
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2349] =>      2349 nucs 'mol-32-1e87-073387_2349'

Score:        2349
Aligned:      2349        nucs
Identic:      2349 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13021722,13024070]
 second seq =>  [       1,    2349]

 13021722 GGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGC 13021781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGC 60

 13021782 AAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGA 13021841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGA 120

 13021842 TAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTT 13021901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTT 180

 13021902 CTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTT 13021961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTT 240

 13021962 TGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAG 13022021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAG 300

 13022022 TTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGA 13022081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGA 360

 13022082 AAGTATCAGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATT 13022141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTATCAGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATT 420

 13022142 TCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTC 13022201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTC 480

 13022202 TCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTC 13022261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTC 540

 13022262 ACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCT 13022321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCT 600

 13022322 TCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTA 13022381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTA 660

 13022382 TTCTTTTAGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTT 13022441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTTTTAGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTT 720

 13022442 ATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGT 13022501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGT 780

 13022502 ATATGTAACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGT 13022561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATGTAACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGT 840

 13022562 GTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGT 13022621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGT 900

 13022622 GAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCA 13022681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCA 960

 13022682 AAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTA 13022741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTA 1020

 13022742 CCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAAT 13022801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAAT 1080

 13022802 GTAGGTAATAATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTT 13022861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAGGTAATAATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTT 1140

 13022862 CATCTAGTATACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTC 13022921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATCTAGTATACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTC 1200

 13022922 CCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAAT 13022981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAAT 1260

 13022982 CTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAA 13023041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAA 1320

 13023042 AATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGA 13023101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGA 1380

 13023102 CAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACG 13023161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACG 1440

 13023162 ATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGA 13023221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGA 1500

 13023222 TAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTG 13023281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTG 1560

 13023282 TGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTT 13023341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTT 1620

 13023342 TGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAA 13023401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAA 1680

 13023402 GGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTT 13023461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTT 1740

 13023462 CTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGA 13023521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGA 1800

 13023522 CATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGA 13023581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGA 1860

 13023582 AGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCT 13023641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCT 1920

 13023642 TTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTT 13023701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTT 1980

 13023702 TTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAA 13023761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAA 2040

 13023762 GCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAG 13023821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAG 2100

 13023822 AGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATC 13023881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATC 2160

 13023882 TAACAAATCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAA 13023941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAACAAATCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAA 2220

 13023942 CTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTT 13024001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTT 2280

 13024002 AAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTG 13024061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTG 2340

 13024062 GGAGTACCT 13024070
          |||||||||
     2341 GGAGTACCT 2349

Alignment time is 2.41482 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7728] =>      7728 nucs 'mol-32-1e87-130843_7728'

Score:        7705
Aligned:      7716        nucs
Identic:      7715 (100%) nucs =>      7082 (100%)       633 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13023900,13030981] EXCISED REGION [13030994,13031627]
 second seq =>  [       1,    7082] EXCISED REGION [    7095,    7728]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [13030982,13030993]
 second seq =>        12 nucs [7083,7094]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [13030993,13030993]
 second seq =>         1 nucs [7094,7094]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13030981,13030981] to [13030994,13030994]
 second seq =>         1 nucs [7082,7082] to [7095,7095]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13030982,13030982] to [13030993,13030993]
 second seq =>         1 nucs [7083,7083] to [7094,7094]

 13023900 ATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGC 13023959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGC 60

 13023960 CACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTC 13024019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTC 120

 13024020 CAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGA 13024079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGA 180

 13024080 GAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATAC 13024139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATAC 240

 13024140 TAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGT 13024199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGT 300

 13024200 ATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATC 13024259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATC 360

 13024260 TTGTTTTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTA 13024319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTTTTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTA 420

 13024320 CTCAGAAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTG 13024379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAGAAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTG 480

 13024380 CGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAA 13024439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAA 540

 13024440 ATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCC 13024499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCC 600

 13024500 AAAGATGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTT 13024559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGATGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTT 660

 13024560 GTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTG 13024619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTG 720

 13024620 TCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTT 13024679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTT 780

 13024680 TATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTT 13024739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTT 840

 13024740 TGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTT 13024799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTT 900

 13024800 CTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAA 13024859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAA 960

 13024860 TTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGT 13024919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGT 1020

 13024920 GAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCT 13024979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCT 1080

 13024980 GCTGCCCAGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAG 13025039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTGCCCAGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAG 1140

 13025040 CAGTAGCTACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGC 13025099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTAGCTACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGC 1200

 13025100 CCCATGTCCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTC 13025159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCATGTCCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTC 1260

 13025160 CACCTGCACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGAT 13025219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACCTGCACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGAT 1320

 13025220 TAAATCATTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAA 13025279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAATCATTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAA 1380

 13025280 TTAGTAAGATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTA 13025339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAGTAAGATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTA 1440

 13025340 AGAAAAAAAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATA 13025399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAAAAAAAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATA 1500

 13025400 AAATATTTTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCAT 13025459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATATTTTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCAT 1560

 13025460 AAGATGTTATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAA 13025519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGATGTTATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAA 1620

 13025520 TAGATTGATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAAC 13025579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGATTGATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAAC 1680

 13025580 ATTGAGTGAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGT 13025639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTGAGTGAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGT 1740

 13025640 TACAAATTTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGC 13025699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACAAATTTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGC 1800

 13025700 TTTTATTTTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGT 13025759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTATTTTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGT 1860

 13025760 ACAACATGAGACATTTTCAACAGATTTATAGTAAATTTGATAAGATATTTTTTCTAACAA 13025819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAACATGAGACATTTTCAACAGATTTATAGTAAATTTGATAAGATATTTTTTCTAACAA 1920

 13025820 AAAGTCATTGAGTTTAGCCACTTGAAATAATATTTTAAAAGAACAGACAAAACGAACTGA 13025879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGTCATTGAGTTTAGCCACTTGAAATAATATTTTAAAAGAACAGACAAAACGAACTGA 1980

 13025880 TGAATTGGTTAGAATTGGAATTAAAAGACTAACAAAAAGTTTTTAATGATTTTTCAAAAG 13025939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGAATTGGTTAGAATTGGAATTAAAAGACTAACAAAAAGTTTTTAATGATTTTTCAAAAG 2040

 13025940 ATCTAAGCTTGTAAATAAGCTAGGTTTTTTAAAAATAAGAAACCATTTTTACATGGAGAA 13025999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCTAAGCTTGTAAATAAGCTAGGTTTTTTAAAAATAAGAAACCATTTTTACATGGAGAA 2100

 13026000 ATGGCAAAAATGATTAATAATTTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATATGGCTACC 13026059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGGCAAAAATGATTAATAATTTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATATGGCTACC 2160

 13026060 AATTAAAAATTATATATGTGACTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCAAAGAGTAT 13026119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATTAAAAATTATATATGTGACTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCAAAGAGTAT 2220

 13026120 ATGGAGACTTGAGGTAAAGTCTCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAGCTTCCACT 13026179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGGAGACTTGAGGTAAAGTCTCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAGCTTCCACT 2280

 13026180 TCAGCTTTCCAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTAGTTTTTAC 13026239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCAGCTTTCCAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTAGTTTTTAC 2340

 13026240 TACATAATTCATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTA 13026299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACATAATTCATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTA 2400

 13026300 TGCCTTAGTAAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACAATAAAGAG 13026359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCCTTAGTAAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACAATAAAGAG 2460

 13026360 GAAAAAACAATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTACGAA 13026419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAAAAACAATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTACGAA 2520

 13026420 TTAGTATATATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAGAGAGGAAA 13026479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAGTATATATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAGAGAGGAAA 2580

 13026480 AAACAATAACATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGCATATCAAT 13026539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAACAATAACATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGCATATCAAT 2640

 13026540 AGCTTTTCTTTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAGTGAACACG 13026599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGCTTTTCTTTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAGTGAACACG 2700

 13026600 TGAAAAAGACTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATTATGTAATT 13026659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGAAAAAGACTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATTATGTAATT 2760

 13026660 AAAAATACAGAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTGGTAGATAT 13026719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAAAATACAGAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTGGTAGATAT 2820

 13026720 TTGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGA 13026779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGA 2880

 13026780 TAACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATAT 13026839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATAT 2940

 13026840 TAGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAAT 13026899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAAT 3000

 13026900 AACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTT 13026959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTT 3060

 13026960 GTATTGTTTTTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAG 13027019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTATTGTTTTTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAG 3120

 13027020 GTATAGTGCTCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAA 13027079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTATAGTGCTCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAA 3180

 13027080 TGAGTAAACAAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAG 13027139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGAGTAAACAAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAG 3240

 13027140 TATTTTAATTCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTT 13027199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATTTTAATTCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTT 3300

 13027200 AATACTTGTGGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATAT 13027259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATACTTGTGGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATAT 3360

 13027260 CTTTTCAAGGGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTA 13027319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTTTTCAAGGGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTA 3420

 13027320 TCATTCTTGAAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCT 13027379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCATTCTTGAAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCT 3480

 13027380 TAGGGAAAAAGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGA 13027439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAGGGAAAAAGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGA 3540

 13027440 GGGGGCCTTTATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATA 13027499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGGGGCCTTTATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATA 3600

 13027500 TATCAGTCCTATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTAT 13027559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATCAGTCCTATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTAT 3660

 13027560 TCCACATGGATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAG 13027619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCCACATGGATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAG 3720

 13027620 GAAAAGAAATTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAA 13027679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAAAAGAAATTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAA 3780

 13027680 TATCAAACTATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGA 13027739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TATCAAACTATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGA 3840

 13027740 TGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACC 13027799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACC 3900

 13027800 GTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTA 13027859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTA 3960

 13027860 ACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAG 13027919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAG 4020

 13027920 CTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTT 13027979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTT 4080

 13027980 CTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGC 13028039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGC 4140

 13028040 TTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACC 13028099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACC 4200

 13028100 CCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATA 13028159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATA 4260

 13028160 GGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTT 13028219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTT 4320

 13028220 TTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCT 13028279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCT 4380

 13028280 CTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGC 13028339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGC 4440

 13028340 TCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGA 13028399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGA 4500

 13028400 CTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGT 13028459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGT 4560

 13028460 AGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGA 13028519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGA 4620

 13028520 AAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACT 13028579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACT 4680

 13028580 GTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGC 13028639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGC 4740

 13028640 GGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTAC 13028699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTAC 4800

 13028700 TAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGG 13028759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGG 4860

 13028760 GAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATC 13028819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATC 4920

 13028820 GCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCA 13028879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCA 4980

 13028880 AAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAG 13028939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAG 5040

 13028940 GCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAAT 13028999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAAT 5100

 13029000 AACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAG 13029059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAG 5160

 13029060 TTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGG 13029119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGG 5220

 13029120 AAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCC 13029179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCC 5280

 13029180 CTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAA 13029239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAA 5340

 13029240 CCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGC 13029299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGC 5400

 13029300 AGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAA 13029359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAA 5460

 13029360 GTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTA 13029419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTA 5520

 13029420 TTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTA 13029479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTA 5580

 13029480 TCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATA 13029539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATA 5640

 13029540 AAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCA 13029599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCA 5700

 13029600 AAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAA 13029659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAA 5760

 13029660 GGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAA 13029719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAA 5820

 13029720 CAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGC 13029779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGC 5880

 13029780 TGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGA 13029839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGA 5940

 13029840 ACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCA 13029899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCA 6000

 13029900 CACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAA 13029959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAA 6060

 13029960 AATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCAC 13030019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCAC 6120

 13030020 TTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACAC 13030079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACAC 6180

 13030080 ATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAAC 13030139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAAC 6240

 13030140 TCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGG 13030199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGG 6300

 13030200 TCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAG 13030259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAG 6360

 13030260 ATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGG 13030319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGG 6420

 13030320 AAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATA 13030379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATA 6480

 13030380 CCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCC 13030439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCC 6540

 13030440 ACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAA 13030499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 ACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAA 6600

 13030500 ATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGC 13030559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 ATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGC 6660

 13030560 TATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGA 13030619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGA 6720

 13030620 AATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCGTTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACT 13030679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCGTTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACT 6780

 13030680 TTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCTAGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTG 13030739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCTAGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTG 6840

 13030740 GAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGAGAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTT 13030799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 GAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGAGAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTT 6900

 13030800 TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCAC 13030859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCAC 6960

 13030860 TGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATACTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG 13030919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATACTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG 7020

 13030920 ATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 13030979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 7080

 13030980 GA 13030981
          ||
     7081 GA 7082

EXCISED REGION

 13030994 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAA 13031053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7095 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAA 7154

 13031054 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGAT 13031113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7155 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGAT 7214

 13031114 TTTGTGGTAATGGTTACACAATCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTC 13031173
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7215 TTTGTGGTAATGGTTACACAGTCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTC 7274

 13031174 AAATGAGTGAATAGTATGTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGT 13031233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7275 AAATGAGTGAATAGTATGTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGT 7334

 13031234 GATCTGTGAAGGCAATGGTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTT 13031293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7335 GATCTGTGAAGGCAATGGTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTT 7394

 13031294 AATTATGTCCCTTGTATCCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAAT 13031353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7395 AATTATGTCCCTTGTATCCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAAT 7454

 13031354 TGATCACTACTTTTACTACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAA 13031413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7455 TGATCACTACTTTTACTACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAA 7514

 13031414 AAGGACATTTTCAATATATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCT 13031473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7515 AAGGACATTTTCAATATATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCT 7574

 13031474 TTATGTACATGATAGTCATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTG 13031533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7575 TTATGTACATGATAGTCATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTG 7634

 13031534 GCTAGCTACAAACCAGATGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATA 13031593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7635 GCTAGCTACAAACCAGATGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATA 7694

 13031594 TGTTTCCTCCCTTTTCAGAGGTAGACTCTGCTAG 13031627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7695 TGTTTCCTCCCTTTTCAGAGGTAGACTCTGCTAG 7728

Alignment time is 8.86459 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3546] =>      3546 nucs 'mol-32-1ef5-047937_3546'

Score:        3535
Aligned:      3546        nucs
Identic:      3545 (100%) nucs =>      2920 (100%)       625 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019181,13022101] EXCISED REGION [13028551,13029175]
 second seq =>  [       1,    2921] EXCISED REGION [    2922,    3546]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [2921,2921] to [2922,2922]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019181 AACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTA 13019240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTA 60

 13019241 GCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTA 13019300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTA 120

 13019301 AATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTC 13019360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTC 180

 13019361 CCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAA 13019420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAA 240

 13019421 AAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATT 13019480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATT 300

 13019481 AAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTA 13019540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTA 360

 13019541 CTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTAT 13019600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTAT 420

 13019601 TTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAAT 13019660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAAT 480

 13019661 TGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTA 13019720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTA 540

 13019721 GAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTT 13019780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTT 600

 13019781 CTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGT 13019840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGT 660

 13019841 ATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTA 13019900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTA 720

 13019901 GATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAA 13019960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAA 780

 13019961 GTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATAT 13020020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATAT 840

 13020021 CTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGT 13020080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGT 900

 13020081 ATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCT 13020140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCT 960

 13020141 TTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTG 13020200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTG 1020

 13020201 TGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTT 13020260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTT 1080

 13020261 CTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATAT 13020320
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1081 CTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATAT 1140

 13020321 GTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAAT 13020380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAAT 1200

 13020381 ACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAAT 13020440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAAT 1260

 13020441 AGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCG 13020500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCG 1320

 13020501 CCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAAT 13020560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAAT 1380

 13020561 AAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAA 13020620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAA 1440

 13020621 ACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGAC 13020680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGAC 1500

 13020681 CACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCT 13020740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCT 1560

 13020741 TTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTT 13020800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTT 1620

 13020801 GCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCC 13020860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCC 1680

 13020861 TATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCT 13020920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCT 1740

 13020921 AAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTC 13020980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTC 1800

 13020981 TGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTT 13021040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTT 1860

 13021041 CTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTT 13021100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTT 1920

 13021101 AATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCT 13021160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCT 1980

 13021161 AATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTT 13021220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTT 2040

 13021221 ATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGG 13021280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGG 2100

 13021281 TGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTAT 13021340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTAT 2160

 13021341 ACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATT 13021400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATT 2220

 13021401 GGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTAT 13021460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTAT 2280

 13021461 ACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGG 13021520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGG 2340

 13021521 TTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTAC 13021580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTAC 2400

 13021581 CTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGA 13021640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGA 2460

 13021641 GGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAG 13021700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAG 2520

 13021701 TTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATG 13021760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATG 2580

 13021761 AAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCT 13021820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCT 2640

 13021821 TATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTT 13021880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTT 2700

 13021881 CCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTC 13021940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTC 2760

 13021941 AAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGA 13022000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGA 2820

 13022001 CTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATAC 13022060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATAC 2880

 13022061 TTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 2921

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 2981

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 3041

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 3101

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 13028790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 3161

 13028791 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 13028850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 3221

 13028851 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 13028910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 3281

 13028911 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 13028970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 3341

 13028971 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 13029030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 3401

 13029031 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 13029090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 3461

 13029091 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 13029150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 3521

 13029151 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAA 13029175
          |||||||||||||||||||||||||
     3522 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAA 3546

Alignment time is 4.11708 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2639] =>      2639 nucs 'mol-32-1f0b-067149_2639'

Score:        2604
Aligned:      2638        nucs
Identic:      2630 (100%) nucs =>       601 ( 99%)      2029 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13028093,13028695] EXCISED REGION [13028702,13030732]
 second seq =>  [       1,     603] EXCISED REGION [     609,    2639]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [13028696,13028701]
 second seq =>         5 nucs [604,608]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [602,603] to [607,608]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [604,605] to [607,608]

 13028093 CTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACAT 13028152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACAT 60

 13028153 ACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCC 13028212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCC 120

 13028213 TGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTAC 13028272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTAC 180

 13028273 CCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGAC 13028332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGAC 240

 13028333 AAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAAT 13028392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAAT 300

 13028393 TCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAA 13028452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAA 360

 13028453 GGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTG 13028512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTG 420

 13028513 ACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAG 13028572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAG 480

 13028573 GAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGA 13028632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGA 540

 13028633 GGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACA--GTGAAACCC 13028690
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||
      541 GGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACA--AGGTGAAACCC 598

 13028691 CGTCT 13028695
          |||||
      599 CGTCT 603

EXCISED REGION

 13028702 AAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTA--GTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGG 13028759
          |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||
      609 AAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCG--CGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGG 666

 13028760 GAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATC 13028819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 GAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATC 726

 13028820 GCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCA 13028879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 GCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCA 786

 13028880 AAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAG 13028939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 AAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAG 846

 13028940 GCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAAT 13028999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 GCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAAT 906

 13029000 AACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAG 13029059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 AACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAG 966

 13029060 TTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGG 13029119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 TTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGG 1026

 13029120 AAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCC 13029179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 AAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCC 1086

 13029180 CTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAA 13029239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 CTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAA 1146

 13029240 CCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGC 13029299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 CCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGC 1206

 13029300 AGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAA 13029359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 AGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAA 1266

 13029360 GTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTA 13029419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 GTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTA 1326

 13029420 TTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTA 13029479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 TTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTA 1386

 13029480 TCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATA 13029539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATA 1446

 13029540 AAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCA 13029599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 AAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCA 1506

 13029600 AAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAA 13029659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 AAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAA 1566

 13029660 GGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAA 13029719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 GGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAA 1626

 13029720 CAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGC 13029779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 CAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGC 1686

 13029780 TGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGA 13029839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 TGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGA 1746

 13029840 ACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCA 13029899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 ACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCA 1806

 13029900 CACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAA 13029959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 CACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAA 1866

 13029960 AATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCAC 13030019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 AATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCAC 1926

 13030020 TTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACAC 13030079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACAC 1986

 13030080 ATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAAC 13030139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAAC 2046

 13030140 TCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGG 13030199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGG 2106

 13030200 TCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAG 13030259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAG 2166

 13030260 ATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGG 13030319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 ATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGG 2226

 13030320 AAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATA 13030379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATA 2286

 13030380 CCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCC 13030439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 CCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCC 2346

 13030440 ACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAA 13030499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 ACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAA 2406

 13030500 ATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGC 13030559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 ATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGC 2466

 13030560 TATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGA 13030619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGA 2526

 13030620 AATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCGTTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACT 13030679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 AATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCGTTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACT 2586

 13030680 TTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCTAGCACTGGGGGTGAGGGTGGGC 13030732
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 TTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCTAGCACTGGGGGTGAGGGTGGGC 2639

Alignment time is 3.04397 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2439] =>      2439 nucs 'mol-32-1f16-025967_2439'

Score:        2439
Aligned:      2439        nucs
Identic:      2439 (100%) nucs =>      1718 (100%)       721 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13020384,13022101] EXCISED REGION [13028551,13029271]
 second seq =>  [       1,    1718] EXCISED REGION [    1719,    2439]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [1718,1718] to [1719,1719]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13020384 TTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGA 13020443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGA 60

 13020444 CTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCT 13020503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCT 120

 13020504 CTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAA 13020563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAA 180

 13020564 TTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACA 13020623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACA 240

 13020624 ATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCAC 13020683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCAC 300

 13020684 AGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTC 13020743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTC 360

 13020744 CCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCA 13020803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCA 420

 13020804 AAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTAT 13020863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTAT 480

 13020864 TTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAG 13020923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAG 540

 13020924 GGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGT 13020983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGT 600

 13020984 AGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTT 13021043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTT 660

 13021044 CTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAAT 13021103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAAT 720

 13021104 GCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAAT 13021163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAAT 780

 13021164 CTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATC 13021223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATC 840

 13021224 CTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGG 13021283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGG 900

 13021284 CACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACT 13021343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACT 960

 13021344 CCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGC 13021403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGC 1020

 13021404 CTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACA 13021463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACA 1080

 13021464 TTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTG 13021523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTG 1140

 13021524 ACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTC 13021583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTC 1200

 13021584 CCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGC 13021643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGC 1260

 13021644 ACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTC 13021703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTC 1320

 13021704 CAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAA 13021763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAA 1380

 13021764 TGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTAT 13021823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTAT 1440

 13021824 TTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCA 13021883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCA 1500

 13021884 ATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAG 13021943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAG 1560

 13021944 TTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTA 13022003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTA 1620

 13022004 GATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTG 13022063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTG 1680

 13022064 TTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 1718

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 1778

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 1838

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 1898

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 13028790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 1958

 13028791 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 13028850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 2018

 13028851 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 13028910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 2078

 13028911 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 13028970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 2138

 13028971 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 13029030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 2198

 13029031 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 13029090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 2258

 13029091 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 13029150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 2318

 13029151 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 13029210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 2378

 13029211 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 13029270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 2438

 13029271 G 13029271
          |
     2439 G 2439

Alignment time is 2.82918 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6376] =>      6376 nucs 'mol-32-1f16-085241_6376'

Score:        6353
Aligned:      6364        nucs
Identic:      6363 (100%) nucs =>      2752 (100%)      3611 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13028230,13030981] EXCISED REGION [13030994,13034605]
 second seq =>  [       1,    2752] EXCISED REGION [    2765,    6376]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [13030982,13030993]
 second seq =>        12 nucs [2753,2764]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [13030993,13030993]
 second seq =>         1 nucs [2764,2764]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13030981,13030981] to [13030994,13030994]
 second seq =>         1 nucs [2752,2752] to [2765,2765]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13030982,13030982] to [13030993,13030993]
 second seq =>         1 nucs [2753,2753] to [2764,2764]

 13028230 CAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAAT 13028289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAAT 60

 13028290 AGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTT 13028349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTT 120

 13028350 TTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCA 13028409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCA 180

 13028410 TTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGA 13028469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGA 240

 13028470 AGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAAC 13028529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAAC 300

 13028530 CAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGT 13028589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGT 360

 13028590 GCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAG 13028649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAG 420

 13028650 GTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATAC 13028709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATAC 480

 13028710 AAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 13028769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 540

 13028770 CAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTAC 13028829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTAC 600

 13028830 ACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATA 13028889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATA 660

 13028890 TGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCG 13028949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCG 720

 13028950 CACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCT 13029009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCT 780

 13029010 AACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAG 13029069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAG 840

 13029070 TCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACT 13029129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACT 900

 13029130 TTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTG 13029189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTG 960

 13029190 ATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATG 13029249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATG 1020

 13029250 ATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCA 13029309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCA 1080

 13029310 GAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATC 13029369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATC 1140

 13029370 AAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCC 13029429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCC 1200

 13029430 AGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGC 13029489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGC 1260

 13029490 AAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCT 13029549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCT 1320

 13029550 TTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTAT 13029609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTAT 1380

 13029610 CATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGA 13029669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGA 1440

 13029670 TGATGCCTTATTAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAAT 13029729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGATGCCTTATTAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAAT 1500

 13029730 TTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGA 13029789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGA 1560

 13029790 AAGAATCAGCAAACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGA 13029849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGAATCAGCAAACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGA 1620

 13029850 AAAATAATTAAACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACA 13029909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAATAATTAAACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACA 1680

 13029910 CAAATACGTGTAATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAA 13029969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAATACGTGTAATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAA 1740

 13029970 AAATTATGTCTGGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAG 13030029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATTATGTCTGGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAG 1800

 13030030 CTCAACAAAATCTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCA 13030089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTCAACAAAATCTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCA 1860

 13030090 AAATGTTGAAAGATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTA 13030149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATGTTGAAAGATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTA 1920

 13030150 CAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCAT 13030209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCAT 1980

 13030210 TGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAA 13030269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAA 2040

 13030270 GGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACG 13030329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACG 2100

 13030330 CAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACC 13030389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACC 2160

 13030390 TAGCAATTCTACTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCT 13030449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGCAATTCTACTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCT 2220

 13030450 TGTATGTAAGTGTTCATAATAGCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATA 13030509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTATGTAAGTGTTCATAATAGCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATA 2280

 13030510 TATCTATCAACTGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGC 13030569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATCTATCAACTGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGC 2340

 13030570 CTATACAGAGGAAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGC 13030629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTATACAGAGGAAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGC 2400

 13030630 TAAGCATATTATATTATTTCGTTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAG 13030689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAGCATATTATATTATTTCGTTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAG 2460

 13030690 AAATAAGAATATTCACTGCCTAGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGC 13030749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAATAAGAATATTCACTGCCTAGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGC 2520

 13030750 TAAAGGGCAGGAGGCTAGGGAGAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGA 13030809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAAAGGGCAGGAGGCTAGGGAGAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGA 2580

 13030810 GTCTCGCTCTGTCATCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCT 13030869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTCTCGCTCTGTCATCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCT 2640

 13030870 GCCTCCCGGGTTCAAGCGATACTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGG 13030929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCTCCCGGGTTCAAGCGATACTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGG 2700

 13030930 ATTACAGGCATGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 13030981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTACAGGCATGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 2752

EXCISED REGION

 13030994 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAA 13031053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAA 2824

 13031054 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGAT 13031113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGAT 2884

 13031114 TTTGTGGTAATGGTTACACAATCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTC 13031173
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 TTTGTGGTAATGGTTACACAGTCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTC 2944

 13031174 AAATGAGTGAATAGTATGTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGT 13031233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 AAATGAGTGAATAGTATGTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGT 3004

 13031234 GATCTGTGAAGGCAATGGTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTT 13031293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 GATCTGTGAAGGCAATGGTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTT 3064

 13031294 AATTATGTCCCTTGTATCCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAAT 13031353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 AATTATGTCCCTTGTATCCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAAT 3124

 13031354 TGATCACTACTTTTACTACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAA 13031413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 TGATCACTACTTTTACTACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAA 3184

 13031414 AAGGACATTTTCAATATATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCT 13031473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 AAGGACATTTTCAATATATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCT 3244

 13031474 TTATGTACATGATAGTCATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTG 13031533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 TTATGTACATGATAGTCATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTG 3304

 13031534 GCTAGCTACAAACCAGATGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATA 13031593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 GCTAGCTACAAACCAGATGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATA 3364

 13031594 TGTTTCCTCCCTTTTCAGAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGC 13031653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 TGTTTCCTCCCTTTTCAGAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGC 3424

 13031654 TTTTAAATGGCCTATCTTTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTAT 13031713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 TTTTAAATGGCCTATCTTTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTAT 3484

 13031714 GAAATGCCTGCTACTGTTCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACA 13031773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 GAAATGCCTGCTACTGTTCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACA 3544

 13031774 AATTAGTTTTGCAGACATTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTC 13031833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 AATTAGTTTTGCAGACATTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTC 3604

 13031834 CTGGGATTAACACTCAGTTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGT 13031893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 CTGGGATTAACACTCAGTTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGT 3664

 13031894 TTCGCTGTAGGAAATGGTAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTT 13031953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 TTCGCTGTAGGAAATGGTAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTT 3724

 13031954 GTTGAGCTCTGCATATTTTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGC 13032013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 GTTGAGCTCTGCATATTTTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGC 3784

 13032014 CACCCCTAGGCCTACATTTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTT 13032073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 CACCCCTAGGCCTACATTTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTT 3844

 13032074 TTTACCAGTTTTTTTCATTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGC 13032133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 TTTACCAGTTTTTTTCATTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGC 3904

 13032134 TATGTGGTGGGCTCTACTGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTT 13032193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 TATGTGGTGGGCTCTACTGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTT 3964

 13032194 CTAGGAGGGTGATGGAGAGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAAT 13032253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 CTAGGAGGGTGATGGAGAGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAAT 4024

 13032254 TTTACAAAGTAATAATAAACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCT 13032313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 TTTACAAAGTAATAATAAACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCT 4084

 13032314 ATAAATCATAAATGTTTCAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAG 13032373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 ATAAATCATAAATGTTTCAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAG 4144

 13032374 TAGGTATGAAATTTTGTGAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATT 13032433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 TAGGTATGAAATTTTGTGAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATT 4204

 13032434 GGAAGAAAAGAGACTGAAAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCT 13032493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 GGAAGAAAAGAGACTGAAAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCT 4264

 13032494 CTGAAAATGTACGTGCATTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGT 13032553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 CTGAAAATGTACGTGCATTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGT 4324

 13032554 AGCAACTCCTTTATAATATTAATATTCTTTCCTTGTTCCTCTTCCCAACATGTATGTACC 13032613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 AGCAACTCCTTTATAATATTAATATTCTTTCCTTGTTCCTCTTCCCAACATGTATGTACC 4384

 13032614 CACAGAAAGCCTCATATAAGACTCAAAATTGCTTAGGTTTTAAAAAAAATTTTCAGATTA 13032673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 CACAGAAAGCCTCATATAAGACTCAAAATTGCTTAGGTTTTAAAAAAAATTTTCAGATTA 4444

 13032674 AAAAAAATCCAACCTTGCTTTTAGTTAATAGCTGCATAGATGTTAGATTTTCAAAATGAC 13032733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 AAAAAAATCCAACCTTGCTTTTAGTTAATAGCTGCATAGATGTTAGATTTTCAAAATGAC 4504

 13032734 AAGTGGAAAATTTTCCCATTCACTCACATTAGGCCAACCATATTTACTGTATCAACAGTA 13032793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 AAGTGGAAAATTTTCCCATTCACTCACATTAGGCCAACCATATTTACTGTATCAACAGTA 4564

 13032794 TGAATTTCCAGTGTGTCAACAGGTTATTTTAAAGAAGGTCTTTCATGAGATTTCTCTCTC 13032853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TGAATTTCCAGTGTGTCAACAGGTTATTTTAAAGAAGGTCTTTCATGAGATTTCTCTCTC 4624

 13032854 TGCAGACTATGAATCATGCAAATTAACCCATCACTAGAGATATCTGAGTGTGTGTGTGTA 13032913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TGCAGACTATGAATCATGCAAATTAACCCATCACTAGAGATATCTGAGTGTGTGTGTGTA 4684

 13032914 CATATATTTTCTGTGTAATAAATTGAGGCTATAAAACTGTTCTGTCCCCAAAAAGGAAAC 13032973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 CATATATTTTCTGTGTAATAAATTGAGGCTATAAAACTGTTCTGTCCCCAAAAAGGAAAC 4744

 13032974 TACAGCATTCTGTGACTGTATGTGTTGGAGTATGTATTGCTTGGAGGAAAAAATAAGCAG 13033033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 TACAGCATTCTGTGACTGTATGTGTTGGAGTATGTATTGCTTGGAGGAAAAAATAAGCAG 4804

 13033034 ATATCAGCAACCAGAAATAGAAAGCTATATGCTTACATCACGGATAAAATAACCCATAAA 13033093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 ATATCAGCAACCAGAAATAGAAAGCTATATGCTTACATCACGGATAAAATAACCCATAAA 4864

 13033094 CCATTCCTGATTCAGCACCCAATATCTTGCTAGCTACACACTGTTAAAATGTCTCCATAT 13033153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 CCATTCCTGATTCAGCACCCAATATCTTGCTAGCTACACACTGTTAAAATGTCTCCATAT 4924

 13033154 ACCTAAAGTTGTCTATCCTGGAAATGTCAAACTTCTGTCTACCATAGATAAAATTATCAG 13033213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 ACCTAAAGTTGTCTATCCTGGAAATGTCAAACTTCTGTCTACCATAGATAAAATTATCAG 4984

 13033214 GCAACATTTATTATTTTTTCAGATTTTTTATGACATTTATTACAATCCAGAATTATTCAT 13033273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 GCAACATTTATTATTTTTTCAGATTTTTTATGACATTTATTACAATCCAGAATTATTCAT 5044

 13033274 TTGTTGTCTCTCATTGCCTTCCCAAACCAGAATGTAAATTTTGCAGGAAAAGGGACCATA 13033333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 TTGTTGTCTCTCATTGCCTTCCCAAACCAGAATGTAAATTTTGCAGGAAAAGGGACCATA 5104

 13033334 TCTGTTTTGCTCATCCCTATGTCCCTAACAACTTGTACCTGTCATACCACAAGTGCTTAA 13033393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 TCTGTTTTGCTCATCCCTATGTCCCTAACAACTTGTACCTGTCATACCACAAGTGCTTAA 5164

 13033394 TAAATATGCAAATAAATATGCGCTGTAAAAATATCGTATGCATTTGGAGAGAGAGATTGT 13033453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 TAAATATGCAAATAAATATGCGCTGTAAAAATATCGTATGCATTTGGAGAGAGAGATTGT 5224

 13033454 AGACTGATTAGTCCATTATATATTAAAAAATAATTTATTAATGAAATCCCTTTCCCCCAA 13033513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 AGACTGATTAGTCCATTATATATTAAAAAATAATTTATTAATGAAATCCCTTTCCCCCAA 5284

 13033514 TTTTTCCTCTCAGAATGTTTTTAATGTTAATTACTCTTAATTTGTACTTCACTAAGTTTA 13033573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 TTTTTCCTCTCAGAATGTTTTTAATGTTAATTACTCTTAATTTGTACTTCACTAAGTTTA 5344

 13033574 TAAGTTCTTCTCAGATTTAAGACTTTTTGAGACACACACAGACATACACCCTGCAAGTGT 13033633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 TAAGTTCTTCTCAGATTTAAGACTTTTTGAGACACACACAGACATACACCCTGCAAGTGT 5404

 13033634 AATTTTGGTAAAAGAATCACTGATACTGAAGCACAGGGTTTCAAACATATATTTTCAAAA 13033693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 AATTTTGGTAAAAGAATCACTGATACTGAAGCACAGGGTTTCAAACATATATTTTCAAAA 5464

 13033694 CCTCCATCATCTTTCCAGTTTTAAAATTTCCTCCTAAGGTCTTATAATATTTATTTTATT 13033753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 CCTCCATCATCTTTCCAGTTTTAAAATTTCCTCCTAAGGTCTTATAATATTTATTTTATT 5524

 13033754 CAAACTGGGTTAAACTTCTTAATTGTAAAGATGTCTACATCTGTTTCTACGTAGGCTTTA 13033813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 CAAACTGGGTTAAACTTCTTAATTGTAAAGATGTCTACATCTGTTTCTACGTAGGCTTTA 5584

 13033814 ATCTGATATAAAGTTTCTGATTCTCCCTCCCTATCCATCCCTCTCCAATTCTCTCTCTTT 13033873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 ATCTGATATAAAGTTTCTGATTCTCCCTCCCTATCCATCCCTCTCCAATTCTCTCTCTTT 5644

 13033874 TTCTCCTTCTTTCTCCTCCCCATTATGGTTATATTAGAATTAGAATATTGCTCTCTTTTT 13033933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 TTCTCCTTCTTTCTCCTCCCCATTATGGTTATATTAGAATTAGAATATTGCTCTCTTTTT 5704

 13033934 TGCTTTTTTTTAAACTTTTTTTCTTCACTGCTTCATAAGAGCAGAGAAAGAAGATAGAAT 13033993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 TGCTTTTTTTTAAACTTTTTTTCTTCACTGCTTCATAAGAGCAGAGAAAGAAGATAGAAT 5764

 13033994 TACAGACCCATTTAATTTGCAGTTTATTAATGGCTTCCCTTACAGATGTAGGTGACAGAA 13034053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 TACAGACCCATTTAATTTGCAGTTTATTAATGGCTTCCCTTACAGATGTAGGTGACAGAA 5824

 13034054 AATTTGGAGGAGTTTGAGAATAACATATATGGATAAAAATGCACTATTTGACCATCATGC 13034113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 AATTTGGAGGAGTTTGAGAATAACATATATGGATAAAAATGCACTATTTGACCATCATGC 5884

 13034114 TCATAAGATTCTTATGCTTATAGAGAATAGATTATTCGGTTTAATTGCTTATACCACTGT 13034173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 TCATAAGATTCTTATGCTTATAGAGAATAGATTATTCGGTTTAATTGCTTATACCACTGT 5944

 13034174 CCACTCCAAGGGAGCTCTATTTGGGCAGTGGCTGGGAACTATTCACACCAGTGATTAGTT 13034233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 CCACTCCAAGGGAGCTCTATTTGGGCAGTGGCTGGGAACTATTCACACCAGTGATTAGTT 6004

 13034234 TACCACTTGTGTTCCTTCAGGTCAGAACCAAATTGCTATCTACCAACTGTCAAGGGAAAA 13034293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 TACCACTTGTGTTCCTTCAGGTCAGAACCAAATTGCTATCTACCAACTGTCAAGGGAAAA 6064

 13034294 TGTGCCAGAATAGGTAGGTTTTCCATTTCTCCACCTGGCTGGCTTACCAGTTGGATGAGT 13034353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 TGTGCCAGAATAGGTAGGTTTTCCATTTCTCCACCTGGCTGGCTTACCAGTTGGATGAGT 6124

 13034354 AAAGGATAAATAGTGAAGACCATTCAGAGGGGATTAGAGGATAGAAGAGATGACACTTGT 13034413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 AAAGGATAAATAGTGAAGACCATTCAGAGGGGATTAGAGGATAGAAGAGATGACACTTGT 6184

 13034414 GAAACGGCATTGCACCTCTTAGCACACAGATGGGGTATATGTATTTAGGTTTTGGCATTA 13034473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6185 GAAACGGCATTGCACCTCTTAGCACACAGATGGGGTATATGTATTTAGGTTTTGGCATTA 6244

 13034474 TTTCTCCCTGTTCAAACCTGCTGTTGTATCTGGGAAGGGTTATTTATCCAATGCTTTGTA 13034533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 TTTCTCCCTGTTCAAACCTGCTGTTGTATCTGGGAAGGGTTATTTATCCAATGCTTTGTA 6304

 13034534 CTTTAAATTTCCACTAGTGTCTCTGAAATTTATTAATGGTGGATCTCTTCCTTGACTGTG 13034593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6305 CTTTAAATTTCCACTAGTGTCTCTGAAATTTATTAATGGTGGATCTCTTCCTTGACTGTG 6364

 13034594 CATTACAATCAT 13034605
          ||||||||||||
     6365 CATTACAATCAT 6376

Alignment time is 7.32876 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4403] =>      4403 nucs 'mol-32-1f21-022155_4403'

Score:        4403
Aligned:      4403        nucs
Identic:      4403 (100%) nucs =>         3 (100%)      4400 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13012112,13012114] EXCISED REGION [13020309,13024708]
 second seq =>  [       1,       3] EXCISED REGION [       4,    4403]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8194 nucs [13012115,13020308]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 52
 first  seq =>        29 nucs [13020280,13020308]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13012115,13012115] to [13020308,13020308]
 second seq =>         0 nucs

 13012112 GCA 13012114
          |||
        1 GCA 3

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 63

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 123

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 183

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 243

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 303

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 363

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 423

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 483

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 543

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 603

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 663

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 723

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 783

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 843

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 903

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 963

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1023

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1083

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1143

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1203

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1263

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 1323

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 1383

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 1443

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 1503

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 1563

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 1623

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 1683

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 1743

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 1803

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 1863

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 1923

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 1983

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2043

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2103

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2163

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2223

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 2283

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 2343

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 2403

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 2463

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 2523

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 2583

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 2643

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 2703

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 2763

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 2823

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 2883

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 2943

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3003

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3063

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3123

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3183

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3243

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 3303

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 3363

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 3423

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 3483

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 3543

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 3603

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 3663

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 3723

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 3783

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 13024148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 3843

 13024149 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 13024208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 3903

 13024209 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 13024268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 3963

 13024269 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 13024328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 4023

 13024329 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 13024388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 4083

 13024389 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 13024448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 4143

 13024449 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 13024508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 4203

 13024509 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 13024568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 4263

 13024569 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 13024628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 4323

 13024629 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 13024688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 4383

 13024689 AACACTGATTTGAAAAAAAA 13024708
          ||||||||||||||||||||
     4384 AACACTGATTTGAAAAAAAA 4403

Alignment time is 4.79734 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3014] =>      3014 nucs 'mol-32-2076-076722_3014'

Score:        3002
Aligned:      3013        nucs
Identic:      3012 (100%) nucs =>       131 (100%)      2881 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13021014,13021144] EXCISED REGION [13021146,13024027]
 second seq =>  [       1,     131] EXCISED REGION [     133,    3014]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13021145,13021145]
 second seq =>         1 nucs [132,132]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [131,131] to [132,132]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13021014 TCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAA 13021073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAA 60

 13021074 TTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAG 13021133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAG 120

 13021134 CACCTGCTACA 13021144
          |||||||||||
      121 CACCTGCTACA 131

EXCISED REGION

 13021146 GCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATA 13021205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      133 GCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATA 192

 13021206 GGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAA 13021265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      193 GGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAA 252

 13021266 AATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCA 13021325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      253 AATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCA 312

 13021326 AGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCT 13021385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      313 AGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCT 372

 13021386 TTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCA 13021445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      373 TTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCA 432

 13021446 GATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCA 13021505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      433 GATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCA 492

 13021506 AAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTAC 13021565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 AAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTAC 552

 13021566 TTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTT 13021625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      553 TTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTT 612

 13021626 AAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGAT 13021685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 AAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGAT 672

 13021686 TCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAG 13021745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 TCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAG 732

 13021746 AGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATA 13021805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 AGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATA 792

 13021806 GCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAA 13021865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 GCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAA 852

 13021866 GTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATT 13021925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 GTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATT 912

 13021926 CACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTC 13021985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 CACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTC 972

 13021986 GCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTC 13022045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 GCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTC 1032

 13022046 TATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATA 13022105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 TATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATA 1092

 13022106 ACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCC 13022165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 ACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCC 1152

 13022166 TCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCA 13022225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 TCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCA 1212

 13022226 CTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACT 13022285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 CTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACT 1272

 13022286 TACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAA 13022345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 TACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAA 1332

 13022346 GTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTAC 13022405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 GTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTAC 1392

 13022406 CACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTA 13022465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 CACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTA 1452

 13022466 TCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATT 13022525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 TCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATT 1512

 13022526 TCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTC 13022585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 TCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTC 1572

 13022586 CGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAG 13022645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 CGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAG 1632

 13022646 TTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCC 13022705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 TTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCC 1692

 13022706 TGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTC 13022765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 TGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTC 1752

 13022766 TCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTA 13022825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 TCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTA 1812

 13022826 CTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCC 13022885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCC 1872

 13022886 ACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCC 13022945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 ACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCC 1932

 13022946 CATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGG 13023005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 CATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGG 1992

 13023006 TAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGT 13023065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGT 2052

 13023066 TAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGA 13023125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 TAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGA 2112

 13023126 TACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTA 13023185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 TACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTA 2172

 13023186 GCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACC 13023245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 GCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACC 2232

 13023246 TAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGG 13023305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 TAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGG 2292

 13023306 CTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCT 13023365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2293 CTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAGTGGTCCATGCTTGCT 2352

 13023366 GGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTC 13023425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTC 2412

 13023426 CAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTT 13023485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 CAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTT 2472

 13023486 TATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGA 13023545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 TATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGA 2532

 13023546 GGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATG 13023605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 GGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATG 2592

 13023606 ATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAA 13023665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 ATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAA 2652

 13023666 AGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTA 13023725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 AGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTA 2712

 13023726 ATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTA 13023785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 ATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTA 2772

 13023786 AAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAA 13023845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 AAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAA 2832

 13023846 AAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTG 13023905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 AAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTG 2892

 13023906 ACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTG 13023965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 ACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTG 2952

 13023966 CGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTG 13024025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 CGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTG 3012

 13024026 TT 13024027
          ||
     3013 TT 3014

Alignment time is 3.48892 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4561] =>      4561 nucs 'mol-32-2081-011685_4561'

Score:        4532
Aligned:      4532        nucs
Identic:      4532 (100%) nucs =>        10 (100%)      4522 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13014686,13014695] EXCISED REGION [13026168,13030689]
 second seq =>  [       5,      14] EXCISED REGION [      40,    4561]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     11472 nucs [13014696,13026167]
 second seq =>        25 nucs [15,39]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13014696,13014696] to [13026168,13026168]
 second seq =>         1 nucs [14,14] to [39,39]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13014692,13014695] to [13026168,13026171]
 second seq =>         4 nucs [11,14] to [40,43]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13014696,13014696] to [13026167,13026167]
 second seq =>         1 nucs [15,15] to [39,39]

 13014686 CTTTGCAAAG 13014695
          ||||||||||
        5 CTTTGCAAAG 14

EXCISED REGION

 13026168 AAAGCTTCCACTTCAGCTTTCCAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATAT 13026227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       40 AAAGCTTCCACTTCAGCTTTCCAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATAT 99

 13026228 TTTAGTTTTTACTACATAATTCATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTA 13026287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      100 TTTAGTTTTTACTACATAATTCATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTA 159

 13026288 CTTGTGCCTGTATGCCTTAGTAAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTA 13026347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      160 CTTGTGCCTGTATGCCTTAGTAAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTA 219

 13026348 GACAATAAAGAGGAAAAAACAATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTG 13026407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      220 GACAATAAAGAGGAAAAAACAATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTG 279

 13026408 TGCCTGTACGAATTAGTATATATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAA 13026467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      280 TGCCTGTACGAATTAGTATATATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAA 339

 13026468 ATAGAGAGGAAAAAACAATAACATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGT 13026527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      340 ATAGAGAGGAAAAAACAATAACATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGT 399

 13026528 TAGCATATCAATAGCTTTTCTTTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACA 13026587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      400 TAGCATATCAATAGCTTTTCTTTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACA 459

 13026588 TAAGTGAACACGTGAAAAAGACTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGA 13026647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      460 TAAGTGAACACGTGAAAAAGACTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGA 519

 13026648 CATTATGTAATTAAAAATACAGAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTT 13026707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      520 CATTATGTAATTAAAAATACAGAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTT 579

 13026708 AGTGGTAGATATTTGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGA 13026767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 AGTGGTAGATATTTGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGA 639

 13026768 GTTGGTTCTTGATAACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATAT 13026827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 GTTGGTTCTTGATAACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATAT 699

 13026828 TTGGTATAATATTAGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCT 13026887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 TTGGTATAATATTAGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCT 759

 13026888 TGCCTGTTGAATAACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATT 13026947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 TGCCTGTTGAATAACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATT 819

 13026948 TCTAACCATGTTGTATTGTTTTTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAAC 13027007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TCTAACCATGTTGTATTGTTTTTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAAC 879

 13027008 TCCTTGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCC 13027067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 TCCTTGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCC 939

 13027068 AACACAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCA 13027127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 AACACAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCA 999

 13027128 GGCAATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCA 13027187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 GGCAATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCA 1059

 13027188 GAAAATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTT 13027247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 GAAAATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTT 1119

 13027248 GACATTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACT 13027307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 GACATTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACT 1179

 13027308 AAACTTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAA 13027367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 AAACTTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAA 1239

 13027368 AGTAAACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGT 13027427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 AGTAAACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGT 1299

 13027428 CCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTG 13027487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 CCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTG 1359

 13027488 TATCTGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCAT 13027547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TATCTGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCAT 1419

 13027548 ATTAAAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAAC 13027607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 ATTAAAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAAC 1479

 13027608 CTTGTAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGC 13027667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 CTTGTAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGC 1539

 13027668 TACTTGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCA 13027727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 TACTTGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCA 1599

 13027728 TAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAAT 13027787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 TAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAAT 1659

 13027788 TGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGT 13027847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 TGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGT 1719

 13027848 TGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTC 13027907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTC 1779

 13027908 TTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTC 13027967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTC 1839

 13027968 GGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCA 13028027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 GGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCA 1899

 13028028 AGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGA 13028087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGA 1959

 13028088 TGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCC 13028147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCC 2019

 13028148 AACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGC 13028207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 AACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGC 2079

 13028208 CACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTC 13028267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 CACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTC 2139

 13028268 CCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATA 13028327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 CCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATA 2199

 13028328 AAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAG 13028387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 AAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAG 2259

 13028388 AGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTT 13028447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 AGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTT 2319

 13028448 AAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGA 13028507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 AAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGA 2379

 13028508 GAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGG 13028567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGG 2439

 13028568 GGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAG 13028627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 GGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAG 2499

 13028628 GCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAA 13028687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 GCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAA 2559

 13028688 CCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTC 13028747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 CCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTC 2619

 13028748 CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAG 13028807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAG 2679

 13028808 TGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCA 13028867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 TGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCA 2739

 13028868 AAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCC 13028927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 AAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCC 2799

 13028928 CATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACAC 13028987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 CATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACAC 2859

 13028988 AAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATA 13029047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 AAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATA 2919

 13029048 GAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTT 13029107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 GAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTT 2979

 13029108 GACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACA 13029167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 GACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACA 3039

 13029168 AATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGT 13029227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 AATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGT 3099

 13029228 GGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAA 13029287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 GGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAA 3159

 13029288 AGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAAT 13029347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 AGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAAT 3219

 13029348 TGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCC 13029407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 TGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCC 3279

 13029408 CCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCA 13029467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 CCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCA 3339

 13029468 ATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAG 13029527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 ATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAG 3399

 13029528 TAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAG 13029587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 TAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAG 3459

 13029588 ACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTAC 13029647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 ACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTAC 3519

 13029648 GAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAAT 13029707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 GAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAAT 3579

 13029708 ACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATG 13029767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 ACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATG 3639

 13029768 AAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAG 13029827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 AAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAG 3699

 13029828 GCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCA 13029887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 GCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCA 3759

 13029888 CTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAA 13029947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 CTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAA 3819

 13029948 AGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAAC 13030007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 AGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAAC 3879

 13030008 ATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAG 13030067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 ATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAG 3939

 13030068 ACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAA 13030127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 ACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAA 3999

 13030128 GAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAA 13030187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 GAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAA 4059

 13030188 AAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAA 13030247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 AAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAA 4119

 13030248 TCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAACTGACACTCTCATAC 13030307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 TCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAACTGACACTCTCATAC 4179

 13030308 TTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCT 13030367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 TTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCT 4239

 13030368 GTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGA 13030427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 GTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGA 4299

 13030428 AAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCATTATTCGTAATATC 13030487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 AAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCATTATTCGTAATATC 4359

 13030488 CAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATC 13030547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 CAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATC 4419

 13030548 CATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAG 13030607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 CATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAG 4479

 13030608 ATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCGTTTATAGGATATGTCCA 13030667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 ATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCGTTTATAGGATATGTCCA 4539

 13030668 GAATATGCAACTTTATTGATAG 13030689
          ||||||||||||||||||||||
     4540 GAATATGCAACTTTATTGATAG 4561

Alignment time is 5.22953 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3667] =>      3667 nucs 'mol-32-208c-039614_3667'

Score:        3666
Aligned:      3666        nucs
Identic:      3666 (100%) nucs =>      3519 (100%)       147 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13026009,13029527] EXCISED REGION [13029529,13029675]
 second seq =>  [       1,    3519] EXCISED REGION [    3521,    3667]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13029528,13029528]
 second seq =>         1 nucs [3520,3520]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [13029526,13029527] to [13029529,13029530]
 second seq =>         2 nucs [3518,3519] to [3521,3522]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13026009 ATGATTAATAATTTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATATGGCTACCAATTAAAAA 13026068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGATTAATAATTTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATATGGCTACCAATTAAAAA 60

 13026069 TTATATATGTGACTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCAAAGAGTATATGGAGACT 13026128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATATATGTGACTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCAAAGAGTATATGGAGACT 120

 13026129 TGAGGTAAAGTCTCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAGCTTCCACTTCAGCTTTC 13026188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGGTAAAGTCTCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAGCTTCCACTTCAGCTTTC 180

 13026189 CAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTAGTTTTTACTACATAATT 13026248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTAGTTTTTACTACATAATT 240

 13026249 CATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTATGCCTTAGT 13026308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTATGCCTTAGT 300

 13026309 AAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACAATAAAGAGGAAAAAACA 13026368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACAATAAAGAGGAAAAAACA 360

 13026369 ATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTACGAATTAGTATAT 13026428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTACGAATTAGTATAT 420

 13026429 ATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAGAGAGGAAAAAACAATAA 13026488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAGAGAGGAAAAAACAATAA 480

 13026489 CATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGCATATCAATAGCTTTTCT 13026548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGCATATCAATAGCTTTTCT 540

 13026549 TTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAGTGAACACGTGAAAAAGA 13026608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAGTGAACACGTGAAAAAGA 600

 13026609 CTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATTATGTAATTAAAAATACA 13026668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATTATGTAATTAAAAATACA 660

 13026669 GAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTGGTAGATATTTGGTAGAA 13026728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTGGTAGATATTTGGTAGAA 720

 13026729 TAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGATAACCATGC 13026788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGATAACCATGC 780

 13026789 TGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATATTAGGTTACA 13026848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATATTAGGTTACA 840

 13026849 TTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAATAACCAATCT 13026908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAATAACCAATCT 900

 13026909 TGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTTGTATTGTTT 13026968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTTGTATTGTTT 960

 13026969 TTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGC 13027028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGC 1020

 13027029 TCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAAC 13027088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAAC 1080

 13027089 AAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAAT 13027148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAAT 1140

 13027149 TCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGT 13027208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGT 1200

 13027209 GGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAG 13027268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAG 1260

 13027269 GGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTG 13027328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTG 1320

 13027329 AAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAA 13027388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAA 1380

 13027389 AGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTT 13027448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTT 1440

 13027449 TATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCC 13027508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCC 1500

 13027509 TATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGG 13027568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGG 1560

 13027569 ATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAA 13027628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAA 1620

 13027629 TTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACT 13027688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACT 1680

 13027689 ATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTT 13027748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTT 1740

 13027749 CCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAA 13027808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAA 1800

 13027809 ATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACC 13027868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACC 1860

 13027869 CCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCA 13027928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCA 1920

 13027929 AGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTC 13027988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTC 1980

 13027989 ACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAA 13028048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAA 2040

 13028049 TAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCA 13028108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCA 2100

 13028109 ACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAG 13028168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAG 2160

 13028169 TTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTC 13028228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTC 2220

 13028229 ACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAA 13028288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAA 2280

 13028289 TAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCT 13028348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCT 2340

 13028349 TTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGC 13028408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGC 2400

 13028409 ATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATG 13028468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATG 2460

 13028469 AAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAA 13028528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAA 2520

 13028529 CCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATG 13028588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATG 2580

 13028589 TGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAA 13028648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAA 2640

 13028649 GGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATA 13028708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATA 2700

 13028709 CAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG 13028768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG 2760

 13028769 GCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTA 13028828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTA 2820

 13028829 CACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGAT 13028888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGAT 2880

 13028889 ATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCC 13028948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCC 2940

 13028949 GCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTC 13029008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTC 3000

 13029009 TAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACA 13029068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACA 3060

 13029069 GTCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAAC 13029128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAAC 3120

 13029129 TTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCT 13029188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCT 3180

 13029189 GATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGAT 13029248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGAT 3240

 13029249 GATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATC 13029308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATC 3300

 13029309 AGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAAT 13029368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAAT 3360

 13029369 CAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATC 13029428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATC 3420

 13029429 CAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATG 13029488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATG 3480

 13029489 CAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAG 13029527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAG 3519

EXCISED REGION

 13029529 AGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGA 13029588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 AGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGA 3580

 13029589 CGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACG 13029648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 CGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACG 3640

 13029649 AATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGC 13029675
          |||||||||||||||||||||||||||
     3641 AATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGC 3667

Alignment time is 4.26261 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2892] =>      2892 nucs 'mol-32-2105-030509_2892'

Score:        2892
Aligned:      2892        nucs
Identic:      2892 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13021583,13024474]
 second seq =>  [       1,    2892]

 13021583 CCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGG 13021642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGG 60

 13021643 CACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTT 13021702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTT 120

 13021703 CCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAA 13021762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAA 180

 13021763 ATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTA 13021822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTA 240

 13021823 TTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCC 13021882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCC 300

 13021883 AATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAA 13021942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAA 360

 13021943 GTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACT 13022002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACT 420

 13022003 AGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTT 13022062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTT 480

 13022063 GTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTT 13022122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTT 540

 13022123 ACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAAT 13022182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAAT 600

 13022183 TCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAA 13022242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAA 660

 13022243 CACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTA 13022302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTA 720

 13022303 TTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAG 13022362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAG 780

 13022363 GATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATC 13022422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATC 840

 13022423 CATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTC 13022482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTC 900

 13022483 TCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCA 13022542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCA 960

 13022543 TAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGT 13022602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGT 1020

 13022603 TTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAAC 13022662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAAC 1080

 13022663 TTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCT 13022722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCT 1140

 13022723 TCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGT 13022782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGT 1200

 13022783 CAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGG 13022842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGG 1260

 13022843 TTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGG 13022902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGG 1320

 13022903 AGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCT 13022962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCT 1380

 13022963 CAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATA 13023022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATA 1440

 13023023 TGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACA 13023082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACA 1500

 13023083 CCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGG 13023142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGG 1560

 13023143 ATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAA 13023202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAA 1620

 13023203 GCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGT 13023262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGT 1680

 13023263 TCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACT 13023322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACT 1740

 13023323 TGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCT 13023382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCT 1800

 13023383 TCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTG 13023442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTG 1860

 13023443 TGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGT 13023502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGT 1920

 13023503 TGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGAT 13023562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGAT 1980

 13023563 TAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCA 13023622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCA 2040

 13023623 TCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTA 13023682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTA 2100

 13023683 GTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATA 13023742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATA 2160

 13023743 CAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAA 13023802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAA 2220

 13023803 AGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGC 13023862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGC 2280

 13023863 GTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAA 13023922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAA 2340

 13023923 AGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCC 13023982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCC 2400

 13023983 CCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAAT 13024042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAAT 2460

 13024043 GGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTT 13024102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTT 2520

 13024103 ATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCC 13024162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCC 2580

 13024163 TGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTC 13024222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTC 2640

 13024223 TGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAAC 13024282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAAC 2700

 13024283 ATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCAT 13024342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCAT 2760

 13024343 ATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTT 13024402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTT 2820

 13024403 CCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTC 13024462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTC 2880

 13024463 AGATTGGTAGTA 13024474
          ||||||||||||
     2881 AGATTGGTAGTA 2892

Alignment time is 2.948 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3438] =>      3438 nucs 'mol-32-2110-072469_3438'

Score:        3426
Aligned:      3437        nucs
Identic:      3436 (100%) nucs =>      2404 (100%)      1032 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13020412,13022815] EXCISED REGION [13022817,13023849]
 second seq =>  [       1,    2404] EXCISED REGION [    2406,    3438]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13022816,13022816]
 second seq =>         1 nucs [2405,2405]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [13022813,13022815] to [13022817,13022819]
 second seq =>         3 nucs [2402,2404] to [2406,2408]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13020412 TTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAA 13020471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAA 60

 13020472 TTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGT 13020531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGT 120

 13020532 ATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTT 13020591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTT 180

 13020592 TTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCAT 13020651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCAT 240

 13020652 GTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAAT 13020711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAAT 300

 13020712 GCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCA 13020771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCA 360

 13020772 GGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTT 13020831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTT 420

 13020832 CCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAG 13020891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAG 480

 13020892 TTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTT 13020951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTT 540

 13020952 TCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGA 13021011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGA 600

 13021012 TTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACT 13021071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACT 660

 13021072 AATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTG 13021131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTG 720

 13021132 AGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATC 13021191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATC 780

 13021192 TTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAG 13021251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAG 840

 13021252 GAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACA 13021311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACA 900

 13021312 AAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTT 13021371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTT 960

 13021372 TGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACT 13021431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACT 1020

 13021432 TACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTC 13021491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTC 1080

 13021492 TCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTAT 13021551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTAT 1140

 13021552 CAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAA 13021611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAA 1200

 13021612 ATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTT 13021671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTT 1260

 13021672 GAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCAC 13021731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCAC 1320

 13021732 CAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATA 13021791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATA 1380

 13021792 CTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAG 13021851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAG 1440

 13021852 TTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCT 13021911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCT 1500

 13021912 TTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGA 13021971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGA 1560

 13021972 GCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTC 13022031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTC 1620

 13022032 CTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGA 13022091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGA 1680

 13022092 TAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTA 13022151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTA 1740

 13022152 GTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCA 13022211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCA 1800

 13022212 AGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCT 13022271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCT 1860

 13022272 TACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTC 13022331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTC 1920

 13022332 TGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGC 13022391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGC 1980

 13022392 ATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATA 13022451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATA 2040

 13022452 GCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACC 13022511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACC 2100

 13022512 ATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGT 13022571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGT 2160

 13022572 GAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGAT 13022631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGAT 2220

 13022632 CACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGC 13022691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGC 2280

 13022692 CTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATAT 13022751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATAT 2340

 13022752 ATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATA 13022811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATA 2400

 13022812 ATAC 13022815
          ||||
     2401 ATAC 2404

EXCISED REGION

 13022817 TACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCA 13022876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCA 2465

 13022877 CCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGT 13022936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 CCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGT 2525

 13022937 GTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATC 13022996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATC 2585

 13022997 GGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAA 13023056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 GGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAA 2645

 13023057 GAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGC 13023116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGC 2705

 13023117 CGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGG 13023176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGG 2765

 13023177 AGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCT 13023236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 AGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCT 2825

 13023237 AGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCT 13023296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 AGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCT 2885

 13023297 TCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCC 13023356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 TCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCC 2945

 13023357 ATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGT 13023416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 ATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGT 3005

 13023417 TTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGA 13023476
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3006 TTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCCTCTGCTCACAACTGGA 3065

 13023477 ATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGG 13023536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 ATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGG 3125

 13023537 GTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAG 13023596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAG 3185

 13023597 TGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGC 13023656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 TGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGC 3245

 13023657 TTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTA 13023716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 TTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTA 3305

 13023717 CTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCA 13023776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCA 3365

 13023777 GTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAA 13023836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 GTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAA 3425

 13023837 GGAAAAAAAAAGA 13023849
          |||||||||||||
     3426 GGAAAAAAAAAGA 3438

Alignment time is 3.97366 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5378] =>      5378 nucs 'mol-32-2110-094310_5378'

Score:        5377
Aligned:      5377        nucs
Identic:      5377 (100%) nucs =>       309 (100%)      5068 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019999,13020307] EXCISED REGION [13020309,13025376]
 second seq =>  [       1,     309] EXCISED REGION [     311,    5378]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [310,310]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019999 GGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGA 13020058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGA 60

 13020059 CCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTT 13020118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTT 120

 13020119 TTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGAC 13020178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGAC 180

 13020179 TTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGA 13020238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGA 240

 13020239 TAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACAC 13020298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACAC 300

 13020299 ATAATAAGC 13020307
          |||||||||
      301 ATAATAAGC 309

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 370

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 430

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 490

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 550

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 610

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 670

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 730

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 790

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 850

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 910

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 970

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1030

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1090

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1150

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1210

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1270

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1330

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1390

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1450

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1510

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1570

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 1630

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 1690

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 1750

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 1810

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 1870

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 1930

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 1990

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2050

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2110

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2170

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2230

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2290

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2350

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2410

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2470

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2530

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 2590

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 2650

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 2710

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 2770

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 2830

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 2890

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 2950

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3010

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3070

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3130

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3190

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3250

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3310

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3370

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3430

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3490

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3550

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 3610

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 3670

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 3730

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 3790

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 3850

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 3910

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 3970

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 4030

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 4090

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 13024148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 4150

 13024149 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 13024208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 4210

 13024209 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 13024268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 4270

 13024269 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 13024328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 4330

 13024329 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 13024388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 4390

 13024389 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 13024448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 4450

 13024449 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 13024508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 4510

 13024509 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 13024568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 4570

 13024569 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 13024628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 4630

 13024629 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 13024688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 4690

 13024689 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 13024748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 4750

 13024749 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 13024808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 4810

 13024809 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 13024868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 4870

 13024869 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 13024928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 4930

 13024929 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 13024988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 4990

 13024989 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 13025048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 5050

 13025049 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 13025108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 5110

 13025109 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 13025168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 5170

 13025169 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 13025228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 5230

 13025229 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 13025288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 5290

 13025289 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 13025348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 5350

 13025349 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTA 13025376
          ||||||||||||||||||||||||||||
     5351 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTA 5378

Alignment time is 6.25562 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2220] =>      2220 nucs 'mol-32-229c-002144_2220'

Score:        2220
Aligned:      2220        nucs
Identic:      2220 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13020525,13022744]
 second seq =>  [       1,    2220]

 13020525 CAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAG 13020584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAG 60

 13020585 TAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATT 13020644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATT 120

 13020645 TGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGC 13020704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGC 180

 13020705 ATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCC 13020764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCC 240

 13020765 ATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAA 13020824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAA 300

 13020825 TCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATT 13020884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATT 360

 13020885 CAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTG 13020944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTG 420

 13020945 AATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAA 13021004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAA 480

 13021005 GGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATAT 13021064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATAT 540

 13021065 TAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAAC 13021124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAAC 600

 13021125 ATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAG 13021184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAG 660

 13021185 TTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAA 13021244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAA 720

 13021245 ACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTA 13021304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTA 780

 13021305 GGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTT 13021364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTT 840

 13021365 CACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAAT 13021424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAAT 900

 13021425 GAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAAC 13021484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAAC 960

 13021485 TGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTG 13021544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTG 1020

 13021545 ACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAA 13021604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAA 1080

 13021605 CATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAG 13021664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAG 1140

 13021665 TTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGA 13021724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGA 1200

 13021725 GATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAA 13021784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAA 1260

 13021785 GAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAG 13021844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAG 1320

 13021845 TCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTG 13021904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTG 1380

 13021905 TTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGC 13021964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGC 1440

 13021965 ATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTT 13022024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTT 1500

 13022025 TTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAG 13022084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAG 1560

 13022085 TATCAGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCT 13022144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATCAGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCT 1620

 13022145 CCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCA 13022204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCA 1680

 13022205 GGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACT 13022264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACT 1740

 13022265 GCAGTCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCT 13022324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCAGTCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCT 1800

 13022325 ATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTC 13022384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTC 1860

 13022385 TTTTAGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATT 13022444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTAGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATT 1920

 13022445 ACAGATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATA 13022504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACAGATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATA 1980

 13022505 TGTAACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTC 13022564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTAACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTC 2040

 13022565 TAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAA 13022624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAA 2100

 13022625 TTGGGATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAA 13022684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGGGATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAA 2160

 13022685 ATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCT 13022744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCT 2220

Alignment time is 2.28023 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3363] =>      3363 nucs 'mol-32-22b2-026079_3363'

Score:        3363
Aligned:      3363        nucs
Identic:      3363 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13025409,13028771]
 second seq =>  [       1,    3363]

 13025409 TCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTA 13025468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTA 60

 13025469 TTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTGAT 13025528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTGAT 120

 13025529 TCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGTGA 13025588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGTGA 180

 13025589 AAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGTTACAAATTT 13025648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGTTACAAATTT 240

 13025649 CATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGCTTTTATTTT 13025708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGCTTTTATTTT 300

 13025709 TATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGTACAACATGA 13025768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGTACAACATGA 360

 13025769 GACATTTTCAACAGATTTATAGTAAATTTGATAAGATATTTTTTCTAACAAAAAGTCATT 13025828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACATTTTCAACAGATTTATAGTAAATTTGATAAGATATTTTTTCTAACAAAAAGTCATT 420

 13025829 GAGTTTAGCCACTTGAAATAATATTTTAAAAGAACAGACAAAACGAACTGATGAATTGGT 13025888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGTTTAGCCACTTGAAATAATATTTTAAAAGAACAGACAAAACGAACTGATGAATTGGT 480

 13025889 TAGAATTGGAATTAAAAGACTAACAAAAAGTTTTTAATGATTTTTCAAAAGATCTAAGCT 13025948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGAATTGGAATTAAAAGACTAACAAAAAGTTTTTAATGATTTTTCAAAAGATCTAAGCT 540

 13025949 TGTAAATAAGCTAGGTTTTTTAAAAATAAGAAACCATTTTTACATGGAGAAATGGCAAAA 13026008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTAAATAAGCTAGGTTTTTTAAAAATAAGAAACCATTTTTACATGGAGAAATGGCAAAA 600

 13026009 ATGATTAATAATTTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATATGGCTACCAATTAAAAA 13026068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGATTAATAATTTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATATGGCTACCAATTAAAAA 660

 13026069 TTATATATGTGACTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCAAAGAGTATATGGAGACT 13026128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATATATGTGACTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCAAAGAGTATATGGAGACT 720

 13026129 TGAGGTAAAGTCTCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAGCTTCCACTTCAGCTTTC 13026188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGGTAAAGTCTCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAGCTTCCACTTCAGCTTTC 780

 13026189 CAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTAGTTTTTACTACATAATT 13026248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTAGTTTTTACTACATAATT 840

 13026249 CATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTATGCCTTAGT 13026308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTATGCCTTAGT 900

 13026309 AAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACAATAAAGAGGAAAAAACA 13026368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACAATAAAGAGGAAAAAACA 960

 13026369 ATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTACGAATTAGTATAT 13026428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTACGAATTAGTATAT 1020

 13026429 ATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAGAGAGGAAAAAACAATAA 13026488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAGAGAGGAAAAAACAATAA 1080

 13026489 CATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGCATATCAATAGCTTTTCT 13026548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGCATATCAATAGCTTTTCT 1140

 13026549 TTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAGTGAACACGTGAAAAAGA 13026608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAGTGAACACGTGAAAAAGA 1200

 13026609 CTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATTATGTAATTAAAAATACA 13026668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATTATGTAATTAAAAATACA 1260

 13026669 GAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTGGTAGATATTTGGTAGAA 13026728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTGGTAGATATTTGGTAGAA 1320

 13026729 TAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGATAACCATGC 13026788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGATAACCATGC 1380

 13026789 TGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATATTAGGTTACA 13026848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATATTAGGTTACA 1440

 13026849 TTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAATAACCAATCT 13026908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAATAACCAATCT 1500

 13026909 TGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTTGTATTGTTT 13026968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTTGTATTGTTT 1560

 13026969 TTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGC 13027028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGC 1620

 13027029 TCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAAC 13027088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAAC 1680

 13027089 AAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAAT 13027148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAAT 1740

 13027149 TCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGT 13027208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGT 1800

 13027209 GGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAG 13027268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAG 1860

 13027269 GGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTG 13027328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTG 1920

 13027329 AAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAA 13027388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAA 1980

 13027389 AGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTT 13027448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTT 2040

 13027449 TATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCC 13027508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCC 2100

 13027509 TATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGG 13027568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGG 2160

 13027569 ATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAA 13027628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAA 2220

 13027629 TTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACT 13027688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACT 2280

 13027689 ATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTT 13027748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTT 2340

 13027749 CCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAA 13027808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAA 2400

 13027809 ATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACC 13027868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACC 2460

 13027869 CCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCA 13027928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCA 2520

 13027929 AGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTC 13027988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTC 2580

 13027989 ACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAA 13028048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAA 2640

 13028049 TAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCA 13028108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCA 2700

 13028109 ACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAG 13028168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAG 2760

 13028169 TTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTC 13028228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTC 2820

 13028229 ACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAA 13028288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAA 2880

 13028289 TAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCT 13028348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCT 2940

 13028349 TTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGC 13028408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGC 3000

 13028409 ATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATG 13028468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATG 3060

 13028469 AAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAA 13028528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAA 3120

 13028529 CCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATG 13028588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATG 3180

 13028589 TGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAA 13028648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAA 3240

 13028649 GGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATA 13028708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATA 3300

 13028709 CAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG 13028768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG 3360

 13028769 GCA 13028771
          |||
     3361 GCA 3363

Alignment time is 3.45444 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3477] =>      3477 nucs 'mol-32-23ba-068019_3477'

Score:        3444
Aligned:      3477        nucs
Identic:      3474 (100%) nucs =>      3391 (100%)        83 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018708,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028633]
 second seq =>  [       1,    3394] EXCISED REGION [    3395,    3477]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3394,3394] to [3395,3395]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018708 TATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAA 13018767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAA 60

 13018768 ATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGA 13018827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGA 120

 13018828 GTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAA 13018887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAA 180

 13018888 ATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTG 13018947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTG 240

 13018948 GGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTA 13019007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTA 300

 13019008 TTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAA 13019067
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAACGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAA 360

 13019068 CTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGG 13019127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGG 420

 13019128 GATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTC 13019187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTC 480

 13019188 TTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAA 13019247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAA 540

 13019248 TTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAAT 13019307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAAT 600

 13019308 AAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCT 13019367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCT 660

 13019368 GTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGT 13019427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGT 720

 13019428 CTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAG 13019487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAG 780

 13019488 GAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAA 13019547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAA 840

 13019548 TGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTA 13019607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTA 900

 13019608 AAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAAT 13019667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAAT 960

 13019668 GCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATG 13019727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATG 1020

 13019728 AAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTA 13019787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTA 1080

 13019788 ATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGA 13019847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGA 1140

 13019848 AACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTA 13019907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTA 1200

 13019908 TTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAAT 13019967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAAT 1260

 13019968 ACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCA 13020027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCA 1320

 13020028 AAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCC 13020087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCC 1380

 13020088 CACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCAT 13020147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCAT 1440

 13020148 AGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTAT 13020207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTAT 1500

 13020208 CTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGAT 13020267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGAT 1560

 13020268 GTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAA 13020327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1561 GTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAA 1620

 13020328 TAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTT 13020387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTT 1680

 13020388 TAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGA 13020447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGA 1740

 13020448 GTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGT 13020507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGT 1800

 13020508 GGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTT 13020567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTT 1860

 13020568 AGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATAT 13020627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATAT 1920

 13020628 ATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGA 13020687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGA 1980

 13020688 TCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTT 13020747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTT 2040

 13020748 CTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGC 13020807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGC 2100

 13020808 TTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTG 13020867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTG 2160

 13020868 CACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTT 13020927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTT 2220

 13020928 GAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTA 13020987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTA 2280

 13020988 ACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTAC 13021047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTAC 2340

 13021048 ACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCA 13021107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCA 2400

 13021108 GTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCT 13021167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCT 2460

 13021168 GTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCA 13021227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCA 2520

 13021228 TTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACA 13021287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACA 2580

 13021288 ACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTA 13021347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTA 2640

 13021348 ACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGC 13021407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGC 2700

 13021408 CTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTG 13021467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTG 2760

 13021468 TGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTC 13021527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTC 2820

 13021528 TCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCAT 13021587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCAT 2880

 13021588 CTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAG 13021647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAG 2940

 13021648 TAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGA 13021707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGA 3000

 13021708 CAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAA 13021767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAA 3060

 13021768 CACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGG 13021827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGG 3120

 13021828 TATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTG 13021887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTG 3180

 13021888 ATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAA 13021947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAA 3240

 13021948 GTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATT 13022007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATT 3300

 13022008 TGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGA 13022067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGA 3360

 13022068 AGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3361 AGGGGGAAAGTCGAAAGTATCAGATAAATTTACC 3394

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3454

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAG 13028633
          |||||||||||||||||||||||
     3455 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAG 3477

Alignment time is 4.05766 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4113] =>      4113 nucs 'mol-32-2874-118065_4113'

Score:        4070
Aligned:      4114        nucs
Identic:      4110 (100%) nucs =>      3861 (100%)       249 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018237,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028799]
 second seq =>  [       1,    3864] EXCISED REGION [    3865,    4113]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3864,3864] to [3865,3865]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018237 AAATGTGTCAGAAATCTCTAAATTAATTCATTAAATTAAAAGTGCTCCCAAACAACAACA 13018296
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGTGTCAGAAATCTCCAAATTAATTCATTAAATTAAAAGTGCTCCCAAACAACAACA 60

 13018297 AAAAACTAGCATTAAAAGAAATAATTTGACAATTTGGTTTCAGAGTTCATTTGGAGACGT 13018356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAACTAGCATTAAAAGAAATAATTTGACAATTTGGTTTCAGAGTTCATTTGGAGACGT 120

 13018357 TATAATGCTTAAAATAATTTTCCATATCTCTTTCAAGGATAGAAAAATAGAACAGAATAG 13018416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAATGCTTAAAATAATTTTCCATATCTCTTTCAAGGATAGAAAAATAGAACAGAATAG 180

 13018417 TATAAAATAGCTATAATTTCGTATGAGAATTCAGCATAAAATTTGATTTCAAGTATTTAT 13018476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAAAATAGCTATAATTTCGTATGAGAATTCAGCATAAAATTTGATTTCAAGTATTTAT 240

 13018477 GTATGTAGTATTGAGGCAAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAATATTGCATTTCTTCTGAAC 13018536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTATGTAGTATTGAGGCAAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAATATTGCATTTCTTCTGAAC 300

 13018537 TCTTTTTAAATTTAAAAATAAAATTGAATTCATAATGAACCAGGGGATAATAAACATTGG 13018596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTTTTAAATTTAAAAATAAAATTGAATTCATAATGAACCAGGGGATAATAAACATTGG 360

 13018597 TGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGCAAACAT 13018656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGCAAACAT 420

 13018657 CTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTATGTAAAT 13018716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTATGTAAAT 480

 13018717 ATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATGAACATC 13018776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATGAACATC 540

 13018777 TTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTATGATGT 13018836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTATGATGT 600

 13018837 ACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATTTCAACT 13018896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATTTCAACT 660

 13018897 TCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGTTTGTGA 13018956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGTTTGTGA 720

 13018957 AATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTAATGAAC 13019016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTAATGAAC 780

 13019017 TTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTGCAGAGC 13019076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTGCAGAGC 840

 13019077 GTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGATTGGAAC 13019136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGATTGGAAC 900

 13019137 AAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTGGGAAGA 13019196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTGGGAAGA 960

 13019197 CATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTAGATTCA 13019256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTAGATTCA 1020

 13019257 GTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAAAAAAAT 13019316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAAAAAAAT 1080

 13019317 ATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATC 13019376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATC 1140

 13019377 TCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAAT 13019436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAAT 1200

 13019437 ATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTG 13019496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTG 1260

 13019497 TTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAG 13019556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAG 1320

 13019557 ATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATC 13019616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATC 1380

 13019617 TCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAG 13019676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAG 1440

 13019677 CTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAG 13019736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAG 1500

 13019737 GATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATA 13019796
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1501 GATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTACTAGCTAATCAAGATA 1560

 13019797 AAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAA 13019856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAA 1620

 13019857 GAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAA 13019916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAA 1680

 13019917 CCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAA 13019976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAA 1740

 13019977 TTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTT 13020036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTT 1800

 13020037 TTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTC 13020096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTC 1860

 13020097 CTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTAC 13020156
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTCATCTGGATTTTTTTTTTTT-ACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTAC 1919

 13020157 CACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCC 13020216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCC 1979

 13020217 CAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATG 13020276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATG 2039

 13020277 GCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAG 13020336
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAG 2099

 13020337 GTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGG 13020396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGG 2159

 13020397 CTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAA 13020456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAA 2219

 13020457 TAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATA 13020516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATA 2279

 13020517 CATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGAT 13020576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGAT 2339

 13020577 ATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCT 13020636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCT 2399

 13020637 CTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTA 13020696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTA 2459

 13020697 GATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTC 13020756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTC 2519

 13020757 AGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATT 13020816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATT 2579

 13020817 TGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACT 13020876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACT 2639

 13020877 CAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCAT 13020936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCAT 2699

 13020937 GTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCAC 13020996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCAC 2759

 13020997 CTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGT 13021056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGT 2819

 13021057 ATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATA 13021116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 ATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATA 2879

 13021117 TAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTA 13021176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTA 2939

 13021177 GTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATA 13021236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATA 2999

 13021237 TGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATT 13021296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATT 3059

 13021297 TGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTA 13021356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTA 3119

 13021357 TCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTA 13021416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTA 3179

 13021417 AGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAA 13021476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAA 3239

 13021477 ATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCT 13021536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCT 3299

 13021537 CTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTAT 13021596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTAT 3359

 13021597 TATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTT 13021656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTT 3419

 13021657 TTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTG 13021716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTG 3479

 13021717 GTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGT 13021776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGT 3539

 13021777 AAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTA 13021836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTA 3599

 13021837 TTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTT 13021896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTT 3659

 13021897 AATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTT 13021956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTT 3719

 13021957 ATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTC 13022016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTC 3779

 13022017 AGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAA 13022076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAA 3839

 13022077 GTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||||||||||||||||
     3840 GTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 3864

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3924

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 3984

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 4044

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 13028790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 4104

 13028791 GGAGGCGGA 13028799
          |||||||||
     4105 GGAGGCGGA 4113

Alignment time is 4.79315 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4098] =>      4098 nucs 'mol-32-287f-018589_4098'

Score:        4075
Aligned:      4097        nucs
Identic:      4095 (100%) nucs =>       880 (100%)      3215 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019428,13020307] EXCISED REGION [13020309,13023525]
 second seq =>  [       1,     880] EXCISED REGION [     882,    4098]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [881,881]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019428 CTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAG 13019487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAG 60

 13019488 GAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAA 13019547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAA 120

 13019548 TGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTA 13019607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTA 180

 13019608 AAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAAT 13019667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAAT 240

 13019668 GCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATG 13019727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATG 300

 13019728 AAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTA 13019787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTA 360

 13019788 ATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGA 13019847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGA 420

 13019848 AACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTA 13019907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTA 480

 13019908 TTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAAT 13019967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAAT 540

 13019968 ACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCA 13020027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCA 600

 13020028 AAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCC 13020087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCC 660

 13020088 CACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCAT 13020147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCAT 720

 13020148 AGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTAT 13020207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTAT 780

 13020208 CTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGAT 13020267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGAT 840

 13020268 GTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 13020307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 880

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 941

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 1001

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 1061

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 1121

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 TAAAATCACTATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 1181

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 1241

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1301

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1361

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1421

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1481

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1541

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1601

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1661

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1721

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1781

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1841

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1901

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1961

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 2021

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAGTCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 2081

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 2141

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 2201

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 2261

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2321

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2381

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2441

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2501

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2561

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2621

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2681

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2741

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2801

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2861

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2921

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2981

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 3041

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 3101

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 3161

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 3221

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 3281

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 3341

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 3401

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3461

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3521

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3581

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3641

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3701

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3761

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3821

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3881

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3941

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 4001

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 4061

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATG 13023525
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATG 4098

Alignment time is 4.75154 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3807] =>      3807 nucs 'mol-32-2b08-067244_3807'

Score:        3806
Aligned:      3806        nucs
Identic:      3806 (100%) nucs =>       538 (100%)      3268 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13021986,13022523] EXCISED REGION [13022525,13025792]
 second seq =>  [       1,     538] EXCISED REGION [     540,    3807]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13022524,13022524]
 second seq =>         1 nucs [539,539]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [13022524,13022525] to [13022525,13022526]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13021986 GCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTC 13022045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTC 60

 13022046 TATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATA 13022105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATA 120

 13022106 ACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCC 13022165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCC 180

 13022166 TCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCA 13022225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCA 240

 13022226 CTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACT 13022285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACT 300

 13022286 TACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAA 13022345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAA 360

 13022346 GTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTAC 13022405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTAC 420

 13022406 CACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTA 13022465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTA 480

 13022466 TCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATA 13022523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATA 538

EXCISED REGION

 13022525 TTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCT 13022584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCT 599

 13022585 CCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCA 13022644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCA 659

 13022645 GTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACC 13022704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACC 719

 13022705 CTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCT 13022764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCT 779

 13022765 CTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTT 13022824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTT 839

 13022825 ACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATC 13022884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATC 899

 13022885 CACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGC 13022944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGC 959

 13022945 CCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAG 13023004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAG 1019

 13023005 GTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAG 13023064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAG 1079

 13023065 TTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAG 13023124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAG 1139

 13023125 ATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGT 13023184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGT 1199

 13023185 AGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTAC 13023244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTAC 1259

 13023245 CTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGG 13023304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGG 1319

 13023305 GCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGC 13023364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGC 1379

 13023365 TGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCT 13023424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCT 1439

 13023425 CCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCT 13023484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCT 1499

 13023485 TTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGG 13023544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGG 1559

 13023545 AGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACAT 13023604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACAT 1619

 13023605 GATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGA 13023664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGA 1679

 13023665 AAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGT 13023724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGT 1739

 13023725 AATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTT 13023784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTT 1799

 13023785 AAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAA 13023844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAA 1859

 13023845 AAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTT 13023904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTT 1919

 13023905 GACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGT 13023964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGT 1979

 13023965 GCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATT 13024024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATT 2039

 13024025 GTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATG 13024084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATG 2099

 13024085 AAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATA 13024144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATA 2159

 13024145 GATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTG 13024204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTG 2219

 13024205 AATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTT 13024264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTT 2279

 13024265 TTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAG 13024324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAG 2339

 13024325 AAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCAC 13024384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCAC 2399

 13024385 CACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTAT 13024444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTAT 2459

 13024445 TTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGA 13024504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGA 2519

 13024505 TGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTT 13024564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTT 2579

 13024565 CAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGA 13024624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGA 2639

 13024625 AGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTT 13024684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTT 2699

 13024685 TTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGC 13024744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGC 2759

 13024745 ACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCA 13024804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCA 2819

 13024805 AACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGT 13024864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGT 2879

 13024865 AGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGG 13024924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGG 2939

 13024925 CAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGC 13024984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGC 2999

 13024985 CCAGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTA 13025044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CCAGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTA 3059

 13025045 GCTACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCAT 13025104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GCTACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCAT 3119

 13025105 GTCCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCT 13025164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GTCCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCT 3179

 13025165 GCACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAAT 13025224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GCACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAAT 3239

 13025225 CATTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGT 13025284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CATTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGT 3299

 13025285 AAGATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAA 13025344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AAGATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAA 3359

 13025345 AAAAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATA 13025404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AAAAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATA 3419

 13025405 TTTTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGAT 13025464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTTTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGAT 3479

 13025465 GTTATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGAT 13025524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GTTATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGAT 3539

 13025525 TGATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGA 13025584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TGATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGA 3599

 13025585 GTGAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGTTACAA 13025644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GTGAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGTTACAA 3659

 13025645 ATTTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGCTTTTA 13025704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ATTTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGCTTTTA 3719

 13025705 TTTTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGTACAAC 13025764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TTTTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGTACAAC 3779

 13025765 ATGAGACATTTTCAACAGATTTATAGTA 13025792
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ATGAGACATTTTCAACAGATTTATAGTA 3807

Alignment time is 4.42388 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2390] =>      2390 nucs 'mol-32-2b13-003929_2390'

Score:        2390
Aligned:      2390        nucs
Identic:      2390 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13027270,13029659]
 second seq =>  [       1,    2390]

 13027270 GATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTGA 13027329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTGA 60

 13027330 AAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAAA 13027389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAAA 120

 13027390 GCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTT 13027449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTT 180

 13027450 ATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCCT 13027509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCCT 240

 13027510 ATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGGA 13027569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGGA 300

 13027570 TACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAAT 13027629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAAT 360

 13027630 TTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACTA 13027689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACTA 420

 13027690 TGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTC 13027749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTC 480

 13027750 CCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAA 13027809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAA 540

 13027810 TGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCC 13027869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCC 600

 13027870 CCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAA 13027929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAA 660

 13027930 GAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCA 13027989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCA 720

 13027990 CCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAAT 13028049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAAT 780

 13028050 AGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAA 13028109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAA 840

 13028110 CACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGT 13028169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGT 900

 13028170 TCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCA 13028229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCA 960

 13028230 CAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAAT 13028289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAAT 1020

 13028290 AGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTT 13028349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTT 1080

 13028350 TTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCA 13028409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCA 1140

 13028410 TTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGA 13028469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGA 1200

 13028470 AGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAAC 13028529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAAC 1260

 13028530 CAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGT 13028589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGT 1320

 13028590 GCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAG 13028649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAG 1380

 13028650 GTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATAC 13028709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATAC 1440

 13028710 AAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 13028769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 1500

 13028770 CAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTAC 13028829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTAC 1560

 13028830 ACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATA 13028889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATA 1620

 13028890 TGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCG 13028949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGAAAGACTTGAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCG 1680

 13028950 CACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCT 13029009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACTGCCACAGGCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCT 1740

 13029010 AACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAG 13029069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAG 1800

 13029070 TCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACT 13029129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTGTATGACTGTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACT 1860

 13029130 TTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTG 13029189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTG 1920

 13029190 ATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATG 13029249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATG 1980

 13029250 ATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCA 13029309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCA 2040

 13029310 GAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATC 13029369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGGCTGCACACTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATC 2100

 13029370 AAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCC 13029429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATAAGCAAAGGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCC 2160

 13029430 AGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGC 13029489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGATTTGCTAAAAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGC 2220

 13029490 AAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCT 13029549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAGAAACGGGAAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCT 2280

 13029550 TTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTAT 13029609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGAAGATATCCTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTAT 2340

 13029610 CATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAA 13029659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATAAAGATATTCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAA 2390

Alignment time is 2.46322 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6101] =>      6101 nucs 'mol-32-2b4a-108675_6101'

Score:        6100
Aligned:      6100        nucs
Identic:      6100 (100%) nucs =>       798 (100%)      5302 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019510,13020307] EXCISED REGION [13020309,13025610]
 second seq =>  [       1,     798] EXCISED REGION [     800,    6101]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [799,799]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019510 GCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTG 13019569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTG 60

 13019570 TCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATAT 13019629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATAT 120

 13019630 GGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAA 13019689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAA 180

 13019690 GAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATT 13019749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATT 240

 13019750 CTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAA 13019809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAA 300

 13019810 TCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAAT 13019869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAAT 360

 13019870 AAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACAT 13019929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACAT 420

 13019930 TGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTT 13019989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTT 480

 13019990 CTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAAC 13020049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAAC 540

 13020050 CTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATT 13020109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATT 600

 13020110 TTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAG 13020169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAG 660

 13020170 TTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTT 13020229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTT 720

 13020230 CCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAA 13020289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAA 780

 13020290 TGCTTACACATAATAAGC 13020307
          ||||||||||||||||||
      781 TGCTTACACATAATAAGC 798

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 859

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 919

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 979

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 1039

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 1099

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 1159

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1219

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1279

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1339

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1399

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1459

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1519

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1579

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1639

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1699

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1759

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1819

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1879

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1939

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1999

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 2059

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 2119

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 2179

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2239

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2299

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2359

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2419

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2479

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2539

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2599

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2659

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2719

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2779

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2839

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2899

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2959

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 3019

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 3079

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 3139

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 3199

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 3259

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 3319

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3379

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3439

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3499

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3559

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3619

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3679

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3739

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3799

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3859

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3919

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3979

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 4039

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 4099

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 4159

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 4219

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 4279

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 4339

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 4399

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 4459

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 4519

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 4579

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 13024148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 4639

 13024149 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 13024208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 4699

 13024209 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 13024268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 4759

 13024269 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 13024328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 4819

 13024329 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 13024388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 4879

 13024389 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 13024448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 4939

 13024449 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 13024508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 4999

 13024509 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 13024568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 5059

 13024569 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 13024628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 5119

 13024629 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 13024688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 5179

 13024689 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 13024748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 5239

 13024749 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 13024808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 5299

 13024809 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 13024868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 5359

 13024869 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 13024928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 5419

 13024929 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 13024988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 5479

 13024989 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 13025048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 5539

 13025049 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 13025108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 5599

 13025109 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 13025168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 5659

 13025169 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 13025228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 5719

 13025229 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 13025288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 5779

 13025289 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 13025348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 5839

 13025349 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATTTT 13025408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATTTT 5899

 13025409 TCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTA 13025468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 TCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTA 5959

 13025469 TTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTGAT 13025528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 TTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTGAT 6019

 13025529 TCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGTGA 13025588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 TCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGTGA 6079

 13025589 AAATGCTACCACCAGAATAGTA 13025610
          ||||||||||||||||||||||
     6080 AAATGCTACCACCAGAATAGTA 6101

Alignment time is 7.02804 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2896] =>      2896 nucs 'mol-32-2b55-088343_2896'

Score:        2896
Aligned:      2896        nucs
Identic:      2896 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13020960,13023855]
 second seq =>  [       1,    2896]

 13020960 CTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGA 13021019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGA 60

 13021020 CCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCAT 13021079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCAT 120

 13021080 GTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTG 13021139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTG 180

 13021140 CTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCAC 13021199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCAC 240

 13021200 TCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATAT 13021259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATAT 300

 13021260 GGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAA 13021319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAA 360

 13021320 AAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAA 13021379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAA 420

 13021380 CTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCC 13021439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCC 480

 13021440 ATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTC 13021499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTC 540

 13021500 TCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCAT 13021559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCAT 600

 13021560 CTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCC 13021619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCC 660

 13021620 CTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAAC 13021679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAAC 720

 13021680 AATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAA 13021739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAA 780

 13021740 TGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTG 13021799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTG 840

 13021800 GCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAA 13021859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAA 900

 13021860 TTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTA 13021919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTA 960

 13021920 TGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTT 13021979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTT 1020

 13021980 AAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTC 13022039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTC 1080

 13022040 CATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTA 13022099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTA 1140

 13022100 CCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTC 13022159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTC 1200

 13022160 TGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGC 13022219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGC 1260

 13022220 TTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTT 13022279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTT 1320

 13022280 TGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTAC 13022339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTAC 1380

 13022340 TCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACA 13022399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACA 1440

 13022400 CATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAA 13022459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAA 1500

 13022460 TTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTG 13022519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTG 1560

 13022520 GATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTC 13022579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTC 1620

 13022580 ATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCC 13022639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCC 1680

 13022640 ACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCT 13022699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCT 1740

 13022700 CAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTG 13022759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTG 1800

 13022760 AATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATAC 13022819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATAC 1860

 13022820 TTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCA 13022879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCA 1920

 13022880 TAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTC 13022939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTC 1980

 13022940 TCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGT 13022999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGT 2040

 13023000 TCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAG 13023059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAG 2100

 13023060 ATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGT 13023119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGT 2160

 13023120 TACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGA 13023179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGA 2220

 13023180 AATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGC 13023239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGC 2280

 13023240 TCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCA 13023299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCA 2340

 13023300 TCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATG 13023359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATG 2400

 13023360 CTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTG 13023419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTG 2460

 13023420 TCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATC 13023479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATC 2520

 13023480 ATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTG 13023539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTG 2580

 13023540 CTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGT 13023599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGT 2640

 13023600 CACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTC 13023659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTC 2700

 13023660 CTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTG 13023719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTG 2760

 13023720 AAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTC 13023779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTC 2820

 13023780 ATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGA 13023839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGA 2880

 13023840 AAAAAAAAGATTGTAT 13023855
          ||||||||||||||||
     2881 AAAAAAAAGATTGTAT 2896

Alignment time is 2.95845 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3596] =>      3596 nucs 'mol-32-2b55-119281_3596'

Score:        3585
Aligned:      3596        nucs
Identic:      3595 (100%) nucs =>      3518 (100%)        77 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018583,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028627]
 second seq =>  [       1,    3519] EXCISED REGION [    3520,    3596]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3519,3519] to [3520,3520]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018583 ATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATC 13018642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATC 60

 13018643 TGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTA 13018702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTA 120

 13018703 TAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATG 13018762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATG 180

 13018763 CTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCA 13018822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCA 240

 13018823 AAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAAT 13018882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAAT 300

 13018883 ATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGA 13018942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGA 360

 13018943 AAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTT 13019002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTT 420

 13019003 ATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGA 13019062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGA 480

 13019063 GCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTC 13019122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTC 540

 13019123 AAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAA 13019182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAA 600

 13019183 CGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGC 13019242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGC 660

 13019243 TAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAA 13019302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAA 720

 13019303 TTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCC 13019362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCC 780

 13019363 TTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAA 13019422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAA 840

 13019423 AGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAA 13019482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAA 900

 13019483 ACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACT 13019542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACT 960

 13019543 AAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTT 13019602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTT 1020

 13019603 ATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTG 13019662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTG 1080

 13019663 AGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGA 13019722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGA 1140

 13019723 AAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCT 13019782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCT 1200

 13019783 AGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTAT 13019842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTAT 1260

 13019843 CAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGA 13019902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGA 1320

 13019903 TGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGT 13019962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGT 1380

 13019963 GCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCT 13020022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCT 1440

 13020023 ACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTAT 13020082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTAT 1500

 13020083 TCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTT 13020142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTT 1560

 13020143 TTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTG 13020202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTG 1620

 13020203 TTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCT 13020262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCT 1680

 13020263 CTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGT 13020322
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1681 CTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGT 1740

 13020323 GTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATAC 13020382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATAC 1800

 13020383 ATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAG 13020442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAG 1860

 13020443 ACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCC 13020502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCC 1920

 13020503 TCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAA 13020562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAA 1980

 13020563 ATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAAC 13020622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAAC 2040

 13020623 AATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCA 13020682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCA 2100

 13020683 CAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTT 13020742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTT 2160

 13020743 CCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGC 13020802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGC 2220

 13020803 AAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTA 13020862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTA 2280

 13020863 TTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAA 13020922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAA 2340

 13020923 GGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTG 13020982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTG 2400

 13020983 TAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCT 13021042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCT 2460

 13021043 TCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAA 13021102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAA 2520

 13021103 TGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAA 13021162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAA 2580

 13021163 TCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTAT 13021222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTAT 2640

 13021223 CCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTG 13021282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTG 2700

 13021283 GCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATAC 13021342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATAC 2760

 13021343 TCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGG 13021402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGG 2820

 13021403 CCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATAC 13021462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATAC 2880

 13021463 ATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTT 13021522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTT 2940

 13021523 GACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCT 13021582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCT 3000

 13021583 CCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGG 13021642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGG 3060

 13021643 CACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTT 13021702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTT 3120

 13021703 CCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAA 13021762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAA 3180

 13021763 ATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTA 13021822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTA 3240

 13021823 TTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCC 13021882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCC 3300

 13021883 AATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAA 13021942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAA 3360

 13021943 GTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACT 13022002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACT 3420

 13022003 AGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTT 13022062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTT 3480

 13022063 GTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 3519

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3579

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAG 13028627
          |||||||||||||||||
     3580 TCCCAGCACTCTGGGAG 3596

Alignment time is 4.20462 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6640] =>      6640 nucs 'mol-32-2e0a-071291_6640'

Score:        6628
Aligned:      6639        nucs
Identic:      6638 (100%) nucs =>        33 (100%)      6605 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13022118,13022150] EXCISED REGION [13022152,13028757]
 second seq =>  [       1,      33] EXCISED REGION [      35,    6640]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13022151,13022151]
 second seq =>         1 nucs [34,34]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [34,34] to [35,35]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13022118 CTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCT 13022150
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCT 33

EXCISED REGION

 13022152 GTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCA 13022211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       35 GTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCA 94

 13022212 AGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCT 13022271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       95 AGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCT 154

 13022272 TACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTC 13022331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      155 TACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTC 214

 13022332 TGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGC 13022391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      215 TGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGC 274

 13022392 ATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATA 13022451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      275 ATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATA 334

 13022452 GCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACC 13022511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 GCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACC 394

 13022512 ATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGT 13022571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      395 ATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGT 454

 13022572 GAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGAT 13022631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 GAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGAT 514

 13022632 CACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGC 13022691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 CACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGC 574

 13022692 CTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATAT 13022751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 CTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATAT 634

 13022752 ATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATA 13022811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 ATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATA 694

 13022812 ATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTAT 13022871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 ATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTAT 754

 13022872 ACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTC 13022931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 ACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTC 814

 13022932 TCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTC 13022991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 TCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTC 874

 13022992 CAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAA 13023051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 CAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAA 934

 13023052 CTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGA 13023111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 CTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGA 994

 13023112 ATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGA 13023171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 ATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGA 1054

 13023172 ACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATA 13023231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 ACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATA 1114

 13023232 TCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGG 13023291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 TCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGG 1174

 13023292 CTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAAT 13023351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 CTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAAT 1234

 13023352 GGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAAT 13023411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 GGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAAT 1294

 13023412 ACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAA 13023471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 ACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAA 1354

 13023472 CTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCT 13023531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 CTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCT 1414

 13023532 GGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGG 13023591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 GGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGG 1474

 13023592 GGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCA 13023651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 GGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCA 1534

 13023652 TTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCA 13023711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 TTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCA 1594

 13023712 AACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCC 13023771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 AACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCC 1654

 13023772 ATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCC 13023831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 ATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCC 1714

 13023832 ACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCA 13023891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 ACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCA 1774

 13023892 TTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTG 13023951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTG 1834

 13023952 GTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCA 13024011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 GTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCA 1894

 13024012 CAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTT 13024071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 CAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTT 1954

 13024072 TCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAA 13024131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAA 2014

 13024132 AAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTC 13024191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 AAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTC 2074

 13024192 TGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCAC 13024251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCAC 2134

 13024252 ATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCT 13024311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 ATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCT 2194

 13024312 TTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGG 13024371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 TTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGG 2254

 13024372 AAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGG 13024431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 AAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGG 2314

 13024432 AGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGA 13024491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 AGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGA 2374

 13024492 ATATTGCCAAAGATGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGAT 13024551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 ATATTGCCAAAGATGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGAT 2434

 13024552 TTGTACTTGTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAG 13024611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 TTGTACTTGTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAG 2494

 13024612 AATTTCTGTCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAAT 13024671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AATTTCTGTCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAAT 2554

 13024672 TCTGGTTTTATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGA 13024731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TCTGGTTTTATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGA 2614

 13024732 GGAGATTTTGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAA 13024791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GGAGATTTTGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAA 2674

 13024792 TGATGTTTCTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTG 13024851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TGATGTTTCTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTG 2734

 13024852 GAAGTGAATTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAAC 13024911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 GAAGTGAATTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAAC 2794

 13024912 CCAGATGTGAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTG 13024971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 CCAGATGTGAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTG 2854

 13024972 CTGGCTCTGCTGCCCAGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACT 13025031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 CTGGCTCTGCTGCCCAGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACT 2914

 13025032 AACAGAAGCAGTAGCTACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACAT 13025091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 AACAGAAGCAGTAGCTACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACAT 2974

 13025092 TACATGGCCCCATGTCCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCC 13025151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 TACATGGCCCCATGTCCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCC 3034

 13025152 AATTTGTCCACCTGCACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGT 13025211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 AATTTGTCCACCTGCACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGT 3094

 13025212 GGGTAGATTAAATCATTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATC 13025271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 GGGTAGATTAAATCATTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATC 3154

 13025272 TGTTTTAATTAGTAAGATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGT 13025331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 TGTTTTAATTAGTAAGATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGT 3214

 13025332 GTGACTTAAGAAAAAAAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAA 13025391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 GTGACTTAAGAAAAAAAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAA 3274

 13025392 GTAGTATAAAATATTTTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCA 13025451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 GTAGTATAAAATATTTTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCA 3334

 13025452 CATTGCATAAGATGTTATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTC 13025511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 CATTGCATAAGATGTTATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTC 3394

 13025512 ATTGTTAATAGATTGATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACT 13025571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 ATTGTTAATAGATTGATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACT 3454

 13025572 GATGCAACATTGAGTGAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGT 13025631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 GATGCAACATTGAGTGAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGT 3514

 13025632 AGTCATGTTACAAATTTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAA 13025691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 AGTCATGTTACAAATTTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAA 3574

 13025692 AAAAGCGCTTTTATTTTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGA 13025751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 AAAAGCGCTTTTATTTTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGA 3634

 13025752 AGAAGTGTACAACATGAGACATTTTCAACAGATTTATAGTAAATTTGATAAGATATTTTT 13025811
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 AGGAGTGTACAACATGAGACATTTTCAACAGATTTATAGTAAATTTGATAAGATATTTTT 3694

 13025812 TCTAACAAAAAGTCATTGAGTTTAGCCACTTGAAATAATATTTTAAAAGAACAGACAAAA 13025871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 TCTAACAAAAAGTCATTGAGTTTAGCCACTTGAAATAATATTTTAAAAGAACAGACAAAA 3754

 13025872 CGAACTGATGAATTGGTTAGAATTGGAATTAAAAGACTAACAAAAAGTTTTTAATGATTT 13025931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 CGAACTGATGAATTGGTTAGAATTGGAATTAAAAGACTAACAAAAAGTTTTTAATGATTT 3814

 13025932 TTCAAAAGATCTAAGCTTGTAAATAAGCTAGGTTTTTTAAAAATAAGAAACCATTTTTAC 13025991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 TTCAAAAGATCTAAGCTTGTAAATAAGCTAGGTTTTTTAAAAATAAGAAACCATTTTTAC 3874

 13025992 ATGGAGAAATGGCAAAAATGATTAATAATTTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATA 13026051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 ATGGAGAAATGGCAAAAATGATTAATAATTTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATA 3934

 13026052 TGGCTACCAATTAAAAATTATATATGTGACTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCA 13026111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 TGGCTACCAATTAAAAATTATATATGTGACTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCA 3994

 13026112 AAGAGTATATGGAGACTTGAGGTAAAGTCTCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAG 13026171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 AAGAGTATATGGAGACTTGAGGTAAAGTCTCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAG 4054

 13026172 CTTCCACTTCAGCTTTCCAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTA 13026231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 CTTCCACTTCAGCTTTCCAGATCTTTCCATTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTA 4114

 13026232 GTTTTTACTACATAATTCATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTG 13026291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 GTTTTTACTACATAATTCATAAAAATTTGATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTG 4174

 13026292 TGCCTGTATGCCTTAGTAAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACA 13026351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 TGCCTGTATGCCTTAGTAAATTTCCGTGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACA 4234

 13026352 ATAAAGAGGAAAAAACAATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCC 13026411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 ATAAAGAGGAAAAAACAATGAGGAAAAAACAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCC 4294

 13026412 TGTACGAATTAGTATATATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAG 13026471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 TGTACGAATTAGTATATATCCATGTATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAG 4354

 13026472 AGAGGAAAAAACAATAACATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGC 13026531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 AGAGGAAAAAACAATAACATTTTAATATTAGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGC 4414

 13026532 ATATCAATAGCTTTTCTTTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAG 13026591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 ATATCAATAGCTTTTCTTTTACAACACAAAAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAG 4474

 13026592 TGAACACGTGAAAAAGACTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATT 13026651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 TGAACACGTGAAAAAGACTATTGGAAACAAAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATT 4534

 13026652 ATGTAATTAAAAATACAGAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTG 13026711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 ATGTAATTAAAAATACAGAAAAGTTTTGCCAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTG 4594

 13026712 GTAGATATTTGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTG 13026771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 GTAGATATTTGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTG 4654

 13026772 GTTCTTGATAACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGG 13026831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 GTTCTTGATAACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGG 4714

 13026832 TATAATATTAGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCC 13026891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TATAATATTAGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCC 4774

 13026892 TGTTGAATAACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTA 13026951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 TGTTGAATAACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTA 4834

 13026952 ACCATGTTGTATTGTTTTTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCT 13027011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 ACCATGTTGTATTGTTTTTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCT 4894

 13027012 TGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACA 13027071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 TGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACA 4954

 13027072 CAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCA 13027131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 CAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCA 5014

 13027132 ATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAA 13027191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 ATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAA 5074

 13027192 ATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACA 13027251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 ATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACA 5134

 13027252 TTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAAC 13027311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 TTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAAC 5194

 13027312 TTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTA 13027371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 TTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTA 5254

 13027372 AACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAG 13027431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 AACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAG 5314

 13027432 AAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATC 13027491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 AAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATC 5374

 13027492 TGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTA 13027551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 TGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTA 5434

 13027552 AAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTG 13027611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5435 AAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTG 5494

 13027612 TAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACT 13027671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 TAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACT 5554

 13027672 TGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAG 13027731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 TGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAG 5614

 13027732 GTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTC 13027791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 GTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTC 5674

 13027792 CTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTG 13027851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5675 CTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTG 5734

 13027852 TCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCT 13027911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 TCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCT 5794

 13027912 CTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGC 13027971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 CTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGC 5854

 13027972 CATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCG 13028031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 CATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCG 5914

 13028032 GATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAA 13028091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 GATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAA 5974

 13028092 GCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACA 13028151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 GCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACA 6034

 13028152 TACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACC 13028211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 TACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACC 6094

 13028212 CTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTA 13028271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 CTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTA 6154

 13028272 CCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGA 13028331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 CCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGA 6214

 13028332 CAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAA 13028391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 CAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAA 6274

 13028392 TTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAA 13028451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 TTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAA 6334

 13028452 AGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGT 13028511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 AGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGT 6394

 13028512 GACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCA 13028571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6395 GACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCA 6454

 13028572 GGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCG 13028631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 GGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCG 6514

 13028632 AGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCC 13028691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 AGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCC 6574

 13028692 GTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAG 13028751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 GTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAG 6634

 13028752 CTACTC 13028757
          ||||||
     6635 CTACTC 6640

Alignment time is 7.61086 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3814] =>      3814 nucs 'mol-32-2f07-012482_3814'

Score:        3803
Aligned:      3814        nucs
Identic:      3813 (100%) nucs =>      3607 (100%)       206 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018494,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028756]
 second seq =>  [       1,    3608] EXCISED REGION [    3609,    3814]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3608,3608] to [3609,3609]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018494 AAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAATATTGCATTTCTTCTGAACTCTTTTTAAATTTAAAA 13018553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAATATTGCATTTCTTCTGAACTCTTTTTAAATTTAAAA 60

 13018554 ATAAAATTGAATTCATAATGAACCAGGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGA 13018613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAAATTGAATTCATAATGAACCAGGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGA 120

 13018614 ACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAA 13018673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAA 180

 13018674 CACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGC 13018733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGC 240

 13018734 ATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAA 13018793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAA 300

 13018794 GTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAA 13018853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAA 360

 13018854 ATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAA 13018913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAA 420

 13018914 ATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACC 13018973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACC 480

 13018974 ATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAG 13019033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAG 540

 13019034 GGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTC 13019093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTC 600

 13019094 TTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTAT 13019153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTAT 660

 13019154 AAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGA 13019213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGA 720

 13019214 TTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTC 13019273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTC 780

 13019274 ATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTT 13019333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTT 840

 13019334 TAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTG 13019393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTG 900

 13019394 TACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAA 13019453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAA 960

 13019454 ATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCAT 13019513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCAT 1020

 13019514 ATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCAT 13019573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCAT 1080

 13019574 CAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTT 13019633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTT 1140

 13019634 TTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAAT 13019693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAAT 1200

 13019694 CATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGC 13019753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGC 1260

 13019754 ATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAG 13019813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAG 1320

 13019814 CATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGT 13019873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGT 1380

 13019874 CAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTG 13019933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTG 1440

 13019934 AGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTT 13019993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTT 1500

 13019994 AGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTAC 13020053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTAC 1560

 13020054 CTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTT 13020113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTT 1620

 13020114 TTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAA 13020173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAA 1680

 13020174 TAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAA 13020233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAA 1740

 13020234 GAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCT 13020293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCT 1800

 13020294 TACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTC 13020353
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTC 1860

 13020354 CTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTT 13020413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTT 1920

 13020414 AAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATT 13020473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATT 1980

 13020474 TAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTAT 13020533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTAT 2040

 13020534 GATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTT 13020593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTT 2100

 13020594 TAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGT 13020653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGT 2160

 13020654 GCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGC 13020713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGC 2220

 13020714 TTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGG 13020773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGG 2280

 13020774 ACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCC 13020833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCC 2340

 13020834 ACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTT 13020893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTT 2400

 13020894 ATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTC 13020953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTC 2460

 13020954 CTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATT 13021013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATT 2520

 13021014 TCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAA 13021073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAA 2580

 13021074 TTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAG 13021133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAG 2640

 13021134 CACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTT 13021193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTT 2700

 13021194 CACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGA 13021253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGA 2760

 13021254 AAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAA 13021313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAA 2820

 13021314 GCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTG 13021373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTG 2880

 13021374 TTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTA 13021433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTA 2940

 13021434 CTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTC 13021493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTC 3000

 13021494 GAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCA 13021553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCA 3060

 13021554 AATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAAT 13021613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAAT 3120

 13021614 AACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGA 13021673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGA 3180

 13021674 GCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCA 13021733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCA 3240

 13021734 GGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACT 13021793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACT 3300

 13021794 TGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTT 13021853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTT 3360

 13021854 ATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTT 13021913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTT 3420

 13021914 AATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGC 13021973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGC 3480

 13021974 AAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCT 13022033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCT 3540

 13022034 GGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATA 13022093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATA 3600

 13022094 AATTTACC 13022101
          ||||||||
     3601 AATTTACC 3608

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3668

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 3728

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 3788

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACT 13028756
          ||||||||||||||||||||||||||
     3789 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACT 3814

Alignment time is 4.43597 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4141] =>      4141 nucs 'mol-32-2f12-003171_4141'

Score:        4087
Aligned:      4142        nucs
Identic:      4137 (100%) nucs =>      3879 (100%)       258 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018219,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028809]
 second seq =>  [       1,    3882] EXCISED REGION [    3883,    4141]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3882,3882] to [3883,3883]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018219 ATTTAAAAAGCGTCCTGAAAATGTGTCAGAAATCTCTAAATTAATTCATTAAATTAAAAG 13018278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
        1 ATTTAAAAAGCGTCCTGAAAATGTGTCAGAAATCTCCAAATTAATTCATTAAATTAAAAG 60

 13018279 TGCTCCCAAACAACAACAAAAAACTAGCATTAAAAGAAATAATTTGACAATTTGGTTTCA 13018338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCTCCCAAACAACAACAAAAAACTAGCATTAAAAGAAATAATTTGACAATTTGGTTTCA 120

 13018339 GAGTTCATTTGGAGACGTTATAATGCTTAAAATAATTTTCCATATCTCTTTCAAGGATAG 13018398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGTTCATTTGGAGACGTTATAATGCTTAAAATAATTTTCCATATCTCTTTCAAGGATAG 180

 13018399 AAAAATAGAACAGAATAGTATAAAATAGCTATAATTTCGTATGAGAATTCAGCATAAAAT 13018458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAATAGAACAGAATAGTATAAAATAGCTATAATTTCGTATGAGAATTCAGCATAAAAT 240

 13018459 TTGATTTCAAGTATTTATGTATGTAGTATTGAGGCAAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAAT 13018518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGATTTCAAGTATTTATGTATGTAGTATTGAGGCAAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAAT 300

 13018519 ATTGCATTTCTTCTGAACTCTTTTTAAATTTAAAAATAAAATTGAATTCATAATGAACCA 13018578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGCATTTCTTCTGAACTCTTTTTAAATTTAAAAATAAAATTGAATTCATAATGAACCA 360

 13018579 GGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGA 13018638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGA 420

 13018639 GATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCAT 13018698
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATCTGGCACGCAAACGTCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCAT 480

 13018699 ATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGC 13018758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGC 540

 13018759 AATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAAT 13018818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAAT 600

 13018819 TGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTG 13018878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTG 660

 13018879 TAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGA 13018938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGA 720

 13018939 TAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCA 13018998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCA 780

 13018999 TGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAG 13019058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAG 840

 13019059 GAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGA 13019118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGA 900

 13019119 ACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAA 13019178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAA 960

 13019179 ATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAAT 13019238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAAT 1020

 13019239 TAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATT 13019298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATT 1080

 13019299 TAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCT 13019358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCT 1140

 13019359 TCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCT 13019418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCT 1200

 13019419 AAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAA 13019478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAA 1260

 13019479 TTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAAT 13019538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAAT 1320

 13019539 TACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTT 13019598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTT 1380

 13019599 ATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACA 13019658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACA 1440

 13019659 ATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAG 13019718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAG 1500

 13019719 TAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTAT 13019778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTAT 1560

 13019779 TTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTT 13019838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTT 1620

 13019839 GTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGG 13019898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGG 1680

 13019899 TAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGA 13019958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGA 1740

 13019959 AAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGAT 13020018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGAT 1800

 13020019 ATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACT 13020078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACT 1860

 13020079 GTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTC 13020138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     1861 GTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTT-ACTCTGTTCTGTGTGTTC 1919

 13020139 CTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAAT 13020198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAAT 1979

 13020199 TGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTG 13020258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTG 2039

 13020259 TTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAAT 13020318
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2040 TTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAAT 2099

 13020319 ATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACA 13020378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACA 2159

 13020379 ATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTA 13020438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTA 2219

 13020439 ATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAG 13020498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAG 2279

 13020499 CGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACA 13020558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACA 2339

 13020559 ATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAG 13020618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAG 2399

 13020619 AAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTG 13020678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTG 2459

 13020679 ACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATC 13020738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATC 2519

 13020739 CTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACAC 13020798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACAC 2579

 13020799 TTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTT 13020858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTT 2639

 13020859 CCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAAT 13020918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAAT 2699

 13020919 CTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTT 13020978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTT 2759

 13020979 TCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTC 13021038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTC 2819

 13021039 TTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAAT 13021098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAAT 2879

 13021099 TTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATT 13021158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATT 2939

 13021159 CTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTG 13021218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTG 2999

 13021219 TTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAA 13021278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAA 3059

 13021279 GGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTT 13021338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTT 3119

 13021339 ATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACA 13021398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACA 3179

 13021399 TTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGT 13021458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGT 3239

 13021459 ATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTT 13021518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTT 3299

 13021519 GGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTT 13021578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTT 3359

 13021579 ACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACT 13021638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACT 3419

 13021639 GAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGA 13021698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGA 3479

 13021699 AGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTA 13021758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTA 3539

 13021759 TGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGC 13021818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGC 3599

 13021819 CTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGC 13021878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGC 3659

 13021879 TTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGC 13021938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGC 3719

 13021939 TCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCT 13021998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCT 3779

 13021999 GACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAAT 13022058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAAT 3839

 13022059 ACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 ACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 3882

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3942

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 4002

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 4062

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 13028790
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4063 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCG 4122

 13028791 GGAGGCGGAGCTTGCAGTG 13028809
          |||||||||||||||||||
     4123 GGAGGCGGAGCTTGCAGTG 4141

Alignment time is 4.77733 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3758] =>      3758 nucs 'mol-32-2f28-029031_3758'

Score:        3747
Aligned:      3758        nucs
Identic:      3757 (100%) nucs =>      3522 (100%)       235 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018579,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028785]
 second seq =>  [       1,    3523] EXCISED REGION [    3524,    3758]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3523,3523] to [3524,3524]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018579 GGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGA 13018638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGA 60

 13018639 GATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCAT 13018698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCAT 120

 13018699 ATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGC 13018758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGC 180

 13018759 AATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAAT 13018818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAAT 240

 13018819 TGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTG 13018878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTG 300

 13018879 TAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGA 13018938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGA 360

 13018939 TAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCA 13018998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCA 420

 13018999 TGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAG 13019058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAG 480

 13019059 GAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGA 13019118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGA 540

 13019119 ACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAA 13019178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAA 600

 13019179 ATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAAT 13019238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAAT 660

 13019239 TAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATT 13019298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATT 720

 13019299 TAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCT 13019358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCT 780

 13019359 TCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCT 13019418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCT 840

 13019419 AAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAA 13019478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAA 900

 13019479 TTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAAT 13019538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAAT 960

 13019539 TACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTT 13019598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTT 1020

 13019599 ATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACA 13019658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACA 1080

 13019659 ATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAG 13019718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAG 1140

 13019719 TAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTAT 13019778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTAT 1200

 13019779 TTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTT 13019838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTT 1260

 13019839 GTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGG 13019898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGG 1320

 13019899 TAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGA 13019958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGA 1380

 13019959 AAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGAT 13020018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGAT 1440

 13020019 ATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACT 13020078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACT 1500

 13020079 GTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTC 13020138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTC 1560

 13020139 CTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAAT 13020198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAAT 1620

 13020199 TGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTG 13020258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTG 1680

 13020259 TTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAAT 13020318
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1681 TTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAAT 1740

 13020319 ATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACA 13020378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACA 1800

 13020379 ATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTA 13020438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTA 1860

 13020439 ATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAG 13020498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAG 1920

 13020499 CGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACA 13020558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACA 1980

 13020559 ATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAG 13020618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAG 2040

 13020619 AAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTG 13020678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTG 2100

 13020679 ACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATC 13020738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATC 2160

 13020739 CTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACAC 13020798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACAC 2220

 13020799 TTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTT 13020858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTT 2280

 13020859 CCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAAT 13020918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAAT 2340

 13020919 CTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTT 13020978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTT 2400

 13020979 TCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTC 13021038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTC 2460

 13021039 TTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAAT 13021098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAAT 2520

 13021099 TTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATT 13021158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATT 2580

 13021159 CTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTG 13021218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTG 2640

 13021219 TTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAA 13021278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAA 2700

 13021279 GGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTT 13021338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTT 2760

 13021339 ATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACA 13021398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACA 2820

 13021399 TTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGT 13021458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGT 2880

 13021459 ATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTT 13021518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTT 2940

 13021519 GGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTT 13021578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTT 3000

 13021579 ACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACT 13021638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACT 3060

 13021639 GAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGA 13021698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGA 3120

 13021699 AGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTA 13021758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTA 3180

 13021759 TGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGC 13021818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGC 3240

 13021819 CTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGC 13021878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGC 3300

 13021879 TTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGC 13021938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGC 3360

 13021939 TCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCT 13021998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCT 3420

 13021999 GACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAAT 13022058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAAT 3480

 13022059 ACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 3523

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3583

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 3643

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 3703

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGA 13028785
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGA 3758

Alignment time is 4.3668 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6689] =>      6689 nucs 'mol-32-2fc2-033649_6689'

Score:        6634
Aligned:      6689        nucs
Identic:      6684 (100%) nucs =>      1773 (100%)      4911 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13020329,13022101] EXCISED REGION [13028551,13033466]
 second seq =>  [       1,    1773] EXCISED REGION [    1774,    6689]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [1773,1773] to [1774,1774]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13020329 AAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTT 13020388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTT 60

 13020389 AGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAG 13020448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAG 120

 13020449 TAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTG 13020508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTG 180

 13020509 GTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTA 13020568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTA 240

 13020569 GAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATA 13020628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATA 300

 13020629 TTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGAT 13020688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGAT 360

 13020689 CTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTC 13020748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTC 420

 13020749 TCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCT 13020808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCT 480

 13020809 TTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGC 13020868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGC 540

 13020869 ACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTG 13020928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTG 600

 13020929 AACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAA 13020988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAA 660

 13020989 CTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACA 13021048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACA 720

 13021049 CAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAG 13021108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAG 780

 13021109 TACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTG 13021168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTG 840

 13021169 TGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCAT 13021228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCAT 900

 13021229 TATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAA 13021288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAA 960

 13021289 CTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAA 13021348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAA 1020

 13021349 CCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCC 13021408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCC 1080

 13021409 TATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGT 13021468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGT 1140

 13021469 GATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCT 13021528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCT 1200

 13021529 CCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATC 13021588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATC 1260

 13021589 TCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGT 13021648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGT 1320

 13021649 AATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGAC 13021708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGAC 1380

 13021709 AAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAAC 13021768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAAC 1440

 13021769 ACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGT 13021828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGT 1500

 13021829 ATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGA 13021888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGA 1560

 13021889 TTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAG 13021948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAG 1620

 13021949 TTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTT 13022008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTT 1680

 13022009 GATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAA 13022068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAA 1740

 13022069 GGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 1773

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 1833

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 1893

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 1953

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 13028790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 2013

 13028791 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 13028850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 2073

 13028851 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 13028910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 2133

 13028911 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 13028970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 2193

 13028971 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 13029030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 2253

 13029031 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 13029090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 2313

 13029091 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 13029150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 2373

 13029151 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 13029210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 2433

 13029211 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 13029270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 2493

 13029271 GAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGA 13029330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 GAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGA 2553

 13029331 ATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCA 13029390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 ATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCA 2613

 13029391 AACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCT 13029450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 AACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCT 2673

 13029451 AAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAAC 13029510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 AAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAAC 2733

 13029511 CCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAG 13029570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 CCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAG 2793

 13029571 GATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTA 13029630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 GATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTA 2853

 13029631 AAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGA 13029690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 AAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGA 2913

 13029691 ATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAA 13029750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 ATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAA 2973

 13029751 AAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGAT 13029810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 AAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGAT 3033

 13029811 AGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACT 13029870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 AGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACT 3093

 13029871 TAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTA 13029930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 TAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTA 3153

 13029931 CCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCC 13029990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 CCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCC 3213

 13029991 TAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGA 13030050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 TAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGA 3273

 13030051 CAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCA 13030110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 CAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCA 3333

 13030111 AATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATG 13030170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 AATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATG 3393

 13030171 AAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGC 13030230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 AAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGC 3453

 13030231 CGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGA 13030290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 CGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGA 3513

 13030291 AACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTT 13030350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 AACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTT 3573

 13030351 CAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATG 13030410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 CAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATG 3633

 13030411 TATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATA 13030470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 TATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATA 3693

 13030471 GCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGG 13030530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 GCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGG 3753

 13030531 ATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTG 13030590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 ATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTG 3813

 13030591 ATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCG 13030650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 ATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCG 3873

 13030651 TTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCT 13030710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 TTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCT 3933

 13030711 AGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGA 13030770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 AGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGA 3993

 13030771 GAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGT 13030830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 GAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGT 4053

 13030831 TGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATA 13030890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 TGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATA 4113

 13030891 CTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCAC 13030950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 CTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCAC 4173

 13030951 ACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGT 13031010
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
     4174 ACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGCTGGT 4233

 13031011 CTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAAAGTGCTGGGATTACAGG 13031070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 CTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAAAGTGCTGGGATTACAGG 4293

 13031071 CGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGATTTTGTGGTAATGGTTAC 13031130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 CGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGATTTTGTGGTAATGGTTAC 4353

 13031131 ACAATCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTCAAATGAGTGAATAGTAT 13031190
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 ACAGTCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTCAAATGAGTGAATAGTAT 4413

 13031191 GTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGTGATCTGTGAAGGCAATG 13031250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 GTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGTGATCTGTGAAGGCAATG 4473

 13031251 GTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTTAATTATGTCCCTTGTAT 13031310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 GTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTTAATTATGTCCCTTGTAT 4533

 13031311 CCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAATTGATCACTACTTTTACT 13031370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 CCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAATTGATCACTACTTTTACT 4593

 13031371 ACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAAAAGGACATTTTCAATAT 13031430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 ACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAAAAGGACATTTTCAATAT 4653

 13031431 ATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCTTTATGTACATGATAGTC 13031490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 ATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCTTTATGTACATGATAGTC 4713

 13031491 ATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTGGCTAGCTACAAACCAGA 13031550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 ATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTGGCTAGCTACAAACCAGA 4773

 13031551 TGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATATGTTTCCTCCCTTTTCA 13031610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 TGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATATGTTTCCTCCCTTTTCA 4833

 13031611 GAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGCTTTTAAATGGCCTATCT 13031670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 GAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGCTTTTAAATGGCCTATCT 4893

 13031671 TTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTATGAAATGCCTGCTACTGT 13031730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 TTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTATGAAATGCCTGCTACTGT 4953

 13031731 TCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACAAATTAGTTTTGCAGACA 13031790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 TCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACAAATTAGTTTTGCAGACA 5013

 13031791 TTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTCCTGGGATTAACACTCAG 13031850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 TTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTCCTGGGATTAACACTCAG 5073

 13031851 TTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGTTTCGCTGTAGGAAATGG 13031910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 TTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGTTTCGCTGTAGGAAATGG 5133

 13031911 TAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTTGTTGAGCTCTGCATATT 13031970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 TAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTTGTTGAGCTCTGCATATT 5193

 13031971 TTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGCCACCCCTAGGCCTACAT 13032030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 TTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGCCACCCCTAGGCCTACAT 5253

 13032031 TTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTTTTTACCAGTTTTTTTCA 13032090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 TTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTTTTTACCAGTTTTTTTCA 5313

 13032091 TTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGCTATGTGGTGGGCTCTAC 13032150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 TTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGCTATGTGGTGGGCTCTAC 5373

 13032151 TGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTTCTAGGAGGGTGATGGAG 13032210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 TGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTTCTAGGAGGGTGATGGAG 5433

 13032211 AGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAATTTTACAAAGTAATAATA 13032270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 AGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAATTTTACAAAGTAATAATA 5493

 13032271 AACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCTATAAATCATAAATGTTT 13032330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 AACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCTATAAATCATAAATGTTT 5553

 13032331 CAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAGTAGGTATGAAATTTTGT 13032390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 CAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAGTAGGTATGAAATTTTGT 5613

 13032391 GAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATTGGAAGAAAAGAGACTGA 13032450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 GAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATTGGAAGAAAAGAGACTGA 5673

 13032451 AAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCTCTGAAAATGTACGTGCA 13032510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 AAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCTCTGAAAATGTACGTGCA 5733

 13032511 TTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGTAGCAACTCCTTTATAAT 13032570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 TTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGTAGCAACTCCTTTATAAT 5793

 13032571 ATTAATATTCTTTCCTTGTTCCTCTTCCCAACATGTATGTACCCACAGAAAGCCTCATAT 13032630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 ATTAATATTCTTTCCTTGTTCCTCTTCCCAACATGTATGTACCCACAGAAAGCCTCATAT 5853

 13032631 AAGACTCAAAATTGCTTAGGTTTTAAAAAAAATTTTCAGATTAAAAAAAATCCAACCTTG 13032690
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5854 AAGACTCAAAATTGCTTAGGTTTTAAAAAAAATTTTCAGATTAAAGAAAATCCAACCTTG 5913

 13032691 CTTTTAGTTAATAGCTGCATAGATGTTAGATTTTCAAAATGACAAGTGGAAAATTTTCCC 13032750
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 CTTTTAGTTAATAGCCGCATAGATGTTAGATTTTCAAAATGACAAGTGGAAAATTTTCCC 5973

 13032751 ATTCACTCACATTAGGCCAACCATATTTACTGTATCAACAGTATGAATTTCCAGTGTGTC 13032810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 ATTCACTCACATTAGGCCAACCATATTTACTGTATCAACAGTATGAATTTCCAGTGTGTC 6033

 13032811 AACAGGTTATTTTAAAGAAGGTCTTTCATGAGATTTCTCTCTCTGCAGACTATGAATCAT 13032870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 AACAGGTTATTTTAAAGAAGGTCTTTCATGAGATTTCTCTCTCTGCAGACTATGAATCAT 6093

 13032871 GCAAATTAACCCATCACTAGAGATATCTGAGTGTGTGTGTGTACATATATTTTCTGTGTA 13032930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 GCAAATTAACCCATCACTAGAGATATCTGAGTGTGTGTGTGTACATATATTTTCTGTGTA 6153

 13032931 ATAAATTGAGGCTATAAAACTGTTCTGTCCCCAAAAAGGAAACTACAGCATTCTGTGACT 13032990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 ATAAATTGAGGCTATAAAACTGTTCTGTCCCCAAAAAGGAAACTACAGCATTCTGTGACT 6213

 13032991 GTATGTGTTGGAGTATGTATTGCTTGGAGGAAAAAATAAGCAGATATCAGCAACCAGAAA 13033050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 GTATGTGTTGGAGTATGTATTGCTTGGAGGAAAAAATAAGCAGATATCAGCAACCAGAAA 6273

 13033051 TAGAAAGCTATATGCTTACATCACGGATAAAATAACCCATAAACCATTCCTGATTCAGCA 13033110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 TAGAAAGCTATATGCTTACATCACGGATAAAATAACCCATAAACCATTCCTGATTCAGCA 6333

 13033111 CCCAATATCTTGCTAGCTACACACTGTTAAAATGTCTCCATATACCTAAAGTTGTCTATC 13033170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6334 CCCAATATCTTGCTAGCTACACACTGTTAAAATGTCTCCATATACCTAAAGTTGTCTATC 6393

 13033171 CTGGAAATGTCAAACTTCTGTCTACCATAGATAAAATTATCAGGCAACATTTATTATTTT 13033230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 CTGGAAATGTCAAACTTCTGTCTACCATAGATAAAATTATCAGGCAACATTTATTATTTT 6453

 13033231 TTCAGATTTTTTATGACATTTATTACAATCCAGAATTATTCATTTGTTGTCTCTCATTGC 13033290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 TTCAGATTTTTTATGACATTTATTACAATCCAGAATTATTCATTTGTTGTCTCTCATTGC 6513

 13033291 CTTCCCAAACCAGAATGTAAATTTTGCAGGAAAAGGGACCATATCTGTTTTGCTCATCCC 13033350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6514 CTTCCCAAACCAGAATGTAAATTTTGCAGGAAAAGGGACCATATCTGTTTTGCTCATCCC 6573

 13033351 TATGTCCCTAACAACTTGTACCTGTCATACCACAAGTGCTTAATAAATATGCAAATAAAT 13033410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 TATGTCCCTAACAACTTGTACCTGTCATACCACAAGTGCTTAATAAATATGCAAATAAAT 6633

 13033411 ATGCGCTGTAAAAATATCGTATGCATTTGGAGAGAGAGATTGTAGACTGATTAGTC 13033466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6634 ATGCGCTGTAAAAATATCGTATGCATTTGGAGAGAGAGATTGTAGACTGATTAGTC 6689

Alignment time is 7.74519 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4143] =>      4143 nucs 'mol-32-2ff9-212671_4143'

Score:        4142
Aligned:      4142        nucs
Identic:      4142 (100%) nucs =>       585 (100%)      3557 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019723,13020307] EXCISED REGION [13020309,13023865]
 second seq =>  [       1,     585] EXCISED REGION [     587,    4143]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [586,586]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019723 AAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCT 13019782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCT 60

 13019783 AGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTAT 13019842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTAT 120

 13019843 CAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGA 13019902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGA 180

 13019903 TGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGT 13019962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGT 240

 13019963 GCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCT 13020022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCT 300

 13020023 ACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTAT 13020082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTAT 360

 13020083 TCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTT 13020142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTT 420

 13020143 TTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTG 13020202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTG 480

 13020203 TTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCT 13020262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCT 540

 13020263 CTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 13020307
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 585

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 646

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 706

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 766

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 826

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 886

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 946

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1006

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1066

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1126

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1186

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1246

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1306

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1366

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1426

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1486

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1546

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1606

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1666

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1726

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1786

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1846

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 1906

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 1966

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2026

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2086

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2146

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2206

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2266

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2326

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2386

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2446

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2506

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2566

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2626

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2686

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2746

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2806

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 2866

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 2926

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 2986

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 3046

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 3106

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3166

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3226

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3286

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3346

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3406

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3466

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3526

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3586

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3646

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3706

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3766

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3826

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 3886

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 3946

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 4006

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 4066

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 4126

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTA 13023865
          |||||||||||||||||
     4127 ATTGTATTTTTAGCGTA 4143

Alignment time is 4.76334 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2701] =>      2701 nucs 'mol-32-300f-083126_2701'

Score:        2680
Aligned:      2702        nucs
Identic:      2700 (100%) nucs =>      2474 (100%)       226 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019626,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028776]
 second seq =>  [       1,    2475] EXCISED REGION [    2476,    2701]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [2475,2475] to [2476,2476]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019626 ATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGT 13019685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGT 60

 13019686 TCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGT 13019745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGT 120

 13019746 TATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATAT 13019805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATAT 180

 13019806 TTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAG 13019865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAG 240

 13019866 AAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTG 13019925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTG 300

 13019926 ACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGA 13019985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGA 360

 13019986 TCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATG 13020045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATG 420

 13020046 GAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTG 13020105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTG 480

 13020106 GATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTA 13020165
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTTTTTTTTTTT-ACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTA 539

 13020166 AAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTA 13020225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTA 599

 13020226 ACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGA 13020285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGA 659

 13020286 ATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGA 13020345
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGA 719

 13020346 AGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATT 13020405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATT 779

 13020406 TAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAAT 13020465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAAT 839

 13020466 TAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTC 13020525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTC 899

 13020526 AAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGT 13020585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGT 959

 13020586 AGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTT 13020645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTT 1019

 13020646 GGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCA 13020705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCA 1079

 13020706 TCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCA 13020765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCA 1139

 13020766 TTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAAT 13020825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAAT 1199

 13020826 CAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTC 13020885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTC 1259

 13020886 AGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGA 13020945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGA 1319

 13020946 ATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAG 13021005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAG 1379

 13021006 GTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATT 13021065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATT 1439

 13021066 AATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACA 13021125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACA 1499

 13021126 TTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGT 13021185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGT 1559

 13021186 TTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAA 13021245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAA 1619

 13021246 CTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAG 13021305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAG 1679

 13021306 GCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTC 13021365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTC 1739

 13021366 ACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATG 13021425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATG 1799

 13021426 AACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACT 13021485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACT 1859

 13021486 GAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGA 13021545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGA 1919

 13021546 CTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAAC 13021605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAAC 1979

 13021606 ATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGT 13021665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGT 2039

 13021666 TTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAG 13021725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAG 2099

 13021726 ATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAG 13021785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAG 2159

 13021786 AAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGT 13021845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGT 2219

 13021846 CCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGT 13021905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGT 2279

 13021906 TTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCA 13021965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCA 2339

 13021966 TATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTT 13022025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTT 2399

 13022026 TCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGT 13022085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGT 2459

 13022086 ATCAGATAAATTTACC 13022101
          ||||||||||||||||
     2460 ATCAGATAAATTTACC 2475

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 2535

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 2595

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 2655

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 13028776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 2701

Alignment time is 3.17245 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2612] =>      2612 nucs 'mol-32-300f-112081_2612'

Score:        2601
Aligned:      2612        nucs
Identic:      2611 (100%) nucs =>      2481 (100%)       130 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019620,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028680]
 second seq =>  [       1,    2482] EXCISED REGION [    2483,    2612]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [2482,2482] to [2483,2483]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019620 TAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTC 13019679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTC 60

 13019680 ACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGAT 13019739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGAT 120

 13019740 TTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAA 13019799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAA 180

 13019800 AGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAA 13019859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAA 240

 13019860 TGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCA 13019919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCA 300

 13019920 CATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTA 13019979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTA 360

 13019980 AATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTC 13020039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTC 420

 13020040 TCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTT 13020099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTT 480

 13020100 CATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCAC 13020159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCAC 540

 13020160 CTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAG 13020219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAG 600

 13020220 AACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCA 13020279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCA 660

 13020280 CCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTA 13020339
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTA 720

 13020340 TATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTA 13020399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTA 780

 13020400 GAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAG 13020459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAG 840

 13020460 ATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACAT 13020519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACAT 900

 13020520 TAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATT 13020579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATT 960

 13020580 TTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTC 13020639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTC 1020

 13020640 TCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGAT 13020699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGAT 1080

 13020700 ATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGC 13020759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGC 1140

 13020760 TGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGA 13020819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGA 1200

 13020820 TATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAG 13020879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAG 1260

 13020880 TTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTC 13020939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTC 1320

 13020940 CACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTT 13020999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTT 1380

 13021000 TGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATT 13021059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATT 1440

 13021060 AATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAG 13021119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAG 1500

 13021120 TTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTG 13021179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTG 1560

 13021180 CCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGA 13021239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGA 1620

 13021240 AAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGG 13021299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGG 1680

 13021300 AACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCT 13021359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCT 1740

 13021360 GCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGT 13021419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGT 1800

 13021420 GTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATC 13021479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATC 1860

 13021480 TCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTG 13021539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTG 1920

 13021540 TAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTAT 13021599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTAT 1980

 13021600 TAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTA 13021659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTA 2040

 13021660 TAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTT 13021719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTT 2100

 13021720 CAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAA 13021779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAA 2160

 13021780 GCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTG 13021839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTG 2220

 13021840 GATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAAT 13021899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAAT 2280

 13021900 TTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATG 13021959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATG 2340

 13021960 TTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGG 13022019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGG 2400

 13022020 AGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTT 13022079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTT 2460

 13022080 GAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          ||||||||||||||||||||||
     2461 GAAAGTATCAGATAAATTTACC 2482

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 2542

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 2602

 13028671 TGGCTAACAC 13028680
          ||||||||||
     2603 TGGCTAACAC 2612

Alignment time is 3.07001 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2186] =>      2186 nucs 'mol-32-300f-228552_2186'

Score:        2186
Aligned:      2186        nucs
Identic:      2186 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13021859,13024044]
 second seq =>  [       1,    2186]

 13021859 ATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGT 13021918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGT 60

 13021919 ATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGT 13021978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGT 120

 13021979 TAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTT 13022038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTT 180

 13022039 CCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTT 13022098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTT 240

 13022099 ACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTT 13022158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTT 300

 13022159 CTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAG 13022218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAG 360

 13022219 CTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACT 13022278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACT 420

 13022279 TTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTA 13022338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTA 480

 13022339 CTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTAC 13022398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTAC 540

 13022399 ACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAA 13022458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAA 600

 13022459 ATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCT 13022518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCT 660

 13022519 GGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCT 13022578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCT 720

 13022579 CATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATC 13022638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATC 780

 13022639 CACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTC 13022698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTC 840

 13022699 TCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTT 13022758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTT 900

 13022759 GAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATA 13022818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATA 960

 13022819 CTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACC 13022878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACC 1020

 13022879 ATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGT 13022938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGT 1080

 13022939 CTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGG 13022998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGG 1140

 13022999 TTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGA 13023058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGA 1200

 13023059 GATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCG 13023118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCG 1260

 13023119 TTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAG 13023178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAG 1320

 13023179 AAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAG 13023238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAG 1380

 13023239 CTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTC 13023298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTC 1440

 13023299 ATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCAT 13023358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCAT 1500

 13023359 GCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTT 13023418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTT 1560

 13023419 GTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAAT 13023478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAAT 1620

 13023479 CATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGT 13023538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGT 1680

 13023539 GCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTG 13023598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTG 1740

 13023599 TCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTT 13023658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTT 1800

 13023659 CCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACT 13023718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACT 1860

 13023719 GAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGT 13023778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGT 1920

 13023779 CATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGG 13023838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGG 1980

 13023839 AAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATT 13023898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATT 2040

 13023899 AATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAG 13023958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAG 2100

 13023959 CCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTT 13024018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTT 2160

 13024019 CCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGG 13024044
          ||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGG 2186

Alignment time is 2.17766 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2980] =>      2980 nucs 'mol-32-3030-149185_2980'

Score:        2969
Aligned:      2980        nucs
Identic:      2979 (100%) nucs =>      2766 (100%)       213 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019335,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028763]
 second seq =>  [       1,    2767] EXCISED REGION [    2768,    2980]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [2767,2767] to [2768,2768]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019335 AATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGT 13019394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGT 60

 13019395 ACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAA 13019454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAA 120

 13019455 TACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATA 13019514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATA 180

 13019515 TTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATC 13019574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATC 240

 13019575 AGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTT 13019634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTT 300

 13019635 TATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATC 13019694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATC 360

 13019695 ATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCA 13019754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCA 420

 13019755 TCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGC 13019814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGC 480

 13019815 ATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTC 13019874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTC 540

 13019875 AAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGA 13019934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGA 600

 13019935 GATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTA 13019994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTA 660

 13019995 GAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACC 13020054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACC 720

 13020055 TGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTT 13020114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTT 780

 13020115 TTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAAT 13020174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAAT 840

 13020175 AGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAG 13020234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAG 900

 13020235 AGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTT 13020294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTT 960

 13020295 ACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCC 13020354
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCC 1020

 13020355 TAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTA 13020414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTA 1080

 13020415 AGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTT 13020474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTT 1140

 13020475 AGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATG 13020534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATG 1200

 13020535 ATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTT 13020594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTT 1260

 13020595 AAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTG 13020654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTG 1320

 13020655 CATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCT 13020714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCT 1380

 13020715 TTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGA 13020774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGA 1440

 13020775 CCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCA 13020834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCA 1500

 13020835 CCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTA 13020894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTA 1560

 13020895 TTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCC 13020954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCC 1620

 13020955 TTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTT 13021014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTT 1680

 13021015 CATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAAT 13021074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAAT 1740

 13021075 TCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGC 13021134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGC 1800

 13021135 ACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTC 13021194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTC 1860

 13021195 ACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAA 13021254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAA 1920

 13021255 AATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAG 13021314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAG 1980

 13021315 CCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGT 13021374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGT 2040

 13021375 TGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTAC 13021434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTAC 2100

 13021435 TCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCG 13021494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCG 2160

 13021495 AATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAA 13021554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAA 2220

 13021555 ATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATA 13021614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATA 2280

 13021615 ACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAG 13021674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAG 2340

 13021675 CAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAG 13021734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAG 2400

 13021735 GAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTT 13021794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTT 2460

 13021795 GATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTA 13021854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTA 2520

 13021855 TATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTA 13021914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTA 2580

 13021915 ATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCA 13021974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCA 2640

 13021975 AGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTG 13022034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTG 2700

 13022035 GTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAA 13022094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAA 2760

 13022095 ATTTACC 13022101
          |||||||
     2761 ATTTACC 2767

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 2827

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 2887

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 2947

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGG 13028763
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGG 2980

Alignment time is 3.44712 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4540] =>      4540 nucs 'mol-32-3030-210353_4540'

Score:        4512
Aligned:      4534        nucs
Identic:      4532 (100%) nucs =>       702 (100%)      3830 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019606,13020307] EXCISED REGION [13020309,13024140]
 second seq =>  [       1,     702] EXCISED REGION [     704,    4535]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [703,703]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019606 TAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGA 13019665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGA 60

 13019666 ATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAA 13019725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAA 120

 13019726 TGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGC 13019785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGC 180

 13019786 TAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAA 13019845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAA 240

 13019846 GAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGT 13019905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGT 300

 13019906 TATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCA 13019965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCA 360

 13019966 ATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACT 13020025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACT 420

 13020026 CAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCG 13020085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCG 480

 13020086 CCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTC 13020145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTC 540

 13020146 ATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTT 13020205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTT 600

 13020206 ATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTG 13020265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTG 660

 13020266 ATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 13020307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 702

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 763

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 823

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 883

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 943

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 1003

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1004 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCAAATCCCAA 1063

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1123

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1183

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1243

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1303

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1363

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1423

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1483

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1543

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1603

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1663

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1723

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1783

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1843

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1903

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1963

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 2023

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 2083

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2143

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2203

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2263

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2323

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2383

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2443

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2503

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2563

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2623

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2683

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2743

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2803

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2863

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2923

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 2983

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2984 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATACACTCAGTTG 3043

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 3103

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 3163

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 3223

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3283

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3343

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3403

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3463

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3523

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3583

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3643

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3703

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3763

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3823

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3883

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3943

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 4003

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 4063

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 4123

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 4183

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 4243

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 4303

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 4363

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 4423

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 4483

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACT 13024140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACT 4535

Alignment time is 5.20751 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3847] =>      3847 nucs 'mol-32-30eb-184174_3847'

Score:        3846
Aligned:      3846        nucs
Identic:      3846 (100%) nucs =>        71 (100%)      3775 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13020237,13020307] EXCISED REGION [13020309,13024083]
 second seq =>  [       1,      71] EXCISED REGION [      73,    3847]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [72,72]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13020237 GATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTAC 13020296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTAC 60

 13020297 ACATAATAAGC 13020307
          |||||||||||
       61 ACATAATAAGC 71

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       73 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 132

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      133 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 192

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      193 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 252

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      253 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 312

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      313 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 372

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      373 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 432

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      433 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 492

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 552

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      553 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 612

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 672

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 732

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 792

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 852

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 912

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 972

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1032

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1092

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1152

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1212

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1272

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1332

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 1392

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 1452

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 1512

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 1572

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 1632

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 1692

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 1752

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 1812

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 1872

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 1932

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 1992

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2052

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2112

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2172

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2232

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2292

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 2352

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 2412

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 2472

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 2532

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 2592

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 2652

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 2712

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 2772

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 2832

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 2892

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 2952

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3012

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3072

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3132

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3192

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3252

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3312

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 3372

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 3432

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 3492

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 3552

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 3612

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 3672

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 3732

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 3792

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAAT 13024083
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAAT 3847

Alignment time is 4.4508 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4785] =>      4785 nucs 'mol-32-3143-043048_4785'

Score:        4784
Aligned:      4784        nucs
Identic:      4784 (100%) nucs =>       722 (100%)      4062 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019586,13020307] EXCISED REGION [13020309,13024370]
 second seq =>  [       1,     722] EXCISED REGION [     724,    4785]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [723,723]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019586 AGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTT 13019645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTT 60

 13019646 TACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTG 13019705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTG 120

 13019706 GACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGT 13019765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGT 180

 13019766 CTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTT 13019825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTT 240

 13019826 TCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGA 13019885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGA 300

 13019886 AGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAG 13019945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAG 360

 13019946 ATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAA 13020005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAA 420

 13020006 GACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATC 13020065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATC 480

 13020066 CCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCT 13020125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCT 540

 13020126 GTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTA 13020185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTA 600

 13020186 TTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGAT 13020245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGAT 660

 13020246 CTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAA 13020305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAA 720

 13020306 GC 13020307
          ||
      721 GC 722

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 783

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 843

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 903

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 963

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 1023

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 1083

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1143

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1203

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1263

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1323

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1383

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1443

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1503

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1563

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1623

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1683

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1743

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1803

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1863

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1923

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1983

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 2043

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 2103

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2163

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2223

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2283

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2343

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2403

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2463

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2523

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2583

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2643

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2703

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2763

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2823

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2883

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2943

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 3003

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 3063

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 3123

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 3183

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 3243

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3303

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3363

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3423

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3483

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3543

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3603

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3663

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3723

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3783

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3843

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3903

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3963

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 4023

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 4083

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 4143

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 4203

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 4263

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 4323

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 4383

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 4443

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 4503

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 13024148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 4563

 13024149 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 13024208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 4623

 13024209 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 13024268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 4683

 13024269 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 13024328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 4743

 13024329 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAG 13024370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAG 4785

Alignment time is 5.47865 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5830] =>      5830 nucs 'mol-32-316f-056701_5830'

Score:        5818
Aligned:      5829        nucs
Identic:      5828 (100%) nucs =>       635 (100%)      5193 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019673,13020307] EXCISED REGION [13020309,13025502]
 second seq =>  [       1,     635] EXCISED REGION [     637,    5830]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [636,636]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019673 TTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAA 13019732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAA 60

 13019733 AAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAA 13019792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAA 120

 13019793 GATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAG 13019852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAG 180

 13019853 TGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCT 13019912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCT 240

 13019913 CAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCAT 13019972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCAT 300

 13019973 CTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGG 13020032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGG 360

 13020033 CGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCC 13020092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCC 420

 13020093 ATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCAC 13020152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCAC 480

 13020153 TTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCC 13020212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCC 540

 13020213 CTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACA 13020272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACA 600

 13020273 CATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 13020307
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 635

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 696

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 756

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 816

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 876

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 936

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 996

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1056

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1116

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1176

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1236

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1296

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1356

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1416

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1476

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1536

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1596

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1656

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1716

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1776

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1836

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1896

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 1956

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 2016

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2076

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2136

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2196

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2256

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2316

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2376

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2436

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2496

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2556

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2616

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGCTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2676

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2736

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2796

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2856

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 2916

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 2976

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 3036

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 3096

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 3156

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3216

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3276

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3336

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3396

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3456

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3516

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3576

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3636

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3696

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3756

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3816

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3876

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 3936

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 3996

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 4056

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 4116

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 4176

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 4236

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 4296

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 4356

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 4416

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 13024148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 4476

 13024149 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 13024208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 4536

 13024209 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 13024268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 4596

 13024269 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 13024328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 4656

 13024329 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 13024388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 4716

 13024389 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 13024448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 4776

 13024449 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 13024508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 4836

 13024509 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 13024568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 4896

 13024569 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 13024628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 4956

 13024629 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 13024688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 5016

 13024689 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 13024748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 5076

 13024749 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 13024808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 5136

 13024809 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 13024868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 5196

 13024869 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 13024928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 5256

 13024929 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 13024988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 5316

 13024989 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 13025048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 5376

 13025049 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 13025108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 5436

 13025109 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 13025168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 5496

 13025169 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 13025228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 5556

 13025229 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 13025288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 5616

 13025289 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 13025348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 5676

 13025349 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATTTT 13025408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATTTT 5736

 13025409 TCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTA 13025468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 TCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTA 5796

 13025469 TTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATG 13025502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 TTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATG 5830

Alignment time is 6.76531 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3800] =>      3800 nucs 'mol-32-316f-056959_3800'

Score:        3799
Aligned:      3799        nucs
Identic:      3799 (100%) nucs =>      2096 (100%)      1703 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13026697,13028792] EXCISED REGION [13028794,13030496]
 second seq =>  [       1,    2096] EXCISED REGION [    2098,    3800]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13028793,13028793]
 second seq =>         1 nucs [2097,2097]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2095,2098] to [2096,2099]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [13028791,13028792] to [13028794,13028795]
 second seq =>         2 nucs [2095,2096] to [2098,2099]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13026697 CACGAGTTTTTAGTGGTAGATATTTGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCA 13026756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACGAGTTTTTAGTGGTAGATATTTGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCA 60

 13026757 TATTACTTGGAGTTGGTTCTTGATAACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGT 13026816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTACTTGGAGTTGGTTCTTGATAACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGT 120

 13026817 CAGAATAATATTTGGTATAATATTAGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAG 13026876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGAATAATATTTGGTATAATATTAGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAG 180

 13026877 TTTAATTATCTTGCCTGTTGAATAACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCA 13026936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTAATTATCTTGCCTGTTGAATAACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCA 240

 13026937 TTTGTGCCATTTCTAACCATGTTGTATTGTTTTTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACA 13026996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGTGCCATTTCTAACCATGTTGTATTGTTTTTAGAATGACTTTCTTCTTCAAATAACA 300

 13026997 AGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAG 13027056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTATAAAGGTTGGGTTACCAG 360

 13027057 GTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCT 13027116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGCAGAAACTTAGACCTGCT 420

 13027117 TAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTA 13027176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAATGTAACCTACTGTTTTA 480

 13027177 ATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTA 13027236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATTCCAGCTGGAGATGCCTA 540

 13027237 TCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAA 13027296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTGAATTGGAAATAAAAGAA 600

 13027297 AAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTC 13027356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTATCAAATTGAAAGAACCTC 660

 13027357 AGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAG 13027416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGTCATTGCTGCCTAACTAG 720

 13027417 GTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGT 13027476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAGCCTGATTCTGAAATAGT 780

 13027477 TTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAA 13027536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAGTGTATGTGGTCATGGAA 840

 13027537 GTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTC 13027596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCTGCCATTCTTCTCATTTC 900

 13027597 GTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAA 13027656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGGCATGTCATTCAGAATAA 960

 13027657 TATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCA 13027716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGAAGGACATGGAAATTCCA 1020

 13027717 GGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAG 13027776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTAAAG 1080

 13027777 TCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTG 13027836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCATTTG 1140

 13027837 AGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTAC 13027896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGCTAC 1200

 13027897 CCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGC 13027956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCCAGC 1260

 13027957 CTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAA 13028016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCAGAA 1320

 13028017 GTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCT 13028076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTACCT 1380

 13028077 ACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATC 13028136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCTATC 1440

 13028137 ACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAA 13028196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAGAAA 1500

 13028197 ATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGA 13028256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCTTGA 1560

 13028257 AAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAA 13028316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGGAAA 1620

 13028317 GGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGA 13028376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTTGGA 1680

 13028377 ACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCA 13028436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTGGCA 1740

 13028437 GAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAA 13028496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACCAAA 1800

 13028497 GGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGT 13028556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCATAGT 1860

 13028557 CAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAG 13028616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCCCAG 1920

 13028617 CACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTA 13028676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTA 1980

 13028677 ACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGG 13028736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGG 2040

 13028737 CGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGG 13028792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGG 2096

EXCISED REGION

 13028794 GGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTG 13028853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTG 2157

 13028854 TCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCAC 13028913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCAC 2217

 13028914 AAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGC 13028973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGC 2277

 13028974 TTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGG 13029033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGG 2337

 13029034 ATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAA 13029093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAA 2397

 13029094 GCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAA 13029153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 GCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAA 2457

 13029154 AACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCC 13029213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 AACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCC 2517

 13029214 CTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAG 13029273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAG 2577

 13029274 CTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATT 13029333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATT 2637

 13029334 AGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAAC 13029393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAAC 2697

 13029394 AAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAA 13029453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAA 2757

 13029454 ATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCA 13029513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCA 2817

 13029514 AACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGAT 13029573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGAT 2877

 13029574 GGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAA 13029633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 GGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAA 2937

 13029634 GAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATC 13029693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 GAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATC 2997

 13029694 AATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAG 13029753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 AATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAG 3057

 13029754 AAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGA 13029813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGA 3117

 13029814 TCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAA 13029873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAA 3177

 13029874 GGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCA 13029933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCA 3237

 13029934 GAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAA 13029993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAA 3297

 13029994 ATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAG 13030053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 ATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAG 3357

 13030054 ATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAAT 13030113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAAT 3417

 13030114 CTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAG 13030173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAG 3477

 13030174 AATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGA 13030233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGA 3537

 13030234 AAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAAC 13030293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAAC 3597

 13030294 TGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAG 13030353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAG 3657

 13030354 CAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTAT 13030413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTAT 3717

 13030414 ATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCA 13030473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 ATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCA 3777

 13030474 TTATTCGTAATATCCAAAAAGTG 13030496
          |||||||||||||||||||||||
     3778 TTATTCGTAATATCCAAAAAGTG 3800

Alignment time is 4.37781 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6266] =>      6266 nucs 'mol-32-316f-161286_6266'

Score:        6254
Aligned:      6265        nucs
Identic:      6264 (100%) nucs =>       793 (100%)      5471 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019515,13020307] EXCISED REGION [13020309,13025780]
 second seq =>  [       1,     793] EXCISED REGION [     795,    6266]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [794,794]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019515 TTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATC 13019574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATC 60

 13019575 AGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTT 13019634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTT 120

 13019635 TATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATC 13019694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATC 180

 13019695 ATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCA 13019754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCA 240

 13019755 TCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGC 13019814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGC 300

 13019815 ATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTC 13019874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTC 360

 13019875 AAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGA 13019934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGA 420

 13019935 GATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTA 13019994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTA 480

 13019995 GAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACC 13020054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACC 540

 13020055 TGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTT 13020114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTT 600

 13020115 TTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAAT 13020174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAAT 660

 13020175 AGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAG 13020234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAG 720

 13020235 AGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTT 13020294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTT 780

 13020295 ACACATAATAAGC 13020307
          |||||||||||||
      781 ACACATAATAAGC 793

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 854

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 914

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 974

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 1034

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 1094

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 1154

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1214

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1274

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1334

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1394

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1454

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1514

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1574

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1634

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1694

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1754

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1814

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1874

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1934

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1994

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 2054

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 2114

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 2174

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2234

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2294

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2354

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2414

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2474

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2534

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2594

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2654

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2714

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2774

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2834

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2894

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2954

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 3014

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 3074

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 3134

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 3194

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 3254

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 3314

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3374

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3434

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3494

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3554

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3614

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3674

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3734

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3794

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3854

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3914

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3974

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 4034

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 4094

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 4154

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 4214

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 4274

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 4334

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 4394

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 4454

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 4514

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 4574

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 13024148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 4634

 13024149 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 13024208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 4694

 13024209 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 13024268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 4754

 13024269 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 13024328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 4814

 13024329 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 13024388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 4874

 13024389 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 13024448
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 GACAATGTTTGCTTCCTCCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 4934

 13024449 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 13024508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 4994

 13024509 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 13024568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 5054

 13024569 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 13024628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 5114

 13024629 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 13024688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 5174

 13024689 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 13024748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 5234

 13024749 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 13024808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 5294

 13024809 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 13024868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 5354

 13024869 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 13024928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 5414

 13024929 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 13024988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 5474

 13024989 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 13025048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 5534

 13025049 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 13025108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 5594

 13025109 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 13025168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 5654

 13025169 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 13025228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 5714

 13025229 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 13025288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 5774

 13025289 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 13025348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 5834

 13025349 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATTTT 13025408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATTTT 5894

 13025409 TCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTA 13025468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 TCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTA 5954

 13025469 TTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTGAT 13025528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 TTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTGAT 6014

 13025529 TCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGTGA 13025588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 TCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGTGA 6074

 13025589 AAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGTTACAAATTT 13025648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 AAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGTTACAAATTT 6134

 13025649 CATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGCTTTTATTTT 13025708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 CATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGCTTTTATTTT 6194

 13025709 TATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGTACAACATGA 13025768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 TATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGTACAACATGA 6254

 13025769 GACATTTTCAAC 13025780
          ||||||||||||
     6255 GACATTTTCAAC 6266

Alignment time is 7.22989 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5395] =>      5395 nucs 'mol-32-317a-046697_5395'

Score:        5395
Aligned:      5395        nucs
Identic:      5395 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13020367,13025761]
 second seq =>  [       1,    5395]

 13020367 CAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTA 13020426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTA 60

 13020427 AAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAA 13020486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAA 120

 13020487 ATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATA 13020546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATA 180

 13020547 ATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAAT 13020606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAAT 240

 13020607 TTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCC 13020666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCC 300

 13020667 AATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTC 13020726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTC 360

 13020727 ATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAA 13020786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAA 420

 13020787 CCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTC 13020846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTC 480

 13020847 TGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAAT 13020906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAAT 540

 13020907 CTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAG 13020966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAG 600

 13020967 CATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCA 13021026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCA 660

 13021027 CTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAA 13021086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAA 720

 13021087 CTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATG 13021146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATG 780

 13021147 CCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAG 13021206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAG 840

 13021207 GTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAA 13021266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAA 900

 13021267 ATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAA 13021326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAA 960

 13021327 GTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTT 13021386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTT 1020

 13021387 TGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAG 13021446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAG 1080

 13021447 ATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAA 13021506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAA 1140

 13021507 AGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACT 13021566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACT 1200

 13021567 TGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTA 13021626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTA 1260

 13021627 AAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATT 13021686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATT 1320

 13021687 CATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGA 13021746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGA 1380

 13021747 GGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAG 13021806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAG 1440

 13021807 CTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAG 13021866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAG 1500

 13021867 TCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTC 13021926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTC 1560

 13021927 ACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCG 13021986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCG 1620

 13021987 CTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCT 13022046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCT 1680

 13022047 ATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAA 13022106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAA 1740

 13022107 CTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCT 13022166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCT 1800

 13022167 CTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCAC 13022226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCAC 1860

 13022227 TTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTT 13022286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTT 1920

 13022287 ACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAG 13022346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAG 1980

 13022347 TTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACC 13022406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACC 2040

 13022407 ACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTAT 13022466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTAT 2100

 13022467 CTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTT 13022526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTT 2160

 13022527 CTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCC 13022586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCC 2220

 13022587 GCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGT 13022646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGT 2280

 13022647 TGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCT 13022706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCT 2340

 13022707 GACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCT 13022766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCT 2400

 13022767 CCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTAC 13022826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTAC 2460

 13022827 TGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCA 13022886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCA 2520

 13022887 CGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCC 13022946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCC 2580

 13022947 ATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGT 13023006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGT 2640

 13023007 AAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTT 13023066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTT 2700

 13023067 AGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGAT 13023126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGAT 2760

 13023127 ACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAG 13023186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAG 2820

 13023187 CGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCT 13023246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCT 2880

 13023247 AGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGC 13023306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGC 2940

 13023307 TTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTG 13023366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTG 3000

 13023367 GGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCC 13023426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCC 3060

 13023427 AATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTT 13023486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTT 3120

 13023487 ATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAG 13023546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAG 3180

 13023547 GAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGA 13023606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGA 3240

 13023607 TGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAA 13023666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAA 3300

 13023667 GGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAA 13023726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAA 3360

 13023727 TAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAA 13023786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAA 3420

 13023787 AAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAA 13023846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAA 3480

 13023847 AGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGA 13023906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGA 3540

 13023907 CTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGC 13023966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGC 3600

 13023967 GAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGT 13024026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGT 3660

 13024027 TAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAA 13024086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAA 3720

 13024087 AGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGA 13024146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGA 3780

 13024147 TAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAA 13024206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAA 3840

 13024207 TTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTT 13024266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTT 3900

 13024267 TAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAA 13024326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAA 3960

 13024327 AATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCA 13024386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCA 4020

 13024387 CAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTT 13024446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTT 4080

 13024447 AGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATG 13024506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATG 4140

 13024507 GGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCA 13024566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCA 4200

 13024567 AGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAG 13024626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAG 4260

 13024627 TAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTT 13024686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTT 4320

 13024687 CAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCAC 13024746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCAC 4380

 13024747 AGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAA 13024806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAA 4440

 13024807 CCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAG 13024866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAG 4500

 13024867 CTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCA 13024926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCA 4560

 13024927 GGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCC 13024986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCC 4620

 13024987 AGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGC 13025046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGC 4680

 13025047 TACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGT 13025106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGT 4740

 13025107 CCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGC 13025166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGC 4800

 13025167 ACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCA 13025226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCA 4860

 13025227 TTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAA 13025286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAA 4920

 13025287 GATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAA 13025346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAA 4980

 13025347 AAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATT 13025406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATT 5040

 13025407 TTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGT 13025466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGT 5100

 13025467 TATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTG 13025526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTG 5160

 13025527 ATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGT 13025586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGT 5220

 13025587 GAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGTTACAAAT 13025646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGATTAGTAGTCATGTTACAAAT 5280

 13025647 TTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGCTTTTATT 13025706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGAACAAAAAAGCGCTTTTATT 5340

 13025707 TTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGTAC 13025761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTGTGGAAGAAGTGTAC 5395

Alignment time is 5.38644 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5907] =>      5907 nucs 'mol-32-317a-147218_5907'

Score:        5906
Aligned:      5906        nucs
Identic:      5906 (100%) nucs =>      1076 (100%)      4830 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019232,13020307] EXCISED REGION [13020309,13025138]
 second seq =>  [       1,    1076] EXCISED REGION [    1078,    5907]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [1077,1077]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019232 TCTCAATTAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAA 13019291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCAATTAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAA 60

 13019292 CATTATTTAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACAT 13019351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTATTTAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACAT 120

 13019352 TATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCAC 13019411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCAC 180

 13019412 AGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCA 13019471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCA 240

 13019472 ACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAA 13019531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAA 300

 13019532 AACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTG 13019591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTG 360

 13019592 GGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATC 13019651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATC 420

 13019652 AAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTC 13019711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTC 480

 13019712 AGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTAT 13019771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTAT 540

 13019772 AAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTT 13019831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTT 600

 13019832 GCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTT 13019891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTT 660

 13019892 ATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTA 13019951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTA 720

 13019952 GTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCC 13020011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCC 780

 13020012 TTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTT 13020071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTT 840

 13020072 AAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTG 13020131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTG 900

 13020132 TGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATAT 13020191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATAT 960

 13020192 TTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGT 13020251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGT 1020

 13020252 AGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 13020307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 1076

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 1137

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 1197

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 1257

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 1317

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 1377

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 1437

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1497

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1557

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1617

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1677

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1737

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1797

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1857

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1917

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1977

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 2037

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 2097

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 2157

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 2217

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 2277

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 2337

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 2397

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 2457

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2517

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2577

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2637

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2697

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2757

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2817

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2877

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2937

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2997

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 3057

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 3117

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 3177

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 3237

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 3297

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 3357

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 3417

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 3477

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 3537

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 3597

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3657

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3717

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3777

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3837

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3897

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3957

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 4017

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 4077

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 4137

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 4197

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 4257

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 4317

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 4377

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 4437

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 4497

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 4557

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 4617

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 4677

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 4737

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 4797

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 4857

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 13024148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 4917

 13024149 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 13024208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 4977

 13024209 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 13024268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 5037

 13024269 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 13024328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 5097

 13024329 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 13024388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 5157

 13024389 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 13024448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 5217

 13024449 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 13024508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 5277

 13024509 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 13024568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 5337

 13024569 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 13024628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 5397

 13024629 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 13024688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 5457

 13024689 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 13024748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 5517

 13024749 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 13024808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 5577

 13024809 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 13024868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 5637

 13024869 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 13024928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 5697

 13024929 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 13024988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 5757

 13024989 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 13025048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 5817

 13025049 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 13025108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 5877

 13025109 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTC 13025138
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTC 5907

Alignment time is 6.80752 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2044] =>      2044 nucs 'mol-32-317a-262109_2044'

Score:        2033
Aligned:      2044        nucs
Identic:      2043 (100%) nucs =>       258 (100%)      1785 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13026721,13026978] EXCISED REGION [13026980,13028765]
 second seq =>  [       1,     258] EXCISED REGION [     260,    2044]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13026979,13026979]
 second seq =>         1 nucs [259,259]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [13027295,13027295]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [13026979,13026980] to [13026980,13026981]
 second seq =>         1 nucs [258,258] to [259,259]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13026721 TGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGAT 13026780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGTAGAATAAGAGATGGGACGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGAT 60

 13026781 AACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATATT 13026840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCATGCTGTTTATAGCTAATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATATT 120

 13026841 AGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAATA 13026900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGTTACATTGCTGCATTTGAACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAATA 180

 13026901 ACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTTG 13026960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCAATCTTGGATTTTTCTTTTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTTG 240

 13026961 TATTGTTTTTAGAATGAC 13026978
          ||||||||||||||||||
      241 TATTGTTTTTAGAATGAC 258

EXCISED REGION

 13026980 TTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTAT 13027039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 TTCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTAT 319

 13027040 AAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGC 13027099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 AAAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGC 379

 13027100 AGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAA 13027159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 AGAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAA 439

 13027160 TGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATT 13027219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 TGTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATT 499

 13027220 CCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTG 13027279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 CCAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTG 559

 13027280 AATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTAT 13027339
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 AATTGGAAATAAAAG-AAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTAT 618

 13027340 CAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGT 13027399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 CAAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGT 678

 13027400 CATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAG 13027459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 CATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAG 738

 13027460 CCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAG 13027519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 CCTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAG 798

 13027520 TGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCT 13027579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 TGTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCT 858

 13027580 GCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGG 13027639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 GCCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGG 918

 13027640 CATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGA 13027699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 CATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGA 978

 13027700 AGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAA 13027759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 AGGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAA 1038

 13027760 ACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTG 13027819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 ACAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTG 1098

 13027820 AGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCAT 13027879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 AGAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCAT 1158

 13027880 GTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGT 13027939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 GTTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGT 1218

 13027940 GCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCT 13027999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 GCTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCT 1278

 13028000 AGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCT 13028059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 AGTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCT 1338

 13028060 TTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAA 13028119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 TTCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAA 1398

 13028120 CTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAG 13028179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 CTACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAG 1458

 13028180 TGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAG 13028239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TGGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAG 1518

 13028240 AGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGG 13028299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 AGCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGG 1578

 13028300 TACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGA 13028359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 TACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGA 1638

 13028360 AACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAA 13028419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 AACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAA 1698

 13028420 TTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAA 13028479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TTATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAA 1758

 13028480 ATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGC 13028539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 ATGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGC 1818

 13028540 CCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAA 13028599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 CCTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAA 1878

 13028600 ACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGAT 13028659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 ACAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGAT 1938

 13028660 CAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAG 13028719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 CAAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAG 1998

 13028720 CCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT 13028765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 CCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT 2044

Alignment time is 2.40055 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3903] =>      3903 nucs 'mol-32-317a-262118_3903'

Score:        3891
Aligned:      3902        nucs
Identic:      3901 (100%) nucs =>      1240 (100%)      2661 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13021927,13023166] EXCISED REGION [13023168,13025829]
 second seq =>  [       1,    1240] EXCISED REGION [    1242,    3903]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13023167,13023167]
 second seq =>         1 nucs [1241,1241]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1240,1241] to [1241,1242]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [13023164,13023166] to [13023168,13023170]
 second seq =>         3 nucs [1238,1240] to [1242,1244]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13021927 ACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCG 13021986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCG 60

 13021987 CTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCT 13022046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCT 120

 13022047 ATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAA 13022106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAA 180

 13022107 CTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCT 13022166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCT 240

 13022167 CTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCAC 13022226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCAC 300

 13022227 TTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTT 13022286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTT 360

 13022287 ACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAG 13022346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAG 420

 13022347 TTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACC 13022406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACC 480

 13022407 ACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTAT 13022466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTAT 540

 13022467 CTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTT 13022526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTT 600

 13022527 CTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCC 13022586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCC 660

 13022587 GCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGT 13022646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGT 720

 13022647 TGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCT 13022706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCT 780

 13022707 GACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCT 13022766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCT 840

 13022767 CCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTAC 13022826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTAC 900

 13022827 TGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCA 13022886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCA 960

 13022887 CGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCC 13022946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCC 1020

 13022947 ATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGT 13023006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGT 1080

 13023007 AAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTT 13023066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTT 1140

 13023067 AGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGAT 13023126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGAT 1200

 13023127 ACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAG 13023166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAG 1240

EXCISED REGION

 13023168 GAGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCA 13023227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 GAGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCA 1301

 13023228 GATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTC 13023287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 GATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTC 1361

 13023288 TTGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAG 13023347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 TTGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAG 1421

 13023348 AAATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGT 13023407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 AAATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGT 1481

 13023408 GAATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTC 13023467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 GAATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTC 1541

 13023468 ACAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCA 13023527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 ACAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCA 1601

 13023528 TTCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAAT 13023587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAAT 1661

 13023588 CTGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTT 13023647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 CTGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTT 1721

 13023648 GGCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCA 13023707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 GGCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCA 1781

 13023708 GGCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTT 13023767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GGCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTT 1841

 13023768 TCCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAAT 13023827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TCCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAAT 1901

 13023828 TTCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAA 13023887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TTCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAA 1961

 13023888 ATCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTT 13023947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 ATCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTT 2021

 13023948 ACTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGG 13024007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 ACTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGG 2081

 13024008 TCCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTA 13024067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TCCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTA 2141

 13024068 CCTTTCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCA 13024127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CCTTTCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCA 2201

 13024128 AAAAAAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTT 13024187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 AAAAAAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTT 2261

 13024188 GTTCTGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTC 13024247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GTTCTGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTC 2321

 13024248 TCACATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGC 13024307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TCACATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGC 2381

 13024308 ATCTTTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAA 13024367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ATCTTTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAA 2441

 13024368 TAGGAAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAA 13024427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TAGGAAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAA 2501

 13024428 ATGGAGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGT 13024487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 ATGGAGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGT 2561

 13024488 CAGAATATTGCCAAAGATGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCA 13024547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 CAGAATATTGCCAAAGATGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCA 2621

 13024548 TGATTTGTACTTGTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTAT 13024607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 TGATTTGTACTTGTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTAT 2681

 13024608 GTAGAATTTCTGTCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTG 13024667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 GTAGAATTTCTGTCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTG 2741

 13024668 GAATTCTGGTTTTATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTT 13024727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 GAATTCTGGTTTTATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTT 2801

 13024728 TAGAGGAGATTTTGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACT 13024787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TAGAGGAGATTTTGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACT 2861

 13024788 GGAATGATGTTTCTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAA 13024847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 GGAATGATGTTTCTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAA 2921

 13024848 GGTGGAAGTGAATTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAA 13024907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 GGTGGAAGTGAATTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAA 2981

 13024908 AAACCCAGATGTGAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTG 13024967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 AAACCCAGATGTGAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTG 3041

 13024968 ATTGCTGGCTCTGCTGCCCAGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCT 13025027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 ATTGCTGGCTCTGCTGCCCAGCCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCT 3101

 13025028 GACTAACAGAAGCAGTAGCTACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCA 13025087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 GACTAACAGAAGCAGTAGCTACACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCA 3161

 13025088 ACATTACATGGCCCCATGTCCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGG 13025147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 ACATTACATGGCCCCATGTCCACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGG 3221

 13025148 CTCCAATTTGTCCACCTGCACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGT 13025207
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 CTCCAATTTGTCCACATGCACCAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGT 3281

 13025208 TTGTGGGTAGATTAAATCATTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAG 13025267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 TTGTGGGTAGATTAAATCATTGAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAG 3341

 13025268 TATCTGTTTTAATTAGTAAGATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAA 13025327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 TATCTGTTTTAATTAGTAAGATCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAA 3401

 13025328 CAGTGTGACTTAAGAAAAAAAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACAC 13025387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 CAGTGTGACTTAAGAAAAAAAATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACAACAC 3461

 13025388 CAAAGTAGTATAAAATATTTTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACAT 13025447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 CAAAGTAGTATAAAATATTTTTCCATTAAACCAACTTTATTGTTTTGGTAGAACTTACAT 3521

 13025448 TTCACATTGCATAAGATGTTATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCT 13025507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 TTCACATTGCATAAGATGTTATTGCCTTATTGTTAACATGCAGATTGGCTGCATGCATCT 3581

 13025508 AGTCATTGTTAATAGATTGATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTAC 13025567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 AGTCATTGTTAATAGATTGATTCAGATTGAATGCATTTTACATTTTAAATGAAGGCTTAC 3641

 13025568 TACTGATGCAACATTGAGTGAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGAT 13025627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TACTGATGCAACATTGAGTGAAAATGCTACCACCAGAATAGTAAACAGAAAACAAGAGAT 3701

 13025628 TAGTAGTCATGTTACAAATTTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGA 13025687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TAGTAGTCATGTTACAAATTTCATGAGGAATGGAATTGCATTTCAGTAGGGCACAGCAGA 3761

 13025688 ACAAAAAAGCGCTTTTATTTTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTG 13025747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 ACAAAAAAGCGCTTTTATTTTTATGTAAAAAGGTAAAAATAGTGGGCAGCGTTTTTGTTG 3821

 13025748 TGGAAGAAGTGTACAACATGAGACATTTTCAACAGATTTATAGTAAATTTGATAAGATAT 13025807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 TGGAAGAAGTGTACAACATGAGACATTTTCAACAGATTTATAGTAAATTTGATAAGATAT 3881

 13025808 TTTTTCTAACAAAAAGTCATTG 13025829
          ||||||||||||||||||||||
     3882 TTTTTCTAACAAAAAGTCATTG 3903

Alignment time is 4.51816 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3191] =>      3191 nucs 'mol-32-3240-110525_3191'

Score:        3180
Aligned:      3191        nucs
Identic:      3190 (100%) nucs =>      3028 (100%)       162 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019073,13022101] EXCISED REGION [13028551,13028712]
 second seq =>  [       1,    3029] EXCISED REGION [    3030,    3191]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3029,3029] to [3030,3030]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019073 GAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGATTG 13019132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGATTG 60

 13019133 GAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTGGG 13019192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTGGG 120

 13019193 AAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTAGA 13019252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTAGA 180

 13019253 TTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAAAA 13019312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAAAA 240

 13019313 AAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAG 13019372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAG 300

 13019373 AATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGT 13019432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGT 360

 13019433 AAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACA 13019492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACA 420

 13019493 AGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTA 13019552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTA 480

 13019553 TGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATC 13019612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATC 540

 13019613 CATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTAT 13019672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTAT 600

 13019673 TTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAA 13019732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAA 660

 13019733 AAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAA 13019792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAA 720

 13019793 GATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAG 13019852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAG 780

 13019853 TGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCT 13019912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCT 840

 13019913 CAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCAT 13019972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCAT 900

 13019973 CTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGG 13020032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGG 960

 13020033 CGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCC 13020092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCC 1020

 13020093 ATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCAC 13020152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCAC 1080

 13020153 TTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCC 13020212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCC 1140

 13020213 CTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACA 13020272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACA 1200

 13020273 CATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAAT 13020332
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAAT 1260

 13020333 GAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGC 13020392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGC 1320

 13020393 AAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGA 13020452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGA 1380

 13020453 GGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAA 13020512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAA 1440

 13020513 AATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAAT 13020572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAAT 1500

 13020573 TGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTG 13020632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTG 1560

 13020633 CCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTG 13020692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTG 1620

 13020693 GGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCC 13020752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCC 1680

 13020753 CTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCA 13020812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCA 1740

 13020813 CATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTA 13020872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTA 1800

 13020873 AACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACC 13020932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACC 1860

 13020933 TCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTT 13020992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTT 1920

 13020993 CCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGA 13021052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGA 1980

 13021053 TAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACT 13021112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACT 2040

 13021113 AATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCA 13021172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCA 2100

 13021173 TGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATA 13021232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATA 2160

 13021233 CATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGA 13021292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGA 2220

 13021293 GATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCAT 13021352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCAT 2280

 13021353 GGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATT 13021412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATT 2340

 13021413 GCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATC 13021472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATC 2400

 13021473 TCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAG 13021532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAG 2460

 13021533 GTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCAT 13021592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCAT 2520

 13021593 TTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATT 13021652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATT 2580

 13021653 TTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGA 13021712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGA 2640

 13021713 AGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAG 13021772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAG 2700

 13021773 AAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATAT 13021832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATAT 2760

 13021833 ACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGA 13021892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGA 2820

 13021893 GCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTC 13021952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTC 2880

 13021953 ACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATT 13022012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATT 2940

 13022013 GCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGG 13022072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGG 3000

 13022073 GAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 3029

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3089

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 3149

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAA 13028712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAA 3191

Alignment time is 3.70879 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5126] =>      5126 nucs 'mol-32-32f0-048220_5126'

Score:        5125
Aligned:      5125        nucs
Identic:      5125 (100%) nucs =>        50 (100%)      5075 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13020258,13020307] EXCISED REGION [13020309,13025383]
 second seq =>  [       1,      50] EXCISED REGION [      52,    5126]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [51,51]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13020258 GTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 13020307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 50

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       52 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 111

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 171

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 231

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 291

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 351

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 411

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 471

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 531

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 591

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 651

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 711

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 771

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 831

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 891

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 951

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1011

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1071

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1131

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1191

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1251

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1311

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 1371

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 1431

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 1491

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 1551

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 1611

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 1671

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 1731

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 1791

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 1851

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 1911

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 1971

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2031

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2091

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2151

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2211

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2271

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 2331

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 2391

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 2451

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 2511

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 2571

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 2631

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 2691

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 2751

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 2811

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 2871

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 2931

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 2991

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3051

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3111

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3171

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3231

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3291

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 3351

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 3411

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 3471

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 3531

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 3591

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 3651

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 3711

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 3771

 13024029 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 13024088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 GCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAG 3831

 13024089 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 13024148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 TAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATA 3891

 13024149 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 13024208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 ATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATT 3951

 13024209 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 13024268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 ACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTA 4011

 13024269 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 13024328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 AATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAA 4071

 13024329 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 13024388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 TAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACA 4131

 13024389 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 13024448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 GACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAG 4191

 13024449 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 13024508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 AAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGG 4251

 13024509 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 13024568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 CACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAG 4311

 13024569 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 13024628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 TGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTA 4371

 13024629 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 13024688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 AGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCA 4431

 13024689 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 13024748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 AACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAG 4491

 13024749 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 13024808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 TATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACC 4551

 13024809 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 13024868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 CTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCT 4611

 13024869 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 13024928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 GTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGG 4671

 13024929 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 13024988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 TTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAG 4731

 13024989 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 13025048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 CCATGGCCTTCAGGCCCCATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTA 4791

 13025049 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 13025108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 CACAAAGGCAACAGCTTTCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCC 4851

 13025109 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 13025168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 ACAGCTGTATGTGCCTTTCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCAC 4911

 13025169 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 13025228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 CAGGGGTTTGACAGTTGCCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATT 4971

 13025229 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 13025288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 GAGAAATAGCATGCGGGGATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGA 5031

 13025289 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 13025348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 TCTGGTAAGTGTTTATCTAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAA 5091

 13025349 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACA 13025383
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 ATTTTTAATTTTATATAATTTTAATTTAAATTACA 5126

Alignment time is 6.12145 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4168] =>      4168 nucs 'mol-32-3311-264159_4168'

Score:        4145
Aligned:      4167        nucs
Identic:      4165 (100%) nucs =>       441 (100%)      3724 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019867,13020307] EXCISED REGION [13020309,13024034]
 second seq =>  [       1,     441] EXCISED REGION [     443,    4168]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [442,442]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019867 AATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGA 13019926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGA 60

 13019927 CATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGAT 13019986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGAT 120

 13019987 CTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGG 13020046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGG 180

 13020047 AACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGG 13020106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGG 240

 13020107 ATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAA 13020166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAA 300

 13020167 AAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAA 13020226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAA 360

 13020227 CTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAA 13020286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAA 420

 13020287 TAATGCTTACACATAATAAGC 13020307
          |||||||||||||||||||||
      421 TAATGCTTACACATAATAAGC 441

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 502

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 562

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 622

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 682

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 742

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 802

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 862

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 922

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 982

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1042

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1102

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1162

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1222

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1282

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1342

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1402

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1462

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1522

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1582

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1642

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 1702

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 1762

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 1822

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 1882

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 1942

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2002

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2062

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2122

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2182

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 2242

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 2302

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 2362

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 2422

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 2482

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 2542

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 2602

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 2662

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 2722

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 2782

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 2842

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 2902

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 2962

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 3022

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 3082

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 3142

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 3202

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGGGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 3262

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3263 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGGCGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 3322

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 13023248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAG 3382

 13023249 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 13023308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 GTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTT 3442

 13023309 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 13023368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 TTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGG 3502

 13023369 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 13023428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 GAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAA 3562

 13023429 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 13023488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 TCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTAT 3622

 13023489 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 13023548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 AGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGA 3682

 13023549 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 13023608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 GAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATG 3742

 13023609 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 13023668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3743 TATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGG 3802

 13023669 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 13023728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3803 TCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATA 3862

 13023729 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 13023788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3863 ATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAA 3922

 13023789 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 13023848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3923 GTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAG 3982

 13023849 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 13023908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3983 ATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACT 4042

 13023909 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 13023968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4043 GTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGA 4102

 13023969 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 13024028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4103 GCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTA 4162

 13024029 GCCTTA 13024034
          ||||||
     4163 GCCTTA 4168

Alignment time is 5.10599 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7475] =>      7475 nucs 'mol-32-331c-095559_7475'

Score:        7420
Aligned:      7475        nucs
Identic:      7470 (100%) nucs =>      2591 (100%)      4879 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019510,13022101] EXCISED REGION [13028551,13033433]
 second seq =>  [       1,    2592] EXCISED REGION [    2593,    7475]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [2592,2592] to [2593,2593]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019510 GCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTG 13019569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTG 60

 13019570 TCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATAT 13019629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATAT 120

 13019630 GGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAA 13019689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAA 180

 13019690 GAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATT 13019749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATT 240

 13019750 CTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAA 13019809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAA 300

 13019810 TCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAAT 13019869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAAT 360

 13019870 AAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACAT 13019929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACAT 420

 13019930 TGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTT 13019989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTT 480

 13019990 CTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAAC 13020049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAAC 540

 13020050 CTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATT 13020109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATT 600

 13020110 TTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAG 13020169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAG 660

 13020170 TTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTT 13020229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTT 720

 13020230 CCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAA 13020289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAA 780

 13020290 TGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAA 13020349
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAA 840

 13020350 ATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAAC 13020409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAAC 900

 13020410 TCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAA 13020469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAA 960

 13020470 AATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGG 13020529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGG 1020

 13020530 GTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTT 13020589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTT 1080

 13020590 TTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTC 13020649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTC 1140

 13020650 ATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCA 13020709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCA 1200

 13020710 ATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCC 13020769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCC 1260

 13020770 CAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGT 13020829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGT 1320

 13020830 TTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCC 13020889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCC 1380

 13020890 AGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGT 13020949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGT 1440

 13020950 TTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTA 13021009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTA 1500

 13021010 GATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATA 13021069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATA 1560

 13021070 CTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTT 13021129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTT 1620

 13021130 TGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAA 13021189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAA 1680

 13021190 TCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAA 13021249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAA 1740

 13021250 AGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTA 13021309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTA 1800

 13021310 CAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACAC 13021369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACAC 1860

 13021370 TTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACA 13021429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACA 1920

 13021430 CTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGC 13021489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGC 1980

 13021490 TCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCT 13021549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCT 2040

 13021550 ATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAA 13021609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAA 2100

 13021610 AAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTAT 13021669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTAT 2160

 13021670 TTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCC 13021729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCC 2220

 13021730 ACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGA 13021789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGA 2280

 13021790 TACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTG 13021849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTG 2340

 13021850 AGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTT 13021909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTT 2400

 13021910 CTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATT 13021969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATT 2460

 13021970 GAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAG 13022029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAG 2520

 13022030 TCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCA 13022089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCA 2580

 13022090 GATAAATTTACC 13022101
          ||||||||||||
     2581 GATAAATTTACC 2592

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 2652

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 2712

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 2772

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 13028790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 2832

 13028791 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 13028850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 2892

 13028851 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 13028910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 2952

 13028911 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 13028970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 3012

 13028971 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 13029030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 3072

 13029031 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 13029090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 3132

 13029091 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 13029150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 3192

 13029151 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 13029210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 3252

 13029211 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 13029270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 3312

 13029271 GAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGA 13029330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 GAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGA 3372

 13029331 ATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCA 13029390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 ATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCA 3432

 13029391 AACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCT 13029450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 AACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCT 3492

 13029451 AAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAAC 13029510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 AAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAAC 3552

 13029511 CCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAG 13029570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 CCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAG 3612

 13029571 GATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTA 13029630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 GATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTA 3672

 13029631 AAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGA 13029690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 AAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGA 3732

 13029691 ATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAA 13029750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 ATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAA 3792

 13029751 AAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGAT 13029810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 AAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGAT 3852

 13029811 AGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACT 13029870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 AGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACT 3912

 13029871 TAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTA 13029930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3913 TAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACGAATACGTGTAATGAGTGTA 3972

 13029931 CCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCC 13029990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 CCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCC 4032

 13029991 TAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGA 13030050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 TAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGA 4092

 13030051 CAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCA 13030110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 CAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCA 4152

 13030111 AATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATG 13030170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 AATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATG 4212

 13030171 AAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGC 13030230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 AAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGC 4272

 13030231 CGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGA 13030290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 CGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGA 4332

 13030291 AACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTT 13030350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 AACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTT 4392

 13030351 CAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATG 13030410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 CAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATG 4452

 13030411 TATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATA 13030470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 TATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATA 4512

 13030471 GCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGG 13030530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 GCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGG 4572

 13030531 ATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTG 13030590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 ATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTG 4632

 13030591 ATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCG 13030650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4633 ATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCG 4692

 13030651 TTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCT 13030710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 TTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCT 4752

 13030711 AGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGA 13030770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4753 AGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGA 4812

 13030771 GAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGT 13030830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4813 GAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGT 4872

 13030831 TGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATA 13030890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4873 TGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATA 4932

 13030891 CTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCAC 13030950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 CTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCAC 4992

 13030951 ACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGT 13031010
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
     4993 ACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGCTGGT 5052

 13031011 CTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAAAGTGCTGGGATTACAGG 13031070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 CTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAAAGTGCTGGGATTACAGG 5112

 13031071 CGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGATTTTGTGGTAATGGTTAC 13031130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5113 CGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGATTTTGTGGTAATGGTTAC 5172

 13031131 ACAATCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTCAAATGAGTGAATAGTAT 13031190
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5173 ACAGTCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTCAAATGAGTGAATAGTAT 5232

 13031191 GTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGTGATCTGTGAAGGCAATG 13031250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5233 GTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGTGATCTGTGAAGGCAATG 5292

 13031251 GTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTTAATTATGTCCCTTGTAT 13031310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5293 GTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTTAATTATGTCCCTTGTAT 5352

 13031311 CCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAATTGATCACTACTTTTACT 13031370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5353 CCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAATTGATCACTACTTTTACT 5412

 13031371 ACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAAAAGGACATTTTCAATAT 13031430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5413 ACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAAAAGGACATTTTCAATAT 5472

 13031431 ATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCTTTATGTACATGATAGTC 13031490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5473 ATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCTTTATGTACATGATAGTC 5532

 13031491 ATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTGGCTAGCTACAAACCAGA 13031550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5533 ATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTGGCTAGCTACAAACCAGA 5592

 13031551 TGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATATGTTTCCTCCCTTTTCA 13031610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5593 TGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATATGTTTCCTCCCTTTTCA 5652

 13031611 GAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGCTTTTAAATGGCCTATCT 13031670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5653 GAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGCTTTTAAATGGCCTATCT 5712

 13031671 TTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTATGAAATGCCTGCTACTGT 13031730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5713 TTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTATGAAATGCCTGCTACTGT 5772

 13031731 TCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACAAATTAGTTTTGCAGACA 13031790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5773 TCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACAAATTAGTTTTGCAGACA 5832

 13031791 TTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTCCTGGGATTAACACTCAG 13031850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5833 TTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTCCTGGGATTAACACTCAG 5892

 13031851 TTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGTTTCGCTGTAGGAAATGG 13031910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5893 TTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGTTTCGCTGTAGGAAATGG 5952

 13031911 TAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTTGTTGAGCTCTGCATATT 13031970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5953 TAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTTGTTGAGCTCTGCATATT 6012

 13031971 TTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGCCACCCCTAGGCCTACAT 13032030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6013 TTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGCCACCCCTAGGCCTACAT 6072

 13032031 TTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTTTTTACCAGTTTTTTTCA 13032090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6073 TTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTTTTTACCAGTTTTTTTCA 6132

 13032091 TTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGCTATGTGGTGGGCTCTAC 13032150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6133 TTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGCTATGTGGTGGGCTCTAC 6192

 13032151 TGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTTCTAGGAGGGTGATGGAG 13032210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6193 TGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTTCTAGGAGGGTGATGGAG 6252

 13032211 AGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAATTTTACAAAGTAATAATA 13032270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6253 AGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAATTTTACAAAGTAATAATA 6312

 13032271 AACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCTATAAATCATAAATGTTT 13032330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6313 AACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCTATAAATCATAAATGTTT 6372

 13032331 CAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAGTAGGTATGAAATTTTGT 13032390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6373 CAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAGTAGGTATGAAATTTTGT 6432

 13032391 GAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATTGGAAGAAAAGAGACTGA 13032450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6433 GAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATTGGAAGAAAAGAGACTGA 6492

 13032451 AAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCTCTGAAAATGTACGTGCA 13032510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6493 AAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCTCTGAAAATGTACGTGCA 6552

 13032511 TTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGTAGCAACTCCTTTATAAT 13032570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6553 TTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGTAGCAACTCCTTTATAAT 6612

 13032571 ATTAATATTCTTTCCTTGTTCCTCTTCCCAACATGTATGTACCCACAGAAAGCCTCATAT 13032630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6613 ATTAATATTCTTTCCTTGTTCCTCTTCCCAACATGTATGTACCCACAGAAAGCCTCATAT 6672

 13032631 AAGACTCAAAATTGCTTAGGTTTTAAAAAAAATTTTCAGATTAAAAAAAATCCAACCTTG 13032690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6673 AAGACTCAAAATTGCTTAGGTTTTAAAAAAAATTTTCAGATTAAAAAAAATCCAACCTTG 6732

 13032691 CTTTTAGTTAATAGCTGCATAGATGTTAGATTTTCAAAATGACAAGTGGAAAATTTTCCC 13032750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6733 CTTTTAGTTAATAGCTGCATAGATGTTAGATTTTCAAAATGACAAGTGGAAAATTTTCCC 6792

 13032751 ATTCACTCACATTAGGCCAACCATATTTACTGTATCAACAGTATGAATTTCCAGTGTGTC 13032810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6793 ATTCACTCACATTAGGCCAACCATATTTACTGTATCAACAGTATGAATTTCCAGTGTGTC 6852

 13032811 AACAGGTTATTTTAAAGAAGGTCTTTCATGAGATTTCTCTCTCTGCAGACTATGAATCAT 13032870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6853 AACAGGTTATTTTAAAGAAGGTCTTTCATGAGATTTCTCTCTCTGCAGACTATGAATCAT 6912

 13032871 GCAAATTAACCCATCACTAGAGATATCTGAGTGTGTGTGTGTACATATATTTTCTGTGTA 13032930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6913 GCAAATTAACCCATCACTAGAGATATCTGAGTGTGTGTGTGTACATATATTTTCTGTGTA 6972

 13032931 ATAAATTGAGGCTATAAAACTGTTCTGTCCCCAAAAAGGAAACTACAGCATTCTGTGACT 13032990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6973 ATAAATTGAGGCTATAAAACTGTTCTGTCCCCAAAAAGGAAACTACAGCATTCTGTGACT 7032

 13032991 GTATGTGTTGGAGTATGTATTGCTTGGAGGAAAAAATAAGCAGATATCAGCAACCAGAAA 13033050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7033 GTATGTGTTGGAGTATGTATTGCTTGGAGGAAAAAATAAGCAGATATCAGCAACCAGAAA 7092

 13033051 TAGAAAGCTATATGCTTACATCACGGATAAAATAACCCATAAACCATTCCTGATTCAGCA 13033110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7093 TAGAAAGCTATATGCTTACATCACGGATAAAATAACCCATAAACCATTCCTGATTCAGCA 7152

 13033111 CCCAATATCTTGCTAGCTACACACTGTTAAAATGTCTCCATATACCTAAAGTTGTCTATC 13033170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7153 CCCAATATCTTGCTAGCTACACACTGTTAAAATGTCTCCATATACCTAAAGTTGTCTATC 7212

 13033171 CTGGAAATGTCAAACTTCTGTCTACCATAGATAAAATTATCAGGCAACATTTATTATTTT 13033230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7213 CTGGAAATGTCAAACTTCTGTCTACCATAGATAAAATTATCAGGCAACATTTATTATTTT 7272

 13033231 TTCAGATTTTTTATGACATTTATTACAATCCAGAATTATTCATTTGTTGTCTCTCATTGC 13033290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7273 TTCAGATTTTTTATGACATTTATTACAATCCAGAATTATTCATTTGTTGTCTCTCATTGC 7332

 13033291 CTTCCCAAACCAGAATGTAAATTTTGCAGGAAAAGGGACCATATCTGTTTTGCTCATCCC 13033350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7333 CTTCCCAAACCAGAATGTAAATTTTGCAGGAAAAGGGACCATATCTGTTTTGCTCATCCC 7392

 13033351 TATGTCCCTAACAACTTGTACCTGTCATACCACAAGTGCTTAATAAATATGCAAATAAAT 13033410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7393 TATGTCCCTAACAACTTGTACCTGTCATACCACAAGTGCTTAATAAATATGCAAATAAAT 7452

 13033411 ATGCGCTGTAAAAATATCGTATG 13033433
          |||||||||||||||||||||||
     7453 ATGCGCTGTAAAAATATCGTATG 7475

Alignment time is 8.60077 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2596] =>      2596 nucs 'mol-32-331c-095559_2596'

Score:        2595
Aligned:      2595        nucs
Identic:      2595 (100%) nucs =>       798 (100%)      1797 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019510,13020307] EXCISED REGION [13020309,13022105]
 second seq =>  [       1,     798] EXCISED REGION [     800,    2596]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [799,799]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019510 GCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTG 13019569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTG 60

 13019570 TCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATAT 13019629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATAT 120

 13019630 GGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAA 13019689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAA 180

 13019690 GAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATT 13019749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATT 240

 13019750 CTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAA 13019809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAA 300

 13019810 TCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAAT 13019869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAAT 360

 13019870 AAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACAT 13019929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACAT 420

 13019930 TGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTT 13019989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTT 480

 13019990 CTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAAC 13020049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAAC 540

 13020050 CTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATT 13020109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATT 600

 13020110 TTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAG 13020169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAG 660

 13020170 TTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTT 13020229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTT 720

 13020230 CCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAA 13020289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAA 780

 13020290 TGCTTACACATAATAAGC 13020307
          ||||||||||||||||||
      781 TGCTTACACATAATAAGC 798

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 859

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 919

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 979

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 1039

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 1099

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 1159

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 1219

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 1279

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 1339

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 1399

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 1459

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 1519

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 1579

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 1639

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 1699

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 1759

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 1819

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 1879

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 1939

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 1999

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 2059

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 2119

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 2179

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 2239

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 2299

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 2359

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 2419

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 2479

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 2539

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATA 13022105
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATA 2596

Alignment time is 3.04375 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5234] =>      5234 nucs 'mol-32-331c-103054_5234'

Score:        5212
Aligned:      5234        nucs
Identic:      5232 (100%) nucs =>       356 (100%)      4876 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019752,13020107] EXCISED REGION [13020109,13024986]
 second seq =>  [       1,     356] EXCISED REGION [     357,    5234]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020108,13020108]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [556,556]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [13020108,13020119] to [13020109,13020120]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019752 GCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATC 13019811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATC 60

 13019812 AGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAA 13019871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAA 120

 13019872 GTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTG 13019931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTG 180

 13019932 TGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCT 13019991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCT 240

 13019992 TTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCT 13020051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCT 300

 13020052 ACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGA 13020107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGA 356

EXCISED REGION

 13020109 TTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAA 13020168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 TTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAA 416

 13020169 GTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACT 13020228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 GTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACT 476

 13020229 TCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATA 13020288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATA 536

 13020289 ATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGA 13020348
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 ATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGA 596

 13020349 AATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAA 13020408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 AATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAA 656

 13020409 CTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAA 13020468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 CTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAA 716

 13020469 AAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAG 13020528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 AAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAG 776

 13020529 GGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGT 13020588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 GGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGT 836

 13020589 TTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGT 13020648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGT 896

 13020649 CATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCC 13020708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 CATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCC 956

 13020709 AATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTC 13020768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 AATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTC 1016

 13020769 CCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAG 13020828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAG 1076

 13020829 TTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGC 13020888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGC 1136

 13020889 CAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATG 13020948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATG 1196

 13020949 TTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTT 13021008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTT 1256

 13021009 AGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAAT 13021068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAAT 1316

 13021069 ACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTT 13021128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 ACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTT 1376

 13021129 TTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTA 13021188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTA 1436

 13021189 ATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTA 13021248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTA 1496

 13021249 AAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCT 13021308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCT 1556

 13021309 ACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACA 13021368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 ACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACA 1616

 13021369 CTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAAC 13021428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAAC 1676

 13021429 ACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAG 13021488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 ACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAG 1736

 13021489 CTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTC 13021548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTC 1796

 13021549 TATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATA 13021608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATA 1856

 13021609 AAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTA 13021668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 AAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTA 1916

 13021669 TTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATC 13021728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATC 1976

 13021729 CACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAG 13021788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 CACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAG 2036

 13021789 ATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCT 13021848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 ATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCT 2096

 13021849 GAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTT 13021908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 GAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTT 2156

 13021909 TCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATAT 13021968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATAT 2216

 13021969 TGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCA 13022028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCA 2276

 13022029 GTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATC 13022088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 GTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATC 2336

 13022089 AGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTC 13022148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTC 2396

 13022149 CTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGA 13022208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGA 2456

 13022209 GCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAG 13022268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAG 2516

 13022269 TCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTT 13022328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTT 2576

 13022329 CTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTT 13022388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTT 2636

 13022389 AGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAG 13022448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAG 2696

 13022449 ATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTA 13022508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTA 2756

 13022509 ACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAA 13022568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 ACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAA 2816

 13022569 AGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGG 13022628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 AGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGG 2876

 13022629 GATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGT 13022688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 GATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGT 2936

 13022689 TGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTA 13022748
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2937 TGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCCTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTA 2996

 13022749 TATATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTA 13022808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TATATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTA 3056

 13022809 ATAATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAG 13022868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 ATAATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAG 3116

 13022869 TATACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGAT 13022928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TATACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGAT 3176

 13022929 GTCTCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATA 13022988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 GTCTCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATA 3236

 13022989 TTCCAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGT 13023048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TTCCAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGT 3296

 13023049 GAACTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGAC 13023108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GAACTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGAC 3356

 13023109 AGAATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAG 13023168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AGAATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAG 3416

 13023169 AGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAG 13023228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATGTAGATAGGCAG 3476

 13023229 ATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCT 13023288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCCTGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCT 3536

 13023289 TGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGA 13023348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGAGTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGA 3596

 13023349 AATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTG 13023408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCTGATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTG 3656

 13023409 AATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCA 13023468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 AATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGAAAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCA 3716

 13023469 CAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCAT 13023528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGTTCCTGGTGTACTGGGACATGCAT 3776

 13023529 TCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATC 13023588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAGCAACAGACTTGGATGAAGCAATC 3836

 13023589 TGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTG 13023648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCTGTGAATACTTTCTCCTTTCCTTG 3896

 13023649 GCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAG 13023708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 GCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTGGAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAG 3956

 13023709 GCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTT 13023768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAAGGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTT 4016

 13023769 CCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATT 13023828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGGAGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATT 4076

 13023829 TCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAA 13023888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 TCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTACTTTACACAGTTAATCTAACAAA 4136

 13023889 TCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTA 13023948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGAGCAGAATTGAAAGAAACTTTTTA 4196

 13023949 CTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGT 13024008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 CTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCTGACCATTTGAAAGTTTAAAAGGT 4256

 13024009 CCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTAC 13024068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGAAACTTAAAATGGTCTGGGAGTAC 4316

 13024069 CTTTCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAA 13024128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 CTTTCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATTTCCCTGAAATTGCATTCCTGCAA 4376

 13024129 AAAAAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTG 13024188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 AAAAAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGGTCTTTAATAATGCACTTACCTTG 4436

 13024189 TTCTGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCT 13024248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TTCTGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGTCTGGGTAAGGCTGAACCACTTCT 4496

 13024249 CACATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCA 13024308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 CACATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAACATTGTTTTCCTAAATCTACTTCAGCA 4556

 13024309 TCTTTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAAT 13024368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TCTTTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCATATTTGCCCATATGTGTAGCAATAAAT 4616

 13024369 AGGAAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAA 13024428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 AGGAAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCTTCAATGACAGTGTCCTGAACAAA 4676

 13024429 TGGAGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTC 13024488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TGGAGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGATTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTC 4736

 13024489 AGAATATTGCCAAAGATGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCAT 13024548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 AGAATATTGCCAAAGATGGGCACAATATGACTGAAATTATATATTTACTGAGAAGAGCAT 4796

 13024549 GATTTGTACTTGTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATG 13024608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 GATTTGTACTTGTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATCCAATACTTTGCTACCCTTCTATG 4856

 13024609 TAGAATTTCTGTCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGG 13024668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TAGAATTTCTGTCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATTCACATTATCATAGTTGAAACTGG 4916

 13024669 AATTCTGGTTTTATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTT 13024728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 AATTCTGGTTTTATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAAAAAATCATTATGTCTTCTGCTTT 4976

 13024729 AGAGGAGATTTTGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTG 13024788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 AGAGGAGATTTTGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGTATTGTGTCAGCTTGGTTACACTG 5036

 13024789 GAATGATGTTTCTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAG 13024848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 GAATGATGTTTCTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTCCTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAG 5096

 13024849 GTGGAAGTGAATTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAA 13024908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 GTGGAAGTGAATTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCCAGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAA 5156

 13024909 AACCCAGATGTGAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGA 13024968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 AACCCAGATGTGAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCACTCTCCCCAGGTTATCACTCCTGA 5216

 13024969 TTGCTGGCTCTGCTGCCC 13024986
          ||||||||||||||||||
     5217 TTGCTGGCTCTGCTGCCC 5234

Alignment time is 5.9907 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4861] =>      4861 nucs 'mol-32-3327-072648_4861'

Score:        4861
Aligned:      4861        nucs
Identic:      4861 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13025781,13030641]
 second seq =>  [       1,    4861]

 13025781 AGATTTATAGTAAATTTGATAAGATATTTTTTCTAACAAAAAGTCATTGAGTTTAGCCAC 13025840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATTTATAGTAAATTTGATAAGATATTTTTTCTAACAAAAAGTCATTGAGTTTAGCCAC 60

 13025841 TTGAAATAATATTTTAAAAGAACAGACAAAACGAACTGATGAATTGGTTAGAATTGGAAT 13025900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAAATAATATTTTAAAAGAACAGACAAAACGAACTGATGAATTGGTTAGAATTGGAAT 120

 13025901 TAAAAGACTAACAAAAAGTTTTTAATGATTTTTCAAAAGATCTAAGCTTGTAAATAAGCT 13025960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAAGACTAACAAAAAGTTTTTAATGATTTTTCAAAAGATCTAAGCTTGTAAATAAGCT 180

 13025961 AGGTTTTTTAAAAATAAGAAACCATTTTTACATGGAGAAATGGCAAAAATGATTAATAAT 13026020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTTTTTTAAAAATAAGAAACCATTTTTACATGGAGAAATGGCAAAAATGATTAATAAT 240

 13026021 TTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATATGGCTACCAATTAAAAATTATATATGTGA 13026080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCACCTTTTAATTTTTACTTTTTAAAAATATGGCTACCAATTAAAAATTATATATGTGA 300

 13026081 CTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCAAAGAGTATATGGAGACTTGAGGTAAAGTC 13026140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGTATTTTATTTCTCTTAGTGCTGATTCAAAGAGTATATGGAGACTTGAGGTAAAGTC 360

 13026141 TCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAGCTTCCACTTCAGCTTTCCAGATCTTTCCA 13026200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATTCAGATGAATCTGAGAGGCCAGAAAAGCTTCCACTTCAGCTTTCCAGATCTTTCCA 420

 13026201 TTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTAGTTTTTACTACATAATTCATAAAAATTTG 13026260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCCAGGGGACCTTTGCAAAGTATATTTTAGTTTTTACTACATAATTCATAAAAATTTG 480

 13026261 ATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTATGCCTTAGTAAATTTCCGTGT 13026320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTTTTACTGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTATGCCTTAGTAAATTTCCGTGT 540

 13026321 ATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACAATAAAGAGGAAAAAACAATGAGGAAAAAA 13026380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTAAAAATATTTCTTCAGAAACGTAGACAATAAAGAGGAAAAAACAATGAGGAAAAAA 600

 13026381 CAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTACGAATTAGTATATATCCATGTATTT 13026440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGCCAGTTAAAATTACTGGCTACTTGTGCCTGTACGAATTAGTATATATCCATGTATTT 660

 13026441 AAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAGAGAGGAAAAAACAATAACATTTTAATATT 13026500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAATATTTCTTCAGAAACTTGGAAAATAGAGAGGAAAAAACAATAACATTTTAATATT 720

 13026501 AGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGCATATCAATAGCTTTTCTTTTACAACACAA 13026560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTATTAAATGCTAATACCATCATTGTTAGCATATCAATAGCTTTTCTTTTACAACACAA 780

 13026561 AAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAGTGAACACGTGAAAAAGACTATTGGAAACA 13026620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATCTCATTTGAAATAAGTAAAAACATAAGTGAACACGTGAAAAAGACTATTGGAAACA 840

 13026621 AAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATTATGTAATTAAAAATACAGAAAAGTTTTGC 13026680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGCCTTTTTAAGAACAGCAAACATGACATTATGTAATTAAAAATACAGAAAAGTTTTGC 900

 13026681 CAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTGGTAGATATTTGGTAGAATAAGAGATGGGA 13026740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAACGAATATTACATTCACGAGTTTTTAGTGGTAGATATTTGGTAGAATAAGAGATGGGA 960

 13026741 CGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGATAACCATGCTGTTTATAGCTA 13026800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGTATCAGCATACCCATATTACTTGGAGTTGGTTCTTGATAACCATGCTGTTTATAGCTA 1020

 13026801 ATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATATTAGGTTACATTGCTGCATTTG 13026860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTATTTTTGTATAGTCAGAATAATATTTGGTATAATATTAGGTTACATTGCTGCATTTG 1080

 13026861 AACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAATAACCAATCTTGGATTTTTCTT 13026920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTATCAATTTAGAGTTTAATTATCTTGCCTGTTGAATAACCAATCTTGGATTTTTCTT 1140

 13026921 TTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTTGTATTGTTTTTAGAATGACTT 13026980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCTGTGCAATTTCATTTGTGCCATTTCTAACCATGTTGTATTGTTTTTAGAATGACTT 1200

 13026981 TCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTATA 13027040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTCTTCAAATAACAAGTAGCCAAACTCCTTGAAAAAGGTATAGTGCTCTATCAGTATA 1260

 13027041 AAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGCA 13027100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGTTGGGTTACCAGGTTTGGCAGCCAACACAATTTAATGAGTAAACAAACACTCTGCA 1320

 13027101 GAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAAT 13027160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAACTTAGACCTGCTTAACCCCTTCAGGCAATTTTAAGTATTTTAATTCTGCCAGAAAT 1380

 13027161 GTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATTC 13027220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAACCTACTGTTTTAATGAATAGTCAGAAAATATCCTTAATACTTGTGGATATTGATTC 1440

 13027221 CAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTGA 13027280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGCTGGAGATGCCTATCACCTGAGTTGACATTTAATATCTTTTCAAGGGATTCTCTTGA 1500

 13027281 ATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTATC 13027340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTGGAAATAAAAGAAAAAAAAGAACTAAACTTGCTTTATCATTCTTGAAAGTATTTATC 1560

 13027341 AAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGTC 13027400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATTGAAAGAACCTCAGATTTTAAAAAGTAAACCACCTTAGGGAAAAAGCATAAATGTC 1620

 13027401 ATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAGC 13027460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTGCTGCCTAACTAGGTTTTAGGAGTCCAGAAGTCGGAGGGGGCCTTTATAGACAAAGC 1680

 13027461 CTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAGT 13027520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGATTCTGAAATAGTTTTGATTCCTGTATCTGAGAATATATCAGTCCTATTTGTACAGT 1740

 13027521 GTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCTG 13027580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTATGTGGTCATGGAAGTTATCAGCATATTAAAATGTATTCCACATGGATACTTTTTCTG 1800

 13027581 CCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGGC 13027640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCATTCTTCTCATTTCGTACTCCTAACCTTGTAAAGTAGGAAAAGAAATTTAAAAGGGGC 1860

 13027641 ATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGAA 13027700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGTCATTCAGAATAATATATTTATGCTACTTGGCTAAATATCAAACTATGGAATGTGAA 1920

 13027701 GGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAA 13027760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGACATGGAAATTCCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAA 1980

 13027761 CAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGA 13027820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAACAATAATTTAAAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGA 2040

 13027821 GAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATG 13027880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGGCCGTGGCATTTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATG 2100

 13027881 TTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTG 13027940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAACAGAGGTGCTACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTG 2160

 13027941 CTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTA 13028000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCCCTCTCCTCCAGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTA 2220

 13028001 GTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTT 13028060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTCCACTGTTGCAGAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTT 2280

 13028061 TCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAAC 13028120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCCTACTCAGTACCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAAC 2340

 13028121 TACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGT 13028180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACTGGGACCCCTATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGT 2400

 13028181 GGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGA 13028240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGGGCAAGCTAAGAAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGA 2460

 13028241 GCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGT 13028300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCAGATGTACTCTTGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGT 2520

 13028301 ACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAA 13028360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACCACCCAGGAGGAAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAA 2580

 13028361 ACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAAT 13028420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTGCCTTTATTTGGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAAT 2640

 13028421 TATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAA 13028480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATGGAGATCTTGGCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAA 2700

 13028481 TGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCC 13028540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGCAGAGCAACCAAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCC 2760

 13028541 CTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAA 13028600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCTTGGGATCATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAA 2820

 13028601 CAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATC 13028660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAACCAGAGATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATC 2880

 13028661 AAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGC 13028720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGC 2940

 13028721 CGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 13028780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 3000

 13028781 CGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACT 13028840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACT 3060

 13028841 CTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTT 13028900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAGCCTGGGCTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTT 3120

 13028901 GAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAG 13028960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAAGCATCCCCACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAG 3180

 13028961 GCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGC 13029020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCTTAAGAACAGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGC 3240

 13029021 TGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACT 13029080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGCTCCTAGGAGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACT 3300

 13029081 GTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACT 13029140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTATATGCCCAAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACT 3360

 13029141 TGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTC 13029200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGGCTGTGGCAAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTC 3420

 13029201 CAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGA 13029260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGGCCACCAGCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGA 3480

 13029261 ATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACA 13029320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATGAGGCCAAGAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACA 3540

 13029321 CTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAA 13029380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTTGGAGGGAATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAA 3600

 13029381 GGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAA 13029440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGACCCAGCAAACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAA 3660

 13029441 AAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGG 13029500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAATAAACCTAAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGG 3720

 13029501 AAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATC 13029560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAAATGTAACCCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATC 3780

 13029561 CTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATAT 13029620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTAATGGTAGGATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATAT 3840

 13029621 TCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTAT 13029680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCAAAGACTAAAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTAT 3900

 13029681 TAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGA 13029740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAAATAGAGAATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGA 3960

 13029741 AAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCA 13029800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAGTAAAAAAAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCA 4020

 13029801 AACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAA 13029860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AACTGAAGATAGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAA 4080

 13029861 ACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGT 13029920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACGAAAAACTTAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGT 4140

 13029921 AATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCT 13029980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AATGAGTGTACCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCT 4200

 13029981 GGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAAT 13030040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGAAATTCCCTAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAAT 4260

 13030041 CTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAA 13030100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTAAGTAGGACAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAA 4320

 13030101 GATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTC 13030160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GATAGATGCAAATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTC 4380

 13030161 CAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATA 13030220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CAGTAACATGAAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATA 4440

 13030221 ACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAG 13030280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ACCAAAGTGCCGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAG 4500

 13030281 GATGTTGGGAAACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTG 13030340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GATGTTGGGAAACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTG 4560

 13030341 GGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTA 13030400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GGAAACATTTCAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTA 4620

 13030401 CTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGT 13030460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTCAGCTATGTATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGT 4680

 13030461 GTTCATAATAGCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAAC 13030520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTTCATAATAGCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAAC 4740

 13030521 TGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGG 13030580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGATGATTGGATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGG 4800

 13030581 AAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTA 13030640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AAAAGTACTGATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTA 4860

 13030641 T 13030641
          |
     4861 T 4861

Alignment time is 4.90735 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4820] =>      4820 nucs 'mol-32-3327-077736_4820'

Score:        4819
Aligned:      4819        nucs
Identic:      4819 (100%) nucs =>      1910 (100%)      2909 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018398,13020307] EXCISED REGION [13020309,13023217]
 second seq =>  [       1,    1910] EXCISED REGION [    1912,    4820]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [1911,1911]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018398 GAAAAATAGAACAGAATAGTATAAAATAGCTATAATTTCGTATGAGAATTCAGCATAAAA 13018457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAAATAGAACAGAATAGTATAAAATAGCTATAATTTCGTATGAGAATTCAGCATAAAA 60

 13018458 TTTGATTTCAAGTATTTATGTATGTAGTATTGAGGCAAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAA 13018517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGATTTCAAGTATTTATGTATGTAGTATTGAGGCAAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAA 120

 13018518 TATTGCATTTCTTCTGAACTCTTTTTAAATTTAAAAATAAAATTGAATTCATAATGAACC 13018577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTGCATTTCTTCTGAACTCTTTTTAAATTTAAAAATAAAATTGAATTCATAATGAACC 180

 13018578 AGGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTG 13018637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTG 240

 13018638 AGATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCA 13018697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCA 300

 13018698 TATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAG 13018757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAG 360

 13018758 CAATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAA 13018817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAA 420

 13018818 TTGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCT 13018877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCT 480

 13018878 GTAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGG 13018937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGG 540

 13018938 ATAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGC 13018997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGC 600

 13018998 ATGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGA 13019057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGA 660

 13019058 GGAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTG 13019117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTG 720

 13019118 AACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAA 13019177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAA 780

 13019178 AATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAA 13019237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAA 840

 13019238 TTAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTAT 13019297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTAT 900

 13019298 TTAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTC 13019357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTC 960

 13019358 TTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTC 13019417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTC 1020

 13019418 TAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAA 13019477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAA 1080

 13019478 ATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAA 13019537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAA 1140

 13019538 TTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTT 13019597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTT 1200

 13019598 TATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAAC 13019657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAAC 1260

 13019658 AATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGA 13019717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGA 1320

 13019718 GTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTA 13019777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTA 1380

 13019778 TTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGT 13019837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGT 1440

 13019838 TGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAG 13019897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAG 1500

 13019898 GTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAG 13019957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAG 1560

 13019958 AAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGA 13020017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGA 1620

 13020018 TATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAAC 13020077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAAC 1680

 13020078 TGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTT 13020137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTT 1740

 13020138 CCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAA 13020197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAA 1800

 13020198 TTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTT 13020257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTT 1860

 13020258 GTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 13020307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGC 1910

EXCISED REGION

 13020309 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 13020368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCA 1971

 13020369 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 13020428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 AAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAA 2031

 13020429 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 13020488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 AGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAAT 2091

 13020489 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 13020548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 ATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAAT 2151

 13020549 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 13020608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTT 2211

 13020609 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 13020668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 GCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAA 2271

 13020669 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 13020728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCAT 2331

 13020729 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 13020788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACC 2391

 13020789 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 13020848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTG 2451

 13020849 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 13020908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 ACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCT 2511

 13020909 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 13020968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 AATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCA 2571

 13020969 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 13021028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACT 2631

 13021029 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 13021088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACT 2691

 13021089 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 13021148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 AATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCC 2751

 13021149 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 13021208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 CAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGT 2811

 13021209 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 13021268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 AACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAAT 2871

 13021269 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 13021328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 TATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGT 2931

 13021329 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 13021388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 TCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTG 2991

 13021389 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 13021448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 CAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGAT 3051

 13021449 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 13021508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 GGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAG 3111

 13021509 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 13021568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 TCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTG 3171

 13021569 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 13021628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 TTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAA 3231

 13021629 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 13021688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 AAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCA 3291

 13021689 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 13021748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 TGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGG 3351

 13021749 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 13021808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 GAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCT 3411

 13021809 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 13021868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 ATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTC 3471

 13021869 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 13021928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 TGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCAC 3531

 13021929 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 13021988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 AATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCT 3591

 13021989 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 13022048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 TAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTAT 3651

 13022049 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 13022108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACT 3711

 13022109 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 13022168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 CTCTCATACCTCTTACTACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCT 3771

 13022169 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 13022228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 AGCCTTGTCCTAATTCATATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTT 3831

 13022229 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 13022288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 TTGCTTTCACAGAACACTTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTAC 3891

 13022289 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 13022348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 TTTGTGACTGCTTATTTTTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTT 3951

 13022349 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 13022408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 CTGGTGTTTATCAGGATTCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCAC 4011

 13022409 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 13022468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 TAGCCTCTATCATCCATTTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCT 4071

 13022469 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 13022528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 TTCACTCAGATCTCTCCTGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCT 4131

 13022529 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 13022588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 GTTTGAATGCTCCATAAGCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGC 4191

 13022589 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 13022648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 AATGAACCTCCTGTTTTGCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTG 4251

 13022649 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 13022708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 TGTAAGATATAAACTTTAAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGA 4311

 13022709 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 13022768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 CATCCAATCAGCCTTCAAAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCC 4371

 13022769 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 13022828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 ACTTCTCTGTAGGTCAACTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTG 4431

 13022829 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 13022888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 GAGCATTGTAATGGTTCCTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACG 4491

 13022889 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 13022948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 TTCTTAACAACTGGAGAATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCAT 4551

 13022949 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 13023008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 TCTGGGATTAGGCTCAGGCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAA 4611

 13023009 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 13023068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 GGATGAGACAAATATGGTTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAG 4671

 13023069 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 13023128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 CTGCCTTCCATACACCCAATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATAC 4731

 13023129 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 13023188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 TCCTATTCAGTAGGATACTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCG 4791

 13023189 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATG 13023217
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4792 GTCACTAGTCCCAAGCAAATTCTGAGATG 4820

Alignment time is 5.56619 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8626] =>      8626 nucs 'mol-32-34a8-174714_8626'

Score:        8560
Aligned:      8626        nucs
Identic:      8620 (100%) nucs =>      3510 (100%)      5110 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018591,13022101] EXCISED REGION [13028551,13033664]
 second seq =>  [       1,    3512] EXCISED REGION [    3513,    8626]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3512,3512] to [3513,3513]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018591 CATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGC 13018650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGC 60

 13018651 AAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTAT 13018710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTAT 120

 13018711 GTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATG 13018770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATG 180

 13018771 AACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTA 13018830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTA 240

 13018831 TGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATT 13018890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATT 300

 13018891 TCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGT 13018950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGT 360

 13018951 TTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTA 13019010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTA 420

 13019011 ATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTG 13019070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTG 480

 13019071 CAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGAT 13019130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGAT 540

 13019131 TGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTG 13019190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTG 600

 13019191 GGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTA 13019250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTA 660

 13019251 GATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAA 13019310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAA 720

 13019311 AAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTT 13019370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTT 780

 13019371 AGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTG 13019430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTG 840

 13019431 GTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAA 13019490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAA 900

 13019491 CAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGT 13019550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGT 960

 13019551 TATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAA 13019610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAA 1020

 13019611 TCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCT 13019670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCT 1080

 13019671 ATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAA 13019730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAA 1140

 13019731 AAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATC 13019790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATC 1200

 13019791 AAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAAC 13019850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAAC 1260

 13019851 AGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTC 13019910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTC 1320

 13019911 CTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACC 13019970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACC 1380

 13019971 ATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAG 13020030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAG 1440

 13020031 GGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCAC 13020090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCAC 1500

 13020091 CCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTT-ACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAG 13020149
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAG 1560

 13020150 CACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCT 13020209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCT 1620

 13020210 CCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGT 13020269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGT 1680

 13020270 ACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATA 13020329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1681 ACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATA 1740

 13020330 AATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTA 13020389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTA 1800

 13020390 GGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGT 13020449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGT 1860

 13020450 AGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGG 13020509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGG 1920

 13020510 TAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAG 13020569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAG 1980

 13020570 AATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATAT 13020629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATAT 2040

 13020630 TTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATC 13020689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATC 2100

 13020690 TTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCT 13020749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCT 2160

 13020750 CCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTT 13020809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTT 2220

 13020810 TCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCA 13020869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCA 2280

 13020870 CTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGA 13020929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGA 2340

 13020930 ACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAAC 13020989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAAC 2400

 13020990 TTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACAC 13021049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACAC 2460

 13021050 AGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGT 13021109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGT 2520

 13021110 ACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGT 13021169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGT 2580

 13021170 GCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATT 13021229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATT 2640

 13021230 ATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAAC 13021289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAAC 2700

 13021290 TGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAAC 13021349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAAC 2760

 13021350 CATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCT 13021409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCT 2820

 13021410 ATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTG 13021469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTG 2880

 13021470 ATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTC 13021529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTC 2940

 13021530 CAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCT 13021589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCT 3000

 13021590 CATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTA 13021649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTA 3060

 13021650 ATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACA 13021709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACA 3120

 13021710 AGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACA 13021769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACA 3180

 13021770 CAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTA 13021829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTA 3240

 13021830 TATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGAT 13021889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGAT 3300

 13021890 TGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGT 13021949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGT 3360

 13021950 TTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTG 13022009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTG 3420

 13022010 ATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAG 13022069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAG 3480

 13022070 GGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 13022101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACC 3512

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3572

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 3632

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 3692

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 13028790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 3752

 13028791 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 13028850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 3812

 13028851 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 13028910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 3872

 13028911 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 13028970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 3932

 13028971 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 13029030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 3992

 13029031 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 13029090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 4052

 13029091 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 13029150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 4112

 13029151 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 13029210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 4172

 13029211 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 13029270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 4232

 13029271 GAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGA 13029330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 GAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGA 4292

 13029331 ATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCA 13029390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 ATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCA 4352

 13029391 AACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCT 13029450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 AACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCT 4412

 13029451 AAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAAC 13029510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 AAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAAC 4472

 13029511 CCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAG 13029570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 CCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAG 4532

 13029571 GATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTA 13029630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 GATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTA 4592

 13029631 AAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGA 13029690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 AAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGA 4652

 13029691 ATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAA 13029750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 ATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAA 4712

 13029751 AAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGAT 13029810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 AAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGAT 4772

 13029811 AGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACT 13029870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 AGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACT 4832

 13029871 TAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTA 13029930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 TAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTA 4892

 13029931 CCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCC 13029990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 CCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCC 4952

 13029991 TAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGA 13030050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 TAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGA 5012

 13030051 CAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCA 13030110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 CAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCA 5072

 13030111 AATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATG 13030170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 AATCTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATG 5132

 13030171 AAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGC 13030230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 AAGAATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGC 5192

 13030231 CGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGA 13030290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 CGAAAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGA 5252

 13030291 AACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTT 13030350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 AACTGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTT 5312

 13030351 CAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATG 13030410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 CAGCAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATG 5372

 13030411 TATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATA 13030470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 TATATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATA 5432

 13030471 GCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGG 13030530
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5433 GCATTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCTACTGATGATTGG 5492

 13030531 ATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTG 13030590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 ATAAAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTG 5552

 13030591 ATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCG 13030650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 ATGTATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCG 5612

 13030651 TTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCT 13030710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 TTTATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCT 5672

 13030711 AGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGA 13030770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5673 AGCACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGA 5732

 13030771 GAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGT 13030830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5733 GAAAGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGT 5792

 13030831 TGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATA 13030890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5793 TGGAGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATA 5852

 13030891 CTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCAC 13030950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5853 CTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCAC 5912

 13030951 ACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGT 13031010
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
     5913 ACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGCTGGT 5972

 13031011 CTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAAAGTGCTGGGATTACAGG 13031070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5973 CTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAAAGTGCTGGGATTACAGG 6032

 13031071 CGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGATTTTGTGGTAATGGTTAC 13031130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6033 CGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGATTTTGTGGTAATGGTTAC 6092

 13031131 ACAATCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTCAAATGAGTGAATAGTAT 13031190
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6093 ACAGTCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTCAAATGAGTGAATAGTAT 6152

 13031191 GTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGTGATCTGTGAAGGCAATG 13031250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6153 GTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGTGATCTGTGAAGGCAATG 6212

 13031251 GTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTTAATTATGTCCCTTGTAT 13031310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6213 GTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTTAATTATGTCCCTTGTAT 6272

 13031311 CCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAATTGATCACTACTTTTACT 13031370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6273 CCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAATTGATCACTACTTTTACT 6332

 13031371 ACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAAAAGGACATTTTCAATAT 13031430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6333 ACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAAAAGGACATTTTCAATAT 6392

 13031431 ATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCTTTATGTACATGATAGTC 13031490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6393 ATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCTTTATGTACATGATAGTC 6452

 13031491 ATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTGGCTAGCTACAAACCAGA 13031550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6453 ATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTGGCTAGCTACAAACCAGA 6512

 13031551 TGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATATGTTTCCTCCCTTTTCA 13031610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6513 TGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATATGTTTCCTCCCTTTTCA 6572

 13031611 GAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGCTTTTAAATGGCCTATCT 13031670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6573 GAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGCTTTTAAATGGCCTATCT 6632

 13031671 TTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTATGAAATGCCTGCTACTGT 13031730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6633 TTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTATGAAATGCCTGCTACTGT 6692

 13031731 TCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACAAATTAGTTTTGCAGACA 13031790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6693 TCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACAAATTAGTTTTGCAGACA 6752

 13031791 TTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTCCTGGGATTAACACTCAG 13031850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6753 TTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTCCTGGGATTAACACTCAG 6812

 13031851 TTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGTTTCGCTGTAGGAAATGG 13031910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6813 TTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGTTTCGCTGTAGGAAATGG 6872

 13031911 TAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTTGTTGAGCTCTGCATATT 13031970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6873 TAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTTGTTGAGCTCTGCATATT 6932

 13031971 TTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGCCACCCCTAGGCCTACAT 13032030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6933 TTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGCCACCCCTAGGCCTACAT 6992

 13032031 TTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTTTTTACCAGTTTTTTTCA 13032090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6993 TTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTTTTTACCAGTTTTTTTCA 7052

 13032091 TTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGCTATGTGGTGGGCTCTAC 13032150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7053 TTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGCTATGTGGTGGGCTCTAC 7112

 13032151 TGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTTCTAGGAGGGTGATGGAG 13032210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7113 TGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTTCTAGGAGGGTGATGGAG 7172

 13032211 AGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAATTTTACAAAGTAATAATA 13032270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7173 AGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAATTTTACAAAGTAATAATA 7232

 13032271 AACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCTATAAATCATAAATGTTT 13032330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7233 AACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCTATAAATCATAAATGTTT 7292

 13032331 CAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAGTAGGTATGAAATTTTGT 13032390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7293 CAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAGTAGGTATGAAATTTTGT 7352

 13032391 GAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATTGGAAGAAAAGAGACTGA 13032450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7353 GAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATTGGAAGAAAAGAGACTGA 7412

 13032451 AAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCTCTGAAAATGTACGTGCA 13032510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7413 AAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCTCTGAAAATGTACGTGCA 7472

 13032511 TTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGTAGCAACTCCTTTATAAT 13032570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7473 TTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGTAGCAACTCCTTTATAAT 7532

 13032571 ATTAATATTCTTTCCTTGTTCCTCTTCCCAACATGTATGTACCCACAGAAAGCCTCATAT 13032630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7533 ATTAATATTCTTTCCTTGTTCCTCTTCCCAACATGTATGTACCCACAGAAAGCCTCATAT 7592

 13032631 AAGACTCAAAATTGCTTAGGTTTTAAAAAAAATTTTCAGATTAAAAAAAATCCAACCTTG 13032690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7593 AAGACTCAAAATTGCTTAGGTTTTAAAAAAAATTTTCAGATTAAAAAAAATCCAACCTTG 7652

 13032691 CTTTTAGTTAATAGCTGCATAGATGTTAGATTTTCAAAATGACAAGTGGAAAATTTTCCC 13032750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7653 CTTTTAGTTAATAGCTGCATAGATGTTAGATTTTCAAAATGACAAGTGGAAAATTTTCCC 7712

 13032751 ATTCACTCACATTAGGCCAACCATATTTACTGTATCAACAGTATGAATTTCCAGTGTGTC 13032810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7713 ATTCACTCACATTAGGCCAACCATATTTACTGTATCAACAGTATGAATTTCCAGTGTGTC 7772

 13032811 AACAGGTTATTTTAAAGAAGGTCTTTCATGAGATTTCTCTCTCTGCAGACTATGAATCAT 13032870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7773 AACAGGTTATTTTAAAGAAGGTCTTTCATGAGATTTCTCTCTCTGCAGACTATGAATCAT 7832

 13032871 GCAAATTAACCCATCACTAGAGATATCTGAGTGTGTGTGTGTACATATATTTTCTGTGTA 13032930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7833 GCAAATTAACCCATCACTAGAGATATCTGAGTGTGTGTGTGTACATATATTTTCTGTGTA 7892

 13032931 ATAAATTGAGGCTATAAAACTGTTCTGTCCCCAAAAAGGAAACTACAGCATTCTGTGACT 13032990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7893 ATAAATTGAGGCTATAAAACTGTTCTGTCCCCAAAAAGGAAACTACAGCATTCTGTGACT 7952

 13032991 GTATGTGTTGGAGTATGTATTGCTTGGAGGAAAAAATAAGCAGATATCAGCAACCAGAAA 13033050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7953 GTATGTGTTGGAGTATGTATTGCTTGGAGGAAAAAATAAGCAGATATCAGCAACCAGAAA 8012

 13033051 TAGAAAGCTATATGCTTACATCACGGATAAAATAACCCATAAACCATTCCTGATTCAGCA 13033110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8013 TAGAAAGCTATATGCTTACATCACGGATAAAATAACCCATAAACCATTCCTGATTCAGCA 8072

 13033111 CCCAATATCTTGCTAGCTACACACTGTTAAAATGTCTCCATATACCTAAAGTTGTCTATC 13033170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8073 CCCAATATCTTGCTAGCTACACACTGTTAAAATGTCTCCATATACCTAAAGTTGTCTATC 8132

 13033171 CTGGAAATGTCAAACTTCTGTCTACCATAGATAAAATTATCAGGCAACATTTATTATTTT 13033230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8133 CTGGAAATGTCAAACTTCTGTCTACCATAGATAAAATTATCAGGCAACATTTATTATTTT 8192

 13033231 TTCAGATTTTTTATGACATTTATTACAATCCAGAATTATTCATTTGTTGTCTCTCATTGC 13033290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8193 TTCAGATTTTTTATGACATTTATTACAATCCAGAATTATTCATTTGTTGTCTCTCATTGC 8252

 13033291 CTTCCCAAACCAGAATGTAAATTTTGCAGGAAAAGGGACCATATCTGTTTTGCTCATCCC 13033350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8253 CTTCCCAAACCAGAATGTAAATTTTGCAGGAAAAGGGACCATATCTGTTTTGCTCATCCC 8312

 13033351 TATGTCCCTAACAACTTGTACCTGTCATACCACAAGTGCTTAATAAATATGCAAATAAAT 13033410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8313 TATGTCCCTAACAACTTGTACCTGTCATACCACAAGTGCTTAATAAATATGCAAATAAAT 8372

 13033411 ATGCGCTGTAAAAATATCGTATGCATTTGGAGAGAGAGATTGTAGACTGATTAGTCCATT 13033470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8373 ATGCGCTGTAAAAATATCGTATGCATTTGGAGAGAGAGATTGTAGACTGATTAGTCCATT 8432

 13033471 ATATATTAAAAAATAATTTATTAATGAAATCCCTTTCCCCCAATTTTTCCTCTCAGAATG 13033530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8433 ATATATTAAAAAATAATTTATTAATGAAATCCCTTTCCCCCAATTTTTCCTCTCAGAATG 8492

 13033531 TTTTTAATGTTAATTACTCTTAATTTGTACTTCACTAAGTTTATAAGTTCTTCTCAGATT 13033590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8493 TTTTTAATGTTAATTACTCTTAATTTGTACTTCACTAAGTTTATAAGTTCTTCTCAGATT 8552

 13033591 TAAGACTTTTTGAGACACACACAGACATACACCCTGCAAGTGTAATTTTGGTAAAAGAAT 13033650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8553 TAAGACTTTTTGAGACACACACAGACATACACCCTGCAAGTGTAATTTTGGTAAAAGAAT 8612

 13033651 CACTGATACTGAAG 13033664
          ||||||||||||||
     8613 CACTGATACTGAAG 8626

Alignment time is 10.0035 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3516] =>      3516 nucs 'mol-32-34a8-174714_3516'

Score:        3504
Aligned:      3515        nucs
Identic:      3514 (100%) nucs =>      1517 (100%)      1997 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018591,13020107] EXCISED REGION [13020108,13022105]
 second seq =>  [       1,    1517] EXCISED REGION [    1519,    3516]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1518,1518]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [13020308,13020308]
 second seq =>         1 nucs [1719,1719]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [1518,1530] to [1519,1531]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018591 CATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGC 13018650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATTGGTGAATAGATTTTACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGC 60

 13018651 AAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTAT 13018710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACATCTGTATTACTTTAATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTAT 120

 13018711 GTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATG 13018770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAAATATAACCTGTGGCTAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATG 180

 13018771 AACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTA 13018830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACATCTTTTCACAAATGAATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTA 240

 13018831 TGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATT 13018890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGATGTACTCACATTTTTAGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATT 300

 13018891 TCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGT 13018950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAACTTCAAATGTTAAGAAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGT 360

 13018951 TTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTA 13019010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTGAAATGAAAGTGACATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTA 420

 13019011 ATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTG 13019070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGAACTTGTTAGATAGTTAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTG 480

 13019071 CAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGAT 13019130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGAGCGTTGTGGATCTGTGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGAT 540

 13019131 TGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTG 13019190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAACAAAACGAGAAGAGTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTG 600

 13019191 GGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTA 13019250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAAGACATCAAAGATATCTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTA 660

 13019251 GATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAA 13019310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATTCAGTTCCAGGAAATATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAA 720

 13019311 AAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTT 13019370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAATATATCTTGTCAAAATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTT 780

 13019371 AGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTG 13019430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAATCTCACAACTCTTTTAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTG 840

 13019431 GTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAA 13019490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAA 900

 13019491 CAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGT 13019550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGT 960

 13019551 TATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAA 13019610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAA 1020

 13019611 TCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCT 13019670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCT 1080

 13019671 ATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAA 13019730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAA 1140

 13019731 AAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATC 13019790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATC 1200

 13019791 AAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAAC 13019850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAAC 1260

 13019851 AGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTC 13019910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTC 1320

 13019911 CTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACC 13019970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACC 1380

 13019971 ATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAG 13020030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAG 1440

 13020031 GGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCAC 13020090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCAC 1500

 13020091 CCATTCCTTCATCTGGA 13020107
          |||||||||||||||||
     1501 CCATTCCTTCATCTGGA 1517

EXCISED REGION

 13020108 TTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAA 13020167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 TTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAA 1578

 13020168 AGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAAC 13020227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 AGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAAC 1638

 13020228 TTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAAT 13020287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAAT 1698

 13020288 AATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAG 13020347
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 AATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAG 1758

 13020348 AAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTA 13020407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTA 1818

 13020408 ACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTA 13020467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 ACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTA 1878

 13020468 AAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAA 13020527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 AAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAA 1938

 13020528 GGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAG 13020587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 GGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAG 1998

 13020588 TTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGG 13020647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGG 2058

 13020648 TCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATC 13020707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 TCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATC 2118

 13020708 CAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATT 13020767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 CAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATT 2178

 13020768 CCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCA 13020827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 CCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCA 2238

 13020828 GTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAG 13020887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 GTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAG 2298

 13020888 CCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAAT 13020947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 CCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAAT 2358

 13020948 GTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGT 13021007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 GTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGT 2418

 13021008 TAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAA 13021067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAA 2478

 13021068 TACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATT 13021127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATT 2538

 13021128 TTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTT 13021187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 TTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTT 2598

 13021188 AATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACT 13021247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 AATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACT 2658

 13021248 AAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGC 13021307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 AAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGC 2718

 13021308 TACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCAC 13021367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 TACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCAC 2778

 13021368 ACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAA 13021427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 ACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAA 2838

 13021428 CACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGA 13021487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 CACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGA 2898

 13021488 GCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACT 13021547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 GCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACT 2958

 13021548 CTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACAT 13021607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 CTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACAT 3018

 13021608 AAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTT 13021667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 AAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTT 3078

 13021668 ATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGAT 13021727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 ATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGAT 3138

 13021728 CCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAA 13021787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 CCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAA 3198

 13021788 GATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCC 13021847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCC 3258

 13021848 TGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTT 13021907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTT 3318

 13021908 TTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATA 13021967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 TTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATA 3378

 13021968 TTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTC 13022027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTC 3438

 13022028 AGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTAT 13022087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 AGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTAT 3498

 13022088 CAGATAAATTTACCCATA 13022105
          ||||||||||||||||||
     3499 CAGATAAATTTACCCATA 3516

Alignment time is 4.11477 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6204] =>      6204 nucs 'mol-32-34be-175161_6204'

Score:        6192
Aligned:      6203        nucs
Identic:      6202 (100%) nucs =>        32 (100%)      6170 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13019393,13019424] EXCISED REGION [13019426,13025596]
 second seq =>  [       1,      32] EXCISED REGION [      34,    6204]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13019425,13019425]
 second seq =>         1 nucs [33,33]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13019424,13019424] to [13019426,13019426]
 second seq =>         1 nucs [32,32] to [34,34]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13019393 GTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAG 13019424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAG 32

EXCISED REGION

 13019426 GTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACA 13019485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       34 GTCTGGTAAATATATACGATGGAGAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACA 93

 13019486 AGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAA 13019545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       94 AGGAACAAGTGTTTGATTTGTAGTGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAA 153

 13019546 AATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATG 13019605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      154 AATGTTATGAGATTAGCAATTCTGTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATG 213

 13019606 TAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGA 13019665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      214 TAAAATCCATCTCTTAGATAATATGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGA 273

 13019666 ATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAA 13019725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      274 ATGCTATTTAGCTCACAAGTTCAAGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAA 333

 13019726 TGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGC 13019785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      334 TGAAAAAAAAGGATTTGAGTTATTCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGC 393

 13019786 TAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAA 13019845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      394 TAATCAAGATAAAAAGATATTTAATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAA 453

 13019846 GAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGT 13019905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      454 GAAACAGTGAAGAATGTAAGAAATAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGT 513

 13019906 TATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCA 13019965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      514 TATTCCTCAAACCACATTTGACATTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCA 573

 13019966 ATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACT 13020025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      574 ATACCATCTAATTAAATGGATCTTCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACT 633

 13020026 CAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCG 13020085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 CAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAACCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCG 693

 13020086 CCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTC 13020145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 CCCACCCATTCCTTCATCTGGATTTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTC 753

 13020146 ATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTT 13020205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 ATAGCACTTACCACCTTCTAAAAGTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTT 813

 13020206 ATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTG 13020265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 ATCTCCCCTCCCAGAACCTAACTTCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTG 873

 13020266 ATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTG 13020325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      874 ATGTACACATGGCACCTGGAATAATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTG 933

 13020326 AATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATT 13020385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 AATAAATGAAGGTATATGGAAGAAATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATT 993

 13020386 TTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACT 13020445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 TTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAACTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACT 1053

 13020446 GAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCT 13020505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 GAGTAGAGGAATAGATTAATTAAAAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCT 1113

 13020506 GTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATT 13020565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 GTGGTAAAATACATTAACTCAAGGGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATT 1173

 13020566 TTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAAT 13020625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 TTAGAATTGATATTTTAAGTAGTTTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAAT 1233

 13020626 ATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAG 13020685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 ATATTTGCCCTCTCTCATTTGGTCATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAG 1293

 13020686 GATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCC 13020745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 GATCTTGGGTAGATATTGCATCCAATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCC 1353

 13020746 TTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAA 13020805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 TTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTCCCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAA 1413

 13020806 GCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTT 13020865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 GCTTTCACATTTGATATAATCAGTTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTT 1473

 13020866 TGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGG 13020925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 TGCACTAAACTCAGTTATTCAGCCAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGG 1533

 13020926 TTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAG 13020985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 TTGAACCTCATGTCCACTGAATGTTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAG 1593

 13020986 TAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCT 13021045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 TAACTTTCCACCTTTGCAAGGTTAGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCT 1653

 13021046 ACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGC 13021105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 ACACAGATAGTATTAATATTAATACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGC 1713

 13021106 CAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCT 13021165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 CAGTACTAATATAGTTAACATTTTTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCT 1773

 13021166 CTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCT 13021225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 CTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTAATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCT 1833

 13021226 CATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCA 13021285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 CATTATACATATGAAAAAAACTAAAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCA 1893

 13021286 CAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCC 13021345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 CAACTGAGATTTGGAACTAGGCTACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCC 1953

 13021346 TAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCT 13021405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 TAACCATGGTATCTGCCTTCACACTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCT 2013

 13021406 GCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATT 13021465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 GCCTATTGCTAAGTGTAATGAACACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATT 2073

 13021466 TGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGAC 13021525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 TGTGATCTCAAATCTCAACTGAGCTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGAC 2133

 13021526 TCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCC 13021585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 TCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTCTATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCC 2193

 13021586 ATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCAC 13021645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 ATCTCATTTATTATTAAAACATAAAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCAC 2253

 13021646 AGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCA 13021705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 AGTAATTTTTTTTATAGAGTTTATTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCA 2313

 13021706 GACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATG 13021765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 GACAAGAAGTGGTTCAGGAGATCCACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATG 2373

 13021766 AACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTT 13021825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AACACAGAAGTAAAGCAAAGAAGATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTT 2433

 13021826 GGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAAT 13021885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GGTATATACTATTGGATAGTCCTGAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAAT 2493

 13021886 TGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTT 13021945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TGATTGAGCTTAATTTCTGTTTTTCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTT 2553

 13021946 AAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGA 13022005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 AAGTTTCACTTATGTTTGCATATTGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGA 2613

 13022006 TTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTT 13022065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 TTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCAGTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTT 2673

 13022066 GAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACT 13022125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 GAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATCAGATAAATTTACCCATAACTCTCTCATACCTCTTACT 2733

 13022126 ACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCA 13022185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 ACCATGGACAATTATTTCTCCTCCTAGTTAGTTCTGTTCCTCTAGCCTTGTCCTAATTCA 2793

 13022186 TATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACAC 13022245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 TATCTCCTCCTGCTTCTCAGGGAGCAAGCAGAGCTTACCACTTTTGCTTTCACAGAACAC 2853

 13022246 TTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTT 13022305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 TTTTACCTTTCCTGTCACTGCAGTCTTACAACTTTGCACTTACTTTGTGACTGCTTATTT 2913

 13022306 TTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGAT 13022365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TTATTCTCTGTTGCCTTCTATTTCTCTGCGTTACTCTTAAGTTCTGGTGTTTATCAGGAT 2973

 13022366 TCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCAT 13022425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 TCAACTCTAGGCTTTATTCTTTTAGCATGCTACACATTACCACTAGCCTCTATCATCCAT 3033

 13022426 TTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCC 13022485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 TTTCATTGTTTTAGTTATTACAGATAGCCTAAAATTTGTATCTTTCACTCAGATCTCTCC 3093

 13022486 TGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAA 13022545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 TGAGCTTTAAACCAGTATATGTAACCATACTCTGGATATTTCTGTTTGAATGCTCCATAA 3153

 13022546 GCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTT 13022605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 GCACCTTAAATTCAGTGTCTAAAAGTGAACTCTCATTCTCCGCAATGAACCTCCTGTTTT 3213

 13022606 GCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTT 13022665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 GCCCATGTTTTATAGTGAATTGGGATCACTATCCACTCAGTTGTGTAAGATATAAACTTT 3273

 13022666 AAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCA 13022725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 AAAGTTGCATCGTTCAAAAATGTTGCCTTTCTCTCAACCCTGACATCCAATCAGCCTTCA 3333

 13022726 AAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAA 13022785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 AAACTTGCCCATTCTACCTTGTATATATATCTTGAATCTCTCCACTTCTCTGTAGGTCAA 3393

 13022786 CTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTC 13022845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 CTGACATTTTCCTAATGTAGGTAATAATACATACTTTTTACTGGAGCATTGTAATGGTTC 3453

 13022846 CTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGA 13022905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 CTAATTGCCCTCTCTTCATCTAGTATACTCACCATAATCCACGTTCTTAACAACTGGAGA 3513

 13022906 ATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAG 13022965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 ATATACTTCCACCTTCCCAAGATGTCTCAGTGTCTCAGCCCATTCTGGGATTAGGCTCAG 3573

 13022966 GCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGG 13023025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 GCTTGAGGTGTAGAATCTTGATATTCCAATCGGTTCCAGGTAAGGATGAGACAAATATGG 3633

 13023026 TTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCC 13023085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 TTTCTTTCAATTGGAAAATCTGTGAACTAAAGAGATAAGTTAGCTGCCTTCCATACACCC 3693

 13023086 AATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATA 13023145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 AATAAGAGTGGCGAGACAGGGACAGAATAGCCGTTACAGATACTCCTATTCAGTAGGATA 3753

 13023146 CTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCA 13023205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 CTGGATGGCAGAGACGATGAGAGAGAACAGGAGAAATGTAGCGGTCACTAGTCCCAAGCA 3813

 13023206 AATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCC 13023265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 AATTCTGAGATGTAGATAGGCAGATATCTCTAGCTCTACCTAGGTTGCCATTTGAGTTCC 3873

 13023266 TGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGA 13023325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 TGGGAGTGGGTTTCTGTGGCTCTTGGCTCCTTCATCTGGGCTTTTAGCTTCATGACTTGA 3933

 13023326 GTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCT 13023385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 GTCACTTTCTCTTTTTTGTTAGAAATGGTCCATGCTTGCTGGGGAGTAGTTTCTCCTTCT 3993

 13023386 GATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGA 13023445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 GATTCCTTTCCAGGAAGGTTGTGAATACTGTTTGTCTCTCCAATCAGGCTTTCTGTGTGA 4053

 13023446 AAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGT 13023505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 AAAGCCCTGGTATCTTCTGCTCACAACTGGAATCATTCTTTATAGTGTGCCAGAAGTTGT 4113

 13023506 TCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAG 13023565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 TCCTGGTGTACTGGGACATGCATTCTGGTGGGTGCTTGGAGGAGAGGATGGAGGGATTAG 4173

 13023566 CAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCT 13023625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 CAACAGACTTGGATGAAGCAATCTGGGGAAGTGTCACATGATGTATGTACCTCTTCATCT 4233

 13023626 GTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTG 13023685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 GTGAATACTTTCTCCTTTCCTTGGCATTGGCTTCCTGGAAAGGTCTTCCTGGTATTAGTG 4293

 13023686 GAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAA 13023745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 GAGGAGGTCATTGTTTTTCTCAGGCAAACTACTGAAAGTAATAATATTAAACCAATACAA 4353

 13023746 GGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGG 13023805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 GGCAAAATAGCAAAAAGCCCTTTCCCATTCAGTCATTTTAAAAGTTAATTCACCAAAAGG 4413

 13023806 AGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTA 13023865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 AGTAAAGTTTGGTCAGAGTAATTTCCACCAAGGAAAAAAAAAGATTGTATTTTTAGCGTA 4473

 13023866 CTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGA 13023925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 CTTTACACAGTTAATCTAACAAATCATTTCATTAATGTTGACTGTTCTTCCGGCCAAAGA 4533

 13023926 GCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCT 13023985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 GCAGAATTGAAAGAAACTTTTTACTGGTTGAAGCCACGTGCGAGCTTTTCTAAGTCCCCT 4593

 13023986 GACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGA 13024045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 GACCATTTGAAAGTTTAAAAGGTCCACAACTTTCCAATTGTTAGCCTTAGGGTAAATGGA 4653

 13024046 AACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATT 13024105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 AACTTAAAATGGTCTGGGAGTACCTTTCTTATGAGAATGAAAGTAGCCTTCAGATTTATT 4713

 13024106 TCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGG 13024165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 TCCCTGAAATTGCATTCCTGCAAAAAAAAAATACTAATAGATAATTACTAAGAAGCCTGG 4773

 13024166 TCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGT 13024225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 TCTTTAATAATGCACTTACCTTGTTCTGAGAAGTATGTGAATTACAGATCAGGTGTCTGT 4833

 13024226 CTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAACATT 13024285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 CTGGGTAAGGCTGAACCACTTCTCACATATAATCTTGTTTTTAAATCCTATATTAACATT 4893

 13024286 GTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCATATT 13024345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 GTTTTCCTAAATCTACTTCAGCATCTTTATACTACTCAGAAAATAGAAATAATTCATATT 4953

 13024346 TGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCT 13024405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 TGCCCATATGTGTAGCAATAAATAGGAAGGATTGCGCACCACAGACAATGTTTGCTTCCT 5013

 13024406 TCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGA 13024465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 TCAATGACAGTGTCCTGAACAAATGGAGTGTTAAATTATTTAGAAATACTTCTTCTCAGA 5073

 13024466 TTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGGCACAATATGACTGAAAT 13024525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 TTGGTAGTATTTGTCTTTTTGTCAGAATATTGCCAAAGATGGGCACAATATGACTGAAAT 5133

 13024526 TATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATC 13024585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 TATATATTTACTGAGAAGAGCATGATTTGTACTTGTTTTCAAGTGAGGGAATTATAAATC 5193

 13024586 CAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATT 13024645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 CAATACTTTGCTACCCTTCTATGTAGAATTTCTGTCAGAAGTAAGCATTTAATCTCTATT 5253

 13024646 CACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAA 13024705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 CACATTATCATAGTTGAAACTGGAATTCTGGTTTTATTTTTCAAACACTGATTTGAAAAA 5313

 13024706 AAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGT 13024765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 AAAATCATTATGTCTTCTGCTTTAGAGGAGATTTTGAGCACAGTATCTGTGATGGTTTGT 5373

 13024766 ATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTC 13024825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 ATTGTGTCAGCTTGGTTACACTGGAATGATGTTTCTCCAAACCCTCACCCTTCTGTGGTC 5433

 13024826 CTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCC 13024885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 CTGGGTTGTGTGAGACTTGGAAGGTGGAAGTGAATTAGTAGCTGTTAGTGTCTGAAGGCC 5493

 13024886 AGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCAC 13024945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 AGTGTTGTGAGAGGCAGTCAAAAAACCCAGATGTGAGGGCAGGTTCAAGTGTGTCCTCAC 5553

 13024946 TCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAGCCATGGCCTTCAGGCCC 13025005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 TCTCCCCAGGTTATCACTCCTGATTGCTGGCTCTGCTGCCCAGCCATGGCCTTCAGGCCC 5613

 13025006 CATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTACACAAAGGCAACAGCTT 13025065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 CATAACTGGACCTTGGGCTGCTGACTAACAGAAGCAGTAGCTACACAAAGGCAACAGCTT 5673

 13025066 TCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCCACAGCTGTATGTGCCTT 13025125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 TCCATAGACAACTACCCCAGCAACATTACATGGCCCCATGTCCACAGCTGTATGTGCCTT 5733

 13025126 TCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCACCAGGGGTTTGACAGTTG 13025185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 TCTCCCTAGATTCCTTTGCAGGCTCCAATTTGTCCACCTGCACCAGGGGTTTGACAGTTG 5793

 13025186 CCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATTGAGAAATAGCATGCGGG 13025245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 CCAGCTCTGATAACAAAGCTGTTTGTGGGTAGATTAAATCATTGAGAAATAGCATGCGGG 5853

 13025246 GATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGATCTGGTAAGTGTTTATC 13025305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 GATTACCTGGGAATATTAGGAGTATCTGTTTTAATTAGTAAGATCTGGTAAGTGTTTATC 5913

 13025306 TAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAAATTTTTAATTTTATATA 13025365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 TAAAACTGTAGCAACCACTAAACAGTGTGACTTAAGAAAAAAAATTTTTAATTTTATATA 5973

 13025366 ATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATTTTTCCATTAAACCAACTTT 13025425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 ATTTTAATTTAAATTACAACACCAAAGTAGTATAAAATATTTTTCCATTAAACCAACTTT 6033

 13025426 ATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTATTGCCTTATTGTTAACA 13025485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 ATTGTTTTGGTAGAACTTACATTTCACATTGCATAAGATGTTATTGCCTTATTGTTAACA 6093

 13025486 TGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTGATTCAGATTGAATGCATTT 13025545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 TGCAGATTGGCTGCATGCATCTAGTCATTGTTAATAGATTGATTCAGATTGAATGCATTT 6153

 13025546 TACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGTGAAAATGCTA 13025596
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 TACATTTTAAATGAAGGCTTACTACTGATGCAACATTGAGTGAAAATGCTA 6204

Alignment time is 7.06032 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    4863] =>      4863 nucs 'mol-32-34d4-007084_4863'

Score:        4840
Aligned:      4851        nucs
Identic:      4850 (100%) nucs =>      3268 (100%)      1582 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13027714,13030981] EXCISED REGION [13030994,13032576]
 second seq =>  [       1,    3268] EXCISED REGION [    3281,    4863]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [13030982,13030993]
 second seq =>        12 nucs [3269,3280]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [13030993,13030993]
 second seq =>         1 nucs [3280,3280]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13030981,13030981] to [13030994,13030994]
 second seq =>         1 nucs [3268,3268] to [3281,3281]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13030982,13030982] to [13030993,13030993]
 second seq =>         1 nucs [3269,3269] to [3280,3280]

 13027714 CCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTA 13027773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGATGGCAGCATAAGGTGCTTGATGAACCCTTCCCCCAGCAAAACAACAATAATTTA 60

 13027774 AAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCAT 13027833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTCCCTGGAAATTGTCCTAAAACCGTAGAGTAAATGAAACAGTGAGAGGCCGTGGCAT 120

 13027834 TTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGC 13027893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGAGCCACGAGGTTGTGTCCATTTAACTTCCACCCCCAGCTCCATGTTAACAGAGGTGC 180

 13027894 TACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCC 13027953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACCCCAGGTGTTCTTCTCTGGGCAGCTGCAACCAAGAAGAGAGGTGCTCCCTCTCCTCC 240

 13027954 AGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCA 13028013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCCTCCCAGTCTCGGGCCATGGTTTCTACATCTCACCGTCATCCTAGTCCACTGTTGCA 300

 13028014 GAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTA 13028073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAGTTCTCTTCCAAGCGGATGTGGCTTAGAGAAATAGATCTTCCTTTCCCTACTCAGTA 360

 13028074 CCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCT 13028133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTACTCATAAAGATGAAGCTCAACCCCAAATGCAACACGCTGAAACTACTGGGACCCCT 420

 13028134 ATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAG 13028193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCACCTTTGCCCCAACATACTTATAGGGCGAAAGTTCCATGTCAGTGGGGCAAGCTAAG 480

 13028194 AAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCT 13028253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATAGTGGCAGCCACCCTGCCCTTTTGCTCGTCACAATTCATAGAGCAGATGTACTCT 540

 13028254 TGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGG 13028313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAAAAAGTATGTCCCTACCCCAGCTCTGGTGAAATAGTACAAGGGTACCACCCAGGAGG 600

 13028314 AAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTT 13028373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGGCAGGCCATAAAGACAAGGAGCTCTATATCTTTTCCTCAGGAAACTGCCTTTATTT 660

 13028374 GGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTG 13028433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAACAGAGCATAGAGAATTCCATGACTTAAGAGCATTTTTAAAAATTATGGAGATCTTG 720

 13028434 GCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACC 13028493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAGAAAGTGATTTAAAAAGGCTGGTAGCTCTATGAAGTATGCAAAATGGCAGAGCAACC 780

 13028494 AAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCAT 13028553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGGTTTAATAGAGAGTGACAGAGAAAAAGATAACCAAAAAGAGCCCTCTTGGGATCAT 840

 13028554 AGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCC 13028613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGATCC 900

 13028614 CAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGG 13028673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGG 960

 13028674 CTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGC 13028733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGC 1020

 13028734 GGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGA 13028793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGA 1080

 13028794 GGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTG 13028853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGGCTG 1140

 13028854 TCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCAC 13028913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCCCAC 1200

 13028914 AAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGC 13028973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAACAGC 1260

 13028974 TTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGG 13029033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGGAGG 1320

 13029034 ATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAA 13029093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCCAAA 1380

 13029094 GCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAA 13029153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGCAAA 1440

 13029154 AACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCC 13029213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCAGCC 1500

 13029214 CTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAG 13029273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAAGAG 1560

 13029274 CTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATT 13029333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGAATT 1620

 13029334 AGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAAC 13029393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCAAAC 1680

 13029394 AAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAA 13029453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCTAAA 1740

 13029454 ATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCA 13029513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAACCCA 1800

 13029514 AACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGAT 13029573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAGGAT 1860

 13029574 GGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAA 13029633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTAAAA 1920

 13029634 GAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATC 13029693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGAATC 1980

 13029694 AATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAG 13029753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAAAAG 2040

 13029754 AAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGA 13029813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGATAGA 2100

 13029814 TCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAA 13029873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACTTAA 2160

 13029874 GGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCA 13029933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTACCA 2220

 13029934 GAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAA 13029993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCCTAA 2280

 13029994 ATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAG 13030053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGACAG 2340

 13030054 ATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAAT 13030113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCAAAT 2400

 13030114 CTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAG 13030173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTGAAAGCAGCAAGAGAAAAATAACTCATCATGTACAAGGGAAGTCCAGTAACATGAAG 2460

 13030174 AATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGA 13030233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTAACTTCTCAAAAACAATGAAGGTCAAAGGCATTGCAAGTCATAACCAAAGTGCCGA 2520

 13030234 AAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAAC 13030293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGTAAGAAAAAAATCAAATAGAAAGATAATGAGAAGGGTTGGTGAGGATGTTGGGAAAC 2580

 13030294 TGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAG 13030353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGACACTCTCATACTTTGCTAATGGGAAGGTAAACGCAGCTGCTTTGGGAAACATTTCAG 2640

 13030354 CAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTAT 13030413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGTTTCTTTACCTGTTAAACAGATACCATATGACCTAGCAATTCTACTCAGCTATGTAT 2700

 13030414 ATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCA 13030473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTCAAGAGAACGAAAACATAGATCCACACAAACCTTGTATGTAAGTGTTCATAATAGCA 2760

 13030474 TTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGGATA 13030533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTATTCGTAATATCCAAAAAGTGTAAATTACTCATATATCTATCAACTGATGATTGGATA 2820

 13030534 AAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTGATG 13030593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGTGTGTTAAATCCATAAAATAGGCTATTATTTGCCTATACAGAGGAAAAGTACTGATG 2880

 13030594 TATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCGTTT 13030653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATGCTAAACACAGATGAATTTTGGAAATATTATGCTAAGCATATTATATTATTTCGTTT 2940

 13030654 ATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCTAGC 13030713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATAGGATATGTCCAGAATATGCAACTTTATTGATAGAAATAAGAATATTCACTGCCTAGC 3000

 13030714 ACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGAGAA 13030773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTGGGGGTGAGGGTGGGCAAATGTGGAGTGACAGCTAAAGGGCAGGAGGCTAGGGAGAA 3060

 13030774 AGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGTTGG 13030833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGAAAATGGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCATCCAGGTTGG 3120

 13030834 AGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATACTC 13030893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGTGCAGTGGCGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATACTC 3180

 13030894 CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACC 13030953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACC 3240

 13030954 TGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 13030981
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 3268

EXCISED REGION

 13030994 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAA 13031053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTTACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCTAA 3340

 13031054 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGAT 13031113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCTAGAAAATGTTTTAGGGTCAGAT 3400

 13031114 TTTGTGGTAATGGTTACACAATCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTC 13031173
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TTTGTGGTAATGGTTACACAGTCCTATGAATATACTAAAAATGTTTGAATTTTACACGTC 3460

 13031174 AAATGAGTGAATAGTATGTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGT 13031233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 AAATGAGTGAATAGTATGTTCACTATATCTCAATAAAGCTGTTTTTTAAAAAACAATTGT 3520

 13031234 GATCTGTGAAGGCAATGGTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTT 13031293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GATCTGTGAAGGCAATGGTATACATCTGTTTAAAATTCACTTCTCTTTTCCATAGTTCTT 3580

 13031294 AATTATGTCCCTTGTATCCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAAT 13031353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 AATTATGTCCCTTGTATCCTATTTTTGTACCTCACTCCTGAGATACTCAACAGATAAAAT 3640

 13031354 TGATCACTACTTTTACTACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAA 13031413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 TGATCACTACTTTTACTACTACTGTTTATAATAGCAGATAAAATTGAACTATTTTTATAA 3700

 13031414 AAGGACATTTTCAATATATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCT 13031473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 AAGGACATTTTCAATATATTGTCTGCTTGGTTATCTATGTGCATTGAAAAAAGTCTAGCT 3760

 13031474 TTATGTACATGATAGTCATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTG 13031533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 TTATGTACATGATAGTCATGAAACTGATACTCAGGAAAATTTGTATTTCCCATTTCTTTG 3820

 13031534 GCTAGCTACAAACCAGATGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATA 13031593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 GCTAGCTACAAACCAGATGTAATAATCTTATTACCTATTCCATAGCTCCCATAAAATATA 3880

 13031594 TGTTTCCTCCCTTTTCAGAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGC 13031653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 TGTTTCCTCCCTTTTCAGAGGTAGACTCTGCTAGTGTTCAACATTTGTGCATCACTTTGC 3940

 13031654 TTTTAAATGGCCTATCTTTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTAT 13031713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TTTTAAATGGCCTATCTTTAGTGGTCTCCCCTAACAGCCATTATCAGGATCAGTGTTTAT 4000

 13031714 GAAATGCCTGCTACTGTTCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACA 13031773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 GAAATGCCTGCTACTGTTCACCTTGCTAGTGATCTTTGAGTCTATTAAGAGGGAGGAACA 4060

 13031774 AATTAGTTTTGCAGACATTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTC 13031833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 AATTAGTTTTGCAGACATTTTTCCTGCATACCGAGGTCCCAAAATAATATTGTGGGAGTC 4120

 13031834 CTGGGATTAACACTCAGTTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGT 13031893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 CTGGGATTAACACTCAGTTCTCTCATCTCAACTGCACCATAGTTTACTCACTTATATCGT 4180

 13031894 TTCGCTGTAGGAAATGGTAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTT 13031953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TTCGCTGTAGGAAATGGTAAGCAGAAATATCTCACTGCACCTCCAGTCTGTAATGTGTTT 4240

 13031954 GTTGAGCTCTGCATATTTTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGC 13032013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 GTTGAGCTCTGCATATTTTAGCAAACTCTGAGGGTTACAGCTCTATAGGTAAAGTCATGC 4300

 13032014 CACCCCTAGGCCTACATTTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTT 13032073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 CACCCCTAGGCCTACATTTCAACTACTTTGCCATTGGGAGCACTCCATCTGGAGTTCCTT 4360

 13032074 TTTACCAGTTTTTTTCATTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGC 13032133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TTTACCAGTTTTTTTCATTCCATGCTGTTCTACTAATTCTTCCGTCTTTCGTGTCTTTGC 4420

 13032134 TATGTGGTGGGCTCTACTGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTT 13032193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TATGTGGTGGGCTCTACTGCTTGTAACTTGAGGAAAACAATCAAACATTATTTTTACTTT 4480

 13032194 CTAGGAGGGTGATGGAGAGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAAT 13032253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 CTAGGAGGGTGATGGAGAGGTTAACTATCAAAGTTTATGTTTTATTTTGCATACCTGAAT 4540

 13032254 TTTACAAAGTAATAATAAACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCT 13032313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 TTTACAAAGTAATAATAAACCAGTTCCAACCCAGCTGTTGTTAGGACATTTTCCATATCT 4600

 13032314 ATAAATCATAAATGTTTCAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAG 13032373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 ATAAATCATAAATGTTTCAAAACTGGTGTCATTCTTCTTGTTAGAGACTGAGGATAAGAG 4660

 13032374 TAGGTATGAAATTTTGTGAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATT 13032433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 TAGGTATGAAATTTTGTGAGCACAGGTGATATTTTCCTCATCCTTATTTTCCACATGATT 4720

 13032434 GGAAGAAAAGAGACTGAAAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCT 13032493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 GGAAGAAAAGAGACTGAAAGAAAACCCTATGTACTAACCAAAATTGTTTCCTTAATGTCT 4780

 13032494 CTGAAAATGTACGTGCATTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGT 13032553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 CTGAAAATGTACGTGCATTTTCAAACATGTTGAAGAAATAAAAGATGACCACATCTCCGT 4840

 13032554 AGCAACTCCTTTATAATATTAAT 13032576
          |||||||||||||||||||||||
     4841 AGCAACTCCTTTATAATATTAAT 4863

Alignment time is 5.6303 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13012101,13038550] =>     26450 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5181] =>      5181 nucs 'mol-32-34d4-172851_5181'

Score:        5170
Aligned:      5181        nucs
Identic:      5180 (100%) nucs =>      3612 (100%)      1568 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13018489,13022101] EXCISED REGION [13028551,13030118]
 second seq =>  [       1,    3613] EXCISED REGION [    3614,    5181]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6449 nucs [13022102,13028550]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [13022102,13022105] to [13028551,13028554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13022101,13022101] to [13028551,13028551]
 second seq =>         1 nucs [3613,3613] to [3614,3614]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13018489 GAGGCAAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAATATTGCATTTCTTCTGAACTCTTTTTAAATT 13018548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGCAAATGTTAGTTCTTTGGGGAAAAATATTGCATTTCTTCTGAACTCTTTTTAAATT 60

 13018549 TAAAAATAAAATTGAATTCATAATGAACCAGGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTT 13018608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAAATAAAATTGAATTCATAATGAACCAGGGGATAATAAACATTGGTGAATAGATTTT 120

 13018609 ACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTT 13018668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTGAACAGTGCATCACAGAAACCTTTTGAGATCTGGCACGCAAACATCTGTATTACTTT 180

 13018669 AATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGC 13018728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAACACATATTTTTTTATTTAGGACCATATTATAACTTATGTAAATATAACCTGTGGC 240

 13018729 TAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATG 13018788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGGCATTCAGTTACTTCCATATTAGAAGCAATGCTAAAATGAACATCTTTTCACAAATG 300

 13018789 AATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTT 13018848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAAGTGATATTTGTGGGAGAAATTAAATTGCAAAAGAGTATGATGTACTCACATTTTT 360

 13018849 AGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAG 13018908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAAAATGATATAGTCACATTTGTCTTCTGTAATATTAAATTTCAACTTCAAATGTTAAG 420

 13018909 AAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGAC 13018968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAAATTTTAATTGTGTTTGTGCCTTGGATAGAAAGTGGGTTTGTGAAATGAAAGTGAC 480

 13018969 ATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGT 13019028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATACCATTTTATTGTACATTAACCAGTGCATGTTATTTATTAATGAACTTGTTAGATAGT 540

 13019029 TAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTG 13019088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAAGGGAGGATGTCTACAATGGAAGTGAGGAGAGCCAACTGCAGAGCGTTGTGGATCTG 600

 13019089 TGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGA 13019148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGTCTTATTTTTACAGAAAGATAATTTGAACTCAAAGGGATTGGAACAAAACGAGAAGA 660

 13019149 GTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATAT 13019208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTATAAATAAAAAAGAAAAAGGGAATAAAATAACGCTCTTGGGAAGACATCAAAGATAT 720

 13019209 CTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAAT 13019268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGATTTGTTTCTAATTATTTTTCTCAATTAGCTAAAATTAGATTCAGTTCCAGGAAAT 780

 13019269 ATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAA 13019328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTCATTAATATTTCATGACAACATTATTTAAATTAATAAAAAAAATATATCTTGTCAA 840

 13019329 AATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTT 13019388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTTTAATTTTTAAAACCACATTATTTCTTCCCTTCCTGTTAGAATCTCACAACTCTTT 900

 13019389 TAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGA 13019448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGTGTACAACATGGTGGCTCACAGTCTCTAAAAAGTGTCTGGTAAATATATACGATGGA 960

 13019449 GAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAG 13019508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAAAATACAACAGGAAAGCCCAACCAAAATTAAACAAGGAACAAGTGTTTGATTTGTAG 1020

 13019509 TGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCT 13019568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCATATTTCATATATTCTTTAAAACAAATTACTAAAAATGTTATGAGATTAGCAATTCT 1080

 13019569 GTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATA 13019628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCATCAGCGAAGAAGGAGTCTGGGTTTTTATTTATGTAAAATCCATCTCTTAGATAATA 1140

 13019629 TGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCA 13019688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGTTTTATTTAAAGTTTACATCAAAAACAATTGAGAATGCTATTTAGCTCACAAGTTCA 1200

 13019689 AGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTAT 13019748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAATCATTTTCTTCTGGACTTCAGTGGAGTAGAAAATGAAAAAAAAGGATTTGAGTTAT 1260

 13019749 TCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTA 13019808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGCATCTGAGTTTGTCTGTATAAGGTATTTCTAGCTAATCAAGATAAAAAGATATTTA 1320

 13019809 ATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAA 13019868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCAGCATTCTTTATTTTCATTTGCTGGTTGTATCAAGAAACAGTGAAGAATGTAAGAAA 1380

 13019869 TAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACA 13019928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGTCAAAAAATGAGAAGGTTTATGGAGGTAGATGTTATTCCTCAAACCACATTTGACA 1440

 13019929 TTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCT 13019988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTGAGATGCAAATAGATTTTAGTCCAGAAAGTGCAATACCATCTAATTAAATGGATCT 1500

 13019989 TCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAA 13020048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTTAGAATGGTACAAGACCCCTTCAGATATCTACTCAAAGGGCGTTTTCTCAATGGAA 1560

 13020049 CCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGAT 13020108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTACCTGGACCACATCCCGTTTAAAAACTGTATTCGCCCACCCATTCCTTCATCTGGAT 1620

 13020109 TTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAA 13020168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTTTTTTTTTACTCTGTTCTGTGTGTTCCTTTTTCATAGCACTTACCACCTTCTAAAA 1680

 13020169 GTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACT 13020228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTAATAGACTTATTTATTATATTTATAATTGTGTTTATCTCCCCTCCCAGAACCTAACT 1740

 13020229 TCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATA 13020288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCAAGAGGATAGAGATCTGTGTAGATTTGTTCTCTGATGTACACATGGCACCTGGAATA 1800

 13020289 ATGCTTACACATAATAAGCGTTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGA 13020348
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGCTTACACATAATAAGCATTCAATAAATATGTGTGAATAAATGAAGGTATATGGAAGA 1860

 13020349 AATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAA 13020408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATTCCTAGCCATAAAAGCAAAACATCACAATACATTTTTAGGCAAGGCTAGAGATTTAA 1920

 13020409 CTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAA 13020468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTTAAGGAAGGATTTAAAAGCATTCTTAATAGACTGAGTAGAGGAATAGATTAATTAA 1980

 13020469 AAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAG 13020528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAATTTAGAATCTGTAAAATATTTATGAAGCGCCTCTGTGGTAAAATACATTAACTCAAG 2040

 13020529 GGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGT 13020588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTATGATTATATTAATAATTAAAATCACAATAAATTTTAGAATTGATATTTTAAGTAGT 2100

 13020589 TTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGT 13020648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTTTAAAACATCCAATTTGCTTTCCTAGAAACAATATATTTGCCCTCTCTCATTTGGT 2160

 13020649 CATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCC 13020708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATGTGCATTCACATCCCAATAGCCTTCTGACCACAGGATCTTGGGTAGATATTGCATCC 2220

 13020709 AATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTC 13020768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATGCTTTTCTCATCTTCATTTCCAATATCCTTTCCCTTCTCCCCTTCAGCTGCCCATTC 2280

 13020769 CCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAG 13020828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAGGACCACACCTTGAACCTTGCCAACACTTGCAAAGCTTTCACATTTGATATAATCAG 2340

 13020829 TTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGC 13020888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTCCACCTGTAGTCTTCTGACCGTGATTTCCTATTTTGCACTAAACTCAGTTATTCAGC 2400

 13020889 CAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATG 13020948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGTTATTCAAACTAAATCTAATCTTGAATCTAAGGGTTGAACCTCATGTCCACTGAATG 2460

 13020949 TTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTT 13021008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTCCTTTGCCTCAAAGCATCAGCCACTTTCTGTAGTAACTTTCCACCTTTGCAAGGTT 2520

 13021009 AGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAAT 13021068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGATTTCATGACCTATCACTTCATCCACTCTTCTTCTACACAGATAGTATTAATATTAAT 2580

 13021069 ACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTT 13021128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTAATTCCATGTTAAAACTAATATTAAATTTAATGCCAGTACTAATATAGTTAACATTT 2640

 13021129 TTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTA 13021188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGAGCACCTGCTACATGCCCAACATTATTCTAATCTCTGTGCATGTAGTGCCTAGTTTA 2700

 13021189 ATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTA 13021248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATCTTCACCACTCCATAGGTAACTTTTGTGTTATCCTCATTATACATATGAAAAAAACTA 2760

 13021249 AAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCT 13021308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGGAAAATATGGTTAAAATTATGGCTTAAGGTGGCACAACTGAGATTTGGAACTAGGCT 2820

 13021309 ACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACA 13021368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAAAGCCCAAAAATCAAGTTCCAGAGCTTATACTCCTAACCATGGTATCTGCCTTCACA 2880

 13021369 CTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAAC 13021428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTTGTTGAAACTGCCTTTGCAAGTTTACATTGGCCTGCCTATTGCTAAGTGTAATGAAC 2940

 13021429 ACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAG 13021488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTTACTCTCCATGGCAGATGGGTGAAAGTATACATTTGTGATCTCAAATCTCAACTGAG 3000

 13021489 CTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTC 13021548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCTCGAATTCTCTCCAAAGTCTTCTGGTTGGTTGACTCTCCAGGTCTCTGTAGTGACTC 3060

 13021549 TATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATA 13021608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATCAAATCATCTGTACTTGTTCAAACTTTACCTCCCATCTCATTTATTATTAAAACATA 3120

 13021609 AAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTA 13021668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAAATAACCCCCTTGTTAAAAAGGTAAACTGAGGCACAGTAATTTTTTTTATAGAGTTTA 3180

 13021669 TTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATC 13021728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTGAGCAAACAATGATTCATGAATTGGGAAGTTCCAGACAAGAAGTGGTTCAGGAGATC 3240

 13021729 CACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAG 13021788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CACCAGGAAAATGCAAGAGGGAGGTTTTTATGAAATGAACACAGAAGTAAAGCAAAGAAG 3300

 13021789 ATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCT 13021848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATACTTGATTGGCTATAGCTATACAGTTGCCTTATTTGGTATATACTATTGGATAGTCCT 3360

 13021849 GAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTT 13021908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAGTTATATAATTATAAGTCTGTTGGCTGCTTCCAATTGATTGAGCTTAATTTCTGTTTT 3420

 13021909 TCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATAT 13021968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTTTAATGTATGCATTCACAATAAATAGCTCAAGTTAAGTTTCACTTATGTTTGCATAT 3480

 13021969 TGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCA 13022028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGAGCAAGGTTAAAGTCGCTTAAGAGGCCTGACTAGATTTGATTGCTCAGGAGTTTTTCA 3540

 13022029 GTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATC 13022088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTCCTGGTTTCCATTTCTATTTACTTTAATACTTGTTGAAGGGGGAAAGTTGAAAGTATC 3600

 13022089 AGATAAATTTACC 13022101
          |||||||||||||
     3601 AGATAAATTTACC 3613

EXCISED REGION

 13028551 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 13028610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 CATAGTCAATTCTTGGGGGCAGGAAGACTGTGCACATGTGCTTTCAGAAACAACCAGAGA 3673

 13028611 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 13028670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 TCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 3733

 13028671 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 13028730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 TGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGT 3793

 13028731 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 13028790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCA 3853

 13028791 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 13028850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 GGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTCCAGATCGCACCACTACACTCCAGCACTCTAGCCTGGG 3913

 13028851 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 13028910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 CTGTCGCCCACGTCTCAAAAAAACAATCAAAGCAGGATATGGAAAGACTTGAAGCATCCC 3973

 13028911 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 13028970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 CACAAAGTGCACAGGCCCATCAACACAAGGCAGAGCCCGCACTGCCACAGGCTTAAGAAC 4033

 13028971 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 13029030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 AGCTTCTGATCAAACACAAATCAAACAATAACATGCTCTAACCTGGGAGCTGCTCCTAGG 4093

 13029031 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 13029090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 AGGATAAATATAAAATAGAATCACACTAGTTCCAGACAGTCTGTATGACTGTATATGCCC 4153

 13029091 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 13029150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 AAAGCTACTTCCTTCTTGACAAAGTTTGGAAAGATAACTTTCAAGATACTTGGCTGTGGC 4213

 13029151 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 13029210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 AAAAACACAGGGCAACAAATATAAACTCCCTGAACTCTGATAGCAGCCTCCAGGCCACCA 4273

 13029211 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 13029270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 GCCCTTGATGAGTAAGTGGCTTATGCAAACCCAAGGATGATCCCTAGGGAATGAGGCCAA 4333

 13029271 GAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGA 13029330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 GAGCTAAAACAAGGGAAAGAAATCTGTGCAGGGACATCAGAGGCTGCACACTTGGAGGGA 4393

 13029331 ATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCA 13029390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 ATTAGAATTTGCAGAATTGGTTTAATTAAGTAATTAATCAAATAAGCAAAGGACCCAGCA 4453

 13029391 AACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCT 13029450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 AACAAGAAGAACAACCCCCCCCAACAGTATTCAGTATCCAGATTTGCTAAAAATAAACCT 4513

 13029451 AAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAAC 13029510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 AAAATGTCTAGCTTTCAATAAAAAAATTATCAGATATGCAAAGAAACGGGAAAATGTAAC 4573

 13029511 CCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAG 13029570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 CCAAACACAGGAAAAAGTAGCAGGCAATAAAAACTGCCTTTGAAGATATCCTAATGGTAG 4633

 13029571 GATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTA 13029630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 GATGGCGAATTTAGCAGACGAAGACTTCAAAAAAGCTATCATAAAGATATTCAAAGACTA 4693

 13029631 AAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGA 13029690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 AAAGAAGTCATGTTTACGAATTAAAGGAAGGTCTGATGATGATGCCTTATTAAATAGAGA 4753

 13029691 ATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAA 13029750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 ATCAATAAAGAAAAAATACTTAAAAGAAACAAATTGAATTTTGGAGTTGAAAAGTAAAAA 4813

 13029751 AAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGAT 13029810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 AAGAAAAAGCCCAAATGAAAAATTTTAGCTGGCAGAGGAAAGAATCAGCAAACTGAAGAT 4873

 13029811 AGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACT 13029870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 AGATCAATAGAAATTAGGCAATCTGAAGAACAGAGAGGAAAAATAATTAAACGAAAAACT 4933

 13029871 TAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTA 13029930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 TAAGGAAATAAAGGGCACTATTAAGCGCACACACACACACAAATACGTGTAATGAGTGTA 4993

 13029931 CCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCC 13029990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 CCAGAGGTAAGAGGAAAAGGATAGAAAAAAATATCAAAAAAATTATGTCTGGAAATTCCC 5053

 13029991 TAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGA 13030050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 TAAATATGAAGAAAAACATTAATTTTCACTTCCAAGAAGCTCAACAAAATCTAAGTAGGA 5113

 13030051 CAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCA 13030110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 CAGATGGAAAGAGATAGACAACCGGACACATTATTGTCAAAATGTTGAAAGATAGATGCA 5173

 13030111 AATCTTGA 13030118
          ||||||||
     5174 AATCTTGA 5181

Alignment time is 6.02047 s

