
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,  10957] =>     10957 nucs 'mol-32-1e66-017371_10957'

Score:       10496
Aligned:     10980        nucs
Identic:     10891 ( 99%) nucs =>      1515 ( 98%)      9376 ( 99%)
Gaps:           61 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5896900,5898447] EXCISED REGION [5898876,5908274]
 second seq =>  [      6,   1528] EXCISED REGION [   1529,  10957]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5896900 TCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGA 5896959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 TCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGA 65

  5896960 CAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGG 5897019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||.||||||||||||
       66 CAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGG 120

  5897020 AAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGC 5897079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGC 180

  5897080 ACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCC 5897139
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCC 240

  5897140 CCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCA 5897199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCA 300

  5897200 AGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGC 5897259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGC 360

  5897260 CGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTT 5897319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTT 420

  5897320 TCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTAT 5897379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTAT 480

  5897380 TGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAG 5897439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAG 540

  5897440 CCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGA 5897499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGA 600

  5897500 AGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCAC 5897559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCAC 660

  5897560 AGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGG 5897619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGG 720

  5897620 GCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACAC 5897679
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
      721 GCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACA--------CACACACACACACACACACACAC 772

  5897680 ACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCG 5897739
          ||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||
      773 ACACACACACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCG 820

  5897740 GGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTT 5897799
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTT 880

  5897800 TCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACA 5897859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 TCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACA 940

  5897860 GTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACC 5897919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      941 GTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACC 1000

  5897920 TCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCAT 5897979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 TCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCAT 1060

  5897980 ACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAG 5898039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 ACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAG 1120

  5898040 ATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAG 5898099
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 ATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAG 1180

  5898100 TTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAG 5898159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1181 TTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAG 1240

  5898160 AAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTC 5898219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 AAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTC 1300

  5898220 CAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGG 5898279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 CAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGG 1360

  5898280 TCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGAC 5898339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGAC 1420

  5898340 TGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTC 5898399
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1421 TGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTC 1480

  5898400 CATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 CATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 1528

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 1588

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1589 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 1648

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 1708

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 1768

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1769 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 1828

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 1888

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 1948

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 2008

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 2068

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 2128

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 2188

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 2248

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 2308

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 2368

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 2428

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2429 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 2488

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 2548

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 2608

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 2668

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 2728

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 2788

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 2848

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2849 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 2908

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 2968

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 3028

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 3088

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 3148

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 3208

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 3268

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 3328

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 3388

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     3389 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 3448

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 3508

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 3568

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 3628

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 3688

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 3748

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 3808

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 3868

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 3928

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 3988

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 4048

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 4108

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 4168

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 4228

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 4288

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 4348

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 4408

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 4468

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 4528

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 4588

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 4648

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 4708

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 4768

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 4828

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 4888

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 4948

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5008

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5068

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5128

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5188

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5248

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5308

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5309 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5368

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5369 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5428

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5429 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5488

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5489 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5548

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5608

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5609 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5668

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5669 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5728

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5788

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5848

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5908

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5968

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 6028

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6029 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 6088

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6089 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 6148

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6149 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 6208

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6209 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 6268

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6269 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 6328

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6329 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 6385

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 6445

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 6505

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 6565

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6566 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 6625

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6626 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 6685

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 6745

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 6805

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 6865

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 6925

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 6985

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 7045

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 7105

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 7165

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 7225

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 7285

  5904617 A--------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 5904662
          |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 7345

  5904663 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 5904722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 7405

  5904723 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 5904782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 7465

  5904783 TTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 5904842
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 TTTACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 7525

  5904843 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 5904902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 7585

  5904903 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 5904962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 7645

  5904963 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 5905022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 7705

  5905023 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 5905082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7706 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 7765

  5905083 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 5905142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7766 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 7825

  5905143 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 5905202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7826 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 7885

  5905203 TACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 5905262
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7886 TACTTCTTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 7945

  5905263 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 5905322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7946 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 8005

  5905323 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 5905382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8006 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 8065

  5905383 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 5905442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8066 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 8125

  5905443 AGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 5905502
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8126 AGGGCTTCATGTCCCAAGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 8185

  5905503 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 5905562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8186 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 8245

  5905563 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAA 5905622
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     8246 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTTTGTGTCATCGAGGGAA 8305

  5905623 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 5905682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8306 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 8365

  5905683 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 5905742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8366 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 8425

  5905743 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 5905802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8426 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 8485

  5905803 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 5905862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8486 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 8545

  5905863 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 5905922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8546 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 8605

  5905923 AATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTC 5905982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8606 AATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTC 8665

  5905983 CAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGC 5906042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8666 CAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGC 8725

  5906043 AGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCA 5906102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8726 AGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCA 8785

  5906103 GCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCA 5906162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8786 GCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCA 8845

  5906163 GTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACC 5906222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8846 GTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACC 8905

  5906223 GGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATA 5906282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8906 GGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATA 8965

  5906283 GAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTA 5906342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8966 GAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTA 9025

  5906343 TTCTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTG 5906402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9026 TTCTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTG 9085

  5906403 GACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGA 5906462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9086 GACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGA 9145

  5906463 CTTGTCTTCATGGATCTGAAAGGCATTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCT 5906522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9146 CTTGTCTTCATGGATCTGAAAGGCATTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCT 9205

  5906523 GGTCCTCGGCTTCCTAGTGGTGGGATCACTCGCTTCCCGATCTCTGCATCTCAGCTGTGG 5906582
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9206 GGTCCTTGGCTTCCTAGTGGTGGGATCACTCGCTTCCCGATCTCTGCATCTCAGCTGTGG 9265

  5906583 CTTCTTACTCTTGAGCTCAGCAGTTCCAAGGCCATCTCCTGGAGTCCTTCCTCCAGCCCT 5906642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9266 CTTCTTACTCTTGAGCTCAGCAGTTCCAAGGCCATCTCCTGGAGTCCTTCCTCCAGCCCT 9325

  5906643 TCCAATGCATTACATTTTCTTTCCTTAAAAATAGCTGAAGTGGTTTCCTATTCCTGGAAC 5906702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9326 TCCAATGCATTACATTTTCTTTCCTTAAAAATAGCTGAAGTGGTTTCCTATTCCTGGAAC 9385

  5906703 TGGACCATGGCTGATACAGGCGGGTATCAGCCTGCCAAGGAATAACAGCAAACATTACCA 5906762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9386 TGGACCATGGCTGATACAGGCGGGTATCAGCCTGCCAAGGAATAACAGCAAACATTACCA 9445

  5906763 TGCAATATGTAAGTATGTTACATTCATTCATCAGATTTTACAGATGTGGAAACTGAGATG 5906822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9446 TGCAATATGTAAGTATGTTACATTCATTCATCAGATTTTACAGATGTGGAAACTGAGATG 9505

  5906823 CTGGGAAATTAAGTGAACAGCCCAGGCTCACACAGGCAATGAAAACTACAGCTGGATTTC 5906882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9506 CTGGGAAATTAAGTGAACAGCCCAGGCTCACACAGGCAATGAAAACTACAGCTGGATTTC 9565

  5906883 AGAGCCCACACTCTTAATGCTGCCACATTGGGGCCACTCAGAAGGTTGCATCTTATGTGG 5906942
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9566 AGAGCCCACACTCTTAACGCTGCCACATTGGGGCCACTCAGAAGGTTGCATCTTATGTGG 9625

  5906943 CTTTCCCTTATAAGGGAAAAGGGCTAAAAGGACTTTGGTGTCCGTTCAAAAGGCTGATGA 5907002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9626 CTTTCCCTTATAAGGGAAAAGGGCTAAAAGGACTTTGGTGTCCGTTCAAAAGGCTGATGA 9685

  5907003 GATCTTGGGTTTCTTCATAAAATCATTTTTTATTTTTATGAGACATCTGGCAGGTAATAA 5907062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9686 GATCTTGGGTTTCTTCATAAAATCATTTTTTATTTTTATGAGACATCTGGCAGGTAATAA 9745

  5907063 TTTATTGTCAGGAATCTCAAACCCCAGGCAAAATACTGCACCAGGGTAACAGCCAAGGCC 5907122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9746 TTTATTGTCAGGAATCTCAAACCCCAGGCAAAATACTGCACCAGGGTAACAGCCAAGGCC 9805

  5907123 AGTAGGTGAAGGCCAGCAAGGCCAACCTCTCATTTCTCCTACTGACATCTGAGTAGGTGT 5907182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9806 AGTAGGTGAAGGCCAGCAAGGCCAACCTCTCATTTCTCCTACTGACATCTGAGTAGGTGT 9865

  5907183 CCCAACATCAGGGAACACATTTTAAATATTTTTTGAAAAATTTTACCCAAGACCCAATTT 5907242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9866 CCCAACATCAGGGAACACATTTTAAATATTTTTTGAAAAATTTTACCCAAGACCCAATTT 9925

  5907243 TGTTCAGACTTTACATTGACACAAATTACCCTTACTCTGCATTAAATATTACTATCATTT 5907302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9926 TGTTCAGACTTTACATTGACACAAATTACCCTTACTCTGCATTAAATATTACTATCATTT 9985

  5907303 CTATAGAGTCATAGCAATCAAGTTCCAGTGAAACCCACTTGCTACCATAAAGACACATGC 5907362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9986 CTATAGAGTCATAGCAATCAAGTTCCAGTGAAACCCACTTGCTACCATAAAGACACATGC 10045

  5907363 ATGCATGTGTTCATCACAGGACTGTCCACAGTAGCAGAGACAAGAAATCAACCTAGATGC 5907422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10046 ATGCATGTGTTCATCACAGGACTGTCCACAGTAGCAGAGACAAGAAATCAACCTAGATGC 10105

  5907423 CCATCAGCAGAGGACTAGATAAAGAAAATGCGGTACACTGGCACCATGGAATAGTATCCA 5907482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10106 CCATCAGCAGAGGACTAGATAAAGAAAATGCGGTACACTGGCACCATGGAATAGTATCCA 10165

  5907483 GCCACGAAAAAGCATGCAATCATATCCTTTGAAGCAAGATGGATGGAGCTGGAGGGCATG 5907542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10166 GCCACGAAAAAGCATGCAATCATATCCTTTGAAGCAAGATGGATGGAGCTGGAGGGCATG 10225

  5907543 ATTTTAAGGAAACTAATGCAGGGACAGAAAACCAAATACAACATGCTATCACTTACAAGT 5907602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10226 ATTTTAAGGAAACTAATGCAGGGACAGAAAACCAAATACAACATGCTATCACTTACAAGT 10285

  5907603 GGGAGCTAAACATTGAGAACGCATGGACATAAAGAAGGGAACAACAGACTCTGGAGCCTA 5907662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10286 GGGAGCTAAACATTGAGAACGCATGGACATAAAGAAGGGAACAACAGACTCTGGAGCCTA 10345

  5907663 CTTGAGGGTGAAGAGTGGGAGGAGAATGAGGATAGAAAAACTACCTATCCGGTATTCCTA 5907722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10346 CTTGAGGGTGAAGAGTGGGAGGAGAATGAGGATAGAAAAACTACCTATCCGGTATTCCTA 10405

  5907723 TTGGGTATTATGCTGATTACCTGGGAGACAAAACCCCTGCAACATGCAGTTTACCCATGT 5907782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
    10406 TTGGGTATTATGCTGATTACCTGGGAGACAAAACCCCTGCAATATGCAGTTTACCCATGT 10465

  5907783 AACAAACCTGCATGTGTATTCTTGAACCTAAAATAAAAGTTAGAAAGAAAAATATCCCAC 5907842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10466 AACAAACCTGCATGTGTATTCTTGAACCTAAAATAAAAGTTAGAAAGAAAAATATCCCAC 10525

  5907843 TTTCTTATGTATCTCCTATTATGGGAATCACAGGGCCTCTGGGTAATTCCTGAAATACAG 5907902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10526 TTTCTTATGTATCTCCTATTATGGGAATCACAGGGCCTCTGGGTAATTCCTGAAATACAG 10585

  5907903 GGCTTTACGTACGAATTTACACTCAACAAGTTTTTCTTGAGCATATACTATGCTCTGCAC 5907962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10586 GGCTTTACGTACGAATTTACACTCAACAAGTTTTTCTTGAGCATATACTATGCTCTGCAC 10645

  5907963 ACTCAGCATAACAACCAGGGGTAAGGAAAGTCTCTGACACAACCCAAAGCAGGCCATAGG 5908022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10646 ACTCAGCATAACAACCAGGGGTAAGGAAAGTCTCTGACACAACCCAAAGCAGGCCATAGG 10705

  5908023 CTTTAAGTGCAGTGGCATTAGGACTTGGAGGTATGGGCAGATTGACCACTCGAAGAGCTC 5908082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10706 CTTTAAGTGCAGTGGCATTAGGACTTGGAGGTATGGGCAGATTGACCACTCGAAGAGCTC 10765

  5908083 AGCTGTCACATCAAGGCTGAGGGCTGAAGGTCACTTCTCATGAATGGAATACTGGATGTA 5908142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10766 AGCTGTCACATCAAGGCTGAGGGCTGAAGGTCACTTCTCATGAATGGAATACTGGATGTA 10825

  5908143 TCATAGGGGAGAACACTGGATGCATTCCAGGAAACATTAATAGAAAAAAGAAGTCCTAAC 5908202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10826 TCATAGGGGAGAACACTGGATGCATTCCAGGAAACATTAATAGAAAAAAGAAGTCCTAAC 10885

  5908203 AGTGGCTTTTTTGTATAAGCAAAATCGAGTAGGTAATTAAGGCAGAAAAGAACTTGAAGA 5908262
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10886 AGTGGCTTTTTTATATAAGCAAAATCGAGTAGGTAATTAAGGCAGAAAAGAACTTGAAGA 10945

  5908263 TGATAACTATGA 5908274
          ||||||||||||
    10946 TGATAACTATGA 10957

Alignment time is 7.99033 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   6770] =>      6770 nucs 'mol-32-1f00-067533_6770'

Score:        6727
Aligned:      6773        nucs
Identic:      6768 (100%) nucs =>       819 (100%)      5949 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5894645,5895463] EXCISED REGION [5895500,5901453]
 second seq =>  [      1,    819] EXCISED REGION [    820,   6770]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        36 nucs [5895464,5895499]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        55 nucs [5895464,5895518] to [5895500,5895554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5895464,5895464] to [5895499,5895499]
 second seq =>         0 nucs

  5894645 CTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGG 5894704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGG 60

  5894705 TAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGC 5894764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGC 120

  5894765 TGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGG 5894824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGG 180

  5894825 GTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCA 5894884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCA 240

  5894885 AATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCAC 5894944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCAC 300

  5894945 AGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGC 5895004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGC 360

  5895005 TTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTA 5895064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTA 420

  5895065 AAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCT 5895124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCT 480

  5895125 TTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTG 5895184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTG 540

  5895185 GGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGA 5895244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGA 600

  5895245 TTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACT 5895304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACT 660

  5895305 GGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTG 5895364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTG 720

  5895365 CAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAA 5895424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAA 780

  5895425 GCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 5895463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 819

EXCISED REGION

  5895500 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 5895559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 879

  5895560 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 5895619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 939

  5895620 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 5895679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 999

  5895680 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 5895739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 1059

  5895740 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 5895799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 1119

  5895800 AGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 5895859
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 AGATGTCGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 1179

  5895860 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 5895919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 1239

  5895920 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 5895979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 1299

  5895980 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 5896039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 1359

  5896040 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 5896099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 1419

  5896100 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 5896159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 1479

  5896160 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 5896219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 1539

  5896220 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 5896279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 1599

  5896280 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 5896339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 1659

  5896340 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 5896399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 1719

  5896400 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 5896459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 1779

  5896460 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 5896519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 1839

  5896520 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 5896579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 1899

  5896580 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 5896639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 1959

  5896640 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 5896699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 2019

  5896700 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 5896759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 2079

  5896760 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 5896819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 2139

  5896820 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 5896879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 2199

  5896880 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 5896939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 2259

  5896940 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT 5896999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2260 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA-TTTTTTTTTTTTTTTTT 2318

  5897000 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 5897059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 2378

  5897060 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 5897119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 2438

  5897120 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 5897179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 2498

  5897180 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 5897239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 2558

  5897240 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 5897299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 2618

  5897300 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 5897359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 2678

  5897360 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5897419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 2738

  5897420 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5897479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 2798

  5897480 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5897539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 2858

  5897540 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5897599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 2918

  5897600 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5897659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
     2919 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACAT--ACACACAC 2976

  5897660 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5897719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 3036

  5897720 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5897779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 3096

  5897780 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5897839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 3156

  5897840 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5897899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 3216

  5897900 CTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5897959
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 3276

  5897960 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5898019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 3336

  5898020 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5898079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 3396

  5898080 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5898139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 3456

  5898140 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5898199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 3516

  5898200 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5898259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 3576

  5898260 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 5898319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 3636

  5898320 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 5898379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 3696

  5898380 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 5898439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 3756

  5898440 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 5898499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 3816

  5898500 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 5898559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 3876

  5898560 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 5898619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 3936

  5898620 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 5898679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 3996

  5898680 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 5898739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 4056

  5898740 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 5898799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 4116

  5898800 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 5898859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 4176

  5898860 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 5898919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 4236

  5898920 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 5898979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 4296

  5898980 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 5899039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 4356

  5899040 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 5899099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 4416

  5899100 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 5899159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 4476

  5899160 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 5899219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 4536

  5899220 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 5899279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 4596

  5899280 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 5899339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 4656

  5899340 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 5899399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 4716

  5899400 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 5899459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 4776

  5899460 CCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACC 5899519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 CCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACC 4836

  5899520 ACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAG 5899579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 ACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAG 4896

  5899580 CATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGG 5899639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 CATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGG 4956

  5899640 GCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACC 5899699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 GCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACC 5016

  5899700 GTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCA 5899759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 GTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCA 5076

  5899760 AGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTC 5899819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 AGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTC 5136

  5899820 CCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCT 5899879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 CCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCT 5196

  5899880 GAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCC 5899939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 GAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCC 5256

  5899940 CACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACT 5899999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 CACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACT 5316

  5900000 ATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTC 5900059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 ATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTC 5376

  5900060 AGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCAT 5900119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 AGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCAT 5436

  5900120 ATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAAT 5900179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 ATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAAT 5496

  5900180 CCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCT 5900239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 CCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCT 5556

  5900240 CTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCA 5900299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 CTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCA 5616

  5900300 GCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACAT 5900359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 GCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACAT 5676

  5900360 GGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAG 5900419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 GGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAG 5736

  5900420 TGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAG 5900479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 TGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAG 5796

  5900480 AAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTC 5900539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 AAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTC 5856

  5900540 TAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATT 5900599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 TAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATT 5916

  5900600 GGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGC 5900659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5917 GGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGC 5976

  5900660 TTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATA 5900719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5977 TTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATA 6036

  5900720 GTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCC 5900779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6037 GTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCC 6096

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6097 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 6156

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6157 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 6216

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6217 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 6276

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6277 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 6336

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6337 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 6396

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6397 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 6456

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6457 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 6516

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6517 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 6576

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6577 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 6636

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6637 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 6696

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6697 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 6756

  5901440 ACACACAAACACAC 5901453
          ||||||||||||||
     6757 ACACACAAACACAC 6770

Alignment time is 5.11144 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3655] =>      3655 nucs 'mol-32-1f21-167922_3655'

Score:        3422
Aligned:      3672        nucs
Identic:      3637 ( 99%) nucs =>      2951 ( 99%)       686 ( 99%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5895467,5898447] EXCISED REGION [5898876,5899566]
 second seq =>  [      1,   2964] EXCISED REGION [   2965,   3655]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5895467 TTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCA 5895526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCA 60

  5895527 TTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCA 5895586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCA 120

  5895587 ATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGG 5895646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGG 180

  5895647 TGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGA 5895706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGA 240

  5895707 TAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAAC 5895766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAAC 300

  5895767 ACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAG 5895826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAG 360

  5895827 ACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTC 5895886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTC 420

  5895887 AGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATG 5895946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATG 480

  5895947 GGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAG 5896006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAG 540

  5896007 TTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACA 5896066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACA 600

  5896067 GCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGT 5896126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGT 660

  5896127 ACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTC 5896186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTC 720

  5896187 GATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGC 5896246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGC 780

  5896247 TAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGAT 5896306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGAT 840

  5896307 TAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTT 5896366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTT 900

  5896367 TGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGC 5896426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGC 960

  5896427 GAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTA 5896486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      961 GAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTA 1020

  5896487 TCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATT 5896546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATT 1080

  5896547 TACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATA 5896606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACTACGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATA 1140

  5896607 GTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAG 5896666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAG 1200

  5896667 AGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTG 5896726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTG 1260

  5896727 CTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAA 5896786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAA 1320

  5896787 TCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCA 5896846
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCA 1380

  5896847 CTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTT 5896906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1381 CTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTT 1440

  5896907 ATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACA 5896966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACA 1500

  5896967 ATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGC 5897026
          |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||.|||||||||||||||||||
     1501 ATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGC 1555

  5897027 TGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACA 5897086
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1556 TGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACA 1615

  5897087 CGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATT 5897146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 CGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATT 1675

  5897147 TGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGG 5897206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGG 1735

  5897207 TTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGA 5897266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGA 1795

  5897267 AGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTT 5897326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 AGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTT 1855

  5897327 CCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCA 5897386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 CCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCA 1915

  5897387 TTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCT 5897446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCT 1975

  5897447 GGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGG 5897506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGG 2035

  5897507 CAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCC 5897566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCC 2095

  5897567 CACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCT 5897626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCT 2155

  5897627 TGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 5897686
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TGCAGGGAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 2215

  5897687 CACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCC 5897746
          |||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||
     2216 CACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCC 2263

  5897747 GGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGT 5897806
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 GGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGT 2323

  5897807 TTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAG 5897866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 TTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAG 2383

  5897867 GAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGC 5897926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2384 GAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGC 2443

  5897927 CCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAA 5897986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 CCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAA 2503

  5897987 TGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTA 5898046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 TGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTA 2563

  5898047 AGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGA 5898106
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 AATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGA 2623

  5898107 TGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTG 5898166
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2624 TGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTG 2683

  5898167 CCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGG 5898226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 CCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGG 2743

  5898227 CTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGG 5898286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 CTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGG 2803

  5898287 CACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGG 5898346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 CACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGG 2863

  5898347 AGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTAT 5898406
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 AGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTAT 2923

  5898407 TACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 TACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 2964

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 3024

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3025 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 3084

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 3144

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 3204

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3205 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 3264

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3265 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCCC 3324

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 3384

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 3444

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 3504

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 3564

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 3624

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCC 5899566
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCC 3655

Alignment time is 2.7543 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   5033] =>      5033 nucs 'mol-32-1f58-215102_5033'

Score:        4838
Aligned:      5033        nucs
Identic:      5003 ( 99%) nucs =>       549 ( 99%)      4454 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897894,5898447] EXCISED REGION [5898876,5903338]
 second seq =>  [      1,    554] EXCISED REGION [    555,   5033]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5897894 ATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTA 5897953
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTA 60

  5897954 AGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACA 5898013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACA 120

  5898014 GTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTG 5898073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTG 180

  5898074 GGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAA 5898133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAA 240

  5898134 AATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGC 5898193
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGC 300

  5898194 AGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCC 5898253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCC 360

  5898254 CACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGT 5898313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGT 420

  5898314 ATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCAC 5898373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      421 ATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCAC 480

  5898374 TATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCT 5898433
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCT 540

  5898434 AGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||
      541 AGGGTAGAGGGCAG 554

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 614

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      615 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 674

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 734

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 794

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      795 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 854

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 914

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 974

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 1034

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 1094

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 1154

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 1214

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 1274

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 1334

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 1394

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 1454

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1455 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 1514

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1574

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1634

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1694

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1754

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1814

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 1874

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1875 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 1934

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 1994

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 2054

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 2114

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 2174

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 2234

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 2294

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 2354

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 2414

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     2415 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 2474

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 2534

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 2594

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 2654

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 2714

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 2774

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 2834

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 2894

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 2954

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 3014

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 3074

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 3134

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 3194

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 3254

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 3314

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 3374

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 3434

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 3494

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 3554

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 3614

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 3674

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 3734

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 3794

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 3854

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 3914

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 3974

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 4034

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 4094

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 4154

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 4214

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 4274

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 4334

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 4394

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 4454

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 4514

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 4574

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 4634

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 4694

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 4754

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 4814

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 4874

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 4934

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 4994

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTAT 5903338
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTAT 5033

Alignment time is 3.6031 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   2486] =>      2486 nucs 'mol-32-2105-135422_2486'

Score:        2486
Aligned:      2486        nucs
Identic:      2486 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5898216,5900701]
 second seq =>  [      1,   2486]

  5898216 CTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTG 5898275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTG 60

  5898276 TGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAA 5898335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAA 120

  5898336 TGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAG 5898395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAG 180

  5898396 ACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTT 5898455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTT 240

  5898456 TGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTAC 5898515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTAC 300

  5898516 TTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAA 5898575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAA 360

  5898576 TCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCC 5898635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCC 420

  5898636 CTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGT 5898695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGT 480

  5898696 GGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATT 5898755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATT 540

  5898756 TCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAG 5898815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAG 600

  5898816 GGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGC 5898875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGC 660

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 720

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 780

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 840

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 900

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 960

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 1020

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 1080

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 1140

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 1200

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 1260

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 1320

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 1380

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 1440

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 1500

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 1560

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 1620

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1680

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1740

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1800

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1860

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1920

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 1980

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 2040

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 2100

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 2160

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 2220

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 2280

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 2340

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 2400

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 2460

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTT 5900701
          ||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTT 2486

Alignment time is 1.56221 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   2139] =>      2139 nucs 'mol-32-21f7-042025_2139'

Score:        2126
Aligned:      2137        nucs
Identic:      2136 (100%) nucs =>       371 (100%)      1765 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897279,5897649] EXCISED REGION [5897650,5899415]
 second seq =>  [      1,    371] EXCISED REGION [    374,   2139]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [372,373]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        47 nucs [372,418] to [374,420]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5897279 CCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTC 5897338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTC 60

  5897339 TTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTG 5897398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTG 120

  5897399 ATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGC 5897458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGC 180

  5897459 AGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCC 5897518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCC 240

  5897519 TCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGT 5897578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGT 300

  5897579 TCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACA 5897638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACA 360

  5897639 CACACACACAT 5897649
          |||||||||||
      361 CACACACACAT 371

EXCISED REGION

  5897650 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAG 5897709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      374 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAG 433

  5897710 AGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTT 5897769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      434 AGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTT 493

  5897770 GATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACC 5897829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      494 GATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACC 553

  5897830 TCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAA 5897889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      554 TCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAA 613

  5897890 TTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTC 5897949
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      614 TTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTC 673

  5897950 TCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTG 5898009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      674 TCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTG 733

  5898010 CACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCT 5898069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      734 CACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCT 793

  5898070 TTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGC 5898129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 TTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGC 853

  5898130 CTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGC 5898189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 CTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGC 913

  5898190 TGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTT 5898249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 TGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTT 973

  5898250 ACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCC 5898309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 ACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCC 1033

  5898310 AAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGAT 5898369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 AAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGAT 1093

  5898370 CCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGA 5898429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 CCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGA 1153

  5898430 ATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTC 5898489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 ATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTC 1213

  5898490 CAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAA 5898549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 CAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAA 1273

  5898550 TGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGG 5898609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 TGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGG 1333

  5898610 CACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCA 5898669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 CACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCA 1393

  5898670 GTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCT 5898729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 GTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCT 1453

  5898730 TGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACT 5898789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 TGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACT 1513

  5898790 GGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCC 5898849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 GGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCC 1573

  5898850 CTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGG 5898909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 CTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGG 1633

  5898910 TCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGT 5898969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 TCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGT 1693

  5898970 GCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCAC 5899029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 GCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCAC 1753

  5899030 CGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACA 5899089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 CGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACA 1813

  5899090 CTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGG 5899149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 CTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGG 1873

  5899150 AGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGC 5899209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 AGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGC 1933

  5899210 TGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTG 5899269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 TGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTG 1993

  5899270 GGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATC 5899329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 GGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATC 2053

  5899330 CAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTC 5899389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 CAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTC 2113

  5899390 CAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||
     2114 CAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 2139

Alignment time is 1.5335 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   6051] =>      6051 nucs 'mol-32-22e9-040793_6051'

Score:        6005
Aligned:      6049        nucs
Identic:      6045 (100%) nucs =>      1284 (100%)      4761 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5896366,5897649] EXCISED REGION [5897650,5902413]
 second seq =>  [      1,   1285] EXCISED REGION [   1288,   6051]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1286,1287]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        47 nucs [1286,1332] to [1288,1334]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5896366 TTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTG 5896425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTG 60

  5896426 CGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTT 5896485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTT 120

  5896486 ATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCAT 5896545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCAT 180

  5896546 TTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATAT 5896605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATAT 240

  5896606 AGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATA 5896665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATA 300

  5896666 GAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATT 5896725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATT 360

  5896726 GCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACA 5896785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACA 420

  5896786 ATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCC 5896845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCC 480

  5896846 ACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTT 5896905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTT 540

  5896906 TATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCAC 5896965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCAC 600

  5896966 AATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-ACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAG 5897024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
      601 AATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAG 660

  5897025 GCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGA 5897084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGA 720

  5897085 CACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACA 5897144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACA 780

  5897145 TTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTT 5897204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTT 840

  5897205 GGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACC 5897264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACC 900

  5897265 GAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAAC 5897324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAAC 960

  5897325 TTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAAC 5897384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAAC 1020

  5897385 CATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCT 5897444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCT 1080

  5897445 CTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCA 5897504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCA 1140

  5897505 GGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCAC 5897564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCAC 1200

  5897565 CCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCT 5897624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCT 1260

  5897625 CTTGCAGGGAAACACACACACACAT 5897649
          |||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGCAGGGAAACACACACACACAT 1285

EXCISED REGION

  5897650 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAG 5897709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAG 1347

  5897710 AGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTT 5897769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 AGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTT 1407

  5897770 GATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACC 5897829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 GATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACC 1467

  5897830 TCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAA 5897889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAA 1527

  5897890 TTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTC 5897949
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 TTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTC 1587

  5897950 TCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTG 5898009
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1588 TCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGTATATTG 1647

  5898010 CACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCT 5898069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 CACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCT 1707

  5898070 TTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGC 5898129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 TTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGC 1767

  5898130 CTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGC 5898189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 CTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGC 1827

  5898190 TGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTT 5898249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 TGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTT 1887

  5898250 ACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCC 5898309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 ACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCC 1947

  5898310 AAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGAT 5898369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 AAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGAT 2007

  5898370 CCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGA 5898429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 CCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGA 2067

  5898430 ATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTC 5898489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 ATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTC 2127

  5898490 CAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAA 5898549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 CAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAA 2187

  5898550 TGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGG 5898609
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2188 TGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACAATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGG 2247

  5898610 CACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCA 5898669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 CACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCA 2307

  5898670 GTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCT 5898729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 GTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCT 2367

  5898730 TGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACT 5898789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 TGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACT 2427

  5898790 GGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCC 5898849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 GGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCC 2487

  5898850 CTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGG 5898909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 CTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGG 2547

  5898910 TCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGT 5898969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 TCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGT 2607

  5898970 GCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCAC 5899029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 GCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCAC 2667

  5899030 CGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACA 5899089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 CGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACA 2727

  5899090 CTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGG 5899149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 CTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGG 2787

  5899150 AGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGC 5899209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 AGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGC 2847

  5899210 TGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTG 5899269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTG 2907

  5899270 GGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATC 5899329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 GGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATC 2967

  5899330 CAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTC 5899389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 CAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTC 3027

  5899390 CAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACC 5899449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 CAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACC 3087

  5899450 TCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTC 5899509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTC 3147

  5899510 TTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTT 5899569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 TTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTT 3207

  5899570 TCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTG 5899629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 TCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTG 3267

  5899630 TGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACA 5899689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 TGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACA 3327

  5899690 CCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATC 5899749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 CCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATC 3387

  5899750 TGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTT 5899809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 TGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTT 3447

  5899810 CCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGT 5899869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 CCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGT 3507

  5899870 GACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTC 5899929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 GACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTC 3567

  5899930 TCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGC 5899989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGC 3627

  5899990 TTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCA 5900049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCA 3687

  5900050 GAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAA 5900109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 GAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAA 3747

  5900110 TTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACT 5900169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 TTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACT 3807

  5900170 GATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGC 5900229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 GATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGC 3867

  5900230 CAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGG 5900289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 CAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGG 3927

  5900290 TAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCA 5900349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 TAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCA 3987

  5900350 ACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTT 5900409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 ACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTT 4047

  5900410 TATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGG 5900469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGG 4107

  5900470 GCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCA 5900529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 GCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCA 4167

  5900530 CTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACC 5900589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 CTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACC 4227

  5900590 CTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGC 5900649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 CTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGC 4287

  5900650 TCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGC 5900709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 TCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGC 4347

  5900710 TGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 5900769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 TGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 4407

  5900770 CTGCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTC 5900829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 CTGCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTC 4467

  5900830 TGATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAA 5900889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 TGATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAA 4527

  5900890 AATTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGA 5900949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 AATTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGA 4587

  5900950 GATAGATGTCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGT 5901009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 GATAGATGTCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGT 4647

  5901010 AACCAAGTGCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCAT 5901069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 AACCAAGTGCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCAT 4707

  5901070 TATCAGAAACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATA 5901129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 TATCAGAAACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATA 4767

  5901130 ATGGCTAGTCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAAC 5901189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 ATGGCTAGTCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAAC 4827

  5901190 CATGACTAAAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAAT 5901249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 CATGACTAAAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAAT 4887

  5901250 TAGGGAATGTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGC 5901309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 TAGGGAATGTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGC 4947

  5901310 TTGAACATCCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAAC 5901369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 TTGAACATCCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAAC 5007

  5901370 TGTATAATATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCA 5901429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 TGTATAATATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCA 5067

  5901430 CTTATTGCACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATAT 5901489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 CTTATTGCACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATAT 5127

  5901490 ATTTATATATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAA 5901549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 ATTTATATATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAA 5187

  5901550 AACTGAAATTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAA 5901609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 AACTGAAATTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAA 5247

  5901610 AATTCAGAAACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAG 5901669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 AATTCAGAAACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAG 5307

  5901670 GACATATAGATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGT 5901729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 GACATATAGATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGT 5367

  5901730 GAGGGATGAGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAA 5901789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 GAGGGATGAGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAA 5427

  5901790 AAGCACTGACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACC 5901849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 AAGCACTGACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACC 5487

  5901850 CCCAAATCTATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATAT 5901909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 CCCAAATCTATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATAT 5547

  5901910 ATATATCTATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTA 5901969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 ATATATCTATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTA 5607

  5901970 ATATAAATAATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTC 5902029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 ATATAAATAATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTC 5667

  5902030 CTTCCTTGGGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGT 5902089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 CTTCCTTGGGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGT 5727

  5902090 CATTTGATATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTA 5902149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 CATTTGATATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTA 5787

  5902150 GAAGTACATGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGA 5902209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 GAAGTACATGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGA 5847

  5902210 TGCTAATTATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACA 5902269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 TGCTAATTATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACA 5907

  5902270 GTTCATATTGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTA 5902329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 GTTCATATTGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTA 5967

  5902330 GGGATGGCTCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACT 5902389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 GGGATGGCTCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACT 6027

  5902390 GGCACCTAGAGGCTCAGCCCTAAC 5902413
          ||||||||||||||||||||||||
     6028 GGCACCTAGAGGCTCAGCCCTAAC 6051

Alignment time is 4.48152 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   4777] =>      4777 nucs 'mol-32-23af-028598_4777'

Score:        4704
Aligned:      4782        nucs
Identic:      4770 (100%) nucs =>      1641 (100%)      3129 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5893818,5895463] EXCISED REGION [5895500,5898632]
 second seq =>  [      1,   1645] EXCISED REGION [   1646,   4777]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        36 nucs [5895464,5895499]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        55 nucs [5895464,5895518] to [5895500,5895554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5895464,5895464] to [5895499,5895499]
 second seq =>         0 nucs

  5893818 GTGGCCTCAGAGCAGTCAGACTTCATACACTATGGCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCC 5893877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGCCTCAGAGCAGTCAGACTTCATACACTATGGCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCC 60

  5893878 CAGCAAACAAAGAGGAAGCAGCATTGCCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTC 5893937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCAAACAAAGAGGAAGCAGCATTGCCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTC 120

  5893938 TCAAGCCCACTCAGATTTAACAGGAGGGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCG 5893997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAAGCCCACTCAGATTTAACAGGAGGGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCG 180

  5893998 ATGGGAGGAATGTCAAAGAATTTGCAGCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGA 5894057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGGAGGAATGTCAAAGAATTTGCAGCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGA 240

  5894058 GCAGTTTTAGGTTTACAGCAAAATTGGTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATAT 5894117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAGTTTTAGGTTTACAGCAAAATTGGTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATAT 300

  5894118 TGCCTGCCTTCCACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTC 5894177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
      301 TGCCTGCCTTCCACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG---- 356

  5894178 ---TCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCG 5894234
             |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 GTTTCGCTCTTTTGCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCG 416

  5894235 CCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCAC 5894294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 CCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCAC 476

  5894295 ACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTT 5894354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 ACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTT 536

  5894355 TGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGC 5894414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 TGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGC 596

  5894415 TGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCT 5894474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 TGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCT 656

  5894475 CTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAA 5894534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 CTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAA 716

  5894535 ATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAA 5894594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 ATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAA 776

  5894595 TATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAG 5894654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAG 836

  5894655 AAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTC 5894714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 AAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTC 896

  5894715 CTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGG 5894774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 CTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGG 956

  5894775 CCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCG 5894834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCG 1016

  5894835 TGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGC 5894894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGC 1076

  5894895 TTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGT 5894954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGT 1136

  5894955 TCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAA 5895014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAA 1196

  5895015 GGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACA 5895074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACA 1256

  5895075 TCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCC 5895134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCC 1316

  5895135 ATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAAT 5895194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 ATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAAT 1376

  5895195 CACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTG 5895254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTG 1436

  5895255 ATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAG 5895314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAG 1496

  5895315 TTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTT 5895374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTT 1556

  5895375 TTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCT 5895434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCT 1616

  5895435 CCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 5895463
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 1645

EXCISED REGION

  5895500 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 5895559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 1705

  5895560 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 5895619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 1765

  5895620 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 5895679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1766 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGCGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 1825

  5895680 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 5895739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 1885

  5895740 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 5895799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 1945

  5895800 AGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 5895859
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 AGATGTCGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 2005

  5895860 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 5895919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 2065

  5895920 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 5895979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 2125

  5895980 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 5896039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 2185

  5896040 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 5896099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 2245

  5896100 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 5896159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 2305

  5896160 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 5896219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 2365

  5896220 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 5896279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 2425

  5896280 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 5896339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 2485

  5896340 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 5896399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 2545

  5896400 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 5896459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 2605

  5896460 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 5896519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 2665

  5896520 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 5896579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 2725

  5896580 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 5896639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 2785

  5896640 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 5896699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 2845

  5896700 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 5896759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 2905

  5896760 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 5896819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 2965

  5896820 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 5896879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 3025

  5896880 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 5896939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 3085

  5896940 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT 5896999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     3086 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA-TTTTTTTTTTTTTTTTT 3144

  5897000 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 5897059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 3204

  5897060 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 5897119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 3264

  5897120 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 5897179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 3324

  5897180 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 5897239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 3384

  5897240 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 5897299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 3444

  5897300 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 5897359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 3504

  5897360 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5897419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 3564

  5897420 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5897479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 3624

  5897480 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5897539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 3684

  5897540 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5897599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 3744

  5897600 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5897659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 3804

  5897660 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5897719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 3864

  5897720 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5897779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 3924

  5897780 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5897839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 3984

  5897840 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5897899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 4044

  5897900 CTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5897959
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 CTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 4104

  5897960 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5898019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 4164

  5898020 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5898079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 4224

  5898080 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5898139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 4284

  5898140 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5898199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 4344

  5898200 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5898259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 4404

  5898260 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 5898319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 4464

  5898320 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 5898379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 4524

  5898380 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 5898439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 4584

  5898440 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 5898499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 4644

  5898500 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 5898559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 4704

  5898560 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 5898619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 4764

  5898620 CCTCCTCCTGCCC 5898632
          |||||||||||||
     4765 CCTCCTCCTGCCC 4777

Alignment time is 3.81288 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   6128] =>      6128 nucs 'mol-32-23ba-029175_6128'

Score:        5841
Aligned:      6126        nucs
Identic:      6087 ( 99%) nucs =>      4200 ( 99%)      1887 (100%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5894216,5898447] EXCISED REGION [5898876,5900769]
 second seq =>  [      1,   4213] EXCISED REGION [   4214,   6107]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5894216 TGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGG 5894275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGG 60

  5894276 TAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAA 5894335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAA 120

  5894336 GATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTG 5894395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTG 180

  5894396 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACT 5894455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACT 240

  5894456 TTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCG 5894515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCG 300

  5894516 TCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTC 5894575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTC 360

  5894576 AGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATT 5894635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATT 420

  5894636 CTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCA 5894695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCA 480

  5894696 TTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTT 5894755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTT 540

  5894756 GTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGG 5894815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGG 600

  5894816 GCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCA 5894875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCA 660

  5894876 GGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCC 5894935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCC 720

  5894936 CAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCAT 5894995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCAT 780

  5894996 AAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAA 5895055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAA 840

  5895056 CTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCT 5895115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCT 900

  5895116 CTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCT 5895175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCT 960

  5895176 GGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAA 5895235
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGGTGTGGGTACCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAA 1020

  5895236 GAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATT 5895295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATT 1080

  5895296 CTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCC 5895355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCC 1140

  5895356 ACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCT 5895415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCT 1200

  5895416 GCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCAT 5895475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCAT 1260

  5895476 GACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAG 5895535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAG 1320

  5895536 GGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGT 5895595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGT 1380

  5895596 TCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGAT 5895655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGAT 1440

  5895656 GGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTT 5895715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTT 1500

  5895716 TATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCC 5895775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCC 1560

  5895776 TCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTC 5895835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTC 1620

  5895836 CCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTC 5895895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTC 1680

  5895896 AGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAA 5895955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAA 1740

  5895956 ACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGG 5896015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGG 1800

  5896016 GACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACA 5896075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACA 1860

  5896076 GCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGG 5896135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGG 1920

  5896136 CCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGT 5896195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGT 1980

  5896196 CTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAAT 5896255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAAT 2040

  5896256 GTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCA 5896315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCA 2100

  5896316 GTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGG 5896375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGG 2160

  5896376 CAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGA 5896435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGA 2220

  5896436 TGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTG 5896495
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTG 2280

  5896496 TCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTA 5896555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2281 TCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTA 2340

  5896556 TGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGG 5896615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGG 2400

  5896616 GTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAAT 5896675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAAT 2460

  5896676 GGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGC 5896735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGC 2520

  5896736 CAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTAC 5896795
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2521 CAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCAC 2580

  5896796 ACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGT 5896855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGT 2640

  5896856 CTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCC 5896915
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2641 CTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCC 2700

  5896916 TCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACT 5896975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACT 2760

  5896976 TGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGT 5897035
          ||||||||||||||||||||||     ||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTGGATTTTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGT 2815

  5897036 CCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCA 5897095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2816 CCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCA 2875

  5897096 GCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCC 5897155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCC 2935

  5897156 AACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGG 5897215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGG 2995

  5897216 AAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAA 5897275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAA 3055

  5897276 AGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGG 5897335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGG 3115

  5897336 TTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTA 5897395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 TTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTA 3175

  5897396 TTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGT 5897455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGT 3235

  5897456 GGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAA 5897515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAA 3295

  5897516 TCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGT 5897575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGT 3355

  5897576 GGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAA 5897635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 GGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAA 3415

  5897636 ACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 5897695
          |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 ACACACACACACA--CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 3473

  5897696 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCA 5897755
          ||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 AGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCA 3521

  5897756 GGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAA 5897815
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 GGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAA 3581

  5897816 AAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCT 5897875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 AAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCT 3641

  5897876 GACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGA 5897935
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 GACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGA 3701

  5897936 CATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAG 5897995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 CATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAG 3761

  5897996 CCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAA 5898055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3762 CCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAA 3821

  5898056 AAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTC 5898115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 AAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTC 3881

  5898116 TTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCT 5898175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3882 TTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCT 3941

  5898176 AGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCA 5898235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 AGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCA 4001

  5898236 CTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCA 5898295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 CTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCA 4061

  5898296 AGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTA 5898355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 AGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTA 4121

  5898356 TGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTC 5898415
          ||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 TGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTC 4181

  5898416 CCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 CCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 4213

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 4273

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4274 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 4333

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 4393

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 4453

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4454 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 4513

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 4573

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 4633

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 4693

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 4753

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 4813

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 4873

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 4933

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 4993

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5053

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5113

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5114 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5173

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5233

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5293

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5353

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5413

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5473

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5533

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5534 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 5593

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5653

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5713

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5773

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5833

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5893

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5953

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 6013

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 6073

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 5900769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 6107

Alignment time is 4.4403 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3205] =>      3205 nucs 'mol-32-29b3-072013_3205'

Score:        3185
Aligned:      3185        nucs
Identic:      3185 (100%) nucs =>       196 (100%)      2989 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897709,5897904] EXCISED REGION [5897906,5900894]
 second seq =>  [      1,    196] EXCISED REGION [    198,   3186]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5897905,5897905]
 second seq =>         1 nucs [197,197]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      5712 nucs [5900895,5906606]
 second seq =>         9 nucs [3187,3195]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5897904,5897904] to [5897905,5897905]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5897903,5897904] to [5897906,5897907]
 second seq =>         2 nucs [195,196] to [198,199]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5897709 GAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATT 5897768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATT 60

  5897769 TGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAAC 5897828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAAC 120

  5897829 CTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAA 5897888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAA 180

  5897889 ATTACATTTCACTTCT 5897904
          ||||||||||||||||
      181 ATTACATTTCACTTCT 196

EXCISED REGION

  5897906 CTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAAC 5897965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      198 CTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAAC 257

  5897966 TCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTA 5898025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      258 TCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTA 317

  5898026 AGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGC 5898085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      318 AGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGC 377

  5898086 GGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGT 5898145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 GGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGT 437

  5898146 CTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTA 5898205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 CTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTA 497

  5898206 TGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGG 5898265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 TGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGG 557

  5898266 ACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAG 5898325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 ACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAG 617

  5898326 ACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGAC 5898385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 ACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGAC 677

  5898386 CTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGC 5898445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 CTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGC 737

  5898446 AGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAAT 5898505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 AGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAAT 797

  5898506 GTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAG 5898565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 GTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAG 857

  5898566 ACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCT 5898625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 ACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCT 917

  5898626 CCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGA 5898685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 CCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGA 977

  5898686 TCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACC 5898745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 TCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACC 1037

  5898746 CACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTT 5898805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 CACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTT 1097

  5898806 TGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCC 5898865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 TGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCC 1157

  5898866 AGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGT 5898925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 AGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGT 1217

  5898926 CCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTT 5898985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 CCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTT 1277

  5898986 CATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAA 5899045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 CATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAA 1337

  5899046 GCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCT 5899105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 GCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCT 1397

  5899106 TTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGC 5899165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGC 1457

  5899166 ATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCA 5899225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 ATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCA 1517

  5899226 TATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGT 5899285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 TATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGT 1577

  5899286 ATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCC 5899345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 ATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCC 1637

  5899346 AAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTT 5899405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 AAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTT 1697

  5899406 CCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCC 5899465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 CCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCC 1757

  5899466 ATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGG 5899525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 ATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGG 1817

  5899526 CTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGC 5899585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 CTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGC 1877

  5899586 CCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACA 5899645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 CCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACA 1937

  5899646 GGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTC 5899705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 GGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTC 1997

  5899706 AAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCT 5899765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 AAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCT 2057

  5899766 TCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGC 5899825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 TCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGC 2117

  5899826 ACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACT 5899885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 ACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACT 2177

  5899886 CAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTC 5899945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 CAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTC 2237

  5899946 AGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCT 5900005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 AGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCT 2297

  5900006 TAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTC 5900065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 TAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTC 2357

  5900066 AGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCT 5900125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCT 2417

  5900126 CAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTC 5900185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 CAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTC 2477

  5900186 TCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCC 5900245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 TCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCC 2537

  5900246 TCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCA 5900305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 TCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCA 2597

  5900306 ATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTC 5900365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 ATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTC 2657

  5900366 CCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCT 5900425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 CCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCT 2717

  5900426 GAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCA 5900485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 GAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCA 2777

  5900486 AGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGC 5900545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 AGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGC 2837

  5900546 TGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGT 5900605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 TGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGT 2897

  5900606 GAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGC 5900665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 GAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGC 2957

  5900666 GCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATT 5900725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 GCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATT 3017

  5900726 CATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCA 5900785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 CATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCA 3077

  5900786 GTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTC 5900845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 GTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTC 3137

  5900846 TTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTA 5900894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 TTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTA 3186

Alignment time is 2.36678 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   5150] =>      5150 nucs 'mol-32-29be-042408_5150'

Score:        5081
Aligned:      5157        nucs
Identic:      5146 (100%) nucs =>      1186 (100%)      3960 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5894278,5895463] EXCISED REGION [5895500,5899470]
 second seq =>  [      1,   1186] EXCISED REGION [   1187,   5150]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        36 nucs [5895464,5895499]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        55 nucs [5895464,5895518] to [5895500,5895554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5895464,5895464] to [5895499,5895499]
 second seq =>         0 nucs

  5894278 GCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGA 5894337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGA 60

  5894338 TGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCC 5894397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCC 120

  5894398 TCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACTTT 5894457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACTTT 180

  5894458 TTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCGTC 5894517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCGTC 240

  5894518 AGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTCAG 5894577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTCAG 300

  5894578 ATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATTCT 5894637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATTCT 360

  5894638 TGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATT 5894697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATT 420

  5894698 AAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGT 5894757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGT 480

  5894758 ATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGC 5894817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGC 540

  5894818 ACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGG 5894877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGG 600

  5894878 CTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCA 5894937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCA 660

  5894938 AAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAA 5894997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAA 720

  5894998 AGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACT 5895057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACT 780

  5895058 TATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCT 5895117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCT 840

  5895118 CTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGG 5895177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGG 900

  5895178 AGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGA 5895237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGA 960

  5895238 ATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCT 5895297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCT 1020

  5895298 TCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCAC 5895357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCAC 1080

  5895358 TTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGC 5895417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGC 1140

  5895418 CTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 5895463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 1186

EXCISED REGION

  5895500 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 5895559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 1246

  5895560 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 5895619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 1306

  5895620 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 5895679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 1366

  5895680 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 5895739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 1426

  5895740 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 5895799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 1486

  5895800 AGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 5895859
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 AGATGTCGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 1546

  5895860 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 5895919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 1606

  5895920 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 5895979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 1666

  5895980 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 5896039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 1726

  5896040 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 5896099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 1786

  5896100 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 5896159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 1846

  5896160 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 5896219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 1906

  5896220 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 5896279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 1966

  5896280 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 5896339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 2026

  5896340 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 5896399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 2086

  5896400 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 5896459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 2146

  5896460 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 5896519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 2206

  5896520 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 5896579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 2266

  5896580 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 5896639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 2326

  5896640 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 5896699
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 CGCTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 2386

  5896700 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 5896759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 2446

  5896760 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 5896819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 2506

  5896820 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 5896879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 2566

  5896880 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 5896939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 2626

  5896940 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT 5896999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2627 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA-TTTTTTTTTTTTTTTTT 2685

  5897000 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 5897059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 2745

  5897060 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 5897119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 2805

  5897120 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 5897179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 2865

  5897180 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 5897239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 2925

  5897240 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 5897299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 2985

  5897300 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 5897359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 3045

  5897360 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5897419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 3105

  5897420 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5897479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 3165

  5897480 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5897539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 3225

  5897540 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5897599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 3285

  5897600 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5897659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 3345

  5897660 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5897719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||
     3346 ACACACACACACACACACACACACACACACAC------AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 3399

  5897720 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5897779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 3459

  5897780 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5897839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 3519

  5897840 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5897899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 3579

  5897900 CTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5897959
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 CTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 3639

  5897960 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5898019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 3699

  5898020 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5898079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 3759

  5898080 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5898139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 3819

  5898140 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5898199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 3879

  5898200 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5898259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 3939

  5898260 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 5898319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 3999

  5898320 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 5898379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 4059

  5898380 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 5898439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 4119

  5898440 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 5898499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 4179

  5898500 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 5898559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 4239

  5898560 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 5898619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 4299

  5898620 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 5898679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 4359

  5898680 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 5898739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 4419

  5898740 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 5898799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 4479

  5898800 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 5898859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 4539

  5898860 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 5898919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 4599

  5898920 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 5898979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 4659

  5898980 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 5899039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 4719

  5899040 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 5899099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4720 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGGACACTGTGTCCCC 4779

  5899100 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 5899159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 4839

  5899160 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 5899219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 4899

  5899220 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 5899279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 4959

  5899280 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 5899339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 5019

  5899340 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 5899399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 5079

  5899400 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 5899459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 5139

  5899460 CCTCCCATCCA 5899470
          |||||||||||
     5140 CCTCCCATCCA 5150

Alignment time is 3.78037 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   9118] =>      9118 nucs 'mol-32-29d4-074145_9118'

Score:        8671
Aligned:      9132        nucs
Identic:      9050 ( 99%) nucs =>      2338 ( 99%)      6712 ( 99%)
Gaps:           54 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5896082,5898447] EXCISED REGION [5898876,5905605]
 second seq =>  [      1,   2352] EXCISED REGION [   2353,   9114]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5896082 AACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTAC 5896141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTAC 60

  5896142 AGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTG 5896201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTG 120

  5896202 AATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGA 5896261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGA 180

  5896262 TAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATG 5896321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATG 240

  5896322 TGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAG 5896381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAG 300

  5896382 GTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGAC 5896441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGAC 360

  5896442 AAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCA 5896501
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCA 420

  5896502 TCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGT 5896561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      421 TCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGT 480

  5896562 TAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTA 5896621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTA 540

  5896622 GGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAAC 5896681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAAC 600

  5896682 TGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTG 5896741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTG 660

  5896742 TAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTA 5896801
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      661 TAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTA 720

  5896802 GATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTA 5896861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTA 780

  5896862 ACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCT 5896921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      781 ACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCT 840

  5896922 GACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA 5896981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA 900

  5896982 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTC 5897041
          |||||||||||||||||    ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTTTTTTTTTTTTT----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTC 956

  5897042 CTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGG 5897101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      957 CTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGG 1016

  5897102 ATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAA 5897161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 ATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAA 1076

  5897162 TTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCG 5897221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCG 1136

  5897222 AGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCA 5897281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 AGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCA 1196

  5897282 TCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTA 5897341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTA 1256

  5897342 TTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATT 5897401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATT 1316

  5897402 GGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGC 5897461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGC 1376

  5897462 CCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCC 5897521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCC 1436

  5897522 AGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCT 5897581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 AGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCT 1496

  5897582 TGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACAC 5897641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACAC 1556

  5897642 ACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAG 5897701
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
     1557 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA----- 1611

  5897702 AGAGAG-AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTA 5897760
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 ------CAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTA 1665

  5897761 AAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGT 5897820
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 AAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGT 1725

  5897821 AAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCC 5897880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 AAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCC 1785

  5897881 AAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTT 5897940
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 AAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTT 1845

  5897941 CAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGT 5898000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 CAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGT 1905

  5898001 TGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGAT 5898060
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1906 TGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGAT 1965

  5898061 GATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGC 5898120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 GATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGC 2025

  5898121 TTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTA 5898180
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTA 2085

  5898181 CTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATG 5898240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 CTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATG 2145

  5898241 GTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCT 5898300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCT 2205

  5898301 GTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGC 5898360
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2206 GTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGC 2265

  5898361 CCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCAT 5898420
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCAT 2325

  5898421 ATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          |||||||||||||||||||||||||||
     2326 ATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 2352

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 2412

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2413 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 2472

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 2532

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 2592

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2593 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 2652

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 2712

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 2772

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 2832

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 2892

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 2952

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 3012

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 3072

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 3132

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 3192

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 3252

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3253 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 3312

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 3372

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 3432

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 3492

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 3552

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 3612

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 3672

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3673 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 3732

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 3792

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 3852

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 3912

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 3972

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 4032

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 4092

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 4152

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 4212

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     4213 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 4272

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 4332

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 4392

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 4452

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 4512

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 4572

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 4632

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4633 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 4692

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 4752

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4753 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 4812

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4813 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 4872

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4873 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 4932

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 4992

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4993 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5052

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5112

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5113 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5172

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5173 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5232

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5233 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5292

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5293 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5352

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5353 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5412

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5413 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5472

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5473 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5532

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5533 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5592

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5593 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5652

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5653 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5712

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5713 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5772

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5773 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5832

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5833 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5892

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5893 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5952

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5953 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 6012

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6013 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 6072

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6073 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 6132

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6133 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 6192

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6193 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 6252

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6253 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 6312

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6313 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 6372

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6373 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 6432

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6433 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 6492

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6493 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 6552

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6553 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 6612

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6613 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 6672

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6673 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 6732

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6733 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 6792

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6793 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 6852

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6853 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 6912

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6913 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 6972

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6973 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 7032

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7033 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 7092

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7093 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 7152

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7153 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 7209

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7210 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 7269

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7270 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 7329

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7330 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 7389

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7390 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 7449

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7450 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 7509

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7510 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 7569

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7570 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 7629

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7630 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 7689

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7690 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 7749

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7750 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 7809

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7810 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 7869

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7870 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 7929

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7930 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 7989

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7990 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 8049

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8050 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 8109

  5904617 A----------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACAC 5904660
          |                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8110 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACAC 8169

  5904661 TAGTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCT 5904720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8170 TAGTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCT 8229

  5904721 AAGCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTA 5904780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8230 AAGCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTA 8289

  5904781 TCTTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTC 5904840
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8290 TCTTTACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTC 8349

  5904841 CATGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAAC 5904900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8350 CATGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAAC 8409

  5904901 TCTTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCAT 5904960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8410 TCTTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCAT 8469

  5904961 CTACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACT 5905020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8470 CTACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACT 8529

  5905021 AATGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCT 5905080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8530 AATGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCT 8589

  5905081 GCCTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCT 5905140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8590 GCCTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCT 8649

  5905141 CGTGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCA 5905200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8650 CGTGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCA 8709

  5905201 GTTACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACT 5905260
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8710 GTTACTTCTTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACT 8769

  5905261 TTTCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAA 5905320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8770 TTTCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAA 8829

  5905321 TTTGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCA 5905380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8830 TTTGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCA 8889

  5905381 AGAATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAA 5905440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8890 AGAATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAA 8949

  5905441 GCAGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTT 5905500
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8950 GCAGGGCTTCATGTCCCAAGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTT 9009

  5905501 TGCACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACA 5905560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9010 TGCACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACA 9069

  5905561 TTCTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCT 5905605
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9070 TTCTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCT 9114

Alignment time is 6.61685 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   2354] =>      2354 nucs 'mol-32-29d4-074145_2354'

Score:        2197
Aligned:      2357        nucs
Identic:      2340 ( 99%) nucs =>      1604 ( 99%)       736 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5896082,5897696] EXCISED REGION [5897708,5898449]
 second seq =>  [      1,   1611] EXCISED REGION [   1613,   2354]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        11 nucs [5897697,5897707]
 second seq =>         1 nucs [1612,1612]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5897696,5897696] to [5897708,5897708]
 second seq =>         1 nucs [1611,1611] to [1613,1613]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [5897697,5897701] to [5897703,5897707]
 second seq =>         0 nucs

  5896082 AACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTAC 5896141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTAC 60

  5896142 AGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTG 5896201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTG 120

  5896202 AATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGA 5896261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGA 180

  5896262 TAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATG 5896321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATG 240

  5896322 TGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAG 5896381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAG 300

  5896382 GTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGAC 5896441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGAC 360

  5896442 AAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCA 5896501
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCA 420

  5896502 TCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGT 5896561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      421 TCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGT 480

  5896562 TAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTA 5896621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTA 540

  5896622 GGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAAC 5896681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAAC 600

  5896682 TGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTG 5896741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTG 660

  5896742 TAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTA 5896801
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      661 TAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTA 720

  5896802 GATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTA 5896861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTA 780

  5896862 ACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCT 5896921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      781 ACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCT 840

  5896922 GACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA 5896981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA 900

  5896982 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTC 5897041
          |||||||||||||||||    ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTTTTTTTTTTTTT----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTC 956

  5897042 CTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGG 5897101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      957 CTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGG 1016

  5897102 ATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAA 5897161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 ATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAA 1076

  5897162 TTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCG 5897221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCG 1136

  5897222 AGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCA 5897281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 AGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCA 1196

  5897282 TCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTA 5897341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTA 1256

  5897342 TTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATT 5897401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATT 1316

  5897402 GGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGC 5897461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGC 1376

  5897462 CCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCC 5897521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCC 1436

  5897522 AGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCT 5897581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 AGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCT 1496

  5897582 TGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACAC 5897641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACAC 1556

  5897642 ACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 5897696
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 1611

EXCISED REGION

  5897708 AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACAT 5897767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACAT 1672

  5897768 TTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAA 5897827
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAA 1732

  5897828 CCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAA 5897887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 CCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAA 1792

  5897888 AATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCT 5897947
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCT 1852

  5897948 TCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATAT 5898007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATAT 1912

  5898008 TGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGC 5898067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1913 TGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGC 1972

  5898068 CTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAA 5898127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 CTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAA 2032

  5898128 GCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGT 5898187
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGT 2092

  5898188 GCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTC 5898247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTC 2152

  5898248 TTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATC 5898307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 TTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATC 2212

  5898308 CCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGG 5898367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2213 CCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGG 2272

  5898368 ATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCT 5898427
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 ATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCT 2332

  5898428 GAATCTAGGGTAGAGGGCAGCA 5898449
          ||||||||||||||||||||||
     2333 GAATCTAGGGTAGAGGGCAGCA 2354

Alignment time is 1.73382 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,  10211] =>     10211 nucs 'mol-32-2afd-100526_10211'

Score:        9837
Aligned:     10238        nucs
Identic:     10168 ( 99%) nucs =>      5359 ( 99%)      4809 ( 99%)
Gaps:           46 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5893050,5898447] EXCISED REGION [5898876,5903696]
 second seq =>  [      1,   5374] EXCISED REGION [   5375,  10211]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5893050 TCTGTGCAAAGCTCTGTGCCCACAGCTGTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCCC 5893109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGTGCAAAGCTCTGTGCCCACAGCTGTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCCC 60

  5893110 TGAAGACCCCAGCAGTCAGGCCAGGGAGAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGTC 5893169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAAGACCCCAGCAGTCAGGCCAGGGAGAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGTC 120

  5893170 CCTGGGGAAAGGTGAGTGGTGCCCGATGAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGGG 5893229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGGGGAAAGGTGAGTGGTGCCCGATGAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGGG 180

  5893230 CTACAGTGGTCAGGAAAGGCTTTGGAATAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTGG 5893289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTACAGTGGTCAGGAAAGGCTTTGGAATAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTGG 240

  5893290 GTACCACGCAGTGTTTTAAGCACTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTA 5893349
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTACCATGCAGTGTTTTAAGCACTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTA 300

  5893350 GGTAGGCACTAATAGTACCTACAATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAA 5893409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTAGGCACTAATAGTACCTACAATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAA 360

  5893410 TACCTTGCACCAGGTTGCGGAGGTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGG 5893469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACCTTGCACCAGGTTGCGGAGGTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGG 420

  5893470 ATTCCTTATTAACCGTGATTCTATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAAC 5893529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTCCTTATTAACCGTGATTCTATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAAC 480

  5893530 AAATCACTATGACCATAGTTGCATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGG 5893589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCACTATGACCATAGTTGCATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGG 540

  5893590 GTCAGGAATTTGGATAGAACACATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCT 5893649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCAGGAATTTGGATAGAACACATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCT 600

  5893650 TGACTGGGTGCATGAACACCGGGGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATC 5893709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGACTGGGTGCATGAACACCGGGGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATC 660

  5893710 CATGTGTCCAGTAGATGATACTGGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGA 5893769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGTGTCCAGTAGATGATACTGGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGA 720

  5893770 ACACCCATACGTGGCCTCTCCAGGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAG 5893829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACACCCATACGTGGCCTCTCCAGGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAG 780

  5893830 CAGTCAGACTTCATACACTATGGCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAG 5893889
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGTCAGACTTCATACACTATGCCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAG 840

  5893890 AGGAAGCAGCATTGCCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTC 5893949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGAAGCAGCATTGCCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTC 900

  5893950 AGATTTAACAGGAGGGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATG 5894009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGATTTAACAGGAGGGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATG 960

  5894010 TCAAAGAATTTGCAGCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGT 5894069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAAAGAATTTGCAGCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGT 1020

  5894070 TTACAGCAAAATTGGTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCC 5894129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACAGCAAAATTGGTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCC 1080

  5894130 ACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTCTCGCTCTGTTGC 5894189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTCTCGCTCTGTTGC 1140

  5894190 CAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAG 5894249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAG 1200

  5894250 CAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTG 5894309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTG 1260

  5894310 GCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTT 5894369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTT 1320

  5894370 GATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGT 5894429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGT 1380

  5894430 GAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCC 5894489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCC 1440

  5894490 ATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCG 5894549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCG 1500

  5894550 TCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCC 5894609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCC 1560

  5894610 TGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTT 5894669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTT 1620

  5894670 GGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGC 5894729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGC 1680

  5894730 CAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCC 5894789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCC 1740

  5894790 AAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTT 5894849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTT 1800

  5894850 TACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTA 5894909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTA 1860

  5894910 AGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCC 5894969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCC 1920

  5894970 ACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTT 5895029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTT 1980

  5895030 GATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACA 5895089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACA 2040

  5895090 TGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCC 5895149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCC 2100

  5895150 AATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGA 5895209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2101 AATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTACCCAATCACAAGTCATCCAGA 2160

  5895210 TTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGT 5895269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGT 2220

  5895270 GTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGG 5895329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGG 2280

  5895330 AGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTC 5895389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTC 2340

  5895390 TGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTT 5895449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTT 2400

  5895450 CTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTC 5895509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTC 2460

  5895510 ATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGA 5895569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGA 2520

  5895570 CATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCC 5895629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCC 2580

  5895630 CTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGAT 5895689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGAT 2640

  5895690 GTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCT 5895749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCT 2700

  5895750 TTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTG 5895809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTG 2760

  5895810 GTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGA 5895869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGA 2820

  5895870 GGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATA 5895929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATA 2880

  5895930 GCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACT 5895989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACT 2940

  5895990 TGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCT 5896049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCT 3000

  5896050 ACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCT 5896109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCT 3060

  5896110 AGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTA 5896169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTA 3120

  5896170 TCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAG 5896229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAG 3180

  5896230 AAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTT 5896289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTT 3240

  5896290 AATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCC 5896349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCC 3300

  5896350 TTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAA 5896409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAA 3360

  5896410 GTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGC 5896469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3361 GTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGC 3420

  5896470 ATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGC 5896529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGC 3480

  5896530 TGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTAT 5896589
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTAT 3540

  5896590 TAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAA 5896649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAA 3600

  5896650 GGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAG 5896709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAG 3660

  5896710 GTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGG 5896769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGG 3720

  5896770 AGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTG 5896829
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTG 3780

  5896830 CTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGC 5896889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGC 3840

  5896890 TTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTA 5896949
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTA 3900

  5896950 TTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAG 5897009
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||.||
     3901 TTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTT----ACTCTAG 3956

  5897010 GGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAG 5897069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAG 4016

  5897070 ATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAG 5897129
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 ATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAG 4076

  5897130 TTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCA 5897189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 TTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCA 4136

  5897190 TCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTG 5897249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTG 4196

  5897250 TGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAAC 5897309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAAC 4256

  5897310 ACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAA 5897369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 ACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAA 4316

  5897370 AATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGG 5897429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 AATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGG 4376

  5897430 ACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTC 5897489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 ACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTC 4436

  5897490 TCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGT 5897549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGT 4496

  5897550 GGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAA 5897609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 GGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAA 4556

  5897610 TGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACAC 5897669
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||
     4557 TGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACA--------CACACACACACAC 4608

  5897670 ACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGC 5897729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||
     4609 ACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGC 4656

  5897730 AATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTT 5897789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4657 AATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTT 4716

  5897790 GGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTG 5897849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 GGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTG 4776

  5897850 ACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTC 5897909
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4777 ACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTC 4836

  5897910 CTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGA 5897969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 CTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGA 4896

  5897970 CAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAA 5898029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 CAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAA 4956

  5898030 TGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTT 5898089
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 TGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTT 5016

  5898090 GCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGG 5898149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 GCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGG 5076

  5898150 CCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTT 5898209
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTT 5136

  5898210 CAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACAC 5898269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 CAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACAC 5196

  5898270 AGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCA 5898329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 AGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCA 5256

  5898330 GGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGG 5898389
          ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||
     5257 GGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGG 5316

  5898390 GCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 GCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5374

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5434

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5435 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 5494

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5554

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5614

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5615 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 5674

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5675 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5734

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5794

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5854

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5914

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5974

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 6034

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 6094

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 6154

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 6214

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 6274

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     6275 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 6334

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 6394

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6395 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 6454

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 6514

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 6574

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 6634

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 6694

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6695 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 6754

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 6814

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6815 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 6874

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6875 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 6934

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 6994

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6995 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 7054

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7055 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 7114

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7115 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 7174

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7175 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 7234

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     7235 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 7294

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7295 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 7354

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7355 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 7414

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7415 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 7474

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7475 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 7534

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7535 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 7594

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7595 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 7654

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7655 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 7714

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7715 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 7774

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7775 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 7834

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7835 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 7894

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7895 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 7954

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7955 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 8014

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8015 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 8074

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8075 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 8134

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8135 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 8194

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8195 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 8254

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8255 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 8314

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8315 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 8374

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8375 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 8434

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8435 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 8494

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8495 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 8554

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8555 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 8614

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8615 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 8674

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8675 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 8734

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8735 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 8794

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8795 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 8854

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8855 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 8914

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8915 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 8974

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8975 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 9034

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9035 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 9094

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9095 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 9154

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     9155 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 9214

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9215 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 9274

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9275 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 9334

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9335 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 9394

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9395 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 9454

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9455 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 9514

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9515 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 9574

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9575 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 9634

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9635 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 9694

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9695 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 9754

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9755 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 9814

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9815 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 9874

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9875 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 9934

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9935 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 9994

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9995 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 10054

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10055 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 10114

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10115 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 10174

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTT 5903696
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||
    10175 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTT 10211

Alignment time is 7.37682 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   4837] =>      4837 nucs 'mol-32-2afd-100526_4837'

Score:        4707
Aligned:      4816        nucs
Identic:      4802 (100%) nucs =>      1887 (100%)      2915 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5898876,5900769] EXCISED REGION [5900778,5903696]
 second seq =>  [      1,   1894] EXCISED REGION [   1919,   4837]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [5900770,5900777]
 second seq =>        24 nucs [1895,1918]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5900770,5900770] to [5900778,5900778]
 second seq =>         1 nucs [1894,1894] to [1918,1918]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5900769,5900769] to [5900778,5900778]
 second seq =>         1 nucs [1894,1894] to [1919,1919]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5900770,5900772] to [5900775,5900777]
 second seq =>         0 nucs

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 60

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
       61 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 120

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 180

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 240

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      241 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 300

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 360

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 420

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 480

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 540

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 600

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 660

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 720

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 780

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 840

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 900

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      901 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 960

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1020

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1080

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1140

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1200

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1260

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 1320

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1321 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 1380

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 1440

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 1500

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 1560

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 1620

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 1680

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 1740

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 1800

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 1860

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 5900769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 1894

EXCISED REGION

  5900778 CCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTC 5900837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTC 1978

  5900838 AAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAG 5900897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAG 2038

  5900898 AAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATG 5900957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATG 2098

  5900958 TCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGT 5901017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGT 2158

  5901018 GCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAA 5901077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAA 2218

  5901078 ACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAG 5901137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAG 2278

  5901138 TCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTA 5901197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTA 2338

  5901198 AAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAAT 5901257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAAT 2398

  5901258 GTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACAT 5901317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACAT 2458

  5901318 CCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAAT 5901377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAAT 2518

  5901378 ATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGC 5901437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGC 2578

  5901438 ACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATAT 5901497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATAT 2638

  5901498 ATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAA 5901557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAA 2698

  5901558 TTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGA 5901617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGA 2758

  5901618 AACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATA 5901677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATA 2818

  5901678 GATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATG 5901737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATG 2878

  5901738 AGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTG 5901797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTG 2938

  5901798 ACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATC 5901857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATC 2998

  5901858 TATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCT 5901917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCT 3058

  5901918 ATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAAT 5901977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAAT 3118

  5901978 AATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTG 5902037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTG 3178

  5902038 GGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGAT 5902097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGAT 3238

  5902098 ATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACA 5902157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACA 3298

  5902158 TGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATT 5902217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATT 3358

  5902218 ATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATAT 5902277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATAT 3418

  5902278 TGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGC 5902337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGC 3478

  5902338 TCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTA 5902397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTA 3538

  5902398 GAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTA 5902457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTA 3598

  5902458 AATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAG 5902517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAG 3658

  5902518 TGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCA 5902577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCA 3718

  5902578 TAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTC 5902637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTC 3778

  5902638 CAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAA 5902697
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAA 3838

  5902698 AGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCC 5902757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCC 3898

  5902758 CTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCA 5902817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCA 3958

  5902818 GCTCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGAT 5902877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GCTCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGAT 4018

  5902878 TCCCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCAT 5902937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TCCCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCAT 4078

  5902938 GAGCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTC 5902997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GAGCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTC 4138

  5902998 ACTGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCT 5903057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 ACTGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCT 4198

  5903058 TCCCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTT 5903117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TCCCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTT 4258

  5903118 TCTATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGT 5903177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TCTATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGT 4318

  5903178 CTCTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTG 5903237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CTCTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTG 4378

  5903238 CAGATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATT 5903297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CAGATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATT 4438

  5903298 ATAGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACA 5903357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ATAGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACA 4498

  5903358 AGCTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCT 5903417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 AGCTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCT 4558

  5903418 GGAGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTC 5903477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GGAGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTC 4618

  5903478 TGCTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAAT 5903537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TGCTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAAT 4678

  5903538 TTTTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACT 5903597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TTTTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACT 4738

  5903598 CCTGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAG 5903657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 CCTGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAG 4798

  5903658 CCACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTT 5903696
          |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CCACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTT 4837

Alignment time is 3.52822 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   9549] =>      9549 nucs 'mol-32-2b4a-112708_9549'

Score:        9099
Aligned:      9571        nucs
Identic:      9488 ( 99%) nucs =>      1939 ( 98%)      7549 ( 99%)
Gaps:           55 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5896479,5898447] EXCISED REGION [5898876,5906444]
 second seq =>  [      1,   1950] EXCISED REGION [   1951,   9549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5896479 GGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTG 5896538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTG 60

  5896539 TTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATT 5896598
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATT 120

  5896599 ACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACC 5896658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACC 180

  5896659 CTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCT 5896718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCT 240

  5896719 GAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCC 5896778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCC 300

  5896779 TGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCA 5896838
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCA 360

  5896839 GAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGG 5896898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGG 420

  5896899 TTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATG 5896958
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATG 480

  5896959 ACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAG 5897018
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||.|||||||||||
      481 ACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAG 535

  5897019 GAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACG 5897078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 GAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACG 595

  5897079 CACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTC 5897138
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 CACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTC 655

  5897139 CCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTC 5897198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 CCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTC 715

  5897199 AAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTG 5897258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 AAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTG 775

  5897259 CCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGT 5897318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 CCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGT 835

  5897319 TTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTA 5897378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 TTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTA 895

  5897379 TTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAA 5897438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 TTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAA 955

  5897439 GCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGG 5897498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 GCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGG 1015

  5897499 AAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCA 5897558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 AAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCA 1075

  5897559 CAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCG 5897618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 CAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCG 1135

  5897619 GGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACA 5897678
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     1136 GGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACA--CACACACACACACACACACACACACACA 1193

  5897679 CACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTC 5897738
          |||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||
     1194 CACACACACACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTC 1241

  5897739 GGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGT 5897798
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 GGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGT 1301

  5897799 TTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTAC 5897858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTAC 1361

  5897859 AGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGAC 5897918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1362 AGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGAC 1421

  5897919 CTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCA 5897978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 CTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCA 1481

  5897979 TACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTA 5898038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTA 1541

  5898039 GATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGA 5898098
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 GATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGA 1601

  5898099 GTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACA 5898158
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1602 GTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACA 1661

  5898159 GAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTT 5898218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 GAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTT 1721

  5898219 CCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGG 5898278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGG 1781

  5898279 GTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGA 5898338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGA 1841

  5898339 CTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACT 5898398
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1842 CTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACT 1901

  5898399 CCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 CCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 1950

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 2010

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2011 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 2070

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 2130

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 2190

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2191 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 2250

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 2310

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 2370

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 2430

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 2490

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 2550

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 2610

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 2670

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 2730

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 2790

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 2850

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2851 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 2910

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 2970

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 3030

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 3090

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 3150

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 3210

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 3270

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3271 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 3330

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 3390

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 3450

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 3510

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 3570

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 3630

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 3690

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 3750

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 3810

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     3811 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 3870

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 3930

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 3990

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 4050

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 4110

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 4170

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 4230

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 4290

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 4350

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 4410

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 4470

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 4530

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 4590

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 4650

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 4710

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 4770

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 4830

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 4890

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 4950

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5010

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5070

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5130

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5190

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5250

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5310

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5370

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5430

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5490

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5491 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAGTATTAAA 5550

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5610

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5670

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5730

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5790

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5850

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5910

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5911 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5970

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5971 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 6030

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6031 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 6090

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6091 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 6150

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6151 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 6210

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6211 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 6270

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6271 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 6330

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6331 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 6390

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6391 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 6450

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6451 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 6510

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6511 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 6570

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6571 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 6630

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6631 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 6690

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6691 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 6750

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6751 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 6807

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6808 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 6867

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6868 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 6927

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6928 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 6987

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6988 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 7047

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7048 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 7107

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7108 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 7167

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7168 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 7227

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7228 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 7287

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7288 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 7347

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7348 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 7407

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7408 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 7467

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7468 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 7527

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7528 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 7587

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7588 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 7647

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7648 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 7707

  5904617 A--------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 5904662
          |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7708 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 7767

  5904663 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 5904722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7768 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 7827

  5904723 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 5904782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7828 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 7887

  5904783 TTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 5904842
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7888 TTTACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 7947

  5904843 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 5904902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7948 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 8007

  5904903 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 5904962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8008 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 8067

  5904963 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 5905022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8068 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 8127

  5905023 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 5905082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8128 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 8187

  5905083 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 5905142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8188 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 8247

  5905143 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 5905202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8248 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 8307

  5905203 TACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 5905262
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8308 TACTTCTTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 8367

  5905263 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 5905322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8368 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 8427

  5905323 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 5905382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8428 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 8487

  5905383 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 5905442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8488 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 8547

  5905443 AGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 5905502
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8548 AGGGCTTCATGTCCCAAGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 8607

  5905503 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 5905562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8608 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 8667

  5905563 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAA 5905622
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     8668 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTTTGTGTCATCGAGGGAA 8727

  5905623 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 5905682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8728 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 8787

  5905683 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 5905742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8788 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 8847

  5905743 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 5905802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8848 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 8907

  5905803 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 5905862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8908 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 8967

  5905863 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 5905922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8968 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 9027

  5905923 AATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTC 5905982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9028 AATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTC 9087

  5905983 CAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGC 5906042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9088 CAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGC 9147

  5906043 AGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCA 5906102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9148 AGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCA 9207

  5906103 GCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCA 5906162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9208 GCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCA 9267

  5906163 GTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACC 5906222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9268 GTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACC 9327

  5906223 GGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATA 5906282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9328 GGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATA 9387

  5906283 GAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTA 5906342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9388 GAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTA 9447

  5906343 TTCTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTG 5906402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9448 TTCTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTG 9507

  5906403 GACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGC 5906444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9508 GACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGC 9549

Alignment time is 6.89802 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   7795] =>      7795 nucs 'mol-32-2e0a-104190_7795'

Score:        7450
Aligned:      7819        nucs
Identic:      7756 ( 99%) nucs =>      3280 ( 99%)      4476 ( 99%)
Gaps:           40 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5895130,5898447] EXCISED REGION [5898876,5903360]
 second seq =>  [      1,   3294] EXCISED REGION [   3295,   7795]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5895130 ACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGC 5895189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
        1 ACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTAC 60

  5895190 CCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTT 5895249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTT 120

  5895250 GCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTA 5895309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTA 180

  5895310 TGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCA 5895369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCA 240

  5895370 GCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGG 5895429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGG 300

  5895430 GGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGC 5895489
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGC 360

  5895490 ATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGA 5895549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGA 420

  5895550 CTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTT 5895609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTT 480

  5895610 GGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGAT 5895669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGAT 540

  5895670 GACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACT 5895729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACT 600

  5895730 TGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGG 5895789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGG 660

  5895790 CTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCC 5895849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCC 720

  5895850 ATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTT 5895909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTT 780

  5895910 TGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGG 5895969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGG 840

  5895970 GTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACC 5896029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACC 900

  5896030 CATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTG 5896089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTG 960

  5896090 TGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAA 5896149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAA 1020

  5896150 GGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTA 5896209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTA 1080

  5896210 AATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTG 5896269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTG 1140

  5896270 CACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGAC 5896329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGAC 1200

  5896330 TTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCT 5896389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCT 1260

  5896390 GTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGAT 5896449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGAT 1320

  5896450 TCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTC 5896509
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTC 1380

  5896510 CATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAA 5896569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1381 CATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAA 1440

  5896570 TAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGA 5896629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGA 1500

  5896630 GTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAA 5896689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAA 1560

  5896690 TTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTT 5896749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTT 1620

  5896750 AGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCA 5896809
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1621 AGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCA 1680

  5896810 CAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAA 5896869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAA 1740

  5896870 GAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCA 5896929
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCA 1800

  5896930 GCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTT 5896989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTT 1860

  5896990 TTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGG 5897049
          |||||||||    ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTTTTT----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGG 1916

  5897050 TGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCA 5897109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1917 TGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCA 1976

  5897110 GTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTG 5897169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTG 2036

  5897170 GTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACA 5897229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACA 2096

  5897230 CTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTG 5897289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTG 2156

  5897290 GCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTA 5897349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTA 2216

  5897350 TTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGC 5897409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGC 2276

  5897410 TTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGT 5897469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGT 2336

  5897470 CTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCA 5897529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 CTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCA 2396

  5897530 GGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGT 5897589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGT 2456

  5897590 CTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACAT 5897649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2457 CTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACA- 2515

  5897650 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAG 5897709
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     2516 -------CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAG-- 2566

  5897710 AGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTT 5897769
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2567 ----------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCT 2616

  5897770 GATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACC 5897829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 GATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACC 2676

  5897830 TCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAA 5897889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAA 2736

  5897890 TTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTC 5897949
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTC 2796

  5897950 TCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTG 5898009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTG 2856

  5898010 CACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCT 5898069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2857 CACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCT 2916

  5898070 TTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGC 5898129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGC 2976

  5898130 CTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGC 5898189
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 CTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGC 3036

  5898190 TGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTT 5898249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTT 3096

  5898250 ACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCC 5898309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCC 3156

  5898310 AAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGAT 5898369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3157 AAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGAT 3216

  5898370 CCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGA 5898429
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGA 3276

  5898430 ATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||
     3277 ATCTAGGGTAGAGGGCAG 3294

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 3354

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3355 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 3414

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 3474

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 3534

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3535 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 3594

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 3654

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 3714

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 3774

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 3834

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 3894

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 3954

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 4014

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 4074

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 4134

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 4194

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4195 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 4254

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 4314

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 4374

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 4434

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 4494

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 4554

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 4614

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4615 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 4674

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 4734

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 4794

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 4854

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 4914

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 4974

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5034

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5094

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5154

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     5155 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 5214

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5274

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5334

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5394

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5454

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5514

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5574

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5634

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5694

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5754

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5814

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5874

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5934

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5994

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 6054

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 6114

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 6174

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 6234

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6235 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 6294

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 6354

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 6414

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 6474

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 6534

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 6594

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 6654

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 6714

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 6774

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 6834

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 6894

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6895 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 6954

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 7014

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7015 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 7074

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     7075 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 7134

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7135 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 7194

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7195 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 7254

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7255 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 7314

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7315 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 7374

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7375 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 7434

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7435 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 7494

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7495 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 7554

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7555 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 7614

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7615 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 7674

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7675 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 7734

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7735 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 7794

  5903360 C 5903360
          |
     7795 C 7795

Alignment time is 5.58224 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3296] =>      3296 nucs 'mol-32-2e0a-104190_3296'

Score:        3118
Aligned:      3300        nucs
Identic:      3281 ( 99%) nucs =>      2545 ( 99%)       736 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5895130,5897687] EXCISED REGION [5897708,5898449]
 second seq =>  [      1,   2554] EXCISED REGION [   2555,   3296]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        20 nucs [5897688,5897707]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>        18 nucs [5897690,5897707]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5897688,5897688] to [5897708,5897708]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5895130 ACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGC 5895189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
        1 ACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTAC 60

  5895190 CCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTT 5895249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTT 120

  5895250 GCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTA 5895309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTA 180

  5895310 TGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCA 5895369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCA 240

  5895370 GCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGG 5895429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGG 300

  5895430 GGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGC 5895489
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGC 360

  5895490 ATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGA 5895549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGA 420

  5895550 CTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTT 5895609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTT 480

  5895610 GGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGAT 5895669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGAT 540

  5895670 GACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACT 5895729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACT 600

  5895730 TGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGG 5895789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGG 660

  5895790 CTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCC 5895849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCC 720

  5895850 ATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTT 5895909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTT 780

  5895910 TGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGG 5895969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGG 840

  5895970 GTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACC 5896029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACC 900

  5896030 CATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTG 5896089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTG 960

  5896090 TGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAA 5896149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAA 1020

  5896150 GGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTA 5896209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTA 1080

  5896210 AATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTG 5896269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTG 1140

  5896270 CACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGAC 5896329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGAC 1200

  5896330 TTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCT 5896389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCT 1260

  5896390 GTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGAT 5896449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGAT 1320

  5896450 TCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTC 5896509
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTC 1380

  5896510 CATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAA 5896569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1381 CATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAA 1440

  5896570 TAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGA 5896629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGA 1500

  5896630 GTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAA 5896689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAA 1560

  5896690 TTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTT 5896749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTT 1620

  5896750 AGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCA 5896809
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1621 AGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCA 1680

  5896810 CAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAA 5896869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAA 1740

  5896870 GAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCA 5896929
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCA 1800

  5896930 GCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTT 5896989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTT 1860

  5896990 TTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGG 5897049
          |||||||||    ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTTTTT----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGG 1916

  5897050 TGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCA 5897109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1917 TGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCA 1976

  5897110 GTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTG 5897169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTG 2036

  5897170 GTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACA 5897229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACA 2096

  5897230 CTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTG 5897289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTG 2156

  5897290 GCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTA 5897349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTA 2216

  5897350 TTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGC 5897409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGC 2276

  5897410 TTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGT 5897469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGT 2336

  5897470 CTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCA 5897529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 CTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCA 2396

  5897530 GGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGT 5897589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGT 2456

  5897590 CTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACAT 5897649
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2457 CTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACAC 2516

  5897650 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 5897687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 2554

EXCISED REGION

  5897708 AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACAT 5897767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACAT 2614

  5897768 TTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAA 5897827
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 CTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAA 2674

  5897828 CCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAA 5897887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 CCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAA 2734

  5897888 AATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCT 5897947
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 AATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCT 2794

  5897948 TCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATAT 5898007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATAT 2854

  5898008 TGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGC 5898067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2855 TGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGC 2914

  5898068 CTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAA 5898127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 CTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAA 2974

  5898128 GCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGT 5898187
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 GCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGT 3034

  5898188 GCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTC 5898247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 GCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTC 3094

  5898248 TTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATC 5898307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 TTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATC 3154

  5898308 CCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGG 5898367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3155 CCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGG 3214

  5898368 ATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCT 5898427
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 ATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCT 3274

  5898428 GAATCTAGGGTAGAGGGCAGCA 5898449
          ||||||||||||||||||||||
     3275 GAATCTAGGGTAGAGGGCAGCA 3296

Alignment time is 2.43766 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   7910] =>      7910 nucs 'mol-32-2ee6-061075_7910'

Score:        7589
Aligned:      7924        nucs
Identic:      7869 ( 99%) nucs =>      4218 ( 99%)      3651 ( 99%)
Gaps:           33 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5894202,5898447] EXCISED REGION [5898876,5902534]
 second seq =>  [      1,   4235] EXCISED REGION [   4236,   7910]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5894202 CAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGT 5894261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGT 60

  5894262 CTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTT 5894321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTT 120

  5894322 GTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACC 5894381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACC 180

  5894382 TCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGG 5894441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGG 240

  5894442 TCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGT 5894501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGT 300

  5894502 CACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCT 5894561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCT 360

  5894562 TACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTT 5894621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTT 420

  5894622 AGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAA 5894681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAA 480

  5894682 AATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACC 5894741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACC 540

  5894742 TGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGC 5894801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGC 600

  5894802 AGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTG 5894861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTG 660

  5894862 CCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGAC 5894921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGAC 720

  5894922 CAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGT 5894981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGT 780

  5894982 TGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTA 5895041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTA 840

  5895042 CTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGT 5895101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGT 900

  5895102 GTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAA 5895161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAA 960

  5895162 TCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCC 5895221
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTACCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCC 1020

  5895222 ATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTA 5895281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTA 1080

  5895282 TCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCT 5895341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCT 1140

  5895342 CACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCAC 5895401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCAC 1200

  5895402 TGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATC 5895461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATC 1260

  5895462 AAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCC 5895521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCC 1320

  5895522 CAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATT 5895581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATT 1380

  5895582 TGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGG 5895641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGG 1440

  5895642 ACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTC 5895701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTC 1500

  5895702 TGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGG 5895761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGG 1560

  5895762 GGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGG 5895821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGG 1620

  5895822 AGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGC 5895881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGC 1680

  5895882 CTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGC 5895941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGC 1740

  5895942 TTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAA 5896001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAA 1800

  5896002 TGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTC 5896061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTC 1860

  5896062 ACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAA 5896121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAA 1920

  5896122 ATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATA 5896181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATA 1980

  5896182 CACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCT 5896241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCT 2040

  5896242 GATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCA 5896301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCA 2100

  5896302 TTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAG 5896361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAG 2160

  5896362 GGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGA 5896421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGA 2220

  5896422 GGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGG 5896481
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2221 GGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGG 2280

  5896482 ATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTG 5896541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTG 2340

  5896542 TCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACA 5896601
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACA 2400

  5896602 ATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTT 5896661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTT 2460

  5896662 GATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAG 5896721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAG 2520

  5896722 AATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGG 5896781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGG 2580

  5896782 AACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAG 5896841
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAG 2640

  5896842 CCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTC 5896901
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2641 CCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTC 2700

  5896902 TTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACA 5896961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACA 2760

  5896962 GCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAA 5897021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||.||||||||||||||
     2761 GCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT---ACTCTAGGGTCGGGAGGAA 2817

  5897022 GAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCAC 5897081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCAC 2877

  5897082 TGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCC 5897141
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCC 2937

  5897142 ACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAG 5897201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAG 2997

  5897202 TTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCG 5897261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCG 3057

  5897262 ACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTC 5897321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTC 3117

  5897322 AACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTG 5897381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTG 3177

  5897382 AACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCC 5897441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCC 3237

  5897442 CCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAG 5897501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAG 3297

  5897502 CCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAG 5897561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAG 3357

  5897562 CACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGC 5897621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 CACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGC 3417

  5897622 CCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACAC 5897681
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CCTCTTGCAGGGAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 3477

  5897682 ACACACACACACACAGAGAGAGAGAG---AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTC 5897738
          |||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ACACACACACACACA-----------CACAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTC 3526

  5897739 GGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGT 5897798
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 GGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGT 3586

  5897799 TTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTAC 5897858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 TTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTAC 3646

  5897859 AGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGAC 5897918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3647 AGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGAC 3706

  5897919 CTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCA 5897978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 CTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCA 3766

  5897979 TACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTA 5898038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 TACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTA 3826

  5898039 GATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGA 5898098
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 GATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGA 3886

  5898099 GTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACA 5898158
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3887 GTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACA 3946

  5898159 GAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTT 5898218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 GAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTT 4006

  5898219 CCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGG 5898278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 CCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGG 4066

  5898279 GTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGA 5898338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 GTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGA 4126

  5898339 CTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACT 5898398
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4127 CTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACT 4186

  5898399 CCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 CCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 4235

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 4295

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4296 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 4355

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 4415

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 4475

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4476 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 4535

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 4595

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 4655

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 4715

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 4775

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 4835

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 4895

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 4955

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5015

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5075

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5135

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5136 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5195

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5255

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5315

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5375

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5435

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5495

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5555

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5556 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 5615

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5675

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5735

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5795

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5855

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5915

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5975

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5976 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 6035

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6036 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 6095

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     6096 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 6155

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 6215

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6216 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 6275

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6276 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 6335

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6336 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 6395

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6396 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 6455

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6456 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 6515

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6516 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 6575

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6576 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 6635

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6636 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 6695

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6696 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 6755

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6756 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 6815

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6816 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 6875

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6876 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 6935

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6936 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 6995

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6996 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 7055

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7056 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 7115

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7116 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 7175

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7176 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 7235

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7236 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 7295

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7296 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 7355

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7356 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 7415

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7416 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 7475

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7476 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 7535

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7536 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 7595

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7596 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 7655

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7656 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 7715

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7716 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 7775

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7776 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 7835

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7836 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 7895

  5902520 ACATCATGATGGGTC 5902534
          |||||||||||||||
     7896 ACATCATGATGGGTC 7910

Alignment time is 5.61992 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3675] =>      3675 nucs 'mol-32-2ee6-061075_3675'

Score:        3574
Aligned:      3651        nucs
Identic:      3644 (100%) nucs =>      1887 (100%)      1757 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5898876,5900769] EXCISED REGION [5900778,5902534]
 second seq =>  [      1,   1894] EXCISED REGION [   1919,   3675]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [5900770,5900777]
 second seq =>        24 nucs [1895,1918]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5900770,5900770] to [5900778,5900778]
 second seq =>         1 nucs [1894,1894] to [1918,1918]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5900769,5900769] to [5900778,5900778]
 second seq =>         1 nucs [1894,1894] to [1919,1919]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5900770,5900772] to [5900775,5900777]
 second seq =>         0 nucs

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 60

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
       61 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 120

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 180

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 240

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      241 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 300

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 360

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 420

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 480

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 540

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 600

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 660

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 720

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 780

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 840

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 900

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      901 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 960

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1020

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1080

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1140

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1200

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1260

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 1320

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1321 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 1380

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 1440

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 1500

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 1560

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 1620

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 1680

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 1740

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 1800

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 1860

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 5900769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 1894

EXCISED REGION

  5900778 CCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTC 5900837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTC 1978

  5900838 AAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAG 5900897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAG 2038

  5900898 AAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATG 5900957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATG 2098

  5900958 TCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGT 5901017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGT 2158

  5901018 GCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAA 5901077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAA 2218

  5901078 ACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAG 5901137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAG 2278

  5901138 TCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTA 5901197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTA 2338

  5901198 AAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAAT 5901257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAAT 2398

  5901258 GTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACAT 5901317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACAT 2458

  5901318 CCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAAT 5901377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAAT 2518

  5901378 ATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGC 5901437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGC 2578

  5901438 ACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATAT 5901497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATAT 2638

  5901498 ATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAA 5901557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAA 2698

  5901558 TTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGA 5901617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGA 2758

  5901618 AACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATA 5901677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATA 2818

  5901678 GATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATG 5901737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATG 2878

  5901738 AGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTG 5901797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTG 2938

  5901798 ACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATC 5901857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATC 2998

  5901858 TATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCT 5901917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCT 3058

  5901918 ATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAAT 5901977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAAT 3118

  5901978 AATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTG 5902037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTG 3178

  5902038 GGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGAT 5902097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGAT 3238

  5902098 ATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACA 5902157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACA 3298

  5902158 TGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATT 5902217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATT 3358

  5902218 ATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATAT 5902277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATAT 3418

  5902278 TGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGC 5902337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGC 3478

  5902338 TCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTA 5902397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTA 3538

  5902398 GAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTA 5902457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTA 3598

  5902458 AATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAG 5902517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAG 3658

  5902518 TGACATCATGATGGGTC 5902534
          |||||||||||||||||
     3659 TGACATCATGATGGGTC 3675

Alignment time is 2.64188 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   7954] =>      7954 nucs 'mol-32-2ee6-171241_7954'

Score:        7911
Aligned:      7955        nucs
Identic:      7951 (100%) nucs =>       374 (100%)      7577 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897275,5897649] EXCISED REGION [5897652,5905231]
 second seq =>  [      1,    375] EXCISED REGION [    376,   7954]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [5897650,5897651]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        45 nucs [5897650,5897694] to [5897652,5897696]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5897275 AAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAG 5897334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAG 60

  5897335 GTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCT 5897394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCT 120

  5897395 ATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGG 5897454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGG 180

  5897455 TGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCA 5897514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCA 240

  5897515 ATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGG 5897574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGG 300

  5897575 TGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGA 5897634
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAGTTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGA 360

  5897635 AACACACACACACAT 5897649
          |||||||||||||||
      361 AACACACACACACAT 375

EXCISED REGION

  5897652 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAG 5897711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAG 435

  5897712 AGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGA 5897771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 AGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGA 495

  5897772 TCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTC 5897831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 TCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTC 555

  5897832 ATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATT 5897891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 ATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATT 615

  5897892 ACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTC 5897951
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 ACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTC 675

  5897952 TAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCA 5898011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 TAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCA 735

  5898012 CAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTT 5898071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 CAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTT 795

  5898072 TGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCT 5898131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 TGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCT 855

  5898132 AAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTG 5898191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 AAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTG 915

  5898192 GCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTAC 5898251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 GCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTAC 975

  5898252 CCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAA 5898311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 CCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAA 1035

  5898312 GTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCC 5898371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 GTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCC 1095

  5898372 ACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAAT 5898431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 ACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAAT 1155

  5898432 CTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCA 5898491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCA 1215

  5898492 GCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATG 5898551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 GCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATG 1275

  5898552 TCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCA 5898611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 TCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCA 1335

  5898612 CTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGT 5898671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGT 1395

  5898672 CAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTG 5898731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 CAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTG 1455

  5898732 GCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGG 5898791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGG 1515

  5898792 CTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCT 5898851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCT 1575

  5898852 GTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTC 5898911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 GTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTC 1635

  5898912 ACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGC 5898971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 ACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGC 1695

  5898972 GTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCG 5899031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 GTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCG 1755

  5899032 GCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACT 5899091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 GCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACT 1815

  5899092 GTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAG 5899151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 GTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAG 1875

  5899152 CAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTG 5899211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 CAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTG 1935

  5899212 CTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGG 5899271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 CTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGG 1995

  5899272 GCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCA 5899331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 GCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCA 2055

  5899332 GAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCA 5899391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 GAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCA 2115

  5899392 AACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTC 5899451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 AACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTC 2175

  5899452 ATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTT 5899511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 ATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTT 2235

  5899512 GCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTC 5899571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     2236 GCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCC-TTTC 2294

  5899572 AGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTG 5899631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 AGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTG 2354

  5899632 GCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACC 5899691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 GCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACC 2414

  5899692 TCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTG 5899751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 TCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTG 2474

  5899752 GGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCC 5899811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 GGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCC 2534

  5899812 ATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGA 5899871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 ATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGA 2594

  5899872 CCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTC 5899931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTC 2654

  5899932 TGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTT 5899991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 TGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTT 2714

  5899992 TCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGA 5900051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 TCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGA 2774

  5900052 AGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATT 5900111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 AGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATT 2834

  5900112 TCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGA 5900171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 TCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGA 2894

  5900172 TGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCA 5900231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 TGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCA 2954

  5900232 GCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTA 5900291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 GCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTA 3014

  5900292 GGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAAC 5900351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 GGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAAC 3074

  5900352 TGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTA 5900411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 TGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTA 3134

  5900412 TTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGC 5900471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 TTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGC 3194

  5900472 AGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACT 5900531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 AGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACT 3254

  5900532 AGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCT 5900591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 AGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCT 3314

  5900592 CCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTC 5900651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 CCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTC 3374

  5900652 GTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTG 5900711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 GTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTG 3434

  5900712 GGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCT 5900771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 GGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCT 3494

  5900772 GCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTG 5900831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 GCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTG 3554

  5900832 ATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAA 5900891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 ATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAA 3614

  5900892 TTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGA 5900951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 TTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGA 3674

  5900952 TAGATGTCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAA 5901011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 TAGATGTCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAA 3734

  5901012 CCAAGTGCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTA 5901071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 CCAAGTGCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTA 3794

  5901072 TCAGAAACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAAT 5901131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 TCAGAAACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAAT 3854

  5901132 GGCTAGTCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCA 5901191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 GGCTAGTCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCA 3914

  5901192 TGACTAAAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTA 5901251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 TGACTAAAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTA 3974

  5901252 GGGAATGTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTT 5901311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 GGGAATGTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTT 4034

  5901312 GAACATCCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTG 5901371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 GAACATCCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTG 4094

  5901372 TATAATATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACT 5901431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 TATAATATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACT 4154

  5901432 TATTGCACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATAT 5901491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 TATTGCACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATAT 4214

  5901492 TTATATATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAA 5901551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 TTATATATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAA 4274

  5901552 CTGAAATTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAA 5901611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 CTGAAATTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAA 4334

  5901612 TTCAGAAACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGA 5901671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 TTCAGAAACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGA 4394

  5901672 CATATAGATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGA 5901731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 CATATAGATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGA 4454

  5901732 GGGATGAGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAA 5901791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 GGGATGAGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAA 4514

  5901792 GCACTGACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCC 5901851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 GCACTGACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCC 4574

  5901852 CAAATCTATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATAT 5901911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 CAAATCTATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATAT 4634

  5901912 ATATCTATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAAT 5901971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 ATATCTATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAAT 4694

  5901972 ATAAATAATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCT 5902031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 ATAAATAATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCT 4754

  5902032 TCCTTGGGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCA 5902091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 TCCTTGGGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCA 4814

  5902092 TTTGATATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGA 5902151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 TTTGATATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGA 4874

  5902152 AGTACATGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATG 5902211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 AGTACATGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATG 4934

  5902212 CTAATTATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGT 5902271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 CTAATTATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGT 4994

  5902272 TCATATTGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGG 5902331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 TCATATTGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGG 5054

  5902332 GATGGCTCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGG 5902391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 GATGGCTCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGG 5114

  5902392 CACCTAGAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAA 5902451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 CACCTAGAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAA 5174

  5902452 ATATTAAATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAG 5902511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 ATATTAAATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAG 5234

  5902512 TACCAGTGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGA 5902571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 TACCAGTGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGA 5294

  5902572 ATAGCATAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAG 5902631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 ATAGCATAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAG 5354

  5902632 AGATTCCAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAG 5902691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 AGATTCCAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAG 5414

  5902692 AGGGAAAGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTC 5902751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 AGGGAAAGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTC 5474

  5902752 ATGCCCCTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCA 5902811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 ATGCCCCTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCA 5534

  5902812 AGCCCAGCTCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTC 5902871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 AGCCCAGCTCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTC 5594

  5902872 CCCGATTCCCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATG 5902931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 CCCGATTCCCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATG 5654

  5902932 ATTCATGAGCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTG 5902991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 ATTCATGAGCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTG 5714

  5902992 TTTGTCACTGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAG 5903051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 TTTGTCACTGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAG 5774

  5903052 CATCCTTCCCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACAC 5903111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 CATCCTTCCCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACAC 5834

  5903112 TGAGTTTCTATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCAT 5903171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 TGAGTTTCTATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCAT 5894

  5903172 ATCAGTCTCTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGA 5903231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 ATCAGTCTCTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGA 5954

  5903232 TGTGTGCAGATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGAC 5903291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 TGTGTGCAGATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGAC 6014

  5903292 CCTATTATAGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCA 5903351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 CCTATTATAGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCA 6074

  5903352 CCCACAAGCTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCC 5903411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 CCCACAAGCTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCC 6134

  5903412 CAGGCTGGAGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAG 5903471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 CAGGCTGGAGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAG 6194

  5903472 CGATTCTGCTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTG 5903531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 CGATTCTGCTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTG 6254

  5903532 GCCAATTTTTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTT 5903591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 GCCAATTTTTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTT 6314

  5903592 CGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGG 5903651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6315 CGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGG 6374

  5903652 CGTGAGCCACCGTGCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAA 5903711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6375 CGTGAGCCACCGTGCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAA 6434

  5903712 TTAAATAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACA 5903771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6435 TTAAATAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACA 6494

  5903772 TGTATATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGC 5903831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6495 TGTATATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGC 6554

  5903832 CCATATCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAG 5903891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6555 CCATATCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAG 6614

  5903892 AGAGAGAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCG 5903951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6615 AGAGAGAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCG 6674

  5903952 CCCAGGCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTA 5904011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6675 CCCAGGCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTA 6734

  5904012 TAATTTTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTG 5904071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6735 TAATTTTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTG 6794

  5904072 TGCCATGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTA 5904131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6795 TGCCATGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTA 6854

  5904132 TATATAAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTT 5904191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6855 TATATAAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTT 6914

  5904192 CCTCTTTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGA 5904251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6915 CCTCTTTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGA 6974

  5904252 CTTTTAATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCG 5904311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6975 CTTTTAATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCG 7034

  5904312 ATTAAGCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATA 5904371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7035 ATTAAGCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATA 7094

  5904372 ATTTTCATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTT 5904431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7095 ATTTTCATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTT 7154

  5904432 TCCACCAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCT 5904491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7155 TCCACCAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCT 7214

  5904492 AAGGATAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGT 5904551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7215 AAGGATAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGT 7274

  5904552 GTTTGCTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAG 5904611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7275 GTTTGCTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAG 7334

  5904612 TGTTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTAGTCAGGGAC 5904671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7335 TGTTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTAGTCAGGGAC 7394

  5904672 AGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAAGCTTTTTGT 5904731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7395 AGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAAGCTTTTTGT 7454

  5904732 AGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATCTTTACTTTT 5904791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7455 AGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATCTTTACTTTT 7514

  5904792 CCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCATGTTTAAAG 5904851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7515 CCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCATGTTTAAAG 7574

  5904852 AAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTCTTCTAAAGG 5904911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7575 AAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTCTTCTAAAGG 7634

  5904912 TCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCTACCCTGGGA 5904971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7635 TCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCTACCCTGGGA 7694

  5904972 CATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAATGATCTCCA 5905031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7695 CATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAATGATCTCCA 7754

  5905032 CACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGCCTTGGTCCC 5905091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7755 CACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGCCTTGGTCCC 7814

  5905092 CCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCGTGGTTTCTG 5905151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7815 CCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCGTGGTTTCTG 7874

  5905152 GAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGTTACTTCCTT 5905211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     7875 GAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGTTACATCCTT 7934

  5905212 GTGTGGGAACTTGCAAAGGC 5905231
          ||||||||||||||||||||
     7935 GTGTGGGAACTTGCAAAGGC 7954

Alignment time is 5.73423 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   5547] =>      5547 nucs 'mol-32-2efc-106637_5547'

Score:        5240
Aligned:      5566        nucs
Identic:      5511 ( 99%) nucs =>      2953 ( 99%)      2558 ( 99%)
Gaps:           35 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5895464,5898447] EXCISED REGION [5898876,5901441]
 second seq =>  [      1,   2965] EXCISED REGION [   2966,   5547]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5895464 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCA 5895523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCA 60

  5895524 GCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTG 5895583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTG 120

  5895584 CCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGAC 5895643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGAC 180

  5895644 AGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTG 5895703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTG 240

  5895704 GGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGG 5895763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGG 300

  5895764 AACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAG 5895823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAG 360

  5895824 AAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCT 5895883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCT 420

  5895884 CTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTT 5895943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTT 480

  5895944 ATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATG 5896003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATG 540

  5896004 AAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCAC 5896063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCAC 600

  5896064 ACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAAT 5896123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAAT 660

  5896124 TGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACA 5896183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACA 720

  5896184 CTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGA 5896243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGA 780

  5896244 TGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATT 5896303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATT 840

  5896304 GATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGG 5896363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGG 900

  5896364 GTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGG 5896423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGG 960

  5896424 TGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGAT 5896483
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      961 TGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGAT 1020

  5896484 TTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTC 5896543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTC 1080

  5896544 ATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAAT 5896603
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAAT 1140

  5896604 ATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGA 5896663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGA 1200

  5896664 TAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAA 5896723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAA 1260

  5896724 TTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAA 5896783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAA 1320

  5896784 CAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCC 5896843
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCC 1380

  5896844 CCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTT 5896903
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1381 CCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTT 1440

  5896904 TTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGC 5896963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGC 1500

  5896964 ACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGA 5897023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||.||||||||||||||||
     1501 ACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGA 1555

  5897024 GGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTG 5897083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1556 GGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAG 1615

  5897084 ACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCAC 5897143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 ACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCAC 1675

  5897144 ATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTT 5897203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 ATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTT 1735

  5897204 TGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGAC 5897263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGAC 1795

  5897264 CGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAA 5897323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAA 1855

  5897324 CTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAA 5897383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 CTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAA 1915

  5897384 CCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCC 5897443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCC 1975

  5897444 TCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCC 5897503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCC 2035

  5897504 AGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCA 5897563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 AGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCA 2095

  5897564 CCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCC 5897623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCC 2155

  5897624 TCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACAC 5897683
          |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TCTTGCAGGGAAACACACACACACA--CACACACACACACACACACACACACACACACAC 2213

  5897684 ACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGA 5897743
          ||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||
     2214 ACACACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGA 2261

  5897744 GCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTT 5897803
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTT 2321

  5897804 AGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCC 5897863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 AGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCC 2381

  5897864 TAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCAC 5897923
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2382 TAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCAC 2441

  5897924 AGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCA 5897983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCA 2501

  5897984 TAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTT 5898043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTT 2561

  5898044 TTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGA 5898103
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGA 2621

  5898104 AGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGT 5898163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2622 AGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGT 2681

  5898164 TTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGT 5898223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 TTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGT 2741

  5898224 TGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCT 5898283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCT 2801

  5898284 GGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCC 5898343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 GGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCC 2861

  5898344 AGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATT 5898403
          ||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2862 AGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATT 2921

  5898404 TATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 2965

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 3025

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3026 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 3085

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 3145

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 3205

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3206 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 3265

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 3325

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 3385

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 3445

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 3505

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 3565

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 3625

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 3685

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 3745

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 3805

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 3865

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3866 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 3925

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 3985

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 4045

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 4105

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 4165

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 4225

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 4285

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4286 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 4345

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 4405

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 4465

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 4525

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 4585

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 4645

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 4705

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 4765

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 4825

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     4826 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 4885

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 4945

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5005

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5065

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5125

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5185

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5245

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5305

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5365

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5425

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5485

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5545

  5901440 AC 5901441
          ||
     5546 AC 5547

Alignment time is 3.99576 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   2582] =>      2582 nucs 'mol-32-2efc-106637_2582'

Score:        2481
Aligned:      2558        nucs
Identic:      2551 (100%) nucs =>      1887 (100%)       664 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5898876,5900769] EXCISED REGION [5900778,5901441]
 second seq =>  [      1,   1894] EXCISED REGION [   1919,   2582]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [5900770,5900777]
 second seq =>        24 nucs [1895,1918]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5900770,5900770] to [5900778,5900778]
 second seq =>         1 nucs [1894,1894] to [1918,1918]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5900769,5900769] to [5900778,5900778]
 second seq =>         1 nucs [1894,1894] to [1919,1919]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5900770,5900772] to [5900775,5900777]
 second seq =>         0 nucs

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 60

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
       61 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 120

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 180

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 240

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      241 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 300

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 360

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 420

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 480

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 540

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 600

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 660

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 720

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 780

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 840

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 900

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      901 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 960

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1020

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1080

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1140

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1200

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1260

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 1320

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1321 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 1380

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 1440

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 1500

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 1560

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 1620

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 1680

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 1740

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 1800

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 1860

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 5900769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 1894

EXCISED REGION

  5900778 CCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTC 5900837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTC 1978

  5900838 AAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAG 5900897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAG 2038

  5900898 AAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATG 5900957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATG 2098

  5900958 TCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGT 5901017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGT 2158

  5901018 GCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAA 5901077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAA 2218

  5901078 ACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAG 5901137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAG 2278

  5901138 TCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTA 5901197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTA 2338

  5901198 AAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAAT 5901257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAAT 2398

  5901258 GTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACAT 5901317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACAT 2458

  5901318 CCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAAT 5901377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAAT 2518

  5901378 ATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGC 5901437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGC 2578

  5901438 ACAC 5901441
          ||||
     2579 ACAC 2582

Alignment time is 1.88032 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   8219] =>      8219 nucs 'mol-32-2f33-094044_8219'

Score:        7897
Aligned:      8216        nucs
Identic:      8160 ( 99%) nucs =>       396 ( 99%)      7764 ( 99%)
Gaps:           36 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5898049,5898447] EXCISED REGION [5898876,5906659]
 second seq =>  [      7,    405] EXCISED REGION [    406,   8219]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5898049 TATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATG 5898108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 TATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATG 66

  5898109 TTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCC 5898168
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
       67 TTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCC 126

  5898169 AGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCT 5898228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 AGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCT 186

  5898229 TTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCA 5898288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 TTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCA 246

  5898289 CCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAG 5898348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 CCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAG 306

  5898349 GGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTA 5898408
          |||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 GGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTA 366

  5898409 CATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 CATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 405

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      406 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 465

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      466 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 525

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 585

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 645

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      646 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 705

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 765

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 825

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 885

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 945

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 1005

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 1065

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 1125

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 1185

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 1245

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 1305

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1306 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 1365

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1425

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1485

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1545

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1605

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1665

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 1725

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1726 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 1785

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 1845

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 1905

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 1965

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 2025

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 2085

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 2145

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 2205

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 2265

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     2266 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 2325

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 2385

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 2445

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 2505

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 2565

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 2625

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 2685

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 2745

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 2805

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 2865

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 2925

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 2985

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 3045

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 3105

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 3165

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 3225

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 3285

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 3345

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 3405

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 3465

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 3525

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 3585

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 3645

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 3705

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 3765

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 3825

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 3885

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 3945

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 4005

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 4065

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 4125

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 4185

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 4245

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 4305

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 4365

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 4425

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 4485

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 4545

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 4605

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 4665

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 4725

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 4785

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 4845

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 4905

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 4965

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5025

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5085

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5145

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5205

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5262

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5322

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5382

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5442

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5443 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5502

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5503 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5562

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5622

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5682

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5742

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5802

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5862

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5922

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5982

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 6042

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 6102

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 6162

  5904617 A--------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 5904662
          |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 6222

  5904663 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 5904722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 6282

  5904723 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 5904782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 6342

  5904783 TTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 5904842
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 TTTACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 6402

  5904843 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 5904902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 6462

  5904903 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 5904962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 6522

  5904963 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 5905022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 6582

  5905023 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 5905082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 6642

  5905083 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 5905142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 6702

  5905143 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 5905202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 6762

  5905203 TACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 5905262
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 TACTTCTTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 6822

  5905263 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 5905322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 6882

  5905323 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 5905382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 6942

  5905383 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 5905442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 7002

  5905443 AGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 5905502
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 AGGGCTTCATGTCCCAAGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 7062

  5905503 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 5905562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 7122

  5905563 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAA 5905622
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7123 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTTTGTGTCATCGAGGGAA 7182

  5905623 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 5905682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 7242

  5905683 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 5905742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7243 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 7302

  5905743 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 5905802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 7362

  5905803 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 5905862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 7422

  5905863 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 5905922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 7482

  5905923 AATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTC 5905982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 AATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTC 7542

  5905983 CAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGC 5906042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7543 CAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGC 7602

  5906043 AGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCA 5906102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 AGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCA 7662

  5906103 GCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCA 5906162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 GCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCA 7722

  5906163 GTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACC 5906222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 GTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACC 7782

  5906223 GGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATA 5906282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 GGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATA 7842

  5906283 GAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTA 5906342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 GAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTA 7902

  5906343 TTCTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTG 5906402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7903 TTCTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTG 7962

  5906403 GACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGA 5906462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7963 GACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGA 8022

  5906463 CTTGTCTTCATGGATCTGAAAGGCATTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCT 5906522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8023 CTTGTCTTCATGGATCTGAAAGGCATTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCT 8082

  5906523 GGTCCTCGGCTTCCTAGTGGTGGGATCACTCGCTTCCCGATCTCTGCATCTCAGCTGTGG 5906582
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8083 GGTCCTTGGCTTCCTAGTGGTGGGATCACTCGCTTCCCGATCTCTGCATCTCAGCTGTGG 8142

  5906583 CTTCTTACTCTTGAGCTCAGCAGTTCCAAGGCCATCTCCTGGAGTCCTTCCTCCAGCCCT 5906642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8143 CTTCTTACTCTTGAGCTCAGCAGTTCCAAGGCCATCTCCTGGAGTCCTTCCTCCAGCCCT 8202

  5906643 TCCAATGCATTACATTT 5906659
          |||||||||||||||||
     8203 TCCAATGCATTACATTT 8219

Alignment time is 5.89191 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   8787] =>      8787 nucs 'mol-32-2fcd-020262_8787'

Score:        8341
Aligned:      8818        nucs
Identic:      8728 ( 99%) nucs =>      2503 ( 98%)      6225 ( 99%)
Gaps:           64 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5895904,5898447] EXCISED REGION [5898876,5905116]
 second seq =>  [      1,   2516] EXCISED REGION [   2517,   8787]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5895904 AGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGC 5895963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGC 60

  5895964 CCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGC 5896023
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCATGG-TCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGC 119

  5896024 CATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAA 5896083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 CATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAA 179

  5896084 CAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAG 5896143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 CAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAG 239

  5896144 AGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAA 5896203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 AGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAA 299

  5896204 TTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATA 5896263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATA 359

  5896264 ACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTG 5896323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 ACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTG 419

  5896324 TCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGT 5896383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGT 479

  5896384 GTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAA 5896443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAA 539

  5896444 GAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATC 5896503
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATC 599

  5896504 GAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTA 5896563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      600 GAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGTTA 659

  5896564 GCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGG 5896623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGG 719

  5896624 ATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTG 5896683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTG 779

  5896684 GTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTA 5896743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTA 839

  5896744 GTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGA 5896803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      840 GTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGA 899

  5896804 TTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAAC 5896863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAAC 959

  5896864 ACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGA 5896923
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      960 ACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGA 1019

  5896924 CAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATT 5896983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATT 1079

  5896984 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCT 5897043
          ||||||||||||||     ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCT 1134

  5897044 CTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGAT 5897103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1135 CTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGAT 1194

  5897104 GCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATT 5897163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 GCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATT 1254

  5897164 GATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAG 5897223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1255 GATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTCACCTAGGAAACCGAG 1314

  5897224 GGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATC 5897283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 GGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATC 1374

  5897284 AACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATT 5897343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 AACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATT 1434

  5897344 TATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGG 5897403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGG 1494

  5897404 GGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCC 5897463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 GGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCC 1554

  5897464 AGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAG 5897523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 AGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAG 1614

  5897524 CCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTG 5897583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTG 1674

  5897584 CAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACAC 5897643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 CAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACAC 1734

  5897644 ACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAG 5897703
          |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 ACACA----------CACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAG 1784

  5897704 AGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAA 5897763
          ||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 AGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAA 1832

  5897764 ACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAA 5897823
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 ACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAA 1892

  5897824 TAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAA 5897883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 TAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAA 1952

  5897884 GGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAG 5897943
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 GGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAG 2012

  5897944 GCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGG 5898003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 GCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGG 2072

  5898004 ATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGAT 5898063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2073 ATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGAT 2132

  5898064 TAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTG 5898123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 TAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTG 2192

  5898124 AAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTT 5898183
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 AAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTT 2252

  5898184 CTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTA 5898243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 CTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTA 2312

  5898244 GCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTC 5898303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 GCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTC 2372

  5898304 TATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCA 5898363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2373 TATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCA 2432

  5898364 GTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATG 5898423
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 GTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATG 2492

  5898424 TTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||
     2493 TTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 2516

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 2576

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2577 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 2636

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 2696

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 2756

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2757 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 2816

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 2876

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 2936

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 2996

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 3056

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 3116

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 3176

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 3236

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 3296

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 3356

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 3416

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3417 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 3476

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 3536

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 3596

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 3656

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 3716

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 3776

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 3836

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3837 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 3896

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 3956

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 4016

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 4076

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 4136

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 4196

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 4256

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 4316

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 4376

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     4377 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 4436

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 4496

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 4556

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 4616

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 4676

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 4736

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 4796

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 4856

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 4916

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 4976

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5036

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5096

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5156

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5216

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5276

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5336

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5396

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5456

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5516

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5576

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5636

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5696

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5756

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5816

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5876

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5936

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5996

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 6056

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 6116

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 6176

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 6236

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 6296

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 6356

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 6416

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 6476

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 6536

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 6596

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 6656

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 6716

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 6776

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 6836

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 6896

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 6956

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 7016

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 7076

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 7136

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 7196

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 7256

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 7316

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 7373

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 7433

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 7493

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 7553

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7554 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 7613

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7614 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 7673

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 7733

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 7793

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7794 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 7853

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 7913

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 7973

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 8033

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 8093

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 8153

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8154 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 8213

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8214 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 8273

  5904617 A--------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 5904662
          |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8274 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 8333

  5904663 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 5904722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8334 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 8393

  5904723 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 5904782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8394 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 8453

  5904783 TTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 5904842
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8454 TTTACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 8513

  5904843 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 5904902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8514 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 8573

  5904903 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 5904962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8574 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 8633

  5904963 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 5905022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8634 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 8693

  5905023 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 5905082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8694 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 8753

  5905083 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTAC 5905116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8754 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTAC 8787

Alignment time is 6.21151 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   2518] =>      2518 nucs 'mol-32-2fcd-020262_2518'

Score:        2340
Aligned:      2524        nucs
Identic:      2504 ( 99%) nucs =>      1768 ( 99%)       736 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5895904,5897685] EXCISED REGION [5897708,5898449]
 second seq =>  [      1,   1776] EXCISED REGION [   1777,   2518]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        22 nucs [5897686,5897707]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>        20 nucs [5897688,5897707]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5897686,5897686] to [5897708,5897708]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5895904 AGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGC 5895963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGC 60

  5895964 CCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGC 5896023
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCATGG-TCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGC 119

  5896024 CATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAA 5896083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 CATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAA 179

  5896084 CAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAG 5896143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 CAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAG 239

  5896144 AGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAA 5896203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 AGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAA 299

  5896204 TTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATA 5896263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATA 359

  5896264 ACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTG 5896323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 ACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTG 419

  5896324 TCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGT 5896383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGT 479

  5896384 GTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAA 5896443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAA 539

  5896444 GAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATC 5896503
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATC 599

  5896504 GAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTA 5896563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      600 GAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGTTA 659

  5896564 GCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGG 5896623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGG 719

  5896624 ATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTG 5896683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTG 779

  5896684 GTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTA 5896743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTA 839

  5896744 GTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGA 5896803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      840 GTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGA 899

  5896804 TTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAAC 5896863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAAC 959

  5896864 ACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGA 5896923
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      960 ACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGA 1019

  5896924 CAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATT 5896983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATT 1079

  5896984 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCT 5897043
          ||||||||||||||     ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCT 1134

  5897044 CTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGAT 5897103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1135 CTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGAT 1194

  5897104 GCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATT 5897163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 GCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATT 1254

  5897164 GATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAG 5897223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1255 GATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTCACCTAGGAAACCGAG 1314

  5897224 GGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATC 5897283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 GGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATC 1374

  5897284 AACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATT 5897343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 AACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATT 1434

  5897344 TATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGG 5897403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGG 1494

  5897404 GGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCC 5897463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 GGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCC 1554

  5897464 AGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAG 5897523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 AGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAG 1614

  5897524 CCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTG 5897583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTG 1674

  5897584 CAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACAC 5897643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 CAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACAC 1734

  5897644 ACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 5897685
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 1776

EXCISED REGION

  5897708 AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACAT 5897767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACAT 1836

  5897768 TTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAA 5897827
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 CTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAA 1896

  5897828 CCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAA 5897887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 CCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAA 1956

  5897888 AATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCT 5897947
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCT 2016

  5897948 TCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATAT 5898007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATAT 2076

  5898008 TGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGC 5898067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2077 TGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGC 2136

  5898068 CTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAA 5898127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 CTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAA 2196

  5898128 GCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGT 5898187
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 GCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGT 2256

  5898188 GCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTC 5898247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 GCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTC 2316

  5898248 TTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATC 5898307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 TTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATC 2376

  5898308 CCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGG 5898367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2377 CCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGG 2436

  5898368 ATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCT 5898427
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 ATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCT 2496

  5898428 GAATCTAGGGTAGAGGGCAGCA 5898449
          ||||||||||||||||||||||
     2497 GAATCTAGGGTAGAGGGCAGCA 2518

Alignment time is 1.80364 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   6240] =>      6240 nucs 'mol-32-3004-012160_6240'

Score:        5904
Aligned:      6259        nucs
Identic:      6185 ( 99%) nucs =>      5902 ( 99%)       283 (100%)
Gaps:           56 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5892510,5898447] EXCISED REGION [5898876,5899159]
 second seq =>  [      1,   5956] EXCISED REGION [   5957,   6240]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5892510 TGCGCCCGCTCTCTGGCACTCCCTAGTGAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAG 5892569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCGCCCGCTCTCTGGCACTCCCTAGTGAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAG 60

  5892570 AAATCACC-GTCTTCTGCGTCGCTCACGCTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTC 5892628
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATCACCAGTCTTCTGCGTCGCTCACGCTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTC 120

  5892629 GGCCATCTTGGCTCCTCCAGGCCAATTTACTTTCAAAAATACCTGCATCCAGGAACTCTC 5892688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCCATCTTGGCTCCTCCAGGCCAATTTACTTTCAAAAATACCTGCATCCAGGAACTCTC 180

  5892689 ATGCTAGCAGGATGAGGTAATGACTATTTCCCATACTCGTGTCAACTTTGAGCAATGCTA 5892748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGCTAGCAGGATGAGGTAATGACTATTTCCCATACTCGTGTCAACTTTGAGCAATGCTA 240

  5892749 GGAATTTCCATATGTCCAAACAACTGTTTATCAGGAAATGCAACAAGGTACTTTTGACAC 5892808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAATTTCCATATGTCCAAACAACTGTTTATCAGGAAATGCAACAAGGTACTTTTGACAC 300

  5892809 TGAGCGTGAAAGGAACTCATTGAACCAAAATCTTCCAAAAAGACTGGAACATAAGAGAGC 5892868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGCGTGAAAGGAACTCATTGAACCAAAATCTTCCAAAAAGACTGGAACATAAGAGAGC 360

  5892869 GGATGAAGAGCATAATAGAAGAGAAGTGCCAGGGAGGAGGATTATCTTAGGCAGAGCACA 5892928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATGAAGAGCATAATAGAAGAGAAGTGCCAGGGAGGAGGATTATCTTAGGCAGAGCACA 420

  5892929 CTGAGGATGGAGAGTTACCAGCCCTCCCGAGCTGTCGTTGGCACTGAACCAATGAGAGCC 5892988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGAGGATGGAGAGTTACCAGCCCTCCCGAGCTGTCGTTGGCACTGAACCAATGAGAGCC 480

  5892989 ATTCATGTGCCTGTCTGTGCCTTGTGTTTTTCTTCTTCAACATATACTTTAGAACATCCA 5893048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCATGTGCCTGTCTGTGCCTTGTGTTTTTCTTCTTCAACATATACTTTAGAACATCCA 540

  5893049 TTCTGTGCAAAGCTCTGTGCCCACAGCTGTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCC 5893108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTGTGCAAAGCTCTGTGCCCACAGCTGTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCC 600

  5893109 CTGAAGACCCCAGCAGTCAGGCCAGGGAGAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGT 5893168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAAGACCCCAGCAGTCAGGCCAGGGAGAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGT 660

  5893169 CCCTGGGGAAAGGTGAGTGGTGCCCGATGAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGG 5893228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTGGGGAAAGGTGAGTGGTGCCCGATGAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGG 720

  5893229 GCTACAGTGGTCAGGAAAGGCTTTGGAATAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTG 5893288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTACAGTGGTCAGGAAAGGCTTTGGAATAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTG 780

  5893289 GGTACCACGCAGTGTTTTAAGCACTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATT 5893348
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTACCATGCAGTGTTTTAAGCACTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATT 840

  5893349 AGGTAGGCACTAATAGTACCTACAATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAA 5893408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGTAGGCACTAATAGTACCTACAATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAA 900

  5893409 ATACCTTGCACCAGGTTGCGGAGGTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTG 5893468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATACCTTGCACCAGGTTGCGGAGGTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTG 960

  5893469 GATTCCTTATTAACCGTGATTCTATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAA 5893528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTCCTTATTAACCGTGATTCTATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAA 1020

  5893529 CAAATCACTATGACCATAGTTGCATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTG 5893588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAATCACTATGACCATAGTTGCATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTG 1080

  5893589 GGTCAGGAATTTGGATAGAACACATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCC 5893648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTCAGGAATTTGGATAGAACACATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCC 1140

  5893649 TTGACTGGGTGCATGAACACCGGGGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCAT 5893708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGACTGGGTGCATGAACACCGGGGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCAT 1200

  5893709 CCATGTGTCCAGTAGATGATACTGGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGG 5893768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATGTGTCCAGTAGATGATACTGGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGG 1260

  5893769 AACACCCATACGTGGCCTCTCCAGGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGA 5893828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACACCCATACGTGGCCTCTCCAGGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGA 1320

  5893829 GCAGTCAGACTTCATACACTATGGCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAA 5893888
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCAGTCAGACTTCATACACTATGCCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAA 1380

  5893889 GAGGAAGCAGCATTGCCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACT 5893948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGAAGCAGCATTGCCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACT 1440

  5893949 CAGATTTAACAGGAGGGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAAT 5894008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGATTTAACAGGAGGGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAAT 1500

  5894009 GTCAAAGAATTTGCAGCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGG 5894068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCAAAGAATTTGCAGCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGG 1560

  5894069 TTTACAGCAAAATTGGTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTC 5894128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTACAGCAAAATTGGTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTC 1620

  5894129 CACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTCTCGCTCTGTTG 5894188
          |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACGGCAGTCTTTTTTTTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTCTCGCTCTGTTG 1678

  5894189 CCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAA 5894248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAA 1738

  5894249 GCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCT 5894308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCT 1798

  5894309 GGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCT 5894368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCT 1858

  5894369 TGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCG 5894428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCG 1918

  5894429 TGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTC 5894488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTC 1978

  5894489 CATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTC 5894548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTC 2038

  5894549 GTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGC 5894608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGC 2098

  5894609 CTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCT 5894668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCT 2158

  5894669 TGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTG 5894728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTG 2218

  5894729 CCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGC 5894788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGC 2278

  5894789 CAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCT 5894848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCT 2338

  5894849 TTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGT 5894908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGT 2398

  5894909 AAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATC 5894968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATC 2458

  5894969 CACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCT 5895028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCT 2518

  5895029 TGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACAC 5895088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACAC 2578

  5895089 ATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCC 5895148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCC 2638

  5895149 CAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAG 5895208
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2639 CAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTACCCAATCACAAGTCATCCAG 2698

  5895209 ATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATG 5895268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATG 2758

  5895269 TGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGG 5895328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGG 2818

  5895329 GAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGT 5895388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGT 2878

  5895389 CTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTT 5895448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTT 2938

  5895449 TCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCT 5895508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCT 2998

  5895509 CATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGAT-------------- 5895554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
     2999 CATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGAT 3058

  5895555 ----------------------TCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTC 5895592
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTC 3118

  5895593 AGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGT 5895652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGT 3178

  5895653 GATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGC 5895712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGC 3238

  5895713 GTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAA 5895772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAA 3298

  5895773 GCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCC 5895832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCC 3358

  5895833 CTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTG 5895892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTG 3418

  5895893 TTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGG 5895952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGG 3478

  5895953 CAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTAT 5896012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTAT 3538

  5896013 TGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATG 5896072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATG 3598

  5896073 ACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATT 5896132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 ACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATT 3658

  5896133 TGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAA 5896192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAA 3718

  5896193 AGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAAT 5896252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAAT 3778

  5896253 AATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCG 5896312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCG 3838

  5896313 CCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGA 5896372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGA 3898

  5896373 TGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGA 5896432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGA 3958

  5896433 GGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCA 5896492
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCA 4018

  5896493 CTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTAT 5896552
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4019 CTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTAC 4078

  5896553 GTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGA 5896612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGA 4138

  5896613 TGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAA 5896672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAA 4198

  5896673 AATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTT 5896732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTT 4258

  5896733 GGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTT 5896792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 GGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTT 4318

  5896793 TACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTA 5896852
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTA 4378

  5896853 AGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTA 5896912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4379 AGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTA 4438

  5896913 TCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGA 5896972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGA 4498

  5896973 ACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGG 5897032
          |||||||||||||||||||||||||     ||||.|||||||||||||||||||||||||
     4499 ACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGG 4553

  5897033 CGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCA 5897092
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4554 CGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCA 4613

  5897093 TCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACC 5897152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 TCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACC 4673

  5897153 TCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCT 5897212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 TCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCT 4733

  5897213 AGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTAT 5897272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 AGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTAT 4793

  5897273 TAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCC 5897332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 TAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCC 4853

  5897333 AGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGC 5897392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 AGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGC 4913

  5897393 CTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACT 5897452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 CTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACT 4973

  5897453 GGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCAT 5897512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCAT 5033

  5897513 CAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAAT 5897572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 CAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAAT 5093

  5897573 GGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGG 5897632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 GGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGG 5153

  5897633 GAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 5897692
          |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 GAAACACGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 5213

  5897693 CACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTC 5897752
          |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTC 5261

  5897753 CCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAA 5897812
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 CCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAA 5321

  5897813 AAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTT 5897872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 AAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTT 5381

  5897873 CCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTT 5897932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5382 CCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTT 5441

  5897933 GGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTT 5897992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 GGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTT 5501

  5897993 CAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATA 5898052
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5502 CAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATA 5561

  5898053 AAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGC 5898112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 AAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGC 5621

  5898113 TTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCC 5898172
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5622 TTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCC 5681

  5898173 CCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTT 5898232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 CCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTT 5741

  5898233 CCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTG 5898292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 CCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTG 5801

  5898293 TCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGT 5898352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 TCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGT 5861

  5898353 CTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATG 5898412
          |||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 CTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATG 5921

  5898413 GTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 GTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5956

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 6016

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6017 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 6076

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 6136

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 6196

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 5899159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 6240

Alignment time is 4.44044 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   6395] =>      6395 nucs 'mol-32-301a-151801_6395'

Score:        6129
Aligned:      6412        nucs
Identic:      6374 ( 99%) nucs =>      5882 ( 99%)       492 ( 99%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5892533,5898447] EXCISED REGION [5898876,5899371]
 second seq =>  [      1,   5899] EXCISED REGION [   5900,   6395]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5892533 TAGTGAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAGAAATCACC-GTCTTCTGCGTCGC 5892591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
        1 TAGTGAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAGAAATCACCCGTCTTCTGCGTCGC 60

  5892592 TCACGCTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTGGCTCCTCCAGGCC 5892651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACGCTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTGGCTCCTCCAGGCC 120

  5892652 AATTTACTTTCAAAAATACCTGCATCCAGGAACTCTCATGCTAGCAGGATGAGGTAATGA 5892711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTACTTTCAAAAATACCTGCATCCAGGAACTCTCATGCTAGCAGGATGAGGTAATGA 180

  5892712 CTATTTCCCATACTCGTGTCAACTTTGAGCAATGCTAGGAATTTCCATATGTCCAAACAA 5892771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATTTCCCATACTCGTGTCAACTTTGAGCAATGCTAGGAATTTCCATATGTCCAAACAA 240

  5892772 CTGTTTATCAGGAAATGCAACAAGGTACTTTTGACACTGAGCGTGAAAGGAACTCATTGA 5892831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGTTTATCAGGAAATGCAACAAGGTACTTTTGACACTGAGCGTGAAAGGAACTCATTGA 300

  5892832 ACCAAAATCTTCCAAAAAGACTGGAACATAAGAGAGCGGATGAAGAGCATAATAGAAGAG 5892891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCAAAATCTTCCAAAAAGACTGGAACATAAGAGAGCGGATGAAGAGCATAATAGAAGAG 360

  5892892 AAGTGCCAGGGAGGAGGATTATCTTAGGCAGAGCACACTGAGGATGGAGAGTTACCAGCC 5892951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTGCCAGGGAGGAGGATTATCTTAGGCAGAGCACACTGAGGATGGAGAGTTACCAGCC 420

  5892952 CTCCCGAGCTGTCGTTGGCACTGAACCAATGAGAGCCATTCATGTGCCTGTCTGTGCCTT 5893011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCCGAGCTGTCGTTGGCACTGAACCAATGAGAGCCATTCATGTGCCTGTCTGTGCCTT 480

  5893012 GTGTTTTTCTTCTTCAACATATACTTTAGAACATCCATTCTGTGCAAAGCTCTGTGCCCA 5893071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGTTTTTCTTCTTCAACATATACTTTAGAACATCCATTCTGTGCAAAGCTCTGTGCCCA 540

  5893072 CAGCTGTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCCCTGAAGACCCCAGCAGTCAGGCC 5893131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCTGTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCCCTGAAGACCCCAGCAGTCAGGCC 600

  5893132 AGGGAGAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGTCCCTGGGGAAAGGTGAGTGGTGC 5893191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGGAGAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGTCCCTGGGGAAAGGTGAGTGGTGC 660

  5893192 CCGATGAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGGGCTACAGTGGTCAGGAAAGGCTT 5893251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCGATGAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGGGCTACAGTGGTCAGGAAAGGCTT 720

  5893252 TGGAATAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTGGGTACCACGCAGTGTTTTAAGCA 5893311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      721 TGGAATAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTGGGTACCATGCAGTGTTTTAAGCA 780

  5893312 CTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTAGGTAGGCACTAATAGTACCTAC 5893371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTAGGTAGGCACTAATAGTACCTAC 840

  5893372 AATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAATACCTTGCACCAGGTTGCGGAG 5893431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAATACCTTGCACCAGGTTGCGGAG 900

  5893432 GTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGGATTCCTTATTAACCGTGATTCT 5893491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGGATTCCTTATTAACCGTGATTCT 960

  5893492 ATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAACAAATCACTATGACCATAGTTGC 5893551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAACAAATCACTATGACCATAGTTGC 1020

  5893552 ATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGGGTCAGGAATTTGGATAGAACAC 5893611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGGGTCAGGAATTTGGATAGAACAC 1080

  5893612 ATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCTTGACTGGGTGCATGAACACCGG 5893671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCTTGACTGGGTGCATGAACACCGG 1140

  5893672 GGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATCCATGTGTCCAGTAGATGATACT 5893731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATCCATGTGTCCAGTAGATGATACT 1200

  5893732 GGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGAACACCCATACGTGGCCTCTCCA 5893791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGAACACCCATACGTGGCCTCTCCA 1260

  5893792 GGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAGCAGTCAGACTTCATACACTATG 5893851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAGCAGTCAGACTTCATACACTATG 1320

  5893852 GCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAGAGGAAGCAGCATTGCCTTTCCT 5893911
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAGAGGAAGCAGCATTGCCTTTCCT 1380

  5893912 GAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTCAGATTTAACAGGAGGGGATACA 5893971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTCAGATTTAACAGGAGGGGATACA 1440

  5893972 GACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATGTCAAAGAATTTGCAGCCATTTT 5894031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATGTCAAAGAATTTGCAGCCATTTT 1500

  5894032 TTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGTTTACAGCAAAATTGGTTAGAAG 5894091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGTTTACAGCAAAATTGGTTAGAAG 1560

  5894092 GTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCCACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCT 5894151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCCACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCT 1620

  5894152 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCG 5894211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCG 1680

  5894212 ATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCC 5894271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCC 1740

  5894272 CGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 5894331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 1800

  5894332 TAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTG 5894391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTG 1860

  5894392 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGG 5894451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGG 1920

  5894452 TACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTT 5894511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTT 1980

  5894512 GTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCC 5894571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCC 2040

  5894572 TTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATT 5894631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATT 2100

  5894632 AATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGT 5894691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGT 2160

  5894692 TTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCT 5894751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCT 2220

  5894752 CTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGAC 5894811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGAC 2280

  5894812 GAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTC 5894871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTC 2340

  5894872 TCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTC 5894931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTC 2400

  5894932 CTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTG 5894991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTG 2460

  5894992 GCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCA 5895051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCA 2520

  5895052 GTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTC 5895111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTC 2580

  5895112 TTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATA 5895171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATA 2640

  5895172 GTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTG 5895231
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTCTGGAGGTGTGGGTACCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTG 2700

  5895232 CAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGT 5895291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGT 2760

  5895292 CATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTA 5895351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTA 2820

  5895352 ACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGAT 5895411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGAT 2880

  5895412 GCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGC 5895471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGC 2940

  5895472 TCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGA 5895531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGA 3000

  5895532 TCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTT 5895591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTT 3060

  5895592 CAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGG 5895651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGG 3120

  5895652 TGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGG 5895711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGG 3180

  5895712 CGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGA 5895771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGA 3240

  5895772 AGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTC 5895831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTC 3300

  5895832 CCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGT 5895891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGT 3360

  5895892 GTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTG 5895951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTG 3420

  5895952 GCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTA 5896011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTA 3480

  5896012 TTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAAT 5896071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAAT 3540

  5896072 GACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTAT 5896131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTAT 3600

  5896132 TTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAA 5896191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAA 3660

  5896192 AAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAA 5896251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAA 3720

  5896252 TAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGC 5896311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGC 3780

  5896312 GCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGG 5896371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGG 3840

  5896372 ATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGG 5896431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGG 3900

  5896432 AGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACC 5896491
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACC 3960

  5896492 ACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTA 5896551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTA 4020

  5896552 TGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTG 5896611
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTG 4080

  5896612 ATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCA 5896671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCA 4140

  5896672 AAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGT 5896731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGT 4200

  5896732 TGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCT 5896791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCT 4260

  5896792 TTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCT 5896851
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCT 4320

  5896852 AAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCT 5896911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4321 AAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCT 4380

  5896912 ATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGG 5896971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGG 4440

  5896972 AACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTG 5897031
          ||||||||||||||||||||||||||     ||||.||||||||||||||||||||||||
     4441 AACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTG 4495

  5897032 GCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATC 5897091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4496 GCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATC 4555

  5897092 ATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTAC 5897151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 ATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTAC 4615

  5897152 CTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACC 5897211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 CTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACC 4675

  5897212 TAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTA 5897271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 TAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTA 4735

  5897272 TTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGC 5897331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 TTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGC 4795

  5897332 CAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAG 5897391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 CAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAG 4855

  5897392 CCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAAC 5897451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 CCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAAC 4915

  5897452 TGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCA 5897511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 TGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCA 4975

  5897512 TCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAA 5897571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 TCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAA 5035

  5897572 TGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAG 5897631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 TGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAG 5095

  5897632 GGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 5897691
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 GGAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 5155

  5897692 ACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACT 5897751
          ||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 ACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACT 5203

  5897752 CCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGA 5897811
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 CCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGA 5263

  5897812 AAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACT 5897871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 AAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACT 5323

  5897872 TCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCT 5897931
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5324 TCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCT 5383

  5897932 TGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCT 5897991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 TGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCT 5443

  5897992 TCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTAT 5898051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5444 TCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATAT 5503

  5898052 AAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTG 5898111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 AAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTG 5563

  5898112 CTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGC 5898171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5564 CTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGC 5623

  5898172 CCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTT 5898231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 CCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTT 5683

  5898232 TCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCT 5898291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 TCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCT 5743

  5898292 GTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGG 5898351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 GTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGG 5803

  5898352 TCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACAT 5898411
          ||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 TCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACAT 5863

  5898412 GGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 GGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5899

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5959

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5960 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 6019

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 6079

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 6139

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     6140 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 6199

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 6259

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 6319

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 6379

  5899356 CATTTCCTTGGCATTT 5899371
          ||||||||||||||||
     6380 CATTTCCTTGGCATTT 6395

Alignment time is 4.55339 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   2449] =>      2449 nucs 'mol-32-301a-161392_2449'

Score:        2449
Aligned:      2449        nucs
Identic:      2449 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5898479,5900927]
 second seq =>  [      1,   2449]

  5898479 GACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTT 5898538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTT 60

  5898539 ATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCAT 5898598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCAT 120

  5898599 GGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAG 5898658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAG 180

  5898659 ACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGG 5898718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGG 240

  5898719 GGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATG 5898778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATG 300

  5898779 CTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTT 5898838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTT 360

  5898839 TCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCC 5898898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCC 420

  5898899 CACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAG 5898958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAG 480

  5898959 TGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGC 5899018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGC 540

  5899019 AGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCG 5899078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCG 600

  5899079 CTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCC 5899138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCC 660

  5899139 CAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCT 5899198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCT 720

  5899199 CCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCC 5899258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCC 780

  5899259 CACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTC 5899318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTC 840

  5899319 CATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTA 5899378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTA 900

  5899379 CTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCA 5899438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCA 960

  5899439 TGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATAC 5899498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATAC 1020

  5899499 CCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCC 5899558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCC 1080

  5899559 TTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGT 5899618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGT 1140

  5899619 TCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTT 5899678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTT 1200

  5899679 GTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTG 5899738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTG 1260

  5899739 TCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGT 5899798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGT 1320

  5899799 GTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTT 5899858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTT 1380

  5899859 GTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGT 5899918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGT 1440

  5899919 GTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGA 5899978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGA 1500

  5899979 AGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTT 5900038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTT 1560

  5900039 TTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATAT 5900098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATAT 1620

  5900099 CATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTAT 5900158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTAT 1680

  5900159 TCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTT 5900218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTT 1740

  5900219 TCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCAT 5900278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCAT 1800

  5900279 CAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGAT 5900338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGAT 1860

  5900339 ATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCA 5900398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCA 1920

  5900399 TGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGA 5900458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGA 1980

  5900459 GGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCT 5900518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCT 2040

  5900519 GACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGT 5900578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGT 2100

  5900579 CTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTG 5900638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTG 2160

  5900639 AAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCA 5900698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCA 2220

  5900699 CTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACA 5900758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACA 2280

  5900759 GTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCC 5900818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCC 2340

  5900819 TTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGC 5900878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGC 2400

  5900879 CCATTTCAGAAAATTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTC 5900927
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCATTTCAGAAAATTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTC 2449

Alignment time is 1.53011 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   9480] =>      9480 nucs 'mol-32-3030-025065_9480'

Score:        9031
Aligned:      9501        nucs
Identic:      9419 ( 99%) nucs =>      1766 ( 98%)      7653 ( 99%)
Gaps:           54 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5896654,5898447] EXCISED REGION [5898876,5906549]
 second seq =>  [      1,   1776] EXCISED REGION [   1777,   9480]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5896654 ATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGA 5896713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGA 60

  5896714 AGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAA 5896773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAA 120

  5896774 AGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTT 5896833
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTT 180

  5896834 AGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTC 5896893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTC 240

  5896894 TCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGA 5896953
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGA 300

  5896954 TCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTC 5897013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||.||||||
      301 TCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTT----ACTCTAGGGTC 356

  5897014 GGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATAC 5897073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 GGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATAC 416

  5897074 CCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCG 5897133
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 CCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCG 476

  5897134 CCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTT 5897193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 CCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTT 536

  5897194 ATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTT 5897253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 ATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTT 596

  5897254 CTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAG 5897313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 CTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAG 656

  5897314 ACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATG 5897373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 ACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATG 716

  5897374 AGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACAC 5897433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 AGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACAC 776

  5897434 CTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCAC 5897493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 CTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCAC 836

  5897494 CAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTC 5897553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 CAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTC 896

  5897554 AGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGAT 5897613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 AGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGAT 956

  5897614 ACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACAC 5897673
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
      957 ACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACA--CACACACACACACACACACACAC 1014

  5897674 ACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATA 5897733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||
     1015 ACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATA 1062

  5897734 TAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAA 5897793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1063 TAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAA 1122

  5897794 CTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAA 5897853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 CTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAA 1182

  5897854 TCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGA 5897913
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1183 TCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGA 1242

  5897914 GAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGA 5897973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 GAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGA 1302

  5897974 GACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGT 5898033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 GACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGT 1362

  5898034 TTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTT 5898093
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 TTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTT 1422

  5898094 GAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCT 5898153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1423 GAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCT 1482

  5898154 GTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGA 5898213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 GTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGA 1542

  5898214 GGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTG 5898273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 GGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTG 1602

  5898274 TGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGA 5898333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 TGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGA 1662

  5898334 AATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCA 5898393
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1663 AATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCA 1722

  5898394 AGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 AGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 1776

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 1836

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1837 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 1896

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 1956

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 2016

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2017 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 2076

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 2136

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 2196

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 2256

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 2316

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 2376

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 2436

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 2496

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 2556

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 2616

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 2676

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2677 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 2736

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 2796

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 2856

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 2916

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 2976

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 3036

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3037 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGCGCAATCCTGTCTCACCACTGG 3096

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3097 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 3156

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 3216

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 3276

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 3336

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 3396

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 3456

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 3516

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 3576

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 3636

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     3637 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 3696

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 3756

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 3816

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 3876

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 3936

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 3996

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 4056

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 4116

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 4176

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 4236

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 4296

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 4356

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 4416

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 4476

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 4536

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 4596

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 4656

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 4716

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 4776

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 4836

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 4896

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 4956

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5016

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5076

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5136

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5196

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5256

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5316

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5376

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5436

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5496

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5556

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5616

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5676

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5736

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5796

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5856

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5916

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5917 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5976

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5977 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 6036

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6037 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 6096

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6097 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 6156

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6157 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 6216

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6217 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 6276

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6277 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 6336

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6337 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 6396

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6397 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 6456

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6457 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 6516

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6517 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 6576

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6577 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 6633

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6634 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 6693

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6694 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 6753

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6754 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 6813

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6814 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 6873

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6874 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 6933

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6934 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 6993

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6994 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 7053

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7054 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 7113

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7114 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 7173

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7174 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 7233

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7234 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 7293

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7294 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 7353

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7354 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 7413

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7414 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 7473

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7474 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 7533

  5904617 A--------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 5904662
          |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7534 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 7593

  5904663 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 5904722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7594 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 7653

  5904723 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 5904782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7654 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 7713

  5904783 TTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 5904842
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7714 TTTACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 7773

  5904843 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 5904902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7774 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 7833

  5904903 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 5904962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7834 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 7893

  5904963 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 5905022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7894 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 7953

  5905023 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 5905082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7954 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 8013

  5905083 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 5905142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8014 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 8073

  5905143 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 5905202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8074 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 8133

  5905203 TACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 5905262
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8134 TACTTCTTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 8193

  5905263 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 5905322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8194 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 8253

  5905323 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 5905382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8254 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 8313

  5905383 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 5905442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8314 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 8373

  5905443 AGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 5905502
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8374 AGGGCTTCATGTCCCAAGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 8433

  5905503 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 5905562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8434 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 8493

  5905563 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAA 5905622
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     8494 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTTTGTGTCATCGAGGGAA 8553

  5905623 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 5905682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8554 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 8613

  5905683 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 5905742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8614 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 8673

  5905743 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 5905802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8674 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 8733

  5905803 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 5905862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8734 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 8793

  5905863 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 5905922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8794 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 8853

  5905923 AATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTC 5905982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8854 AATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTC 8913

  5905983 CAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGC 5906042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8914 CAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGC 8973

  5906043 AGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCA 5906102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8974 AGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCA 9033

  5906103 GCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCA 5906162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9034 GCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCA 9093

  5906163 GTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACC 5906222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9094 GTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACC 9153

  5906223 GGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATA 5906282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9154 GGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATA 9213

  5906283 GAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTA 5906342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9214 GAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTA 9273

  5906343 TTCTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTG 5906402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9274 TTCTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTG 9333

  5906403 GACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGA 5906462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9334 GACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGA 9393

  5906463 CTTGTCTTCATGGATCTGAAAGGCATTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCT 5906522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9394 CTTGTCTTCATGGATCTGAAAGGCATTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCT 9453

  5906523 GGTCCTCGGCTTCCTAGTGGTGGGATC 5906549
          ||||||.||||||||||||||||||||
     9454 GGTCCTTGGCTTCCTAGTGGTGGGATC 9480

Alignment time is 6.51615 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   8819] =>      8819 nucs 'mol-32-303b-088024_8819'

Score:        8819
Aligned:      8819        nucs
Identic:      8819 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5898508,5907326]
 second seq =>  [      1,   8819]

  5898508 TTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGAC 5898567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGAC 60

  5898568 TGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCC 5898627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCC 120

  5898628 TGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATC 5898687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATC 180

  5898688 CAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCA 5898747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCA 240

  5898748 CCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTG 5898807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTG 300

  5898808 CCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAG 5898867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAG 360

  5898868 CTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCC 5898927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCC 420

  5898928 TTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCA 5898987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCA 480

  5898988 TTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGC 5899047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGC 540

  5899048 TGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTT 5899107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTT 600

  5899108 TCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCAT 5899167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCAT 660

  5899168 GCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATA 5899227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATA 720

  5899228 TCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTAT 5899287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTAT 780

  5899288 ATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAA 5899347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAA 840

  5899348 ATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCC 5899407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCC 900

  5899408 TGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCAT 5899467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCAT 960

  5899468 CCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCT 5899527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCT 1020

  5899528 GGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCC 5899587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCC 1080

  5899588 TGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGG 5899647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGG 1140

  5899648 GGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAA 5899707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAA 1200

  5899708 GTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTC 5899767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTC 1260

  5899768 AGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCAC 5899827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCAC 1320

  5899828 GGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCA 5899887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCA 1380

  5899888 GCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAG 5899947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAG 1440

  5899948 GAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTA 5900007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTA 1500

  5900008 GTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAG 5900067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAG 1560

  5900068 TAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCA 5900127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCA 1620

  5900128 GATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTC 5900187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTC 1680

  5900188 ACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTC 5900247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTC 1740

  5900248 CACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAAT 5900307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAAT 1800

  5900308 AACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCC 5900367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCC 1860

  5900368 TGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGA 5900427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGA 1920

  5900428 GGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAG 5900487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAG 1980

  5900488 CTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTG 5900547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTG 2040

  5900548 GAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGA 5900607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGA 2100

  5900608 GCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGC 5900667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGC 2160

  5900668 TTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCA 5900727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCA 2220

  5900728 TTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCAGT 5900787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCAGT 2280

  5900788 CTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTCTT 5900847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTCTT 2340

  5900848 ACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAAAATATAGT 5900907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAAAATATAGT 2400

  5900908 AATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTCCCCACCCT 5900967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTCCCCACCCT 2460

  5900968 GAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGCGATGTTGA 5901027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGCGATGTTGA 2520

  5901028 ATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAACTTCTAGTA 5901087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAACTTCTAGTA 2580

  5901088 AACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTCGTAAGAGA 5901147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTCGTAAGAGA 2640

  5901148 ACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAAATTTTGTT 5901207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAAATTTTGTT 2700

  5901208 ACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGTTTTCTAAG 5901267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGTTTTCTAAG 2760

  5901268 ATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCCCTCTGACA 5901327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCCCTCTGACA 2820

  5901328 TATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATATTCTATTGC 5901387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATATTCTATTGC 2880

  5901388 ATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCACACACACAA 5901447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCACACACACAA 2940

  5901448 ACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATATATACATAC 5901507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATATATACATAC 3000

  5901508 ACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATTGTGTCTTT 5901567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATTGTGTCTTT 3060

  5901568 TGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAACAGAAAGT 5901627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAACAGAAAGT 3120

  5901628 CAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGATTGATAAT 5901687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGATTGATAAT 3180

  5901688 AGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAGAAATTACC 5901747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAGAAATTACC 3240

  5901748 CAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGACCTCACCAC 5901807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGACCTCACCAC 3300

  5901808 TATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTATAAAAATA 5901867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTATAAAAATA 3360

  5901868 AAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTATGTATACAT 5901927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTATGTATACAT 3420

  5901928 AAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAATTTTCTGA 5901987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAATTTTCTGA 3480

  5901988 TGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGGATAAAACC 5902047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGGATAAAACC 3540

  5902048 TTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATATATACTGCC 5902107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATATATACTGCC 3600

  5902108 AAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATGTGGGCAAT 5902167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATGTGGGCAAT 3660

  5902168 TGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTATGGTGCCTG 5902227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTATGGTGCCTG 3720

  5902228 CATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTGAAGAGGTA 5902287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTGAAGAGGTA 3780

  5902288 CGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTCACAGAAGG 5902347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTCACAGAAGG 3840

  5902348 GCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGAGGCTCAGC 5902407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGAGGCTCAGC 3900

  5902408 CCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAATGGAAACA 5902467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAATGGAAACA 3960

  5902468 TGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTGACATCATG 5902527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTGACATCATG 4020

  5902528 ATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATAAATAAGTT 5902587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATAAATAAGTT 4080

  5902588 AAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCAGGTGGTAG 5902647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCAGGTGGTAG 4140

  5902648 ATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAGAGTCGCTA 5902707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAGAGTCGCTA 4200

  5902708 GTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCTAAAGCCCC 5902767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCTAAAGCCCC 4260

  5902768 TGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGCTCCTGTTC 5902827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGCTCCTGTTC 4320

  5902828 TTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTCCCACTGGT 5902887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTCCCACTGGT 4380

  5902888 CTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGAGCATCCCT 5902947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGAGCATCCCT 4440

  5902948 GAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCACTGTAAATG 5903007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCACTGTAAATG 4500

  5903008 AGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTCCCTTAATC 5903067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTCCCTTAATC 4560

  5903068 AAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTCTATTATTA 5903127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTCTATTATTA 4620

  5903128 TTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCTCTAAGGCC 5903187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCTCTAAGGCC 4680

  5903188 TCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCAGATCTTAG 5903247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCAGATCTTAG 4740

  5903248 GCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTATAGACACAA 5903307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTATAGACACAA 4800

  5903308 GCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAGCTACATTG 5903367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAGCTACATTG 4860

  5903368 TTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGT 5903427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGT 4920

  5903428 GGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTGCTGTCTCA 5903487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTGCTGTCTCA 4980

  5903488 GCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTTTTAAAATA 5903547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTTTTAAAATA 5040

  5903548 TTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCCTGACCTCA 5903607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCCTGACCTCA 5100

  5903608 AGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCC 5903667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCC 5160

  5903668 TGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAATAACTTCCCTG 5903727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAATAACTTCCCTG 5220

  5903728 ATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTATATTTATATGTA 5903787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTATATTTATATGTA 5280

  5903788 TACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATATCAATGAGTAT 5903847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATATCAATGAGTAT 5340

  5903848 ATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGAGAGAGGGAAAG 5903907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGAGAGAGGGAAAG 5400

  5903908 AGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAGGCCTGTTTTTT 5903967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAGGCCTGTTTTTT 5460

  5903968 GCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATTTTTAATCTCAG 5904027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATTTTTAATCTCAG 5520

  5904028 TGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCATGGCTATGAAA 5904087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCATGGCTATGAAA 5580

  5904088 AAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATATAAGGTATTCCT 5904147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATATAAGGTATTCCT 5640

  5904148 CTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCTTTCAAAGATCA 5904207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCTTTCAAAGATCA 5700

  5904208 AAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTTAATAATCTTCT 5904267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTTAATAATCTTCT 5760

  5904268 CTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAAGCACAAGAAGT 5904327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAAGCACAAGAAGT 5820

  5904328 GTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTTCATCTTTGCCA 5904387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTTCATCTTTGCCA 5880

  5904388 CAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCACCAGCTTTAAGA 5904447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCACCAGCTTTAAGA 5940

  5904448 CAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGATAGCAACACTG 5904507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGATAGCAACACTG 6000

  5904508 CAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTGCTCACCAGCTG 5904567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTGCTCACCAGCTG 6060

  5904568 ATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTGATGTGTGTGTG 5904627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTGATGTGTGTGTG 6120

  5904628 TGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTAGTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATA 5904687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTAGTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATA 6180

  5904688 AACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAAGCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACT 5904747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAAGCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACT 6240

  5904748 AAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATCTTTACTTTTCCCAAACCATATAGTT 5904807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 AAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATCTTTACTTTTCCCAAACCATATAGTT 6300

  5904808 TTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCATGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAG 5904867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCATGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAG 6360

  5904868 TGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTCTTCTAAAGGTCACTTAATAAATCAT 5904927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTCTTCTAAAGGTCACTTAATAAATCAT 6420

  5904928 TGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCTACCCTGGGACATTTTCACACTCTTG 5904987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCTACCCTGGGACATTTTCACACTCTTG 6480

  5904988 CCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAATGATCTCCACACTAACCCTCTGAGA 5905047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAATGATCTCCACACTAACCCTCTGAGA 6540

  5905048 ATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGCCTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAG 5905107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 ATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGCCTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAG 6600

  5905108 TCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCGTGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACAC 5905167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCGTGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACAC 6660

  5905168 ATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGTTACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAA 5905227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 ATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGTTACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAA 6720

  5905228 AGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTTTCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCAC 5905287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTTTCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCAC 6780

  5905288 CAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATTTGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAG 5905347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 CAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATTTGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAG 6840

  5905348 GTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAGAATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGG 5905407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 GTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAGAATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGG 6900

  5905408 GTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGCAGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGT 5905467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 GTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGCAGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGT 6960

  5905468 CTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTGCACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGG 5905527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTGCACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGG 7020

  5905528 AAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATTCTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACA 5905587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 AAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATTCTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACA 7080

  5905588 GAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAAAGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCA 5905647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAAAGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCA 7140

  5905648 ATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATGGTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTG 5905707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 ATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATGGTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTG 7200

  5905708 GCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCAGATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTA 5905767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 GCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCAGATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTA 7260

  5905768 TCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGCACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAG 5905827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGCACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAG 7320

  5905828 CAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGCCGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTA 5905887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGCCGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTA 7380

  5905888 TGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCGAATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCT 5905947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 TGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCGAATTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCT 7440

  5905948 GTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTCCAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTA 5906007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 GTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTCCAGAAGTCAGCAGCTCACTATAGTA 7500

  5906008 AACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGCAGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTG 5906067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 AACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGCAGTCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTG 7560

  5906068 GTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCAGCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCC 5906127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCAGCTGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCC 7620

  5906128 ACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCAGTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCC 5906187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 ACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCAGTTCCTCACCACGTGGGCTTCTCCC 7680

  5906188 CAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACCGGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTG 5906247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 CAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACCGGTTTCCCCCAGAACAAAAGACCTG 7740

  5906248 GGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATAGAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCC 5906307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 GGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATAGAAGTCACAGTGTCTTCTGAAACCC 7800

  5906308 AGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTATTCTGTTGCTCACACAGACCATCCC 5906367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 AGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTATTCTGTTGCTCACACAGACCATCCC 7860

  5906368 TGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTGGACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGG 5906427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 TGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTGGACACCTGAAGGCAGGGACCGCTGG 7920

  5906428 GGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGACTTGTCTTCATGGATCTGAAAGGCA 5906487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 GGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGACTTGTCTTCATGGATCTGAAAGGCA 7980

  5906488 TTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCTGGTCCTCGGCTTCCTAGTGGTGGGA 5906547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 TTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCTGGTCCTCGGCTTCCTAGTGGTGGGA 8040

  5906548 TCACTCGCTTCCCGATCTCTGCATCTCAGCTGTGGCTTCTTACTCTTGAGCTCAGCAGTT 5906607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 TCACTCGCTTCCCGATCTCTGCATCTCAGCTGTGGCTTCTTACTCTTGAGCTCAGCAGTT 8100

  5906608 CCAAGGCCATCTCCTGGAGTCCTTCCTCCAGCCCTTCCAATGCATTACATTTTCTTTCCT 5906667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 CCAAGGCCATCTCCTGGAGTCCTTCCTCCAGCCCTTCCAATGCATTACATTTTCTTTCCT 8160

  5906668 TAAAAATAGCTGAAGTGGTTTCCTATTCCTGGAACTGGACCATGGCTGATACAGGCGGGT 5906727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 TAAAAATAGCTGAAGTGGTTTCCTATTCCTGGAACTGGACCATGGCTGATACAGGCGGGT 8220

  5906728 ATCAGCCTGCCAAGGAATAACAGCAAACATTACCATGCAATATGTAAGTATGTTACATTC 5906787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 ATCAGCCTGCCAAGGAATAACAGCAAACATTACCATGCAATATGTAAGTATGTTACATTC 8280

  5906788 ATTCATCAGATTTTACAGATGTGGAAACTGAGATGCTGGGAAATTAAGTGAACAGCCCAG 5906847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 ATTCATCAGATTTTACAGATGTGGAAACTGAGATGCTGGGAAATTAAGTGAACAGCCCAG 8340

  5906848 GCTCACACAGGCAATGAAAACTACAGCTGGATTTCAGAGCCCACACTCTTAATGCTGCCA 5906907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 GCTCACACAGGCAATGAAAACTACAGCTGGATTTCAGAGCCCACACTCTTAATGCTGCCA 8400

  5906908 CATTGGGGCCACTCAGAAGGTTGCATCTTATGTGGCTTTCCCTTATAAGGGAAAAGGGCT 5906967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 CATTGGGGCCACTCAGAAGGTTGCATCTTATGTGGCTTTCCCTTATAAGGGAAAAGGGCT 8460

  5906968 AAAAGGACTTTGGTGTCCGTTCAAAAGGCTGATGAGATCTTGGGTTTCTTCATAAAATCA 5907027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 AAAAGGACTTTGGTGTCCGTTCAAAAGGCTGATGAGATCTTGGGTTTCTTCATAAAATCA 8520

  5907028 TTTTTTATTTTTATGAGACATCTGGCAGGTAATAATTTATTGTCAGGAATCTCAAACCCC 5907087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 TTTTTTATTTTTATGAGACATCTGGCAGGTAATAATTTATTGTCAGGAATCTCAAACCCC 8580

  5907088 AGGCAAAATACTGCACCAGGGTAACAGCCAAGGCCAGTAGGTGAAGGCCAGCAAGGCCAA 5907147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 AGGCAAAATACTGCACCAGGGTAACAGCCAAGGCCAGTAGGTGAAGGCCAGCAAGGCCAA 8640

  5907148 CCTCTCATTTCTCCTACTGACATCTGAGTAGGTGTCCCAACATCAGGGAACACATTTTAA 5907207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 CCTCTCATTTCTCCTACTGACATCTGAGTAGGTGTCCCAACATCAGGGAACACATTTTAA 8700

  5907208 ATATTTTTTGAAAAATTTTACCCAAGACCCAATTTTGTTCAGACTTTACATTGACACAAA 5907267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 ATATTTTTTGAAAAATTTTACCCAAGACCCAATTTTGTTCAGACTTTACATTGACACAAA 8760

  5907268 TTACCCTTACTCTGCATTAAATATTACTATCATTTCTATAGAGTCATAGCAATCAAGTT 5907326
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 TTACCCTTACTCTGCATTAAATATTACTATCATTTCTATAGAGTCATAGCAATCAAGTT 8819

Alignment time is 6.05666 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   8095] =>      8095 nucs 'mol-32-310c-128590_8095'

Score:        8028
Aligned:      8100        nucs
Identic:      8091 (100%) nucs =>       630 (100%)      7461 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5894834,5895463] EXCISED REGION [5895500,5902969]
 second seq =>  [      1,    630] EXCISED REGION [    631,   8095]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        36 nucs [5895464,5895499]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        55 nucs [5895464,5895518] to [5895500,5895554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5895464,5895464] to [5895499,5895499]
 second seq =>         0 nucs

  5894834 GTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGG 5894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGG 60

  5894894 CTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTG 5894953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTG 120

  5894954 TTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGA 5895013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGA 180

  5895014 AGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTAC 5895073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTAC 240

  5895074 ATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCC 5895133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCC 300

  5895134 CATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAA 5895193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAA 360

  5895194 TCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCT 5895253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCT 420

  5895254 GATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGA 5895313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGA 480

  5895314 GTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTT 5895373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTT 540

  5895374 TTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCC 5895433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCC 600

  5895434 TCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 5895463
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 630

EXCISED REGION

  5895500 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 5895559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 690

  5895560 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 5895619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 750

  5895620 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 5895679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 810

  5895680 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 5895739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 870

  5895740 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 5895799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 930

  5895800 AGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 5895859
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 AGATGTCGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 990

  5895860 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 5895919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 1050

  5895920 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 5895979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 1110

  5895980 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 5896039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 1170

  5896040 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 5896099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 1230

  5896100 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 5896159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 1290

  5896160 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 5896219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 1350

  5896220 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 5896279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 1410

  5896280 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 5896339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 1470

  5896340 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 5896399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 1530

  5896400 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 5896459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 1590

  5896460 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 5896519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 1650

  5896520 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 5896579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 1710

  5896580 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 5896639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 1770

  5896640 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 5896699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 1830

  5896700 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 5896759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 1890

  5896760 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 5896819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 1950

  5896820 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 5896879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 2010

  5896880 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 5896939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 2070

  5896940 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT 5896999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2071 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA-TTTTTTTTTTTTTTTTT 2129

  5897000 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 5897059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 2189

  5897060 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 5897119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 2249

  5897120 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 5897179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 2309

  5897180 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 5897239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 2369

  5897240 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 5897299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 2429

  5897300 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 5897359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 2489

  5897360 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5897419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 2549

  5897420 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5897479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 2609

  5897480 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5897539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 2669

  5897540 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5897599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 2729

  5897600 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5897659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
     2730 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACAT----ACACAC 2785

  5897660 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5897719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 2845

  5897720 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5897779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 2905

  5897780 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5897839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 2965

  5897840 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5897899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 3025

  5897900 CTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5897959
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 CTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 3085

  5897960 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5898019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 3145

  5898020 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5898079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 3205

  5898080 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5898139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 3265

  5898140 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5898199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 3325

  5898200 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5898259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 3385

  5898260 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 5898319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 3445

  5898320 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 5898379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 3505

  5898380 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 5898439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 3565

  5898440 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 5898499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 3625

  5898500 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 5898559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 3685

  5898560 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 5898619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 3745

  5898620 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 5898679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 3805

  5898680 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 5898739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 3865

  5898740 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 5898799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 3925

  5898800 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 5898859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 3985

  5898860 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 5898919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 4045

  5898920 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 5898979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 4105

  5898980 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 5899039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 4165

  5899040 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 5899099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 4225

  5899100 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 5899159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 4285

  5899160 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 5899219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 4345

  5899220 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 5899279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 4405

  5899280 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 5899339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 4465

  5899340 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 5899399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 4525

  5899400 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 5899459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 4585

  5899460 CCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACC 5899519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 CCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACC 4645

  5899520 ACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAG 5899579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 ACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAG 4705

  5899580 CATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGG 5899639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 CATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGG 4765

  5899640 GCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACC 5899699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 GCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACC 4825

  5899700 GTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCA 5899759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 GTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCA 4885

  5899760 AGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTC 5899819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 AGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTC 4945

  5899820 CCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCT 5899879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 CCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCT 5005

  5899880 GAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCC 5899939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 GAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCC 5065

  5899940 CACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACT 5899999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 CACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACT 5125

  5900000 ATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTC 5900059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 ATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTC 5185

  5900060 AGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCAT 5900119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 AGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCAT 5245

  5900120 ATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAAT 5900179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 ATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAAT 5305

  5900180 CCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCT 5900239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 CCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCT 5365

  5900240 CTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCA 5900299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 CTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCA 5425

  5900300 GCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACAT 5900359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 GCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACAT 5485

  5900360 GGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAG 5900419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 GGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAG 5545

  5900420 TGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAG 5900479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAG 5605

  5900480 AAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTC 5900539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 AAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTC 5665

  5900540 TAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATT 5900599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 TAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATT 5725

  5900600 GGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGC 5900659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 GGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGC 5785

  5900660 TTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATA 5900719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 TTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATA 5845

  5900720 GTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCC 5900779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 GTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCC 5905

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5965

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 ATTCCCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 6025

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 6085

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 6145

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 6205

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 6265

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 GTAAGAGAACACTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 6325

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 6385

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 6445

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 6505

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 6565

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 6625

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 6685

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 6745

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 6805

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 6865

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 6925

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 6985

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 7045

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 7105

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 7165

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 7225

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 7285

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 7345

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 7405

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 7465

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 7525

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 7585

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 7645

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 7705

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7706 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 7765

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7766 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 7825

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7826 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 7885

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7886 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 7945

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7946 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 8005

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8006 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 8065

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGG 5902969
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     8066 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGG 8095

Alignment time is 6.436 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3267] =>      3267 nucs 'mol-32-3143-241890_3267'

Score:        3265
Aligned:      3265        nucs
Identic:      3265 (100%) nucs =>       207 (100%)      3058 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897698,5897904] EXCISED REGION [5897906,5900963]
 second seq =>  [      2,    208] EXCISED REGION [    210,   3267]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5897905,5897905]
 second seq =>         1 nucs [209,209]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5897904,5897904] to [5897905,5897905]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5897903,5897904] to [5897906,5897907]
 second seq =>         2 nucs [207,208] to [210,211]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5897698 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGG 5897757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGG 61

  5897758 CTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAA 5897817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       62 CTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAA 121

  5897818 AGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGA 5897877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      122 AGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGA 181

  5897878 CCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCT 5897904
          |||||||||||||||||||||||||||
      182 CCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCT 208

EXCISED REGION

  5897906 CTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAAC 5897965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      210 CTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAAC 269

  5897966 TCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTA 5898025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      270 TCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTA 329

  5898026 AGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGC 5898085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      330 AGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGC 389

  5898086 GGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGT 5898145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      390 GGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGT 449

  5898146 CTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTA 5898205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      450 CTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTA 509

  5898206 TGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGG 5898265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 TGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGG 569

  5898266 ACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAG 5898325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 ACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAG 629

  5898326 ACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGAC 5898385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 ACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGAC 689

  5898386 CTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGC 5898445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 CTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGC 749

  5898446 AGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAAT 5898505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 AGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAAT 809

  5898506 GTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAG 5898565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 GTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAG 869

  5898566 ACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCT 5898625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 ACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCT 929

  5898626 CCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGA 5898685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 CCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGA 989

  5898686 TCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACC 5898745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 TCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACC 1049

  5898746 CACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTT 5898805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 CACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTT 1109

  5898806 TGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCC 5898865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 TGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCC 1169

  5898866 AGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGT 5898925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 AGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGT 1229

  5898926 CCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTT 5898985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 CCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTT 1289

  5898986 CATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAA 5899045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAA 1349

  5899046 GCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCT 5899105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 GCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCT 1409

  5899106 TTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGC 5899165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGC 1469

  5899166 ATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCA 5899225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 ATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCA 1529

  5899226 TATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGT 5899285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 TATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGT 1589

  5899286 ATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCC 5899345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 ATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCC 1649

  5899346 AAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTT 5899405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 AAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTT 1709

  5899406 CCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCC 5899465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 CCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCC 1769

  5899466 ATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGG 5899525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 ATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGG 1829

  5899526 CTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGC 5899585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 CTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGC 1889

  5899586 CCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACA 5899645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACA 1949

  5899646 GGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTC 5899705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 GGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTC 2009

  5899706 AAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCT 5899765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 AAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCT 2069

  5899766 TCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGC 5899825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGC 2129

  5899826 ACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACT 5899885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 ACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACT 2189

  5899886 CAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTC 5899945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 CAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTC 2249

  5899946 AGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCT 5900005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 AGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCT 2309

  5900006 TAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTC 5900065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTC 2369

  5900066 AGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCT 5900125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 AGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCT 2429

  5900126 CAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTC 5900185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 CAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTC 2489

  5900186 TCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCC 5900245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCC 2549

  5900246 TCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCA 5900305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCA 2609

  5900306 ATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTC 5900365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 ATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTC 2669

  5900366 CCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCT 5900425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 CCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCT 2729

  5900426 GAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCA 5900485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 GAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCA 2789

  5900486 AGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGC 5900545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 AGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGC 2849

  5900546 TGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGT 5900605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 TGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGT 2909

  5900606 GAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGC 5900665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 GAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGC 2969

  5900666 GCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATT 5900725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 GCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATT 3029

  5900726 CATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCA 5900785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 CATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCA 3089

  5900786 GTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTC 5900845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 GTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTC 3149

  5900846 TTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAAAATATA 5900905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 TTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAAAATATA 3209

  5900906 GTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTCCCCA 5900963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 GTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTCCCCA 3267

Alignment time is 3.2176 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   2956] =>      2956 nucs 'mol-32-3159-056275_2956'

Score:        2706
Aligned:      2979        nucs
Identic:      2937 ( 99%) nucs =>      2379 ( 98%)       558 ( 99%)
Gaps:           24 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5896032,5898447] EXCISED REGION [5898876,5899437]
 second seq =>  [      1,   2394] EXCISED REGION [   2395,   2956]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5896032 TTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTG 5896091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTG 60

  5896092 ACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGG 5896151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGG 120

  5896152 TTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAA 5896211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAA 180

  5896212 TTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCA 5896271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCA 240

  5896272 CGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTT 5896331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTT 300

  5896332 GGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGT 5896391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGT 360

  5896392 CCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTC 5896451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTC 420

  5896452 AAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCA 5896511
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCA 480

  5896512 TTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATA 5896571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      481 TTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAATA 540

  5896572 GATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGT 5896631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGT 600

  5896632 GTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATT 5896691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATT 660

  5896692 CCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAG 5896751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAG 720

  5896752 GGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACA 5896811
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      721 GGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACA 780

  5896812 GCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGA 5896871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGA 840

  5896872 GCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGC 5896931
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGC 900

  5896932 CTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTT-TTTTT 5896990
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||
      901 CTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGG-----GTTTTT 955

  5896991 TTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGT 5897050
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 TTTTTTTTTTTTACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGT 1015

  5897051 GGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAG 5897110
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1016 GGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAG 1075

  5897111 TCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGG 5897170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGG 1135

  5897171 TACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACAC 5897230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACAC 1195

  5897231 TGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGG 5897290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGG 1255

  5897291 CCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTAT 5897350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 CCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTAT 1315

  5897351 TTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCT 5897410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCT 1375

  5897411 TTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTC 5897470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTC 1435

  5897471 TTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAG 5897530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAG 1495

  5897531 GGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTC 5897590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 GGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTC 1555

  5897591 TTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATA 5897650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     1556 TTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACA-- 1613

  5897651 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGA 5897710
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
     1614 ----CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAG--- 1666

  5897711 GAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTG 5897770
                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
     1667 ---------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAGAACATCTG 1717

  5897771 ATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCT 5897830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 ATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCT 1777

  5897831 CATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAAT 5897890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 CATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAAT 1837

  5897891 TACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCT 5897950
          ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TACATTTCCCTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCT 1897

  5897951 CTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGC 5898010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGC 1957

  5898011 ACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTT 5898070
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1958 ACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTT 2017

  5898071 TTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCC 5898130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCC 2077

  5898131 TAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCT 5898190
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCT 2137

  5898191 GGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTA 5898250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTA 2197

  5898251 CCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCA 5898310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 CCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCA 2257

  5898311 AGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATC 5898370
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2258 AGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATC 2317

  5898371 CACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAA 5898430
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 CACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAA 2377

  5898431 TCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          |||||||||||||||||
     2378 TCTAGGGTAGAGGGCAG 2394

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 2454

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2455 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 2514

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 2574

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 2634

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2635 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 2694

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 2754

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 2814

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 2874

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 2934

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACC 5899437
          ||||||||||||||||||||||
     2935 GTTACCCCATAGGCCAAGGACC 2956

Alignment time is 2.88245 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   7549] =>      7549 nucs 'mol-32-32f0-192704_7549'

Score:        7515
Aligned:      7548        nucs
Identic:      7545 (100%) nucs =>       262 (100%)      7283 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897190,5897451] EXCISED REGION [5897453,5904738]
 second seq =>  [      1,    262] EXCISED REGION [    264,   7549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5897452,5897452]
 second seq =>         1 nucs [263,263]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5897190 TCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTG 5897249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTG 60

  5897250 TGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAAC 5897309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAAC 120

  5897310 ACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAA 5897369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAA 180

  5897370 AATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGG 5897429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGG 240

  5897430 ACACCTGAAGCCCCTCTGGAAC 5897451
          ||||||||||||||||||||||
      241 ACACCTGAAGCCCCTCTGGAAC 262

EXCISED REGION

  5897453 GGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCAT 5897512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 GGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCAT 323

  5897513 CAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAAT 5897572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      324 CAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAAT 383

  5897573 GGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGG 5897632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 GGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGG 443

  5897633 GAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 5897692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 GAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 503

  5897693 CACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTC 5897752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 CACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTC 563

  5897753 CCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAA 5897812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 CCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAA 623

  5897813 AAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTT 5897872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 AAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTT 683

  5897873 CCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTT 5897932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      684 CCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTT 743

  5897933 GGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTT 5897992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 GGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTT 803

  5897993 CAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATA 5898052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 CAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATA 863

  5898053 AAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGC 5898112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 AAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGC 923

  5898113 TTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCC 5898172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 TTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCC 983

  5898173 CCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTT 5898232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 CCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTT 1043

  5898233 CCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTG 5898292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 CCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTG 1103

  5898293 TCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGT 5898352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 TCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGT 1163

  5898353 CTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATG 5898412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 CTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATG 1223

  5898413 GTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTC 5898472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 GTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTC 1283

  5898473 AGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGT 5898532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 AGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGT 1343

  5898533 ACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACT 5898592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 ACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACT 1403

  5898593 TGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGA 5898652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 TGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGA 1463

  5898653 ACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGT 5898712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 ACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGT 1523

  5898713 TTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGAT 5898772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGAT 1583

  5898773 GCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAA 5898832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 GCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAA 1643

  5898833 ATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATT 5898892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 ATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATT 1703

  5898893 GTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACC 5898952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 GTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACC 1763

  5898953 TGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTC 5899012
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TGTCAGTGGTAGGCAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTC 1823

  5899013 TCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCC 5899072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 TCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCC 1883

  5899073 TTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGG 5899132
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TTAGTGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGG 1943

  5899133 GTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCC 5899192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 GTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCC 2003

  5899193 CTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCA 5899252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCA 2063

  5899253 CTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGG 5899312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 CTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGG 2123

  5899313 GTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTT 5899372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 GTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTT 2183

  5899373 CCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAA 5899432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 CCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAA 2243

  5899433 GGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCAC 5899492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 GGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCAC 2303

  5899493 CCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCAC 5899552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 CCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCAC 2363

  5899553 AGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACC 5899612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 AGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACC 2423

  5899613 CCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACA 5899672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 CCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACA 2483

  5899673 TGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCA 5899732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCA 2543

  5899733 CTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCA 5899792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 CTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCA 2603

  5899793 TTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCT 5899852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 TTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCT 2663

  5899853 TACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTG 5899912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 TACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTG 2723

  5899913 TCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTT 5899972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 TCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTT 2783

  5899973 CCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTT 5900032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 CCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTT 2843

  5900033 TTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCC 5900092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCC 2903

  5900093 TTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTA 5900152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 TTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTA 2963

  5900153 ATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATT 5900212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 ATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATT 3023

  5900213 GTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTT 5900272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 GTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTT 3083

  5900273 CATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCG 5900332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 CATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCG 3143

  5900333 GACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGA 5900392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 GACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGA 3203

  5900393 GTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAG 5900452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 GTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAG 3263

  5900453 GAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCC 5900512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 GAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCC 3323

  5900513 CCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGC 5900572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 CCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGC 3383

  5900573 TGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACT 5900632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 TGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACT 3443

  5900633 TTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTG 5900692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 TTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTG 3503

  5900693 GCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACAC 5900752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 GCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACAC 3563

  5900753 ACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGAT 5900812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 ACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGAT 3623

  5900813 AAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAAC 5900872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 AAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAAC 3683

  5900873 ATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTG 5900932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 ATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTG 3743

  5900933 TAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCT 5900992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 TAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCT 3803

  5900993 CCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAA 5901052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 CCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAA 3863

  5901053 CATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCT 5901112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 CATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCT 3923

  5901113 TTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTAT 5901172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 TTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTAT 3983

  5901173 CTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGT 5901232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 CTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGT 4043

  5901233 GTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTA 5901292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 GTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTA 4103

  5901293 TTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATAT 5901352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 TTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATAT 4163

  5901353 ACAACCACTTTAATAACTGTATAATATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAA 5901412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 ACAACCACTTTAATAACTGTATAATATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAA 4223

  5901413 GTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAA 5901472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 GTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAA 4283

  5901473 TACACACACACATATATATTTATATATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAA 5901532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 TACACACACACATATATATTTATATATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAA 4343

  5901533 TACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCC 5901592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 TACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCC 4403

  5901593 ATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATA 5901652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 ATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATA 4463

  5901653 AATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAG 5901712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 AATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAG 4523

  5901713 GAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAA 5901772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 GAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAA 4583

  5901773 AATAATGCTTACACTAAAAGCACTGACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAA 5901832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 AATAATGCTTACACTAAAAGCACTGACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAA 4643

  5901833 CTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATG 5901892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 CTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATG 4703

  5901893 GGTGTGTGTATACATATATATATCTATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTT 5901952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 GGTGTGTGTATACATATATATATCTATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTT 4763

  5901953 TTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTT 5902012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 TTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTT 4823

  5902013 GTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAG 5902072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 GTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAG 4883

  5902073 TCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTAC 5902132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 TCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTAC 4943

  5902133 AAATTTACTCACGACTAGAAGTACATGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATT 5902192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 AAATTTACTCACGACTAGAAGTACATGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATT 5003

  5902193 AGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGG 5902252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 AGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGG 5063

  5902253 GAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAAT 5902312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 GAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAAT 5123

  5902313 AACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGC 5902372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 AACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGC 5183

  5902373 ACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCAC 5902432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 ACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCAC 5243

  5902433 TGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGA 5902492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 TGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGA 5303

  5902493 GTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCAT 5902552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 GTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCAT 5363

  5902553 AAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAA 5902612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 AAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAA 5423

  5902613 GCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGA 5902672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5424 GCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGA 5483

  5902673 AGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTAT 5902732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 AGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTAT 5543

  5902733 GGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTG 5902792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 GGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTG 5603

  5902793 TTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGCTCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAA 5902852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 TTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGCTCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAA 5663

  5902853 GGACATTTTAATATAACTCCCCGATTCCCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGC 5902912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 GGACATTTTAATATAACTCCCCGATTCCCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGC 5723

  5902913 GCCTAAAATAACATGAATGATTCATGAGCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTG 5902972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 GCCTAAAATAACATGAATGATTCATGAGCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTG 5783

  5902973 TTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCACTGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACA 5903032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5784 TTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCACTGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACA 5843

  5903033 TTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTCCCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCA 5903092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 TTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTCCCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCA 5903

  5903093 CATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTCTATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGA 5903152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 CATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTCTATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGA 5963

  5903153 CAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCTCTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGT 5903212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 CAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCTCTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGT 6023

  5903213 TCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCAGATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGA 5903272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6024 TCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCAGATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGA 6083

  5903273 GCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTATAGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAA 5903332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 GCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTATAGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAA 6143

  5903333 TATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAGCTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATG 5903392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6144 TATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAGCTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATG 6203

  5903393 GAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACC 5903452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 GAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACC 6263

  5903453 TCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTGCTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAG 5903512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 TCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTGCTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAG 6323

  5903513 GCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTTTTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACC 5903572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 GCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTTTTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACC 6383

  5903573 ATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCC 5903632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 ATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCC 6443

  5903633 AAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACA 5903692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 AAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACA 6503

  5903693 GCTTCTAAAATTTCACCAATTAAATAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGA 5903752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6504 GCTTCTAAAATTTCACCAATTAAATAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGA 6563

  5903753 AGACTTTACTGTATGTACATGTATATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAAT 5903812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6564 AGACTTTACTGTATGTACATGTATATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAAT 6623

  5903813 GTCTCCATCTCCAACTAGCCCATATCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTT 5903872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6624 GTCTCCATCTCCAACTAGCCCATATCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTT 6683

  5903873 TTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGAGAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGA 5903932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6684 TTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGAGAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGA 6743

  5903933 GACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAGGCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCAT 5903992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6744 GACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAGGCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCAT 6803

  5903993 CGAGGTCTGCTCTAAATTATAATTTTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCA 5904052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6804 CGAGGTCTGCTCTAAATTATAATTTTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCA 6863

  5904053 TCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCATGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCAC 5904112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6864 TCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCATGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCAC 6923

  5904113 CTGTTAGTCCCAGTATTTATATATAAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCT 5904172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6924 CTGTTAGTCCCAGTATTTATATATAAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCT 6983

  5904173 ATACTTTATAAATCATGTTCCTCTTTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATA 5904232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6984 ATACTTTATAAATCATGTTCCTCTTTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATA 7043

  5904233 CTTGCTTTTTATATTTTGACTTTTAATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAAT 5904292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7044 CTTGCTTTTTATATTTTGACTTTTAATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAAT 7103

  5904293 TGAACACAGAATCAATTCGATTAAGCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACT 5904352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7104 TGAACACAGAATCAATTCGATTAAGCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACT 7163

  5904353 GCTTTGGAACCACTCAATAATTTTCATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCA 5904412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7164 GCTTTGGAACCACTCAATAATTTTCATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCA 7223

  5904413 ATAACTAAATTTCCCACTTTCCACCAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAA 5904472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7224 ATAACTAAATTTCCCACTTTCCACCAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAA 7283

  5904473 GTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGATAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACA 5904532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7284 GTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGATAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACA 7343

  5904533 GCACAGAACATCTCAGAGTGTTTGCTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAG 5904592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7344 GCACAGAACATCTCAGAGTGTTTGCTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAG 7403

  5904593 CCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCA 5904652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7404 CCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCA 7463

  5904653 GAACACACTAGTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGA 5904712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7464 GAACACACTAGTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGA 7523

  5904713 TTTGGGCTAAGCTTTTTGTAGTTATA 5904738
          ||||||||||||||||||||||||||
     7524 TTTGGGCTAAGCTTTTTGTAGTTATA 7549

Alignment time is 5.85401 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   7615] =>      7615 nucs 'mol-32-32fb-009676_7615'

Score:        7299
Aligned:      7618        nucs
Identic:      7562 ( 99%) nucs =>       516 ( 99%)      7046 ( 99%)
Gaps:           36 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897928,5898447] EXCISED REGION [5898876,5905940]
 second seq =>  [      1,    520] EXCISED REGION [    521,   7615]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5897928 CCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAAT 5897987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAAT 60

  5897988 GTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAA 5898047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAA 120

  5898048 GTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGAT 5898107
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGAT 180

  5898108 GTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGC 5898167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      181 GTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGC 240

  5898168 CAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGC 5898227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGC 300

  5898228 TTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGC 5898287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGC 360

  5898288 ACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGA 5898347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGA 420

  5898348 GGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATT 5898407
          ||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATT 480

  5898408 ACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 520

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 580

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      581 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 640

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 700

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 760

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      761 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 820

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 880

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 940

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 1000

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 1060

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 1120

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 1180

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 1240

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 1300

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 1360

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 1420

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1421 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 1480

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1540

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1600

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1660

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1720

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1780

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 1840

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1841 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 1900

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 1960

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 2020

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 2080

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 2140

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 2200

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 2260

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 2320

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 2380

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     2381 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 2440

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 2500

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 2560

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 2620

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 2680

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 2740

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 2800

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 2860

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 2920

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 2980

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 3040

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 3100

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 3160

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 3220

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 3280

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 3340

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 3400

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 3460

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 3520

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 3580

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 3640

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 3700

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 3760

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 3820

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 3880

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 3940

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 4000

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 4060

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 4120

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 4180

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 4240

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 4300

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 4360

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 4420

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 4480

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 4540

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 4600

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 4660

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 4720

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 4780

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 4840

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 4900

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 4960

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5020

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5080

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5140

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5200

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5260

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5320

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5377

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5378 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5437

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5438 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5497

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5498 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5557

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5558 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5617

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5618 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5677

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5678 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5737

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5738 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5797

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5798 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5857

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5858 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5917

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5918 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5977

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5978 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 6037

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6038 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 6097

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6098 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 6157

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6158 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 6217

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 6277

  5904617 A--------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 5904662
          |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 6337

  5904663 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 5904722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 6397

  5904723 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 5904782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 6457

  5904783 TTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 5904842
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 TTTACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 6517

  5904843 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 5904902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6518 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 6577

  5904903 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 5904962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 6637

  5904963 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 5905022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6638 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 6697

  5905023 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 5905082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6698 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 6757

  5905083 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 5905142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6758 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 6817

  5905143 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 5905202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6818 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 6877

  5905203 TACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 5905262
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6878 TACTTCTTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 6937

  5905263 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 5905322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6938 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 6997

  5905323 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 5905382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6998 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 7057

  5905383 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 5905442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7058 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 7117

  5905443 AGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 5905502
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7118 AGGGCTTCATGTCCCAAGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 7177

  5905503 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 5905562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7178 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 7237

  5905563 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAA 5905622
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7238 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTTTGTGTCATCGAGGGAA 7297

  5905623 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 5905682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7298 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 7357

  5905683 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 5905742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7358 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCA 7417

  5905743 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 5905802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7418 GATCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGC 7477

  5905803 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 5905862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7478 ACGTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGC 7537

  5905863 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 5905922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7538 CGCAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCG 7597

  5905923 AATTAAGTCTTCCCAGTT 5905940
          ||||||||||||||||||
     7598 AATTAAGTCTTCCCAGTT 7615

Alignment time is 6.04445 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   9100] =>      9100 nucs 'mol-32-32fb-133699_9100'

Score:        8750
Aligned:      9120        nucs
Identic:      9061 ( 99%) nucs =>      5114 ( 99%)      3947 ( 99%)
Gaps:           36 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5893300,5898447] EXCISED REGION [5898876,5902831]
 second seq =>  [      1,   5128] EXCISED REGION [   5129,   9100]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5893300 GTGTTTTAAGCACTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTAGGTAGGCACT 5893359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTTTTAAGCACTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTAGGTAGGCACT 60

  5893360 AATAGTACCTACAATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAATACCTTGCAC 5893419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAGTACCTACAATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAATACCTTGCAC 120

  5893420 CAGGTTGCGGAGGTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGGATTCCTTATT 5893479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGTTGCGGAGGTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGGATTCCTTATT 180

  5893480 AACCGTGATTCTATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAACAAATCACTAT 5893539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCGTGATTCTATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAACAAATCACTAT 240

  5893540 GACCATAGTTGCATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGGGTCAGGAATT 5893599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACCATAGTTGCATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGGGTCAGGAATT 300

  5893600 TGGATAGAACACATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCTTGACTGGGTG 5893659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGATAGAACACATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCTTGACTGGGTG 360

  5893660 CATGAACACCGGGGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATCCATGTGTCCA 5893719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGAACACCGGGGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATCCATGTGTCCA 420

  5893720 GTAGATGATACTGGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGAACACCCATAC 5893779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTAGATGATACTGGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGAACACCCATAC 480

  5893780 GTGGCCTCTCCAGGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAGCAGTCAGACT 5893839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGGCCTCTCCAGGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAGCAGTCAGACT 540

  5893840 TCATACACTATGGCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAGAGGAAGCAGC 5893899
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATACACTATGCCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAGAGGAAGCAGC 600

  5893900 ATTGCCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTCAGATTTAACA 5893959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTGCCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTCAGATTTAACA 660

  5893960 GGAGGGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATGTCAAAGAATT 5894019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGGGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATGTCAAAGAATT 720

  5894020 TGCAGCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGTTTACAGCAAA 5894079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCAGCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGTTTACAGCAAA 780

  5894080 ATTGGTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCCACGGCAGTCT 5894139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGGTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCCACGGCAGTCT 840

  5894140 TTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAG 5894199
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-GGAGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAG 899

  5894200 GGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCT 5894259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCT 959

  5894260 GTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTT 5894319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTT 1019

  5894320 TTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGA 5894379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGA 1079

  5894380 CCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGT 5894439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGT 1139

  5894440 GGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAG 5894499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAG 1199

  5894500 GTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTG 5894559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTG 1259

  5894560 CTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCT 5894619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCT 1319

  5894620 TTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGAC 5894679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGAC 1379

  5894680 AAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGA 5894739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGA 1439

  5894740 CCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAG 5894799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAG 1499

  5894800 GCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCAC 5894859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCAC 1559

  5894860 TGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTG 5894919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTG 1619

  5894920 ACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCT 5894979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 ACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCT 1679

  5894980 GTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTC 5895039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTC 1739

  5895040 TACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCT 5895099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCT 1799

  5895100 GTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTC 5895159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTC 1859

  5895160 AATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGC 5895219
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTACCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGC 1919

  5895220 CCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACT 5895279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACT 1979

  5895280 TATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACC 5895339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACC 2039

  5895340 CTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTC 5895399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTC 2099

  5895400 ACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGA 5895459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGA 2159

  5895460 TCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATG 5895519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATG 2219

  5895520 CCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAA 5895579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACATCGTAGACATGACTTAA 2279

  5895580 TTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCA 5895639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTGCATGCCCTTGAATTCA 2339

  5895640 GGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCT 5895699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGACGTGATGTGTGTGCCT 2399

  5895700 TCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCAT 5895759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCAT 2459

  5895760 GGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGT 5895819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGT 2519

  5895820 GGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATA 5895879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATA 2579

  5895880 GCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTA 5895939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTA 2639

  5895940 GCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCA 5895999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCA 2699

  5896000 AATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTT 5896059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTT 2759

  5896060 TCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGA 5896119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGA 2819

  5896120 AAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGA 5896179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGA 2879

  5896180 TACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAG 5896239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAG 2939

  5896240 CTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAG 5896299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAG 2999

  5896300 CATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCT 5896359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCT 3059

  5896360 AGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTT 5896419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTT 3119

  5896420 GAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAG 5896479
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3120 GAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGATTCTGCATGAACTGAG 3179

  5896480 GGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGT 5896539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGT 3239

  5896540 TGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTA 5896599
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TGTCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTA 3299

  5896600 CAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCC 5896659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCC 3359

  5896660 TTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTG 5896719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTG 3419

  5896720 AGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCT 5896779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCT 3479

  5896780 GGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAG 5896839
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAG 3539

  5896840 AGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGT 5896899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3540 AGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGC 3599

  5896900 TCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGA 5896959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGA 3659

  5896960 CAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGG 5897019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||.||||||||||||
     3660 CAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTT-----ACTCTAGGGTCGGGAGG 3714

  5897020 AAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGC 5897079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 AAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGC 3774

  5897080 ACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCC 5897139
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 ACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCC 3834

  5897140 CCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCA 5897199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 CCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCA 3894

  5897200 AGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGC 5897259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 AGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGC 3954

  5897260 CGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTT 5897319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 CGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTT 4014

  5897320 TCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTAT 5897379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTAT 4074

  5897380 TGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAG 5897439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 TGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAG 4134

  5897440 CCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGA 5897499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 CCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGA 4194

  5897500 AGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCAC 5897559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 AGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCAC 4254

  5897560 AGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGG 5897619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 AGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGG 4314

  5897620 GCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACAC 5897679
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
     4315 GCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACA--CACACACACACACACACACACACACACAC 4372

  5897680 ACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCG 5897739
          ||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||
     4373 ACACACACACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCG 4420

  5897740 GGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTT 5897799
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 GGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTT 4480

  5897800 TCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACA 5897859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 TCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACA 4540

  5897860 GTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACC 5897919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4541 GTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACC 4600

  5897920 TCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCAT 5897979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 TCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCAT 4660

  5897980 ACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAG 5898039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 ACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAG 4720

  5898040 ATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAG 5898099
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 ATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAG 4780

  5898100 TTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAG 5898159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4781 TTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAG 4840

  5898160 AAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTC 5898219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 AAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTC 4900

  5898220 CAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGG 5898279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 CAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGG 4960

  5898280 TCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGAC 5898339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGAC 5020

  5898340 TGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTC 5898399
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5021 TGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTC 5080

  5898400 CATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 CATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5128

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5188

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5189 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 5248

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5308

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5309 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5368

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5369 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 5428

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5429 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5488

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5489 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5548

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5608

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5609 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5668

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5669 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5728

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5788

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5848

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5908

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5968

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 6028

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     6029 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 6088

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6089 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 6148

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6149 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 6208

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6209 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 6268

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6269 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 6328

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6329 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 6388

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6389 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 6448

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6449 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 6508

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6509 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 6568

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6569 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 6628

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6629 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 6688

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6689 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 6748

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6749 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 6808

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6809 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 6868

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6869 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 6928

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6929 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 6988

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     6989 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 7048

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7049 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 7108

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7109 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 7168

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7169 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 7228

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7229 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 7288

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7289 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 7348

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7349 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 7408

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 7468

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 7528

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 7588

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 7648

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7649 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 7708

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7709 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 7768

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7769 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 7828

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7829 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 7888

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7889 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 7948

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7949 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 8008

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8009 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 8068

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8069 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 8128

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8129 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 8188

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8189 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 8248

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8249 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 8308

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8309 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 8368

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8369 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 8428

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8429 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 8488

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8489 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 8548

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8549 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 8608

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8609 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 8668

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8669 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 8728

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8729 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 8788

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8789 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 8848

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8849 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 8908

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     8909 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 8968

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8969 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 9028

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9029 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 9088

  5902820 TCCTGTTCTTTG 5902831
          ||||||||||||
     9089 TCCTGTTCTTTG 9100

Alignment time is 6.9198 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3972] =>      3972 nucs 'mol-32-32fb-133699_3972'

Score:        3860
Aligned:      3948        nucs
Identic:      3940 (100%) nucs =>      1887 (100%)      2053 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5898876,5900769] EXCISED REGION [5900778,5902831]
 second seq =>  [      1,   1894] EXCISED REGION [   1919,   3972]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [5900770,5900777]
 second seq =>        24 nucs [1895,1918]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5900770,5900770] to [5900778,5900778]
 second seq =>         1 nucs [1894,1894] to [1918,1918]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5900769,5900769] to [5900778,5900778]
 second seq =>         1 nucs [1894,1894] to [1919,1919]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5900770,5900772] to [5900775,5900777]
 second seq =>         0 nucs

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 60

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
       61 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 120

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 180

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 240

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      241 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 300

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 360

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 420

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 480

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 540

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 600

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 660

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 720

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 780

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 840

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 900

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      901 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 960

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1020

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1080

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1140

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1200

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1260

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 1320

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1321 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 1380

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 1440

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 1500

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 1560

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 1620

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 1680

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 1740

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 1800

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 1860

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 5900769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTAC 1894

EXCISED REGION

  5900778 CCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTC 5900837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTC 1978

  5900838 AAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAG 5900897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAG 2038

  5900898 AAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATG 5900957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATG 2098

  5900958 TCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGT 5901017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGT 2158

  5901018 GCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAA 5901077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAA 2218

  5901078 ACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAG 5901137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAG 2278

  5901138 TCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTA 5901197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTA 2338

  5901198 AAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAAT 5901257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAAT 2398

  5901258 GTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACAT 5901317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACAT 2458

  5901318 CCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAAT 5901377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAAT 2518

  5901378 ATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGC 5901437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGC 2578

  5901438 ACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATAT 5901497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATAT 2638

  5901498 ATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAA 5901557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAA 2698

  5901558 TTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGA 5901617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGA 2758

  5901618 AACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATA 5901677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATA 2818

  5901678 GATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATG 5901737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATG 2878

  5901738 AGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTG 5901797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTG 2938

  5901798 ACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATC 5901857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATC 2998

  5901858 TATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCT 5901917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCT 3058

  5901918 ATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAAT 5901977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAAT 3118

  5901978 AATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTG 5902037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTG 3178

  5902038 GGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGAT 5902097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGAT 3238

  5902098 ATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACA 5902157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACA 3298

  5902158 TGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATT 5902217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATT 3358

  5902218 ATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATAT 5902277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATAT 3418

  5902278 TGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGC 5902337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGC 3478

  5902338 TCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTA 5902397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTA 3538

  5902398 GAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTA 5902457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTA 3598

  5902458 AATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAG 5902517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAG 3658

  5902518 TGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCA 5902577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCA 3718

  5902578 TAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTC 5902637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTC 3778

  5902638 CAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAA 5902697
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAA 3838

  5902698 AGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCC 5902757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCC 3898

  5902758 CTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCA 5902817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCA 3958

  5902818 GCTCCTGTTCTTTG 5902831
          ||||||||||||||
     3959 GCTCCTGTTCTTTG 3972

Alignment time is 3.9169 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3581] =>      3581 nucs 'mol-32-3311-285267_3581'

Score:        3348
Aligned:      3601        nucs
Identic:      3551 ( 99%) nucs =>      1336 ( 98%)      2215 ( 99%)
Gaps:           36 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897086,5898447] EXCISED REGION [5898876,5901098]
 second seq =>  [      1,   1342] EXCISED REGION [   1343,   3581]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5897086 ACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACAT 5897145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACAT 60

  5897146 TTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTG 5897205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTG 120

  5897206 GTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCG 5897265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCG 180

  5897266 AAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACT 5897325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACT 240

  5897326 TCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACC 5897385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACC 300

  5897386 ATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTC 5897445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTC 360

  5897446 TGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAG 5897505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAG 420

  5897506 GCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACC 5897565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACC 480

  5897566 CCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTC 5897625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTC 540

  5897626 TTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 5897685
          |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCAGGGAAACACACACACACA--------CACACACACACACACACACACACACACAC 592

  5897686 ACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGC 5897745
          ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||
      593 ACACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGC 640

  5897746 CGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAG 5897805
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 CGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAG 700

  5897806 TTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTA 5897865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 TTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTA 760

  5897866 GGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAG 5897925
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      761 GGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAG 820

  5897926 CCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATA 5897985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 CCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATA 880

  5897986 ATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTT 5898045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 ATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTT 940

  5898046 AAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAG 5898105
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 AAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAG 1000

  5898106 ATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTT 5898165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1001 ATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTT 1060

  5898166 GCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTG 5898225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 GCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTG 1120

  5898226 GCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGG 5898285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 GCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGG 1180

  5898286 GCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAG 5898345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 GCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAG 1240

  5898346 GAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTA 5898405
          ||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 GAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTA 1300

  5898406 TTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 1342

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 1402

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1403 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 1462

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 1522

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 1582

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1583 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 1642

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 1702

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 1762

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 1822

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 1882

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 1942

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 2002

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 2062

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 2122

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 2182

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 2242

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2243 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 2302

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 2362

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 2422

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 2482

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 2542

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 2602

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 2662

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2663 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 2722

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 2782

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 2842

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 2902

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 2962

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 3022

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 3082

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 3142

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 3202

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     3203 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 3262

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 3322

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 3382

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 3442

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 3502

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 3562

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGT 5901098
          |||||||||||||||||||
     3563 TTCTAGTAAACACTGATGT 3581

Alignment time is 3.38067 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,  10468] =>     10468 nucs 'mol-32-331c-124932_10468'

Score:       10012
Aligned:     10489        nucs
Identic:     10408 ( 99%) nucs =>      1917 ( 99%)      8491 ( 99%)
Gaps:           52 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5896502,5898447] EXCISED REGION [5898876,5907387]
 second seq =>  [      1,   1928] EXCISED REGION [   1929,  10468]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5896502 TCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGT 5896561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
        1 TCGAAGTCCATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGT 60

  5896562 TAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTA 5896621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCTGAATAGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTA 120

  5896622 GGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAAC 5896681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGATTGGAGTGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAAC 180

  5896682 TGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTG 5896741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTGTAATTCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTG 240

  5896742 TAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTA 5896801
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      241 TAGTACTTAGGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTA 300

  5896802 GATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTA 5896861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTTGCACAGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTA 360

  5896862 ACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCT 5896921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      361 ACACAAAAGAGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCT 420

  5896922 GACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA 5896981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACAGGCAGCCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA 480

  5896982 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTC 5897041
          |||||||||||||||||    ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTTTTTTTTTTTTT----ACTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTC 536

  5897042 CTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGG 5897101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      537 CTCTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGG 596

  5897102 ATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAA 5897161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 ATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAA 656

  5897162 TTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCG 5897221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCG 716

  5897222 AGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCA 5897281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 AGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCA 776

  5897282 TCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTA 5897341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTA 836

  5897342 TTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATT 5897401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATT 896

  5897402 GGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGC 5897461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGC 956

  5897462 CCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCC 5897521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCC 1016

  5897522 AGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCT 5897581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 AGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCT 1076

  5897582 TGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACAC 5897641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACAC 1136

  5897642 ACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAG 5897701
          |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 ACACACA--CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAG 1194

  5897702 AGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAA 5897761
          ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 AGAGAG------------CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAA 1242

  5897762 AAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTA 5897821
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 AAACATCTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTA 1302

  5897822 AATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCA 5897881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 AATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCA 1362

  5897882 AAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTC 5897941
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 AAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTC 1422

  5897942 AGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTT 5898001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 AGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTT 1482

  5898002 GGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATG 5898061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1483 GGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATG 1542

  5898062 ATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCT 5898121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 ATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCT 1602

  5898122 TGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTAC 5898181
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 TGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTAC 1662

  5898182 TTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGG 5898241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 TTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGG 1722

  5898242 TAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTG 5898301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 TAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTG 1782

  5898302 TCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCC 5898361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1783 TCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCC 1842

  5898362 CAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATA 5898421
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 CAGTGGATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATA 1902

  5898422 TGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 5898447
          ||||||||||||||||||||||||||
     1903 TGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAG 1928

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 1988

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1989 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 2048

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 2108

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 2168

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2169 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 2228

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 2288

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 2348

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 2408

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 2468

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 2528

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 2588

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 2648

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 2708

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 2768

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 2828

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2829 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 2888

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 2948

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 3008

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 3068

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 3128

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 3188

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 3248

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3249 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 3308

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 3368

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 3428

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 3488

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 3548

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 3608

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 3668

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 3728

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 3788

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     3789 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 3848

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 3908

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 3968

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 4028

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 4088

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 4148

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 4208

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 4268

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 4328

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 4388

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 4448

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 4508

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 4568

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 4628

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4629 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 4688

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 4748

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 4808

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 4868

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 4928

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 4988

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4989 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5048

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5049 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5108

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5109 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5168

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5169 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5228

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5229 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5288

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5289 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5348

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5349 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5408

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5409 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5468

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5469 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5528

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5529 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5588

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5648

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5708

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5768

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5828

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5888

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5948

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 6008

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 6068

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 6128

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 6188

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 6248

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6249 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 6308

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6309 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 6368

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6369 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 6428

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6429 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 6488

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6489 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 6548

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6549 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 6608

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6609 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 6668

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6669 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 6728

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6729 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 6785

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 6845

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 6905

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 6965

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6966 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 7025

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7026 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 7085

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 7145

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 7205

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 7265

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 7325

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 7385

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 7445

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 7505

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 7565

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 7625

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 7685

  5904617 A------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTAGT 5904664
          |            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTAGT 7745

  5904665 CAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAAGC 5904724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 CAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAAGC 7805

  5904725 TTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATCTT 5904784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 TTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATCTT 7865

  5904785 TACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCATG 5904844
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 TACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCATG 7925

  5904845 TTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTCTT 5904904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 TTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTCTT 7985

  5904905 CTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCTAC 5904964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 CTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCTAC 8045

  5904965 CCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAATG 5905024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 CCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAATG 8105

  5905025 ATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGCCT 5905084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 ATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGCCT 8165

  5905085 TGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCGTG 5905144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 TGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCGTG 8225

  5905145 GTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGTTA 5905204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 GTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGTTA 8285

  5905205 CTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTTTC 5905264
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 CTTCTTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTTTC 8345

  5905265 CTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATTTG 5905324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 CTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATTTG 8405

  5905325 GATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAGAA 5905384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 GATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAGAA 8465

  5905385 TTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGCAG 5905444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 TTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGCAG 8525

  5905445 GGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTGCA 5905504
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8526 GGCTTCATGTCCCAAGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTGCA 8585

  5905505 CTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATTCT 5905564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8586 CTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATTCT 8645

  5905565 TTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAAAG 5905624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     8646 TTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTTTGTGTCATCGAGGGAAAG 8705

  5905625 AGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATGGT 5905684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8706 AGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATGGT 8765

  5905685 GAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCAGA 5905744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8766 GAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGTTGGTTATCAGA 8825

  5905745 TCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGCAC 5905804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8826 TCCCTTGCTTCTTAAAAACACTATCCACGTCAGCCTCCCTGGTAGAAAATGGTGTGGCAC 8885

  5905805 GTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGCCG 5905864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8886 GTTCTGTGGATTAGACCATTCAGCAGCCAGCCCCTCCTCCTCATGGACTGCTCTGCGCCG 8945

  5905865 CAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCGAA 5905924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8946 CAGCACTGGAAGGCTAAAATCTATGCCTCACATTCCCTGCTGCCAGGATTGGGAGGCGAA 9005

  5905925 TTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTCCA 5905984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9006 TTAAGTCTTCCCAGTTAGATGCTGTATTATTTATCTATTGCTGAGTAACAAATTGCTCCA 9065

  5905985 GAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGCAG 5906044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9066 GAAGTCAGCAGCTCACTATAGTAAACATTTCTTCTCTCCCCTGGTTCTGTGGGTCAGCAG 9125

  5906045 TCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCAGC 5906104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9126 TCTGGGAGCAGCTTAACTGGGTGGTTCTGGCCCAGGGCCTCTCACGAGGCTGTAGTCAGC 9185

  5906105 TGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCAGT 5906164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9186 TGTCAGCTGGAGAAGCTGCCTCCACGCTTACTCACACGGTTGTTGGCAGGAGGCCTCAGT 9245

  5906165 TCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACCGG 5906224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9246 TCCTCACCACGTGGGCTTCTCCCCAGGGCCGCCTGAGTGTCCTCAAGACAAGGCAACCGG 9305

  5906225 TTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATAGA 5906284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9306 TTTCCCCCAGAACAAAAGACCTGGGAGAGAAACAGACTATGAGTCCCTTACTGAGATAGA 9365

  5906285 AGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTATT 5906344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9366 AGTCACAGTGTCTTCTGAAACCCAGTCTTATAAGTGGCACACCCTCACTTCTGCTGTATT 9425

  5906345 CTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTGGA 5906404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9426 CTGTTGCTCACACAGACCATCCCTGGTACCATGTGGGAGGAGGCTACACAAGGGCGTGGA 9485

  5906405 CACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGACT 5906464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9486 CACCTGAAGGCAGGGACCGCTGGGGCCATCACAGACGGGCCTGTGAAGCATGTCCAGACT 9545

  5906465 TGTCTTCATGGATCTGAAAGGCATTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCTGG 5906524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9546 TGTCTTCATGGATCTGAAAGGCATTCTTGTGGCTGTGGTGACCAGCTCAGCTCTGTCTGG 9605

  5906525 TCCTCGGCTTCCTAGTGGTGGGATCACTCGCTTCCCGATCTCTGCATCTCAGCTGTGGCT 5906584
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9606 TCCTTGGCTTCCTAGTGGTGGGATCACTCGCTTCCCGATCTCTGCATCTCAGCTGTGGCT 9665

  5906585 TCTTACTCTTGAGCTCAGCAGTTCCAAGGCCATCTCCTGGAGTCCTTCCTCCAGCCCTTC 5906644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9666 TCTTACTCTTGAGCTCAGCAGTTCCAAGGCCATCTCCTGGAGTCCTTCCTCCAGCCCTTC 9725

  5906645 CAATGCATTACATTTTCTTTCCTTAAAAATAGCTGAAGTGGTTTCCTATTCCTGGAACTG 5906704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9726 CAATGCATTACATTTTCTTTCCTTAAAAATAGCTGAAGTGGTTTCCTATTCCTGGAACTG 9785

  5906705 GACCATGGCTGATACAGGCGGGTATCAGCCTGCCAAGGAATAACAGCAAACATTACCATG 5906764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9786 GACCATGGCTGATACAGGCGGGTATCAGCCTGCCAAGGAATAACAGCAAACATTACCATG 9845

  5906765 CAATATGTAAGTATGTTACATTCATTCATCAGATTTTACAGATGTGGAAACTGAGATGCT 5906824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9846 CAATATGTAAGTATGTTACATTCATTCATCAGATTTTACAGATGTGGAAACTGAGATGCT 9905

  5906825 GGGAAATTAAGTGAACAGCCCAGGCTCACACAGGCAATGAAAACTACAGCTGGATTTCAG 5906884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9906 GGGAAATTAAGTGAACAGCCCAGGCTCACACAGGCAATGAAAACTACAGCTGGATTTCAG 9965

  5906885 AGCCCACACTCTTAATGCTGCCACATTGGGGCCACTCAGAAGGTTGCATCTTATGTGGCT 5906944
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9966 AGCCCACACTCTTAACGCTGCCACATTGGGGCCACTCAGAAGGTTGCATCTTATGTGGCT 10025

  5906945 TTCCCTTATAAGGGAAAAGGGCTAAAAGGACTTTGGTGTCCGTTCAAAAGGCTGATGAGA 5907004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10026 TTCCCTTATAAGGGAAAAGGGCTAAAAGGACTTTGGTGTCCGTTCAAAAGGCTGATGAGA 10085

  5907005 TCTTGGGTTTCTTCATAAAATCATTTTTTATTTTTATGAGACATCTGGCAGGTAATAATT 5907064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10086 TCTTGGGTTTCTTCATAAAATCATTTTTTATTTTTATGAGACATCTGGCAGGTAATAATT 10145

  5907065 TATTGTCAGGAATCTCAAACCCCAGGCAAAATACTGCACCAGGGTAACAGCCAAGGCCAG 5907124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10146 TATTGTCAGGAATCTCAAACCCCAGGCAAAATACTGCACCAGGGTAACAGCCAAGGCCAG 10205

  5907125 TAGGTGAAGGCCAGCAAGGCCAACCTCTCATTTCTCCTACTGACATCTGAGTAGGTGTCC 5907184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10206 TAGGTGAAGGCCAGCAAGGCCAACCTCTCATTTCTCCTACTGACATCTGAGTAGGTGTCC 10265

  5907185 CAACATCAGGGAACACATTTTAAATATTTTTTGAAAAATTTTACCCAAGACCCAATTTTG 5907244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10266 CAACATCAGGGAACACATTTTAAATATTTTTTGAAAAATTTTACCCAAGACCCAATTTTG 10325

  5907245 TTCAGACTTTACATTGACACAAATTACCCTTACTCTGCATTAAATATTACTATCATTTCT 5907304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10326 TTCAGACTTTACATTGACACAAATTACCCTTACTCTGCATTAAATATTACTATCATTTCT 10385

  5907305 ATAGAGTCATAGCAATCAAGTTCCAGTGAAACCCACTTGCTACCATAAAGACACATGCAT 5907364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10386 ATAGAGTCATAGCAATCAAGTTCCAGTGAAACCCACTTGCTACCATAAAGACACATGCAT 10445

  5907365 GCATGTGTTCATCACAGGACTGT 5907387
          |||||||||||||||||||||||
    10446 GCATGTGTTCATCACAGGACTGT 10468

Alignment time is 8.03641 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   6677] =>      6677 nucs 'mol-32-33ab-048220_6677'

Score:        6586
Aligned:      6640        nucs
Identic:      6631 (100%) nucs =>      1205 (100%)      5426 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5894259,5895463] EXCISED REGION [5895500,5900934]
 second seq =>  [      1,   1205] EXCISED REGION [   1206,   6633]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        36 nucs [5895464,5895499]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        55 nucs [5895464,5895518] to [5895500,5895554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5895464,5895464] to [5895499,5895499]
 second seq =>         0 nucs

  5894259 TGTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTT 5894318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTT 60

  5894319 TTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTG 5894378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTG 120

  5894379 ACCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCG 5894438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTCGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCG 180

  5894439 TGGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAA 5894498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTCTGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAA 240

  5894499 GGTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGT 5894558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTCACTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGT 300

  5894559 GCTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCC 5894618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTACACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCC 360

  5894619 TTTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGA 5894678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAGTATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGA 420

  5894679 CAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTG 5894738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAATGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTG 480

  5894739 ACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTA 5894798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTGTGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTA 540

  5894799 GGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCA 5894858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCA 600

  5894859 CTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTT 5894918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTT 660

  5894919 GACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTC 5894978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTC 720

  5894979 TGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTT 5895038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTT 780

  5895039 CTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGC 5895098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGC 840

  5895099 TGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCT 5895158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCT 900

  5895159 CAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTG 5895218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTG 960

  5895219 CCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTAC 5895278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTAC 1020

  5895279 TTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGAC 5895338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGAC 1080

  5895339 CCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGT 5895398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGT 1140

  5895399 CACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTG 5895458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTG 1200

  5895459 ATCAA 5895463
          |||||
     1201 ATCAA 1205

EXCISED REGION

  5895500 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 5895559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 1265

  5895560 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 5895619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 1325

  5895620 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 5895679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 1385

  5895680 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 5895739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 1445

  5895740 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 5895799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 1505

  5895800 AGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 5895859
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 AGATGTCGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 1565

  5895860 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 5895919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 1625

  5895920 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 5895979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 1685

  5895980 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 5896039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 1745

  5896040 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 5896099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 1805

  5896100 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 5896159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 1865

  5896160 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 5896219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 1925

  5896220 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 5896279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 1985

  5896280 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 5896339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 2045

  5896340 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 5896399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 2105

  5896400 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 5896459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 2165

  5896460 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 5896519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 2225

  5896520 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 5896579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 2285

  5896580 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 5896639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 2345

  5896640 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 5896699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 2405

  5896700 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 5896759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 2465

  5896760 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 5896819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 2525

  5896820 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 5896879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 2585

  5896880 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 5896939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 2645

  5896940 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT 5896999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2646 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA-TTTTTTTTTTTTTTTTT 2704

  5897000 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 5897059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 2764

  5897060 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 5897119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 2824

  5897120 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 5897179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 2884

  5897180 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 5897239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 2944

  5897240 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 5897299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 3004

  5897300 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 5897359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 3064

  5897360 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5897419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 3124

  5897420 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5897479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 3184

  5897480 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5897539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 3244

  5897540 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5897599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 3304

  5897600 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5897659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||
     3305 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACAT------ACAC 3358

  5897660 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5897719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 3418

  5897720 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5897779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 3478

  5897780 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5897839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 3538

  5897840 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5897899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 3598

  5897900 CTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5897959
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 3658

  5897960 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5898019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 3718

  5898020 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5898079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 3778

  5898080 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5898139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 3838

  5898140 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5898199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 3898

  5898200 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5898259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 3958

  5898260 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 5898319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 4018

  5898320 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 5898379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 4078

  5898380 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 5898439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 4138

  5898440 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 5898499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 4198

  5898500 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 5898559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 4258

  5898560 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 5898619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 4318

  5898620 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 5898679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 4378

  5898680 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 5898739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 4438

  5898740 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 5898799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 4498

  5898800 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 5898859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 4558

  5898860 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 5898919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 4618

  5898920 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 5898979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 4678

  5898980 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 5899039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 4738

  5899040 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 5899099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 4798

  5899100 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 5899159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 4858

  5899160 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 5899219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 4918

  5899220 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 5899279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 4978

  5899280 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 5899339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 5038

  5899340 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 5899399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 5098

  5899400 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 5899459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 5158

  5899460 CCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACC 5899519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 CCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACC 5218

  5899520 ACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAG 5899579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 ACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAG 5278

  5899580 CATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGG 5899639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGG 5338

  5899640 GCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACC 5899699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 GCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACC 5398

  5899700 GTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCA 5899759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 GTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCA 5458

  5899760 AGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTC 5899819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 AGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTC 5518

  5899820 CCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCT 5899879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 CCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCT 5578

  5899880 GAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCC 5899939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 GAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCC 5638

  5899940 CACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACT 5899999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 CACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACT 5698

  5900000 ATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTC 5900059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 ATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTC 5758

  5900060 AGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCAT 5900119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 AGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCAT 5818

  5900120 ATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAAT 5900179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 ATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAAT 5878

  5900180 CCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCT 5900239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 CCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCT 5938

  5900240 CTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCA 5900299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 CTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCA 5998

  5900300 GCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACAT 5900359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 GCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACAT 6058

  5900360 GGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAG 5900419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 GGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAG 6118

  5900420 TGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAG 5900479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 TGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAG 6178

  5900480 AAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTC 5900539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 AAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTC 6238

  5900540 TAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATT 5900599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATT 6298

  5900600 GGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGC 5900659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 GGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGC 6358

  5900660 TTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATA 5900719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 TTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATA 6418

  5900720 GTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCC 5900779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 GTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACCTGCTCTGCC 6478

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 6538

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 6598

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTA 5900934
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTA 6633

Alignment time is 5.36569 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   6457] =>      6457 nucs 'mol-32-33ab-076625_6457'

Score:        6421
Aligned:      6462        nucs
Identic:      6455 (100%) nucs =>      3115 (100%)      3340 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5892344,5895463] EXCISED REGION [5895500,5898841]
 second seq =>  [      1,   3115] EXCISED REGION [   3116,   6457]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        36 nucs [5895464,5895499]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        55 nucs [5895464,5895518] to [5895500,5895554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5895464,5895464] to [5895499,5895499]
 second seq =>         0 nucs

  5892344 CGTCGGAAAAGCGCAGTATTCGGGTGGGAGTGACCCGATTTTCCAGGTGCCGTCCGTCAC 5892403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGTCGGAAAAGCGCAGTATTCGGGTGGGAGTGACCCGATTTTCCAGGTGCCGTCCGTCAC 60

  5892404 CCCTTTCTTTGACTCGGAAAGGGAACTCCCTGACCCCTTGCGCTTCCCGAGTGAGGCAGT 5892463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCTTTCTTTGACTCGGAAAGGGAACTCCCTGACCCCTTGCGCTTCCCGAGTGAGGCAGT 120

  5892464 GCCTCGCCCTGCTTCGGCTCGCACACGGTGCGCGCACCCACTGACCTGCGCCCGCTCTCT 5892523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTCGCCCTGCTTCGGCTCGCACACGGTGCGCGCACCCACTGACCTGCGCCCGCTCTCT 180

  5892524 GGCACTCCCTAGTGAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAGAAATCACCGTCTTC 5892583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCACTCCCTAGTGAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAGAAATCACCGTCTTC 240

  5892584 TGCGTCGCTCACGCTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTGGCTCC 5892643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCGTCGCTCACGCTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTGGCTCC 300

  5892644 TCCAGGCCAATTTACTTTCAAAAATACCTGCATCCAGGAACTCTCATGCTAGCAGGATGA 5892703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAGGCCAATTTACTTTCAAAAATACCTGCATCCAGGAACTCTCATGCTAGCAGGATGA 360

  5892704 GGTAATGACTATTTCCCATACTCGTGTCAACTTTGAGCAATGCTAGGAATTTCCATATGT 5892763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTAATGACTATTTCCCATACTCGTGTCAACTTTGAGCAATGCTAGGAATTTCCATATGT 420

  5892764 CCAAACAACTGTTTATCAGGAAATGCAACAAGGTACTTTTGACACTGAGCGTGAAAGGAA 5892823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAAACAACTGTTTATCAGGAAATGCAACAAGGTACTTTTGACACTGAGCGTGAAAGGAA 480

  5892824 CTCATTGAACCAAAATCTTCCAAAAAGACTGGAACATAAGAGAGCGGATGAAGAGCATAA 5892883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCATTGAACCAAAATCTTCCAAAAAGACTGGAACATAAGAGAGCGGATGAAGAGCATAA 540

  5892884 TAGAAGAGAAGTGCCAGGGAGGAGGATTATCTTAGGCAGAGCACACTGAGGATGGAGAGT 5892943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAAGAGAAGTGCCAGGGAGGAGGATTATCTTAGGCAGAGCACACTGAGGATGGAGAGT 600

  5892944 TACCAGCCCTCCCGAGCTGTCGTTGGCACTGAACCAATGAGAGCCATTCATGTGCCTGTC 5893003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACCAGCCCTCCCGAGCTGTCGTTGGCACTGAACCAATGAGAGCCATTCATGTGCCTGTC 660

  5893004 TGTGCCTTGTGTTTTTCTTCTTCAACATATACTTTAGAACATCCATTCTGTGCAAAGCTC 5893063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGCCTTGTGTTTTTCTTCTTCAACATATACTTTAGAACATCCATTCTGTGCAAAGCTC 720

  5893064 TGTGCCCACAGCTGTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCCCTGAAGACCCCAGCA 5893123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGCCCACAGCTGTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCCCTGAAGACCCCAGCA 780

  5893124 GTCAGGCCAGGGAGAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGTCCCTGGGGAAAGGTG 5893183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCAGGCCAGGGAGAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGTCCCTGGGGAAAGGTG 840

  5893184 AGTGGTGCCCGATGAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGGGCTACAGTGGTCAGG 5893243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGGTGCCCGATGAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGGGCTACAGTGGTCAGG 900

  5893244 AAAGGCTTTGGAATAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTGGGTACCACGCAGTGT 5893303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAGGCTTTGGAATAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTGGGTACCACGCAGTGT 960

  5893304 TTTAAGCACTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTAGGTAGGCACTAATA 5893363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTAAGCACTTTCTGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTAGGTAGGCACTAATA 1020

  5893364 GTACCTACAATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAATACCTTGCACCAGG 5893423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTACCTACAATTTACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAATACCTTGCACCAGG 1080

  5893424 TTGCGGAGGTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGGATTCCTTATTAACC 5893483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCGGAGGTGGTGGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGGATTCCTTATTAACC 1140

  5893484 GTGATTCTATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAACAAATCACTATGACC 5893543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGATTCTATGCAGCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAACAAATCACTATGACC 1200

  5893544 ATAGTTGCATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGGGTCAGGAATTTGGA 5893603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAGTTGCATAAAGCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGGGTCAGGAATTTGGA 1260

  5893604 TAGAACACATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCTTGACTGGGTGCATG 5893663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGAACACATCAGGGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCTTGACTGGGTGCATG 1320

  5893664 AACACCGGGGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATCCATGTGTCCAGTAG 5893723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACACCGGGGGTTGACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATCCATGTGTCCAGTAG 1380

  5893724 ATGATACTGGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGAACACCCATACGTGG 5893783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGATACTGGCTGTCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGAACACCCATACGTGG 1440

  5893784 CCTCTCCAGGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAGCAGTCAGACTTCAT 5893843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTCTCCAGGTGGCCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAGCAGTCAGACTTCAT 1500

  5893844 ACACTATGGCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAGAGGAAGCAGCATTG 5893903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACACTATGGCTTAAGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAGAGGAAGCAGCATTG 1560

  5893904 CCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTCAGATTTAACAGGAG 5893963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTTTCCTGAGCTAACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTCAGATTTAACAGGAG 1620

  5893964 GGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATGTCAAAGAATTTGCA 5894023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGATACAGACCCCTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATGTCAAAGAATTTGCA 1680

  5894024 GCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGTTTACAGCAAAATTG 5894083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCATTTTTTTGGTAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGTTTACAGCAAAATTG 1740

  5894084 GTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCCACGGCAGTCTTTTT 5894143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTAGAAGGTACAGAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCCACGGCAGTCTTTTT 1800

  5894144 TTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGGGCA 5894203
          |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTT-----GGAGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGGGCA 1855

  5894204 GTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCT 5894263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCT 1915

  5894264 CAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGT 5894323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CAGCCTCCCGGGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGT 1975

  5894324 ATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTC 5894383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 ATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTC 2035

  5894384 GTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTC 5894443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTC 2095

  5894444 TGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCA 5894503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TGGCGTGGTACTTTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCA 2155

  5894504 CTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTA 5894563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CTTTGCTTGTCGTCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTA 2215

  5894564 CACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAG 5894623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CACTGGCCTTTCAGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAG 2275

  5894624 TATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAA 5894683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TATTAATTAATTCTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAA 2335

  5894684 TGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTG 5894743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGAATTGTTTCATTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTG 2395

  5894744 TGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAG 5894803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TGAGTTCTCTTTGTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAG 2455

  5894804 AGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCC 5894863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 AGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCC 2515

  5894864 AGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCA 5894923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCA 2575

  5894924 GCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTG 5894983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTG 2635

  5894984 CTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACT 5895043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACT 2695

  5895044 ATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGT 5895103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGT 2755

  5895104 TTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATC 5895163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATC 2815

  5895164 TAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCAT 5895223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCAT 2875

  5895224 CGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATC 5895283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATC 2935

  5895284 CTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCA 5895343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 CTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCA 2995

  5895344 CCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTG 5895403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 CCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTG 3055

  5895404 GGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 5895463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 GGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 3115

EXCISED REGION

  5895500 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 5895559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 3175

  5895560 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 5895619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 3235

  5895620 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 5895679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 3295

  5895680 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 5895739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 3355

  5895740 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 5895799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 3415

  5895800 AGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 5895859
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AGATGTCGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 3475

  5895860 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 5895919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 3535

  5895920 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 5895979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 3595

  5895980 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 5896039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 3655

  5896040 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 5896099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 3715

  5896100 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 5896159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 3775

  5896160 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 5896219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 3835

  5896220 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 5896279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 3895

  5896280 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 5896339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 3955

  5896340 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 5896399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 4015

  5896400 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 5896459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 4075

  5896460 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 5896519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 4135

  5896520 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 5896579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 4195

  5896580 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 5896639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 4255

  5896640 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 5896699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 4315

  5896700 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 5896759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 4375

  5896760 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 5896819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 4435

  5896820 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 5896879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 4495

  5896880 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 5896939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 4555

  5896940 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT 5896999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT 4615

  5897000 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 5897059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 4675

  5897060 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 5897119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 4735

  5897120 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 5897179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 4795

  5897180 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 5897239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 4855

  5897240 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 5897299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 4915

  5897300 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 5897359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 4975

  5897360 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5897419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5035

  5897420 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5897479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5095

  5897480 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5897539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5155

  5897540 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5897599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5215

  5897600 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5897659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5275

  5897660 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5897719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5335

  5897720 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5897779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5395

  5897780 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5897839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5455

  5897840 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5897899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5515

  5897900 CTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5897959
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 CTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5575

  5897960 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5898019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5635

  5898020 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5898079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5695

  5898080 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5898139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5755

  5898140 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5898199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5815

  5898200 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5898259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5875

  5898260 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 5898319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 5935

  5898320 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 5898379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 5995

  5898380 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 5898439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 6055

  5898440 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 5898499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 6115

  5898500 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 5898559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 6175

  5898560 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 5898619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 6235

  5898620 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 5898679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 6295

  5898680 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 5898739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 6355

  5898740 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 5898799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6356 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 6415

  5898800 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCC 5898841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6416 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCC 6457

Alignment time is 5.42259 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,  10534] =>     10534 nucs 'mol-32-33ab-094406_10534'

Score:       10074
Aligned:     10555        nucs
Identic:     10472 ( 99%) nucs =>      3633 ( 99%)      6839 ( 99%)
Gaps:           54 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5894784,5898447] EXCISED REGION [5898876,5905733]
 second seq =>  [      1,   3646] EXCISED REGION [   3647,  10534]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5894784 CATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCT 5894843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCT 60

  5894844 TTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTAC 5894903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTAC 120

  5894904 TTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGA 5894963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGA 180

  5894964 GGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCT 5895023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCT 240

  5895024 GTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTT 5895083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTT 300

  5895084 TACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAAT 5895143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAAT 360

  5895144 AGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCA 5895203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      361 AGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTACCCAATCACAAGTCA 420

  5895204 TCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTG 5895263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTG 480

  5895264 TCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCT 5895323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCT 540

  5895324 AAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGG 5895383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGG 600

  5895384 TGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGC 5895443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGC 660

  5895444 TACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCT 5895503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCT 720

  5895504 TTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACAT 5895563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACAT 780

  5895564 CGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTG 5895623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTG 840

  5895624 CATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGA 5895683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGA 900

  5895684 CGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCC 5895743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCC 960

  5895744 TTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGAT 5895803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGAT 1020

  5895804 GTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTT 5895863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTT 1080

  5895864 GCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTT 5895923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTT 1140

  5895924 GCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCA 5895983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCA 1200

  5895984 TTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATA 5896043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATA 1260

  5896044 TTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCA 5896103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCA 1320

  5896104 TGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCC 5896163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCC 1380

  5896164 CACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAA 5896223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAA 1440

  5896224 AGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACG 5896283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACG 1500

  5896284 CAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGAT 5896343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGAT 1560

  5896344 TTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTT 5896403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTT 1620

  5896404 TGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGA 5896463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1621 TGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGA 1680

  5896464 TTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAA 5896523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAA 1740

  5896524 ACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAG 5896583
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAG 1800

  5896584 GATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACT 5896643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACT 1860

  5896644 GGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGA 5896703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGA 1920

  5896704 AGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCC 5896763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCC 1980

  5896764 CTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGA 5896823
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGA 2040

  5896824 TCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATG 5896883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATG 2100

  5896884 CACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGC 5896943
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGC 2160

  5896944 ATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA 5897003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |
     2161 ATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTT----A 2216

  5897004 CTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAG 5897063
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 CTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAG 2276

  5897064 CGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTAT 5897123
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTAT 2336

  5897124 GTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAG 5897183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAG 2396

  5897184 CCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTC 5897243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTC 2456

  5897244 TGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCA 5897303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCA 2516

  5897304 CTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAG 5897363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAG 2576

  5897364 CAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATT 5897423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATT 2636

  5897424 TCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGT 5897483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGT 2696

  5897484 GAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTG 5897543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTG 2756

  5897544 GGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGA 5897603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGA 2816

  5897604 AGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACAC 5897663
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
     2817 AGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACA--CACACACACACAC 2874

  5897664 ACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTT 5897723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||
     2875 ACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAG------------CTTT 2922

  5897724 GGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTTTATT 5897783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2923 GGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGTTTATT 2982

  5897784 CTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAG 5897843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 CTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGCCCAG 3042

  5897844 GATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTC 5897903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCACTTC 3102

  5897904 TTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGA 5897963
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 TGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATGGTGA 3162

  5897964 ACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAAC 5898023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 ACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGTGAAC 3222

  5898024 TAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGG 5898083
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 TAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGG 3282

  5898084 GCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTT 5898143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 GCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATTTGTT 3342

  5898144 GTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAG 5898203
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 GTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAG 3402

  5898204 TATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAA 5898263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGAGCAA 3462

  5898264 GGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAA 5898323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 GGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGTTCAA 3522

  5898324 AGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAGCAGG 5898383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||
     3523 AGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGAGCAGG 3582

  5898384 ACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGG 5898443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 ACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTAGAGG 3642

  5898444 GCAG 5898447
          ||||
     3643 GCAG 3646

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 3706

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3707 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 3766

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 3826

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 3886

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3887 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 3946

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 4006

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 4066

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 4126

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 4186

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 4246

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 4306

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 4366

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 4426

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 4486

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 4546

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4547 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 4606

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 4666

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 4726

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 4786

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 4846

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 4906

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 5900195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGG 4966

  5900196 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCC 5900255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4967 TTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGCCAGCAGCTGTCTGGCCTCCACTTCCC 5026

  5900256 ACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5900315
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 ACTAGCAATGGGATTTTCATCATCAGTTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATC 5086

  5900316 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5900375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 TTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGC 5146

  5900376 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5900435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 AGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCAT 5206

  5900436 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5900495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 ACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATG 5266

  5900496 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5900555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 CAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACC 5326

  5900556 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5900615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 TTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCT 5386

  5900616 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5900675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 GGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACAT 5446

  5900676 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5900735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 CTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTTCCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGA 5506

  5900736 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCAC----------------TACCTGCTCTGCC 5900779
          |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||.||
     5507 GGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTATCCACTACAACCTGATCAGATTACCTGCTCTCCC 5566

  5900780 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5900839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 ATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTTAATCTTTCTGATCCTCAA 5626

  5900840 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5900899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 ATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCATTTCAGAAAATTATAGAA 5686

  5900900 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5900959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 AATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAGTACCCAGAGATAGATGTC 5746

  5900960 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5901019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 CCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAATATAGTGGTAACCAAGTGC 5806

  5901020 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5901079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 GATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAAATCAGCATTATCAGAAAC 5866

  5901080 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5901139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 TTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTAAAAAAATAATGGCTAGTC 5926

  5901140 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5901199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 GTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTAGAAATAACCATGACTAAA 5986

  5901200 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 5901259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 ATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATAAATAAAATTAGGGAATGT 6046

  5901260 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 5901319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 TTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGCTTTATAGCTTGAACATCC 6106

  5901320 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 5901379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 CTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACTTTAATAACTGTATAATAT 6166

  5901380 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 5901439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 TCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATCAATGGGCACTTATTGCAC 6226

  5901440 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 5901499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 ACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACACACATATATATTTATATAT 6286

  5901500 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 5901559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 ATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTAGCCATAAAAACTGAAATT 6346

  5901560 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 5901619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 GTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTAAGTGAAAAAATTCAGAAA 6406

  5901620 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 5901679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 CAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAGACAAGGACATATAGA 6466

  5901680 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 5901739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 TTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGGAAGGAGGTGAGGGATGAG 6526

  5901740 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 5901799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 AAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCTTACACTAAAAGCACTGAC 6586

  5901800 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 5901859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 CTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGATACAGTACCCCCAAATCTA 6646

  5901860 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 5901919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 TAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGTATACATATATATATCTAT 6706

  5901920 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 5901979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 GTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACATCTTTCCTAATATAAATAA 6766

  5901980 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 5902039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 TTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATCTCTGATTCCTTCCTTGGG 6826

  5902040 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 5902099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 ATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAACATTCAAGTCATTTGATAT 6886

  5902100 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 5902159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 ATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACTCACGACTAGAAGTACATG 6946

  5902160 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 5902219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 TGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTACACTAGAGATGCTAATTAT 7006

  5902220 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 5902279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 GGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCTCAGCCACAGTTCATATTG 7066

  5902280 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 5902339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 AAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCCCTTCCCTAGGGATGGCTC 7126

  5902340 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 5902399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 ACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGGTAATTACTGGCACCTAGA 7186

  5902400 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 5902459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 GGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATTAATTTTAGAAATATTAAA 7246

  5902460 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 5902519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 TGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTTTAAATGAAAGTACCAGTG 7306

  5902520 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 5902579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 ACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCAAAAACGATGAATAGCATA 7366

  5902580 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 5902639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 AATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGGTGGAGAGAAGAGATTCCA 7426

  5902640 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 5902699
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 GGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTGAGGAAGTTGGGATTGAAACAGAGAGGGAAAG 7486

  5902700 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 5902759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7487 AGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAGCCTTAATTTCATGCCCCT 7546

  5902760 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 5902819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7547 AAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGGGGCCTGGCCAAGCCCAGC 7606

  5902820 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 5902879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7607 TCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTTAATATAACTCCCCGATTC 7666

  5902880 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 5902939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7667 CCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAATAACATGAATGATTCATGA 7726

  5902940 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 5902999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7727 GCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTTATCTTTATTGTTTGTCAC 7786

  5903000 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 5903059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7787 TGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGTGTGTGTATAGCATCCTTC 7846

  5903060 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 5903119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7847 CCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGGGCACAAACACTGAGTTTC 7906

  5903120 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 5903179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7907 TATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAGGGCAGGCCATATCAGTCT 7966

  5903180 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 5903239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7967 CTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTTGTCTTCCAGATGTGTGCA 8026

  5903240 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 5903299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8027 GATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAAGAGAAGGGACCCTATTAT 8086

  5903300 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 5903359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8087 AGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTCCCTATTCCCACCCACAAG 8146

  5903360 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 5903419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8147 CTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGG 8206

  5903420 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 5903479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8207 AGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCCAGCGATTCTG 8266

  5903480 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 5903539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8267 CTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGTCTGGCCAATTT 8326

  5903540 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 5903599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8327 TTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGATTTCGAACTCC 8386

  5903600 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 5903659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8387 TGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCC 8446

  5903660 ACCGTG---CCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 5903716
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8447 ACC---ATTCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAAATTTCACCAATTAAA 8503

  5903717 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 5903776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8504 TAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTACTGTATGTACATGTAT 8563

  5903777 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 5903836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8564 ATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATCTCCAACTAGCCCATA 8623

  5903837 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 5903896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8624 TCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTTTTAAAGGGAGAGAGA 8683

  5903897 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAGGTCAACAGCGCCCAG 5903956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     8684 GAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAGGGAGGTCAACAGCGCCCAG 8743

  5903957 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 5904016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     8744 GCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCAAGGTCTGCTCTAAATTATAATT 8803

  5904017 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 5904076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8804 TTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAGTTTCGATTTGTGCCA 8863

  5904077 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 5904136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8864 TGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTCCCAGTATTTATATAT 8923

  5904137 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 5904196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8924 AAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTATAAATCATGTTCCTCT 8983

  5904197 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 5904256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8984 TTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTTTATATTTTGACTTTT 9043

  5904257 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 5904316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9044 AATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAGAATCAATTCGATTAA 9103

  5904317 GCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 5904376
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9104 GCACAGGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAACCACTCAATAATTTT 9163

  5904377 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 5904436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9164 CATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAATTTCCCACTTTCCAC 9223

  5904437 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 5904496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9224 CAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCATGTGAAGCCTAAGGA 9283

  5904497 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 5904556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9284 TAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAACATCTCAGAGTGTTTG 9343

  5904557 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 5904616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9344 CTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGATCCGTTTAGAGTGTTG 9403

  5904617 A--------------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 5904662
          |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9404 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACTA 9463

  5904663 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 5904722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9464 GTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTAA 9523

  5904723 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 5904782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9524 GCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTATC 9583

  5904783 TTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 5904842
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9584 TTTACTTTCCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCCA 9643

  5904843 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 5904902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9644 TGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACTC 9703

  5904903 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 5904962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9704 TTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATCT 9763

  5904963 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 5905022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9764 ACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTAA 9823

  5905023 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 5905082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9824 TGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTGC 9883

  5905083 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 5905142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9884 CTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTCG 9943

  5905143 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 5905202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9944 TGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAGT 10003

  5905203 TACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 5905262
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10004 TACTTCTTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTTT 10063

  5905263 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 5905322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10064 TCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAAGGAAAACAATTTCCCCTTTAAATAGGGTAATT 10123

  5905323 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 5905382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10124 TGGATCCCTTCAGGATCCACCTCAGGTGGTGTGGGCAGAGGGTCGCTGAAACTGCTCAAG 10183

  5905383 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 5905442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10184 AATTGTTCAACAATAGCCAAAGTGGGTCCGGTCAAATGGGTCTGCTACTAGCCTCCAAGC 10243

  5905443 AGGGCTTCATGTCCCAGGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 5905502
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10244 AGGGCTTCATGTCCCAAGCTGTTGTCTTGCACAGGTTTCTTTATGTTGCTACAGTGTTTG 10303

  5905503 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 5905562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10304 CACTTCACTGTAAGCCCCTAAGAGGAAAGGGTTCTGCTTAGCAGAGAATCCTGAGACATT 10363

  5905563 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTCTGTGTCATCGAGGGAA 5905622
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
    10364 CTTTGTGAAAGCTCTATGTGATACAGAAAGAATTCTCTTCTCTTTGTGTCATCGAGGGAA 10423

  5905623 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 5905682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10424 AGAGGCAAACTGTTGGTGAATGCCAATCATCACAAAAAAAGAAGGACTTCATTTGTAATG 10483

  5905683 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGT 5905733
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10484 GTGAATGAAGGCGGACAAGATTCTGGCAAGAGGGAGTTCTCTGGAATATGT 10534

Alignment time is 7.318 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3648] =>      3648 nucs 'mol-32-33ab-094406_3648'

Score:        3481
Aligned:      3652        nucs
Identic:      3634 (100%) nucs =>      2898 (100%)       736 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5894784,5897693] EXCISED REGION [5897708,5898449]
 second seq =>  [      1,   2906] EXCISED REGION [   2907,   3648]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [5897694,5897707]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>        12 nucs [5897696,5897707]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5897694,5897694] to [5897708,5897708]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5894784 CATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCT 5894843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGGGCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCT 60

  5894844 TTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTAC 5894903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCAGGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTAC 120

  5894904 TTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGA 5894963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCCCAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGA 180

  5894964 GGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCT 5895023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCATAAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCT 240

  5895024 GTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTT 5895083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAACTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTT 300

  5895084 TACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAAT 5895143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCTCTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAAT 360

  5895144 AGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCA 5895203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      361 AGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCTGGAGGTGTGGGTACCCAATCACAAGTCA 420

  5895204 TCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTG 5895263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAAGAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTG 480

  5895264 TCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCT 5895323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATTCTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCT 540

  5895324 AAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGG 5895383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCCACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGG 600

  5895384 TGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGC 5895443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCTGCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGC 660

  5895444 TACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCT 5895503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACTTTCTTCTCCTGATCAAGGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCT 720

  5895504 TTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACAT 5895563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCAACAT 780

  5895564 CGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTG 5895623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGTTCTG 840

  5895624 CATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGA 5895683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGATAGA 900

  5895684 CGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCC 5895743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTGGCCC 960

  5895744 TTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGAT 5895803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATAAGAT 1020

  5895804 GTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTT 5895863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCATGTT 1080

  5895864 GCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTT 5895923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTTTGTT 1140

  5895924 GCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCA 5895983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTGGTCA 1200

  5895984 TTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATA 5896043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTATATA 1260

  5896044 TTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCA 5896103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGCTGCA 1320

  5896104 TGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCC 5896163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGATGCC 1380

  5896164 CACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAA 5896223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAATGAAA 1440

  5896224 AGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACG 5896283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATCAACG 1500

  5896284 CAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGAT 5896343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAATGAT 1560

  5896344 TTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTT 5896403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTAAGTT 1620

  5896404 TGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAGGA 5896463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1621 TGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCAAAGA 1680

  5896464 TTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAA 5896523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCACCAA 1740

  5896524 ACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAG 5896583
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTACGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCACAAAG 1800

  5896584 GATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACT 5896643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGACACT 1860

  5896644 GGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGA 5896703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGACTGA 1920

  5896704 AGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCC 5896763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTCTTCC 1980

  5896764 CTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGA 5896823
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTCACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCTCAGA 2040

  5896824 TCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATG 5896883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCCTATG 2100

  5896884 CACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGC 5896943
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACAGCTTTCTCTGGCTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAGAAGC 2160

  5896944 ATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA 5897003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |
     2161 ATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTT----A 2216

  5897004 CTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAG 5897063
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 CTCTAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAATGAG 2276

  5897064 CGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTAT 5897123
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CGGTAGATACCCACGCACAGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTAT 2336

  5897124 GTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAG 5897183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAG 2396

  5897184 CCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTC 5897243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTC 2456

  5897244 TGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCA 5897303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCA 2516

  5897304 CTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAG 5897363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAG 2576

  5897364 CAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATT 5897423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATT 2636

  5897424 TCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGT 5897483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGT 2696

  5897484 GAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTG 5897543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTG 2756

  5897544 GGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGA 5897603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGA 2816

  5897604 AGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACACACAC 5897663
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2817 AGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACACACACACACACACAC 2876

  5897664 ACACACACACACACACACACACACACACAC 5897693
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 ACACACACACACACACACACACACACACAC 2906

EXCISED REGION

  5897708 AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACAT 5897767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 AGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACAT 2966

  5897768 TTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAA 5897827
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 CTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAA 3026

  5897828 CCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAA 5897887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 CCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAA 3086

  5897888 AATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCT 5897947
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 AATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCT 3146

  5897948 TCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATAT 5898007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATAT 3206

  5898008 TGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGC 5898067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3207 TGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGC 3266

  5898068 CTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAA 5898127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 CTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAA 3326

  5898128 GCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGT 5898187
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 GCCTAAAATATTTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGT 3386

  5898188 GCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTC 5898247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 GCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTC 3446

  5898248 TTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATC 5898307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATC 3506

  5898308 CCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGG 5898367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3507 CCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGG 3566

  5898368 ATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCT 5898427
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 ATCCACTGTGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCT 3626

  5898428 GAATCTAGGGTAGAGGGCAGCA 5898449
          ||||||||||||||||||||||
     3627 GAATCTAGGGTAGAGGGCAGCA 3648

Alignment time is 2.63033 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   7927] =>      7927 nucs 'mol-32-33b6-075143_7927'

Score:        7871
Aligned:      7932        nucs
Identic:      7924 (100%) nucs =>      3227 (100%)      4697 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5892237,5895463] EXCISED REGION [5895500,5900203]
 second seq =>  [      1,   3228] EXCISED REGION [   3229,   7927]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        36 nucs [5895464,5895499]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        55 nucs [5895464,5895518] to [5895500,5895554]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5895464,5895464] to [5895499,5895499]
 second seq =>         0 nucs

  5892237 GGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCA 5892296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCA 60

  5892297 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGGTGCGCCGTTTTTTAAGCCCGTCGGAAAAGCG 5892356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGGTGCGCCGTTTTTTAAGCCCGTCGGAAAAGCG 120

  5892357 CAGTATTCGGGTGGGAGTGACCCGATTTTCCAGGTGCCGTCCGTCACCCCTTTCTTTGAC 5892416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTATTCGGGTGGGAGTGACCCGATTTTCCAGGTGCCGTCCGTCACCCCTTTCTTTGAC 180

  5892417 TCGGAAAGGGAACTCCCTGACCCCTTGCGCTTCCCGAGTGAGGCAGTGCCTCGCCCTGCT 5892476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCGGAAAGGGAACTCCCTGACCCCTTGCGCTTCCCGAGTGAGGCAGTGCCTCGCCCTGCT 240

  5892477 TCGGCTCGCACACGGTGCGCGCACCCACTGACCTGCGCCCGCTCTCTGGCACTCCCTAGT 5892536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCGGCTCGCACACGGTGCGCGCACCCACTGACCTGCGCCCGCTCTCTGGCACTCCCTAGT 300

  5892537 GAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAGAAATCACCGTCTTCTGCGTCGCTCACG 5892596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAGAAATCACCGTCTTCTGCGTCGCTCACG 360

  5892597 CTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTGGCTCCTCCAGGCCAATTT 5892656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTCGGCCATCTTGGCTCCTCCAGGCCAATTT 420

  5892657 ACTTTCAAAAATACCTGCATCCAGGAACTCTCATGCTAGCAGGATGAGGTAATGACTATT 5892716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTTTCAAAAATACCTGCATCCAGGAACTCTCATGCTAGCAGGATGAGGTAATGACTATT 480

  5892717 TCCCATACTCGTGTCAACTTTGAGCAATGCTAGGAATTTCCATATGTCCAAACAACTGTT 5892776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCCATACTCGTGTCAACTTTGAGCAATGCTAGGAATTTCCATATGTCCAAACAACTGTT 540

  5892777 TATCAGGAAATGCAACAAGGTACTTTTGACACTGAGCGTGAAAGGAACTCATTGAACCAA 5892836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCAGGAAATGCAACAAGGTACTTTTGACACTGAGCGTGAAAGGAACTCATTGAACCAA 600

  5892837 AATCTTCCAAAAAGACTGGAACATAAGAGAGCGGATGAAGAGCATAATAGAAGAGAAGTG 5892896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATCTTCCAAAAAGACTGGAACATAAGAGAGCGGATGAAGAGCATAATAGAAGAGAAGTG 660

  5892897 CCAGGGAGGAGGATTATCTTAGGCAGAGCACACTGAGGATGGAGAGTTACCAGCCCTCCC 5892956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAGGGAGGAGGATTATCTTAGGCAGAGCACACTGAGGATGGAGAGTTACCAGCCCTCCC 720

  5892957 GAGCTGTCGTTGGCACTGAACCAATGAGAGCCATTCATGTGCCTGTCTGTGCCTTGTGTT 5893016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGCTGTCGTTGGCACTGAACCAATGAGAGCCATTCATGTGCCTGTCTGTGCCTTGTGTT 780

  5893017 TTTCTTCTTCAACATATACTTTAGAACATCCATTCTGTGCAAAGCTCTGTGCCCACAGCT 5893076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCTTCTTCAACATATACTTTAGAACATCCATTCTGTGCAAAGCTCTGTGCCCACAGCT 840

  5893077 GTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCCCTGAAGACCCCAGCAGTCAGGCCAGGGA 5893136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTGAGATGCCAGATGCATGCTGTTCCCTGCCCTGAAGACCCCAGCAGTCAGGCCAGGGA 900

  5893137 GAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGTCCCTGGGGAAAGGTGAGTGGTGCCCGAT 5893196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGAAGACATTCTTAGACAACCCAACAGTCGTCCCTGGGGAAAGGTGAGTGGTGCCCGAT 960

  5893197 GAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGGGCTACAGTGGTCAGGAAAGGCTTTGGAA 5893256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGGATTGAATAAGAGAAGACATCACCATGGGCTACAGTGGTCAGGAAAGGCTTTGGAA 1020

  5893257 TAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTGGGTACCACGCAGTGTTTTAAGCACTTTC 5893316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGAACAGCAAATCTTTATGGAGCGTTTACTGGGTACCACGCAGTGTTTTAAGCACTTTC 1080

  5893317 TGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTAGGTAGGCACTAATAGTACCTACAATTT 5893376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAATCACTGAATATTCACAGTAACCCATATTAGGTAGGCACTAATAGTACCTACAATTT 1140

  5893377 ACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAATACCTTGCACCAGGTTGCGGAGGTGGT 5893436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCAATGAGAAAATTGAGGCACAAGAGTTGAAATACCTTGCACCAGGTTGCGGAGGTGGT 1200

  5893437 GGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGGATTCCTTATTAACCGTGATTCTATGCA 5893496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTAAATGGGGGAGTCAAGCAGATGGGTTCTGGATTCCTTATTAACCGTGATTCTATGCA 1260

  5893497 GCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAACAAATCACTATGACCATAGTTGCATAAA 5893556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCTTCACATTTAAGTTACTATCAACGTGTAACAAATCACTATGACCATAGTTGCATAAA 1320

  5893557 GCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGGGTCAGGAATTTGGATAGAACACATCAG 5893616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCAACTGTTTTATTATGCTCCCAAATTCTGTGGGTCAGGAATTTGGATAGAACACATCAG 1380

  5893617 GGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCTTGACTGGGTGCATGAACACCGGGGGTT 5893676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGACAGCTTGGCTCTGCTCCACGTCTGGGGCCTTGACTGGGTGCATGAACACCGGGGGTT 1440

  5893677 GACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATCCATGTGTCCAGTAGATGATACTGGCTG 5893736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACTCAATATGACCGGAATCACCTGGAGGCATCCATGTGTCCAGTAGATGATACTGGCTG 1500

  5893737 TCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGAACACCCATACGTGGCCTCTCCAGGTGG 5893796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCAGCTGGGACCTCAGCTGTGGCTGCAGCTGGAACACCCATACGTGGCCTCTCCAGGTGG 1560

  5893797 CCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAGCAGTCAGACTTCATACACTATGGCTTA 5893856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTGGGCTTCTACACAGCATGGTGGCCTCAGAGCAGTCAGACTTCATACACTATGGCTTA 1620

  5893857 AGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAGAGGAAGCAGCATTGCCTTTCCTGAGCT 5893916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGCTCTAAAGGCAAGTGTCCCAGCAAACAAAGAGGAAGCAGCATTGCCTTTCCTGAGCT 1680

  5893917 AACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTCAGATTTAACAGGAGGGGATACAGACCC 5893976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACCCTGGAAGTCCCACAGTCTCAAGCCCACTCAGATTTAACAGGAGGGGATACAGACCC 1740

  5893977 CTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATGTCAAAGAATTTGCAGCCATTTTTTTGG 5894036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCCCTCCACCCAAACTCTCGATGGGAGGAATGTCAAAGAATTTGCAGCCATTTTTTTGG 1800

  5894037 TAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGTTTACAGCAAAATTGGTTAGAAGGTACA 5894096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATAGACTTTACTTTTAAGAGCAGTTTTAGGTTTACAGCAAAATTGGTTAGAAGGTACA 1860

  5894097 GAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCCACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCTTTTTT 5894156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAACTTTCCCATATATCATATTGCCTGCCTTCCACGGCAGTCTTTTTTTTTTCCTTTTTT 1920

  5894157 TTTTTTTTTTTTTTTGG-AGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCT 5894215
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTTTTTTTTTTTTGGGAGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCT 1980

  5894216 TGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGG 5894275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGGG 2040

  5894276 TAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAA 5894335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGGCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAAA 2100

  5894336 GATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTG 5894395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATGAGGTTTTACCATGTTTGTCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTG 2160

  5894396 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACT 5894455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGGTCTGGCGTGGTACT 2220

  5894456 TTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCG 5894515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTTGTAGGAAGGGCTCTCTTCCTTGTATTTCCATATGGCAAGGTCACTTTGCTTGTCG 2280

  5894516 TCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTC 5894575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCAGATGGAGTATTATAAAATAAAGCCAAACTCGTCTATTTGTGCTTACACTGGCCTTTC 2340

  5894576 AGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATT 5894635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGATTAAACAAATCCTTAATATTGGCAAAGGGCCTGACAAGCCTTTAGTATTAATTAATT 2400

  5894636 CTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCA 5894695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTGGAAGTCTCTGGGGAGAAGGTAAGTATTCTTGGGAACTGACAAAATGAATTGTTTCA 2460

  5894696 TTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTT 5894755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAAGCAGGTAAACCATTCCTCTAAGCCCTGTGCCAACTTCTGACCTGTGAGTTCTCTTT 2520

  5894756 GTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGG 5894815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTATCAGGCTGGCCAGGGGCCCTCAGGCCATGCCAAGCTTGTAGGCAGAGCTGGACGAGG 2580

  5894816 GCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCA 5894875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCACGATGGGTCACGTGCGTGTGTCTCTTTTCTTTACTGTTCACTGCCAGGCTCTCTCCA 2640

  5894876 GGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCC 5894935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGCTTTTCAAATTCCAGGCTTTCCCTACTTTGTAAGTGAATTTGACCAGCATTTTCCTCC 2700

  5894936 CAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCAT 5894995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAAAGTCACAGTTGAGTGTTCAAAATGAGGATCCACTGGTGTCTGTTGCTGATGTGGCAT 2760

  5894996 AAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAA 5895055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAAGGCTGCTTGAGTGGAAGGAACATCTGTCCTTGATAGGCTTCTACTATTTTCCAGTAA 2820

  5895056 CTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCT 5895115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTTATTTTAAAAATTTACATCATTACTTTACACATGGGAAGGCTGTGTTTGCTTTCTTCT 2880

  5895116 CTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCT 5895175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCTGCTCTTTCTCACCCCATACCCAATAGGCCCAATATCCCTCAATCTAGAAATAGTCT 2940

  5895176 GGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAA 5895235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGAGGTGTGGGTGCCCAATCACAAGTCATCCAGATTTTCACTGCCCATCGAATGTGCAAA 3000

  5895236 GAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATT 5895295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAATTGGGATTCTTGCCTGATATCCTTGTCATGTGTTGTGTACTTATCCTTATTGTCATT 3060

  5895296 CTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCC 5895355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTCGGACTGGTTATGGAGTTTATGGCTAAGGGGAGTATAGACCCTCACCCTCCTAACCC 3120

  5895356 ACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCT 5895415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACTTGCTTGCAGCAGCTTTTTCTGCAGGTGTGTCTGTCTTGGTCACTGGGCTGGATGCCT 3180

  5895416 GCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 5895463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCCTATTAAGCAGGGGCCTCCTCTTAGCTACTTTCTTCTCCTGATCAA 3228

EXCISED REGION

  5895500 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 5895559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 GGCTTTGCTCATGACTGATGCCCAGCATTGGATCAGGGCTTTGCTCATGACTGATTCTCA 3288

  5895560 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 5895619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 ACATCGTAGACATGACTTAATTTGCCAATGTTCAGTTCTCTTCTAACTTTGGATTACAGT 3348

  5895620 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 5895679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 TCTGCATGCCCTTGAATTCAGGACAGGTGGGGTGATGGGTTCTAGACGATGACATGAGGA 3408

  5895680 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 5895739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TAGACGTGATGTGTGTGCCTTCTGGGATAAGGCGTTTATTTGCCAGAACTTGCCTTATTG 3468

  5895740 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 5895799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 GCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGCTCTGTCATA 3528

  5895800 AGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 5895859
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 AGATGTCGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCATGATGGGCA 3588

  5895860 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 5895919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 TGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTTGGTGGTGTT 3648

  5895920 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 5895979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 TGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGGTCAAATCTG 3708

  5895980 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 5896039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 GTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCCATTCACTTA 3768

  5896040 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 5896099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 TATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGTGACAGATGC 3828

  5896100 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 5896159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 TGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAGGTTTGCTGA 3888

  5896160 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 5896219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 TGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAAATTGACAAT 3948

  5896220 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 5896279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 GAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGCACGATAATC 4008

  5896280 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 5896339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 AACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACTTGGGGGAAA 4068

  5896340 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 5896399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 TGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTGTCCTTCTTA 4128

  5896400 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 5896459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 AGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATTCAAACCCCA 4188

  5896460 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 5896519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 AGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCCATTCATTCA 4248

  5896520 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 5896579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 CCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAATAGATGGCAC 4308

  5896580 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 5896639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 AAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAGTGTGCAAGA 4368

  5896640 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 5896699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 CACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAATTCCCTGAGA 4428

  5896700 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 5896759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 CTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTAGGGATTTTC 4488

  5896760 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 5896819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 TTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCACAGCAGTTCT 4548

  5896820 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 5896879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 CAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAGAGCTTTGCC 4608

  5896880 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 5896939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 TATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAGCCTGGAAAG 4668

  5896940 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTT 5896999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
     4669 AAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA---TTTTTTTTTTTTTTT 4725

  5897000 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 5897059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 TTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCTCTAGGGTGGGAGGTAA 4785

  5897060 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 5897119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 TGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGATGCTGCAGTCTGCAGTT 4845

  5897120 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 5897179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 TTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATTGATTTGGTACCCAGTT 4905

  5897180 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 5897239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 TGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAGGGCACACTGCTGGGAC 4965

  5897240 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 5897299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 AGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATCAACTTGGCCTCCGAGA 5025

  5897300 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 5897359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 AGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATTTATTTATTTTACTGCC 5085

  5897360 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5897419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGGGGCAGCTTTTCCCCTG 5145

  5897420 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5897479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 CATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAA 5205

  5897480 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5897539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 TGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGG 5265

  5897540 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5897599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 CCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTGCAAAGTCTTTGAATTT 5325

  5897600 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5897659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 GTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACACACACATACACACACAC 5385

  5897660 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5897719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
     5386 ACACACACACACACACACACACACACACACACACAC--AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 5443

  5897720 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5897779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 CTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGTT 5503

  5897780 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5897839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 TATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTGC 5563

  5897840 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5897899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 CCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTCA 5623

  5897900 CTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5897959
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 CTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAATG 5683

  5897960 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5898019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 GTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTGT 5743

  5898020 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5898079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 GAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGAG 5803

  5898080 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5898139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 GAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATATT 5863

  5898140 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5898199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 TGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGGG 5923

  5898200 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5898259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 GCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAGA 5983

  5898260 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 5898319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 GCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATGT 6043

  5898320 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 5898379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 TCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGAG 6103

  5898380 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 5898439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 CAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGTA 6163

  5898440 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 5898499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 GAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTCCAGCAGTTTT 6223

  5898500 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 5898559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 CAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAATGTCCCTTTG 6283

  5898560 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 5898619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 AGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGGCACTGCCCTC 6343

  5898620 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 5898679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 CCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCAGTCAGTGGGT 6403

  5898680 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 5898739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 TCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCTTGGCCTCCAG 6463

  5898740 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 5898799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 TCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACTGGCTGCCCAT 6523

  5898800 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 5898859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 TTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCCCTGTGGGTCA 6583

  5898860 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 5898919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 GGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTG 6643

  5898920 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 5898979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 AAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCT 6703

  5898980 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 5899039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 ACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTG 6763

  5899040 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 5899099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 AGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCC 6823

  5899100 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 5899159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 TGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACAC 6883

  5899160 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 5899219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 TTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATT 6943

  5899220 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 5899279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 CTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCT 7003

  5899280 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 5899339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 CATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGT 7063

  5899340 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 5899399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7064 ACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATA 7123

  5899400 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 5899459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7124 ACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTG 7183

  5899460 CCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACC 5899519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7184 CCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACC 7243

  5899520 ACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAG 5899579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7244 ACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAG 7303

  5899580 CATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGG 5899639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7304 CATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGG 7363

  5899640 GCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACC 5899699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7364 GCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACC 7423

  5899700 GTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCA 5899759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7424 GTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCA 7483

  5899760 AGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTC 5899819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7484 AGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTC 7543

  5899820 CCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCT 5899879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7544 CCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCT 7603

  5899880 GAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCC 5899939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7604 GAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCC 7663

  5899940 CACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACT 5899999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7664 CACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACT 7723

  5900000 ATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTC 5900059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7724 ATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTC 7783

  5900060 AGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCAT 5900119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7784 AGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCAT 7843

  5900120 ATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAAT 5900179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7844 ATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCAAT 7903

  5900180 CCTGTCTCACCACTGGTTGAATTT 5900203
          ||||||||||||||||||||||||
     7904 CCTGTCTCACCACTGGTTGAATTT 7927

Alignment time is 5.52672 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   3612] =>      3612 nucs 'mol-32-33b6-101615_3612'

Score:        3580
Aligned:      3602        nucs
Identic:      3600 (100%) nucs =>       552 (100%)      3048 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897098,5897649] EXCISED REGION [5897650,5900699]
 second seq =>  [      1,    552] EXCISED REGION [    563,   3612]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        10 nucs [553,562]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        47 nucs [553,599] to [563,609]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [553,556] to [559,562]

  5897098 GTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAA 5897157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGATGCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAA 60

  5897158 CAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAA 5897217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAATTGATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAA 120

  5897218 ACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAG 5897277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCGAGGGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAG 180

  5897278 CCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTT 5897337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCATCAACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTT 240

  5897338 CTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATT 5897397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTATTTATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATT 300

  5897398 GATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGG 5897457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTGGGGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGG 360

  5897458 CAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATC 5897517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGCCCAGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATC 420

  5897518 CTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGG 5897577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCAGCCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGG 480

  5897578 TTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAAC 5897637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTTGCAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAAC 540

  5897638 ACACACACACAT 5897649
          ||||||||||||
      541 ACACACACACAT 552

EXCISED REGION

  5897650 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAG 5897709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAG 622

  5897710 AGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTT 5897769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 AGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTT 682

  5897770 GATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACC 5897829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 GATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACC 742

  5897830 TCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAA 5897889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 TCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAA 802

  5897890 TTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTC 5897949
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 TTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTC 862

  5897950 TCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTG 5898009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 TCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTG 922

  5898010 CACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCT 5898069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 CACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCT 982

  5898070 TTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGC 5898129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 TTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGC 1042

  5898130 CTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGC 5898189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 CTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGC 1102

  5898190 TGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTT 5898249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTT 1162

  5898250 ACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCC 5898309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 ACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCC 1222

  5898310 AAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGAT 5898369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 AAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGAT 1282

  5898370 CCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGA 5898429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 CCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGA 1342

  5898430 ATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTC 5898489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 ATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGACTCTGTGTC 1402

  5898490 CAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAA 5898549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 CAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATCCAAGTAAA 1462

  5898550 TGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGG 5898609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 TGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGTGTTGCAGG 1522

  5898610 CACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCA 5898669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 CACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACTCTCCTTCA 1582

  5898670 GTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCT 5898729
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 GTCAGTGGGTTCTGGACCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGCACAGCTCT 1642

  5898730 TGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACT 5898789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 TGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTATCCTTACT 1702

  5898790 GGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCC 5898849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 GGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCCCTCACTCC 1762

  5898850 CTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGG 5898909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 CTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGG 1822

  5898910 TCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGT 5898969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 TCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGT 1882

  5898970 GCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCAC 5899029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 GCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCAC 1942

  5899030 CGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACA 5899089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACA 2002

  5899090 CTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGG 5899149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 CTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGG 2062

  5899150 AGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGC 5899209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 AGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGC 2122

  5899210 TGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTG 5899269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 TGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTG 2182

  5899270 GGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATC 5899329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 GGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATC 2242

  5899330 CAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTC 5899389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 CAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTC 2302

  5899390 CAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACC 5899449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 CAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACC 2362

  5899450 TCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTC 5899509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 TCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTC 2422

  5899510 TTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTT 5899569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 TTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTT 2482

  5899570 TCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTG 5899629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 TCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTG 2542

  5899630 TGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACA 5899689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 TGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACA 2602

  5899690 CCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATC 5899749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 CCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATC 2662

  5899750 TGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTT 5899809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 TGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTT 2722

  5899810 CCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGT 5899869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 CCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGT 2782

  5899870 GACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTC 5899929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 GACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTC 2842

  5899930 TCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGC 5899989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 TCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGC 2902

  5899990 TTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCA 5900049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 TTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCA 2962

  5900050 GAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAA 5900109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 GAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAA 3022

  5900110 TTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACT 5900169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACT 3082

  5900170 GATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGC 5900229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 GATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCATCTTGGGC 3142

  5900230 CAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGG 5900289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 CAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAGTTTGCTGG 3202

  5900290 TAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCA 5900349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 TAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATCTGGCACCA 3262

  5900350 ACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTT 5900409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 ACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGTAAGATGTT 3322

  5900410 TATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGG 5900469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 TATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGCAGAACTGG 3382

  5900470 GCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCA 5900529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 GCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGACAGCCCCCA 3442

  5900530 CTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACC 5900589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 CTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTTTTGTGACC 3502

  5900590 CTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGC 5900649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 CTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAGAAGGAGGC 3562

  5900650 TCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCAC 5900699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 TCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCAC 3612

Alignment time is 2.60255 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   9560] =>      9560 nucs 'mol-32-3492-008594_9560'

Score:        9514
Aligned:      9560        nucs
Identic:      9555 (100%) nucs =>      1250 (100%)      8305 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5895731,5896981] EXCISED REGION [5896984,5905290]
 second seq =>  [      1,   1251] EXCISED REGION [   1252,   9560]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [5896982,5896983]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1918,1919]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [5896982,5897000] to [5896984,5897002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5896982,5896982] to [5896983,5896983]
 second seq =>         0 nucs

  5895731 GCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGC 5895790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTATTGGCCCTTCCCTTTCCTGCCATGGGGAACACTGAAGCCTCACATAGAGATGGC 60

  5895791 TCTGTCATAAGATGTTGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCA 5895850
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGTCATAAGATGTCGTGGTAATTTTGTGGAGAAGACCTCCCTCCCCACCACCAACCCA 120

  5895851 TGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTT 5895910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATGGGCATGTTGCATGAGGGAGAAATAGCCTCTCAGTGTGTTCAGCCTCCGAGATTTT 180

  5895911 GGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGG 5895970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTGGTGTTTGTTGCTATAGCCTATCCTAGCTTATGGGTTGGCAAACTATGGCCCATGGG 240

  5895971 TCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCC 5896030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAAATCTGGTCATTCACTTGTTTTTGCAAATGAAGTTTTATTGGGACACAGCCATACCC 300

  5896031 ATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGT 5896090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCACTTATATATTGTCTACACCTGCTTTCACACAGCAATGACAGCAATGAACAGTTGT 360

  5896091 GACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAG 5896150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACAGATGCTGCATGGTCTAGAAAGTAGAAAATTGTACTATTTGGCCCTACAGAGAGAAG 420

  5896151 GTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAA 5896210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTGCTGATGCCCACCTATCCTGACTGATACACTCGATAAAAGTCTCTTGAATTATTAA 480

  5896211 ATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGC 5896270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTGACAATGAAAAGGTAGAAGCCCAAAGCTGATGCTAAAATAATGTGAGATAACTTTGC 540

  5896271 ACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACT 5896330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACGATAATCAACGCAGCTTAATTGGCAAGCATTGATTAAGCGCCAGTTATGTGTCAGACT 600

  5896331 TGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTG 5896390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGGGAAATGATTTTTCCTTGGGGTCCTAGGGGTTTGGGGATGGCAGGAGGTGTTGCTG 660

  5896391 TCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATT 5896450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCTTCTTAAGTTTGGGAAGTAAAGACTTGAGGTGCGAAGGAGGATGTGACAAGAGGATT 720

  5896451 CAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCC 5896510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAACCCCAAGGATTCTGCATGAACTGAGGGATTTATCACCACTGTCTCCATCGAAGTCC 780

  5896511 ATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAAT 5896570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCATTCACCAAACATGCTGTGAGCTGTTGTCATTTACTATGTATGGTGTTAGCTGAAT 840

  5896571 AGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAG 5896630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGATGGCACAAAGGATTATTAGGCAATTACAATATAGTGTGATGGGTGTTAGGATTGGAG 900

  5896631 TGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAAT 5896690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTGCAAGACACTGGGGAAGGATATACCCTTGATAGAGCCAAAATGGCAACTGGTGTAAT 960

  5896691 TCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTA 5896750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCCTGAGACTGAAGCCAGGTGAAGGCTGAGAATTGCTTGTTGGCCAACTGTAGTACTTA 1020

  5896751 GGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCAC 5896810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGATTTTCTTCCCTAGGGAGAAAGCCCTGGAACAATCTCTTTACACCCTAGATTTGCAC 1080

  5896811 AGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAG 5896870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCAGTTCTCAGATCCTTGCTTTAGGCAGAGCCCCACTGCTAAGTCTTGTAACACAAAAG 1140

  5896871 AGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAG 5896930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTTTGCCTATGCACAGCTTTCTCTGGTTCTTTTTATCCTATCCTCCCCTGACAGGCAG 1200

  5896931 CCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA 5896981
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGGAAAGAAGCATCCTATTGATCATGACAGCACAATTGGAACTTGTGGA 1251

EXCISED REGION

  5896984 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCT 5897043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCCAGGGTCGGGAGGAAGAGGCTGGTGGCGTCCCTTCCT 1311

  5897044 CTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGAT 5897103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CTAGGGTGGGAGGTAATGAGCGGTAGATACCCACGCACTGACACGATCATCAGCGTGGAT 1371

  5897104 GCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATT 5897163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GCTGCAGTCTGCAGTTTTATGTGAAGTTCGCCTTCCCCACATTTGTACCTCCAACAAATT 1431

  5897164 GATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAG 5897223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GATTTGGTACCCAGTTTGAGCCATCATCTTATTTCAAGTTTGGTTACCTAGGAAACCGAG 1491

  5897224 GGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATC 5897283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 GGCACACTGCTGGGACAGTCTGCCTGTGTTCTGTGCCGACCGAAGCTATTAAAGCCCATC 1551

  5897284 AACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATT 5897343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 AACTTGGCCTCCGAGAAGCACTGAACACAGACAGTTTCAACTTCCAGCCAGGTTCTTATT 1611

  5897344 TATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGG 5897403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TATTTATTTTACTGCCTCAGCAGCAAAATGAGTTATTGAACCATTCAGCCTATTGATTGG 1671

  5897404 GGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCC 5897463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 GGCAGCTTTTCCCCTGCATTTCTCGGACACCTGAAGCCCCTCTGGAACTGGTGGCAGCCC 1731

  5897464 AGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAG 5897523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 AGAGGTCTTTTGTTAATGGTGAGTTCTCACCAGGGAAGCCAGGCAGCATCAATCCTCCAG 1791

  5897524 CCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTG 5897583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CCAGCAGGGCCTGGGGCCTGGGCTGTGGTCAGGCACAGCACCCCACAATGGTGGTTCTTG 1851

  5897584 CAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACAC 5897643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 CAAAGTCTTTGAATTTGTGAAGAAAATGATACTCGGGCCCTCTTGCAGGGAAACACACAC 1911

  5897644 ACACAT--ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAG 5897701
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 ACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAG 1971

  5897702 AGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAA 5897761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 AGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAA 2031

  5897762 AAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTA 5897821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 AAACATTTGATCGAAGTTTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTA 2091

  5897822 AATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCA 5897881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 AATAAACCTCATATGTGCCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCA 2151

  5897882 AAGGAAAATTACATTTCACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTC 5897941
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 AAGGAAAATTACATTTCACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTC 2211

  5897942 AGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTT 5898001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AGGCCTTCTCTAAGAATGGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTT 2271

  5898002 GGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATG 5898061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 GGATATTGCACAGTCTGTGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATG 2331

  5898062 ATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCT 5898121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 ATTAGCCTTTTGGGGGAGGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCT 2391

  5898122 TGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTAC 5898181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TGAAAAGCCTAAAATATTTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTAC 2451

  5898182 TTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGG 5898241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TTCTGTGCTGGCAGAGGGGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGG 2511

  5898242 TAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTG 5898301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2512 TAGCTCTTACCCCACAGAGCAAGGACACAGTGTGCGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTG 2571

  5898302 TCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCC 5898361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TCTATCCCAAGTATATGTTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCC 2631

  5898362 CAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATA 5898421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 CAGTGGATCCACTATGAGCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATA 2691

  5898422 TGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGAC 5898481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 TGTTCTGAATCTAGGGTAGAGGGCAGCATTGCTTTGTGTCTCTATGATGTCAGCTTAGAC 2751

  5898482 TCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATC 5898541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 TCTGTGTCCAGCAGTTTTCAAAATGTTTGGGTACTTGCCTTTCCTCAGTGTACAGTTATC 2811

  5898542 CAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGT 5898601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 CAAGTAAATGTCCCTTTGAGGAAGACTGGATGAATCATTACCATGTTTACTTGCCATGGT 2871

  5898602 GTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACT 5898661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 GTTGCAGGCACTGCCCTCCCTCCTCCTGCCCTCCCTCCCTTCCTTCTGGGAACCCAGACT 2931

  5898662 CTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGC 5898721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 CTCCTTCAGTCAGTGGGTTCTGGATCCAAAATGTGGATCAGAAAGGATGGTTTCGGGGGC 2991

  5898722 ACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTA 5898781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 ACAGCTCTTGGCCTCCAGTCCACCCACCTTGATTTCTTTGACTGCACAGATGCAATGCTA 3051

  5898782 TCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCC 5898841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TCCTTACTGGCTGCCCATTTATTTTGCCCCGCAGGGCACTGTGTTTTATAAATTCTTTCC 3111

  5898842 CTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCAC 5898901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 CTCACTCCCTGTGGGTCAGGCCCCAGCTTCTTGCCACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCAC 3171

  5898902 AGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGG 5898961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 AGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGCTTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGG 3231

  5898962 TAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGA 5899021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 TAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCCAGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGA 3291

  5899022 GCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTT 5899081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 GCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCCTCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTT 3351

  5899082 GGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAG 5899141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 GGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGAATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAG 3411

  5899142 CCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCA 5899201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 CCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGCCTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCA 3471

  5899202 CCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCAC 5899261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 CCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTCACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCAC 3531

  5899262 GTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCAT 5899321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 GTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACACCTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCAT 3591

  5899322 CCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTG 5899381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 CCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAACATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTG 3651

  5899382 ATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGT 5899441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 ATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCTGTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGT 3711

  5899442 TCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCT 5899501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 TCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACCCTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCT 3771

  5899502 TTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTT 5899561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 TTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTGCAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTT 3831

  5899562 ACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCT 5899621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 ACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGGTTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCT 3891

  5899622 AGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTG 5899681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 AGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGATCCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTG 3951

  5899682 GGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCA 5899741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 GGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGGTTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCA 4011

  5899742 GCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTG 5899801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 GCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACATCTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTG 4071

  5899802 TCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTT 5899861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 TCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGGCCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTT 4131

  5899862 AAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTA 5899921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 AAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCTCCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTA 4191

  5899922 CAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGT 5899981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 CAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTGAGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGT 4251

  5899982 CCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTC 5900041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 CCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGGTTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTC 4311

  5900042 TTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCAT 5900101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 TTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCCACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCAT 4371

  5900102 AGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCC 5900161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 AGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTGCTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCC 4431

  5900162 CTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCA 5900221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 CTACCACTGATGTGCAATCCTGTCTCACCACTGGTTGAATTTCCAACAATTGTCCTTTCA 4491

  5900222 TCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAG 5900281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 TCTTGGGCCAGCAGCTCTCTGGCCTCCACTTCCCACTAGCAATGGGGTTTTCATCATCAG 4551

  5900282 TTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATC 5900341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 TTTGCTGGTAGGTGACCAGCTCCAATAACCTATCTTATGTCTGCTTTCTCGGACGATATC 4611

  5900342 TGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGT 5900401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 TGGCACCAACTGTCACATGGGTTCCCTGGGAGGCAGACTCTGAGATGGAGAGTATCATGT 4671

  5900402 AAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGC 5900461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 AAGATGTTTATTAGGAAGTGTTCTGAGGAGTCATACCTAGGGAAGCAGGAGGAAGGAGGC 4731

  5900462 AGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGAC 5900521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 AGAACTGGGCAGAGGAAGAAGTCAAGCTATGATGCAGCTCCAACTAAGGCCCCAGCTGAC 4791

  5900522 AGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTT 5900581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 AGCCCCCACTAGGAGCTCTAGAGCTGGAAAAACCTTTAGTGCCATCCCTGCTGGAGTCTT 4851

  5900582 TTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAG 5900641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 TTGTGACCCTCCATCATTGGGTGTGAGCCACCCTGGAAAGGGTGAGTAACTTTGTTGAAG 4911

  5900642 AAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTT 5900701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 AAGGAGGCTCGTTTTAGCTTAGGCGCTTTGACATCTGAGGGCTGTCATCTGGCAGCACTT 4971

  5900702 CCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTA 5900761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 CCAGAAGCTGGGGGAATAGTCATTCATTCCTGGAGGAGTTCTGGGCAACACACTACAGTA 5031

  5900762 TCCACTACCTGCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTT 5900821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 TCCACTACCTGCTCTGCCATCCCAGTCTGTCTAACAGCTGTGGCCTTGGATAAAGCCTTT 5091

  5900822 AATCTTTCTGATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCA 5900881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 AATCTTTCTGATCCTCAAATTCTCTTACATAAAAAAAAGATTTAAATTAACATATGCCCA 5151

  5900882 TTTCAGAAAATTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAG 5900941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 TTTCAGAAAATTATAGAAAATATAGTAATGTAGAAAGAAGAGAGTCTCCTGTAGTCTCAG 5211

  5900942 TACCCAGAGATAGATGTCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAAT 5901001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 TACCCAGAGATAGATGTCCCCACCCTGAAGTGTGTTTCTTGTATTTTTGCTCCACTTAAT 5271

  5901002 ATAGTGGTAACCAAGTGCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAA 5901061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 ATAGTGGTAACCAAGTGCGATGTTGAATTTTGTGTTCTCATTTTCACTTAACATTGTGAA 5331

  5901062 ATCAGCATTATCAGAAACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTA 5901121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 ATCAGCATTATCAGAAACTTCTAGTAAACACTGATGTTAAAGGTAAATTCTTTCTGATTA 5391

  5901122 AAAAAATAATGGCTAGTCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTA 5901181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 AAAAAATAATGGCTAGTCGTAAGAGAACATTATGGAAAAATTATACATTATCTCTCTTTA 5451

  5901182 GAAATAACCATGACTAAAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATA 5901241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 GAAATAACCATGACTAAAATTTTGTTACACAGCTCTCCAGTTTTACTGTGTGTGTTTATA 5511

  5901242 AATAAAATTAGGGAATGTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGC 5901301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 AATAAAATTAGGGAATGTTTTCTAAGATTCTAATGTTATTGTTTCAATCTATTTTTTTGC 5571

  5901302 TTTATAGCTTGAACATCCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACT 5901361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 TTTATAGCTTGAACATCCCTCTGACATATTACATATTTGTCTATACCATATACAACCACT 5631

  5901362 TTAATAACTGTATAATATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATC 5901421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 TTAATAACTGTATAATATTCTATTGCATAAAAAGATATGGAATCAACTTAAGTGCCCATC 5691

  5901422 AATGGGCACTTATTGCACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACAC 5901481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 AATGGGCACTTATTGCACACACACAAACACACACATACACATACCATAAAATACACACAC 5751

  5901482 ACATATATATTTATATATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTA 5901541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 ACATATATATTTATATATATACATACACAAACACATACACATACCATGGAATACTACTTA 5811

  5901542 GCCATAAAAACTGAAATTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTA 5901601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 GCCATAAAAACTGAAATTGTGTCTTTTGTAACATTGGTGGGACTGGAGGCCATTATCTTA 5871

  5901602 AGTGAAAAAATTCAGAAACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGC 5901661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 AGTGAAAAAATTCAGAAACAGAAAGTCAAATACCACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGC 5931

  5901662 TAGACAAGGACATATAGATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGG 5901721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 TAGACAAGGACATATAGATTGATAATAGACATTGGAGACTCAGAAGGGTAGGAAGGTGGG 5991

  5901722 AAGGAGGTGAGGGATGAGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCT 5901781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 AAGGAGGTGAGGGATGAGAAATTACCCAATGGGTGCAATGTACACTACTAAAATAATGCT 6051

  5901782 TACACTAAAAGCACTGACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGAT 5901841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6052 TACACTAAAAGCACTGACCTCACCACTATGCAGTATATCCATGTATCAAAACTGCATGAT 6111

  5901842 ACAGTACCCCCAAATCTATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGT 5901901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 ACAGTACCCCCAAATCTATAAAAATAAAAAAACTTAACTCTATTGCATATGGGTGTGTGT 6171

  5901902 ATACATATATATATCTATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACAT 5901961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 ATACATATATATATCTATGTATACATAAAACATAGCTTAATTCATCTCCTTTTAAAACAT 6231

  5901962 CTTTCCTAATATAAATAATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATC 5902021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 CTTTCCTAATATAAATAATTTTCTGATGAAGATCCTTACTTGTAGATCTTTGTGTTCATC 6291

  5902022 TCTGATTCCTTCCTTGGGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAAC 5902081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 TCTGATTCCTTCCTTGGGATAAAACCTTAGAAGCAGAATTATTGGGTGAAGTCTTTGAAC 6351

  5902082 ATTCAAGTCATTTGATATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACT 5902141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 ATTCAAGTCATTTGATATATACTGCCAAATTACCCTCTTGAAAAGTTGTACAAATTTACT 6411

  5902142 CACGACTAGAAGTACATGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTAC 5902201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 CACGACTAGAAGTACATGTGGGCAATTGTCATGCTTTCGTATTTCTATATTAGTTTGTAC 6471

  5902202 ACTAGAGATGCTAATTATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCT 5902261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 ACTAGAGATGCTAATTATGGTGCCTGCATATGCCTAGAGTCCCTTATAAGGGAAGCTTCT 6531

  5902262 CAGCCACAGTTCATATTGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCC 5902321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 CAGCCACAGTTCATATTGAAGAGGTACGATATGCAGTGATGTTTCTTTAATAACCCATCC 6591

  5902322 CTTCCCTAGGGATGGCTCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGG 5902381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 CTTCCCTAGGGATGGCTCACAGAAGGGCAGGCAACCCATAGGCTTAGCAGCACCCTATGG 6651

  5902382 TAATTACTGGCACCTAGAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATT 5902441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6652 TAATTACTGGCACCTAGAGGCTCAGCCCTAACAGTGGTGGTTACTACTCACTGGACTATT 6711

  5902442 AATTTTAGAAATATTAAATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTT 5902501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6712 AATTTTAGAAATATTAAATGGAAACATGAAACCTGTTATTTACCAACGAGAGTTAAAGTT 6771

  5902502 TAAATGAAAGTACCAGTGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCA 5902561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6772 TAAATGAAAGTACCAGTGACATCATGATGGGTCACAGCAAGTCAAAGTCATAAGGAACCA 6831

  5902562 AAAACGATGAATAGCATAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGG 5902621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 AAAACGATGAATAGCATAAATAAGTTAAAACTATCATCAAGAAAAGCAGAAGCTGTGAGG 6891

  5902622 TGGAGAGAAGAGATTCCAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGAT 5902681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6892 TGGAGAGAAGAGATTCCAGGTGGTAGATAAGGAAGTCAGTTTTACTCAGGAAGTTGGGAT 6951

  5902682 TGAAACAGAGAGGGAAAGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAG 5902741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6952 TGAAACAGAGAGGGAAAGAGTCGCTAGTACTCATTAATGACAGAACAGTATGGTGATGAG 7011

  5902742 CCTTAATTTCATGCCCCTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGG 5902801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 CCTTAATTTCATGCCCCTAAAGCCCCTGGGACTGCCTTGGACAAGCTCCTGTTCTCCTGG 7071

  5902802 GGCCTGGCCAAGCCCAGCTCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTT 5902861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 GGCCTGGCCAAGCCCAGCTCCTGTTCTTTGTTGTTACACCTACAACCCCAAGGACATTTT 7131

  5902862 AATATAACTCCCCGATTCCCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAAT 5902921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 AATATAACTCCCCGATTCCCACTGGTCTGAGTTTATCTTAGAACCAGAAGCGCCTAAAAT 7191

  5902922 AACATGAATGATTCATGAGCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTT 5902981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 AACATGAATGATTCATGAGCATCCCTGAATCTACTGGAGACTCTTAGGTTGTTTACTTTT 7251

  5902982 ATCTTTATTGTTTGTCACTGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGT 5903041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7252 ATCTTTATTGTTTGTCACTGTAAATGAGGCCAGGATGAACATCTTTGTACATTAAATCGT 7311

  5903042 GTGTGTATAGCATCCTTCCCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGG 5903101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7312 GTGTGTATAGCATCCTTCCCTTAATCAAGATGACCACAGCAAGAAATTTCACATCAAAGG 7371

  5903102 GCACAAACACTGAGTTTCTATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAG 5903161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7372 GCACAAACACTGAGTTTCTATTATTATTAAAAAACAAGAGCTAATGGGAGACAGGGAGAG 7431

  5903162 GGCAGGCCATATCAGTCTCTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTT 5903221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7432 GGCAGGCCATATCAGTCTCTAAGGCCTCATGAATTTCTAAAAGACTTGTGTTCTCTGGTT 7491

  5903222 GTCTTCCAGATGTGTGCAGATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAA 5903281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7492 GTCTTCCAGATGTGTGCAGATCTTAGGCATACCAATGCAGTCTTCAACTGAGCCAAGAAA 7551

  5903282 GAGAAGGGACCCTATTATAGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTC 5903341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7552 GAGAAGGGACCCTATTATAGACACAAGCATTATTCTGGACCTTGCTTGCAATATTATTTC 7611

  5903342 CCTATTCCCACCCACAAGCTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGC 5903401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7612 CCTATTCCCACCCACAAGCTACATTGTTGTATCATTTTTTTTTCCAAGATGGAGTTTCGC 7671

  5903402 TCTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 5903461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7672 TCTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 7731

  5903462 TGGGTTCCAGCGATTCTGCTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCC 5903521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7732 TGGGTTCCAGCGATTCTGCTGTCTCAGCTTGCCAAGTGGCTGGGATTACAGGCACCTGCC 7791

  5903522 ACCATGTCTGGCCAATTTTTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCC 5903581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7792 ACCATGTCTGGCCAATTTTTAAAATATTTTTAGTACAAACAGGGTTTCACCATGTTGGCC 7851

  5903582 AGGGTGATTTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTA 5903641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7852 AGGGTGATTTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTA 7911

  5903642 GGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAA 5903701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7912 GGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCCATTGTTCCATCATTCAACAGCTTCTAAA 7971

  5903702 ATTTCACCAATTAAATAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTAC 5903761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7972 ATTTCACCAATTAAATAACTTCCCTGATTGGAATGGGAGAAAGTGAGCAGAAGACTTTAC 8031

  5903762 TGTATGTACATGTATATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATC 5903821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8032 TGTATGTACATGTATATTTATATGTATACCAATGTCTATGTCTACGTGAATGTCTCCATC 8091

  5903822 TCCAACTAGCCCATATCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTT 5903881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8092 TCCAACTAGCCCATATCAATGAGTATATGTGTAACTGAAGAAGTAGGTGTTTTAGAATTT 8151

  5903882 TTAAAGGGAGAGAGAGAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAG 5903941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8152 TTAAAGGGAGAGAGAGAGAGGGAAAGAGTGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGACAAGGAG 8211

  5903942 GTCAACAGCGCCCAGGCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTG 5904001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8212 GTCAACAGCGCCCAGGCCTGTTTTTTGCTTGACATCTTGATGATCATGCATCGAGGTCTG 8271

  5904002 CTCTAAATTATAATTTTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAG 5904061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8272 CTCTAAATTATAATTTTTAATCTCAGTGATGTTTCTCAGCTCTGAAAAGCATCAGAGGAG 8331

  5904062 TTTCGATTTGTGCCATGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTC 5904121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8332 TTTCGATTTGTGCCATGGCTATGAAAAAACTGTCTCTGGAGAGTTGTCCACCTGTTAGTC 8391

  5904122 CCAGTATTTATATATAAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTAT 5904181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8392 CCAGTATTTATATATAAGGTATTCCTCTTGTTCTGAGATTCTAACAATGCTATACTTTAT 8451

  5904182 AAATCATGTTCCTCTTTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTT 5904241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8452 AAATCATGTTCCTCTTTCAAAGATCAAAAAATTAGAAATTCTCCTACCATACTTGCTTTT 8511

  5904242 TATATTTTGACTTTTAATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAG 5904301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8512 TATATTTTGACTTTTAATAATCTTCTCTAATATTGTTATTTGATTTCAAATTGAACACAG 8571

  5904302 AATCAATTCGATTAAGCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAA 5904361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8572 AATCAATTCGATTAAGCACAAGAAGTGTCTGATGAAAGATTAGGATTCACTGCTTTGGAA 8631

  5904362 CCACTCAATAATTTTCATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAA 5904421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8632 CCACTCAATAATTTTCATCTTTGCCACAAATATGTTAAGTTTAGGAGGCCAATAACTAAA 8691

  5904422 TTTCCCACTTTCCACCAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCA 5904481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8692 TTTCCCACTTTCCACCAGCTTTAAGACAGAATGGGGTTCAAGTACAATGAAGTGGCCCCA 8751

  5904482 TGTGAAGCCTAAGGATAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAAC 5904541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8752 TGTGAAGCCTAAGGATAGCAACACTGCAGAAACTGAACTGGCAGAAGCACAGCACAGAAC 8811

  5904542 ATCTCAGAGTGTTTGCTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGAT 5904601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8812 ATCTCAGAGTGTTTGCTCACCAGCTGATGCTCAGCAATTCAAAACTCTGAGCCCAAGGAT 8871

  5904602 CCGTTTAGAGTGTTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACT 5904661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8872 CCGTTTAGAGTGTTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGAATGAAGTCAGAACACACT 8931

  5904662 AGTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTA 5904721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8932 AGTCAGGGACAGAGAGCCACCTGATAAACTGATAACTGTGTCCAGGGTAGATTTGGGCTA 8991

  5904722 AGCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTAT 5904781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8992 AGCTTTTTGTAGTTATAAAAAAAACTAAGAGAGTCAGAAAATTATATAATATTTACTTAT 9051

  5904782 CTTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCC 5904841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9052 CTTTACTTTTCCCAAACCATATAGTTTTTTAGATAAGAAAAGTTCCTCTAGTAATACTCC 9111

  5904842 ATGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACT 5904901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9112 ATGTTTAAAGAAACACAAGCCCTAAGTGCAAATTAAATGCGCTTGTCACCCTGCTTAACT 9171

  5904902 CTTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATC 5904961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9172 CTTCTAAAGGTCACTTAATAAATCATTGGCTATTCAGCACTCTCACTCACGGACAGCATC 9231

  5904962 TACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTA 5905021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9232 TACCCTGGGACATTTTCACACTCTTGCCCCTTCTGTTAATTTCTCAGAGAAAAGCTACTA 9291

  5905022 ATGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTG 5905081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9292 ATGATCTCCACACTAACCCTCTGAGAATTACCTGTCTTACTGCCTCCATACGGAGCCCTG 9351

  5905082 CCTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTC 5905141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9352 CCTTGGTCCCCCAAGCCAAGGTCCAGTCCCAGTACACCCTTTCCCTGTTAAATGGCTCTC 9411

  5905142 GTGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAG 5905201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9412 GTGGTTTCTGGAAAACAAAGGCACACATGTCTCTGTTGTTGCAACTAGCACCTGCCTCAG 9471

  5905202 TTACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTT 5905261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9472 TTACTTCCTTGTGTGGGAACTTGCAAAGGCCATGCATTAGCTTTTATAAAGCATAGACTT 9531

  5905262 TTCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAA 5905290
          |||||||||||||||||||||||||||||
     9532 TTCCTTCGTGTACTTCTGAGAATCACCAA 9560

Alignment time is 6.55627 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5888447,5908875] =>     20429 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [      1,   2031] =>      2031 nucs 'mol-32-34be-067569_2031'

Score:        1910
Aligned:      2031        nucs
Identic:      2020 ( 99%) nucs =>       723 ( 99%)      1297 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5897719,5898447] EXCISED REGION [5898876,5900177]
 second seq =>  [      1,    729] EXCISED REGION [    730,   2031]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       428 nucs [5898448,5898875]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5898448,5898449] to [5898876,5898877]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5898448,5898448] to [5898875,5898875]
 second seq =>         0 nucs

  5897719 GCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATTTGATCGAAGT 5897778
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
        1 GCTTTGGATGCAATATAGTCGGGGAGCCGGACTCCCAGGCTAAAAACATCTGATCGAAGT 60

  5897779 TTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTG 5897838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTCTGTTTGGAACTAGTTTCTTAGTTTTGAAAAAAAAGTAAATAAACCTCATATGTG 120

  5897839 CCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTC 5897898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCAGGATTTGACAATCTACAGTCCTAGGAACTTCCTGACCCAAAGGAAAATTACATTTC 180

  5897899 ACTTCTTCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAAT 5897958
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTCTGCTTCCTGAGAGACCTCACAGCCCCCTTGGACATTTCAGGCCTTCTCTAAGAAT 240

  5897959 GGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTG 5898018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTGAACTCGACAGAGACCATACCATAATGTCTTCAGCCTGTTGGATATTGCACAGTCTG 300

  5898019 TGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAGTATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGA 5898078
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAACTAAGAATGGTTTTTAGATTTTTAAATATAAAAAAGATGATTAGCCTTTTGGGGGA 360

  5898079 GGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATAT 5898138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGGGCGGTTGCTTGAGGAGTTGAAGATGTTGCTTCTTGGCTTGAAAAGCCTAAAATAT 420

  5898139 TTGTTGTCTGGCCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGG 5898198
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTTGTCTGGTCCTGTACAGAAGTTTGCCAGCCCCTAGGTACTTCTGTGCTGGCAGAGG 480

  5898199 GGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAG 5898258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCAGTATGTTCAGAGGCTTCCAGTTGGCTTTTTCCACTATGGTAGCTCTTACCCCACAG 540

  5898259 AGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATG 5898318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCAAGGACACAGTGTGTGGGTCCTGGGCACCTGTCAAGTCTGTCTATCCCAAGTATATG 600

  5898319 TTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGGGCCCAGTGGATCCACTATGA 5898378
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
      601 TTCAAAGACCAGGGAAATGACTGCCAGGAGGGGTCTATGAGCCCAGTGGATCCACTGTGA 660

  5898379 GCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGT 5898438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAGGACCTGGGCCAAGACTCCATTTATTACATGGTCCCCATATGTTCTGAATCTAGGGT 720

  5898439 AGAGGGCAG 5898447
          |||||||||
      721 AGAGGGCAG 729

EXCISED REGION

  5898876 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 5898935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 CACTCGCTGTGATGATTGTCTCCCACAGATGGGGTCACGCTGTGAAGTGTCCTTGGGTGC 789

  5898936 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTACCCTTCATTGAGCCC 5898995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      790 TTCAAGGTCCCTCTACCTGTCAGTGGTAGGTAGTGCGTCCCTCTGCCCTTCATTGAGCCC 849

  5898996 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 5899055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 AGCTCTGGGGCAGCGTCTCCTGCAGAGCCACCACCGGCCTCCTGAGTGAAGCTGGTGCCC 909

  5899056 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 5899115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 TCTCCCCAGCACGTCCCTTAGCGCTTGGTGAACACTGTGTCCCCTGGTCTTTTCCATGGA 969

  5899116 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCATGCACATGC 5899175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      970 ATGCATCCCACTGCTGGGTTTCCCAGCCTCATGGAGCAATACACTTGAGCGTGCACATGC 1029

  5899176 CTCTGAGCCTTTCTTCCCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 5899235
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 CTCTGAGCCTTTCTTCTCTTCCTCCACCTTCTGCTGCTGAAATTCTGGCATATCCGCCTC 1089

  5899236 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACGTTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 5899295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 ACCCAGTGCAGCTGTCACTATCCCACATTATTTGGGGCCATCCTCATAGTATATCTACAC 1149

  5899296 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 5899355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 CTGGGATTCTTACCTGGGTGTTCCATCCTGAATCCAGAAAGAGTACACCCAAATCAATAA 1209

  5899356 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 5899415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 CATTTCCTTGGCATTTTCCATTACTGATTATTTCCAAACCAATAACATTTCCTGGTAGCT 1269

  5899416 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 5899475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 GTTACCCCATAGGCCAAGGACCATGTTCCAAACCTCATGCTCTGCCTCCCATCCAGCACC 1329

  5899476 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 5899535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 CTCAGGACCCAGCCCACCCATACCCTTTCCTGTCTTGCTGCACCACCTGGCTGGGTCCTG 1389

  5899536 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 5899595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 CAACTCCTTCAAGGCACAGTCCCTTTACCCCTTTTCAGGCCCAGCATGGCCCTGGCTGGG 1449

  5899596 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 5899655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 TTATGTTGTGACTCACCCCTAGTTCTAGGACTTGTGGCCAGTGGGCAACAGGGGTTGGAT 1509

  5899656 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 5899715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CCTGAGGCGGGGGCACATGCTTTGTGGGGAGACACCTCTGTACCGTCTTCAAGTAAGGGG 1569

  5899716 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 5899775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 TTGGTAGGGAGAGTCCACTTCTGTCAGCCTAATCTGGGCCTTCAAGGTCTTCAGAAACAT 1629

  5899776 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTTCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 5899835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1630 CTACCCAGATGCCGTCATTGTGTGTGTCAGGGTCCCATTCTCTCCCATGCACGGCCCTGG 1689

  5899836 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 5899895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 CCCTGGCACAGCAACCTTACCTTGTTAAAAGTGTGACCCTCTCTGAAACTCAGCTGCTCT 1749

  5899896 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 5899955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 CCAGATGAAGTTCTTTGTCTGGTGTACAGCCTTCTCTGCCCTCCCACTTCAGGAGATTTG 1809

  5899956 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 5900015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 AGCCTTTTTATAGGCTTCCAGGAAGTCCTCTAGCTTTCAAAACTATCTCTTAGTTGCTGG 1869

  5900016 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 5900075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TTAATCACACTCAGCTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGAAGTCAGTCAGTTTCAGTAGTAGCC 1929

  5900076 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 5900135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 ACCCAATTCTGTTGTCCTTATATCATAGTAATAATTTCTCTCATATTTCTCAGATGCCTG 1989

  5900136 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCA 5900177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 CTGCATTGCACCAGCTAATGTATTCCCTACCACTGATGTGCA 2031

Alignment time is 2.19162 s

