGCAGGAGGAGGAAATAATACAA 1860051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 TTCCTACTTCAAGAAACGAAGGGAAAAACAAGCCCGAAGCAGGAGGAGGAAATAATACAA 3333

  1860052 GTAGGAATGAACAGGAAAACAAAAGTTATTAAAACCAAAAACTGCTTCTTTAAAAAATAG 1860111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 GTAGGAATGAACAGGAAAACAAAAGTTATTAAAACCAAAAACTGCTTCTTTAAAAAATAG 3393

  1860112 CAATAAGGCCGGCCAGGAGCA-GGGCTCACACCTGTAATCTTTGCACTTTGGGAGGCCAA 1860170
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 CAATAAGGCCGGCCAGGAGCAGGGGCTCACACCTGTAATCTTTGCACTTTGGGAGGCCAA 3453

  1860171 GGTGAGAGGATCACTTGAGCCCTGGAGTTTGAGACCAGCCTGGACAACACAGTGAGACCC 1860230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 GGTGAGAGGATCACTTGAGCCCTGGAGTTTGAGACCAGCCTGGACAACACAGTGAGACCC 3513

  1860231 CATCCCTATAATCAATCAGCCAGGTGTGGTGGCATACACCTGTAGCCCCAGGTATGTGGG 1860290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 CATCCCTATAATCAATCAGCCAGGTGTGGTGGCATACACCTGTAGCCCCAGGTATGTGGG 3573

  1860291 ATCACGTGGGCCTAGGAGTTTGAGGCTGTAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAG 1860350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 ATCACGTGGGCCTAGGAGTTTGAGGCTGTAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAG 3633

  1860351 CCTGGGCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAATTTGTTAGAAAGACCAGCAACGATAAA 1860410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 CCTGGGCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAATTTGTTAGAAAGACCAGCAACGATAAA 3693

  1860411 TTGATAAACCCCTGGCAAAACTGACAAAGATTAAAAAGGGGGAACGCCTGTAATCCCAGC 1860470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 TTGATAAACCCCTGGCAAAACTGACAAAGATTAAAAAGGGGGAACGCCTGTAATCCCAGC 3753

  1860471 ACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAA 1860530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 ACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAA 3813

  1860531 CACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGGGTG 1860590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 CACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGGGTG 3873

  1860591 CCTGTAGTCCCAGCTCCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCGG 1860650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 CCTGTAGTCCCAGCTCCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCGG 3933

  1860651 AGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACACAGCGAGACTC 1860710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 AGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACACAGCGAGACTC 3993

  1860711 CATCTCAAAAAAAAAAAAAGGGG---GGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGA 1860767
          ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 CATCTCAAAAAAAAAAAA-----GGCGGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGA 4048

  1860768 AATGGAAATATTATAATAGATCCAGAAGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACA 1860827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 AATGGAAATATTATAATAGATCCAGAAGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACA 4108

  1860828 AAACTTGATGCTCATAACAAACTGGATGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGT 1860887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 AAACTTGATGCTCATAACAAACTGGATGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGT 4168

  1860888 GCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTCCTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAAT 1860947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 GCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTCCTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAAT 4228

  1860948 TAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTCCCAGATGGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACAT 1861007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4229 TAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTCCCAGATAGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACAT 4288

  1861008 TAAATATGAATTAATACCAATTTTACACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAA 1861067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 TAAATATGAATTAATACCAATTTTACACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAA 4348

  1861068 CACCTTTCCACTATGAACCCTGTACTGAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAA 1861127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 CACCTTTCCACTATGAACCCTGTACTGAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAA 4408

  1861128 ATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTAGCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGG 1861187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 ATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTAGCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGG 4468

  1861188 AATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTATCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTG 1861247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 AATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTATCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTG 4528

  1861248 TACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGAAAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGC 1861307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 TACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGAAAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGC 4588

  1861308 TAAAGGAAGACAATGATATGATCCTATTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATC 1861367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 TAAAGGAAGACAATGATATGATCCTATTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATC 4648

  1861368 TCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAAAGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTA 1861427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 TCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAAAGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTA 4708

  1861428 AAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCTCACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCC 1861487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 AAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCTCACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCC 4768

  1861488 CTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCTTTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTC 1861547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 CTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCTTTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTC 4828

  1861548 CTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAAAAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAAC 1861607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 CTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAAAAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAAC 4888

  1861608 AGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACATGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGC 1861667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 AGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACATGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGC 4948

  1861668 AGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGGCCCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAA 1861727
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 AGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGGCTCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAA 5008

  1861728 CTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACGAAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAAT 1861787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 CTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACGAAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAAT 5068

  1861788 TAACCACATTTCTATAAAGCAATTGCAAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATA 1861847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 TAACCACATTTCTATAAAGCAATTGCAAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATA 5128

  1861848 ATTTACAGAACATCTTAAATACTCGGGTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGT 1861907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 ATTTACAGAACATCTTAAATACTCGGGTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGT 5188

  1861908 TTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATGAAAGGAATCGAAAGGAATAAAAAGAATGTTTGTA 1861967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5189 TTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATGAAAGGAATCGAAAGGAATCAAAAGAATGTTTGTA 5248

  1861968 TAAATAGATACAATGTTTATGAACTGGAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTG 1862027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 TAAATAGATACAATGTTTATGAACTGGAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTG 5308

  1862028 ATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGTCCAAACCTCAGCATATATATATATATTTTTT-TT 1862086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||
     5309 ATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGTCCAAACCTCAGCATATATATATATAT-----ATT 5363

  1862087 TTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTT 1862146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 TTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTT 5423

  1862147 GGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATCTTCCTGCCTCAACGTGCCAAGTAGCTGTAACTACAG 1862206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5424 GGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATCTTCCTGCCTCAATGTGCCAAGTAGCTGTAACTACAG 5483

  1862207 GTGCGCACCACCACTCATGGCTGTATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCC 1862266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 GTGCGCACCACCACTCATGGCTGTATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCC 5543

  1862267 CAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGT 1862326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 CAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGT 5603

  1862327 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAG 1862386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     5604 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAGCA-TTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAG 5662

  1862387 AGAGACACAAGATTATTCTAAAATGTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAG 1862446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5663 AGAGACACAAGATTATTCTAAAATGTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAG 5722

  1862447 GAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGAACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCCTA 1862506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5723 GAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGAACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCCTA 5782

  1862507 CGTCAGACAGACATGGCTGGGGCAGCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACAGA 1862566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5783 CGTCAGACAGACATGGCTGGGGCAGCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACAGA 5842

  1862567 ACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCACAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATATT 1862626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5843 ACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCACAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATATT 5902

  1862627 ATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCGTTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAATC 1862686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5903 ATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCGTTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAATC 5962

  1862687 AATCAATGTAATCTGCTATATCAACAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTAAT 1862746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5963 AATCAATGTAATCTGCTATATCAACAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTAAT 6022

  1862747 CGATACGGAAAAGTCACAGAAAAGTCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTG 1862806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6023 CGATACGGAAAAGTCACAGAAAAGTCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTG 6082

  1862807 TCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAGGAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTG 1862866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6083 TCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAGGAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTG 6142

  1862867 ACCGAAACCTCACATCTCAAATAAAATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGTAA 1862926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6143 ACCGAAACCTCACATCTCAAATAAAATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGTAA 6202

  1862927 AACACAGAATTATGTTAAAAAAGAAATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGACAC 1862986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6203 AACACAGAATTATGTTAAAAAAGAAATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGACAC 6262

  1862987 TCAACACCAAAGCACAATCCACAGAATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAAAA 1863046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6263 TCAACACCAAAGCACAATCCACAGAATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAAAA 6322

  1863047 TTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACGAC 1863106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6323 TTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACGAC 6382

  1863107 AGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCATCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCTGG 1863166
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     6383 AGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCATCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCCGG 6442

  1863167 CACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGTCTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGC 1863226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6443 CACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGTCTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGC 6502

  1863227 CCCACAGGGCAAGGCCCACATCTGTCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCACCA 1863286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6503 CCCACAGGGCAAGGCCCACATCTGTCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCACCA 6562

  1863287 GGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAGAGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAGGG 1863346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6563 GGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAGAGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAGGG 6622

  1863347 CAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGACACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCA 1863406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6623 CAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGACACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCA 6682

  1863407 CCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCCGCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTTCAT 1863466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6683 CCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCCGCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTCCAT 6742

  1863467 GCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTG 1863526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6743 GCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTG 6802

  1863527 AAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGT 1863586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6803 AAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGT 6862

  1863587 GGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGACGG 1863646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6863 GGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGACGG 6922

  1863647 AGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGC 1863706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6923 AGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGC 6982

  1863707 TGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACCAC 1863766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6983 TGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACCAC 7042

  1863767 CTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGACT 1863826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7043 CTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGACT 7102

  1863827 TGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGC 1863869
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7103 TGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGC 7145

Alignment time is 7.55238 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   2242] =>      2242 nucs 'mol-32-1ef5-016686_2242'

Score:        2231
Aligned:      2242        nucs
Identic:      2241 (100%) nucs =>      1378 (100%)       863 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1854665,1856043] EXCISED REGION [1863577,1864439]
 second seq =>  [      1,   1379] EXCISED REGION [   1380,   2242]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      7533 nucs [1856044,1863576]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1854665 CCCACCTTTGAGGAGTCTGGGTGGAGGCGGCAGTCCCGGGCGTGGCCCTGGCCCAGGCCC 1854724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCACCTTTGAGGAGTCTGGGTGGAGGCGGCAGTCCCGGGCGTGGCCCTGGCCCAGGCCC 60

  1854725 ACAGTTCGCAGGCAGGTGGCAGGGTCCACGCCTCCCTGCTCCTTCCTCCCCCTGCCCCCG 1854784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGTTCGCAGGCAGGTGGCAGGGTCCACGCCTCCCTGCTCCTTCCTCCCCCTGCCCCCG 120

  1854785 CCCCCACCATGGGTCTCCCTCCGTCTCAGCATTGGAGGCTCTGGAGCAAGGCCGTTCCCC 1854844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCCCACCATGGGTCTCCCTCCGTCTCAGCATTGGAGGCTCTGGAGCAAGGCCGTTCCCC 180

  1854845 TGGCTGCACCAGCTCCCCTCTGCTGGGCTCAGATAGCGGCAGCTGCACCTCTGAATCATC 1854904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCTGCACCAGCTCCCCTCTGCTGGGCTCAGATAGCGGCAGCTGCACCTCTGAATCATC 240

  1854905 GGCTCATATTCCCCATGGCTGGAGAAGGCCGGGGCCGCCGAGTTGGGAGGAGGGGACTCG 1854964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTCATATTCCCCATGGCTGGAGAAGGCCGGGGCCGCCGAGTTGGGAGGAGGGGACTCG 300

  1854965 CTCTCCAGCCTCCAGGGCCAGATGCTCCATCTGCCCCATGGGGCGGAGCCACCCCACACC 1855024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTCCAGCCTCCAGGGCCAGATGCTCCATCTGCCCCATGGGGCGGAGCCACCCCACACC 360

  1855025 CCTGGGTTTGGTGCTGCCAGCCGGGTCCAGGCCCTCTCTTGGCCCTGGAGAGATGGGCAC 1855084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTGGGTTTGGTGCTGCCAGCCGGGTCCAGGCCCTCTCTTGGCCCTGGAGAGATGGGCAC 420

  1855085 AGAGGGCAGTCTCCCCTCGATGCACCCTTATCTGTGAGGACAGTCCCCCCAGCCCCTGTG 1855144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAGGGCAGTCTCCCCTCGATGCACCCTTATCTGTGAGGACAGTCCCCCCAGCCCCTGTG 480

  1855145 CCTCCATCCGGGTTCCATCAGCAAAGGGAAGTCCTGGAGCTGGGGCCCGGCCTTGAGGCA 1855204
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      481 CCTCCATCCGGGTTCCATCAGCAAAGGGAAGTCCTGGAGCTGGAGCCCGGCCTTGAGGCA 540

  1855205 GAGCTGGAAGCTGCTACGCGGAGGGGCCTCAGCCCATGGTGGTGGGGAGGGCACCCCAGC 1855264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGCTGGAAGCTGCTACGCGGAGGGGCCTCAGCCCATGGTGGTGGGGAGGGCACCCCAGC 600

  1855265 CACCCTTGGTCCCAGCTGCCACCTGTGCACTCCCTGAGCAGAGATGCCTGACTCACCCTA 1855324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACCCTTGGTCCCAGCTGCCACCTGTGCACTCCCTGAGCAGAGATGCCTGACTCACCCTA 660

  1855325 ACGTTGTCCGGGCTGCAGATGGCGGCGGCTGCTGAGGGAGCTCCTTCCCCTCCTCCCGCC 1855384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACGTTGTCCGGGCTGCAGATGGCGGCGGCTGCTGAGGGAGCTCCTTCCCCTCCTCCCGCC 720

  1855385 CACCCTGCTAGGGCTAGGCCACAGATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGAAGA 1855444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACCCTGCTAGGGCTAGGCCACAGATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGAAGA 780

  1855445 TTTTATTTCACAAGGTGAGGAACCCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTCCGG 1855504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTATTTCACAAGGTGAGGAACCCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTCCGG 840

  1855505 GACGCATGGGGTCTGCACGTGGAGAGGGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACGTAG 1855564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACGCATGGGGTCTGCACGTGGAGAGGGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACGTAG 900

  1855565 GTCCCAGCGTGTCTGTCAGTCATGCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGTGCA 1855624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCCCAGCGTGTCTGTCAGTCATGCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGTGCA 960

  1855625 CCCAGCCTGTGGCTGGCGGGGCAGGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTCCGG 1855684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCAGCCTGTGGCTGGCGGGGCAGGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTCCGG 1020

  1855685 CTATGCCCCCGAGCCTGCAGGCTACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGTGAG 1855744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTATGCCCCCGAGCCTGCAGGCTACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGTGAG 1080

  1855745 CGAGCTGAGGAAGGCAGGGATGCTGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTCGCC 1855804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CGAGCTGAGGAAGGCAGGGATGCTGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTCGCC 1140

  1855805 CACGGTGTGTGAGAACTCTGTCTCCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGTGGC 1855864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACGGTGTGTGAGAACTCTGTCTCCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGTGGC 1200

  1855865 CTGCGGGGCAGTCAAGAAAGAGACAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTCTCC 1855924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGCGGGGCAGTCAAGAAAGAGACAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTCTCC 1260

  1855925 CCTCCCTCCCTACACAGCCCCTCCAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTGGAC 1855984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCCCTCCCTACACAGCCCCTCCAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTGGAC 1320

  1855985 AGGGGTAGATGCGTCCTCAACCCTGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACTGA 1856043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGGGTAGATGCGTCCTCAACCCTGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACTGA 1379

EXCISED REGION

  1863577 GGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGT 1863636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGT 1439

  1863637 GGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCT 1863696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCT 1499

  1863697 GACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGC 1863756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGC 1559

  1863757 CTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTC 1863816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTC 1619

  1863817 AATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCG 1863876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCG 1679

  1863877 GGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAA 1863936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAA 1739

  1863937 CCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAG 1863996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAG 1799

  1863997 CCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACC 1864056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACC 1859

  1864057 GGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCG 1864116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCG 1919

  1864117 GGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAG 1864176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAG 1979

  1864177 TGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCC 1864236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCC 2039

  1864237 CGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGG 1864296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGG 2099

  1864297 CGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAAT 1864356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAAT 2159

  1864357 ACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAA 1864416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAA 2219

  1864417 TCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAA 1864439
          |||||||||||||||||||||||
     2220 TCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAA 2242

Alignment time is 2.19913 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   5856] =>      5856 nucs 'mol-32-1f00-179713_5856'

Score:        5746
Aligned:      5858        nucs
Identic:      5847 (100%) nucs =>      2205 (100%)      3642 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1852385,1854596] EXCISED REGION [1854602,1858247]
 second seq =>  [      1,   2210] EXCISED REGION [   2211,   5856]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [1854597,1854601]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [1854597,1854606] to [1854602,1854611]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [1854597,1854598] to [1854600,1854601]
 second seq =>         0 nucs

  1852385 CGGCAGCCAGGGCTGGGCAGGGACAGGGGACCGGTGGCGCCTCCTGGGGTCCTCACACGC 1852444
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGGCAGCCAGGGCTGGGCAGGGACAGGGTACCGGTGGCGCCTCCTGGGGTCCTCACACGC 60

  1852445 TGTTTCTTTCCCATTCCACCTGGCAGACGCGTGAAGAGGATTTGACAAACTCGTGGGGAA 1852504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTTCTTTCCCATTCCACCTGGCAGACGCGTGAAGAGGATTTGACAAACTCGTGGGGAA 120

  1852505 GGTTTATTAAATCAGCCCGCAAGGGACACATGTTATCAGAGACCTCTGCTCTCTCCAGCC 1852564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTTATTAAATCAGCCCGCAAGGGACACATGTTATCAGAGACCTCTGCTCTCTCCAGCC 180

  1852565 CACCCAGACACGTCCCTTGGGGGTGTGAGGGCTGCTCCAGCCCCGCCTCTGCCTCTTCCC 1852624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCCAGACACGTCCCTTGGGGGTGTGAGGGCTGCTCCAGCCCCGCCTCTGCCTCTTCCC 240

  1852625 GGGGAAAGGAAAATCCCATGATCAGAGCAGAGCCGCCTGCCGGCCGGAGCTGGTGCATCT 1852684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGGAAAGGAAAATCCCATGATCAGAGCAGAGCCGCCTGCCGGCCGGAGCTGGTGCATCT 300

  1852685 CAGCGCTGGCTGGGGGGCCCAGCCTCTTGTAGACCCTCCCGGGGAGCCGGCAGGGGAGGT 1852744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCGCTGGCTGGGGGGCCCAGCCTCTTGTAGACCCTCCCGGGGAGCCGGCAGGGGAGGT 360

  1852745 GCCGGCCCCGGGCTCCCCGAAAGGAAGGTGCTTTGGAGATCCCTGGCTGTGGAGGGGGAA 1852804
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCGGCCCTGGGCTCCCCGAAAGGAAGGTGCTTTGGAGATCCCTGGCTGTGGAGGGGGAA 420

  1852805 GGGGAGACCAAGGCAGGAGGGTACCCCTGGTCCGGATGCGGATGTGGACGGGGAAGGGGA 1852864
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGGAGACCAAGGCAGGAAGGTACCCCTGGTCCGGATGCGGATGTGGACGGGGAAGGGGA 480

  1852865 GACCAAGTCAGGAAGGCGCCCCGGGTCCAGATGCAGACTTGAGATTGCACCTGGGGACAG 1852924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACCAAGTCAGGAAGGCGCCCCGGGTCCAGATGCAGACTTGAGATTGCACCTGGGGACAG 540

  1852925 GGGGCTTGTTTGTGGCCCTTTAGCTGCCAAGCCCGTCTTGATGCCACAGAAGCCGGGGTG 1852984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGGCTTGTTTGTGGCCCTTTAGCTGCCAAGCCCGTCTTGATGCCACAGAAGCCGGGGTG 600

  1852985 GAAGGCAGGTGTGGGCCGTGGCCCAGGCTGCAGCAACCAGAAGGTTCAGCAGCCTCAGAT 1853044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAGGCAGGTGTGGGCCGTGGCCCAGGCTGCAGCAACCAGAAGGTTCAGCAGCCTCAGAT 660

  1853045 CTTGGGAAGGTGACACAAGGGCTTGGGGACAGTGGGTGGAGTCCTGTGGCCATGAGGGTC 1853104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGGGAAGGTGACACAAGGGCTTGGGGACAGTGGGTGGAGTCCTGTGGCCATGAGGGTC 720

  1853105 TGTGGCTGTGGGAACCCCTGCTGCGGTTTTTCTGGTGTGGTTGGAGGCCGTGACCATTGC 1853164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGGCTGTGGGAACCCCTGCTGCGGTTTTTCTGGTGTGGTTGGAGGCCGTGACCATTGC 780

  1853165 TCCTCAGCCACCAGGTTATGCATCGGTGATGGCAGAGCCAGTGGTCCCAGGGTCCCGGAG 1853224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCTCAGCCACCAGGTTATGCATCGGTGATGGCAGAGCCAGTGGTCCCAGGGTCCCGGAG 840

  1853225 CTGAGGGGTGTGTGTCCACCGGGGGAGTCAGTGGGGTGTGTGTCCACCGGGGGAGCCGTG 1853284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGAGGGGTGTGTGTCCACCGGGGGAGTCAGTGGGGTGTGTGTCCACCGGGGGAGCCGTG 900

  1853285 GGGTGTGTGTCCACCGGGGGAGTCAGTGGGGTGTGTGTCCACCGCGGGAGTCAGTGGGGT 1853344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGTGTGTGTCCACCGGGGGAGTCAGTGGGGTGTGTGTCCACCGCGGGAGTCAGTGGGGT 960

  1853345 GTGTGTCCACGGGGGGAGCCGTGCCAGTGCCTCCTGAGGCTGAGCCCACCTCCCCACTCT 1853404
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
      961 GTGTGTCCACGGGGGGAGCCGTGCCAGTGCCTCCTGAGG--GAGCCCACCTCCCCACTCT 1018

  1853405 CCATTTTCTCAGCCTCTGCCCCAAATCCTCCTGGTAAGTTCCATTCCCACCTGGGCTGGC 1853464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CCATTTTCTCAGCCTCTGCCCCAAATCCTCCTGGTAAGTTCCATTCCCACCTGGGCTGGC 1078

  1853465 TGGAGTTTAGCTCTGGCCTTGCAATCAAGACCACCACCTTTGGGGGGGCTCCTGCCTGGA 1853524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TGGAGTTTAGCTCTGGCCTTGCAATCAAGACCACCACCTTTGGGGGGGCTCCTGCCTGGA 1138

  1853525 CCTGGACCCGGCTGTCGCCCACCAGGGACCACTCCCCCTGCTGCCCCTGGGGCAGAGGCT 1853584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CCTGGACCCGGCTGTCGCCCACCAGGGACCACTCCCCCTGCTGCCCCTGGGGCAGAGGCT 1198

  1853585 GCGGGCTTCTGTTCTGCCTGAGGGCTCAGCCCTCTGTCCTCCCCCAGGATGGCCCCTGAC 1853644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GCGGGCTTCTGTTCTGCCTGAGGGCTCAGCCCTCTGTCCTCCCCCAGGATGGCCCCTGAC 1258

  1853645 CTCCAGCCTCTGGGCCCACCCTATCCCCGCTTCCTACCTGGTGGGGTCCCATCCGCCTTC 1853704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CTCCAGCCTCTGGGCCCACCCTATCCCCGCTTCCTACCTGGTGGGGTCCCATCCGCCTTC 1318

  1853705 AGGGTCCAGTCGGACCCCATCTCCTAAATTGCCTTGACAAGAACCGGCCCCTGTCCCTCT 1853764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AGGGTCCAGTCGGACCCCATCTCCTAAATTGCCTTGACAAGAACCGGCCCCTGTCCCTCT 1378

  1853765 GTGTTCACAGCCAGGGTGGTGCTGGCTCCCTGGTCCTGAAGGGCCAGCTGAGTGGGGCTC 1853824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GTGTTCACAGCCAGGGTGGTGCTGGCTCCCTGGTCCTGAAGGGCCAGCTGAGTGGGGCTC 1438

  1853825 GGTCCCAGAAGCCCCAGGTCCATGAGTGTGTGTGGGGGCCGTCACCGGGGCTGCTGGCGG 1853884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GGTCCCAGAAGCCCCAGGTCCATGAGTGTGTGTGGGGGCCGTCACCGGGGCTGCTGGCGG 1498

  1853885 TGAAAGGGTGGGTGGAGGCAGGCACCTCGGCTCTCAGGCTGTGGCACGGCAGGAATGGTG 1853944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TGAAAGGGTGGGTGGAGGCAGGCACCTCGGCTCTCAGGCTGTGGCACGGCAGGAATGGTG 1558

  1853945 ATGGGGAAAGCAGGGTGGTGGGGGCTGGGGTGCCAGGACCCTGGGATTGACCTGGGGGGT 1854004
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ATGGGGAAAGCAGGGTGGTAGGGGCTGGGGTGCCAGGACCCTGGGATTGACCTGGGGGGT 1618

  1854005 ATTGGCAGAGGACAGCCCAAAGGCTAGACCAGGGCCCCGTTCTGATTATCTGTGGCTGTG 1854064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATTGGCAGAGGACAGCCCAAAGGCTAGACCAGGGCCCCGTTCTGATTATCTGTGGCTGTG 1678

  1854065 GGAGCAGCATCCTGTGTGGGCCCCGCTGTGCTCAGCTGAGACATGGGGCTGTGGCCACCC 1854124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GGAGCAGCATCCTGTGTGGGCCCCGCTGTGCTCAGCTGAGACATGGGGCTGTGGCCACCC 1738

  1854125 CAGGGCTGCGATGGGGCCGAACAGTCTGGGACTCCGGGTTTCAGTGTGAGAGCCAGTGGT 1854184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1739 CAGGGCTGCGATGGGGCCGAACAGTCTGGGACTCGGGGTTTCAGTGTGAGAGCCAGTGGT 1798

  1854185 TGCCCAGCTCTGGCGGGGCTGTGTGTCTGTCTGAGGCACATGTGTGTCCAGGGGCCGAGC 1854244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TGCCCAGCTCTGGCGGGGCTGTGTGTCTGTCTGAGGCACATGTGTGTCCAGGGGCCGAGC 1858

  1854245 CAGGGCAGAACAACCTTCACGTGACATGGAGACATCTCACTTCTCTTGTCTGCACAGCCT 1854304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CAGGGCAGAACAACCTTCACGTGACATGGAGACATCTCACTTCTCTTGTCTGCACAGCCT 1918

  1854305 GCGTCCCGCACAAAGCCTCGTGAAGCTGAACCCCATGGGCCTCCGAGGACCCCTCCGTCA 1854364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GCGTCCCGCACAAAGCCTCGTGAAGCTGAACCCCATGGGCCTCCGAGGACCCCTCCGTCA 1978

  1854365 AACCCCTTGCGCCCAGGAACAGAAGCCAACACTGAAAGGTGACATTGGGGGGTAGGGAGA 1854424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AACCCCTTGCGCCCAGGAACAGAAGCCAACACTGAAAGGTGACATTGGGGGGTAGGGAGA 2038

  1854425 GGACACGCAGGAGGAATCAGGGGCTTCCTGTCTCGAGGCTGGGGGACACAACACATCCGT 1854484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GGACACGCAGGAGGAATCAGGGGCTTCCTGTCTCGAGGCTGGGGGACACAACACATCCGT 2098

  1854485 CTCTCCCAGTGGGCCTCTTAGTGGACGGCCCCCCAACTTTCCCCTGAGACCTGGAGGAAA 1854544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTCTCCCAGTGGGCCTCTTAGTGGACGGCCCCCCAACTTTCCCCTGAGACCTGGAGGAAA 2158

  1854545 AGGGCTTTCATGAAGGGTTTGTGGAACCTGACGGAGTGTTCTAATGGTGGGC 1854596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGGGCTTTCATGAAGGGTTTGTGGAACCTGACGGAGTGTTCTAATGGTGGGC 2210

EXCISED REGION

  1854602 GGGGGGGGGGTTGCTGGGAGTGGGAAGTGGGACGTGAGGCGGGGGTGGCAGAGCCGGAGC 1854661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2211 GGGGGGGGGGTTGCTGGGAGTGGGAAGTGGGATGTGAGGCGGGGGTGGCAGAGCCGGAGC 2270

  1854662 TGCCCCACCTTTGAGGAGTCTGGGTGGAGGCGGCAGTCCCGGGCGTGGCCCTGGCCCAGG 1854721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TGCCCCACCTTTGAGGAGTCTGGGTGGAGGCGGCAGTCCCGGGCGTGGCCCTGGCCCAGG 2330

  1854722 CCCACAGTTCGCAGGCAGGTGGCAGGGTCCACGCCTCCCTGCTCCTTCCTCCCCCTGCCC 1854781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CCCACAGTTCGCAGGCAGGTGGCAGGGTCCACGCCTCCCTGCTCCTTCCTCCCCCTGCCC 2390

  1854782 CCGCCCCCACCATGGGTCTCCCTCCGTCTCAGCATTGGAGGCTCTGGAGCAAGGCCGTTC 1854841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 CCGCCCCCACCATGGGTCTCCCTCCGTCTCAGCATTGGAGGCTCTGGAGCAAGGCCGTTC 2450

  1854842 CCCTGGCTGCACCAGCTCCCCTCTGCTGGGCTCAGATAGCGGCAGCTGCACCTCTGAATC 1854901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 CCCTGGCTGCACCAGCTCCCCTCTGCTGGGCTCAGATAGCGGCAGCTGCACCTCTGAATC 2510

  1854902 ATCGGCTCATATTCCCCATGGCTGGAGAAGGCCGGGGCCGCCGAGTTGGGAGGAGGGGAC 1854961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 ATCGGCTCATATTCCCCATGGCTGGAGAAGGCCGGGGCCGCCGAGTTGGGAGGAGGGGAC 2570

  1854962 TCGCTCTCCAGCCTCCAGGGCCAGATGCTCCATCTGCCCCATGGGGCGGAGCCACCCCAC 1855021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TCGCTCTCCAGCCTCCAGGGCCAGATGCTCCATCTGCCCCATGGGGCGGAGCCACCCCAC 2630

  1855022 ACCCCTGGGTTTGGTGCTGCCAGCCGGGTCCAGGCCCTCTCTTGGCCCTGGAGAGATGGG 1855081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 ACCCCTGGGTTTGGTGCTGCCAGCCGGGTCCAGGCCCTCTCTTGGCCCTGGAGAGATGGG 2690

  1855082 CACAGAGGGCAGTCTCCCCTCGATGCACCCTTATCTGTGAGGACAGTCCCCCCAGCCCCT 1855141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CACAGAGGGCAGTCTCCCCTCGATGCACCCTTATCTGTGAGGACAGTCCCCCCAGCCCCT 2750

  1855142 GTGCCTCCATCCGGGTTCCATCAGCAAAGGGAAGTCCTGGAGCTGGGGCCCGGCCTTGAG 1855201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 GTGCCTCCATCCGGGTTCCATCAGCAAAGGGAAGTCCTGGAGCTGGGGCCCGGCCTTGAG 2810

  1855202 GCAGAGCTGGAAGCTGCTACGCGGAGGGGCCTCAGCCCATGGTGGTGGGGAGGGCACCCC 1855261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 GCAGAGCTGGAAGCTGCTACGCGGAGGGGCCTCAGCCCATGGTGGTGGGGAGGGCACCCC 2870

  1855262 AGCCACCCTTGGTCCCAGCTGCCACCTGTGCACTCCCTGAGCAGAGATGCCTGACTCACC 1855321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 AGCCACCCTTGGTCCCAGCTGCCACCTGTGCACTCCCTGAGCAGAGATGCCTGACTCACC 2930

  1855322 CTAACGTTGTCCGGGCTGCAGATGGCGGCGGCTGCTGAGGGAGCTCCTTCCCCTCCTCCC 1855381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 CTAACGTTGTCCGGGCTGCAGATGGCGGCGGCTGCTGAGGGAGCTCCTTCCCCTCCTCCC 2990

  1855382 GCCCACCCTGCTAGGGCTAGGCCACAGATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGA 1855441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 GCCCACCCTGCTAGGGCTAGGCCACAGATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGA 3050

  1855442 AGATTTTATTTCACAAGGTGAGGAACCCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTC 1855501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 AGATTTTATTTCACAAGGTGAGGAACCCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTC 3110

  1855502 CGGGACGCATGGGGTCTGCACGTGGAGAGGGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACG 1855561
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 CGGGACGCATGGGGTCTGCACGTGGAGAGAGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACG 3170

  1855562 TAGGTCCCAGCGTGTCTGTCAGTCATGCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGT 1855621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TAGGTCCCAGCGTGTCTGTCAGTCATGCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGT 3230

  1855622 GCACCCAGCCTGTGGCTGGCGGGGCAGGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTC 1855681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 GCACCCAGCCTGTGGCTGGCGGGGCAGGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTC 3290

  1855682 CGGCTATGCCCCCGAGCCTGCAGGCTACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGT 1855741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CGGCTATGCCCCCGAGCCTGCAGGCTACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGT 3350

  1855742 GAGCGAGCTGAGGAAGGCAGGGATGCTGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTC 1855801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 GAGCGAGCTGAGGAAGGCAGGGATGCTGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTC 3410

  1855802 GCCCACGGTGTGTGAGAACTCTGTCTCCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGT 1855861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GCCCACGGTGTGTGAGAACTCTGTCTCCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGT 3470

  1855862 GGCCTGCGGGGCAGTCAAGAAAGAGACAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTC 1855921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GGCCTGCGGGGCAGTCAAGAAAGAGACAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTC 3530

  1855922 TCCCCTCCCTCCCTACACAGCCCCTCCAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTG 1855981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TCCCCTCCCTCCCTACACAGCCCCTCCAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTG 3590

  1855982 GACAGGGGTAGATGCGTCCTCAACCCTGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACT 1856041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GACAGGGGTAGATGCGTCCTCAACCCTGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACT 3650

  1856042 GAATTAACCCAGGGCAAGGTCTCTGTTGTCTACACTGTCATCTACCCAGGCAGTTGGGGG 1856101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 GAATTAACCCAGGGCAAGGTCTCTGTTGTCTACACTGTCATCTACCCAGGCAGTTGGGGG 3710

  1856102 TCCCAGGCACTGTGGGGTGTGCCCACCCAAGGGGCTGCCACCTTGCTCCTTCCTCCACCT 1856161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TCCCAGGCACTGTGGGGTGTGCCCACCCAAGGGGCTGCCACCTTGCTCCTTCCTCCACCT 3770

  1856162 GGGGGGCTCCAGCACCTGTGCCAGGCCCTAGTGCCACTCTTCACTGAGGCTGGAGGACCC 1856221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 GGGGGGCTCCAGCACCTGTGCCAGGCCCTAGTGCCACTCTTCACTGAGGCTGGAGGACCC 3830

  1856222 CACGCCCTGGGCAAGTCCTGCAACGCCTTCCACACTGCCTGGGCCCCATGACCTAGTTTC 1856281
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3831 CACGCCCTGGGCAAGTCCTGCAACGCCTTCCACACTGCCTGGGCCCCATGATCTAGTTTC 3890

  1856282 CCCACTTGTGCAGGGGGGCGCTGGGGGCCCAGGGGGAGTCTGGCTCTGTGGATTCTGCAG 1856341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 CCCACTTGTGCAGGGGGGCGCTGGGGGCCCAGGGGGAGTCTGGCTCTGTGGATTCTGCAG 3950

  1856342 CCCAGAGGGCGGCCTCCTGTAACTGGAGAACGGGCAAGGAGGAGCTTCCAGACAGCGCTG 1856401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CCCAGAGGGCGGCCTCCTGTAACTGGAGAACGGGCAAGGAGGAGCTTCCAGACAGCGCTG 4010

  1856402 CAGGCCCCAGGGGACACAGGGCAGGAGTCACACAGCAGGTCTGAGCAAGCTGCTGTGCCA 1856461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 CAGGCCCCAGGGGACACAGGGCAGGAGTCACACAGCAGGTCTGAGCAAGCTGCTGTGCCA 4070

  1856462 CGGTCCTGGGCTGTGTGGGGAGTGGACAGAGGCCCTTCTGAGCTGCCCCCGAGAGCCAGC 1856521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 CGGTCCTGGGCTGTGTGGGGAGTGGACAGAGGCCCTTCTGAGCTGCCCCCGAGAGCCAGC 4130

  1856522 CCCACCCCGGTCAGCACCCACACAGCCCCAGGTCAGGCAGGACACAAACCCGGCCCACCA 1856581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 CCCACCCCGGTCAGCACCCACACAGCCCCAGGTCAGGCAGGACACAAACCCGGCCCACCA 4190

  1856582 CAAAGCTCCCTCTGAAACCACGTCCCTGAAAAGTCCTGTACCCAGAATATGCCCAGAACT 1856641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 CAAAGCTCCCTCTGAAACCACGTCCCTGAAAAGTCCTGTACCCAGAATATGCCCAGAACT 4250

  1856642 CCCACAACTCCACCATGAAGAGGAAAGAGCCAATTAAACAAGGGGCCCTTGAACATTTCT 1856701
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CCCACAACTCCACCATGAAGAGGAAAGGGCCAATTAAACAAGGGGCCCTTGAACATTTCT 4310

  1856702 CCAGAGAAGAGCCACACACGGCCAATGAGCTCATGCCAGGACGCTGGGCACCGGGGAAAC 1856761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 CCAGAGAAGAGCCACACACGGCCAATGAGCTCATGCCAGGACGCTGGGCACCGGGGAAAC 4370

  1856762 GTGAACCGCAACTGAGCGAGACACGGAGCCGCCTCGCGCCGACGGCCACTGAGAGCAACC 1856821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GTGAACCGCAACTGAGCGAGACACGGAGCCGCCTCGCGCCGACGGCCACTGAGAGCAACC 4430

  1856822 ACCATGAGCTGCTGGGTCGAGGGGAATCAGACCCTCCGCGTCGCTGGCGGGAGCGTGTGT 1856881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 ACCATGAGCTGCTGGGTCGAGGGGAATCAGACCCTCCGCGTCGCTGGCGGGAGCGTGTGT 4490

  1856882 GGTGCGGCCACTGCAAACAGCCGGCAGCTCCTCAAAGAGCTGGACGCAGAGTCCATGGGC 1856941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 GGTGCGGCCACTGCAAACAGCCGGCAGCTCCTCAAAGAGCTGGACGCAGAGTCCATGGGC 4550

  1856942 CCAGCACCCGCCCGGGCGCGCAGCCAGGGGGTCTGAGCGCAGTCCACGCACAGACCTCGG 1857001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 CCAGCACCCGCCCGGGCGCGCAGCCAGGGGGTCTGAGCGCAGTCCACGCACAGACCTCGG 4610

  1857002 CACGGGTGTCCACGGCAACACGATCCCATCACCAACAGATGGAACGCGGAACCAGCCCTC 1857061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 CACGGGTGTCCACGGCAACACGATCCCATCACCAACAGATGGAACGCGGAACCAGCCCTC 4670

  1857062 AACCGCCGGAGGGAGACACAAAACCGGGTTTACCCGTCAACACCGCTTCGTACAGCCGAA 1857121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 AACCGCCGGAGGGAGACACAAAACCGGGTTTACCCGTCAACACCGCTTCGTACAGCCGAA 4730

  1857122 CTCTGATACACGCTGCCACGCGGGCAAACCCCGAAAACACGCCCAGCCAGTCACAGAGAC 1857181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 CTCTGATACACGCTGCCACGCGGGCAAACCCCGAAAACACGCCCAGCCAGTCACAGAGAC 4790

  1857182 CTGTCGACACAACTCCGTGCCCAGGGGATGTCCTGGAGGGGCACGTCAGGGCTCAGGGCC 1857241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 CTGTCGACACAACTCCGTGCCCAGGGGATGTCCTGGAGGGGCACGTCAGGGCTCAGGGCC 4850

  1857242 AGTGGAAATGTGCCACGGTTAGACTGGTCGCGGCTGCGCACTGAATGTGCCGGGAGGAAC 1857301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 AGTGGAAATGTGCCACGGTTAGACTGGTCGCGGCTGCGCACTGAATGTGCCGGGAGGAAC 4910

  1857302 GGAACGGTAGACTAATGGAGCGCTAGACGTGAGGGTGAGCTGCATGTGTGTGCATCGGAG 1857361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 GGAACGGTAGACTAATGGAGCGCTAGACGTGAGGGTGAGCTGCATGTGTGTGCATCGGAG 4970

  1857362 CTCAGGAAACCGTTTTGGAAAGCGCTCCCTCCGCCCGGCAGCCCTCTGGGAACCCTCCCC 1857421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 CTCAGGAAACCGTTTTGGAAAGCGCTCCCTCCGCCCGGCAGCCCTCTGGGAACCCTCCCC 5030

  1857422 AGGAGCCACAGGGCGGCCTGGCTCCATCCAGCTTGGTCCTGGCAGCTCCCCTGTCCACCG 1857481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 AGGAGCCACAGGGCGGCCTGGCTCCATCCAGCTTGGTCCTGGCAGCTCCCCTGTCCACCG 5090

  1857482 GAGCATGCCTGGGCTGGGCCCCGCCCTGATGGTGTCGCCCCTCCCCTCACCACCTTTGGA 1857541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 GAGCATGCCTGGGCTGGGCCCCGCCCTGATGGTGTCGCCCCTCCCCTCACCACCTTTGGA 5150

  1857542 GCACGTGCTGCCCCAGAGGCCCTGCGACCTGACCTGTTCCTGCACCTCCTGTTTCTCAGG 1857601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 GCACGTGCTGCCCCAGAGGCCCTGCGACCTGACCTGTTCCTGCACCTCCTGTTTCTCAGG 5210

  1857602 AGCCGTCCCCGTGCCCTCCCCCTGCCCTCCCCCTGTTTCTGCTGCCTTAGTACATTTGGC 1857661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 AGCCGTCCCCGTGCCCTCCCCCTGCCCTCCCCCTGTTTCTGCTGCCTTAGTACATTTGGC 5270

  1857662 CTTGTCATAGTTCAACACAAACCATTTTTAAACAAAAACAAGAGAAACCACTCTGACCTT 1857721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 CTTGTCATAGTTCAACACAAACCATTTTTAAACAAAAACAAGAGAAACCACTCTGACCTT 5330

  1857722 TCGCTGAGAAAATCCTTTCACTTCTGCCTTCTGCTCTTGATTCTGAATTTCTCCCCCTAA 1857781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 TCGCTGAGAAAATCCTTTCACTTCTGCCTTCTGCTCTTGATTCTGAATTTCTCCCCCTAA 5390

  1857782 ATGTCAGAGGGGCTGATTCTCCTGCAGCTGCCGGGCAGGGGTGGGGAGGCAGTGTGGGAA 1857841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 ATGTCAGAGGGGCTGATTCTCCTGCAGCTGCCGGGCAGGGGTGGGGAGGCAGTGTGGGAA 5450

  1857842 GAAGTCTCCTCAGCCGGCCCTTCGCCCTCCTCCCAACCCAGGGCTGGCAACCTGGCTGGG 1857901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 GAAGTCTCCTCAGCCGGCCCTTCGCCCTCCTCCCAACCCAGGGCTGGCAACCTGGCTGGG 5510

  1857902 CCTGACGCACTGTGGTGCAGACTCTGGCCAGGCTGGACCAGAGAATAGCTGTTTTCCAGG 1857961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 CCTGACGCACTGTGGTGCAGACTCTGGCCAGGCTGGACCAGAGAATAGCTGTTTTCCAGG 5570

  1857962 CACCCGCCTTCCCCGGCCCTCAGAGGCTGGCAGGCTTTGGGAGCCTGGCCGTTCATTTCT 1858021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 CACCCGCCTTCCCCGGCCCTCAGAGGCTGGCAGGCTTTGGGAGCCTGGCCGTTCATTTCT 5630

  1858022 AAAAATATTTTTTTTTAGAGACGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 1858081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 AAAAATATTTTTTTTTAGAGACGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 5690

  1858082 TGATAACGGGTCACTCAGCCTCGAGCTCCCGGACTCAAGTGATCCACCTCAGCCTCCTGA 1858141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 TGATAACGGGTCACTCAGCCTCGAGCTCCCGGACTCAAGTGATCCACCTCAGCCTCCTGA 5750

  1858142 GCAGTTGGAATGACAGGCATGTGCCAGCACACCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTTGAGAG 1858201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 GCAGTTGGAATGACAGGCATGTGCCAGCACACCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTTGAGAG 5810

  1858202 ATAGATAGACTTTAGCTATTTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTG 1858247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 ATAGATAGACTTTAGCTATTTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTG 5856

Alignment time is 5.62754 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   4313] =>      4313 nucs 'mol-32-1f63-210268_4313'

Score:        4181
Aligned:      4313        nucs
Identic:      4301 (100%) nucs =>      2818 (100%)      1483 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1855408,1858228] EXCISED REGION [1858252,1859743]
 second seq =>  [      1,   2821] EXCISED REGION [   2822,   4313]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        23 nucs [1858229,1858251]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [1858229,1858252] to [1858252,1858275]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1855408 GATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGAAGATTTTATTTCACAAGGTGAGGAAC 1855467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGAAGATTTTATTTCACAAGGTGAGGAAC 60

  1855468 CCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTCCGGGACGCATGGGGTCTGCACGTGGA 1855527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTCCGGGACGCATGGGGTCTGCACGTGGA 120

  1855528 GAGGGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACGTAGGTCCCAGCGTGTCTGTCAGTCAT 1855587
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACGTAGGTCCCAGCGTGTCTGTCAGTCAT 180

  1855588 GCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGTGCACCCAGCCTGTGGCTGGCGGGGCA 1855647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGTGCACCCAGCCTGTGGCTGGCGGGGCA 240

  1855648 GGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTCCGGCTATGCCCCCGAGCCTGCAGGCT 1855707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTCCGGCTATGCCCCCGAGCCTGCAGGCT 300

  1855708 ACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGTGAGCGAGCTGAGGAAGGCAGGGATGC 1855767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGTGAGCGAGCTGAGGAAGGCAGGGATGC 360

  1855768 TGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTCGCCCACGGTGTGTGAGAACTCTGTCT 1855827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTCGCCCACGGTGTGTGAGAACTCTGTCT 420

  1855828 CCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGTGGCCTGCGGGGCAGTCAAGAAAGAGA 1855887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGTGGCCTGCGGGGCAGTCAAGAAAGAGA 480

  1855888 CAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTCTCCCCTCCCTCCCTACACAGCCCCTC 1855947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTCTCCCCTCCCTCCCTACACAGCCCCTC 540

  1855948 CAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTGGACAGGGGTAGATGCGTCCTCAACCC 1856007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTGGACAGGGGTAGATGCGTCCTCAACCC 600

  1856008 TGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACTGAATTAACCCAGGGCAAGGTCTCTGT 1856067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACTGAATTAACCCAGGGCAAGGTCTCTGT 660

  1856068 TGTCTACACTGTCATCTACCCAGGCAGTTGGGGGTCCCAGGCACTGTGGGGTGTGCCCAC 1856127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCTACACTGTCATCTACCCAGGCAGTTGGGGGTCCCAGGCACTGTGGGGTGTGCCCAC 720

  1856128 CCAAGGGGCTGCCACCTTGCTCCTTCCTCCACCTGGGGGGCTCCAGCACCTGTGCCAGGC 1856187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAAGGGGCTGCCACCTTGCTCCTTCCTCCACCTGGGGGGCTCCAGCACCTGTGCCAGGC 780

  1856188 CCTAGTGCCACTCTTCACTGAGGCTGGAGGACCCCACGCCCTGGGCAAGTCCTGCAACGC 1856247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTAGTGCCACTCTTCACTGAGGCTGGAGGACCCCACGCCCTGGGCAAGTCCTGCAACGC 840

  1856248 CTTCCACACTGCCTGGGCCCCATGACCTAGTTTCCCCACTTGTGCAGGGGGGCGCTGGGG 1856307
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTCCACACTGCCTGGGCCCCATGATCTAGTTTCCCCACTTGTGCAGGGGGGCGCTGGGG 900

  1856308 GCCCAGGGGGAGTCTGGCTCTGTGGATTCTGCAGCCCAGAGGGCGGCCTCCTGTAACTGG 1856367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCCAGGGGGAGTCTGGCTCTGTGGATTCTGCAGCCCAGAGGGCGGCCTCCTGTAACTGG 960

  1856368 AGAACGGGCAAGGAGGAGCTTCCAGACAGCGCTGCAGGCCCCAGGGGACACAGGGCAGGA 1856427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAACGGGCAAGGAGGAGCTTCCAGACAGCGCTGCAGGCCCCAGGGGACACAGGGCAGGA 1020

  1856428 GTCACACAGCAGGTCTGAGCAAGCTGCTGTGCCACGGTCCTGGGCTGTGTGGGGAGTGGA 1856487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCACACAGCAGGTCTGAGCAAGCTGCTGTGCCACGGTCCTGGGCTGTGTGGGGAGTGGA 1080

  1856488 CAGAGGCCCTTCTGAGCTGCCCCCGAGAGCCAGCCCCACCCCGGTCAGCACCCACACAGC 1856547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGAGGCCCTTCTGAGCTGCCCCCGAGAGCCAGCCCCACCCCGGTCAGCACCCACACAGC 1140

  1856548 CCCAGGTCAGGCAGGACACAAACCCGGCCCACCACAAAGCTCCCTCTGAAACCACGTCCC 1856607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCAGGTCAGGCAGGACACAAACCCGGCCCACCACAAAGCTCCCTCTGAAACCACGTCCC 1200

  1856608 TGAAAAGTCCTGTACCCAGAATATGCCCAGAACTCCCACAACTCCACCATGAAGAGGAAA 1856667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAAAAGTCCTGTACCCAGAATATGCCCAGAACTCCCACAACTCCACCATGAAGAGGAAA 1260

  1856668 GAGCCAATTAAACAAGGGGCCCTTGAACATTTCTCCAGAGAAGAGCCACACACGGCCAAT 1856727
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGCCAATTAAACAAGGGGCCCTTGAACATTTCTCCAGAGAAGAGCCACACACGGCCAAT 1320

  1856728 GAGCTCATGCCAGGACGCTGGGCACCGGGGAAACGTGAACCGCAACTGAGCGAGACACGG 1856787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGCTCATGCCAGGACGCTGGGCACCGGGGAAACGTGAACCGCAACTGAGCGAGACACGG 1380

  1856788 AGCCGCCTCGCGCCGACGGCCACTGAGAGCAACCACCATGAGCTGCTGGGTCGAGGGGAA 1856847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCCGCCTCGCGCCGACGGCCACTGAGAGCAACCACCATGAGCTGCTGGGTCGAGGGGAA 1440

  1856848 TCAGACCCTCCGCGTCGCTGGCGGGAGCGTGTGTGGTGCGGCCACTGCAAACAGCCGGCA 1856907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAGACCCTCCGCGTCGCTGGCGGGAGCGTGTGTGGTGCGGCCACTGCAAACAGCCGGCA 1500

  1856908 GCTCCTCAAAGAGCTGGACGCAGAGTCCATGGGCCCAGCACCCGCCCGGGCGCGCAGCCA 1856967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTCCTCAAAGAGCTGGACGCAGAGTCCATGGGCCCAGCACCCGCCCGGGCGCGCAGCCA 1560

  1856968 GGGGGTCTGAGCGCAGTCCACGCACAGACCTCGGCACGGGTGTCCACGGCAACACGATCC 1857027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGGGGTCTGAGCGCAGTCCACGCACAGACCTCGGCACGGGTGTCCACGGCAACACGATCC 1620

  1857028 CATCACCAACAGATGGAACGCGGAACCAGCCCTCAACCGCCGGAGGGAGACACAAAACCG 1857087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATCACCAACAGATGGAACGCGGAACCAGCCCTCAACCGCCGGAGGGAGACACAAAACCG 1680

  1857088 GGTTTACCCGTCAACACCGCTTCGTACAGCCGAACTCTGATACACGCTGCCACGCGGGCA 1857147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTTTACCCGTCAACACCGCTTCGTACAGCCGAACTCTGATACACGCTGCCACGCGGGCA 1740

  1857148 AACCCCGAAAACACGCCCAGCCAGTCACAGAGACCTGTCGACACAACTCCGTGCCCAGGG 1857207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACCCCGAAAACACGCCCAGCCAGTCACAGAGACCTGTCGACACAACTCCGTGCCCAGGG 1800

  1857208 GATGTCCTGGAGGGGCACGTCAGGGCTCAGGGCCAGTGGAAATGTGCCACGGTTAGACTG 1857267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATGTCCTGGAGGGGCACGTCAGGGCTCAGGGCCAGTGGAAATGTGCCACGGTTAGACTG 1860

  1857268 GTCGCGGCTGCGCACTGAATGTGCCGGGAGGAACGGAACGGTAGACTAATGGAGCGCTAG 1857327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCGCGGCTGCGCACTGAATGTGCCGGGAGGAACGGAACGGTAGACTAATGGAGCGCTAG 1920

  1857328 ACGTGAGGGTGAGCTGCATGTGTGTGCATCGGAGCTCAGGAAACCGTTTTGGAAAGCGCT 1857387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACGTGAGGGTGAGCTGCATGTGTGTGCATCGGAGCTCAGGAAACCGTTTTGGAAAGCGCT 1980

  1857388 CCCTCCGCCCGGCAGCCCTCTGGGAACCCTCCCCAGGAGCCACAGGGCGGCCTGGCTCCA 1857447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCTCCGCCCGGCAGCCCTCTGGGAACCCTCCCCAGGAGCCACAGGGCGGCCTGGCTCCA 2040

  1857448 TCCAGCTTGGTCCTGGCAGCTCCCCTGTCCACCGGAGCATGCCTGGGCTGGGCCCCGCCC 1857507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCAGCTTGGTCCTGGCAGCTCCCCTGTCCACCGGAGCATGCCTGGGCTGGGCCCCGCCC 2100

  1857508 TGATGGTGTCGCCCCTCCCCTCACCACCTTTGGAGCACGTGCTGCCCCAGAGGCCCTGCG 1857567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGATGGTGTCGCCCCTCCCCTCACCACCTTTGGAGCACGTGCTGCCCCAGAGGCCCTGCG 2160

  1857568 ACCTGACCTGTTCCTGCACCTCCTGTTTCTCAGGAGCCGTCCCCGTGCCCTCCCCCTGCC 1857627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCTGACCTGTTCCTGCACCTCCTGTTTCTCAGGAGCCGTCCCCGTGCCCTCCCCCTGCC 2220

  1857628 CTCCCCCTGTTTCTGCTGCCTTAGTACATTTGGCCTTGTCATAGTTCAACACAAACCATT 1857687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCCCCCTGTTTCTGCTGCCTTAGTACATTTGGCCTTGTCATAGTTCAACACAAACCATT 2280

  1857688 TTTAAACAAAAACAAGAGAAACCACTCTGACCTTTCGCTGAGAAAATCCTTTCACTTCTG 1857747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTAAACAAAAACAAGAGAAACCACTCTGACCTTTCGCTGAGAAAATCCTTTCACTTCTG 2340

  1857748 CCTTCTGCTCTTGATTCTGAATTTCTCCCCCTAAATGTCAGAGGGGCTGATTCTCCTGCA 1857807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTTCTGCTCTTGATTCTGAATTTCTCCCCCTAAATGTCAGAGGGGCTGATTCTCCTGCA 2400

  1857808 GCTGCCGGGCAGGGGTGGGGAGGCAGTGTGGGAAGAAGTCTCCTCAGCCGGCCCTTCGCC 1857867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCTGCCGGGCAGGGGTGGGGAGGCAGTGTGGGAAGAAGTCTCCTCAGCCGGCCCTTCGCC 2460

  1857868 CTCCTCCCAACCCAGGGCTGGCAACCTGGCTGGGCCTGACGCACTGTGGTGCAGACTCTG 1857927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCCTCCCAACCCAGGGCTGGCAACCTGGCTGGGCCTGACGCACTGTGGTGCAGACTCTG 2520

  1857928 GCCAGGCTGGACCAGAGAATAGCTGTTTTCCAGGCACCCGCCTTCCCCGGCCCTCAGAGG 1857987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCCAGGCTGGACCAGAGAATAGCTGTTTTCCAGGCACCCGCCTTCCCCGGCCCTCAGAGG 2580

  1857988 CTGGCAGGCTTTGGGAGCCTGGCCGTTCATTTCTAAAAATATTTTTTTTTAGAGACGAGT 1858047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGGCAGGCTTTGGGAGCCTGGCCGTTCATTTCTAAAAATATTTTTTTTTAGAGACGAGT 2640

  1858048 CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATAACGGGTCACTCAGCCTCGAGC 1858107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATAACGGGTCACTCAGCCTCGAGC 2700

  1858108 TCCCGGACTCAAGTGATCCACCTCAGCCTCCTGAGCAGTTGGAATGACAGGCATGTGCCA 1858167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCCGGACTCAAGTGATCCACCTCAGCCTCCTGAGCAGTTGGAATGACAGGCATGTGCCA 2760

  1858168 GCACACCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTTGAGAGATAGATAGACTTTAGCTATTTTGCCC 1858227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCACACCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTTGAGAGATAGATAGACTTTAGCTATTTTGCCC 2820

  1858228 A 1858228
          |
     2821 A 2821

EXCISED REGION

  1858252 GGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTGACGTGATCCTCCTGCCTCAGCTGCCCACGACGTGAG 1858311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 GGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTGACGTGATCCTCCTGCCTCAGCTGCCCACGACGTGAG 2881

  1858312 GATTACAGGCGTGAGCTCTGATCATTCTTTATTTGAAACAGGTGCACCCCGCCAGCGTCA 1858371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 GATTACAGGCGTGAGCTCTGATCATTCTTTATTTGAAACAGGTGCACCCCGCCAGCGTCA 2941

  1858372 GCAAGACAGCTGCTCCCAATGGTAGGCCGGGCAACCCACTCACGGCTCCTACAGCACCTC 1858431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 GCAAGACAGCTGCTCCCAATGGTAGGCCGGGCAACCCACTCACGGCTCCTACAGCACCTC 3001

  1858432 CTCTCTGCCGGCCTCAGGCGGCTCTGGAAGAATGATGCCCTAATATACCGCGCTGCCCTC 1858491
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||
     3002 CTCTCTGCCGGCCTCAGGCGGCTCTGGAAGAATGACGCCCTAAGATACCGCGCTGCCCTC 3061

  1858492 CAGGTGGGGGTGGGGGTGGACGGAGACAGGCAGGAGTAACCAGTGCTACTCTCCCAGCTC 1858551
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3062 CAGGTGGGGGTGGGGGTGGACGGAGACAGGCAGGAGTGACCAGTGCTACTCTCCCAGCTC 3121

  1858552 AAACCCCACACGAAGGCAGACCCAGCGTTTGCAAAACACCAGCCCCCGGTGAACAAGTCG 1858611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 AAACCCCACACGAAGGCAGACCCAGCGTTTGCAAAACACCAGCCCCCGGTGAACAAGTCG 3181

  1858612 ACCTGCTGTGCAGCCCACCTCTGACTCCGTTTCCCCCAGCGTACCCAGCCACATTGGGAG 1858671
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3182 ACCTGCCGTGCAGCCCACCTCTGACTCCGTTTCCCCCAGTGTACCCAGCCACATTGGGAG 3241

  1858672 GCTCCACCTCGGTCTAACGCTCCGGCATTAGCAGGACCTGCTGAATGAGTGGCGCCGGGC 1858731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 GCTCCACCTCGGTCTAACGCTCCGGCATTAGCAGGACCTGCTGAATGAGTGGCGCCGGGC 3301

  1858732 CCATCCATCTCTGCCATCGCTGCTCAGCCCTCTGCCATGTTCAAATATCACACAGTCCCC 1858791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 CCATCCATCTCTGCCATCGCTGCTCAGCCCTCTGCCATGTTCAAATATCACACAGTCCCC 3361

  1858792 AGGTACCTCGTAAATCACTGTAATTACGGGCTGCTCACTTAAAATTAAACTGCAATTTTT 1858851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 AGGTACCTCGTAAATCACTGTAATTACGGGCTGCTCACTTAAAATTAAACTGCAATTTTT 3421

  1858852 TAAAAAGCAAATTGCCAGTAAGACACGTTGGCTGTGGCTGGAAATACTTCTGAGGCTGCC 1858911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3422 TAAAAAGCAAATTGCCAGTAAGACACGTTGGCTGTGGCTGGAAATATTTCTGAGGCTGCC 3481

  1858912 TGCGCGCAGGCTCTGGCTTCCTCTCCCTCTGCCTGGCCGGCCCGAGCTGCCACCTGTCTA 1858971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 TGCGCGCAGGCTCTGGCTTCCTCTCCCTCTGCCTGGCCGGCCCGAGCTGCCACCTGTCTA 3541

  1858972 GTCTGCGCACATAGCGGCCCTGTGGCTGGCGGGCGCCCTGGGGGAGACTGAGACACTCAC 1859031
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 GTCTGCGCACATAGCGGCCGTGTGGCTGGCGGGCGCCCTGGGGGAGACTGAGACACTCAC 3601

  1859032 TCTTAATGAAGACACTCGCGGCGTCCATTGTGGCCACTGCACTCTAGTCCAGACCCTCGC 1859091
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 TCTTAATGAAGACACTCGCGGCGTCCACTGTGGCCACTGCACTCTAGTCCAGACCCTCGC 3661

  1859092 TGGCCTGGCCTGGGGCTCACCTGCCCCTCTGGAAGCAGAGAGGGCCTGCCCTGGAGGGCC 1859151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 TGGCCTGGCCTGGGGCTCACCTGCCCCTCTGGAAGCAGAGAGGGCCTGCCCTGGAGGGCC 3721

  1859152 GGGGACCTCTGCAGCATGTCCGTGGAACACGTGGGCCAGGGATTGTGTGCCCGGCCCCCA 1859211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3722 GGGGACCTCTGCAGCATGTCCGTGGAACACGTGGGCCAGGGAGTGTGTGCCCGGCCCCCA 3781

  1859212 TTCCAGCTCTGCCACGTGAGCAGTGCTCACTCGGTGCCTAGGGCTGACTAGTCTTACTAA 1859271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 TTCCAGCTCTGCCACGTGAGCAGTGCTCACTCGGTGCCTAGGGCTGACTAGTCTTACTAA 3841

  1859272 GCGCTGGTCCCACCATCCCCTGAGCCGAGCCCCATGGTGTCCCAGCGGGCACGGACAAGA 1859331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 GCGCTGGTCCCACCATCCCCTGAGCCGAGCCCCATGGTGTCCCAGCGGGCACGGACAAGA 3901

  1859332 GGCACGGAGTGAGGGAGGGGTGGGGGCTGACAAAGGGCTTGGAGAGCAGAGACAGCGCAC 1859391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 GGCACGGAGTGAGGGAGGGGTGGGGGCTGACAAAGGGCTTGGAGAGCAGAGACAGCGCAC 3961

  1859392 ACCACCAACTCTCTCCACACACCACTTTCTCCACACACCACCAACCGCAGGATGTGGTGG 1859451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 ACCACCAACTCTCTCCACACACCACTTTCTCCACACACCACCAACCGCAGGATGTGGTGG 4021

  1859452 GGCTCGGAGGCCAAGGGGGAAGTGTGAGGGATTCCTGTCAAGAACAAGACCCCCTGCTGC 1859511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 GGCTCGGAGGCCAAGGGGGAAGTGTGAGGGATTCCTGTCAAGAACAAGACCCCCTGCTGC 4081

  1859512 TGAGGGTCCAAGAGAAACTCCATGAACTGGGAAACTCGAGGGGAGGAAGCTAGAGATGGA 1859571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 TGAGGGTCCAAGAGAAACTCCATGAACTGGGAAACTCGAGGGGAGGAAGCTAGAGATGGA 4141

  1859572 ATGAAGGAAGCCCTGAATCCTGGCTCAAACAAGGAAAGCTGAAATAATGCAGTAAAATGA 1859631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 ATGAAGGAAGCCCTGAATCCTGGCTCAAACAAGGAAAGCTGAAATAATGCAGTAAAATGA 4201

  1859632 GAAGACACGCAGGAAATGGAAACGATGCTACTTCGAGATACTGGGAAGTTATGTGAATGC 1859691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 GAAGACACGCAGGAAATGGAAACGATGCTACTTCGAGATACTGGGAAGTTATGTGAATGC 4261

  1859692 TGTTCATCTGTGGGGTGGCGTGAAGAGGTGGAGGCCACACCAGTGGACATCA 1859743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 TGTTCATCTGTGGGGTGGCGTGAAGAGGTGGAGGCCACACCAGTGGACATCA 4313

Alignment time is 4.20702 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   5188] =>      5188 nucs 'mol-32-20fa-140223_5188'

Score:        4976
Aligned:      5173        nucs
Identic:      5142 ( 99%) nucs =>      3724 (100%)      1418 ( 99%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1863464,1867198] EXCISED REGION [1867380,1868804]
 second seq =>  [      5,   3739] EXCISED REGION [   3756,   5188]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       181 nucs [1867199,1867379]
 second seq =>        16 nucs [3740,3755]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3740,3740] to [3756,3756]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [1867182,1867198] to [1867380,1867396]
 second seq =>        17 nucs [3723,3739] to [3756,3772]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [1867199,1867200] to [1867378,1867379]
 second seq =>         0 nucs

  1863464 CATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCC 1863523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 CATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCC 64

  1863524 CTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTG 1863583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 CTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTG 124

  1863584 TGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGA 1863643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 TGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGA 184

  1863644 CGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGG 1863703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 CGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGG 244

  1863704 GGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCAC 1863763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 GGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCAC 304

  1863764 CACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTG 1863823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 CACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTG 364

  1863824 ACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGG 1863883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 ACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGG 424

  1863884 TGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGC 1863943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 TGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGC 484

  1863944 TTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTC 1864003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTC 544

  1864004 TGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCA 1864063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 TGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCA 604

  1864064 GGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATG 1864123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 GGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATG 664

  1864124 AGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTG 1864183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 AGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTG 724

  1864184 CTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCC 1864243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 CTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCC 784

  1864244 CCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCT 1864303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 CCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCT 844

  1864304 GGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTG 1864363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 GGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTG 904

  1864364 CTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGT 1864423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 CTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGT 964

  1864424 GTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGC 1864483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 GTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGC 1024

  1864484 ACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCA 1864543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 ACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCA 1084

  1864544 GCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTC 1864603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 GCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTC 1144

  1864604 TCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGT 1864663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 TCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGT 1204

  1864664 TAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTT 1864723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 TAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTT 1264

  1864724 ATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGA 1864783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 ATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGA 1324

  1864784 ACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCC 1864843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 ACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCC 1384

  1864844 AATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGG 1864903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 AATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGG 1444

  1864904 AGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCA 1864963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 AGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCA 1504

  1864964 CCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTT 1865023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 CCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTT 1564

  1865024 GGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGG 1865083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 GGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGG 1624

  1865084 GGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGC 1865143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 GGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGC 1684

  1865144 TGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACC 1865203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACC 1744

  1865204 CAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCGGTG 1865263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1745 CAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCAGTG 1804

  1865264 CCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGA 1865323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 CCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGA 1864

  1865324 GCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGG 1865383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 GCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGG 1924

  1865384 ACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAG 1865443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 ACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAG 1984

  1865444 GTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGT 1865503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 GTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGT 2044

  1865504 CCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCC 1865563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 CCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCC 2104

  1865564 CCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCC 1865623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCC 2164

  1865624 AGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACG 1865683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 AGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACG 2224

  1865684 TCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTA 1865743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTA 2284

  1865744 CGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGC 1865803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 CGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGC 2344

  1865804 TCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGA 1865863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGA 2404

  1865864 AGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGC 1865923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 AGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGC 2464

  1865924 GCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCT 1865983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 GCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCT 2524

  1865984 CCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGCTCATGGC 1866043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 CCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGCTCATGGC 2584

  1866044 CTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCCTCCAGCT 1866103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 CTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCCTCCAGCT 2644

  1866104 CCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTTTGACCCC 1866163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 CCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTTTGACCCC 2704

  1866164 AGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACTGTCCCTC 1866223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 AGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACTGTCCCTC 2764

  1866224 CGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGATGCTGCCG 1866283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 CGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGATGCTGCCG 2824

  1866284 CGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCGGCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACAGAACGCC 1866343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 CGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCGGCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACAGAACGCC 2884

  1866344 GAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTCCAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTGTGTCCGG 1866403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 GAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTCCAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTGTGTCCGG 2944

  1866404 CACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTATTCCTGCCTAATTGTACCGAGGAAAGCATCTAAA 1866463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 CACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTATTCCTGCCTAATTGTACCGAGGAAAGCATCTAAA 3004

  1866464 TACTGCCTGTGCTAATTATACCAGCGTTATTGGGGTTTATCTTCCCGGCGAGGGTGACCT 1866523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 TACTGCCTGTGCTAATTATACCAGCGTTATTGGGGTTTATCTTCCCGGCGAGGGTGACCT 3064

  1866524 TTCCTTCAAGAGTGACTGGCGGGGCGGGCAAGGCCAGGCACCCCAGCAGTCGCAGAAAAA 1866583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 TTCCTTCAAGAGTGACTGGCGGGGCGGGCAAGGCCAGGCACCCCAGCAGTCGCAGAAAAA 3124

  1866584 TCCCAAACCAACAATTATTATTATTATTATTCTATTTATACAGCTCCCCCTCGCACACGG 1866643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 TCCCAAACCAACAATTATTATTATTATTATTCTATTTATACAGCTCCCCCTCGCACACGG 3184

  1866644 GCGTTCTGCTTTACAGCCACACGCAGCTGCTCCTGCAGCCGCAGCCGGAGGGGAGCCGAG 1866703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 GCGTTCTGCTTTACAGCCACACGCAGCTGCTCCTGCAGCCGCAGCCGGAGGGGAGCCGAG 3244

  1866704 GGAGTGGGGGCGCCGGCTCGGGGTGGGGCGGCCTGCGCAGCCCCTGCTGTGAGTGGCATC 1866763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 GGAGTGGGGGCGCCGGCTCGGGGTGGGGCGGCCTGCGCAGCCCCTGCTGTGAGTGGCATC 3304

  1866764 CGCCACGGGCGGCTCCAAGGGCCGTGGAAGGGCATGGAGGCCACAGGGATGAGTTAGAGG 1866823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 CGCCACGGGCGGCTCCAAGGGCCGTGGAAGGGCATGGAGGCCACAGGGATGAGTTAGAGG 3364

  1866824 AGGTGGCGGGGATGGAGAAGGTGGGAGAAGGGGCTGAGTGTGGGTTAAAAGACAGGGACT 1866883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 AGGTGGCGGGGATGGAGAAGGTGGGAGAAGGGGCTGAGTGTGGGTTAAAAGACAGGGACT 3424

  1866884 GGCCCCGAGGGCAGCAGGAGCACAGAACACAATGAAGGTTAAGGGAAGAAAGGGGACGCA 1866943
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 GGCCCCGAGGGCAGCAGAAGCACAGAACACAATGAAGGTTAAGGGAAGAAAGGGGACGCA 3484

  1866944 GCGGGCAGGGAGGACAGGTGCTCAGATCAGGCACACGGGTGAGGAGGGAGGAGCTGCAGC 1867003
          ||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 GCAGGCAGGCAGGACAGGTGCTCAGATCAGGCACACGGGTGAGGAGGGAGGAGCTGCAGC 3544

  1867004 ACAGCCCTCGCCCAGTGGCTCCCTGAGCCCCGCCCAGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAG 1867063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 ACAGCCCTCGCCCAGTGGCTCCCTGAGCCCCGCCCAGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAG 3604

  1867064 CCCGTCGCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCGCGGGTGTGGGGGCCTCCCCT 1867123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 CCCGTCGCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCGCGGGTGTGGGGGCCTCCCCT 3664

  1867124 CCTGAGCCCGTCCC-----GGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGTGG 1867178
          |||||||||          ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 CCTGAGCCC-----TGCGTGGCTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGTGG 3719

  1867179 GGGCCTCCCCTCCTGAGCCC 1867198
          ||.|||||||||||||||||
     3720 GGTCCTCCCCTCCTGAGCCC 3739

EXCISED REGION

  1867380 CCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTG 1867439
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3756 CCTCCCCTCCTGAGCCCGGCCCGGGTGTGGGGGCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTG 3815

  1867440 TGGGGTCCTCCCCTCCTGGGCCCGGGCTAGACAGCACCACCCTTTCCAGATGTAGCCGAA 1867499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 TGGGGTCCTCCCCTCCTGGGCCCGGGCTAGACAGCACCACCCTTTCCAGATGTAGCCGAA 3875

  1867500 TGAGAACAGGAGAGGACGTCAGCGGCCTCTGCGCCTTCTCACCTCCCACCCAGGCGAGGC 1867559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 TGAGAACAGGAGAGGACGTCAGCGGCCTCTGCGCCTTCTCACCTCCCACCCAGGCGAGGC 3935

  1867560 CCATGCTGCTGGCAGTGACGTTTCGTGGAGCGCCACGCTTAGGGCAATGTGATGCTGGGG 1867619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 CCATGCTGCTGGCAGTGACGTTTCGTGGAGCGCCACGCTTAGGGCAATGTGATGCTGGGG 3995

  1867620 ATGCGGGGTGAGGAGGGCCGGAGATGCAGGCCCGCCCTCCTGTGAGGCTGCCCCTCTTAT 1867679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 ATGCGGGGTGAGGAGGGCCGGAGATGCAGGCCCGCCCTCCTGTGAGGCTGCCCCTCTTAT 4055

  1867680 GTGCTGTGGGCCCCGGGGCCCATCAGTTTGTCTCTCTGAGCTGAAGTTTCCTGAATGTAA 1867739
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 CTGCTGTGGGCCCCGGGGCCCATCAGTTTGTCTCTCTGAGCTGAAGTTTCCTGAATGTAA 4115

  1867740 AATGGAGACAAAATGCCTATTTTCCCACCTCAGAGGGCGGCCGGCAGCTTCCGGCCGAGA 1867799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 AATGGAGACAAAATGCCTATTTTCCCACCTCAGAGGGCGGCCGGCAGCTTCCGGCCGAGA 4175

  1867800 CAGAGCCACAAGGACAGATGCACCTGCCATCTGAAACAGCCAGAATATGAGGCATCAAAT 1867859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 CAGAGCCACAAGGACAGATGCACCTGCCATCTGAAACAGCCAGAATATGAGGCATCAAAT 4235

  1867860 GTGAAACAACAGTTTTCAGTCAGGAAGGGTGGCGGGCCCTGAGAGACGGGGCGAGCCTGG 1867919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 GTGAAACAACAGTTTTCAGTCAGGAAGGGTGGCGGGCCCTGAGAGACGGGGCGAGCCTGG 4295

  1867920 GGAGACAGTCACAGCCCAGGCAGGGCCTCGCGGGACCCGAGTTGAGGGACAGGGCTGGAG 1867979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 GGAGACAGTCACAGCCCAGGCAGGGCCTCGCGGGACCCGAGTTGAGGGACAGGGCTGGAG 4355

  1867980 CTGGAGCCAGGGCGCCGAAAAGAGTGCCACAGAGGAGGGCTGAGTTCGCTGGAGTGCTCA 1868039
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4356 CTGGAGCCAGGGCGCCGAAAAGAGTGCCACAGAGGAGGGCTGAGTTCGCTGGAGTGCTCG 4415

  1868040 GTGAGAGGCTGAGAAAACCTGGAGCATTAGAGAGAAAAACCCAGAAAATGGCACCCGAAG 1868099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4416 GTGAGAGGCTGAGAAAACCTGGAGCATTAGAGAGAAAAACCCAGAAAATGGCGCCCGAAG 4475

  1868100 CTCACACTGGGCTGGACCAGTGCCTGTCTCCGGCAGCCTCGCGGGAAAGCCTGCGAACTA 1868159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 CTCACACTGGGCTGGACCAGTGCCTGTCTCCGGCAGCCTCGCGGGAAAGCCTGCGAACTA 4535

  1868160 GGCGGCTCCAGGGCACAGCACTGAGATGGACACCCCGCAGCAAGGGGCGGTGTGAGCCCC 1868219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 GGCGGCTCCAGGGCACAGCACTGAGATGGACACCCCGCAGCAAGGGGCGGTGTGAGCCCC 4595

  1868220 AGACAGACGCTGCCCTGCTCCCACCTCACATTTCCTAAACCGAGACCCAGAGAACCAGGC 1868279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 AGACAGACGCTGCCCTGCTCCCACCTCACATTTCCTAAACCGAGACCCAGAGAACCAGGC 4655

  1868280 TGTTTCCAAGTACCTGAACTGTGTCTCCGAACAGAGCTCACGAATATTTATAGGAACACA 1868339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 TGTTTCCAAGTACCTGAACTGTGTCTCCGAACAGAGCTCACGAATATTTATAGGAACACA 4715

  1868340 CACACACGTGCATGCACAGGCACAC--------GCACACATGCACACACAGCCTCGCAGC 1868391
          |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||
     4716 CACACACGTGCATGCACAGGCACACGCACACATGCACACATGCACACACAGCCTCGCAGC 4775

  1868392 ACTCAACAAAGAGAAAATCAGCTGAGTGAAACAGACCTAGGGCTGACCTGACGTCAGAAG 1868451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 ACTCAACAAAGAGAAAATCAGCTGAGTGAAACAGACCTAGGGCTGACCTGACGTCAGAAG 4835

  1868452 CGGCAGATCACATTAAGTCACTGTAACTTTGCTCCATATGCCCAAAAAATTGAGGATAGA 1868511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 CGGCAGATCACATTAAGTCACTGTAACTTTGCTCCATATGCCCAAAAAATTGAGGATAGA 4895

  1868512 CATAAAAGGGACAAAAAAGAGCCAAATTGACCTTCTAAGGATGAAGACAACAAGTACGGG 1868571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 CATAAAAGGGACAAAAAAGAGCCAAATTGACCTTCTAAGGATGAAGACAACAAGTACGGG 4955

  1868572 GGACGGATCCATGCCAGATCAGACATGGCGAAAACAGGATCAGTGAAGCTGCAGATACAA 1868631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 GGACGGATCCATGCCAGATCAGACATGGCGAAAACAGGATCAGTGAAGCTGCAGATACAA 5015

  1868632 CCACGGAAACCGTCCGAGATGAAACAGATGAGAAAAAGAAAGAAAAGCGCATACAAACAA 1868691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 CCACGGAAACCGTCCGAGATGAAACAGATGAGAAAAAGAAAGAAAAGCGCATACAAACAA 5075

  1868692 AAAGGAAAAAACGGAAAGACAGACATAAAGGAGGCAGCACATTGGGCGTGGGCTGTGGGG 1868751
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5076 AAAGGAAAAAACGGAAAGACAGACATAAAGGAGGCGGCACATTGGGCGTGGGCTGTGGGG 5135

  1868752 CGACGTCACATGGCCTGACACGTAGGGCAGGAGTCCTGGAGGCAGGCTGGTGG 1868804
          |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 CGACGTCACGTGGCCTGACACGTAGGGCAGGAGTCCTGGAGGCAGGCTGGTGG 5188

Alignment time is 5.59649 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   3742] =>      3742 nucs 'mol-32-22e9-015124_3742'

Score:        3731
Aligned:      3742        nucs
Identic:      3741 (100%) nucs =>       879 (100%)      2862 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1855165,1856043] EXCISED REGION [1863577,1866439]
 second seq =>  [      1,    879] EXCISED REGION [    880,   3742]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      7533 nucs [1856044,1863576]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1855165 GCAAAGGGAAGTCCTGGAGCTGGGGCCCGGCCTTGAGGCAGAGCTGGAAGCTGCTACGCG 1855224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAAAGGGAAGTCCTGGAGCTGGGGCCCGGCCTTGAGGCAGAGCTGGAAGCTGCTACGCG 60

  1855225 GAGGGGCCTCAGCCCATGGTGGTGGGGAGGGCACCCCAGCCACCCTTGGTCCCAGCTGCC 1855284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGGGCCTCAGCCCATGGTGGTGGGGAGGGCACCCCAGCCACCCTTGGTCCCAGCTGCC 120

  1855285 ACCTGTGCACTCCCTGAGCAGAGATGCCTGACTCACCCTAACGTTGTCCGGGCTGCAGAT 1855344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTGTGCACTCCCTGAGCAGAGATGCCTGACTCACCCTAACGTTGTCCGGGCTGCAGAT 180

  1855345 GGCGGCGGCTGCTGAGGGAGCTCCTTCCCCTCCTCCCGCCCACCCTGCTAGGGCTAGGCC 1855404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCGGCGGCTGCTGAGGGAGCTCCTTCCCCTCCTCCCGCCCACCCTGCTAGGGCTAGGCC 240

  1855405 ACAGATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGAAGATTTTATTTCACAAGGTGAGG 1855464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGAAGATTTTATTTCACAAGGTGAGG 300

  1855465 AACCCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTCCGGGACGCATGGGGTCTGCACGT 1855524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACCCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTCCGGGACGCATGGGGTCTGCACGT 360

  1855525 GGAGAGGGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACGTAGGTCCCAGCGTGTCTGTCAGT 1855584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGAGGGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACGTAGGTCCCAGCGTGTCTGTCAGT 420

  1855585 CATGCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGTGCACCCAGCCTGTGGCTGGCGGG 1855644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATGCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGTGCACCCAGCCTGTGGCTGGCGGG 480

  1855645 GCAGGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTCCGGCTATGCCCCCGAGCCTGCAG 1855704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTCCGGCTATGCCCCCGAGCCTGCAG 540

  1855705 GCTACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGTGAGCGAGCTGAGGAAGGCAGGGA 1855764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGTGAGCGAGCTGAGGAAGGCAGGGA 600

  1855765 TGCTGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTCGCCCACGGTGTGTGAGAACTCTG 1855824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTCGCCCACGGTGTGTGAGAACTCTG 660

  1855825 TCTCCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGTGGCCTGCGGGGCAGTCAAGAAAG 1855884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGTGGCCTGCGGGGCAGTCAAGAAAG 720

  1855885 AGACAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTCTCCCCTCCCTCCCTACACAGCCC 1855944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGACAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTCTCCCCTCCCTCCCTACACAGCCC 780

  1855945 CTCCAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTGGACAGGGGTAGATGCGTCCTCAA 1856004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTGGACAGGGGTAGATGCGTCCTCAA 840

  1856005 CCCTGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACTGA 1856043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCTGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACTGA 879

EXCISED REGION

  1863577 GGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGT 1863636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 GGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGT 939

  1863637 GGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCT 1863696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 GGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCT 999

  1863697 GACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGC 1863756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 GACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGC 1059

  1863757 CTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTC 1863816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 CTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTC 1119

  1863817 AATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCG 1863876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 AATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCG 1179

  1863877 GGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAA 1863936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 GGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAA 1239

  1863937 CCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAG 1863996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 CCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAG 1299

  1863997 CCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACC 1864056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 CCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACC 1359

  1864057 GGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCG 1864116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 GGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCG 1419

  1864117 GGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAG 1864176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 GGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAG 1479

  1864177 TGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCC 1864236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCC 1539

  1864237 CGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGG 1864296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 CGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGG 1599

  1864297 CGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAAT 1864356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 CGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAAT 1659

  1864357 ACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAA 1864416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 ACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAA 1719

  1864417 TCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGT 1864476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGT 1779

  1864477 CCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCG 1864536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 CCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCG 1839

  1864537 AGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACA 1864596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 AGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACA 1899

  1864597 CACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAA 1864656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 CACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAA 1959

  1864657 TGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGA 1864716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGA 2019

  1864717 TTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAA 1864776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 TTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAA 2079

  1864777 GAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGC 1864836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 GAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGC 2139

  1864837 AAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTC 1864896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 AAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTC 2199

  1864897 TGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTG 1864956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTG 2259

  1864957 CTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTG 1865016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 CTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTG 2319

  1865017 GCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGC 1865076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 GCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGC 2379

  1865077 TGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTC 1865136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 TGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTC 2439

  1865137 ATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCA 1865196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 ATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCA 2499

  1865197 GGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTT 1865256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 GGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTT 2559

  1865257 TGCGGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTC 1865316
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 TGCAGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTC 2619

  1865317 TGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAG 1865376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 TGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAG 2679

  1865377 GCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATC 1865436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 GCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATC 2739

  1865437 CCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCA 1865496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 CCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCA 2799

  1865497 GCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGT 1865556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 GCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGT 2859

  1865557 CCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCG 1865616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 CCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCG 2919

  1865617 CGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGT 1865676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 CGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGT 2979

  1865677 GATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCG 1865736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 GATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCG 3039

  1865737 TGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACA 1865796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 TGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACA 3099

  1865797 GCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCAC 1865856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 GCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCAC 3159

  1865857 GGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCC 1865916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 GGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCC 3219

  1865917 CGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCG 1865976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 CGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCG 3279

  1865977 AGGGCCTCCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGC 1866036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 AGGGCCTCCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGC 3339

  1866037 TCATGGCCTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCC 1866096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 TCATGGCCTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCC 3399

  1866097 TCCAGCTCCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTT 1866156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 TCCAGCTCCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTT 3459

  1866157 TGACCCCAGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACT 1866216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 TGACCCCAGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACT 3519

  1866217 GTCCCTCCGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGAT 1866276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 GTCCCTCCGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGAT 3579

  1866277 GCTGCCGCGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCGGCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACA 1866336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 GCTGCCGCGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCGGCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACA 3639

  1866337 GAACGCCGAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTCCAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTG 1866396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 GAACGCCGAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTCCAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTG 3699

  1866397 TGTCCGGCACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTATTCCTGCCTA 1866439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 TGTCCGGCACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTATTCCTGCCTA 3742

Alignment time is 3.61762 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   6663] =>      6663 nucs 'mol-32-2b13-069499_6663'

Score:        6543
Aligned:      6665        nucs
Identic:      6649 (100%) nucs =>      1406 (100%)      5243 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1859323,1860728] EXCISED REGION [1860734,1865988]
 second seq =>  [      1,   1407] EXCISED REGION [   1411,   6663]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [1860729,1860733]
 second seq =>         3 nucs [1408,1410]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1408,1409] to [1411,1412]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1859323 CGGACAAGAGGCACGGAGTGAGGGAGGGGTGGGGGCTGACAAAGGGCTTGGAGAGCAGAG 1859382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGGACAAGAGGCACGGAGTGAGGGAGGGGTGGGGGCTGACAAAGGGCTTGGAGAGCAGAG 60

  1859383 ACAGCGCACACCACCAACTCTCTCCACACACCACTTTCTCCACACACCACCAACCGCAGG 1859442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGCGCACACCACCAACTCTCTCCACACACCACTTTCTCCACACACCACCAACCGCAGG 120

  1859443 ATGTGGTGGGGCTCGGAGGCCAAGGGGGAAGTGTGAGGGATTCCTGTCAAGAACAAGACC 1859502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTGGTGGGGCTCGGAGGCCAAGGGGGAAGTGTGAGGGATTCCTGTCAAGAACAAGACC 180

  1859503 CCCTGCTGCTGAGGGTCCAAGAGAAACTCCATGAACTGGGAAACTCGAGGGGAGGAAGCT 1859562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCTGCTGCTGAGGGTCCAAGAGAAACTCCATGAACTGGGAAACTCGAGGGGAGGAAGCT 240

  1859563 AGAGATGGAATGAAGGAAGCCCTGAATCCTGGCTCAAACAAGGAAAGCTGAAATAATGCA 1859622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGATGGAATGAAGGAAGCCCTGAATCCTGGCTCAAACAAGGAAAGCTGAAATAATGCA 300

  1859623 GTAAAATGAGAAGACACGCAGGAAATGGAAACGATGCTACTTCGAGATACTGGGAAGTTA 1859682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAAAATGAGAAGACACGCAGGAAATGGAAACGATGCTACTTCGAGATACTGGGAAGTTA 360

  1859683 TGTGAATGCTGTTCATCTGTGGGGTGGCGTGAAGAGGTGGAGGCCACACCAGTGGACATC 1859742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTGAATGCTGTTCATCTGTGGGGTGGCGTGAAGAGGTGGAGGCCACACCAGTGGACATC 420

  1859743 AAAACCAGAAACCAGTCAGAGAAAGACAACAGGAAAACTGTAAGTGCCTGGAAATTAAAC 1859802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAACCAGAAACCAGTCAGAGAAAGACAACAGGAAAACTGTAAGTGCCTGGAAATTAAAC 480

  1859803 AGCACACTTCTAAGTAATCCACGAGTCAAATGGGATGCCTCGAAGGAAATAAAAAAGAGA 1859862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCACACTTCTAAGTAATCCACGAGTCAAATGGGATGCCTCGAAGGAAATAAAAAAGAGA 540

  1859863 ACAGAATGGAAACAAGAATACAGCATAATGAAATTTGCCAGACGCACCCAAGGCAGTGCT 1859922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGAATGGAAACAAGAATACAGCATAATGAAATTTGCCAGACGCACCCAAGGCAGTGCT 600

  1859923 TAGAGGGAAACGGACAGCACTCAATGCCTGTATCAGGAAAGGAGAAAGATCTCAAATCGC 1859982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGAGGGAAACGGACAGCACTCAATGCCTGTATCAGGAAAGGAGAAAGATCTCAAATCGC 660

  1859983 TTCTCTAAATTCCTACTTCAAGAAACGAAGGGAAAAACAAGCCCGAAGCAGGAGGAGGAA 1860042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTCTAAATTCCTACTTCAAGAAACGAAGGGAAAAACAAGCCCGAAGCAGGAGGAGGAA 720

  1860043 ATAATACAAGTAGGAATGAACAGGAAAACAAAAGTTATTAAAACCAAAAACTGCTTCTTT 1860102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAATACAAGTAGGAATGAACAGGAAAACAAAAGTTATTAAAACCAAAAACTGCTTCTTT 780

  1860103 AAAAAATAGCAATAAGGCCGGCCAGGAGCAGGG-CTCACACCTGTAATCTTTGCACTTTG 1860161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAATAGCAATAAGGCCGGCCAGGAGCAGGGGCTCACACCTGTAATCTTTGCACTTTG 840

  1860162 GGAGGCCAAGGTGAGAGGATCACTTGAGCCCTGGAGTTTGAGACCAGCCTGGACAACACA 1860221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGGCCAAGGTGAGAGGATCACTTGAGCCCTGGAGTTTGAGACCAGCCTGGACAACACA 900

  1860222 GTGAGACCCCATCCCTATAATCAATCAGCCAGGTGTGGTGGCATACACCTGTAGCCCCAG 1860281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGAGACCCCATCCCTATAATCAATCAGCCAGGTGTGGTGGCATACACCTGTAGCCCCAG 960

  1860282 GTATGTGGGATCACGTGGGCCTAGGAGTTTGAGGCTGTAGTGAGCTATGATCACACCACT 1860341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTATGTGGGATCACGTGGGCCTAGGAGTTTGAGGCTGTAGTGAGCTATGATCACACCACT 1020

  1860342 GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAATTTGTTAGAAAGACCAGC 1860401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAATTTGTTAGAAAGACCAGC 1080

  1860402 AACGATAAATTGATAAACCCCTGGCAAAACTGACAAAGATTAAAAAGGGGGAACGCCTGT 1860461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACGATAAATTGATAAACCCCTGGCAAAACTGACAAAGATTAAAAAGGGGGAACGCCTGT 1140

  1860462 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCAT 1860521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCAT 1200

  1860522 CCTGGCTAACACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGG 1860581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGGCTAACACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGG 1260

  1860582 TGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTCCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCC 1860641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTCCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCC 1320

  1860642 AGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACACA 1860701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACACA 1380

  1860702 GCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAA 1860728
          |||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAA 1407

EXCISED REGION

  1860734 GGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGAAATGGAAATATTATAATAGATCCAGA 1860793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 GGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGAAATGGAAATATTATAATAGATCCAGA 1470

  1860794 AGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACAAAACTTGATGCTCATAACAAACTGGA 1860853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 AGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACAAAACTTGATGCTCATAACAAACTGGA 1530

  1860854 TGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGTGCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTC 1860913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 TGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGTGCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTC 1590

  1860914 CTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAATTAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTC 1860973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 CTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAATTAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTC 1650

  1860974 CCAGATGGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACATTAAATATGAATTAATACCAATTTTAC 1861033
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 CCAGATAGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACATTAAATATGAATTAATACCAATTTTAC 1710

  1861034 ACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAACACCTTTCCACTATGAACCCTGTACT 1861093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 ACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAACACCTTTCCACTATGAACCCTGTACT 1770

  1861094 GAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAAATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTA 1861153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 GAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAAATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTA 1830

  1861154 GCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGGAATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTA 1861213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 GCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGGAATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTA 1890

  1861214 TCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTGTACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGA 1861273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 TCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTGTACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGA 1950

  1861274 AAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGCTAAAGGAAGACAATGATATGATCCTA 1861333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 AAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGCTAAAGGAAGACAATGATATGATCCTA 2010

  1861334 TTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATCTCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAA 1861393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATCTCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAA 2070

  1861394 AGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTAAAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCT 1861453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 AGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTAAAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCT 2130

  1861454 CACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCCCTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCT 1861513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 CACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCCCTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCT 2190

  1861514 TTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTCCTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAA 1861573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTCCTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAA 2250

  1861574 AAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAACAGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACA 1861633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 AAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAACAGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACA 2310

  1861634 TGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGCAGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGG 1861693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGCAGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGG 2370

  1861694 CCCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAACTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACG 1861753
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 CTCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAACTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACG 2430

  1861754 AAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAATTAACCACATTTCTATAAAGCAATTGC 1861813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 AAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAATTAACCACATTTCTATAAAGCAATTGC 2490

  1861814 AAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATAATTTACAGAACATCTTAAATACTCGG 1861873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 AAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATAATTTACAGAACATCTTAAATACTCGG 2550

  1861874 GTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGTTTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATG 1861933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 GTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGTTTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATG 2610

  1861934 AAAGGAATCGAAAGGAATAAAAAGAATGTTTGTATAAATAGATACAATGTTTATGAACTG 1861993
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 AAAGGAATCGAAAGGAATCAAAAGAATGTTTGTATAAATAGATACAATGTTTATGAACTG 2670

  1861994 GAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTGATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGT 1862053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 GAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTGATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGT 2730

  1862054 CCAAACCTCAGCATATATATATATATTTTT---TTTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTAT 1862110
          ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||
     2731 CCAAACCTCAGCATATATATATATAT----ATATTTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTAT 2786

  1862111 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATC 1862170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATC 2846

  1862171 TTCCTGCCTCAACGTGCCAAGTAGCTGTAACTACAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGT 1862230
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 TTCCTGCCTCAATGTGCCAAGTAGCTGTAACTACAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGT 2906

  1862231 ATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGG 1862290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 ATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGG 2966

  1862291 CTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCA 1862350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 CTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCA 3026

  1862351 TGCCCGGCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAAT 1862410
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 TGCCCGGCCAGCA-TTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAAT 3085

  1862411 GTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGA 1862470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 GTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGA 3145

  1862471 ACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCCTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCA 1862530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 ACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCCTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCA 3205

  1862531 GCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACAGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCA 1862590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 GCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACAGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCA 3265

  1862591 CAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCG 1862650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 CAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCG 3325

  1862651 TTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAA 1862710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAA 3385

  1862711 CAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTAATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAG 1862770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 CAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTAATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAG 3445

  1862771 TCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAG 1862830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAG 3505

  1862831 GAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAA 1862890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 GAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAA 3565

  1862891 AATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGTAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGA 1862950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 AATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGTAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGA 3625

  1862951 AATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGACACTCAACACCAAAGCACAATCCACAG 1863010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 AATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGACACTCAACACCAAAGCACAATCCACAG 3685

  1863011 AATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAAAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAG 1863070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 AATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAAAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAG 3745

  1863071 AGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACGACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCA 1863130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 AGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACGACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCA 3805

  1863131 TCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCTGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGT 1863190
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3806 TCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCCGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGT 3865

  1863191 CTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTG 1863250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 CTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTG 3925

  1863251 TCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCACCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAG 1863310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 TCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCACCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAG 3985

  1863311 AGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAGGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGAC 1863370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 AGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAGGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGAC 4045

  1863371 ACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCC 1863430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 ACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCC 4105

  1863431 GCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTTCATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCA 1863490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4106 GCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTCCATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCA 4165

  1863491 CCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGT 1863550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 CCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGT 4225

  1863551 GTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGG 1863610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 GTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGG 4285

  1863611 GGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAG 1863670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAG 4345

  1863671 GATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCA 1863730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 GATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCA 4405

  1863731 CTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCT 1863790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 CTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCT 4465

  1863791 CAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCT 1863850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 CAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCT 4525

  1863851 CCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTT 1863910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 CCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTT 4585

  1863911 TCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCT 1863970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 TCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCT 4645

  1863971 GGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACT 1864030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 GGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACT 4705

  1864031 AACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGA 1864090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 AACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGA 4765

  1864091 GGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGC 1864150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 GGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGC 4825

  1864151 GCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGC 1864210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 GCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGC 4885

  1864211 AGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCA 1864270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 AGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCA 4945

  1864271 CCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAG 1864330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 CCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAG 5005

  1864331 GTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTT 1864390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 GTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTT 5065

  1864391 TTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGG 1864450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 TTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGG 5125

  1864451 CGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCG 1864510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCG 5185

  1864511 GGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACC 1864570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACC 5245

  1864571 CTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAA 1864630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 CTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAA 5305

  1864631 GGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTG 1864690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 GGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTG 5365

  1864691 ACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAA 1864750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 ACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAA 5425

  1864751 AATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCAC 1864810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 AATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCAC 5485

  1864811 ACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCC 1864870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 ACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCC 5545

  1864871 TCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGC 1864930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGC 5605

  1864931 CCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCT 1864990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 CCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCT 5665

  1864991 GGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCG 1865050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 GGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCG 5725

  1865051 TGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCAC 1865110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 TGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCAC 5785

  1865111 AGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGC 1865170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 AGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGC 5845

  1865171 CCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGT 1865230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 CCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGT 5905

  1865231 GGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCGGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCT 1865290
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 GGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCAGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCT 5965

  1865291 GGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCT 1865350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 GGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCT 6025

  1865351 TCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGAT 1865410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 TCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGAT 6085

  1865411 AAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCAC 1865470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 AAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCAC 6145

  1865471 AGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCA 1865530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 AGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCA 6205

  1865531 GCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGT 1865590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 GCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGT 6265

  1865591 CCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAG 1865650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 CCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAG 6325

  1865651 TGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTA 1865710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 TGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTA 6385

  1865711 CAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAG 1865770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 CAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAG 6445

  1865771 GACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGG 1865830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 GACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGG 6505

  1865831 GGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCAC 1865890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 GGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCAC 6565

  1865891 CGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTC 1865950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 CGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTC 6625

  1865951 TCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCTCCTCC 1865988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 TCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCTCCTCC 6663

Alignment time is 6.33216 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   5443] =>      5443 nucs 'mol-32-2e0a-106955_5443'

Score:        5364
Aligned:      5441        nucs
Identic:      5434 (100%) nucs =>       667 (100%)      4767 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1861411,1862079] EXCISED REGION [1862084,1866855]
 second seq =>  [      1,    669] EXCISED REGION [    673,   5443]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [1862080,1862083]
 second seq =>         3 nucs [670,672]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [1862079,1862090] to [1862083,1862094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1862079,1862079] to [1862084,1862084]
 second seq =>         1 nucs [669,669] to [673,673]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [1862080,1862081] to [1862082,1862083]
 second seq =>         1 nucs [670,670] to [672,672]

  1861411 AGTCCTCCGACTTGGTAAAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCTCACGCTGCTTCACGGAA 1861470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCCTCCGACTTGGTAAAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCTCACGCTGCTTCACGGAA 60

  1861471 GAGTCTGGCCGCCTTCCCTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCTTTCCCCACTCATCCTCA 1861530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGTCTGGCCGCCTTCCCTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCTTTCCCCACTCATCCTCA 120

  1861531 ACCCAGCATGGGAGCTCCTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAAAAGGAAAGCAGCAGCAT 1861590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCAGCATGGGAGCTCCTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAAAAGGAAAGCAGCAGCAT 180

  1861591 AGGGATTGGAAAAGAACAGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACATGACGGCACACGTGGAA 1861650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGGATTGGAAAAGAACAGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACATGACGGCACACGTGGAA 240

  1861651 AACCCTAAGCAATCTGCAGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGGCCCACGTGGAAAATCCT 1861710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      241 AACCCTAAGCAATCTGCAGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGGCTCACGTGGAAAATCCT 300

  1861711 GAGCAATCTGCAGAAAACTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACGAAGGTTGCAGGAAATAA 1861770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGCAATCTGCAGAAAACTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACGAAGGTTGCAGGAAATAA 360

  1861771 GATGAACATACAAAAATTAACCACATTTCTATAAAGCAATTGCAAACAAGTGAAAAACAA 1861830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATGAACATACAAAAATTAACCACATTTCTATAAAGCAATTGCAAACAAGTGAAAAACAA 420

  1861831 AATTAAAAGGCAATATAATTTACAGAACATCTTAAATACTCGGGTATACATCTAACAAAA 1861890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTAAAAGGCAATATAATTTACAGAACATCTTAAATACTCGGGTATACATCTAACAAAA 480

  1861891 ACTTGTATAGTGTCTGTTTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATGAAAGGAATCGAAAGGAA 1861950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTGTATAGTGTCTGTTTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATGAAAGGAATCGAAAGGAA 540

  1861951 TAAAAAGAATGTTTGTATAAATAGATACAATGTTTATGAACTGGAAGACTTATAGTAAAT 1862010
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAAAAGAATGTTTGTATAAATAGATACAATGTTTATGAACTGGAAGACTTATAGTAAAT 600

  1862011 CAATTTTTCCAAAATTGATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGTCCAAACCTCAGCATATA 1862070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAATTTTTCCAAAATTGATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGTCCAAACCTCAGCATATA 660

  1862071 TATATATAT 1862079
          |||||||||
      661 TATATATAT 669

EXCISED REGION

  1862084 TTTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGT 1862143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 TTTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGT 732

  1862144 CTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATCTTCCTGCCTCAACGTGCCAAGTAGCTGTAACTA 1862203
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      733 CTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATCTTCCTGCCTCAATGTGCCAAGTAGCTGTAACTA 792

  1862204 CAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGTATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTT 1862263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 CAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGTATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTT 852

  1862264 GCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAG 1862323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 GCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAG 912

  1862324 TGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGG 1862383
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
      913 TGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAGCA-TTTTTTTTTTTTTTTTTGG 971

  1862384 TAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAATGTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTA 1862443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 TAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAATGTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTA 1031

  1862444 GAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGAACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTC 1862503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGAACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTC 1091

  1862504 CTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCAGCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAAC 1862563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 CTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCAGCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAAC 1151

  1862564 AGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCACAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAAT 1862623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 AGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCACAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAAT 1211

  1862624 ATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCGTTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAA 1862683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 ATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCGTTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAA 1271

  1862684 ATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAACAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATT 1862743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 ATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAACAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATT 1331

  1862744 AATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAGTCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCC 1862803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 AATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAGTCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCC 1391

  1862804 TTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAGGAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTT 1862863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAGGAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTT 1451

  1862864 TTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAAAATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATG 1862923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 TTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAAAATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATG 1511

  1862924 TAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGAAATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGA 1862983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 TAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGAAATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGA 1571

  1862984 CACTCAACACCAAAGCACAATCCACAGAATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCA 1863043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 CACTCAACACCAAAGCACAATCCACAGAATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCA 1631

  1863044 AAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACAC 1863103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 AAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACAC 1691

  1863104 GACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCATCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCC 1863163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 GACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCATCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCC 1751

  1863164 TGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGTCTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCT 1863223
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 CGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGTCTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCT 1811

  1863224 GGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTGTCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCA 1863283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 GGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTGTCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCA 1871

  1863284 CCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAGAGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGA 1863343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAGAGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGA 1931

  1863344 GGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGACACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAA 1863403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGACACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAA 1991

  1863404 GCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCCGCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTT 1863463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1992 GCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCCGCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTC 2051

  1863464 CATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCC 1863523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCC 2111

  1863524 CTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTG 1863583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTG 2171

  1863584 TGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGA 1863643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGA 2231

  1863644 CGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGG 1863703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 CGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGG 2291

  1863704 GGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCAC 1863763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 GGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCAC 2351

  1863764 CACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTG 1863823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTG 2411

  1863824 ACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGG 1863883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 ACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGG 2471

  1863884 TGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGC 1863943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 TGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGC 2531

  1863944 TTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTC 1864003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 TTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTC 2591

  1864004 TGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCA 1864063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCA 2651

  1864064 GGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATG 1864123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 GGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATG 2711

  1864124 AGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTG 1864183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 AGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTG 2771

  1864184 CTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCC 1864243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 CTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCC 2831

  1864244 CCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCT 1864303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 CCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCT 2891

  1864304 GGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTG 1864363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 GGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTG 2951

  1864364 CTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGT 1864423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 CTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGT 3011

  1864424 GTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGC 1864483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGC 3071

  1864484 ACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCA 1864543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 ACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCA 3131

  1864544 GCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTC 1864603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 GCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTC 3191

  1864604 TCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGT 1864663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGT 3251

  1864664 TAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTT 1864723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 TAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTT 3311

  1864724 ATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGA 1864783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 ATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGA 3371

  1864784 ACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCC 1864843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCC 3431

  1864844 AATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGG 1864903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 AATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGG 3491

  1864904 AGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCA 1864963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 AGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCA 3551

  1864964 CCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTT 1865023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 CCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTT 3611

  1865024 GGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGG 1865083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 GGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGG 3671

  1865084 GGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGC 1865143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 GGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGC 3731

  1865144 TGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACC 1865203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 TGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACC 3791

  1865204 CAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCGGTG 1865263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3792 CAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCAGTG 3851

  1865264 CCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGA 1865323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 CCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGA 3911

  1865324 GCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGG 1865383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 GCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGG 3971

  1865384 ACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAG 1865443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 ACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAG 4031

  1865444 GTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGT 1865503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 GTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGT 4091

  1865504 CCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCC 1865563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 CCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCC 4151

  1865564 CCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCC 1865623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 CCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCC 4211

  1865624 AGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACG 1865683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 AGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACG 4271

  1865684 TCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTA 1865743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 TCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTA 4331

  1865744 CGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGC 1865803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 CGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGC 4391

  1865804 TCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGA 1865863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 TCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGA 4451

  1865864 AGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGC 1865923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 AGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGC 4511

  1865924 GCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCT 1865983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 GCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCT 4571

  1865984 CCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGCTCATGGC 1866043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 CCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGCTCATGGC 4631

  1866044 CTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCCTCCAGCT 1866103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 CTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCCTCCAGCT 4691

  1866104 CCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTTTGACCCC 1866163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 CCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTTTGACCCC 4751

  1866164 AGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACTGTCCCTC 1866223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 AGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACTGTCCCTC 4811

  1866224 CGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGATGCTGCCG 1866283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 CGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGATGCTGCCG 4871

  1866284 CGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCGGCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACAGAACGCC 1866343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 CGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCGGCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACAGAACGCC 4931

  1866344 GAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTCCAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTGTGTCCGG 1866403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4932 GAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTCCAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTGTGTCCGG 4991

  1866404 CACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTATTCCTGCCTAATTGTACCGAGGAAAGCATCTAAA 1866463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4992 CACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTATTCCTGCCTAATTGTACCGAGGAAAGCATCTAAA 5051

  1866464 TACTGCCTGTGCTAATTATACCAGCGTTATTGGGGTTTATCTTCCCGGCGAGGGTGACCT 1866523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5052 TACTGCCTGTGCTAATTATACCAGCGTTATTGGGGTTTATCTTCCCGGCGAGGGTGACCT 5111

  1866524 TTCCTTCAAGAGTGACTGGCGGGGCGGGCAAGGCCAGGCACCCCAGCAGTCGCAGAAAAA 1866583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5112 TTCCTTCAAGAGTGACTGGCGGGGCGGGCAAGGCCAGGCACCCCAGCAGTCGCAGAAAAA 5171

  1866584 TCCCAAACCAACAATTATTATTATTATTATTCTATTTATACAGCTCCCCCTCGCACACGG 1866643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5172 TCCCAAACCAACAATTATTATTATTATTATTCTATTTATACAGCTCCCCCTCGCACACGG 5231

  1866644 GCGTTCTGCTTTACAGCCACACGCAGCTGCTCCTGCAGCCGCAGCCGGAGGGGAGCCGAG 1866703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5232 GCGTTCTGCTTTACAGCCACACGCAGCTGCTCCTGCAGCCGCAGCCGGAGGGGAGCCGAG 5291

  1866704 GGAGTGGGGGCGCCGGCTCGGGGTGGGGCGGCCTGCGCAGCCCCTGCTGTGAGTGGCATC 1866763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5292 GGAGTGGGGGCGCCGGCTCGGGGTGGGGCGGCCTGCGCAGCCCCTGCTGTGAGTGGCATC 5351

  1866764 CGCCACGGGCGGCTCCAAGGGCCGTGGAAGGGCATGGAGGCCACAGGGATGAGTTAGAGG 1866823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5352 CGCCACGGGCGGCTCCAAGGGCCGTGGAAGGGCATGGAGGCCACAGGGATGAGTTAGAGG 5411

  1866824 AGGTGGCGGGGATGGAGAAGGTGGGAGAAGGG 1866855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5412 AGGTGGCGGGGATGGAGAAGGTGGGAGAAGGG 5443

Alignment time is 5.20242 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   4664] =>      4664 nucs 'mol-32-2fcd-098824_4664'

Score:        4409
Aligned:      4745        nucs
Identic:      4640 ( 98%) nucs =>       661 (100%)      3979 ( 97%)
Gaps:           96 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1855383,1856043] EXCISED REGION [1863577,1867645]
 second seq =>  [      1,    661] EXCISED REGION [    662,   4664]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      7533 nucs [1856044,1863576]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1855383 CCCACCCTGCTAGGGCTAGGCCACAGATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGAA 1855442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCACCCTGCTAGGGCTAGGCCACAGATACACAGGGCGAGTGGGAGTGTCTAGGGGAGAA 60

  1855443 GATTTTATTTCACAAGGTGAGGAACCCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTCC 1855502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTTTATTTCACAAGGTGAGGAACCCAGGCTGGTGGCCGACGCCCACACACCAGGCTCC 120

  1855503 GGGACGCATGGGGTCTGCACGTGGAGAGGGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACGT 1855562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGACGCATGGGGTCTGCACGTGGAGAGGGTGCTGGCCGCCCCAGCAGGAAGCCCGACGT 180

  1855563 AGGTCCCAGCGTGTCTGTCAGTCATGCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGTG 1855622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTCCCAGCGTGTCTGTCAGTCATGCTGCTGCCCTGTGGGGCTGGAGAGGCAGGACGTG 240

  1855623 CACCCAGCCTGTGGCTGGCGGGGCAGGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTCC 1855682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCCAGCCTGTGGCTGGCGGGGCAGGGGACCTGCAGGTCAGGCCAAGCAGAGTGGCTCC 300

  1855683 GGCTATGCCCCCGAGCCTGCAGGCTACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGTG 1855742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTATGCCCCCGAGCCTGCAGGCTACGCCACGGTCTGGCGGCTGAAGAGCTCGAGGGTG 360

  1855743 AGCGAGCTGAGGAAGGCAGGGATGCTGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTCG 1855802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCGAGCTGAGGAAGGCAGGGATGCTGTCCTGGCGCCGCAGGTGCACCTCGATGAGCTCG 420

  1855803 CCCACGGTGTGTGAGAACTCTGTCTCCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGTG 1855862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCACGGTGTGTGAGAACTCTGTCTCCAGTAGCTGCATCTTGGAACCCGAGGGGCTGGTG 480

  1855863 GCCTGCGGGGCAGTCAAGAAAGAGACAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTCT 1855922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTGCGGGGCAGTCAAGAAAGAGACAAGACAGCGGTCAGCCCGACAGGCCTCTCCCTCT 540

  1855923 CCCCTCCCTCCCTACACAGCCCCTCCAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTGG 1855982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCCTCCCTCCCTACACAGCCCCTCCAGCCATGGGGGCTTCCCTCAGTCTGAGGACCTGG 600

  1855983 ACAGGGGTAGATGCGTCCTCAACCCTGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACTG 1856042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGGGGTAGATGCGTCCTCAACCCTGCCAGGCCTTATTCCAGGTCACCTAAAGGGACTG 660

  1856043 A 1856043
          |
      661 A 661

EXCISED REGION

  1863577 GGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGT 1863636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 GGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGT 721

  1863637 GGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCT 1863696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 GGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCT 781

  1863697 GACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGC 1863756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 GACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGC 841

  1863757 CTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTC 1863816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 CTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTC 901

  1863817 AATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCG 1863876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 AATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCG 961

  1863877 GGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAA 1863936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 GGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAA 1021

  1863937 CCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAG 1863996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 CCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAG 1081

  1863997 CCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACC 1864056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 CCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACC 1141

  1864057 GGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCG 1864116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 GGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCG 1201

  1864117 GGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAG 1864176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 GGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAG 1261

  1864177 TGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCC 1864236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 TGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCC 1321

  1864237 CGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGG 1864296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 CGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGG 1381

  1864297 CGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAAT 1864356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 CGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAAT 1441

  1864357 ACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAA 1864416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 ACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAA 1501

  1864417 TCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGT 1864476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 TCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGT 1561

  1864477 CCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCG 1864536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 CCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCG 1621

  1864537 AGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACA 1864596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 AGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACA 1681

  1864597 CACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAA 1864656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 CACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAA 1741

  1864657 TGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGA 1864716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 TGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGA 1801

  1864717 TTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAA 1864776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 TTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAA 1861

  1864777 GAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGC 1864836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 GAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGC 1921

  1864837 AAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTC 1864896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 AAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTC 1981

  1864897 TGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTG 1864956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 TGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTG 2041

  1864957 CTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTG 1865016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 CTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTG 2101

  1865017 GCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGC 1865076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 GCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGC 2161

  1865077 TGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTC 1865136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 TGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTC 2221

  1865137 ATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCA 1865196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 ATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCA 2281

  1865197 GGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTT 1865256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 GGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTT 2341

  1865257 TGCGGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTC 1865316
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 TGCAGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTC 2401

  1865317 TGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAG 1865376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 TGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAG 2461

  1865377 GCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATC 1865436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 GCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATC 2521

  1865437 CCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCA 1865496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 CCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCA 2581

  1865497 GCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGT 1865556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 GCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGT 2641

  1865557 CCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCG 1865616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 CCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCG 2701

  1865617 CGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGT 1865676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 CGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGT 2761

  1865677 GATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCG 1865736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 GATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCG 2821

  1865737 TGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACA 1865796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 TGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACA 2881

  1865797 GCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCAC 1865856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 GCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCAC 2941

  1865857 GGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCC 1865916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 GGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCC 3001

  1865917 CGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCG 1865976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 CGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCG 3061

  1865977 AGGGCCTCCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGC 1866036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 AGGGCCTCCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGC 3121

  1866037 TCATGGCCTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCC 1866096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 TCATGGCCTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCC 3181

  1866097 TCCAGCTCCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTT 1866156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 TCCAGCTCCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTT 3241

  1866157 TGACCCCAGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACT 1866216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 TGACCCCAGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACT 3301

  1866217 GTCCCTCCGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGAT 1866276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 GTCCCTCCGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGAT 3361

  1866277 GCTGCCGCGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCGGCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACA 1866336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 GCTGCCGCGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCGGCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACA 3421

  1866337 GAACGCCGAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTCCAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTG 1866396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 GAACGCCGAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTCCAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTG 3481

  1866397 TGTCCGGCACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTATTCCTGCCTAATTGTACCGAGGAAAGC 1866456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 TGTCCGGCACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTATTCCTGCCTAATTGTACCGAGGAAAGC 3541

  1866457 ATCTAAATACTGCCTGTGCTAATTATACCAGCGTTATTGGGGTTTATCTTCCCGGCGAGG 1866516
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3542 ATCTAAATACTGCCTGTGCTAATTATACCAGTGTTATTGGGGTTTATCTTCCCGGCGAGG 3601

  1866517 GTGACCTTTCCTTCAAGAGTGACTGGCGGGGCGGGCAAGGCCAGGCACCCCAGCAGTCGC 1866576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 GTGACCTTTCCTTCAAGAGTGACTGGCGGGGCGGGCAAGGCCAGGCACCCCAGCAGTCGC 3661

  1866577 AGAAAAATCCCAAACCAACAATTATTATTATTATTATTCTATTTATACAGCTCCCCCTCG 1866636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 AGAAAAATCCCAAACCAACAATTATTATTATTATTATTCTATTTATACAGCTCCCCCTCG 3721

  1866637 CACACGGGCGTTCTGCTTTACAGCCACACGCAGCTGCTCCTGCAGCCGCAGCCGGAGGGG 1866696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 CACACGGGCGTTCTGCTTTACAGCCACACGCAGCTGCTCCTGCAGCCGCAGCCGGAGGGG 3781

  1866697 AGCCGAGGGAGTGGGGGCGCCGGCTCGGGGTGGGGCGGCCTGCGCAGCCCCTGCTGTGAG 1866756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 AGCCGAGGGAGTGGGGGCGCCGGCTCGGGGTGGGGCGGCCTGCGCAGCCCCTGCTGTGAG 3841

  1866757 TGGCATCCGCCACGGGCGGCTCCAAGGGCCGTGGAAGGGCATGGAGGCCACAGGGATGAG 1866816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 TGGCATCCGCCACGGGCGGCTCCAAGGGCCGTGGAAGGGCATGGAGGCCACAGGGATGAG 3901

  1866817 TTAGAGGAGGTGGCGGGGATGGAGAAGGTGGGAGAAGGGGCTGAGTGTGGGTTAAAAGAC 1866876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 TTAGAGGAGGTGGCGGGGATGGAGAAGGTGGGAGAAGGGGCTGAGTGTGGGTTAAAAGAC 3961

  1866877 AGGGACTGGCCCCGAGGGCAGCAGGAGCACAGAACACAATGAAGGTTAAGGGAAGAAAGG 1866936
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 AGGGACTGGCCCCGAGGGCAGCAGAAGCACAGAACACAATGAAGGTTAAGGGAAGAAAGG 4021

  1866937 GGACGCAGCGGGCAGGGAGGACAGGTGCTCAGATCAGGCACACGGGTGAGGAGGGAGGAG 1866996
          |||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 GGACGCAGCAGGCAGGCAGGACAGGTGCTCAGATCAGGCACACGGGTGAGGAGGGAGGAG 4081

  1866997 CTGCAGCACAGCCCTCGCCCAGTGGCTCCCTGAGCCCCGCCCAGGTGTGGGGTCCTCCCC 1867056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 CTGCAGCACAGCCCTCGCCCAGTGGCTCCCTGAGCCCCGCCCAGGTGTGGGGTCCTCCCC 4141

  1867057 TCCTGAGCCCGTCGCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCGCGGGTGTGGGGGC 1867116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 TCCTGAGCCCGTCGCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCGCGGGTGTGGGGGC 4201

  1867117 CTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGT--CCCGGGT 1867174
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||
     4202 CTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCC--CGCCCGGGT 4259

  1867175 GTGGGGGCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGTGGCAT---CCTCCCCTCCTGAGCCC 1867231
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||      |||||||||||||||||
     4260 GTGGGGGCCTCCCCTCCTGAGCCCGGCCCGGGTGTGG---GGGCCTCCCCTCCTGAGCCC 4316

  1867232 GTCCCGGG--------TGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCCG--CCCGGGTGTGGGGGC 1867281
                          |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||.|
     4317 --------TGCGTGGCTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCC--GTCCCGGGTGTGGGGTC 4366

  1867282 CTCCCCTCCTGAGCCCGGCCCGGGTGTGGGGGCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGT 1867341
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4367 CTCCCCTCCTGAGCCCCGCCCGGGTGTGGGGGCCTCCCCTCCTGAGCCCGGCCCGGGTGT 4426

  1867342 GGGGGCCTCCCCTCCTGAGCCCTGCGTGGCTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCC 1867401
          |||||                                                       
     4427 GGGGG------------------------------------------------------- 4431

  1867402 GGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGGGCC 1867461
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 -----------CCTCCCCTCCTGAGCCCGTCCCGGGTGTGGGGTCCTCCCCTCCTGGGCC 4480

  1867462 CGGGCTAGACAGCACCACCCTTTCCAGATGTAGCCGAATGAGAACAGGAGAGGACGTCAG 1867521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 CGGGCTAGACAGCACCACCCTTTCCAGATGTAGCCGAATGAGAACAGGAGAGGACGTCAG 4540

  1867522 CGGCCTCTGCGCCTTCTCACCTCCCACCCAGGCGAGGCCCATGCTGCTGGCAGTGACGTT 1867581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 CGGCCTCTGCGCCTTCTCACCTCCCACCCAGGCGAGGCCCATGCTGCTGGCAGTGACGTT 4600

  1867582 TCGTGGAGCGCCACGCTTAGGGCAATGTGATGCTGGGGATGCGGGGTGAGGAGGGCCGGA 1867641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 TCGTGGAGCGCCACGCTTAGGGCAATGTGATGCTGGGGATGCGGGGTGAGGAGGGCCGGA 4660

  1867642 GATG 1867645
          ||||
     4661 GATG 4664

Alignment time is 4.49797 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   4160] =>      4160 nucs 'mol-32-314e-259475_4160'

Score:        4094
Aligned:      4160        nucs
Identic:      4154 (100%) nucs =>        69 (100%)      4085 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1862114,1862182] EXCISED REGION [1862184,1866274]
 second seq =>  [      1,     69] EXCISED REGION [     71,   4160]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [1862183,1862183]
 second seq =>         1 nucs [70,70]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [1862364,1862364]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1862114 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATCTTC 1862173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATCTTC 60

  1862174 CTGCCTCAA 1862182
          |||||||||
       61 CTGCCTCAA 69

EXCISED REGION

  1862184 GTGCCAAGTAGCTGTAACTACAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGTATTTTTTTCATAG 1862243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       71 GTGCCAAGTAGCTGTAACTACAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGTATTTTTTTCATAG 130

  1862244 AGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCT 1862303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      131 AGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCT 190

  1862304 TTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAGCA 1862363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 TTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAGCA 250

  1862364 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAATGTATATAGAAAGC 1862423
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 -TTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAATGTATATAGAAAGC 309

  1862424 AATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGAACCGTACAGCTAC 1862483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 AATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGAACCGTACAGCTAC 369

  1862484 AGCACAGCGTTATACGGCTCCTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCAGCGCTGGAGGGGA 1862543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 AGCACAGCGTTATACGGCTCCTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCAGCGCTGGAGGGGA 429

  1862544 GATGTGGAGACCAGCAGAACAGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCACAGACGCGTCCAG 1862603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 GATGTGGAGACCAGCAGAACAGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCACAGACGCGTCCAG 489

  1862604 GCCACTTTCTAACAGAGAATATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCGTTTAGGTGTACGA 1862663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 GCCACTTTCTAACAGAGAATATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCGTTTAGGTGTACGA 549

  1862664 GGCTAGCTTGGTATTTGAAAATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAACAGGCTAAAGAAT 1862723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 GGCTAGCTTGGTATTTGAAAATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAACAGGCTAAAGAAT 609

  1862724 AAACAACATATGACCCTATTAATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAGTCACAAAGGCGCT 1862783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 AAACAACATATGACCCTATTAATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAGTCACAAAGGCGCT 669

  1862784 TCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAGGAGCTGGACACAC 1862843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAGGAGCTGGACACAC 729

  1862844 TTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAAAATTTAACTCAAA 1862903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAAAATTTAACTCAAA 789

  1862904 CTGTATCACGAACTTACATGTAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGAAATCTTCAGGATC 1862963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 CTGTATCACGAACTTACATGTAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGAAATCTTCAGGATC 849

  1862964 TGGATGAGGCAGAGCTCTGACACTCAACACCAAAGCACAATCCACAGAATAAAATTAAAA 1863023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 TGGATGAGGCAGAGCTCTGACACTCAACACCAAAGCACAATCCACAGAATAAAATTAAAA 909

  1863024 TGGATAAATGGGCCTCGCCAAAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCA 1863083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 TGGATAAATGGGCCTCGCCAAAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCA 969

  1863084 GATACAAGGATAAGCTACACGACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCATCTCTCCTAGAAC 1863143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GATACAAGGATAAGCTACACGACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCATCTCTCCTAGAAC 1029

  1863144 GCCACGGCCACAGGGGACCCTGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGTCTTAACCCCAAGT 1863203
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 GCCACGGCCACAGGGGACCCCGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGTCTTAACCCCAAGT 1089

  1863204 GGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTGTCTTGCTTCTCTC 1863263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 GGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTGTCTTGCTTCTCTC 1149

  1863264 TTTTCCCAGAACAGACCTCACCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAGAGGCCGGGCCTGT 1863323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TTTTCCCAGAACAGACCTCACCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAGAGGCCGGGCCTGT 1209

  1863324 GGCATCAGCGGCCATCGTGAGGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGACACACCCCTGCTCC 1863383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 GGCATCAGCGGCCATCGTGAGGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGACACACCCCTGCTCC 1269

  1863384 CACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCCGCAGCTGCTGGGC 1863443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 CACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCCGCAGCTGCTGGGC 1329

  1863444 CGGGGGAGGCATGAATATTTCATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACAC 1863503
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 CGGGGGAGGCATGAATATTCCATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACAC 1389

  1863504 AGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGC 1863563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 AGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGC 1449

  1863564 CGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTG 1863623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTG 1509

  1863624 GGAGCCCATTTGTGGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCT 1863683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 GGAGCCCATTTGTGGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCT 1569

  1863684 GCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATG 1863743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 GCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATG 1629

  1863744 GCAGGTAGTCAGCCTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCC 1863803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 GCAGGTAGTCAGCCTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCC 1689

  1863804 AGATAGACGGCTCAATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACC 1863863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 AGATAGACGGCTCAATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACC 1749

  1863864 ACCTGCTTGTGCGGGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAG 1863923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 ACCTGCTTGTGCGGGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAG 1809

  1863924 AACTAGCTTCTAACCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACA 1863983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 AACTAGCTTCTAACCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACA 1869

  1863984 CACCTCTCTTGAGCCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGT 1864043
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 CACCTCTCTTGAGCCTGGTCTGCACGCTTGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGT 1929

  1864044 GCGTAAAATCACCGGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGC 1864103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 GCGTAAAATCACCGGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGC 1989

  1864104 CCACGTTACCCCGGGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGC 1864163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 CCACGTTACCCCGGGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGC 2049

  1864164 CTCTACTGGGAAGTGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTT 1864223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 CTCTACTGGGAAGTGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTT 2109

  1864224 GTCTGCCAGGCCCCGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGG 1864283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 GTCTGCCAGGCCCCGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGG 2169

  1864284 GAGAGGAGAGGGGCGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACC 1864343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GAGAGGAGAGGGGCGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACC 2229

  1864344 TCGCTTGTAGAATACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGA 1864403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 TCGCTTGTAGAATACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGA 2289

  1864404 GGCTGTCAGGAAATCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGA 1864463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 GGCTGTCAGGAAATCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGA 2349

  1864464 GAATCTGACGCGTCCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCA 1864523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 GAATCTGACGCGTCCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCA 2409

  1864524 GCAGCGTCCGCCGAGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACA 1864583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 GCAGCGTCCGCCGAGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACA 2469

  1864584 CTGCAGCACGACACACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAA 1864643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 CTGCAGCACGACACACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAA 2529

  1864644 ATCAAAATGTTAATGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTC 1864703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 ATCAAAATGTTAATGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTC 2589

  1864704 TGCATTTTCCAGATTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAA 1864763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 TGCATTTTCCAGATTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAA 2649

  1864764 ATTATATCTGCAAGAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCAC 1864823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 ATTATATCTGCAAGAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCAC 2709

  1864824 TGCGGACACATGCAAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGC 1864883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TGCGGACACATGCAAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGC 2769

  1864884 TCATCTGCCCGTCTGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCT 1864943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 TCATCTGCCCGTCTGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCT 2829

  1864944 GCTGAGGCCGGTGCTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCT 1865003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 GCTGAGGCCGGTGCTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCT 2889

  1865004 GGCGTCATGGCTGGCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGT 1865063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 GGCGTCATGGCTGGCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGT 2949

  1865064 GAGCCCAGCCAGCTGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCT 1865123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 GAGCCCAGCCAGCTGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCT 3009

  1865124 GAGGCTACCTGTCATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGG 1865183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 GAGGCTACCTGTCATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGG 3069

  1865184 CACCCAGCGGCCAGGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCT 1865243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 CACCCAGCGGCCAGGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCT 3129

  1865244 GTCCACGGGTCTTTGCGGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACC 1865303
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 GTCCACGGGTCTTTGCAGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACC 3189

  1865304 ATGCACACAGCTCTGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTC 1865363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 ATGCACACAGCTCTGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTC 3249

  1865364 TCAGGGGCTGAAGGCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAAT 1865423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TCAGGGGCTGAAGGCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAAT 3309

  1865424 GTGTGCTCTCATCCCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCG 1865483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 GTGTGCTCTCATCCCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCG 3369

  1865484 GGGTTGGAGGTCAGCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGG 1865543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 GGGTTGGAGGTCAGCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGG 3429

  1865544 CGGTCGGCACAGTCCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGG 1865603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 CGGTCGGCACAGTCCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGG 3489

  1865604 TTGGAGGTCGGCGCGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCC 1865663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 TTGGAGGTCGGCGCGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCC 3549

  1865664 AAAGTTCAGGCGTGATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATG 1865723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 AAAGTTCAGGCGTGATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATG 3609

  1865724 GCTGGTGCTACCGTGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGC 1865783
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 GCTGGTGCTACCGTGGTCTACGCAATCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGC 3669

  1865784 CTCACAACTCACAGCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCT 1865843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 CTCACAACTCACAGCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCT 3729

  1865844 GCTGCACATCCACGGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAG 1865903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 GCTGCACATCCACGGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAG 3789

  1865904 TCACTGCCTGGCCCGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGT 1865963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 TCACTGCCTGGCCCGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGT 3849

  1865964 ATTACCTCGGCCGAGGGCCTCCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGC 1866023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 ATTACCTCGGCCGAGGGCCTCCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGC 3909

  1866024 CTGACTCCCCCGCTCATGGCCTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCAC 1866083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 CTGACTCCCCCGCTCATGGCCTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCAC 3969

  1866084 CCTGCACAAGCCCTCCAGCTCCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCC 1866143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 CCTGCACAAGCCCTCCAGCTCCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCGGAGCTCCTGGTCC 4029

  1866144 AGAGGTCCAGGTTTGACCCCAGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCC 1866203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 AGAGGTCCAGGTTTGACCCCAGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCTCAGCTCCCACCCC 4089

  1866204 TCTCTGCCCCACTGTCCCTCCGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAG 1866263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 TCTCTGCCCCACTGTCCCTCCGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAGCCGGGCCCAAAAG 4149

  1866264 AGGCCTCGCAG 1866274
          |||||||||||
     4150 AGGCCTCGCAG 4160

Alignment time is 4.36362 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   7850] =>      7850 nucs 'mol-32-317a-210485_7850'

Score:        7622
Aligned:      7861        nucs
Identic:      7827 (100%) nucs =>        20 (100%)      7807 (100%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1858209,1858228] EXCISED REGION [1858252,1866085]
 second seq =>  [      1,     20] EXCISED REGION [     21,   7850]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        23 nucs [1858229,1858251]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [1858229,1858252] to [1858252,1858275]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1858209 GACTTTAGCTATTTTGCCCA 1858228
          ||||||||||||||||||||
        1 GACTTTAGCTATTTTGCCCA 20

EXCISED REGION

  1858252 GGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTGACGTGATCCTCCTGCCTCAGCTGCCCACGACGTGAG 1858311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       21 GGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTGACGTGATCCTCCTGCCTCAGCTGCCCACGACGTGAG 80

  1858312 GATTACAGGCGTGAGCTCTGATCATTCTTTATTTGAAACAGGTGCACCCCGCCAGCGTCA 1858371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       81 GATTACAGGCGTGAGCTCTGATCATTCTTTATTTGAAACAGGTGCACCCCGCCAGCGTCA 140

  1858372 GCAAGACAGCTGCTCCCAATGGTAGGCCGGGCAACCCACTCACGGCTCCTACAGCACCTC 1858431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      141 GCAAGACAGCTGCTCCCAATGGTAGGCCGGGCAACCCACTCACGGCTCCTACAGCACCTC 200

  1858432 CTCTCTGCCGGCCTCAGGCGGCTCTGGAAGAATGATGCCCTAATATACCGCGCTGCCCTC 1858491
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||
      201 CTCTCTGCCGGCCTCAGGCGGCTCTGGAAGAATGACGCCCTAAGATACCGCGCTGCCCTC 260

  1858492 CAGGTGGGGGTGGGGGTGGACGGAGACAGGCAGGAGTAACCAGTGCTACTCTCCCAGCTC 1858551
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      261 CAGGTGGGGGTGGGGGTGGACGGAGACAGGCAGGAGTGACCAGTGCTACTCTCCCAGCTC 320

  1858552 AAACCCCACACGAAGGCAGACCCAGCGTTTGCAAAACACCAGCCCCCGGTGAACAAGTCG 1858611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      321 AAACCCCACACGAAGGCAGACCCAGCGTTTGCAAAACACCAGCCCCCGGTGAACAAGTCG 380

  1858612 ACCTGCTGTGCAGCCCACCTCTGACTCCGTTTCCCCCAGCGTACCCAGCCACATTGGGAG 1858671
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      381 ACCTGCCGTGCAGCCCACCTCTGACTCCGTTTCCCCCAGTGTACCCAGCCACATTGGGAG 440

  1858672 GCTCCACCTCGGTCTAACGCTCCGGCATTAGCAGGACCTGCTGAATGAGTGGCGCCGGGC 1858731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 GCTCCACCTCGGTCTAACGCTCCGGCATTAGCAGGACCTGCTGAATGAGTGGCGCCGGGC 500

  1858732 CCATCCATCTCTGCCATCGCTGCTCAGCCCTCTGCCATGTTCAAATATCACACAGTCCCC 1858791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 CCATCCATCTCTGCCATCGCTGCTCAGCCCTCTGCCATGTTCAAATATCACACAGTCCCC 560

  1858792 AGGTACCTCGTAAATCACTGTAATTACGGGCTGCTCACTTAAAATTAAACTGCAATTTTT 1858851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 AGGTACCTCGTAAATCACTGTAATTACGGGCTGCTCACTTAAAATTAAACTGCAATTTTT 620

  1858852 TAAAAAGCAAATTGCCAGTAAGACACGTTGGCTGTGGCTGGAAATACTTCTGAGGCTGCC 1858911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      621 TAAAAAGCAAATTGCCAGTAAGACACGTTGGCTGTGGCTGGAAATATTTCTGAGGCTGCC 680

  1858912 TGCGCGCAGGCTCTGGCTTCCTCTCCCTCTGCCTGGCCGGCCCGAGCTGCCACCTGTCTA 1858971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 TGCGCGCAGGCTCTGGCTTCCTCTCCCTCTGCCTGGCCGGCCCGAGCTGCCACCTGTCTA 740

  1858972 GTCTGCGCACATAGCGGCCCTGTGGCTGGCGGGCGCCCTGGGGGAGACTGAGACACTCAC 1859031
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 GTCTGCGCACATAGCGGCCGTGTGGCTGGCGGGCGCCCTGGGGGAGACTGAGACACTCAC 800

  1859032 TCTTAATGAAGACACTCGCGGCGTCCATTGTGGCCACTGCACTCTAGTCCAGACCCTCGC 1859091
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 TCTTAATGAAGACACTCGCGGCGTCCACTGTGGCCACTGCACTCTAGTCCAGACCCTCGC 860

  1859092 TGGCCTGGCCTGGGGCTCACCTGCCCCTCTGGAAGCAGAGAGGGCCTGCCCTGGAGGGCC 1859151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 TGGCCTGGCCTGGGGCTCACCTGCCCCTCTGGAAGCAGAGAGGGCCTGCCCTGGAGGGCC 920

  1859152 GGGGACCTCTGCAGCATGTCCGTGGAACACGTGGGCCAGGGATTGTGTGCCCGGCCCCCA 1859211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      921 GGGGACCTCTGCAGCATGTCCGTGGAACACGTGGGCCAGGGAGTGTGTGCCCGGCCCCCA 980

  1859212 TTCCAGCTCTGCCACGTGAGCAGTGCTCACTCGGTGCCTAGGGCTGACTAGTCTTACTAA 1859271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 TTCCAGCTCTGCCACGTGAGCAGTGCTCACTCGGTGCCTAGGGCTGACTAGTCTTACTAA 1040

  1859272 GCGCTGGTCCCACCATCCCCTGAGCCGAGCCCCATGGTGTCCCAGCGGGCACGGACAAGA 1859331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 GCGCTGGTCCCACCATCCCCTGAGCCGAGCCCCATGGTGTCCCAGCGGGCACGGACAAGA 1100

  1859332 GGCACGGAGTGAGGGAGGGGTGGGGGCTGACAAAGGGCTTGGAGAGCAGAGACAGCGCAC 1859391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 GGCACGGAGTGAGGGAGGGGTGGGGGCTGACAAAGGGCTTGGAGAGCAGAGACAGCGCAC 1160

  1859392 ACCACCAACTCTCTCCACACACCACTTTCTCCACACACCACCAACCGCAGGATGTGGTGG 1859451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 ACCACCAACTCTCTCCACACACCACTTTCTCCACACACCACCAACCGCAGGATGTGGTGG 1220

  1859452 GGCTCGGAGGCCAAGGGGGAAGTGTGAGGGATTCCTGTCAAGAACAAGACCCCCTGCTGC 1859511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 GGCTCGGAGGCCAAGGGGGAAGTGTGAGGGATTCCTGTCAAGAACAAGACCCCCTGCTGC 1280

  1859512 TGAGGGTCCAAGAGAAACTCCATGAACTGGGAAACTCGAGGGGAGGAAGCTAGAGATGGA 1859571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 TGAGGGTCCAAGAGAAACTCCATGAACTGGGAAACTCGAGGGGAGGAAGCTAGAGATGGA 1340

  1859572 ATGAAGGAAGCCCTGAATCCTGGCTCAAACAAGGAAAGCTGAAATAATGCAGTAAAATGA 1859631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 ATGAAGGAAGCCCTGAATCCTGGCTCAAACAAGGAAAGCTGAAATAATGCAGTAAAATGA 1400

  1859632 GAAGACACGCAGGAAATGGAAACGATGCTACTTCGAGATACTGGGAAGTTATGTGAATGC 1859691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 GAAGACACGCAGGAAATGGAAACGATGCTACTTCGAGATACTGGGAAGTTATGTGAATGC 1460

  1859692 TGTTCATCTGTGGGGTGGCGTGAAGAGGTGGAGGCCACACCAGTGGACATCAAAACCAGA 1859751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 TGTTCATCTGTGGGGTGGCGTGAAGAGGTGGAGGCCACACCAGTGGACATCAAAACCAGA 1520

  1859752 AACCAGTCAGAGAAAGACAACAGGAAAACTGTAAGTGCCTGGAAATTAAACAGCACACTT 1859811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 AACCAGTCAGAGAAAGACAACAGGAAAACTGTAAGTGCCTGGAAATTAAACAGCACACTT 1580

  1859812 CTAAGTAATCCACGAGTCAAATGGGATGCCTCGAAGGAAATAAAAAAGAGAACAGAATGG 1859871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 CTAAGTAATCCACGAGTCAAATGGGATGCCTCGAAGGAAATAAAAAAGAGAACAGAATGG 1640

  1859872 AAACAAGAATACAGCATAATGAAATTTGCCAGACGCACCCAAGGCAGTGCTTAGAGGGAA 1859931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 AAACAAGAATACAGCATAATGAAATTTGCCAGACGCACCCAAGGCAGTGCTTAGAGGGAA 1700

  1859932 ACGGACAGCACTCAATGCCTGTATCAGGAAAGGAGAAAGATCTCAAATCGCTTCTCTAAA 1859991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 ACGGACAGCACTCAATGCCTGTATCAGGAAAGGAGAAAGATCTCAAATCGCTTCTCTAAA 1760

  1859992 TTCCTACTTCAAGAAACGAAGGGAAAAACAAGCCCGAAGCAGGAGGAGGAAATAATACAA 1860051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 TTCCTACTTCAAGAAACGAAGGGAAAAACAAGCCCGAAGCAGGAGGAGGAAATAATACAA 1820

  1860052 GTAGGAATGAACAGGAAAACAAAAGTTATTAAAACCAAAAACTGCTTCTTTAAAAAATAG 1860111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 GTAGGAATGAACAGGAAAACAAAAGTTATTAAAACCAAAAACTGCTTCTTTAAAAAATAG 1880

  1860112 CAATAAGGCCGGCCAGGAGCA-GGGCTCACACCTGTAATCTTTGCACTTTGGGAGGCCAA 1860170
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 CAATAAGGCCGGCCAGGAGCAGGGGCTCACACCTGTAATCTTTGCACTTTGGGAGGCCAA 1940

  1860171 GGTGAGAGGATCACTTGAGCCCTGGAGTTTGAGACCAGCCTGGACAACACAGTGAGACCC 1860230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 GGTGAGAGGATCACTTGAGCCCTGGAGTTTGAGACCAGCCTGGACAACACAGTGAGACCC 2000

  1860231 CATCCCTATAATCAATCAGCCAGGTGTGGTGGCATACACCTGTAGCCCCAGGTATGTGGG 1860290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 CATCCCTATAATCAATCAGCCAGGTGTGGTGGCATACACCTGTAGCCCCAGGTATGTGGG 2060

  1860291 ATCACGTGGGCCTAGGAGTTTGAGGCTGTAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAG 1860350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 ATCACGTGGGCCTAGGAGTTTGAGGCTGTAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAG 2120

  1860351 CCTGGGCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAATTTGTTAGAAAGACCAGCAACGATAAA 1860410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 CCTGGGCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAATTTGTTAGAAAGACCAGCAACGATAAA 2180

  1860411 TTGATAAACCCCTGGCAAAACTGACAAAGATTAAAAAGGGGGAACGCCTGTAATCCCAGC 1860470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 TTGATAAACCCCTGGCAAAACTGACAAAGATTAAAAAGGGGGAACGCCTGTAATCCCAGC 2240

  1860471 ACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAA 1860530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 ACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAA 2300

  1860531 CACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGGGTG 1860590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 CACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGGGTG 2360

  1860591 CCTGTAGTCCCAGCTCCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCGG 1860650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 CCTGTAGTCCCAGCTCCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCGG 2420

  1860651 AGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACACAGCGAGACTC 1860710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 AGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACACAGCGAGACTC 2480

  1860711 CATCTCAAAAAAAAAAAAAGGGG---GGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGA 1860767
          |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 CATCTCAAAAAAAAAAA------GGCGGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGA 2534

  1860768 AATGGAAATATTATAATAGATCCAGAAGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACA 1860827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 AATGGAAATATTATAATAGATCCAGAAGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACA 2594

  1860828 AAACTTGATGCTCATAACAAACTGGATGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGT 1860887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 AAACTTGATGCTCATAACAAACTGGATGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGT 2654

  1860888 GCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTCCTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAAT 1860947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 GCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTCCTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAAT 2714

  1860948 TAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTCCCAGATGGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACAT 1861007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2715 TAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTCCCAGATAGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACAT 2774

  1861008 TAAATATGAATTAATACCAATTTTACACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAA 1861067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TAAATATGAATTAATACCAATTTTACACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAA 2834

  1861068 CACCTTTCCACTATGAACCCTGTACTGAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAA 1861127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 CACCTTTCCACTATGAACCCTGTACTGAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAA 2894

  1861128 ATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTAGCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGG 1861187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 ATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTAGCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGG 2954

  1861188 AATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTATCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTG 1861247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 AATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTATCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTG 3014

  1861248 TACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGAAAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGC 1861307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 TACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGAAAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGC 3074

  1861308 TAAAGGAAGACAATGATATGATCCTATTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATC 1861367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 TAAAGGAAGACAATGATATGATCCTATTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATC 3134

  1861368 TCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAAAGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTA 1861427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 TCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAAAGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTA 3194

  1861428 AAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCTCACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCC 1861487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 AAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCTCACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCC 3254

  1861488 CTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCTTTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTC 1861547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 CTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCTTTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTC 3314

  1861548 CTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAAAAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAAC 1861607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 CTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAAAAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAAC 3374

  1861608 AGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACATGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGC 1861667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 AGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACATGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGC 3434

  1861668 AGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGGCCCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAA 1861727
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 AGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGGCTCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAA 3494

  1861728 CTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACGAAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAAT 1861787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 CTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACGAAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAAT 3554

  1861788 TAACCACATTTCTATAAAGCAATTGCAAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATA 1861847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 TAACCACATTTCTATAAAGCAATTGCAAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATA 3614

  1861848 ATTTACAGAACATCTTAAATACTCGGGTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGT 1861907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 ATTTACAGAACATCTTAAATACTCGGGTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGT 3674

  1861908 TTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATGAAAGGAATCGAAAGGAATAAAAAGAATGTTTGTA 1861967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3675 TTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATGAAAGGAATCGAAAGGAATCAAAAGAATGTTTGTA 3734

  1861968 TAAATAGATACAATGTTTATGAACTGGAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTG 1862027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 TAAATAGATACAATGTTTATGAACTGGAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTG 3794

  1862028 ATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGTCCAAACCTCAGCATATATATATATATTTTTT--- 1862084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
     3795 ATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGTCCAAACCTCAGCATATATATATATAT-----ATA 3849

  1862085 TTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTC 1862144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 TTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTC 3909

  1862145 TTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATCTTCCTGCCTCAACGTGCCAAGTAGCTGTAACTAC 1862204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3910 TTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATCTTCCTGCCTCAATGTGCCAAGTAGCTGTAACTAC 3969

  1862205 AGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGTATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTG 1862264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 AGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGTATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTG 4029

  1862265 CCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGT 1862324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 CCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGT 4089

  1862325 GTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGT 1862384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 GTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGT 4149

  1862385 AGAGAGACACAAGATTATTCTAAAATGTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAG 1862444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 AGAGAGACACAAGATTATTCTAAAATGTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAG 4209

  1862445 AGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGAACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCC 1862504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 AGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGAACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCC 4269

  1862505 TACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCAGCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACA 1862564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 TACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCAGCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACA 4329

  1862565 GAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCACAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATA 1862624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 GAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCACAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATA 4389

  1862625 TTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCGTTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAA 1862684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 TTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCGTTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAA 4449

  1862685 TCAATCAATGTAATCTGCTATATCAACAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTA 1862744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 TCAATCAATGTAATCTGCTATATCAACAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTA 4509

  1862745 ATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAGTCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCT 1862804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 ATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAGTCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCT 4569

  1862805 TGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAGGAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTT 1862864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 TGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAGGAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTT 4629

  1862865 TGACCGAAACCTCACATCTCAAATAAAATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGT 1862924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 TGACCGAAACCTCACATCTCAAATAAAATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGT 4689

  1862925 AAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGAAATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGAC 1862984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 AAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGAAATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGAC 4749

  1862985 ACTCAACACCAAAGCACAATCCACAGAATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAA 1863044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 ACTCAACACCAAAGCACAATCCACAGAATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAA 4809

  1863045 AATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACG 1863104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 AATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACG 4869

  1863105 ACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCATCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCT 1863164
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4870 ACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCATCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCC 4929

  1863165 GGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGTCTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTG 1863224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4930 GGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGTCTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTG 4989

  1863225 GCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTGTCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCAC 1863284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 GCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTGTCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCAC 5049

  1863285 CAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAGAGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAG 1863344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5050 CAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAGAGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAG 5109

  1863345 GGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGACACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAG 1863404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5110 GGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGACACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAG 5169

  1863405 CACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCCGCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTTC 1863464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5170 CACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCCGCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTCC 5229

  1863465 ATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCC 1863524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 ATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCACCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCC 5289

  1863525 TGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGT 1863584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5290 TGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGTGTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGT 5349

  1863585 GTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGAC 1863644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 GTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGGGGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGAC 5409

  1863645 GGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGG 1863704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5410 GGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAGGATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGG 5469

  1863705 GCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACC 1863764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 GCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCACTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACC 5529

  1863765 ACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGA 1863824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 ACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCTCAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGA 5589

  1863825 CTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGGT 1863884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5590 CTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCTCCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGGT 5649

  1863885 GGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGCT 1863944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5650 GGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTTTCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGCT 5709

  1863945 TGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTCT 1864004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5710 TGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCTGGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTCT 5769

  1864005 GCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCAG 1864064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5770 GCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACTAACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCAG 5829

  1864065 GGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATGA 1864124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5830 GGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGAGGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATGA 5889

  1864125 GGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTGC 1864184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5890 GGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGCGCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTGC 5949

  1864185 TCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCCC 1864244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 TCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGCAGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCCC 6009

  1864245 CCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCTG 1864304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 CCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCACCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCTG 6069

  1864305 GATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTGC 1864364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 GATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAGGTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTGC 6129

  1864365 TCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGTG 1864424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 TCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTTTTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGTG 6189

  1864425 TTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGCA 1864484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 TTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGGCGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGCA 6249

  1864485 CTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCAG 1864544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 CTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCGGGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCAG 6309

  1864545 CCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTCT 1864604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6310 CCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACCCTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTCT 6369

  1864605 CACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGTT 1864664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6370 CACACCCACACTCACAGAGTGCAAAAGGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGTT 6429

  1864665 AACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTTA 1864724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 AACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTGACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTTA 6489

  1864725 TATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGAA 1864784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 TATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAAAATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGAA 6549

  1864785 CAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCCA 1864844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6550 CAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCACACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCCA 6609

  1864845 ATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGGA 1864904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6610 ATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCCTCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGGA 6669

  1864905 GTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCAC 1864964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6670 GTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGCCCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCAC 6729

  1864965 CCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTTG 1865024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6730 CCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCTGGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTTG 6789

  1865025 GCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGGG 1865084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6790 GCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCGTGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGGG 6849

  1865085 GTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGCT 1865144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6850 GTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCACAGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGCT 6909

  1865145 GCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACCC 1865204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6910 GCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGCCCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACCC 6969

  1865205 AGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCGGTGC 1865264
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6970 AGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGTGGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCAGTGC 7029

  1865265 CCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGAG 1865324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7030 CCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCTGGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGAG 7089

  1865325 CCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGGA 1865384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7090 CCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCTTCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGGA 7149

  1865385 CCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAGG 1865444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7150 CCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGATAAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAGG 7209

  1865445 TGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGTC 1865504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7210 TGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCACAGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGTC 7269

  1865505 CCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCCC 1865564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7270 CCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCAGCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCCC 7329

  1865565 CAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCCA 1865624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7330 CAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGTCCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCCA 7389

  1865625 GCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACGT 1865684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7390 GCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAGTGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACGT 7449

  1865685 CAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTAC 1865744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7450 CAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTACAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTAC 7509

  1865745 GCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGCT 1865804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7510 GCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAGGACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGCT 7569

  1865805 CTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGAA 1865864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7570 CTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGGGGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGAA 7629

  1865865 GGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGCG 1865924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7630 GGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCACCGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGCG 7689

  1865925 CTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCTC 1865984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7690 CTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTCTCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCTC 7749

  1865985 CTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGCTCATGGCC 1866044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7750 CTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTGTTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGCTCATGGCC 7809

  1866045 TCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCC 1866085
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7810 TCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCCGGCCCAGCCCCACCC 7850

Alignment time is 7.94485 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   5260] =>      5260 nucs 'mol-32-317a-212865_5260'

Score:        5160
Aligned:      5262        nucs
Identic:      5247 (100%) nucs =>       199 (100%)      5048 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1860530,1860728] EXCISED REGION [1860734,1865793]
 second seq =>  [      1,    199] EXCISED REGION [    203,   5260]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [1860729,1860733]
 second seq =>         3 nucs [200,202]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [200,201] to [203,204]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1860530 ACACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGGGT 1860589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGGGT 60

  1860590 GCCTGTAGTCCCAGCTCCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCG 1860649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTGTAGTCCCAGCTCCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCG 120

  1860650 GAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACACAGCGAGACT 1860709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACACAGCGAGACT 180

  1860710 CCATCTCAAAAAAAAAAAA 1860728
          |||||||||||||||||||
      181 CCATCTCAAAAAAAAAAAA 199

EXCISED REGION

  1860734 GGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGAAATGGAAATATTATAATAGATCCAGA 1860793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      203 GGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGAAATGGAAATATTATAATAGATCCAGA 262

  1860794 AGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACAAAACTTGATGCTCATAACAAACTGGA 1860853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      263 AGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACAAAACTTGATGCTCATAACAAACTGGA 322

  1860854 TGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGTGCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTC 1860913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      323 TGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGTGCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTC 382

  1860914 CTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAATTAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTC 1860973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 CTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAATTAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTC 442

  1860974 CCAGATGGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACATTAAATATGAATTAATACCAATTTTAC 1861033
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 CCAGATAGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACATTAAATATGAATTAATACCAATTTTAC 502

  1861034 ACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAACACCTTTCCACTATGAACCCTGTACT 1861093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 ACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAACACCTTTCCACTATGAACCCTGTACT 562

  1861094 GAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAAATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTA 1861153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 GAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAAATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTA 622

  1861154 GCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGGAATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTA 1861213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 GCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGGAATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTA 682

  1861214 TCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTGTACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGA 1861273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 TCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTGTACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGA 742

  1861274 AAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGCTAAAGGAAGACAATGATATGATCCTA 1861333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 AAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGCTAAAGGAAGACAATGATATGATCCTA 802

  1861334 TTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATCTCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAA 1861393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 TTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATCTCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAA 862

  1861394 AGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTAAAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCT 1861453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 AGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTAAAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCT 922

  1861454 CACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCCCTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCT 1861513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 CACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCCCTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCT 982

  1861514 TTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTCCTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAA 1861573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 TTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTCCTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAA 1042

  1861574 AAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAACAGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACA 1861633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 AAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAACAGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACA 1102

  1861634 TGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGCAGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGG 1861693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGCAGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGG 1162

  1861694 CCCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAACTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACG 1861753
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 CTCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAACTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACG 1222

  1861754 AAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAATTAACCACATTTCTATAAAGCAATTGC 1861813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 AAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAATTAACCACATTTCTATAAAGCAATTGC 1282

  1861814 AAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATAATTTACAGAACATCTTAAATACTCGG 1861873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 AAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATAATTTACAGAACATCTTAAATACTCGG 1342

  1861874 GTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGTTTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATG 1861933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 GTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGTTTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATG 1402

  1861934 AAAGGAATCGAAAGGAATAAAAAGAATGTTTGTATAAATAGATACAATGTTTATGAACTG 1861993
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 AAAGGAATCGAAAGGAATCAAAAGAATGTTTGTATAAATAGATACAATGTTTATGAACTG 1462

  1861994 GAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTGATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGT 1862053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 GAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTGATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGT 1522

  1862054 CCAAACCTCAGCATATATATATATATTTTTT---TTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTAT 1862110
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     1523 CCAAACCTCAGCATATATATATATAT-----ATATTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTAT 1577

  1862111 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATC 1862170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATC 1637

  1862171 TTCCTGCCTCAACGTGCCAAGTAGCTGTAACTACAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGT 1862230
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 TTCCTGCCTCAATGTGCCAAGTAGCTGTAACTACAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGT 1697

  1862231 ATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGG 1862290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 ATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGG 1757

  1862291 CTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCA 1862350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 CTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCA 1817

  1862351 TGCCCGGCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAAT 1862410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 TGCCCGGCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAAT 1877

  1862411 GTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGA 1862470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 GTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGA 1937

  1862471 ACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCCTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCA 1862530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 ACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCCTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCA 1997

  1862531 GCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACAGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCA 1862590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 GCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACAGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCA 2057

  1862591 CAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCG 1862650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 CAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCG 2117

  1862651 TTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAA 1862710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 TTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAA 2177

  1862711 CAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTAATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAG 1862770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 CAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTAATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAG 2237

  1862771 TCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAG 1862830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 TCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAG 2297

  1862831 GAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAA 1862890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 GAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAA 2357

  1862891 AATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGTAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGA 1862950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGTAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGA 2417

  1862951 AATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGACACTCAACACCAAAGCACAATCCACAG 1863010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 AATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGACACTCAACACCAAAGCACAATCCACAG 2477

  1863011 AATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAAAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAG 1863070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 AATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAAAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAG 2537

  1863071 AGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACGACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCA 1863130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 AGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACGACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCA 2597

  1863131 TCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCTGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGT 1863190
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2598 TCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCCGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGT 2657

  1863191 CTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTG 1863250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 CTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTG 2717

  1863251 TCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCACCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAG 1863310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 TCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCACCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAG 2777

  1863311 AGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAGGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGAC 1863370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 AGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAGGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGAC 2837

  1863371 ACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCC 1863430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 ACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCC 2897

  1863431 GCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTTCATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCA 1863490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2898 GCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTCCATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCA 2957

  1863491 CCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGT 1863550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 CCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGT 3017

  1863551 GTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGG 1863610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 GTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGG 3077

  1863611 GGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAG 1863670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 GGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAG 3137

  1863671 GATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCA 1863730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 GATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCA 3197

  1863731 CTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCT 1863790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 CTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCT 3257

  1863791 CAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCT 1863850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 CAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCT 3317

  1863851 CCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTT 1863910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 CCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTT 3377

  1863911 TCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCT 1863970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 TCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCT 3437

  1863971 GGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACT 1864030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 GGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACT 3497

  1864031 AACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGA 1864090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 AACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGA 3557

  1864091 GGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGC 1864150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 GGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGC 3617

  1864151 GCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGC 1864210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 GCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGC 3677

  1864211 AGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCA 1864270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 AGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCA 3737

  1864271 CCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAG 1864330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 CCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAG 3797

  1864331 GTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTT 1864390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 GTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTT 3857

  1864391 TTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGG 1864450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 TTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGG 3917

  1864451 CGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCG 1864510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 CGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCG 3977

  1864511 GGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACC 1864570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 GGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACC 4037

  1864571 CTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAA 1864630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 CTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAA 4097

  1864631 GGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTG 1864690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 GGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTG 4157

  1864691 ACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAA 1864750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 ACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAA 4217

  1864751 AATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCAC 1864810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4218 AATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCAC 4277

  1864811 ACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCC 1864870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 ACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCC 4337

  1864871 TCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGC 1864930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 TCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGC 4397

  1864931 CCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCT 1864990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 CCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCT 4457

  1864991 GGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCG 1865050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 GGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCG 4517

  1865051 TGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCAC 1865110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 TGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCAC 4577

  1865111 AGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGC 1865170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 AGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGC 4637

  1865171 CCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGT 1865230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 CCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGT 4697

  1865231 GGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCGGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCT 1865290
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 GGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCAGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCT 4757

  1865291 GGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCT 1865350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 GGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCT 4817

  1865351 TCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGAT 1865410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 TCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGAT 4877

  1865411 AAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCAC 1865470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 AAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCAC 4937

  1865471 AGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCA 1865530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 AGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCA 4997

  1865531 GCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGT 1865590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 GCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGT 5057

  1865591 CCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAG 1865650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 CCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAG 5117

  1865651 TGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTA 1865710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 TGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTA 5177

  1865711 CAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAG 1865770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 CAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAG 5237

  1865771 GACTCCTGGCAGCCTCACAACTC 1865793
          |||||||||||||||||||||||
     5238 GACTCCTGGCAGCCTCACAACTC 5260

Alignment time is 5.16644 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1846043,1873576] =>     27534 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [      1,   5994] =>      5994 nucs 'mol-32-322a-299193_5994'

Score:        5885
Aligned:      5996        nucs
Identic:      5981 (100%) nucs =>        23 (100%)      5958 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1860706,1860728] EXCISED REGION [1860734,1866703]
 second seq =>  [      1,     23] EXCISED REGION [     27,   5994]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [1860729,1860733]
 second seq =>         3 nucs [24,26]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [24,25] to [27,28]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1860706 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAA 1860728
          |||||||||||||||||||||||
        1 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAA 23

EXCISED REGION

  1860734 GGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGAAATGGAAATATTATAATAGATCCAGA 1860793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       27 GGGGGGAGAGTGAAATGACCAATATCAGAAATGAAATGGAAATATTATAATAGATCCAGA 86

  1860794 AGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACAAAACTTGATGCTCATAACAAACTGGA 1860853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       87 AGCTATTAAAATAACAATAAAAAATACTACAACAAAACTTGATGCTCATAACAAACTGGA 146

  1860854 TGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGTGCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTC 1860913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      147 TGGATTCCTCGAAAACCACATACTACCAAAACGTGCCAAGATAAAATAGCCTCGGTAGTC 206

  1860914 CTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAATTAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTC 1860973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 CTATAACCATTAAATAAATCAAGTTTGTTCTAATTAAAATGCTACTCAAAATCTCCAGTC 266

  1860974 CCAGATGGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACATTAAATATGAATTAATACCAATTTTAC 1861033
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 CCAGATAGTTTCACTAGAAAGTTTTACCGAACATTAAATATGAATTAATACCAATTTTAC 326

  1861034 ACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAACACCTTTCCACTATGAACCCTGTACT 1861093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 ACAATCCTTTTTCAGTTAACAAAAGACAGAGAAACACCTTTCCACTATGAACCCTGTACT 386

  1861094 GAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAAATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTA 1861153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 GAAACCAACAAGGATGGTGCGCACACAAAGAAAAATAAGTATCAGTCTCTCATGAGCTTA 446

  1861154 GCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGGAATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTA 1861213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 GCTGCAAAAATACTCAACAAGGACTAACAAATGGAATCCAGCAACACACGAAAAAGAGTA 506

  1861214 TCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTGTACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGA 1861273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 TCACACCCTGACCAAGTGGGATTCAGTTTAGGTGTACAACGACGGCTAGTTCAAATTTGA 566

  1861274 AAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGCTAAAGGAAGACAATGATATGATCCTA 1861333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 AAATCAATCAATGTTATCCACCCTATCAACAGGCTAAAGGAAGACAATGATATGATCCTA 626

  1861334 TTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATCTCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAA 1861393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 TTGGCACAGGCAAAGCATTTGAAAAAATTTAATCTCCATTCCTGACAAGAACTCTTGCAA 686

  1861394 AGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTAAAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCT 1861453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 AGCAGGAATCAAGGGAAAGTCCTCCGACTTGGTAAAAAGCACCACGAAGAACCCTCAGCT 746

  1861454 CACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCCCTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCT 1861513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 CACGCTGCTTCACGGAAGAGTCTGGCCGCCTTCCCTCATTCGGTCAGCGGAGAGCTGGCT 806

  1861514 TTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTCCTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAA 1861573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 TTCCCCACTCATCCTCAACCCAGCATGGGAGCTCCTCACGCCAGGGCATGCAGGTAAGAA 866

  1861574 AAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAACAGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACA 1861633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 AAGGAAAGCAGCAGCATAGGGATTGGAAAAGAACAGAACTGTCCCTACTCGGAAATCACA 926

  1861634 TGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGCAGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGG 1861693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 TGACGGCACACGTGGAAAACCCTAAGCAATCTGCAGAAAACTCCTAGAATGACGTGACGG 986

  1861694 CCCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAACTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACG 1861753
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 CTCACGTGGAAAATCCTGAGCAATCTGCAGAAAACTCCTGGAACACTAAGTGAGTCCACG 1046

  1861754 AAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAATTAACCACATTTCTATAAAGCAATTGC 1861813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 AAGGTTGCAGGAAATAAGATGAACATACAAAAATTAACCACATTTCTATAAAGCAATTGC 1106

  1861814 AAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATAATTTACAGAACATCTTAAATACTCGG 1861873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 AAACAAGTGAAAAACAAAATTAAAAGGCAATATAATTTACAGAACATCTTAAATACTCGG 1166

  1861874 GTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGTTTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATG 1861933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 GTATACATCTAACAAAAACTTGTATAGTGTCTGTTTGCAGAAAGTTAGGAAATACTGATG 1226

  1861934 AAAGGAATCGAAAGGAATAAAAAGAATGTTTGTATAAATAGATACAATGTTTATGAACTG 1861993
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 AAAGGAATCGAAAGGAATCAAAAGAATGTTTGTATAAATAGATACAATGTTTATGAACTG 1286

  1861994 GAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTGATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGT 1862053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 GAAGACTTATAGTAAATCAATTTTTCCAAAATTGATCTTTGGTTTTAAGGTAATTGCTGT 1346

  1862054 CCAAACCTCAGCATATATATATATATTTTT---TTTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTAT 1862110
          ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||
     1347 CCAAACCTCAGCATATATATATATAT----ATATTTTTTTTTTTGGAAAGAGGGTCTTAT 1402

  1862111 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATC 1862170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGGTCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGGCAATC 1462

  1862171 TTCCTGCCTCAACGTGCCAAGTAGCTGTAACTACAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGT 1862230
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 TTCCTGCCTCAATGTGCCAAGTAGCTGTAACTACAGGTGCGCACCACCACTCATGGCTGT 1522

  1862231 ATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGG 1862290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 ATTTTTTTCATAGAGATGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCCAACTCCTGGG 1582

  1862291 CTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCA 1862350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 CTCAAGCGATCCTTTTGCCTTGGCTTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCA 1642

  1862351 TGCCCGGCCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAAT 1862410
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 TGCCCGGCCAGCA-TTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGAGACACAAGATTATTCTAAAAT 1701

  1862411 GTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGA 1862470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 GTATATAGAAAGCAATTCCAAAAAAGAAGAGTAGAGGAATTGCCCTTCCTGATGTTGAGA 1761

  1862471 ACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCCTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCA 1862530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 ACCGTACAGCTACAGCACAGCGTTATACGGCTCCTACGTCAGACAGACATGGCTGGGGCA 1821

  1862531 GCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACAGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCA 1862590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 GCGCTGGAGGGGAGATGTGGAGACCAGCAGAACAGAACAGAGGAACTCGAAAGAGACCCA 1881

  1862591 CAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCG 1862650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 CAGACGCGTCCAGGCCACTTTCTAACAGAGAATATTATGCCGTGACCAAGTGGGACTTCG 1941

  1862651 TTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAA 1862710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 TTTAGGTGTACGAGGCTAGCTTGGTATTTGAAAATCAATCAATGTAATCTGCTATATCAA 2001

  1862711 CAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTAATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAG 1862770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 CAGGCTAAAGAATAAACAACATATGACCCTATTAATCGATACGGAAAAGTCACAGAAAAG 2061

  1862771 TCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAG 1862830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 TCACAAAGGCGCTTCAGTGGAGGAAGGGCAGCCTTGTCTTTGCTACAGCTGGAGCCGGAG 2121

  1862831 GAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAA 1862890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 GAGCTGGACACACTTAGTTAAAAAAAAATTTTTTTGACCGAAACCTCACATCTCAAATAA 2181

  1862891 AATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGTAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGA 1862950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 AATTTAACTCAAACTGTATCACGAACTTACATGTAAAACACAGAATTATGTTAAAAAAGA 2241

  1862951 AATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGACACTCAACACCAAAGCACAATCCACAG 1863010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 AATCTTCAGGATCTGGATGAGGCAGAGCTCTGACACTCAACACCAAAGCACAATCCACAG 2301

  1863011 AATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAAAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAG 1863070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 AATAAAATTAAAATGGATAAATGGGCCTCGCCAAAATTTTAGGAAATTGCACAGTGGAAG 2361

  1863071 AGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACGACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCA 1863130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 AGCCTGTGAAGCAGATACAAGGATAAGCTACACGACAGGGCGCCAGCGTCTCCCTGCCCA 2421

  1863131 TCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCTGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGT 1863190
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2422 TCTCTCCTAGAACGCCACGGCCACAGGGGACCCCGGCACCTGGAGGGGTGACTGCAGCGT 2481

  1863191 CTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTG 1863250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 CTTAACCCCAAGTGGGATTCCTGCCTGTGCCCTGGCCCCACAGGGCAAGGCCCACATCTG 2541

  1863251 TCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCACCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAG 1863310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TCTTGCTTCTCTCTTTTCCCAGAACAGACCTCACCAGGCTGGAGAGTGGCCTGGGCACAG 2601

  1863311 AGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAGGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGAC 1863370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 AGGCCGGGCCTGTGGCATCAGCGGCCATCGTGAGGGCAGAGCGCCCAGGCATTCTCAGAC 2661

  1863371 ACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCC 1863430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 ACACCCCTGCTCCCACTGGCCTTCCTGGGAGAAGCACCCCCTTGTTCCAGATGAGAAGCC 2721

  1863431 GCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTTCATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCA 1863490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2722 GCAGCTGCTGGGCCGGGGGAGGCATGAATATTCCATGCTTGGATCTGCAAGCGCCACGCA 2781

  1863491 CCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGT 1863550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 CCTAACTGGACACAGCTCCAGGCGCCTGCTTCCCTGAAGCCCAATCCTCCTGTCATTGGT 2841

  1863551 GTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGG 1863610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 GTGCTGCAAGCGCCGCTCCGGAGCAGGGCTCTGTGTGGGGAGAGGAAAGGAGCCCTCGGG 2901

  1863611 GGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAG 1863670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GGAAGTTATGCTGGGAGCCCATTTGTGGGGGGACGGAGAGCGGGAAGCAAGGTCCATGAG 2961

  1863671 GATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCA 1863730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GATGGGGTGTCCTGCAGCTGGGTCCTGACCGGGGGCTGCTCCCTCTCCTGGGCCTAGGCA 3021

  1863731 CTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCT 1863790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 CTGCAGGAAAATGGCAGGTAGTCAGCCTGCCACCACCTCCCGGCCACCAGCACACACCCT 3081

  1863791 CAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCT 1863850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 CAACAGACCTTCCAGATAGACGGCTCAATCCTGACTTGAGCACTGCCGGCCCCAACGCCT 3141

  1863851 CCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTT 1863910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 CCCCTCTTACACCACCTGCTTGTGCGGGCCTGGTGGCAGAGCTGCCGACATCGGGGGCTT 3201

  1863911 TCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCT 1863970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TCGCACCCACCAGAACTAGCTTCTAACCTCGGCTTGGCCACCAGGAAGCTGCGTGACCCT 3261

  1863971 GGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACT 1864030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 GGGCACACCGACACACCTCTCTTGAGCCTGGTCTGCACGCTGGGCATTGCCGAGAAGACT 3321

  1864031 AACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGA 1864090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 AACGAAGTCAGGTGCGTAAAATCACCGGGCTCAGGGGAGACACAGAGCACAGTGGGATGA 3381

  1864091 GGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGC 1864150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 GGAAACCCTGTGCCCACGTTACCCCGGGCCATGAGGACAGCAGCTGCCCCGTGCCCTGGC 3441

  1864151 GCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGC 1864210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 GCCATCGGATGGCCTCTACTGGGAAGTGAGCTGCTCCCGGCCTTGTCCCCACCTCGCTGC 3501

  1864211 AGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCA 1864270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 AGCAGGACTGGTTGTCTGCCAGGCCCCGGAGCCCCCAGGCTTCCCACAGAGGCTCCCCCA 3561

  1864271 CCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAG 1864330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 CCAGGACCCGCGGGAGAGGAGAGGGGCGTGCCTGGATGGCATCTGCCGGGGCAGCCATAG 3621

  1864331 GTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTT 1864390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 GTCCCTGTGAACCTCGCTTGTAGAATACACCTGCTCTCAAAGCCAGCGAAGGGGAGATTT 3681

  1864391 TTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGG 1864450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 TTTTTTGTCTTGAGGCTGTCAGGAAATCAAAGTGTTTTCAACTTCAAAAGACTCTCCGGG 3741

  1864451 CGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCG 1864510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CGTCTCAAGTTGAGAATCTGACGCGTCCCAGGCACTTTCATGCACACATGGGGCGAGCCG 3801

  1864511 GGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACC 1864570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 GGGAGAAGACTCAGCAGCGTCCGCCGAGAGTCAGCCCTGAACTTCAGGGGTGAGAAAACC 3861

  1864571 CTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAA 1864630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 CTTCAAGTTCACACTGCAGCACGACACACACTCTCACACCCACACTCACAGAGTGCAAAA 3921

  1864631 GGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTG 1864690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 GGACTCTTAGAAAATCAAAATGTTAATGGCGGTTAACTCGGAGTGCTGGGACGGAAAGTG 3981

  1864691 ACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAA 1864750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 ACTCATGGTTCTCTGCATTTTCCAGATTTTTTTATATGCTGCATATTTGTAATTAGGAAA 4041

  1864751 AATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCAC 1864810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 AATGTATATCTAAATTATATCTGCAAGAGCGGAACAGCTTCAAGACAGGCCGCTGAGCAC 4101

  1864811 ACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCC 1864870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 ACGGGTTCCCCACTGCGGACACATGCAAGCCCCAATCCTTATCCACCTGGCCTGCAACCC 4161

  1864871 TCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGC 1864930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TCGGGCGTCTTGCTCATCTGCCCGTCTGCCTGGAGTGTCTCCAGACACTCTGTGGGAGGC 4221

  1864931 CCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCT 1864990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 CCCTCTGTGGGCTGCTGAGGCCGGTGCTGCCCACCCACCTGCCCCAGATGTCCTGGGCCT 4281

  1864991 GGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCG 1865050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 GGGGTGCCAGGCTGGCGTCATGGCTGGCATCTTGGCTGGTGGCACCACAGACGCCAGGCG 4341

  1865051 TGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCAC 1865110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 TGGGTCACAGCGTGAGCCCAGCCAGCTGGTTGGGGTGGGTGGCGCTGGTCAGGTGGCCAC 4401

  1865111 AGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGC 1865170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 AGCAGAGTCCGCTGAGGCTACCTGTCATAGGGCTGCTGCTGAGGTGTGAGAGACACGGGC 4461

  1865171 CCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGT 1865230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 CCAAGCCCCTCGGCACCCAGCGGCCAGGGCACCCAGGTTGGGCTTGTGCAAATCCCAGGT 4521

  1865231 GGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCGGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCT 1865290
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 GGGGCACAGCTCTGTCCACGGGTCTTTGCAGTGCCCGTCTGAGCGCCTGTGAACAGTGCT 4581

  1865291 GGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCT 1865350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 GGGCAGTCTCACCATGCACACAGCTCTGCACGAGCCTCCACGGCCAGGGCTGCCCTCCCT 4641

  1865351 TCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGAT 1865410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TCCCTAAAACGTCTCAGGGGCTGAAGGCCTTGGACCATGGCATCAGGGTCCAGAGGTGAT 4701

  1865411 AAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCAC 1865470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AAACCTGGGTAATGTGTGCTCTCATCCCAGCAGGTGCTGCTGGGGGTTAGAGGTCAGCAC 4761

  1865471 AGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCA 1865530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 AGTCCCAGCCCCGGGGTTGGAGGTCAGCATAGTCCCAGCCCTGGGATGAGCACAGTCCCA 4821

  1865531 GCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGT 1865590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 GCCCCAGGGTTGGCGGTCGGCACAGTCCCAGCCCCAGGCGGGGTTGGAGGCCAGCACGGT 4881

  1865591 CCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAG 1865650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 CCCAGCCCCAGGGTTGGAGGTCGGCGCGGCCCCAGCTTGGCTTCATGACCTCGGCAGCAG 4941

  1865651 TGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTA 1865710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 TGATCTGTATCCCAAAGTTCAGGCGTGATAACGTCAAGACCGTGCTGAGCCTGCCGGGTA 5001

  1865711 CAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAG 1865770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 CAGCGTGAAAATGGCTGGTGCTACCGTGGTCTACGCAACCTGTTAGACCGGGATACCGAG 5061

  1865771 GACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGG 1865830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 GACTCCTGGCAGCCTCACAACTCACAGCTGGGCTCTGCACAGGAGTCTCAGGTGCTGTGG 5121

  1865831 GGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCAC 1865890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 GGCCAGCCTGCCTGCTGCACATCCACGGCCCGAAGGTGATCCAGGAGCAGCAGCCACCAC 5181

  1865891 CGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTC 1865950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 CGAGCCCTGACAGTCACTGCCTGGCCCGTCCGCGCTCTGAGGAGGGAGAGAGCAAGCTTC 5241

  1865951 TCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCTCCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTG 1866010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 TCGCTGCTGGTGTATTACCTCGGCCGAGGGCCTCCTCCTCCAGGCTGGCCACAGGACTTG 5301

  1866011 TTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGCTCATGGCCTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCC 1866070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 TTACAGCCTATGCCTGACTCCCCCGCTCATGGCCTCACTCCCTCATGGATGCCCATGGCC 5361

  1866071 GGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCCTCCAGCTCCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCG 1866130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 GGCCCAGCCCCACCCTGCACAAGCCCTCCAGCTCCAGGCCCAGCCCAGCTCAGCTCCGCG 5421

  1866131 GAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTTTGACCCCAGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCT 1866190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 GAGCTCCTGGTCCAGAGGTCCAGGTTTGACCCCAGGACACCCTGCTGTGTGCACGACCCT 5481

  1866191 CAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACTGTCCCTCCGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAG 1866250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 CAGCTCCCACCCCTCTCTGCCCCACTGTCCCTCCGGCGTCCCTCGGGGGAGACGACACAG 5541

  1866251 CCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGATGCTGCCGCGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCG 1866310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 CCGGGCCCAAAAGAGGCCTCGCAGATGCTGCCGCGTGAGCACCGCGCTGAGGGCCTGGCG 5601

  1866311 GCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACAGAACGCCGAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTC 1866370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 GCAACTGGGTCAGGACAGCTTGGACAGAACGCCGAGAACAAATGTCCCGGCATGAAGTTC 5661

  1866371 CAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTGTGTCCGGCACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTAT 1866430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 CAAAGAACGGAAGCTGGCAAAAAGTGTGTCCGGCACGGGGAAAATAGCTCAGCCAATTAT 5721

  1866431 TCCTGCCTAATTGTACCGAGGAAAGCATCTAAATACTGCCTGTGCTAATTATACCAGCGT 1866490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 TCCTGCCTAATTGTACCGAGGAAAGCATCTAAATACTGCCTGTGCTAATTATACCAGCGT 5781

  1866491 TATTGGGGTTTATCTTCCCGGCGAGGGTGACCTTTCCTTCAAGAGTGACTGGCGGGGCGG 1866550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 TATTGGGGTTTATCTTCCCGGCGAGGGTGACCTTTCCTTCAAGAGTGACTGGCGGGGCGG 5841

  1866551 GCAAGGCCAGGCACCCCAGCAGTCGCAGAAAAATCCCAAACCAACAATTATTATTATTAT 1866610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 GCAAGGCCAGGCACCCCAGCAGTCGCAGAAAAATCCCAAACCAACAATTATTATTATTAT 5901

  1866611 TATTCTATTTATACAGCTCCCCCTCGCACACGGGCGTTCTGCTTTACAGCCACACGCAGC 1866670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 TATTCTATTTATACAGCTCCCCCTCGCACACGGGCGTTCTGCTTTACAGCCACACGCAGC 5961

  1866671 TGCTCCTGCAGCCGCAGCCGGAGGGGAGCCGAG 1866703
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 TGCTCCTGCAGCCGCAGCCGGAGGGGAGCCGAG 5994

Alignment time is 6.41936 s

