
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3618] =>      3618 nucs 'mol-32-1e87-052770_3618'

Score:        3607
Aligned:      3618        nucs
Identic:      3617 (100%) nucs =>      2061 (100%)      1556 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120291195,120293255] EXCISED REGION [120293257,120294813]
 second seq =>  [        1,     2061] EXCISED REGION [     2062,     3618]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120293256,120293256]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [120293284,120293284]
 second seq =>         1 nucs [2089,2089]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [120293256,120293270] to [120293257,120293271]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120291195 GCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGC 120291254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGC 60

120291255 CCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTC 120291314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTC 120

120291315 CATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGT 120291374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGT 180

120291375 GCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAAT 120291434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAAT 240

120291435 GAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTG 120291494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTG 300

120291495 TGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCC 120291554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCC 360

120291555 AGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACT 120291614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACT 420

120291615 TCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTG 120291674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTG 480

120291675 TCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATG 120291734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATG 540

120291735 CGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTA 120291794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTA 600

120291795 TTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATT 120291854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATT 660

120291855 AATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTG 120291914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTG 720

120291915 AAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACAC 120291974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACAC 780

120291975 ATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGA 120292034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGA 840

120292035 AATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTC 120292094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTC 900

120292095 TCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATG 120292154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATG 960

120292155 GAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTC 120292214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTC 1020

120292215 CGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGT 120292274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGT 1080

120292275 GCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTT 120292334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTT 1140

120292335 GGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGC 120292394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGC 1200

120292395 TGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGA 120292454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGA 1260

120292455 TCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGT 120292514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGT 1320

120292515 CCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAAT 120292574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAAT 1380

120292575 GAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGA 120292634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGA 1440

120292635 AGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCT 120292694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCT 1500

120292695 GAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGA 120292754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGA 1560

120292755 ACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCAT 120292814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCAT 1620

120292815 CCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTG 120292874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTG 1680

120292875 AAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAG 120292934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAG 1740

120292935 AAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGAT 120292994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGAT 1800

120292995 TAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATG 120293054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATG 1860

120293055 GATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACT 120293114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACT 1920

120293115 CTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGC 120293174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGC 1980

120293175 CTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCAC 120293234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCAC 2040

120293235 ACACCACCATGCCTGGCTACA 120293255
          |||||||||||||||||||||
     2041 ACACCACCATGCCTGGCTACA 2061

EXCISED REGION

120293257 TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGT 120293316
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGT 2121

120293317 CTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATA 120293376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 CTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATA 2181

120293377 GATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCA 120293436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 GATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCA 2241

120293437 GAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATA 120293496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 GAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATA 2301

120293497 AACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCC 120293556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 AACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCC 2361

120293557 CTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGG 120293616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 CTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGG 2421

120293617 ACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTA 120293676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 ACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTA 2481

120293677 AAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGT 120293736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 AAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGT 2541

120293737 TGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATT 120293796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATT 2601

120293797 GTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCA 120293856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 GTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCA 2661

120293857 GAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTA 120293916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 GAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTA 2721

120293917 GACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAAC 120293976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 GACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAAC 2781

120293977 AAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCT 120294036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 AAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCT 2841

120294037 CTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCT 120294096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 CTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCT 2901

120294097 GTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATT 120294156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATT 2961

120294157 GTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTA 120294216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTA 3021

120294217 ATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGA 120294276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 ATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGA 3081

120294277 TACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTA 120294336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 TACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTA 3141

120294337 ACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATA 120294396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 ACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATA 3201

120294397 TGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATG 120294456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATG 3261

120294457 GAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCATT 120294516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 GAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCATT 3321

120294517 ACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATGAG 120294576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 ACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATGAG 3381

120294577 AATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACAAG 120294636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 AATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACAAG 3441

120294637 ATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGCAT 120294696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 ATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGCAT 3501

120294697 GTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAATAT 120294756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 GTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAATAT 3561

120294757 GTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCACAACTGTG 120294813
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 GTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCACAACTGTG 3618

Alignment time is 4.31895 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     6124] =>      6124 nucs 'mol-32-1f16-089470_6124'

Score:        6015
Aligned:      6115        nucs
Identic:      6101 (100%) nucs =>      2185 (100%)      3916 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120288061,120290250] EXCISED REGION [120291388,120295308]
 second seq =>  [        1,     2190] EXCISED REGION [     2206,     6124]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [2191,2205]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2190,2190] to [2205,2205]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2191,2193] to [2203,2205]

120288061 TTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGAAAGATTTCTACTTCTAAAAAG 120288120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGAAAGATTTCTACTTCTAAAAAG 60

120288121 AAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAATAGGTTTTCCTGTCCTCCTAAA 120288180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAATAGGTTTTCCTGTCCTCCTAAA 120

120288181 CTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGAGAGATGGAAAAACCTAATGGC 120288240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGAGAGATGGAAAAACCTAATGGC 180

120288241 ACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGATGATTAAGGAAAGGTAATGAT 120288300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGATGATTAAGGAAAGGTAATGAT 240

120288301 AATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAAAT 120288360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAAAT 300

120288361 GAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGAGG 120288420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGAGG 360

120288421 GAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGCTA 120288480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGCTA 420

120288481 ATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAA 120288540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAA 480

120288541 CAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGA 120288600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGA 540

120288601 GGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGA 120288660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGA 600

120288661 AGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGTTG 120288720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGTTG 660

120288721 ATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATGTA 120288780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATGTA 720

120288781 GAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAACT 120288840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAACT 780

120288841 CACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATAAC 120288900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATAAC 840

120288901 CTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAA 120288960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAA 900

120288961 AGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAAT 120289020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAAT 960

120289021 CACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGAT 120289080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGAT 1020

120289081 TCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCA 120289140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCA 1080

120289141 TTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTT 120289200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTT 1140

120289201 CAGACTAGACCTCAATATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGT 120289260
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGACTAGACCTCAAAATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGT 1200

120289261 TTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTA 120289320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTA 1260

120289321 GCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAA 120289380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAA 1320

120289381 TTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAA 120289440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAA 1380

120289441 AGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAG 120289500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAG 1440

120289501 AATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCA 120289560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCA 1500

120289561 GAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTG 120289620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTG 1560

120289621 AGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGT 120289680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGT 1620

120289681 AAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTG 120289740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTG 1680

120289741 CAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGG 120289800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGG 1740

120289801 CTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGG 120289860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGG 1800

120289861 CCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTC 120289920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTC 1860

120289921 ACTTAAT--AAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTA 120289978
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTA--TGAAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTA 1918

120289979 AGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCC 120290038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCC 1978

120290039 GCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTT 120290098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTT 2038

120290099 AACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCT 120290158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCT 2098

120290159 CTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGC 120290218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2099 CTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGC 2158

120290219 CTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||||||||||||||.||||||||||||||
     2159 CTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 2190

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 2265

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 2325

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 2385

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
     2386 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 2443

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 2503

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 2563

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 2623

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 2683

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 2743

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 2803

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 2863

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 2923

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     2924 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 2982

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 3042

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 3102

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 3162

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 3222

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 3282

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 3342

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 3402

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 3462

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 3522

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 3582

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 3642

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 3702

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 3762

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 3822

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 3882

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 3942

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 4002

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 4062

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 CCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 4121

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 4181

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 4241

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 4301

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 4361

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 4421

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 4481

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 4541

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 4601

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 4661

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 4721

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 4781

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 4841

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 4901

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 4961

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 5021

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 5081

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 5141

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 5201

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 5261

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 5321

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 5381

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 5441

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 120294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 5501

120294686 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 120294745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 5561

120294746 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 120294805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 5621

120294806 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAAT 120294865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAAT 5681

120294866 ATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAA 120294925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 ATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAA 5741

120294926 TAAGCTGTCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAAT 120294985
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 TAAGCTATCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAAT 5801

120294986 ATAATATTCACTTATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGTGTATGTATT 120295045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 ATAATATTCACTTATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGTGTATGTATT 5861

120295046 ACCTATTCAAAAATGCATTAAATGAATCTAGAAAATAAATACCTAAAACACAGAATATCA 120295105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 ACCTATTCAAAAATGCATTAAATGAATCTAGAAAATAAATACCTAAAACACAGAATATCA 5921

120295106 TCCACAACCATATTTATAATTGTCTTGGTGGAAAGGATTTTTGTAAATTCACAAGGGTTA 120295165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 TCCACAACCATATTTATAATTGTCTTGGTGGAAAGGATTTTTGTAAATTCACAAGGGTTA 5981

120295166 TACATGTTAATTCATTTTTATATTTAGAAAAATAGTTTGAATTTTTTCTAAAGGAAGAAT 120295225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 TACATGTTAATTCATTTTTATATTTAGAAAAATAGTTTGAATTTTTTCTAAAGGAAGAAT 6041

120295226 ATTTTTAAAATTCTTTAATTTACTTTTTCCCCCAGGAAGTAAATAAACTTCAATTACTTT 120295285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 ATTTTTAAAATTCTTTAATTTACTTTTTCCCCCAGGAAGTAAATAAACTTCAATTACTTT 6101

120295286 ACACCAAAAGAGGCAGCATCAGC 120295308
          |||||||||||||||||||||||
     6102 ACACCAAAAGAGGCAGCATCAGC 6124

Alignment time is 7.824 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2190] =>      2190 nucs 'mol-32-1f16-089470_2190'

Score:        2155
Aligned:      2188        nucs
Identic:      2185 (100%) nucs =>      1864 (100%)       321 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120288061,120289925] EXCISED REGION [120289928,120290250]
 second seq =>  [        1,     1865] EXCISED REGION [     1868,     2190]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [120289926,120289927]
 second seq =>         2 nucs [1866,1867]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289926,120289926] to [120289928,120289928]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289925,120289925] to [120289928,120289928]
 second seq =>         1 nucs [1865,1865] to [1868,1868]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120288061 TTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGAAAGATTTCTACTTCTAAAAAG 120288120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGAAAGATTTCTACTTCTAAAAAG 60

120288121 AAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAATAGGTTTTCCTGTCCTCCTAAA 120288180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAATAGGTTTTCCTGTCCTCCTAAA 120

120288181 CTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGAGAGATGGAAAAACCTAATGGC 120288240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGAGAGATGGAAAAACCTAATGGC 180

120288241 ACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGATGATTAAGGAAAGGTAATGAT 120288300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGATGATTAAGGAAAGGTAATGAT 240

120288301 AATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAAAT 120288360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAAAT 300

120288361 GAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGAGG 120288420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGAGG 360

120288421 GAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGCTA 120288480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGCTA 420

120288481 ATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAA 120288540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAA 480

120288541 CAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGA 120288600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGA 540

120288601 GGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGA 120288660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGA 600

120288661 AGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGTTG 120288720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGTTG 660

120288721 ATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATGTA 120288780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATGTA 720

120288781 GAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAACT 120288840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAACT 780

120288841 CACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATAAC 120288900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATAAC 840

120288901 CTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAA 120288960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAA 900

120288961 AGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAAT 120289020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAAT 960

120289021 CACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGAT 120289080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGAT 1020

120289081 TCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCA 120289140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCA 1080

120289141 TTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTT 120289200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTT 1140

120289201 CAGACTAGACCTCAATATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGT 120289260
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGACTAGACCTCAAAATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGT 1200

120289261 TTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTA 120289320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTA 1260

120289321 GCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAA 120289380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAA 1320

120289381 TTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAA 120289440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAA 1380

120289441 AGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAG 120289500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAG 1440

120289501 AATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCA 120289560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCA 1500

120289561 GAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTG 120289620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTG 1560

120289621 AGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGT 120289680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGT 1620

120289681 AAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTG 120289740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTG 1680

120289741 CAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGG 120289800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGG 1740

120289801 CTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGG 120289860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGG 1800

120289861 CCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTC 120289920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTC 1860

120289921 ACTTA 120289925
          |||||
     1861 ACTTA 1865

EXCISED REGION

120289928 AAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTG 120289987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 AAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTG 1927

120289988 AATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGT 120290047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 AATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGT 1987

120290048 CTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTT 120290107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 CTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTT 2047

120290108 TCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAG 120290167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 TCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAG 2107

120290168 GAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGG 120290227
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2108 GAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGG 2167

120290228 TTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||||.||||||||||||||
     2168 TTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 2190

Alignment time is 3.26323 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2620] =>      2620 nucs 'mol-32-1f58-215410_2620'

Score:        2619
Aligned:      2619        nucs
Identic:      2619 (100%) nucs =>       796 (100%)      1823 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290358,120291153] EXCISED REGION [120291155,120292977]
 second seq =>  [        1,      796] EXCISED REGION [      798,     2620]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154]
 second seq =>         1 nucs [797,797]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154] to [120291155,120291155]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290358 TTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCA 120290417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCA 60

120290418 TTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGT 120290477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGT 120

120290478 GCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTT 120290537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTT 180

120290538 CTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTC 120290597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTC 240

120290598 TTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTC 120290657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTC 300

120290658 TTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCT 120290717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCT 360

120290718 GCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTT 120290777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTT 420

120290778 TTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGA 120290837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGA 480

120290838 TGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCC 120290897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCC 540

120290898 TCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTA 120290957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTA 600

120290958 TCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATC 120291017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATC 660

120291018 GTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCC 120291077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCC 720

120291078 TACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCA 120291137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCA 780

120291138 GTCTGACCATTCTCAG 120291153
          ||||||||||||||||
      781 GTCTGACCATTCTCAG 796

EXCISED REGION

120291155 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 120291214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 857

120291215 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 120291274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 917

120291275 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 120291334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 977

120291335 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 120291394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 1037

120291395 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 120291454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 1097

120291455 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 120291514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 1157

120291515 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 120291574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 1217

120291575 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 120291634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 1277

120291635 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 120291694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 1337

120291695 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 120291754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 1397

120291755 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 120291814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 1457

120291815 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 120291874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 1517

120291875 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 120291934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 1577

120291935 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 120291994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 1637

120291995 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 120292054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 1697

120292055 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 120292114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 1757

120292115 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 120292174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 1817

120292175 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 120292234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 1877

120292235 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 120292294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 1937

120292295 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 120292354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 1997

120292355 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 120292414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 2057

120292415 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 120292474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 2117

120292475 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 120292534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 2177

120292535 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 120292594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 2237

120292595 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 120292654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 2297

120292655 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 120292714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 2357

120292715 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 120292774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 2417

120292775 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 120292834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 2477

120292835 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 120292894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 2537

120292895 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 120292954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 2597

120292955 TTTTATTATACTTTTTAATCATG 120292977
          |||||||||||||||||||||||
     2598 TTTTATTATACTTTTTAATCATG 2620

Alignment time is 3.70991 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3595] =>      3595 nucs 'mol-32-1f63-143355_3595'

Score:        3583
Aligned:      3594        nucs
Identic:      3593 (100%) nucs =>       287 (100%)      3306 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290867,120291153] EXCISED REGION [120291155,120294461]
 second seq =>  [        1,      287] EXCISED REGION [      289,     3595]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154]
 second seq =>         1 nucs [288,288]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154] to [120291155,120291155]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290867 TTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGG 120290926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGG 60

120290927 AGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAAT 120290986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAAT 120

120290987 ATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGG 120291046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGG 180

120291047 TACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTA 120291106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTA 240

120291107 CTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 120291153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 287

EXCISED REGION

120291155 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 120291214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      289 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 348

120291215 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 120291274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      349 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 408

120291275 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 120291334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      409 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 468

120291335 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 120291394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 528

120291395 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 120291454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 588

120291455 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 120291514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 648

120291515 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 120291574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 708

120291575 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 120291634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 768

120291635 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 120291694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 828

120291695 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 120291754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 888

120291755 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 120291814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 948

120291815 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 120291874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 1008

120291875 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 120291934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 1068

120291935 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 120291994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 1128

120291995 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 120292054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 1188

120292055 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 120292114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 1248

120292115 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 120292174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 1308

120292175 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 120292234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 1368

120292235 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 120292294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 1428

120292295 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 120292354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 1488

120292355 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 120292414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 1548

120292415 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 120292474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 1608

120292475 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 120292534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 1668

120292535 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 120292594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 1728

120292595 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 120292654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 1788

120292655 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 120292714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 1848

120292715 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 120292774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 1908

120292775 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 120292834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 1968

120292835 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 120292894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 2028

120292895 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 120292954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 2088

120292955 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 120293014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 2148

120293015 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 120293074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 2208

120293075 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 120293134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 2268

120293135 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 120293194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 2328

120293195 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 120293254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 2388

120293255 ATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 120293314
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 ATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 2448

120293315 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 120293374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 2508

120293375 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 120293434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 2568

120293435 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 120293494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 2628

120293495 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 120293554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 2688

120293555 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 120293614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 2748

120293615 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 120293674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 2808

120293675 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 120293734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 2868

120293735 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 120293794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 2928

120293795 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 120293854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 2988

120293855 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 120293914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 3048

120293915 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 120293974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 3108

120293975 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 120294034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 3168

120294035 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 120294094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 3228

120294095 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 120294154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 3288

120294155 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 120294214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 3348

120294215 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 120294274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 3408

120294275 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 120294334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 3468

120294335 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAA 120294394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAA 3528

120294395 TATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATA 120294454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATA 3588

120294455 TGGAAAG 120294461
          |||||||
     3589 TGGAAAG 3595

Alignment time is 5.13039 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2046] =>      2046 nucs 'mol-32-1f63-190484_2046'

Score:        1984
Aligned:      2034        nucs
Identic:      2027 (100%) nucs =>       273 ( 99%)      1754 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120289976,120290250] EXCISED REGION [120291388,120293144]
 second seq =>  [        1,      275] EXCISED REGION [      291,     2046]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [276,290]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [275,275] to [290,290]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [276,278] to [288,290]

120289976 TTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGA 120290035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGA 60

120290036 TCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCC 120290095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCC 120

120290096 CTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTT 120290155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTT 180

120290156 GCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCT 120290215
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      181 GCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCC 240

120290216 TGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      241 TGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 275

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 350

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 410

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 470

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      471 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 528

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 588

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 648

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 708

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 768

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 828

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 888

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 948

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 1008

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1009 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 1067

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 1127

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1187

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1247

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1307

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1367

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1427

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1487

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1547

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1607

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1667

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1727

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1787

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1847

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1907

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1967

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 2027

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGA 120293144
          |||||||||||||||||||
     2028 GCCTAGACTGGAGGGCAGA 2046

Alignment time is 3.07449 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     4226] =>      4226 nucs 'mol-32-2110-090502_4226'

Score:        4203
Aligned:      4225        nucs
Identic:      4223 (100%) nucs =>       617 (100%)      3606 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290537,120291153] EXCISED REGION [120291155,120294762]
 second seq =>  [        1,      617] EXCISED REGION [      619,     4226]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154]
 second seq =>         1 nucs [618,618]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154] to [120291155,120291155]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290537 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 120290596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 60

120290597 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 120290656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 120

120290657 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 120290716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 180

120290717 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 120290776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 240

120290777 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 120290836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 300

120290837 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 120290896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 360

120290897 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 120290956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 420

120290957 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 120291016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 480

120291017 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 120291076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 540

120291077 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 120291136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 600

120291137 AGTCTGACCATTCTCAG 120291153
          |||||||||||||||||
      601 AGTCTGACCATTCTCAG 617

EXCISED REGION

120291155 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 120291214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 678

120291215 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 120291274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 738

120291275 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 120291334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 798

120291335 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 120291394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 858

120291395 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 120291454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 918

120291455 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 120291514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 978

120291515 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 120291574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 1038

120291575 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 120291634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 1098

120291635 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 120291694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 1158

120291695 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 120291754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 1218

120291755 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 120291814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 1278

120291815 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 120291874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 1338

120291875 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 120291934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 1398

120291935 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 120291994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 1458

120291995 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 120292054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 1518

120292055 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 120292114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 1578

120292115 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 120292174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 1638

120292175 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 120292234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 1698

120292235 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 120292294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 1758

120292295 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 120292354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 1818

120292355 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 120292414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 1878

120292415 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 120292474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 1938

120292475 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 120292534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 1998

120292535 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 120292594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 2058

120292595 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 120292654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 2118

120292655 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 120292714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 2178

120292715 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 120292774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 2238

120292775 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 120292834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 2298

120292835 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 120292894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 2358

120292895 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 120292954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 2418

120292955 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 120293014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 2478

120293015 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 120293074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 2538

120293075 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 120293134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 2598

120293135 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 120293194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 2658

120293195 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 120293254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 2718

120293255 ATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 120293314
          |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 ATTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 2778

120293315 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 120293374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 2838

120293375 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 120293434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 2898

120293435 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 120293494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 2958

120293495 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 120293554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 3018

120293555 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 120293614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 3078

120293615 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 120293674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 3138

120293675 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 120293734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 3198

120293735 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 120293794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 3258

120293795 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 120293854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 3318

120293855 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 120293914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 3378

120293915 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 120293974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 3438

120293975 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 120294034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 3498

120294035 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 120294094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 3558

120294095 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 120294154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 3618

120294155 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 120294214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 3678

120294215 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 120294274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 3738

120294275 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 120294334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 3798

120294335 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAA 120294394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAA 3858

120294395 TATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATA 120294454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 TATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATA 3918

120294455 TGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCA 120294514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 TGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCA 3978

120294515 TTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATG 120294574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 TTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATG 4038

120294575 AGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACA 120294634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 AGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACA 4098

120294635 AGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGC 120294694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 AGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGC 4158

120294695 ATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAAT 120294754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 ATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAAT 4218

120294755 ATGTACTG 120294762
          ||||||||
     4219 ATGTACTG 4226

Alignment time is 5.61604 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     4201] =>      4201 nucs 'mol-32-21ec-048479_4201'

Score:        4128
Aligned:      4189        nucs
Identic:      4181 (100%) nucs =>       168 ( 99%)      4013 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290081,120290250] EXCISED REGION [120291388,120295404]
 second seq =>  [        1,      170] EXCISED REGION [      186,     4201]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [171,185]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [170,170] to [185,185]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [171,173] to [183,185]

120290081 TTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATT 120290140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATT 60

120290141 ATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGA 120290200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGA 120

120290201 ATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      121 ATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 170

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 245

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 305

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 365

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      366 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 423

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 483

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 543

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 603

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 663

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 723

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 783

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 843

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 903

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      904 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 962

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 1022

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1082

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1142

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1202

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1262

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1322

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1382

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1442

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1502

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1562

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1622

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1682

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1742

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1802

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1862

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1922

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1982

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 2042

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2102

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2162

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2222

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2282

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2342

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2402

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2462

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2522

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2582

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2642

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2702

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2762

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2822

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2882

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2942

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 3002

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 3062

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3122

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3182

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3242

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3302

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3362

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3422

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 120294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 3482

120294686 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 120294745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 3542

120294746 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 120294805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 3602

120294806 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAAT 120294865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAAT 3662

120294866 ATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAA 120294925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 ATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAA 3722

120294926 TAAGCTGTCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAAT 120294985
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 TAAGCTATCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAAT 3782

120294986 ATAATATTCACTTATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGTGTATGTATT 120295045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 ATAATATTCACTTATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGTGTATGTATT 3842

120295046 ACCTATTCAAAAATGCATTAAATGAATCTAGAAAATAAATACCTAAAACACAGAATATCA 120295105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 ACCTATTCAAAAATGCATTAAATGAATCTAGAAAATAAATACCTAAAACACAGAATATCA 3902

120295106 TCCACAACCATATTTATAATTGTCTTGGTGGAAAGGATTTTTGTAAATTCACAAGGGTTA 120295165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 TCCACAACCATATTTATAATTGTCTTGGTGGAAAGGATTTTTGTAAATTCACAAGGGTTA 3962

120295166 TACATGTTAATTCATTTTTATATTTAGAAAAATAGTTTGAATTTTTTCTAAAGGAAGAAT 120295225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 TACATGTTAATTCATTTTTATATTTAGAAAAATAGTTTGAATTTTTTCTAAAGGAAGAAT 4022

120295226 ATTTTTAAAATTCTTTAATTTACTTTTTCCCCCAGGAAGTAAATAAACTTCAATTACTTT 120295285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 ATTTTTAAAATTCTTTAATTTACTTTTTCCCCCAGGAAGTAAATAAACTTCAATTACTTT 4082

120295286 ACACCAAAAGAGGCAGCATCAGCTATAAAAAAGGGATGAATCCTGTATTTGATAGCATAA 120295345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 ACACCAAAAGAGGCAGCATCAGCTATAAAAAAGGGATGAATCCTGTATTTGATAGCATAA 4142

120295346 ATGAGGCATAATAATCAAAGAAAAAACTTTTGAAAAGAAGAATGTTTGAGCTACAGGAC 120295404
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 ATGAGGCATAATAATCAAAGAAAAAACTTTTGAAAAGAAGAATGTTTGAGCTACAGGAC 4201

Alignment time is 5.55652 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3331] =>      3331 nucs 'mol-32-2291-069643_3331'

Score:        3259
Aligned:      3320        nucs
Identic:      3312 (100%) nucs =>       320 ( 99%)      2992 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120289929,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294383]
 second seq =>  [        1,      322] EXCISED REGION [      338,     3331]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [323,337]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [322,322] to [337,337]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [323,325] to [335,337]

120289929 AGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGA 120289988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGA 60

120289989 ATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTC 120290048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTC 120

120290049 TGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTT 120290108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTT 180

120290109 CCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGG 120290168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGG 240

120290169 AGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGT 120290228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      241 AGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGT 300

120290229 TGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||||.||||||||||||||
      301 TGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 322

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      338 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 397

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 457

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 517

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      518 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 575

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 635

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 695

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 755

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 815

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 875

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 935

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 995

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 1055

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1056 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 1114

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 1174

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1234

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1294

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1354

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1414

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1474

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1534

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1594

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1654

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1714

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1774

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1834

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1894

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1954

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 2014

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 2074

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 2134

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 2194

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 CCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2253

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2313

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2373

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2433

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2493

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2553

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2613

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2673

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2733

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2793

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2853

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2913

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2973

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 3033

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 3093

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 3153

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 3213

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3273

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAA 120294383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAA 3331

Alignment time is 4.52262 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3556] =>      3556 nucs 'mol-32-229c-049213_3556'

Score:        3544
Aligned:      3555        nucs
Identic:      3554 (100%) nucs =>       194 (100%)      3360 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120289022,120289215] EXCISED REGION [120289217,120292577]
 second seq =>  [        1,      194] EXCISED REGION [      196,     3556]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120289216,120289216]
 second seq =>         1 nucs [195,195]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [193,195] to [194,196]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289215,120289215] to [120289217,120289217]
 second seq =>         1 nucs [194,194] to [196,196]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120289022 ACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGATT 120289081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGATT 60

120289082 CATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCAT 120289141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCAT 120

120289142 TTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTTC 120289201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTTC 180

120289202 AGACTAGACCTCAA 120289215
          ||||||||||||||
      181 AGACTAGACCTCAA 194

EXCISED REGION

120289217 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 120289276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 255

120289277 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 120289336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 315

120289337 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 120289396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 375

120289397 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 120289456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 435

120289457 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 120289516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 495

120289517 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 120289576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 555

120289577 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 120289636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 615

120289637 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 120289696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 675

120289697 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 120289756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 735

120289757 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 120289816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 795

120289817 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 120289876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 855

120289877 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 120289936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 915

120289937 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 120289996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 975

120289997 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 120290056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 1035

120290057 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 120290116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 1095

120290117 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 120290176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 1155

120290177 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 120290236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 1215

120290237 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 120290296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 1275

120290297 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 120290356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 1335

120290357 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 120290416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 1395

120290417 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 120290476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 1455

120290477 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 120290536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 1515

120290537 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 120290596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 1575

120290597 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 120290656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 1635

120290657 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 120290716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 1695

120290717 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 120290776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 1755

120290777 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 120290836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 1815

120290837 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 120290896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 1875

120290897 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 120290956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 1935

120290957 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 120291016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 1995

120291017 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 120291076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 2055

120291077 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 120291136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 2115

120291137 AGTCTGACCATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 120291196
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 AGTCTGACCATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 2175

120291197 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 120291256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 2235

120291257 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCA 120291316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCA 2295

120291317 TCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGC 120291376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 TCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGC 2355

120291377 CCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGA 120291436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 CCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGA 2415

120291437 GTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTG 120291496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 GTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTG 2475

120291497 CTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAG 120291556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 CTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAG 2535

120291557 GTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTC 120291616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTC 2595

120291617 CCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTC 120291676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 CCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTC 2655

120291677 CTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCG 120291736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 CTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCG 2715

120291737 GAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATT 120291796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATT 2775

120291797 CGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAA 120291856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 CGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAA 2835

120291857 TCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAA 120291916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 TCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAA 2895

120291917 AGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACAT 120291976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 AGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACAT 2955

120291977 GATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAA 120292036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 GATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAA 3015

120292037 TCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTC 120292096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 TCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTC 3075

120292097 CTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGA 120292156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 CTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGA 3135

120292157 GTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCG 120292216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 GTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCG 3195

120292217 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 120292276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 3255

120292277 GCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGG 120292336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 GCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGG 3315

120292337 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTG 120292396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTG 3375

120292397 GGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATC 120292456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 GGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATC 3435

120292457 AGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCC 120292516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 AGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCC 3495

120292517 CCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGA 120292576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 CCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGA 3555

120292577 A 120292577
          |
     3556 A 3556

Alignment time is 4.7851 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2377] =>      2377 nucs 'mol-32-23af-034988_2377'

Score:        2314
Aligned:      2364        nucs
Identic:      2357 (100%) nucs =>      1725 (100%)       632 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120288523,120290250] EXCISED REGION [120291388,120292021]
 second seq =>  [        1,     1728] EXCISED REGION [     1744,     2377]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [1729,1743]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1728,1728] to [1743,1743]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1729,1731] to [1741,1743]

120288523 AATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGAC 120288582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGAC 60

120288583 CCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGAT 120288642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGAT 120

120288643 GCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACAT 120288702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACAT 180

120288703 ATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAA 120288762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAA 240

120288763 ATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAG 120288822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAG 300

120288823 CAATCTAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGC 120288882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATCTAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGC 360

120288883 TACTCTACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTT 120288942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTCTACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTT 420

120288943 GTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAA 120289002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAA 480

120289003 ATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTA 120289062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTA 540

120289063 TTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATAC 120289122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATAC 600

120289123 ACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAAC 120289182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAAC 660

120289183 TAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAATATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAAT 120289242
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAAAATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAAT 720

120289243 CAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGC 120289302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGC 780

120289303 ATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTA 120289362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTA 840

120289363 CTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGT 120289422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGT 900

120289423 AAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTAC 120289482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTAC 960

120289483 ATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGT 120289542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGT 1020

120289543 AGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTG 120289602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTG 1080

120289603 CATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGT 120289662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGT 1140

120289663 TGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTT 120289722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTT 1200

120289723 TGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTT 120289782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTT 1260

120289783 GGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAG 120289842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAG 1320

120289843 GAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAA 120289902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAA 1380

120289903 GGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTG 120289962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTG 1440

120289963 AAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGT 120290022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGT 1500

120290023 TTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTT 120290082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTT 1560

120290083 CTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTAT 120290142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTAT 1620

120290143 GTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAAT 120290202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAAT 1680

120290203 TTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1681 TTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 1728

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 1803

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 1863

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 1923

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
     1924 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 1981

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 2041

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 2101

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 2161

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 2221

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 2281

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 2341

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAAC 120292021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAAC 2377

Alignment time is 3.32243 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     5393] =>      5393 nucs 'mol-32-23c5-034318_5393'

Score:        5360
Aligned:      5393        nucs
Identic:      5390 (100%) nucs =>       917 (100%)      4473 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120288299,120289215] EXCISED REGION [120289217,120293692]
 second seq =>  [        1,      917] EXCISED REGION [      919,     5393]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120289216,120289216]
 second seq =>         1 nucs [918,918]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [120293256,120293256]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [916,918] to [917,919]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289215,120289215] to [120289217,120289217]
 second seq =>         1 nucs [917,917] to [919,919]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120288299 ATAATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAA 120288358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAA 60

120288359 ATGAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGA 120288418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGA 120

120288419 GGGAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGC 120288478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGC 180

120288479 TAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAA 120288538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAA 240

120288539 AACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGAT 120288598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGAT 300

120288599 GAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGT 120288658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGT 360

120288659 GAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGT 120288718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGT 420

120288719 TGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATG 120288778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATG 480

120288779 TAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAA 120288838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAA 540

120288839 CTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATA 120288898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATA 600

120288899 ACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCA 120288958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCA 660

120288959 AAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGA 120289018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGA 720

120289019 ATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAG 120289078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAG 780

120289079 ATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCT 120289138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCT 840

120289139 CATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAAT 120289198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAAT 900

120289199 TTCAGACTAGACCTCAA 120289215
          |||||||||||||||||
      901 TTCAGACTAGACCTCAA 917

EXCISED REGION

120289217 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 120289276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 978

120289277 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 120289336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 1038

120289337 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 120289396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 1098

120289397 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 120289456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 1158

120289457 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 120289516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 1218

120289517 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 120289576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 1278

120289577 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 120289636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 1338

120289637 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 120289696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 1398

120289697 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 120289756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 1458

120289757 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 120289816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 1518

120289817 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 120289876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 1578

120289877 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 120289936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 1638

120289937 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 120289996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 1698

120289997 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 120290056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 1758

120290057 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 120290116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 1818

120290117 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 120290176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 1878

120290177 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 120290236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 1938

120290237 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 120290296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 1998

120290297 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 120290356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 2058

120290357 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 120290416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 2118

120290417 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 120290476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 2178

120290477 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 120290536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 2238

120290537 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 120290596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 2298

120290597 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 120290656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 2358

120290657 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 120290716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 2418

120290717 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 120290776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 2478

120290777 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 120290836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 2538

120290837 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 120290896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 2598

120290897 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 120290956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 2658

120290957 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 120291016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 2718

120291017 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 120291076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 2778

120291077 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 120291136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 2838

120291137 AGTCTGACCATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 120291196
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 AGTCTGACCATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 2898

120291197 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 120291256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 2958

120291257 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCA 120291316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCA 3018

120291317 TCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGC 120291376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGC 3078

120291377 CCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGA 120291436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 CCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGA 3138

120291437 GTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTG 120291496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 GTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTG 3198

120291497 CTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAG 120291556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 CTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAG 3258

120291557 GTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTC 120291616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 GTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTC 3318

120291617 CCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTC 120291676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 CCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTC 3378

120291677 CTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCG 120291736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 CTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCG 3438

120291737 GAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATT 120291796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 GAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATT 3498

120291797 CGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAA 120291856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 CGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAA 3558

120291857 TCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAA 120291916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 TCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAA 3618

120291917 AGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACAT 120291976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 AGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACAT 3678

120291977 GATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAA 120292036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 GATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAA 3738

120292037 TCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTC 120292096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 TCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTC 3798

120292097 CTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGA 120292156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 CTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGA 3858

120292157 GTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCG 120292216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 GTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCG 3918

120292217 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 120292276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 3978

120292277 GCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGG 120292336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 GCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGG 4038

120292337 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTG 120292396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTG 4098

120292397 GGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATC 120292456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 GGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATC 4158

120292457 AGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCC 120292516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 AGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCC 4218

120292517 CCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGA 120292576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 CCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGA 4278

120292577 AATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAG 120292636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 AATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAG 4338

120292637 CCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGA 120292696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 CCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGA 4398

120292697 GAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAAC 120292756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 GAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAAC 4458

120292757 CTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCC 120292816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 CTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCC 4518

120292817 CAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAA 120292876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 CAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAA 4578

120292877 GAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAA 120292936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 GAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAA 4638

120292937 ACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTA 120292996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 ACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTA 4698

120292997 GCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGA 120293056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 GCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGA 4758

120293057 TGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCT 120293116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCT 4818

120293117 GTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCT 120293176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 GTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCT 4878

120293177 CCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACAC 120293236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 CCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACAC 4938

120293237 ACCACCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTC 120293296
          ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4939 ACCACCATGCCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTC 4997

120293297 TCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCT 120293356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 TCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCT 5057

120293357 CCCAAAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGC 120293416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 CCCAAAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGC 5117

120293417 CTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTA 120293476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 CTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTA 5177

120293477 GCAACTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGC 120293536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 GCAACTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGC 5237

120293537 TTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTT 120293596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 TTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTT 5297

120293597 TGGTACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATA 120293656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 TGGTACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATA 5357

120293657 TGCCAATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAAT 120293692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 TGCCAATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAAT 5393

Alignment time is 7.05135 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2843] =>      2843 nucs 'mol-32-2afd-006741_2843'

Score:        2831
Aligned:      2842        nucs
Identic:      2841 (100%) nucs =>       760 (100%)      2081 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120288456,120289215] EXCISED REGION [120289217,120291298]
 second seq =>  [        1,      760] EXCISED REGION [      762,     2843]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120289216,120289216]
 second seq =>         1 nucs [761,761]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [759,761] to [760,762]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289215,120289215] to [120289217,120289217]
 second seq =>         1 nucs [760,760] to [762,762]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120288456 GAATAAAATGAAGGAATATATGCTAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAA 120288515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAATAAAATGAAGGAATATATGCTAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAA 60

120288516 AAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAA 120288575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAA 120

120288576 GAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGA 120288635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGA 180

120288636 AAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCC 120288695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCC 240

120288696 CATACATATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCC 120288755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATACATATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCC 300

120288756 TATTAAAATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCA 120288815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTAAAATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCA 360

120288816 ACTACAGCAATCTAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCT 120288875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTACAGCAATCTAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCT 420

120288876 AAATGGCTACTCTACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATT 120288935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATGGCTACTCTACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATT 480

120288936 ATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTA 120288995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTA 540

120288996 AATAAAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAAT 120289055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATAAAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAAT 600

120289056 TCACCTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTA 120289115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCACCTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTA 660

120289116 AAGATACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTG 120289175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGATACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTG 720

120289176 AGATAACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAA 120289215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATAACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAA 760

EXCISED REGION

120289217 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 120289276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 821

120289277 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 120289336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 881

120289337 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 120289396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 941

120289397 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 120289456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 1001

120289457 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 120289516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 1061

120289517 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 120289576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 1121

120289577 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 120289636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 1181

120289637 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 120289696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 1241

120289697 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 120289756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 1301

120289757 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 120289816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 1361

120289817 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 120289876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 1421

120289877 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 120289936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 1481

120289937 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 120289996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 1541

120289997 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 120290056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 1601

120290057 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 120290116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 1661

120290117 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 120290176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 1721

120290177 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 120290236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 1781

120290237 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 120290296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 1841

120290297 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 120290356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 1901

120290357 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 120290416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 1961

120290417 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 120290476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 2021

120290477 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 120290536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 2081

120290537 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 120290596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 2141

120290597 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 120290656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 2201

120290657 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 120290716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 2261

120290717 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 120290776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 2321

120290777 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 120290836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 2381

120290837 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 120290896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 2441

120290897 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 120290956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 2501

120290957 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 120291016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 2561

120291017 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 120291076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 2621

120291077 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 120291136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 2681

120291137 AGTCTGACCATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 120291196
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 AGTCTGACCATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 2741

120291197 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 120291256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 2801

120291257 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTT 120291298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTT 2843

Alignment time is 4.08085 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2690] =>      2690 nucs 'mol-32-2afd-006901_2690'

Score:        2678
Aligned:      2689        nucs
Identic:      2688 (100%) nucs =>      1110 (100%)      1578 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120291220,120292329] EXCISED REGION [120292331,120293909]
 second seq =>  [        1,     1110] EXCISED REGION [     1112,     2690]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120292330,120292330]
 second seq =>         1 nucs [1111,1111]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120291220 TGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACA 120291279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACA 60

120291280 GAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCAC 120291339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCAC 120

120291340 TTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGC 120291399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGC 180

120291400 CTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGAC 120291459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGAC 240

120291460 TCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAA 120291519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAA 300

120291520 AGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCT 120291579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCT 360

120291580 TGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCC 120291639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCC 420

120291640 TGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCC 120291699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCC 480

120291700 CCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCA 120291759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCA 540

120291760 CTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAAT 120291819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAAT 600

120291820 TTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCT 120291879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCT 660

120291880 TAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGG 120291939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGG 720

120291940 ACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAA 120291999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAA 780

120292000 AATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCA 120292059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCA 840

120292060 AACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTAT 120292119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTAT 900

120292120 CTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGG 120292179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGG 960

120292180 AGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCC 120292239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCC 1020

120292240 CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTT 120292299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTT 1080

120292300 TTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACC 120292329
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACC 1110

EXCISED REGION

120292331 TGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAA 120292390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAA 1171

120292391 GTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACA 120292450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 GTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACA 1231

120292451 TGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGG 120292510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGG 1291

120292511 ATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAA 120292570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 ATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAA 1351

120292571 CAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAAT 120292630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 CAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAAT 1411

120292631 TAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATAT 120292690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATAT 1471

120292691 TTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATG 120292750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 TTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATG 1531

120292751 GAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGT 120292810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 GAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGT 1591

120292811 TCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGA 120292870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGA 1651

120292871 TCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATC 120292930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATC 1711

120292931 CCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAG 120292990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 CCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAG 1771

120292991 TGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGA 120293050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGA 1831

120293051 GATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCT 120293110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCT 1891

120293111 CACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCT 120293170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 CACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCT 1951

120293171 CTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAG 120293230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 CTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAG 2011

120293231 GCACACACCACCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGG 120293290
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2012 GCACACACCACCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGG 2071

120293291 GGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCT 120293350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 GGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCT 2131

120293351 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAA 120293410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAA 2191

120293411 TTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAA 120293470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 TTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAA 2251

120293471 ATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGA 120293530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 ATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGA 2311

120293531 GATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCA 120293590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 GATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCA 2371

120293591 TGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCT 120293650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 TGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCT 2431

120293651 GGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTT 120293710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 GGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTT 2491

120293711 TTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAAC 120293770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAAC 2551

120293771 AGTAACACACCTACTATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGA 120293830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 AGTAACACACCTACTATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGA 2611

120293831 GTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAA 120293890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 GTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAA 2671

120293891 AACACAGTGAGAAGAAATA 120293909
          |||||||||||||||||||
     2672 AACACAGTGAGAAGAAATA 2690

Alignment time is 3.89577 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2913] =>      2913 nucs 'mol-32-2b55-119757_2913'

Score:        2827
Aligned:      2860        nucs
Identic:      2857 (100%) nucs =>       114 (100%)      2743 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290706,120290819] EXCISED REGION [120290821,120293566]
 second seq =>  [        1,      114] EXCISED REGION [      116,     2860]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120290820,120290820]
 second seq =>         1 nucs [115,115]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      5799 nucs [120293567,120299365]
 second seq =>         6 nucs [2861,2866]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290706 TGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGC 120290765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGC 60

120290766 TTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTC 120290819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTC 114

EXCISED REGION

120290821 TGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCT 120290880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      116 TGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCT 175

120290881 TCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGA 120290940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 TCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGA 235

120290941 CCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCA 120291000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 CCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCA 295

120291001 AACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTG 120291060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 AACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTG 355

120291061 AGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGG 120291120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 AGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGG 415

120291121 ACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCA 120291180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      416 ACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCA 475

120291181 CTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTT 120291240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 CTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTT 535

120291241 TTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGA 120291300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 TTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGA 595

120291301 GCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCT 120291360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 GCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCT 655

120291361 CAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACT 120291420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 CAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACT 715

120291421 GCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGAT 120291480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 GCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGAT 775

120291481 ATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAG 120291540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 ATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAG 835

120291541 TGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCC 120291600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 TGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCC 895

120291601 TGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATG 120291660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 TGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATG 955

120291661 GGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTAT 120291720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 GGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTAT 1015

120291721 CTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGAC 120291780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 CTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGAC 1075

120291781 TGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATC 120291840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATC 1135

120291841 ATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTA 120291900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 ATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTA 1195

120291901 TTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACT 120291960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACT 1255

120291961 TTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAA 120292020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 TTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAA 1315

120292021 CTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAA 120292080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 CTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAA 1375

120292081 ATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTT 120292140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 ATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTT 1435

120292141 TTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGG 120292200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGG 1495

120292201 CTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAG 120292260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAG 1555

120292261 CTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGG 120292320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGG 1615

120292321 AGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTG 120292380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 AGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTG 1675

120292381 GTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATC 120292440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATC 1735

120292441 TTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGAT 120292500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGAT 1795

120292501 TCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAA 120292560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAA 1855

120292561 AAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATA 120292620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATA 1915

120292621 TATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACT 120292680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACT 1975

120292681 GTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAAC 120292740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAAC 2035

120292741 TGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTT 120292800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 TGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTT 2095

120292801 CAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGC 120292860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGC 2155

120292861 ATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACT 120292920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 ATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACT 2215

120292921 TTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTC 120292980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTC 2275

120292981 TTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAG 120293040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAG 2335

120293041 CAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAA 120293100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 CAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAA 2395

120293101 GATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTC 120293160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 GATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTC 2455

120293161 ACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTG 120293220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 ACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTG 2515

120293221 GGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTG 120293280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     2516 GGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTG 2574

120293281 GTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGAT 120293340
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 GTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGAT 2634

120293341 CCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCC 120293400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 CCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCC 2694

120293401 CTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGAT 120293460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 CTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGAT 2754

120293461 TTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATT 120293520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 TTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATT 2814

120293521 GGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCA 120293566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCA 2860

Alignment time is 3.91952 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     6151] =>      6151 nucs 'mol-32-2dff-096566_6151'

Score:        6117
Aligned:      6150        nucs
Identic:      6147 (100%) nucs =>       296 (100%)      5851 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120288920,120289215] EXCISED REGION [120289217,120295070]
 second seq =>  [        1,      296] EXCISED REGION [      298,     6151]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120289216,120289216]
 second seq =>         1 nucs [297,297]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [295,297] to [296,298]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289215,120289215] to [120289217,120289217]
 second seq =>         1 nucs [296,296] to [298,298]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120288920 ATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAG 120288979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAG 60

120288980 ACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTG 120289039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTG 120

120289040 CATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACA 120289099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACA 180

120289100 GGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGT 120289159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGT 240

120289160 AAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAA 120289215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAA 296

EXCISED REGION

120289217 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 120289276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 357

120289277 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 120289336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 417

120289337 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 120289396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 477

120289397 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 120289456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 537

120289457 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 120289516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 597

120289517 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 120289576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 657

120289577 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 120289636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 717

120289637 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 120289696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 777

120289697 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 120289756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 837

120289757 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 120289816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 897

120289817 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 120289876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 957

120289877 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 120289936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 1017

120289937 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 120289996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 1077

120289997 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 120290056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 1137

120290057 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 120290116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 1197

120290117 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 120290176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 1257

120290177 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 120290236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 1317

120290237 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 120290296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 1377

120290297 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 120290356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 1437

120290357 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 120290416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 1497

120290417 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 120290476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 1557

120290477 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 120290536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 1617

120290537 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 120290596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 1677

120290597 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 120290656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 1737

120290657 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 120290716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 1797

120290717 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 120290776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 1857

120290777 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 120290836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 1917

120290837 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 120290896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 1977

120290897 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 120290956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 2037

120290957 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 120291016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 2097

120291017 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 120291076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 2157

120291077 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 120291136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 2217

120291137 AGTCTGACCATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 120291196
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AGTCTGACCATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 2277

120291197 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 120291256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 2337

120291257 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCA 120291316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCA 2397

120291317 TCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGC 120291376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGC 2457

120291377 CCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGA 120291436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGA 2517

120291437 GTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTG 120291496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTG 2577

120291497 CTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAG 120291556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAG 2637

120291557 GTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTC 120291616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTC 2697

120291617 CCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTC 120291676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTC 2757

120291677 CTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCG 120291736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCG 2817

120291737 GAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATT 120291796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATT 2877

120291797 CGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAA 120291856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAA 2937

120291857 TCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAA 120291916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAA 2997

120291917 AGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACAT 120291976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 AGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACAT 3057

120291977 GATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAA 120292036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAA 3117

120292037 TCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTC 120292096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTC 3177

120292097 CTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGA 120292156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 CTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGA 3237

120292157 GTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCG 120292216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCG 3297

120292217 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 120292276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 3357

120292277 GCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGG 120292336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGG 3417

120292337 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTG 120292396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTG 3477

120292397 GGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATC 120292456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATC 3537

120292457 AGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCC 120292516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCC 3597

120292517 CCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGA 120292576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 CCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGA 3657

120292577 AATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAG 120292636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 AATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAG 3717

120292637 CCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGA 120292696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 CCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGA 3777

120292697 GAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAAC 120292756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 GAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAAC 3837

120292757 CTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCC 120292816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCC 3897

120292817 CAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAA 120292876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 CAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAA 3957

120292877 GAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAA 120292936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAA 4017

120292937 ACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTA 120292996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 ACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTA 4077

120292997 GCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGA 120293056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGA 4137

120293057 TGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCT 120293116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCT 4197

120293117 GTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCT 120293176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 GTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCT 4257

120293177 CCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACAC 120293236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACAC 4317

120293237 ACCACCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTC 120293296
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4318 ACCACCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTC 4377

120293297 TCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCT 120293356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCT 4437

120293357 CCCAAAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGC 120293416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CCCAAAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGC 4497

120293417 CTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTA 120293476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 CTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTA 4557

120293477 GCAACTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGC 120293536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 GCAACTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGC 4617

120293537 TTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTT 120293596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTT 4677

120293597 TGGTACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATA 120293656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TGGTACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATA 4737

120293657 TGCCAATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTG 120293716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TGCCAATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTG 4797

120293717 TAGGGATAAAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAAC 120293776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TAGGGATAAAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAAC 4857

120293777 ACACCTACTATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCT 120293836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 ACACCTACTATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCT 4917

120293837 GATCTCGAGGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACA 120293896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 GATCTCGAGGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACA 4977

120293897 GTGAGAAGAAATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAAC 120293956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GTGAGAAGAAATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAAC 5037

120293957 TTTGCCTGGAGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCA 120294016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 TTTGCCTGGAGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCA 5097

120294017 TGTTTTTGAGCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACA 120294076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TGTTTTTGAGCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACA 5157

120294077 TGTTCAATTCTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGA 120294136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TGTTCAATTCTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGA 5217

120294137 TGATAATGTCCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACG 120294196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TGATAATGTCCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACG 5277

120294197 TGGTTCTTCAGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTC 120294256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TGGTTCTTCAGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTC 5337

120294257 CGAGAATGCAGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAA 120294316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 CGAGAATGCAGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAA 5397

120294317 CATATTCATAGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAA 120294376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CATATTCATAGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAA 5457

120294377 CATAAAACAGTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGT 120294436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 CATAAAACAGTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGT 5517

120294437 TAATTGTTGCAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTAC 120294496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TAATTGTTGCAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTAC 5577

120294497 AGAATCTTTGACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATT 120294556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 AGAATCTTTGACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATT 5637

120294557 TGTGAAGTAACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAA 120294616
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 TGTGAAGCAACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAA 5697

120294617 CCACATAAATATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTAT 120294676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 CCACATAAATATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTAT 5757

120294677 GCATTGTATATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAA 120294736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 GCATTGTATATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAA 5817

120294737 AGAATAAGACAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAG 120294796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 AGAATAAGACAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAG 5877

120294797 TAAAGTGCACAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTA 120294856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TAAAGTGCACAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTA 5937

120294857 GATATAAATATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTT 120294916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 GATATAAATATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTT 5997

120294917 TTATATAAATAAGCTGTCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGA 120294976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TTATATAAATAAGCTGTCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGA 6057

120294977 AGATGAAATATAATATTCACTTATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGT 120295036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 AGATGAAATATAATATTCACTTATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGT 6117

120295037 GTATGTATTACCTATTCAAAAATGCATTAAATGA 120295070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 GTATGTATTACCTATTCAAAAATGCATTAAATGA 6151

Alignment time is 7.78764 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3186] =>      3186 nucs 'mol-32-2ef1-007616_3186'

Score:        3124
Aligned:      3174        nucs
Identic:      3167 (100%) nucs =>       138 ( 99%)      3029 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290111,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294419]
 second seq =>  [        1,      140] EXCISED REGION [      156,     3186]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [141,155]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [140,140] to [155,155]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [141,143] to [153,155]

120290111 TTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAG 120290170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAG 60

120290171 TATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTG 120290230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
       61 TATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTG 120

120290231 GGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||.||||||||||||||
      121 GGGAAATTCTCCTGGATAAT 140

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 215

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 275

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 335

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      336 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 393

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      394 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 453

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      454 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 513

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      514 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 573

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      574 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 633

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 693

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 753

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 813

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 873

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      874 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 932

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 992

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1052

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1112

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1172

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1232

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1292

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1352

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1412

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1472

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1532

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1592

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1652

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1712

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1772

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1832

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1892

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1952

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 2012

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2072

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2132

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2192

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2252

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2312

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2372

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2432

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2492

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2552

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2612

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2672

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2732

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2792

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2852

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2912

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2972

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 3032

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3092

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3152

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTAT 120294419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTAT 3186

Alignment time is 4.24411 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     8347] =>      8347 nucs 'mol-32-2ef1-050718_8347'

Score:        8252
Aligned:      8335        nucs
Identic:      8325 (100%) nucs =>      4858 (100%)      3467 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120285388,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294857]
 second seq =>  [        1,     4863] EXCISED REGION [     4879,     8347]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [4864,4878]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4863,4863] to [4878,4878]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [4864,4866] to [4876,4878]

120285388 GCCCATGACTAGTGGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGCTAA 120285447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCCATGACTAGTGGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGCTAA 60

120285448 TATAGAGTTCTGTGTCCCATGGCTGGCCATATGACCAGTTGCATGCTAACATAGGGTTCT 120285507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATAGAGTTCTGTGTCCCATGGCTGGCCATATGACCAGTTGCATGCTAACATAGGGTTCT 120

120285508 GTGTCCAGTGGCTGACCACATGACATGTGCCATACTAATACAGAGTTCTGTGTTTCACGG 120285567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGTCCAGTGGCTGACCACATGACATGTGCCATACTAATACAGAGTTCTGTGTTTCACGG 180

120285568 CTGGCCACATGACAAGTGGCATGCTAACAGAGCATGCTGTGTCCCATGGCTGACCACATA 120285627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGCCACATGACAAGTGGCATGCTAACAGAGCATGCTGTGTCCCATGGCTGACCACATA 240

120285628 ACATGTGGCATGCTAATACAGAGTTCTGTGTTTCATGGCTGGCCACATGACAATTGGCAT 120285687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATGTGGCATGCTAATACAGAGTTCTGTGTTTCATGGCTGGCCACATGACAATTGGCAT 300

120285688 GCTAATTTAGGGTTCTGCTTCCAATGGCTGGCCACTGACAATTGGCATGCTAATATATGG 120285747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTAATTTAGGGTTCTGCTTCCAATGGCTGGCCACTGACAATTGGCATGCTAATATATGG 360

120285748 TTCTGTGTCCCATGCCTGGACACGTGACAAGTGGCATACTAATATTGGATTCTGTGCCCA 120285807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTGTGTCCCATGCCTGGACACGTGACAAGTGGCATACTAATATTGGATTCTGTGCCCA 420

120285808 ATGGCTGGCCACTGAGAAGTGGCATGCTAATATGGTGTTTTATGTCCAATAGCTGACCAT 120285867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGCTGGCCACTGAGAAGTGGCATGCTAATATGGTGTTTTATGTCCAATAGCTGACCAT 480

120285868 GTGACAAATGGCATCCTAATATAGGGTTTTGTGTTCAGTGACAAAATAGCTTCACATTCA 120285927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGACAAATGGCATCCTAATATAGGGTTTTGTGTTCAGTGACAAAATAGCTTCACATTCA 540

120285928 TATAGATAAAGACATGAACTCAGTGGACACTTAGCAAGTTATGTCTCCCTCTCCTTTAAT 120285987
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATAGATAAAGACATGAACTCATTGGACACTTAGCAAGTTATGTCTCCCTCTCCTTTAAT 600

120285988 AAACACTGGAAGTCCTCATATTTAGCAAGGTGAGAAAATAGATACCACTATTTAAGCATC 120286047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACACTGGAAGTCCTCATATTTAGCAAGGTGAGAAAATAGATACCACTATTTAAGCATC 660

120286048 CACTACCAAGATATGACTTTGTTGTCTTTTGTGCAGCTGTGGACCAAAAATCACTTCTCT 120286107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTACCAAGATATGACTTTGTTGTCTTTTGTGCAGCTGTGGACCAAAAATCACTTCTCT 720

120286108 TCAGAAAGATAAAAATGTGGCCCTAGGAAATAAACTAAAGTCTGCTGGAATTATTTTGCA 120286167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAGAAAGATAAAAATGTGGCCCTAGGAAATAAACTAAAGTCTGCTGGAATTATTTTGCA 780

120286168 ATCCTGACACTACATTATGACAATCTGTCCCAAGATTTCCTTCCCACAACCATATGTGAC 120286227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCTGACACTACATTATGACAATCTGTCCCAAGATTTCCTTCCCACAACCATATGTGAC 840

120286228 CCATTTAACGCAGCCCAATAAGTGATTCTCTGTTTCTGAATGAGCAATGAAGAGAAATTT 120286287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCATTTAACGCAGCCCAATAAGTGATTCTCTGTTTCTGAATGAGCAATGAAGAGAAATTT 900

120286288 GAAAAACATTCATCTCTGCAACAACATTGCTGTGGCATTAACATCCTTCTTCTCCATGGC 120286347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAAACATTCATCTCTGCAACAACATTGCTGTGGCATTAACATCCTTCTTCTCCATGGC 960

120286348 CTGCCTCCTTCCTTTCCATCCTCACTGATAGCTCCTTCTTTTCTCTTTTCCCAATAGCTT 120286407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCCTCCTTCCTTTCCATCCTCACTGATAGCTCCTTCTTTTCTCTTTTCCCAATAGCTT 1020

120286408 AGATTTGTTTCAACTCCTTGATGTAATCATGCCCTAAGACATCTTTTTAAAAAGTAATTT 120286467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATTTGTTTCAACTCCTTGATGTAATCATGCCCTAAGACATCTTTTTAAAAAGTAATTT 1080

120286468 TTCTGTTAGTGATTTTATTGATTATCATTTATTTAAAATTAGATATTTGTCTTTCAATTT 120286527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTGTTAGTGATTTTATTGATTATCATTTATTTAAAATTAGATATTTGTCTTTCAATTT 1140

120286528 TGTTTATGGTGATTTTTTTCTGTCAACTCTTATATTTGCTTTGTATGCTTTCAAATCTGT 120286587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTTATGGTGATTTTTTTCTGTCAACTCTTATATTTGCTTTGTATGCTTTCAAATCTGT 1200

120286588 CATCACCCTTCTTCATGGTTTTTGCCTATGGCAACATGCAGTGAAAAGGTTTTTCCACTT 120286647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATCACCCTTCTTCATGGTTTTTGCCTATGGCAACATGCAGTGAAAAGGTTTTTCCACTT 1260

120286648 TAAGGTTAGATGAATGGACAAATGGCTTCAATTTTGCTGAAGGGGAAGAAAGAAAAATGA 120286707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAGGTTAGATGAATGGACAAATGGCTTCAATTTTGCTGAAGGGGAAGAAAGAAAAATGA 1320

120286708 GTATAAAGATTAGTTTCTAAATAAATAAGTTATTTTAAAAAACTGTAAAGTAATAGATAT 120286767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTATAAAGATTAGTTTCTAAATAAATAAGTTATTTTAAAAAACTGTAAAGTAATAGATAT 1380

120286768 CCTACTAGTGGGGAAAATAATGAAATAGTTTTGTCTTTCATTTCAGCAAAGATTCGGTAC 120286827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTACTAGTGGGGAAAATAATGAAATAGTTTTGTCTTTCATTTCAGCAAAGATTCGGTAC 1440

120286828 TGAATTGGTACAGACCATATTCCTTTAGAAAGATAACAATTTAGAAAGTATATTTTCTAC 120286887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAATTGGTACAGACCATATTCCTTTAGAAAGATAACAATTTAGAAAGTATATTTTCTAC 1500

120286888 TAGTGAAAGTACAAGCCTCACTTTGGTTTTTAAATCTTCTCCCTTGGTTTTGTTTACTCA 120286947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGTGAAAGTACAAGCCTCACTTTGGTTTTTAAATCTTCTCCCTTGGTTTTGTTTACTCA 1560

120286948 GATATGTTTGAACTTATGGAAAGACAACTCAAAGAGTCACTTGTTCTTAAACTTTCGGAT 120287007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATATGTTTGAACTTATGGAAAGACAACTCAAAGAGTCACTTGTTCTTAAACTTTCGGAT 1620

120287008 CCATTTTTCGGATATGCAGAGTAGTGAGCAATTTCGCCTAAGCAATAAAGAGTTCACTGA 120287067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCATTTTTCGGATATGCAGAGTAGTGAGCAATTTCGCCTAAGCAATAAAGAGTTCACTGA 1680

120287068 AAAAGACTTTAGGTTGAAAGTATTTCTTTTACCTGAAATATCATGAAGTAATAATTTCTA 120287127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAGACTTTAGGTTGAAAGTATTTCTTTTACCTGAAATATCATGAAGTAATAATTTCTA 1740

120287128 TAATACCAGGTCTTGAACTGTTTTTACAGTATGGTTTAAGTTTCTTTGTTTCTGTTTTTT 120287187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAATACCAGGTCTTGAACTGTTTTTACAGTATGGTTTAAGTTTCTTTGTTTCTGTTTTTT 1800

120287188 TCAGCCTAATCTTTGTGCATAGTACTCTCTTCATTGATCGAATGTATTTGAATTCAAAGG 120287247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAGCCTAATCTTTGTGCATAGTACTCTCTTCATTGATCGAATGTATTTGAATTCAAAGG 1860

120287248 TCTATGATTATAATATGCCTTAAGTTAAACATCATATTAACCTTCAGCGCATAGAGTTTG 120287307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTATGATTATAATATGCCTTAAGTTAAACATCATATTAACCTTCAGCGCATAGAGTTTG 1920

120287308 CTTTTGGTGCACTAGCAACAGGCTGCCTGGCAGCCCTGACTGCCCTTGAACTCAGTTCTC 120287367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTTTGGTGCACTAGCAACAGGCTGCCTGGCAGCCCTGACTGCCCTTGAACTCAGTTCTC 1980

120287368 TGTGGCTGGCTGGAGTTATAAGGATGGAACTTTCAAACACCTACACCACAGCTGCTGAGC 120287427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTGGCTGGCTGGAGTTATAAGGATGGAACTTTCAAACACCTACACCACAGCTGCTGAGC 2040

120287428 CTTTCAGATAAGGCGGGGATAGACCCATTAACCTCATGTCATTATCTTTATTTTATGGCT 120287487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTTCAGATAAGGCGGGGATAGACCCATTAACCTCATGTCATTATCTTTATTTTATGGCT 2100

120287488 GATAAAACTGTTTCTTTTGTGTGTCTTACTCTCCAAGACCCCTCTCACCTTCCCCCTTGC 120287547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATAAAACTGTTTCTTTTGTGTGTCTTACTCTCCAAGACCCCTCTCACCTTCCCCCTTGC 2160

120287548 TTTAAAAACACATTAATATCATAATCTAGTTAAATTAGTTTGTTGCCATATTGAAAATAA 120287607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTAAAAACACATTAATATCATAATCTAGTTAAATTAGTTTGTTGCCATATTGAAAATAA 2220

120287608 GGCTCTTTTTGTTTCTAGTCAGGTTGATACAGCAAGAGTTTATTGACAAGATGTGGCTGC 120287667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGCTCTTTTTGTTTCTAGTCAGGTTGATACAGCAAGAGTTTATTGACAAGATGTGGCTGC 2280

120287668 AGAAAAGAACGGCTAATTATTTTCATTTGCATGAATGGCTTACTGCTTTTGCCTAATTAC 120287727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAAAAGAACGGCTAATTATTTTCATTTGCATGAATGGCTTACTGCTTTTGCCTAATTAC 2340

120287728 TGTTTAGTACAATACTGTTAATATTCTCCATTAAATATTTGCCAAATTAACTTTGCCGTA 120287787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTTTAGTACAATACTGTTAATATTCTCCATTAAATATTTGCCAAATTAACTTTGCCGTA 2400

120287788 AGTTTTCATTAGTTTTAACATTCAACTCTGAATATAAGTATGCAGGCATACTGTGTAGTA 120287847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTTTTCATTAGTTTTAACATTCAACTCTGAATATAAGTATGCAGGCATACTGTGTAGTA 2460

120287848 TTATGCTCACTGAACATGGAAAGCTACTCTAAAATGTTAATACATTTAGCAGTAACGTTA 120287907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTATGCTCACTGAACATGGAAAGCTACTCTAAAATGTTAATACATTTAGCAGTAACGTTA 2520

120287908 GAATACACAGATTTTATTCCCACATATACGGTATATGCATAGAAGTATGTATGCATATAG 120287967
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAATACACAGATTTTATTCCCACATATACAGTATATGCATAGAAGTATGTATGCATATAG 2580

120287968 ATATAGATATTTATCTTGTTACACATAGATGTGTACAATAGTCTTGCCTTGCTTTGTCGG 120288027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATAGATATTTATCTTGTTACACATAGATGTGTACAATAGTCTTGCCTTGCTTTGTCGG 2640

120288028 CATGTCTAAGTACAGTAATATTAGCAATTGCAATTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGA 120288087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CATGTCTAAGTACAGTAATATTAGCAATTGCAATTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGA 2700

120288088 ATAAGTAGATGAAAGATTTCTACTTCTAAAAAGAAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGT 120288147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATAAGTAGATGAAAGATTTCTACTTCTAAAAAGAAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGT 2760

120288148 CCTCCTAAAAATAGGTTTTCCTGTCCTCCTAAACTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTG 120288207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCTCCTAAAAATAGGTTTTCCTGTCCTCCTAAACTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTG 2820

120288208 TCCCCACGGAGAGAGATGGAAAAACCTAATGGCACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTA 120288267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCCCACGGAGAGAGATGGAAAAACCTAATGGCACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTA 2880

120288268 TAATTAAAAAGATGATTAAGGAAAGGTAATGATAATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTG 120288327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAATTAAAAAGATGATTAAGGAAAGGTAATGATAATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTG 2940

120288328 GATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAAATGAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTG 120288387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAAATGAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTG 3000

120288388 GGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGAGGGAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAA 120288447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGAGGGAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAA 3060

120288448 GAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGCTAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAG 120288507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGCTAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAG 3120

120288508 GAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAA 120288567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAA 3180

120288568 AGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAA 120288627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAA 3240

120288628 AGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTT 120288687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTT 3300

120288688 GCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTC 120288747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTC 3360

120288748 CTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAA 120288807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAA 3420

120288808 TCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCA 120288867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCA 3480

120288868 TTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACA 120288927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACA 3540

120288928 AAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATA 120288987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATA 3600

120288988 TTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAA 120289047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAA 3660

120289048 ATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAA 120289107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAA 3720

120289108 AGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAG 120289167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAG 3780

120289168 AATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAATATAAGACTTCC 120289227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3781 AATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAAAATAAGACTTCC 3840

120289228 TTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTA 120289287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTA 3900

120289288 TTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTG 120289347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTG 3960

120289348 CCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAA 120289407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAA 4020

120289408 TCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAAT 120289467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAAT 4080

120289468 GCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCT 120289527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCT 4140

120289528 GTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCA 120289587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCA 4200

120289588 TTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCC 120289647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCC 4260

120289648 ACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTC 120289707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTC 4320

120289708 TGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGA 120289767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGA 4380

120289768 TGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTT 120289827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTT 4440

120289828 TAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCAT 120289887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCAT 4500

120289888 TTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGTTTGGCTGGATG 120289947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGTTTGGCTGGATG 4560

120289948 TGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCT 120290007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCT 4620

120290008 TCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTG 120290067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTG 4680

120290068 GATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGT 120290127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGT 4740

120290128 GAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCT 120290187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCT 4800

120290188 CTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGAT 120290247
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4801 CTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGAT 4860

120290248 AAT 120290250
          |||
     4861 AAT 4863

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 4938

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 4998

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 5058

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
     5059 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 5116

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 5176

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 5236

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 5296

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 5356

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 5416

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 5476

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 5536

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 5596

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     5597 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 5655

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 5715

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 5775

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5776 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 5835

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 5895

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5896 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 5955

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5956 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 6015

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6016 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 6075

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6076 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 6135

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6136 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 6195

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6196 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 6255

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6256 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 6315

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6316 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 6375

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6376 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 6435

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6436 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 6495

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6496 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 6555

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6556 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 6615

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6616 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 6675

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6676 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 6735

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6736 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 6795

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6796 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 6855

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6856 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 6915

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6916 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 6975

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6976 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 7035

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7036 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 7095

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7096 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 7155

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7156 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 7215

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7216 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 7275

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7276 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 7335

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7336 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 7395

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7396 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 7455

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7456 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 7515

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7516 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 7575

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7576 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 7635

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7636 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 7695

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7696 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 7755

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7756 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 7815

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7816 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 7875

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7876 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 7935

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7936 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 7995

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7996 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 8055

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8056 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 8115

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 120294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8116 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 8175

120294686 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 120294745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8176 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 8235

120294746 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 120294805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8236 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 8295

120294806 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAG 120294857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8296 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAG 8347

Alignment time is 10.2547 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3469] =>      3469 nucs 'mol-32-2ef1-050718_3469'

Score:        3457
Aligned:      3468        nucs
Identic:      3467 (100%) nucs =>       231 (100%)      3236 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120291388,120291618] EXCISED REGION [120291621,120294857]
 second seq =>  [        1,      231] EXCISED REGION [      234,     3469]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [120291619,120291620]
 second seq =>         2 nucs [232,233]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [120291619,120291621] to [120291621,120291623]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 60

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 180

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC 120291618
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC 231

EXCISED REGION

120291621 GTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGC 120291680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      234 GTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGC 293

120291681 ACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAA 120291740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      294 ACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAA 353

120291741 TCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGC 120291800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 TCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGC 413

120291801 CATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAA 120291860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 CATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAA 473

120291861 GTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGT 120291920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 GTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGT 533

120291921 AAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATT 120291980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 AAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATT 593

120291981 TTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTG 120292040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTG 653

120292041 TTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTAT 120292100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTAT 713

120292101 CCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCT 120292160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
      714 CCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCT 772

120292161 TGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTC 120292220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTC 832

120292221 CCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCAC 120292280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCAC 892

120292281 CACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAG 120292340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAG 952

120292341 GATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGAT 120292400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 GATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGAT 1012

120292401 TACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAG 120292460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAG 1072

120292461 TAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCAT 120292520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCAT 1132

120292521 GCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATG 120292580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATG 1192

120292581 ACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCA 120292640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 ACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCA 1252

120292641 CCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGT 120292700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 CCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGT 1312

120292701 GATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTG 120292760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 GATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTG 1372

120292761 AGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAAT 120292820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 AGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAAT 1432

120292821 GCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGA 120292880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGA 1492

120292881 GGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTT 120292940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTT 1552

120292941 TGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAG 120293000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAG 1612

120293001 AAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGA 120293060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 AAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGA 1672

120293061 AGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCA 120293120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 AGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCA 1732

120293121 ACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 120293180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 ACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 1792

120293181 AGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCA 120293240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCA 1852

120293241 CCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTA 120293300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 CCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTA 1912

120293301 TGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCA 120293360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 TGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCA 1972

120293361 AAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCA 120293420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 AAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCA 2032

120293421 TTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAA 120293480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAA 2092

120293481 CTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCA 120293540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCA 2152

120293541 TTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGT 120293600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 TTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGT 2212

120293601 ACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCC 120293660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 ACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCC 2272

120293661 AATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGG 120293720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 AATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGG 2332

120293721 GATAAAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACAC 120293780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 GATAAAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACAC 2392

120293781 CTACTATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATC 120293840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 CTACTATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATC 2452

120293841 TCGAGGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGA 120293900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 TCGAGGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGA 2512

120293901 GAAGAAATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTG 120293960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 GAAGAAATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTG 2572

120293961 CCTGGAGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTT 120294020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CCTGGAGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTT 2632

120294021 TTTGAGCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTT 120294080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TTTGAGCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTT 2692

120294081 CAATTCTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGAT 120294140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 CAATTCTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGAT 2752

120294141 AATGTCCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGT 120294200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 AATGTCCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGT 2812

120294201 TCTTCAGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAG 120294260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 TCTTCAGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAG 2872

120294261 AATGCAGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATA 120294320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 AATGCAGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATA 2932

120294321 TTCATAGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATA 120294380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 TTCATAGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATA 2992

120294381 AAACAGTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAAT 120294440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 AAACAGTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAAT 3052

120294441 TGTTGCAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAA 120294500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 TGTTGCAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAA 3112

120294501 TCTTTGACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTG 120294560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 TCTTTGACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTG 3172

120294561 AAGTAACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCAC 120294620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 AAGTAACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCAC 3232

120294621 ATAAATATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCAT 120294680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 ATAAATATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCAT 3292

120294681 TGTATATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAA 120294740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 TGTATATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAA 3352

120294741 TAAGACAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAA 120294800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 TAAGACAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAA 3412

120294801 GTGCACAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAG 120294857
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 GTGCACAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAG 3469

Alignment time is 4.73994 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     5083] =>      5083 nucs 'mol-32-2efc-056726_5083'

Score:        5000
Aligned:      5072        nucs
Identic:      5063 (100%) nucs =>       731 (100%)      4332 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120289518,120290250] EXCISED REGION [120291388,120295724]
 second seq =>  [        1,      733] EXCISED REGION [      749,     5083]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [734,748]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [733,733] to [748,748]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [734,736] to [746,748]

120289518 TAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAA 120289577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAA 60

120289578 TTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATA 120289637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATA 120

120289638 TCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCA 120289697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCA 180

120289698 TTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCAT 120289757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCAT 240

120289758 TCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCC 120289817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCC 300

120289818 TTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAAT 120289877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAAT 360

120289878 CTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGTT 120289937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGTT 420

120289938 TGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCC 120289997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCC 480

120289998 CCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCT 120290057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCT 540

120290058 TCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTT 120290117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTT 600

120290118 CAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTT 120290177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTT 660

120290178 GTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGT 120290237
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
      661 GTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAAT 720

120290238 TCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||||||||||
      721 TCTCCTGGATAAT 733

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      749 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 808

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      809 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 868

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 928

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      929 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 986

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 1046

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 1106

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 1166

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 1226

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 1286

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 1346

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 1406

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 1466

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1467 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 1525

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 1585

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1645

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1705

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1765

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1825

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1885

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1945

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 2005

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 2065

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 2125

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 2185

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 2245

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 2305

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 2365

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 2425

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 2485

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 2545

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 2605

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 CCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2664

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2724

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2784

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2844

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2904

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2964

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 3024

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 3084

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 3144

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 3204

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 3264

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 3324

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 3384

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 3444

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 3504

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 3564

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 3624

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3684

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3744

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3804

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3864

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3924

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3984

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 120294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 4044

120294686 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 120294745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 4104

120294746 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 120294805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 4164

120294806 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAAT 120294865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAAT 4224

120294866 ATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAA 120294925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 ATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAA 4284

120294926 TAAGCTGTCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAAT 120294985
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TAAGCTATCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAAT 4344

120294986 ATAATATTCACTTATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGTGTATGTATT 120295045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 ATAATATTCACTTATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGTGTATGTATT 4404

120295046 ACCTATTCAAAAATGCATTAAATGAATCTAGAAAATAAATACCTAAAACACAGAATATCA 120295105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 ACCTATTCAAAAATGCATTAAATGAATCTAGAAAATAAATACCTAAAACACAGAATATCA 4464

120295106 TCCACAACCATATTTATAATTGTCTTGGTGGAAAGGATTTTTGTAAATTCACAAGGGTTA 120295165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 TCCACAACCATATTTATAATTGTCTTGGTGGAAAGGATTTTTGTAAATTCACAAGGGTTA 4524

120295166 TACATGTTAATTCATTTTTATATTTAGAAAAATAGTTTGAATTTTTTCTAAAGGAAGAAT 120295225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 TACATGTTAATTCATTTTTATATTTAGAAAAATAGTTTGAATTTTTTCTAAAGGAAGAAT 4584

120295226 ATTTTTAAAATTCTTTAATTTACTTTTTCCCCCAGGAAGTAAATAAACTTCAATTACTTT 120295285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 ATTTTTAAAATTCTTTAATTTACTTTTTCCCCCAGGAAGTAAATAAACTTCAATTACTTT 4644

120295286 ACACCAAAAGAGGCAGCATCAGCTATAAAAAAGGGATGAATCCTGTATTTGATAGCATAA 120295345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 ACACCAAAAGAGGCAGCATCAGCTATAAAAAAGGGATGAATCCTGTATTTGATAGCATAA 4704

120295346 ATGAGGCATAATAATCAAAGAAAAAACTTTTGAAAAGAAGAATGTTTGAGCTACAGGACC 120295405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 ATGAGGCATAATAATCAAAGAAAAAACTTTTGAAAAGAAGAATGTTTGAGCTACAGGACC 4764

120295406 CTTGGGATGCCAGCAGTAATTTACACACCATTACTTATTCAGGGTTGCATTCCTAATTAC 120295465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 CTTGGGATGCCAGCAGTAATTTACACACCATTACTTATTCAGGGTTGCATTCCTAATTAC 4824

120295466 TCTTTGGTAAAAAAATAATTATTATACTATAGTGATTACTCCTTTCATCACAGAAGAGAA 120295525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TCTTTGGTAAAAAAATAATTATTATACTATAGTGATTACTCCTTTCATCACAGAAGAGAA 4884

120295526 ACAATGCTGATATAGGCAAATCTTAAAGAAATAGAACTCTAGTTTGTTGATAAAGTTGTT 120295585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 ACAATGCTGATATAGGCAAATCTTAAAGAAATAGAACTCTAGTTTGTTGATAAAGTTGTT 4944

120295586 TATATGCAGTAGTTGAAGGGGAATATAGTAATAGCAAAAACATATTTCTTAAAGAGCATT 120295645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 TATATGCAGTAGTTGAAGGGGAATATAGTAATAGCAAAAACATATTTCTTAAAGAGCATT 5004

120295646 GAGTTTTCCAGCAAACTCTCATGCTCAAGTATTTTTACAAAAATGTACATAAACCAAGTC 120295705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 GAGTTTTCCAGCAAACTCTCATGCTCAAGTATTTTTACAAAAATGTACATAAACCAAGTC 5064

120295706 AAATTTTAAACTTGATTCT 120295724
          |||||||||||||||||||
     5065 AAATTTTAAACTTGATTCT 5083

Alignment time is 6.55932 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     7719] =>      7719 nucs 'mol-32-2fb7-067868_7719'

Score:        7697
Aligned:      7719        nucs
Identic:      7717 (100%) nucs =>      4386 (100%)      3331 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120284830,120289215] EXCISED REGION [120289217,120292549]
 second seq =>  [        1,     4386] EXCISED REGION [     4388,     7719]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120289216,120289216]
 second seq =>         1 nucs [4387,4387]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [120289260,120289260]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [4385,4387] to [4386,4388]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289215,120289215] to [120289217,120289217]
 second seq =>         1 nucs [4386,4386] to [4388,4388]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120284830 AGCCCTCCTACAGAAATTATTTGTGTGTCTAGTATTTATCTCTTATCCTAATATATCCTG 120284889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCCTCCTACAGAAATTATTTGTGTGTCTAGTATTTATCTCTTATCCTAATATATCCTG 60

120284890 GACTAGGTATAACTTTTATTGATAATCTTTCTAAACCTTCATACACGCATGATAGATAAT 120284949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACTAGGTATAACTTTTATTGATAATCTTTCTAAACCTTCATACACGCATGATAGATAAT 120

120284950 GAATATTTATTGAATGAATTCACAGTTATTCTATTTTATGTGTTGATGGAGTTTTTTTTT 120285009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATATTTATTGAATGAATTCACAGTTATTCTATTTTATGTGTTGATGGAGTTTTTTTTT 180

120285010 CCTATGAAGTTTTTCTGTGCTGCCTCTCTCTAAACTTTTTATATGTCCCATATCTGCCTT 120285069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTATGAAGTTTTTCTGTGCTGCCTCTCTCTAAACTTTTTATATGTCCCATATCTGCCTT 240

120285070 TAATGTCTCTCTGTGCCTACTGCAATGATATGTATTCAGACAGCATGTGTTATAGGTTGT 120285129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATGTCTCTCTGTGCCTACTGCAATGATATGTATTCAGACAGCATGTGTTATAGGTTGT 300

120285130 TAAATGACTCAGGAAATTGGTTTAGTAAAACAGATACAAGTTCAGAAGTAGTTTGAGTTC 120285189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAATGACTCAGGAAATTGGTTTAGTAAAACAGATACAAGTTCAGAAGTAGTTTGAGTTC 360

120285190 TCACAACTAAATAAAGTGATGGAATCAAACTGTAGCCCTGAGCCTCATTGCTATAAAAGC 120285249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCACAACTAAATAAAGTGATGGAATCAAACTGTAGCCCTGAGCCTCATTGCTATAAAAGC 420

120285250 CTGCGTATAAGCCGGCCGCTTGATAAATGGCATGCTAATATGTGATTCTGTGTCTAGTGG 120285309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGCGTATAAGCCGGCCGCTTGATAAATGGCATGCTAATATGTGATTCTGTGTCTAGTGG 480

120285310 CTGACCACGTGTCTTGTGGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTAGCATG 120285369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGACCACGTGTCTTGTGGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTAGCATG 540

120285370 TTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCA 120285429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCA 600

120285430 TGACTAGTGGCATGCTAATATAGAGTTCTGTGTCCCATGGCTGGCCATATGACCAGTTGC 120285489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGACTAGTGGCATGCTAATATAGAGTTCTGTGTCCCATGGCTGGCCATATGACCAGTTGC 660

120285490 ATGCTAACATAGGGTTCTGTGTCCAGTGGCTGACCACATGACATGTGCCATACTAATACA 120285549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGCTAACATAGGGTTCTGTGTCCAGTGGCTGACCACATGACATGTGCCATACTAATACA 720

120285550 GAGTTCTGTGTTTCACGGCTGGCCACATGACAAGTGGCATGCTAACAGAGCATGCTGTGT 120285609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGTTCTGTGTTTCACGGCTGGCCACATGACAAGTGGCATGCTAACAGAGCATGCTGTGT 780

120285610 CCCATGGCTGACCACATAACATGTGGCATGCTAATACAGAGTTCTGTGTTTCATGGCTGG 120285669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCATGGCTGACCACATAACATGTGGCATGCTAATACAGAGTTCTGTGTTTCATGGCTGG 840

120285670 CCACATGACAATTGGCATGCTAATTTAGGGTTCTGCTTCCAATGGCTGGCCACTGACAAT 120285729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACATGACAATTGGCATGCTAATTTAGGGTTCTGCTTCCAATGGCTGGCCACTGACAAT 900

120285730 TGGCATGCTAATATATGGTTCTGTGTCCCATGCCTGGACACGTGACAAGTGGCATACTAA 120285789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGCATGCTAATATATGGTTCTGTGTCCCATGCCTGGACACGTGACAAGTGGCATACTAA 960

120285790 TATTGGATTCTGTGCCCAATGGCTGGCCACTGAGAAGTGGCATGCTAATATGGTGTTTTA 120285849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTGGATTCTGTGCCCAATGGCTGGCCACTGAGAAGTGGCATGCTAATATGGTGTTTTA 1020

120285850 TGTCCAATAGCTGACCATGTGACAAATGGCATCCTAATATAGGGTTTTGTGTTCAGTGAC 120285909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTCCAATAGCTGACCATGTGACAAATGGCATCCTAATATAGGGTTTTGTGTTCAGTGAC 1080

120285910 AAAATAGCTTCACATTCATATAGATAAAGACATGAACTCAGTGGACACTTAGCAAGTTAT 120285969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAATAGCTTCACATTCATATAGATAAAGACATGAACTCAGTGGACACTTAGCAAGTTAT 1140

120285970 GTCTCCCTCTCCTTTAATAAACACTGGAAGTCCTCATATTTAGCAAGGTGAGAAAATAGA 120286029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTCCCTCTCCTTTAATAAACACTGGAAGTCCTCATATTTAGCAAGGTGAGAAAATAGA 1200

120286030 TACCACTATTTAAGCATCCACTACCAAGATATGACTTTGTTGTCTTTTGTGCAGCTGTGG 120286089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACCACTATTTAAGCATCCACTACCAAGATATGACTTTGTTGTCTTTTGTGCAGCTGTGG 1260

120286090 ACCAAAAATCACTTCTCTTCAGAAAGATAAAAATGTGGCCCTAGGAAATAAACTAAAGTC 120286149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCAAAAATCACTTCTCTTCAGAAAGATAAAAATGTGGCCCTAGGAAATAAACTAAAGTC 1320

120286150 TGCTGGAATTATTTTGCAATCCTGACACTACATTATGACAATCTGTCCCAAGATTTCCTT 120286209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCTGGAATTATTTTGCAATCCTGACACTACATTATGACAATCTGTCCCAAGATTTCCTT 1380

120286210 CCCACAACCATATGTGACCCATTTAACGCAGCCCAATAAGTGATTCTCTGTTTCTGAATG 120286269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCACAACCATATGTGACCCATTTAACGCAGCCCAATAAGTGATTCTCTGTTTCTGAATG 1440

120286270 AGCAATGAAGAGAAATTTGAAAAACATTCATCTCTGCAACAACATTGCTGTGGCATTAAC 120286329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCAATGAAGAGAAATTTGAAAAACATTCATCTCTGCAACAACATTGCTGTGGCATTAAC 1500

120286330 ATCCTTCTTCTCCATGGCCTGCCTCCTTCCTTTCCATCCTCACTGATAGCTCCTTCTTTT 120286389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCCTTCTTCTCCATGGCCTGCCTCCTTCCTTTCCATCCTCACTGATAGCTCCTTCTTTT 1560

120286390 CTCTTTTCCCAATAGCTTAGATTTGTTTCAACTCCTTGATGTAATCATGCCCTAAGACAT 120286449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCTTTTCCCAATAGCTTAGATTTGTTTCAACTCCTTGATGTAATCATGCCCTAAGACAT 1620

120286450 CTTTTTAAAAAGTAATTTTTCTGTTAGTGATTTTATTGATTATCATTTATTTAAAATTAG 120286509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTTTAAAAAGTAATTTTTCTGTTAGTGATTTTATTGATTATCATTTATTTAAAATTAG 1680

120286510 ATATTTGTCTTTCAATTTTGTTTATGGTGATTTTTTTCTGTCAACTCTTATATTTGCTTT 120286569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATATTTGTCTTTCAATTTTGTTTATGGTGATTTTTTTCTGTCAACTCTTATATTTGCTTT 1740

120286570 GTATGCTTTCAAATCTGTCATCACCCTTCTTCATGGTTTTTGCCTATGGCAACATGCAGT 120286629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTATGCTTTCAAATCTGTCATCACCCTTCTTCATGGTTTTTGCCTATGGCAACATGCAGT 1800

120286630 GAAAAGGTTTTTCCACTTTAAGGTTAGATGAATGGACAAATGGCTTCAATTTTGCTGAAG 120286689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAAAGGTTTTTCCACTTTAAGGTTAGATGAATGGACAAATGGCTTCAATTTTGCTGAAG 1860

120286690 GGGAAGAAAGAAAAATGAGTATAAAGATTAGTTTCTAAATAAATAAGTTATTTTAAAAAA 120286749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGGAAGAAAGAAAAATGAGTATAAAGATTAGTTTCTAAATAAATAAGTTATTTTAAAAAA 1920

120286750 CTGTAAAGTAATAGATATCCTACTAGTGGGGAAAATAATGAAATAGTTTTGTCTTTCATT 120286809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGTAAAGTAATAGATATCCTACTAGTGGGGAAAATAATGAAATAGTTTTGTCTTTCATT 1980

120286810 TCAGCAAAGATTCGGTACTGAATTGGTACAGACCATATTCCTTTAGAAAGATAACAATTT 120286869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAGCAAAGATTCGGTACTGAATTGGTACAGACCATATTCCTTTAGAAAGATAACAATTT 2040

120286870 AGAAAGTATATTTTCTACTAGTGAAAGTACAAGCCTCACTTTGGTTTTTAAATCTTCTCC 120286929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGAAAGTATATTTTCTACTAGTGAAAGTACAAGCCTCACTTTGGTTTTTAAATCTTCTCC 2100

120286930 CTTGGTTTTGTTTACTCAGATATGTTTGAACTTATGGAAAGACAACTCAAAGAGTCACTT 120286989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTGGTTTTGTTTACTCAGATATGTTTGAACTTATGGAAAGACAACTCAAAGAGTCACTT 2160

120286990 GTTCTTAAACTTTCGGATCCATTTTTCGGATATGCAGAGTAGTGAGCAATTTCGCCTAAG 120287049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTCTTAAACTTTCGGATCCATTTTTCGGATATGCAGAGTAGTGAGCAATTTCGCCTAAG 2220

120287050 CAATAAAGAGTTCACTGAAAAAGACTTTAGGTTGAAAGTATTTCTTTTACCTGAAATATC 120287109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAATAAAGAGTTCACTGAAAAAGACTTTAGGTTGAAAGTATTTCTTTTACCTGAAATATC 2280

120287110 ATGAAGTAATAATTTCTATAATACCAGGTCTTGAACTGTTTTTACAGTATGGTTTAAGTT 120287169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGAAGTAATAATTTCTATAATACCAGGTCTTGAACTGTTTTTACAGTATGGTTTAAGTT 2340

120287170 TCTTTGTTTCTGTTTTTTTCAGCCTAATCTTTGTGCATAGTACTCTCTTCATTGATCGAA 120287229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCTTTGTTTCTGTTTTTTTCAGCCTAATCTTTGTGCATAGTACTCTCTTCATTGATCGAA 2400

120287230 TGTATTTGAATTCAAAGGTCTATGATTATAATATGCCTTAAGTTAAACATCATATTAACC 120287289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTATTTGAATTCAAAGGTCTATGATTATAATATGCCTTAAGTTAAACATCATATTAACC 2460

120287290 TTCAGCGCATAGAGTTTGCTTTTGGTGCACTAGCAACAGGCTGCCTGGCAGCCCTGACTG 120287349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCAGCGCATAGAGTTTGCTTTTGGTGCACTAGCAACAGGCTGCCTGGCAGCCCTGACTG 2520

120287350 CCCTTGAACTCAGTTCTCTGTGGCTGGCTGGAGTTATAAGGATGGAACTTTCAAACACCT 120287409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCTTGAACTCAGTTCTCTGTGGCTGGCTGGAGTTATAAGGATGGAACTTTCAAACACCT 2580

120287410 ACACCACAGCTGCTGAGCCTTTCAGATAAGGCGGGGATAGACCCATTAACCTCATGTCAT 120287469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACACCACAGCTGCTGAGCCTTTCAGATAAGGCGGGGATAGACCCATTAACCTCATGTCAT 2640

120287470 TATCTTTATTTTATGGCTGATAAAACTGTTTCTTTTGTGTGTCTTACTCTCCAAGACCCC 120287529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATCTTTATTTTATGGCTGATAAAACTGTTTCTTTTGTGTGTCTTACTCTCCAAGACCCC 2700

120287530 TCTCACCTTCCCCCTTGCTTTAAAAACACATTAATATCATAATCTAGTTAAATTAGTTTG 120287589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTCACCTTCCCCCTTGCTTTAAAAACACATTAATATCATAATCTAGTTAAATTAGTTTG 2760

120287590 TTGCCATATTGAAAATAAGGCTCTTTTTGTTTCTAGTCAGGTTGATACAGCAAGAGTTTA 120287649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGCCATATTGAAAATAAGGCTCTTTTTGTTTCTAGTCAGGTTGATACAGCAAGAGTTTA 2820

120287650 TTGACAAGATGTGGCTGCAGAAAAGAACGGCTAATTATTTTCATTTGCATGAATGGCTTA 120287709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGACAAGATGTGGCTGCAGAAAAGAACGGCTAATTATTTTCATTTGCATGAATGGCTTA 2880

120287710 CTGCTTTTGCCTAATTACTGTTTAGTACAATACTGTTAATATTCTCCATTAAATATTTGC 120287769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGCTTTTGCCTAATTACTGTTTAGTACAATACTGTTAATATTCTCCATTAAATATTTGC 2940

120287770 CAAATTAACTTTGCCGTAAGTTTTCATTAGTTTTAACATTCAACTCTGAATATAAGTATG 120287829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAATTAACTTTGCCGTAAGTTTTCATTAGTTTTAACATTCAACTCTGAATATAAGTATG 3000

120287830 CAGGCATACTGTGTAGTATTATGCTCACTGAACATGGAAAGCTACTCTAAAATGTTAATA 120287889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGGCATACTGTGTAGTATTATGCTCACTGAACATGGAAAGCTACTCTAAAATGTTAATA 3060

120287890 CATTTAGCAGTAACGTTAGAATACACAGATTTTATTCCCACATATACGGTATATGCATAG 120287949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CATTTAGCAGTAACGTTAGAATACACAGATTTTATTCCCACATATACGGTATATGCATAG 3120

120287950 AAGTATGTATGCATATAGATATAGATATTTATCTTGTTACACATAGATGTGTACAATAGT 120288009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGTATGTATGCATATAGATATAGATATTTATCTTGTTACACATAGATGTGTACAATAGT 3180

120288010 CTTGCCTTGCTTTGTCGGCATGTCTAAGTACAGTAATATTAGCAATTGCAATTAGTTAGT 120288069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTGCCTTGCTTTGTCGGCATGTCTAAGTACAGTAATATTAGCAATTGCAATTAGTTAGT 3240

120288070 TTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGAAAGATTTCTACTTCTAAAAAGAAATATGAT 120288129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGAAAGATTTCTACTTCTAAAAAGAAATATGAT 3300

120288130 AAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAATAGGTTTTCCTGTCCTCCTAAACTATCTGTT 120288189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAATAGGTTTTCCTGTCCTCCTAAACTATCTGTT 3360

120288190 TTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGAGAGATGGAAAAACCTAATGGCACATAGTAG 120288249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGAGAGATGGAAAAACCTAATGGCACATAGTAG 3420

120288250 AGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGATGATTAAGGAAAGGTAATGATAATCACAGA 120288309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGATGATTAAGGAAAGGTAATGATAATCACAGA 3480

120288310 TGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAAATGAATGAAAA 120288369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAAGGAGAGAGAAAATGAATGAAAA 3540

120288370 AATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGAGGGAAAATTAT 120288429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCCATGGAAATGGAGGGAAAATTAT 3600

120288430 GTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGCTAATAGAAAGA 120288489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAAGGAATATATGCTAATAGAAAGA 3660

120288490 CATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTAC 120288549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTAC 3720

120288550 AGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACA 120288609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACA 3780

120288610 AAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGG 120288669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGG 3840

120288670 GGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAAT 120288729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAAT 3900

120288730 TTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGAC 120288789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGAC 3960

120288790 TTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAACTCACCTTTGT 120288849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATCTAATAACATAACTCACCTTTGT 4020

120288850 ACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATAACCTAACTATG 120288909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTCTACTTCTTATAACCTAACTATG 4080

120288910 TCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTT 120288969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTT 4140

120288970 TTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGT 120289029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGT 4200

120289030 AAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCT 120289089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCT 4260

120289090 CATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTT 120289149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTT 4320

120289150 TGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGA 120289209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGA 4380

120289210 CCTCAA 120289215
          ||||||
     4381 CCTCAA 4386

EXCISED REGION

120289217 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTC 120289276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     4388 ATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTG-TTTTTTTTTTCATTTC 4446

120289277 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 120289336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 AGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTT 4506

120289337 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 120289396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAG 4566

120289397 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 120289456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 TGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAG 4626

120289457 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 120289516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 AGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCT 4686

120289517 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 120289576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 GTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTA 4746

120289577 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 120289636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 ATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACAT 4806

120289637 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 120289696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 ATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTC 4866

120289697 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 120289756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 ATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCA 4926

120289757 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 120289816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTC 4986

120289817 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 120289876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAA 5046

120289877 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 120289936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 TCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAATAAGCTTAGT 5106

120289937 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 120289996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGC 5166

120289997 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 120290056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGC 5226

120290057 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 120290116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATT 5286

120290117 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 120290176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTT 5346

120290177 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 120290236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAG 5406

120290237 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 120290296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTT 5466

120290297 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 120290356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGG 5526

120290357 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 120290416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTC 5586

120290417 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 120290476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 ATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTG 5646

120290477 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 120290536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 TGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACT 5706

120290537 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 120290596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 TCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTT 5766

120290597 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 120290656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 CTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTT 5826

120290657 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 120290716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 CTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGC 5886

120290717 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 120290776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 TGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCT 5946

120290777 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 120290836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAG 6006

120290837 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 120290896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 ATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACC 6066

120290897 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 120290956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 CTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGT 6126

120290957 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 120291016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 ATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGAT 6186

120291017 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 120291076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 CGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCC 6246

120291077 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 120291136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 CTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGC 6306

120291137 AGTCTGACCATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 120291196
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 AGTCTGACCATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGC 6366

120291197 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 120291256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 TGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCC 6426

120291257 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCA 120291316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 TGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCA 6486

120291317 TCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGC 120291376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 TCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGC 6546

120291377 CCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGA 120291436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 CCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGA 6606

120291437 GTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTG 120291496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 GTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTG 6666

120291497 CTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAG 120291556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 CTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAG 6726

120291557 GTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTC 120291616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 GTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTC 6786

120291617 CCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTC 120291676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 CCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTC 6846

120291677 CTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCG 120291736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 CTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCG 6906

120291737 GAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATT 120291796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 GAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATT 6966

120291797 CGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAA 120291856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 CGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAA 7026

120291857 TCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAA 120291916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 TCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAA 7086

120291917 AGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACAT 120291976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 AGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACAT 7146

120291977 GATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAA 120292036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 GATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAA 7206

120292037 TCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTC 120292096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 TCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTC 7266

120292097 CTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGA 120292156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 CTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGA 7326

120292157 GTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCG 120292216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 GTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCG 7386

120292217 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 120292276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 7446

120292277 GCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGG 120292336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 GCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGG 7506

120292337 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTG 120292396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTG 7566

120292397 GGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATC 120292456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 GGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATC 7626

120292457 AGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCC 120292516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 AGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCC 7686

120292517 CCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCC 120292549
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 CCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCC 7719

Alignment time is 9.49109 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     4974] =>      4974 nucs 'mol-32-2fcd-157908_4974'

Score:        4869
Aligned:      4974        nucs
Identic:      4962 (100%) nucs =>       812 ( 99%)      4150 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120289200,120290017] EXCISED REGION [120290021,120294174]
 second seq =>  [        1,      817] EXCISED REGION [      821,     4974]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [120290018,120290020]
 second seq =>         3 nucs [818,820]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120290018,120290018] to [120290021,120290021]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [120290016,120290017] to [120290021,120290022]
 second seq =>         2 nucs [816,817] to [821,822]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120289200 TCAGACTAGACCTCAATATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTG 120289259
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAGACTAGACCTCAAAATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGATATTTTGTCTTG 60

120289260 TTTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATT 120289319
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTTTTT-CATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCATTACTCACACATT 119

120289320 AGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAA 120289379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 AGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATGGCTAGAGTTAAA 179

120289380 ATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAA 120289439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 ATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGACTATAATGCTCAA 239

120289440 AAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAA 120289499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 AAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGTTGTAGAAAGAAA 299

120289500 GAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGC 120289559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTTCTTTTGCTGTGC 359

120289560 AGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTT 120289619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTCTT 419

120289620 GAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTG 120289679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTG 479

120289680 TAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTT 120289739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAAATGAGTAGTTT 539

120289740 GCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTG 120289799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTG 599

120289800 GCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAG 120289859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAG 659

120289860 GCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTT 120289919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      660 GCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGTATTTTATTTCTCCTT 719

120289920 CACTTAAT--AAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTT 120289977
          ||||||    |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CACTTA--TGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTT 777

120289978 AAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGT 120290017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 AAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGT 817

EXCISED REGION

120290021 GTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCT 120290080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      821 GTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCGACCT 880

120290081 TTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATT 120290140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 TTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATT 940

120290141 ATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGA 120290200
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      941 ATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTATGGCATTCTCTGTATTTCCTGA 1000

120290201 ATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAATATCCTGCAAA 120290260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 ATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAATATCCTGCAAA 1060

120290261 GTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTTTCAGGTACACCAATCAGCTGTAGA 120290320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 GTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTTTCAGGTACACCAATCAGCTGTAGA 1120

120290321 TTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGGCTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTT 120290380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 TTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGGCTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTT 1180

120290381 TTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACC 120290440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 TTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACC 1240

120290441 CTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGTGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTG 120290500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 CTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGTGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTG 1300

120290501 CCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTTCTCTACACTGATTATTCTAGTTA 120290560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 CCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTTCTCTACACTGATTATTCTAGTTA 1360

120290561 GCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCT 120290620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 GCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCT 1420

120290621 CCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCAT 120290680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 CCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCAT 1480

120290681 TCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGG 120290740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 TCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGG 1540

120290741 CACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTT 120290800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 CACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTT 1600

120290801 TATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCT 120290860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCT 1660

120290861 TTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTT 120290920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTT 1720

120290921 TGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACA 120290980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACA 1780

120290981 GCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCA 120291040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 GCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCA 1840

120291041 GAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTT 120291100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 GAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTT 1900

120291101 AGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAGTTCTAAA 120291160
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1901 AGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAGATCTAAA 1960

120291161 ACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCT 120291220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 ACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCT 2020

120291221 GCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAG 120291280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAG 2080

120291281 AGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACT 120291340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACT 2140

120291341 TTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCC 120291400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 TTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCC 2200

120291401 TTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACT 120291460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACT 2260

120291461 CTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAA 120291520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 CTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAA 2320

120291521 GTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTT 120291580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 GTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTT 2380

120291581 GGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCT 120291640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 GGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCT 2440

120291641 GCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCC 120291700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 GCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCC 2500

120291701 CAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCAC 120291760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCAC 2560

120291761 TCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATT 120291820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATT 2620

120291821 TAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCTT 120291880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCTT 2680

120291881 AAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGGA 120291940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 AAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGGA 2740

120291941 CCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAA 120292000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 CCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAA 2800

120292001 ATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAA 120292060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 ATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAA 2860

120292061 ACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATC 120292120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 ACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATC 2920

120292121 TCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGA 120292180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 TCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGA 2980

120292181 GTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCC 120292240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 GTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCC 3040

120292241 TGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTTT 120292300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTTT 3100

120292301 TTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAA 120292360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAA 3160

120292361 TTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCG 120292420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 TTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCG 3220

120292421 CCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAA 120292480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAA 3280

120292481 GGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTC 120292540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 GGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTC 3340

120292541 CATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAAT 120292600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 CATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAAT 3400

120292601 GCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCA 120292660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 GCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCA 3460

120292661 GAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATA 120292720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 GAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATA 3520

120292721 TGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGT 120292780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGT 3580

120292781 GTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTG 120292840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 GTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTG 3640

120292841 CTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAA 120292900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAA 3700

120292901 GATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTAT 120292960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 GATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTAT 3760

120292961 TATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGA 120293020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 TATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGA 3820

120293021 GGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAG 120293080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 GGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAG 3880

120293081 TGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGG 120293140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 TGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGG 3940

120293141 CAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCAC 120293200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 CAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCAC 4000

120293201 CTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTACATTTTT 120293260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 CTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTACATTTTT 4060

120293261 TTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCA 120293320
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 TTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTCTCA 4120

120293321 AACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAGATG 120293380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 AACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAGATG 4180

120293381 CAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGA 120293440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 CAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAGAGA 4240

120293441 TAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAAACG 120293500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAAACG 4300

120293501 GCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAA 120293560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 GCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCCTAA 4360

120293561 GAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGACCC 120293620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 GAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGACCC 4420

120293621 TGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAAAGG 120293680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAAAGG 4480

120293681 AGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTTGTT 120293740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 AGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTTGTT 4540

120293741 CAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATTGTTA 120293800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 CAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATTGTTA 4600

120293801 TGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAGAGG 120293860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 TGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAGAGG 4660

120293861 GATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTAGACA 120293920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 GATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTAGACA 4720

120293921 GAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAACAAGC 120293980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 GAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAACAAGC 4780

120293981 AGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCTCTAC 120294040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 AGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCTCTAC 4840

120294041 CCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCTGTAT 120294100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 CCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCTGTAT 4900

120294101 AATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATTGTTT 120294160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 AATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATTGTTT 4960

120294161 GATTACTGGGAAAG 120294174
          ||||||||||||||
     4961 GATTACTGGGAAAG 4974

Alignment time is 6.40965 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3903] =>      3903 nucs 'mol-32-2fee-248738_3903'

Score:        3881
Aligned:      3903        nucs
Identic:      3901 (100%) nucs =>      2420 (100%)      1481 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290835,120293255] EXCISED REGION [120293258,120294739]
 second seq =>  [        1,     2421] EXCISED REGION [     2422,     3903]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [120293256,120293257]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [120293256,120293269] to [120293258,120293271]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120293256,120293256] to [120293257,120293257]
 second seq =>         0 nucs

120290835 AGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGA 120290894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGA 60

120290895 CCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGG 120290954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGG 120

120290955 GTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTG 120291014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTG 180

120291015 ATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGC 120291074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGC 240

120291075 CCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAG 120291134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAG 300

120291135 GCAGTCTGACCATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAA 120291194
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAGTCTGACCATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAA 360

120291195 GCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGC 120291254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGC 420

120291255 CCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTC 120291314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTC 480

120291315 CATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGT 120291374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGT 540

120291375 GCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAAT 120291434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAAT 600

120291435 GAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTG 120291494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTG 660

120291495 TGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCC 120291554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCC 720

120291555 AGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACT 120291614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACT 780

120291615 TCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTG 120291674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTG 840

120291675 TCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATG 120291734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATG 900

120291735 CGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTA 120291794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTA 960

120291795 TTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATT 120291854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATT 1020

120291855 AATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTG 120291914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTG 1080

120291915 AAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACAC 120291974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACAC 1140

120291975 ATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGA 120292034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGA 1200

120292035 AATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTC 120292094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTC 1260

120292095 TCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATG 120292154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATG 1320

120292155 GAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTC 120292214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTC 1380

120292215 CGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGT 120292274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGT 1440

120292275 GCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTT 120292334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTT 1500

120292335 GGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGC 120292394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGC 1560

120292395 TGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGA 120292454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGA 1620

120292455 TCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGT 120292514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGT 1680

120292515 CCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAAT 120292574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAAT 1740

120292575 GAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGA 120292634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGA 1800

120292635 AGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCT 120292694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCT 1860

120292695 GAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGA 120292754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGA 1920

120292755 ACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCAT 120292814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCAT 1980

120292815 CCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTG 120292874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTG 2040

120292875 AAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAG 120292934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAG 2100

120292935 AAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGAT 120292994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGAT 2160

120292995 TAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATG 120293054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATG 2220

120293055 GATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACT 120293114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACT 2280

120293115 CTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGC 120293174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGC 2340

120293175 CTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCAC 120293234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCAC 2400

120293235 ACACCACCATGCCTGGCTACA 120293255
          |||||||||||||||||||||
     2401 ACACCACCATGCCTGGCTACA 2421

EXCISED REGION

120293258 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTC 120293317
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTC 2481

120293318 TCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAG 120293377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 TCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAG 2541

120293378 ATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAG 120293437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 ATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAG 2601

120293438 AGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAA 120293497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 AGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAA 2661

120293498 ACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCC 120293557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 ACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCC 2721

120293558 TAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGA 120293617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 TAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGA 2781

120293618 CCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAA 120293677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 CCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAA 2841

120293678 AGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTT 120293737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 AGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTT 2901

120293738 GTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATTG 120293797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATTG 2961

120293798 TTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAG 120293857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 TTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAG 3021

120293858 AGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTAG 120293917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 AGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTAG 3081

120293918 ACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAACA 120293977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 ACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAACA 3141

120293978 AGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCTC 120294037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 AGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCTC 3201

120294038 TACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCTG 120294097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCTG 3261

120294098 TATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATTG 120294157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 TATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATTG 3321

120294158 TTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTAA 120294217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 TTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTAA 3381

120294218 TAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGAT 120294277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 TAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGAT 3441

120294278 ACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTAA 120294337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 ACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTAA 3501

120294338 CTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATAT 120294397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 CTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATAT 3561

120294398 GAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATGG 120294457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 GAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATGG 3621

120294458 AAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCATTA 120294517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 AAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCATTA 3681

120294518 CTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATGAGA 120294577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 CTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATGAGA 3741

120294578 ATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACAAGA 120294637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 ATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACAAGA 3801

120294638 TGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGCATG 120294697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 TGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGCATG 3861

120294698 TTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGA 120294739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 TTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGA 3903

Alignment time is 5.32737 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3894] =>      3894 nucs 'mol-32-2ff9-191358_3894'

Score:        3861
Aligned:      3894        nucs
Identic:      3891 (100%) nucs =>      2350 (100%)      1541 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290904,120293255] EXCISED REGION [120293258,120294799]
 second seq =>  [        1,     2352] EXCISED REGION [     2353,     3894]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [120293256,120293257]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [120293256,120293269] to [120293258,120293271]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120293256,120293256] to [120293257,120293257]
 second seq =>         0 nucs

120290904 GCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCA 120290963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCA 60

120290964 GCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCT 120291023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCT 120

120291024 CTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTG 120291083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTG 180

120291084 GGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGA 120291143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGA 240

120291144 CCATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGA 120291203
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGA 300

120291204 CAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCC 120291263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCC 360

120291264 AGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTT 120291323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTT 420

120291324 CAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCC 120291383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCC 480

120291384 CAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGC 120291443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGC 540

120291444 TCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTG 120291503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTG 600

120291504 CTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCAC 120291563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCAC 660

120291564 TTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTG 120291623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTG 720

120291624 AGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACC 120291683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACC 780

120291684 CAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCA 120291743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCA 840

120291744 TCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCAT 120291803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCAT 900

120291804 CTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTC 120291863
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCCTTTCTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTC 960

120291864 ACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAA 120291923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAA 1020

120291924 CATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTG 120291983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTG 1080

120291984 CTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTA 120292043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTA 1140

120292044 ATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCC 120292103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCC 1200

120292104 AGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGC 120292163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGC 1260

120292164 TCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCG 120292223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCG 1320

120292224 GGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCAC 120292283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCAC 1380

120292284 CACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGAT 120292343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGAT 1440

120292344 GGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 120292403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 1500

120292404 AGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAG 120292463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAG 1560

120292464 GAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCA 120292523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCA 1620

120292524 CTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACA 120292583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACA 1680

120292584 CATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCT 120292643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCT 1740

120292644 CTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGAT 120292703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGAT 1800

120292704 CTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGC 120292763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGC 1860

120292764 TACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCT 120292823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCT 1920

120292824 AATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGA 120292883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGA 1980

120292884 AGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGT 120292943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGT 2040

120292944 AATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAA 120293003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAA 2100

120293004 ATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGA 120293063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGA 2160

120293064 GCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACC 120293123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACC 2220

120293124 AGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGC 120293183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGC 2280

120293184 TCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCA 120293243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCA 2340

120293244 TGCCTGGCTACA 120293255
          ||||||||||||
     2341 TGCCTGGCTACA 2352

EXCISED REGION

120293258 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTC 120293317
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTC 2412

120293318 TCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAG 120293377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAG 2472

120293378 ATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAG 120293437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 ATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAG 2532

120293438 AGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAA 120293497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 AGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAA 2592

120293498 ACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCC 120293557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 ACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCC 2652

120293558 TAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGA 120293617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 TAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGA 2712

120293618 CCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAA 120293677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 CCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAA 2772

120293678 AGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTT 120293737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 AGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTT 2832

120293738 GTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATTG 120293797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 GTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATTG 2892

120293798 TTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAG 120293857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 TTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAG 2952

120293858 AGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTAG 120293917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 AGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTAG 3012

120293918 ACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAACA 120293977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 ACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAACA 3072

120293978 AGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCTC 120294037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 AGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCTC 3132

120294038 TACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCTG 120294097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 TACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCTG 3192

120294098 TATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATTG 120294157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 TATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATTG 3252

120294158 TTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTAA 120294217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 TTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTAA 3312

120294218 TAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGAT 120294277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 TAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGAT 3372

120294278 ACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTAA 120294337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 ACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTAA 3432

120294338 CTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATAT 120294397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 CTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATAT 3492

120294398 GAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATGG 120294457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 GAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATGG 3552

120294458 AAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCATTA 120294517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 AAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCATTA 3612

120294518 CTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATGAGA 120294577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 CTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATGAGA 3672

120294578 ATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACAAGA 120294637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 ATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACAAGA 3732

120294638 TGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGCATG 120294697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 TGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGCATG 3792

120294698 TTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAATATG 120294757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAATATG 3852

120294758 TACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAA 120294799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 TACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAA 3894

Alignment time is 5.07864 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3429] =>      3429 nucs 'mol-32-2ff9-268683_3429'

Score:        3367
Aligned:      3417        nucs
Identic:      3410 (100%) nucs =>        85 ( 98%)      3325 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290164,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294715]
 second seq =>  [        1,       87] EXCISED REGION [      103,     3429]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [88,102]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [87,87] to [102,102]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [88,90] to [100,102]

120290164 CGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGC 120290223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
        1 CGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGC 60

120290224 TAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||||||||.||||||||||||||
       61 TAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 87

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      103 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 162

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      163 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 222

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      223 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 282

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      283 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 340

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      341 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 400

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 460

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 520

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 580

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 640

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 700

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 760

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 820

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      821 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 879

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 939

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 999

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1059

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1119

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1179

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1239

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1299

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1359

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1419

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1479

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1539

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1599

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1659

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1719

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1779

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1839

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1899

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1959

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2019

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2079

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2139

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2199

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2259

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2319

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2379

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2439

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2499

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2559

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2619

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2679

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2739

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2799

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2859

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2919

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 2979

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3039

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3099

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3159

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3219

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3279

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3339

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 120294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 3399

120294686 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGG 120294715
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGG 3429

Alignment time is 4.6369 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3725] =>      3725 nucs 'mol-32-2ff9-324118_3725'

Score:        3652
Aligned:      3713        nucs
Identic:      3705 (100%) nucs =>       101 ( 98%)      3604 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290148,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294995]
 second seq =>  [        1,      103] EXCISED REGION [      119,     3725]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [104,118]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [103,103] to [118,118]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [104,106] to [116,118]

120290148 TTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAA 120290207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAA 60

120290208 TGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
       61 TGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 103

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 178

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 238

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 298

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      299 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 356

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 416

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 476

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 536

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 596

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 656

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 716

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 776

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 836

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      837 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 895

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 955

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1015

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1075

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1135

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1195

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1255

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1315

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1375

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1435

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1495

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1555

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1615

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1675

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1735

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1795

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1855

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1915

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1975

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2035

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2095

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2155

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2215

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2275

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2335

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2395

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2455

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2515

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2575

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2635

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2695

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2755

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2815

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2875

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2935

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 2995

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3055

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3115

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3175

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3235

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3295

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3355

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 120294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 3415

120294686 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 120294745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 3475

120294746 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 120294805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCA 3535

120294806 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAAT 120294865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 CAACTGTGTATGGAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAAT 3595

120294866 ATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAA 120294925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 ATAAACACAGCTATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAA 3655

120294926 TAAGCTGTCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAAT 120294985
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TAAGCTATCCCTAAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAAT 3715

120294986 ATAATATTCA 120294995
          ||||||||||
     3716 ATAATATTCA 3725

Alignment time is 5.14867 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3464] =>      3464 nucs 'mol-32-3004-195873_3464'

Score:        3402
Aligned:      3452        nucs
Identic:      3445 (100%) nucs =>        54 ( 96%)      3391 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290195,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294781]
 second seq =>  [        1,       56] EXCISED REGION [       72,     3464]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [57,71]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [56,56] to [71,71]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [57,59] to [69,71]

120290195 TCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
        1 TCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 56

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       72 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 131

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      132 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 191

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      192 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 251

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      252 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 309

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 369

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 429

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 489

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 549

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 609

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 669

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 729

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 789

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      790 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 848

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 908

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 968

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1028

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1088

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1148

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1208

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1268

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1328

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1388

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1448

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1508

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1568

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1628

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1688

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1748

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1808

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1868

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1928

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 1988

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2048

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2108

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2168

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2228

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2288

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2348

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2408

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2468

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2528

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2588

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2648

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2708

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2768

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2828

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2888

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 2948

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3008

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3068

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3128

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3188

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3248

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3308

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 120294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 3368

120294686 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 120294745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 3428

120294746 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATC 120294781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGCAAATC 3464

Alignment time is 4.80972 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     4153] =>      4153 nucs 'mol-32-3046-028537_4153'

Score:        4131
Aligned:      4153        nucs
Identic:      4151 (100%) nucs =>       923 (100%)      3228 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290231,120291153] EXCISED REGION [120291155,120294384]
 second seq =>  [        1,      923] EXCISED REGION [      925,     4153]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154]
 second seq =>         1 nucs [924,924]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [120293256,120293256]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154] to [120291155,120291155]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290231 GGGAAGTTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCG 120290290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGAAGTTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCG 60

120290291 TCACTTTCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCT 120290350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACTTTCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCT 120

120290351 TGGAGGCTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATT 120290410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAGGCTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATT 180

120290411 TCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTG 120290470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTG 240

120290471 AAGCTGTGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTA 120290530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCTGTGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTA 300

120290531 AGGACTTCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTT 120290590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGACTTCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTT 360

120290591 TAGCTTCTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGA 120290650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCTTCTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGA 420

120290651 AGCCTTCTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCG 120290710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCTTCTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCG 480

120290711 AGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTC 120290770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTC 540

120290771 TGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGAT 120290830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGAT 600

120290831 GTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTC 120290890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTC 660

120290891 AGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGC 120290950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGC 720

120290951 CTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCA 120291010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCA 780

120291011 CCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGT 120291070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGT 840

120291071 CTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGA 120291130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGA 900

120291131 GGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 120291153
          |||||||||||||||||||||||
      901 GGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 923

EXCISED REGION

120291155 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 120291214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 984

120291215 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 120291274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 1044

120291275 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 120291334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 1104

120291335 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 120291394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 1164

120291395 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 120291454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 1224

120291455 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 120291514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 1284

120291515 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 120291574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 1344

120291575 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 120291634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 1404

120291635 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 120291694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 1464

120291695 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 120291754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 1524

120291755 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 120291814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 1584

120291815 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 120291874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 1644

120291875 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 120291934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 1704

120291935 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 120291994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 1764

120291995 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 120292054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 1824

120292055 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 120292114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 1884

120292115 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 120292174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 1944

120292175 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 120292234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 2004

120292235 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 120292294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 2064

120292295 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 120292354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 2124

120292355 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 120292414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 2184

120292415 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 120292474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 2244

120292475 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 120292534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 2304

120292535 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 120292594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 2364

120292595 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 120292654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 2424

120292655 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 120292714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 2484

120292715 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 120292774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 2544

120292775 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 120292834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 2604

120292835 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 120292894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 2664

120292895 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 120292954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 2724

120292955 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 120293014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 2784

120293015 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 120293074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 2844

120293075 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 120293134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 2904

120293135 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 120293194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 2964

120293195 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 120293254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 3024

120293255 ATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 120293314
          | |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 A-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 3083

120293315 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 120293374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 3143

120293375 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 120293434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 3203

120293435 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 120293494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 3263

120293495 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 120293554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 3323

120293555 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 120293614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 3383

120293615 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 120293674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 3443

120293675 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 120293734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 3503

120293735 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 120293794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 3563

120293795 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 120293854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 3623

120293855 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 120293914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 3683

120293915 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 120293974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 3743

120293975 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 120294034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 3803

120294035 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 120294094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 3863

120294095 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 120294154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 3923

120294155 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 120294214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 3983

120294215 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 120294274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 4043

120294275 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 120294334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 4103

120294335 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAAC 120294384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAAC 4153

Alignment time is 5.54709 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     4464] =>      4464 nucs 'mol-32-30f6-089195_4464'

Score:        4442
Aligned:      4464        nucs
Identic:      4462 (100%) nucs =>      2350 (100%)      2112 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290905,120293255] EXCISED REGION [120293258,120295370]
 second seq =>  [        1,     2351] EXCISED REGION [     2352,     4464]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [120293256,120293257]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [120293256,120293269] to [120293258,120293271]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120293256,120293256] to [120293257,120293257]
 second seq =>         0 nucs

120290905 CAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAG 120290964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAG 60

120290965 CAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTC 120291024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTC 120

120291025 TGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGG 120291084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGG 180

120291085 GGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGAC 120291144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGAC 240

120291145 CATTCTCAGTTCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGAC 120291204
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTCTCAGATCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGAC 300

120291205 AGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCA 120291264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCA 360

120291265 GAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTC 120291324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTC 420

120291325 AAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCC 120291384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCC 480

120291385 AAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCT 120291444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCT 540

120291445 CCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGC 120291504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGC 600

120291505 TAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACT 120291564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACT 660

120291565 TGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGA 120291624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGA 720

120291625 GGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCC 120291684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCC 780

120291685 AGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCAT 120291744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCAT 840

120291745 CCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATC 120291804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATC 900

120291805 TTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCA 120291864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCA 960

120291865 CATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAAC 120291924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAAC 1020

120291925 ATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGC 120291984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGC 1080

120291985 TTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAA 120292044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAA 1140

120292045 TTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCA 120292104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCA 1200

120292105 GATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCT 120292164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCT 1260

120292165 CTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGG 120292224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGG 1320

120292225 GTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACC 120292284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACC 1380

120292285 ACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATG 120292344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATG 1440

120292345 GTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 120292404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 1500

120292405 GGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGG 120292464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGG 1560

120292465 AACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCAC 120292524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCAC 1620

120292525 TTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACAC 120292584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACAC 1680

120292585 ATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTC 120292644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTC 1740

120292645 TCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATC 120292704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATC 1800

120292705 TTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCT 120292764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCT 1860

120292765 ACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTA 120292824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTA 1920

120292825 ATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAA 120292884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAA 1980

120292885 GAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTA 120292944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTA 2040

120292945 ATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAA 120293004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAA 2100

120293005 TCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAG 120293064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAG 2160

120293065 CTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCA 120293124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCA 2220

120293125 GGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCT 120293184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCT 2280

120293185 CAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCAT 120293244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCAT 2340

120293245 GCCTGGCTACA 120293255
          |||||||||||
     2341 GCCTGGCTACA 2351

EXCISED REGION

120293258 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTC 120293317
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGTC 2411

120293318 TCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAG 120293377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 TCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAG 2471

120293378 ATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAG 120293437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 ATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCAG 2531

120293438 AGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAA 120293497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATAA 2591

120293498 ACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCC 120293557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 ACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCCC 2651

120293558 TAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGA 120293617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGGA 2711

120293618 CCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAA 120293677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 CCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTAA 2771

120293678 AGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTT 120293737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 AGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGTT 2831

120293738 GTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATTG 120293797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 GTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATTG 2891

120293798 TTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAG 120293857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 TTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCAG 2951

120293858 AGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTAG 120293917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 AGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTAG 3011

120293918 ACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAACA 120293977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 ACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAACA 3071

120293978 AGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCTC 120294037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 AGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCTC 3131

120294038 TACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCTG 120294097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 TACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCTG 3191

120294098 TATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATTG 120294157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATTG 3251

120294158 TTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTAA 120294217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 TTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTAA 3311

120294218 TAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGAT 120294277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 TAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGAT 3371

120294278 ACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTAA 120294337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTAA 3431

120294338 CTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATAT 120294397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 CTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATAT 3491

120294398 GAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATGG 120294457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 GAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATGG 3551

120294458 AAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCATTA 120294517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 AAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCATTA 3611

120294518 CTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATGAGA 120294577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 CTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATGAGA 3671

120294578 ATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACAAGA 120294637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 ATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACAAGA 3731

120294638 TGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGCATG 120294697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 TGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGCATG 3791

120294698 TTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAATATG 120294757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 TTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAATATG 3851

120294758 TACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCACAACTGTGTATG 120294817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 TACTGATACAATGCCAAGCAAATCAGTAAAGTGCTACAGTAAAGTGCACAACTGTGTATG 3911

120294818 GAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAATATAAACACAGCT 120294877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 GAGTACATAATCATTAGTGGATGGAGATATAGATATTTAGATATAAATATAAACACAGCT 3971

120294878 ATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAATAAGCTGTCCCT 120294937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 ATGGATATGGATATACACACATACATTCATATGGATTTTTTATATAAATAAGCTGTCCCT 4031

120294938 AAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAATATAATATTCACT 120294997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 AAAAGGATACACAAGAAATGATCACAATGGTGCCAGAGAAGATGAAATATAATATTCACT 4091

120294998 TATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGTGTATGTATTACCTATTCAAAA 120295057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 TATTACACACATCTGTGCTTTTTGAACATGATATTATGTGTATGTATTACCTATTCAAAA 4151

120295058 ATGCATTAAATGAATCTAGAAAATAAATACCTAAAACACAGAATATCATCCACAACCATA 120295117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 ATGCATTAAATGAATCTAGAAAATAAATACCTAAAACACAGAATATCATCCACAACCATA 4211

120295118 TTTATAATTGTCTTGGTGGAAAGGATTTTTGTAAATTCACAAGGGTTATACATGTTAATT 120295177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 TTTATAATTGTCTTGGTGGAAAGGATTTTTGTAAATTCACAAGGGTTATACATGTTAATT 4271

120295178 CATTTTTATATTTAGAAAAATAGTTTGAATTTTTTCTAAAGGAAGAATATTTTTAAAATT 120295237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 CATTTTTATATTTAGAAAAATAGTTTGAATTTTTTCTAAAGGAAGAATATTTTTAAAATT 4331

120295238 CTTTAATTTACTTTTTCCCCCAGGAAGTAAATAAACTTCAATTACTTTACACCAAAAGAG 120295297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 CTTTAATTTACTTTTTCCCCCAGGAAGTAAATAAACTTCAATTACTTTACACCAAAAGAG 4391

120295298 GCAGCATCAGCTATAAAAAAGGGATGAATCCTGTATTTGATAGCATAAATGAGGCATAAT 120295357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 GCAGCATCAGCTATAAAAAAGGGATGAATCCTGTATTTGATAGCATAAATGAGGCATAAT 4451

120295358 AATCAAAGAAAAA 120295370
          |||||||||||||
     4452 AATCAAAGAAAAA 4464

Alignment time is 6.02133 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2097] =>      2097 nucs 'mol-32-3159-197628_2097'

Score:        2084
Aligned:      2095        nucs
Identic:      2094 (100%) nucs =>       950 (100%)      1144 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120291188,120292137] EXCISED REGION [120292139,120293283]
 second seq =>  [        1,      950] EXCISED REGION [      951,     2094]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120292138,120292138]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [120292138,120292147] to [120292139,120292148]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120291188 CTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCA 120291247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTTAAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCA 60

120291248 GCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGG 120291307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGTCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGG 120

120291308 TGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAAT 120291367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAAT 180

120291368 GGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGC 120291427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGC 240

120291428 CAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCT 120291487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCT 300

120291488 CCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCT 120291547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCT 360

120291548 ATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATC 120291607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATC 420

120291608 TTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCA 120291667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCA 480

120291668 CCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTT 120291727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTT 540

120291728 GGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCT 120291787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCT 600

120291788 GTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAA 120291847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAA 660

120291848 GAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGT 120291907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGT 720

120291908 TGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAG 120291967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAG 780

120291968 TATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGC 120292027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGC 840

120292028 TATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACC 120292087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACC 900

120292088 AAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC 120292137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC 950

EXCISED REGION

120292139 TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTT 120292198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTT 1010

120292199 GGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 120292258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 GGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 1070

120292259 AGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGAT 120292318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 AGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGAT 1130

120292319 GGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCT 120292378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 GGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCT 1190

120292379 TGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTA 120292438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 TGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTA 1250

120292439 TCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTG 120292498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 TCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTG 1310

120292499 ATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAA 120292558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 ATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAA 1370

120292559 AAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCA 120292618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 AAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCA 1430

120292619 TATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAA 120292678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 TATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAA 1490

120292679 CTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAA 120292738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 CTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAA 1550

120292739 ACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCAC 120292798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 ACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCAC 1610

120292799 TTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAG 120292858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 TTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAG 1670

120292859 GCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAA 120292918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAA 1730

120292919 CTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGT 120292978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 CTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGT 1790

120292979 TCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGAC 120293038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGAC 1850

120293039 AGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGT 120293098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 AGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGT 1910

120293099 AAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGC 120293158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 AAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGC 1970

120293159 TCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAAC 120293218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 TCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAAC 2030

120293219 TGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTT 120293278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     2031 TGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTT 2089

120293279 TGGTA 120293283
          |||||
     2090 TGGTA 2094

Alignment time is 3.20179 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2875] =>      2875 nucs 'mol-32-317a-272881_2875'

Score:        2852
Aligned:      2874        nucs
Identic:      2872 (100%) nucs =>      1024 (100%)      1848 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290130,120291153] EXCISED REGION [120291155,120293004]
 second seq =>  [        1,     1024] EXCISED REGION [     1026,     2875]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154]
 second seq =>         1 nucs [1025,1025]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154] to [120291155,120291155]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290130 ATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCT 120290189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCT 60

120290190 GTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAA 120290249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAA 120

120290250 TATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTTTCAGGTACACCAA 120290309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTTTCAGGTACACCAA 180

120290310 TCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGGCTTTGTTCATTTC 120290369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGGCTTTGTTCATTTC 240

120290370 TTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTGATCTTCAA 120290429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTGATCTTCAA 300

120290430 TCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGTGCATTTGTCGTG 120290489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGTGCATTTGTCGTG 360

120290490 TAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTTCTCTACACTGAT 120290549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGTTCTCGTGCCATGGTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTTCTCTACACTGAT 420

120290550 TATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCTTTGCGATGGGT 120290609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTCTAGTTAGCCATTCGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCTTTGCGATGGGT 480

120290610 TCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCCCGACTC 120290669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCGAACTTCCTCCTTTAGCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCCCGACTC 540

120290670 GTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGG 120290729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCAAAGTCATTCTCTGTCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGG 600

120290730 AGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGT 120290789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGAGGACAGGCACTCTGATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGT 660

120290790 TTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGT 120290849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTGTGGTTTTATCTACCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGT 720

120290850 GTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGT 120290909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGATATCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGT 780

120290910 CTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAG 120290969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAG 840

120290970 GCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAA 120291029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAA 900

120291030 GCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGT 120291089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGT 960

120291090 GCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTC 120291149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTC 1020

120291150 TCAG 120291153
          ||||
     1021 TCAG 1024

EXCISED REGION

120291155 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 120291214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 1085

120291215 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 120291274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 1145

120291275 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 120291334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 1205

120291335 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 120291394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 1265

120291395 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 120291454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 1325

120291455 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 120291514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 1385

120291515 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 120291574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 1445

120291575 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 120291634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 1505

120291635 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 120291694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 1565

120291695 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 120291754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 1625

120291755 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 120291814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 1685

120291815 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 120291874
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1686 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCGCATTTACCTC 1745

120291875 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 120291934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 1805

120291935 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 120291994
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 CATGGACCCCCTGTACTTTCCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 1865

120291995 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 120292054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 1925

120292055 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 120292114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 1985

120292115 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 120292174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 2045

120292175 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 120292234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 2105

120292235 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 120292294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 2165

120292295 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 120292354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 2225

120292355 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 120292414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 2285

120292415 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 120292474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 2345

120292475 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 120292534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 2405

120292535 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 120292594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 2465

120292595 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 120292654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 2525

120292655 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 120292714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 2585

120292715 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 120292774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 2645

120292775 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 120292834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 2705

120292835 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 120292894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 2765

120292895 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 120292954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 2825

120292955 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAA 120293004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAA 2875

Alignment time is 3.98174 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2283] =>      2283 nucs 'mol-32-3185-216498_2283'

Score:        2010
Aligned:      2099        nucs
Identic:      2086 ( 99%) nucs =>       479 ( 98%)      1607 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120289766,120290250] EXCISED REGION [120291388,120292997]
 second seq =>  [      175,      659] EXCISED REGION [      675,     2283]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [660,674]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [659,659] to [674,674]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [660,662] to [672,674]

120289766 GATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATG 120289825
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      175 GATGGTCTTTACAATTTGGCATGTTTTTGCAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATG 234

120289826 TTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGC 120289885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      235 TTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGC 294

120289886 ATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTAAT--AAGCTTAGTTTGGCTG 120289943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
      295 ATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTA--TGAAGCTTAGTTTGGCTG 352

120289944 GATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACT 120290003
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 GATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACT 412

120290004 CTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTT 120290063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      413 CTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTT 472

120290064 TGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTT 120290123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 TGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTT 532

120290124 TGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCA 120290183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 TGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCA 592

120290184 TTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCT 120290243
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
      593 TTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCT 652

120290244 GGATAAT 120290250
          |||||||
      653 GGATAAT 659

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 734

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 794

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 854

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      855 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 912

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 972

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 1032

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 1092

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 1152

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 1212

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 1272

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 1332

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 1392

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1393 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 1451

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 1511

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1571

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1631

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1691

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1751

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1811

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1871

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1931

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1991

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 2051

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 2111

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 2171

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 2231

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAG 120292997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAG 2283

Alignment time is 3.21598 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3367] =>      3367 nucs 'mol-32-3190-034182_3367'

Score:        3305
Aligned:      3355        nucs
Identic:      3348 (100%) nucs =>        54 ( 96%)      3294 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290195,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294684]
 second seq =>  [        1,       56] EXCISED REGION [       72,     3367]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [57,71]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [56,56] to [71,71]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [57,59] to [69,71]

120290195 TCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
        1 TCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 56

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       72 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 131

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      132 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 191

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      192 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 251

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      252 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 309

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 369

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 429

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 489

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 549

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 609

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 669

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 729

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 789

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      790 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 848

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 908

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 968

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1028

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1088

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1148

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1208

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1268

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1328

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1388

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1448

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1508

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1568

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1628

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1688

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1748

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1808

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1868

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1928

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 1988

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2048

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2108

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2168

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2228

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2288

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2348

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2408

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2468

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2528

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2588

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2648

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2708

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2768

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2828

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2888

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 2948

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3008

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3068

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3128

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3188

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3248

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3308

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTA 120294684
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTA 3367

Alignment time is 4.63808 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     4375] =>      4375 nucs 'mol-32-3190-131369_4375'

Score:        4363
Aligned:      4374        nucs
Identic:      4373 (100%) nucs =>       887 (100%)      3486 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290267,120291153] EXCISED REGION [120291155,120294641]
 second seq =>  [        1,      887] EXCISED REGION [      889,     4375]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154]
 second seq =>         1 nucs [888,888]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154] to [120291155,120291155]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290267 TCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTTTCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGT 120290326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCAACTTGGTTCCATTCTCCCCGTCACTTTCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGT 60

120290327 CTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGGCTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCT 120290386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTCGTATAGTCCCATATTTCTTGGAGGCTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCT 120

120290387 CTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCT 120290446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAAACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCT 180

120290447 TTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGTGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGG 120290506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAGTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGTGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGG 240

120290507 TTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTTCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATT 120290566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTTCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATT 300

120290567 CGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTA 120290626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGTCTAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTA 360

120290627 GCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTG 120290686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTCGGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTG 420

120290687 TCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCT 120290746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAGCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCT 480

120290747 GATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTA 120290806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTTTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTA 540

120290807 CCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGT 120290866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTTTGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGT 600

120290867 TTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGG 120290926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGTTAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGG 660

120290927 AGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAAT 120290986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAAT 720

120290987 ATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGG 120291046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGG 780

120291047 TACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTA 120291106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTA 840

120291107 CTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 120291153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 887

EXCISED REGION

120291155 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 120291214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 948

120291215 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 120291274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 1008

120291275 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 120291334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 1068

120291335 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 120291394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 1128

120291395 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 120291454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 1188

120291455 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 120291514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 1248

120291515 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 120291574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 1308

120291575 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 120291634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 1368

120291635 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 120291694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 1428

120291695 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 120291754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 1488

120291755 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 120291814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 1548

120291815 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 120291874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 1608

120291875 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 120291934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 1668

120291935 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 120291994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 1728

120291995 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 120292054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 1788

120292055 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 120292114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 1848

120292115 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 120292174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 1908

120292175 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 120292234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 1968

120292235 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 120292294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 2028

120292295 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 120292354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 2088

120292355 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 120292414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 2148

120292415 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 120292474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 2208

120292475 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 120292534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 2268

120292535 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 120292594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 2328

120292595 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 120292654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 2388

120292655 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 120292714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 2448

120292715 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 120292774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 2508

120292775 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 120292834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 2568

120292835 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 120292894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 2628

120292895 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 120292954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 2688

120292955 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 120293014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 2748

120293015 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 120293074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 2808

120293075 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 120293134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 2868

120293135 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 120293194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 2928

120293195 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 120293254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 2988

120293255 ATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 120293314
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 ATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 3048

120293315 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 120293374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 3108

120293375 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 120293434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 3168

120293435 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 120293494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 3228

120293495 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 120293554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 3288

120293555 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 120293614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 3348

120293615 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 120293674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 3408

120293675 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 120293734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 3468

120293735 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 120293794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 3528

120293795 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 120293854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 3588

120293855 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 120293914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 3648

120293915 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 120293974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 3708

120293975 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 120294034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 3768

120294035 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 120294094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 3828

120294095 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 120294154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 3888

120294155 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 120294214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 3948

120294215 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 120294274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 4008

120294275 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 120294334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 4068

120294335 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAA 120294394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAA 4128

120294395 TATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATA 120294454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 TATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATA 4188

120294455 TGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCA 120294514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 TGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCA 4248

120294515 TTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATG 120294574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 TTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATG 4308

120294575 AGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACA 120294634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 AGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACA 4368

120294635 AGATGGG 120294641
          |||||||
     4369 AGATGGG 4375

Alignment time is 5.86515 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     4370] =>      4370 nucs 'mol-32-322a-144563_4370'

Score:        4348
Aligned:      4370        nucs
Identic:      4368 (100%) nucs =>       763 (100%)      3605 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290391,120291153] EXCISED REGION [120291155,120294761]
 second seq =>  [        1,      763] EXCISED REGION [      765,     4370]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154]
 second seq =>         1 nucs [764,764]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [120293256,120293256]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154] to [120291155,120291155]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290391 ACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCA 120290450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTCTGTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCA 60

120290451 GTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGTGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTT 120290510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTGATCGAATCAGCTACTGAAGCTGTGCATTTGTCGTGTAGTTCTCGTGCCATGGTTTT 120

120290511 CAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTTCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTC 120290570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCTCCATCAGGTCATTTAAGGACTTCTCTACACTGATTATTCTAGTTAGCCATTCGTC 180

120290571 TAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTC 120290630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATCTTTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCTTTGCGATGGGTTCGAACTTCCTCCTTTAGCTC 240

120290631 GGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCA 120290690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGAAGTTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCCCGACTCGTCAAAGTCATTCTCTGTCCA 300

120290691 GCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATT 120290750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTTGTTCCATTGCTGGCGAGGAGCTGCGTTCCTTTGGAGGAGGACAGGCACTCTGATT 360

120290751 TTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTT 120290810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAGAATTTTCAGCTTTTCTGCTCTTTTTGTTCCCCGTTTTTGTGGTTTTATCTACCTT 420

120290811 TGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGT 120290870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTCTTTCATGATGGTGATGTACAGATGGGGTTTTGGTGTGGATATCCTTTCTGTTTGT 480

120290871 TAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGT 120290930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGTTTTCCTTCTAACAGTCAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGT 540

120290931 CCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTG 120290990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCACTCCAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTG 600

120290991 CTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACC 120291050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAACAGCAAACGTTGCCACCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACC 660

120291051 CAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTG 120291110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACCGTGTGAGGTGTCAGTCTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTG 720

120291111 GGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 120291153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGTCAGGGACCCAGTTGAGGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 763

EXCISED REGION

120291155 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 120291214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 824

120291215 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 120291274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 884

120291275 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 120291334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 944

120291335 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 120291394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 1004

120291395 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 120291454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 1064

120291455 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 120291514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 1124

120291515 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 120291574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 1184

120291575 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 120291634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 1244

120291635 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 120291694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 1304

120291695 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 120291754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 1364

120291755 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 120291814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 1424

120291815 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 120291874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 1484

120291875 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 120291934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 1544

120291935 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 120291994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 1604

120291995 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 120292054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 1664

120292055 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 120292114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 1724

120292115 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 120292174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 1784

120292175 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 120292234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 1844

120292235 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 120292294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 1904

120292295 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 120292354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 1964

120292355 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 120292414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 2024

120292415 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 120292474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 2084

120292475 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 120292534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 2144

120292535 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 120292594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 2204

120292595 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 120292654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 2264

120292655 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 120292714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 2324

120292715 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 120292774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 2384

120292775 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 120292834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 2444

120292835 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 120292894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 2504

120292895 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 120292954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 2564

120292955 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 120293014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 2624

120293015 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 120293074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 2684

120293075 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 120293134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 2744

120293135 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 120293194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 GGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCC 2804

120293195 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 120293254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 TCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTAC 2864

120293255 ATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 120293314
          | |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 A-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTG 2923

120293315 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 120293374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 GTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTA 2983

120293375 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 120293434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 TAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCC 3043

120293435 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 120293494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 CAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGA 3103

120293495 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 120293554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 TAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTT 3163

120293555 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 120293614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 CCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTA 3223

120293615 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 120293674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 GGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTT 3283

120293675 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 120293734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 TAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGAT 3343

120293735 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 120293794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 GTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAA 3403

120293795 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 120293854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTC 3463

120293855 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 120293914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 CAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATG 3523

120293915 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 120293974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 TAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTA 3583

120293975 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 120294034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 ACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCT 3643

120294035 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 120294094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 CTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCT 3703

120294095 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 120294154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 CTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTA 3763

120294155 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 120294214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 TTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTT 3823

120294215 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 120294274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 TAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTT 3883

120294275 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 120294334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 GATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATT 3943

120294335 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAA 120294394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 TAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAA 4003

120294395 TATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATA 120294454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 TATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATA 4063

120294455 TGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCA 120294514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 TGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTCAGCA 4123

120294515 TTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATG 120294574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 TTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTAACATGTATG 4183

120294575 AGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACA 120294634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 AGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAATATTCAACA 4243

120294635 AGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGC 120294694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 AGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTATATGTAATGC 4303

120294695 ATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAAT 120294754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 ATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGACAGCAAAAT 4363

120294755 ATGTACT 120294761
          |||||||
     4364 ATGTACT 4370

Alignment time is 5.76121 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2253] =>      2253 nucs 'mol-32-322a-147120_2253'

Score:        2241
Aligned:      2252        nucs
Identic:      2251 (100%) nucs =>       263 (100%)      1988 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290891,120291153] EXCISED REGION [120291155,120293143]
 second seq =>  [        1,      263] EXCISED REGION [      265,     2253]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154]
 second seq =>         1 nucs [264,264]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120291154,120291154] to [120291155,120291155]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120290891 AGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGC 120290950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAGTTTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTTGC 60

120290951 CTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCA 120291010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGGTATCAGCAGCAGAGGCTGCAGAACAGCAAATATTGCTGAACAGCAAACGTTGCCA 120

120291011 CCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGT 120291070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGATCGTTCCTCTGGAAGCTTCATCTCAGAGGGGTACCCAACCGTGTGAGGTGTCAGT 180

120291071 CTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGA 120291130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCCCCTACTTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTACTTGGGTGTCAGGGACCCAGTTGA 240

120291131 GGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 120291153
          |||||||||||||||||||||||
      241 GGAGGCAGTCTGACCATTCTCAG 263

EXCISED REGION

120291155 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCTGTCAGACAGGGACATTT 120291214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      265 TCTAAAACTCCATGCTGGGAGAACCACTACTCTCTTCAAAGCCGTCAGACAGGGACATTT 324

120291215 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 120291274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 AAGCCTGCAGAGGTTTCTGCTGCCTTTTGTTCAGCTATGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGT 384

120291275 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 120291334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTGAGCTGTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCG 444

120291335 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 120291394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAGCAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCT 504

120291395 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 120291454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 GCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGT 564

120291455 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 120291514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 GGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTT 624

120291515 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 120291574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 GGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCT 684

120291575 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 120291634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 TCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCT 744

120291635 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 120291694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGAC 804

120291695 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 120291754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 AAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTG 864

120291755 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 120291814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTC 924

120291815 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 120291874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 TAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTC 984

120291875 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 120291934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 CACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATC 1044

120291935 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 120291994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 CATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGG 1104

120291995 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 120292054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 TTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTA 1164

120292055 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 120292114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAG 1224

120292115 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 120292174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAG 1284

120292175 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 120292234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 GCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGA 1344

120292235 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 120292294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCT 1404

120292295 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 120292354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 AATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCT 1464

120292355 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 120292414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCA 1524

120292415 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 120292474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 ACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAA 1584

120292475 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 120292534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 ACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCA 1644

120292535 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 120292594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 GCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACT 1704

120292595 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 120292654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 CATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTG 1764

120292655 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 120292714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 GTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGAT 1824

120292715 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 120292774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAG 1884

120292775 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 120292834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTC 1944

120292835 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 120292894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGA 2004

120292895 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 120292954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTAT 2064

120292955 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 120293014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAA 2124

120293015 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 120293074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACT 2184

120293075 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 120293134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACT 2244

120293135 GGAGGGCAG 120293143
          |||||||||
     2245 GGAGGGCAG 2253

Alignment time is 3.18843 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3375] =>      3375 nucs 'mol-32-3240-171936_3375'

Score:        3313
Aligned:      3363        nucs
Identic:      3356 (100%) nucs =>        78 ( 98%)      3278 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290171,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294668]
 second seq =>  [        1,       80] EXCISED REGION [       96,     3375]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [81,95]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [80,80] to [95,95]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [81,83] to [93,95]

120290171 TATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTG 120290230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
        1 TATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTG 60

120290231 GGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||.||||||||||||||
       61 GGGAAATTCTCCTGGATAAT 80

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       96 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 155

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 215

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 275

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      276 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 333

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      334 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 393

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      394 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 453

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      454 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 513

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      514 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 573

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      574 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 633

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 693

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 753

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 813

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      814 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 872

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 932

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 992

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1052

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1112

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1172

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1232

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1292

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1352

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1412

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1472

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1532

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1592

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1652

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1712

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1772

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1832

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1892

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1952

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2012

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2072

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2132

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2192

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2252

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2312

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2372

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2432

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2492

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2552

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2612

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2672

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2732

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2792

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2852

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2912

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 2972

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3032

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3092

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3152

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3212

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3272

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3332

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATA 120294668
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATA 3375

Alignment time is 4.57326 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     6080] =>      6080 nucs 'mol-32-32fb-025388_6080'

Score:        6056
Aligned:      6078        nucs
Identic:      6076 (100%) nucs =>      5544 (100%)       532 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120284380,120289925] EXCISED REGION [120289928,120290459]
 second seq =>  [        1,     5546] EXCISED REGION [     5549,     6080]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [120289926,120289927]
 second seq =>         2 nucs [5547,5548]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289926,120289926] to [120289928,120289928]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [120289925,120289925] to [120289928,120289928]
 second seq =>         1 nucs [5546,5546] to [5549,5549]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120284380 CGCAGAAATATCAGCCAGACTATACTACAAAATAAGATTTAACAAATCTAGAAAGGTAGA 120284439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCAGAAATATCAGCCAGACTATACTACAAAATAAGATTTAACAAATCTAGAAAGGTAGA 60

120284440 AGCTATAAATGATAGGCCTGTTCACTTTACCAAGGAAACTGTGGGATAAATGACTCAAAA 120284499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTATAAATGATAGGCCTGTTCACTTTACCAATGAAACTGTGGGATAAATGACTCAAAA 120

120284500 CTCAATTTCCAAACCTCTAGAAAATAACAAACTACCAGGAAATGCCCATATTTAATTTCT 120284559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAATTTCCAAACCTCTAGAAAATAACAAACTACCAGGAAATGCCCATATTTAATTTCT 180

120284560 GTAATACAAAACTGTTCCATTATGAAATATAGCAAAGAAATTATTAGCAAAGATTTTGTT 120284619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAATACAAAACTGTTCCATTATGAAATATAGCAAAGAAATTATTAGCAAAGATTTTGTT 240

120284620 TCTCATCAAATGACAGCATCCAACTAGTATAAATATTCCCCCTGGGCAGAAATTGATGTC 120284679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCATCAAATGACAGCATCCAACTAGTATAAATATTCCCCCTGGGCAGAAATTGATGTC 300

120284680 ATTCCGACAGAGATAGTGATATGCACATCACAAAACGTCAATTAAGAATTTCATGATGTT 120284739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCCGACAGAGATAGTGATATGCACATCACAAAACGTCAATTAAGAATTTCATGATGTT 360

120284740 TTTGGTTATATTTACTGATAAATACTCACTATTGTCAGAAGCCGGGTTTTATCTTTTGAT 120284799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGGTTATATTTACTGATAAATACTCACTATTGTCAGAAGCCGGGTTTTATCTTTTGAT 420

120284800 ATTAATTAGGAATATATTTACTTAAGATCAAGCCCTCCTACAGAAATTATTTGTGTGTCT 120284859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTAATTAGGAATATATTTACTTAAGATCAAGCCCTCCTACAGAAATTATTTGTGTGTCT 480

120284860 AGTATTTATCTCTTATCCTAATATATCCTGGACTAGGTATAACTTTTATTGATAATCTTT 120284919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTATTTATCTCTTATCCTAATATATCCTGGACTAGGTATAACTTTTATTGATAATCTTT 540

120284920 CTAAACCTTCATACACGCATGATAGATAATGAATATTTATTGAATGAATTCACAGTTATT 120284979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAAACCTTCATACACGCATGATAGATAATGAATATTTATTGAATGAATTCACAGTTATT 600

120284980 CTATTTTATGTGTTGATGGAGTTTTTTTTTCCTATGAAGTTTTTCTGTGCTGCCTCTCTC 120285039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTATTTTATGTGTTGATGGAGTTTTTTTTTCCTATGAAGTTTTTCTGTGCTGCCTCTCTC 660

120285040 TAAACTTTTTATATGTCCCATATCTGCCTTTAATGTCTCTCTGTGCCTACTGCAATGATA 120285099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAACTTTTTATATGTCCCATATCTGCCTTTAATGTCTCTCTGTGCCTACTGCAATGATA 720

120285100 TGTATTCAGACAGCATGTGTTATAGGTTGTTAAATGACTCAGGAAATTGGTTTAGTAAAA 120285159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTATTCAGACAGCATGTGTTATAGGTTGTTAAATGACTCAGGAAATTGGTTTAGTAAAA 780

120285160 CAGATACAAGTTCAGAAGTAGTTTGAGTTCTCACAACTAAATAAAGTGATGGAATCAAAC 120285219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGATACAAGTTCAGAAGTAGTTTGAGTTCTCACAACTAAATAAAGTGATGGAATCAAAC 840

120285220 TGTAGCCCTGAGCCTCATTGCTATAAAAGCCTGCGTATAAGCCGGCCGCTTGATAAATGG 120285279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAGCCCTGAGCCTCATTGCTATAAAAGCCTGCGTATAAGCCGGCCGCTTGATAAATGG 900

120285280 CATGCTAATATGTGATTCTGTGTCTAGTGGCTGACCACGTGTCTTGTGGCATGTTAATAT 120285339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATGCTAATATGTGATTCTGTGTCTAGTGGCTGACCACGTGTCTTGTGGCATGTTAATAT 960

120285340 AGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTAGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAG 120285399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTAGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAG 1020

120285400 TGGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGCTAATATAGAGTTCTG 120285459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGCTAATATAGAGTTCTG 1080

120285460 TGTCCCATGGCTGGCCATATGACCAGTTGCATGCTAACATAGGGTTCTGTGTCCAGTGGC 120285519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTCCCATGGCTGGCCATATGACCAGTTGCATGCTAACATAGGGTTCTGTGTCCAGTGGC 1140

120285520 TGACCACATGACATGTGCCATACTAATACAGAGTTCTGTGTTTCACGGCTGGCCACATGA 120285579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGACCACATGACATGTGCCATACTAATACAGAGTTCTGTGTTTCACGGCTGGCCACATGA 1200

120285580 CAAGTGGCATGCTAACAGAGCATGCTGTGTCCCATGGCTGACCACATAACATGTGGCATG 120285639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAGTGGCATGCTAACAGAGCATGCTGTGTCCCATGGCTGACCACATAACATGTGGCATG 1260

120285640 CTAATACAGAGTTCTGTGTTTCATGGCTGGCCACATGACAATTGGCATGCTAATTTAGGG 120285699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAATACAGAGTTCTGTGTTTCATGGCTGGCCACATGACAATTGGCATGCTAATTTAGGG 1320

120285700 TTCTGCTTCCAATGGCTGGCCACTGACAATTGGCATGCTAATATATGGTTCTGTGTCCCA 120285759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTGCTTCCAATGGCTGGCCACTGACAATTGGCATGCTAATATATGGTTCTGTGTCCCA 1380

120285760 TGCCTGGACACGTGACAAGTGGCATACTAATATTGGATTCTGTGCCCAATGGCTGGCCAC 120285819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCTGGACACGTGACAAGTGGCATACTAATATTGGATTCTGTGCCCAATGGCTGGCCAC 1440

120285820 TGAGAAGTGGCATGCTAATATGGTGTTTTATGTCCAATAGCTGACCATGTGACAAATGGC 120285879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAGAAGTGGCATGCTAATATGGTGTTTTATGTCCAATAGCTGACCATGTGACAAATGGC 1500

120285880 ATCCTAATATAGGGTTTTGTGTTCAGTGACAAAATAGCTTCACATTCATATAGATAAAGA 120285939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCCTAATATAGGGTTTTGTGTTCAGTGACAAAATAGCTTCACATTCATATAGATAAAGA 1560

120285940 CATGAACTCAGTGGACACTTAGCAAGTTATGTCTCCCTCTCCTTTAATAAACACTGGAAG 120285999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATGAACTCAGTGGACACTTAGCAAGTTATGTCTCCCTCTCCTTTAATAAACACTGGAAG 1620

120286000 TCCTCATATTTAGCAAGGTGAGAAAATAGATACCACTATTTAAGCATCCACTACCAAGAT 120286059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCTCATATTTAGCAAGGTGAGAAAATAGATACCACTATTTAAGCATCCACTACCAAGAT 1680

120286060 ATGACTTTGTTGTCTTTTGTGCAGCTGTGGACCAAAAATCACTTCTCTTCAGAAAGATAA 120286119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGACTTTGTTGTCTTTTGTGCAGCTGTGGACCAAAAATCACTTCTCTTCAGAAAGATAA 1740

120286120 AAATGTGGCCCTAGGAAATAAACTAAAGTCTGCTGGAATTATTTTGCAATCCTGACACTA 120286179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATGTGGCCCTAGGAAATAAACTAAAGTCTGCTGGAATTATTTTGCAATCCTGACACTA 1800

120286180 CATTATGACAATCTGTCCCAAGATTTCCTTCCCACAACCATATGTGACCCATTTAACGCA 120286239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATTATGACAATCTGTCCCAAGATTTCCTTCCCACAACCATATGTGACCCATTTAACGCA 1860

120286240 GCCCAATAAGTGATTCTCTGTTTCTGAATGAGCAATGAAGAGAAATTTGAAAAACATTCA 120286299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCCAATAAGTGATTCTCTGTTTCTGAATGAGCAATGAAGAGAAATTTGAAAAACATTCA 1920

120286300 TCTCTGCAACAACATTGCTGTGGCATTAACATCCTTCTTCTCCATGGCCTGCCTCCTTCC 120286359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTCTGCAACAACATTGCTGTGGCATTAACATCCTTCTTCTCCATGGCCTGCCTCCTTCC 1980

120286360 TTTCCATCCTCACTGATAGCTCCTTCTTTTCTCTTTTCCCAATAGCTTAGATTTGTTTCA 120286419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCCATCCTCACTGATAGCTCCTTCTTTTCTCTTTTCCCAATAGCTTAGATTTGTTTCA 2040

120286420 ACTCCTTGATGTAATCATGCCCTAAGACATCTTTTTAAAAAGTAATTTTTCTGTTAGTGA 120286479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTCCTTGATGTAATCATGCCCTAAGACATCTTTTTAAAAAGTAATTTTTCTGTTAGTGA 2100

120286480 TTTTATTGATTATCATTTATTTAAAATTAGATATTTGTCTTTCAATTTTGTTTATGGTGA 120286539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTATTGATTATCATTTATTTAAAATTAGATATTTGTCTTTCAATTTTGTTTATGGTGA 2160

120286540 TTTTTTTCTGTCAACTCTTATATTTGCTTTGTATGCTTTCAAATCTGTCATCACCCTTCT 120286599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTTTTCTGTCAACTCTTATATTTGCTTTGTATGCTTTCAAATCTGTCATCACCCTTCT 2220

120286600 TCATGGTTTTTGCCTATGGCAACATGCAGTGAAAAGGTTTTTCCACTTTAAGGTTAGATG 120286659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCATGGTTTTTGCCTATGGCAACATGCAGTGAAAAGGTTTTTCCACTTTAAGGTTAGATG 2280

120286660 AATGGACAAATGGCTTCAATTTTGCTGAAGGGGAAGAAAGAAAAATGAGTATAAAGATTA 120286719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATGGACAAATGGCTTCAATTTTGCTGAAGGGGAAGAAAGAAAAATGAGTATAAAGATTA 2340

120286720 GTTTCTAAATAAATAAGTTATTTTAAAAAACTGTAAAGTAATAGATATCCTACTAGTGGG 120286779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTTTCTAAATAAATAAGTTATTTTAAAAAACTGTAAAGTAATAGATATCCTACTAGTGGG 2400

120286780 GAAAATAATGAAATAGTTTTGTCTTTCATTTCAGCAAAGATTCGGTACTGAATTGGTACA 120286839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAAAATAATGAAATAGTTTTGTCTTTCATTTCAGCAAAGATTCGGTACTGAATTGGTACA 2460

120286840 GACCATATTCCTTTAGAAAGATAACAATTTAGAAAGTATATTTTCTACTAGTGAAAGTAC 120286899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GACCATATTCCTTTAGAAAGATAACAATTTAGAAAGTATATTTTCTACTAGTGAAAGTAC 2520

120286900 AAGCCTCACTTTGGTTTTTAAATCTTCTCCCTTGGTTTTGTTTACTCAGATATGTTTGAA 120286959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGCCTCACTTTGGTTTTTAAATCTTCTCCCTTGGTTTTGTTTACTCAGATATGTTTGAA 2580

120286960 CTTATGGAAAGACAACTCAAAGAGTCACTTGTTCTTAAACTTTCGGATCCATTTTTCGGA 120287019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTATGGAAAGACAACTCAAAGAGTCACTTGTTCTTAAACTTTCGGATCCATTTTTCGGA 2640

120287020 TATGCAGAGTAGTGAGCAATTTCGCCTAAGCAATAAAGAGTTCACTGAAAAAGACTTTAG 120287079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATGCAGAGTAGTGAGCAATTTCGCCTAAGCAATAAAGAGTTCACTGAAAAAGACTTTAG 2700

120287080 GTTGAAAGTATTTCTTTTACCTGAAATATCATGAAGTAATAATTTCTATAATACCAGGTC 120287139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTGAAAGTATTTCTTTTACCTGAAATATCATGAAGTAATAATTTCTATAATACCAGGTC 2760

120287140 TTGAACTGTTTTTACAGTATGGTTTAAGTTTCTTTGTTTCTGTTTTTTTCAGCCTAATCT 120287199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGAACTGTTTTTACAGTATGGTTTAAGTTTCTTTGTTTCTGTTTTTTTCAGCCTAATCT 2820

120287200 TTGTGCATAGTACTCTCTTCATTGATCGAATGTATTTGAATTCAAAGGTCTATGATTATA 120287259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGTGCATAGTACTCTCTTCATTGATCGAATGTATTTGAATTCAAAGGTCTATGATTATA 2880

120287260 ATATGCCTTAAGTTAAACATCATATTAACCTTCAGCGCATAGAGTTTGCTTTTGGTGCAC 120287319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATATGCCTTAAGTTAAACATCATATTAACCTTCAGCGCATAGAGTTTGCTTTTGGTGCAC 2940

120287320 TAGCAACAGGCTGCCTGGCAGCCCTGACTGCCCTTGAACTCAGTTCTCTGTGGCTGGCTG 120287379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAGCAACAGGCTGCCTGGCAGCCCTGACTGCCCTTGAACTCAGTTCTCTGTGGCTGGCTG 3000

120287380 GAGTTATAAGGATGGAACTTTCAAACACCTACACCACAGCTGCTGAGCCTTTCAGATAAG 120287439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAGTTATAAGGATGGAACTTTCAAACACCTACACCACAGCTGCTGAGCCTTTCAGATAAG 3060

120287440 GCGGGGATAGACCCATTAACCTCATGTCATTATCTTTATTTTATGGCTGATAAAACTGTT 120287499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCGGGGATAGACCCATTAACCTCATGTCATTATCTTTATTTTATGGCTGATAAAACTGTT 3120

120287500 TCTTTTGTGTGTCTTACTCTCCAAGACCCCTCTCACCTTCCCCCTTGCTTTAAAAACACA 120287559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTTTTGTGTGTCTTACTCTCCAAGACCCCTCTCACCTTCCCCCTTGCTTTAAAAACACA 3180

120287560 TTAATATCATAATCTAGTTAAATTAGTTTGTTGCCATATTGAAAATAAGGCTCTTTTTGT 120287619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTAATATCATAATCTAGTTAAATTAGTTTGTTGCCATATTGAAAATAAGGCTCTTTTTGT 3240

120287620 TTCTAGTCAGGTTGATACAGCAAGAGTTTATTGACAAGATGTGGCTGCAGAAAAGAACGG 120287679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCTAGTCAGGTTGATACAGCAAGAGTTTATTGACAAGATGTGGCTGCAGAAAAGAACGG 3300

120287680 CTAATTATTTTCATTTGCATGAATGGCTTACTGCTTTTGCCTAATTACTGTTTAGTACAA 120287739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTAATTATTTTCATTTGCATGAATGGCTTACTGCTTTTGCCTAATTACTGTTTAGTACAA 3360

120287740 TACTGTTAATATTCTCCATTAAATATTTGCCAAATTAACTTTGCCGTAAGTTTTCATTAG 120287799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TACTGTTAATATTCTCCATTAAATATTTGCCAAATTAACTTTGCCGTAAGTTTTCATTAG 3420

120287800 TTTTAACATTCAACTCTGAATATAAGTATGCAGGCATACTGTGTAGTATTATGCTCACTG 120287859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTTAACATTCAACTCTGAATATAAGTATGCAGGCATACTGTGTAGTATTATGCTCACTG 3480

120287860 AACATGGAAAGCTACTCTAAAATGTTAATACATTTAGCAGTAACGTTAGAATACACAGAT 120287919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AACATGGAAAGCTACTCTAAAATGTTAATACATTTAGCAGTAACGTTAGAATACACAGAT 3540

120287920 TTTATTCCCACATATACGGTATATGCATAGAAGTATGTATGCATATAGATATAGATATTT 120287979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTATTCCCACATATACGGTATATGCATAGAAGTATGTATGCATATAGATATAGATATTT 3600

120287980 ATCTTGTTACACATAGATGTGTACAATAGTCTTGCCTTGCTTTGTCGGCATGTCTAAGTA 120288039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATCTTGTTACACATAGATGTGTACAATAGTCTTGCCTTGCTTTGTCGGCATGTCTAAGTA 3660

120288040 CAGTAATATTAGCAATTGCAATTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGA 120288099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAGTAATATTAGCAATTGCAATTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGA 3720

120288100 AAGATTTCTACTTCTAAAAAGAAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAAT 120288159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGATTTCTACTTCTAAAAAGAAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAAT 3780

120288160 AGGTTTTCCTGTCCTCCTAAACTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGA 120288219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGGTTTTCCTGTCCTCCTAAACTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGA 3840

120288220 GAGATGGAAAAACCTAATGGCACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGA 120288279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGATGGAAAAACCTAATGGCACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGA 3900

120288280 TGATTAAGGAAAGGTAATGATAATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGT 120288339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGATTAAGGAAAGGTAATGATAATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGT 3960

120288340 CAAAAAAAGGAGAGAGAAAATGAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAA 120288399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAAAAAAAGGAGAGAGAAAATGAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAA 4020

120288400 TGGGTGCCATGGAAATGGAGGGAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAAT 120288459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGGGTGCCATGGAAATGGAGGGAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAAT 4080

120288460 AAAATGAAGGAATATATGCTAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAG 120288519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AAAATGAAGGAATATATGCTAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAG 4140

120288520 GCAAATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAG 120288579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCAAATAAGAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAG 4200

120288580 GACCCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAG 120288639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GACCCTGAAAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAG 4260

120288640 GATGCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATA 120288699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GATGCCTCTGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATA 4320

120288700 CATATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATT 120288759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CATATTAATGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATT 4380

120288760 AAAATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTA 120288819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAAATTGCAAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTA 4440

120288820 CAGCAATCTAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAAT 120288879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CAGCAATCTAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAAT 4500

120288880 GGCTACTCTACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAA 120288939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GGCTACTCTACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAA 4560

120288940 TTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATA 120288999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTTGTCTTCTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATA 4620

120289000 AAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCAC 120289059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAAATTAATAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCAC 4680

120289060 CTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGA 120289119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTATTATAAAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGA 4740

120289120 TACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGAT 120289179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TACACTAATCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGAT 4800

120289180 AACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAATATAAGACTTCCTTTCTCAATTTA 120289239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4801 AACTAATTATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAAAATAAGACTTCCTTTCTCAATTTA 4860

120289240 AATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAA 120289299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AATCAAGATATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAA 4920

120289300 TGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTT 120289359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGCATCATTACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTT 4980

120289360 GTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATA 120289419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GTACTATGGCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATA 5040

120289420 AGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAG 120289479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AGTAAGACTATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAG 5100

120289480 TACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGAT 120289539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TACATAGTTGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGAT 5160

120289540 AGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGG 120289599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGG 5220

120289600 CTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGG 120289659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CTGCATAAATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGG 5280

120289660 GGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCC 120289719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCC 5340

120289720 CTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAA 120289779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTTTGTCAAATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAA 5400

120289780 TTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTT 120289839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTTGGCATGTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTT 5460

120289840 CAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGT 120289899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CAGGAGCTCTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGT 5520

120289900 AAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTA 120289925
          ||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTA 5546

EXCISED REGION

120289928 AAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTG 120289987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 AAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGTTG 5608

120289988 AATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGT 120290047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5609 AATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGTTAGT 5668

120290048 CTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTT 120290107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5669 CTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTT 5728

120290108 TCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAG 120290167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 TCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAG 5788

120290168 GAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGG 120290227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 GAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGG 5848

120290228 TTGGGGAAGTTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCC 120290287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 TTGGGGAAGTTCTCCTGGATAATATCCTGCAAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCC 5908

120290288 CCGTCACTTTCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATT 120290347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 CCGTCACTTTCAGGTACACCAATCAGCTGTAGATTTGGTCTTTTCGTATAGTCCCATATT 5968

120290348 TCTTGGAGGCTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTC 120290407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 TCTTGGAGGCTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAAACTTCTGTTCTCGCTTC 6028

120290408 ATTTCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGA 120290459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6029 ATTTCATTCATTTGATCTTCAATCATTGATACCCTTTCTTTCAGTTGATCGA 6080

Alignment time is 7.66904 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     2346] =>      2346 nucs 'mol-32-32fb-147402_2346'

Score:        2284
Aligned:      2334        nucs
Identic:      2327 (100%) nucs =>        94 ( 98%)      2233 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290155,120290250] EXCISED REGION [120291388,120293623]
 second seq =>  [        1,       96] EXCISED REGION [      112,     2346]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [97,111]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [96,96] to [111,111]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [97,99] to [109,111]

120290155 TGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGC 120290214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGC 60

120290215 TTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          .||||||||||||||||||||.||||||||||||||
       61 CTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 96

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 171

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 231

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 291

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      292 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 349

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      350 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 409

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      410 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 469

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      470 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 529

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 589

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 649

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 709

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 769

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 829

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      830 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 888

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 948

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1008

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1068

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1128

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1188

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1248

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1308

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1368

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1428

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1488

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1548

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1608

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1668

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1728

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1788

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1848

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1908

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1968

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2028

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2088

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2148

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2208

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2268

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2328

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGC 120293623
          ||||||||||||||||||
     2329 AAAGTTTTAGGACCCTGC 2346

Alignment time is 3.33047 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3366] =>      3366 nucs 'mol-32-3311-133181_3366'

Score:        3282
Aligned:      3356        nucs
Identic:      3346 (100%) nucs =>        71 ( 97%)      3275 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290178,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294668]
 second seq =>  [        1,       73] EXCISED REGION [       89,     3366]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [74,88]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [73,73] to [88,88]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [74,76] to [86,88]

120290178 GTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGT 120290237
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
        1 GTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAAT 60

120290238 TCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||||||||||
       61 TCTCCTGGATAAT 73

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       89 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 148

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      149 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 208

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      209 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 268

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      269 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 326

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 386

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 446

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 506

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 566

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 626

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 686

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 746

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 806

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||.|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      807 ATAGTGCAGTCCATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 865

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 925

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 985

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1045

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1105

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1165

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1225

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1285

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1345

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1405

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1465

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1525

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1585

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1645

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1705

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1765

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1825

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1885

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1945

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 CCTGGCTACA--TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2003

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2063

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2123

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2183

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2243

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2303

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2363

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2423

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2483

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2543

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2603

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2663

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2723

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2783

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2843

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2903

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 2963

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3023

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3083

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3143

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3203

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3263

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3323

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATA 120294668
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATA 3366

Alignment time is 4.59459 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3505] =>      3505 nucs 'mol-32-3311-195923_3505'

Score:        3433
Aligned:      3494        nucs
Identic:      3486 (100%) nucs =>       101 ( 98%)      3385 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290148,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294776]
 second seq =>  [        1,      103] EXCISED REGION [      119,     3505]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [104,118]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [103,103] to [118,118]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [104,106] to [116,118]

120290148 TTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAA 120290207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAA 60

120290208 TGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
       61 TGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 103

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 178

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 238

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 298

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      299 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 356

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 416

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 476

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 536

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 596

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 656

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 716

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 776

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 836

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      837 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 895

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 955

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1015

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1075

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1135

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1195

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1255

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1315

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1375

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1435

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1495

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1555

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1615

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1675

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1735

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1795

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1855

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1915

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1975

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2034

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2094

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2154

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2214

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2274

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2334

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2394

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2454

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2514

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2574

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2634

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2694

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2754

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2814

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2874

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2934

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 2994

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3054

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3114

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 120294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTG 3174

120294446 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 120294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 CAATTTATATGGAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTT 3234

120294506 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 120294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 GACTCAGCATTACTAATTCTAGGAATGCATTCTGCAGACATATTGGCCATTTGTGAAGTA 3294

120294566 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 120294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 ACATGTATGAGAATATTTACTGAAGTGATTATAATAGTAAAAGGTTAAAAACCACATAAA 3354

120294626 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 120294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 TATTCAACAAGATGGGGGGACTGGGTTATCAAACTATTAGATAAATTTTATGCATTGTAT 3414

120294686 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 120294745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 ATGTAATGCATGTTCAAATAATTACAATGGAGCAATATGCAATGGTTAAAAAGAATAAGA 3474

120294746 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGC 120294776
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 CAGCAAAATATGTACTGATACAATGCCAAGC 3505

Alignment time is 4.88591 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3361] =>      3361 nucs 'mol-32-338a-017206_3361'

Score:        3275
Aligned:      3351        nucs
Identic:      3340 (100%) nucs =>       381 ( 98%)      2959 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120289866,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294349]
 second seq =>  [        1,      385] EXCISED REGION [      401,     3361]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [386,400]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [385,385] to [400,400]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [386,388] to [398,400]

120289866 TGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTA 120289925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATTTTATTTCTCCTTCACTTA 60

120289926 ATAAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGT 120289985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGAATGT 120

120289986 TGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTG--GAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGT 120290043
          |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||
      121 TGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGG--TGTGCAGAGTTTCTGCCGAGAGATCCGCTGT 178

120290044 TAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACAT 120290103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 TAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACAT 238

120290104 TTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCT 120290163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 TTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCT 298

120290164 CGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCTTGCCTTGC 120290223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      299 CGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTGCCTTGC 358

120290224 TAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||||||||.||||||||||||||
      359 TAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 385

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 460

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 520

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 580

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      581 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 638

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 698

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 758

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      759 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 818

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 878

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 938

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 998

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 1058

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 1118

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1119 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 1177

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 1237

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1297

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1357

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1417

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1477

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1537

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1597

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1657

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1717

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1777

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1837

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1897

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1957

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 2017

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 2077

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 2137

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 2197

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 2257

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2317

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2377

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2437

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2497

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2557

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2617

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2677

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2737

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2797

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2857

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2917

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2977

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 3037

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 3097

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 3157

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 3217

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 3277

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3337

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTAT 120294349
          ||||||||||||||||||||||||
     3338 AGTCATATTTAACTAAACAGGTAT 3361

Alignment time is 4.35682 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3073] =>      3073 nucs 'mol-32-338a-076180_3073'

Score:        3000
Aligned:      3061        nucs
Identic:      3053 (100%) nucs =>        94 ( 98%)      2959 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290155,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294349]
 second seq =>  [        1,       96] EXCISED REGION [      112,     3073]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [97,111]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [96,96] to [111,111]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [97,99] to [109,111]

120290155 TGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGC 120290214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGC 60

120290215 TTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          .||||||||||||||||||||.||||||||||||||
       61 CTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 96

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 171

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 231

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 291

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      292 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 349

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      350 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 409

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      410 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 469

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      470 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 529

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 589

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 649

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 709

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 769

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 829

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      830 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 888

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 948

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1008

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1068

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1128

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1188

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1248

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1308

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1368

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1428

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1488

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1548

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1608

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1668

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1728

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1788

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1848

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1908

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 1968

120293246 CCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTT 120293304
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTT 2028

120293305 ACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGT 120293364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 ACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGT 2088

120293365 GCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGA 120293424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 GCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGA 2148

120293425 AAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCT 120293484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 AAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCT 2208

120293485 GGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAG 120293544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 GGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAG 2268

120293545 TTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCT 120293604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 TTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCT 2328

120293605 GAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATT 120293664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 GAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATT 2388

120293665 GGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATA 120293724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 GGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATA 2448

120293725 AAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTAC 120293784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 AAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTAC 2508

120293785 TATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGA 120293844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGA 2568

120293845 GGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAG 120293904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 GGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAG 2628

120293905 AAATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTG 120293964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 AAATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTG 2688

120293965 GAGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTG 120294024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 GAGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTG 2748

120294025 AGCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAAT 120294084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 AGCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAAT 2808

120294085 TCTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATG 120294144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TCTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATG 2868

120294145 TCCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTT 120294204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TCCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTT 2928

120294205 CAGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATG 120294264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 CAGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATG 2988

120294265 CAGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCA 120294324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 CAGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCA 3048

120294325 TAGTCATATTTAACTAAACAGGTAT 120294349
          |||||||||||||||||||||||||
     3049 TAGTCATATTTAACTAAACAGGTAT 3073

Alignment time is 3.68502 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3196] =>      3196 nucs 'mol-32-33ab-198643_3196'

Score:        3124
Aligned:      3185        nucs
Identic:      3177 (100%) nucs =>       160 ( 99%)      3017 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120290089,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294408]
 second seq =>  [        1,      162] EXCISED REGION [      178,     3196]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [163,177]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [162,162] to [177,177]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [163,165] to [175,177]

120290089 GGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCT 120290148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTGTCT 60

120290149 TGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAAT 120290208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTGAAT 120

120290209 GTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      121 GTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 162

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 237

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 297

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 357

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
      358 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 415

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 475

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 535

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 595

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 655

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 715

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 775

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 835

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 895

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      896 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC-TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 954

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 1014

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 1074

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 1134

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1194

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 1254

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 1314

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 1374

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 1434

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 1494

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 1554

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 1614

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 1674

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 1734

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 1794

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 1854

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 1914

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 1974

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 2034

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 CCTGGCTACA-TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 2093

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 2153

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 2213

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 2273

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 2333

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 2393

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 2453

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 2513

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 2573

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 2633

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 2693

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 2753

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 2813

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 2873

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 2933

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 2993

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 3053

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 3113

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 3173

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATA 120294408
          |||||||||||||||||||||||
     3174 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATA 3196

Alignment time is 3.80174 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,    10108] =>     10108 nucs 'mol-32-34a8-100259_10108'

Score:        9943
Aligned:     10100        nucs
Identic:     10080 (100%) nucs =>      7051 (100%)      3029 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120283188,120290250] EXCISED REGION [120291388,120294420]
 second seq =>  [        1,     7062] EXCISED REGION [     7078,    10108]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1137 nucs [120290251,120291387]
 second seq =>        15 nucs [7063,7077]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [7062,7062] to [7077,7077]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [7063,7065] to [7075,7077]

120283188 AATAAGGTGCTATTTTTCTAATGCCATTTAGTTTTCCACATATAAGTATTTATTTGTGCC 120283247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAAGGTGCTATTTTTCTAATGCCATTTAGTTTTCCACATATAAGTATTTATTTGTGCC 60

120283248 TAAGTAAGGAACTAAGAATATTAACCATGGGGAATGCAGTTTTAATCTCATGAATGACAT 120283307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGTAAGGAACTAAGAATATTAACCATGGGGAATGCAGTTTTAATCTCATGAATGACAT 120

120283308 TAACATAATAAGAAAAAATGTAATAATAGCTGTATATGATAGGCTGTAATTGCTGAATGT 120283367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACATAATAAGAAAAAATGTAATAATAGCTGTATATGATAGGCTGTAATTGCTGAATGT 180

120283368 CAACATAGAATGAGAAATATTCTAATTTGTGAAGTTAAATTTATCATATGGTATTGAAAA 120283427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACATAGAATGAGAAATATTCTAATTTGTGAAGTTAAATTTATCATATGGTATTGAAAA 240

120283428 CTTCCATATGTTTTTAAAAACAATTAACATAAAAATATATATATACTCAAATGCAAAAGC 120283487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCCATATGTTTTTAAAAACAATTAACATAAAAATATATATATACTCAAATGCAAAAGC 300

120283488 AAGCTCTGTTGCCACAGGTATGTGATTTGATCAAAGTAATAGATTTTTATATCTTAAACC 120283547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGCTCTGTTGCCACAGGTATGTGATTTGATCAAAGTAATAGATTTTTATATCTTAAACC 360

120283548 ATTTAGTGTTTCATTTTGAATGTTTATGAGGGATTTTAAGAAAGTAAATGACGTGCTATT 120283607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTAGTGTTTCATTTTGAATGTTTATGAGGGATTTTAAGAAAGTAAATGACGTGCTATT 420

120283608 TATTTATACAAATGAATGACTTTGGGTAAATCATTTAGGCATATTAGAAGCCAAAGTCCT 120283667
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      421 TATTTATACAAATGAATGACTTTGGGTAAATCATTTAGGCATATTAGAAGCTAAAGTCCT 480

120283668 TTGAAAGATCAATCATTGCTTGAAAGACTGATAAATAAGGATCATAACAACTTATTTCAG 120283727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGAAAGATCAATCATTGCTTGAAAGACTGATAAATAAGGATCATAACAACTTATTTCAG 540

120283728 AAAATTTATTTTAAATACTCTTCCTAGTCTATATTACATACATACAGTGCAATAAAATGT 120283787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATTTATTTTAAATACTCTTCCTAGTCTATATTACATACATACAGTGCAATAAAATGT 600

120283788 CAAAAAATATATACACACAGCACACTACAAAATAATCTAAACTATTTTAACCATGAGTGA 120283847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAAAATATATACACACAGCACACTACAAAATAATCTAAACTATTTTAACCATGAGTGA 660

120283848 AATAGAAAAAAAAAATTGCTACTTACTCTCAAAAATAGGATGTTTACATGACATATTCAT 120283907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATAGAAAAAAAAAATTGCTACTTACTCTCAAAAATAGGATGTTTACATGACATATTCAT 720

120283908 TTTATATATATGAATTCAAATAATACTTACAATAATTATCCTTATATTAATATAATAATA 120283967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTATATATATGAATTCAAATAATACTTACAATAATTATCCTTATATTAATATAATAATA 780

120283968 TTTTTATATGTTATTATTTTTAGCTATTTTTCAGGGCATATTATTAGAATAACATAAGTA 120284027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTATATGTTATTATTTTTAGCTATTTTTCAGGGCATATTATTAGAATAACATAAGTA 840

120284028 ATCTAGGTTTATTTCCTCATATTACCTCATCATAAACCATCTCAAAATGAACTTTGGTGA 120284087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTAGGTTTATTTCCTCATATTACCTCATCATAAACCATCTCAAAATGAACTTTGGTGA 900

120284088 AAGTGTGTGTGTATGATATATTTAAAGCTTAGCTAAATTATATCCCATTCTCATTCATAA 120284147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTGTGTGTGTATGATATATTTAAAGCTTAGCTAAATTATATCCCATTCTCATTCATAA 960

120284148 GAAGATGAATGAACTCTCTGCAGAGACACAACTTACCTGGATTGAGAGTTTCAGATAATA 120284207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAGATGAATGAACTCTCTGCAGAGACACAACTTACCTGGATTGAGAGTTTCAGATAATA 1020

120284208 TTTAAAGTCTAGGACAAGAATTTCAGAATATTATATGCAGAGGAAAATAGTATGGTAGGA 120284267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTAAAGTCTAGGACAAGAATTTCAGAATATTATATGCAGAGGAAAATAGTATGGTAGGA 1080

120284268 GTGTCAGATGACCATTAAGTATGGAAGATCCTCCATTTCAGGGGCATTCCTGTTTTCAAC 120284327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGTCAGATGACCATTAAGTATGGAAGATCCTCCATTTCAGGGGCATTCCTGTTTTCAAC 1140

120284328 TCTCCTGGAAAATGTTCTGGTCTCATACTAGAACTCAGCTCCATTTCCGAGGCGCAGAAA 120284387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTCCTGGAAAATGTTCTGGTCTCATACTAGAACTCAGCTCCATTTCCGAGGCGCAGAAA 1200

120284388 TATCAGCCAGACTATACTACAAAATAAGATTTAACAAATCTAGAAAGGTAGAAGCTATAA 120284447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATCAGCCAGACTATACTACAAAATAAGATTTAACAAATCTAGAAAGGTAGAAGCTATAA 1260

120284448 ATGATAGGCCTGTTCACTTTACCAAGGAAACTGTGGGATAAATGACTCAAAACTCAATTT 120284507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGATAGGCCTGTTCACTTTACCAAGGAAACTGTGGGATAAATGACTCAAAACTCAATTT 1320

120284508 CCAAACCTCTAGAAAATAACAAACTACCAGGAAATGCCCATATTTAATTTCTGTAATACA 120284567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAACCTCTAGAAAATAACAAACTACCAGGAAATGCCCATATTTAATTTCTGTAATACA 1380

120284568 AAACTGTTCCATTATGAAATATAGCAAAGAAATTATTAGCAAAGATTTTGTTTCTCATCA 120284627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAACTGTTCCATTATGAAATATAGCAAAGAAATTATTAGCAAAGATTTTGTTTCTCATCA 1440

120284628 AATGACAGCATCCAACTAGTATAAATATTCCCCCTGGGCAGAAATTGATGTCATTCCGAC 120284687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGACAGCATCCAACTAGTATAAATATTCCCTCTGGGCAGAAATTGATGTCATTCCGAC 1500

120284688 AGAGATAGTGATATGCACATCACAAAACGTCAATTAAGAATTTCATGATGTTTTTGGTTA 120284747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAGATAGTGATATGCACATCACAAAACGTCAATTAAGAATTTCATGATGTTTTTGGTTA 1560

120284748 TATTTACTGATAAATACTCACTATTGTCAGAAGCCGGGTTTTATCTTTTGATATTAATTA 120284807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTTACTGATAAATACTCACTATTGTCAGAAGCCGGGTTTTATCTTTTGATATTAATTA 1620

120284808 GGAATATATTTACTTAAGATCAAGCCCTCCTACAGAAATTATTTGTGTGTCTAGTATTTA 120284867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAATATATTTACTTAAGATCAAGCCCTCCTACAGAAATTATTTGTGTGTCTAGTATTTA 1680

120284868 TCTCTTATCCTAATATATCCTGGACTAGGTATAACTTTTATTGATAATCTTTCTAAACCT 120284927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTCTTATCCTAATATATCCTGGACTAGGTATAACTTTTATTGATAATCTTTCTAAACCT 1740

120284928 TCATACACGCATGATAGATAATGAATATTTATTGAATGAATTCACAGTTATTCTATTTTA 120284987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATACACGCATGATAGATAATGAATATTTATTGAATGAATTCACAGTTATTCTATTTTA 1800

120284988 TGTGTTGATGGAGTTTTTTTTTCCTATGAAGTTTTTCTGTGCTGCCTCTCTCTAAACTTT 120285047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGTTGATGGAGTTTTTTTTTCCTATGAAGTTTTTCTGTGCTGCCTCTCTCTAAACTTT 1860

120285048 TTATATGTCCCATATCTGCCTTTAATGTCTCTCTGTGCCTACTGCAATGATATGTATTCA 120285107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATATGTCCCATATCTGCCTTTAATGTCTCTCTGTGCCTACTGCAATGATATGTATTCA 1920

120285108 GACAGCATGTGTTATAGGTTGTTAAATGACTCAGGAAATTGGTTTAGTAAAACAGATACA 120285167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GACAGCATGTGTTATAGGTTGTTAAATGACTCAGGAAATTGGTTTAGTAAAACAGATACA 1980

120285168 AGTTCAGAAGTAGTTTGAGTTCTCACAACTAAATAAAGTGATGGAATCAAACTGTAGCCC 120285227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTTCAGAAGTAGTTTGAGTTCTCACAACTAAATAAAGTGATGGAATCAAACTGTAGCCC 2040

120285228 TGAGCCTCATTGCTATAAAAGCCTGCGTATAAGCCGGCCGCTTGATAAATGGCATGCTAA 120285287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAGCCTCATTGCTATAAAAGCCTGCGTATAAGCCGGCCGCTTGATAAATGGCATGCTAA 2100

120285288 TATGTGATTCTGTGTCTAGTGGCTGACCACGTGTCTTGTGGCATGTTAATATAGGGTTCT 120285347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2101 TATGTGATTCTGTGTCTAGTGGCTGACCACGTGTCTTGTGTCATGTTAATATAGGGTTCT 2160

120285348 GTGGCCCATGACTAGTAGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGT 120285407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGGCCCATGACTAGTAGCATGTTAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGT 2220

120285408 TAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGCTAATATAGAGTTCTGTGTCCCAT 120285467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAATATAGGGTTCTGTGGCCCATGACTAGTGGCATGCTAATATAGAGTTCTGTGTCCCAT 2280

120285468 GGCTGGCCATATGACCAGTTGCATGCTAACATAGGGTTCTGTGTCCAGTGGCTGACCACA 120285527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCTGGCCATATGACCAGTTGCATGCTAACATAGGGTTCTGTGTCCAGTGGCTGACCACA 2340

120285528 TGACATGTGCCATACTAATACAGAGTTCTGTGTTTCACGGCTGGCCACATGACAAGTGGC 120285587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGACATGTGCCATACTAATACAGAGTTCTGTGTTTCACGGCTGGCCACATGACAAGTGGC 2400

120285588 ATGCTAACAGAGCATGCTGTGTCCCATGGCTGACCACATAACATGTGGCATGCTAATACA 120285647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGCTAACAGAGCATGCTGTGTCCCATGGCTGACCACATAACATGTGGCATGCTAATACA 2460

120285648 GAGTTCTGTGTTTCATGGCTGGCCACATGACAATTGGCATGCTAATTTAGGGTTCTGCTT 120285707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGTTCTGTGTTTCATGGCTGGCCACATGACAATTGGCATGCTAATTTAGGGTTCTGCTT 2520

120285708 CCAATGGCTGGCCACTGACAATTGGCATGCTAATATATGGTTCTGTGTCCCATGCCTGGA 120285767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCAATGGCTGGCCACTGACAATTGGCATGCTAATATATGGTTCTGTGTCCCATGCCTGGA 2580

120285768 CACGTGACAAGTGGCATACTAATATTGGATTCTGTGCCCAATGGCTGGCCACTGAGAAGT 120285827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CACGTGACAAGTGGCATACTAATATTGGATTCTGTGCCCAATGGCTGGCCACTGAGAAGT 2640

120285828 GGCATGCTAATATGGTGTTTTATGTCCAATAGCTGACCATGTGACAAATGGCATCCTAAT 120285887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGCATGCTAATATGGTGTTTTATGTCCAATAGCTGACCATGTGACAAATGGCATCCTAAT 2700

120285888 ATAGGGTTTTGTGTTCAGTGACAAAATAGCTTCACATTCATATAGATAAAGACATGAACT 120285947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATAGGGTTTTGTGTTCAGTGACAAAATAGCTTCACATTCATATAGATAAAGACATGAACT 2760

120285948 CAGTGGACACTTAGCAAGTTATGTCTCCCTCTCCTTTAATAAACACTGGAAGTCCTCATA 120286007
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATTGGACACTTAGCAAGTTATGTCTCCCTCTCCTTTAATAAACACTGGAAGTCCTCATA 2820

120286008 TTTAGCAAGGTGAGAAAATAGATACCACTATTTAAGCATCCACTACCAAGATATGACTTT 120286067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTAGCAAGGTGAGAAAATAGATACCACTATTTAAGCATCCACTACCAAGATATGACTTT 2880

120286068 GTTGTCTTTTGTGCAGCTGTGGACCAAAAATCACTTCTCTTCAGAAAGATAAAAATGTGG 120286127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTTGTCTTTTGTGCAGCTGTGGACCAAAAATCACTTCTCTTCAGAAAGATAAAAATGTGG 2940

120286128 CCCTAGGAAATAAACTAAAGTCTGCTGGAATTATTTTGCAATCCTGACACTACATTATGA 120286187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCCTAGGAAATAAACTAAAGTCTGCTGGAATTATTTTGCAATCCTGACACTACATTATGA 3000

120286188 CAATCTGTCCCAAGATTTCCTTCCCACAACCATATGTGACCCATTTAACGCAGCCCAATA 120286247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAATCTGTCCCAAGATTTCCTTCCCACAACCATATGTGACCCATTTAACGCAGCCCAATA 3060

120286248 AGTGATTCTCTGTTTCTGAATGAGCAATGAAGAGAAATTTGAAAAACATTCATCTCTGCA 120286307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTGATTCTCTGTTTCTGAATGAGCAATGAAGAGAAATTTGAAAAACATTCATCTCTGCA 3120

120286308 ACAACATTGCTGTGGCATTAACATCCTTCTTCTCCATGGCCTGCCTCCTTCCTTTCCATC 120286367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACAACATTGCTGTGGCATTAACATCCTTCTTCTCCATGGCCTGCCTCCTTCCTTTCCATC 3180

120286368 CTCACTGATAGCTCCTTCTTTTCTCTTTTCCCAATAGCTTAGATTTGTTTCAACTCCTTG 120286427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCACTGATAGCTCCTTCTTTTCTCTTTTCCCAATAGCTTAGATTTGTTTCAACTCCTTG 3240

120286428 ATGTAATCATGCCCTAAGACATCTTTTTAAAAAGTAATTTTTCTGTTAGTGATTTTATTG 120286487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATGTAATCATGCCCTAAGACATCTTTTTAAAAAGTAATTTTTCTGTTAGTGATTTTATTG 3300

120286488 ATTATCATTTATTTAAAATTAGATATTTGTCTTTCAATTTTGTTTATGGTGATTTTTTTC 120286547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTATCATTTATTTAAAATTAGATATTTGTCTTTCAATTTTGTTTATGGTGATTTTTTTC 3360

120286548 TGTCAACTCTTATATTTGCTTTGTATGCTTTCAAATCTGTCATCACCCTTCTTCATGGTT 120286607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGTCAACTCTTATATTTGCTTTGTATGCTTTCAAATCTGTCATCACCCTTCTTCATGGTT 3420

120286608 TTTGCCTATGGCAACATGCAGTGAAAAGGTTTTTCCACTTTAAGGTTAGATGAATGGACA 120286667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTGCCTATGGCAACATGCAGTGAAAAGGTTTTTCCACTTTAAGGTTAGATGAATGGACA 3480

120286668 AATGGCTTCAATTTTGCTGAAGGGGAAGAAAGAAAAATGAGTATAAAGATTAGTTTCTAA 120286727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATGGCTTCAATTTTGCTGAAGGGGAAGAAAGAAAAATGAGTATAAAGATTAGTTTCTAA 3540

120286728 ATAAATAAGTTATTTTAAAAAACTGTAAAGTAATAGATATCCTACTAGTGGGGAAAATAA 120286787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATAAATAAGTTATTTTAAAAAACTGTAAAGTAATAGATATCCTACTAGTGGGGAAAATAA 3600

120286788 TGAAATAGTTTTGTCTTTCATTTCAGCAAAGATTCGGTACTGAATTGGTACAGACCATAT 120286847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGAAATAGTTTTGTCTTTCATTTCAGCAAAGATTCGGTACTGAATTGGTACAGACCATAT 3660

120286848 TCCTTTAGAAAGATAACAATTTAGAAAGTATATTTTCTACTAGTGAAAGTACAAGCCTCA 120286907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCCTTTAGAAAGATAACAATTTAGAAAGTATATTTTCTACTAGTGAAAGTACAAGCCTCA 3720

120286908 CTTTGGTTTTTAAATCTTCTCCCTTGGTTTTGTTTACTCAGATATGTTTGAACTTATGGA 120286967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTTGGTTTTTAAATCTTCTCCCTTGGTTTTGTTTACTCAGATATGTTTGAACTTATGGA 3780

120286968 AAGACAACTCAAAGAGTCACTTGTTCTTAAACTTTCGGATCCATTTTTCGGATATGCAGA 120287027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAGACAACTCAAAGAGTCACTTGTTCTTAAACTTTCGGATCCATTTTTCGGATATGCAGA 3840

120287028 GTAGTGAGCAATTTCGCCTAAGCAATAAAGAGTTCACTGAAAAAGACTTTAGGTTGAAAG 120287087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTAGTGAGCAATTTCGCCTAAGCAATAAAGAGTTCACTGAAAAAGACTTTAGGTTGAAAG 3900

120287088 TATTTCTTTTACCTGAAATATCATGAAGTAATAATTTCTATAATACCAGGTCTTGAACTG 120287147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATTTCTTTTACCTGAAATATCATGAAGTAATAATTTCTATAATACCAGGTCTTGAACTG 3960

120287148 TTTTTACAGTATGGTTTAAGTTTCTTTGTTTCTGTTTTTTTCAGCCTAATCTTTGTGCAT 120287207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTTTTACAGTATGGTTTAAGTTTCTTTGTTTCTGTTTTTTTCAGCCTAATCTTTGTGCAT 4020

120287208 AGTACTCTCTTCATTGATCGAATGTATTTGAATTCAAAGGTCTATGATTATAATATGCCT 120287267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGTACTCTCTTCATTGATCGAATGTATTTGAATTCAAAGGTCTATGATTATAATATGCCT 4080

120287268 TAAGTTAAACATCATATTAACCTTCAGCGCATAGAGTTTGCTTTTGGTGCACTAGCAACA 120287327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAAGTTAAACATCATATTAACCTTCAGCGCATAGAGTTTGCTTTTGGTGCACTAGCAACA 4140

120287328 GGCTGCCTGGCAGCCCTGACTGCCCTTGAACTCAGTTCTCTGTGGCTGGCTGGAGTTATA 120287387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGCTGCCTGGCAGCCCTGACTGCCCTTGAACTCAGTTCTCTGTGGCTGGCTGGAGTTATA 4200

120287388 AGGATGGAACTTTCAAACACCTACACCACAGCTGCTGAGCCTTTCAGATAAGGCGGGGAT 120287447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGGATGGAACTTTCAAACACCTACACCACAGCTGCTGAGCCTTTCAGATAAGGCGGGGAT 4260

120287448 AGACCCATTAACCTCATGTCATTATCTTTATTTTATGGCTGATAAAACTGTTTCTTTTGT 120287507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGACCCATTAACCTCATGTCATTATCTTTATTTTATGGCTGATAAAACTGTTTCTTTTGT 4320

120287508 GTGTCTTACTCTCCAAGACCCCTCTCACCTTCCCCCTTGCTTTAAAAACACATTAATATC 120287567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTGTCTTACTCTCCAAGACCCCTCTCACCTTCCCCCTTGCTTTAAAAACACATTAATATC 4380

120287568 ATAATCTAGTTAAATTAGTTTGTTGCCATATTGAAAATAAGGCTCTTTTTGTTTCTAGTC 120287627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATAATCTAGTTAAATTAGTTTGTTGCCATATTGAAAATAAGGCTCTTTTTGTTTCTAGTC 4440

120287628 AGGTTGATACAGCAAGAGTTTATTGACAAGATGTGGCTGCAGAAAAGAACGGCTAATTAT 120287687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGGTTGATACAGCAAGAGTTTATTGACAAGATGTGGCTGCAGAAAAGAACGGCTAATTAT 4500

120287688 TTTCATTTGCATGAATGGCTTACTGCTTTTGCCTAATTACTGTTTAGTACAATACTGTTA 120287747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTTCATTTGCATGAATGGCTTACTGCTTTTGCCTAATTACTGTTTAGTACAATACTGTTA 4560

120287748 ATATTCTCCATTAAATATTTGCCAAATTAACTTTGCCGTAAGTTTTCATTAGTTTTAACA 120287807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATATTCTCCATTAAATATTTGCCAAATTAACTTTGCCGTAAGTTTTCATTAGTTTTAACA 4620

120287808 TTCAACTCTGAATATAAGTATGCAGGCATACTGTGTAGTATTATGCTCACTGAACATGGA 120287867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTCAACTCTGAATATAAGTATGCAGGCATACTGTGTAGTATTATGCTCACTGAACATGGA 4680

120287868 AAGCTACTCTAAAATGTTAATACATTTAGCAGTAACGTTAGAATACACAGATTTTATTCC 120287927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAGCTACTCTAAAATGTTAATACATTTAGCAGTAACGTTAGAATACACAGATTTTATTCC 4740

120287928 CACATATACGGTATATGCATAGAAGTATGTATGCATATAGATATAGATATTTATCTTGTT 120287987
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CACATATACAGTATATGCATAGAAGTATGTATGCATATAGATATAGATATTTATCTTGTT 4800

120287988 ACACATAGATGTGTACAATAGTCTTGCCTTGCTTTGTCGGCATGTCTAAGTACAGTAATA 120288047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACACATAGATGTGTACAATAGTCTTGCCTTGCTTTGTCGGCATGTCTAAGTACAGTAATA 4860

120288048 TTAGCAATTGCAATTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGAAAGATTTC 120288107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTAGCAATTGCAATTAGTTAGTTTTTTCTTAATAGAATGAATAAGTAGATGAAAGATTTC 4920

120288108 TACTTCTAAAAAGAAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTGTCCTCCTAAAAATAGGTTTTC 120288167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4921 TACTTCTAAAAAGAAATATGATAAAAATAGGTTTTTCTTTCCTCCTAAAAATAGGTTTTC 4980

120288168 CTGTCCTCCTAAACTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGAGAGATGGA 120288227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTGTCCTCCTAAACTATCTGTTTTGTTCTTTAATATTTTGTCCCCACGGAGAGAGATGGA 5040

120288228 AAAACCTAATGGCACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGATGATTAAG 120288287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAAACCTAATGGCACATAGTAGAGACAAAATAAATATTTATAATTAAAAAGATGATTAAG 5100

120288288 GAAAGGTAATGATAATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAA 120288347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GAAAGGTAATGATAATCACAGATGGGAATGAATGAGTTTGGATAGTGCAGGTCAAAAAAA 5160

120288348 GGAGAGAGAAAATGAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCC 120288407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GGAGAGAGAAAATGAATGAAAAAATATAATAGAGAAATTGGGGCTAAACTAATGGGTGCC 5220

120288408 ATGGAAATGGAGGGAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAA 120288467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ATGGAAATGGAGGGAAAATTATGTGGAGTAGTAGGTGGAAGAGAAGGAGAATAAAATGAA 5280

120288468 GGAATATATGCTAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAA 120288527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GGAATATATGCTAATAGAAAGACATCGAAATAGAGAAGAGGAGTGTAAAAAGGCAAATAA 5340

120288528 GAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGA 120288587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GAAGGTTAGAAAACAAGAGTACAGTCAACAAGATGGAGAAAGATGGAAGAAGGACCCTGA 5400

120288588 AAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTC 120288647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AAGGAGTAGATGAGGCAAAACAAAAGAGGTGAGCAGGCAAAGAAGTGAAAAGGATGCCTC 5460

120288648 TGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAA 120288707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTGCAAGAGTGAAGGAATTGGGGTCACTGTGTTAGCTTTGCATTGCCCATACATATTAA 5520

120288708 TGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGC 120288767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGACTTTTGGTTGATTTTAAATTTCAGATTTGGTATTTTCCTTAAGCCTATTAAAATTGC 5580

120288768 AAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATC 120288827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAAAATTCATGTAGAGTTAGACTTCCATGCACACTATGAATCTAGTCAACTACAGCAATC 5640

120288828 TAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTC 120288887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TAATAACATAACTCACCTTTGTACTTCAACTGAAATAGCATTTCATCTAAATGGCTACTC 5700

120288888 TACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTT 120288947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TACTTCTTATAACCTAACTATGTCTCTTGGCAATACTACAAAGTCATTATAATTTGTCTT 5760

120288948 CTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAA 120289007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CTAATTTCTCAAAAGTTCATTTTTATTAGAAGACTTGATATTAATTTAAATAAAAATTAA 5820

120289008 TAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATA 120289067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TAAGCCATTGAATCACACTAGTAAAGTATTTGCATAGCAAATTGAAATTCACCTATTATA 5880

120289068 AAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAA 120289127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AAAACACATAGATTCATAGTCTCATTGACACAGGAAGAAAAGATCTTAAAGATACACTAA 5940

120289128 TCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATT 120289187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TCCTAACCTCTCATTTAATTTTTGAGAAAAGTAAGGCTAGAATTATTGAGATAACTAATT 6000

120289188 ATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAATATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGA 120289247
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 ATTGGCAGAATTTCAGACTAGACCTCAAAATAAGACTTCCTTTCTCAATTTAAATCAAGA 6060

120289248 TATTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTCATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCAT 120289307
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TATTTTGTCTTGTTTTTTTTTT-CATTTCAGTCTATGTTATTATCCAAGAAATGCATCAT 6119

120289308 TACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATG 120289367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TACTCACACATTAGCACTGATGGGATTTTTTAATCCTGTGCCATTTTTTTTTGTACTATG 6179

120289368 GCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGAC 120289427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 GCTAGAGTTAAAATTGAAATTCATTGCAGTGGGGAAAAAATCTTCTAAAATAAGTAAGAC 6239

120289428 TATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGT 120289487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 TATAATGCTCAAAAGATAAACAACAGAAGAGTTCAAGAATGCCAACTTTAAGTACATAGT 6299

120289488 TGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTT 120289547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 TGTAGAAAGAAAGAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATAGTAGTTT 6359

120289548 CTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAA 120289607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 CTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTTTTGGCTGCATAA 6419

120289608 ATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 120289667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 ATGTCTTCTCTTGAGAAGTGTCTGTACATATCCTTCGTCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 6479

120289668 GTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCA 120289727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 GTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCA 6539

120289728 AATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCAT 120289787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 AATGAGTAGTTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGGATGGTCTTTACAATTTGGCAT 6599

120289788 GTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCT 120289847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 GTTTTTACAGTGGCTGGTACCAGTTGTTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCT 6659

120289848 CTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATT 120289907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 CTTGTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCTCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGATT 6719

120289908 TTATTTCTCCTTCACTTAAT--AAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAA 120289965
          ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 TTATTTCTCCTTCACTTA--TGAAGCTTAGTTTGGCTGGATGTGAAATTCTGGGTTGAAA 6777

120289966 ATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTC 120290025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 ATTCTTTTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTGGAGTTTC 6837

120290026 TGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTC 120290085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 TGCCGAGAGATCCGCTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGATAACCCGACCTTTCTC 6897

120290086 TCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTG 120290145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 TCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGAATCTGACAATTATGTG 6957

120290146 TCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTG 120290205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 TCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGTGGCATTCTCTGTATTTCCTGAATTTG 7017

120290206 AATGTTGGCTTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATAAT 120290250
          |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7018 AATGTTGGCCTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAATTCTCCTGGATAAT 7062

EXCISED REGION

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 7137

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 7197

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 7257

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCCGT--GTGAG 120291625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
     7258 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC--AGGTGAG 7315

120291626 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 120291685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7316 GCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGCACCCA 7375

120291686 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 120291745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7376 GTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAATCATC 7435

120291746 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 120291805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7436 CATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCT 7495

120291806 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 120291865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7496 TCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAAGTCAC 7555

120291866 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 120291925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7556 ATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGTAAACA 7615

120291926 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 120291985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7616 TCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATTTTGCT 7675

120291986 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 120292045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7676 TATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTGTTAAT 7735

120292046 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 120292105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7736 TTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTATCCCAG 7795

120292106 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 120292165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     7796 ATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC--TTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTC 7853

120292166 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 120292225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 TGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTCCCGGG 7913

120292226 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 120292285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 TTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCACCA 7973

120292286 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 120292345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 CACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGG 8033

120292346 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120292405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 TCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 8093

120292406 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 120292465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 GTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAGTAGGA 8153

120292466 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 120292525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8154 ACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCATGCACT 8213

120292526 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 120292585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8214 TTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATGACACA 8273

120292586 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 120292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8274 TTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCACCTCT 8333

120292646 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 120292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8334 CCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGTGATCT 8393

120292706 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 120292765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8394 TAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTGAGCTA 8453

120292766 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 120292825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8454 CCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAATGCTAA 8513

120292826 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 120292885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8514 TTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGAGGAAG 8573

120292886 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 120292945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8574 AAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTTTGTAA 8633

120292946 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 120293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8634 TTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAGAAAAT 8693

120293006 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 120293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8694 CTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGAAGAGC 8753

120293066 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 120293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8754 TGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCAACCAG 8813

120293126 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 120293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8814 GCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAAGCTC 8873

120293186 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 120293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8874 AAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCACCATG 8933

120293246 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 120293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8934 CCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTA 8993

120293306 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 120293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8994 CCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTG 9053

120293366 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 120293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9054 CTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAA 9113

120293426 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 120293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9114 AAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTG 9173

120293486 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 120293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9174 GGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGT 9233

120293546 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 120293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9234 TCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTG 9293

120293606 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 120293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9294 AAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTG 9353

120293666 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 120293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9354 GCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAA 9413

120293726 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 120293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9414 AAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACT 9473

120293786 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 120293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9474 ATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAG 9533

120293846 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 120293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9534 GTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGA 9593

120293906 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 120293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9594 AATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGG 9653

120293966 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 120294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9654 AGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGA 9713

120294026 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 120294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9714 GCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATT 9773

120294086 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 120294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9774 CTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGT 9833

120294146 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 120294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9834 CCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTC 9893

120294206 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 120294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9894 AGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGC 9953

120294266 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 120294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9954 AGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCAT 10013

120294326 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 120294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10014 AGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACA 10073

120294386 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATC 120294420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10074 GTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATC 10108

Alignment time is 12.3135 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3031] =>      3031 nucs 'mol-32-34a8-100259_3031'

Score:        3018
Aligned:      3031        nucs
Identic:      3029 (100%) nucs =>       231 (100%)      2798 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120291388,120291618] EXCISED REGION [120291621,120294420]
 second seq =>  [        1,      231] EXCISED REGION [      234,     3031]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [120291619,120291620]
 second seq =>         2 nucs [232,233]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [120291619,120291621] to [120291621,120291623]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120291388 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 120291447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCTGTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCA 60

120291448 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120291507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATAATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAA 120

120291508 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 120291567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGACCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGT 180

120291568 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC 120291618
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGACATCTTGCACTTCCC 231

EXCISED REGION

120291621 GTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGC 120291680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      234 GTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGCTGCACCCACTGTCCTGC 293

120291681 ACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAA 120291740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      294 ACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTCGGTTGGAAATGCGGAAA 353

120291741 TCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGC 120291800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 TCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGGAGCTGTTCCTATTCGGC 413

120291801 CATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAA 120291860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 CATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATTTAAAGAATATTAATCAA 473

120291861 GTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGT 120291920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 GTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTTAAGTTGGCCTGAAAGGT 533

120291921 AAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATT 120291980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 AAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTGCCAGTATACACATGATT 593

120291981 TTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTG 120292040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTGAAGCTATGGGAAATCTG 653

120292041 TTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTAT 120292100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATGAACCAAAATTCTCCTAT 713

120292101 CCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCT 120292160
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
      714 CCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCC--TTTTTTTTTGAGATGGAGTCT 771

120292161 TGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTC 120292220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 TGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTTACTCCAAACTCCGCCTC 831

120292221 CCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCAC 120292280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 CCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCAC 891

120292281 CACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAG 120292340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 CACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAG 951

120292341 GATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGAT 120292400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 GATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGAT 1011

120292401 TACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAG 120292460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTAGGGGACATGGATCAGAG 1071

120292461 TAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCAT 120292520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 TAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCTCCTGTGGATGTCCCCAT 1131

120292521 GCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATG 120292580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 GCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAGGAATAAACAATGAAATG 1191

120292581 ACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCA 120292640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 ACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATATAACTAATTAGAAGCCCA 1251

120292641 CCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGT 120292700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTAAAGATATTTCTGAGAGT 1311

120292701 GATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTG 120292760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 GATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGTCTTTATGGAGAACCTTG 1371

120292761 AGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAAT 120292820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAAAACTTGTTCATCCCAAT 1431

120292821 GCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGA 120292880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATGGATTAGATCTGAAGAGA 1491

120292881 GGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTT 120292940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 GGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTTAAATATCCCAGAAACTT 1551

120292941 TGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAG 120293000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTTCTTTTAGTGATTAGCAG 1611

120293001 AAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGA 120293060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAAGACCTGAGATGGATGGA 1671

120293061 AGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCA 120293120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 AGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGTCTCACTCTGTCA 1731

120293121 ACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 120293180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 ACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 1791

120293181 AGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCA 120293240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 AGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGACCCACAGGCACACACCA 1851

120293241 CCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTA 120293300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 CCATGCCTGGCTACATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTA 1911

120293301 TGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCA 120293360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TGTTACCCAGCCTGGTCTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCA 1971

120293361 AAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCA 120293420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 AAGTGCTGGAATTATAGATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCA 2031

120293421 TTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAA 120293480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TTGAAAAGAACCCCCAGAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAA 2091

120293481 CTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCA 120293540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CTCTGGGACTTTGATAAACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCA 2151

120293541 TTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGT 120293600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TTAGTTCATCTGTTCCCTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGT 2211

120293601 ACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCC 120293660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 ACCTGAAAGTTTTAGGACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCC 2271

120293661 AATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGG 120293720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 AATTGGCTCATCTTTAAAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGG 2331

120293721 GATAAAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACAC 120293780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 GATAAAAAGGAGATGTTGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACAC 2391

120293781 CTACTATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATC 120293840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 CTACTATGTGGCAATTGTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATC 2451

120293841 TCGAGGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGA 120293900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TCGAGGTCTCAGTCCAGAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGA 2511

120293901 GAAGAAATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTG 120293960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 GAAGAAATACAATGTAGACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTG 2571

120293961 CCTGGAGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTT 120294020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 CCTGGAGAAAGTTAACAAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTT 2631

120294021 TTTGAGCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTT 120294080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TTTGAGCGTTTTCTCTCTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTT 2691

120294081 CAATTCTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGAT 120294140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 CAATTCTGTGTTCTCTGTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGAT 2751

120294141 AATGTCCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGT 120294200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 AATGTCCTTTTCTATTGTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGT 2811

120294201 TCTTCAGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAG 120294260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 TCTTCAGCCAGTTTTAATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAG 2871

120294261 AATGCAGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATA 120294320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 AATGCAGGATATTTGATACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATA 2931

120294321 TTCATAGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATA 120294380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 TTCATAGTCATATTTAACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATA 2991

120294381 AAACAGTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATC 120294420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 AAACAGTTTGTGAATATGAGGAGTAATAGATACTTGTATC 3031

Alignment time is 4.24152 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [120280250,120301387] =>     21138 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [        1,     3206] =>      3206 nucs 'mol-32-34b3-047938_3206'

Score:        3195
Aligned:      3206        nucs
Identic:      3205 (100%) nucs =>      1952 (100%)      1253 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [120291304,120293255] EXCISED REGION [120293257,120294510]
 second seq =>  [        1,     1952] EXCISED REGION [     1953,     3206]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [120293256,120293256]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [120293284,120293284]
 second seq =>         1 nucs [1980,1980]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [120293256,120293270] to [120293257,120293271]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

120291304 GTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAG 120291363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGTGGGCTCCATCCAGTTCAAGCTTCCCGGCCACTTTGTTTACCTACTCAAGCCTCAG 60

120291364 CAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCT 120291423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATGGTGGGTGCCCCTCCCCAAGCCTGGCTGCTGCCTTGCAGTTCGATCTCAGACTGCT 120

120291424 GTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATA 120291483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCCAGCAATGAGTGAGGCTCCATGGGCGTGGGACTCTCCCAGCCATGCACGGGATATA 180

120291484 ATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGA 120291543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTCCTGGTGTGCTGTTTGCTAAGACTGTTGGAAAAGTGCAGTATTAGGGTGGGAGTGA 240

120291544 CCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGA 120291603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTATTTTCCAGGTCCCACTTGTCACAGCTTCCCTTGGCTAGGAAAGGGAATTCCCTGA 300

120291604 CATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGC 120291663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATCTTGCACTTCCCGTGTGAGGCAATGCCTTGCCCTGCTTCAGCTCACGCTCGATGGGC 360

120291664 TGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTC 120291723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCACCCACTGTCCTGCACCCAGTGTCCGACAAGCCCCAGTGAGATGAACCTGGTATCTC 420

120291724 GGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGG 120291783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTTGGAAATGCGGAAATCATCCATCTTCTGTGTCACTCATGCTGGGGGCTGTAGACTGG 480

120291784 AGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATT 120291843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTCCTTTTTCTAAATTTAAATTTGAGTTAATAAATCATT 540

120291844 TAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTT 120291903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAAGAATATTAATCAAGTCACATTTACCTCCACCTTAAATTAAGTATCTCTATTTATTT 600

120291904 AAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTG 120291963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGTTGGCCTGAAAGGTAAACATCTGATATCCATGGACCCCCTGTACTTTTCTGACTTTG 660

120291964 CCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTG 120292023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAGTATACACATGATTTTGCTTATTTTTGGTTAAAAATATGCCTCAATCCAGCTAACTG 720

120292024 AAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATG 120292083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGCTATGGGAAATCTGTTAATTTTATTGTAAGGCAAACTACTTCTCTGCCTTCCAAATG 780

120292084 AACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTT 120292143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACCAAAATTCTCCTATCCCAGATAGTGCAGTCTATCTCTATCTTTTTTTTTCCTTTTTT 840

120292144 TTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTT 120292203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTTGGCTT 900

120292204 ACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 120292263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTCCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 960

120292264 GGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGT 120292323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGACTACAGGTGCGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGT 1020

120292324 TTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTC 120292383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAATTCGTGGTCCACTTGCCTTGGTC 1080

120292384 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTA 120292443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACTGCGCCTGGCCAGTGCAGTCTATCTTA 1140

120292444 GGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCT 120292503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGGACATGGATCAGAGTAGGAACAAGAAAAACTGAAGGGTGGAGAGACACAGTGATTCT 1200

120292504 CCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAG 120292563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGTGGATGTCCCCATGCACTTTTGTCTCAGCTGTCCATGTTCCCCAACAATAAAAAAG 1260

120292564 GAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATAT 120292623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAATAAACAATGAAATGACACATTGTTAACTCATAATGCAGAGACTGTGATAGCATATAT 1320

120292624 AACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTA 120292683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTAATTAGAAGCCCACCTCTCCTTGTGTGGTCCCAGAGAAGAAACTTTGAGAACTGTA 1380

120292684 AAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGT 120292743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGATATTTCTGAGAGTGATCTTAATTGGATTACATATGGGATAAAGGGAGGCAAACTGT 1440

120292744 CTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAA 120292803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTATGGAGAACCTTGAGCTACCTTCTAAGGTTTGTGTTTGGATGGCTCATCACTTCAA 1500

120292804 AACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATG 120292863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACTTGTTCATCCCAATGCTAATTTTAGCTCTTTCTGCTGGAGAGGGGAAATTAGGCATG 1560

120292864 GATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTT 120292923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATTAGATCTGAAGAGAGGAAGAAACTGCGATATCAAGATGACATTTAAAAACAACTTTT 1620

120292924 AAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTT 120292983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATATCCCAGAAACTTTGTAATTTCCTTATTTTTATTATACTTTTTAATCATGTTCTTT 1680

120292984 CTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAA 120293043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTTAGTGATTAGCAGAAAATCTTTTAGAATGTTGAGGATGGATTTTTGGTGACAGCAA 1740

120293044 GACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGAT 120293103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACCTGAGATGGATGGAAGAGCTGATCCACTAAACAGTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGAT 1800

120293104 CAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACT 120293163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCCTAGACTGGAGGGCAGAGGCATGATCTTGGCTCACT 1860

120293164 GCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGA 120293223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAACCTCTGCCTCCCAAGCTCAAGAAATCCTCTCACCTCAGCCTCCCAAGTAACTGGGA 1920

120293224 CCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTACA 120293255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCACAGGCACACACCACCATGCCTGGCTACA 1952

EXCISED REGION

120293257 TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGT 120293316
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 TTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGGTAAAGATGGGGTCTCTCTATGTTACCCAGCCTGGT 2012

120293317 CTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATA 120293376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 CTCAAACTTCTGAGCTCAAGTGATCCACCCTTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATA 2072

120293377 GATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCA 120293436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 GATGCAGGCCACCACATCGGGCCCCTCTTTACAATTCTGCCTCATTGAAAAGAACCCCCA 2132

120293437 GAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATA 120293496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 GAGATAGTGGAATAAAGAAAAGATTTGAAACCAAATCTTAGCAACTCTGGGACTTTGATA 2192

120293497 AACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCC 120293556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 AACGGCCACTCGTTGACCTGGATTGGACCTGAGAGATGGCTTCATTAGTTCATCTGTTCC 2252

120293557 CTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGG 120293616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 CTAAGAGGCAATGTCTTTCCTTTGTTCCAAACCATGTGTTTGGTACCTGAAAGTTTTAGG 2312

120293617 ACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTA 120293676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 ACCCTGCCCCTGCAACTAACTAGCTATGTGACCTGGAATATGCCAATTGGCTCATCTTTA 2372

120293677 AAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGT 120293736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 AAGGAGGAACAATAATATTATTTACATCATAGTTTTATTGTAGGGATAAAAAGGAGATGT 2432

120293737 TGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATT 120293796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 TGTTCAGCATCCATTTATTCATAAAACAAACAACAGTAACACACCTACTATGTGGCAATT 2492

120293797 GTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCA 120293856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 GTTATGCTAAATACTGAGGATATACAAAATTTGAGTTCCTGATCTCGAGGTCTCAGTCCA 2552

120293857 GAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTA 120293916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 GAGGGATTGCTGAGAGGCCACTGGATATACACAAAACACAGTGAGAAGAAATACAATGTA 2612

120293917 GACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAAC 120293976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 GACAGAGCATTATGAGAATATGGAAGAGGAAGCCATTAACTTTGCCTGGAGAAAGTTAAC 2672

120293977 AAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCT 120294036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 AAGCAGCAGGCTTGTTTCCCCACAGGGAAAGTTGAAGGCATGTTTTTGAGCGTTTTCTCT 2732

120294037 CTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCT 120294096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 CTACCCAGCTTTAAATTGTGACTTAAATGCCTTCAGAACATGTTCAATTCTGTGTTCTCT 2792

120294097 GTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATT 120294156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 GTATAATGTTTCTTGTGTAAATGTTTATTATTTGCAATGATGATAATGTCCTTTTCTATT 2852

120294157 GTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTA 120294216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GTTTGATTACTGGGAAAGCAGGGGTGGCTGAAATCTCACGTGGTTCTTCAGCCAGTTTTA 2912

120294217 ATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGA 120294276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 ATAGCAAGTTGTTCCTGGTTGTTTCTTCCTAGAATGACTCCGAGAATGCAGGATATTTGA 2972

120294277 TACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTA 120294336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 TACTGTCAATGAGAAAATATGTTTTCTACATATCAAATAACATATTCATAGTCATATTTA 3032

120294337 ACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATA 120294396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 ACTAAACAGGTATTCAACTGGAGAGACATAAAATTTTCAACATAAAACAGTTTGTGAATA 3092

120294397 TGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATG 120294456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 TGAGGAGTAATAGATACTTGTATCTTGCTGGCTAGCATGTTAATTGTTGCAATTTATATG 3152

120294457 GAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTC 120294510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 GAAAGTCATTCAGAAACATCAATCACAATTAATTATTTACAGAATCTTTGACTC 3206

Alignment time is 4.24229 s

